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Fabris, Victoria T.. "Contribución de los estudios cromosómicos a la comprensión de los mecanismos de la carcinogénesis hormonal: estudio citogenético de carcinomas mamarios murinos inducidos por progestágenos" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El tratamiento prolongado con acetato de medroxiprogesterona (MPA) en ratones de la cepa BALB/c induce carcinomas mamarios de histología ductal, que expresan receptores de estrógenos y progesterona, y son metastásicos en pulmón y ganglio linfático. Estos tumores se mantienen in vivo por pasajes singeneicos, siendo hormono-dependientes (HD) ya que requieren del agregado exógeno del MPA para crecer, y no crecen en animales sin tratar con MPA. Se seleccionaron variantes hormono-independientes (HI) a partir de los tumores HD que comenzaron a crecer en los animales sin MPA. Estos tumores HI son capaces de crecer en animales sin tratar con MPA, pero mantienen los receptores hormonales. Los tumores HI presentan una respuesta diferencial a1 tratamiento con l7-ᵝ-estradiol (E2) y los antiprogestágenos mifepristona y onapristona. Se los clasifica en respondedores, aquellos tumores HI que inhiben su crecimiento in vivo por el tratamiento hormonal, y no respondedores a aquellos que no regresionan por el tratamiento. En la primera parte de este trabajo se estudió el cariotipo de los tumores HD (n=5) y sus variantes HI (n=ll) con técnicas de citogenética clásica (bandeo G) y molecular (hibridación in situ fluorescente, FISH), con el objetivo de relacionar el número de cromosomas y las alteraciones del cariotipo presentes con las características biológicas de los tumores. Tres de los 5 tumores HD (60%) presentaron un número de cromosomas en el rango diploide (ratón normal, 2n=40), mientras que los tumores HD que presentaron números modales en el rango triploide a tetraploide fueron estudiados en pasajes muy avanzados. Los tumores HI en pasajes tempranos presentaron números modales diploides. En pasajes tardíos la mayoría de los tumores HI (8 de los ll estudiados) presentaron cariotipos en el rango triploide a tetraploide. Todos los tumores presentaron alteraciones numéricas y estructurales de sus cromosomas. No se observó una alteración común a todos los tumores, o que estuviera asociada con la dependencia hormonal. Sin embargo, podemos inferir que los tumores con números modales diploides responderán al tratamiento con E2 y antiprogestágenos. Las alteraciones más frecuentes fueron ganancia de los cromosomas 3, 4 y 6 (entre el 50% y 60% de los tumores) y pérdida de los cromosomas 16 y X (en el 70% y 100% de los tumores, respectivamente). En un análisis global, la pérdida del cromosoma X resultó significativa. Se observaron numerosas translocaciones, que involucraron a los cromosomas 4 y 7 con mayor frecuencia (presentes en tres de las cuatro familias tumorales con alteraciones evaluables), observándose el mismo punto de ruptura para el cromosoma 7. Por otra parte, las alteraciones presentes en los tumores HD se conservan en los pasajes tempranos del crecimiento autónomo. En base a estos resultados podemos concluir que los tumores inducidos por el MPA serían diploides, y que con el continuo pasaje in vivo puede aumentar el número de cromosomas. La adquisición de la hormono-indepedencia no es causada por el aumento de la ploidía, y los tumores HI conservarían el cariotipo diploide de los tumores HD en los pasajes tempranos. El aumento del número de cromosomas y la adquisición de nuevas alteraciones sería posterior a la adquisición de la hormono-independencia y ocurriría como consecuencia del aumento de los pasajes. La ocurrencia en pasajes más tempranos de variaciones en el cariotipo observada en los tumores HI con p53 mutado, respecto de los tumores HI con p53 normal, podría estar asociada a las mutaciones en p53. Sin embargo, en el tumor HD la presencia de p53 mutado no está acompañada de inestabilidad cromosómica, sugiriendo que serían necesarios otros factores además de dichas mutaciones. En la segunda parte del trabajo se estudiaron los cambios del cariotipo durante el establecimiento de líneas celulares a partir de carcinomas mamarios murinos HD y HI. Se analizaron las variaciones en ploidía y de las alteraciones cromosómicas a lo largo de los repiques de las 8 líneas celulares obtenidas. Las líneas celulares conservaron el número de cromosomas diploide de los tumores parentales en los primeros repiques, este número de cromosomas aumentó con los posteriores pasajes in vitro, y se estabilizó en el rango triploide en 5 de las 8 líneas celulares, sugiriendo que éste les daría cierta ventaja para el crecimiento en cultivo. Sin embargo, una de las líneas celulares mantiene su cariotipo diploide hasta repiques avanzados. Todas las líneas celulares conservan los cromosomas marcadores de los tumores parentales a través de los repiques, pero 7 de las 8 líneas adquieren alteraciones nuevas desde repiques muy tempranos. Podemos concluir que el aumento de la ploidía se vería favorecido por el avance de los repiques. Por otra parte, los cromosomas marcadores del tumor no se pierden por el continuo cultivo in vitro, pero se favorece la formación de nuevas alteraciones. El conocimiento del cariotipo permitió, además de caracterizar las líneas celulares, discernir sobre el origen de una de las líneas establecidas. En resumen, en este trabajo de tesis se investigó la evolución cariotípica de diferentes tumores mamarios murinos en su evolución desde la hormono-dependencia hacia la independencia, y de las líneas celulares derivadas. En nuestro conocimiento, este es el primer informe del estudio citogenético en relación con la independencia hormonal en tumores mamarios murinos. Los genes ubicados en los sitios de ruptura de las translocaciones observadas, como por ejemplo Aurora C, merecen ser estudiados en investigaciones futuras.

Abstract:
Medroxyprogesterone acetate treatment in BALB/c female mice leads to the development of ductal mammary carcinomas which express estrogen and progesterone receptors and are metastatic in axilar lymph nodes and lungs. They are maintained by syngeneic transplantation in progestin treated female mice disclosing a hormone dependent (HD) pattern of tumor growth. Occasionally hormone independent (HI) variants have been selected. These HI tumors are able to grow without exogenous hormone supply. Some of them are able to regress completely afier l7-ᵝ-estradiol or antiprogestin administration and are so called responsive HI tumors while others are unresponsive to both treatments. In the first part of this study we have investigated the karyotype of 5 HD tumors and of ll HI variants using classic cytogenetic techniques as G banding and molecular approaches as fluorescence in situ hybridization (FISH). The aim of this study was to evaluate possible relationships between ploidy, chromosome markers and acquisition of hormone independence. A near diploid karyotype (2n=40) was found in 3/5 HD while a triploid to tetraploid karyotype was observed in the other two HD tumors which were studied in late passages. In early passages from HI tumors we obtained diploid karyotypes while in advanced passages they were mainly poliploid (8/11 tumors). All tumors showed number and structural chromosomal rearrangements. The tumors studied did not share chromosomal abnormalities neither chromosome markers could be related to HD or HI tumors. However, it seems that in this experimental model it can be inferred that a diploid tumor will be responsive to hormones whereas a poliploid tumor may be HD, responsive HI or unresponsive to hormone treatments. The most frequent chromosomal rearrangements found in individual tumors were gains in chromosomes 3, 4 and 6 (in 50 and 60% of the tumors) and loses in chromosomes 16 and X (70% and 100% respectively). In a global analysis of frequencies only loses of chromosome X were statistically significant. Nearly all tumors disclosed several translocations (22 in 9 tumors studied). Chromosomes 4 and 7 were involved independently in 3 of the 4 tumor families which could be studied. Twice they were together, and in the case of chromosome 7, in the same breakpoint. Abnormalties present in HD tumors were maintained in early passages of HI tumors although later on new rearrangements were observed. It can be concluded that MPA dependent tumors are probably diploid and polyploidy arises by continuous in vivo transplantation. The acquisition of hormone independence is not caused by an increase in ploidy. Conversely, HI tumors may maintain the same diploid karyotype in early passages while progressively losing and acquiring new markets in later passages. SSCP revealed a point mutation in p53 in 4/5 tumors of the same family. The parental HD tumor showed a diploid stable karyotype while the HI variants were poliploid and did not share common markers suggesting that mutated p53 is not uniquely involved in chromosome instability. HI variants may have acquired other alterations that together with mutated p53 may confer this phenotype. In the second part of this study the karyotype of 8 cell lines derived from 2 of these diploid tumors was investigated. Cell lines maintained the diploid karyotype during the early passages and nearly all of them after passage 35 changed to a stable triploid karyotype. Only one cell line, the MC4-L5 remained diploid for more than 45 passages. All cell lines maintained the same chromosome markers than the parental tumors and 7/8 acquired new markers which were different for each cell line and were characterized in this study. It can be concluded that the onset of the cell lines are not defined by increases in ploidy but that in vitro culturing favors their evolution towards a triploid state. The fact that the onset of the cell lines were associated with new different rearrangements suggests that these may favor this event. Thus cytogenetic analysis is extremely important to identify cell lines. In addition, cytogenetic studies helped to determine if one of the cell lines could have been originated as a consequence of an epithelial mesenchymal transition from the same cells or if it could have been originated from a different cell. Summing up, in this thesis we have investigated the evolution of karyotypes of different mammary tumors from a hormone dependent to a hormone independent state and in their derived cell lines. To our knowledge this is the first report on the field studying cytogenetics in relation to hormone independence in mouse mammary tumors. Genes located in breakpoints, such as Aurora C in chromosome 7, deserve further investigations.

Fabrizio, María del Carmen. "Modelización y estudio de la propagación de la infección por Trypanosoma cruzi en escenarios rural y urbano" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se formularon dos modelos matemáticos uno determinístico y el otro, estocástico para obtener una mejor comprensión de la dinámica de la infección por T. cruzi y los mecanismos asociados a la dispersión de la misma. Se recalca la importancia de la diferenciación de las tres etapas de la infección en humanos: aguda, crónica indeterminada y crónica con patología determinada. El modelo determinístico en el escenario rural también involucró a la población de triatominos y a la de los perros (principales reservorios domésticos de T. cruzi en la presencia del triatomino). Las vías de transmisión consideradas para los humanos fueron la vectorial, la congénita y la transfusional. Debido a que el flujo migratorio ha originado la expansión de la enfermedad desde zonas rurales hacia zonas urbanas en ciudades latinoamericanas, generando un problema sanitario en dichos lugares, incluso en países como Canadá, Estados Unidos, Australia, Japón y en países de Europa, se analiza el modelo correspondiente al denominado “Chagas urbano”, en el que se involucra sólo al humano. Se obtienen las fórmulas de la matriz de la próxima generación (interpretando el significado de cada uno de sus componentes) y a partir de ella, de diversos números reproductivos básicos. Se realizan sus correspondientes estimaciones en dos escenarios diferentes. (i) zona rural endémica del Gran Chaco Argentino y (ii) ciudad de Buenos Aires. Se resuelven numéricamente los sistemas de ecuaciones diferenciales de los modelos para (i) vivienda rural en la zona endémica mencionada y (ii) en la ciudad de Buenos Aires. Se deducen las expresiones analíticas de la cantidad de individuos en la dispersión inicial de la infección. Se planteó el modelo urbano en su versión estocástica, obteniéndose la resolución numérica del número esperado de individuos en cada una de las cuatro etapas consideradas.

Abstract:
Deterministic and stochastic mathematical models were formulated in order to get a better understanting of the development and mechanisms associated with the dispersion of the disease. The significance of the classification in three stages of infected individuals (acute stage, indeterminate chronic stage, and chronic stage with apparent symptoms), is stressed. Besides the human population, the deterministic model in the rural scenario involved both, the insect and the dog populations (which are the basic domestic reservoirs of T. cruzi when the insect is present). Three transmission mechanisms were considered: vectorial, congenital and through blood transfussions. Given the expansion of the disease from rural endemic zones toward the Latinoamerican cities caused by migratory streams, thus generating a public health issue in Canada, USA, European countries, Australia and Japan, the model of the so called “urban Chagas” is analyzed as well, in which only human beings are considered as the T. cruzi carriers. Expressions were obtained (and interpreted) from the next generation matrix and the basic reproductive numbers are calculated from it. Two estimations were obtained corresponding to two different scenarios: (i) endemic zone (Argentine Chaco) and, (ii) city of Buenos Aires. The systems of differential equations corresponding to (i) a farm household in the endemic area and, (ii) Buenos Aires city, are numerically solved. Analytical expressions for the number of individuals in the initial phase of the disease dispersion are obtained. A stochastic urban model of differential equations was constructed and numerically solved for the expected number on individuals in each of the four stages considered for the disease.

Facciuto, Gabriela R.. "Auto-incompatibilidad de acción tardía e hibridación interespecífica en el género Tabebuia A.I. Gomes ex DC (Bignoniaceae): estudios relacionados con el desarrollo reproductivo" (2007). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Objetivo: El objetivo general de esta tesis fue el estudio de los mecanismos de autoincompatibilidad y compatibilidad interespecífica en el género Tabebuia. Principales resultados y conclusiones: Se comprobó la existencia de un sistema de auto-incompatibilidad, que opera en las tres especies estudiadas: T. heptaphylla, T. alba y T. pulcherrima. El sistema de auto-compatibilidad pudo ser categorizado como de acción tardía al comprobarse que en los pistilos auto-polinizados, los tubos polínicos crecen hasta el ovario. En la auto-polinización de las tres especies, se comprobó que, aunque la doble fecundación es eficiente, la abscisión de los pistilos, que se produce entre los 4 y 6 DPP, pone en evidencia que los cruzamientos son auto-incompatibles. Durante este período, el endosperma alcanza el estado de 8-células y el cigoto permanece indiviso. La abscisión de los pistilos en un mismo estado de desarrollo del endosperma permitió confirmar que se trata de un sistema de auto-incompatibilidad y no de depresión por endogamia. Se detectó que la velocidad de crecimiento de los tubos polínicos fue mayor en la polinización cruzada con respecto a la auto-polinización. Por inducción de poliploidía se obtuvieron individuos tetraploides auto-compatibles y luego triploides estériles. Se obtuvieron híbridos a partir de los siguientes cruzamientos: T. pulcherrima x T. heptaphylla, T. heptaphylla x T. alba y T. pulcherrima x T. crysotricha. Se comprobó la existencia de incompatibilidad unilateral en el cruzamiento entre T. heptaphylla y T. alba. Se determinó que los mecanismos de incompatibilidad operan previo a la fecundación. En las diferentes combinaciones, se identificaron patrones diferentes de deposición de calosa en los tubos polínicos, lo que indica mecanismos diferentes de incompatibilidad. La propagación de clones selectos de T. heptaphylla por el método de injerto, mantuvo las características de los mismos.

Abstract:
Objective: the main objective of this thesis was the study of self-incompatibility and interspecific compatibility mechanisms in the genus Tabebuia. Main Results and Conclusions: The existence of self-incompatibility was proved in T. heptaphylla, T. alba y T. pulcherrima. The incompatibility system was categorized as late-acting self-incompatibility because the pollen tubes reach the ovary in selfpollinated pistils. While double fertilization was verified in self-pollinated pistils from the three species, pistils abscission, produced between 4 and 6 days post pollination, demonstrated incompatibility. During this period, the endosperm reached 8–cellular stage and the zygote remain undivided. Pistils abscission, always in the same endosperm developmental stage confirmed the existence of a self-incompatibility system, rather than inbreeding depression. Pollen tube growth was faster in cross pollination than in self pollination. Polyploidy induction permitted the acquisition of self-compatible tetraploids, and later sterile triploids. Interspecific hybrids were obtained from the following crossings: T. pulcherrima x T. heptaphylla, T. heptaphylla x T. alba and T. pulcherrima x T. crysotrycha. The occurrence of unilateral incompatibility was confirmed in T. alba x T. heptaphylla. Incompatibility mechanisms were proved to operate prior to fecundation. Different callose deposition patterns were identified in pollen tubes in the different cross combinations, indicating different incompatibility systems. Propagation of T. heptaphylla by grafting maintained selected clones' characteristics.

Fachinetti, Carolina. "Coloración del plumaje, sistema de apareamiento y elección de pareja en el Capuchino Canela (Sporophila hypoxantha)" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El Capuchino Canela, Sporophila hypoxantha, es una especie sexualmente dicromática, siendo los machos adultos más coloridos y los machos juveniles indistinguibles a simple vista de las hembras. Poco se conoce sobre esta especie y los objetivos de este trabajo fueron estudiar algunos aspectos de su biología reproductiva y el posible rol de la coloración de los machos en la elección de pareja por parte de las hembras y/o en la competencia intraespecífica. Se estudió el sistema de apareamiento social y genético y la participación de machos y hembras en el cuidado parental de los huevos y/o pichones, utilizando filmaciones de nidos y herramientas moleculares. Por otro lado, se analizaron la microestructura de cortes de bárbulas de machos y hembras y la maduración de la coloración del plumaje de los machos, evaluando si existen diferencias cripticas con la coloración del plumaje de las hembras utilizando espectrofotometría de reflectancia y un modelo visual de discriminación del color. Finalmente, en experimentos con animales en cautiverio, se evaluó si la elección de pareja por parte de las hembras y la dominancia en contiendas por acceso a recursos estaban asociadas a la coloración y/o edad de los machos. El Capuchino Canela presenta monogamia social con cuidado biparental sesgado hacia las hembras. Sin embargo, se encontró que existe un mínimo del 13% de los pichones que son el resultado de fertilizaciones por fuera de la pareja social, lo que indica que el sistema de apareamiento social difiere del genético. La coloración del pecho es principalmente el resultado de la presencia de melanina y las diferencias observadas en la coloración de machos adultos y hembras se debe principalmente a la concentración de los gránulos de melaninas, mientras que las diferencias entre machos adultos y juveniles, a la distribución de los mismos en las bárbulas. La coloración de la corona es principalmente estructural, y las diferencias entre machos adultos y hembras se deben a diferencias en la organización de los gránulos de melanina en las bárbulas. Los machos presentan maduración tardía del plumaje adquiriendo el plumaje definitivo a los dos años de edad, y durante el primer año de vida, si bien parecen ser indistinguibles de las hembras, presentan diferencias en la coloración del pecho y de la corona que podrían ser percibidas por su sistema visual. En los experimentos de elección de pareja y dominancia se observó que las hembras no mostraron una clara preferencia por la coloración o edad de los machos, y que la coloración del pecho de los machos no parece ser un indicador de la dominancia social bajo estas condiciones de estudio.

Abstract:
The Tawny-bellied Seedeater, Sporophila hypoxantha, is a sexually dichromatic species, with adult males more colorful and juvenile males indistinguishable from females. Little is known about this species and the aims of this work were to study some aspect of the reproductive biology and evaluate if male coloration is a sexually selected trait or an indicator of male social dominance. I studied the social and genetic mating system and the extent of parental care provided by females and males using videotapes of nest activity and molecular tools. I also examined electronic micrographs of barbules from males and females and studied plumage maturation of males and determined if juvenile males and females differ in plumage coloration using reflectance spectrometry and an avian model visual system. Finally, I conducted mate choice and dominance experiments in captivity. I found that the Tawny-bellied Seedeater is a social monogamous species with biparental care biased towards the females. However, I found a minimum of 13% of young that were the result of extra pair fertilizations, which indicates that the social and genetic mating systems are different. Breast plumage coloration was melanin-based, the differences between adult males and females were the result to differences in melanin concentration, while differences between adult and juvenile males were the result of differences in the distribution of the pigment in the barbules. Crown coloration was mainly structurally-based, and the differences between adult males and females were the result to differences in the organization of the melanin granules in the barbules. Males showed delayed plumage maturation and acquired the definitive plumage before the second reproductive season. During the first year of life juvenile males were distinguishable from females in breast and crown coloration and these differences can be detected by the visual system of conspecifics. Finally, in mate choice and dominance experiments, females did not show a clear preference for males breast coloration or age, and breast coloration of males appears not to be an indicator of social dominance under my experimental conditions.

Factorovich, Matías Héctor. "Termodinámica del agua en sistemas nanoscópicos" (2015-12-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Termodinámica del agua en sistemas nanoscópicos. En este trabajo de tesis se investigaron fenómenos físico-químicos que se ponen de mani- fiesto en sistemas confinados y de escala nanométrica. Se analizaron dos tipos de sistemas principalmente: (i) clusters de agua en equilibrio con su vapor y (ii) Agua confinada interactuando con superficies de distinta hidrofobicidad a nivel nanoscópico. Los clusters de agua suponen sistemas de interés que ponen a prueba las ecuaciones fundamentales y las hipótesis de la termodinámica macroscópica. La variación de la presión de vapor con la curvatura de una superficie está descrita por la ecuación de Kelvin y la corrección de Tolman para la tensión superficial, donde ambas se derivan bajo las suposiciones de la termodinámica macroscópica. La capacidad de estas ecuaciones de describir la presión de vapor en sistemas nanoscópicos es cuestión de controversia en la literatura. Por esto se investigó el rango de aplicabilidad de estas ecuaciones encontrando que su validez se extiende a tama~nos muy peque~nos, y que a su vez es posible justificar sus desviaciones con argumentos termodinámicos. Entender cómo se modifica la presión de vapor de estos agregados, ya sean puros o en mezclas binarias o ternarias, juega un papel central en la comprensión del proceso de generación de aerosoles en la atmósfera. Sin embargo, esta información no es de fácil acceso a través de experimentos, ni por simulaciones. El confinamiento en materiales nano y mesoporosos produce cambios en las propiedades físico-químicas del agua, y supone un medio muy prominente para distintas aplicaciones tecnológicas como (foto)catálisis, sorción, sensores, biomateriales, etc. Es por esto que resulta importante el estudio básico de estas propiedades. En particular se estudió el fenómeno de equilibrio líquido-vapor en nanoporos, adsorción (condensación capilar) y desorción en equilibrio y fuera del equilibrio (cavitación), en función de la hidrofilicidad de superficies tanto homogéneas como heterogéneas, las cuales se caracterizaron en términos del ángulo de contacto y la energía de adsorción. Para realizar el trabajo planteado se recurrió a diversas herramientas computacionales. Se utilizó el programa de código abierto LAMMPS para realizar dinámicas moleculares. Se implementó una rutina de Monte Carlo de intercambio de partículas con un reservorio gaseoso que permite trabajar a potencial químico (μ) constante y de esta forma determinar la presión de vapor de un sistema. Se desarrolló un esquema de simulación que permite calcular presiones de vapor en sistemas que presentan interfase y que puede aplicarse independientemente de la geometría de esta, al que se llamó barrido gran canónico (GCS) por sus siglas en inglés. A su vez se desarrollaron diversas herramientas de análisis de datos basadas en protocolos de bibliografía para determinar ángulos de contacto y energía de adsorción.

Abstract:
Thermodynamics of water in nanoscopic systems. In this thesis, physico-chemical phenomena that are apparent in confined and nanoscale systems were investigated. Mainly two types of systems were analyzed: (i) water clusters in equilibrium with its vapor and (ii) confined water interacting with surfaces of different hydrophobicity at the nanoscopic level. The water cluster systems are interesting because they put to test the fundamental equations and assumptions of macroscopic thermodynamics. The variation of vapor pressure with respect to the curvature of a surface is described by the Kelvin equation and Tolman's correction to the surface tension, both derived under the assumptions of macroscopic thermodynamics. The ability of these equations to describe the vapor pressure in nanoscale systems is a matter of controversy in the literature. Thus, the range of applicability of these equations was investigated, finding that it extends to very small sizes, whereas the deviations can be explained via thermodynamic arguments. Understanding how the vapor pressure is modified in this kind of aggregates, whether pure, in binary, or ternary mixtures, plays a central role in understanding the process of aerosols generation in the atmosphere. However, this information is not easily accessible through experiments or by simulations. The confinement in nano and mesoporous materials causes changes in the physicochemical properties of water and poses a very prominent media for new technologies such as (photo)catalysis, sorption, sensors, biomaterials, etc. This is why it is important to achieve a basic understanding of these properties. In particular, focus was made on the vapor-liquid equilibrium in nanopores, adsorption (capillary condensation) and desorption in equilibrium and out of equilibrium (cavitation), as a function of the hydrophilicity of homogeneous and heterogeneous surfaces, which were characterized in terms of contact angle and adsorption energy. To perform the proposed work various computational tools were required. The LAMMPS open source program was used for molecular dynamics. It was modified with a Monte Carlo routine that exchanges particles with a gas reservoir, thus allowing to perform simulations at constant chemical potential (μ) and to determine the vapor pressure of a system. A simulation scheme to calculate vapor pressures on interfaces of any geometry was proposed, and called Grand Canonical Screening (GCS). Also various data analysis tools based on literature protocols were implemented, to determine contact angle and the adsorption energy on the different surfaces.

Faerman, Sara. "Aplicación de la técnica de Dobbins-Southern a la separación del tercer grupo de cationes" (1946). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Faigón Soverna, Ana. "Bases genéticas y moleculares de la interacción entre las respuestas fotomorfogénicas y las de defensa frente a patógenos" (2007). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La luz es uno de los principales factores ambientales que regulan el crecimiento y desarrollo de las plantas. A lo largo de su ciclo de vida, desde la germinación hasta la floración, las plantas monitorean la intensidad, la longitud de onda, la dirección y la duración de la luz y utilizan la información del ambiente lumínico para optimizar su desarrollo. La percepción de las señales lumínicas está mediada por fotorreceptores específicos como los fitocromos, del rojo al rojo lejano. En Arabidopsis thaliana, existen 5 fitocromos diferentes (PHYA, PHYB, PHYC, PHYD y PHYE). La percepción de los cambios en el ambiente lumínicos asociados a la presencia de plantas vecinas acelera el crecimiento de los tallos, la floración e induce la hiponastia. Conjuntamente estos cambios en el desarrollo se denominan síndrome de escape al sombreado y están mediados principalmente por el PHYB. Este trabajo aporta nuevos elementos para comprender los mecanismos implicados en la transducción de las señales lumínicas en plantas a través de la identificación de nuevos componentes involucrados en la vía de señalización del fitocromo B. En esta tesis se aisló y caracterizó al mutante csa1 (del inglés constitutive shade avoidance) por presentar el síndrome de escape al sombreado aún creciendo en condiciones no inductivas. csa1 posee una inserción de T-DNA en el segundo exón de un gen TIR-NBS-LRR (del inglés Toll/Interleukin1 receptor-nucleotide binding site-leucinerich repeat), generando así una proteína truncada que interfiere en la señalización de otras proteínas con dominios TIR. Hasta el momento las proteínas TIR-NBS-LRR habían sido implicadas únicamente en las respuestas de defensa en plantas; nuestros resultados indican que además estarían involucradas en la modulación de la vía de señalización del fitocromo B a través de la regulación de la expresión de PIF3. Además, detectamos que los niveles de expresión de los genes PIF3 y PIF4 (dos genes involucrados en las respuestas ftomorfogénicas) varían luego de la infección con Pseudomonas syringae. Finalmente, los resultados de estas tesis muestran que el mutante eds4 aislado originalmente por ser hipersensible a la infección con bacterias, está afectado en las vías de transducción de las señales lumínicas. En conjunto, los resultados de este trabajo constituyen el primer paso para comprender los mecanismos moleculares implicados en la interacción o cross-talk entre las vías de señalización que conducen a las respuestas foromorfogénicas y las que regulan las respuestas de resistencia frente al ataque de los patógenos.

Abstract:
Light is a critical factor for plant development. Plants monitor the intensity, quality, direction and duration of light and use the information to adapt and optimize their growth and development. Perception of light signal is mediated by specific photoreceptors such as phytochromes. Phytochromes are encoded by a family of five genes in Arabidopsis thaliana (PHYA, PHYB, PHYC, PHYD y PHYE). In plants, light signals generated by the presence of neighbors accelerate stem growth, flowering, and induce a more erect position of the leaves, a developmental strategy known as shade-avoidance syndrome. PHYB is the major contributor to shade avoidance responses. In this work we shed light on the mechanisms of light transduction, identifying new PHYB signaling components. We describe the constitutive shade-avoidance 1 mutant (csa1), which shows a shade- avoidance phenotype in the absence of shade. This mutant has a T-DNA inserted within the second exon of a Toll/Interleukin1 receptornucleotide binding site-leucine-rich repeat (TIR-NBS-LRR) gene, which leads to the production of a truncated protein that, in turn, interferes with TIR-proteins signaling. So far, TIR-NBS-LRR proteins had been only implicated in pathogen defense responses in plants. Our results show that they are also involved in PHYB signaling modulation, regulating PIF3 gene expression. In addition, we detected that PIF3 and PIF4 (two genes implicated in photomorphogenic responses) mRNA level changes after Pseudomonas syringae infection. Finally, we show that the eds4 mutant, which was originally isolated for displaying enhanced disease susceptibility to P. syringae, it is also defective in light signaling. Taken together, our findings constitutes a first step towards understanding the molecular mechanisms underlying the cross talk observed between photomorphogenic and defense responses.

Faillace, María Paula. "Estudio de la participación de la melatonina en la fisiología de la retina de Hámster Dorado" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La melatonina caracterizada originalmente en la glándula pineal fue más tarde identificada en la retina de diversas especies, así como las enzimas involucradas en su síntesis, la serotonina-N-acetiltransferasa (NAT) y la hidroxiindol-O-metiltransferasa (HIOMT). El hámster dorado ha sido considerado frecuentemente el modelo clásico para el estudio de la melatonina pineal, sin embargo, la melatonina retiniana en esta especie ha recibido relativamente poca atención. El objetivo de este trabajo de tesis consistió en examinar la biosíntesis del metoxiindol en la retina del hámster, así como elucidar algunos de los mecanismos involucrados en la regulación de su síntesis y su posible rol fisiológico a nivel local. En este sentido, se describe por primera vez la presencia de un ritmo en el contenido retiniano de melatonina en el hámster dorado, con valores máximos en la segunda mitad de la noche. La síntesis de melatonina en la retina del hámster es independiente de la actividad pineal. Asimismo, se demuestra la capacidad de las retinas aisladas de sintetizar melatonina. La síntesis de melatonina es regulada directamente por la señal fótica ambiental, sin indicación de la existencia de un ritmo de naturaleza endógena en los experimentos realizados en este trabajo. El GABA, postulado como un neurotransmisor retiniano regulatorio de procesos asociados a oscuridad, estimula la producción in vitro de melatonina retiniana, probablemente a través de receptores de tipo A, en tanto que antagonistas específicos del receptor GABAA suprimen el incremento in vitro de melatonina en oscuridad. El "turnover" de GABA es máximo en la fase de oscuridad y precede al aumento en el contenido de melatonina. En conjunto, estas evidencias sugieren que el GABA actúa como intermediario entre la señal de oscuridad y la inducción de la síntesis del metoxiindol. El AMPc ha sido postulado como la señal intracelular involucrada en la inducción génica de la NAT retiniana. La existencia de una correlación temporal entre el ritmo en el contenido de AMPc y el de melatonina (ambos regulados de manera análoga por la señal fótica ambiental) avala resultados previos. Sin embargo, en este trabajo se postula adicionalmente que el GMPc participa en la regulación de la síntesis de melatonina retiniana, tanto por sus efectos in vitro, como por la correlación temporal entre las variaciones diarias de ambas moléculas. Considerando que el GABA estimula la acumulación de GMPc, pero inhibe la de AMPc, se sugiere que el efecto gabaérgico sobre la síntesis de melatonina podría estar mediado por el incremento en los niveles de GMPc retinianos. Por otra parte, se demuestra que la melatonina estimula la producción de GMPc, a través de una acción dual sobre la síntesis y degradación, ambos efectos tendientes al incremento en los niveles del nucleótido cíclico. La activación de la enzima de síntesis, así como la inhibición de la enzima de degradación podrían ocurrir a través de la disminución de los niveles de calcio citoplasmático. En este sentido, la melatonina inhibe en forma inmediata (luego de 10 seg) la captación de 45Ca2+ en fracciones sinaptosomales crudas. La melatonina incrementa la captación de 3H-glutamato, a través de un mecanismo independiente del calcio extracelular, así como la liberación de 3H glutamato, por un mecanismo dependiente del catión. La exposición más prolongada a melatonina (durante 20 min) estimula la captación de 45Ca2+ por fracciones crudas sinaptosomales. Considerando que análogos permeables del GMPc provocan efectos similares a los de la melatonina sobre estos parámetros, el metoxiindol podría actuar a través del incremento en el contenido del nucleótido. En este trabajo de tesis, se describe también la presencia de receptores específicos, de alta afinidad, con un perfil farmacológico compatible con el descripto para receptores de melatonina de tipo ML-1. Los resultados sugieren además que estos receptores podrían estar acoplados con una proteína G inhibitoria. De este modo, la melatonina disminuye significativamente los niveles retinianos de AMPc, quien a su vez podría actuar como un segundo mensajero del metoxiindol y/o regular negativamente su propia síntesis. En todos los casos, los efectos de la melatonina fueron dependientes del horario, mostrando una alta correlación con la variación diaria en la concentración de receptores al metoxiindol. La densidad máxima se observó a la medianoche, coincidiendo con el horario de máxima sensibilidad. La variación diaria en la concentración de sitios receptores podría deberse a mecanismos de "up y down-regulation" inducidos por el ligando endógeno. En conjunto, los resultados obtenidos permiten postular la participación de la melatonina retiniana en los mecanismos de transducción y procesado de la información fótica como una señal "senso-parácrina", es decir una molécula sintetizada y liberada por los fotorreceptores en respuesta a un estímulo sensorial (la oscuridad) y que actúa localmente modulando diversos aspectos de la fisiología retiniana.

Abstract:
Melatonin was initially characterized in the pineal gland and later identified in the retina of several species, along with its synthesizing enzymes serotonin N-acetyltransferase (NAT) and hydroxyindole-O-methyltransferase (HIOMT).% Although the Golden hamster is one of the most widely used models in the investigation of pineal melatonin physiology, retinal melatonin in this species has received relatively little attention. The aim of this work was to examine the biosynthesis of melatonin in the hamster retina, as well as to elucidate the mechanisms involved in the regulation of its synthesis. Additionally, some aspects of the physiological role of retinal melatonin were tudied. A daily rhythm in hamster retinal melatonin levels, which peaks late in the night, as well as the ability of the hamster retina to regulate melatonin synthesis in isolated conditions, were found. Melatonin synthesis was independent on pineal activity. and was directly regulated by photic stimuli. In fact, a circadian rhythm was absent in the ex vivo experiments performed under free running conditions. GABA, a retinal transmitter that mediates dark-related processes, stimulated melatonin synthesis in vitro, probably acting through a GABAA receptor.% Moreover, the dark-induced increase in melatonin production was blocked by a specific GABAA antagonist receptor (bicuculline). Retinal GABA turnover was maximal at night and preceded the increase of melatonin levels by about 4 hours. These results indicate that GABA could be the intercellular message linking darkness with melatonin biosynthesis. Cyclic AMP has been postulated as the intracellular messenger involved in the genomic induction of retinal NAT. A temporal correlation between melatonin and cAMP content (mainly influenced by the photic stimulus), which supports previous studies, was observed. A significant increase of melatonin synthesis stimulated by cGMP analogs, and a temporal relationship between rhythms in cGMP levels and melatonin content were also described. Considering that GABA stimulates cGMP and decreases cAMP accumulation, GABA effects on melatonin synthesis could be mediated by an increase in cGMP levels. A dual effect of melatonin on cGMP biosynthesis was described, i.e. by increasing its synthesis and by inhibiting its degradation, both resulting in an increase of cGMP levels. This effect could occur by rapid (about 10 sec) melatonin inhibition of calcium uptake, since calcium could inhibit retinal guanylate cyclase and stimulate retinal phosphodiesterase activities. Melatonin significantly increased 3H-glutamate uptake, this effect persisting in a Ca2+-free medium. On the other hand, melatonin increased 3H-glutamate release through an effect that was Ca2+ sensitive. Melatonin significantly increased 45Ca2+ uptake by a crude synaptosomal retinal fraction, after a 20 min incubation. Taking into account that melatonin affects the cGMP system and that 3H-glutamate uptake and release and 45Ca2+ uptake were stimulated by cGMP analogs, these results suggest that melatonin could increase 3H-glutamate release by increasing cGMP levels. The presence of specific high-affinity receptors, showing a pharmacological profile consistent with a ML-1-like site, was also demonstrated. In addition, an equipotent decrease in the total specific binding of 2--melatonin caused by GTP and GDP suggested that these binding sites could be G inhibitory protein-coupled receptors. Likewise, melatonin significantly decreased cAMP accumulation. This cyclic nucleotide might act as a second messenger for melatonin action, and/or regulate melatonin biosynthesis by a negative feed-back mechanism. In all cases, melatonin effects occurred in a time-dependent manner, showing a high correlation with daily variations in 2--melatonin specific binding sites density found in hamster retina. Maximal density was observed at 24.00 h in coincidence with the maximal sensitivity window for the melatonin effects. Daily variations in the density of melatonin binding sites is probably regulated through up- and down-regulation mechanisms, induced by melatonin on its own binding sites. Collectively, the foregoing results suggest that in the hamster retina, melatonin could participate in the photic information transduction or processing mechanisms, as a "sensory-paracrine" signal. In fact, melatonin is released by photoreceptor cells in response to a sensorial stimulus (darkness), and acts locally by modulating several aspects of retinal physiology.

Falibene, Agustina L.. "Modulación del comportamiento alimentario en hormigas: fisiología de la ingestión de néctar" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La alimentación es un comportamiento complejo cuya regulación involucra la integración de factores externos e internos. En insectos sociales este comportamiento no solo varía de acuerdo a las características del alimento y las condiciones ambientales sino que también de acuerdo a los requerimientos de la colonia. En este trabajo combinamos estudios de comportamiento, electrofisiológicos, farmacológicos e inmunocitoquímicos para estudiar cómo distintos factores afectan la ingestión de soluciones azucaradas en la hormiga Camponotus mus. Nuestros estudios mostraron que el ayuno de la colonia determina la motivación recolectora de la hormiga forrajera modificando la concentración umbral de aceptación y su comportamiento de ingestión no solo de soluciones azucaradas sino también de cebos tóxicos. Durante la ingestión, el accionar de la bomba de succión estuvo determinado por el ayuno de la colonia, la temperatura ambiental, la concentración de sacarosa y la presencia de tóxico en la solución. Cambios en estas variables dieron lugar a variaciones en la velocidad y el tiempo de ingestión a través de la modulación de la frecuencia de bombeo, el volumen de solución incorporado por cada bombeo o el número de bombeos totales. Indagamos sobre los mecanismos neuroendócrinos involucrados y encontramos un efecto depresivo de la serotonina sobre la ingestión. También observamos la presencia de neuronas serotoninérgicas en los centros nerviosos involucrados en el control de la alimentación e inervaciones serotoninérgicas a lo largo del tubo digestivo. En conjunto, estos resultados nos permiten una comprensión integral de cómo distintos factores modelan el comportamiento de ingestión en hormigas y cómo esto se integra con estratégias de recolección eficientes en condiciones siempre cambiantes.

Abstract:
Feeding is a very complex behaviour and its regulation requires the integration of both internal and external factors. Social insects present a special case: not only do the quality of food and the environmental conditions determine their feeding behaviour, but also the colony´s requirements. In the present work we combined behavioural, electrophysiological, pharmacological and immunocitochemical studies in order to investigate how different factors affect the nectar ingestion in the ant Camponotus mus. Our results showed that colony starvation determines forager motivation by modifying its acceptance threshold and its feeding behaviour not only of sucrose solutions but also of toxic baits. During ingestion, sucking pump activity was determined by colony starvation level, ambient temperature, sucrose concentration and presence or not of toxic in the ingested solution. Changes in these variables prompted variations in the intake rate and the feeding time by modulating the pumping frequency, the volume uptake per pump contraction or the total number of pump contractions. We explored the neuroendocrine mechanisms involved in this regulation and we found a depressant effect of serotonin on food intake. We also observed the presence of serotonin immunoreactive cell bodies on the main nervous centres involved in feeding control and serotonergic innervation along the digestive tube. Alltogether, these results allow for an integral understanding of how different factors model feeding behaviour in ants and how this articulates with efficient foraging strategies in ever-changing conditions.

Falivene, Juliana. "Estudio del impacto del balance Th17/Treg en periferia y en mucosas sobre la funcionalidad de la respuesta celular antiviral y la inmunopatogénesis de la infección HIV/SIDA" (2016-03-08). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las subpoblaciones de linfocitos Th17 y T regulatorios (Treg) han sido relacionados con la progresión a enfermedad en el contexto de la infección por HIV-1. Sin embargo, su relación con la respuesta adaptativa T CD8+ antiviral durante la infección aguda/temprana por HIV (PHI, primary HIV infection) no ha sido aún estudiada. En este contexto, el primer objetivo general de este trabajo de tesis consistió en analizar las subpoblaciones Th17 y Treg y su relación con la respuesta celular T CD8+ específica frente a HIV y parámetros de seguimiento de la infección durante la infección aguda/temprana y hasta un año postinfección (p.i). Para ello se utilizaron muestras de sangre de 14 dadores sanos (DSs), 40 PHI, 17 Crónicos y 13 controladores elite (ECs, Elite Controllers). Los porcentajes de células Th17 y Treg se encontraban severamente alterados en individuos Crónicos, mientras que todos los pacientes infectados con HIV evidenciaron un desbalance Th17/Treg comparados con DSs (incluso ECs), en concordancia con sus mayores proporciones de células T CD8+ activadas (HLA-DR+/CD38+). Un mejor estatus clínico (evidenciado por mayores recuentos de células T CD4+ y menores cargas virales y activación inmune) se asoció con mayores niveles de Th17 y menores niveles de Treg. Notablemente, se encontraron correlaciones positivas entre los niveles basales de Th17 y la funcionalidad de la respuesta T CD8+ específica frente a HIV: la capacidad de suprimir la replicación viral (VIA, viral inhibitory activity) y la proporción de células polifuncionales (IFN-γ+/CD107A/B +) tanto a tiempos tempranos como tardíos p.i, resaltando el valor pronóstico de la subpoblación Th17 en la preservación de una inmunidad celular antiviral más eficiente. La relación Th17/Treg y la intensidad media de fluorescencia relativa (IMFr) de IL-17 también se correlacionaron positivamente con VIA. Debido a la importancia del tratamiento antirretroviral (TARV) en la reconstitución inmune de individuos infectados, a continuación se decidió caracterizar las subpoblaciones Th17, Treg y su balance en sangre periférica y mucosa cervical y su implicancia en la inmunopatogénesis de HIV-1 en ausencia o presencia de TARV. Para ello se utilizaron muestras de 19 individuos TARV+ (más de 2 años con supresión efectiva de la CV), 22 pacientes crónicamente infectados naïve de tratamiento (TARV-) y 20 DSs. Tras el tratamiento, tanto la frecuencia de Th17 como la relación Th17/Treg en periferia alcanzaron valores similares a los observados en DSs, en contraste a lo observado en células Treg cuyos niveles se mantuvieron altos. Asimismo, en individuos TARV+ se observó una disminución de los niveles de activación inmune a pesar de lo cual no se alcanzaron valores normales, hallándose correlaciones negativas entre los niveles de activación celular y el balance Th17/Treg. Por otro lado, mayores niveles de la citoquina proinflamatoria IL-1β en exocervix se correlacionaron positivamente con los niveles de activación celular periféricos, sugiriendo que existiría una relación entre los niveles de inflamación sistémicos y lo observado en sitios de mucosas. Es importante destacar que el tratamiento no indujo un incremento de los recuentos de células T CD4+ CD161+ (subpoblación de células precursoras de Th17 que migran a intestino) los cuales resultaron significativamente menores a los observados en DSs. Asimismo, al estudiar el patrón de secreción de citoquinas por parte de células mononucleares de cérvix (CMCs) estimuladas, se observó que las CMCs provenientes de individuos TARV+ secretan menores niveles de IL-17A e IL-10 en relación a las de DSs. En conjunto, los resultados de la presente tesis sugieren, por un lado, la existencia de una potencial relación entre la subpoblación Th17 y el balance Th17/Treg con respuestas T CD8+ HIV-específicas que juegan un rol clave en la contención de la infección. Por otro lado, aunque el tratamiento antirretroviral parece tener un impacto positivo sobre la restauración de las funciones inmunes a nivel sistémico, tanto los niveles de precursores de células Th17 que migran a intestino como la secreción de IL-17A e IL-10 por CMCs no alcanzaron valores normales, sugiriendo que en sitios de mucosas la restauración inmune es incompleta.

Abstract:
Th17 and Treg subsets have been related to disease progression during HIV-1 infection. However, the potential relation of these T cell subsets with antiviral T-cell responses during primary HIV infection (PHI) has not been studied yet. In this context, the first aim of this study was to analyze Th17 and Treg subsets and their relation with anti-HIV T-cell responses and clinical parameters during PHI and up to one year post-infection (p.i). Samples from 14 healthy donors (HDs), 40 PHI patients, 17 Chronics, and 13 Elite controllers (ECs) were studied. The percentages of Th17 and Treg subsets were severely altered in Chronics, whereas all HIV-infected individuals (including ECs) showed Th17/Treg imbalance compared to HDs, in concordance with higher frequencies of activated CD8+ Tcells (HLA-DR+/CD38+). Better clinical status (higher CD4+ T-cell counts, lower viral loads and immune activation) was associated with higher Th17 and lower Treg levels. Positive correlations were found between Th17 at baseline and anti-HIV CD8+ T-cell functionality: viral inhibitory activity (VIA) and key polyfunctions (IFN-γ+/CD107A/B +) at both early and later times p.i, highlighting the prognostic value of Th17 cells to preserve an effective antiviral T-cell immunity. Th17/Treg ratio and the IL-17 relative mean fluorescence intensity were also positively correlated with VIA. Due to the importance that antiretroviral treatment (ART) has in the immune reconstitution of HIV+ patients, the second aim of this study was to characterize Th17 and Treg subsets and their balance in peripheral blood and female genital tract and their implications in the immunopathogenesis of HIV-1 infection comparing ART+ with ARTpatients. Samples from 19 HIV+ ART+ patients (more than 2 years under treatment), 22 HIV+ ART naïve patients (ART-) and 20 HDs were used. After treatment, both the frequency of Th17 cells as well as Th17/Treg ratio in peripheral blood reached similar levels compared to HDs, in contrast to that observed for Treg cells that remained at high levels despite ART. Also, ART was accompanied by a reduction in the immune activation levels, yet not to normal values, finding negative correlations between cellular immune activation and Th17/Treg ratio. On the other hand, high levels of the proinflammatory cytokine IL-1β in exocervix samples were positively correlated with higher levels of cellular immune activation in the blood, suggesting a relationship exists between systemic and mucosal activation/inflammation. Importantly, ART did not induce a proper restoration of CD4+ CD161+ T-cell counts (a subset of Th17 precursor cells with GALT homing properties) which were significantly lower compared to HDs. Interestingly, it was observed that cervix mononuclear cells (CMCs) from ART+ subjects secreted lower amounts of IL-17A and IL-10 upon stimulation than those obtained from HDs. Taken together, these results suggested, first, a potential link between Th17 and Th17/Treg ratio with key HIV-specific CD8+ T-cell responses against the infection. On the other hand, although ART has a positive impact on immune restoration in blood, both the levels of Th17 precursor subset with GALT homing properties and the ability of CMCs to secrete IL-17A and IL-10 did not reach normal values, suggesting that immune restoration at mucosal sites is impaired or incomplete.

Falsetti, Marcela Cristina. "Dimensión de Minkowski, autosimilaridad y aplicaciones" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo abordamos el estudio de algunos tópicos de Geometría Hactal y se presenta en dos partes. Comenzamos con un análisis de aspectos teóricos y prácticos de la dimensión de Hausdorff y de la dimensión de Minskowski, dado que la dimensión es un parámetro esencial para estudiar conjuntos fractales. Usando integración de medidas unidimensionales, se encuentra un método alternativo para el cálculo de la dimensión de Minkowski para cualquier conjunto acotado del plano. Este abordaje es computacionalmente más eficiente que el cálculo directo de la dimensión de Minkowski (see , ). De los conjuntos en general ponemos especial interés en las curvas. Las curvas, y especialmente las “curvas fractales”, son importantes pues modelizan una amplia clase de fenómenos naturales tales como costas geográficas, señales de sonido, etc. El caso de curvas planas ha sido tratado por Tricot (ver ) quien desarrolló un análisis de las mismas basado en parámetros geométricos asociados a conjuntos convexos. La idea es aproximar el engordado de una curva por cápsulas convexas de subarcos y, usando el diámetro y la anchura de dichas cápsulas, obtener una fórmula más simple y eficiente para el cálculo de la dimensión de Minkowski. En este trabajo se realiza un análisis geométrico para. las curvas tridimensionales y se introduce un nuevo parámetro: la anchura secundaria. Se define la clase de curvas expansivas para el caso tridimensional y se encuentra para ellas una fórmula alternativa para calcular dimensión de Minkowski. Finalmente mostramos cómo este abordaje generaliza el desarrollado por Tricot para curvas planas y analizamos las dificultades que aparecen al aumentar la dimensionalidad del espacio de base. En la Segunda Parte presentamos los fundamentos matemáticos de la Compresión Fractal de imágenes. Se revisan los principales modelos matemáticos de compresión fractal que tienen estrecha relación con nuestro trabajo y se explican diferentes modelos para el problema de compresión de imágenes. Estos modelos dependen esencialmente del espacio de representación de las imágenes con niveles de gris: pueden usar medidas o funciones definidas sobre puntos. En particular se analiza el modelo de Codificación por Bloques de J acquin (ver ) y el modelo IFZS (ver ) como ejemplos de uno y otro caso. Se estudia el esquema funcional de Autosimilaridad Generalizada como modelo teórico para resolver el problema inverso para fractales y otros conjuntos. La idea en este caso es la siguiente: dada una función, que representa una imagen o una señal, se quieren encontrar dos conjuntos finitos de funciones i} 1«i«m, y un operador contractivo que los involucra, tal que el punto fijo de ese operador sea una función cercana a la dada. Se presenta un modelo que combina elementos de la Autosimilaridad Generalizada con la codificación por bloques. El mismo permite mayor flexibilidad en la estructura autosimilar de la compresión fractal estandard, un mejor aprovechamiento de la redundacia de la imagen, una completa automatización del algoritmo y control del error de aproximación entre la imagen original y la reconstruida. Por último se muestra la relación entre los modelos funcionales IFZS y de Autosimilaridad Generalizada que están definidos sobre espacios funcionales esencialmente distintos.

Abstract:
This thesis is about Fiactal Geometry and is presented in two parts. Since dimension is an essential parameter to study fractals, in Part I we analyze the theoretical and practical aspects of Hausdorfi dimension and Minskowskidimension. We present a theoretical approach, by using integration of unidimensional measures, for the computation of Minskowskidimension of any bounded planar set. This approach is computationally more efficent than stright computation of the Minkowski dimension (see , ). We are particularly interested in curves. Curves, and specially “fractal curves”, are important because they represent a wide class of natural fenomena such that geographical coasts, sígnals, Brownian motion,etc. Planar curves have been studied by Tricot (see ). He developed an analysis for expansive planar curves based on geometrical parameters associated to convex sets. The main idea is to approximate the e-saussage of a curve by convex hulls of subarcs, obtaining a more simple and eflicient formula for the computation of the Minkowski dimension, by using the diameter and breadth of these convex hulls. In this work we present a geometrical analysis of tridimensional curves and we introduce a new parameter: the secondary breadth. We define the class of expansive curves for the tridimensional case and find an alternative formula for computing he Minskowski dimension. First we need to demonstrate some results about convex sets. We show that this method generalizes the Tricot's approach. In Part II, we present the mathematical foundations of Fractal Block Compression of images. We review the main mathematical models that are closely related to our work and analyze different approaches to the fractal compression problem. They are mainly two possible approaches: the first one uses measures to represent images with grey-levels and the second one uses functions. In particular we review the Block-codingmethod introduced by Jacquin in , as an example of the first approach, and the IFZS method introduced by Cabrelli et al. in as an example of the second one. We study the functional scheme of Generalized Self-Similarity (see and ) as a theoretical model to solve the inverse problem to fractals and other sets. The idea in this case es the following: Given a target function, that represents an image or signal, we must find two finite sets of functions: i} 1«i«m, and a contractive operator that involves these functions, such that the attractor of this operator is a function close to the target. In this thesis we present a model that combines the main ideas of Generalized Self-Similarity and the Block-coding method. It allows more fiexibility in the self-similar structure of standard fractal compression, it takes more advantages of redundancy of the image, and furthemore it enables us to incorporate a complete algorithm automatization and the control of the approximation error. Finally, we show the relation between the IFZS and the Generalized SelfSimilarity models that are defined on essentialy different functional spaces.

Falzone, Tomás Luis. "Estudio de la función del receptor dopaminérgico D4 en el sistema nervioso central a través del análisis de ratones modificados genéticamente" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fanara, Juan José. "Explotación diferencial de los recursos en especies cactófilas de Drosophila" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las especies cactófilas Drosophila buzzatii y D. koepferae son sinmórficas y utilizan como recursos para oviponer y alimentarse los tejidos en descomposición de los cactus tanto en el desarrollo larvario como en la fase adulta. Dado que hay heterogeneidad ambiental en los recursos, fundamentalmente por las diferencias existentes entre los tipos de cactus columnares y las opuntias así como las diferencias entre las especies en ambos casos, el objetivo de la presente tesis es estudiar la adaptación de las dos especies de Drosophila a los diferentes escenarios ecológicos y, a partir de este conocimiento determinar las posibles causas de la biodistribución de D. buzzatii y D. koepferae. Para alcanzar este objetivo, el trabajo experimental se dividió en 3 partes: a) determinación del efecto de la heterogeneidad ambiental sobre un parámetro de vida de gran importancia adaptativa: el tamaño del tórax, y la correlación de este parámetro con el polimorfismo cromosómico en D. buzzatii; b) estudio del efecto de la heterogeneidad ambiental en el mantenimiento del polimorfismo cromosómico de D. buzzatii en una población natural donde los potenciales hospedadores son Opuntia quimilo y O. ficus-indica y c) análisis de la selección de habitat entre las especies D. buzzatii y D. koepferae en la población de Ruinas de Quilmes en la que se encuentra O. sulphurea y T. terschekii(columnar). De acuerdo a los resultados obtenidos, el tamaño del tórax de D. buzzatii mostró una relación significativa entre este carácter morfométrico con las inversiones cromosómicas y con componentes del fitness (longevidad) que sumado a la facilidad de la medición, hacen de este caracter una herramienta importante en los estudios ecogenéticos. En cuanto a los efectos de la heterogeneidad ambiental en el mantenimiento de la variabilidad, se demostró en D. buzzatii que los cariotipos no utilizan diferencialmente los recursos presentes en la población de Termas de Río Hondo: O. quimilo y O. ficus—indica. En cuanto a la capacidad de D. buzzatii y D. koepferae de colonizar opuntias y cactus columnares se observó que la misma es factible aunque se demostró que D. buzzatii preferiría las opuntias mientras que D. koepferae los columnares siendo estas diferencias explicadas por efectos de oviposición y viabilidad.

Fanelli, Silvia Laura. "Alteraciones en los lípidos nucleares hepáticos debidas a la activación in situ del tetracloruro de carbono a radicales libresAlterations in hepatic nuclear lipids due to in situ carbon tetrachloride activation to free radicals." (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se evidenció que a partir de la activación nuclear hepática del tetracloruro de carbono (CCl4) se forman radicales libres triclorometilo (*CCl3). Los radicales *CC13 y los CCl3O2* derivados de la reacción de los primeros con el oxígeno, promueven reacciones de adición y de abstracción de H desde los lípidos nucleares. Las reacciones de adición son más intensas con los *CCl3 ; mientras que las de abstracción de H son promovidas más fuertemente por los CCl302*. Los *CCl3 se adicionan preferentemente a los ácidos grasos poliinsaturados de los fosfolípidos (PUFA) de la membrana perinuclear. Los CCl3O2* y los *CCl3 abstraen hidrógenos de los PUFA (especialmente ac. araquidónico) e inician procesos de peroxidación de lípidos de la membrana perinuclear que conducen a la formación de aldehídos reactivos (ej. malondialdehído). También abstraen H del colesterol de la membrana perinuclear formando productos de oxidación y cetoderivados del mismo. Por estudio comparativo en dos cepas de ratas con distinta susceptibdidad a sufrir cáncer hepático por efecto del CCl4, se deduce que la intensidad de producción de los radicales *CCl3 en las cercanías del ADN y la unión covalente de los mismos a fosfolípidos específicos, colesterol y ésteres de colesterol podrían tener relación con la susceptibilidad a sufiir los efectos carcinogénicos ejercidos por el CCl4. En resumen: Los resultados evidencian que durante la biotransformación nuclear hepática del CCl4 se forman radicales libres *CCl3 y CCl302*. Dichos radicales interactúan con los lípidos de la membrana perinuclear y generan productos potencialmente capaces de reaccionar o regular la función del ADN y/o las proteínas nucleares, con consecuencias potencialmente graves a nivel celular.

Abstract:
Evidence was provided that during liver nuclear activation of carbon tetracloride (CCl4) trichloromethyl free radicals (*CCl3) are formed. The *CCl3 free radicals produced and the CCl3O2 resulting from the reaction of the former with oxygen, are able to suffer addition and H abstraction reactions. Addition reactions are fundamentally promoted by the *CC13 while H abstraction reactions are mainly attributable to the CCl3O2* free radicals. The *CCl3 preferentially add to the polyunsaturated fatty acids (PUFA) from the perinuclear membrane. The CCl302* and the *CCl3 abstract H atoms from the PUFA (mostly from arachidonic acid) and spark a lipid peroxidation process leading to the production of reactive aldehydes (eg. malondialdehyde). They also perform H abstraction reactions from perinuclear lipid cholesterol moieties to lead to keto and other oxidized products of the steroid. Studyng two strains of rats with different susceptibility to CCl4 hepatic cancer, it was deduced that the intensity of *CCl3 radicals production nearby DNA and regulation protein and the covalent binding with specific phospholipids, cholesterol and cholesterol esters might be related with the susceptibility to suffer the CCl4 carcinogenic effects. In summary: The performed studies evidence that during liver nuclear biotransformation of CCl4, *CCl3 and CCl3O2* radicals are formed. These radicals interact with lipids from the perinuclear membrane to generate products having potential ability to react or regulate DNA and/or nuclear protein function.

Fantini, Lucía. "Evolución cromosómica y divergencia de especies en Cebus y Ateles (Primates: Platyrrhini) desde un enfoque citogenético molecular" (2015-12-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La diversidad de los primates neotropicales (Platyrrhini), analizada en el GIBE a partir de la diversidad cariotípica, ha permitido plantear, al menos, dos posibles “estrategias especiogénicas” generales. Según una de ellas, las inversiones y la variación en heterocromatina constituirían los reordenamientos y cambios distintivos entre especies. La especiación en Platyrrhini, además, ocurriría acompañada de cambios cuantitativos en el genoma. Como ejemplo, Cebus y Ateles, los géneros con mayor proporción de heterocromatina, comparten además un patrón específico de distribución geográfica coincidente con la proporción y presencia de heterocromatina en sus genomas. En este trabajo se analizó la diversidad de especies en Cebus y Ateles tomando como eje la variabilidad en el tamaño del genoma y su influencia en parámetros fenotípicos como la diversidad cariotipíca y la distribución y proporción de heterocromatina. Fueron estimados los tamaños de genoma (Valor C) de 13 especies, entre ellas 3 pertenecientes al género Ateles y 6 del género Cebus. Por medio de Hibridación Genómica Comparativa se identificaron las regiones cromosómicas correspondientes a las diferencias cuantitativas entre los genomas, dentro de cada género. En Ateles, éstas se ubican principalmente en regiones heterocromáticas, aunque también en regiones eucromáticas. Los genomas de menor valor C de Ateles estarían completamente incluidos en los genomas de mayor tamaño, mientras que las regiones de ganancia de ADN detectadas en las especies de mayor valor C sólo corresponderían a amplificaciones o repeticiones del mismo tipo de secuencias, y no a secuencias especie-específicas. Las únicas diferencias cuantitativas entre las especies de Cebus analizadas se hallaron en el cromosoma Y. Como parte del estudio de la evolución del cariotipo primate se estableció el mapa de homologías cromosómicas de A. chamek y Cebus sp. respecto del cariotipo humano, así como también se obtuvo el primer registro de homología entre el cromosoma Y humano y un primate neotropical, mediante FISH con el gen ZFY en Ateles paniscus. Finalmente, se discuten los resultados obtenidos y la divergencia de especies en cada género en el contexto de la citogenética molecular, respecto de la presencia y proporción de heterocromatina y tamaño del genoma. Los hallazgos citogeneticos y los datos genómicos aquí presentados podrían estar indicando que durante los procesos especiogénicos en Cebus y Ateles el genoma se modula complementariamente entre regiones de eucromatina y heterocromatina, pero compensado de distinta manera según el género considerado. Palabras clave: Cebus, Ateles, Valor C, Genoma, CGH, Evolución del cariotipo

Abstract:
The karyotype diversity of Neotropical primates (Platyrrhini) has enabled us to propose at least two possible general "speciation strategies." According to one, chromosomal inversions and variation in heterochromatin are the distinctive chromosomal rearrangements and changes between karyotypes. Also, speciation in Platyrrhini appears to be accompanied by quantitative changes in the genome at inter- e intrageneric level. As an example, Cebus and Ateles, both genus with the highest proportion of heterochromatin, share a specific pattern of geographic distribution corresponding to the presence and proportion of heterochromatin in the genome. In this work, species diversity in Cebus and Ateles was analyzed taking variability in genome size and its influence on phenotypic parameters such as karyotypic diversity and distribution and proportion of heterochromatin as main axis. Genome size (C value) of 13 species were estimated, including 3 belonging to the genus Ateles and 6 of the genus Cebus. Using Comparative Genomic Hybridization (CGH) chromosomal regions associated with quantitative differences among species genomes were identified. In Ateles, these regions are mainly heterochromatic but also euchromatic.. The genomes of Ateles species with small C value are completely included in the genomes of the species with bigger C value. Regions of gained DNA in the bigger genomes represent amplifications or repetitions of sequences of the same type, not speciesspecific sequences. The only quantitative differences between Cebus genomes were located in chromosome Y. Regarding chromosomal evolution in Primates, an homeology map between karyotypes of A. chamek, Cebus sp. and the human is presented. Also the first record of homeology between human chromosome Y and that of a neotropical primate was observed with hybridization of human gene ZFY in A. paniscus. Finally, results and species divergence are discussed in a molecular cytogenetic context, relative to presence and proportion of heterochromatin and genome size. All in all, the cytogenetic and genomic findings and species characterizations here presented seems to point out that genomes, during a speciation process in Cebus and Ateles, are modulated in a complementary fashion between euchromatic and heterochromatic regions, but distinctively balanced in the genus considered. Key words: Ateles, Cebus, C value, genome, CGH, karyotype evolution

Farall, Rodolfo Andrés. "Detección de errores e inhomogeneidades en series de datos meteorológicos" (2016-08-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los problemas de calidad en series de datos meteorológicos resultan principalmente de errores de medición o registro y de cambios en las condiciones de medición o en el entorno de la estación meteorológica (inhomogeneidades). Cuando no se dispone de información adicional (metadata) es necesario contar con una metodología confiable de control de calidad que permita detectar, en una serie de datos meteorológicos proveniente de una estación, errores e inhomogeneidades. En esta tesis se presenta una caracterización detallada de las series de datos de temperatura y precipitación, y se discuten las diferencias entre estos dos tipos de variables. Se introduce un marco conceptual basado en modelos estadísticos para los problemas de detección de errores y de detección de inhomogeneidades (puntos de corte en la serie). Se muestra la importancia de la apropiada selección del modelo y se propone metodología para cada uno de los problemas en los dos tipos de variables meteorológicas. Características de los métodos propuestos para controlar la serie de datos de una estación objetivo: 1) Multivariados, usan las series de observaciones de estaciones cercanas; 2) No hacen supuestos sobre la distribución de los datos; 3) Usan procedimientos de estimación robustos; 4) Atienden a la estructura de correlación presente en la serie de datos; 5) Son capaces de detectar múltiples tipos de inhomogeneidades. Usando datos de modelos numéricos regionales se estudia el desempeño de los métodos propuestos bajo diferentes escenarios.

Abstract:
The lack of quality in climate data is mostly the result of measurement or recording errors and arbitrary changes in the monitoring conditions or surrounding environment (inhomogeneities). When additional information (metadata) is not available, a reliable methodology to detect errors and inhomogeneities is required. In this thesis we present a detailed characterization of temperature and precipitation time series, while discussing their basic differences. We introduce a conceptual framework based on statistical models for the error and inhomogeneity detection issues. The relevance in the choice of the statistical model is shown, and separate methods are developed for both problems and these two main meteorological variables. Main features of the proposed methods, to control the target station time series, are: 1) Multivariate, they use data from nearby stations; 2) No specific assumptions about the distribution of data; 3) Use of robust estimation procedures; 4) They respond to the actual correlation structure present in data; 5) Capable of detecting several types of inhomogeneities. Finally, we study the performance of the methods through the use of numerical regional models under changing scenarios.

Farber, Marisa Diana. "Transducción de señales en Phytomonas (parásitos de plantas)" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Phytomonas es un género de la familia Trypanosomatidae que parasita plantas. Si bien muchos de sus componentes no provocan daño a sus respectivos huéspedes, otros en cambio, son responsables de afecciones que acarrean pérdidas económicas. Tal es el caso de las palmas aceiteras en paises como Colombia, Venezuela y Guyana, el café en Brasil y algunos reportes de daño en algunos frutos como el tomate, tanto en Brasil como en España (Granada). La especie objeto de este estudio no es patogénica y corresponde a la aislada de Euphorbia characias (planta laticífera). Contiene una adenilil ciclasa unida a membranas y un sistema transductor de señales de proteínas G, del tipo Gs y Gi. Estas proteínas afectan la actividad de la adenilil ciclasa y posiblemente participan en un mecanismo que involucra a una señal de tipo hormonal. Si bien no existen evidencias directas de la existencia de un receptor, la proteína del tipo Gi es capaz de interaccionar con el peptido tóxico Mastoparán, que mimetiza la acción de los receptores acoplados a proteínas G. Se analizaron distintas fracciones subcelulares para caracterizar una actividad de quinasa de proteínas modulada por AMPc (PKA). Las fracciones subcelulares purificadas por cromatografía en DEAE-celulosa mostraton dos picos de actividad enzimática frente a histona IIA y a kémptido como sustratos. Usando un anticuerpo policlonal contra la subunidad catalítica de PKA de corazón bovino, se inmunoprecipitó un polipéptido con un peso molecular de 40 kDa. Estos datos en conjunto sugieren la presencia de dos tipos de actividad de quinasa de proteína de pendiente de AMPc (tipo I y 11). Experimentos in vivo con toxina del cólera, dieron como resultado un arresto del ciclo celular del parásito, poniendo en evidencia un efecto ambiguo de la vía de señalización mediada por AMPc, que requerirá de futuros estudios para su profundización. Datos preliminares, aunque incompletos nos dan un primer indicio de la conservación de este tipo de vía en una cepa patógena (responsable del Hartrot de las palmas aceiteras). La extrapolación de los resultados anteriores, nos permitirán diseñar aquellos experimentos tendientes a tratar de develar dónde reside la diferencia de patogenicidad de ambas cepas.

Abstract:
Phytomonas constitutes a genus of flagellated trypanosomatids with the capacity to infect plants. Although these trypanosomatids parasitize many plants species without apparent pathogenicity, in some cases they are responsible for economically important diseases including those affecting Solanum lycopersicum (tomato), Coffea liberica (coffee), Cocos nucifera (coconut), and Elaeis guineesis (oilpalm). Phytomonas sp membranes have an Adenylyl cyclase activity wich is greater in the presence of Mn2+ than with Mg2+. The Mg2+ and Mn2+ activity ratio varies from one preparation to another suggesting that the Adenylyl cyclase has a variable activation state. A GTP- -S binding activity with a Kd of 171 nM was detected in Phytomonas membranes. Incubation of these membranes with activated cholera or pertussis toxin and NAD+ led to incorporation of radioactivity into bands of about 40-44 kDa. Crude membranes were electrophoresed on SDS-polyacrylamide gels and analysed, by Western blotting, with the 9188 anti- s antibody and the AS/7 antibody (anti- t, anti- i1, anti- i2). These procedures resulted in the identification of polipeptides of approximately 40-44 kDa. Phytomonas Adenylyl cyclase could be activated by treatment of membrane preparation with cholera toxin in the presence of NAD+, while treatment with pertussis toxin did not affect this enzime activity. These studies indicate that in Phytomonas, Adenylyl cyclase activity is coupled to an unknown receptor entity trough G s proteins. We have identified two types of cyclic AMP-dependent protein kinase activity in Phytomonas citosol. Criteria to assert authenticity of this activity are the followings: 1- The enzime is specifically activated by cAMP; 2- Specificity for phosphate acceptors characteristic of this type of phosphotransferase activity; 3- DEAE-cellulose fractions specifically binds cAMP; 4- Polyclonal antibodies to bovine heart catalytic subunit immunoprecipitates a 40 kDa phosphorylated polypeptide; 5- As occures with mammalian type II cAMP dependent protein kinase, the activity corresponding to peak II is able to phosphorilate its own "regulatory component" an this doesn't occur with the enzime obtained in peak Y. As the present results were done in Phytomonas isolated from E.characias (a non-pathogenic specie) our next goal is to verify the regulation of this signal pathway in others strains, trying to understand the relationship with the host, and find out, why some of them are responsible of plant's deseases.

Farengo, Ricardo. "Microinestabilidades producidas por gradientes de corriente en plasmas magnetizados" (1984). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Farias, María Belén. "Fricción cuántica: disipación inducida por las fluctuaciones de vacío" (2017-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo estudiamos las manifestaciones macroscópicas de las fluctuaciones cuánticas de vacío, en particular el efecto conocido como la fricción de Casimir, o fricción cuántica. Este fenómeno se produce cuando dos cuerpos son puestos en movimiento relativo (incluso a velocidad constante), y se observa una fuerza disipativa actuando en sentido contrario al movimiento. Este efecto, al igual que el caso más estudiado de la fuerza atractiva entre dos placas neutras conocido como Efecto Casimir, es el resultado de una interacción efectiva entre los dos cuerpos, mediada por el campo electromagnético uctuante, que está presente aun cuando los cuerpos son eléctricamente neutros y no están en contacto (por esta razón, a la fricción cuántica también se la denomina fricción sin contacto). A lo largo de esta tesis analizamos dichos efectos disipativos en distintos sistemas. En primer lugar consideramos el caso más simple en el que el campo de vacío es un campo escalar no masivo y luego extendemos nuestros cálculos al caso más realista en el que el campo de vacío es un campo de Maxwell no masivo. En cuanto a la geometría del sistema, consideramos el caso de dos placas semi-infinitas, dos placas de espesor infinitesimal (en ambos casos con velocidad relativa paralela a los planos), y un átomo frente a una placa dieléctrica moviéndose paralelo a la misma. Muchos de nuestros resultados están expresados en función de las características del material que conforma las placas (o el átomo), por ejemplo su permitividad eléctrica є. Estudiamos con detalle algunos modelos específicos: el caso de un modelo microscópico en el que el material está descripto por un contínuo de osciladores armónicos desacoplados de frecuencia fija, y el caso de dos placas de materiales de Dirac bidimensionales (materiales cuyas excitaciones de baja energía se comportan como fermiones de Dirac), particularmente el grafeno. Desarrollamos un formalismo funcional para la descripción de la fricción cuántica, donde nuestro principal objeto de estudio es la acción efectiva in-out, cuya parte imaginaria da cuenta de los efectos disipativos del sistema. Calculamos la parte imaginaria de la acción efectiva in-out y encontramos que es no nula en un rango no despreciable de velocidades, encontrando la existencia de un umbral que depende de las magnitudes características del sistema, a partir del cual comienza a haber disipación. Para el caso de las dos placas conformadas por osciladores armónicos desacoplados, calculamos además la acción efectiva CTP (Closed Time Path) o in-in, la que nos permite obtener explícitamente el cuadritensor energía-momento y por lo tanto la fuerza de fricción. En el caso de la partícula frente al plano, estudiamos además la decoherencia del grado de libertad interno de la partícula, encontrando que la presencia de la placa y el movimiento relativo aumenta los efectos de decoherencia propios del vacío, volviéndolos potenicalmente detectables experimentalmente. Paralelamente, estudiamos el problema de un átomo ubicado frente a una placa dieléctrica semi-infinita, moviéndose con velocidad constante pero en una dirección arbitraria (acercándose al plano y con una componente paralela al mismo). Con las herramientas de la teoría de perturbaciones dependientes del tiempo de la mecánica cuántica, calculamos la fuerza de fricción actuante sobre el átomo.

Abstract:
On this work we study one of the macroscopic manifestation of quantum vacuum fluctuations: Casimir friction, or quantum friction. This phenomenon is produced when two bodies are set in relative motion (even if the relative velocity is constant), where a frictional force acts on the bodies, opposed to the motion. This effect, like the more studied case of an attractive force acting between two neutral plates, known as Casimir Effect, is the result of an effective interaction between the two bodies, mediated by the uctuating electromagnetic field, which is present even when both bodies are electrically neutral and are not in contact (this is the reason why quantum friction is also known as non-contact friction). Along this thesis we study these dissipative effects on different systems. First we consider the simpler case of modelling the vacuum field with a non-massive scalar field, and then we extend our calculations to the more realistic case where the vacuum field is a non-massive Maxwell field. Concerning the geometry, we consider the case of two semi-infinite plates, two plates with infinitesimal width, and an atom moving in front of a dielectric plane, with velocity parallel to the plate. Many of our results are very general and expressed as a function of the material that conforms the plates (or the atom), for instance their electric permitivity є. We studied with detail some specific models: a microscopic model where the material is described by a continuum of uncoupled harmonic oscillators, and the relevant case of 2D Dirac materials, graphene in particular. We develop a functional approach to the description of the quantum friction, where our main object of study is the in-out effective action, whose imaginary part accounts for the dissipative effects on the system. We calculate the imaginary part of the in-out effective action, finding that it is non-vanishing in a wide range of velocities. We also find a threshold depending on the characteristic of the materials, and only fore velocities above that threshold we have dissipation. For the case of the two plates modelled as a harmonic oscillators, we also calculate the CTP (closed time path) or in-in eggective action, which allows us to explicitly obtain the energymomentum four-tensor, and hence de frictional force. On the case of the particle in fron of a plate, we have also studied the decoherence on the internal degree of freedom of the atom, ginding that the presence of the plate and the relative motion enhance the (otherwise undetectable) decoherence effect due to the vacuum, making them potentially experimentally detectable. We also study the problem of an atom in front of a dielectric semi-infinite plate, moving at a constant velocity but in an arbitrary direction (approaching the plate and with a component parallel to it). With the tools of quantum mechanics' time dependent perturbation theory, we calculate the frictional force acting on the atom.

Farina, Mariana. "Participación de la progesterona en la regulación de factores moduladores de quiescencia y motilidad uterina durante la preñez y el parto" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La quiescencia miometrial es un requerimiento fundamental de todas las especies para llegar al término de la gestación. La falla en el mantenimiento de la relajación uterina a menudo provoca parto prematuro, una de las principales causas de morbilidad y mortalidad fetal. En este trabajo se investigó el efecto de la progesterona (P4), hormona responsable del mantenimiento de la quiescencia de la musculatura lisa uterina, sobre factores que suprimen o estimulan la actividad contráctil miometrial como el óxido nítrico (NO), el GMPc y las prostaglandinas (PGs). Se estudió el perfil de síntesis de NO y la expresión de las isoformas de NOS uterinas durante la preñez temprana, media y tardía, observándose que la actividad Ca independiente y el nivel proteico de la NOsintasa inducible (iNOS) y la NOS endotelial (eNOS) estaban aumentados durante la gestación y descendían antes del parto. Estos hallazgos mostraron una relación temporal entre los niveles de NO producido por el útero gestante y las concentraciones de P4 sérica. La administración de RU-486, antagonista de la P4, produjo una disminución de la actividad de las NOS y del nivel proteico de la iNOS, mientras que el tratamiento con P4 en los días previos al parto, provocó un incremento en la síntesis de NO y en el nivel proteico de la iNOS. Estos hallazgos muestran que la P4 podría modular la producción de NO durante la preñez. La P4 aumentó la acumulación de GMPc,hecho que fue abolido en parte por la incubación con Aminoguanidina, inhibidor selectivo de la iNOS, sugiriendo que el efecto de la P4 sobre el NO trasciende al GMPc. La producción de PGF2α y PGE2; se encontró disminuida durante la preñez, como así también el nivel proteico de las Ciclooxigenasas (COX) 1 y 2. La P4 inhibió significativamente la liberación uterina de PGF2α y PGE2 y el nivel proteico de la COX-2. A pesar que durante la preñez se detectó baja actividad de la PLA;secretoria, enzima que libera el sustrato de las PGs, no se observó una modulación de la misma por la P4. El metabolismo de la PGF2α evaluado por la actividad de PG dehidrogenasa (PGDH), resultó incrementado durante la preñez y por la administración de progesterona. Estos resultados nos indican que los niveles de PGs estarían modulados negativamente por la progesterona, que actuaría aumentando su metabolismo a través de la PGDH e inhibiendo las COX. Cuando se estudió la posible interrelación entre los sistemas de NO y PGs se observó que la administración in vivo de un inhibidor selectivo de la COX-2 redujo el efecto del RU-486 sobre la síntesis de NO y que las PGs in vitro inhibían la actividad de la NOS. Por otro lado un dador de NO fue capaz de aumentar la síntesis de PGE2 sin modificar la de PGF2α. Estos datos nos permiten sugerir la existencia de una interrelación entre el NO y las PGs en el útero de la rata gestante. Este trabajo demuestra que la progesterona es capaz de modular la síntesis de las principales moléculas involucradas en la regulación de la contractilidad uterina durante la gestación.

Abstract:
Myometrial quiescence is a key factor in all species to accomplish a succesful gestation. The failure to maintain uterine relaxation often results in premature birth, which is one of the main causes of fetal morbidity and mortality. In this work me effect of Progesterone (P4)-the hormone responsible for maintaining the quiescence of uterine smooth muscle- was investigated on several factors that either stimulate or suppress myometric contractile activity, such as nitric oxide (NO), cGMP and prostalglandins (PGs). The profile of NO synthesis as well as the expression of uterine NOS isoforms was studied during early, mid and late pregnancy; Ca-independent activity as well as me levels of NO inducible synthase (iNOS)and endothelial NOS were found to be greater during gestation, and to decrease before birth. These findings revealed a time-response relationship between the NO levels produced by the pregnant rat uterus and the serum P4 levels. The administration of RU-486, a P4 antagonist, caused a decrease in NOS activity and iNOS levels, whereas P4 treatment in the days before labor determined an increase in NO synthesis and iNOS levels. These findings show that P4 might modulate NO production during pregnancy. The amounts of cGMP were increased by P4, and this was partly abolished by incubation with Aminoguanidine -a selective iNOS inhibitor-, suggesting that the effect of P4 on NO transcended cGMP We found a decrease in PGF2α and PGE2 production during pregnancy, and also in the levels of cyclooxygenases (COX) 1 and 2. P4 significantly inhibited the uterine release of PGF2α and PGE2; and also COX-2 levels. Although a low secretory PLA2; -the enzyme that releases the substrate for PGs production- activity was detected during pregnancy, P4 was not found to modulate this activity. PGF2α,metabolism was assessed by PG dehydrogenase (PGDH) activity, which resulted high during pregnancy and as a result of P4 administration. These results indicate that PGs levels might be negativer modulated by P4 which would act by increasing its metabolism through a PGDH stimulation and COX inhibition. Once a possible cross talk between NO and PGs systems was evaluated, we observed that the in vivo administration of a selective COX-2 inhibitor reduced the effect of RU-486 on the NO synthesis, and that PGs inhibited NOS activity in vitro. All in all, this work demonstrates that progesterone is able to modulate the main molecules involved in the regulation of uterus conctractility during pregnancy.

Farroni, Abel Eduardo. "Transformaciones estructurales y físico-químicas de maíces argentinos en la producción de alimentos obtenidos por procesos de gelatinización-laminación" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo del presente trabajo fue analizar y caracterizar los factores involucrados en las transformaciones estructurales y físico-químicas de maíces argentinos de tipo colorado duro que determinan la calidad de productos obtenidos por procesos de gelatinización-laminación. Se estudiaron muestras tomadas de distintas etapas del proceso de producción industrial de copos de maíz comerciales que incluyeron desde la materia prima hasta el producto final. Además se analizaron sistemas modelo producidos en el laboratorio para estudiar la influencia de la formulación en el proceso de cocción. Se generó un mapa completo de los cambios de fase y estado que se produjeron a lo largo del proceso industrial mediante diagramas de estado suplementados y el estudio de la movilidad molecular. Se observó un efecto antiplastificante del agua, detectado al estudiar las propiedades mecánicas y los atributos sensoriales de los copos de maíz en función del contenido de agua. Los cambios más importantes en la textura producidos por la absorción de agua se observaron en el estado vítreo, indicando que el agua límite de hidratación es un mejor indicador de estabilidad que la Tg para estos sistemas. La correlación entre la generación de pigmentos y la apariencia visual de las muestras fue afectada por los procesos que afectan la transparencia como los cambios de forma y la generación y destrucción de interfases. Los diagramas de estado y las técnicas de medición no destructivas relacionadas a los marcadores químicos junto al modelado del efecto del agua en las propiedades texturales pueden utilizarse como herramientas para el diseño de procesos, desarrollo de productos y el control de su estabilidad. Se establecieron parámetros que podrían emplearse en e control de proceso o en el producto final para garantizar atributos de calidad.

Abstract:
The objective of the present work was to analyze and characterize factors involved in structural and physicochemical transformations of argentine red flint corn which have impact on quality of food obtained by using gelatinization-lamination process. Samples from selected industrial process steps which included from raw materials to finished products were taken from cornflake production line. Model systems were cooked in the laboratory to study formulation effects on cooking process. Supplemented state diagrams generated and molecular mobility studies allowed to generate a complete map of phase and state changes that took place along the industrial process. Mechanical properties and sensory attributes of corn flakes were characterized as a function of water content. Antiplasticizing effect of water was detected both sensory and instrumentally. Important texture changes upon water absorption were observed when the samples were still in glassy state indicating that, for these samples, hydration limit is a better stability indicator than Tg. The correlation between pigment concentration and visual appearance was affected by shape and transparency changes, mainly due to generation or disappearance of inter-phases. Supplemented state diagrams and non destructive measurements techniques that correlate to chemical markers, along with water effect modeling on textural properties can be used as useful tools in process design, product development and stability control.

Farías de Funes, Silvia. "Análisis multielemental secuencial de aleaciones mediante plasma de argón generado por acoplamiento inductivo de radiofrecuencia" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se describe la caracterización espectroscópica y analítica de un espectrómetro óptico constituido por el acoplamiento de una fuente de plasma inductivo de argón (IPC) y un monocromador programable de alta resolución, aplicable a la determinación secuencial de Mg, Mn, Cr, Mo en aleaciones de aluminio y de base Cu-Ni. Después de una discusión general sobre las características fundamentales del dispositivo instrumental empleado, se consideran aspectos básicos relacionados con al medición experimental del poder de resolución práctico del monocromador programable, controlado por computadora. Utilizando fuentes de líneas atómicas angostas (lámparas de cátodo hueco), se determinó la variación del ancho de banda espectral en función del ancho de ranura para diferentes regiones de longitud de onda, lo que permitió establecer la capacidad del sistema para la resolución de espectros complejos. Utilizando un modelo simple de convolución cuadrática, se evaluó un término que representa la contribución de efectos de aberración óptica. Pudo demostrarse que es posible obtener valores de resolución del orden de 5 pm utilizando ranuras angostas de altura reducida. La caracterización espectroscópica de la fuente se basó en la medición de parámetros fundamentales de la descarga en condiciones de operación analítica, utilizando como variable la potencia incidente. Se midieron temperaturas de excitación rotacionales, utilizando el espectro de bandas de OH, yde excitación atómicas, empleando en este caso Fe(I) (representativo de un analito) y Ar(I) (componente del gas soporte). También se evaluó el estado de ionización del sistema mediante la medición de concentraciones electrónicas a partir del ensanchamiento Stark de las líneas Hδ y Hγ. Los resultados obtenidos se discuten en el contexto de modelos existentes que describen la descarga de plasma inductivo, y confirman el apartamiento del estado de equilibrio termodinámico local. La optimización de las condiciones de operación involucró en primer lugar una selección de líneas apropiadas, para lo que se compararon barridos espectrales obtenidos experimentalmente con espectros simulados generados por una base comercial. Se llevó a cabo a continuación un esudio paramétrico en el que se investigó la influencia de las diferentes variables (potencia incidente, flujo de gas soporte, presión del nebulizador, corrección por fondo, modalidad de adquisición de datos, tiempo de integración) que determinan la respuesta del sistema, evaluada a partir de la señal corregida, la relación línea/fondo o la relación señal/ruido. También se aplicó para el caso particular del Mn un método de optimización de variable múltiples (Simplex). Una vez establecidas las condiciones de operación que permiten la determinación secuencial de los cuatro analitos estudiados, se determinaron, con propósitos comparativos, los límites de detección para varios elementos adicionales. Los valores obtenidos se encuentran en el ámbito de 1 a 80 μg/L. El sistema instrumental estudiado se aplicó a la determinación de Mn y Mg en aleaciones de aluminio y de Mn, Cr y Mo en superaleaciones base Cu-Ni. Se emplearon en esta etapa tres niveles de validación: soluciones sintéticas de composición conocida que simulaba la composición de la matriz, aplicaión de métodos analíticos alternativos y análisis de materiales de referencia cartificados, en los casos en que se dispusiera de éstos. La correlación observada entre los valores de referencia y los obtenidos demuestra la excelente capacidad de la espectrometría de emisión atómica con plasma inductivo para la determinación de macrocomponentes , componentes menores y trazas en muestras complejas generadas por el desarrollo de nuevos materiales.

Abstract:
The spectroanalytical characterization of an instrumental system consisting of a RF inductively coupled plasma (ICP) source coupled to a computer controlled, high resolution scanning monochromator and its application to the analysis of aluminum alloys and superalloys, is described in this work. The elements selected for this study were Cr, Mn, Mg and Mo. Principal components of the materials considered were Al, Cu and Ni. After a consideration of the fundamental properties of the employed instrumentation, theoretical and experimental aspects of the measurement of the practical resolution power of the wavelength selector are discussed. The capability of the programable monochromator to resolve complex spectra such as those produced by the atomization of superalloys was established by studying the variation of the spectral bandpass as a function of the monochromator slit height and width on different wavelength regions. Measurements were performed with narrow spectral lines emitted by hollow-cathode lamps. A simple quadratic convolution model was applied to compare experimental and theoretical bandpass values and to semiquantitatively evaluate the influence of a term representing the contribution from optical aberrations. It was demonstrated that resolutions as low as about 5 pm can be obtained with narrow slits of reduced height. Spectrochemical characterization of the ICP emission source, operated at analytical conditions, was carried out by measuring Boltzmann rotational and excitation (atomic) temperatures. A molecular specie (OH) present in the plasma, Fe(I) (representative of an analyte) and Ar(I) (plasma supporting gas) were selected as thermometric species. In addition , the ionization state of the plasma was assessed by measuring electron concentrations from Stark broadening of the Hd and Hg lines. Differences among the estimated temperatures suggest relatively large departures from local thermodynamic equilibrium. Results are discussed in connection with existing colisional - radiative plasma models.% Selection of analytical lines was carried out by comparing simulated spectra generated from a commercial data base software with wavelength scans obtained on the spectral regions of interest. A parametric study, employing net line intensities, signal to background ratios and signal to noise ratios as response variables was conducted. The influence of source parameters (incident power, supporting argon gas flow rate, nebulizer pressure) and data acquisition conditions (potential of photomultiplier tube, integration times, peak and background measurement modes) was considered. A multiple variable optimization procedure (Simplex) was also investigated in the case of Mn. Instrumental detection limits were determined for elements other than the studied analytes and compared with values taken from recent publications. Values in the range from 1 to 80 mg/L were measured under realistic analytical conditions. The ICP spectrometer was tested for the direct determination (i.e. only sample dissolution is required) of Mg and Mn in aluminum and aluminum alloys, and of Cr, Mn and Mo in Ni-Cu based superalloys. Appropriate sample dissolution schemes were proposed for the materials considered and the effect of acid concentration in the injected solutions on signal was evaluated. Three levels of analytical validation were employed for the developed methods: synthetic solutions of known composition simulating the sample solutions, application of alternative analytical procedures and analysis of certified reference materials, when available. Good correlation between known or certified values and obtained concentration values was achieved, demonstrating the capabilities of ICP atomic emission spectrometry for bulk analysis of complex materials, involving the determination of major, minor and trace components.

Farías, María Edith. "Autoensamblaje del caseinomacropéptido (CMP) y su impacto en la gelificación y espumado" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de este trabajo fue estudiar mediante dispersión dinámica de luz (DLS) el autoensamblaje del caseinomacropéptido (CMP) en relación al pH, tipo de ácido y presencia de sales y su impacto en la gelificación y el espumado. A pH 7,0, las soluciones de CMP son estables con el tiempo y no gelifican aún bajo calentamiento. La forma predominante del CMP en estas condiciones es la monomérica. A pH < 4,5 ya sea a temperatura ambiente o por calentamiento, el CMP genera en el tiempo una estructura ordenada gelificada de características viscoelásticas, baja dureza y cohesividad. Dicha estructura es reversible a un cambio ulterior de pH pero no a la forma monomérica original. Se propuso un modelo de autoensamblaje y gelificación del CMP. El autoensamblaje del CMP y su gelificación están modulados por diferentes condiciones del medio: pH, temperatura, tipo de ácido y presencia de sales. El tipo de ácido y la presencia de sales impactan en la asociación del CMP por vía hidrofóbica, la cual constituye la primera etapa del autoensamblaje, conduciendo a dímeros (HCl), tetrámeros (ácido cítrico, ácido láctico, NaCl, CaCl2) o hexámeros (ácido acético). Estas formas asociadas del CMP son las que posteriormente interactúan a pH < 4,5 por via electrostática (segunda etapa del autoensamblaje) conduciendo en el tiempo a una estructura ordenada gelificada. Las propiedades de espumado del CMP también están relacionadas con su autoensamblaje y gelificación ya que la estabilidad de las espumas tanto al colapso como al drenado aumenta significativamente a pH < 4,5.

Abstract:
The aim of this work was to study by dynamic light scattering (DLS) the self-assembly of caseinomacropeptide (CMP) as affected by pH, type of acid and salts as well as its effect on gelling and foaming. At pH 7.0, CMP solutions are stable over time and do not gel even under heating. The dominant form of CMP in these conditions is the monomer. At pH < 4.5, at room temperature or upon heating, the CMP generates an ordered gelled structure with viscoelastic characteristics, low hardness and cohesiveness. This structure is reversible to a subsequent change of pH but not to the original monomeric form. CMP selfassembly and gelation are modulated by different environmental conditions: pH, temperature, type of acid and presence of salts. A model to explain CMP self-assembly and the formation of a gel is proposed. The type of acid and the presence of salts have an impact on the association of CMP via hydrophobic interactions, which constitutes the first stage of self-assembly, leading to dimers (HCl), tetramers (citric acid, lactic acid, NaCl, CaCl2) or hexamers (acetic acid). These associated forms interact subsequently at pH < 4.5 via electrostatic interactions (second stage of self-assembly) leading over time to a gelled structure. The foaming properties of CMP are also related to its self-assembly and gelation as the stability of foams both to drainaige or collapse were slightly increased at pH < 4.5.

Fasanella, Mariana. "Variabilidad genética espacial y ecología molecular en dos especies de roedores del Archipiélago de Tierra del Fuego: Ctenomys magellanicus, especie nativa y Castor canadensis, especie invasora" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis, se analizan a nivel molecular dos especies que habitan el Archipiélago de Tierra del Fuego (ATDF): una especie endémica (Ctenomys magellanicus) y una invasora (Castor canadensis). Ctenomys magellanicus se encuentra en estado Vulnerable según la UICN y es la única especie del género Ctenomys que se encuentra en Tierra del Fuego, mientras que el castor es la exótica más importante del ATDF y que genera mayores problemas a nivel ecológico y económico. Utilizando trampas de captura muerta, se capturaron 255 ejemplares de C. canadensis muestreados en todo el ATDF incluyendo Chile y Argentina, mientras que se capturaron 60 ejemplares de C. magellanicus de la zona norte de la Isla Grande de TDF (Argentina) utilizando trampas de captura viva. Utilizando marcadores moleculares (ADNmt y microsatélites), se estudió la variabilidad genética y la estructura genético poblacional de ambas especies. Para esto se subdividió a la población de castor en 5 subpoblaciones y a la de tucos en dos regiones (REGION NORTE y REGION SUR) según la forma cromosómica y dentro de cada una en 2 y 4 subpoblaciones respectivamente. Para C. magellanicus se detectaron 9 haplotipos de ADNmt, 3 exclusivos de la REGION NORTE y 6 exclusivos de la REGION SUR mientras que para castor se encontraron 7 haplotipos distribuidos en casi todas las subpoblaciones. Se encontró una significativa estructuración genética en la población de tucos (tanto con el marcador mitocondrial Φst=0,181 p=0,001 como con el nuclear Fst=0,108 p=0,001) a diferencia de la población de castores, que no presentó estructuración significativa en ambos marcadores moleculares (Φst=0,058 p=0,002; Fst=0,052 p < 0,001). Los resultados del ADNmt y los microsatélites mostraron una alta variabilidad para tucos mientras que para castor la variabilidad fue menor. Por último, en castor, se identificó a la Isla Dawson (subpob E) como una Unidad de Erradicación (UE) mientras que dentro de la Isla Grande, al haber muy baja estructuración poblacional no se pudieron identificar UE. Debido a que en la Isla Grande no existen barreras a la dispersión para los castores, se deberá realizar un control simultáneo en toda la isla para evitar posibles recolonizaciones. Si bien los datos para Ctenomys magellanicus aportan información parcial, se podrían sugerir 5 Unidades de Manejo (UM) basadas en la estructuración genética: 4 UM para la REGION SUR y 1 UM para la REGION NORTE.

Abstract:
In this thesis, we analyze at the molecular level two species that inhabit the Tierra del Fuego Archipelago (TDFA): an endemic (Ctenomys magellanicus) and an invasive species (Castor canadensis). Ctenomys magellanicus is in a Vulnerable state by the UICN and is the only species of the genus Ctenomys found in Tierra del Fuego, while the beaver is the most important exotic in the TDFA and generates the biggest problems at the ecological and economic levels. Using killing traps we capture 255 individuals of C. canadensis sampled throughout the TDFA including Chile and Argentina, while we capture 60 individuals of C. magellanicus from the north of the Isla Grande of TDF (Argentina) live trapping. Using molecular markers (mtDNA and microsatellites), we studied the genetic variability and population genetic structure of both species. For this, beaver population was further divided into 5 sub-populations and C. magellanicus was divided into two regions (NORTH REGION and SOUTH REGION) according to the chromosome form and within each into 2 and 4 sub- populations respectively. For C. magellanicus we detected 9 mitochondrial haplotypes, 3 exclusive from the NORTH REGION and 6 exclusive from SOUTH REGION while for beaver we found 7 haplotypes in almost all sub-populations. There was a significant population genetic structure in tucos (both with mitochondrial marker Φst=0,181 p=0,001 as with nuclear Fst=0,108 p=0,001) as opposed to the beaver population which did not present significant structure in both molecular markers (Φst=0,058 p=0,002; Fst=0,052 p < 0,001). Microsatellite and mtADN results showed a high variability in tucos while in beavers the variability was less. Finally, in beavers, we identified Isla Dawson (Subpop E) as an Eradication Unit (EU) while inside the Isla Grande, we could not identified EUs because of the very low population structure. Since on the Isla Grande there are no barriers to dispersal for beavers, it should be performed a simultaneously control on the island to avoid recolonization. While data on Ctenomys magellanicus provide partial information, we could suggest 5 Management Units (MU) based on the genetic structure: 4 MU for the SOUTH REGION and 1 MU for the NORTH REGION.

Fascio, Mirta Liliana. "Síntesis de heterociclos nitrogenados a partir de hidratos de carbono vía cicloadiciones 1,3-dipolares" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se describe la síntesis de heterociclos nitrogenados-oxigenados de cinco miembros tales como isoxazolinas, isoxazoles y oxadiazoles derivados de hidratos de carbono. La mayoría de los compuestos se obtuvieron por cicloadiciones 1,3-dipolares entre un dipolarófilo,generalmente comercial y un 1,3-dipolo proveniente de un hidrato de carbono libre o debidamente protegido. Se sintetizaron isoxazoles e isoxazolinas derivadas de 2-desoxiazúcares utilizando como dipolos las oximas de 2-desoxi-D-glucosa y 2-desoxi-D-ribosa, siendo los dipolarófilos alquinos y alquenos sustituidos con grupos atractores de electrones. Por otra parte, se obtuvieron también los derivados isoxazolínicos e isoxazólicos partiendo de la 1,2-O-isopropilidén-α-D-xílo-pentadialdo-1,4-furanosa oxima como precursor del 1,3-dipolo, utilizando una gama más variada de dipolarófilos algunos de los cuales se sintetizaron especialmente para este trabajo. Además partiendo de un hidrato de carbono protegido, como el 2,3,4,5,6-penta-O-benzoíl-D-manononitrilo, pudieron sintetizarse los derivados 1,3,4- y 1,2,4-oxadiazólicos correspondientes. Se realizó la cicloadición 1,3-dipolar intramolecular de la 1,2-O-isopropilidén-3-O- alil-α-D-xilopentadialdo-1,4-furanosa oxima que condujo a un producto tetracíclíco enantioméricamente puro. Finalmente se analizaron los resultados de la hidrogenación catalitica de algunos de los heterociclos isoxazolínicos sintetizados anteriormente, como probables intermediarios sintéticos. Todos los compuestos nuevos fueron caracterizados por sus constantes físicas y por espectroscopía de resonancia magnética nuclear y masa.

Abstract:
In the present work, the syntheses of some nitrogenated-oxigenated five member heterocycles such as isoxazolines, isoxazoles and oxadiazoles are described. Most of the compounds were obtained by 1,3-dipolar cycloadditions between dipolarophiles, commercially available, and an 1,3-dipole from a free or protectived carbohydrate derivatives. We synthesised isoxazoles and isoxazolines rings from 2-deoxysugars using 2-deoxy- D-glucose oxime and 2-deoxy-D-ribose oxime as 1,3-dipole and alkines and alkenes with electron-withdrawing substituents as dipholarophiles. In other way, we also obtained the isoxazolinic and isoxazolic rings from 1,2-O-isopropylidene- α-D-xylopentadialdo-1,4-furanose oxime as 1,3-dipole precursor, and a wide range of dipolarophiles, some of them was synthesised specially to this work. Beside this, from other protected sugar, such as 2,3,4,5,6-penta-O-benzoyl-D-mannononitrile, we could obtained the corresponding 1,3,4- and 1,2,4-oxadiazoles derivatives. We realized the intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition from 1,2-O-isopropylidene- 3-O-allyl-α-D-xylopentadialdo-1,4-furanose oxime yielding an enantiomerically pure tetracyclic compound. We also analized the catalytic hydrogenation results of some isoxazolinic derivatives to explore their posibilities as synthetic intermediates. The new compounds were characterized physical and spectroscopically.

Fassolari, Marisol. "Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal: integración mecanística y estructural" (2014-11-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El reconocimiento de antígenos por medio de anticuerpos es un evento fundamental en la respuesta inmune adaptativa. A su vez la formación de los complejos Antígeno:Anticuerpo es extensivamente utilizada como modelo de estudio de interacción proteína-proteína. En la presente tesis estudiamos el mecanismo de reconocimiento de un anticuerpo monoclonal específico, M1, por la proteína E7 del papilomavirus humano (HPV). E7 es la oncoproteína que constituye la principal actividad transformante del virus y además es paradigma de proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP). E7 se expresa constitutivamente en tejidos de carcinoma y la aparición de anticuerpos específicos ocurre con alta frecuencia en pacientes con cáncer cervical. Llevando a cabo un mapeo epitópico determinamos que el anticuerpo M1 reconoce específicamente una región inmunodominante de la proteína de HPV- 16 denominada “bisagra”, por conectar el dominio IDP N-terminal con el dominio globular Cterminal de la misma. Experimentos cinéticos mostraron que la región reconocida por M1, la cual posee dos residuos de prolina, comprende al menos dos poblaciones separadas por una alta barrera energética (~ 22 Kcal/mol). Los estudios de Resonancia Magnética Nuclear identificaron el origen de esta barrera como un evento de isomerización cis-trans de las prolinas presentes en el epítope de reconocimiento. Se determinó que el anticuerpo M1 reconoce específicamente al epítope en su conformación minoritaria (10%), que posee sus prolinas en cis, mediante el mecanismo de selección conformacional. Por lo tanto, se requiere que el 90% de las moléculas que se encuentran en configuración trans isomericen previo a la unión con el anticuerpo. La velocidad de asociación del conformero cis por M1 ( kon = 6 x 107 M-1 s-1) se encuentra entre las más rápidas para las interacciones Antígeno:Anticuerpo, a pesar de que la reacción global es extremadamente lenta (t1/2 ~ 4 min). Esto indica que la reacción de asociación se encuentra limitada por un evento de isomerización de prolina. Utilizando mutantes puntuales demostramos que la P41 en su conformación cis es la requerida para la unión con el anticuerpo. Luego del evento lento de pre-equilibrio y de la unión con M1, ocurre un evento de rearreglo unimolecular, formándose finalmente un complejo consolidado de alta afinidad (KD 120 nM). Nuestros resultados sugieren que la presentación de este epítope viral por las células presentadoras de antígeno tiene que haber estado en su configuración minoritaria cis, al generar el clon que produce el anticuerpo específico. Finalmente, mostramos la importancia de los determinantes estructurales presentes en regiones desordenadas en el reconocimiento entre macromoléculas. Dado que numerosas proteínas virales son multifuncionales debido a su naturaleza IDP, los resultados presentados en esta tesis sientan la bases para el análisis del mecanismo de reconocimiento por medio de anticuerpos de epítopes virales intrínsecamente desordenados.

Abstract:
Recognition of antigens by antibodies is a critical event in the adaptive immune response. Furthermore, the Antigen:Antibody complex is extensively used as a model of protein-protein interactions. In the present thesis, we present a detailed mechanistic study of the interaction between a specific monoclonal antibody, M1, with the E7 oncoprotein of human papillomavirus. E7 is the main transforming factor of this virus and also emerges as a paradigmatic example of an intrinsically disordered protein or IDP. E7 is constitutively expressed at high levels in carcinoma tissues and antibodies are frequently raised in patients with cervical cancer. Epitope mapping studies reveal that the M1 antibody specifically recognizes an immunodominant region of the HPV-16 E7 protein called "hinge", located between the IDP N-terminal and the globular C-terminal domains of the protein. Kinetic experiments show that this hinge, which has two proline residues, has at least two populations separated by a high energy barrier (~ 22 kcal / mol). Nuclear magnetic resonance traced the origin of this barrier to a very slow trans/cis prolyl isomerization event present in E7 epitope. The less populated (10%) cis isomer is the binding-competent species. Thus, the 90% of the molecules in the trans configuration require isomerization before binding. The association rate for the cis isomer approaches 6x107 M-1s-1, a ceiling for antigen-antibody interactions, although the overall reaction is extremely slow (t1/2 ~ 4 min). Therefore, the E7 epitope:M1 antibody complex formation is limited by a proline isomerization event. Mutagenesis experiments showed that Pro 41 in the epitope was required for both binding and isomerization. After the slow pre-equilibrium event and M1 binding, a post-binding unimolecular event occurs and a consolidated complex with a KD = 1.2!10-7 M is reached. Our results suggest that presentation of this viral epitope by the antigen presenting cells would have to be “locked” in the cis conformation in opposition to the most populated trans isomer in order to select the specific antibody clone. Finally, we show the importance of the structural determinants within disordered regions in the recognition mechanism between macromolecules. Many viral proteins are multifunctional due to its IDP nature. Therefore, the results presented in this thesis establish the basis for the analysis of the recognition mechanism by antibodies of intrinsically disordered viral epitopes.

Fassolari, Matías. "Estudio funcional de la familia de enzimas Aurora quinasa en Trypanosoma cruzi" (2013-05-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fastame, Inés Gabriela. "Regulación de síntesis proteica en bacterias y parásitos" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fauerbach, Jonathan Arturo. "Caracterización de las etapas tempranas de la agregación de alfa-sinucleína in vitro mediante sondas fluorescentes ESIPT y microscopia de fuerza atómica" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La Enfermedad de Parkinson (EP) es el desorden neurodegenerativo motor más frecuente, caracterizado por la presencia de agregados proteicos amiloideos intra y extraneuronales conocidos como Cuerpos de Lewy (CL). El principal componente de estas estructuras es alfa-sinucleína (AS), una proteína presináptica de 140 aminoácidos abundante en células dopaminérgicas del cerebro aunque su función fisiológica permanece aún desconocida. En su forma libre nativa AS carece de una estructura secundaria definida pudiendo adoptar múltiples conformaciones en solución y en asociación con otras proteínas y membranas. Se cree que los CL y las fibras amiloides maduras (mafs) son el resultado de un proceso de mal plegamiento, auto-ensamblado y asociación de AS y que posiblemente sirven como mecanismos de protección para la célula, a través de la redistribución en la población de las especies tóxicas intermediarias solubles asociadas a etapas tempranas. Estudio in vitro de las especies y procesos involucrados en la agregación de AS brindan la posibilidad de entender los mecanismos subyacentes en EP. El diseño de nuevas formas de detección de las especies intervinientes en el proceso de agregación y el estudio de los mecanismos de formación de dichos intermediarios tempranos poseen una alta importancia. En esta tesis, se sintetizaron sondas fluorescentes sensibles a cambios en la polaridad de su microentorno que permiten monitorear el proceso de auto-ensamblado y asociación de AS marcada covalentemente con estos compuestos. Dichas sondas demuestran una muy alta sensibilidad al proceso en estudio, proveyendo una novedosa metodología de monitoreo en continuo con la mínima perturbación del sistema. Diversas sondas fueron sintetizadas basándose en la familia de las 3-hidroxicromonas (3HC), compuestos altamente sensibles a los cambios de polaridad de su entorno. Su particular estructura química posibilita el fenómeno conocido como ESIPT (‘Excited State Intramolecular Proton Transfer o Transferencia Protónica Intramolecular en el Estado Excitado’). En ESIPT se produce una transferencia protónica intramolecular en el estado excitado obteniendo dos formas excitadas cada una con un nivel de energía distinto. Con lo cual estos compuestos fluorescentes ESIPT presentan dos bandas de emisión en lugar de una sola. La posición, intensidad y relación entre las bandas de emisión se modifican de acuerdo a los cambios en la polaridad, formación de enlaces por puentes de hidrógeno, y acidez/basicidad del microentorno de la sonda. Las nuevas sondas 3HC sintetizadas resultaron reporteros muy versátiles para el proceso de agregación de AS, particularmente sensibles a las etapas tempranas a cuyos agregados de AS se les adjudica la mayor citotoxicidad. La combinación de distintas sondas de polaridad han permitido obtener datos experimentales acerca de la formación y desaparición de intermediarios pre-amiloideos transientes. Las curvas de agregación obtenidas y sus cambios espectroscópicos fueron complementadas con un análisis por Microscopia de Fuerza Atómica (AFM). Mediante un estudio sistemático por AFM se lograron identificar las diferentes especies provenientes del proceso de autoensamblado de AS, donde cada una de las especies fue caracterizada y catalogada. Estudios a diferentes temperaturas permitieron evaluar su influencia en la cinética y termodinámica del proceso de agregación. Incubaciones a baja temperatura (4°C) permitieron definir un mínimo local de energía en la coordenada de la agregación, revelando una novedosa especie supramolecular (la "acuna") que muestra indicios de estar directamente involucrada en el paso clave de la formación de estructuras fibrilares. Estudios preliminares sobre células SH-SY5Y en cultivo dan indicios de que las acunas son citotóxicas. A través de la Crio-Microscopía de Transmisión Electrónica (Cryo-ET) se obtuvo información estructural con resolución sub-nm de esta novedosa especie supramolecular. Los estudios dieron lugar a la formulación de un nuevo esquema secuencial de agregación (SAS) para AS, basándose en conceptos de química coloidal, de polímeros y supramolecular. SAS distingue 3 etapas de la agregación: molecular, coloidal y fibrilar, en función de las estructuras halladas, su orden secuencial lineal y orquestado de interconversión, su presencia transiente (aparición y desaparición) y morfología característica. Además, SAS distingue etapas exergónicas y endotérmicas del proceso global, señalando un mínimo local de energía correspondiente con la formación de la acuna. Se prevé que este modelo pudiera ser útil no sólo para AS sino para otras proteínas amiloideas “intrínsicamente desordenadas” asociadas a enfermedades neurodegenerativas similares, abriendo la posibilidad de la existencia de un mecanismo común y unificado. Esta tesis doctoral involucra un estudio desde lo sintético orgánico y la biofísica estructural, utilizando microscopias de alta resolución y herramientas fluorescentes avocadas al estudio y la descripción del proceso integro de agregación de AS, obteniendo nuevos datos relevantes al área que son interesantes de continuar y ser explorados por el aporte que puedan rendir en el contexto biomédico.

Abstract:
Parkinson's disease (PD) is the most common neurodegenerative motor disorder, characterized by the presence of intra and extraneuronal amyloid protein aggregates known as Lewy bodies (LB). The main component of these structures is alpha-synuclein (AS), a presynaptic protein of 140 aminoacids abundant in dopaminergic brain cells, although its function is not fully understood. In its native form AS has no defined secondary structure and can adopt multiple conformations in solution and in association with other proteins and membranes. It is believed that LB and mature amyloid fibers (mafs) are the result of a process of AS misfolding, self-assembly and association (where the trigger remains unknown), which are believed to play a neuroprotective role through the redistribution of the population of intermediate toxic soluble species associated with early stages. In vitro studies of the process provide the means for controlling the conditions under which aggregation occurs and offer the possibility to study their dynamics so as to understand the underlying mechanisms. The design of new means for detecting the involved species in AS aggregation has high priority in order to elucidate the mechanisms of formation of these early intermediates and certain their potential role in the context of PD. This thesis describes the synthesis of fluorescent probes sensitive to changes in the polarity of their microenvironment’s which have served to monitor the process of self-assembly and association of AS. Such probes show a high sensitive for the early stages of the process under study, providing a novel continuous monitoring methodology with minimal perturbation of the system. Different probes based on the family of 3-hydroxychromones (3HC) were synthesized, being organic compounds highly sensitive to changes in the polarity of their environment. Their unique chemical structure leads to the phenomenon known as ESIPT (‘Excited State Intramolecular Proton Transfer’), a process by which an intramolecular proton is transfered in the excited state leading two the formation of two states with different energy levels. As a consequence, these compounds exhibit two emission bands instead of one. The position, intensity and ratio of the bands are modified according to changes in the polarity, hydrogen-bonding potential, and acidity/basicity of the microenvironment of the probe. The new probes are versatile reporters of AS aggregation, particularly sensitive to the early stages and species to which the highest cytotoxicity is attributed. The combination of different polarity probes have provided experimental data on the formation and disappearance of pre-amyloid transient intermediates. Spectroscopic data for the progress curves of aggregation were complemented by analysis by Atomic Force Microscopy (AFM). Through a systematic study by AFM it was possible to identify the different species in the self-assembly process of AS, where each species was characterized and cataloged. Studies at different temperatures allowed the evaluation of their influence on the kinetics and thermodynamics of the aggregation. Incubations at low temperature (4°C) helped to define a local energy minimum of the aggregation coordinate, revealing a novel supramolecular species (the "acuna") with evidence that it is directly involved in key steps leading to the formation of fibrillar structures. Preliminary studies on SH-SY5Y cells provided evidence that these species are cytotoxic. Through cryotransmission electron microscopy (Cryo-ET) structural information was obtained with subnm resolution of the so-called "latent" acunas. These studies have led to the formulation of a new sequential aggregation scheme (SAS) for AS, based on concepts of colloidal, polymers and supramolecular chemistry. SAS distinguishes 3 stages of aggregation: molecular, colloidal and fibrillar according to the found structures, their sequential orchestrated interconversion, their transient presence (or absence) and their particular morphology. In addition, SAS distinguishes exergonic and endothermic stages of the overall process, pointing to a specific local energy minimum. It is anticipated that this model could be useful not only for AS and PD but for other "intrinsically disordered" amyloid proteins associated with neurodegenerative diseases, opening the possibility that a common and unified mechanism may exist. This thesis features a study encompassing synthetic organic chemistry and structural biophysics, using high-resolution microscopy and fluorescent tools to study and describe the entire process of the in vitro aggregation of AS, obtaining new relevant data to the field and with implications in the biomedical context, which required and justify further exploration.

Faut, Mónica. "Rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales gamma frente al exceso de andrógenos durante la foliculogénesis temprana" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La reproducción es uno de los procesos fisiológicos con mayor costo energético, tal es así que los mecanismos fisiológicos que controlan el balance energético se hallan ligados a la fertilidad. Existen múltiples endocrinopatías asociadas a desbalances metabólicos, entre ellas el Síndrome de Ovario Poliquístico (SOP). Esta es una de las patologías más frecuentes en mujeres en edad reproductiva y cuya alteración principal es el hiperandrogenismo. Estas pacientes presentan alteraciones en la foliculogénesis temprana dado que, por mecanismos aun no conocidos, no ocurre la selección de folículos dominantes. Con el propósito de dilucidar estos mecanismos, en el laboratorio se ha generado un modelo murino de hiperandrogenización con dehidroepiandrosterona (DHEA) para el estudio del desarrollo folicular temprano. El objetivo principal de este trabajo es evaluar si “es el exceso de andrógenos durante la vida peripuberal el que genera alteraciones en la funcionalidad ovárica” y “cuál es el rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales de tipo γ (PPARγ) en esta alteración”. En el presente trabajo encontramos que el estímulo con eCG indujo un aumento en el número de folículos, disminuyendo la atresia folicular de manera controlada, sin alterar los procesos apoptóticos. Por otro lado, el aumento en los niveles de progesterona sérica (P4), indica la capacidad esteroidogénica de estos ovarios, permitiéndonos estudiar los efectos del hiperandrogenismo sobre las primeras etapas de la foliculogénesis y la regulación de la esteroidogénesis. En ovarios provenientes de animales hiperandrogenizados, encontramos un aumento en la expresión de proteínas fundamentales, como StAR, mientras que otras enzimas reguladoras, como P450scc, se encuentran disminuídas. Esta alteración provocó una disminución en la producción de P4, generando un efecto deletéreo en estos folículos. Los PPARγ actuarían como factores de transcripción, regulando la expresión de estas enzimas y estimulando la producción de P4 en las primeras etapas de la foliculogénesis, pero no siendo capaz de hacerlo en un ambiente hiperandrogénico. En estas condiciones, se produce un desbalance oxidativo en donde el GSHt es consumido rápidamente generándose daño a lípidos, lo cual alteraría la estructura de las membranas, provocando que las células no respondan correctamente al ambiente que las rodea, y entrando en un estado proapoptótico. De esta manera, el folículo entra en atresia.

Abstract:
Reproduction is one of the physiological processes with higher energy costs, that is so the physiological mechanisms that control energy balance are linked to fertility. There are multiple metabolic imbalances associated endocrinopathies, including Polycystic Ovary Syndrome (PCOS). This is one of the most frecuent pathology in women of childbearing age and whose main alteration is hyperandrogenism. Women with PCOS have many troubles during early folliculogenesis given that, by unknown mechanisms, the dominant follicles can´t be selected. To try to elucidate this phenomenon, in the laboratory we have generated a rat model of early follicular development with dehydroepiandrosterone (DHEA). The main objective of this work is to evaluate if "it´s the excess of androgens during peripubertal life that generates alterations in ovarian function" and "Which is the role of peroxisome proliferator-activeted receptors γ (PPARγ) in this condition". In this work, we found that ECG stimulation induces an increase in the number of follicles, decreasing the follicular atresia in a controlled manner, without exacerbating apoptotic processes. In the other hand, an increase in the serum progesterone (P4) indicates the steroidogenic capacity of these follicles, allowing us to study the effects of hyperandrogenism on the early stages of folliculogenesis and the regulation of the steroidogenic pathway. Ovaries from animals treated with DHEA, we found an increase in the expression of key proteins such as StAR, while others regulatory enzymes are diminished, such as P450scc. This alteration causes a decrease of P4, producing a deleterious effect on these follicles. PPARγ act as transcription factor of these enzymes by stimulating the production of P4 in the early stages of folliculogenesis, but not being able to do so in a hyperandrogenic environment. In these conditions, GSHt is rapidly consumed which increases the damage to lipids, altering the membrane structure and causing the cells do not respond to the surrounding environment, and entering into a proapoptotic state. In this manner, the follicle is leading to atresia.

Fava, Joaquín. "Anatomía aplicada al diseño de tecnologías de procesamiento mínimo en frutos (bayas) de Vaccinium corymbosum L. (Ericaceae), Solanum lycopersicum L. var. cerasiforme (Solanaceae) y Vitis labrusca L. (Vitaceae)" (2012-05-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La alta calidad de los frutos es una de las metas principales de la investigación actual en tecnologías postcosecha y de preservación. El diseño del procesamiento mínimo de arándanos, tomates cereza y uvas requiere, entre otros, el conocimiento de las alteraciones estructurales y ultraestructurales de células y tejidos debido a su influencia en las propiedades físico-químicas del fruto. El presente estudio examinó los principales cambios (micro-, ultra- y nano-) estructurales de la pared tangencial externa de la epidermis de frutos de arándano (Vaccinium corymbosum L.), tomate cereza (Solanum lycopersicum L. var. cerasiforme) y uva (Vitis labrusca L.) producidos por el tratamiento con peróxido de hidrógeno, la radiación UV-C, la aplicación de ultrasonido, la congelación y descongelación y el escaldado en vapor y su efecto en las propiedades mecánicas y ópticas. Se analizaron y discutieron las observaciones con microscopio óptico (MO), microscopio electrónico de barrido ambiental (MEBA), microscopio electrónico de transmisión (MET) y microscopio de fuerza atómica (MFA). Se evaluaron las características reológicas mediante ensayos de punción con una máquina de ensayos universales Instron y el color mediante los parámetros L*, a* y b* y las funciones C* y h* con un colorímetro. Cada tratamiento produjo en el epicarpo efectos estructurales específicos, que además dependieron del tipo de fruto. Los cambios observados afectaron las propiedades mecánicas de punción y el color de los frutos en diferente grado.

Abstract:
High quality of fruits is one of the main targets of post harvest and preservation research. The design of minimal processes for blueberries, cherry tomatoes, and grapefruits preservation requires, among others, the knowledge of structural and ultrastructural tissue and cell changes due to influence of physico-chemical properties of fruits. The present study examined the main structural (micro-, ultra-, and nano-) alterations occurred in the outer tangential epidermal cell wall of blueberries (Vaccinium corymbosum L.), cherry tomatoes (Solanum lycopersicum L. var. cerasiforme), and grapefruits (Vitis labrusca L.) due to hydrogen peroxide, UV-C irradiation, vapor blanching, freezing-thawing and ultrasound treatments, and their effect on the optical and mechanical properties. Light microscope (LM), environmental scanning electron microscope (ESEM), transmission electron microscope (TEM) and atomic force microscope (AFM) observations were analyzed and discussed. Rheological properties were evaluated by puncture test with an universal testing machine, and color by L*, a* and b* parameters, and C* and h* functions with a colorimeter. Each treatment produced specific epicarp effects depending of fruit type. These changes affected the mechanical properties, shape, brigthness, colour and the integrity of the fruit in different degree.

Favier Dubois, Cristian Mario. "Análisis geoarqueológico de los procesos de formación del registro, cronología y paleoambientes, en sitios arqueológicos de Fuego-Patagonia" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Favre, Roberto. "Determinación de citral en aceite esencial de limón" (1945). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Favret, Eduardo Alfredo. "Análisis y descripción de una superficie metálica mediante la iluminación laser oblicua y unidireccional de la microscopía óptica" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente trabajo de investigación introduce una descripción de la superficie metálica, ya sea luego de un desbaste mecánico o de un ataque químico específico, como composición de estructuras de bordes rectos en distintas direcciones superficiales, haciendo uso de la iluminación laser oblicua y unidireccional (ULOI) en el microscopio óptico. La intensidad I de la luz laser dispersada por la superficie de la muestra metálica, al rotar la misma un ángulo φ alrededor de un eje perpendicular a ella, exhibe máximos cuyas ubicaciones son características de cada grano cristalino. Estas curvas de intensidad luminica se deben a la difracción que sufre el haz de luz laser al incidir sobre la superficie. Se analiza la forma de uno de los máximos, es decir la curva I(φ), mostrando que una curva gaussiana ajusta bien los datos experimentales. Se considera un posible modelo para explicar dicha curva. Dicho modelo expresa a la curva experimental como combinación lineal de una curva teórica, que surge de aplicar la teoría de la difracción de FRESNEL-KIRCHHOFF y el concepto de THOMAS YOUNG acerca de que la difracción es un efecto de borde, del cual emana la teoria geométrica de la difracción de KELLER. De esta combinación lineal surge la idea de considerar a la rugosidad superficial como composición de estructuras de bordes rectos en distintas direcciones superficiales, denominando a dicha composición rugosidad lineal. Puesto que los cálculos tienen en cuenta las propiedades del instrumental utilizado para adquirir dichas curvas experimentales, fundamentalmente la apertura numérica del objetivo, surge la posibilidad de plantear un nuevo concepto sobre la topografia de la superficie a distintos aumentos. Defino a dicho concepto como orden de linealidad superficial o bien invariancia del diagrama de rugosidad lineal a distintos aumentos, la cual está representada por el parámetro a) (dispersión) de la curva gaussiana, producto del ajuste de la curva experimental. Se discuten estos análisis y se realizan observaciones cualitativas para distintos metales, como asi también para diversas redes de difracción, utilizando objetivos de aumentos 8x y 16x, y en algunos casos de 32x. Se presenta, además, una aplicación de la técnica ULOI a la metalografia, la cual consiste en el cálculo de orientaciones cristalinas.

Abstract:
The present research work introduces a description of a metallic surface, either after a mechanical grinding or after a chemical etching, as a composition of structures of right edges in different directions, making use of the ULOI Technique in the optical microscope. The intensity I of the laser beam dispersed by the surface of the sample, when the sample is rotated an angle φ around an axis perpendicular to its surface, exhibits maxima whose locations are characteristic of each crystalline grain. These curves of light intensity are due to the diffraction that suffers the laser beam when impacting on the surface. The I(φ) curve that represents one of the maxima is analyzed, showing that a gaussian curve adjusts the experimental data. It is considered a possible model to explain this result. This model explains the experimental curve as a lineal combination of a theoretical curve that arises of applying the theory of diffraction of FRESNEL-KIRCHHOFF and THOMAS YOUNG concept about that the diffraction is an edge effect, of which emanates the geometric theory of diffraction of KELLER. Using this idea, I consider the roughness of the metallic surface as a composition of structures of right edges in different directions, which I call “lineal rugosity”. Since the calculations keep in mind the properties of the instrumental used to acquire the experimental curves, fundamentally the numerical aperture of the objective, the possibility of outlining a new concept on the topography of the surface to different magnifications arises. I define this concept like lineal order of the surface or invariability of the diagram of lineal rugosity to different magnications, which is represented by the parameter a) (dispersion) of the gaussian curve. These analyses are discussed and qualitative observations are carried out for different metals, such as zinc, iron, aluminum and brass, and for diverse diffraction gratings, using objectives of different magnifications (8x, 16x and 32x). Besides, a metallographic application is shown.

Fazio, Ana. "Alimentación de gaviotas cocineras (Larus dominicanus) de piel y grasa de ballenas francas del sur (Eubalaena australis) en Península Valdés, Argentina" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La gaviota cocinera (Larus dominicanus) es una especie con hábitos de alimentación generalista y oportunista que en Península Valdés también se alimenta de trozos de piel y grasa de las ballenas francas del sur (Eubalaena australis). Este comportamiento se ha incrementado desde su primera observación en 1972 al igual que la población de gaviotas y de ballenas. Los objetivos de este trabajo fueron evaluar si este comportamiento parásito es una conducta generalizada en la población de gaviotas, describir la distribución espacio-temporal de los ataques, determinar las variables que más se relacionan con esta interacción y establecer las posibles consecuencias sanitarias para las ballenas. Durante las temporadas 2005 al 2008 se realizaron 1.559 embarques desde Puerto Pirámides con 5.703 avistajes. En los años 2009 y 2010 se realizaron 657 avistajes costeros en el área de El Doradillo. Las gaviotas atacaron a las ballenas en la mitad de las ocasiones en que co-ocurren en un avistaje al menos una gaviota y una ballena. Las mayores frecuencias y tasas de ataque se registraron sobre los pares madrecría, especialmente sobre las crías y cerca de la costa en agosto y septiembre, coincidentemente con el mayor número de ballenas y gaviotas en el área. El comportamiento de ataque fue más frecuente e intenso en la zona de El Doradillo. Una gran parte de las observaciones de ballenas adultas y casi todas las de crías de la población de Península Valdés presentaron heridas provocadas por gaviotas cocineras durante la temporada reproductiva y más de la mitad de las observaciones de ballenas adultas presentaron algún otro tipo de lesión de piel. El aumento de las tasas de ataque encontradas en la actualidad podría desencadenar un futuro problema de conservación para las ballenas.

Abstract:
Kelp gulls (Larus dominicanus) are generalist and opportunist seabirds that also feed on pieces of skin and blubber from Southern right whales (Eubalaena australis) at Península Valdés, Argentina. In addition to the kelp gull and whale population growth, interactions between gulls and whales have also increased since the first record in 1972. The main goal of this study was to evaluate if this parasitic behavior is a generalized conduct in the kelp gull population, describe the spatial and temporal distribution of the attacks, assess the most related variables to gull attacks and establish the possible sanitary consequences to whales. During the seasons 2005 to 2008, 1,559 boat trips and 5,703 whale-watching sightings were made from Puerto Pirámides. In the years 2009 and 2010, 657 coastal sightings were made from El Doradillo. Gulls attacked whales in half of the occasions at least one gull and one whale co-occurred in a sighting. The highest frequency of sightings with attacks as well as attack rates were registered on mother-calf pairs, especially on calves and near the coast in August and September, coincidentally with the major number of whales and gulls in the area. The attack behavior was more frequent and intense in El Doradillo. Many observations of adult whales and most the calves‟ of the Península Valdés population presented injuries provoked by gulls during the reproductive season, and more than half of observations of adult whales presented some other kind of skin lesion. The increasing attack rates encountered could cause a future conservation problem to whales.

Fazzito, Sabrina Yesica. "Estudios geofísicos aplicados a la neotectónica de la falla El Tigre, precordillera de San Juan" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente estudio tiene como objetivo principal caracterizar la cinemática, la estructura y la deformación de uno de los rasgos estructurales más destacados en la Precordillera Centro- Occidental de San Juan con actividad neotectónica, la falla con deslizamiento oblicuo El Tigre. Para esto, se mostrará que la aplicación y el desarrollo de diferentes métodos geofísicos, en conjunto con los métodos geológicos tradicionales como el análisis estructural, geomórfico y estratigráfico, permiten ampliar significativamente el conocimiento de una zona afectada por actividad neotectónica. En este trabajo se aplicaron, con resultados positivos, diversos métodos de estudio geofísico en zonas afectadas por la falla: Tomografía Eléctrica Resistiva somera en 2D, Paleomagnetismo y Anisotropía de Susceptibilidad Magnética. Entre los principales aportes de la investigación se encuentran: la identificación de discontinuidades en la traza y geoformas asociadas a fallamiento de desplazamiento de rumbo, el reconocimiento de estructuras oblicuas a la falla, determinación de curvaturas menores y mayores de la traza y la evaluación de la actividad de la falla en el tiempo. En particular en el Segmento Central de la falla El Tigre, la Tomografía Eléctrica Resistiva en 2D reveló características de los sedimentos, la ubicación y orientación de la falla principal, la estructura de dorsos de presión y de bajos de hundimiento y permitió asociar la distribución de esas geoformas a los cambios mayores en la orientación de la traza de la falla. Además, esta metodología permitió sugerir la existencia de fallas ciegas y grábenes, la ubicación de la napa freática y reconocer la función de la falla El Tigre como barrera hidrogeológica. A través del Paleomagnetismo se logró detectar la presencia de zonas con importantes rotaciones tectónicas según ejes verticales asociadas al movimiento de la falla, diferencias en la actividad de la falla en distintos períodos geológicos y, teniendo en cuenta las estructuras oblicuas reveladas en el estudio cartográfico, ayudar a proponer un esquema cinemático preliminar de deformación en bloques. El método de Anisotropía de Susceptibilidad Magnética reveló las direcciones de máximo y mínimo acortamiento de la deformación y una posible variación de orientación de las mismas en el tiempo.

Abstract:
The present study has the characterization of the kinematics, structure and deformation of one of the most outstanding structural features in the Central-Western Precordillera of the San Juan province, the oblique-slip ‘El Tigre’ fault as it main objective. It is shown that the application and development of different geophysical methods, together with the usual geological studies as structural, geomorphological and stratigraphic analysis, allow to significantly extend the understanding of a zone affected by neotectonic activity. Different methods of geophysical study were applied with positive results in zones affected by the fault: shallow 2D Electrical Resistivity Tomography, Paleomagnetism and Anisotropy of Magnetic Susceptibility. Among the main achievements of the investigation we enumerate: the identification of discontinuities in the trace and landforms associated to strike-slip faulting, the recognition of structures oblique to the fault, the determination of smaller and larger trace curvatures, and the evaluation of the fault activity along time. In particular, in the Central Segment of the ‘El Tigre’ fault the 2D Electrical Resistivity Tomography revealed the underground features of sediments, the location and orientation of the main fault, the structure of pressure-ridges and sag-ponds, and allowed to relate the landforms distribution to the largest changes in the fault trace orientation. Besides, this methodology allowed to suggest the existence of blind faults and grabens, the location of the water table and the recognition of the ‘El Tigre’ fault as a hydrogeological barrier. Paleomagnetic studies were essential for: detection of the presence of zones with important tectonic rotations around vertical axes associated to the fault motion, differences in the fault activity in different geological periods and, considering the oblique structures revealed in the cartographic study, helped to propose a preliminary kinematic scheme of rigid-block deformation. The method of Anisotropy of Magnetic Susceptibility showed the maximum and minimum shortening directions of the deformation, and a possible variation of them with time.

Federico, Roque Alejandro. "Reducción del ruido coherente y determinación de la fase óptica en interferometría digital de speckle usando la transformada wavelet" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis se presentan nuevos métodos basados en la transformada wavelet para filtrar el ruido de speckle y obtener distribuciones de fase en interferometría digital de speckle (DSPI). La performance de estos métodos se determina usando franjas simuladas por computadora y también se muestran aplicaciones en franjas experimentales. El método propuesto para la reducción del ruido de speckle se basa en el descarte de los coeficientes pertenecientes a las sub-bandas de la descomposición wavelet. La performance de este método se analiza y se compara con los resultados obtenidos mediante otras técnicas de filtrado que utilizan el wavelet shrinkage basada en los criterios estadísticos de hard y soft thresholding. Se muestra que el método de descarte de sub-bandas puede reducir más eficientemente el ruido de speckle que otras técnicas de filtrado. También se proponen dos métodos para recuperar la distribución de fase a partir de un único interferograma de DSPI, basados en la transformada wavelet continua y en el uso de una distribución suavizada. Ambos métodos no requieren de la aplicación de un algoritmo de desenvoltura de la fase o la introducción de franjas portadoras en el interferómetro. Estos métodos permiten obtener los gradientes de la distribución de fase a lo largo de un camino de pixels y el mapa de fase se determina por integración. Se demuestra que las franjas que cumplen con el límite asintótico analítico pueden ser procesadas por el método de la transformada wavelet en la aproximación de fase estacionaria. El uso de una distribución de Wigner-Ville con un kernel de suavizado de tipo gaussiano obtiene resultados más precisos que el método de la transformada wavelet continua. Se evalúa la influencia del proceso de filtrado y se discuten las limitaciones adicionales que se presentan en sus aplicaciones.

Abstract:
New methods based on the wavelet transform to reduce speckle noise and to evaluate optical phase distributions in digital speckle pattern interferometry (DSPI) are presented. The performance of these methods is determined using computer simulated DSPI fringes and also experimental data. The method for speckle noise reduction is based on the level-dependent removal of the wavelet coefficients of the transformed image. The performance of this method is analysed and compared with the results obtained with the denoising techniques that use wavelet shrinkage based on soft and hard thresholding criteria. It is shown that the wavelet subband removal method reduces speckle noise and maintains image features more effectively than wavelet shrinkage techniques. To retrieve optical phase distributions in DSPI, the continuous wavelet transform in the stationary phase aproximation and a smoothed distribution are proposed. Both techniques do not need the application of a phase unwrapping algorithm neither the introduction of carrier fringes in the interferometer. Phase gradients are found along a pixel path from a single DSPI image and the phase distribution is finally determined by integration. It is shown that only DSPI fringes that verify the analytic asymptotic limit can be processed with the continuous wavelet transform method. It is also shown that a Wigner-Ville distribution with a smoothing Gaussian kernel gives more accurate results than the methods based on the continuous wavelet transform. The influence of the filtering process to smooth the DSPI fringes and additional drawbacks that emerge when these methods are applied are finally discussed.

Federman, María Noel. "Estudio comparado del papel de la epigenética en distintas fases de la memoria de largo término" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La consolidación de las memorias de largo término (MLT) necesita de la síntesis de novo de ARNm y proteínas. Trabajos recientes proponen la existencia de una nueva fase de consolidación en memorias estables y consolidadas, denominada reconsolidación. Esta nueva fase tiene lugar luego de la reactivación de la MLT inducida por la evocación de la MLT. La reconsolidación de la MLT también depende de eventos transcripcionales y traduccionales. La transcripción génica es controlada por factores de transcripción, cofactores y correpresores. Los cofactores y correpresores regulan la expresión génica mediante su interacción directa con la maquinaria de transcripción basal, remodelando la estructura de la cromatina y/o modificando químicamente las histonas. Una de las modificaciones post-traduccionales de histonas más estudiada es la acetilación. Este proceso es regulado por acetilasas (KATs) y desacetilasas de histonas (KDACs). En este trabajo de tesis se presentan evidencias acerca del papel fundamental que cumple la acetilación de histonas durante la consolidación y reconsolidación de la memoria contexto-señal en el cangrejo Chasmagnathus granulatus, así como también durante la consolidación de la memoria de reconocimiento de objeto novedoso en el ratón Mus musculus. En el cerebro central de Chasmagnathus se observó un aumento en los niveles de acetilación de histona H3 durante la consolidación, 1 hora luego de un entrenamiento fuerte. Asimismo, se observó un incremento similar en la acetilación de la histona H3 durante la reconsolidación, 1 hora después de la reactivación de la memoria. En este modelo, el bloqueo farmacológico de la acción de las KDACs mediante la administración del inhibidor butirato de sodio (NaB), durante la consolidación de una memoria débil, induce la facilitación de esta memoria. No se encontró un efecto facilitador de la memoria mediante la administración de esta droga durante la reconsolidación. Por otro lado, en el hipocampo de Mus musculus, se observó un aumento en los niveles de acetilación de histona H3 durante la consolidación, 1 hora luego de un entrenamiento fuerte, no así luego de entrenamientos de menor magnitud. Además, la memoria fue mejorada mediante la administración intra-hipocampal del inhibidor de KDACs NaB. En conjunto, estos datos sostienen que la acetilación de histonas es un mecanismo fundamental en la consolidación y reconsolidación de la MLT. Este proceso epigenético funcionaría como una característica molecular de memorias fuertes. Este mecanismo molecular regulador de la expresión génica durante la formación de la memoria se encuentra evolutivamente conservado.

Abstract:
Consolidation of long-term memories (MLT) requires de novo synthesis of mRNA and protein. Recent studies suggest the existence of a new consolidationlike phase of stable and already consolidated memories, which is called reconsolidation. This phase occurs by the reactivation of the MLT, induced by memory retrieval. Reconsolidation also depends on transcriptional and translational events. Transcriptional activation is controlled by transcription factors, their cofactors and repressors. Cofactors and repressors can regulate gene expression by interacting with basal transcription machinery, remodeling chromatin structure and/or chemically modifying histones. The acetylation is the most studied modification of histones related to gene expression regulation. This process is regulated by histone acetylases (KATs) and histone deacetylases (KDACs). This thesis presents evidences about the critical role of histone acetylation during consolidation and reconsolidation of context-signal memory in the crab Chasmagnathus granulatus, as well as during consolidation of novel object recognition memory in the mouse Mus musculus. In Chasmagnathus, it is shown an increase in the acetylation level of histone H3 in the central brain during consolidation, 1 hour after a strong training protocol. Moreover, that increased acetylation of histone H3 was also observed during reconsolidation, 1 hour after memory reactivation. In this invertebrate model, pharmacological blockade of the action of KDACs by administration of the inhibitor sodium butyrate during the consolidation of a weak memory, induces memory facilitation. We found no memory enhancement effect by administering the drug during reconsolidation. Moreover, in the hippocampus of Mus musculus, there was an increase in the histone H3 acetylation level during consolidation, 1 hour after a strong training. This change is not observed after weaker training protocols. Furthermore, memory was improved by intra-hippocampal administration of KDACs inhibitor sodium butyrate. Together, these data argue that acetylation of histones is a key mechanism in the consolidation and reconsolidation of the MLT. This epigenetic process functions as a molecular feature of stronger memories. This mechanism regulating gene expression during memory formation is evolutionarily conserved.

Feigelstock, Dino Ariel. "Epidemiología molecular del virus de la Fiebre Aftosa serotipo C" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Feingold, Sergio. "Asociación de marcadores moleculares a la calidad panadera en trigos argentinos" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La variación en la calidad panadera ha sido asociada a el tenor proteico y a la composición de proteinas de reserva del grano. Entre las proteinas de reserva, variación alélica en las gluteninas de alto peso molecular han podido explicar hasta el 50% de la calidad en trigos europeos. Klein 32 (K32), un cultivar argentino de buena calidad cultivado en los años 30, presenta las mismas subunidades de gluteninas de alto peso molecular que Chinese Spring (CS) de mala calidad panadera. Estudios previos realizados sobre estos materiales mostraron que las gluteninas de bajo peso molecular y/o las gliadinas, cuyos genes están codificados en los brazos cortos de los cromosomas homeólogos de los grupos 1 y 6, podrian ser responsables de la diferencia en calidad entre estos genotipos. Se encontró que marcadores moleculares localizados en el cromosoma 1BS pudieron explicar alrededor del 20% de la variación en calidad de una población F23 derivada del cruzamiento de K32 y CS. Además, se encontraron efectos positivos de alelos de CS de marcadores localizados en el cromosoma 6AS. Los marcadores asociados a la calidad panadera se encontraron ligados a los loci X-Glu3 y X-Gli1 en el cromosoma 1BS; y a X-Gli2 el 6AS. El contenido proteico relativo influyó marcadamente en la calidad panadera estimada por la prueba de sedimentación en SDS. El uso de este caracter como covariable permitió mejorar la porción de varianza de la calidad explicada por los marcadores del 1BS. La determinación de la calidad mediante el uso del mixógrafo no se vieron tan influenciadas por el contenido proteico. La utilización de los marcadores moleculares identificados, para seleccionar los alelos de K32 en el 1BS y los de CS en el 6AS podría resultar en un incremento del 30% de la calidad a igualdad de contenido proteico. Asimismo, se encontraron evidencias de nuevos genes de proteínas de reserva recientemente reportados por otros investigadores.

Abstract:
Breadmaking quality variation is related to differences in protein content and protein composition. Among storage proteins, it has been reported that variation in the high molecular weight (HMW) glutenin subunit composition can explain about 50% of breadmaking quality in European varieties. Klein 32 (K32), an old Argentinean variety with good rheological properties presents the same HMW glutenin subunit composition than Chinese Spring (CS), a poor baking quality genotype. Previous studies indicated that low molecular weight glutenins and/or gliadins whose genes are coded on the short arms of chromosome groups 1 and 6 could be responsible of the difference in quality showed by these genotypes. The association of molecular markers located in these regions showed that the short arm of chromosome 1B, could explained around 20% of the variation in the trait in an F2:3 population derived from K32 and CS. Moreover, positive effects of alleles from CS located on chromosome 6A were found. Markers associated to breadmaking quality were found linked to the XGlu3 and X-Gli1 loci in chromosome 1BS; and to X-Gli2 in chromosome GAS. Protein content largely affected breadmaking estimation by SDS sedimentation test, and the use of this trait as a covariant improved the degree of explanation of the breadmaking quality by markers on chromosome 1BS. Mixing parameters behave more independently of protein content. The use of markers to select K32 alleles at 188 and CS alleles at 6AS in breeding programs could result in a 30% increase in quality at the same protein level. Evidence of novel storage protein genes proposed by other researchers was found.

Feld, Mariana. "Rol de la vía de MAPKs en distintas fases de la memoria. Implicancias en la señalización intracelular de ß-amiloide" (2007). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de esta tesis fue en primer lugar, estudiar el rol de las proteína- quinasas activadas por mitógenos (MAPK) en distintas fases de la formación de la memoria en el paradigma de Memoria Contexto–Señal (MCS) del cangrejo Chasmagnathus. En segundo lugar, una vez establecida la participación de estas quinasas en dicho modelo, evaluar su rol en la interferencia sobre la memoria ejercida por péptidos β-amiloide de origen humano en este paradigma de memoria en invertebrados. Se observó activación de ERK 1 h luego de un entrenamiento espaciado (que induce formación de una memoria de largo término ) en fracciones citosólicas pero no nucleares. Dos entrenamientos control (que no inducen MLT) evidenciaron activación de ERK y JNK citosólicas inmediatamente luego del entrenamiento, decayendo 1 h después. En concordancia, un inhibidor de la vía de ERK1/2 (PD098059) indujo amnesia durante la evaluación de la MLT, solo cuando fue administrado 45 min después del entrenamiento, y no inmediatamente pre- o post-entrenamiento, o cuando se evaluó la memoria de corto término (MCT). Dosis muy bajas de fibrillas de Aβ naturalmente secretadas (FN) impidieron la retención de la memoria solo cuando fueron administradas peri-entrenamiento, e indujeron activación generalizada de ERK/MAPK 1 h luego de su administración. La inyección de péptidos sintéticos de βA1-42 y βA3-42 fibrilados (pero no oligomerizados) resultó amnésica. Sin embargo, no se observó este efecto por administración de βA1-40 o βA11-42 fibrilados. En conclusión, la consolidación de la MLT, a diferencia de su reconsolidación o de la MCT, requiere la fosforilación diferencial de sustratos extra-nucleares de ERK en este modelo. Aβ parece inducir alteraciones fisiológicas y transitorias en el cerebro, más que permanentes y neuropatológicas, dada la especificidad temporal y de vías de señalización implicadas a partir de la administración de bajas dosis de fibrillas. Este efecto específico sobre la memoria está mediado, al menos en parte, por la activación generalizada de ERK que interferiría con la consolidación de la memoria.

Abstract:
This thesis was aimed firstly at studying the role of mitogen-activated protein kinase (MAPK) in different phases of memory formation in the Context–Signal Memory (CSM) paradigm of the crab Chasmagnathus. Secondly, having established the kinase ́s participation in this model, another objective was to evaluate their role in human β-amyloid-induced memory interference in this invertebrate memory paradigm. ERK activation was disclosed 1 h after spaced training (which induces long-term memory formation) in cytosolic but not nuclear fractions. Two control trainings (which do not induce long-term memory formation) showed cytosolic activation ERK and JNK immediately after training, decaying 1 h later. Accordingly, an ERK1/2 pathway inhibitor (PD098059) induced amnesia during LTM testing, only when administered 45 min after training, but not immediately pre- or post-training, or when short-term memory (STM) was assessed. Very low doses of naturally secreted Aβ fibrils (NF) impaired memory retention in the crab only when administered peri-training, and induced generalized ERK/MAPK specific activation 1 h after administration. Synthetic fibrillated but not oligomerized Aβ1-42 and Aβ3-42 administration induced amnesia. However, no amnestic effect was found after fibrillated Aβ1-40 and Aβ11-42 peptides administration. In conclusion, extra-nuclear ERK substrates must be differentially phosphorylated during memory formation, and this function is necessary for LTM consolidation, but not for reconsolidation or STM, in this model. Transient physiological, rather than permanent neuropathological, alterations of the brain seem to be induced by Aβ, given the temporally- and signaling-specific effects of low doses of fibrils administered. This specific effect on memory involves, at least in part, generalized ERK activation, which would impair memory consolidation.

Feldman, Mario F.. "Caracterización del proceso de translocación de poliprenol azúcares a través de membranas biológicas" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La biogénesis de estructuras complejas que contienen hidratos de carbono como el lipopolisacárido (LPS), los exopolisacáridos, el peptidoglicano y los ácidos teicoicos en procariotas y las glicoproteínas en eucariotas se realiza generalmente a partir de precursores nucleótido-azúcares que transfieren sus restos de azúcares a poliprenoles como el undecaprenol y el dolicol (Dol). Los nucleótido azúcares se encuentran normalmente disponibles en el citoplasma, mientras que los poliprenoles están asociados con una bicapa lipídica.Una vez ensamblados, los azúcares unidos al poliprenol deben atravesar membranas para su posterior procesamiento (polimerización como en el caso del LPS o transferencia a proteínas como ocurre en la formación de glicoproteínas). Este proceso no ocurre espontaneamente y parece estar mediado por proteinas, aunque sólo para el pasaje a través de Ia membrana interna procariótica de las subunidades de antígeno O (el componente más variable del LPS) se ha identificado una proteína, denominada Wzx con actividad translocasa o “flipasa”. Las diferentes translocasas Wzx poseen una muy baja homología de secuencias tanto a nivel de DNA como de proteínas. Los intentos para sobreexpresar Wzx han sido infructuosos, lo que no ha permitido la realización de experimentos tendientes a caracterizar estructural y mecanísticamente a las translocasas. En este trabajo se investigó si es necesario que las subunidades O se sinteticen completamente para poder ser translocadas. Se obtuvo una mutante en el gen glf, responsable de la síntesis de galactofuranosa, el último de los cuatro azúcares que componen la subunidad O16 en Escherichia coli. Se observó que esta mutante es capaz de translocar una subunidad incompleta conteniendo sólo tres azúcares a través de la membrana. Experimentos utilizando la lectina del germen de trigo (WGA) permitieron establecer que también es posible translocar una subunidad truncada conteniendo sólo uno o dos residuos e incorporar estos azúcares al core del LPS. Experimentos de complementación realizados en una mutante de E. coli O7 en el gen wzx con translocasas de Salmonella enterica y E. coli O16 demostraron que la translocación de subunidades de antígeno O es independiente de la naturaleza química de la porción glicosídica de la subunidad O. Por el contrario las putativas translocasas involucradas en la síntesis de exopolisacáridos no fueron capaces de complementar la mutación en wzx. Los resultados presentados en esta Tesis indican que no se requiere que la subunidad O esté completa para que sea reconocida por la maquinaria de translocación y se produzca su pasaje a través de la membrana, pudiendo translocarse subunidades truncadas o completamente diferentes a las que normalmente se producen en una determinada cepa. Los resultados obtenidos sugieren además un modelo de biosíntesis de antígeno O que involucra el reconocimiento del prenol-oligosacárido por un hipotético complejo compuesto por la putativa translocasa Wzx y otras proteínas que participan en la síntesis de antígeno O.

Felitte, Alfredo A.. "Estudio experimental en el campo de las hidrácidas difénicas y nitrodifénicas" (1941). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferder, Ianina C.. "Implicancias del gen FMR1 en la función ovárica" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El gen FMR1, responsable del Síndrome de Fragilidad del X (SFX), se localiza en el sitio FRAXA en el brazo largo del cromosoma X (Xq27.3), está compuesto por 17 exones, abarca aproximadamente 38 kilobases (kb) y su producto transcripcional es un ARN mensajero de 3,9 kb que puede sufrir splicing alternativo. En su región 5’ no codificante presenta una zona de tripletes CGG que puede variar en longitud. Según el tamaño de la expansión, los alelos se clasifican en normales (5- 44 repeticiones), intermedios (45-54 repeticiones), premutados (55- 200 repeticiones) o con mutación completa (>200 repeticiones). Mientras que la mutación completa es la causante del SFX, el estado de premutación se asocia a otros 2 desórdenes clínicos: Síndrome de temblor/ ataxia asociado a la Fragilidad del X (FXTAS), un desorden neurodegenerativo de inicio tardío y a la Insuficiencia Ovárica Primaria (IOP) asociada a la Fragilidad del X (FXPOI). La IOP se define como la presencia de amenorrea (de al menos 4 meses) antes de los 40 años, que se acompaña de un aumento en los niveles séricos de FSH (a niveles menopáusicos) y de bajos niveles de estradiol (hipoestrogenismo). Es un síndrome muy heterogéneo de patogénesis multicausal tales como alteraciones cromosómicas, enzimáticas, autoinmunidad, causas iatrogénicas e infecciosas. Tiene una incidencia del 1% en mujeres menores de 40 años y del 0,1% en menores de 30. FXPOI es la causa genética conocida más común de la IOP 46, XX y la premutación en FMR1 es responsable del 4- 6% de todos los casos de IOP 46, XX. Aproximadamente el 2% de las mujeres 46, XX con IOP aislada y el 14% de la mujeres 46, XX con IOP familiar son portadoras de la premutación en el gen FMR1. Asimismo, se ha descripto que alrededor del 20% de las mujeres portadoras de la premutación desarrollan IOP. A su vez, las mujeres portadoras se vuelven menopáusicas aproximadamente 5 años antes que las no portadoras. Si bien no todas las mujeres portadoras de la premutación experimentan una temprana pérdida de la fertilidad, todas ellas enfrentan el potencial adelantamiento en la aparición de condiciones asociadas con la deficiencia estrogénica (aumento en el riesgo de osteoporosis y de enfermedades cardiovasculares). Estudios genéticos epidemiológicos sugieren que el comienzo y la gravedad de la disfunción ovárica asociada a FXPOI son variables y podrían estar moduladas, potencialmente, por el largo de las repeticiones CGG y otros factores ambientales. El status de premutación per se pareciera estar influyendo en la expresión de la enfermedad. De hecho, no se ha descripto que mujeres que poseen expansión completa de tripletes (>200 repeticiones y con signos clínicos de Síndrome de Fragilidad del X) desarrollen IOP. Si bien no se conoce el mecanismo por el cual la premutación del gen FMR1 puede causar la disfunción ovárica y la insuficiencia ovárica primaria, se ha postulado que puede ocurrir una disminución inicial del número de folículos o una velocidad acelerada de la atresia. Es sabido que la proteína que codifica este gen, FMRP, se expresa en altas cantidades en células germinales del ovario fetal. Asimismo, se ha descripto que esta proteína actúa como inhibidor de la traducción de algunos ARN mensajeros formando parte de los procesos de silenciamiento génicos mediados por miRNAs. Teniendo en cuenta su función, se ha postulado como posible hipótesis de la patogenia, que un aumento de FMRP en estadios tempranos del desarrollo de los ovocitos podría conducir a una haploinsuficiencia de proteínas involucradas en este proceso, provocando una disminución del pool inicial de folículos. Sin embargo, y dado que en FXTAS se ha observado un aumento del ARN mensajero del gen como consecuencia de la premutación, se postula como mecanismos alternativo la existencia de un aumento del ARN mensajero en el ovario que ejerza un efecto tóxico en el tiempo, con el consecuente incremento de la atresia folicular. Ninguno de estos mecanismos han sido aún comprobados en el ovario, más aún la función fisiológica de la proteína en el mismo no está establecida. No se conoce además, si existe expresión diferencial a lo largo del desarrollo folicular. Considerando la escasa información que existe acerca de FMR1 y su expresión en ovario, nuestro trabajo consistió, en una primera fase, en el estudio de la expresión de la proteína FMRP y su mensajero a lo largo de la foliculogénesis, en un modelo de rata. Se utilizaron 3 grupos de ratas: ratas prepuberales de 18 días, ratas prepuberales de 21-23 días tratadas con dietilestilbestrol (DES) para enriquecer a los ovarios en folículos antrales tempranos y ratas prepuberales de 21-23 días tratadas con gonadotrofina coriónica equina (PMSG) para enriquecer los ovarios en folículos preovulatorios. En la primera parte del trabajo analizamos, por inmunohistoquímica, la expresión de FMRP en los distintos tipos celulares del folículo. Hallamos que la proteína se expresa en células de la granulosa, de la teca y en células estromales, con excepción de un grupo de células que rodea al folículo. La expresión se detectó en los folículos en los tres estadios del desarrollo estudiados: preantrales, antrales tempranos y preovulatorios. La expresión de la proteína FMRP fue estudiada también por Western blot en los tres tipos foliculares. Observamos una menor expresión en folículos preantrales y una mayor expresión en estadios más avanzados de la foliculogénesis. Por otra parte, se detectaron al menos 4 isoformas de la proteína cuyos patrones de expresión resultaron diferentes a los observados en testículo y cerebro. Teniendo en cuenta la función de la proteína como parte del complejo de silenciamiento post-transcripcional, estos resultados nos permitirían estimar que las diferencias observadas en los niveles de expresión de la proteína tendrían un rol en el correcto desarrollo del folículo. Asimismo, la presencia de isoformas distintivas en el ovario sugeriría una función específica para algunas de ellas en la gónada. La segunda parte del trabajo consistió en el estudio de la expresión del ARN mensajero de Fmr1 en los 3 estadios foliculares. Por PCR en tiempo real observamos que el patrón de expresión era opuesto al que se obtuvo para la proteína. En los folículos preovulatorios, el nivel del ARN fue menor respecto al de los estadios anteriores. Estos resultados sugerirían que la expresión del mensajero y su proteína en el ovario están regulados de manera diferente y posiblemente independiente. Por otro lado, identificamos por RT-PCR y posterior secuenciación, la existencia de varias isoformas del ARNm del gen, resultantes del splicing alternativo del mismo. Entre ellas, detectamos la isoforma que contiene al exón 12, la cual no ha sido previamente descripta en rata. El último aspecto que quisimos abordar en nuestro estudio fue el efecto biológico de la introducción de tripletes en el rango de la premutación sobre una línea celular de células de granulosa humana (KGN). Par tal fin se transfectaron las células con un plásmido conteniendo tripletes en el rango normal o de la premutación, río arriba de un gen reportero (GFP). Luego de 18 horas de transfección, los niveles de ARNm del gen reportero resultaron más elevados en las células que poseían los tripletes en el rango de la premutación, en concordancia con lo observado en diferentes experimentos y pacientes con FXTAS. Asimismo, detectamos una menor cantidad de células que expresan la proteína GFP, en presencia del plásmido con la premutación, en todos los tiempos de transfección estudiados. A nivel neuronal se ha relacionado al estado de premutación con posibles efectos apoptóticos en la célula. Si bien nuestros estudios aún no demuestran que el efecto de la introducción de tripletes en el rango de la premutación resulte en un aumento en la apoptosis de las células KGN, los resultados obtenidos en esta tesis abren la posibilidad de que este mecanismo sea analizado en un futuro. En conclusión, en esta tesis se describe por primera vez la expresión de la proteína FMRP y de su mensajero a lo largo del desarrollo folicular, y la presencia de algunas isoformas distintivas, producto del splicing alternativo del gen. Asimismo, se iniciaron los estudios tendientes a demostrar el efecto patogénico que posee la expresión de tripletes expandidos en células del ovario.

Abstract:
The FMR1 gene, responsible for the Fragile X Syndrome (FXS), is located in the FRAXA site of chromosome X. The gene is composed of 17 exons, spans about 38 kb and encodes an messenger RNA (mRNA) of 3.9 kilobases (kb) that can be alternatively spliced into a number of different isoforms. The 5’ UTR of the FMR1 gene presents a CGG repeat that is unstable and therefore variable. Based on the size of the expansion, alleles are classified as normal (5–44 trinucleotide repeats), intermediate (45- 54 repeats), premutated (55–200 repeats), or fully mutated (>200 repeats). While full mutation is the responsible for FXS, the premutation condition has been associated to other 2 clinical disorders: Fragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS), a neurodegenerative disorder of late onset and to the Fragile X- associated primary ovarian insufficiency (FXPOI). Primary ovarian insufficiency (POI) is defined as amenorrhea (for at least 4 months) before age of 40, an increase in serum levels of FSH (to menopausal levels) and low levels of estradiol (hypoestrogenism). This syndrome is very heterogeneous with a multicausal pathogenesis, and any of the following: chromosomal, enzymatic, iatrogenic, autoimmune or infectious aberration may be the cause of the disease. It has an incidence of 1% in women under age of 40 and of 0.1% below 30 years of age. FXPOI is the most common known genetic cause for IOP and the premutation condition is responsible for 4-6% of all cases of 46, XX IOP. About 2% of women 46, XX with IOP and 14% of women 46, XX with familial IOP, carry the premutation in the FMR1 gene. Moreover, it has also been described that around 20% of women carrying the premutation, become menopausal around 5 years earlier than not carriers. The premutation status seems to influence the expression of the disease. In fact, no full mutated women with IOP have been described. While not all women carries of the permutation experience an early loss of fertility, all carriers face the potential advance in the onset of the conditions associated with estrogenic deficiency (higher risk for osteoporosis and hearth diseases). Epidemiologic genetic studies also suggest that the onset and severity of ovarian dysfunction associated to FXPOI is variable, and could be potentially modulated by the CGG repeat length and environmental factors. Even though the underlying mechanism by which the FMR1 premutation is responsible for the ovarian dysfunction and POI is not known, it has been suggested that an initial decrease of the number of follicles or an accelerated rate of atresia may take place. The protein encoded by the FMR1 gene, FMRP, is highly expressed in germ cells in the fetal ovary. The protein acts as a translation inhibitor of some target mRNA, most likely via the microRNA silencing complex. Given that in FXTAS an increase in FMR1 mRNA has been observed, another possible mechanism for FXPOI is that high levels of mRNA exert a toxic effect causing an increase in follicular atresia. None of the postulated pathogenic mechanisms has been demonstrated in the ovary. Moreover, the physiological role of FMRP in the gonad has not been established, and the expression pattern of the protein during follicular growth remains unknown. Considering that there is limited information related to FMR1 expression and function in the ovary, the goal of our work was, initially, to study the expression of FMRP protein and its messenger during folliculogenesis in a rat model. For this propose, three groups of rats were used: 1- prepubertal rats of 18 days, 2- prepubertal rats of 21-23 days treated with Diethylstilbestrol (DES) to enrich ovaries with early antral follicles and 3- prepubertal rats of 21-23 days treated with equine chorionic gonadotropin (PMSG) to enrich ovaries with preovulatory follicles. The expression of FMRP in the rat ovarian follicular cells was analyzed by immunohistochemistry (IHQ) and Western blot (WB). By IHQ we found that the protein is expressed in granulosa, theca and stromal cells, except in a group of cells surrounding the follicle, mainly in the cytoplasm. Expression was detected in follicles at all stages of folliculogenesis: preantral, early antral and preovulatory. After WB assays, lower expression in preantral follicle was detected, whereas higher levels of FMRP were observed in later stages of folliculogenesis. Moreover, at least 4 isoforms of the protein were detected whose expression pattern differed from that observed in testis and brain. Considering FMRP’s function as part of the post -transcriptional silencing complex, these results may suggest that the differences observed at FMRP expression levels, could exert a role in the proper development of the follicle. Furthermore, the presence of distinctive isoforms in the ovary could imply a specific function for some of them in de gonad. In the second part of the work we studied the messenger RNA (mRNA) expression of Fmr1 in the three follicular development stages. Using quantitative RT-PCR (qRT-PCR) we found that the mRNA expression pattern was opposite to that observed for the protein: in preovulatory follicles, mRNA level was lower compared to earlier stages. These results suggest that mRNA and protein expression in the ovary may be regulated at different and perhaps independent levels. In addition, by RT-PCR and subsequent sequencing, we identified several messenger isoforms resulting from alternative splicing. Among them, we detected the variant including exon 12, which has not been previously described in other rat tissues so far analyzed. The last aspect we addressed in our work was the biological effect that the CGG repeats in the permutation range could exert on a human ovarian granulosa cell line (KGN). Cells were transfected with a plasmid containing repeats in the normal or in the premutation range cloned upstream of the GFP reporter gene. After different times of transfection, mRNA of the reporter gene was measured by qRT- PCR. We found that after 18 hours, the levels of mRNA was higher in cells transfected with the repeats in the premutation range comparing to the levels found for those with the normal one. These results are in agreement with the observations reported for FXTAS patients and for animal models of the syndrome. Moreover, when cells were transfected with the permutated plasmid, we detected fewer cells expressing the GFP protein in all the transfection times assayed. In neurons, the permutation state has been associated with possible apoptotic effects in the cell. Even though our preliminary studies do not yet show that transfection of KGN cells with the premutation plasmid results in increased apoptosis, the results obtained in the present work open the possibility for this mechanism to be analyzed in a future. In conclusion, this work describes, for the first time, the expression of the FMRP protein and its messenger during folliculogenesis in a rat model. Moreover, the presence of some distinctive isoforms resulting from the alternative splicing of the gene in the ovary is also described. Although we found an increase in mRNA levels and reduced protein expression of the reporter gene containing permutated repeats, further studies are needed to elucidate the pathogenic mechanism of the expanded triplets in the ovary.

Fermani, Paulina. "Patrones de abundancia de los componentes del bucle microbiano en las lagunas pampeanas" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo general de esta Tesis es estudiar los patrones de abundancia de los componentes del bucle microbiano en lagunas pampeanas, utilizando como marco de referencia la Teoría de Estados Estables Alternativos (Scheffer et. al.; 1993) y el modelo de Gasol (1994). En la laguna El Triunfo (aguas claras) la abundancia de bacterias heterótrofas (BH) y flagelados heterótrofos (FH) se encuentran sobre el extremo más productivo del modelo de Gasol (1994), y el grado de acople entre estos componentes es débil; concordando con las predicciones de Perntahler (2005) quienes utilizan el model de Gasol (1994) como marco de referencia. Desde el punto de vista de la teoría de estados alternativos, esta laguna constituye un caso en el que parecen cumplirse sus predicciones. No obstante, uno esperaría que en un cuerpo de agua dominado por macrófitas, el metazooplancton se caracterice por ser abundante y con una alta eficiencia de filtración, lo cual implicaría también un débil acoplamiento entre BH y FH; sin embargo, no se encontró evidencia de este tipo de zooplancton. En la laguna Chascomús (aguas turbias), las abundancias de BH exceden el límite máximo contemplado en el modelo de Gasol (1994), lo que constituye un aporte en sí mismo. El grado de acople observado entre FH y BH resultó levemente superior a las predicciones del modelo. Desde la perspectiva de la teoría de estados alternativos, se esperaría que el metazooplancton de una laguna turbia estuviese dominado por rotíferos y/o copépodos ciclopoideos. Durante el estudio se pudo distinguir dos períodos que difieren marcadamente en la composición del zooplancton: el año 2008 dominado por pequeños cladóceros y copépodos, y el año 2009 dominado por rotíferos y copépodos. Estas diferencias no modificaron el grado de trofismo general de la laguna, pero sí se tradujeron en un distinto grado de acople entre FH y BH: el dasacople (D) resultó significativamente menor durante el primer período que en la segunda mitad del estudio. Ni el modelo original de Gasol (1994) ni sus desarrollos posteriores proveen elementos para interpretar estos resultados. Los patrones de abundancia de BH y FH en 40 lagunas pampeanas confirman la existencia de una gran diversidad de ambientes. Este estudio permite completar el modelo de Gasol (1994), ya que muchas de estas lagunas proporcionan valores que exceden los límites de abundancia del modelo y resultan comparables, o superiores, a los valores más altos reportados en la literatura. Desde el punto de vista de la teoría de estados alternativos, no se encontró evidencia de que la población de lagunas pampeanas se segreguen en dos estados alternativos discretos, sino que se encontró un gradiente de condiciones, tanto de indicadores de estado trófico, como de transparencia. Por otra parte, el grado de acople entre FH y BH no mostró ninguna tendencia ni con los indicadores de estado trófico, ni con los de transparencia. Por lo tanto esta teoría no parece ser de utilidad para evaluar los patrones de abundancia de FH y BH en el conjunto de las lagunas pampeanas, dado que no se cumplen ni sus supuestos ni sus predicciones.

Abstract:
The aim of this thesis is to study the abundance patterns of microbial loop components in Pampean lakes, using as a framework the theory of alternative stable states (Scheffer et. al., 1993) and Gasol model (1994). In shallow lake El Triunfo (clear water) the heterotrophic bacteria (HB) and heterotrophic flagellates (HF) abundances are on the far more productive in the Gasol model (1994), and the degree of coupling between these components is weak, in accordance with the predictions of Perntahler (2005) who used the Gasol’s model (1994) as a reference. According with the theory of alternative states, one would expect in a shallow lake dominated by macrophytes that the metazooplankton will be characterized by abundant and high efficiency filtration, which would also imply a weak coupling between HB and HF, but there was no evidence this type of zooplankton. In shallow turbid lake (Chascomús), the HB abundance exceeds the ceiling set in the Gasol model (1994), which itself is a contribution. The degree of coupling observed between HF and HB was slightly higher than model predictions. From theory of alternative states perspective, one would expect that the metazooplankton was dominated by rotifers and/or cyclopoid copepods. During the study it was possible to distinguish two periods that differ markedly in the composition of zooplankton: 2008 dominated by small cladocerans and copepods, and 2009 dominated by rotifers and copepods. These differences did not change the overall trophic level of the lake, but led to a different degree of coupling between HF and HB: the decoupling (D) was significantly lower during the first period in the second half of the study. Neither the original model of Gasol (1994) and subsequent developments provide elements to interpret these results. HB and HF abundance patterns in 40 Pampas wetlands confirm the existence of a wide range of environments in terms of abundance of HF and HB. This study allows to complete the model of Gasol (1994), as many of these gaps provide values which exceed the limits of abundance of the model and are comparable or superior to the highest values reported in the literature. From the standpoint of the theory of alternative states, there was no evidence that the population of Pampean lakes are segregated into two discrete alternative states, but found a gradient of conditions, both trophic status indicators, such as transparency. Moreover, the degree of coupling between HF and HB showed no tendency with trophic status indicators or with transparency. Therefore this theory does not seem to be useful for assessing patterns of HF and HB abundance in the whole of the Pampas wetlands, as not met or their assumptions or their predictions.

Fernandez, Daniel Alfredo. "Caracterización histoquímica, distribución y crecimiento de las fibras musculares en nototénidos subantárticos : Análisis inicial de dos factores relacionados con la natación : flotabilidad y temperatura" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se caracterizó la musculatura natatoria de nototénidos subantárticos mediante técnicas histoquímicas, determinándose la presencia de cuatro tipos de fibras: SDF, rojas, intermedias y blancas. Se demostró la utilidad de la técnica de la mATPasa para diferenciar distintos tipos musculares. El proceso de hiperplasia muscular cesó al 40 - 70 % de la talla máxima de cada especie, encontrándose tres patrones distintos de incorporación de fibras directamente relacionados con las tallas finales de las mismas. Las fibras musculares de E. maclovinus y P. tessellata mostraron la misma tasa de crecimiento. Todos los nototénidos subantárticos estudiados presentan valores de flotabilidad propios de especies de hábitat bentónico. El rendimiento natatorio de E. maclovinus fue superior a 10°C que a 4°C. La velocidad, aceleración y potencia inercial de los arranques rápidos de E. maclovinus a 2 °C fueron superiores a los de una especie antártica (N. rosii), y el grado de curvatura del cuerpo y de estiramiento de las fibras blancas similares a los de especies de aguas templadas y tropicales. Los valores energéticos de distintos órganos y tejidos de las especies que se separaron antes del tronco ancestral de los nototénidos mostraron valores significativamente mayores que los del resto de las especies.

Abstract:
The swimming muscles of sub-Antarctic notothenioids were characterised using histochemical techniques. Four different fibre types were found: SDF, red, intermediate and white. The mATPase technique was found useful for muscle fibre type characterisation. Hyperplasia cessation occurred at 40 - 70 % of the final length of each species. Three different patterns of fibre incorporation were found and related to the final length of each species. All the sub-Antarctic notothenioid species studied had buoyancy values typical of benthic species. The swimming perfomance of E. maclovinus was higher at 10 °C than at 4°C. The velocity, acceleration and inertial power of the fast-starts of E. maclovinus were higher than the ones found in an Antarctic notothenioid (N. rosii), and the curvature of the body and the muscle strain of the white fibres were similar to those of species from template and tropical waters. The energetic content of different organs and tissues from the species that diverge earlier from the parent taxa of the notothenioids showed significantly higher values than the other notothenioid species.

Fernandez, Diego Carlos. "Estudio de mecanismos de pre y post-condicionamiento como estrategia de inducción de tolerancia isquémica retiniana" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La isquemia es un componente central de diversas enfermedades retinianas que pueden provocar ceguera irreversible. Al presente, no existen tratamientos efectivos frente al daño isquémico retiniano. En este trabajo de Tesis se demostró por primera vez, que el post-condicionamiento isquémico (PostC) inducido por la aplicación de pulsos breves de isquemia en forma posterior a una isquemia prolongada, revierte significativamente las alteraciones funcionales e histológicas provocadas por una isquemia retiniana deletérea. En cuanto a los mecanismos involucrados en este fenómeno, los resultados obtenidos sugieren la participación de la síntesis de novo de proteínas y la actividad de la isoforma inducible de la óxido nítrico sintasa. Además, se demostró que el daño isquémico, al menos en parte, es causado por un aumento en las concentraciones sinápticas de glutamato y que el PostC podría proteger a la retina al disminuir este parámetro. A continuación, se realizó una caracterización del daño de la retina y la vía visual en un modelo de retinopatía diabética experimental inducido por la inyección de estreptozotocina (STZ). A nivel retiniano, se observaron alteraciones funcionales, vasculares y morfológicas significativas. En estadíos tempranos luego de la inyección de STZ se observaron alteraciones axo-gliales en la porción distal del nervio óptico, que podrían constituir el primer cambio estructural en la vía visual diabética. El condicionamiento isquémico (aplicación de pulsos semanales de isquemia) revirtió significativamente todas estas alteraciones, tanto a nivel de la retina como de la vía visual. Asimismo, los resultados obtenidos sugieren que la disminución en los niveles de VEGF y la restauración de la actividad de glutamina sintetasa podrían participar activamente en la protección inducida por el condicionamiento isquémico frente a las alteraciones provocadas por la retinopatía diabética. Finalmente, se demostró que las células ganglionares retinianas intrínsecamente fotosensibles en particular, y el sistema visual no formador de imagen en general, se preservan en etapas avanzadas de diabetes. En suma, los resultados obtenidos en este trabajo constituyen avances originales en la comprensión de los mecanismos involucrados en la lesión retiniana inducida por isquemia aguda y por diabetes, así como en la posibilidad de prevenir ambos procesos a través de la inducción de tolerancia isquémica. La demostración de que el sistema visual no formador de imagen es menos susceptible al daño diabético representa una valiosa pieza de información respecto a este sistema no canónico de transducción de la información luminosa.

Abstract:
Ischemia is a central component of several retinal diseases that can result in irreversible blindness. At present, there are no effective treatments to protect the retina from ischemic damage. For the first time, in this Thesis work, we have demonstrated that ischemic post-conditioning (PostC) induced by brief episodes of ischemia/reperfusion applied at the onset of reperfusion, significantly protected the retina against functional and histological alterations induced by ischemia. As for the involved mechanisms, the results suggest the participation of de novo synthesis of proteins and the inducible isoform of nitric oxide synthase activity in the protective mechanism triggered by PostC. We have also demonstrated that ischemic damage is, at least in part, caused by an increase in glutamate synaptic concentrations and that PostC protected the retina by decreasing this parameter. Moreover, we have analyzed the alterations at retinal and visual pathway level provoked by experimental diabetes induced by streptozotocin (STZ). Al retinal level, diabetes caused significant functional, vascular, and morphological alterations. In addition, significant axo-glial alterations were observed at the distal portion of the optic nerve at early stages of diabetes that could be the first structural change in the diabetic visual pathway. Ischemic conditioning (weekly application of brief pulses of ischemia) significantly reversed all these alterations. Furthermore, the results suggest that a decrease in VEGF levels and the restoration of glutamine synthetase activity could be key aspects in the protective mechanism triggered by ischemic conditioning against diabetic retinopathy. Finally, we showed that intrinsically photosensitive retinal ganglion cells and the non-forming image visual system are preserved at advanced stages of diabetes. In summary, the results presented in this Thesis provide original insights for unraveling the mechanisms involved in the retinal damage induced by acute ischemia and diabetes, as well as in the possibility of preventing these processes through the induction of ischemic tolerance. The demonstration that the non-forming image visual system is less susceptible to diabetic damage is a valuable piece of information about this non canonical system of light transduction.

Fernandez, Graciela. "Efecto de la prometazina (Fenergan) sobre las enzimas que metabolizan tóxicos y fármacos" (1978). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió el efecto de la administración única o repetida de prometazina (Fenergan) sobre los componentes del sistema enzimático de microsomas hepáticos que metabolizan tóxicos y fármacos; el citocromo P-450 y la citocromo C reductasa (P-450 reductasa). También se observaron los efectos que la adminis- tración única o repetida de prometazina tiene sobre la acción hipnótica del pentobarbital y se trató de entender las interacciones observadas en términos de los efectos que la prometazina ejerce sobre el metabolismo desintoxicante del pentobarbital mediado por las enzimas antes mencionadas. Se encontró que una única dosis de prometazina prolonga significativamente el tiempo de hipnosis por pentobarbital y no cambia el contenido de P-450 o la actividad de la citocromo C reductasa. EL efecto prolongador observado parece deberse a una acción aditiva de efectos depresores sobre el sistema nervioso central de la prometazina y el pentobarbital. Si la dosis de prometazina fuese alta también podrían actuar efectos inhibidores detectados en este estudio de este compuesto sobre las enzimas que metabolizan fármacos y tóxicos de microsomas hepáticos. Si el animal recibe más de dos dosis (una diaria) de prometazina, entonces el efecto hipnótico del pentobarbital se acorta y ello parece claramente deberse a que en esas condiciones aumenta el contenido de citocromo P-450, citocromo C reductasa y la actividad global del sistema para desintoxicar al organismo de pentobarbital (medida a través de la actividad de la etil-morfina N-demetilasa). EL aumento de contenido de P-450 microsomal se logra por el aporte del proceso de síntesis de proteína aunque éste no esté acelerado tal cual lo demuestran los estudios de incorporación del isótopo 14 de carbono-leucina en animales tratados y controles. Los estudios de efectos de la prometazina sobre el proceso de degradación proteica medidos con isótopo 14 de carbono-guanidino - arginina sugieren que en el aumento de contenido de citocromo P-450 microsomal el bloqueo de los procesos degradativos por la prometazina desempeña un papel importante. El aumento de actividad de la citocromo C reductasa por efecto de la adminitración de prometazina no depende de los procesos de síntesis o degradación proteica y podrá deberse ya sea a una acción tipo detergente de la prometazina sobre la enzima o alternativamente a que ésta funcionaría como acelerador del transporte de electrones entre el NADPH y el citocromo C. Los resultados obtenidos revisten potencial importancia en toxicología y farmacología, puesto que la exposición simultánea de un individuo a tóxicos o fármacos y a prometazina podría generar interacciones que van desde la consecuencia leve hasta una de tipo grave. Ello se debe a que al interactuar la prometazina sobre las enzimas de microsomas hepáticos que desintoxican algunos compuestos y potencian a otros, ella estaría modulando los efectos de los mismos. El uso frecuente de este antihistamínico en terapéutica hace más probable que ocurran este tipo de interacciones y por lo tanto estos resultados sugieren que se tenga particular cautela cuando se la emplea combinada con otros compuestos o cuando el individuo está expuesto a otros agentes tóxicos.

Fernández de Alvarez, Elsa Herminia Emiliana. "La Macrauchenia patachónica, Owen : descripción esteológica y esteométrica de las principales piezas del esqueleto. Estudio comparativo con algunos géneros de Litopterna del Terciario" (1940). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fernández Bell Fano, Pablo. "Infección persistente del virus Junín in vitro: perturbación del equilibrio virus-célula como estrategia de estudio del mecanismo involucrado en este tipo de infecciones" (2014-10-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El virus Junín (JUNV), agente etiológico de la fiebre hemorrágica argentina, pertenece a la familia Arenaviridae. Los virus pertenecientes a esta familia son capaces de causar infecciones persistentes en roedores, los cuales actúan como reservorios naturales, asegurándose así su evolución y perpetuación en la naturaleza. Asimismo, son capaces de multiplicar en una amplia variedad de cultivos celulares pudiendo desarrollar el estadio de persistencia en la mayoría de ellos. El objetivo de este trabajo fue determinar las diferencias existentes entre infecciones agudas y persistentes en cultivos de células Vero frente a tratamientos que tienden a desestabilizar el equilibrio virus célula. A tal fin, mediante la infección experimental de células Vero con la cepa XJCl3, se obtuvo una línea celular persistentemente infectada con dicho virus, denominada V3, que se utilizó como modelo de estudio. En los ensayos realizados con el agente mutagénico 5-fluoruracilo (5-FU) se observó que la susceptibilidad a la inhibición ejercida por esta droga sobre JUNV dependió del lapso transcurrido entre el momento de la infección y el tratamiento, y de la m.o.i. utilizada sugiriendo que la proporción de células infectadas al momento de tratar definía la resistencia a la droga. En este sentido, las células V3 resultaron menos afectadas por el 5-FU en comparación con las células infectadas y tratadas durante la etapa aguda. Por otro lado, el análisis del ciclo celular de células Vero mostró que la infección con JUNV generó alteraciones en la respuesta del cultivo frente a estímulos como la confluencia de las células de la monocapa y el tratamiento con agentes inductores de arresto del ciclo. Durante ensayos de transfección con proteínas virales dicha alteración del ciclo fue asociada a la nucleoproteína viral N. Sin embargo, a pesar de la aparente manipulación del ciclo celular por parte del virus no se pudo asociar alteraciones inducidas del ciclo, a una disminución en el rendimiento viral. Teniendo en cuenta que los cultivos persistentemente infectados no presentan el efecto citopático (EC) típico de las infecciones agudas de este virus en células Vero, se evaluó en primer lugar la naturaleza de dicho fenómeno. El estudio de distintos indicadores de apoptosis mostró que dicho evento seguía una cinética similar a la desarrollada por el EC viral, observándose además un incremento en la expresión de p53 y en el clivaje de la caspasa 3. Cuando estos indicadores se analizaron en células V3, los valores encontrados presentaron valores similares a los de células Vero sin infectar. Por otro lado, al analizar la respuesta de los distintos cultivos frente a la inducción de apoptosis con staurosporina (STS) o luz ultravioleta (UV) los cultivos persistentemente infectados resultaron más resistentes que los cultivos infectados de forma aguda y las células sin infectar frente a la apoptosis inducida por luz UV y todos se comportaron de manera similar frente a la STS. Este comportamiento sugiere que JUNV podría estar modulando negativamente la apoptosis durante la persistencia de manera específica frente a ciertos estímulos aunque no frente a un inductor fuerte como la STS. La resistencia al estrés térmico también fue evaluada como un parámetro diferencial entre los distintos tipos de cultivos. En forma similar a lo que sucedió con el 5-FU el virus resultó más resistente al tratamiento con calor cuando éste se aplicó a tiempos de tratamiento p.i. tardíos y a mayores m.o.i.. La síntesis de HSP-70, principal efector de la respuesta celular al shock térmico, no se asoció temporalmente con la reducción de los títulos virales. De manera similar a lo observado con la respuesta al shock térmico, el tratamiento con arsenito de sodio (Ars), inductor de estrés oxidativo, resultó menos efectivo cuanto mayor era la proporción de células infectadas en los cultivos. El conjunto de resultados permite concluir que las características diferenciales presentadas por los cultivos infectados en forma persistente serían adquiridas durante el transcurso de la infección, al menos en el caso de la resistencia a los inductores de: extinción viral (5-FU), estrés térmico y oxidativo (HS y Ars) y alteraciones del ciclo. Esta estrategia estaría basada en la acumulación de suficiente cantidad de proteínas, en particular, la nucleoproteína N, a fin de controlar las respuestas a estrés, ya sea por intervención directa de dichas proteínas o a través de la modulación en la formación de gránulos de estrés citoplasmáticos y/o de cuerpos nucleares asociados a la proteína de leucemia promielocítica.

Abstract:
Junín virus (JUNV), the etiological agent of the Argentine Hemorrhagic Fever, belongs to the family Arenaviridae. Viruses belonging to this family are able to cause persistent infections in rodents, which act as natural reservoirs, thus ensuring their evolution and perpetuation in nature. They are also able to multiply in a wide variety of cell cultures having the capacity to develop persistence stage in most of them. The aim of this study was to determine the differences in the response of acute and persistent infection of JUNV in Vero cells to treatments that tend to disrupt the virus-cell equilibrium typical of the latter. To this end, we obtained a cell line persistently infected with the virus, called V3, through experimental infection of Vero cells with JUNV XJCl3 strain, which was used as a study model. Studies performed with the mutagenic agent 5-fluorouracil (5-FU) showed that susceptibility to inhibition exerted by this drug on JUNV depended on the time elapsed between the time of infection and treatment, and the m.o.i. used suggesting that the proportion of infected cells when treatment was applied defined the degree of drug resistance. In this sense, the V3 cells were less affected by the 5-FU compared with treated acutely infected cells. On the other hand, cell cycle profile of Vero cells infected with JUNV was different from acutely and non infected cultures when subjected to conditions of cell cycle arrest. During transfection assays with plasmids expressing viral proteins, alterations of cell cycle, similar to those observed by infection, were associated with the expression of the viral nucleocapsid N. However, despite the apparent alteration of cell cycle by the virus, no effect on viral replication could be associated with experimentally induced cell cycle alterations. Given that persistently infected cultures do not exhibit the typical cytopathic effect (CE) characteristic of acutely infected Vero cells, the nature of this phenomenon was evaluated in first place. The study of various indicators of apoptosis showed that this event followed similar kinetics as the CE that took place in infected cells, with a concomitant increase in expression of p53 and cleavage of caspase-3. By contrast, the level of these apoptotic markers was similar for V3 and non-infected Vero cells. On the other hand, the response to two apoptosis inducers, staurosporine (STS) and UV radiation revealed that persistently infected cultures showed resistance to the latter whereas acutely, persistently and non-infected cells were equally susceptible to STS. This is probably due to the fact that induction of apoptosis by UV treatment is carried out by a specific cellular pathway that might be modulated by the virus during persistence, while STS exerts its effect as a multitarget agent. The tests performed to determine the effect of HSP-70 induction on JUNV replication of the virus showed that this protein was not involved in the reduction of viral titer. Similar to the results obtained with 5-FU, the virus was more resistant at late p.i. treatment times and high m.o.i.. Both heat-shock and treatment with the oxidative stress-inducing drug sodium arsenite (Ars) were effective in reducing viral titers. Further analysis of the activity of heat shock showed that its range of action embraced 2 steps of the viral cycle: the processes leading to the budding of virions and protein translation. Heat-shock response was also evaluated as a differential parameter among the different types of infected and non-infected cell cultures. Similarly to the conclusions withdrawn with 5-FU, JUNV infections were more resistant to heat-shock when treatment was applied late during infection or when high m.o.i. were employed. Synthesis of HSP-70, main effector of heat-shock response, could not be associated to the decrease in virus titer observed in heat-shocked cultures. Also, arsenite, an oxidative stress inducer, diminished viral replication. The degree of arsenite inhibition was dependent of the proportion of infected cells in the monolayer. Altogether, the results allow to conclude that the differential characteristics between JUNV acutely and persistently infected Vero cells would be acquired during the course of infection, at least for the resistance to 5-FU, heat shock, oxidative stress and altered cell cycle. This strategy would be based on the premise of accumulation of viral proteins, particularly the nucleoprotein, in order to control cellular response to stress, either directly or by modulating stress granules formation and/or nuclear bodies associated to the promielocytic leukemia protein.

Fernández Bonder, Julián. "Un problema de frontera libre en teoría de combustión" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis consideramos el siguiente problema de perturbación singular que se presenta en teoría de combustión Δuᵋ - uᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, ΔYᵋ - Yᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, donde D C Rᴺ+¹, ƒε(s) = 1/ε² ƒ(s/ε) con ƒ una función Lipschitz soportada en (-∞, 1]. En este sistema Yᵋ es la fracción de masa de algún reactante, uᵋ la temperatura rescalada de la mezcla y ε es esencialmente el inverso de la energía de activación. Este modelo es derivado en el contexto de la teoría de llamas premezcladas equidifusionales para número de Lewis 1. Probamos que, bajo hipótesis adecuadas sobre las funciones uᵋ e Yᵋ, podemos pasar al límite (ε → 0) — llamado límite de alta energía de activación — y que la función límite u = lim uᵋ = lim Yᵋ es una solución del siguiente problema de frontera libre (P) Δu - ut = 0 en {u>0} │Vu│ = √2M(x,t) en ∂{u>0} en un sentido puntual en los puntos regulares de la frontera libre y en el sentido de la viscosidad. En (P), M(x,t) = ƒ¹̠w˳(x,t) (s+w˳(x,t))ƒ(s)ds y -1 < w˳= limε→0 Yᵋ-uᵋ/ε. Como Yᵋ—uᵋ es una solución de la ecuación del calor, queda completamente determinada por sus datos iniciales y de contorno. En particular, la condición de frontera libre depende fuertemente de las aproximaciones de esos datos. También probamos que, bajo condiciones más débiles sobre los datos, la función límite u (que llamaremos solución límite) es una supersolución clásica del problema de frontera libre. Más aún, si D ∩ ∂{u > 0} es una superficie Lipschitz, u resulta una solución clásica de (P). Finalmente probamos, bajo hipótesis geométricas adecuadas sobre los datos, la unicidad de solución límite para el problema (P).

Abstract:
In this work we consider the following problem arising in combustion theory Δuᵋ - uᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, ΔYᵋ - Yᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, where D C Rᴺ+¹, ƒε(s) = 1/ε² ƒ(s/ε) with ƒ a Lipschitz continuous function with support in (-∞, 1]. Here Yᵋ is the mass fraction of some reactant, uᵋ the rescaled temperature of the mixture and ε is essentially the inverse of the activation energy. This model is derived in the framework of the theory of equidiffusional premixed flames for Lewis number 1. We prove that, under suitable assumptions on the functions uᵋ and Yᵋ, we can pass to the limit (ε → 0) — the so called high activation energy limit — and that the limit function u = lim uᵋ = lim Yᵋ is a solution of the following free boundry problem (P) Δu - ut = 0 en {u>0} │Vu│ = √2M(x,t) en ∂{u>0} in a pointwise sense at regular free bounday points and in a viscosity sense. Here M(x,t) = ƒ¹̠w˳(x,t) (s+w˳(x,t))ƒ(s)ds y -1 < w˳= limε→0 Yᵋ-uᵋ/ε. Since Yᵋ — uᵋ is a solution of the heat equation it is fully determined by its initial-boundary datum. In particular, the free bounday condition only (but strongly) depends on the approximation of the initial-boundary datum. Also we prove that, under weaker assumptions on the data, the limit function u (that we call limit solution) is a classical supersolution of the free bounday problem. Moreover, if D ∩ ∂{u > 0} is a Lipschitz surface, u is a classical solution to (P). Finally we prove, under adequate geometric assumptions on the data, the uniqueness of limit solutions for problem (P).

Fernández Borda, Roberto A.. "Observaciones solares en H alfa : Innovaciones técnicas y aplicaciones científicas" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo central de esta Tesis de Doctorado es la puesta a punto del HASTA (Ha Solar Telescope for Argentina) para su aplicación a las observaciones solares. El HASTAes un telescopio solar provisto de un filtro Lyot sintonizable, optimizado para trabajar en 6562.7 ± 1 Å con un ancho de banda de 0.3 Å. Las imágenes son adquiridas por una cámara CCD (Charge Coupled Device) de 1280 x 1024 pixeles. Cada pier del instrumento subtiende 2.07 arcseg obteniéndose una resolución espacial de ~ 4 arcseg. Este instrumento posee dos modos de operación, el modo de patrullaje y el modo de fulguración. En el modo de patrullaje se adquieren imágenes cada 2 min; mientras que en el modo de fulguración cada 10 seg. El control de estos dos modos de adquisición, mediante métodos automáticos de detección de fulguraciones. hace del HASTA un instrumento versátil capaz de estudiar fenómenos transitorios en el Sol con una excelente resolución temporal. En este trabajo describiremos los pasos seguidos para adaptar al HASTAa su nueva ubicación. a sus nuevos periféricos y sus tareas de patrullaje continuo del Sol. Mostraremos como se realizó la calibración de sus datos y presentaremos un nuevo método de detección automática de fulguraciones solares. También describiremos observaciones en las que el HASTA desempeñó un papel preponderante o fue usado como un eficiente instrumento de apoyo. Por último, se discutirán las potencialidades de este instrumento y las posibles modificaciones que puedan incrementar sus ya excelentes capacidades operativas.

Abstract:
The aim of this Thesis is to develop the necessary tools to make of the Ha Solar Telescope for Argentina (HASTA) an efficient instrument for solar observations. HASTA is a solar telescope provided with a tunable Lyot filter, optimized to work in 6562.7 ± 1 Å with a bandwidth of 0.3 Å. The images are acquired by a CCD (Charge Coupled Device) camera having 1280 x 1024 pixels. Each pixel covers 2.07 arcsec on the Sun, reaching a spatial resolution of ~ 4 arcsec. The instrument has two operating modes. a patrol mode and a flare mode. Images are obtained every 2 min. in patrol mode, and every 10 sec. during flare mode. These two modes are controlled using automatic methods to detect solar fIares. which make HASTA a very versatile instrument to study transitory phenomena on the Sun with an excellent temporal resolution. We will describe the steps followed to adapt HASTA to its new location in the Argentinean mountains, to its new peripheral interfaces and its continuos patrolling of the Sun. We wiIIdescribe the data calibration and we will present a new method to automatically detect solar flares. We will also analyze observations of events in which HASTA either played an important role or supported other instruments. Finally, we will discuss the potentials of the instrument and the improvements to be applied to increase its already excellent operational capabilities.

Fernández Cobo, Mariana. "Aislamiento y caracterización de segmentos genómicos del virus de la Hepatitis B para su utilización como reactivos biológicos" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fernández Degiorgi, Cristina Haydeé Carolina. "Utilización de las radiaciones ionizantes en procesos industriales" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de esta Tesis ha sido la aplicación de las radiaciones ionizantes, en particular la radiación gamma del 60Co, en dos campos diferentes: la obtención de hidrogeles y la inactivación de agentes patógenos en materiales biológicos, con la característica común que, en ambos, las condiciones de irradiación fueron en estado supercongelado (-78°C). Los hidrogeles son matrices poliméricas radioinducidas que absorben y retienen agua sin disolverse. En la polimerización por radiaciones a bajas temperaturas de una solución o suspensión de monómeros (ésteres de ácido metacrílico o ácido acrílico), el agua forma microcristales dispersos en el monómero mientras éste polimeriza en estado líquido supercongelado. Al finalizar la irradiación, cuando el sistema alcanza la temperatura ambiente, los microcristales de hielo retenidos por la matriz polimérica forman poros, en las paredes de los cuales los biocomponentes son inmovilizados principalmente por adhesión. Esta propiedad se puede utilizar para inmovilizar sustancias biológicamente activas o como soporte de especies vivas tales como levaduras, hongos, bacterias, etc. Los hidrogeles fueron utilizados para la inmovilización de un antibiótico con el fin de obtener un sistema de liberación controlada y como soporte para la inmovilización de bacterias para ser empleadas en la remoción de metales pesados de soluciones contaminadas. En los dispositivos obtenidos con ampicilina inmovilizada se realizaron estudios de liberación in vivo e in vitro para determinar los parámetros fármacocinéticos y la determinación de la estabilidad del antibiótico en las condiciones de irradiación. Por otra parte, dada la capacidad de los hidrogeles para ser usados como soporte de bacterias y al uso potencial de biomasas de microorganismos inmovilizadas como bioadsorbentes de metales, en el presente trabajo se realizaron estudios de adhesión de bacterias aisladas del Río de la Plata capaces de crecer en presencia de Cd(II), Pb(II) y Cu(II) en hidrogeles obtenidos por polimerización radioinducida y su aplicación en procesos de remoción de tales iones metálicos. Con este propósito, se obtuvieron diferentes hidrogeles variando el tipo de monómero (diferente hidrofilicidad), la cantidad de agua y glicerina, y también incluyendo otros monómeros (copolimerización), con el objeto de obtener la matriz polimérica más adecuada para lograr la máxima adhesión de los microorganismos. A estos fines. se estudiaron: la hidrofilicidad de los hidrogeles por determinanción de los valores del contenido de agua en equilibrio; la adhesividad de bacterias por microscopía electrónica para seleccionar el soporte polimérico adecuado, y por último, la inmovilización de bacterias aisladas del Rio de la Plata en hidrogeles con el propósito de realizar estudios de descontaminación de soluciones. Respecto de Ia inactivación de agentes patógenos por radiaciones ionizantes a bajas temperaturas (-78°C) se utilizaron dos sistemas de estudio: i) la radioesterilización de sueros fetales bovinos para su uso en cultivos celulares y ii) la inactivación de virus herpes bovino tipo-1. En el primero, el propósito fue determinar si se producían cambios en las propiedades físico-químicas o en las funciones biológicas específicas de las proteínas séricas por efecto de las dosis necesarias para obtener una esterilización eficiente y controles microbiológicos de los sueros irradiados a bajas temperaturas. En el segundo, el propósito fue determinar la dosis necesaria que reduce la población viral en un 90% (D10)en medio Glasgow-MEMlibre de suero, antes y después de la remoción de los restos celulares a bajas temperaturas.

Fernández Di Pardo, Agustina. "Contaminación en suelos de la provincia de Buenos Aires con el herbicida organofosforado (glifosato) : impacto sobre la comunidad de hongos filamentosos" (2014-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El herbicida más utilizado en Argentina es el N-phosphonomethylglycine (nombre comercial: Glifosato). Éste puede ser rápida y completamente degradado por los microorganismos, por lo que el tiempo de vida en el suelo es bajo. Sin embargo, el comportamiento del glifosato puede variar en función de las características físicas y químicas del suelo sobre el que se aplique. Por lo tanto, el tiempo de permanencia en el suelo podría ser mayor. Es importante estudiar el comportamiento de este herbicida dada las potenciales alteraciones que puede provocar en las comunidades de microorganismos que viven en el suelo y en algunos de sus procesos. La contaminación de los suelos no sólo está afectando su biodiversidad microbiana sino también a su fertilidad, dado que los microorganismos son fundamentales para el proceso de reciclaje de nutrientes. En este trabajo, se compararon comunidades de hongos filamentosos provenientes de suelos con y sin historia de aplicación de glifosato y se evaluó la capacidad de los hongos filamentosos en la recuperación de suelos contaminados por el herbicida glifosato. Para ello, se aislaron y caracterizaron hongos filamentosos del suelo en dos sitios con distinta historia de aplicación de glifosato utilizando dos técnicas distintas (método tradicional de lavado de muestras múltiples y siembra de partículas de suelo y el método de pirosecuenciación). Se seleccionaron cepas tolerantes a glifosato, se estudiaron los efectos del glifosato sobre los hongos luego de una aplicación puntual y se evaluó la presencia de glifosato en el suelo. Se observó que las poblaciones fúngicas del suelo varían en su composición específica y en su biomasa en suelos expuestos a glifosato en comparación con suelos sin exposición. La mayor riqueza específica y los mayores valores de ergosterol, como medida indirecta de biomasa, se obtuvieron en suelos sin historia de prácticas agrícolas. Se lograron obtener cepas tolerantes al glifosato: T. harzianum; F. oxysporum; P. lilacinus; C. didymum. Finalmente, los valores de concentración de glifosato en suelos fueron bajos y prácticamente nulos luego de 3 meses de la aplicación en la mayoría de los casos.

Abstract:
The most widely used herbicide in Argentina in de N-phosphonomethylglycine (glyphosate). Because it can be rapidly and completely degraded by microorganisms, it disappears quickly from soil. However, the destiny of glyphosate in soil may vary depending on the physical and chemical soil characteristics. It is important to study the behavior of this herbicide given the potential changes that may produce in the communities of microorganisms and in the processes that involves them. The soil contamination with this herbicide no only affects the microbial biodiversity, but also its fertility, considering that microorganisms are a fundamental part of the nutrient recycling process in soil. In this study, changes in filamentous fungi communities’ from soils that were previously or not exposed to the herbicide and the capacity of some strains of remediating contaminated soils were evaluated. Soil fungi were isolated and communities were characterizes in two sites with different history of exposure to glyphosate, using two techniques: traditional isolation method (morphological) and pyrosequencing (molecular). Tolerant strains of fungi were selected; effects of recent glyphosate application on soils fungal communities was evaluated and remnant glyphosate in soil was quantified. In conclusion, soil fungal community changes and fungal biomass reduction were observed after glyphosate application. Six tolerant strains were obtained: T. harzianum; F. oxysporum; P. lilacinus; C. didymum. The concentration of glyphosate in soil was practically zero after 3 month from application.

Fernández Do Porto, Darío Augusto. "La vía de CD137 regula de manera diferencial las respuestas innatas y adaptativas en el contexto de la tuberculosis humana" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La protección frente a M. tuberculosis requiere del establecimiento una respuesta de citoquinas Th-1, dominada por la secreción de interferón (IFN)-γ. Varias proteínas de señalización participan en la regulación de la activación de los linfocitos T, modulando los niveles y el patrón de citoquinas producidos por dichas células durante la estimulación antigénica. Así, resultados de nuestro laboratorio han demostrado que el Coestimulador Inducible (ICOS) y la Molécula Linfocitaria Activadora de Señales (SLAM) estimulan la secreción de IFN-γ mientras que la proteína asociada a SLAM (SAP), CD31 y el receptor de muerte programada (PD)-1 inhiben la respuesta Th-1 durante la respuesta inmune del hospedador frente a M. tuberculosis (M.tb). El receptor CD137 (4-1BB), un miembro de la superfamilia de receptores del Factor de Necrosis Tumoral (TNFR), es otra de las moléculas de señalización que participan en la regulación de las funciones efectoras de las células T CD137, una molécula que puede expresarse de manera constitutiva o en forma inducida en varios tipos de células inmunes, puede desempeñar un rol coestimulatorio sobre las células T, uniéndose a su ligando CD137L, el cual a su vez se expresa sobre Células Presentadoras de Antígenos (CPA). Dado que CD137 y CD137L puede expresarse sostenidamente durante infecciones crónicas e inflamaciones prolongadas, nuestra hipótesis de trabajo fue que ambas moléculas podrían desempeñar un rol clave durante las respuestas inmunes innata y adaptativa en la infección persistente por M. tuberculosis. A través de cultivos in vitro, demostramos que la estimulación con M.tb de células mononucleares de sangre periférica (CMSP), tanto de pacientes con tuberculosis como de individuos sanos, incrementa la expresión de CD137 y CD137L en monocitos y células NK, y de CD137 en linfocitos T. Por otro lado, observamos que la señalización a través de la vía de CD137 disminuye los porcentajes de monocitos y células NK productoras de IFN-γ y TNF-α estimulados con M.tb, mientras que, en contraste, aumenta las funciones efectoras y la sobrevida de las células T. De esta manera, durante la respuesta temprana, el receptor CD137 inhibiría la producción de IFN-γ y TNF-α por células NK y macrófagos respectivamente. Por el contrario, durante la respuesta inmune más tardía, CD137 estimularía la producción de IFN-γ por las células T, pero continuaría inhibiendo los niveles de TNF-α secretados por los macrófagos. Dado que la señalización a través de CD137 modula de manera opuesta los niveles tardíos de IFN-γ y TNF-α, se estudió la existencia de una posible regulación cruzada entre ambas citoquinas. Así, se demostró que la presencia de IFN-γ aumenta la secreción de TNF-α por CMSP estimuladas con M.tb, mientras que esta citoquina dispara mecanismos pro- y anti-inflamatorios que regulan finamente los niveles de IFN- γ producidos por las células T en el contexto de la tuberculosis. A fin de comprender los mecanismos que regulan la señalización del receptor CD137 se desarrolló un Modelo Bayesiano Computacional (MBC). La construcción de este modelo implicó traducir en ecuaciones diferenciales los diferentes procesos inmunológicos que ocurren en el sistema experimental con el objetivo de utilizar herramientas bayesianas para extraer una mayor información de los resultados experimentales de la que se podría obtener a través de un análisis estadístico tradicional. Los resultados del MBC predicen un efecto directo del receptor CD137 sobre las células T y sugieren que la regulación de los niveles de IFN-γ producidos por estos linfocitos, se basa en un aumento de la sobrevida de los mismos, más que en la inducción de la producción de dicha citoquina. Por otro lado, el MBC muestra que el mecanismo que da cuenta del efecto de CD137 sobre el TNF-α estaría basado en una disminución de la tasa de producción de dicha citoquina por las CPA y posiblemente, en un incremento de la apoptosis de estas células. Así, el MBC demostró ser una herramienta poderosa para comprender en profundidad los mecanismos de señalización del receptor CD137 durante la respuesta inmune humana frente a M. tuberculosis. El estudio de las vías de señalización a través de receptores linfocitarios durante la tuberculosis activa podría constituir un blanco potencial para la manipulación terapéutica, lo cual impactaría en el desarrollo de potenciales tratamientos contra la enfermedad. En particular, en este trabajo se presenta evidencia que propone al receptor CD137 como un posible candidato en la terapia contra la tuberculosis humana. Sin embargo, se deben tener en cuenta algunas precauciones a la hora de manipular este receptor con fines terapéuticos, dado que los anticuerpos agonistas anti-CD137 pueden causar severas anomalías en el sistema inmune del hospedador, tomando en consideración el hecho de que la vía CD137:CD137L opera de manera diferencial en las distintas células durante la respuesta inmune y adaptativa.

Abstract:
Protective immunity against Mycobacterium tuberculosis requires a Th-1 response dominated by IFN-γ secretion. Several signaling proteins contribute to the active up- or down-regulation during the priming of a T cell, modulating the level and pattern of cytokines produced by those cells upon antigen-stimulation. For example, during the immune response of the host against M. tuberculosis, we have demonstrated that SLAM and ICOS enhanced IFN-γ secretion whereas the SLAM associated protein (SAP), CD31 and PD-1 interfered with Th-1 responses. Another signaling molecule that participates in the regulation of T cell effector functions is the receptor CD137 (4-1BB), a member of the TNFR superfamily that can play a costimulatory role for T cell immunity upon binding with its ligand CD137L. In particular, it was reported that CD137:CD137L interactions boost CD8 T cell responses, although the expression profile of CD137 is now known to be quite broad, being present or induced on various types of immune cells, and not solely restricted within T lineage cells. Since the expression of CD137 has been reported to be sustained under conditions of persistent infection in chronically infected individuals, we hypothesized that CD137 and CD137L would have a role during innate and adaptive human responses against M. tuberculosis. By using in vitro cultures, we demonstrated that M. tuberculosis antigenstimulation of Peripheral Blood Mononuclear Cells increased both CD137 and CD137L expression on monocytes and NK cells from tuberculosis patients and healthy donors, but only up-regulated CD137 on T lymphocytes. CD137 pathway inhibits the levels of IFN-γ and TNF-α produced by monocytes and NK against M. tuberculosis. In contrast, CD137 significantly enhanced T cells effector functions and survival. In this way, CD137 inhibits early IFN-γ and TNF-α, produced mainly by NK cells and macrophages respectively, but, during late responses, stimulates IFN-γ produced by T cells, since continue inhibiting the major source of f TNF-α, the macrophages. Since CD137 regulates in opposite ways late IFN-γ and TNF-α, we studied a possible cross regulation between this two cytokines. We have demonstrated that IFN-γ increase TNF-α secretion by M.tb stimulated-PBCM. On the other hand, TNF-α triggered pro- and anti- inflammatory mechanisms that fine tune IFN-γ levels in the tuberculosis context. To make an insight in the possible mechanisms that account for the experimental data experimental data, we build a Bayesian Computational Model (BCM). The construction of this model implied to translate into differential equations those immunological processes occurring in the experimental system in order to use Bayesian tools to extract more information of the experimental results than the obtained through traditional statistical analysis. MBC results predict a direct effect of CD137 on T cells and suggest that the regulation of the levels of IFN-γ is based more on an increased survival of these cells, rather than the induction of the production of this cytokine. On the other hand, BCM shows that the mechanism that accounts the effect of CD137 on TNF-α is based on a decrease in the rate of TNF-α production by Antigen-Presenting Cells (APC), and possibly an increase in apoptosis of these cells. The MBC was shown to be a powerful tool for understanding the signaling mechanisms of CD137 in the human response to Mycobacterium tuberculosis. The understanding of the signaling pathways through lymphocytes receptors during active tuberculosis may have important implications for potential human therapies. In particular, in this work we show evidence to support CD137 receptor as a possible candidate for human therapy against tuberculosis. Nonetheless, caution must be used when designing ways to manipulate CD137 in human therapy, given that the agonistic anti-CD137 antibodies can cause severe immune system abnormalities and taking into consideration the fact that the CD137:CD137L pathway may operate differently in distinct cells during the innate and adaptive immune response.

Fernández Gimenez, Analia Verónica. "Requerimiento de vitaminas liposolubles A y E en la dieta del camarón Artemesia longinaris Bate, 1888 y el langostino Pleoticus muelleri (Bate, 1888)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Una condición importante para el cultivo exitoso de camarones y langostinos, es la calidad de la dieta, basada en su composición y en la proporción en que cada ingrediente es utilizado. Hasta el momento prácticamente no se han realizado estudios relacionados con requerimientos vitaminicos de los camarones penaeoideos del Mar Argentino. Este aspecto es esencial para elaborar una dieta apropiada para estas especies potencialmente cultivables en Argentina. En la presente Tesis se estudió la respuesta del camarón Artemesia longinaris y del langostino Pleoticus muelleri, alimentados con dietas con distintas dosis de vitaminas A y E. con la finalidad de determinar los valores óptimos para un buen crecimiento y estado de salud de los animales. Se realizaron experimentos de crecimiento en acuarios y al finalizar se analizó histológicamente el hepatopáncreas aplicando técnicas de rutina. En general se obtuvieron buenos valores de incremento en peso y supervivencia. En función del crecimiento y el análisis histológico del hepatopáncreas de Artemesia longinaris, se determinó un requerimiento de vitamina A de 500 mg/kg. Para Pleoticus muelleri se estableció un nivel óptimo de 180 mg/kg dieta. He & Lawrence (1994) demostraron que la incorporación de por lo menos 130 mg vitamina A/kg dieta asegura el normal crecimiento de Litopenaeus vannamei. Los camarones alimentados con una dieta suplementada con 1500 mg vitamina E/kg dieta, presentaron mayor incremento en peso y supervivencia y se conservó la estructura normal del hepatopáncreas. Para el langostino Pleoticus muelleri se estimó un requerimiento de 1750 mg vitamina E/kg. He & Lawrence (1993b), determinaron para Litopenaeus vannamei un requerimiento de 99 mg vitamina E/kg dieta, nivel significativamente menor a 300 mg/kg previamente recomendado por Akiyama et al. (1992) para la formulación de dietas comerciales. Los requerimientos vitamínicos difieren entre las distintas especies de camarones, probablemente debido a diferencias especie-especificas. Se observó en las dos especies estudiadas que la utilizaciónde BHT (antioxidante sintético), no permite un adecuado crecimiento de los individuos; además se evidenciaron severos trastornos histopatológicos en el hepatopáncreas. He y Lawrence (1993b) trabajando con Litopenaeus vannamei demostraron que los animales crecieron poco y sugirieron que el BHT no ejerce una buena protección de las membranas celulares. Se puede concluir que las vitaminas A y E son nutrientes esenciales para el camarón Artemesia longinaris y el langostino Pleoticus muelleri ya que en situaciones de estrés nutricional, el hepatopáncreas reacciona con cambios citológicos que pueden provocar la disminución de su actividad. Por lo tanto, para mantener el estado funcional normal de las especies estudiadas, es necesario suplementar las dietas con vitaminas A y E con las dosis recomendadas. Esta investigación aporta información para la reformulación y mejoramiento de las dietas utilizadas para el engorde de camarones y langostinos en cultivo, fundamentalmente en lo referente a las dosis para optimizar el crecimiento y la supervivencia. Asimismo representan un aporte al conocimiento de la respuesta funcional del hepatopáncreas, que hasta el momento no había sido estudiada para especies de crustáceos argentinos.

Abstract:
Diet quality, based on its composition and in the ingredients proportion, is an important condition for a successful culture of prawn and shrimp. Up to this moment, there are just a few studies related to the Vitamin requirement of penaeid shrimps from the Argentine Sea. This topic is essential to elaborate a suitable diet for these species that are potentially appropriate for culture in Argentina. The response of Artemesia longinaris and Pleoticus muelleri, fed with diets containing different quantities of vitamins A and E, was studied in the present Thesis. The main objective was to determine the optimum vitamin values to ensure a good health condition and a good growth of the animals. Growth experiments were carried out in aquaria and in the end the hepatopancreas were analyzed using routine histological techniques. In general, a good survival and good values of weight increment were obtained. According to the growth values and the histological analysis of the hepatopancreas. Artemesia longinaris has got a minimum requirement of 500 mg vitamin A/kg diet. For Pleoticus muelleri the optimum value was determined to be 180 mg vitamin A/Kg diet. He and Lawrence (1994) showed that the inclusion of at least 130 mg vitamin A/Kg diet ensure a normal growth of Litopenaeus vannamei. The shrimps, fed with a supplemented diet containing 1500 vitamin E/Kg, showed greater growth increment and survival and the hepatopancreas kept a normal structure. In Pleoticus muelleri, the requirement of vitamin E was estimated in 1750 mg of vitamin /kg diet. However, He and Lawrence (1993b) determined for Litopenaeus vannamei a requirement of 99 mg vitamin E/Kg diet, this level is significantly lower than the 300 mg/kg previously recommended by Akiyama et al. (1992) to formulate commercial diets. Vitamin requirements differ among distinct shrimp species, this is probably due to specie-specific differences. The studied species evidenced that the utilization of BHT (a synthetic antioxidant) does not permit an adequate growth of the individuals, at the same time severe histopathological changes were observed in the hepatopancreas. He and Lawrence (1993b) working with Litopenaeus vannamei showed that the shrimps had a poor growth and suggested BHT does not produce a good protection of cell membrane. The present work permits to conclude that the vitamins A and E are essential nutrients for Artemesia longinaris and Pleoticus muelleri, since under nutritional stress the hepatopancreas suffers histological changes that can produce a reduction of the organ activity. Then, it is necessary to supplement diets with vitamin A and E, using the recommended proportions, to maintain the normal functional state of the studied species. This investigation supplies information to reformulate and improve diets used to feed prawns and shrimps under culture conditions, in special it presents the minimum quantities of each vitamin to optimize growth and survival. At the same way, it represents a contribution to the knowledge of the functional response of the hepatopancreas; this aspect had not been studied yet for species of Argentine crustaceans.

Fernández Iriarte, Pedro José. "Bases genéticas de la adaptación de Drosophila buzzatii al uso de los recursos" (1999). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo de Tesis se analizaron las bases genéticas de la adaptación de Drosophila buzzatii al uso de los recursos, asociadas con la variación en los caracteres de historias de vida, intentándose profundizar en el conocimiento de los procesos adaptativos que afectan la distribución de la variabilidad en las poblaciones naturales. Se ha demostrado que el polimorfismo de inversión del cromosoma 2 de D. buzzatii afecta a la viabilidad(VI), el tiempo de desarrollo (TD) y el largo del tórax (LT).Además,los efectos de las inversiones sobre el TD y la VT no son independientes del tipo de cactus usado como sustrato larval. Estos efectos de interacción genotipo x ambiente podrían proporcionar las bases para la especialización y partición del recurso. Por otra parte, los efectos entre el TD y el LT sugieren la existencia de compromisos (trade-off) en la aptitud. En poblaciones naturales se observó que la diferenciación microespacial de las frecuencias de inversión entre los sitios de cria individuales (rots), es mayor que la observada a una escala temporal. El nivel principal de diferenciación es el rot individual y una parte de la divergencia en las frecuencias cromosómicas podría deberse al efecto fundador producido por la colonización de un bajo número de individuos. Las inversiones cromosómicas no presentaron un patrón de atracción diferencial entre plantas hospedadoras diferentes (Opuntia quimilo y Trichocereus terschekii).La ordenación 2J mostró en ambos hospedadores efectos direccionales positivos en longevidad balanceados por efectos negativos en viabilidad pupal, mientras que la ordenación 2ST mostró efectos opuestos. Además, los cariotipos mostraron un leve efecto diferencial sobre la viabilidad pupal y un exceso de lieterocigotas significativo en la mayoria de los rots de ambos hospedadores. Este resultado podria ser explicado por aptitud diferencial entre cariotipos. Las comparaciones de las frecuencias de diferentes loci isoenzimáticos mostraron principalmente para el locus Est-2 efectos de atracción y viabilidad diferencial entre hospedadores lo que podría sugerir para su mantenimiento la existencia de selección de hábitat dependiente de la heterogeneidad de los recursos. Estos resultados mostraron, además, que la selección que opera sobre las ordenacione cromosómicas no puede explicar los patrones de variación en las frecuencias alélicas de los loci isoenzimáticos.

Abstract:
The genetic basis of adaptation of Drosophila buzzatti associated with life history variation is analized in this Thesis by study the adaptive processes in relation to the use of different resources affecting the distribution of variability in natural population. This work shows that D. buzzatii second chromosome polymorphic inversions affect viability(VI), developmental time (DT) and thorax lenght (TL). In addition, the effects of inversions on life history traits are not independent of the cactus rearing media. genotype x environment interactions for fitness components would provide the opportunity for resource specialization and resource partitioning. Moreover the effects on DT and TL suggest that a trade-offs between early and late fitness components may be invoked to explain the maintenance of the polymorphism. In natural populations temporal variation of inversion frequencies is lower than variation among individual breeding sites (rots), suggesting that the latter is more important in determining the distributions of inversion frequencies. The breeding structure of D. buzzatii populations is strongly affected by the discrete and ephemeral substrates that are colonized by a small number of mating pairs each generation. Chromosomal inversions do not affect attraction to O. quimilo and T. Terschekii rotting pads. Fitness component analysis showed that arrangement 2J increases longevity effects and decreases pupal viability while 2ST has opposite effects. However, there is a significant within-rot excess of inversion heterokaryotypes for the second chromosome and a slight effect of differential viability in both resources. These results can be explained by differential fitness among karyotype. Analysis of allozyme genotypes variation in a natural population showed differential effects of attraction and viability among alleles of locus list-2 in two types of resources, suggesting the existence of habitat selection. These results suggest that the selection operating on the inversion polymorphism cannot be account for the selective differences affecting allozyme loci.

Fernández Murray, Jorge Pedro. "Aislamiento y caracterización de una Aminopeptidasa en el ascomicete Saccobolus platensis : efecto de la fosforilación del sustrato sobre la actividad enzimática" (1994). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fernández Pepi, María Gabriela. "Estudios fitolíticos de las comunidades vegetales del ecotono fueguino como una herramienta para reconocer sus variaciones de composición en el pasado reciente" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los primeros estudios de la biodiversidad en el Ecotono fueguino (Tierra del Fuego, Argentina), permitieron conocer la composición de las comunidades vegetales y sus variantes en el paisaje. Éstos sugieren cambios en los pastizales naturales como consecuencia del sobrepastoreo. El objetivo de este trabajo fue comparar las asociaciones fitolíticas de las tres principales comunidades de esta región con distinto grado de pastoreo: la Estepa de Festuca gracillima, Pastizal de Poa pratensis y Humedal de Caltha sagittata. La caracterización de las asociaciones fitolíticas de las comunidades actuales permitieron reconocerlas en forma diferencial y esto fue aplicado al análisis de las asociaciones fitolíticas halladas en las sucesiones pedosedimentarias. Las comunidades actuales presentaron mayor afinidad con las asociaciones fitolíticas de los primeros 10-20 cm de cada perfil. Se pudo establecer que el Humedal y el Pastizal presentan mayores diferencias entre las asociaciones fitolíticas actuales con las del pasado. Además los niveles basales de estas comunidades se relacionan con la vegetación actual de la Estepa y su vega de inundación. Esto puede deberse a que tanto el Humedal como el Pastizal están sometidas al pastoreo de animales domésticos como de nativos. En cambio, la Estepa está sujeta sólo al pastoreo ocasional de guanacos.

Abstract:
Early studies of biodiversity in the central part of Fuegian Ecotone (Tierra del Fuego) allowed to know the composition of plant communities inhabiting the area and its variants in the landscape. The results of the present research suggest changes in the surrounding natural grasslands as a result of overgrazing by domestic livestock. The aim of this study was to compare the phytolith assemblages of three Fuegian Ecotone communities with different degrees of grazing: Festuca gracillima steppe, Poa pratensis grassland and Caltha sagittata wetland. The characterization of the phytolith assemblages of the each community allowed to differentiate and was applied to the analysis of phytolith assemblages found in soil succesisions. The actual communities had, in general, higher affinities with the first 10-20 cm phytolith assemblages of each profile. These results allow us to establish that communities of wetland and grassland are those with the greatest differences between actual and past phytolith assemblages. Besides the basal levels of these communities related to the current vegetation of the steppe and its flood plain. This may be due to the grazing level supported: the grasslands and wetlands are subject to livestock grazing as well as native herbivory, while, the steppe has only occasional guanacos grazing.

Fernández Slezak, Diego. "Estimación de parámetros en modelos biológicos complejos. Aplicación a modelos de crecimiento tumoral" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las ciencias de la vida comprenden todos los campos de la ciencia que estudian organismos vivos y procesos biológicos. Tradicionalmente, la biología y la medicina han sido los campos centrales de las ciencias de la vida. Los avances tecnológicos en biología molecular y biotecnología trajeron consigo un crecimiento sin precedentes de campos interdisciplinarios, tales como la bioinformática, biología computacional, biología de sistemas, y neuroinformática por nombrar algunas. En particular, el estudio computacional del cáncer y terapias asociadas se ha transformado en una rama muy importante dentro de la biología computacional. Resultados provenientes de la biología ́de sistemas están siendo utilizados para todo tipo de investigación que comprenden tanto descubrimientos biológicos como avances para el diagnósticoy la medicina clínica. En muchas aplicaciones, los datos provenientes de estudios clínicos, biológicos o moleculares son condensados en modelos matemáticos con cierto poder predictivo. No es infrecuente que estos modelos incluyan gran cantidad de parámetros libres cuyos valores deben ser estimados para obtener un completa determinación del modelo. El proceso de determinación de parámetros presenta un gran desafío en el desarrollo de modelos matemáticos o computacionales de procesos biológicos. En consecuencia, un paso necesario para la utilización efectiva de modelos en la predicción de fenómenos biológicos es la estimación de parámetros libres. El ajuste de parámetros es un área muy estudiada en ciencia, tecnología, economía estadística, y otras disciplinas, por lo cual existen muchos enfoques para resolverlo. En la mayoría de estos enfoques, uno de los desafíos más difíciles de confrontar es la enorme demanda de poder de cómputo requerida tanto en la resolución delmodelo como en el proceso de estimación de parámetros. Dado que la simulación numérica cuenta entre las aplicaciones más fértiles de la Ciencia de la Computación, no debe resultar extraño que un número considerable de estudiosos de la computación científica se hayan volcado al campo de simulación numérica de procesos biológicos. Con el crecimiento exponencial en la potencia computacional de los sistemas modernos, se han ampliado los desarrollos y resolución de sistemas cada vez más grandes y complejos que han permitido atacar el modelado de sistemas biológicos de alta complejidad. En esta tesis nos proponemos estudiar el problema de estimación de parámetros y evaluación de las soluciones encontradas en el modelado de crecimiento tumoral en etapa avascular, utilizando computación de alto rendimiento. Para ello, hemos extendido un modelo de crecimiento de esferoides multicelulares, modelo que abar ca una gran variedad de casos experimentales. Para la evaluación de este modelo de ecuaciones diferenciales en derivadas parciales con condiciones de borde dependientes del tiempo, se desarrollá una solución numérica utilizando el todo de diferencias finitas. Este modelo resultó tener una considerable versatilidad en las soluciones encontradas, mostrando un rango muy amplio de comportamientos que permiten la explicación de una amplia gama de posibles experimentos. A partir de datos experimentales y sintéticos hemos ajustado los parámetros del modelo mediante técnicas de optimización no lineal, utilizando una función decosto de cuadrados mínimos. Mediante el uso de computación de alto rendimiento con miles de procesadores disponibles, exploramos el espacio de parámetros del problema analizado, evaluando dicha función de costo a partir de distintos puntos iniciales y con distintos algoritmos de optimización. De esta forma, se realizó un barrido exhaustivo del espacio de parámetros, lo que nos permitió encontrar una multiplicidad de mínimos locales en el ajuste de parámetros, como así también lo que a todas luces parece ser el mínimo global de la función de costo. El resultado sorprendente de esta búsqueda exhaustiva es que el valor de los parámetros en el tan buscado mínimo global corresponde a valores de parámetros que carecen de sentido desde un punto de vista biológico. Esta tesis muestra un ejemplo en el cual los parámetros del modelo que optimizan el ajuste a los datos experimentales no son necesariamente los mejores en términos biológicos, un fenómeno que es similar al problema de sobreajuste, conocido en el ámbito de aprendizaje estadístico. De esta manera, ponemos de manifiesto la necesidad de una doble verificación de los parámetros encontrados para identificar posibles soluciones fuera del rango realista en términos biológicos dado la complejidad del espacio de par ́metros. Para evitar dicho sobreajuste del modelo a los datos, proponemos la utilización de parámetros sub-óptimos que, no obstante, son explicativos de comportamientos biológicos no tomados en cuenta en el ajuste, pero que podrán ser utilizados para restringir la enorme cantidad de soluciones sub-óptimas encontradas. De esta forma llegamos a una solución de compromiso entre la función de costo óptima y valores biológicamente realistas. Concluimos que la mejor estrategia para el ajuste de un modelo a un experimento dado es el diseño simultáneo del modelo y los experimentos acordes. Algunos experimentos pueden permitir la determinación de parámetros mejor que otros, por lo que una estrategia posible para el ajuste será la generación de experimentos independientes que permitan contrastar y acotar los valores de los distintos parámetros, especialmente de aquellos que la optimización no ha podido ajustar convincentemente. En la ausencia de un modelo basado en primeros principios, la estimación de parámetros no puede simplemente confiar en la optimización de una función de costo. Proponemos que el enfoque presentado en esta tesis deber ser un procedimiento estándar a la hora de ajustar los parámetros de modelos biológicos complejos, y presentamos una formalización del procedimiento como generalización de la estrategia.

Abstract:
Computational Life Sciences include all areas of science that study biology processes and living organisms. Computational Life Sciences is helping to provide a fundamental understanding of complex biological systems and offers the potential to significantly impact a wide variety of technologies, including drug discovery, novel therapies for human, animal and plant diseases,metabolic engineering and efficient production of traditional and high-value foodstuffs. In particular, the computational study of cancer and associated therapies has become in a very proliferative and important section of com- putational biology. The vast computational resources that became available during the past decade enabled the development and simulation of increasingly complex math- ematical models of cancer growth. These models typically involve many free parameters whose determination is a substantial obstacle to model develop- ment. Direct measurement of biochemical parameters in vivo is often difficult and sometimes impracticable, while fitting them under data-poor conditions may result in biologically implausible values. In this thesis, we extended a model of avascular tumor growth covering a great amount of experimental cases. We discuss different methodological approaches to estimate parameters in complex biological models. We make use of the high computational power of the Blue Gene technology to perform an extensive study of the parameter space in a model of avascular tumor growth. We explicitly show that the landscape of the cost function used to optimize the model to the data has a very rugged surface in parameter space. This cost function has many local minima with unrealistic solutions, including the global minimum corresponding to the best fit. The case studied in this thesis shows one example in which model parameters that optimally fit the data are not necessarily the best ones from a biological point of view. To avoid force-fitting a model to a dataset, we propose that the best model parameters should be found by choosing, among suboptimal parameters, those that match criteria other than the ones used to fit the model. We also conclude that the model, data and optimization approach form a new complex system, and point to the need of a theory that addresses this problem more generally.

Fernández, Daniel Adrián. "Síntesis de Ftalocianinas sustituidas : Estudio de sus propiedades fotofísicas y fotoquímicas" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fernández, Fabiana S.. "La UDP-Glc: glicoproteína glucosiltransferasa de Schizosaccharomyces pombe. Una proteína de stress e interviene en el mecanismo de control de calidad del plegamiento de glicoproteínas en el retículo endoplasmático" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El retículo endoplásmico (RE) es el compartimiento de síntesis, modificación post-traduccional y plegamiento de proteínas y glicoproteínas que serán destinadas a secreción, membrana plasmática o distintas organelas de los sistemas endocítico y exocítico. Una de las modificaciones post-traduccionales mas frecuentes, la N-glicosilación, está relacionada con el plegamiento de las proteinas ya que sin la adición de los oligosacáridos, numerosas proteínas son incapaces de alcanzar su conformación nativa. En general, los intermediarios de plegamiento, las proteínas no totalmente ensambladas, las proteínas mal plegadas y los agregados son selectivamente retenidos en el RE. El transporte hacia el aparato de Golgi ocurre solamente cuando las proteínas se han plegado correctamente y se han ensamblado para el caso de los multímeros. Este importante fenómeno, que asegura la integridad funcional de las proteínas que salen del RE, ha sido denominado "control de calidad del RE". Para el caso de las glicoproteínas la estructura o grado de procesamiento de sus oligosacáridos ha sido postulado como una señal para la retención o el transporte de las mismas. La N-glicosilación comienza en la mayoría de los eucariotas con la transferencia de un oligosacárido de estructura GIc3Man9GlcNAc2 desde un intermediario lipídico (dolicol-P-P-oligosacárido), a proteínas nacientes en el RE. Inmediatamente luego de la transferencia, los tres residuos de glucosa son removidos por las glucosidasas I y II. Parodi y colaboradores demostraron que los oligosacáridos unidos a proteína son transitoriamente reglucosilados dentro del RE mediante la acción de la enzima UDP-Glc:glicoproteína glucosiltransferasa. Esta enzima fue purificada a homogeneidad a partir de hígado de rata. La característica que hace única a esta enzima es que la glicoproteína aceptora, en un ensayo libre de células, debe estar desnaturalizada para ser un aceptor eficiente. El efecto de la desnaturalización no se debe a que vuelve accesibles los oligosacáridos que pudieran estar no disponibles en la estructura nativa. Por el contrario, la enzima reconoce en el esqueleto proteico elementos expuestos en las conformaciones desnaturalizadas pero no en las nativas de las glicoproteínas. En este trabajo de tesis se purificó a homogenidad la UDP-Glc:glicoproteína glucosiltransferasa de Schizosaccharomyces pombe Esta resultó ser, al igual que la glucosiltransferasa de hígado de rata, una proteína soluble del RE, que requiere Ca2+ para su actividad, su pH óptimo es cercano al neutro, utiliza UDP-Glc como dador de azucar y glucosila eficientemene glicoproteínas desnaturalizadas. La enzima pura formó Glc1Man7-9GlcNAc2-proteína cuando se incubó con tiroglobulina desnaturalizada y UDP-Glc. Los mismos compuestos se formaron por glucosilación de aceptores endógenos en preparaciones crudas de microsomas de S. pombe. La misma actividad no pudo ser detectada en Saccharomyces cerevisiae siendo este el unico organismo eucarionte conocido hasta el momento que carece de actividad de glucosiltransferasa. Se secuenció el gen de la glucosiltransferasa de S. pombe (gpt1). Este codifica para un polipéptido de 1429 aminoácidos (aa), en su extremo N-terminal posee un péptido señal de 18 aa, y en el C-terminal presenta el tetrapéptido PDEL que representaría una nueva señal de retención para proteínas solubles del RE en S. pombe. Se ha propuesto recientemente un modelo en el cual la calnexina (una proteina de membrana del RE), la glucosidasa II y la UDP-Glc:glicoproteína glucosiltransferasa forman parte del mecanismo de control de calidad del plegamiento de glicoproteínas en el RE. De acuerdo al mencionado modelo, las glicoproteinas serían deglucosiladas por la glucosidasa II y, si no se encuentran correctamente plegadas, sufrirían una reglucosilación catalizada por la glucosiltransferasa. La calnexina es capaz de unir glicoproteínas con oligosacáridos monoglucosilados, por lo tanto, las glicoproteínas no plegadas serían unidas por la calnexina siendo retenidas dentro del RE dado que la calnexina es una proteína de membrana. Este ciclo continuaría hasta que las glicoproteínas adquieren sus estructuras terciarias nativas. En estas condiciones dejarían de ser sustrato de la glucosiltransferasa y solo serían sustrato de la glucosidasa II que las liberaría del residuo de glucosa y por lo tanto de la interacción con la calnexina permitiendo su salida del RE. La glucosiltransferasa tendria un rol fundamental dentro de este modelo ya que sería el sensor de la estructura de las glicoproteinas, marcándolas o no con el residuo de glucosa que determinará su unión a la calnexina. La síntesis del mRNA de gpt1 fue aumentada entre 2 y 9 veces en condiciones que se sabe afectan el plegamiento de las proteínas en el RE. Esta fue la primera evidencia obtenida in vivo que estaría de acuerdo con la participación de la glucosiltransferasa en el mencionado mecanismo de control de calidad en el RE. Hasta el momento esto habia sido inferido por la capacidad de glucosilar in vitro solo glicoproteínas desnaturalizadas. Sin embargo la disrupción del gen gpt1 en S. pombe resultó no ser letal para les células. Las células gptl - pudieron crecer sin inconvenientes a las temperaturas ensayadas, solo presentaron una pequeña diferencia de tamaño.

Fernández, Facundo Martín. "Sistemas de análisis en flujo contínuo acoplados a analizadores discreto para la especiación en línea de Cadmio y Plomo" (1999). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se describe un método de análisis que consiste en el acople entre un sistema de preconcentración en flujo y un Espectrómetro de Absorción Atómica con Atomización Electrotérmica. El sistema se emplea en el análisis y especiación de metales tóxicos (Cd y Pb) en muestras de agua de mar. Los resultados obtenidos se analizan , enfatizando especialmente las figuras de mérito: límite de detección, frecuencia de análisis, repetitividad y sensibilidad. Se realiza además, una evaluación crítica de la performance del sistema de preconcentración (eficiencia, factor de amplificación etc.) utilizando para la separación distintas resinas quelantes (Chelex-100 y 8-hidroxiquinolina inmovilizada sobre sílica). Se estudian las variables que afectan la retención de las distintas especies de los iones metálicos en los materiales antes mencionados y se modela el proceso de partición. Las resinas se comparan también en función de su morfología la que se determina mediante técnicas cromatográficas de exclusión. El sistema de preconcentración se aplica al análisis de materiales de referencia certificados (CASS-3) y a muestras de agua de mar patagónica (Comodoro Rivadavia). Los resultados se comparan con las concentraciones intracelulares de metales en algas que habitan la zona y se establece una relación entre la bioacumulación de los mismos y su especiación en el ambiente marino. Se comparan, además, distintos materiales para la retención de complejos orgánicos de los metales tóxicos los que se incorporan a micro-sistemas de análisis automático. Se realiza la valoración de las distintas fracciones mediante extracción secuencial líquido-sólido de cada una de ellas.

Abstract:
The coupling between an Electrothermal Atomization-Atomic Absorption Spectrometer and a Flow Injection manifold is presented. This system is used for the preconcentration and determination of Cd and Pb in sea water samples. The performance of the method in terms of Detection Limits, Sampling Frequency, Sensitivity and Repeatability are fully discussed. Figures of merit for the preconcentration process such as Preconcentration Efficiency and Enhancement factors are evaluated for different preconcentration materials (Chelex-100 and silica immobilized 8-hydroxiquinoline). The influence of different variables of the flow manifold on the retention of different metal species is also investigated. The hyphenated technique was employed for Cd and Pb determination in certified reference materials (CASS-3) and South Atlantic sea-water samples. The metal contents in sea water at different sites is compared to those in algal tissues. A correlation was established between the bioaccumulation process and the metal speciation in sea water. Different sorbents for the isolation of metal-organic complexes were compared for their use in the Flow Injection-preconcentration manifold. A new micro-analytical automatic method is proposed for the sequential solid-liquid extraction of the different fractions of toxic metals.

Fernández, Gabriela C.. "Participación de la respuesta inflamatoria en el desarrollo del Síndrome Urémico hemolítico" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La forma típica del síndrome urémico hemolítico (D+SUH) es una microangiopatía trombótica caracterizada por anemia hemolítica con fragmentación de eritrocitos, trombocitopenia con agotamiento de la función plaquetaria y daño renal agudo. Esta enfermedad es la principal causa de daño renal en la población pediátrica y nuestro país presenta la mayor incidencia del mundo. Si bien la mortalidad es baja debido a las terapias de soporte empleadas en el tratamiento de los síntomas, existe una alta proporción de niños (hasta un 50%) que puede presentar secuelas renales y neurológicas. El D+SUH se desarrolla luego de la ingestión de alimentos o bebidas contaminadas con bacterias productoras de una exotoxina denominada toxina Shiga (Stx). La bacteria coloniza el intestino, y comienza a producir la toxina que pasa a la circulación y se une a un receptor (Gb3) en los tejidos blanco (principalmente el riñón), donde se internaliza e inhibe la síntesis de proteínas. Si bien la Stx es absolutamente necesaria para el desarrollo de la enfermedad, existen evidencias que demuestran que el sistema inflamatorio puede influenciar el curso del D+SUH. El objetivo de esta tesis fue determinar la importancia de distintos componentes centrales de la respuesta inflamatoria como los neutrófilos (PMNs), las plaquetas y el óxido nítrico (NO) en la fisiopatología del SUH en un modelo murino por inyección endovenosa de la variante tipo 2 de la Stx (Stx2) pura. Asimismo, se investigó el estado de activación y funcionalidad de los PMNs periféricos de pacientes cursando el período agudo del D+SUH y luego de la recuperación clínica. Los resultados mostraron una disminución en la muerte y daño renal de los animales inyectados con Stx2 en ausencia de PMNs. Sin embargo, la depleción de plaquetas no tuvo ninguna influencia en estos aspectos. En los animales inyectados con Stx2 se observó una marcada neutrofilia, la cual correlacionó con el daño renal. Estos PMNs periféricos poseían mayor capacidad citotóxica, adhesión a la vasculatura y expresión del marcador de activación CD1lb. Estos datos evidencian una activación de los PMNs luego de la inyección de la Stx2 y demuestran la importancia de este tipo celular en el desarrollo del SUH como un factor de exacerbación del daño. Por otra parte, también se demostró una activación plaquetaria termprana en respuesta a la Stx2, con una inhibición posterior por agotamiento, similar a la observada en los pacientes. La inhibición de la producción de NO provocó un aumento del daño renal y la mortalidad inducidos por la Stx2. Estos fenómenos fueron mediados, al menos en parte, por una mayor activación plaquetaria en ausencia de NO. Los estudios histológicos apoyaron estos hallazgos y evidenciaron, por primera vez, la formación de coágulos intraglomerulares en los animales tratados con Stx2. Estos resultados sugieren un papel protector del NO en la fisiopatologia del SUH, mediado por su acción antitrombótica e inhibitoria de la activación plaquetaria. El estudio de los PMNs de los pacientes con D+SUH reveló una disminución en los marcadores de activación FcyRIII (CD16) y CD1lb, y en el marcador de degranulación mieloperoxidasa (MPO) y una menor respuesta citotóxica dependiente de anticuerpos y de degranulación con respecto a una población de niños sanos. Los PMNs de los pacientes presentaron una disminución del FcyRIII, la MPO y las respuestas citotóxicas con respecto a una población de niños con neutrofilia no relacionada con el D+SUH, aunque la capacidad de respuesta de degranulación entre ambas poblaciones fue muy similar. El fenotipo y funcionalidad de los PMNs de los pacientes en el momento en que acuden al hospital indica que este tipo celular se encuentra parcialmente agotado, debido a un fenómeno de activación previo. Probablemente, los efectos de la toxina sobre los PMNs sean indirectos y mediados a través de la activación y daño endotelial, ya que en nuestras condiciones y por distintas metodologías, la Stx fue incapaz de unirse y/o de causar ningún efecto en PMNs provenientes de individuos adultos normales. En conclusión, en este trabajo pudimos demostrar el papel central y modulador de distintos componentes de la respuesta inflamatoria en la fisiopatología del SUH.

Fernández, Gustavo Javier. "Ecología reproductiva del Ñandú común, Rhea americana" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se realizó un estudio sobre la ecología reproductiva del ñandú común (Rhea americana) en la localidad de General Lavalle (Provincia de Buenos Aires, Argentina). En el mismo se analizó la estructura social, comportamiento reproductivo y el éxito reproductivo de esta especie durante el período 1992-1996. Los resultados obtenidos en este estudio fueron finalmente analizados en relación a la dinámica poblacional y la evolución de las estrategias reproductivas en esta especie. Durante la temporada no reproductiva (enero-julio), los ñandúes son altamente gregarios. El grado de agrupamiento afecta la asignación de tiempo a distintas actividades. En la temporada reproductiva (agosto-diciembre) se formaron los grupos reproductivos (harenes) donde l ó 2 machos defienden un grupo de 2 a 8 hembras. La postura de huevos comienza hacia finales de setiembre y se extiende hasta fines de diciembre. Las hembras ponen sus huevos en un nido comunal, mientras que el macho se encarga de la incubación y cuidado de los pichones una vez que éstos nacen. Una vez que las hembras finalizan la puesta de huevos en un nido pueden aparearse nuevamente con otro macho, constituyendo así, un sistema reproductivo que combina la poliginia y la poliandria secuencial, y cuidado uniparental del macho. El número de huevos puestos en un nido usualmente varió entre 20 y 30 huevos, y el período de puesta duró entre 10 y 15 días. Sin embargo, algunos nidos tuvieron puestas de mayor tamaño (de hasta 56 huevos). El número de pichones producidos se incrementó con el tamaño de puesta hasta 30-35 huevos, pero disminuyó significativamente cuando había más de 35 huevos. Cerca del 30 % de los machos adultos intentaron reproducirse cada año pero más del 65 % de los nidos fueron abandonados durante la incubación. En estos nidos tanto el número de huevos perdidos (producida por rotura accidental de huevos o predación) como el porcentaje de la puesta perdida fue significativamente mayor que en nidos que completaron la incubación. La probabilidad de deserción disminuyó a medida que avanzaba la incubación. Nidos abandonados en el último período de incubación tuvieron una mayor pérdida de huevos que aquellos abandonados más tempranamente. Solamente el 4-6% de los machos adultos de la población se reprodujo exitosamente cada año. Esto puede ser consecuencia del elevado costo energético del cuidado parental. El costo energético estimado de la incubación fue alrededor de 8 veces mayor al que posee la puesta de huevos en el nido que realiza una hembra. Sumado a esto, los machos con pichones invierten más tiempo en vigilar (y menos en alimentarse) que machos en grupos o solitarios, lo cual implica un costo adicional al costo de incubación. El comportamiento reproductivo de esta especie debe ser entonces analizada considerando los factores ecológicos y fisiológicos que determinan su éxito reproductivo, dentro del marco evolutivo del desarrollo de las estrategias reproductivas en las ratites.

Abstract:
I studied the reproductive ecology of a wild population of Greater Rheas (Rhea americana) from 1992 to 1996 at General Lavalle (province of Buenos Aires, Argentina). I studied rheas social structure and dynamics, breeding behavior and nesting success. The results were analyzed in relation to population dynamics and the evolution of reproductive traits in this species. Greater Rheas are gregarious during the non-reproductive season (January-July). Group size affect the time allocate to different activities. During the breeding season (August-December) 1-2 males monopolized a harem of 2-8 females. Egg laying started in late September and lasted to late December. Females laid eggs communally in a single nest, and the male incubated these eggs for 36 to 45 days. Once chicks hatched, the male care for them until they were 6 months old. After laying eggs for one male, females could move on to lay eggs for another male. Then, this mating system combines harem defense polygyny, sequential polyandry and exclusive male parental care. The number of eggs in a nest mostly varied from 20 to 30 eggs, and laying period lasted between 10-15 days. However a few nests had larger clutches (up to 56 eggs). The number of chicks hatched per nest increased with number of eggs up to 30-35 eggs but decreased for larger clutches. This decrease was the result of a lower hatchability in large clutches. About 30 % of adult males nested each year but more than 65% of these nests were deserted during incubation. Egg losses (produced by egg breakage or predation) and the percentage of clutch lost were higher in nests that were deserted than in nests that produced chicks. The probability of deserting the nest was higher during the laying stage and decreased progressively through incubation. Besides, late deserted nests had higher egg losses than those deserted during early incubation. Only 4-6% of the adult male population bred successfully each year. This could be the consequence of the high energetic cost of uniparental care in rheas. The energetic cost of incubation was about 8 times higher than the cost of egg laying for a female. Furthermore, after hatching, the male allocates more time to vigilance (and less time to feeding) than either solitary males or males or females in groups. Then, the reproductive behavior of Greater Rheas must to be analized considering the ecological and physiological constrains that determine their reproductive success, within the broadest frame of the evolution of the reproductive traits in the ratite species.

Fernández, Lucía Raquel. "Metabolitos secundarios de plantas superiores y análogos con actividad biológica" (2015-02-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo de Tesis se describe el aislamiento, elucidación estructural y actividad biológica de los metabolitos secundarios presentes en los extractos etanólicos de dos especies nativas: Cordia americana (L.) Gottschling & J. S. Mill e Hyalis argentea D. Don ex Hook & Arn var. latisquama Cabrera. También se detalla la obtención de derivados semisintéticos a partir de productos naturales abundantes. Cordia americana (L.) Gottschling & J. S. Mill es un árbol maderero ampliamente distribuido en el norte argentino. A partir de la corteza de este árbol se aislaron seis neolignanos nuevos que poseen en su estructura un particular biciclo octeno, muy poco común en otros productos naturales. Se investigó la actividad antifúngica, antibiótica y antioxidante de dichos compuestos. A partir del extracto etanólico del arbusto costero Hyalis argentea D. Don ex Hook & Arn var. latisquama se aislaron e identificaron veintiséis terpenoides y una cumarina. Cuatro de estos compuestos son nuevos. Tanto los extractos crudos de las partes aéreas y rizomas, como los compuestos puros fueron ensayados frente a los hongos patógenos Candida albicans y Cryptococcus neoformans. Además, una alícuota del extracto polar de las partes aéreas fue incluida en pinturas de matriz soluble, a fin de evaluar su capacidad antifouling en ensayos de campo realizados en el Puerto de Mar del Plata. Con la intención de adicionar residuos que tuvieran actividad antifouling reconocida, se obtuvieron diez derivados a partir del ácido abiético, uno de los mayores constituyentes de la resina colofonia. Cuatro de estos compuestos se reportan por primera vez. Con el mismo objetivo, se adicionó un residuo oxazólico a ácidos biliares obteniéndose siete derivados nuevos. También se sintetizó el oxazol que se utilizó para modificar a los ácidos biliares. Tanto este compuesto, como los derivados de los ácidos biliares y los ácidos biliares de partida fueron utilizados en ensayos de actividad antifúngica frente a Candida albicans. Además, algunos de los derivados fueron incorporados en pinturas antifouling. Palabras clave: plantas superiores, metabolitos secundarios abundantes, Cordia americana, neolignanos, Hyalis argentea var. latisquama, terpenoides, ácido abiético, ácidos biliares, modificaciones sintéticas, oxazoles, actividad antifúngica, actividad antifouling, actividad antioxidante.

Abstract:
In this thesis is described the isolation, structural elucidation and biological activity of secondary metabolites present in the extracts of Cordia americana (L.) Gottschling & JS Mill and Hyalis argentea D. Don ex Hook & Arn var. latisquama. The synthesis of derivatives from accessible natural products that can be obtained in large quantities is also detailed. Cordia americana (L. ) Gottschling & JS Mill is a timber tree widely distributed in northern Argentina. Six new neolignans with a particular octene bicyclic core, rarely found in other natural products were isolated from the bark. Then antifungal, antibiotic and antioxidant activities of the six neolignans were assayed. The aerial parts and rhizomes of the coastal bush Hyalis argentea D. Don ex Hook & Arn var. latisquama were studied separatedly. Twenty six terpenoids and a coumarin were isolated. Four of these compounds are new. Both crude extracts of the aerial parts and rhizomes, as well as the pure compounds were tested to evaluate their antifungal activity against the pathogenic fungi Candida albicans and Cryptococcus neoformans. Besides, the polar extract of the aerial parts was included in antifouling paints for field trials at Mar del Plata harbour. Abietic acid, which is one of the major constituents of rosin, was used as starting material to obtain ten derivatives. The modifications were designed to add structural moieties with known antifouling activity to abietic acid. Four of these derivatives are reported for the first time. With the same objective, seven new oxazole derivatives were synthesized from bile acids. The oxazole fragment itself was also prepared. This last compound, together with the bile acids derivatives and the parent bile acids were tested for their antifungal activity against Candida albicans. In addition, some of the derivatives were incorporated in antifouling paints. Keywords: higher plants, secondary metabolites, Cordia americana, neolignans, Hyalis argentea var. latisquama, terpenoids, abietic acid, bile acids, synthetic modifications, oxazoles, antifungal activity, antifouling activity, antioxidant activity.

Fernández, María Soledad. "Eco-epidemiología de vectores de Leishmania spp. en el noreste de la Argentina (Provincia de Misiones)" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La leishmaniasis es una enfermedad de transmisión vectorial producida por parásitos tripanosomatídeos del género Leishmania (Kinetoplastida: Trypanosomatidae), los vectores involucrados son flebótomos (Díptera: Psychodidae: Phlebotominae) y los reservorios son mamíferos. En nuestro país el ser humano es considerado un hospedador accidental. En Misiones (noreste de la Argentina), donde se realizó esta tesis, se registran casos de leishmaniasis tegumentaria (LT) y leishmaniasis visceral (LV). El trabajo se llevó a cabo en dos áreas: 1) un área endémica de LT, en una zona de chacras ubicada en un frente de deforestación al sur de la ciudad de Puerto Iguazú donde se registró un brote en los años 2004-2005, con Nyssomyia whitmani como vector de Leishmania braziliensis y con reservorio desconocido; y 2) en un foco de LV (ciudad de Posadas), donde se registró el primer caso humano en el país (2006), con Lutzomyia longipalpis como vector de L. infantum (syn chagasi) y el perro doméstico como reservorio. Para el área endémica de LT se realizaron estudios de la composición de la comunidad de vectores en el tiempo y entre ambientes dentro de las chacras, relacionando a los flebótomos con variables climáticas y ambientales. Además se estudió el papel de los micromamíferos como potenciales reservorios de Leishmania spp. Para la ciudad de Posadas, se describió la distribución de Lu. longipalpis y sus cambios en el tiempo y se relacionó la abundancia con variables ambientales. Para ambos escenarios se encontró que la abundancia de los vectores estaría explicada al menos en parte por variables ambientales (principalmente relacionadas con la cobertura vegetal y la abundancia de animales silvestres y/o domésticos) y en el caso del escenario de transmisión de LT se encontró asociación positiva con variables climáticas (temperatura, precipitación). La abundancia de vectores se asoció con la de micromamíferos, sin embargo no se encontró evidencia suficiente para incriminarlos como reservorios. La distribución espacial de vectores resultó heterogénea en ambos escenarios, en la ciudad de Posadas se encontró un patrón de islas de alta abundancia de vectores, incrementándose la abundancia del vector entre los años 2007 y 2009. Para ambos escenarios (LT y LV) se recomienda alejar sitios de cría y dormideros de animales domésticos de la vivienda y de la ceja de monte (LT) cuando corresponda y reforzar cuidados de protección personal y tenencia responsable de mascotas (LV) en situaciones de riesgo donde exista mayor probabilidad de contacto hombre-vector, siendo la primavera y el verano las estaciones de mayor abundancia de los vectores.

Abstract:
Leishmaniasis is a vector-borne disease caused by parasites of the genus Leishmania (Kinetoplastida: Trypanosomatidae), sandflies are the vectors involved (Diptera: Psychodidae: Phlebotominae) and mammals are the reservoirs. In our country the man is considered an accidental host. In Misiones (northeastern Argentina), where this thesis were performed, tegumentary leishmaniasis (TL) and visceral leishmaniasis (VL) were recorded. This work was carried out in two areas: 1) an intense deforestated area endemic of LT, composed by farms, in the south of the city of Puerto Iguazú where an outbreak took place in 2004-2005, with Nyssomyia. whitmani as a vector of Leishmania braziliensis and unknown reservoir, and 2) in a focus of VL (Posadas), where the first case were recorded for the country (2006), with Lutzomyia longipalpis as vector and the domestic dog as reservoir. For the LT endemic area studies of the sandfly community were conducted along the time and between habitats within the farms, relating sandflies with climatic and environmental variables. In addition we studied the role of small mammals as potential reservoirs of Leishmania spp. In the city of Posadas, the distribution of Lu. longipalpis and its changes over time and abundance were related to environmental variables. For both scenarios it was found that the abundance of vectors would be explained at least partially by environmental variables (mainly related to vegetation cover and abundance of wildlife and /or domestic animals) and in the case of the LT scenario it was found a positive association between vectors and climatic variables (temperature, precipitation). The abundance of vectors was associated with small mammals, but it was not found enough evidence to incriminate them as reservoirs. The spatial distribution of vectors was heterogeneous in both scenarios and in the city of Posadas it was found vectors concentrated in limited „islands‟ of high abundance, and that the vector abundance increased between 2007 and 2009. For both scenarios (TL, VL, LV) is recommended to remove resting and breeding sites of domestic animals near the house and the forest edge (TL) where it is appropriate and enhance protective care and responsible pet ownership (VL) at risk situations where there is greater probability of man-vector contact, being the spring and summer the seasons of greatest abundance of vectors.

Fernández, Natalia Brenda. "Caracterización de los mecanismos moleculares y celulares activados por ROR1 durante la progresión de melanoma" (2016-08-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El receptor huérfano de tipo tirosina quinasa, ROR1, se expresa y cumple diversas funciones durante el desarrollo embrionario, mientras que en la adultez, su expresión en los tejidos normales es baja o nula. Sin embargo, se ha descripto que ROR1 se expresa abundantemente en diversos tipos de tumores y leucemias. A su vez, ROR1 actúa como un receptor celular de Wnt5a, un ligando extracelular que ha sido implicado en la tumorigénesis. Es por esto que decidimos determinar la expresión y participación de ROR1 en los procesos celulares y moleculares implicados en la progresión de melanoma. Nuestros resultados indican que ROR1 se expresa en líneas celulares y muestras tumorales de melanoma humano, y que su expresión se asocia con una menor sobrevida postrecurrencia de los pacientes. Empleando estrategias de pérdida y ganancia de función determinamos que ROR1 favorece el crecimiento celular, tanto de manera dependiente como independiente de un sustrato sólido. A su vez, ROR1 disminuye la adhesión y aumenta la motilidad y migración de las células de melanoma. Estos procesos son mediados, en parte, a través de la regulación positiva de la vía de Akt y del aumento de la expresión de los marcadores mesenquimales N-cadherina y vimentina. La regulación de N-cadherina depende tanto de la presencia de ROR1 como de la activación de la vía de Akt. En conclusión, demostramos que ROR1 contribuye a la progresión de melanoma y constituye un posible nuevo marcador pronóstico y blanco terapéutico.

Abstract:
The Receptor tyrosine kinase-like Orphan Receptor 1, ROR1, is primarily expressed during different stages of embryogenesis, while in the adult its expression in the normal tissues is downregulated. However, it has been shown that ROR1 re-express in various types of cancers and leukaemias. Interestingly, ROR1 acts as a Wnt5a receptor, an extracellular ligand that has been implicated in tumorigenesis. For these reasons, we decided to study ROR1 expression in melanoma and its role in the cellular and molecular processes implicated in melanoma progression. Here we show that ROR1 is aberrantly expressed in melanoma cell lines and tumours, and that its expression associates with poor post-recurrence survival of patients with melanoma. Using gain- and loss-of-function approaches we found that ROR1 enhances both anchoragedependent and -independent growth of melanoma cells. In addition, ROR1 decreases cell adhesion and increases cell motility and migration. These processes are mediated, in part, by an upregulation of the Akt pathway and an increased expression of the mesenquimal markers N-cadherin and vimentin. The regulation of N-cadherin relies on the presence of ROR1 and the activation of Akt. In summary, we show that ROR1 contributes to melanoma progression and is a candidate biomarker and a prospective therapy target.

Fernández, Patricia C.. "La recolección de néctar en la abeja Apis mellífera: actividad recolectora y mecanismos de reclutamiento" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La abeja doméstica Apis mellifera es un insecto eusocial. Esto la constituye en un excelente modelo para estudiar el surgimiento de patrones de comportamiento social a partir de comportamientos individuales. La regulación de la actividad de reclutamiento de abejas a fuentes de alimento con relación a la recompensa que estas fuentes ofrecen es el problema analizado en esta tesis. La hipótesis que guía el análisis experimental presente propone que el número de abejas reclutadas hacia una fuente de alimento está directamente relacionado con la productividad de la misma. Se describe la actividad de reclutamiento a fuentes de néctar durante la recolección individual y colectiva en Apis mellifera. Las condiciones experimentales utilizadas permitieron que cada recolectora cargara parcialmente su buche en la fuente (lo que definimos como condiciones de flujos bajos). Cuantificamos el número de abejas que arribaron a una fuente (la respuesta de reclutamiento) estimuladas por una única recolectora empleada. El número promedio de abejas arribadas se distribuyó dependiendo principalmente de la productividad ofrecida en términos de flujo y concentración de solución azucarada. Además, la respuesta de reclutamiento resultó independiente del número de recolectoras empleadas en la fuente de alimento, de variaciones abruptas en los niveles de recompensa y del nivel de recompensa relativo a aquello que la abeja venía recolectando en visitas previas. Se estableció la importancia relativa de los diferentes mecanismos de transferencia de información relacionados con la actividad de reclutamiento: Algunos parámetros de la danza de contoneo, contactos trofalácticos y el número de estadías en la colmena correlacionaron con el número abejas arribadas. Para los flujos más elevados las abejas arribadas descendieron en la fuente de alimento poco después del descenso de la recolectora empleada, lo que correlacionó con el marcado olfativo de la misma. Por último dado que se trabajó con una misma fuente y un mismo grupo de recolectoras a lo largo de varios días, se correlacionó la experiencia de la recolectora empleada y sus compañeras desempleadas en la colmena. El número de abejas arribadas correlacionó fuertemente con el número de recolectoras desempleadas experimentadas disponibles en la colmena. La experiencia de la recolectora empleada no afectó la respuesta de reclutamiento pero resultó una variable clave que estructura la tarea de recolección colectiva. Estos resultados en conjunto indican que la respuesta de reclutamiento en condiciones de flujos bajos estaría determinada por el nivel de recompensa ofrecido a la recolectora empleada junto con la estimulación diferencial de recolectoras desempleadas que conocían previamente la fuente de alimento.

Abstract:
The honeybee Apis mellifera is an eusocial insect. It provides an excellent model to study how social behavior emerges from the individual one. The relationship between reward rate and the recruitment activity of bees at food sources, is the topic analyzed in this Thesis. This study is based on an hypothesis that propose that the number of bees arrived at a food source is directly related to their profitability. We described the recruitment activity to food sources during individual and collective foraging in Apis mellifera bees. Experimental conditions allowed bees to gather partially their crops at the food source (low flow-rate conditions). We quantified the recruitment response (number of bees that arrived at the food source) elicited by a unique test bee. The mean recruitment response was distributed depending on the food source profitability in terms of concentration and flow-rate of sucrose solution. Moreover, the recruitment response was independent of the number of employed foragers and transient variations in the reward rate. It also was independent of the reward rate collected on previous visits. The contribution of the different recruitment-related behaviors to the recruitment response was evaluated: waggle dance, trophallactic behavior and number of hive-stays correlated with the number of incoming bees. For the highest reward rates, the duration of Nasonov gland exposure at the feeding place was higher, and the arrival of most of the incoming bees occurred shortly after the test bee landed at the feeding platform. Finally we correlated the foraging experience of the test bees and the unemployed ones with the number of incoming bees. The foraging experience of the test bee did not affect the recruitment response but was related to the organization of collective foraging. The number of incoming bees highly correlated with the number of experienced unemployed foragers at the hive. These results as a whole indicate that the recruitment response is determined not only by the reward rate offered to the test bee but also the differential stimulation of unemployed experienced bees from the hive.

Fernández, Paula del Carmen. "Análisis genómico de girasol: desarrollo de colecciones de ESTs y de una plataforma bioinformática para estudios de expresión de genes candidato en respuestas a estreses abióticos" (2006). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El girasol es uno de los principales cultivos oleaginosos del mundo por su volumen de producción y composición en ácidos grasos insaturados. En promedio, durante los últimos cinco años, la producción mundial se ha mantenido estable concentrándose el 72% de la misma entre Argentina y la Unión Europea. A pesar de esto y debido a las condiciones de los precios internacionales y la productividad comparativa con otros cultivos, el área de producción se está desplazando a regiones más áridas a nivel mundial cobrando relevancia la incidencia de estreses abióticos como sequía, salinidad y bajas temperaturas. Pese a la importancia económica del girasol a escala mundial, el grado de avance de los conocimientos públicos sobre el genoma de girasol es limitado cuando se lo compara con cultivos como el arroz, el maíz, la soja, el tomate, el trigo, la papa, la cebada. Sin embargo, en los últimos cinco años, en paralelo al avance de este trabajo, se han iniciado distintos proyectos a nivel nacional e internacional orientados al análisis genómico de girasol con lo cual ha aumentado significativamente la disponibilidad de secuencias genómicas y de ADNc, con el consecuente impacto en el avance de las investigaciones y el conocimiento sobre esta especie. El objetivo de este trabajo es contribuir al conocimiento de las regiones codificantes del genoma de girasol a partir de una estrategia de genómica funcional que sirva como base para la caracterización transcripcional simultanea de los perfiles de expresión inducidos bajo condiciones de estrés y el desarrollo de marcadores funcionales. Para lo cual se abordo el desarrollo de un banco local de secuencias que se expresan o ESTs ("expressed sequence tags") diferenciales para distintos órganos y/o estadios de desarrollo de girasol y el desarrollo de una plataforma bioinformática para la caracterización de los perfiles transcripcionales de las mismas en respuesta a estrés abióticos. En una primera etapa se evaluaron distintas estrategias de secuenciación a pequeña y mediana escala para la identificación de genes diferencialmente expresados en girasol a partir de la generación colecciones de ADNc diferencial. La técnica utilizada se basó en la hibridación substractiva como herramienta para la identificación de genes diferencialmente expresados en un tejido definido, disminuyendo significativamente la redundancia en la secuenciación de clones que representan a genes abundantes y maximizando la detección de los transcriptos “raros” o poco abundantes. Esta estrategia posibilitó un incremento de la eficiencia de secuenciación dentro del marco de un proyecto genómico de pequeña escala que apunta a la identificación de genes de utilidad para propósitos de mejoramiento y la búsqueda de marcadores funcionales. Como resultado, se obtuvieron clonotecas diferenciales a partir de hoja, tallo, raíz y flor en dos estadios de desarrollo (R1 y R4). El uso de diferentes fuentes de ARN como objeto o “tester” y referencia o “driver” fue de utilidad para la selección y detección de transcriptos poco abundantes. La especificidad órgano- específica varió dentro de un rango de 75 a 100% de las secuencias no- redundantes (unigenes) dentro de cada clonoteca de ADNc. La clonoteca correspondiente al estadio R4 de flor fue la menos redundante con un 62% de secuencias únicas y la que aportó el número más elevado de secuencias nuevas de girasol. El análisis bioinformático se llevó a cabo mediante la instalación de un servidor local (INTA 01) conteniendo las herramientas de distribución pública para la edición, análisis y ensamblado de secuencias como Phred/Phrap, CAP3 y algoritmos de comparación de secuencias como BLAST y el desarrollo de BioPipeline® una plataforma desarrollada en entorno Windows para el análisis automatizado de secuencias utilizando los mismos programas y algoritmos mencionados anteriormente. La información de secuencias generadas fue depositada en la base dbESTs de NCBI para su distribución pública. Para el manejo local de esta información se desarrolló una base relacional de tipo ACeDB para la integración de la información generada y su anotación funcional. Sobre un total de 919 secuencias que fueron editadas y anotadas, 318 representan secuencias únicas. Las comparaciones contra bases de datos públicos arrojaron un valor del 60% de secuencias no-redundantes con similitud a secuencias conocidas. El número de genes novedosos predichos varió según la clonoteca analizadas, en un rango que va de 56% en las clonotecas de flor estadio R4 al 16% en las de flor R1. Las comparaciones con los ESTs de girasol depositados y reportados en bases de datos mostraron que 197 secuencias (59,9%) del total) representaban secuencias nuevas, sin similitud significativa con secuencias conocidas. Este enfoque fue exitoso respecto del aislamiento de un número significativo de secuencias reportadas asociadas en su función inferida (probable) a caracteres de importancia agronómica, procesos regulatorios y fisiológicos clave. En una segunda etapa se abordó la evaluación de la expresión relativa simultánea de los transcriptos correspondientes a las secuencias de la base de ESTs desarrollada bajo diferentes condiciones de estrés abiótico utilizando la tecnología de micromatrices de ADN. Se imprimieron los fragmentos representativos de los 318 unigenes anotados en las clonotecas previamente descriptas en micromatrices sobre soporte de vidrio. Se evaluaron tres muestras biológicas tanto para tratamiento de frío (estrés térmico), tratamiento de salinidad (estrés salino) y controles representados por plantas crecidas en condiciones regulares. Estos estreses fueron seleccionados considerando al girasol como una planta con grado intermedio-alto de sensibilidad a bajas temperaturas en la zona radicular, así como también particularmente susceptible al desarrollo en condiciones de alta salinidad. El análisis transcripcional permitió detectar 3 grupos de genes bien diferenciados en sus patrones de expresión. Por una parte el Grupo 2, integrado por 126 genes, no mostró variación en sus niveles medios a través de los tratamientos. En cambio, el Grupo 1 (integrado por 112 genes) evidenció sobre- expresión respecto del control cuando las plantas fueron sometidas a estrés (por frío o por salinidad). De manera análoga, 49 genes conformaron el Grupo 3, pero en este caso se observó una sub-expresión respecto del control en ambos tratamientos. Dentro del grupos 1 y 3, se detectaron perfiles de expresión diferenciales para ambos tipos de estrés, siendo la sobre expresión y/o sub expresión de los genes evaluados más pronunciada en respuesta al estrés por frío respecto al estrés por salinidad. Finalmente, surgieron 80 genes candidato en la separación de tratamientos de acuerdo a su p-valor en la prueba de comparación de medias por análisis de la varianza y su ubicación en la región periférica del plano de ordenación generado por los dos primeros ejes principales de un Análisis de Componentes Principales (ACP) de la matriz de expresión génica escalada gen a gen por la desviación estándar residual del análisis de la varianza. De estos genes, 7 fueron validados por técnicas de reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (Real Time PCR), habiéndose obtenido patrones transcripcionales similares con ambas estrategias de análisis La diferencia en expresión génica fue analizada en relación al origen de las secuencias en evaluación. Las secuencias provenientes de la colección de hoja mostraron en general patrones de subexpresión génica en respuesta a ambos estreses (la mayoría corresponden a genes asociados al proceso de fotosíntesis) mientras que las secuencias aisladas de colecciones de tallo o flor en estadio R4 mostraron patrones de inducción génica frente a los mismos estreses. Si se considera que los cambios transcripcionales en respuesta a frío y salinidad fueron evaluados en hoja, estos resultados confirman la eficiencia de la técnica de SSH utilizada para la generación de las colecciones de ADNc órgano específicas y explica la alta relación de transcriptos que muestra cambios en su perfil en respuesta a estreses en relación a los que no varían su nivel transcripcional en las condiciones evaluadas. Durante la segunda etapa de este trabajo se realizó un análisis de los 80 genes candidatos, detectándose 48 como sobre o sub expresados frente a uno u otro estrés, indicando la implicancia de mecanismos regulatorios comunes a ambos estreses. Asimismo 17 y 12 genes se detectaron inducidos o sub expresados específicamente frente a un estrés y no frente al otro. De acuerdo al análisis funcional comparativo estos genes estarían involucrados en mecanismos de regulación incluyendo procesos de transcripción, traducción, degradación/plegado o interacción de proteínas o asociados a mecanismos de generación y procesamiento de especies reactivas de oxigeno. De estas secuencias, 12 corresponden a secuencias con funcionalidad desconocida. Sólo 3 de las secuencias analizadas en este trabajo mostraron patrones transcripcionales opuestos incluyendo una con similitud a un transportador de lípidos. La información generada a partir de la caracterización del banco de ESTs constituye por una parte una fuente de información sobre genes candidatos involucrados en mecanismos de respuesta a estreses abióticos que pueden ser incluidos en ensayos de complementación en plantas transgénicas modelo y asimismo permite identificar secuencias nuevas no descriptas anteriormente para el desarrollo de marcadores funcionales a ser utilizados en programas de mejoramiento asistido de este cultivo

Abstract:
Sunflower is one of the most important oil crops worldwide regarding its production volume and composition in unsaturated fatty acids. However due to international price conditions and productivity respect to other crops, sunflower production is progressively expanding to arid regions worldwide. Consequently, abiotic stresses as drought, low temperatures and salinity arise as main constrains nowadays. Sunflower is considered a medium-high tolerant plant crop to low temperatures in the radial zone and sensitive to saline environment. Compared to other crops such as rice, maize, soybean, tomato, wheat, potato and barley genetic and genomic sunflower knowledge was limited until the onset of the present decade. However, in parallel to the advance of this thesis (last five years), different projects aimed to the genome analysis of cultivated sunflower and its related wild species, resulted in a significant increase of the number of available expressed and genome sequences in public databases. The objective of this work was to develop tools for structural and functional analysis of cultivated sunflower through the development of a model organ-specific ESTs ("expressed sequence tags") database, the creation and actualization of a bioinformatics platform to characterize transcriptional profiles of the represented genes in response to abiotic stress conditions with the aim to identify novel genes as a source of functional molecular markers associated to important traits, under the scope of an alternative, cost-effective strategy to high-throughput sequencing projects. In the first stage of this work a low scale sequencing strategy based on suppressed subtracted hybridization method was evaluated for the construction of organ- specific cDNA libraries in order to identify differentially expressed genes in sunflower Differential organ-specific ESTs were generated from leaf, stem, root and flower bud at two developmental stages (R1 and R4). Organ-specificity ranged from 75 to 100% of non-redundant sequences in the different cDNA libraries. Sequence redundancy varied according to the target and driver cDNA used for each library. The R4 flower cDNA library was the less redundant library with 62% of unique sequences. Bioinformatics analysis was achieved through the development of BioPipeline®, a bioinformatic tool for sequence quality analysis, contaminant sequence removal and sequence assembly and automatic annotation based on the utilization of free available software as Phred/Phrap, CAP3 and BLAST algorithms using a local server installed at the Institute of Biotechnology, INTA01. Processed sequences were deposited for public distribution in the dbEST database at NCBI. Biological information related to these sequences was locally stored using an ACeDB-based relational database as a laboratory information management system. Out of a total of 919 sequences that were edited and annotated, 318 were non redundant sequences. Comparison against sequences in public databases showed that 60% of non redundant sequences showed significant similarity to known sequences. The number of predicted novel genes varied among the different cDNA libraries, ranging from 56% in the R4 flower to 16 % in the R1 flower bud library. Comparison with sunflower ESTs on public databases showed that 197 of non- redundant sequences (60%) did not exhibit significant similarity to previously reported sunflower ESTs. This approach helped to successfully isolate 33 newly reported unique sequences for sunflower putatively related to responses to biotic and/or abiotic stresses. Application of suppressed subtracted hybridization technology not only enabled the cost effective isolation of differentially expressed sequences but it also allowed the identification of novel sequences in sunflower from a relative small number of analyzed sequences when compared to major sequencing projects. In a second stage, functional genomic studies were performed using microarray technology. A cDNA glass slide chip containing the 318 organ-specific unigenes was constructed in order to evaluate the expression profile under cold and salinity stress conditions. Three biological leaf samples from treated plants, exposed either to low temperatures or watered with NaCl solution, as well as control plants grew under standard condition, were evaluated by hybridization of fluorescence labeled treated and control RNA to target genes. Transcriptional analysis allowed the detection of three groups of genes well differentiated in their expression profiles during the exploratory analysis. One group composed by 126 genes did not show variation along treatments; a second group composed by 112 genes showed evidence of up-regulation under abiotic stress (cold or salinity), whereas a SUB- regulation in both treatments was observed in the 49 genes belonging to a third group. During the second phase of this analysis, 80 candidate genes were identified according to the p-value obtained by classical ANOVA and their peripheral location in the PCA analysis of the gene matrix. Seven genes were experimentally validated by quantitative real time PCR (qRT-PCR) being the transcriptional patterns derived from the two methods highly similar in all cases. Differences in genes expression were analyzed according to the differential organ-specific cDNA library from which they were isolated. While differential leaf library sequences showed the majority of genes sub-regulated (most of them corresponding to photosynthesis or general metabolism related genes), R4 flower developmental stage and stem libraries showed a larger number of up-regulated genes. Considering that transcriptional changes in response to salt and cold stresses were evaluated in leaf tissue, these results confirmed the efficiency of SSH technique in the generation of the differential organ specific libraries and explained the large transcription change / transcription unchanged ratio detected in these assays. Within the 80 candidate a large number of evaluated sequences (48) were either up-regulated or sub-regulated under both abiotic stresses, thus supporting common regulatory mechanisms and general responses to low temperature and salinity. Interestingly 17 sequences were specifically up regulated and 12 were specifically sub-regulated in one stress but not in the other. These genes are potentially involved in different regulatory mechanisms including transcription / translation / protein degradation / protein folding or correspond to genes involved in ROS production or ROS-scavenging and some of them (12) did not show similarity to reported gene products. Only three of the evaluated sequences in this work showed an inverted transcriptional pattern under cold and salinity stress, including one with similarity to a LTP transcript. The information obtained from this EST library characterization not only contributed as a major source of knowledge about candidate genes involved in the mechanisms of abiotic stress responses in sunflower that can be incorporated in future complementary gene studies in model or sunflower transgenic plants but also allows the detection of new putative functional markers as a key tool for marker assisted selection in sunflower.

Fernández, Paula Virginia. "Polisacáridos del alga verde Codium vermilara: estructura fina, su ensamble en la pared celular. Actividad anticoagulante de un arabinano piranósico sulfatado" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El alga verde cenocítica Codium vermilara desarrolla paredes celulares complejas, con una fase fibrilar compuesta por β-(1→4)-D-mananos que se ubican en una capa exterior y una interior de similar espesor, y una matriz central de polisacáridos sulfatados, incluyendo un arabinano y un galactano como componentes principales, y en menor medida un β-(1→4)-D-manano sulfatado que podría actuar como interfase con la parte neutra de la pared). El galactano es similar a los sintetizados por otras especies del género. Tienen enlaces β-D-(1→3), grupos sulfato en C-4 y C-6 y acetales de ácido pirúvico en C-3 y C-4. El arabinano, altamente sulfatado y con uniones β-L-(1→3), constituye el primer reporte de un polisacárido compuesto por una cadena lineal de unidades de arabinopiranosa. Estos resultados permiten proponer un modelo completo de pared celular para esta macroalga verde. El arabinano sulfatado presentó una importante actividad anticoagulante a través de al menos cuatro mecanismos: potenciación de antitrombina y de cofactor II de la heparina e inhibición directa de Factor Xa y de trombina. La inhibición directa de trombina involucra un mecanismo novedoso, donde la unión del polisacárido al exositio 2 de la enzima provoca cambios en la geometría de su tríada catalítica.

Abstract:
Coencocytic green seaweed Codium vermilara develops complex cell walls, with a fibrillar phase composed by β-(1→4)-D-mannans that form an outer and an inner layer of similar thickness, and a central matrix of sulfated polysaccharides, including arabinans and galactans as major components, and in minor quantities, a sulfated β- (1→4)-D-mannan that could act as an interphase with the neutral part of the wall). Galactans are similar to those synthetized by other Codium species. They present β-D- (1→3) linkages, sulfate groups on C-4 and C-6 and pyruvic acetals on C-3 and C-4. The highly sulfated arabinan, with β-L-(1→3) linkages, constitutes the first report of a polysaccharide built up by a linear chain of arabinopyranose units. These results allow us to postulate a complete model of cell wall arrangement for this green macroalga. The sulfated arabinan showed important anticoagulant activity by at least four mechanisms of action: potentiation of antithrombin and heparin cofactor II and direct inhibition of Factor Xa and thrombin. Direct inhibition of thrombin takes place by an original mechanism involving binding of the polysaccharide to exosite 2 of the enzyme that promotes changes in the geometry of its catalytic triad.

Fernández, Sandra Viviana. "Estudio de la estructura y regulación de la expresión de los genes Cab en plantas superiores" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se aislaron seis genes Lhc a partir de una biblioteca genómica de papa(Solanum tuberosum). Estos genes codifican polipéptidos que formarían parte de los complejos que captan la luz que luego es utilizada en la fotosíntesis. Estos genes se hallan en tandem y están separados por regiones de 1.3-1.4 kb. Todos poseen la misma orientación 5'( 3' y cada uno de ellos tiene su propio promotor localizado 5' río arriba de la región de código. Las proteínas deducidas a partir de las secuencias de bases, poseen todos los aminoácidos característicos de las proteínas CAB del PSII, Tipo I, las cuales están codificadas por los genes Lhcb1. Por lo tanto los genes aislados fueron denominados: Lhcb1*1, Lhcb1*2, Lhcb1*3, Lhcb1*4, Lhcb1*5 y Lhcb1*6. La región codificante de estos genes posee 798 pb excepto el Lhcb1*6 el cual fue aislado en forma incompleta (411 pb). Estos genes codifican proteínas de 265 aminoácidos, incluyendo el péptido señal. Los genes estudiados poseen un 94-98 por ciento de homología en sus secuencias de bases y codifican proteínas que poseen entre un 97.5 por ciento a 99.75 por ciento de identidad. Las regiones 5' flanqueantes de los seis genes poseen secuencias conservadas y que están presentes en otros genes cuya expresión es regulada por la luz (el fragmento de 62 pb localizado entre las cajas CAAT y TATA contiene tres secuencias GATA). La expresión de los genes Lhcb1 en las plantas de papa mostró ser específica de órgano. Diferentes transcriptos fueron detectados en las hojas de las plantas mientras que solo uno se detectó en los tallos y no hubo expresión en las raíces. Se determinó el sitio de iniciación de la transcripción para el gen Lhcb1*2. El mismo esta localizado a 69 nucleótidos río arriba del codón de iniciación de la traducción (codón ATG). Los resultados indicaron que la C en la secuencia CTTCAT constituye el primer nucleótido en el ARNm correspondiente al gen Lhcb1*2. La región localizada río arriba del gen Lhcb1*2 que se extiende hasta -1300pb fue secuenciada. Esta región contiene un motivo "G" (5'TGGTTGTGTC3') localizado entre las bases -162 a -171 con respecto al sitio de iniciación de la transcripción. Recientemente fue demostrado que el factor citosólico GBF, el cual se une al motivo "G", se transloca al núcleo en presencia de luz, mientras que en la oscuridad permanece en el citoplasma (Harter et al, 1994). Las funciones regularais de la región 5' flanqueaste del gen Lhcb1*2 fueron analizadas en plantas transgénicas de tabaco. En la construcción realizada, la región promotora del gen Lhcb1*2 dirige la expresión del gen reportero uidA, el cual codifica la enzima (-glucuronidasa (GUS). El análisis de las plantas transgénicas reveló que la región 5' flanqueante (-1300 a +10) del gen Lhcb1*2 es suficiente para conferir una respuesta a la luz a través del fotoreceptor fitocromo así como también una respuesta específica de órgano. Por otra parte, la expresión del gen uidA fue detectada en las plántulas transgénicas de tabaco a partir de las 72 hs luego de la germinación de las semillas. Este resultado se correlaciona con el tiempo de maduración de los cloroplastos (Oemüller et al,1986). Además, no se detectó expresión del gen uidA cuando las plántulas de tabaco transgénicas fueron cultivadas en presencia de un herbicida que impide el desarrollo de los cloroplastos. Por lo tanto, estos resultados indican que la presencia de cloroplastos maduros es necesaria para la expresión del GUS dirigida por el promotor del gen Lhcb1*2 aislado de plantas de papa. Se realizaron deleciones de la región promotora las cuales fueron fusionadas al gen uidA. De estos experimentos se pudo concluir que la región del promotor comprendida entre las bases -690 a +10 es suficiente para conferir una respuesta específica de órgano así como también una respuesta a la luz a través del fotoreceptor fitocromo.

Abstract:
A potato (Solanum tuberosum) genomic library was used to isolate five full-length genes and part of a sixth one, encoding the apoproteins of a light-harvesting complex (LHC). These genes are arrange in tandem with a spacing of 1.3-1.4 kb between neighboring genes. They present the same orientation and they have their own promoters 5'-upstream of the coding regions. All the Lhcb1 genes have 798 bp open reading frame coding for a protein of two hundred and sixty-five amino acids, including a transit peptide. The nucleotide homology among the five genes is between 94-98 per centum. The nucleotide sequences showed that they encoded very similar proteins (99.75 per centum o 97.50 per centum identities). The deduced amino acid sequences were homologous to the PSII Type I CAB proteins encoded by the Lhcb1 genes, so these genes were named Lhcb1*1, Lhcb1*2, Lhcb1*3, Lhcb1*4, Lhcb1*5 and Lhcb1*6, respectively. The 5'-flanking regions of the six potato genes shared conserved sequences already detected in other light-responsive genes (62 bp fragment located between the CAAT and TATA boxes containing three GATA motifs). The expression of Lhcb1 genes in potato was organ-specific. At least nine different transcripts can be recognized in leaves by the primer extension method. A unique transcript could be detected in stems and not in roots. The transcription start site for the Lhcb1*2 gene was determinated. It is located 69 nucleotides upstream from the ATG codon. Our results indicated that the C in the sequence CTTCAT would be the first nucleotide in the Lhcb1*2 mRNA. The 5' upstream region of Lhcb1*2 extending from -1300 bp to the cap site was sequenced. This region contained a G-box motif (TGGTTGTGTC) located between -162 and -171 from the transcription start site. It has been recently demonstrated that the translocation of the cytosolic GBFs (G-box binding factor) to the nucleus is light-regulated (Harter et al, 1994). The regulatory function of the 5'-flanking region of the potato Lhcb1*2 was analyzed in transgenic tobacco plants. The construct used contained the uidA gene which was under the control of the potato Lhcb1*2 promoter. Analysis of transgenic plants revealed that the 5'-flanking region (-1300 to +10, relative to the transcription start site) of the Lhcb1*2 gene is sufficient to confer a phytochrome response as well as organ-specific expression. In ours experiments, the expression of the uidA gene was detected in the transgenic tobacco seedlings around 72 h after germination. This result correlates well with the time of maturation of the chloroplasts (Oemüller et al, 1986). Furthermore, the expression of uidA was not detected when transgenic seedlings were grown in presence of Norflurazon. These results correlates the presence of mature chloroplasts with the GUS expression directs by the Lhcb1*2 promoter. We have obtained constructs in which the uidA gene was under the control of deletions of the 5'-flanking region of potato Lhcb1*2. The -690 to +10 flanking region of the Lhcb1*2 is enough to confer organ-specific and phytochrome-regulated expression on the uidA coding sequence.

Fernández, Vanesa Maribel. "Efectos inhibitorios sobre el aprendizaje olfativo en la abeja doméstica (Apis mellifera)" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Entre los múltiples estímulos percibidos del entorno, los animales deben ser capaces de seleccionar aquellos que les sean útiles para sobrevivir. A tal efecto, las experiencias previas permiten diferenciar los estímulos relevantes de aquellos que no lo son; en especial esta Tesis se focalizará en los relacionados con la búsqueda y obtención de alimento. Cuando se pretende asociar un estímulo, que ha sido preexpuesto en el ambiente, a una recompensa, puede resultar difícil establecer una contingencia entre ellos. Este fenómeno ha sido definido como inhibición latente (IL) y se lo ha explorado a lo largo de esta Tesis usando como modelo experimental a la abeja Apis mellifera. A partir de ensayos de condicionamiento olfativo se evaluaron los efectos de volátiles preexpuestos tanto en el contexto social de la colmena como bajo condiciones experimentales controladas. Los volátiles preexpuestos en una colmena reducen las preferencias de las abejas hacia una fuente de alimento aromatizada con ese olor. Además, durante un condicionamiento clásico evaluado bajo el protocolo de extensión de probóscide, la preexposición olfativa dificulta la adquisición de una relación predictiva entre el olor preexpuesto y una recompensa. Esta reducción en el aprendizaje varía con la identidad del olor, siendo olor-específica. Si bien este fenómeno fue evidenciado para todas las categorías de edades de la casta obrera, en ninguna de ellas este efecto duró más de 24 hs. Asimismo, la preexposición de volátiles no provocó ningún cambio en la sensibilidad gustativa al azúcar de individuos de edades pre-recolectoras. Sin embargo, sí se observó que exposiciones prolongadas o mayores concentraciones del volátil afectan la persistencia de la IL. Finalmente, se estudiaron las vías aminérgicas involucradas en la IL de la abeja melífera; para lo cual se realizaron tratamientos farmacológicos que involucraron el uso de antagonistas de algunas aminas biogénicas (octopamina, dopamina y serotonina). Los resultados sugieren que la vía serotoninérgica podría estar involucrada en la modulación de la IL en la abeja melífera. Los resultados de esta Tesis muestran, por un lado, que los olores preexpuestos pueden reducir el rendimiento del aprendizaje asociativo si el mismo es subsecuentemente pareado con el alimento. Esta situación puede tener implicancias a nivel social, pudiendo influir en la propagación de información floral olfativa dentro de la colmena. Por otro lado, el hecho de que por primera vez se haya mostrado una interrupción de la IL mediante tratamientos farmacológicos abre nuevas perspectivas con relación al estudio de las vías neurales involucradas en este fenómeno en insectos.

Abstract:
Among all the stimuli perceived by animals in the environment, they must be able to select those that are useful for survival. In this context, previous experiences with the stimuli allow animals to differentiate those stimuli that are relevant from those that are not. This Thesis will focus on the olfactory experiences related to seeking and obtaining food. The retardation of associative learning as a function of prior stimulus exposure has been named Latent inhibition (LI) phenomenon, and it has been explored throughout this thesis by using the honey bee, Apis mellifera, as experimental model. The effects of volatile pre-exposure have been studied by using an olfactory conditioning procedure, both in the social environment of the hive and under controlled laboratory conditions. The pre-exposition to a volatile compound in a hive reduces the preferences of the bees for a certain food source scented with this odour. Furthermore, during a classical conditioning protocol assessed under the proboscis extension, olfactory preexposure reduces the acquisition of a predictive relationship between the pre-exposed odour and the reward. The LI effect varies with the odour identity and it has been found for the whole range of ages of workers bees. However, its effect did not last more than 24 h., unless the odour concentration was increased or its exposure prolonged. Moreover, the pre-exposition odour did not cause any changes in the gustative responsiveness for pre-foraging age bees. Finally, putative aminergic pathways involved in the LI- phenomenon in honey bees have been studied. Previously pharmacological treated individuals with antagonists of biogenic amines were exposed to a volatile compound, after which, their learning performances were studied. The results suggest that serotonergic pathway may be involved in the modulation of this phenomenon in honey bees. On one hand, the results of this Thesis show that pre-exposed odors may reduce the performance of associative learning if it is subsequently paired with food. This may have implications for the social level, because it may influence the spread of floral scent information within the hive. On the other hand, the fact that for the first time it has been shown a disruption of the IL by drug treatments opens new perspectives on the study of neural pathways involved in this phenomenon in insects.

Ferramola, Carlos Osvaldo. "Determinación de pequeñas cantidades de bicarbonatos alcalinos en presencia de un exceso de carbonatos alcalinos" (1944). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferramola, Raúl. "Nucleoproteína del B. Anthracis" (1934). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferrando, María Mercedes Catalina. "HO-1 en la progresión ósea del cáncer de próstata" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El cáncer de próstata (PCa) es la segunda causa de muerte por cáncer entre los hombres en Argentina. La angiogénesis es crucial para el crecimiento y progresión del PCa. El perfil de diseminación de estos tumores muestra tendencia a desarrollarse en el hueso como único sitio de progresión, donde las células tumorales interactúan con el microambiente interrumpiendo el equilibrio formación/degradación del hueso. Sin embargo, la naturaleza molecular de dicha interacción aún no se conoce completamente. En trabajos previos de nuestro laboratorio demostramos que el aumento de expresión de hemo oxigenasa-1 (HO-1) en líneas de PCa disminuye su proliferación, invasión y migración in vitro y el crecimiento tumoral in vivo. En este trabajo de tesis nos propusimos estudiar el efecto de HO-1 sobre la angiogénesis y progresión del PCa. Comprobamos que la sobre-expresión de HO-1 en PC3 disminuye la expresión de genes pro-angiogénicos in vitro. Un ensayo de angiogénesis in vivo mostró que la inoculación intradérmica de las células con expresión estable de HO-1 (PC3HO-1), generaba tumores menos vascularizados, con reducida densidad de la microvasculatura e inmunomarcación disminuida de marcadores angiogénicos. Mediante un sistema de co-cultivo de células PC3 con cultivos primarios de osteoblastos de ratón (PMOs), comprobamos que la disminución de la proliferación de los PMOs inducida por las células tumorales, se restauraba cuando éstas fueron pre-tratadas con el inductor farmacológico de HO-1 (hemina). No se observaron alteraciones en la expresión de genes involucrados en la diferenciación y resorción ósea. Sin embargo, el tratamiento con hemina indujo DKK-1 en las células PC3 co-cultivadas y el estrés oxidativo y la vía de FoxO en los osteoblastos. Estos resultados se confirmaron utilizando explantes de calvarias. La inyección intra-ósea de PC3HO-1 produjo una robusta remodelación ósea. Mediante un microarray de tejidos derivados de metástasis de pacientes resistentes a la castración creciendo como xenotransplantes en ratones SCID se determinó que HO-1 presentaba inmunomarcación heterogénea. En conjunto, estos resultados demuestran que HO-1 es un factor clave para el control de la angiogénesis y altera el microambiente tumoral impactando sobre la progresión ósea del PCa.

Abstract:
Prostate cancer (PCa) is a leading cause of death among males. The switch to an angiogenic phenotype is known to be critical for its progression. PCa is dominated by complications arising from metastasis to the bone where the tumoral cells interact with the bone microenviroment impairing the balance between bone formation and degradation. However, the molecular nature of this interaction is not completely understood. Previous studies from our laboratory showed that heme oxygenase 1 (HO-1) expression decreased PCa cells proliferation, invasion and migration in vitro and decreased tumor growth in vivo. The goal of this thesis is to study the role of HO- 1 in PCa angiogenesis and progression. We demonstrated that pro-angiogenic genes were down-modulated in response to HO-1 over-expression in PC3 cells (PC3HO-1). An in vivo angiogenic assay showed that intradermic inoculation of PC3HO-1 cells generated tumors less vascularized, with decreased microvessel density and reduced expression of angiogenic markers. Using a co-culture system of PC3 cells with primary mouse osteoblasts (PMOs), we demonstrated that HO-1 pharmacological induction (hemin treatment) abrogated the diminution of PMOs proliferation induced by PCa cells. No changes were detected in the expression of genes involved in differentiation and bone resorption. However, co-culture of hemin pre-treated PC3 cells with PMOs induced DKK-1 expression in tumor cells and oxidative stress and FoxO signaling in osteoblasts. These findings were confirmed using a co-culture system of PCa cells with calvaria explants. In vivo bone injection of PC3HO-1 cells in the femur of SCID mice produced strong bone remodeling. Heterogeneous HO-1 immunoreactivity was detected in a tissue microarray of human prostate cancer metastasis from castrated resistant patients growing as xenografts in SCID mice. These results suggest that HO-1 is a key regulator of the angiogenic switch in PCa and has the potentiality to modify the bone micro-environment modulating PCa bone metastasis.

Ferrara, Andrés. "Reordenamiento de ciclopropilcetonas esteroidales : Aplicación a la síntesis de abeo-pregnanos" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se sintetizaron abeo-pregnanos análogos de hormonas naturales por incorporación del C-18 a los anillos C ó D del esteroide. Para ello se prepararon ciclopropilcetonas fusionadas a los anillos C y D que por reordenamiento a través de procesos radicalarios o aniónicos condujeron a la expansión de los anillos fusionados. A partir de acetato de pregnenolona (110) se preparó 3b-hidroxi-17b,18-ciclopregn-5-en-20-ona (107) que por tratamiento con Bu3SnH/AIBN rindió 17(13--18)-abeo-17a(H)-pregn-4-eno-3,20-diona (23) y 17(13--18)-abeo-17b(H)-pregn-4-eno-3,20-diona (24) (análogos de progesterona). Cuando se utilizó 11a-hidroxiprogesterona (118) como material de partida, se la transformó 3,3-etilendioxi-11a-hidroxi-17b,18-ciclopregn-5-en-20-ona (144) que por reacción con Bu3SnH/AIBN dio 11a-hidroxi-17(13--18)-abeo-17b(H)-pregn-4-eno-3,20-diona (27b). A partir del mismo intermediario se obtuvieron 11b-hidroxi-17(13--18)-abeo-17b(H)-pregn-4-eno-3,20-diona (26b) y 17(13--18)-abeo-17b(H)-pregn-4-eno-3,11,20-triona (25b). El tratamiento de 3,3-etilendioxi-17b,18-ciclopregn-5-eno-11,20-diona (153) con NaOH/MeOH condujo, por un reordenamiento, al 17(13--18)-abeo-17b(H)-pregna-4,12-dieno-3,11,20-triona (28). En las mismas condiciones 3,3-etilendioxi-12b,18-ciclopregn-5-eno-11,20-diona (154) dio 12(13--18)-abeo-17b(H)-pregna-4,13(17)-dieno-3,11,20-triona (29), el compuesto 29 es un C-homo-18-nor-esteroide que posee la particularidad de tener un anillo de 5 carbonos fusionado a uno de 7 miembros. Además se desarrollo un método alternativo basado en hidruro de mercurio (II) para el reordenamiento radicalario de ciclopropilcetonas. La secuencia de reacción aplicada a 3b-acetoxi-17b,18-ciclopregn-5-en-20-ona (107a) dio el producto de expansión mientras que en el caso de 20-acetoxi-3,3-etilendioxi-12b,18-ciclopregn-5-en-11-ona (162), produjo la ruptura del enlace C-12-C-18.

Abstract:
Abeo-pregnane analogues of natural steroid hormones were prepared by incorporation of C-18 into rings C or D of the steroid nucleus. Cyclopropylketones fused to rings C and D were prepared, and the fused rings expanded by radical or anionic rearrangements. 3b-hydroxy-17b,18-cyclopregn-5-en-20-one (107) was prepared from pregnenolone acetate (110), treatment with Bu3SnH/AIBN gave 17(13(18)abeo-17a(H)-pregn-4-ene-3,20-dione (23) and 17(13(18)abeo-17b(H)-pregn-4-ene-3,20-dione (24) (progesterone analogues). When 11a-hydroxyprogesterone (118) was used as the starting material, it was transformed into 3,3-ethylenedioxy-11a-hydroxy-17b,18-cyclopregn-5-en-20-one (144) which upon reaction with Bu3SnH/AIBN gave 11a-hydroxy-17(13(18)abeo-17b(H)-pregn-4-ene-3,20-dione (27b). 11b-Hydroxy-17(13(18)abeo-17b(H)-pregn-4-ene-3,20-dione (26b) and 17(13(18)abeo-17b(H)-pregn-4-ene-3,11,20-trione (25b) were prepared starting from the same intermediate 144. Treatment of 3,3-ethylenedioxy-17b,18-cyclopregn-5-ene-11,20-dione (153) with NaOH/MeOH gave the rearranged product 17(13(18)abeo-17b(H)-pregna-4,12-diene-3,11,20-trione (28). Under the same conditions 3,3-ethylenedioxy-12b,18-cyclopregn-5-ene-11,20-dione (154) gave 12(13(18)abeo-17b(H)-pregna-4,13(17)-diene-3,11,20-trione (29), a C-homo-18-norsteroid which contains fused 5 and 7 membered rings. An alternate method based on mercury (II) hydrides was developed for the radical rearrangement of cyclopropylketones. This reaction sequence, when applied to 3b-acetoxy-17b,18-cyclopregn-5-en-20-one (107a), gave the expansion product, however cleavage of the C-12-C-18 bond occurred when 20-acetoxy-3,3-ethylenedioxy-12b,18-cyclopregn-5-en-11-one (162) was used as substrate.

Ferrari Descole, Esther. "Contribución al estudio de los espacios abstractos" (1943). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferrari, Carina Cintia. "Las estructuras olfatrorias de los armadillos chaetophractus villosus y Dasypus hybridus" (1997). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Esta Tesis se divide en: 1- El modelo experimental y la importancia de los armadillos Chaetophractus villosus y Dasypus hybridus en la investigación biomédica; 2- Adaptación del armadillo Dasypus hybridus a las condicones de cautiverio; 3- Estudio de las estructuras nasales de los armadillos Chaetophractus villosus y Dasypus hybridus, con especial atención en la mucosa olfatoria, 4- Estudio neuroanatómico del armadillo Dasypus hybridus. En la primera parte, se realizó un resumen de la sistemática y taxonomía de ambos armadillos y se mencionan algunas lineas de investigación biomédica que han utilizado ambos modelos experimentales. En la segunda parte, se exponen las tareas realizadas en cuanto a la mantención y reproducción en cautividad del armadillo Dasypus hybridus. La tercera parte, consta de una revisión de los conocimientos actuales sobre la mucosa olfatoria, un estudio topográfico y macroscópico de las estructruas nasales y un estudio de la mucosa olfatoria mediante microscopía óptica y microscopía electrónica, incluyendo estudios histoquímicos e inmunohistoquímicos. La última parte, consta de un estudio neuroanatómico de la especie Dasypus hybridus. El trabajo consiste en una revisión sobre los trabajos neuroantómicos realizados en Edentados y en el análisis de las estructuras cerebrales más importantes de este armadillo con especial referencias a las estructruras nasales.

Abstract:
This Thesis is divided in: 1- The armadilos Chaetophractus villosus and Dasypus hybridus as experimental models in biomedical research; 2- The maintenance in captivity of the armadillo Dasypus hybridus; 3- Nasal structures of the armadillos Chaetophractus villosus and Dasypus hybridus, with special reference to olfactory mucosa; 4- Neuroanatomical study of Dasypus hybridus. In the first part an abstract of the systematic, taxonomy and the most important features of the biomedical research about Chaetophractus villosus and Dasypus hybridus was mentioned. The second part includes the tasks related with maintenance and reproduction in captivity of the armadillo Dasypus hybridus. The third part includes a literature review about the olfactory mucosa, a topographic study of the nasal structures and a study of the olfactory mucosa of both armadillos by optic and transmission electron microscopy, including histochemical and immunohistochemical analysis. The last part consists in a literature review about neuroanatomical studies in Edentates and and analysis of the most salient neuroanatomical features of the South American armadillo Dasypus hybridus, withe special reference to the nasal structures.

Ferrari, Hernán Javier. "Dinámica de flujo magnético a tiempos cortos en superconductores de alta temperatura crítica" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferrari, Lucrecia. "Equilibrio hidromineral de larvas de Bufo arenarum : respuestas compensatorias al "stress" osmótico y al cadmio" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las larvas de anfibios se enfrentan con un medio hipotónico en relación a sus fluidos corporales, viviendo en contacto con cuerpos de agua temporales muchas veces cambiantes en su concentración y composición. Por ello los mecanismos para responder al «stress» osmótico son importantes para su sobrevivencia y comprenden la regulación acoplada del intercambio de agua y de solutos. Nuestros objetivos fueron: 1) determinar la capacidad de sobrevivenciade la larvas de Bufo arenarum en medios de osmolaridades diferentes a la de su ambiente natural; 2) cuantificar la respuesta de los animales al «stress» osmótico; 3) predecir dicha respuesta mediante la confección de modelos de regresión múltiple para cada parámetro analizado; 4) evaluar la respuesta a «stress» osmótico en medio contaminado por cadmio y analizar sus efectos. Para evaluar la sobrevivencia de las larvas en medios de osmolaridades superiores a las de su ambiente natural, se determinó la Osmolaridad Letal madia (OLSO) de manitol y ClNa. No se hallaron diferencias en la supervivencia ni por composición química ni por «stress» de densidad, estableciéndose la OLSO 144hs en 220 mOsm y 0150 48 hs a 279 mOsm. Con la finalidad de cuantificar la respuesta al «stress» osmótico, las larvas se expusieron en forma aguda y con aclimatación a soluciones de diferente osmolaridad y composición quimica (desde 0 a 271 mOsm) y en forma prolongada a soluciones de agua dulce artificial concentrada y a agua destilada. La respuesta de los animales se evaluó utilizando MANOVA, análisis discriminante múltiple y regresiones múltiples. Independientemente de la composición quimica del medio de incubación, las larvas no fueron capaces de osmorregular por encima de 200 mOsm. Este resultado no se modificó con aclimatación previa. En todos los casos la respuesta de las larvas es de deshidratación gradual. Se comprobó que los estadios jóvenes de desarrollo de Bufo arenarum son capaces de sobrevivir durante aproximadamente un mes en agua destilada y en medio salino de 30 mOsm sin indicios de alteraciones en su equilibrio hídrico. Analizando en forma integrada, la respuesta fisiológica de los animales a diferentes osmolaridades, el peso seco surge como principal parámetro de la función discriminante, en la mayor parte de los casos, hecho que se manifiesta cuando el medio de incubación es superiores a 200 mOsm. Se evaluó mortalidad por Cd en larvas jóvenes y prometamórficas (C150) a dos temperaturas de ensayo. Se estableció para larvas jóvenes, tanto a 20 como a 25°C un intervalo de CLSO (de 24 a 96 hs de exposición) entre 3.5 y 2 ppm y para larvas prometamórficas entre 5 y 3 ppm a 20°C y entre 10 y 6 ppm a 25°C. Se comprobó un efecto protector de la temperatura sobre la intoxicación por cadmio en larvas prometamórficas. Se verificó que la presencia de Cd en concentración subletal (1 ppm) en medios de incubación de diferente composición química no modifica la respuesta de las larvas al «stress» osmótico ni altera la sobrevida. Sin embargo en medios carentes de iones se produce un 100% de mortalidad en pocas horas, independientemente de la osmolaridad del medio. Se concluye que existe un efecto protector de los iones sobre la toxicidad por cadmio. Se comprobó que la mortalidad en medio aiónico en presencia de concentración subletal de Cd se halla asociada a importantes alteraciones de la estructura epidérmica semejante a las encontradas en larvas expuestas a concentraciones letales de Cd en medio iónico. Se efectuaron determinaciones referidas a la incorporación de Cd desde diferentes soluciones.

Ferrari, María Angélica Lucrecia. "Teoría de las funciones D lambda" (1942). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferrari, María Rosa. "Estudio de la composición genómica de forrajeras mediante técnicas electroforéticas y de citogenética clásica y molecular" (2004). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Tricepiro es un cereal sintético de alto valor forrajero, que fue obtenido por el Ing. Covas en 1972. Lo logró cruzando triticale Don Santiago INTA(2n=42) por trigopiro Don Noé INTA(2n=56). Luego de varios años de mejoramiento logró la linea 3-40 que fue inscripta en 1994 como cultivar con el nombre de tricepiro Don René INTA.Esta línea, que presenta resistencia a enfermedades y es tolerante al frío y a la salinidad del suelo, constituye un material apto para ser usado en programas de mejoramiento. Dentro de los objetivos de la presente tesis estuvieron. Establecer y comparar los patrones electroforéticos de gluteninas de alto peso molecular (HMW)de tricepiro Don René INTA y de sus progenitores, así como determinar la existencia de variabilidad para dichas proteínas en lineas hermanas del cultivaren estudio. Determinar la estabilidad meiótica de tricepiro Don René INTA mediante el estudio de la meiosis masculina. Establecer la relación entre la rugosidad de las semillas y el contenido de heterocromatina telomérica de los cromosomas de centeno, en lineas de tricepiro Determinar la composición genómica de tricepiro Don René INTA e individualizar sus cromosomas mediante técnicas de citogenética clásica y molecular. La electroforesis de proteinas seminales (SDS-PAGE) mostró que tricepiro Don René INTA tiene cinco bandas correspondientes a gluteninas (HMW), ninguna de las cuales le es propia. De las cinco bandas, cuatro las comparte con ambos progenitores y la quinta la comparte sólo con trigopiro Don Noé INTA. Esta banda podría provenir de Thinopyrum. Las 9 lineas hermanas de tricepiro Don René INTA que se estudiaron tienen las cinco bandas que presenta el cultivar. Dos de estas líneas, tienen una banda adicional, FA-L2 la comparte con trigopiro Don Noé INTA y FA-L66 tiene una banda propia. Los estudios meióticos de tricepiro Don René INTA mostraron la formación de 21 II en diacinesis. Sin embargo, en Metafase I se observaron asincronías en el comportamiento cromosómico tales como bivalentes que segregaban tempranamente y presencia de univalentes fuera de la placa ecuatorial. El comportamiento meiótico no reveló la presencia de heterocigosis para alteraciones numéricas ni estructurales. El número de micronúcleos presentes en las tetradas osciló entre 0 y 9 y se calculó un Índice Meiótico de 66,47. Se hizo bandeo C y DAPI en cromosomas mitóticos de tricepiro Don René INTA. Se observaron 14 cromosomas con importantes bandas teloméricas atribuibles a cromosomas de centeno y 14 cromosomas con numerosas bandas intersticiales, supuestamente pertenecientes al genoma B de trigo, de acuerdo con patrones usados internacionalmente. Tricepiro Don René INTA posee semillas rugosas, mientras que la línea FA-L2 tiene semillas lisas. Se determinó que el tamaño de las bandas teloméricas del genoma R es similar en ambas lineas. Por lo tanto, las caracteristicas rugosidad de las semillas y tamaño de las bandas teloméricas de los cromosomas de centeno no muestran asociación . Los estudios de hibridación in situ con ADN genómico total de Secale cereale y Thinopyrum bessarabicum como sondas y Triticum aestivun var Chinese Spring como bloqueante (GISH) mostraron que Tricepiro Don René INTA tiene 14 cromosomas de centeno y 28 de trigo. En un par de estos últimos se detectó introgresión de Thinopyrum. La identificación de todos los cromosomas del hibrido se logró haciendo hibridación con las sondas pSc 119.2 y pAs1 (FISH). La composición genómica y la constitución cromosómica de tricepiro Don René INTA es la siguiente: 7 pares de cromosomas de centeno (1R, 2R, 3R, 4R, 5R, 6R, 7R); 7 pares de cromosomas del genoma A de trigo (1A, 2A, 3A, 4A, 5A, 6A, 7A); 7 pares de cromosomas del genoma B de trigo (1B, 2B, 3B, 4B, 5B, 6B, 7B). Introgresión del genoma J de Thinopyrum (posiblemente Th. ponticum 2n=70) en un par cromosómico del genoma A, que por su morfología y su tamaño podría ser el 6A.

Abstract:
Tricepiro is a synthetic cereal of high forage value obtained by G. Covas in 1972 in Argentina by crossing hexaploid triticale (2n=6x=42) and octoploid trigopiro (2n=8x=56). Several years of self pollination resulted in a line, 3-40, that was registered as a cultivar under the name tricepiro Don René INTA. This line possesses high potential as a parent in breeding programmes due to its marked disease resistance and freezing and drought tolerance. Inside the objectives of the present thesis they were: to find homologies between tricepiro Don René INTA and its ancestors through high molecular weight glutenines (HMW) analysis and to compare the variability between advanced lines; to study the meiotic behavior in order to determine the meiotic stability of tricepiro Don René INTA; to correlate kernel shrivelling in tricepiro with the size of terminal heterochromatin blocks on the rye chromosomes; to characterize the genome constitution of tricepiro Don René lNTA and identify its chromosomes using clasical and molecular cytogenetical techniques. Glutenines were fractionated by sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis ( SDS- PAGE) and bands of Triticum aestivum var. Chinese Spring were used for comparison. Tricepiro has five bands, four of them shared with both progenitors and one only with trigopiro Don Noé INTA. With the exception of two lines (FA L2 and FA L66) the advanced lines of tricepiro show very low variability among them. Meiotic studies showed the presence of 21 II in diacinesis but in metaphase I an asincronic chromosome behavior was observed: some bivalents segregated early and univalents were detected. Tetrades have between 0 and 9 micronuclei and the Meiotic Index was 66.47. No heterocigosis for structural rearrayement or numerical alterations were detected. C-bands and DAPI showed 14 chromosomes with large terminal heterochromatic band that are putative rye chromosomes and 14 chromosomes with intersticial bands that are putative 14 wheat chromosomes (genome B). Tricepiro Don René INTA (shrivelling kernel) and FA-L2 (smooth kernel) didn't show statistical differences between the size of their rye telomeric heterocromatin bands. So no relation were detected between shrivelling kernel and rye telomeric heterocromatin bands in these tricepiro lines. The in situ hybridization using total DNA of Seca/e, Triticumand Thinopyrum as a probe (GISH) labelled with biotin and/or digoxigenin showed that tricepiro Don René INTA consists of 14 rye chromosomes and 28 wheat chromosomes. Small introgression zones of Thinopyrum in wheat chromosomes were detected. FISH using the repetitive DNA probes pSc 119.2 and pAs1 labelled with biotin, leads us to state that the genomic composition and the chromosomes identification of tricepiro Don René INTA are the folowing: 7 rye chromosomes pairs (1R, 2R, 3R, 4R, 5R, 6R, 7R). 7 wheat chromosomes pairs belonging to the B genome (1B, 2B, 3B, 4B, 5B, 6B, 7B). 7 wheat chromosomes pairs belonging to the A genome (1A, 2A, 3A, 4A, 5A, 6A, 7A). Introgression of a region from Thinopyrum in a wheat chromosome pair belonging to the A genome (putative chromosome 6A).

Ferrari, Valeria Paola. "Transporte en anillos mesoscópicos con un punto cuántico : del régimen de bloqueo de Coulomb al efecto Kondo" (1999). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El sistema estudiado en esta Tesis consiste en un punto cuántico insertado en un anillo mesoscópico que se encuentra atravesado por un flujo magnético. Nuestro objetivo es presentar una descripción completa para este dispositivo y predecir la física de un posible experimento con estas características. Para estudiar este sistema, hemos propuesto un modelo que tiene en cuenta las condiciones experimentales en que se trabaja usualmente en la física de los puntos cuánticos y los sistemas mesoscópicos. En él hemos incluído correlaciones entre electrones, debido a que en los puntos cuánticos éstas son importantes. Para resolver el modelo, hemos desarrollado una metodología que nos permite encontrar las funciones de Green del sistema mediante aproximaciones adecuadas. Este sistema presenta corrientes persistentes como función de un potencial de puerta aplicado en el punto cuántico. Hemos calculado dichas corrientes así como también la carga en el punto. Se ha estudiado la influencia tanto de las interacciones entre electrones como de la hibridización del anillo con el punto. Hemos encontrado varios regímenes de comportamiento que describen diferentes fenómenos físicos involucrados. Estos regímenes abarcan desde el fenómeno de Bloqueo de Coulomb (en el límite de interacciones fuertes) a un régimen prácticamente no interactuante. Entre ambos límites, hemos encontrado un régimen en el cual se manifiesta el efecto Kondo. En el régimen en el que el Bloqueo de Coulomb y el efecto Kondo coexisten, la corriente escalea con la longitud del anillo (L) como 1/L^{1/2} en contraposición al escaleo usual en un anillo mesoscópico perfecto que es 1/L

Abstract:
The system studied in this Thesis consists of a quantum dot inserted in a mesoscopic ring threaded by a magnetic flux. Our aim is to present a complete description for this device and to predict the physics of a potential experiment with these features. In order to study this system, we have proposed a model that takes into account the experimental conditions that are usual in experiments with quantum dots and mesoscopic systems. In the model we have included the electron-electron interaction because it is relevant in quantum dots. To solve it, we develop a methodology to find the Green'’s functions of the system by means of proper approximations. This system presents persistent currents as a function of a gate potential applied to the quantum dot. We have calculated the persistent currents and the charge inside the dot. We have studied the influence of both the interaction between electrons and the hybridization of the ring with the quantum dot. We have found several regimes that describe different physical phenomena involved in the system. These regimes range from the phenomenon of Coulomb Blockade (in the high correlation limit) to a quasi non-interacting regime. Between these two limits we have found an intermediate regime where the Kondo effect shows up. In the regime where both the Coulomb Blockade and Kondo effect coexist, the current scales with the length of the ring (L) as 1/L^{1/2} in contrast to the normal scaling of an ideal mesoscopic ring that is 1/L.

Ferrario, Juan Esteban. "Estudio de la expresión diferencial de genes inducidos por el tratamiento crónico con levodopa en el estriado de ratas con lesiones del sistema nigroestriatal" (2004). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La levodopa constituye la terapia principal para el tratamiento de la enfermedad de Parkinson. En modelos animales de la enfermedad se reportó que el tratamiento crónico con levodopa induce una serie de efectos compensatorios, entre los que se destaca el aumento de terminales axonales de las neuronas dopaminérgicas en el núcleo estriado. Con el objetivo de conocer mejor los mecanismos celulares y moleculares que median los principales cambios compensatorios construimos una biblioteca de expresión diferencial enriquecida en transcriptos del estriado de ratas con lesión del haz nigroestriatal, tratadas con levodopa durante 6 meses. Para identificar los transcriptos presentes en la biblioteca utilizamos un atlas de expresión de genes que representa las principales funciones celulares. Identificamos varios genes que habían sido previamente relacionados con los mecanismos de plasticidad y trofismo. Posteriormente confirmamos la expresión diferencial de tres transcriptos por medio de hibridación in situ y encontramos que el factor trófrco pleiotrofma, la proteína básica de la mielina y la calmodulina están sobreexpresados en el estriado desnervado de las ratas tratadas con levodopa. Además, analizamos el grado de inervación dopaminérgica estriatal mediante la detección inmunoautorradiográfica del transportador de dopamina. En conjunto nuestros resultados obtenidos a partir de aproximaciones moleculares e histológicas, sugieren la participación de determinados genes en la reinervación dopaminérgica estriatal inducida por el tratamiento crónico con levodopa.

Abstract:
Levodopa, the major treatment for patients with Parkinson’s disease, has been shown to induce a variety of compensatory effects, including facilitation of sprouting by dopaminergic neurons in experimental animals with lesions leading to denervation of the striatum. To better understand the cellular and molecular environment where most of these compensatory changes take place, in particular elements that might contribute to the recovery of dopaminergic innervation, we constructed a differential expression library enriched in transcripts from the striata of rats with lesions of the nigrostriatal dopaminergic pathway, orally-treated with levodopa for 6 months. We used this library to screen an expression array of rat genes representing the major cell functions, and have identified several that are involved in neurotrophic mechanisms and plasticity. We confirmed the differential expression of selected transcripts by non-radioactive in situ hybridization, and report that the growth factor pleiotrophin, myelin basic protein and calmodulin are overexpressed in the denervated striatum of levodopa-treated rats. In addition, we analyzed the levodopa-induced dopaminergic reinnervation in the denervated striatum of lesioned rats by immunoautoradiographic detection of the dopamine transporter (DAT). Together, from a combination of molecular and histochemical approaches, our results suggest a possible functional role of several genes in dopaminergic neurons sprouting during levodopa treatment.

Ferrario, Mariana Inés. "Estudio de la aplicación de luz UV pulsada y su combinación con otras tecnologías emergentes en matrices frutales" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo principal de este trabajo residió en evaluar la eficiencia de la aplicación de luz pulsada (LP) en modo estanco (LPe) y en flujo continuo (LPc) y su combinación con ultrasonido de alta intensidad (US) y temperatura moderada (44-56 °C) para preservar jugos frutales. Se estudió la cinética de inactivación y la dinámica del crecimiento en el almacenamiento refrigerado de diversos microorganismos patógenos y deteriorativos inoculados y la flora nativa de varios jugos frutales (manzana, frutilla, naranja y melón) tratados por las tecnologías simples o combinadas mediante los modelos de Weibull, bifásico y doble Weibull. La efectividad de los tratamientos dependió de la absorbancia en el rango UV y turbidez de los jugos y del microorganismo evaluado. Estudios de citometría de flujo mostraron que células de S. cerevisiae, evidenciaron desestabilización de la integridad de la membrana y presencia de una subpoblación con daño subletal a bajas dosis de LP (12 J/cm2) y mediante microscopía electrónica de transmisión, presencia de vacuolas expandidas, pérdida y coagulación del contenido intracelular, y menor densidad electrónica. Los estudios de flora nativa, color y análisis sensorial concluyeron en la definición de un jugo de manzana preservado por LPc (0,73 J/cm2; 155 mL/min) combinado con US (30 min) y temperatura moderada, seguro y de buena calidad organoléptica, cuya vida útil refrigerada fue de 6 días. El producto propuesto evidenció mediante un análisis de conglomerados aceptabilidad por un grupo específico de consumidores interesados en la acidez y el intenso sabor a manzana del producto.

Abstract:
The overall objective of this study was to evaluate the efficacy of pulsed light technology (PL) in a static (PLs) or continuous flow (PLc) modes in combination with high intensity ultrasound (US) to preserve fruit juices. The inactivation kinetics and growth dynamics under refrigeration conditions of relevant microorganisms and native flora in apple, strawberry, orange and melon juices treated by the proposed single or combined technologies were studied by Weibull, biphasic and double Weibull models. The antimicrobial efficiency of the applied treatments depended on absorptivity and turbidity of juices as well as the strains. Flow cytometry studies revealed sub-lethal damage at low PL doses (< 12 J/cm2) and loss of membrane integrity in PL treated S. cerevisiae cells, while transmission electron microscopy observations showed expanded vacuoles, loss of inner content by puncture sites, less electronic density, among others. The combination US and PLs showed additive effects in S. cerevisiae inactivation in apple juice. Analysis of native flora, colour and sensory properties of apple juice processed by the combined PLc (0.73 J/cm2, 155 mL/min) and US (30 min) treatment ratified a product microbiologically safe with good organoleptic quality, with a 6 day shelf life. Apple juice treated by the combined PL/US method exhibited high acceptability by a group of consumers interested in the acidity and intense apple flavour of the juice.

Ferraro, Marta Beatriz. "Estudio teórico del tensor de apantallamiento magnético y su relación con la estructura molecular" (1985). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferraro, Rafael. "Vacíos cuánticos no convencionales" (1986). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La ambigüedad de la cuantificación de un campo en un espacio-tiempo curvo arbitrario, se resuelve introduciendo una noción de vacío cuántico dependiente de los observadores. Para ello se establece que el papel de un sistema de referencia en Relatividad General, consiste en determinar qué es el espacio y qué es el tiempo, nociones éstas que resultan dependientes de los observadores. Como los detectores de campo son sensibles a la diferencia entre espacio y tiempo, resulta natural que el vacío cuántico depende de los observadores. Para saber qué vacío corresponde a cada sistema de observadores, se define un Hamiltoniano invariante frente a cambio de coordenadas pero dependiente de los observadores. La base de soluciones de la ecuación de campo, que un dado sistema de observadores debe utilizar para cuantificar el campo, es aquella que diagonaliza el Hamiltoniano y minimiza la energía del vacío, criterios éstos que resultan ser equivalentes, los datos de Cauchy que la determinan son calculados cuando el tiempo se separa en la ecuación de campo. Esta prescripción para definir el vacío es de aplicación general, y contiene diferentes casos particulares en donde la noción de vacío estaba bien establecida. Por otra parte, se demuestra la invariancia conforme del Hamiltoniano definido. Se estudia también, mediante cálculo numérico, la evolución de un sistema de espejos solicitados por la fuerza ejercida por un campo cuantificado escalar sin masa, en un espacio-tiempo plano. El sistema presenta fuertes analogias con un modelo cosmológico semiclásico. La fuerza de un campo sobre una supeficie mávil es determinada mediante un principio variacional. Se encuentra que los espejos evolucionan hacia un estado final de velocidad constante, siempre que el sistema posea energía suficiente. Se calcula la energía de Casimir (dependiente de la velocidad de los espejos) percibida por observadores geodésicos en la etapa final de la evolución, y se estudian las razones por las cuales el espectro de particulas creadas por un espejo móvil podría ser no térmico.

Ferreiro, Diego U.. "Mecanismo de unión a ADN del dominio C-terminal de la proteína E2 del papilomavirus humano, principal regulador de la expresión génica viral" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La interacción proteína-ADN juega un papel central en la fisiología celular. Dentro de éstas, se identifica al reconocimiento secuencia especifico con un rol regulatorio clave, pues de éstas interacciones depende la orquestación de los patrones de expresión génica de un organismo. Utilizando el dominio de unión a ADN del factor de transcripción E2 del papilomavirus humano, nos propusimos analizar la interacción en condiciones en las cuales fuera posible extraer datos fisicoquímicos precisos del proceso de unión. Confiamos en que la interpretación de éstos en términos termodinámicos provee un marco para relacionar las estructuras proteicas con su funcionalidad biológica Caracterizamos un mecanismo de unión E2c-ADN al equilibrio en el cual E2c presenta dos modos diferentes de unión de ADN diferentes. Estos modos resultan estar estrechamente relacionados con la ocurrencia de poblaciones conformacionales del estado plegado de E2c. Mostramos ademas que ésto no sucede en un homólogo cercano con el que comparte una alta identidad de secuencia y una topología de plegamiento idéntica, sugiriendo que ésto puede estar relacionado con los distintos roles funcionales que E2c presenta. El camino cinétíco de interacción E2c-ADN se inicia con una colisión rápida, limitada por la difusión de las macromoléculas en solución. Esto da lugar a un "complejo de encuentro" estabilizado por interacciones electrostáticas, en el cual E2c tiene la posibilidad de deslizarse sobre la doble hélice. Si el ADN contiene un sitio E2, el complejo sufre fuertes rearreglos conformacionales que, luego de una fase de expulsión de solvente. resultan en la formación de un complejo estable proteina:ADN. Este último paso involucra un ocultamiento de superficie accesible al solvente y es allí donde se consolidan las interacciones cercanas aminoácido-base. Experimentos de doble-mezcla por flujo detenido nos permitieron asignar el orden secuencial de los rearreglos y demostrar que la unión puede también proceder por una ruta macroscópica paralela. caracterizada como de dos estados. Utilizando una estrategia de mutagénesis sitio-dirigida realizamos un mapeo energético de la interfase de unión. Pudimos asignar las contribuciones que cada residuo realiza, en forma aditiva, a la energía libre de asociación. Las asignaciones energéticas resultaron estar en excelente concordancia con las estructuras de alta resolución, y correlacionan con el carácter altamente dinámico de la interfase de asociación. Lon conjuntos de estados de transición del camino cinético fueron analizados con 23 mutantes sitio-dirigidas. Esto nos permitió disectar las contribuciones energéticas de los residuos independientes a nivel atómico e inferir los cambios conformacionales que ocurren durante las etapas de unión y reconocimiento de secuencia. Mostramos que la plasticidad estructural que E2c presenta está íntimamente ligada a su capacidad de reconocimiento sitio-específico. Por último, presentamos un modelo funcional plausible de regular la actividad biológica de E2c y su capacidad de reconocimiento de secuencias de ADN.

Abstract:
Protein-DNA interactions play a central role in cellular physiology. Within these, site specific recognition is a primary topic that underprints the expression profile of whole genomes. Although many biological aspects of these non-covalent interactions are becoming clearer, detailed biophysical understanding of site specific recognition is lacking. Using the human papilomavirus (HPV) E2c transcription factor as a model system we aim a physicochemical dissection of its DNA binding properties. We set-up an spectroscopic binding essay, readily done in solution, which allowed us to quantify DNA binding parameters in energetic terms, detect conformational changes exerted on both macromolecules upon binding and relate them to the high resolution structures available. We characterized an equilibrium DNA binding mechanism where the HPV-16 E2c domain is capable of two distinct binding modes, which correspond to different conformational ensembles of the E2c molecule. Despite having a strong sequence identity and an identical folding topology, a close homolog does not show this behaviour under the same experimental conditions. The differences observed may be related to the distinctive transcriptional roles in which these proteins are involved. The kinetic DNA-binding mechanism is initiated by the diffusion controlled formation of an encounter complex stabilized by electrostatic interactions, in which E2c has the possibility to slide along the DNA duplex. If the target DNA contains an E2-binding site, substantial conformational rearrangements take place, and a solvent exclusion step leads to the formation of a highly stable protein-DNA complex. This last step involves the largest burial of surface area from the interface and the direct readout of the DNA bases is proposed to occur. Double-Jump stopped flow experiments allowed us to characterize the sequence of intermediate events and demonstrate that a last-formed final complex can be formed through a parallel two-state macroscopic route. An extensive site-directed mutagenesis analysis over the entire DNA binding reglon led us assign the energetic contributions of individual sidechains to the overall binding free energy. We show that each sidechain contribute in a small amount to the total free energy in an additive way. These contributions are in excelent agreement with the high resolution structures and correlate with the highly dynamic character of the interface. The transition state ensembles of the kinetic binding pathway were probed with 23 site-directed mutants. This led us to dissect the sidechain energetic contributions at almost atomic resolution, and infer the conformational changes that take place in each kinetic event. We show that the conformational plasticity this protein presents is intimately linked to its DNA recognition capacity. Finally, a plausible biological model for functional E2c regulation and specific DNA recognition is presented.

Ferreiro, Nicolás Andrés. "Influencia de la heterogeneidad ambiental de los lechos de macrófitas en los organismos acompañantes en un arroyo pampeano" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En los arroyos pampeanos, las abundantes y diversas plantas acuáticas constituyen la principal fuente de heterogeneidad ambiental. La hipótesis de trabajo fue que la heterogeneidad de diferentes especies de macrófitas, cuantificada por la dimensión fractal (DF), tiene un efecto positivo sobre la abundancia y diversidad de macroinvertebrados que viven sobre ellas, debido a la influencia positiva de la complejidad sobre el espacio habitable por organismos pequeños y la heterogeneidad del hábitat. Se realizaron tres muestreos estacionales de seis parches mixtos con distintas macrófitas sumergidas (Ceratophyllum demersum, Egeria densa, Elodea ernstae, Stuckenia striata) en un tramo del arroyo Las Flores (NE de pcia. Buenos Aires). En cada ocasión, se estimaron las DF de las macrófitas, la biomasa de algas epífitas, así como la abundancia, biomasa, diversidad y tamaño de los invertebrados asociados. La DF de las macrófitas se encontró relacionada positivamente con la densidad de macroinvertebrados pero no con su biomasa, riqueza o diversidad. La relación entre la DF y la abundancia relativa de invertebrados por clase de tamaño, fue positiva para los organismos pequeños y negativa para los organismos grandes. Se realizaron varios experimentos de campo y laboratorio con E. densa, E. ernstae y análogos plásticos, encontrándose una correlación significativa y positiva entre la DF y la densidad de macroinvertebrados, independientemente del tamaño de los organismos. En los arroyos pampeanos, la complejidad de la arquitectura de las macrófitas afecta positivamente a la abundancia de invertebrados pero no a su biomasa ni diversidad.

Abstract:
Dense and diverse communities of macrophytes are the main source of environmental heterogeneity in Pampean streams. The hypothesis was that heterogeneity caused by different macrophyte species, measured as fractal dimension (FD), has a positive effect on associated macroinvertebrate density and diversity due to a positive effect of complexity on available space for small organisms and habitat heterogeneity. Field work consisted in three sampling dates when six macrophyte patches with several submerged species (Ceratophyllum demersum, Egeria densa, Elodea ernstae, Stuckenia striata) were sampled in a reach of Las Flores stream (NE of Buenos Aires province). Macrophyte FD, epiphytic algae biomass, and macroinvertebrate density, biomasss, richness, diversity and size were estimated each time. Macrophyte FD was positively associated to macroinvertebrate density but not to macroinvertebrate biomass, richness or diversity. FD and macroinvertebrate relative abundance were positively related for small organisms and negatively related for big invertebrates. Several field and laboratory experiments were conducted with E. densa, E. ernstae and plastic analogs. Macroinvertebrate density was positively affected by FD but no effect of invertebrate size on this relationship was detected. According to this, in Pampean streams macrophyte architecture complexity has a positive effect on associated macroinvertebrate abundance but not on its biomass or diversity.

Ferrer, María Florencia. "Construcción y evaluación de virus MVA recombinantes que expresan la glicoproteína D del virus BoHV-1" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El virus vaccinia Ankara modificado (MVA) es un virus altamente atenuado que se utiliza eficientemente como vector viral no replicativo para el desarrollo de nuevas vacunas. En este trabajo de Tesis se desarrolló un nuevo inmunógeno basado en MVA que expresa como antígeno de interés la glicoproteína D (versión secretada, gDs) del virus herpes bovino tipo I (BoHV-1), un agente infeccioso ampliamente distribuido en Argentina. Primeramente, se diseñó y construyó el vector de transferencia para obtener MVA recombinantes utilizando como sitio blanco de inserción el gen no esencial MVA086R. Se obtuvieron virus MVA-gDs recombinantes y se demostró la correcta expresión, antigenicidad y N-glicosilación de la glicoproteína D expresada a partir de dichos virus. Posteriormente, se evaluó la capacidad inmunogénica de los virus MVA-gDs en animales de experimentación (ratones y conejos). En el modelo de ratón, se observó que los virus MVA-gDs desencadenaron una respuesta inmune específica, de tipo humoral, que se mantuvo en niveles similares durante un período de siete meses (luego de la aplicación de dos dosis del inmunógeno). Además, se demostró que la síntesis de novo de la glicoproteína D a partir del vector viral no replicativo MVA-gDs fue la responsable de la respuesta inmune específica. La inoculación de conejos con virus MVA-gDs (por vía intramuscular o subcutánea) desencadenó una respuesta inmune específica de tipo humoral, observándose la máxima respuesta a los 9 días post dosis de refuerzo. En un ensayo de desafío de conejos con el virus BoHV-1, se observó que la inmunización por vía intramuscular de los animales con virus MVA-gDs disminuyó la excreción del virus de desafío. Finalmente, se demostró que la inmunización de ratones por vía intranasal con virus MVA-gDs adicionados con toxina colérica indujo respuestas inmunes humorales específicas de tipo IgA en muestras de lavados nasales y broncopulmonares y de tipo IgG en muestras de suero. De esta forma, se obtuvo, caracterizó y evaluó un nuevo inmunógeno denominado MVA- gDs que, en el futuro, podría ser evaluado como candidato a vacuna contra el virus BoHV-1 en bovinos.

Abstract:
Modified vaccinia virus Ankara (MVA) is a highly attenuated virus. During the past years, non-replicative recombinant MVA vectors have gained major interest in the development of new veterinary vaccines. Bovine herpesvirus 1 (BoHV-1) infection is widely distributed in Argentina and there are no efficacious vaccines to prevent the diseases caused by this virus. In order to develop a candidate vaccine for BoHV-1, the secreted version of glycoprotein D (gDs) was selected as the antigen to be expressed in new recombinant MVA non-replicative based vectors. First, the design and construction of the transference vector necessary to obtain recombinant MVA viruses was achieved using the non-essential gene MVA086R. Recombinant MVA-gDs virus was obtained and molecularly characterized, confirming the correct expression, antigenicity and N-glycosilation of glycoprotein D. Then, immunogenicity of recombinant MVA-gDs viruses was assessed in experimental animals (mice and rabbits). Mice immunized with MVA-gDs viruses developed a specific humoral immune response that was maintained for seven months and was dependent on the booster dose. In addition, mice immunized with MVA-gDs virus demonstrated that MVA-gDs non-replicative viral vector was responsible for the de novo synthesis of glycoprotein D and, consequently, for the immune response induced in animals immunized with not inactivated MVA-gDs virus. Intramuscular and subcutaneous rabbit inoculation with MVA-gDs virus was immunogenic and induced a specific humoral immune response. In a rabbit BoHV-1 challenge assay, diminished viral excretion was observed in those animals intramuscularly immunized with recombinant MVA-gDs. Finally, in order to evaluate MVA-gDs virus as a mucosal vaccine, two doses of MVA-gDs supplemented with cholera toxin were delivered by intranasal immunization of mice. These immunizations induced anti-gD IgA humoral immune responses in nasal and bronchopulmonar lavages as well as anti-gD IgG antibodies in serum samples. In conclusion, the new immunogen designated MVA-gDs was developed, characterized and evaluated in experimental animals. In the future, it could be evaluated in cattle as a candidate bovine vaccine for BoHV-1.

Ferrero, Florencia Victoria. "Función de las protocadherinas en cluster alfa en interacciones intercelulares" (2015-06-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las protocadherinas en cluster (Pcdh) son un grupo de glicoproteínas de la superficie de las neuronas que se expresan en regiones específicas del sistema nervioso central (SNC) de los vertebrados (cerebro, corteza, bulbo olfatorio, médula espinal, hipocampo). Dada su similitud con otras moléculas de adhesión (pertenecen a la superfamilia de las Cadherinas, involucradas en adhesión celular dependiente de calcio -Ca(2+)- y a que su presencia está enriquecida en las sinapsis, podrían ayudar a determinar la especificidad de algunas conexiones sinápticas. Su función es aún desconocida. Consisten en más de 50 genes, codificados por tres clusters de genes muy relacionados entre sí: alfa, beta y gama. A través de splicing alternativo se generan múltiples isoformas alfa y gama, lo que potencialmente genera una enorme variabilidad en moléculas de la superficie celular. La expresión combinada de estas variantes podría ayudar a establecer, hasta cierto punto, la identidad neuronal. Se sabe que neuronas individuales expresan distintas isoformas de Pcdh en forma monoalélica y estocástica, a excepción de la isoforma c2. En este trabajo de tesis intentamos comenzar a comprender el rol biológico de esta diversidad. Logramos determinar que las isoformas Pcdh alfa 4 y c2 entablan interacciones intercelulares exclusivamente homofílicas. Este hallazgo tiene importantes implicancias respecto del posible rol de las Pcdh en la generación de diversidad neuronal ya que es compatible con modelos de interacción proteína-proteína que conducen a la distinción entre terminaciones “propias” y “no propias” de las neuronas. Además, encontramos indicios de que ciertas isoformas de Pcdh podrían tener comportamientos diferentes respecto de otros miembros del mismo cluster. Por ejemplo, en cultivos celulares donde sobreexpresamos la isoforma alfa c2, esta muestra una mejor localización en los contactos célula-célula a medida que transcurre el tiempo, a diferencia de lo que ocurre con las isoformas alfa 4 o alfa 8. A pesar de que, como mencionamos más arriba, estas proteínas pertenecen a la superfamilia de las cadherinas y conservan algunos motivos típicos de las mismas, observamos que se comportan distinto de las cladherinas clásicas. Comparando las isoformas de Pcdh alfa con la cadherina clásica E-cadherina (Ecad), logramos demostrar que no están involucradas en procesos de reciclado de la membrana plasmática, que no median una fuerte adhesión célula-célula, y que el Ca2+ no parece afectar su localización en los contactos célula-célula ni su procesamiento proteolítico. Por otro lado, encontramos que las Pcdh alfa pueden sufrir proteólisis en la membrana de una manera similar a la de las cadherinas clásicas. Nuevamente observamos diferencias entre las Pcdh, esta vez en el nivel de clivaje proteico entre distintas isoformas de Pcdh del cluster alfa. Palabras clave Protocadherina, cluster, adhesión, homofílico, interacción célula-célula

Abstract:
Clustered protocadherins (Pcdh) are a group of neuronal surface glycoproteins that are expressed in specific regions of the central nervous system (CNS) of vertebrates (brain cortex, olfactory bulb, spinal chord, hippocampus). Because of their similarity with other adhesion molecules (they belong to the Cadherin superfamily, involved in calcium -Ca(2+)- dependent cell adhesion) and enriched presence at synapses, they could be involved in determining the specificity of some synaptic connections. Their function remains unknown. They consist of over 50 genes encoded by three closely related gene clusters: alpha, beta and gamma. Alternative splicing generates multiple alpha and gamma isoforms, potentially producing enormous variability in cell surface molecules. The combinatorial expression of these variants could help to establish, to some extent, neuronal identity. It is known that single neurons express Pcdh isoforms monoallelically and stochastically, with the exception of the "c2 type" isoform. In this project we attempted to begin to understand the biological role of this diversity. We were able to establish that Pcdh alpha 4 and c2 isoforms engage exclusively in homophilic intercellular interactions. This finding has important implications regarding a possible role for Pcdh in the generation of neuronal diversity because it is compatible with protein-protein interaction models that lead to distinction of “self” and “non-self” projections from neurons. Also, we found evidence that certain Pcdh isoforms may have a different behaviour from other members of the same cluster. For example, when we overexpress the alpha c2 isoform in cultured cells, it shows a better localization to cell-to-cell contacts over time, unlike what happens for alpha 4 or alpha 8 isoforms. Even though, as we mentioned above, this proteins belong to the cadherin superfamily and they posses some of their typical motifs, we observed they behave differently from classic cadherins. By comparing Pcdh alpha isoforms against Ecadherin (Ecad), we could demonstrate that they are not involved in membrane recycling processes, that they do not mediate strong cell-cell adhesion and that Ca2+ does not seem to affect their localization to cell-cell contacts nor their proteolytic processing. On the other hand, we found that Pcdh alpha can undergo proteolysis at the cell membrane in a way similar to that of classic cadherins. Again, we observed differences among Pcdh, this time at the level of protein cleavage between different Pcdh alpha isoforms. Key words Protocadherin, cluster, adhesion, homophilic, cell-cell interaction

Ferrero, Marcela Alejandra. "Estudios de producción de proteasas en especies del género Bacillus" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ferreyra, Gabriela Alejandra. "Mecanismos de transducción de señales en el reloj biológico de mamíferos" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los ritmos biológicos diarios son el resultado de la interacción entre un reloj circadiano endógeno y factores ambientales sincronizadores, principalmente la luz, que ejerce su efecto a través de cambios en la fase de los ritmos controlados. El objetivo del presente trabajo de tesis fue caracterizar la vía (o una de las vías) de transducción de señales fóticas que ponen en hora al reloj circadiano de mamíferos. Para ello, se realizaron técnicas de registro comportamental (medición de actividad locomotora), neuroquímico (actividad de neurotransmisores), bioquímico (actividad enzimática, cuantificación proteica, fosforilación, etc.) y molecular (western blot, hibridación in situ) en hámsters (Mesocricetus auratus), obteniendo tejido hipotalámico conteniendo los núcleos supraquiasmáticos, sede del reloj circadiano. Los resultados de esta tesis, junto con las evidencias de la bibliografía sobre el tema, permiten sugerir un modelo de señalización de cuya entrada es la interacción del glutamato de la vía retinohipotalámica con receptores de tipo NMDA, que inducen un aumento en el influjo de calcio. A su vez, este ion es capaz de activar tanto a la proteína quinasa dependiente de Ca2+ y calmodulina (CaMKII) y a la óxido nítrico sintetasa (NOS). El óxido nítrico, y posiblemente también el monóxido de carbono, otro mensajero gaseoso, producen un aumento en la actividad de la guanilil ciclasa soluble (GC), que promueve una subida en los niveles del GMPc y la activación de la proteína quinasa G (PKG). Si bien son pocos conocidos los sustratos de esta en el cerebro, se aportan evidencias en favor de que esta vía de señales lleva a la expresión fótica de genes reloj como mPer2.

Abstract:
Daily biological rhythms are the result of the interaction between an endogenous circadian clock and environmental entraining agents, the main of which is light, which exerts its effect through phase changes in overt rhythms. The aim of this thesis work was to characterize the signal transduction pathway that put the mammalian circadian clock on time. For this, techniques of behavioral recording (locomotor activity), neurochemistry (neurotransmitter activity), biochemistry (enzymatic activity, protein quantification, phosphorylation, etc.) and molecular biology (western blot, in situ hybridization) were performed in hamsters (Mesocricetus numtus), obtaining hypothalamic tissue which contained the suprachiasmatic nuclei (SCN), the site of a biological clock. The results of this work, together with previous evidences from the literature, suggest a signaling model whose input is retinohypothalamic glutamate interaction with NMDA receptors in the SCN, inducing an increase in calcium influx. This ion might activate both Ca2+/calmodulin dependent kinase (CaMKII) and nitric oxide synthase (NOS). Nitric oxide, and possibly also carbon monoxide, another gaseous messenger, induces an increase in soluble guanylate cyclase (GC)activity, which in turn elevates cGMP levels and activate protein kinase G (PKG). Although PKG substrates in the brain are not well known, evidences suggesting that this pathway leads to the photic expression of clock genes such as mPer2 are provided.

Ferreyra, Laura Inés. "Estudio de la variabilidad y la diferenciación genética por medio de técnicas de Isoenzimas y RAPD en poblaciones naturales de especies e híbridos del Género Prosopis (Leguminosae)" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió por medio de la electroforesis de isoenzímas y RAPDs la variabilidad, diferenciación y estructura genética en poblaciones naturales de P. alba, P. nigra, P. ruscifolia, P. flexuosa y P. vinalillo y poblaciones de híbridos interespecificos (P. alba x P. nigra y P. alba x P. flexuosa). Se estudió además la posible correlación entre variables ambientales con loci isoenzimáticos y de RAPDs y si la diferenciación genética entre poblaciones podría estar asociada con las distancias geográficas entre las mismas. Las técnicas de isoenzímas permitieron el análisis de 21 loci de los cuales 16 fueron polimórficos. No se encontraron loci diagnósticos de especies. Estas sólo se diferenciaron por sus fiecuencias alélicas. La técnica de RAPDs identificó 28 locí de los cuales 5 permitieron reconocer inequívocamente las especies. Los valores de variabilidad genética promedio observados para isoenzímas (P = 37.5 — 66.7%; H = 0.14- 0.332) y para RAPDs (P = 32.1- 46.4 % ; H = 0.123- 0.246) fueron similares entre sí y con respecto a los estimados en estudios previos con ambas metodologías en especies de Algarobia. Se observó un exceso de homocigotas (F IS >0) en todos los loci polimórficos estudiados. Esto podría deberse a la existencia de cruzamientos endogámicos dentro de las poblaciones como consecuencia de la limitada dispersión de las semillas y el polen y a la autogamia parcial estimada en estudios previos (hasta un 28 %). Los niveles de diferenciación genética obtenidos entre poblaciones a partir de los datos de isoenzímas y RAPDs fueron similares (F ST-0.36 y 0.4 respectivamente) e indicaron una diferenciación altamente significativa entre poblaciones de diferentes especies. En ambos casos el flujo génico estimado (Nm = 0.8 y 0.3) fue menor que l individuo por generación, mientras que el flujo génico entre poblaciones de igual especie fue mayor que uno. Tanto para datos de isoenzímas y RAPDs la mayor diversidad ocurre dentro de las poblaciones (54-69%), es intermedia entre especies (23-42%) y baja entre poblaciones (416%). Se observaron correlaciones significativas entre frecuencias alélicas isoenzimáticas y algunas variables geográfico-climáticas mientras que no se observaron correlaciones significativas entre las variables geográfico-climáticas y las bandas RAPDs. También se observaron diferencias en los resultados cuando se evaluó la correlación entre las matrices de distancias genéticas y geográficas a partir de los datos de isoenzímas (correlación significativa) y RAPDs (correlación no significativa). La asociación de las variables de algunos loci isoenzimáticos con variables geográficas y/o climáticas sugiere un efecto selectivo de los mismos. El intervalo de distancias genéticas entre poblaciones coespecíficas obtenidas a partir de los datos de isoenzímas (0.04 y 0.12) fue similar al obtenido a partir de los datos de RAPDs (0.02 a 0.10). Tanto las isoenzímas como los RAPDs muestran una alta afinidad entre las especies estudiadas de Algarobia, ya que estas comparten la mayoría de los loci con similares frecuencias alélicas. La diferenciación entre especies medida por las distancias de Nei fueron en promedio con ambas metodologías relativamente bajas (0.10-0.27). Estos valores son esperados para sub o semiespecies según Ayala (1974). Los fenogramas obtenidos con ambas metodologías fueron similares entre sí y mostraron a poblaciones coespecíficas agrupadas. Las poblaciones hibridas analizadas no fueron en ningún caso intermedias entre sus progenitores putativos.

Abstract:
Isoenzyme electrophoresis and RAPD techniques were applied to analyze the genetic variability, differentiation and structure of natural populations of P. alba, P. nigra, P. flexuosa, P. vinalillo, P. ruscifolia and interspecific hybrid populations (P. alba x P. nigra and P. alba x P. flexuosa). The present study also evaluated if genetic variables (isozyme and RAPD loci) are correlated with environmental variables and if the genetic distances between populations are associated with geographic distances. Isozyme technique allowed analyzing 21 loci, 16 of which were polymorphic. Diagnostic loci of species were not found. Species were differentiated only by allelic frequencies. RAPD technique identified 28 loci. Only 5 of them allowed unequivocal species recognition. Estimates of genetic variability obtained from isozyme (P =37.5 —66.7 % ; H = 0.14 — 0.32) and RAPD (P = 32.1- 46.4 % ; H =0.123 —0.246) were similar to each other, and to previous estimates obtained using both techniques in other Algarobia species. Significant homozygote excess (F IS > 0) was observed in all polymorphic loci studied. It might be caused by endogamic crosses within populations, due to limited pollen and seed dispersal, and/or partial selfing, which, according to previous works, may reach a rate of 28%. The genetic differentiation among populations obtained from RAPD and isozyme data were similar (F ST = 0.36 and 0.40 respectively) and indicated highly significant differentiation among populations of different species. In both cases estimated gene flow (Nm = 0.8 and 0.3) was lower than one individual per generation. In contrast, gene flow estimates among cospecific populations were higher than one. The highest proportion of variation occurred within population (54 —69 %), the among species variation was intermediate (23 —42 %) and the lower value was observed among conspecific populations (4 —16 %). Significant correlation between isoenzymatic allelic frequencies and geographical or climatic variables was observed. They suggest selective effects of these loci. By contrast, no significant associations were found by RAPD bands. Differences in results were also found when the correlation between geographic distances and genetic distances were evaluated for isozyme (significant correlation) and RAPD (no significant correlation) data. Genetic distance range among cospecific populations from isozyme data (0.04 - 0.121) were similar to that obtained from RAPD data (0.017 —0.10). Both isozyme and RAPDs showed high similarity among the studied species of Algarobia, since most alleles are shared by almost species. The diferentiation among species within this section measured through Nei distance was relative low with both techniques, with values ranging within the expected according to Ayala et al. (1974) for sub to semispecies. The phenogram obtained with both methodologies were consistent and showed clusters of cospecific populations. Hybrid populations were not intermediate between putative parents.

Ferreyroa, Gisele Verónica. "Retención, biodisponibilidad y remediación de Pb en suelos: efectos de la interacción suelo-planta (Brassica napus) y bioacumulación" (2016-02-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La contaminación en suelos por metales pesados, en particular por plomo, es una problemática ambiental de gran importancia; la movilidad y biodisponibilidad de dicho contaminante es fuertemente dependiente de los componentes bióticos y abióticos del suelo. Debido a la importancia toxicológica que la contaminación de Pb reviste en nuestro país, en esta tesis se propone analizar la interacción de este metal con los componentes del suelo y su posible remediación con plantas. Por lo tanto, los objetivos generales del presente trabajo son la determinación de la especiación del metal y su interacción con los componentes del suelo, y el estudio sobre la capacidad de acumulación del metal por parte de una planta de cultivo (Brassica napus, colza), analizando el efecto de dicha planta sobre la especiación del metal. En el estudio sobre la especiación química del metal en el suelo y su evolución temporal, se observó que el Pb se asocia rápidamente con las fracciones minerales, quedando una muy baja fracciónn en forma soluble e intercambiable al cabo de 60 días, que es en principio la fracciónn biodisponible. Luego, mediante el cultivo de Brassica napus en suelos con agregado de Pb reciente y otro con contaminación consolidada por Pb, se analizó la interacción e influencia de la rizosfera en la especiación del metal. El efecto resultó en una mayor concentración de Pb en la zona rizosférica del suelo con contaminación reciente, particularmente en la fracción mineral, y en la permanencia de fracciones intercambiables de Pb en la etapa de fructificación de la planta. En la madurez fisiológica de B. napus, no se detectó contenido de Pb en la fracción intercambiable. Brassica napus resultó ser una especie acumuladora de Pb en suelos con contaminación reciente. Se cuantificó su concentración en hojas, resultando mayor en hojas jóvenes y en granos. Se observaron efectos negativos en la ultraestructura celular (particularmente cloroplastos), y en el contenido de foto pigmentos, los cuales se cuantificaron exitosamente mediante metodos no invasivos. Aun así, no se observo un efecto negativo en su desarrollo fenológico. EN suelos con contaminación consolidada, no se detectó contenido del metal en los organos estudiados de B. napus. Se concluye entonces que la presencia de Pb recientemente incorporado al suelo resulta en la acumulación del metal por Brassica napus, mientras que si el metal ha permanecido en el suelo previamente sembrado, este no se encuentra disponible para la planta debido a que este evoluciona hacia formas químicas mas estables, no biodisponibles.

Abstract:
Soil contamination by heavy metals, in particular lead, is an environmental issue of great importance; the mobility and bioavailability of this pollutant are strongly dependent on the biotic and abiotic components of soil. Because of the toxicological significance of lead pollution in our country, in this thesis it is proposed to analyze the interaction of the metal with soil components and possible ways for phytoremediation. Therefore, the general objectives of this study are to determine the speciation of the metal and its interaction with soil components, and the study of metal storage capacity by a crop plant (Brassica napus, rapeseed) analyzing the effect of the plant on the speciation of the metal. In the study on the chemical speciation of Pb in soil, and its time evolution, it was observed that Pb is rapidly associated with mineral fractions; the soluble and exchangeable fraction, wich is considered bioavaliable, has a very low level after 60 years. The interaction and influence of the rhizosphere on the metal speciation was analyzed. This was accomplished, by growing Brassica napus in polluted soils, both with recent addition of Pb and with consolidated Pb pollution. A higher concentration of Pb in the rhizosphere zone in soil with recent pollution was determined, mainly in the mineral fraction; exchangeable Pb is still detectable in the fruiting stage of the plant. At physiological maturity of B. napus, Pb content is not detected in the exchangeable fraction. Brassica napus proved to be a good Pb accumulator from soils with recent contamination. Metal concentration was quantified in leaves, being higher in young leaves, and grains. negative effects were observed in cell ultrastructure (particularly in chloroplasts), and photo pigments content was successfully quantified by non-invasive methods. Still, no negative effect was observed in phenological development. Lead content is not detected in the studied organs of B. napus for soils with consolidated contamination. It is concluded that the presence of Pb recently incorporated into the soil results in the accumulation of the metal by Brassica napus; if the metal has remained in the soil prior to planting, it is not avaliable for the plant because it evolves into more stable and non-bioavaliable chemical forms.

Ferro, Sergio P.. "Movimiento de fluidos viscosos en canales con paredes porosas y efectos de acoplamiento viscoso-térmico" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió el flujo de un fluido newtoniano que circula en regimen laminar por un canal plano. El flujo es forzado por succión o inyección constante y uniforme a través de paredes porosas y rígidas que se hallan a distintas temperaturas. Se supuso que la viscosidad depende de la temperatura, por lo que la ecuación de Navier-Stokes se halla acoplada a la ecuación de la energía. El problema admite soluciones de similaridad que fueron analizadas en detalle. Se desarrollaron rutinas numéricas basadas en métodos espectrales que resolvieron eficientemente tanto las ecuaciones estacionarias como las ecuaciones dependientes del tiempo. Esto permitió realizar la descripción de los campos de velocidades, presiones y temperaturas para un amplio rango de valores de los parámetros. Por otra parte, se analizó la estabilidad temporal y espacial de las soluciones estacionarias de similaridad. A tal fin se implementaron nuevos códigos numéricos que resuelven los problemas de valores característicos que surgen en este tipo de análisis. El problema en dos variables espaciales (sin efectos de temperatura) fue resuelto mediante un código en diferencias finitas. Esto permitío investigar las relevancia de las soluciones de similaridad bajo determinadas condiciones en la boca del canal.

Abstract:
The flow of a newtonian fluid along a plane channel was studied. The flow is driven by constant, uniform suction (or injection) through porous rigid walls at different temperatures. The viscosity was assumed to depend on the temperature and thus the Navier-Stokes and the energy equations are coupled. The problem admits a similarity solution which was analised in detail. Numerical schemes based on spectral methods were developed. These routines efficently solve both the time dependent and the steady state equations. This fact allows us to describe the velocity, pressure and temperature fields for a large range of values of the parameters. The temporal and spatial stability of steady similarity solutions was also studied. New numerical codes were written to solve the characteristic value problems which appear in this type of analysis. Finally, the two dimensional problem (without thermal effects) was solved using a finite difference code. The importance of similarity solutions under given conditions at the entrance of the channel was investigated.

Ferré, Lilian Elizabeth. "Niveles de vitelogenina en la langosta de agua dulce Cherax quadricarinatus (Decápoda: Parastacidae): ensayos in vitro e in vivo" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se determinaron los niveles de vitelina (Vn) y vitelogenina (Vg) en hembras de la langosta dulceacuícola Cherax quadricarinatus durante todo su ciclo reproductivo y además en respuesta a tratamientos tanto in vitro como in vivo con las siguientes hormonas o neuroreguladores: metil farnesoato (MF), 17α-hidroxiprogesterona (17PG) y naloxona (Nx), ensayando adicionalmente 17β-estradiol (E2) in vitro. Los niveles de Vn y Vg se midieron en ovario (OV), hemolinfa (HL) y hepatopáncreas (HP) mediante la técnica inmunoenzimática ELISA puesta a punto especialmente para el desarrollo de esta Tesis. En el estudio del ciclo reproductivo, se determinó la variación anual de los niveles de Vn yVg en hemolinfa, ovario y hepatopáncreas de hembras adultas de C. quadricarinatus y se correlacionaron tales niveles con los índices gonadosomático (IGS) y hepatosomático (IHS). Se encontró una concentración máxima de vitelogenina circulante en el período reproductivo medio, en correlación con valores elevados de IHS y de contenido de Vg en hepatopáncreas. En el caso de los ensayos in vitro, los compuestos ensayados se agregaron al medio de incubación, mientras que en el ensayo in vivo se incorporaron al alimento. Los resultados obtenidos tanto in vitro como in vivo, indican que el MF estimula la síntesis endógena de vitelina en el ovario, durante la maduración temprana e intermedia del mismo, siendo incluso capaz de inducir la síntesis de Vn en un ovario en quiescencia reproductiva (periodo postreproductivo). El MF no mostró efectos sobre la producción de vitelogenina en sitios extraováricos. Las hormonas esteroideas estimularon la vitelogénesis endógena (en el ovario) durante el periodo pre-reproductivo ó reproductivo temprano. El antagonista encefalinérgico naloxona no tuvo efecto sobre la s vitelogénesis indicando que la hormona estimulante gonadal, cuya secreción es estimulada por naloxona, no estaría involucrada directamente en la síntesis de Vn, aunque sí tendría efecto sobe la síntesis de otras proteínas ováricas. El presente trabajo provee herramientas de potencial aplicación en acuicultura a fin de optimizar la producción de la especie en estudio.

Abstract:
Vitellin (Vn) and vitellogenin (Vg) levels were determined in females of the freshwater crayfish Cherax quadricarinatus during the entire reproductive cycle, and also in response to the following hormones and neuroregulators: methyl farnesoate (MF), 17α- hidroxyprogesterone (17PG) and naloxone (Nx); additionally, 17β-estradiol (E2) was assayed in vitro. Vn and Vg levels were measured in hemolymph (HL), ovary (OV) and hepatopancreas, by means of the immunoenzymatic technique ELISA, specially developed for this Thesis. In the study of the reproductive cycle, the annual variation of Vn and Vg levels in ovarty, hemolymph and hepatopancreas was determined and correlated to both the gonsadosomatic (GSI) and hepatosomatic (HSI) indexes. A maximum concentration of circulating Vg was found in the mid reproductive period, in correlation to high values of both HIS and Vg content in hepatopancreas.. For the in vitro assays, the assayed compounds were added to the incubation medium, while for the in vivo assay, the same compounds were incorporated to the provided food. The results obtained both in vitro and in vivo indicate that MF stimulates the endogenous Vn synthesis in the ovary, during both its early and intermediate maturation, even being able to induce the Vn synthesis in a quiescent ovary (i.e., during the post-reproductive period). On the other hand, MF did not show any stimulating effect on Vg synthesis in extra-ovarian sites. Steroid hormones stimulated endogenous vitellogenesis (in the ovary) during either the prereproductive or early reproductive period. The enkephalinergic antagonist naloxona showed no effect on vitellogenesis process, indicating that the gonad stimulating hormones, whose secretion is stimulated by naloxona, would not be directly involved in the Vn synthesiss; instead, it would be stimulating the synthesis of other ovarian proteins. The current study provides tools of potential application in aquaculture, to improve the production of the studied species.

Fesquet, Alberto E. J.. "Estudio morfológico y sistemático de los Peneidos argentinos, precedido de algunas consideraciones conexas acerca de los Crustáceos y su clasificación" (1939). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fidanza Romani, Nerina Andrea. "Efectos de interferencia en la producción del bosón de Higgs en el LHC" (2017-03-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis se estudiaron los efectos de la interferencia entre la se~nal correspondiente a un bosón de Higgs decayendo a dos fotones en el LHC, y su respectivo background continuo de QCD. En primer lugar, se completó el cálculo de esta interferencia a orden O(α 2 S) para la producción inclusiva de un bosón de Higgs, incluyendo los canales de producción qg y qq que representan hasta un 35% de la contribución dominante del subproceso partónico gg. En particular, se estudió el efecto que tiene dicha interferencia en la posición aparente de la resonancia del bosón de Higgs en el espectro de masa invariante de los dos fotones. Luego, se analizó el caso correspondiente a la producción de un bosón de Higgs en asociaci ón con dos jets, un proceso que recibe contribuciones importantes tanto del mecanismo de fusión de gluones, como de la fusión de bosones vectoriales. Nuevamente se estudió el corrimiento del pico de la distribución en masa invariante del par de fotones, encontrando que este es más peque~no que el de la muestra inclusiva. Debido a esto, y teniendo en cuenta que este corrimiento puede ser utilizado para restringir el ancho total de decaimiento del bosón de Higgs, se propuso utilizar el canal de H(-->ϒϒ) + 2 jets como referencia para medir el corrimiento en la masa invariante inclusiva. Finalmente se estudió el efecto de la interferencia en el espectro de impulso transverso qT del bosón de Higgs. Para poder proveer predicciones confiables para este observable, y en particular en la región de impulso transverso peque~no, se realizó la denominada resumaci ón de qT , que consiste en la suma a todo orden en teoría de perturbaciones de las contribuciones dominantes en el límite qT --> 0. Dicha resumación permite la cancelación de divergencias que de otro modo arruinan la convergencia de las predicciones perturbativas para el observable mencionado.

Abstract:
In this Thesis we studied the effects of the signal-background interference for the Higgs diphoton decay channel at the LHC. In the first place, we present a complete O(α 2 S) computation of the interference in the inclusive Higgs production, including the qg and qq production channels, which amount up to 35% of the dominant gg partonic subprocess. In particular, the effects of the interference on the position of the resonance peak of the Higgs boson in the diphoton invariant mass spectrum was studied. Later, we analized the production of a Higgs boson plus two jets channel, a process which receives important contributions, both from the gluon fusion mechanism, as well as from the vector boson fusion mechanism. Once again, we studied the apparent shift in the position of the diphoton invariant mass peak generated by the interference contributions, finding it to be much smaller than the shift in the inclusive sample. For this reason, and considering that this shift may be used to measure, or bound, the Higgs decay width, we proposed using this channel as a reference mass for measuring the inclusive mass shift. Finally, we studied the interference effects on the transverse momentum qT spectrum of the Higgs boson. In order to provide reliable predictions of this observable, and in particular in the low transverse momentum region, we carried out the so-called qT resummation, which consists on summing to all orders in perturbation theory the dominant contributions in the qT --> 0 limit. This resummation allows the cancellation of divergences which would otherwise ruin the convergence of the perturbative predictions for the said observable.

Figari, Eduardo G.. "Evolución tectónica de la cuenca de Cañadón Asfalto (zona del Valle Medio del Río Chubut)" (2005). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La Formacion Canadon Asfalto es un conjunto de depositos volcanicos, bioquimicos, piroclasticos y epiclasticos que aflora en la zona central y norte de la Provincia de Chubut, pero que fueron descritos inicialmente en la region del Valle Medio del rio Chubut. Las principales incognitas sobre esta unidad se planteaban sobre la geometria, extension y genesis de la cuenca que la albergo, asi como sobre los esfuerzos posteriores que la habrian deformado. El estudio de campo en detalle de la estratigrafia, distribucion, geometria, discontinuidades, y elementos tectonicos que controlaron la depositacion de la Formacion Canadon Asfalto (sensu lato) demostro que bajo este nombre se han considerado distintas unidades litoestratigraficas que deberian en realidad formar parte de formaciones distintas (Formaciones Canadon Calcareo, Estratos de Almada, etc.). Sin embargo por motivos conceptuales y de simplicidad, se decidio mantener el nombre generico de Formacion Canadon Asfalto y adoptar una nomenclatura descriptiva, evitando crear nombres formales nuevos. Los estudios estructurales y tectosedimentarios presentados en esta tesis doctoral permitieron reconocer que la clasica Formacion Asfalto representaba, ademas, el registro de etapas diferentes dentro de la evolucion de cuencas de hemigraben. Estas cuencas se desarrollaron como depocentros aislados sobre un area mas extensa que la conocida hasta el momento, habiendose encontrado numerosos afloramientos previamente mal asignados desde el punto de vista temporal, pero que en realidad pertenecen al mismo gran evento. Se definio entonces la existencia de un sistema de rift elongado en direccion noroeste que se desarrollo desde el Jurasico Medio hasta el Cretacico Temprano, constituido por un conjunto de hemigrabenes vinculados entre si por zonas de acomodacion, que recibe el nombre de Cuenca de Canadon Asfalto. Estos resultados se integraron a la evolucion tectonica de la parte sur del continente americano teniendo en cuenta su relacion temporal y espacial, en especial con la orientacion de los esfuerzos, de la apertura del Mar de Weddell. Esfuerzos compresivos durante el Neogeno de orientacion principal oeste-este provocaron la inversion tectonica parcial de la cuenca, principalmente en su borde occidental. La actitud diferencial que ha tenido la fracturacion preexistente frente a esta compresion regional, se justifica a partir de la orientacion de esas fallas ante al esfuerzo maximo compresivo (sigma 1). De esa manera, se produjo la reactivacion de esos planos de falla previos con desplazamiento inverso u oblicuo o su no reactivacion.

Abstract:
The Canadon Asfalto Formation is a succession of volcanic, biochemical, pyroclastic and epiclastic deposits which are exposed in the central and northern regions of the province of Chubut. These sequences were only originally described in the region of the Middle Valley of the Chubut River. The main uncertainties over this unit, before the present studies, were its geometry, distribution, and genesis of the basin, which controlled its deposition, as well as the stress field that later deformed its sediments. The detail field studies on the stratigraphy, distribution, geometry, discontinuities, and tectonic elements that constrain the deposition of the Canadon Asfalto Formation (sensu lato) showed that under this denomination have been grouped different litostratigraphic units, which could be considered as independent formations such as Canadon Calcareo Formation, the Almada beds, and so on. However, based on conceptual and simplicity reasons it was decided to keep Canadon Asfalto Formation as a generic name and to adopt a descriptive nomenclature avoiding creating new formal names. The structural and tectosedimentary studies in this doctoral thesis allowed recognizing that the classic Canadon Asfalto Formation represented a record of different stages in the evolution of a rift system that was controlled by halfgraben basins. These basins were developed as isolated depocentres over a more extensive area that was previously known. Several outcrops have been identified, whose ages were wrongly interpreted, and were part of a single great event. This reconsideration allowed defining a rift system a with a north-western trend that occurred between the Middle Jurassic up to the Early Cretaceous, formed by a series of halfgrabens linked among them by accommodation zones, which have received the name of Canadon Asfalto Basin. These results have been integrated to the tectonic evolution of the southern part of South American continent, and based on the temporal and space distribution, it was related to the main orientation of the stress field during the opening of the Weddell sea in Middle Jurassic times. Compressive stresses during the Neogene with a main east-west trend were responsible of the partial tectonic inversion of the basin, mainly along its western margin. The differential response that have been observed in the pre-existing fractures, it is explained by the orientation of these faults in relation to the maximum compressive stress (sigma 1). This fact, explains why this reactivation occurred by reverse or oblique displacements or in some cases by no reactivation of the previous faults.

Figueira, Juan Manuel. "Estudio de la tasa de reacción 30P(alfa, p)33S de interés astrofísico en erupciones de rayos X" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los procesos que ocurren en la superficie de una estrella de neutrones durante erupciones de rayos X incluyen cientos de reacciones (p, γ) y (α, p) diferentes, la mayoría de las cuales involucran núcleos radiactivos de corta vida media. Las estimaciones de la mayoría de las tasas de reacción están aún basadas en cálculos realizados utilizando el modelo estadístico de Hauser-Feshbach, ya que en el pasado no eran posibles las mediciones directas de estas reacciones. Sin embargo, la aplicabilidad de un tratamiento estadístico con núcleos de masa liviana y media es cuestionable. Unicamente en los ultimos años los haces de núcleos radioactivos se han vuelto accesibles experimentalmente y se han llevado a cabo las primeras mediciones directas de este tipo de reacciones. Debido a que las intensidades de los haces disponibles en las instalaciones actuales de haces radiactivos siguen siendo 3–5 órdenes de magnitud menores que las disponibles con haces estables, estas mediciones no pueden aún llevarse a cabo en el rango de energías astrofísicas. En consecuencia los experimentos son realizados a mayores energías y luego se extrapolan a la región de interés. Otras dificultades se originan debido la a presencia de impurezas en el haz, que a veces pueden incluso ser la parte dominante del mismo. Por estas razones es necesario que sean desarrolladas técnicas experimentales novedosas. En este trabajo se desarrolló una nueva técnica utilizando un espectrómetro magnético lleno de gas, la cual permite el estudio de reacciones (α, p) de interés astrofísico en cinemática inversa y por medio de las reacciones temporales inversas. Además se midieron las secciones eficaces de la reacción 30 P(α, p)33 S, de relevancia en modelos de nucleosíntesis en explosiones de rayos X, en el rango de energía Ec.m. = 2,83 a 4,38 MeV y se compararon con cálculos de Hauser-Feshbach. Las secciones eficaces experimentales resultaron ser un factor de alrededor de 7 a 8 menores que los resultados teóricos. A partir de estas secciones eficaces experimentales, se calculó la tasa de reacción estelar en función de la temperatura en el rango de aproximadamente 0,1–10 GK relevante para las erupciones de rayos X. Se discuten las posibles consecuencias para la nucleosíntesis en ese tipo de erupciones

Abstract:
The processes occurring on the surface of a neutron star during X-ray bursts usually include hundreds of different (p, γ) and (α, p) reactions, the majority involving short-lived radioactive nuclei. The estimates of most reaction rates are based on statistical Hauser-Feshbach calculations since direct measurements of these reactions were not possible in the past. The applicability of a statistical treatment for light and medium mass nuclei, however, is questionable. Only in recent years have beams of short-lived nuclei become experimentally accessible and the first direct measurements of these reactions been performed. Because the beam intensities available at existing radioactive beam facilities are still 3–5 orders of magnitude smaller than what is available with stable beams, these measurements can not yet be done at astrophysical energies. Consequently experiments are usually studied at higher energies, which are then extrapolated into the region of interest. Other difficulties originate from the presence of beam impurities which sometimes can be the dominant part of the incident beam. For these reasons novel experimental techniques need to be developed. In this work, a new technique has been developed using a gas-filled magnetic spectrograph which enables the study of (α, p) reactions of astrophysical interest in inverse kinematics and by means of the time-reverse reactions. Using this technique, cross sections of the 30 P(α, p)33 S reaction, relevant to X-ray burst nucleosynthesis models, were measured in the energy range Ec.m. = 2.83–4.38 MeV and compared with Hauser-Feshbach calculations. The experimental cross sections were found to be a factor of around 7–8 smaller than the theoretical results. From these experimental cross sections, the stellar reaction rate was calculated as a function of temperature in the range relevant to X-ray bursts of about 0.1–10 GK. Possible implications for nucleosynthesis in X-ray bursts are discussed

Figueira, Santiago Daniel. "Aspectos de aleatoriedad" (2006). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis, investigamos algunos aspectos de aleatoriedad y trivialidad definidos por la teoría de largo de programa. Primero abordamos la aleatoriedad y la absoluta normalidad de números reales. Ambos conjuntos de reales tienen medida de Lebesgue 1 y son nociones que implican varias propiedades de estocasticidad. A pesar de esto, no ha sido fácil dar ejemplos concretos en estas clases. Probamos que existen números absolutamente normales que son computables y damos dos algoritmos para construirlos. El primero está basado en una reformulación computable de un resultado de Sierpinski de 1916. El segundo es parte de nuestra reconstrucción de un manuscrito inédito de Turing sobre números normales. En cuanto a ejemplos de aleatoriedad, generalizamos la probabilidad de detención de Chaitin y analizamos la probabilidad de que una máquina universal se detenga y devuelva un resultado en un conjunto dado X. Estudiamos la relación entre las propiedades de X provenientes de la teoría de la computabilidad y las propiedades de aleatoriedad de la probabilidad inducida. El segundo aspecto de aleatoriedad que tratamos es el estudio de una variante de la complejidad clásica de largo de programa que no involucra oráculos, y nos preguntamos si esta noción conduce a una definición más estricta de aleatoriedad. Definimos nuestra función de complejidad en base a máquinas de Turing monótonas que realizan cómputos infinitos. Investigamos algunas propiedades de esta función y consideramos las definiciones inducidas de aleatoriedad y trivialidad. Con esta última noción caracterizamos a los reales computables. El último aspecto se vincula con la anti-aleatoriedad y la posibilidad de caracterizar a los reales llamados K-triviales con nociones que no involucren directamente a la complejidad de largo de programa libre de prefijos. Proponemos e investigamos dos nociones de lowness que tienen sus raíces puramente en la teoría de la computabilidad, reforzando otras ya existentes en la literatura. Relacionamos la complejidad de largo de programa plana C y libre de prefijos K con estas nociones, considerando variaciones de K-trivialidad y C-trivialidad. Concluimos con una lista de las principales preguntas que quedaron abiertas.

Abstract:
In this thesis we investigate some aspects of randomness and triviality defined by the theory of program-size. We first deal with randomness and absolute normality of real numbers. Both sets of reals have Lebesgue measure 1 and they are notions that imply several properties of stochasticity. Despite that fact, it has not been easy to give concrete examples in such classes. We prove that there are absolutely normal numbers which are computable and we give two algorithms for constructing such numbers. The former is a computable reformulation of a result of Sierpinski of 1916. The latter is part of our reconstruction of an unpublished manuscript of Turing on normal numbers. For examples of randomness, we generalize Chaitin's halting probability and we analyze the probability that a universal machine halts and gives an output in a given set X. We study the relationship between the computability theoretic properties of X and the randomness properties of the induced probability. The second aspect of randomness that we tackle is the study a variant of the classical definition of program-size complexity which does not involve oracles, and we ask whether it leads to a stronger notion of randomness. We define our complexity function based on monotone Turing machines performing unending computations. We investigate some properties of this function and we consider the induced definitions of randomness and triviality. With this last notion we characterize the computable reals. The last aspect deals with anti-randomness and the possibility to characterize the so called K-trivial reals in terms of notions that do not directly involve the prefix-free program-size complexity. We propose and investigate two computability theoretical combinatorial lowness notions by strengthening other notions already existing in the literature. We relate the plain C and the prefix-free program-size complexity K with these notions by considering variations of K-triviality and C-triviality. We conclude with a list of the main questions that remain open.

Figuerola, Patricia Irene. "Disminución nocturna de la temperatura" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La disminución de la temperatura del aire después de la puesta del sol es una consecuencia de la pérdida de radiación de la superficie terrestre. Cuando el cielo esta despejado y los vientos son débiles se presenta un marcado descenso de la temperatura. Se define la ocurrencia de la helada cuando la temperatura del aire es igual o inferior a 0°C. Los cultivos padecen daños por efecto de las bajas temperaturas aún por encima de 0°C. Las etapas de floración y formación de los frutos son, en general, las más sensibles a las bajas temperaturas causando daños que algunas veces son irreversibles. La implementación de técnicas de protección de los cultivos requiere de un pronóstico preciso de la temperatura mínima. Algunos métodos de predicción están basados en relaciones estadisticas, mientras que otros consideran los procesos físicos que directamente determinan la temperatura mínima. En este trabajo, se desarrolla y evalúa un modelo de predicción de la temperatura nocturna, que considera los procesos de conducción de calor en el suelo y de difusión de calor en el aire. El modelo se basa en la ecuación bidimensional de difusión de calor en el aire y en el suelo y en el balance de calor en la interfase suelo-atmósfera. Las expresiones correspondientes a los flujos de calor en los dos medios se obtienen aplicando la teoría del flujo gradiente. Se propone un coeficiente turbulento de difusividad térmica que varía con la altura y con la estabilidad atmosférica. Para obtener el flujo inicial de calor sensible se utiliza la hipótesis de la semejanza de Monin-Obukhov. El sistema de ecuaciones planteado es resuelto analíticamente utilizando el método de la Transformada de Laplace y se obtiene una expresión de la evolución temporal de la temperatura en superficie. Conocer anticipadamente el período de tiempo durante el cual un cultivo estará sometido a bajas temperaturas también resulta de interés para la agricultura. El modelo desarrollado permite obtener la predicción del valor de la temperatura luego de ocurrido su valor mínimo o sea cuando los valores térmicos aumentan. El modelo propuesto es evaluado y comparado con datos observados, obteniéndose resultados satisfactorios. Asimismo, se efectúa un análisis de sensibilidad del modelo a variaciones de los parámetros de entrada. En este trabajo, también, se evalúan otros modelos de predicción de temperatura obtenidos por diferentes autores y los valores son comparados con datos observacionales. Además, se realiza un análisis comparativo del modelo propuesto con respecto a los diferentes modelos.

Filevich, Oscar. "Compuestos enjaulados para la regulación de la expresión de genes" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo se extiende la tecnología de fotoliberadores de moléculas biológicamente interesantes activables con luz visible basados en bipiridinas de rutenio, inicialmente desarrollada en nuestro laboratorio. Se caracterizan algunas propiedades de fotoliberadores de moléculas de importancia biológica, coordinados a rutenio a través de grupos poco básicos como nitrilos o tioéteres. Se describen algunas propiedades de dos de ellos: Un fotoliberador de un fluoróforo derivado de rodamina cuya fluorescencia disminuye en su estado coordinado y es recuperada al ser fotoliberado; y un fotoliberador de una molécula pequeña capaz de controlar la síntesis de proteínas por el operón lactosa, como demuestran los bioensayos en E. coli. La capacidad para proteger y fotoliberar estos grupos funcionales junto con la posibilidad de funcionalizar superficies con fotoliberadores y microirradiarlas a escala subcelular con un microscopio adaptado a tal fin, extienden la utilidad de estas herramientas para responder preguntas actuales y relevantes.

Abstract:
In this work we further extend the technology of visible-light phototriggers for biologically relevant biomolecules, which was originally developed in our lab. We characterize some properties of molecules with biological importance which, through low-basicity groups like nitriles or thioethers, coordinate ruthenium-bipyridine complexes yielding caged-compounds which can be released with low-energy visible light. The properties of two of them are studied to some detail: a phototrigger of a modified rhodamine that is a fluorescence quencher: rhodamine's full fluorescence is recovered upon photorelease. The second one is a phototrigger for a small-molecule which can control genetic systems under lac operon regulatory elements, as shown by E. coli bioassays. As a proof-of-concept, the chemical modification of surfaces with a ruthenium caged-compound is shown, toghether with the optical instrument constructed for controlling photouncageing at a sub-cellular scale. These ruthenium- bipyridine based tools extend the functions available through biomolecule and small-molecule visible-light phototriggers.

Finkielstein, Carla V.. "Caracterización molecular de una fosfoproteína novel intermediaria en el mecanismo de acción de hormonas proteicas" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Trabajos previos de nuestro laboratorio han permitido caracterizar una fosfoproteína novel (p43), intermediaria en la síntesis de esteroides en la zona fasciculata de la corteza adrenal de rata (Paz C. et al. (1994) Eur. J. Biochem. 224:709-716). En la presente Tesis, se describe la caracterización molecular de p43 asi como también la regulación hormonal del transcripto. Los resultados obtenidos mostraron que p43 es homóloga a una acil-CoA tioesterasa mitocondrial. La secuencia aminoacídica deducida de la proteína presentó sitios consenso de fosforilación para diferentes proteínas quinasas y un motíf para serina Lipasa. Anticuerpos dirigidos contra un péptido sintético que incluye dicho motif y otro contra la región N-terminal de p43, bloquearon la actividad biológica de la proteína. El transcripto de p43 fue detectado en ovario de ratas pseudopreñadas, en zona fasciculata y glomerulosa de adrenal de rata, en una línea tumoral de células de Leydig, en cerebro de ratón y en placenta humana. El tratamiento de ratas con dexametasona (Dx) provoca una disminución en los niveles del ARNm de p43 de manera dosisdependiente en adrenales de rata. El tratamiento posterior con ACTH no sólo revierte el efecto de la Dx, sino que produce un aumento rápido (5 min) en los niveles del mensajero alcanzando un máximo a los 15 min (62%) y retornando a los valores basales a los 30 min posteriores al estímulo. El tratamiento con actinomicina D o cicloheximida antes del estímulo con ACTH provoca una disminución o un aumento en los niveles del ARNm de p43 respectivamente. Estos resultados relacionan por primera vez que una actividad de acil-CoA tioesterasa está involucrada en los procesos esteroidogénicos.

Abstract:
We have previously reported the purification of a phosphoprotein (p43) intermediary in steroid synthesis from adrenal zona fasciculata (Paz C. et al. (1994) Eur. J. Biochem. 224:709-716). Here we describe the cloning and sequencing of a cDNA encoding p43 as well as the hormonal regulation of p43 transcript. The protein resulted homologous to a very recently described mitochondrial peroxisome proliferator-induced very-long-chain acyl-CoA thioesterase. The deduced amino acid sequence of the protein shows consensus sites for phosphorylation by different protein kinases, and a Lipase serine motif. Antibodies raised against a synthetic peptide that includes the Lipase serine motif and against the N-terminal region of p43 block the action of the protein. The transcript of p43 was detected in ovary of pseudopregnant rats, rat adrenal zona fasciculata and glomerulosa, mouse Leydig tumor cell line, rat brain and human placenta. Inhibition of adrenocorticotropin hormone (ACTH)release and steroid synthesis by dexamethasone produced a dosedependent decrease in the abundance of the adrenal transcript. The transcript was induced by in vivo stimulation of the adrenals with ACTH. The effect had a rapid onset (5 min), reached maximal stimulation (62%) at 15 min and returned to basal levels at 30 min. ACTH effect on p43 transcript was inhibited by actinomycin D and enhanced by cycloheximide. Our results provide the first evidence linking acyl-CoA thioesterases, with very-long-chain specificities, and a protein intermediary in steroid synthesis, thereby supporting a regulatory role for acyI-CoA thioesterases in steroidogenic tissues.

Fiorini, Franco Luis. "Esquemas regulares para la gravitación con estructura teleparalela" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fiorini-von Niederhäusern, Antonia Leonor. "Reacción que experimentan los melanocitos de Fitzroyia lineata (Jen.) Berg y Cnesterodon decemmaculatus (Jen.) Garman, al ser tratados con preparados de orina y suero de mujer grávida" (1944). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fischbein, Deborah. "Influencia de los rasgos de historia de vida y del uso de información en la adquisición de recursos y dispersión en el parasitoide Ibalia leucospoides Hochenwarth (Hymenoptera: Ibaliidae)" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo central de esta tesis es estudiar como la selección natural moldea los rasgos de historia de vida y el comportamiento de los animales de acuerdo al entorno ecológico en el que viven. Este marco teórico nos conduce a las hipótesis especificas respecto a los procesos de reproducción, dispersión y forrajeo de recursos en el parasitoide Ibalia leucospoides. Los resultados principales de la tesis son (1) que la proporción de huevos maduros que posee la hembra al momento de la emergencia respecto de la fecundidad potencial es alta; es decir que I. leucospoides tiende a la pro-ovigenia como estrategia de maduración de huevos; (2) las hembras adultas no dependen de la alimentación para sostener la maduración de huevos, ni tampoco para el mantenimiento somático y la capacidad de vuelo; (3) bajo nuestras condiciones experimentales la capacidad de vuelo obedece a las características morfológicas del parasitoide (tamaño y carga alar) y finalmente; (4) respecto a la búsqueda de hospedadores, las hembras son capaces de discriminar diferencias en la calidad de los parches de hospedadores a la distancia, sin la necesidad de llevar a cabo un proceso de muestreo de los mismos. Además, para la explotación de los parches utilizan información de los parches de hospedadores vecinos. El éxito reproductivo de I. leucospoides, parasitoide pro-ovigenico, no está limitado por la ausencia de alimento durante la vida adulto. Ambas estrategias, la de asignación de recursos hacia diferentes funciones biológicas y la comportamental de forrajeo, adoptadas por esta especie, probablemente sean en respuesta a características del ambiente tales como la distribución fuertemente agregada de Sirex noctilio, el hospedador, y la disponibilidad de recurso (i.e. hospedador y/o alimento).

Abstract:
The central aim of this thesis is to explore how natural selection shapes life history traits and behaviuors according to the ecological environment in which an animal exists. This overall framework leads to specific hypotheses concerning the reproductive, dispersal and foraging processes in the parasitoid Ibalia leucospoides. The experiments in behavioural ecology and eco-physiology in female parasitoids of Ibalia leucospoides show as main results, that (1) the proportion of the potential lifetime eggs complement that is mature at female emergence is high; (2) low dependency on adult female feeding, not only for egg maturation but also for survival and flight; (3) under our experimental conditions flight capacity depends on the morphological characteristics of the parasitoid (size and wing loading); and (4) regarding host foraging, females accurately assess differences in host patch quality from a distance without the need of displaying a sampling process; in addition that patch exploitation times depend on the information obtained from the surrounding patches. The reproductive success of I. leucospoides, a proovigenic parasitoid, is not constrained by adult food deprivation. Both the resource allocation strategy toward the different biological functions and the foraging behaviour adopted by this parasitoid species may well be in respond to habitat characteristics, such as a strongly aggregated distribution of Sirex noctilio, the host, as well as to the resources availability (i.e. host and food).

Fischer, Sylvia. "Dinámica estacional de insectos acuáticos en ambientes efímeros urbanos : con énfasis en los culícidos" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los cuerpos de agua temporarios se caracterizan por su ciclo de inundación y sequía recurrente, que impone a los organismos limitaciones para su desarrollo. Algunos insectos han desarrollado adaptaciones que les permiten sobrevivir y reproducirse en este tipo de hábitats, entre las cuales se destacan la dispersión activa (migración) y la presencia de estadios de resistencia (tolerancia fisiológica). En general los organismos que habitan este tipo de hábitats poseen un desarrollo rápido que se completa antes de la desecación del ambiente. Entre los insectos se destacan los mosquitos (Diptera: Culicidae) por su abundancia, aunque también se registran diversas especies de Heteroptera, Coleoptera y Odonata. En los espacios verdes de la ciudad de Buenos Aires se registra gran cantidad de charcos temporarios. El objetivo de este trabajo fue estudiar las variables asociadas con la presencia y abundancia de distintas especies, principalmente culicidos. Se realizó un estudio intensivo de 89 cuerpos de agua temporarios en un parque de la ciudad (Parque Saavedra). Se analizó la relación de la permanencia del agua con variables meteorológicas y morfométricas de los cuerpos de agua. La composición de la fauna de insectos (principalmente culicidos) fue analizada cuali y cuantitativamente en función de diferentes variables (precipitaciones, temperatura, dimensiones de los charcos, hidroperíodo, insolación y cobertura vegetal). Los resultados fueron corroborados mediante información correspondiente a un segundo período de estudio. Las variables asociadas positivamente con la permanencia del agua en los charcos fueron las precipitaciones y las dimensiones, mientras que la temperatura y la vegetación mostraron una relación inversa. Durante el periodo de estudio se registraron 43 taxa de insectos, entre los cuales los culícidos fueron los más abundantes, seguidos de coleópteros y heterópteros. Algunas de las especies registradas son consideradas como pioneras tipicas de hábitats temporarios (Neoplea maculosa, Notonecta sellata, Buenoa fuscipennis, Sigara platensis y Ochlerotatus albifasciatus). La composición de insectos mostró similitudes con la de ambientes acuáticos afines de la región. Las mayores riquezas fueron halladas en la temporada de verano, asociadas con un alto grado de anegamiento y permanencia del agua. La mayor parte de los insectos registrados se dispersa activamente, y también son hallados en hábitats permanentes de la zona. La especie más abundante fue Ochlerotatus albifasciatus, que resiste la sequía mediante huevos de resistencia. Los cuerpos de agua del parque Saavedra pertenecen al extremo efímero del gradiente de duraciones favorables para los insectos estudiados. La abundancia relativamente baja de ejemplares inmaduros de heterópteros y odonatos indica que no serian los sitios de cría óptimos para estos organismos debido a su escasa duración. El grado de anegamiento fue la variable más relacionada con la presencia de las distintas especies de culícidos. Este trabajo aporta un marco general sobre la dinámica de cuerpos de agua temporarios y su comunidad de insectos en una área urbanizada. Esta información permite una mejor evaluación de posibles estrategias de manejo, principalmente apuntadas a las poblaciones de mosquitos, teniendo en cuenta la localización urbana de los hábitats.

Abstract:
Temporary pools are bodies of water that experience recurrent flooding and drying cycles and impose severe constraints to faunal development. Aquatic insects have developed different adaptive strategies to survive and reproduce in this kind of habitats, among which active dispersal (migration) and the occurrence of resting stages (physiological tolerance) are the most important ones. Organisms inhabiting temporary waters are characterised by their rapid development before the pool dries up. Although mosquitoes (Diptera: Culicidae) are among the most abundant taxa in this kind of habitats, several Heteroptera, Coleoptera and Odonata are also frequent. The presence of high numbers of temporary rain pools is characteristic of Buenos Aires city parks. The present work is aimed at describing and analysing the variables associated with the presence and abundance of different insect species, mainly culicids. A total of 89 temporary water bodies were intensively studied in a park of Buenos Aires city (Saavedra Park). Relationships between water permanence and meteorological and morphometric variables in each pool were analysed. Aquatic insect faunal composition (presence and abundance) were analysed as a function of different variables (rainfall, temperature, pool dimensions, hydroperiod, insolation degree and vegetation cover). Results were validated with data from a second study period. Water permanence was positively related to rainfall and pool dimensions, while temperature and vegetation cover showed a inverse relationship. Among the 43 taxa recorded during the study period, culicids were the most abundant, followed by coleopterans and heteropterans. Some of the species are considered typically pioneers in temporary pools (e.g. Neoplea maculosa, Notonecta sellata, Buenoa fuscipennis, Sigara platensis, and Ochlerotatus albifasciatus). Insect faunal composition showed similarities to other temporary waters in Buenos Aires. The highest richness was observed during the summer, in association to high water levels and water permanence. Most of the recorded species disperse actively, and are also observed in permanent habitats of Buenos Aires. The mosquito Ochlerotatus albifasciatus, the most abundant species, withstands drying by means of resistant eggs. The temporary pools at Saavedra park represent an extreme of the gradient of suitable conditions for the studied insects, owing to their ephemeral nature. The relatively low abundances of immatures of heteropterans and odonates suggest that most of the studied rain pools may be unsuitable breeding sites for these predatory taxa because of their short permanence. Water level is the variable most significantly associated to the presence of different species of Culicidae. This work provides a general framework about dynamics of temporary rain pools and their insect community in a urban area. This information allows a better evaluation of management strategies of this kind of habitats, mainly to control mosquito populations.

Fiszbein, Ana. "Regulación ¨epigenética¨ del splicing alternativo durante la diferenciación neuronal" (2016-05-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las modificaciones epigenéticas son cruciales para el establecimiento y mantenimiento de programas de diferenciación celular. Un posible mecanismo de regulación está determinado por el efecto de la estructura de la cromatina en los patrones de splicing alternativo. Las marcas epigenéticas pueden provocar cambios en la tasa de elongación de la ARN polimerasa II, así como afectar el reclutamiento de diversos factores y, de esta manera, modular los patrones de splicing alternativo. Aquí descubrimos el mecanismo por el cual el splicing alternativo de la molécula de adhesión celular neural (NCAM) es regulado durante la diferenciación neuronal mediante la estructura cromatínica. Por otra parte, nos centramos en la regulación del splicing alternativo de G9a, la enzima responsable de la dimetilación en lisina 9 de histona H3 (H3K9me2) en eucromatina de mamíferos. Demostramos que G9a es necesaria para la diferenciación de la línea celular neuronal de ratón N2a y que la inclusión de su exón alternativo (E10) aumenta la localización nuclear de G9a, probablemente debido a la mayor exposición de una secuencia de localización nuclear cercana. Por último, mostramos que la isoforma de G9a que incluye el E10 es necesaria para la diferenciación neuronal y que regula el patrón de splicing alternativo de su propio ARN mensajero precursor promoviendo una mayor inclusión del E10. Nuestros resultados indican que, mediante el control de su splicing alternativo, G9a promueve la diferenciación neuronal y gatilla un mecanismo de retroalimentación positiva que reafirma el compromiso a la diferenciación celular.

Abstract:
Epigenetic modifications are critical for the establishment and maintenance of differentiation programs. One possible mechanism of regulation is determined by the effect of chromatin structure on alternative splicing patterns. Epigenetic marks can cause changes in elongation rate of RNA polymerase II, as well as affect the recruitment of different factors, and thus modulate alternative splicing choices. Here we discovered the mechanism by which the alternative splicing of the neural cell adhesion molecule (NCAM) is regulated during neuronal differentiation by chromatin structure. Moreover, we focused on the regulation of G9a alternative splicing, the enzyme responsible for dimethylation of lysine 9 in histone H3 (H3K9me2) in mammalian euchromatin. We demonstrate here that the G9a methyltransferase is required for differentiation of the mouse neuronal cell line N2a and that inclusion of its alternative exon 10 (E10) increases during neuronal differentiation of cultured cells, as well as in the developing mouse brain. Although E10 inclusion greatly stimulates overall H3K9me2 levels, it does not affect G9a catalytic activity. Instead, E10 increases G9a nuclear localization, predictably due to higher exposure of a neighboring nuclear localization signal. We show that G9a inclusion of E10 isoform is necessary for neuron differentiation and regulates the alternative splicing pattern of its own pre-mRNA, enhancing E10 inclusion. Overall, our findings indicate that, by regulating its own alternative splicing, G9a promotes neuron differentiation and creates a positive feedback loop that reinforces the cellular commitment to differentiation.

Floccari, Mirtha Elena. "Estudios genéticos de la biosíntesis de Poli(3-Hidroxibutirato)PHB, en Bacillus megaterium. Obtención y caracterización de mutantes y expresión heteróloga de genes phb" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los polihidroxialcanoatos (PHAs) constituyen una familia compleja de polímeros, que se acumulan en el citoplasma celular de una amplia variedad de microorganismos en forma de gránulos, como material de reserva. Estos polímeros pueden ser utilizados en la fabricación de plásticos que, a diferencia de los producidos por síntesis química son termoplásticos, biodegradables y pueden biosintetizarse a partir de recursos renovables. Bacillus megateríum acumula principalmente poli(3-hidroxibutirato), PHB, un homopolímero lineal de D(-)-3-hidroxibutirato. La estructura del gránulo, así como los mecanismos involucrados en su formación son poco conocidos. En este trabajo se obtuvo una colección de mutantes de Bacillus megaterium deficientes en la biosíntesis de PHA, con inactividad de la enzima PHA sintasa. A continuación, se estableció, un sistema de estudio de genes pha heterólogos en una bacteria que acumula el polímero en forma natural. Para ello se introdujo el gen que codifica para la enzima PHA sintasa de Alcaligenes eutrophus en las mutantes PHA negativas obtenidas, utilizando como vector de subclonado el plásmido “shuttle” pATl9. Por último y para contribuir al conocimiento sobre los roles de las proteínas asociadas al gránulo y sus interacciones en la formación del mismo, se aplicó este sistema de estudio al análisis de la interacción de la proteína de Mr 22 de B. megateríum, propuesta como un factor estructural de importancia en la formación de estas inclusiones, en B. megaterium, con gránulos sintetizados por la PHA sintasa de A. eutrophus. Los resultados obtenidos revelaron que esta proteína puede asociarse a los gránulos formados por la sintasa heteróloga.

Abstract:
The polyhydroxyalkanoates (PHAs) are a group of polymers that accumulate in the bacterial cytoplasm forming inclusions called granules. These polymers, biosynthesized from removable resources, can be used as biodegradable plastics. Bacillus megaterium accumulates poly(3-hydroxybutyrate) PHB, a linear homopolymer of D(-)-3-hydroxybutyrate. The granule structure and the biochemical mechanisms involved in their synthesis are not completely understood. In this work a collection of B. megaterium mutants deficient in PHB synthesis was obtained. None of them showed PHA synthase activity. A system was developed for the study of heterologous genes, using these mutants and the Gram positive and negative bacterial shuttle plasmid pAT19, as cloning vector. In an attempt to understand the role of granule associated proteins and their interactions, this system was used to analyze if the 22 Mr protein of B. megaterium, that is supposed to perform the role of a structural protein, could be associated with PHA granules synthesized by the Alcaligenes eutrophus synthase. The results showed an association to the granules, whose synthesis was directed by an heterologous synthase.

Flores, Graciela B.. "Las antenas y el sentido térmico de la vinchuca triatoma infestans (Heteroptera: Reduviidae)" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió el sentido térmico de la chinche hematófaga Triatoma infestans para dilucidar la función de las antenas en la orientación espacial y en la evaluación de las propiedades de una fuente de calor. Los resultados demuestran que la función de termorreceptores específicos para distintos comportamientos en los que la clave térmica es relevante depende de la localización anatómica. Bajo ciertas circunstancias, otros receptores de calor pueden asumir la función de aquellos localizados en las antenas. Sin embargo, la falta de la entrada antenal altera la respuesta comportamental. El análisis del papel de las antenas durante la aproximación hacia una fuente de calor permitió definir dos mecanismos de orientación: la telotaxis, que opera a distancia y la tropotaxis, que actúa en proximidad. El cambio de un mecanismo a otro ocurre abruptamente, a una distancia de 1,5-2 cm de la fuente, aun en ausencia de una de las antenas y con la información térmica como única clave. El estudio de la dinámica de los movimientos antenales en insectos suspendidos reveló la existencia de patrones definidos diferentes durante la aproximación a una fuente de calor. Durante la fase de locomoción, los insectos despliegan movimientos suaves y coordinados. En contraste, durante las fases detención las antenas exhiben movimientos sacádicos y con cambios de dirección abruptos. Sobre esta base, proponemos que las antenas son usadas como “instrumentos de medición” de las discontinuidades térmicas. La respuesta comportamental de las vinchucas frente a fuentes térmicas de distintos tamaños aparentes, obtenidos variando el área emisora de la fuente o la distancia entre la fuente y el insecto, reveló una correlación positiva, estadísticamente significativa, entre el ángulo de apertura antenal y el ángulo subtendido por la fuente. Con estos resultados se construyó un modelo para explicar el mecanismo por el cual las vinchucas reconocen a sus hospedadores utilizando sólo el calor que éstos emiten.

Abstract:
The thermal sense of the haematophagous insect Triatoma infestans was studied to elucidate the role of the antennae in spatial orientation and in the evaluation of the properties of the thermal source. The results demonstrate that the function of specific thermoreceptors involved with those behaviours for which the thermal cue is important depends on anatomical location. Under certain circumstances other heat receptors can assume the function of those located on the antennae. Nevertheless, the lack of the antennal input alters the behavioural response. The analysis of the role of the antennae during the approach to a thermal source made it possible to define two mechanisms of orientation: telotaxis, which acts at a distance and tropotaxis which acts in proximity. The shift from one mechanism to the other occurs abruptly at a distance of 1.5-2 cm from the source even in the absence of one of the antenna and with thermal information as the only cue. The study of the dynamics of antennal movements in suspended insects revealed the existence of defined and different patterns during the approach to a thermal source. During the walking phases the insects display smooth and co-ordinated movements. In contrast, during the standing phases the antennae exhibit saccadic movements with sudden changes of direction. On this basis, we propose that the antennae are “measuring instruments” for thermal discontinuities. The behavioural response of the insects to thermal sources of differing apparent sizes, obtained by varying the area of the emitting surface or its distance from the insect, revealed a statistically significant positive correlation between the antennal opening and the angles subtended by the sources. A model was constructed with these results to explain the mechanism by which the insects recognise their host by using only their emitted heat.

Foieri, Federico. "Transporte cuántico en sistemas mesoscópicos con campos dependientes del tiempo y desorden" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis se estudian distintos aspectos del transporte electrónico en sistemas mesoscópicos desordenados y fuera del equilibrio. En estos sistemas las propiedades de transporte se ven afectadas por el tamaño de los mismos, su geometría particular y el tipo de contacto que ésta tenga con los reservorios de partículas (electrodos), número de impurezas, etc. En el capítulo 1 presentamos la definición precisa del concepto de sistema mesoscópico, las técnicas de fabricación y las magnitudes físicas relevantes al estudio de los mismos. También describimos cada una de las estructuras particulares estudiadas a lo largo de esta tesis. El método de cálculo utilizado se basa en el formalismo de Keldysh de funciones de Green fuera del equilibrio y es desarrollado en el capítulo 2. En el capítulo 3 estudiamos las propiedades de transporte electrónico en sistemas estrictamente unidimensionales y cuasi-unidimensionales con impurezas en el régimen de respuesta lineal a temperatura (T ) y voltaje (V ) finitos. En particular estudiamos las distribuciones de conductancia de cables cuánticos unidimensionales cuando éstos son conectados a dos reservorios en los que se establece una diferencia de potencial. Presentamos distintas alternativas para aproximar dichas distribuciones dependiendo del rango de V y T . A bajas T y V presentamos un modelo de tunneling resonante mientras que para T y V altos se presenta un método estadístico basado en convolu- cionar la distribución de T nula y V infinitesimal un número finito de veces. Estos métodos luego son aplicados aún en casos en los que los contactos entre el cable y los reservorios son imperfectos y para sistemas con varios canales de conducción. En el capítulo 4 se estudia el transporte electrónico en anillos mesoscópicos en presencia de flujos magnéticos variables en el tiempo y acoplados a un reservorio, analizando la influencia del desorden sobre las corrientes inducidas a través del mismo. Entre los resultados más relevantes hemos encontrado que los valores de conductancia pueden ser mayores que el cuanto de conductancia siendo estos sistemas estrictamente unidimensionales. Por otro lado, hemos determinado una longitud de localización efectiva, a partir de la cual ambos sistemas (tanto el anillo como el cable 1D) son equivalentes, es decir, poseen la misma distribución de conductancias (caracterizadas en capítulo 3). Por último, en el capítulo 5 estudiamos sistemas mesoscópicos en presencia de campos oscilantes en el tiempo, donde el transporte se genera mediante la aplicación de bombeos cuánticos (quantum pumps), que permiten inyectar partículas en forma variable con el tiempo en algún punto del sistema. Hemos estudiado la impedancia a cuatro terminales del sistema y las diferentes formas en las que se pueden caracteri- zar los efectos resistivos de un sistema mesoscópico. Esto se realizó incorporando una punta de voltaje débilmente acoplada al sistema que actúa como voltímetro. Además, se han obtenido expresiones analíticas para la resistencia a cuatro terminales uti- lizando teoría de perturbaciones, y también mostramos que esta resistencia puede ser considerada una característica universal del sistema, es decir, es independiente de la forma en que se induce el transporte. En cada capítulo se brinda una introducción en la que procuramos enfatizar la motivación del trabajo y describimos la situación actual, ya sea teórica o experimen- tal, de dicho problema. Luego se introduce el modelo Hamiltoniano, se presentan los cálculos realizados y se discuten los mismos. Finalmente se exponen las conclusiones.

Abstract:
In this thesis we study different aspects of electronic transport in disordered mesoscopic systems out of equilibrium. In these systems, the transport properties depend strongly on the size and geometry of the structure, the coupling with additional sys- tems (particle reservoirs), impurities, etc. In chapter 1 we describe extensively the mesoscopic systems, describing the fab- rication methods and the physical quantities relevant to quantum transport. We also describe every structure studied along this thesis. To perform calculations we em- ployed the Keldysh non equilibrium Green functions formalism which is described in chapter 2. Each chapter is organized as follows: we first give a brief introduction in which the motivation of our work is emphasized and then we describe the theoretical and experimental situation that motivates each work. Then we introduce the physical model in order to present the calculations and discuss the results. Finally, we end each chapter listing the summary and conclusions. We start studying the properties of electronic transport in strictly one-dimensional systems, in the linear response regime, for clean and disordered systems. In chapter 3 we studied the conductance distributions of one-dimensional quantum wires when transport is induced by connecting the sample to two stationary reservoirs with dif- ferent chemical potentials. Depending on the bias voltage V and the temperature T , we present different methods to fit the conductance distributions of these systems. At low T and V we present a resonant tunneling model while for high T and V we present a statistical method which consists in convoluting the conductance distribu- tion for zero temperature and infinitesimal bias. This method is applied even when the contacts between the wire and the reservoirs are imperfect and for systems with more than one conduction channel. In chapter 4, we study electronic transport in mesoscopic disordered rings coupled to a reservoir and driven by a magnetic flux with a linear dependence on time. We have identified two regimes: (i) A localized regime, characterized by a dc conductance whose probability distribution is identical to the one exhibited by a 1D wire of the same length L and disorder strength placed in a two terminal Landauer setup and (ii) a multifloquet regime which exhibits large conductances that can be greater than the quantum of conductance, in spite of the fact that the ring contains a single electronic transmission channel. In chapter 5 we study mesoscopic systems where transport is generated applying quantum pumping. We introduce and study the concept of four point impedance of a mesoscopic system and the different ways to characterize the resistive effects in these systems. This is achieved by adding a voltage probe which act as a voltimeter which is weakly coupled to the system. Moreover, we obtained analytical expressions for the four point resistance using perturbation theory and we show that the four point resistance can be taken as a measure of the resistive properties of a sample, irrespectively, of the mechanism used to induce the transport.

Folcia, Ana María. "Evaluación de Pseudapanteles dignus (Hymenoptera-Braconidae) como posible agente de control biológico de Tuta Absoluta (Lepidoptera-Gelechidae), plaga clave del cultivo de tomate en los alrededores del Gran Buenos Aires" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La polilla del tomate (Tuta absoluta) es considerada plaga clave del cultivo de tomate producido bajo cubierta en los alrededores de Buenos Aires debido a los daños que causa, en hojas, brotes y frutos, y a requerir permanentes medidas de control. Tanto el corto ciclo de vida que ocurre en los cultivos protegidos como la elevada cantidad de medidas de control requeridas han generado problemas de resistencia a insecticidas. Una de las alternativas al control químico es el control biológico. Hacia 1995 fue detectada la presencia natural de un parasitoide de larvas de T. absoluta, Pseudapanteles dignus (Hymenoptera, Braconidae). El objetivo general de esta tesis fue determinar la eficacia de Ps. dignus como agente de control biológico aumentativo de Tuta absoluta y evaluar su compatibilidad con la estrategia de control químico de la plaga. Para ello se determinó su potencialidad mediante la evaluación de sus atributos biológicos en condiciones de laboratorio (supervivencia y fecundidad) y comparación con los de la plaga. Se estimó su tasa de ataque en relación con la densidad de la presa (respuesta funcional). Se evaluó su eficacia en el control por medio de liberaciones controladas en laboratorio e invernáculos experimentales. Además, se analizó la compatibilidad de su empleo con estrategias de control químico aceptadas en manejo convencional (insecticidas) y orgánico (extractos vegetales) de plagas. Estos estudios resultan fundamentales para la implementación de una estrategia de manejo integrado de T. absoluta en cultivos de tomate en ambientes protegidos, que incluyan el empleo de liberaciones inoculativas de Ps. dignus en un contexto productivo.

Abstract:
The tomato moth (Tuta absoluta) is considered a key pest of tomato crops produced under cover near Buenos Aires due to the damage it causes, in leaves, shoots and fruits, and require permanent control measures. Both the short life cycle that occurs in protected crops and the high number of required control measures have led to problems of insecticide resistance. One alternative to chemical control is biological control. By 1995 it was detected naturally occurring larval parasitoid T. absoluta, Pseudapanteles dignus (Hymenoptera, Braconidae). The aim of this thesis was to evaluate the effectiveness of Ps. dignus as augmentative biological control agent of Tuta absoluta and to assess their compatibility with the chemical control strategy of the pest. This was determined by evaluating potential biological attributes in laboratory conditions (survival and fecundity) and compared with those of the pest. Estimated its attack rate relative to the density of prey (functional response). Evaluated its efficacy in control through releases controlled in laboratory and experimental greenhouses. Further analyzed the compatibility of use with chemical control strategies accepted in conventional (insecticides) and organic (plant extracts) pest management. These studies are essential for the implementation of an integrated pest management strategy of T. absoluta in tomato crop under protected environment, with the use of Ps dignus inoculative releases in a productive context.

Folguera Telichevsky, Alicia. "La reactivación neógena de la Pampa Central" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Esta contribución examina el registro neógeno del área central de Argentina, con especial énfasis en la provincia de La Pampa, y propone un modelo preliminar de evolución en relación a la tectónica andina. Los sedimentos, caracterizados por su procedencia andina (volcaniclásticos) y su vasta extensión, han sido interpretados como depósitos sinorogénicos distales acumulados entre 12 y 4? Ma. Mediante el análisis de la extensión de los depósitos se determina que las cuencas miocena tardía y pliocena no están superpuestas. Basados en los análisis de la geometría de estas cuencas, se las interpreta como de antepaís andino, y se las considera afectadas por subsidencia dinámica. El sector central de la provincia de La Pampa, definido aquí como un bloque (bloque de la Pampa Central) se considera levantado y basculado hacia el este, con pocos metros de rechazo, vinculado a la subducción subhorizontal definida para el Mioceno tardía en estas latitudes. El levantamiento también habría causado el fin del espacio de acomodación al norte de los 38ºS y la restricción del depocentro durante el Plioceno. Se propone como mecanismos de esta deformación a la dinámica andina, así como a las fuerzas vinculadas a la dorsal oceánica (ridge-push) vinculadas con la dorsal centro-oceánica.

Abstract:
This contribution examines the Neogene record of central Argentina with the focus on La Pampa province and offers a preliminary model of evolution in relation to the Andes tectonic. The sediments, characterized by their Andean derived composition (volcaniclastic) and vast extension, are interpreted as distal synorogenic deposits accumulated between 12 Ma and 4? Ma. Based on the geometry analysis of the Late Miocene basin, it is inferred that sedimentation took place in an Andean foreland back bulge affected by dynamic subsidence. The central part of La Pampa Province, here defined as a block (La Pampa Central Block) is considered to have been uplifted and tilted to the east with a few meters throw in response to the flat geometry subduction that occurred at this latitude in the Late Miocene. The uplift may have also caused the end of the accommodation space north of 38°S and caused the southward migration of the sediment depocenter during the Pliocene. Andean dynamics and ridge-push forces related to mid ocean ridge are proposed as deformation mechanisms.

Fongi, Guillermina. "Estructura métrica y diferencial del conjunto de operadores autoadjuntos en un espacio de Hilbert" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo estudiamos aspectos métricos y geométricos del conjunto de operadores autoadjuntos en un espacio de Hilbert H. Extendemos la relación de equivalencia definida por A. C. Thompson en un cono convexo de un espacio de Banach, al conjunto de operadores autoadjuntos. Definimos una métrica completa en cada clase de equivalencia o componente de Thompson, que resulta compatible con la estructura diferencial de la componente. Estudiamos además la órbita de congruencia de un operador autoadjunto a. Describimos la órbita de a en términos de su descomposición polar y de su descomposición positiva ortogonal. Si a es de rango cerrado, dotamos a la órbita de a de una estructura de variedad diferencial. Finalmente, estudiamos descomposiciones de operadores autoadjuntos como diferencia de dos operadores positivos de manera que el ángulo mínimo entre sus rangos sea positivo, que llamamos descomposiciones positivas. Mostramos que las descomposiciones positivas de un operador autoadjunto a están relacionadas con las descomposiciones canónicas del espacio (H, menor , mayor a), donde menor , mayor a es una métrica indefinida asociada al operador a. Como aplicación, caracterizamos la órbita de congruencia de a en términos de sus descomposiciones positivas.

Abstract:
In this thesis, we study metrical and geometrical aspects of the set of selfadjoint operators on a Hilbert space H. We extend the equivalence relation, defined by A.C. Thompson on a closed convex cone of a Banach space, to the set of selfadjoint operators. We define a complete metric on each equivalence class or Thompson component, compatible with the differential structure of the component. We also study the orbit of congruence of a selfajoint operator a. We describe the orbit of a in terms of its polar decomposition and its positive ortogonal decomposition. If a is a closed range operator, we provide the orbit of a with a structure of differential manifold. Finally, we study decompositions of selfadjoint operators as a difference of two positive operators such that the minimal angle of their ranges is positive, called positive decompositions. We show that the positive decompositions of a selfadjoint operator a are related to the canonical decompositions of the space (H, menor , mayor a), where menor , mayor a is an indefinite metric associated to a. As an application, we characterize the orbit of congruence of a in terms of its positive decompositions.

Fontan, Andrea Adriana. "Actividad esterásica de tegumento y penetración de insecticidas fosforados en Triatoma infestans" (1985). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Dado que los insecticidas constituyen un grupo de sustancias químicas sin las cuales la sociedad no podría subsistir, una estrategia obvia para el control de insectos es acelerar la búsqueda de compuestos químicos biodegradables y selectivos que mataran al insecto, pero que no presentaran efectos nocivos para otros organismos o el medio ambiente (62). Sin duda, un análisis racional del sistema acelera la obtención de nuevos y mejores métodos de control. En este sentido los conocimientos básicos sobre la fisiología y la bioquímica del insecto, así como los mecanismos que regulan la interacción del tóxico con el insecto permiten dirigir la estrategia de control. En particular, es sabido que el tegumento es la estructura más distintiva de los Artrópodos (63). Es también la primera barrera que se interpone en la penetración del insecticida. Es de suma importancia entonces, conocer el inicio de la toxicocinética del insecticida, condicionado en gran parte por el tegumento. El objetivo general de este trabajo ha sido analizar la primera interacción entre insecticidas organofosforados y el Triatoma infestans, principal vector de la Enfermedadde Chagas en nuestro país, analizando el mecanismo de penetración y la capacidad del tegumento en la degradación de estos compuestos. En consecuencia se estudió la actividad esterásica presente en el tegumento de T. infestans adulto, su localización, su dependencia de edad y estado nutricional del insecto, además de la caracterización electroforética y mediante inhibidores específicos. Se determinó también el rol de estas enzimas en la degradación de compuestos organofosforados. En relación con el mecanismo de penetración se analizó la existencia de sitios preferenciales de penetración y su correlación con particularidades de la estructura tegumental. Asimismo se consideró el efecto que "carriers" de alto PM ejercen sobre la cinética y el modo de ingreso de estos compuestos. Estos estudios, además del conocimiento básico que aportan, podrían ser utilizados en el futuro para el mejoramiento de las formulaciones de insecticidas utilizados en la lucha contra el vector del Mal de Chagas, a través de cambios cuali-cuantitativos que favorecieran la penetración al insecto y disminuyeran la degradación a nivel del tegumento.

Fontana, Marcelo Raúl. "Cinética de cristalización de aleaciones amorfas base Te y base Mg" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo, se estudió la cinética de cristalización de aleaciones amorfas binarias Ga-X (X = Te, Mg) y temarias Ga-X-Y (Y = Sn, Fe) en la zona de composiciones rica en X. Los materiales fueron caracterizados por difracción de rayos X, espectroscopía Mössbauer y calorimetría diferencial de barrido (DSC). Los sistemas binarios Ga-X presentan un pequeño rango de amortización centrado en 20 % atómico de Ga. Al agregar un tercer elemento Y (hasta un 10 % atómico) a los sistemas binarios se observan comportamientos disímiles en los rangos de amorfización temarios. Estos pueden ser explicados por la existencia de asociaciones Fuertes en el liquido que son retenidas en el enfriado rapido. Teniendo en cuenta las caracteristicas detectadas en la cinética de cristalización, los amorfos pueden dividirse en dos grupos: los de composición binaría (cercana a Ga20X80) y los de composición ternaria. Los amorfos ternarios son más estables y los productos de cristalización son diferentes a los de composición binaria. Se realizó un estudio detallado de la cinética de cristalización de la aleación amorfa de composición Ga20Te80. Se detectaron la existencia de tiempos de inducción y de mecanismos de cristalización compleja. La cristalización de los amorfos temarios base Te puede ser modelada suponiendo sólo modificaciones en la viscosidad con respecto al amorfo de composición Gaonego. En este trabajo se proponen elaboraciones originales que pueden ser aplicadas en general: se separa la señal correspondiente a una cristalización de una de cambio de capacidad calorifica en un barrido de DSC, se diseño un algoritmo que permite la construcción empírica de diagramas de transformación, se cuantifican los errores experimentales en calorimetría, se propone un modelo de cristalización compleja que explica la cinética de una cristalización primaria, se construyen los diagramas de transformación a partir de un modelo de cristalización.

Abstract:
In this work, the crystallization kinetic of binary Ga-X (X = Te, Mg) and ternary Ga-X-Y (Y = Sn, Fe) amorphous alloys has been studied. The materials have been characterized by x-ray diffraction, Mössbauer spectroscopy and differential scanning calorimetric (DSC). The binary systems Ga-X have a small glass forming range centered in 20 % atomic of Ga. When a third element Y (up to 10 % atomic) is added to the binary systems, dissimilar behaviors in the ternary glass forming range have been observed. These can be explained by the existence of strong associations in the liquid which are retained in the rapid quenched. Taking into account the determinate characteristics in the crystallization kinetics, the amorphous alloy can be classified in two groups: those of binary composition (near to Ga20X80) and those of ternary composition. Ternary amorphous alloys are more stable and the crystallization products are different. The crystallization kinetics of the amorphous alloy of composition Ga20Te80 have been studied widely. The existence of induction times and mechanisms of complex crystallization have been detected. The crystallization of Te-based ternary amorphous alloys can be modeled considering just viscosity modifications related to the amorphous alloy of composition Ga20Te80. In this work, original elaborations are formulated: a new procedure is developed to perform the kinetic analysis of continuous heating calorimetric data when the heat capacity of the sample changes during the crystallization, an empirical construction of transformation is presented, the uncertainties inherent to experimental differential scanning calorimetric data are evaluated, a model of complex crystallization which explains the kinetics of a primary crystallization is formulated, the diagrams of transformation for a model of crystallization are constructed.

Fontanet, Paula A.. "Los factores de transcripción Etv4 y Etv5 como mediadores de la respuesta neurotrófica y el desarrollo" (2015-03-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El preciso desarrollo de las conexiones neuronales es esencial para el correcto funcionamiento del sistema nervioso, y la falta de precisión en este proceso está asociada al desarrollo de diferentes patologías. La formación de los circuitos neuronales depende de la interacción de factores celulares intrínsecos y extrínsecos, que regulan la transmisión de la información en el sistema nervioso. Entre estos, los factores neurotróficos (FN) cumplen roles esenciales en el mantenimiento y sobrevida, crecimiento dendrítico y axonal, sinaptogénesis y plasticidad sináptica de distintas poblaciones neuronales del sistema nervioso central y periférico. Para ello estos factores inducen la expresión de programas transcripcionales específicos implicados en el desarrollo neuronal. Durante los últimos años, las evidencias indican que diversos aspectos del desarrollo neuronal están dirigidos por la expresión de combinaciones específicas de factores transcripcionales. Es por ello que uno de los desafíos de la neurobiología del desarrollo es entender como múltiples señales son integradas por las neuronas en programas transcripcionales que generan patrones específicos de conectividad. El objetivo general de este proyecto es identificar nuevos elementos de los programas transcripcionales y vías de señalización disparadas por los factores neurotróficos, para controlar la conectividad de distintas poblaciones neuronales del sistema nervioso central y periférico. Con el objeto de identificar genes involucrados en la diferenciación neuronal hemos realizado ensayos de expresión génica diferencial en un modelo celular análogo a neuroblastos en proliferación, que en presencia del factor de crecimiento nervioso (NGF, nerve growth factor) detienen su división celular y adquieren un fenotipo neuronal. Este ensayo permitió identificar dos genes que codifican para dos factores de transcripción denominados: Etv4 (también conocido como E1AF o Pea3) y Etv5 (también conocido como Erm) que son inducidos por NGF. En la primera sección de este trabajo demostramos que estos dos miembros de la familia Pea3 son expresados en neuronas sensoriales que responden a NGF durante el período de inervación cutánea y son inducidos local y distalmente por esta neurotrofina. Ensayos de pérdida y ganancia de función para Etv4 o Etv5, indicaron que estos factores son esenciales en el crecimiento neurítico de las neuronas sensoriales inducidas por NGF sugiriendo que estos factores cumplen un rol fisiológico durante el período de inervación periférica inducida por esta neurotrofina. En este trabajo también mostramos que Etv4 y Etv5 son expresados en neuronas hipocampales de las áreas CA1, CA3 y el giro dentado. Describimos que estos factores son inducidos en neuronas hipocampales cultivadas en respuesta al factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF, brain derived neurotrofic factor) y utilizando ensayos de inmunoprecipitación in vivo, mostramos que Etv4 y Etv5 interactúan en el hipocampo. Análisis in vitro de pérdida y ganancia de función indicaron que estos factores median los efectos de crecimiento y ramificación del árbol dendrítico disparados por la neurotrofina BDNF en neuronas hipocampales. El estudio de animales deficientes para Etv4 y Etv5 evidenció un importante rol de estos factores transcripcionales en el desarrollo de la conectividad neuronal hipocampal. En resúmen, nuestros resultados demuestran que Etv4 y Etv5 son moleculas esenciales del programa transcripcional disparado por neurotrofinas que llevan al correcto establecimiento de las conexiones neuronales.

Abstract:
Construction of the neural networks depends largely on the precision with which neuronal circuits are established during development. The accuracy of this process is fundamental for normal nervous system function and its aberrant connectivity leads to nervous system disorders. The accuracy of this process depends on the combined actions of extrinsic and intrinsic factors. Between them, neurotrophic factors play key roles in the maintenance and survival of different neuronal populations, dendritic and axonal sprouting, synaptogenesis and synaptic plasticity in the peripheral and central nervous system. To this end, the soluble factors induce the expression of specific transcriptional programs involved in neuronal development. In recent years, the evidence indicates that several aspects of neural development are driven by the expression of specific combinations of transcription factors. Identifying the transcriptional programs and signalling pathways triggered by extracellular cues that control neuronal circuit formation will be of great importance in order to be able to decipher and understand the functioning of mature nervous system. Our general aim focus on the identification of transcriptional programs and signaling pathways triggered by extracellular cues, such as neurotrophic factors, to control the connectivity between specific populations of central and peripheral neurons. In order to identify genes involved in neuronal differentiation and proliferation of neuronal precursors we performed differential gene expression assays in a cellular model analogous to proliferating neuroblasts which in the presence of nerve growth factor (NGF) stops cell division and acquire a neuronal phenotype. This assay allowed us to identify, among others, genes encoding two transcription factors named Etv4 (also known as E1AF, E1A enhancer binding protein) and Etv5 (also known as Erm, ETS related molecule). In this thesis we studied the role of Etv4 and Etv5 in the development of different neuronal type, in central or peripheral nervous system. In the first part of this work we demonstrate that this two members of the Pea3 family are expressed in sensory neurons positive for the NGF receptor, TrkA, during the period of cutaneous innervation and are induced by this neurotrophin. Lost and gain of function assays for Etv4 and Etv5 indicated that these factors are essential for the neurite growth of sensory neurons induced by NGF, suggesting that these factors play a physiological role during the period of peripheral innervation induced by this neurotrophin. In this work we also present data that demonstrate that Etv4 and Etv5 are expressed by CA1, CA3 hippocampal neurons and cells from the dentate gyrus. We describe that these transcriptional factors are induced in hippocampal neuron cultures in response to brain derived neurotrophc factor (BDNF) and immunoprecipitation assays from hippocampus showed that Etv4 and Etv5 interacts in vivo. Moreover, in vitro, lost and gain of function assays indicated that these factors mediate dendrite branching and outgrowth triggered by the BDNF in hippocampal neurons. Animals deficient in Etv4 evidenced a crucial role of it in the development of hippocampal connectivity. In summary, our results demonstrate that Etv4 and Etv5 are essential molecules of the transcriptional program triggered by neurotrophins that leads to the correct establishment of the neuronal connections.

Fontenla, Juan Manuel. "Transporte en atmósferas estelares" (1985). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fontán, Patricia Alejandra. "Mecanismo del daño pulmonar inducido durante las infecciones por P. aeruginosa" (1992). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Durante una infección por P. aeruginosa, la migración de las células fagociticas desde la circulación hacia el pulmónes necesaria para la inactivación de la bacteria. Una respuesta inflamatoria incrementada o acelerada puede, sin embargo, perjudicar al huésped y puede dejar serias secuelas en aquellos pacientes que se reacuperan de una neumonía por P. aeruginosa. Los productos de origen bacteriano con actividad quimiotáctica y quimiotaxigénica ha sido extensamente estudiados debido a su importancia como inductores de inflamación. A pesar que la acumulación de LPMN parece ser una de las mayores causas de la inducción de patogénesis durante la inflamación aguda, poco es lo que se conoce a cerca del efecto de los péptidos quimiotácticos bacterianos sobre los eventos fisiopatológicos que ocurren durante una infección por E. aeruginosa. En estudios previos de nuestro equipo se demostró que B. aeruginosa y g. aureus liberan quimiotactinas en cultivo, con capacidad de atraer LPMN. En este trabajo se ha demostrado que B. aeruginosa libera en cultivo una mezcla de sustancias quimiotacticas para LPMN, con características peptidicas de bajo peso molecular; la contribución de estas sustancias a la actividad quimiotáctica del SBCP es predominante. Las quimiotactinas activan a los LPMN para producir especies reactivas del oxigeno. La respuesta funcional de los LPMN in vitro, frente a las quimiotactinas bacterianas fue parcialmente incrementada por la preincubación de las células con IL-l. La actividad quimiotáctica y la liberación de especies reactivas del oxígeno por los LPMN activados con las quimiotactinas bacterianas in vitro, fueron parcialmente inhibidas por una DAINE. Los estudios in vivo permitieron demostrar que 1a migración de los LPMN, puede ser inducida por un aerosol de P. aeruginosa, por los quimiotácticos bacterianas o un quimiotáctico sintético. La quimiotaxis de los LPMN, en el modelo murino, fue inhibida por el tratamiento con piroxicam. La mortalidad de los ratones, en el modelo de neumonía inducido por P. aeruginosa fue disminuida, tanto por el tratamiento con piroxicam previo como por el tratamiento posterior al desafío por aerosol. Los resultados obtenidos en los experimentos in vivo e in vitro permitieron conocer parte de los mecanismos del daño de tejido pulmonar inducido por LPMN durante la infección por P. aeruginosa. También se demostró la posibilidad de regular el proceso inflamatorio inducido por P. aeruginosa, mediante el tratamiento con DAINE. Estos hallazgos permiten considerar la aplicación clinica futura de estas drogas para controlar el daño de tejido pulmonar inducido durante la neumonía por P. aeruginosa.

Forastiero, Ricardo Raúl. "Autoanticuerpos anti-beta2 glicoproteína I y anti-protrombina humana. Su rol en la fisiopatología del síndrome antifosfolípido" (1997). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El síndrome antifosfolípido (SAF) se caracteriza por la asociación de trombosis venosa o arterial, pérdidas fetales recurrentes y/o trombocitopenia con la presencia de anticuerpos antifosfolípidos (aFL). La especificidad de estos anticuerpos por los fosfolípidos (FL) ha sido cuestionada en los últimos años y algunos datos experimentales indican la necesidad de ciertos cofactores protéicos para que ocurra la interacción entre los FL y los anticuerpos. La β2 glicoproteína I (β2GPI) y la protrombina (II) humana son las principales proteínas reconocidas como cofactores. Principales objetivos - desarrollar enzimoinmunoensayos (ELISA) para evaluar la presencia de anticuerpos anti-β2-GPI y anti-II en pacientes con aFL - estudiar si las inmunoglobulinas G (IgG) purificadas de pacientes con SAF poseen distinta especificidad antigénica que aquellas obtenidas de pacientes con sífilis. - evaluar la especificidad antigénica de los aFL en relación a las complicaciones clínicas del SAF - analizar la interferencia de los aFL sobre el sistema de la proteina C (PrC) y la biosíntesis de eicosanoidcs de origen plaquetario, como probables mecanismos fisiopatogénicos del SAF Resultados Se optimizaron las condiciones para la detección por ELISA de anticuerpos dirigidos contra β2GPI y II en ausencia de FL. La principal variable de los ensayos fue el tipo de superficie utilizada que junto con los datos de los experimentos de inhibición indicaron que los anticuerpos sólo reconocen a las proteínas cuando se presentan en una determinada conformación estmctural. Los anti-β2GPI y anti-II se detectaron con una frecuencia mucho mayor en los pacientes con enfermedades autoinmunes asociadas a los aFL (SAF y lupus eritematoso sistémico) que en pacientes con aFL sin complicaciones clínicas del SAF. Los estudios con IgG purificadas demostraron que los aFL asociados con sífilis reconocen epitopes en los FL y la mayoría de las IgGs obtenidas de pacientes con SAF reaccionan específicamente con la β2GPI y/o II. En el estudio retrospectivo de 233 pacientes con aFL se encontró que los anti-β2GPI-IgG y los anti-β2GPI-IgM a títulos moderados o fuertes eran factores de riesgo independientes para trombosis venosa y complicaciones obstétricas, respectivamente. Además, los anti-β2GPI se asociaron con el fenómeno adquirido de resistencia a la PrC activada y con la alteración en la biosíntesis de tromboxano plaquetario, reflejada en una mayor excreción urinaria del metabolito 11-dehidro-tromboxano B2. En conclusión la utilización de ensayos que nos permitan conocer la especificidad antigénica de los aFL podría ser de gran utilidad diagnóstica y permitir una mejor evaluación de los mecanismos patogénicos del SAF.

Abstract:
The antiphospholipid syndrome (APS) is characterized by the association of venous or arterial thrombosis, recurrent fetal loss and/or thrombocytopenia with the presence of antiphospholipid antibodies (aPL). In the last few years it has been questioned the specificity of these antibodies towards phospholipids (PL). Several studies have emphasized the involvement of some protein cofactors in the interaction between PL and aPL. β2 glycoprotein I (β2GPI) and human prothrombin (II) are the best characterized protein cofactors. Main objectives - to standardize enzyme-linked immunoassays (ELISA) in order to evaluate the presence of anti-β2GPI and anti-II in patients with aPL - to study if the purified immunoglobulins G (IgG) from APS patients differ in the antigenic specificity of those obtained from syphilis patients - to evaluate the relationship between the antigenic specificity and the clinical complications of the APS - to analize the interference of the aPL on the protein C system and the platelet biosynthesis of eicosanoids Results We have standardized the ELISA for the detection of anti-β2GPI and anti-II antibodies in the absence of PL. The experimental evidences on the requirement of a special surface in solid-phase assays and the results of the inhibition studies indicated that these antibodies do not recognize proteins unless they have underwent a conformational change. Patients with aPL from the autoimmune group (APS and systemic lupus erythematosus) had a higher prevalence of anti-β2GPI and anti-II antibodies than those from the group without APS-related clinical complications or with infectious diseases. Using purified IgG fractions, we found that aPL from syphilis react with epitopes exposed on PL but those from APS patients bind mainly to β2GPI and II. In the retrospective analysis performed in 233 patients with aPL, we found that only anti-β2GPI of IgG and anti-β2GPI of IgM isotype are independent risk factors for venous thrombosis and obstetric complications, respectively. It was found specially when taking into account antibodies at moderate or high titres. Anti-β2GPI antibodies were closely related to the acquired phenomenom of activated protein C resistance and to the interference on the platelet biosynthesis of eicosanoids, mainly reflected by a significant increase in the urinary excretion of 11-dehydro-thromboxane B2. In conclusion, the introduction of new assays in order to clarify the the antigens of the aPL could be an important tool in the diagnosis and the evaluation of the pathogenic mechanisms of the APS.

Forcato, Cecilia. "Estudio de la fase de reconsolidación de la memoria declarativa en humanos" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La hipótesis de la reconsolidación postula que una memoria consolidada puede devenir nuevamente lábil y susceptible a la acción de agentes amnésicos o facilitadores, por un período de tiempo, luego de la reexposición a un recordatorio. Este fenómeno ha sido demostrado en una gran variedad de especies y en diferentes tipos de memoria, incluyendo memorias motoras en el hombre. En este trabajo diseñamos y pusimos a punto un protocolo que involucra el aprendizaje de una lista de sílabas sin sentido, asociada a un contexto específico formado por una luz, imagen y música. Por primera vez, demostramos la existencia de la fase de reconsolidación de la memoria declarativa en el hombre. A su vez, demostramos que no cualquier evocación dispara este fenómeno, por el contrario, se requiere un recordatorio con características específicas, siendo el no cumplimiento de la expectativa un componente fundamental del mismo. Más aún, este trabajo evidencia las dos funcionalidades postuladas para el fenómeno de reconsolidación: el reforzamiento de la memoria original y la incorporación de nueva información en la memoria reactivada.

Abstract:
The reconsolidation hypothesis states that a consolidated memory could again become unstable and susceptible to facilitation or impairment for a discrete period of time after a reminder presentation. The phenomenon has been demonstrated in very diverse species and types of memory, including the human procedural memory of a motor skill task. Here we design a new paradigm that involves learning a list of non-sense syllable pairs, associated to a specific context (light, image and sound). We demonstrate for the first time, the human declarative memory reconsolidation. Moreover, we demonstrate that the reconsolidation process does not always occur when a memory is retrieved. On the contrary, it requires a reminder with a specific structure, and it seems that the mismatch between what the subject expects and what actually happens to be crucial. Furthermore, we provide evidence to the potential functionality of this fenomenon: the strengthening of the original trace and the incorporation of new information into the reactivated memory (memory updating).

Forchieri, Horacio Alberto. "Influencia de la variedad y del avance de la época de siembra sobre la composición de semilla de lino oleaginoso y sobre rendimiento : Características físico-químicas y composiciones acídicas de los aceites de extracción" (1970). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Forlenza, María Belén. "Eventos tempranos del ciclo de replicación del virus Junín: interacción del virus con lectinas del tipo C" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El virus Junín (JUNV) es el agente etiológico de la fiebre hemorrágica argentina (FHA), una enfermedad zoonótica que afecta el área central de la Pampa húmeda de la República Argentina. Distintos mecanismos de endocitosis son utilizados en las infecciones virales. En la línea celular Vero, el complejo glicoproteico presente en los viriones es el responsable de las interacciones iniciales con el receptor celular de transferrina 1 (TfR1) y la entrada a la célula es por endocitosis mediada por vesículas recubiertas de clatrina. En varias familias de virus envueltos, su entrada y diseminación pueden estar mediadas por lectinas de tipo C. Las mismas son proteínas transmembrana tipo 2, constituyen una amplia familia de receptores que reconocen estructuras específicas de carbohidratos presentes en patógenos y se encuentra presente principalmente en células dendríticas inmaduras, macrófagos y células endoteliales. Una de ellas, DC-SIGN posee un rol importante en los estadios iniciales de la respuesta inmune, reconoce estructuras internas ramificadas de manosas y posee funciones de receptor para varios virus. DC-SIGN se compone por un dominio extracelular de reconocimiento a carbohidratos (DRC) que une residuos con carbohidratos de alta manosa y una cola citoplasmática con motivos conservados de dileucinas (LL) y un cluster triacídico (EEE). Debido a que JUNV presenta proteínas altamente glicosiladas, y que en los estadíos de la infección temprana interactuaría con células dendríticas y otras del sistema inmune, en este trabajo se estudió la interacción de JUNV con DC-SIGN y el mecanismo endocítico asociado a la misma. Los resultados demuestran que DC-SIGN actúa como un auténtico receptor para JUNV en las células que la expresan y que la entrada a las mismas es a través de endocitosis utilizando vesículas recubiertas de clatrina con dependencia de colesterol y filamentos de actina corticales intactos.

Abstract:
Junin Virus (JUNV) is a member of the Arenaviridae family and the etiologic agent of Argentine Hemorrhagic fever (AHF), a zoonotic illness affecting the farming land of Argentina. Several endocytic pathways are used during viral infections. In Vero cell line, the glycoprotein complex present in virions is responsible of interaction with Transferrin receptor type I (TfR1) and internalization is clathrin mediated. Entry and dissemination of several envelope viruses are mediated by C-type lectins. These are transmembrane proteins that are expressed in immature dendritic, macrophages and endothelial cells, integrating a family of receptors which recognize specific carbohydrates present in pathogens. One of them, Dendritic Cell-Specific ICAM-3 Grabbing Nonintegrin (DC-SIGN) has an important role during the initial stages of the immune response, recognizes high mannose residues and is considered as a receptor for several viruses. DC-SIGN is composed by an extracellular carbohydrate recognition domain (CRD) and a cytoplasmic tail containing conserved motives as dileucine (LL) and triacidic cluster (EEE). As JUNV presents highly glycosylated proteins and that during initial steps of the infection, JUNV would interact with dendritic cells and others belonging to the immune system, in this work we studied the interaction between JUNV and DC-SIGN and the entry pathway associated with this. Taken together our results demonstrate that DC-SIGN is a real receptor for JUNV and that the main entry pathway involved is clathrin mediated endocytosis and it depends on cholesterol and intact cortical actin filaments.

Forlerer de Svarch, Elena. "Efecto de las impurezas en la autodifusión de Zr y en la aleación Zr-50 por ciento át. Ti" (1994). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los valores de los coeficientes de autodifusión medidos en las dos fases del Zr (HCP a bajas y BCC a altas temperaturas), no siguen una ley de Arrhenius con la temperatura como la mayoria de los metales compactos. En este último caso, hay acuerdo general en que los átomos migran por un mecanismo de intercambio con monovacancias en equilibrio térmico. Las "anomalías" se han explicado cualitativamente mediante mecanismos que modifican distintas propiedades de la vacancia: -En HCP Zr, se propusieron distintos mecanismos: a) Asociación de la vacancia con impurezas rápidas como el Fe (HOOD88). b) Un súper-salto de la vacancia, de magnitud inversa a la concentración de la impureza (FRAN91). -En BCC Zr se propuso, una disminución de la entalpia de migración de la vacancia: a’) Por la formación del embrión de la fase metaestable ω debida a un ablandamiento del modo LA 2/3(111) (SANC78). b’) Por el acoplamiento del modo pre-ω (que no varia con T), con el modo transverso pre-α TA 1/2(110) variable con la temperatura (HERZ93). En este trabajo se analizan críticamente los cuatro modelos y también las medidas de autodifusión, en lo que respecta al contenido de impurezas residuales en las muestras utilizadas. En Zr-HCP, se descarta el modelo de Frank ya que la magnitud del súper-salto es controlada por la energia de unión impureza vacancia. Se adopta el modelo de Miller, que propone un efecto acelerador por la formación del par impureza intersticial(Fe) - vacancia(Zr). La concentración del par, sigue el límite de solubilidad del Fe en α-Zr a cada temperatura y se obtiene buen acuerdo con los resultados experimentales hasta 1003K. Por arriba de esta temperatura proponemosla presencia de fase BCC lo que permite explicar resultados en policristales en función de la fracción de fase BCC en borde de grano (FORL91). En Zr BCC,se analizan críticamente los modelos señalando que: -Ademásde la entalpia de migración, debe ser tenida en cuenta la energia libre de formación de la vacancia. -El cálculo del incremento de los desplazamientos atómicos en función de la disminución de la fecuencia con una aproximación anarmónica realizado por (HERZ93) no alcanza el desplazamiento crítico necesario. -Los picos centrales de dispersión quasielástica de neutrones pueden ser interpretados comoun efecto multifonónico (HERZ93) ó bien como un efecto de impurezas. Se sugiere entonces que también en la fase BCC,podria explicarse la difusión anómala debido a la asociación impureza-vacancia, ya que basta una energia de unión Fe-vacancia de 0.12 eV, para que la disociación del par por efecto térmico disminuya la población de defectos en 1/e a 1100C, bien entrada la fase BCC. De las medidas de difusión en la aleación Zr-50% át.Ti y la misma aleación con alto contenido de Oxigeno y Nitrógeno, se obtiene un efecto de frenado en la autodifusión de Zr. Esto indica que, una mayor concentración de embriones de la fase ω no aumenta la difusión de Zr en la fase BCC,contrariamente a lo predicho por el modelo de Sanchez y De Fontaine.

Forte Giacobone, Ana Florencia. "Estudios de corrosión microbiológica en una instalación nuclear" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de este trabajo ha sido analizar las poblaciones bacterianas y los mecanismos de corrosión microbiológica en un depósito de almacenamiento interino en húmedo de elementos combustibles gastados provenientes del reactor de investigación y producción de radioisótopos, también llamado repositorio. Se realizaron análisis de la población bacteriana cultivable presente en el repositorio, identificándose 18 microorganismos diferentes, con presencia mayoritaria de Bacillus cereus, seguido del género Pseudomonas. Se investigó el efecto de una de las cepas aisladas de B. cereus, B. cereus RE10 tanto en la aleación de aluminio 6061 empleada en la fabricación de elementos combustibles como en aluminio de alta pureza (Al 99,999%). Los experimentos fueron llevados a cabo en un medio altamente diluido, con la finalidad de reproducir las condiciones ambientales presentes en el repositorio. Se observó la presencia de picaduras no cristalográficas en forma de túnel en las muestras de AA6061 expuestas a B. cereus RE10 pero no así en Al 99,999%. Dichas picaduras se encontraron cubiertas de depósitos blancos, de tipo globular, compuestos por una mezcla de biofilm y óxido de aluminio. Se determinó la existencia de una correlación entre las zonas atacadas y la presencia de inclusiones de tipo Al-Fe-Si. Se postuló que dicha correlación podría estar relacionada con el pH generado en torno a las inclusiones, el cual favorecería el desarrollo del biofilm, contribuyendo a generar un fenómeno de corrosión bajo depósito. Uno de los mayores problemas en el estudio de los biofilms, en particular en presencia de óxidos, es la dificultad de seguir su desarrollo por técnicas no invasivas, ya que habitualmente se emplean métodos basados en tratamientos tales como desecación, tinción con colorantes, etc. El uso de microorganismos genéticamente modificados capaces de producir la proteína verde fluorescente (GFP) propuesto en este trabajo, ha permitido superar este obstáculo ya que hace posible el seguimiento de los biofilms sin ningún tipo de tratamiento, mediante microscopía de epifluorescencia. Por este motivo se decidió evaluar en forma comparativa la capacidad de formación de biofilms en diferentes condiciones y el efecto sobre AA6061 en medio diluido de la cepa Pseudomonas aeruginosa PAO1, de su derivada PAO1-GFP y de dos cepas de Pseudomonas aisladas del repositorio. El empleo de la cepa PAO1-GFP como modelo en estudios de corrosión microbiológica permitiría el estudio del fenómeno en forma rápida, fácil y de bajo costo. Los resultados muestran que, en todos los casos se observó formación de depósitos y ataque debajo de los mismos, con una morfología similar a la encontrada para el caso de B. cereus RE10. No se encontraron diferencias significativas entre las cepas analizadas, lo que permitiría el uso de PAO1-GFP en futuros estudios de biocorrosion. Este trabajo muestra una primera aproximación al estudio de la corrosión inducida microbiológicamente en repositorios nucleares en Argentina. Los resultados obtenidos permiten destacar la importancia de dicho fenómeno, aún en medios con una baja concentración de nutrientes, así como también enfatizar las ventajas del empleo de microorganismos portadores de genes reporteros en estudios de corrosión microbiológica. Como conclusión general puede decirse que la profundización de estudios de los mecanismos de corrosión inducida microbiológicamente podría contribuir a la prevención y control del proceso de corrosión ya que es o puede llegar a ser un fenómeno de importancia en lo referente a la vida útil, costo operativo y seguridad de este tipo de instalaciones nucleares.

Abstract:
The aim of this Thesis was to analyze the bacterial population and the mechanisms of microbial corrosion in a spent nuclear fuel pool storage system from a research reactor. Analyses of the cultivable bacterial population present in the pool were performed and 18 different microorganisms were identified, with a preponderance of Bacillus cereus, followed by the genus Pseudomonas. The effect of one of the isolates of B. cereus, B. cereus RE10 was investigated both in the aluminum alloy 6061 (used for the manufacture of fuel elements) and in high purity aluminum (Al 99.999%). To simulate the environmental conditions, the experiments were performed using a highly diluted medium. After the exposure to B. cereus RE10 non crystallographic, tunnel-like pitting was found on AA6061 samples but not on Al 99.999%. These pits were covered with white, lumpy, globular deposits, comprised of a mixture of biofilm and aluminum oxide. We found a correlation between the areas under attack and the presence of inclusions such as Al-Fe-Si. It was postulated that this correlation could be the result of the pH generated around these kinds of inclusions, which could favor the development and survival of the biofilm, contributing to underdeposit corrosion. One of the main problems in the study of biofilms, particularly in the presence of oxides, is the difficulty of following their development by noninvasive techniques, since most commonly used methods are based on treatments such as drying, staining with dyes, etc. The use of genetically modified microorganisms capable of producing green fluorescent protein (GFP) proposed in this Thesis, has overcome this obstacle as it allows for monitoring of biofilms without any treatment by epifluorescence microscopy. For this reason we decided to evaluate and compare the ability to form biofilms under different conditions and the effect on AA6061 in a diluted medium of the strain Pseudomonas aeruginosa PAO1, its derivative PAO1-GFP and two strains of Pseudomonas isolated from the storage system. The use of the strain PAO1-GFP as a model for microbiologically induced corrosion experiments allows the study of the phenomenon in a fast, easy and low cost way. The results show that all tested Pseudomonas strains developed biofilms and initiated under deposit corrosion on AA6061 in a diluted medium, independently of the origin of the strain. The morphology of the attack was similar between the samples exposed to the different Pseudomonas strains and the samples exposed to B. cereus RE10. This work shows a first approach to the study of microbiologically induced corrosion in nuclear storage facilities in Argentina. The results obtained allow us to highlight the importance of this phenomenon, even in media with a low concentration of nutrients, as well as emphasize the advantages of using microorganisms carrying reporter genes in studies of microbiologically induced corrosion. As a general conclusion, it is possible to say that the studying of microbiologically induced corrosion mechanisms could contribute to the prevention and control of a process that is or may become a phenomenon of importance in relation to the life, operating cost and safety of nuclear installations.

Forte, Mónica. "Escenarios cosmológicos en expansión acelerada" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Estudiamos escenarios de expansión acelerada en cosmologías de Bianchi I(BI) y Friedmann-Robertson-Walker (FRW) con distintos componentes. En la métrica de BI encontramos modelos de universos con K esencia que disipaban la anisotropía primordial y modelos que eludían la singularidad inicial. Encontramos soluciones exactas para diversas fuentes y vimos que la K esencia impulsada por un potencial cuadrá́tico inverso y la quintaesencia impulsada por un potencial exponencial compartían la misma geometría. En la métrica de FRW, la K esencia permitió construir modelos que interpolaban entre una era dominada por materia oscura, y una era de expansión acelerada. Introdujimos el N-quintom que generalizaba el quintom construido con quintaesencia y campo fantasma. Estudiamos la dualidad, la estabilidad de las soluciones ley de potencias y obtuvimos la solución general del N-quintom impulsado por un potencial exponencial. Para otros potenciales investigamos modelos en espacios internos bi y tridimensionales. Asociamos una representación escalar a un sistema de dos fluidos interactivos que modificó la ecuación de Friedmann, denominada “quintaesencia exótica”. Ajustamos estadísticamente los par ́metros del modelo exótico, estimamos cuando el universo comenzaba a acelerarse, calculamos su edad, estudiamos las perturbaciones lineales y encontramos la solución general con tres fluidos. Finalmente, analizamos modelos con materia barió́nica conservada y con interacciones del sector oscuro limitadas a cocientes asintóticamente estables de las densidades de energía oscuras.

Abstract:
In this thesis we study cosmological scenarios in the metrics of Bianchi I (BI) and Friedmann-Robertson-Walker (FRW) with different contents. In the BI metric we investigate a universe with K essence and find some models that dissipate the primary anisotropy and others that avoid the initial singularity. We find exact solutions with various sources and find that the K essence driven by an inverse square potential and a quintessence driven by exponential potential share the same geometry. In the FRW metric we see that the K essence allows us to build transient models representing universes that interpolate between a non-accelerated expansion era dominated by dark matter, and a stage of accelerated expansion, dominated by dark energy. Alternatively, we introduce the N-quintom model with an internal structure that generalizes different realizations of quintom based on quintessence and ghost fields. We study the duality and show that the power-law type solutions are stable when the N-quintom is driven by an exponential potential, for which we obtain the general solution. Also, we consider models with other potentials and solve for the two and three-dimensional internal spaces. We present the problem of interacting fluids and define a scalar representation of the interaction called ”exotic quintessence”. This led us to a modified Friedmann equation with which we model a universe with baryonic matter, dark matter and dark energy contents. We made statistical adjustment of the parameters of this exotic model. In addition to this, we calculated the age of the universe and the redshift when it begins to accelerate, and also made a study of linear perturbations. Moreover we exactly solve the modified Einstein equation obtained in the exotic case with three fluids. Finally, we analyze models with conserved baryonic matter and dark matter in interaction with dark energy, where interaction is limited to produce ratios of energy densities of both dark components, asymptotically stable.

Fortin, Sebastián Ezequiel. "Un estudio general del proceso de decoherencia cuántica" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se aborda un estudio general de la decoherencia cuántica, entendiendo por general que no se centra en el análisis de un modelo particular. El estudio de la decoherencia ha adquirido, recientemente, una gran importancia en la computación cuántica, donde el fenómeno de la decoherencia representa un gran obstáculo para implementación de hardware para procesamiento de la información. Por otro lado, la decoherencia juega un papel esencial en el límite clásico y en la emergencia del comportamiento clásico en sistemas cuánticos. Por este motivo la comprensión del fenómeno de la decoherencia y el desarrollo de formalismos matemáticos para estudiarla son esenciales. De acuerdo con los trabajos de Zurek et al., la decoherencia es un proceso que resulta de la interacción entre un sistema cuántico abierto y su ambiente (EID). Este proceso determina cuál es la base privilegiada, que define los observables que adquieren características clásicas y pueden interpretarse como propiedades que obedecen a la lógica booleana. Recientemente Castagnino et al señalaron la conveniencia de tomar en cuenta tres aspectos de la teoría: (i) la posibilidad de estudiar la decoherencia de sistemas cerrados (sin ambiente), (ii) el criterio para determinar cuál es el subsistema que decohere, y (iii) el cálculo de la base privilegiada móvil. Por otro lado, en la bibliografía se encuentran otros enfoques para describir tanto la decoherencia como la relajación de los sistemas cuánticos. Tal es el caso de los trabajos de Castagnino et al., según el cual la relajación es un proceso que resulta de la elección de los observables que tienen relevancia física en un sistema cerrado (SID), y que define los observables que adquieren características clásicas y pueden interpretarse como propiedades que obedecen a la lógica booleana. La existencia de ambos enfoques aporta puntos de vista distintos acerca de los fenómenos físicos de la decoherencia y de la relajación. En esta tesis se presenta una perspectiva basada en valores medios, que cambia el foco de interés del operador de estado a los valores medios. Dicha perspectiva da lugar a un esquema general que unifica los enfoques anteriores de decoherencia y relajación, sobre el cual se espera seguir trabajando para la incorporación de otros enfoques. Esta perspectiva, además, permite reconsiderar los tres aspectos señalados anteriormente: (i) incorpora el estudio de sistemas sin ambiente, (ii) explicita el carácter relativo de la decoherencia respecto de la elección de los observables relevantes y permite definir al "mundo" clásico emergente como un conjunto de observables, y (iii) provee caracterizaciones alternativas del tiempo de decoherencia y de la base privilegiada móvil. Por otro lado, se presentan aportes de naturaleza técnica sobre aspectos de la decoherencia, en particular se propone una técnica que permite calcular los tiempos de decoherencia y relajación a partir de la extensión analítica de funciones que dependen del Hamiltoniano.

Abstract:
The present work addresses a general study of quantum decoherence, where general is understood in the sense that it is not an analysis of a particular model. Recently the study of quantum decoherence has acquired a great importance in quantum computing, where the phenomenon of decoherence is a major obstacle to the implementation of hardware for information processing. On the other hand, decoherence plays an essential role in the classical limit of quantum mechanics and in the emergence of classical behavior in quantum systems. For this reason, the understanding of the phenomenon of decoherence and the development of mathematical formalisms to study it are essential. According to the work of Zurek et al., decoherence is a process resulting from the interaction between an open quantum system and its environment (EID). This process determines the privileged basis, which defines the observables that will behave classically, and that can be interpreted as properties obeying Boolean logic. Recently, Castagnino et al pointed out the convenience of taking into account three aspects of the theory: (i) the possibility of studying decoherence in closed systems (no environment), (ii) the criterion to determine the subsystem that decoheres, and (iii) the compotation of the moving preferred basis. On the other hand, in the literature there are other approaches to describe both the decoherence and the relaxation of quantum systems. For example, in the works of Castagnino et al., relaxation is a process resulting from the selection of the physically relevant observables in a closed system (SID), which defines the classical observables that can be interpreted as Boolean properties. The existence of both approaches provides di¤erent views about the physical phenomena of decoherence and relaxation. This thesis presents a perspective based on expectation values, which shifts the focus from state operators to mean values. This perspective leads to a general framework that unifies the previous approaches to decoherence and relaxation. Moreover, this perspective allows us to reconsider the three aspects mentioned above: (i) it adds the study of systems without environment, (ii) it makes explicit the relative nature of decoherence with respect to the selection of the relevant observables, and makes possible to define the emergent classic world as a set of observables, and (iii) supplies alternative characterizations of the decoherence time and the privileged basis. On the other hand, the thesis introduces technical contributions about certain aspects of decoherence; in particular, it provides a method that allows us to compute the decoherence and the relaxation times on the basis of the analytic extension of funcions depending on the Hamiltonian.

Fortunato, Andrés D.. "Aceite de gérmen de maíz argentino : determinación de la composición química de un aceite de gérmen de maíz argentino, elaborado en el establecimiento "Refinería de Maíz S.A." (Baradero, Provincia de Buenos Aires)" (1945). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fox, Ana Romina. "Fototransducción de señales en Arabidopsis thaliana. Dos casos de estudio: participación de la subunidad alfa de la proteína G heterotrimérica; e identificación de proteínas diferencialmente expresadas en el cuádruple mutante phyA phyB cry1 cry2" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El desarrollo de las plantas es un proceso que ocurre bajo fluctuaciones del ambiente lumínico que son percibidas por fotorreceptores específicos, principalmente los fitocromos phyA y phyB, y los criptocromos cry1 y cry2. El estudio de las respuestas de mutantes simples y múltiples de fotorreceptores en diferentes condiciones lumínicas es una herramienta muy útil para analizar las vías de señalización. Este trabajo de tesis tuvo como objetivo principal estudiar los mecanismos moleculares y bioquímicos de la transducción de señales lumínicas mediadas por fitocromos y criptocromos durante el desarrollo de Arabidopsis thaliana. En el primer capítulo estudiamos la participación de la subunidad α de la proteína G heterotrimérica (GPA1) en los caminos de señalización de los fotorreceptores. Los mutantes cry1 fueron los únicos simples mutantes que mostraron una reducción en la unión de GTPγS35, a niveles similares a los observados en el mutante gpa1. Hallamos interacción génica entre cry1 y GPA1 en la apertura del gancho apical en oscuridad y en la acumulación de antocianas en luz azul. Estas respuestas fueron dependientes de la presencia de sacarosa en el medio. Análisis moleculares nos llevaron a proponer un modelo en el que la posible modificación posttraduccional de GPA1 mediada por cry1 alteraría su actividad. En el segundo capítulo realizamos un estudio comparativo de los perfiles proteicos entre plántulas cuádruples mutantes phyA phyB cry1 cry2 y plántulas salvajes utilizando la técnica de geles bidimensionales. La identificación de proteínas sub-expresadas en el cuádruple mutante phyA phyB cry1 cry2 fue consistente con la drástica reducción en la tasa fotosintética, el contenido de clorofila y el concomitante retraso en el desarrollo del mutante. Las proteínas sobreexpresadas en el cuádruple mutante phyA phyB cry1 cry2 estuvieron involucradas en respuesta a estrés por temperatura y por sequía. Sin embargo, sólo la expresión de éstas proteínas no permitió explicar el comportamiento del cuádruple mutante phyA phyB cry1 cry2 en condiciones de estrés. La reducción en la cantidad relativa de ácidos grasos insaturados de las membranas del cuádruple mutante phyA phyB cry1 cry2 fue consistente con una mayor sensibilidad a un shock de bajas temperaturas y una mayor tolerancia a un shock de altas temperaturas. Las posibles significancias fisiológicas y ecológicas de estos resultados son discutidas en esta tesis.

Abstract:
Plant development is a process that occurs under fluctuating light environment which is perceived by specific photoreceptors, mainly by phytochromes phyA and phyB, and cryptochromes cry1 and cry2. The study of the behaviour of simple and multiple photoreceptor mutants in different light conditions is a useful tool to analyze signalling pathways. The main objective of this thesis was to study the molecular and biochemical transduction of light signalling mediated by phytochromes and cryptochromes during Arabidopsis thaliana development. In the first chapter we studied the involvement of the α- subunit of the Heterotrimeric G protein (GPA1) in photoreceptors signalling pathways. cry1 mutants were the only single mutants that showed GTPγS35 binding reduction, at similar levels to that observed for the gpa1 mutant. We found genetic interaction between cry1 and GPA1 on apical hook opening in darkness and anthocyanin accumulation under blue light. These responses were dependent on the presence of sucrose. Molecular approaches conducted us to propose a model where a potential post-translational modification of GPA1 mediated by cry1 would alter its activity. In the second chapter we made a comparative study of the protein profiles between the phyA phyB cry1 cry2 quadruple mutant and wild type seedlings using the two-dimensional gel electrophoresis technology. Under-expressed proteins in the phyA phyB cry1 cry2 quadruple mutant were consistent with the drastic reduction in photosynthetic rates, reduced chlorophylls contents and retarded development in the mutants. Over-expressed proteins were involved in temperature and drought stresses. However, the expression of these proteins does not explain the phyA phyB cry1 cry2 quadruple mutant behaviours under stress conditions. The reduction in the relative contents of unsaturated fatty acid of the phyA phyB cry1 cry2 quadruple mutant membranes was consistent with its sensitivity to a low temperature shock and its tolerance to a high temperature shock. The physiological and ecological significance of these results are discussed in this thesis.

Fracchia, Ricardo Mario. "Estudio teórico de propiedades anarmónicas de sólidos" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fracchia, Sebastian. "Hongos saprotrofos del suelo como microorganismos auxiliares de micorrización" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La formación de micorrizas arbusculares se puede ver afectada por distintos factores bióticos y abióticos. Entre los primeros se encuentran los diferentes microorganismos del suelo que pueden tener efectos inhibitorios, neutros o positivos sobre el establecimiento y posterior desarrollo de la simbiosis. Los hongos saprótrofos del suelo que habitan en la rizósfera de plantas susceptibles, interaccionan con los hongos formadores de micorrizas arbusculares (hongos MA) en forma diversa. Existe un gran potencial en aquellas cepas de hongos saprótrofos que interactúan en forma sinérgica con la formación y desarrollo de esta simbiosis. Coínoculando cepas seleccionadas junto a los hongos MA en plantas hospedantes de interés agronómico favorecería una más rápida colonización de las raíces y una mejora en la bioprotección y nutrición del vegetal. Por otro lado la detección de cepas con efectos inhibitorios sobre la formación de la simbiosis permitiría tener un mayor control sobre la calidad del inóculo de los hongos MA. En el presente trabajo se aislaron 39 cepas de hongos saprótrofos del suelo y se enfrentaron a esporas de Gigaspora rosca. Se seleccionaron dos cepas de hongos saprótrofos, Aspergillus niger y la levadura Rhodotorula mucilaginosa, como los aislamientos más efectivos en la estimulación del desarrollo del micelio a partir de las esporas de Gi. rosea. Se obtuvieron los exudados de ambos hongos saprótrofos y se ensayó su efecto sobre distintas especies de hongos MA, distintas cepas de Gi. rosea y una mezcla de esporas de un suelo cultivado. Con el fin de estudiar la naturaleza del principio activo de ambos exudados, se ensayó la termoestabilidad de los mismos y la diálisis en membranas de distinto tamaño de poro. De acuerdo a los resultados observados, el principio activo no sería el mismo para cada hongo. Se realizó el estudio de la interacción a lo largo de todo el ciclo de vida de Gi. rosea en un sistema especial de crecimiento. El agregado de los exudados de A. niger y R. mucilaginosa produjeron una mayor cantidad de micelio desarrollado a partir de las esporas de Gi. rosea, más del doble número de ápices hifales, mayor número de apresorios sobre las raices de T. repens, mayor porcentaje de micorrización, mayor desarrollo del micelio extrarradical y finalmente una estimulación en la esporulación del hongo MA. La inoculación líquida de los hongos saprótrofos junto al inóculo de Gi. rosea, lO días previos al trasplante de las plantas de T. repens a macetas, resultó la forma más efectiva en la estimulación de la micorrización de las raíces por parte del hongo MA. Esta forma de inoculación resultó ser efectiva para distintas especies de hongos MAy distintos hospedantes de interés agronómico. La inoculación de los hongos saprótrofos en plantas previamente micorrizadas con Gi. rosca no tuvo efectos sobre los valores de micorrización observados al cabo de 9 semanas de crecimiento. El riego con los exudados de A. niger y R. mucilaginosa produjo un aumento en los niveles de micorrización de las raíces de T. repens. En la realización del ensayo del número más probable para hongos MA, se observó un aumento en el número de propágulos de Gi. rosca al inocular los hongos saprótrofos a un inóculo general de dicha cepa. Los dos hongos saprótrofos seleccionados A. niger y R. mucilaginosa pueden considerarse como microorganismos auxiliares de la formación de micorrizas arbusculares.

Abstract:
Arbuscular mycorrhizae formation can be affected by different biotic and abiotic factors. Among the bíotic factors are soil microorganisms, which can inhibit, enhance or have no effect on the stablishment and development of the symbiosis. There are many strains of saprotrophic soil fungi interacting sinergically with the symbiosis that have greate agronomical potential. Dual inoculation of this selected strains and AM fungi of economically important hosts, would favour a faster mycorrhizal formation and a better plant nutrition and bioprotection. On the other hand, the detection of strains with inhibitory effects on the formation of the AM symbiosis would allow a better control on the quality of AM inocula. In this work, 39 strains of saprotrophic soil fungi were isolated and tested against the AM fungi Gigaspora rosca. One strain of Aspergillus niger and one of the yeast Rhodotorula musilaginosa were the most effective stimulating the development of mycelium of Gi. rosea in an in vitro assay. The exhudates of these two fungi were tested in different species of AM fungi and different strains of Gi. rosca. The optimal concentration was 0,25% (VN) for both selected fungi. Dialysis of these exhudates showed that the active compound would be different for each fungus. The interaction study was performed along the whole life cycle of Gi. rosea in a specially design growth system. The addition of exhudates from A. niger and R. musilaginosa induced a higher presymbiotic mycelial growth, number of hyphal tips, entry points on T. repens roots, mycorrhizal colonization, extraradical mycelium development and a final higher sporulation of the MA fungus. Liquid inoculation of saprotrophic fungi with Gi. rosea, lO days before transplanting T. repens seedlings to pots, was the most effective inocultation way for stimulating root colonization in most of AM fungi and host combinations. Inoculation of already mycorrhized plants with saprotrophic fungi, had no effects on the mycorrhizal level observed after 9 weeks of growth. The direct application of exhudates from A. niger and R. mucilaginosa to T. repens inoculated with Gi.rosea, enhanced root colonization of this host. The most probable number assay for AM fungi, showed an increase of the number of Gi. rosea propagules when saprotrophic fungi were added to the general inoculum of the AM fiJngus. Both saprotrophic fungi can be considered as auxiliary microorganisms in the arbuscular mycorrhizal formation.

Fraga, César Guillermo. "Quimioluminiscencia y lipoperoxidación en hígado de mamíferos en condiciones fisiológicas y de estrés oxidativo" (1985). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió la quimioluminiscencia de hígado de rata y ratón, tanto en condiciones fisiológicas como de estrés oxidativo. La quimioluminiscencia fisiológica del hígado de rata fue de 24 ± 1 cps/cm² y del hígado de ratón fue de 109 ± 6 cps/cm². Estos valores correspondieron a una capa superficial de tejido de aproximadamente 100 μm de espesor y daban cuenta de un 2 % del oxígeno total consumido por el hígado. El 95 % de la emisión del hígado de ratones se midió a longitudes de onda mayores de 600 nm. La administración de CCl4 a ratones, produjo un 64 % de aumento de la emisión del hígado de esos animales. El tratamiento con barbital, no modificó la emisión espontánea del hígado, pero sí produjo aumentos de la emisión estimulada por CCl4, que a los 15 días de tratamiento fue del 135 %. Este aumento de la quimioluminiscencia estimulada por CCl4, se correlacionó con un aumento de la proteína microsomal. También aumentaron las actividades de las enzimas antioxidantes: superóxido dismutasa (109 %), catalasa (90 %) y glutatión peroxidasa (103 %) y del contenido de glutatión (18 %). El tratamiento crónico con etanol, produjo aumentos del 45 % de la velocidad fisiológica de producción microsomal de O2 (1.5 ± 0.1 nmoles/min/mg de proteína), del 54 % de la quimioluminiscencia espontánea del hígado y del 63 % de la emisión del hígado estimulada por CCl4. La actividad de la superóxido dismutasa citosólica no se modificó y la quimioluminiscencia iniciada por BOOH, estaba aumentada en los homogeneizados (57 %), en las mitocondrias (43 %) y en los microsomas (28 %) aislados a partir del hígado de los animales tratados. La administración aguda de etanol llevó a aumentos de la emisión espontánea del hígado del 60 %, de la formación de malondialdehido (48 %) y de la formación de dienos conjugados (65 %). La deficiencia de vitamina E y Se, produjo aumentos de la amisión fisiológica del hígado de ratas, que al cabo de 18 días de tratamiento fueron del 100 %, y precedieron a la aparición de necrosis en ese órgano. Al cabo de 18 días, la quimioluminiscencia de hígado se incrementó en un 23 % en las ratas deficientes en vitamina E y en un 64 % en las deficientes en Se (en las cuales la ectividad de la Se-glutatión peroxidasa se redujo de 7.6 a 1.0 U/g de hígado). La administración de (+)-catequina inhibió el 100 % del incremento de la emisión de hígado producido por la administración aguda de etanol. El eriodictiol, la catequina, la cinarina y el ácido 3,4-dicafeoilquínico, disminuyeron en un 38 %, 31 % y 0 %, respectivamente, la emisión estimulada por CCl4. Estas sustancias fueron elegidas entre 21 polifenoles, a partir de sus DI50 calculadas por su capacidad de disminuir la quimioluminiscencia de homogeneizados de hígado de ratón iniciada por BOOH. Todos estos resultados indican una clara correlación entre lipoperoxidación y quimioluminiscencia de hígado in situ. Se observó que diferentes situaciones de estrés oxidativo, modificaron la emisión del hígado por distintos mecanismos bioquímicos.

Fragalá, Marina. "Un S-estimador alternativo para el modelo de regresión lineal con datos censurados y distribución posiblemente asimétrica" (2016-11-04). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Fraguío, María Sol. "Estudio fluidodinámico de reactores multifásicos mediante técnicas de análisis no-invasivas" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo presenta un estudio sobre algunos aspectos de la fluidodinámica de sistemas multifásicos utilizando técnicas que no perturban el movimiento de los fluidos y/o el sólido presentes. El objetivo es caracterizar y/o monitorear la fluidodinámica en sistemas de interés industrial, particularmente, columnas de burbujeo bifásicas y lechos fluidizados trifásicos. Para el estudio de los sistemas multifásicos involucrados en este trabajo se midieron y analizaron series temporales provenientes de experimentos de densitometría, de tomografía de emisión de partículas únicas, generalmente llamada ”Radioactive Particle Tracking” (RPT), y de fluctuaciones de presión. Se utilizaron técnicas estadísticas básicas y un test estadístico que permite tener en cuenta las características caóticas de los sistemas para determinar transiciones de régimen de flujo y/o monitorear un cambio brusco en la fluidodinámica del sistema. El análisis de las diversas series temporales registradas permitió proponer procedimientos de identificación de transiciones del régimen de flujo subyacente, habiéndose obtenido concordancia entre las predicciones que surgen del análisis de series temporales de distintas variables características. Asimismo, el análisis de series temporales durante una perturbación indica que es posible diagnosticar el inicio de la misma con un procedimiento similar al empleado para identificar transiciones de flujo. Por otra parte, además de haber implementado por primera vez la técnica de RPT en Argentina, se estudiaron exhaustivamente distintos aspectos de la misma y se exploró la posibilidad de utilizarla para obtener información en sistemas donde estén ocurriendo cambios en la fluidodinámica debido a una perturbación. Se cuantificaron por primera vez los errores en las determinaciones de posiciones y velocidades ”instantáneas” y se encontró que, para una columna de burbujeo con el sistema agua – aire, es posible utilizar una calibración realizada con la columna llena de líquido y sin circulación de gas para reconstruir las posiciones del trazador cuando la columna opera tanto en régimen homogéneo como heterogéneo.

Abstract:
This work presents a study of some fluid dynamic features in multiphase systems using techniques that do not disturb the behavior of the fluids or solids, in order to characterize or monitor the fluid dynamic in usual industrial systems, such as bubble columns and three phase fluidized beds. For the study of the multiphase systems involved in this work, time series from experiments of densitometry, single particle emission tomography, commonly known as Radioactive Particle Tracking (RPT), and pressure fluctuations were measured and analized. Diferent basic statistic techniques and a statistical test that allows taking into account the chaotic behavior of the multiphase systems were used to classify flow regime transitions and monitor a change in the system fluid dynamics. Analysis of different characteristic variables time series allowed suggesting procedures for flow regime transition identification. Good agreement was found between the predictions arising from the application of the statistic test to the different time series. Likewise, a perturbation could be sucessfully diagnosed from a similar time series analysis. Besides implementing the RPT technique for the first time in Argentina, different aspects of the technique were further investigated. Moreover, application of the technique to obtain information from systems where hydrodynamic changes due to a perturbation are taking place was explored. Errors in the positions and instantaneous velocities determinations were quantified for the first time. For an air-water bubble column, it was found that the use of a calibration carried out in a different hydrodynamic condition does not increase the inherent error of the technique. Hence, doing the calibration in the column with liquid and no gas circulation allows reconstructing the tracer positions measured when the column is operated in the homogeneous and heterogeneous flow regimes.

Franceschini, Esteban Andrés. "Fisicoquímica de materiales para celdas de combustible PEM alimentadas con metanol" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las celdas de combustible de membrana de intercambio protónico (PEM) alimentadas con metanol directo (DMPEM) utilizan en la actualidad como catalizadores catódico y anódico, platino y aleaciones platino/rutenio, respectivamente. Los catalizadores comerciales utilizados, están compuestos por nanopartículas de estos metales soportadas sobre partículas de carbón Vulcan XC72®. Estos catalizadores soportados presentan un bajo aprovechamiento del platino debido a que, para obtener una alta área electroquímicamente activa, se requiere la utilización de una gran cantidad de catalizador. La electrodeposición de platino y sus aleaciones con rutenio puede ser utilizada como método para obtener capas catalíticas de bajo espesor, mejorando el aprovechamiento del platino, mientras que la utilización de nanomoldes permite obtener una alta área electroquímicamente activa. En una primera etapa se consiguió sintetizar catalizadores mesoporosos utilizando como nanomolde un cristal líquido formado por un surfactante comercial, Brij 56® y un copolímero bloque comercial, Pluronic F127®. Estas síntesis mostraron ser reproducibles en diferentes soportes de electrodeposición. El diámetro de poro obtenido con la utilización del Brij 56® (entre 2,5 – 3 nm) podría dificultar el flujo del combustible y los productos de reacción dentro de los poros. Por esta razón, se sintetizaron luego catalizadores de Pt puro y cuatro aleaciones de Pt/Ru con concentración creciente de Ru utilizando como nanomolde el copolímero bloque comercial Pluronic F127® (tamaño de poro 8-10 nm). Los catalizadores obtenidos muestran una estructura estable y reproducible. Estos catalizadores mesoporosos de Pt exhiben un alto grado de conversión de oxígeno hacia la formación de H2O, es decir, una baja producción de H2O2, un producto secundario no deseado en el cátodo de pilas de combustible PEM. La caracterización electroquímica de las aleaciones de Pt/Ru demuestra que estos catalizadores tienen una alta actividad para la reacción de oxidación de metanol, que podría atribuirse a una distribución de tamaño de poro, la cual mejoraría el transporte de masa desde / hacia el área electroactiva. Una vez caracterizados, los catalizadores se ensayaron en lo que respecta a su integración en un prototipo de DMFC. Para ello primero se prepararon capas de catalizadores mesoporosos de Pt/Ru sobre carbón con estructura jerárquica de poros y tela de carbón comercial utilizando el copolímero de bloque, Pluronic F127®, como plantilla. La integración de materiales estructurados muestra un mejor rendimiento en experimentos de celdas de combustible de metanol/O2, alcanzando una potencia máxima de 8,9 mW·mg Pt- 1cm-2 a 25 ºC (~5 % mayor en comparación con materiales comerciales). En resumen, todos estos resultados indican claramente que el catalizador mesoporoso soportado sobre carbón con estructura jerárquica de poros es un sistema integrado capa difusora de gases / soporte de catalizador prometedor que podría contribuir a la miniaturización de celdas de combustibles para aplicaciones portátiles.

Abstract:
The proton exchange membrane (PEM) fuel cells fed with direct methanol (DMPEM) currently uses as cathode and anode catalysts, platinum and platinum / ruthenium alloys, respectively. The commercial catalysts used consist of metal nanoparticles supported on Vulcan XC72® carbon particles. These supported catalysts have low platinum utilization because, large amount of catalyst is required for obtaining high electrochemically active area. The electrodeposition of platinum and platinum / ruthenium alloys can be used as a method to obtain low thickness catalytic layers, improving the utilization of platinum, while the use of nano-templates allows high electrochemically active area. In a first stage, the synthesis of mesoporous catalysts using a liquid crystal consisting of a commercial surfactant, Brij 56® and a commercial block copolymer Pluronic F127® as nano-template was accomplished. These syntheses were shown to be reproducible in different electrodeposition supports. The pore diameter obtained with the use of Brij 56® (from 2.5 to 3 nm) could restrict the flow of fuel and reaction products within the pores. For this reason, pure Pt catalysts and four alloys of Pt / Ru with increasing Ru concentration nano-template using as the commercial block copolymer Pluronic F127® were synthesized (pore size 8-10 nm). The catalysts obtained show a reproducible and stable structure. These mesoporous Pt catalysts exhibit a high oxygen to H2O conversion degree, that is low H2O2 production, an undesired secondary product in the cathode of PEM fuel cells. The electrochemical characterization shows that these mesoporous catalysts have a high activity for methanol oxidation reaction, which could be attributed to a distribution of pore size which could improve the mass transport from/to the electroactive area. Once characterized, the catalysts were tested for integration into a DMFC prototype. Catalytic layers of mesoporous Pt/Ru were prepared on mesoporous carbon with hierarchical pore structure and commercial carbon cloth using the commercial block copolymer, Pluronic F127® as nanotemplate. The integration of structured materials results in a better performance in methanol/O2 fuel cells, reaching a maximum power of 8.9 mW·mg Pt-1cm-2 at 25 °C (~ 5% higher compared with commercial materials). In summary, these results clearly indicate that the mesoporous catalyst supported on carbon with hierarchical pore structure is a promising integrated gas diffusion layer/catalyst support which could contribute to miniaturization of fuel cells for portable applications.

Franchi, Ana María. "Influencia de hormonas sexuales sobre la síntesis y liberación de prostaglandinas en el útero de rata" (1985). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Franco, Bárbara Cristie. "Procesos acoplados bento-pelágicos relacionados con el establecimiento y deriva larval de la vieira patagónica (Zygochlamys patagonica) en el Océano Atlántico sudoeste" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los mayores bancos-agregaciones de la vieira patagónica (Zygochlamys patagonica), se encuentran asociados a la localización de los principales sistemas frontales del Mar Argentino. La disponibilidad de alimento planctónico en el fondo ha sido considerado uno de los factores que condicionan la persistencia y recurrente localización de poblaciones de vieira. En este sentido se ha sugerido que procesos acoplados bento-pelágicos (asentamiento larval y alimento para las vieiras adultas) relacionados con los sistemas frontales en superficie (frecuentemente áreas de alta concentración de fitoplancton) serian la clave para explicar la localización de los principales bancos. En esta tesis se investiga la dinámica, variabilidad y transporte de partículas asociados con el Sistema Frontal Norpatagónico (SFN) y el Frente de Talud (FT). Con este objetivo, inicialmente se configuran modelos idealizados de los sistemas frontales y posteriormente se emplean modelos realistas de alta resolución. A través del seguimiento de partículas lanzadas en el área de variabilidad frontal se simula la deriva del fitoplancton y se investigan los procesos acoplados bento-pelágicos relacionados. La deriva larval de la vieira se simula desde el desove en los respectivos bancos bentónicos. Los resultados del modelado muestran que la dispersión de partículas lanzadas desde el SFN no alcanza el área principal del banco Sea Bay. La ausencia de un sistema frontal permanente asociado a esta región debería ser considerada para analizar estrategias de manejo y restricciones de la pesquería y aportaría una explicación para el cambio reciente de su denominación a Unidad de Manejo. Las simulaciones de dispersión desde el FT evidencian que partículas lanzadas en superficie pueden alcanzar el fondo cerca de la localización de los bancos. Los resultados de dispersión larval inicializados en el fondo indican que podrían ocurrir flujos de larvas en el ámbito geográfico de la región del borde de plataforma, lo que sugiere que estos bancos-agregaciones formarían una metapoblación.

Abstract:
The largest aggregations of the Patagonian scallop (Zygochlamys patagonica) are related with the location of the main frontal systems in the Argentine Sea. Planktonic food availability in the sea bottom has been proposed as one of the key factors influencing the persistence and recurrent localization of scallop populations. Therefore, it is suggested that coupled benthicpelagic processes (larval settlement and food for adult scallops) related with surface frontal systems (frequently associated with areas of high concentration of phytoplankton) would be the main process explaining the location of the major scallop beds. This Thesis investigates the dynamics, variability and particle transport of the Northern Patagonian Frontal System (NPFS) and the Shelf Break Front (SBF). Several idealized hydrodynamic models were configured, aimed to simulate the frontal systems and results from high-resolution realistic models were also employed. Particle-tracking simulations releasing particles at the frontal variability area are employed to model the phytoplankton drift in order to analyze the coupled benthic-pelagic processes. Larval drift is in turn simulated by releasing particles at the benthic beds. The results from the simulations show that the dispersion of particles released from the NPFS does not reach the main area of the Sea Bay bed. The absence of a permanent frontal system over the Sea Bay bed region suggest that this area should be considered to analyze management strategies and restrictions of the fishery and provides an explanation for the recent change in its current status to only a management unit. Simulations of particles dispersion from the SBF indicate that particles released at the surface reach the bottom near the location of the main beds. Simulations of the larval drift at the bottom of the shelf break indicate that flows between beds could occur in the geographical region of the shelf break, suggesting that these beds might form a metapopulation.

Franco, Diana Lorena. "Mecanismos moleculares de sensibilización y protección de la apoptosis inducida por TNF-alfa" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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La mayoría de las células son resistentes a la apoptosis inducida por TNF-ᵅ y se sensibilizan cuando se inhibe la activad transcripcional de NF-kB o bien en presencia de inhibidores de la síntesis proteica capaces de inhibir la expresión de genes antiapoptóticos. En esta tesis analizamos el rol del estrés osmótico en la apoptosis inducida por TNF-ᵅ. Nosotros encontramos que éste es capaz de sensibilizar a células HeLa resitentes a la apoptosis inducida por TNF-ᵅ y que esta sensibilización involucra, un aumento de la actividad de varias MAPKs, la inhibición de la expresión de Bcl-2 y el aumento en una etapa tardía de la actividad de NF-kB. La muerte ocurre a pesar del aumento de la actividad de NF-kB, cuya inhibición por otro lado causa un aumento mayor de la apoptosis. La proteína quinasa p38 parecería estar involucrada en la activación de NF-kB ya que su inhibición provoca un aumento significativo del efecto del estrés osmótico en la apoptosis inducida por TNF-ᵅ. Se ha demostrado previamente que dosis bajas de TNF-ᵅ tienen un rol sensibilizador a la acción de los glucocorticoides en su protección de la apoptosis inducida por esta citoquina. En este trabajo estudiamos las señales inducidas por TNF-ᵅ que podrían estar involucradas en la regulación de la actividad del receptor de glucocorticoides. Analizamos el rol de las MAPKs en la regulación de las actividades biológicas del receptor de glucocorticoides, en un modelo de células sensibles a la apoptosis inducida por TNF-ᵅ, donde los glucocorticoides son capaces de proteger a las células de dicha muerte. Nosotros observamos que las cinco MAPKs mejor caracterizadas hasta el momento son capaces de fosforilar al GR in vitro y que cuatro miembros de esta familia, JNK, p38, Erk6 y Erk1/2 son capaces de interactuar in vivo. Asimismo vimos que p38 induce la activación transcripcional del GR, incrementa su localización nuclear y su unión a sus secuencias blanco presentes en el ADN. De acuerdo con nuestros resultados, existen mecanismos moleculares que involucran la participación de MAPKs inducidas por TNF-ᵅ, por los cuales la citoquina puede regular la actividad del GR y la sensibilidad a su acción protectora de la apoptosis en el modelo de apoptosis inducida por TNF-ᵅ.

Abstract:
Most cells are naturally resistant to TNF-ᵅ-induced cell death and become sensitized when NF-kB transactivation is blocked or in the presence of protein synthesis inhibitors that prevent the expression of anti-apoptotic genes. We analyzed the role of osmotic stress on TNF-ᵅ-induced cell death. We found that it sensitizes the naturally resistant HeLa cells to TNF-ᵅ-induced apoptosis with the involvement of an increase in the activity of several kinases, the inhibition of Bcl-2 expression and a late increase on NF-kB activation. Cell death occurs regardless of the enhanced NF-kB activity whose inhibition produces an increase in apoptosis. The inhibition of p38 kinase, also involved in NF-kB activation, significantly increases the effect of osmotic stress on TNF-ᵅ-induced cell death. It was previously shown that a low dose of TNF-ᵅ has a priming effect on the glucocorticoid-mediated inhibition to TNF-ᵅ-induced apoptosis. We analyzed TNF-ᵅ induced signals that could be involved in the regulation of GR activities. We also investigated the role of MAPKs in the regulation of GR biological activities in L-929 cells. These cells are sensitive to TNF-ᵅ-induced apoptosis which is prevented by ligand activated GR. We observed that five MAPK family members can phosphorylate GR in vitro and four members of this family: JNK, p38, Erk6 and Erkl/2 can physically interact with GR in vivo. We also found that p38 increases the transcriptional activity of GR, its nuclear localization and its binding to DNA specific sequences. According to our results, there are molecular mechanism that involves MAPKs induced by TNF-ᵅ by which the cytokine may modulate the activity of GR and the sensitivity to their protective role on TNF-a-induced apoptosis.

Franco, Marcela. "Resistencia concomitante antitumoral inducida por tumores murinos de distintos grados de inmunogenicidad" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La resistencia concomitante antitumoral (RC) es la capacidad de un individuo portador de un tumor de inhibir el crecimiento de un segundo implante tumoral realizado en un sitio distinto del primero. Se estudió este fenómeno en ratones eutímicos y atímicos, usando nueve tumores murinos con distintos grados de inmunogenicidad. Se describieron dos picos de RC durante el desarrollo del tumor primario. El primer pico fue generado sólo por tumores inmunogénicos pequeños, file específico e irreversible y estuvo asociado a mecanismos inmunológicos convencionales dependientes del timo. El segundo pico de RC fue compartido por tumores inmunogénicos y no inmunogénicos de gran volumen, fire inespecífico, timo-independiente y al menos en parte, reversible y estuvo asociado a la actividad de un factor/es inhibidor de aproximadamente 1000 D de peso molecular, presente en el suero de ratones portadores de tumor. Este factor ejercería un efecto inhibitorio directo e indirecto sobre el tumor secundario: el efecto directo se ejercería sobre las propias células tumorales; el efecto indirecto se ejercería a través de la inhibición de la neovascularización. El efecto inhibitorio se manifiesto como una inhibición de la proliferación —condisminución en el número de células en mitosis y de células positivas para el Antígeno Nuclear de Proliferación Celular (PCNA)- y como un aumento en el número de células en apoptosis. Asimismo, se observaron alteraciones en la cinética del ciclo celular, con un aumento de la fase S y disminución de las fases (G0-G1) y (G2-M).

Abstract:
Antitumor concomitant resistance is the phenomenon according to which a tumor-bearing host inhibits the development of secondary tumor implants carried out in a different site. This phenomenon was studied in euthymic and athymic mice, using nine murine tumors with widely different immunogenicity. Two temporally separate peaks of concomitant resistance were detected during primary tumor development. The first one was exhibited only by small immunogenic tumors; it was tumor-specific, irreversible and mediated by classical immunological T cell dependent mechanisms. The second peak was shared by both immunogenic and non-immunogenic large tumors; it was nonspecific, thymus-independent and partially reversible and correlated with the activity of an antitumor factor/s (molecular weight = 1000 D aprox.) present in the serum of tumor-bearing mice. This factor/s would exert direct and indirect inhibitory effects on secondary tumor growth, the former affecting tumor cells themselves and the latter limiting neovascularization. The inhibitory effect was associated with a decrease in the number of both cells in mitosis and cells expressing the Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA), with an increase in the number of apoptotic cells and alterations in cell cycle kinetics, such as an increase in the proportion of cells in S phase and a decrease in (G0-G1) and (G2-M) phases.

Franco, Mariano Andrés. "Métodos de dispersión electromagnética aplicados a sistemas SAR" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis trabajamos con distintos métodos para calcular la sección eficaz observada por sistemas de radar activos, debido su interacción con superficies y medios aleatorios. En primer lugar describimos el método de la ecuación integral usado para calcular el campo dispersado por una superficie rugosa. Mostramos cuales son los resultados usuales del modelo y luego los que no se condicen con las observaciones. Proponemos entonces no usar las simplificaciones habituales para obtener valores no nulos en los coeficientes de retrodispersión de los canales de polarización cruzada. Concretamente, retener términos no lineales en la distribución de alturas de la superficie y calcular, numéricamente, la nueva sección eficaz del modelo. Luego, extendemos la formulación integral a un modelo de medios estratificados en el cual, debajo de la superficie iluminada por el radar, se encuentra una segunda interface (plana). Con este modelo damos una primer contribución a la dispersión de la onda debido a su interacción con el volumen que se haya debajo de la superficie observada por el radar. En particular, desarrollamos este modelo para estudiar el comportamiento de la emisivad respecto a la distancia media entre las capas, y como segundo objetivo, analizar la respuesta polarimétrica del sistema. Finalmente, basados en una teoría estadística de campos, formulamos el marco teórico para calcular la respuesta al radar de un medio inhomogéneo. Consideramos que debajo de la superficie se encuentra un medio caracterizado por una permitividad dieléctrica estocástica y haciendo uso de métodos funcionales resolvemos las ecuaciones para el campo medio observado por los sistemas de teledetección.

Abstract:
In this thesis we work with different methods to calculate the observed radar cross section by active radar systems due to their interaction with rough surfaces and random media. First, we describe the Integral Equation Method used to compute the scattered field of a random surface. We show that the results are not consistent with the observations and suggest not to use the usual simplifications to obtain nonzero values of the backscattering coeficients for the cross polarized channels. We propose retain the nonlinear terms in the height distribution of the rough surface and calculate, numerically, the new radar cross section. Then, we extend the integral formulation to a model of stratified media which, below the surface illuminated by the radar, there is a second at interface. With this model we give a first contribution to the wave dispersion due to its interaction with the volume to be below the surface. In particular, we develop this model to study the emissivity behavior as a function of the average distance between the layers, and as a second subject, analyzing the polarimetric response of the system. Finally, based on a statistical field theory, we give the theoretical framework in order to compute the radar cross section response in inhomogeneous medium. We consider that below surface there is a random media characterized by a stochastic dielectric permittivity and we use functional methods to solve the equations of the mean field observed by remote sensing systems.

Franco, Paula Gabriela. "Rol del ácido retinoico durante la neurogénesis primaria de Xenopus Laevis" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El primer paso para la construcción del sistema nervioso de los vertebrados es la formación de la placa neural. Varios reportes sugieren que la señal retinoide es esencial para el establecimiento normal del patrón neural y la diferenciación neuronal. Aunque se ha progresado mucho en este sentido, quedan aún muchas preguntas sin respuestas para tratar de elucidar el rol que los retinoides juegan durante el desarrollo embrionario. En este trabajo, dentro del contexto de la cascada de la neurogénesis primaria de Xenopus laevis, exploramos la habilidad de los retinoides de regular diferentes pasos de la cascada que lleva a la diferenciación neuronal. Mostramos que el tratamiento con ácido retinoico (RA) produjo un sustancial aumento en el número de neuronas primarias que expresan N-tubulina debido a un incremento de la diferenciación neuronal sin involucrar cambios en la proliferación o muerte celular programada. Las evidencias indican que este efecto se origina en los pasos iniciales de la cascada neurogénica, ya que este tratamiento alteró el balance entre dos genes de prepattern de expresión temprana. Por un lado, se observó inducción de la expresión de Gli3, que promueve el destino neuronal y por otro, inhibición de Zic2, un represor de la neurogénesis. Además, se modificó la expresión de otros marcadores que participan en los pasos intermedios de la cascada como Neurogenina, MyT1 y X-Delta-1. Paralelamente, determinamos que los retinoides reprimen la expresión de sonic hedgehog (shh) en la línea media del embrión tanto en la placa del piso como en la notocorda y establecímos por primera vez un nexo entre shh, el RA y la neurogénesis primaria. En experimentos de rescate fenotípico demostramos que el RA no es capaz de revertir el efecto inhibitorio de shh, Zic2 o una versión costitutivamente activa de Notch (NotchICD) sobre la neurogénesis primaria. Estos resultados, junto con el hecho de que un pulso corto de RA alrededor del comienzo de la gastrulación es suficiente para desencadenar la inhibición de la expresión de shh, sugieren que el RA participa muy tempranamente en la regulación de esta vía. El tratamiento con agonistas y antagonistas selectivos de los receptores de ácido retinoico (RAR) nos permitió, por un lado, confirmar que la activación de los RAR es suficiente para inhibir la expresión de shh e inducir la neurogénesis y por otro, determinar que RARα es necesario in vivo tanto para regular la expresión de shh, como para establecer el patrón normal de neuronas primarias. Mediante una estrategia de dominancia negativa establecimos que el receptor RARα1 es requerido para la correcta regulación de shh, ya que cuando se interfiere con su función, la expresión de shh se desinhibe. Finalmente, el bloqueo específico de la síntesis de RARγ1 por microinyección de un oligo morfolino antisentido produjo un aumento muy marcado de la expresión de shh, sugiriendo que esta isoforma también es necesaria para mediar la regulación negativa que los retinoides ejercen sobre la expresión de shh. Contrariamente, mostramos mediante esta misma estrategia, que el receptor RARα2.2 no es necesario para ejercer in vivo esta regulación. Todos estos resultados en conjunto proveen nuevas evidencias que profundizan la comprensión del rol de los retinoides durante el desarrollo embrionario, en particular durante la neurogénesis primaria y aportan herramientas críticas para ayudar a descifrar los mecanismos moleculares que determinan la construcción en espacio y tiempo de la placa neural.

Abstract:
The first step in making the nervous system of a vertebrate is the segregation of the neural plate. Several reports suggest that retinoid signal is essential for normal neural patterning and neuronal differentiation. Although there was a lot of progress in this way, many questions remain without answers to elucidate the role that retinoids play during development. In this work, inside the context of Xenopus laevis primary neurogenesis cascade, we explored retinoid's ability to regulate different steps of the cascade that lead to neuronal differentiation. We show that retinoic acid (RA) treatment produced a substantial induction in the number of primary neurons that express N-tubulin due to a promotion of neuronal differentiation without involving changes in proliferation or programmed cell death. Evidences indicate that this effect originates in the initial steps of neurogenic cascade, as this treatment altered the balance between two prepattern genes with early expression. By one side, we observed an induction in Gli3 expression, a promotor of neuronal fate and by the other side, inhibition of Zic2, a repressor of neurogenesis. Furthermore, the expression of other markers that participate in the intermediate steps of the cascade, as neurogenin, MyT1 and Delta-1, was also modified. At the same time, we determined that retinoids repressed sonic hedgehog (shh) expression in the embryo midline, both in the floor plate as well as in the notochord and we established for the first time a link between shh, RA and primary neurogenesis. In phenotypic rescue experiments, we show that RA is not capable to reverse the inhibitory effect caused on primary neurogenesis by shh, Zic2 or a constitutively active form of Notch (Notch ICD). These results, together with the fact that a short RA pulse near the beginning of gastrulation is sufficient to inhibit shh expression, suggest that RA participate very early in the regulation of these processes. The treatment with selective agonists and antagonist of RA receptors (RAR) allowed us, first, to confirm that RAR activation is sufficient to inhibit shh expression and to induce neurogenesis, and second, to determine that RARα is required for proper shh regulation, as when we interfered with its function, shh inhibition was lost. Finally, the specific blockade of RARγ1 synthesis, by microinjection of a morpholino antisense oligo, produced a great induction of shh expression suggesting that this isoform is also necessary to mediate the negative regulation that retinoids exert over shh expression. On the contrary, we showed by the same strategy, that RARα2.2is not required for this regulation in vivo. All these results together, provide new evidences to understand the role that retinoids play during development, particularly during primary neurogenesis and contribute with critical tools to decipher the molecular mechanisms that lead to neural plate construction in space and time.

Frank, Enrique. "Efecto Mössbauer en complejos inorgánicos de hierro" (1966). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo analiza si la espectroscopia de rayos gamma sin retroceso (“Efecto Mössbauer”, EM) es una técnica lo suficientemente sensible para detectar pequeños cambios estructurales en compuestos químicos, particularmente en complejos de hierro. Para ello se utilizaron diversos sistemas. En primer lugar se estudió una serie de nitrosil-bis ditiocarbamatos de Fe (II), en los cuales el sustituyente R es metilo, etilo, isopropilo y fenilo, cuyos parámetros de EM fueron comparados con los respectivos espectros infrarrojo (IR), en especial la frecuencia de estiramiento del grupo NO, y con resultados de espectroscopía electrónica y resonancia paramagnética electrónica (RPE). Se encontró que tanto el EM, como la IR y la RPE dan información que puede ser interpretada en forma coherente sobre la base de un mayor desplazamiento de la densidad de carga del grupo alquílico hacia el átomo de hierro y el grupo NO, en la secuencia Me, Et, iPro mientras que la espectroscopia electrónica no es sensible a esos leves cambios. Adicionalmente se concluye que ninguno de los diagramas de correlación corrimiento isomérico (IS) vs. población de orbitales s, existentes en la literatura es de utilidad para discutir sustancias fuertemente covalentes como éstas. Se hacen numerosas consideraciones sobre el tipo de unión química existente en estos compuestos. La principal conclusión es que los parámetros de la EM, al menos en Fe, son sensibles a variaciones de la estructura química que se producen a una distancia de 4 ó 5 átomos del mencionado núcleo. En segundo lugar se estudió el espectro Mössbauer en soluciones congeladas de ^= y de su producto de reducción electrolítica. Se encontró que dentro de la sensibilidad del equipo no hay diferencia en los parámetros de EM de la solución congelada y de la especie cristalina, probando que es posible medir espectros en matrices congeladas. Esto abre paso a la medición de EM en especies que no se pueden aislar al estado sólido y por lo tanto a la medición de cinética de reacciones en solución. Por el otro lado en base a los parámetros obtenidos se infiere que la especie que se obtiene en la reducción electrolítica es ^= y no ^3- como se supone habitualmente. En tercer lugar se estudió una serie de trisditiocarbamatos de Fe (III), con sustituyentes R= n-butilo, etilo, metilo, bencilo y di-isopropilo, comparándolos con valores de la literatura para los derivados con sustituyentes pirrolidilo, N-etil N-fenil, NN-di-ciclohexil y N-isoamil N- fenil. No se encontraron diferencias sustanciales de IS para el caso que los complejos tuvieran como estado electrónico fundamental el 6^A_1,caso del pirrolidil derivado o el 2^T_2 , que corresponde a los demás casos. Esto implica que no existe la diferencia intrínseca en los parámetros de EM que postulan algunos autores para los complejos de alto spin y bajo spin. Es decir que la transición complejo alto spin a complejo de bajo spin de por si no cambia la distribución de electrones s y d, por lo que no hay variación de IS, o sea que la distribución electrónica está determinada por la naturaleza de los ligantes y el hecho de pasar del caso de spin alto al de spin bajo, manteniendo los mismos ligantes y la geometría de la molécula, no tiene mayor influencia, al menos en este caso. Se encontró también que para estas sustancias existe una correlación entre el momento magnético y el IS, disminuyendo ambos en forma paralela. Esto se puede explicar si se asimila la disminución del IS a un aumento de la covalencia, lo cual se puede indicar como debido a una deformación de la esfera de coordinación, ocasionada por razones electrónicas y estéricas. También se determinó una relación entre el momento magnético y la separación cuadrupolar (QS), correspondiendo un aumento de uno de ellos a una disminución del otro, lo que se puede atribuir a diferentes contribuciones de las estructuras de alto y bajo spin a la QS. Mediante un cálculo muy grosero, a partir de los momentos magnéticos, se encontró que la separación entre los niveles 6^A_1 y 2^T_2 es de aproximadamente 640 cm^-1 para el metil derivado, mientras que para el butil derivado es de alrededor de 275 cm^-1, siendo el triplete orbital en ambos casos el de menor energía. Se demuestra asimismo como una reducción de simetría desdobla el nivel 2^T_2 posibilitando un aumento de la unión Π. Como cuarto tópico de esta tesis se estudiaron los halo-bis ditiocarbamatos de Fe (III) pentacoordinados, producidos accidentalmente y mal caracterizados en la literatura previamente. Se encontró que su IS es muy similar al de los nitrosil-bis ditiocarbamatos de Fe (II) , lo que prueba una vez más la afirmación que un determinado rango de IS no es privativo de un estado de oxidación dado. Por el otro lado el alto valor de sus QS fue el toque de atención que llevó a la identificación de esas sustancias pues valores tan grandes de QS como los hallados, del orden de 0,260 cm/s, solo se podían concebir con una desviación muy grande de la simetría. Esto muestra una vez más que una adecuada interpretación de los parámetros de EM puede ser útil como diagnóstico estructural. El propósito fundamental de este trabajo ha sido demostrar la utilidad del EM como herramienta tanto independiente como complementaria de otras técnicas espectroscópicas para la determinación de estructuras químicas de compuestos de Fe.

Abstract:
This work analyzes if recoilless gamma radiation (Mössbauer Effect, ME) is an enough sensible technique to detect small structural changes in chemical compounds, particularly in iron complexes. For this purposes several systems were used. In first place a series of Fe(II) nitrosil-bis dithiocarbamates, is studied, for which the substituent R is methyl, ethyl, isopropyl and phenyl , whose ME parameters were compared with their infrared spectra (IR), specially with the NO stretching frequency and with the results of electronic spectroscopy and electronic paramagnetic resonance (EPR). It was found that both ME as IR and EPR provide information which can be interpreted in a coherent way on basis of a larger displacement of the charge density of the alkyl group towards the iron atom and the nitrosil group, in the sequence Me, Et, iPro, whereas electronic spectroscopy is not sensible to such small changes. Additionally we conclude that none of the correlation diagrams of isomer shift (IS) vs. s orbital population available in the literature is useful to discuss strong covalent substances like these. Numerous considerations on the kind of chemical bonding existing in these compounds are made. The main conclusion is that the ME parameters, at least in Fe, are sensible to variations of the chemical structure which are produced at a distance of 4 or 5 atoms from the mentioned nucleus. In second place the EM spectra of frozen solutions of ^= and its electrolytic reduction product are studied. It was found that within the sensibility of the equipment there is no difference in the ME parameters of the frozen solution and the crystalline species, proving that it is possible to measure spectra in frozen solutions. This opens the possibility to measure ME in species which can not be isolated at the solid stat and frees the way to the measurement of the kinetics of reactions in solution. On the other hand on base of the obtained ME parameters it is found that the product obtained in the electrolytic reduction is ^= and not ^3- as usually supposed. In third place a series of Fe(III) tris dithiocarbamates, with substituents R =n-butyl, ethyl, methyl, benzyl and di-isopropyl was measured, comparing them with data from the literature for derivatives with substituents pyrrolidil, N-ethyl N-phenyl, NN di-cyclohexyl and N-isoamyl N- phenyl. No substantial differences in the IS were found for the cases were the complexes have an electronic fundamental state of 6^A_1, as in the case of the pyrrolidil derivative or of 2^T_2 , which corresponds to the other cases. This implies that the intrinsic difference in ME parameters which are postulated by several authors for high spin and low spin complexes, does not exist. This means that the transition from a high spin complex to a low spin complex does not change by its own the s and d electron distribution, and therefore there is no change in the IS. Therefore the electronic distribution is determined by the nature of the ligands and that the fact of passing from the high spin case to the low spin case, keeping the same ligands and the geometry of the molecule, has not a major influence, at least in this case. It was found as well that a correlation exists for these substances between the magnetic moment and the IS, decreasing both in a parallel way. This can be explained if the reduction of IS is assimilated to an increase of covalence, which can be assigned to a deformation of the coordination sphere due to electronic and steric effects. A relation between the magnetic moment and the quadrupole splitting (QS) was found. An increase of one of them corresponds to a decrease of the other one, which can be attributed to different contributions of the high spin and low spin structures to the QS. Using a rough calculation, based on their magnetic moments, it was found that the separation between the 6^A_1 y 2^T_2 levels is approximately 640 cm^-1 for the methyl derivative whereas for the butyl derivative it is around 275 cm^-1, being in both cases the orbital triplet the lower energy state. Also it is shown how reduction of symmetry splits the 2^T_2 level allowing an increase of the Π bonding. As a fourth item of this thesis the accidentally produced pent coordinated halo-bis dithiocarbamates Fe (III) were studied. It was found that their IS is very similar to those of the Fe(II) nitrosil-bis dithiocarbamates, which proves once again the affirmation that the determination of a certain range of IS is not privative of a certain oxidation state On the other hand the high value for the QS of the order of 0,260 cm/s, was the warning which allowed the identification of these substances as such large QS values only could be conceived with a very large deviation from symmetry. This shows once again that an adequate interpretation of ME parameters can be useful as a structural diagnosis. The main purpose of this work has been to show the usefulness of the ME as well as an independent tool or as a complementary tool for other spectroscopic techniques for the determination of chemical structures for Fe compounds.

Frankel, Nicolás. "Aproximación a la evolución y función de la familia génica Asr" (2006). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los genes Asr están presentes en plantas con semilla formando, en general, familias génicas de pocos miembros. Su función precisa es desconocida hasta el momento, pero estudios recientes llevan a pensar que estos genes son factores de transcripción involucrados en la regulación del transporte de azúcares en la planta. En esta tesis hemos analizado la evolución de la familia génica Asr en plantas con semilla con un especial énfasis en el género Lycopersicon (tomates). Encontramos que las relaciones de ortología de las proteínas ASR pueden definirse sólo entre especies cercanas evolutivamente. En un árbol filogenético, las proteínas ASR de tomate y papa forman un cluster consistente, separado de las ASR de otras dicotiledóneas, monocotiledóneas y gimnospermas. Las dos observaciones anteriores pueden explicarse por eventos de evolución concertada y “nacimiento y muerte” de genes. Asimismo, investigamos la evolución de los cuatro Asr en especies silvestres de tomate y pudimos comprobar que Asr1 tiene una evolución más lenta que los otros tres genes, tanto a nivel sinónimo como de reemplazo. Creemos que este patrón se debe a sus altos niveles de expresión y a sus diversas funciones en distintos tejidos de la planta. Además, hemos generado plantas transgénicas de papa (Solanum tuberosum) y tabaco (Nicotiana tabacum) que sobreexpresan o tienen silenciado el gen Asr1. Del análisis de estas plantas podemos concluir que este gen regula los niveles de hexosas en la célula, pero no de otros azúcares. En este sentido, tenemos evidencias que indican que Asr1 estaría directa o indirectamente controlando los niveles de algunos transportadores de hexosas en tejidos “destino”, por lo tanto actuando como regulador de la importación de estos azúcares. Por último, por medio de microscopia de fuerza atómica, observamos el pegado de la proteína ASR1 al ADN. Confirmando evidencia previa, vimos dímeros de ASR1 interaccionando con un ADN doble cadena.

Abstract:
Asr genes are present in the genomes of seed plants, in general forming small gene families. Their precise function is currently unknown, but recent reports have suggested that Asr genes encode transcription factors involved in the regulation of sugar mobilization in planta. In this thesis we have analyzed the evolution of the Asr gene family in seed plants and particularly focused in the genus Lycopersicon (tomatoes). We have found that the orthology relations among the members can only be inferred between closely related species. In a phylogenetic tree, ASR proteins from tomato and potato form a consistent cluster, separated from ASRs from other dicots, monocots and gymnosperms. These observations can be explained by events of concerted evolution and “birth and death of genes”. At the same time, we investigated the evolution of the four Asrs in tomato wild species. We could see that Asr1 has a slower evolutionary rate both at synonymous and replacement sites when compared to the other three genes. We think that this pattern is caused by its high expression level and multiple functions in different tissues of the plant. In addition, we generated potato (Solanum tuberosum) and tobacco (Nicotiana tabacum) transgenic plants that overexpress or silence Asr1 gene. From the analysis of these plants we can conclude that this gene is regulating the quantities of hexoses (but not other sugars) in the cells. In this direction, we have evidence supporting that Asr1 would be directly or indirectly involved in controlling the levels of hexose transporters in “sink” tissues, thereby acting as a regulator of hexose uptake. Finally, by means of atomic force microscopy, we observed ASR1 protein bound to DNA. Corroborating previous evidence, we saw ASR1 dimers interacting with double-stranded DNA.

Fraschina, Jimena. "Efectos de cambios en el uso de la tierra sobre ensambles de roedores en agroecosistemas pampeanos" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo general de esta tesis fue analizar el efecto del uso de la tierra y de variables climáticas sobre las comunidades de roedores en un agroecosistema pampeano a distintas escalas temporales y espaciales. Para ello se realizaron muestreos estacionales de roedores durante 2006-2008 en los distintos ambientes presentes en el área de estudio y se analizaron datos de abundancia de roedores y de variables climáticas desde 1984 hasta 2008. También se compararon las abundancias de roedores y características de la vegetación entre los periodos anterior y posterior a la expansión de la soja. Las fluctuaciones en las abundancias de roedores estuvieron relacionadas con la precipitación, pero la tendencia a la disminución observada en .Calomys laucha y Calomys musculinus fue mejor explicada por cambios en el uso de la tierra que por las variables climáticas. Excepto las granjas avícolas, que serían las principales responsables del mantenimiento de M. musculus en el área, el resto de los ambientes estudiados presentaron composición similar de especies, aunque con abundancia variable. Los terraplenes de vía, los arroyos y los bordes de pastizal y cultivo, jugarían un papel importante en el mantenimiento de O. flavescens y O. rufus, y en gran medida de A. azarae, aunque esta última también hace uso de los campos de cultivo. A una escala de paisaje, los campos de cultivo son el ambiente que más aporta a la abundancia total de roedores ya que si bien no presentan una alta densidad, ocupan más del 88% del área total.

Abstract:
The goal of this work was to assess the effect of land use and environmental variables on rodent communities of pampean agroecosystems. We conducted rodent samplings during 2006-2008 in different habitats of the Exaltación de la Cruz Department, Buenos Aires Province, Argentina. We also analyzed rodent abundance and climatic data from a time series for the period 1984 to 2008 in order to assess if there were trends of change in rodents or climatic variables, and we compared rodent abundance and vegetation data between the years after and before the expansion of the soybean.. Fluctuations in rodent abundance were related to precipitation, but the trend to decrease observed in Calomys laucha and Calomys musculinus was better explained by land use changes than by climatic variables. Poultry farms were the more distinct habitat with regard rodent species, and the presence of Mus musculus was fully dependent on this habitat. The other habitats presented similar species composition but with variable abundance. Borders of cropfields, grasslands, and streams, and railway terraces were fundamental for maintaining Oligoryzomys flavescens and Oxymycterus rufus populations, and in less degree Akodon azarae, because this species may also use the cropfields. Although rodent abundance is low in cropfields, at a landscape level this habitat has the highest contribution to abundance, because it occuppies more than 88 % of the total area.

Fratantoni, Silvina Andrea. "Estudio inmunohistológico y electrofisiológico de la motoneurona en un modelo de transmisión pasiva de Esclerosis Lateral Amiotrófica" (1999). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA) es la enfermedad neuromotora humana más común. Los individuos que la padecen muestran disfunción y degeneración progresiva de motoneuronas cerebrales, de la protuberancia y de la médula espinal lo cual se manifiesta clínicamente como una debilidad muscular progresiva, parálisis y muerte dentro de los 3 a 5 años del diagnóstico. No existe una cura para esta enfermedad y su patofisiología permanece sin aclarar. Evidencias clínicas y experimentales apoyan la posibilidad de que un mecanismo autoinmune esté involucrado en la patogénesis de ELA. En trabajos anteriores de nuestro laboratorio se ha demostrado que la aplicación de inmunoglobulina G (IgG) de pacientes con ELA sobre terminales motores inducen una disfunción de la transmisión neuromuscular. Estudios animales han establecido que fisiológicamente la IgG y otras proteínas séricas endógenas son endocitadas por los terminales nerviosos de la placa neuromuscular. Estas proteínas pueden ser localizadas por técnicas inmunocitoquímicas en los somas donde se acumulan luego de ser transportadas por transporte axonal retrógrado. El objetivo de la primera parte de la tesis fue analizar si la captación de IgG es cuantitativamente diferente en el caso que la misma provenga de pacientes con ELA o de IgG controles (pacientes con otras enfermedades neurológicas o personas sanas). Para ello, hemos investigado la presencia de IgG humana de pacientes con ELA e IgG control en los somas de las motoneuronas de ratón. La IgG fue aplicada sobre los terminales motores del músculo elevador de la oreja del ratón, Levator auris longus, el cual está inervado por una rama del nervio facial. La fracción sérica de 7 pacientes con ELA, 6 sujetos controles y 3 pacientes con otras enfermedades neurológicas fue inyectada subcutáneamente dos veces por día durante 5 dias (50 μl cada vez de una solución de IgG 20 mg/ml). Secciones del tallo cerebral conteniendo el núcleo del facial fueron procesadas por inmunocitoquímica para detectar IgG humana y la inmunotinción fue cuantificada con un analizador de imágenes. Para todas las IgG consideradas, la tinción en las motoneuronas del núcleo del facial del lado ipsilateral al sitio de la inyección fue significativamente más intensa. En los animales tratados con IgG de ELA, la marca ipsilateral fue significativamente más alta que la encontrada en el lado ipsilateral de los animales inyectados con IgG control. Nuestros resultados son compatibles con el concepto de que las motoneuronas preferencialmente captan, transportan y/o acumulan IgG de ELA. La captación de anticuerpos patogénicos por terminales motores podrían tener un rol en la patogénesis de la enfermedad de la motoneurona. Para definir el posible rol de las IgG de ELA en la inducción de la disfunción de la transmisión neuromuscular, fue nuestro interés estudiar si la participación de canales de calcio voltaje dependientes (CCVD) puede ser alterada por la transmisión pasiva dichos anticuerpos. En la placa neuromuscular de humanos adultos y también en la placa de ratón, la transmisión sináptica está mediada por la entrada de calcio a través de CCVD del tipo P/Q. Otros canales de calcio, como los de tipo L y N, no están involucrados en la liberación de neurotransmisor. Sin embargo, en nervios en regeneración, la conducción de señales y la transmisión sináptica se hacen altamente sensibles a la nitrendipina, una dihidropiridina bloqueante de los canales de calcio de tipo L, sugiriendo que este canal estaría involucrado en la liberación de neurotransmisor. A fin de estudiar si la aplicación de IgG humana sobre los terminales motores induce cambios en la transmisión neuromuscular, IgG de pacientes con ELA y de sujetos controles fue inyectada subcutáneamente sobre el músculo Levator auris del ratón. La fracción sérica de 8 pacientes con ELA y 6 sujetos controles (3 sujetos sanos y 3 pacientes con otras enfermedades neurológicas) fue inyectada subcutáneamente dos veces por día durante 5 días (50 μl cada vez de una solución de IgG 20 mg/ml). Una semana o un mes después de la ultima inyección, los ratones fueron anestesiados y los músculos removidos en solución Ringer normal. El músculo fue montado en una cámara de registro y el nervio fue estimulado por medio de un electrodo de succión. Los potenciales de placa fueron registrados en por lo menos l5 fibras musculares distintas antes y después de la incubación con Nitrendipina l μM o toxinas polipeptídicas. El contenido cuántico de la respuesta evocada fue evaluado por el método de la varianza. No se observaron cambios en el contenido cuántico de la liberación de neurotransmisor. En los músculos tratados con IgG de ELA o IgG control, la liberación del neurotransmisor permaneció sensible a los bloqueantes de CCVD de tipo P/Q e insensibles al bloqueante de tipo N, como ocurre en los músculos sin tratar. En contraste, las IgG de 5 pacientes distintos de ELA indujeron una reducción significativa en el contenido cuántico de la respuesta evocada luego de la aplicación de Nitrendipina. Esto indicaría que una sensibilidad nueva a este bloqueante de CCVD aparece en los terminales tratados con IgG de pacientes con ELA. Estos resultados sugieren la participación del canal de calcio voltaje dependiente de tipo L en el proceso que llevaría a la muerte neuronal inducida por las inmunoglobulinas de ELA.

Abstract:
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is the most common human motor neuron disease. Affected individuals show progressive dysfunction and degeneration of brain, brainstem and spinal cord motor neurons, clinically manifested as progressive muscular weakness, paralysis and death within a mean of 3 years. There is no cure available for this disease and its pathophysiology remains unclear. Clinical and experimental evidence support an autoimmune etiopathogenesis for ALS. Previous studies in our laboratory have shown that local application of immunoglobulin G (IgG) of ALS patients onto nerve terminals induces dysfunction in neuromuscular transmission. In animal studies, it has been established that endogenous IgG and other circulating serum proteins can be taken up by motor nerve terminals. They can be detected by immunocitochemistry in the motoneurons somas where they accumulate following retrograde axonal transport. We investigated the presence of human ALS and control IgG in the soma of mice motoneurons. IgG was applied onto motor nerve terminals by injections on the levator auris longus muscle which is innervated by a branch of the facial nerve. The seric IgG fraction of 7 ALS patients, 6 control subjects and 3 patients with other neurological diseases was injected subcutaenously, twice a day for 5 days, on the surface of the left Levator auris longus muscle of adult mice (50 μl of 20 mg/ml IgG in PBS per application). Sections of the brainstem containing the facial nuclei were immunoprocessed to detect human IgG. For all lgG tested, motoneuron labeling was significantly more intense in the facial nucleus ipsilateral to the site of injection. In ALS-IgG-treated animals, ipsilateral labeling was significantly stronger than that found on the ipsilateral side of control IgG-treated animals. Our results are compatible with the concept that motoneurons preferentially take up, transport and/or accumulate ALS-IgG. Uptake of pathogenic antibodies by motoneuron terminals may play a role in the pathogenesis of motoneuron disease. At both the mature mouse and human neuromuscular junction, synaptic transmission is mediated by Ca² entry through voltage-sensitive calcium channels (VSCCs) of the P/Q-type family. Other calcium channels, like the L- and N-type, are not involved in neurotransmitter release. However. in regenerating nerves, signal conduction and synaptic transmission become highly sensitive to Nitrendipine, a dihydropyridine antagonist of L-type calcium channel, suggesting that this type of calcium channel mediate transmitter release. Therefore, to further define the possible role of ALS IgG in the induction of NMJ dysfunction, it was our interest to study if the participation of other types of VSCCs in transmitter release can be induced by passively transferring these antibodies, as it was found in regenerating NMJ. In order to search for early changes induced by the application of human IgG onto the motor nerve terminals, IgG from ALS patients and control subjects was injected on the mice Levator auris muscle. The seric IgG fraction of 8 ALS patients and 6 control subjects (3 healthy subjects and 3 with other neurological diseases) was injected subcutaenously, twice a day for 5 days, on the surface of the left Levator auris longus muscle of adult mice (50 μl of 20 mg/ml IgG in PBS per application). A week or a month after the last injection, mice were anesthetized and the muscle removed in Normal Ringer solution. The muscle was mounted in a recording chamber and the nerve was stimulated by a suction electrode. The end plate potentials were recorded from at least 15 different muscle fibers before and after the incubation with l μM Nitrendipine or polipeptidic toxins. The mean quantal content of the evoked response was evaluated by the coefficient of variation method. No changes in quantal content of transmitter release were observed. In control and ALS IgG treated muscles, neurotransmitter release remained sensitive to P/Q-type and insensitive to N-type VSCC blockers as in untreated muscles. In contrast, IgG from 5 of 8 different ALS patients induced a significant reduction in the quantal content of the evoked response afler the incubation with Nitrendipine, indicating that a novel sensitivity to this calcium channel blocker appears in these motor nerve terminals. These results suggest the involvement of L-type VSCC in the process leading to neuronal death induced by ALS IgG.

Freire, Eleonora. "Estructura de compuestos de coordinación conteniendo oxoaniones de azufre y metales de transición" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo original de este trabajo fue la preparación, caracterización y determinación de las estructuras cristalinas de nuevos compuestos de coordinación de metales de transición con el ion tiosulfato y moléculas orgánicas nitrogenadas como ligandos. Entre estas últimas, el estudio se centró particularmente en aquellas que actúan como ligandos polidentados a través del nitrógeno como átomo donor (bipiridina, terpiridina, fenantrolina y otros). Los oxoaniones de azufre son buenos ligandos de metales de transición. El ion tiosulfato (S2O32-) en particular, había sido poco estudiado al momento de comenzar de este trabajo. La presencia en su estructura de átomos donores "duros" y "blandos", de acuerdo con la clasificación de Pearson, hace que pueda coordinarse a una amplia gama de iones metálicos mostrando una gran versatilidad en sus modos de coordinación. Prueba de ello es que entre los veintidós compuestos estudiados, se encontraron además de las coordinaciones más esperables (monodentado a través del azufre y bidentado por azufre y oxígeno) otras no reportadas anteriormente donde el anión se presenta como polidentado y puente, utilizando para tal fin el azufre y/o los oxígenos. En muchos casos la coordinación afecta muy significativamente los parámetros estructurales del anión (distancias y ángulos) corroborando lo encontrado en estudios anteriores. En algunos casos particulares (Ni(II) y Mn(II) como cationes, biquinolina y terpiridina ligandos orgánicos), además de obtenerse complejos con el ión tiosulfato se produjeron reacciones colaterales tipo redox que llevaron a la formación de especies del tipo 2'con n 2 ó 3. El estudio de este nuevo grupo de compuestos, que no es muy común en la literatura, permitió ampliar el objetivo inicial del trabajo. En todos los casos, se estudiaron las propiedades y caracteristicas de los ligandos poliatómicos intervinientes en lo que hace tanto al tipo de unión como a los eventuales efectos debidos a la coordinación, aportando abundante información sobre un terreno hasta el momento poco explorado. El estudio estructural incluyó el análisis de los poliedros de coordinación, así como el de las fuerzas secundarias determinantes del empaquetarniento cristalino, tales como las uniones puente hidrógeno y las interacciones tipo van der Waals.

Abstract:
The original aim of the project was the synthesis, characterization and structure determination of novel transition metal coordination compounds with thiosulfate and nitrogenated bases as ligands. Among the latter, we focussed specially in the polydentate ones containing donor nitrogens (bipyridine, terpyridine, etc). Sulfur oxoanions are good ligands for transition metals. The thiosulfate ion (S2O3 2-) in particular, had been scarcely studied at the beginning of this work. As it contains hard and soft donors atoms, according to Pearson classification, it is likely for the anion to coordinate to a wide range of metallic cations displaying a high versatility in its coordination modes. This property was largely confirmed throughout this work: among the twenty two compounds studied, not only the more common coordination modes were found (S-monodentate and S, O bidentate), but also a couple of new ones not already reported in the literature, where the anion acts as polydentate and bridge through sulfur and/or oxygen. In most cases the coordination largely affects the structural parameters of the anion (angles and distances), as already shown in previous works. In the presence of either Ni(II) or Mn(II) as cations, and some of the organic ligands (biquinoline, terpiridine), in addition to the expected thiosulfate complexes, collateral redox reactions led to the formation of 2'species with n = 2 or 3. The study of these new group of compounds, scarce in the literature, allowed us to broaden the initial scope of the work. In all cases, basic knowledge about the properties and characteristics of the polyatomic ligands about bond types and possible modificatíons eventually introduced by coordination was obtained, contributing to a field so far basically unexplored. Besides the structural analysis of coordination polyhedra, secondary coordination forces (van der Waals interactions and hydrogen bonds) which determine the crystal lattice were studied.

Freitas, José Nahuel. "Termodinámica y simulaciones cuánticas en trampas de iones" (2017-03-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis se estudian fundamentos de termodinámica en sistemas cuánticos lineales. Se desarrolla una teoría general que permite estudiar procesos periódicos sobre redes armónicas acopladas a entornos bosónicos. Se muestra cómo las leyes usuales de la termodinámica clásica emergen a partir de la dinámica determinista del sistema. Además, los resultados obtenidos son utilizados para estudiar procesos termodinámicos en situaciones arbitrariamente alejadas del equilibrio térmico y del límite termodinámico. El formalismo desarrollado aquí es exacto y no requiere de ciertas aproximaciones que son comunmente usadas en la literatura (acoplamiento débil y dinámica Markoviana). Esto permite entender cuáles son las consecuencias de utilizar estas aproximaciones, y establecer precisamente el rango en el que pueden ser aplicadas, lo cuál es de utilidad en otros modelos donde una solución exacta no es posible. Este desarrollo también aclara ciertas confusiones existentes en la literatura respecto de la versión dinámica de la tercera ley de la termodinámica, dado que se obtiene una demostración novedosa de la validez de esta ley para una familia general de máquinas térmicas. Por último, se proponen experimentos en sistemas de iones atrapados para simular procesos de transporte de energía y transiciones de fase en materiales magnéticos.

Abstract:
This thesis studies foundations of thermodynamics in quantum linear systems. A general theory is developed to study periodic processes in harmonic networks that are connected to bosonic reservoirs. It is shown how the usual thermodynamical laws emerge from the deterministic dynamics of the system. Furthermore, the obtained results are employed to study thermodynamical processes in non-equilibrium regimes which are far from the thermodynamical limit. The developed formalism is exact and does not require some approximations that are commonly used in the literature (the weak coupling and Markovian limits). This feature allows to understand what are the consequences of using these approximations, and to establish precisely when they can be employed, which is useful in other models where an exact solution is not available. This development also clarifies some confusions existing in the literature regarding the dynamical version of the third law of thermodynamics, since it is possible to obtain a novel proof of its validity for a general family of thermal machines. Finally, some experiments with trapped ions are proposed to simulate energy transport processes and phase transitions in magnetic materials.

Fresina, Mirta Elida. "Comportamiento hidrogeológico-hidroquímico del acuífero pampeano en la Cuenca inferior del Río Carcaraña, Provincia de Santa Fe" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo de Tesis, se encara el estudio de la evolución hidroquímica creciente de las aguas freáticas de la cuenca inferior del río Tercero - Carcarañá desde las posibles áreas de recarga a la de descarga. Para tal fin se analizaron y establecieron los parámetros, que permitieron subdividir la Cuenca inferior en cuatro Sub-cuencas respondiendo a una litología, hidrología y química. Para la realización del trabajo se partió de la interpretación cartográfica que permitió complementar la información geomorfológica existente, además de establecer el diseño de la red hidrográfica y poder definir la división del area considerada en Sub-cuencas. Se individualizaron los suelos presentes en la región y sus usos tanto actuales como potenciales. En base a datos climatológicos de 90 años se determinaron los tipos de clima, se evaluó el escurrimiento superficial y se calculó la infiltración a partir del Balance Hídrico. El estudio textura], mineralógico y químico de siete perfiles permitió conocer detalladamente las caracteristicas los sedimentos pampeanos, en los cuales se aloja el acuífero libre. Por último se realizó un análisis hidrodinámico e hidroquímico del acuífero freático comprobando estadísticamente las relaciones presentes entre iones. Los estudios anteriores permitieron individualizar cuatro Sub-cuencas superficiales, delimitadas por las divisorias y que presentan ligeras variaciones de clima, distintos tipos de suelos y diferentes pendientes topográficas; estas Sub-cuencas superficiales coinciden con cuatro zonas con distinta hidrodinámica, en donde la calidad química del agua subterránea presenta notorias diferencias. A su vez se estableció un orden de ponderación en la participación de las variables fisicoquímicas, en la sensibilidad del sistema. De esta manera, se verificó que, cuando la pendiente de la llanura es inferior al 0.55 ‰,actúan principalmente los parámetros fisicos de desplazamiento vertical del agua, infiltración (I), precipitación (Pp), evapotranspiración real (EvR) y cuando la pendiente topográfica supera el 0.55 ‰ comienzan a actuar los parametros físicos con tendencia al desplazamiento horizonta del agua, escurrimiento superficial (Es), gradiente subterráneo (G.S), velocidad efectiva (Ve), pendiente topográfica (Pte). Así, las cuencas en donde predominan las variables fisicas de actividad horizontal sobre las de actividad vertical, presentan mejor calidad química en el agua subterránea, que a la inversa. Las cuencas en donde predominan tanto las variables físicas de actividad horizontal como las variables físicas de actividad verticales, tienen la mejor calidad química. Las cuencas en donde no predominan ningua de las variable físicas, ni de actividad horizontal ni vertical, tienen la mala calidad química.

Abstract:
The following doctoral paper concerns the study of the increasing hydrochemical evolution of the freatic waters of the lower basin of the Tercero- Carcarañá River from the possible area of refilling to that of the refill itself. To that aim, parameters were established and analyzed in order to subdivide the lower basin into four sub-basins according to certain lithography, hydrology and chemistry. In order to perform this task, the starting point considered was the cartographic interpretation which allowed to complete the already existing geomorphologic information, apart from allowing for the mapping of the hydrographic net and to be able to define the division of the areas considered under sub-basins. The soil surfaces present in the region were individualized as well as their present and potential uses. Based on 90- year climatology data, kinds of weather were determined, superficial oozing was evaluated and the infiltration as from the Hydro. Balance was estimated. The textural, mineralogical and chemical 7- profile study made it possible to know in detail the characteristics of the Pampean sediments, in which the free aquifer is located. Lastly, a hydrodynamic and hydrochemical analysis of the freatic aquifer was made statistically checking the present relationships among ions. The above mentioned studies allowed us to individualize four superficial sub-basins, limited by divisor lines and which present slight variations in weather, different kinds of soil and different topographic slopes; these superficial sub-basins coincide with four areas of different hydrodynamics, in which the chemical quality of underground water shows notorious differences. At the same time, a weighting order was established in the participation of the physical chemical variables in the sensitivity of the system. In this way, it was verified that when the slope of the plain is lower than 0,55 ‰ the main determiners are the physical parameters of vertical moving of the water, infiltration (I), precipitation (Pp), real evapotransportation (EvR) and when the topographic slope is higher than 0,55 ‰ the physical parameters beginning to act tend to horizontal moving of the water, superficial moving (Es), underground gradient (S G), effective velocity (E V) and topographic slope (Pte). In this way, those basins in which physical variables of horizontal activity prevail over those of vertical activity present better chemical quality in underground water than in the opposite case. Those basins, in which both physical variables of horizontal activity as well as physical variables of vertical activity prevail, possess the best chemical quality. Those basins in which neither of the physical variables predominate- that is- neither horizontal nor vertical activity- present bad chemical quality.

Freudenthal, Ramiro A.M.. "Participación de factores de transcripción de la familia Rel/NF-kappa B en procesos de plasticidad y memoria" (2006). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La memoria de largo término y la plasticidad neuronal comparten varias características,incluyendo las fases temporales de mecanismos celulares y moleculares: la inducción requiere de un aumento de calcio intracelular, la persistencia temprana depende de la activación de quinasas y las etapas tardías necesitan de transcripción génica y de la síntesis de proteínas. Desde los primeros experimentos en los cuales se logro amnesia inhibiendo la síntesis proteica, se especula acerca de la función de factores de transcripción (FT) específicos, en la regulación de la expresión génica necesaria para la perdurabilidad tanto de fenómenos mnésicos como de la plasticidad neuronal. Este trabajo se concentro en dos aspectos de la función del FT NF-kappa B en la consolidación de la memoria de largo término y la plasticidad neuronal. El primer aspecto se refiere a la activación del FT luego de inducidos estos fenómenos, y el segundo a la conservación evolutiva de la función de esta vía de transducción desde crustáceos a mamíferos. Para los propósitos de este trabajo se evaluó la activación de este FT en tres modelos: la consolidación de la memoria de largo termina (MLT) en el cangrejo Chasmagnathus granulatus, un paradigma evitación inhibitoria en ratón y la inducción de potenciación de largo término in vivo de la vía perforante del hipocampo de ratón. La presencia de la vía de regulación transcripcional Rel/NF-kappa B, se determinó en el cangrejo por retardo electroforético (EMSA), Western Blot, inmunoprecipitación, unión covalente con irradiación ultravioleta e inmunohistoquímica. En el cangrejo, un protocolo que induce una MLT es seguido por una activación bifásica de unión al ADN por parte del NF-kappa B, mientras que un protocolo que induce una memoria de corto término no activa al FT. NF-kappa B se encuentra presente en las terminales sinápticas, en donde es activado por protocolos de entrenamiento que inducen MLT. El curso temporal de la activación de NF-kappa B nuclear en hipocampo, se estudió por EMSA, después del entrenamiento de un ensayo, en el paradigma de evitación inhibitoria en ratón. Mostrando, cuando se lo comparo con los animales naive, una inhibición del FT luego de 15 min. del entrenamiento seguida por una activación a los 45 min. tanto en los animales que sufrieron un shock eléctrico, como en los que fueron expuestos al contexto sin shock. En esta misma línea argumental, encontramos que la inyección intra cerebro ventricular (icv) de sulfasalazina inmediatamente post-entrenamiento impide la formación de la memoria de largo término. Más aún, una segunda estrategia independiente para inhibir el NF-kappa B en el cerebro, la administración icv de un oligonucleótido doble cadena de ADN conteniendo la secuencia consenso de NF-kappa B (kB Decoy) también resulta amnésica. Cuando se estudian los EMSAs de extractos nucleares de hipocampo de ratón, se observa que animales tetanizados (protocolo inductor de potenciación de largo término) muestran, luego de 15 min. un aumento en la actividad de unión al ADN, cuando son comparados con, animales estimulados a baja frecuencia (EBF) y animales naive. Los hipocampos al ser analizados por inmunohistoquímica con un anticuerpo contra la forma activa del factor, muestran la misma tendencia general pero con patrones celulares de activación más complejos. Estos resultados indican, primero que la actividad de unión al ADN del NF-kappa B es necesaria para la consolidación de memorias de largo término. Y el tratamiento con inhibidores específicos de NF-kappa B, suficiente para generar amnesia en los animales inyectados. A la vez que muestra un patrón temporal claramente delimitado en el cual el factor es necesario para la consolidación. Igualmente significativa es la activación del FT luego de inducida la plasticidad neuronal, mostrando un papel en el proceso de potenciación. El segundo aspecto de este trabajo sugiere que la vía de transducción señales de NF-kappa B se encuentra conservada, en su función fisiológica en el sistema nervioso, entre invertebrados y vertebrados.

Abstract:
Long term memory and neural plasticity share several characteristics, including the temporal phases of molecular and cellular mechanisms: the induction requires an increment on intracellular calcium, early persistence depends on the activation of kinases and the late steps need gene expression and protein synthesis. Since the first experiments in which amnesia was produced by protein synthesis inhibition, it has been speculation about the role of specific transcription factors (TF) in the regulation of the gene expression needed for the lasting of mnesic processes such as neural plasticity. This thesis concentrates on two aspects of the function of TF NF-kappa B during long term memory consolidation and neuronal plasticity. The first, concerns it’s activation after the induction of these phenomena, and the second concerns the evolutionary conservation of this signaling pathway from crustaceans to mammals. For the purpose of this thesis, the activation of NF-kappa B was evaluated in three models: long term memory (LTM) consolidation in the crab Chasmagnathus granulatus, inhibitory avoidance in mice and the induction of in vivo long term potentiation, of the hipocampal perforant pathway in mice. The presence of the Rel/NF-kappa B transcriptional regulatory pathway in Chasmagnathus was studied by Electro Mobility Shift Assay (EMSA), Western Blot, Immunoprecipitation, Ultraviolet Crosslinking and Immunohistochemistry. In the crab, a protocol that induced LTM, is followed by a a bifasic activation of the DNA binding activity of the TF, while a protocol that induces short term memory does not activate NF-kappa B. This TF is present at the synaptic terminals, where it is activated by the LTM inducing training protocols. The temporal course of nuclear NF-kappa B activation in mice hippocampus, was studied by EMSA, after the one trial inhibitory avoidance training. Showing, when compared with naive animals, an inhibition 15 min. after training, followed by activation after 45 min., both in the animals that received shock and the ones only exposed to the context. In the same line of evidence, animals injected intra cerebro ventricular (icv) with sulfasalazine (an inhibitor of NF-kappa B activation) immediately after training impede the formation of LTM. What is more, an independent and more specific form of NF-kappa B inhibition, the icv injection of a double stranded DNA containing the TF consensus sequence (kB decoy), results amnesic. When we studied EMSAs of hippocampal nuclear extracts, tetanized mice (a protocol that induces potentiation) shows, 15 min after, an augment in DNA binding activity, in contrast with low frequency stimulated and naive mice. Immunohistochemical analysis with an antibody against the active form of the transcription factor, showed the same tendency but with a more complicated cellular pattern of activation within the hipocampal structure. These results indicate, first that the DNA binding activity of the TF is necessary for LTM and that the treatment with NF-kappa B specific inhibitors is sufficient to generate amnesia in the injected animals. At the same time it shows that a clear temporal pattern of activation is needed for consolidation. Equally significant is the activation of TF after the induction of neural plasticity, showing a role in this process. The second aspect suggested by this work, is that the Rel/NF-kappa B pathway is conserved in its physiological function between invertebrates and vertebrates.

Freytes, Héctor. "Objetos inyectivos en estructuras residuadas. Forma algebraica del teorema de Cantor - Bernstein - Schröder" (2004). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La presente tesis es un estudio de objetos inyectivos en clases de estructuras residuadas asociadas con la lógica y del teorema de Cantor - Bernstein - Schröder. En la primera parte se investigan inyectivos y retractos absolutos en clases de retículos residuados y pocrims. Algunas de las clases consideradas son las MTL-álgebras, IMTL-álgebras, BL-álgebras, NM-álgebras y los hoops acotados. En la segunda parte es desarrollado un marco algebraico para la validez del teorema de Cantor-Bernstein-Schröder aplicable a álgebras con una estructura subyacente de retículo tal que los elementos centrales de este retículo determinan una descomposición directa del álgebra. Se dan condiciones necesarias y suficientes para la validez del teorema de Cantor-Bernstein-Schröder en estas álgebras. Estos resultados son aplicados para obtener versiones del teorema en retículos ortomodulares, álgebras de Stone, BL-álgebras, MV-álgebras, pseudo MV-álgebras, álgebras de Lukasiewicz y álgebras de Post of order n.

Abstract:
The present thesis is a study of injectives in several classes of residuated structures associated with logic and the Cantor - Bernstein - Schröder theorem. In the first part we investigate injectives and absolute retracts in classes of residuated lattices and pocrims. Among the classes considered are MTL-algebras, IMTL-algebras, BL-algebras, NM-algebras and bounded hoops. In the second part is developed an algebraic frame for the validity of Cantor-Bernstein-Schröder theorem, applicable to algebras with an underlying lattice structure and such that the central elements of this lattice determine a direct decomposition of the algebra. Necessary and sufficient conditions for the validity of the Cantor-Bernstein-Schröder theorem for these algebras are given. These results are applied to obtain versions of the Cantor-Bernstein-Schröder theorem for orthomodular lattices, Stone algebras, BL-algebras, MV-algebras, pseudo MV-algebras, Lukasiewicz and Post algebras of order n.

Frontera, Jimena Laura. "Rol de BDNF y de la vía de señalización de Wnt y Sox2 en la diferenciación de progenitores neurales en el epitelio olfatorio" (2015-02-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El epitelio olfatorio (EO) de vertebrados es conocido por su remarcable propiedad de renovación de neuronas receptoras olfatorias en forma activa a lo largo de la vida, debido a la presencia de células madre neurales. El EO de larvas de Xenopus laevis muestra todas las características de un vertebrado adulto con una robusta capacidad regenerativa, ofreciendo un sistema ideal para el estudio de células madre neurales en adultos y de factores involucrados en la regeneración del tejido y la diferenciación del linaje neuronal. La identidad y características específicas de las células madre neurales del EO siguen siendo poco conocidas. Estudios previos en otros sistemas como en retina de Xenopus, han sugerido que la señalización de Wnt podría ser necesaria para la expresión de Sox2, el cual a su vez activa la expresión de genes proneurales, y bloquea la diferenciación neuronal a través de la activación de Notch. En el presente trabajo, analizamos la expresión de genes marcadores de células madre neurales en el EO de X. laevis. Además, describimos un incremento significativo en el número de células basales proliferativas y el número de células basales que expresan Sox2, durante la regeneración masiva luego de la destrucción del EO mediante el tratamiento con ZnSO4. Por otra parte, hemos observado que la vía de señalización de Wnt/β-catenina es necesaria para la expresión de Sox2 en células basales del EO principalmente durante la regeneración masiva. Sin embargo, en condiciones fisiológicas normales la expresión de Sox2 podría estar regulada por otros factores. No obstante, no se observó activación de las vías no canónicas de Wnt, como Wnt/JNK o Wnt/Ca++, en células basales en condiciones normales. Estos resultados sugieren un importante rol de Sox2 en las células proliferativas indiferenciadas, posiblemente involucrado en el mantenimiento de las propiedades de células neuro-progenitoras, y sugieren que Wnt estaría involucrado en la regulación de la expresión de Sox2 principalmente durante la regeneración. Por otro lado, se analizó la expresión de BDNF en el sistema olfatorio en condiciones fisiológicas normales, así como durante una regeneración forzada inducida por la destrucción química del epitelio olfatorio en larvas de X. laevis. Hemos descripto la presencia y los patrones de expresión de BDNF tanto en el EO como en el bulbo. En condiciones fisiológicas normales, células sustentaculares (gliales) y algunas células basales dispersas expresan BDNF en el EO, así como las células granulares en el bulbo olfatorio. Por otra parte, durante la regeneración masiva, hemos demostrado un aumento drástico de las células basales que expresan BDNF, así como un aumento de BDNF en el bulbo y nervio olfatorio. En conjunto, estos resultados sugieren un papel importante de BDNF en el mantenimiento y la regeneración del sistema olfatorio. En conclusión, nuestro trabajo pone de manifiesto la importancia del epitelio olfatorio de larvas de anfibios como modelo de estudios de procesos de neurogénesis. Así también hemos demostrado que la vía Wnt/β-catenina y la expresión de Sox2 juegan un rol fundamental en procesos de diferenciación de neuronas olfatorias. Por último, el análisis de la regeneración del EO muestra un significativo aumento en la expresión de BDNF y su importancia en procesos regenerativos neurales. Palabras clave: Epitelio Olfatorio, Células madre neurales, Neurogénesis, Neuronas Receptoras Olfatorias, Wnt, Sox2, BDNF.

Abstract:
The vertebrate olfactory epithelium (OE) has been known for its remarkable property of olfactory receptor neurons renewal actively throughout life due to the presence of neural stem cells. The OE of Xenopus laevis larvae show all the characteristics of an adult vertebrate with a robust regenerative capacity, offering an ideal system for the study of neural stem cells in adults and the factors involved in tissue regeneration and differentiation of neuronal lineage. The identity and specific characteristics of olfactory neural stem cells are still poorly understood. Previous studies in other systems as the retina of Xenopus, have suggested that Wnt signaling may be necessary for expression of Sox2, which in turn activates expression of proneural genes, and blocked neuronal differentiation through the activation of Notch. In this study, we analyzed the expression of neural stem cells markers in the OE of X. laevis. We also describe a significant increase in the number of proliferating basal cells and the number of basal cells that express Sox2, during massive regeneration after partial destruction of OE by treatment with ZnSO4. Moreover, we found that the Wnt/β-catenin signaling pathway is required for Sox2 expression in basal cells of the OE mainly during the massive regeneration. However, under normal physiological conditions Sox2 expression may be regulated by other factors. However, no activation of noncanonical Wnt pathways, such as Wnt/JNK and Wnt/Ca++ in basal cells was observed under normal conditions. These results suggest an important role of Sox2 in undifferentiated proliferating cells, possibly involved in the maintenance of the properties of neural progenitor cells, suggesting that Wnt be involved in the regulation of Sox2 expression mainly during regeneration. Furthermore, the expression of BDNF was analyzed in the olfactory system under normal physiological conditions, and during forced regeneration induced chemical destruction of the olfactory epithelium in X. laevis larvae. We have described the presence and expression patterns of BDNF in both the OE and the bulb. Under normal physiological conditions, supporting cells (glial) and some scattered basal cells express BDNF in the OE and granule cells in the olfactory bulb. Moreover we have shown a dramatic increase of basal cells expressing BDNF and BDNF increase in the bulb and olfactory nerve during regeneration. Together these results suggest an important role of BDNF in the maintenance and regeneration of the olfactory system. In conclusion, our study shows the importance of the olfactory epithelium of larval amphibians as model for the study of neurogenesis process. Moreover, we have also shown that Wnt/β-catenin and Sox2 pathway play a critical role in differentiation processes of olfactory neurons. Finally, analysis of OE regeneration showed a significant increase in the expression of BDNF and its importance in neural regeneration processes. Keywords: Olfactory Epithelium, Neural Stem Cells, Neurogenesis, Olfactory Receptor Neurons, Wnt, Sox2, BDNF.

Frumento, Oscar Andrés. "La evolución estacional de los patrones de circulación atmosférica asociados a las fluctuaciones de la precipitación en el sudeste de sudamérica" (2009). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente trabajo de tesis consistió en estudiar algunos patrones espaciales de circulación, sus relaciones con otras variables climáticas y su asociación con la precipitación en el sudeste de Sudamérica durante el período comprendido entre enero de 1981 y diciembre de 2006. Los patrones espaciales de circulación se determinaron luego de aplicar la metodología de Funciones Empíricas Ortogonales Combinadas a los campos de las anomalías del viento zonal y meridional en 850 hPa sobre un área del continente representativa de los principales factores que influyen en la variabilidad climática de la región como la zona de convergencia del Atlántico sur, el monzón sudamericano, la alta boliviana y el jet de capas bajas entre otros. Con el objetivo de retener exclusivamente aspectos de la variabilidad intra-interanual los datos fueron filtrados de las contribuciones de alta frecuencia de la componente sinóptica. Se utilizaron como bases de datos primarias al conjunto de reanálisis del NCEP/DOE-R2 para las variables atmosféricas y a una base elaborada por el NCEP Climate Prediction Center para la precipitación de Sudamérica. Los modos obtenidos reflejan varias características relacionadas con la circulación troposférica y su vinculación con la variabilidad del régimen de precipitación en la región sudamericana. Mientras que el primer modo retiene aspectos del ciclo anual, los restantes cinco contribuyen indistintamente en otras escalas temporales características de las fluctuaciones intraestacionales e interanuales. El modo 2 caracteriza las situaciones de ondas estacionarias que pueden favorecer los excesos o déficit hídricos en el sudeste de Sudamérica. Los modos 3 a 5 están relacionados con desplazamientos de los anticiclones del Pacífico y del Atlántico (tanto zonal como meridionalmente) que en algunos casos pueden favorecer las circulaciones de tipo jet de capas bajas. El último modo retenido está relacionado con algunos aspectos característicos de los eventos ENOS. La tendencias que se observan en ambas fases del modo 1 estarían indicando el crecimiento de la componente de invierno sobre la componente de verano asociada a las ZCAS, favoreciendo la incursión de una corriente del norte que llega más al sur y que es típico de la estación fría. Las tendencias de ambas fases del modo 5 son importantes y significativas e indican un crecimiento de la fase positiva y un decrecimiento de la fase negativa, ambas altamente influenciadas por un salto en la señal que ocurre a finales de la década del 90 que implica un desplazamiento de los anticiclones hacia el sur.

Abstract:
This thesis focuses on the study of some spatial circulation patterns, their relation to other climatic variables, and their association with precipitations in the south-east of South America during the period held between January 1981 and December 2006. The spatial circulation patterns were determined by applying Combined Empirical Orthogonal Function analysis to anomalous 850 hPa zonal and meridional wind fields over the continental region that is representative of the most influential factors of the climatic variability, such as the South America Convergence Zone, the South America Monsoon System, the Bolivian High and the Low Level Jet. Data were filtered from the synoptic component’s high frequency contributions so that only inter-intra-annual variability aspects were retained. The primary databases used were the NCEP/DOE-R2 reanalysis for the atmospheric variables and a database made by the NCEP Climate Prediction Center for precipitation in South America. The modes obtained contain some features related to tropospheric circulation and also show their connections with the variability of the precipitation regime on the South American region. While the first mode contains features of the annual cycle, the five remaining modes indistinctly contribute to other time scales which are typical of interseasonal and interannual fluctuations. Mode 2 characterises the occurrences of stationary waves which may favour hydric excesses or shortages in the South-East of South America. Modes 3 to 5 are related to the anticyclonic shifts in the Pacific and the Atlantic (zonally as well as meridionally), which under certain circumstances may favour low-level-jet circulations. The last mode retained is related to features typical of ENSO events. The tendencies seen in both phases of mode 1 would indicate the growth of the winter component over the SACZ summer component, thus favouring the incursion of a northern current spreading southwards, which is typical of cold seasons. The tendencies seen in both phases of mode 5 are important and significant, and they indicate an increase in the positive phase and a decrease in the negative phase; both phases were highly influenced by a jump in the signal which happened towards the end of the 90s and which implied a southward shift of the anticyclones.

Frungieri, Mónica Beatriz. "Control de la función reproductiva en el hamster macho" (1997). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El hamster es una especie con reproducción estacional controlada fotoperiódicamente. La exposición de animales adultos a fotoperíodos cortos produce marcadas alteraciones en el eje hipotálamo-hipófiso-gonadal, que resultan en una fase inicial de quiescencia (regresión), y una posterior recuperación de la actividad sexual (recrudescencia espontánea). Los resultados presentados en esta Tesis han permitido: a) realizar un estudio comparativo sobre distintos aspectos de la función sexual, en dos especies de hámsteres: Dorado y Djungarian; b) establecer semejanzas y diferencias entre el proceso de desarrollo puberal y la transición fotoperiódica regresión recrudescencia; c) estudiar el metabolismo de las poliaminas en testículos y vesículas seminales, y su correlación con el trofismo del órgano; d) establecer una dependencia diferencial de la actividad secretoria gonadal de inhibina B respecto de FSH, según el tiempo de permanencia en fotoperíodo corto; e) evaluar la presencia de GABA y Serotonina en gónadas y glándulas sexuales accesorias; y f) determinar la participación de la Serotonina en la modulación local del proceso esteroidogénico, y su mecanismo de acción a través de una inhibición en la actividad adenilato ciclasa. Dichos resultados contribuyen al conocimiento de los mecanismos que controlan la función reproductiva en el hamster macho, los cuales se manifiestan sobre los distintos niveles que conforman el eje hipotálamo-hipófiso-gonadal.

Abstract:
The hamster is a seasonal breeder. The exposure of hamsters to short fotoperiods causes a severe alteration of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis, including an early quiescence phase (regression), and a later recovery of the sexual activity(spontaneous recrudescence). The results of this Thesis permited: a) to make a comparative study about the different aspects of the sexual function between two species of hamsters: Golden and Djungarian; b) to establish similitudes and differences between the sexual development and the regression-recrudescence transition; c) to study polyamine metabolism in testes and seminal vesicles, and its correlation with organ growth; d) to establish a differential dependency of the gonadal secretion of inhibin type B with respect to FSH, in relation with the time of permanence in short photoperiod; e) to determine the presence of GABA and Serotonin in testes and accessory sexual glands; and f) to establish the role of Serotonin in the local modulation of steroidogenesis, and its action mechanism through the inhibition of adenylate cyclase activity. These results contribute to the knowledge of the mechanisms regulating the reproductive function in the male hamster, manifested at different levels of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis.

Fu, Chu Chun. "Estudio por dinámica molecular de la difusión de Si y depósito de C sobre la superficie (001) de Si" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La superlicie (001) de silicio ha sido objeto de numerosos estudios debido a sus interesantes propiedades, que aportan al avance de la física de semiconductores y a sus aplicaciones en dispositivos microelectrónicos. Si(001) es además un buen candidato para usar como sustrato del crecimiento de capas delgadas de carbono amorfo, material que tiene una dureza comparable a la del diamante. En esta tesis se estudiaron tres problemas vinculados con esta superficie: 1. El movimiento de balanceo (flipping) de los dímeros de Si(001) y su correlación dinámica tanto en la superficie perfecta como en la presencia de defectos. El período característico del balanceo y la correlación del movimiento de dímeros vecinos fueron investigados usando el método de simulación por dinámica molecular tight-binding. Los resultados fueron corroborados en parte por cálculos de primeros principios y también comparados con los obtenidos por un modelo de Ising bidimensional. Son importantes para la interpretación de imágenes obtenidas por STM a diferentes temperaturas. 2. La estabilidad y difusión de dímeros de Si adsorbidos sobre la superficie Si(001) a temperatura alta. Se observaron diferentes caminos y mecanismos de difusión en la simulación por dinámica molecular. Los resultados se compararon con los de cálculos a 0K y con los datos experimentales obtenidos por STM disponibles en la literatura. También se estimaron las energías de activación de algunos de estos procesos. 3. El depósito de carbono sobre Si(00l), tratando de simular el experirmmto realizado en Tandar. Con este propósito se propuso un modelo tight-binding para sistemas mixtos de C y Si, a partir de los modelos conocidos para los materiales puros. Se observó la formación de una capa de SiC amorfo que sirve como interfaz para crecer sobre ella el carbono amorfo duro, y se estudiaron sus propiedades estructurales y electrónicas. En particular, se lo caracterizó por su densidad, sus funciones de distribución radiales y angulares, su orden químico y su densidad de estados electrónicos.

Abstract:
The surface Si(001) has been studied in a large number of previous papers, due to its interesting physical properties. These studies have improved the knowledge of semiconductor physics and led to its application in micro-electronic devices. Si(001) is also an excellent substrate for the growth of amorphous carbon thin films, which have a hardness similar to that of diamond. In this thesis three problems related to Si(001) have been studied: I. The flipping of the surface dimers on Si(001) and its dynamical correlation, in the case of perfect and defective surfaces. The characteristic time between flips and the probability of correlated flips, when two nearest neighbouring dimers exchange their buckling positions, hare been studied using tight binding molecular dynamics simulations. The results have been compared with first principles calculations and with Monte Carlo simulations using a two-dimensional Ising model. Thev are important in order to understand STM images and their temperature dependence. 2. The stabilitv and diffusion of Si adsorbed dimers on Si(001) at high temperature. Several mechanisms and diffusion pathways have been observed by means of molecular dynamics simulations. The results have been compared with those from first principles calculations, at 0K, and also with available STM experimental ones. The dynamical activation energies along some pathways have also been estimated. 3. The deposit of energetic C atoms over Si(001), attempting to simulate the experimental procedure used in Tandar Laboratory. For this purpose we have proposed a tight binding model for systems containing both Si and C atoms starting from the available models for the pure materials. The formation of an amorphous SiC (a-SiC) thin film has been observed. It may be the interface over which the amorphous carbon thin film would grow. Structural and electronic properties of the a-SiC film so obtained have been investigated, in particular the density, the radial and angular distribution functions, the chemical order and the local density of electronic states.

Fuchs, Daniela Viviana. "Sistemática y distribución del género Bryconamericus (Teleostei: Characiformes: Characidae) de la Argentina" (2014-12-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El género Bryconamericus Eigenmann está compuesto por peces de pequeño a mediano tamaño que se encuentran distribuidos desde América Central hasta la cuenca del río Sauce Grande (38º56’S-61º23’O) en el sur de la provincia de Buenos Aires. Actualmente la definición del género consiste en la siguiente combinación de caracteres: premaxilar con dos series de dientes, serie interna con cuatro dientes de mayor tamaño que los de la serie externa, serie única de dientes en el dentario, número limitado de dientes a lo largo del margen anterior del maxilar, borde de la quijada superior con una curva simple, ausencia de escamas en la aleta caudal, tercer infraorbital amplio y en contacto con el preopérculo a lo largo de sus márgenes ventral y posterior, rastrillos branquiales setiformes, línea lateral completa y ausencia de bolsillo glandular en la aleta caudal de los machos. Si bien pueden encontrarse representantes en la mayoría de las cuencas de Argentina, no había antecedentes de estudios completos del género, por lo que el objetivo de este estudio fue realizar la revisión taxonómica actualizada del grupo para nuestro territorio. Se confirman 11 especies y se provee una clave de identificación de las mismas. Se considera a B. ikaa y B. agna sinónimos de B. iheringii y B. sylvicola respectivamente. Se menciona por primera vez al género Bryconamericus para la provincia de Santiago del Estero. Se reafirma la presencia de B. exodon para las cuencas de los ríos Paraná y Paraguay. Se amplían las distribuciones geográficas de las siguientes especies: B. eigenmanni, B. iheringii, B. pyahu y B. stramineus. Palabras clave: Teleostei - Characiformes - Characidae - Bryconamericus – Sistemática - Distribución Geográfica - Región Neotropical

Abstract:
The genus Bryconamericus Eigenmann comprises small sized fishes distributed from Central America to the Sauce Grande river basin (38º56’S-61º23’W) in the south of Buenos Aires province (Argentina). The genus is defined by the combination of a single row of teeth on the dentary, two rows of teeth on the premaxilla with four teeth in the inner series that are larger than those of the outer row, the limited number of teeth along the anterior margin of the maxilla, the simple curve to the border of the upper jaw, the lack of scales on the caudal fin, the large third infraorbital contacting the preopercle along its posterior and ventral margins, setiform gill-rakers, the complete laterosensory canal system on the body, and the absence of a glandular pouch on the caudal fin in males. Although representatives of this genus can be found in most drainage basins of Argentina, no complete studies on the genus had been made before, and thus the aim of this study was to perform an updated taxonomic review of this taxon in Argentina. Eleven species are confirmed for our country and an identification key is provided. Bryconamericus ikaa is considered to be a synonym of B. iheringii and B. agna as a synonym of B. sylvicola. The genus Bryconamericus is mentioned for the first time for Santiago del Estero province. The presence of Bryconamericus exodon is verified for the Paraguay and Paraná River basins. The geographical distributions of the following species are expanded: B. eigenmanni, B. iheringii, B. pyahu and B. stramineus. Keywords: Teleostei - Characiformes - Characidae - Bryconamericus - Systematics Geographic Distribution - Neotropical Region

de la Fuente, Verónica. "Mecanismos celulares y moleculares involucrados en las distintas fases de la memoria de condicionamiento de miedo en ratones" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el aprendizaje asociativo, la reactivación de la memoria por la presentación de un recordatorio puede inducir dos procesos mnésicos aparentemente opuestos, la reconsolidación o la extinción. En esta Tesis describimos un switch molecular entre mecanismos de transcripción que se inducen diferencialmente en el hipocampo en la determinación de dichos procesos. Encontramos que NF-kB es necesario para la reconsolidación, mientras que para la extinción su activación se ve restringida por la fosfatasa calcineurina. El factor de transcripción NFAT es activado a su vez por calcineurina durante la extinción, y es necesario para que este proceso tenga lugar. Por el contrario, NFAT parecería no tener ningún rol en la reconsolidación. La actividad de calcineurina también es necesaria para que se lleve a cabo el proceso de extinción. Esta fosfatasa jugaría entonces un doble papel: 1) induciendo la activación y translocación de NFAT desde el citoplasma hacia el núcleo, 2) bloqueando a la vez la activación de NF- kB. Asimismo, nuestros resultados en el estudio de la consolidación sugieren fuertemente que calcineurina actúa como limitante negativo en la formación de memorias, y su mecanismo de acción involucra la regulación del estado de activación de NF-kB. Profundizamos entonces el modelo en el que quinasas y fosfatasas dependientes de calcio controlan activamente el procesamiento neuronal, mediante un equilibrio finamente regulado en el que se oponen entre sí. Por último, estudiamos el rol de NF-kB en plasticidad estructural relacionada a procesos de memoria, y resultados preliminares nos indican que el mismo tendría un rol clave en el aumento de densidad de espinas asociado al aprendizaje.

Abstract:
In associative learning, memory reactivation by the presentation of a reminder can induce two behaviorally opposing memory processes, reconsolidation or extinction. In this PhD Thesis, using the fear conditioning paradigm in mice, we describe a molecular switch between transcriptional mechanisms that are induced differentially in the hippocampus by these two processes. We found that NF-kB is necessary for reconsolidation, whereas in extinction, its activation is constrained by the phosphatase calcineurin. The transcription factor NFAT is, in turn, necessary for the extinction process to take place, and it seems to have no role in reconsolidation. Calcineurin activity is also necessary for extinction. This phosphatase plays then a dual role: inducing the activation and translocation of NFAT from the cytoplasm to the nucleus, while blocking activation of NF-kB. Furthermore, our results in the study of the consolidation phase strongly suggest that calcineurin acts as a negative constraint in memory formation, and its mechanism of action involves the regulation of NF-ĸB activation. Thus, we support the model in which kinases and phosphatases actively control calcium-dependent neuronal processing through a finely regulated balance in which they oppose each other. Finally, preliminary results from our study on the role of NF-ĸB in structural plasticity related to memory processes indicate that it has a key role in the increase in spine density associated with learning.

Fuentes, Carlos Mariano. "Deriva de larvas de Sabalo, Prochilodus lineatus (Valenciennes, 1847) y otras especies de peces de interes comercial, en el Río Paraná Inferior" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Entre 1990 y 1997 se realizaron diversos muestreos para el estudio de la deriva de larvas de sábalo Prochilodus lineatus y otros peces de interés comercial en el río Paraná Inferior, a la altura del límite con el río Paraná Medio (ciudad de Diamante) y el rio Paraná de Las Palmas (ciudad de Zárate). Se observaron diferencias en la composición especifica y Ia densidad de larvas. No obstante, el sábalo fue la especie más abundante en ambos sitios, donde representó más del 40 % del ictioplancton. La presencia de huevos de peces, así como de estadios muytempranos de sábalo solamente en Diamante, al norte, sugiere que los desoves de los stocks meridionales de ésta, y otras especies migratorias, tienen lugar principalmente en el tramo medio del río Paraná. El sábalo se reprodujo activamente al final de la primavera y en el verano con temperaturas del agua entre 22 °C y 27 °C. Los datos sugieren que el ciclo de maduración podría ser controlado por el fotoperíodo y/o la temperatura, mientras que los ascensos sostenidos del nivel de las aguas dispararían Ia actividad reproductiva masiva. Estas investigaciones apoyan la hipótesis de que el sábalo, en el curso de su evolución, ha desarrollado una estrategia reproductiva compleja, que involucra desplazamientos ascendentes, desoves en el canal asociados a las crecientes, y dispersión de los estadios de desarrollo tempranos en una extensa área de cría aguas abajo. Esta es una de las características biológicas que explicarían la abundancia de la especie, pero, al mismo tiempo, la hacen particularmente vulnerable a las transformaciones ambientales, como las producidas por la construcción de represas

Abstract:
During 1990 to 1997, several sampling programs to study the larval fish drift of the "sábalo" Prochilodus lineatus, were carried out in the limit between the middle and the lower Paraná river (Diamante City) and southwards in Paraná de Las Palmas river (Zárate City). There were differences in the species composition and densities of larval fish between sites. However, the "sábalo" Prochilodus lineatus, was the most abundant species, reaching more than 40 % in both cases. Presence of fish eggs and newly hatched larvae of sábalo only at the northern site, suggests that the spawning areas of the meridional stocks of these and other migratory species are located in the Middle Paraná river. Sábalo actively spawned in late spring and summer with water temperatures between 22 °C and 27 °C. Data suggest that the maturation cycle could be overly controlled by factors as photoperiod and/or water temperature, while raising water levels may trigger massive spawning activity. These studies support the hypothesis that sábalo has evolved a complex reproductive strategy, involving upstream migrations, channel spawning during rising waters, and a wide dispersion of larvae in extensive downstream nursery areas. This may be one of the biological features that explain the great abundance of this species, but at the same time makes it particularly vulnerable to environmental transformations, as those produced by damming.

Fuertes, Mariana. "Rol y mecanismos de acción de RSUME en la regulación de PTTG e impacto en un modelo tumoral hipofisario" (2014-03-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los tumores de hipófisis son adenomas benignos de incidencia frecuente que se originan a partir de los distintos tipos celulares hipofisarios por expansión clonal. En todos los tipos de adenomas hipofisarios se ha visto una sobreexpresión de pituitary tumor transforming gene (PTTG). PTTG facilita la progresión del ciclo celular ya que actúa como securina, regulando la correcta separación de las cromátidas hermanas en metafase, entre otras funciones. Por tratarse de un regulador del ciclo celular, el balance de los niveles de expresión de PTTG en la célula es importante, y la desregulación de estos niveles por defecto o exceso conduce a inestabilidad genómica, aneuploidía, apoptosis, daño al ADN, y conlleva al desarrollo de tumores. Se desconoce la causa que provoca el desbalance de PTTG al momento inicial del desarrollo de tumores de hipófisis. En este trabajo identificamos y describimos por primera vez un mecanismo de desregulación de los niveles de expresión de la proteína PTTG, que desencadena su acción como oncogen, permitiendo el avance de la tumorigenicidad hipofisaria. El mismo involucra la sobreexpresión de RWD-containing sumoylation enhancer (RSUME) al momento inicial del proceso tumoral y, como consecuencia, la inducción de la modificación de PTTG por SUMO, reduciendo su degradación por ubiquitinación y aumentando su estabilidad proteica. Este efecto de RSUME conduce a un aumento de la actividad PTTG y conlleva a hiperactividad del ciclo celular, aneuploidía, anormalidades cromosómicas, células multinucleadas y otros efectos tumorigénicos mediados por PTTG. Además, demostramos que PTTG y RSUME colocalizan a nivel celular y su expresión correlaciona positivamente en adenomas hipofisarios humanos.

Abstract:
Pituitary tumors are benign adenomas of frequent incidence originating from different pituitary cell types by clonal expansion. In all types of pituitary adenomas has been an overexpression of pituitary tumor transforming gene (PTTG). PTTG facilitates cell cycle progression by acting as securin, regulating the correct separation of sister chromatids in metaphase. Being a cell cycle regulator, the balance of PTTG expression levels in the cell is important, and deregulation of these default levels or excess leads to genetic instability, aneuploidy, apoptosis, DNA damage, among others, and leads to the development of tumors. The underlying cause of the imbalance of PTTG the initial stage of development of pituitary tumors is unknown. In this paper we identify and describe for the first time a mechanism for deregulation of the expression levels of PTTG protein, which triggers its action as oncogene, allowing the advance of pituitary tumorigenicity. It involves overexpression of RWD-containing sumoylation enhancer (RSUME) at the initial moment of the tumor process and, as a result, induction of PTTG by SUMO modification, reducing degradation by ubiquitination and increasing protein stability. This effect of RSUME leads to an increase of PTTG activity and leads to hyperactivity of the cell cycle, aneuploidy, chromosomal abnormalities, multinucleated cells and other tumorigenic effects mediated by PTTG. Furthermore, we demonstrate that PTTG and RSUME colocalize at the cellular level and its expression correlates positively in human pituitary adenomas.

Fuertes, Mercedes Beatriz. "Rol del sistema Mica-NKG2D en la inmunovigilancia y en el escape tumoral" (2008). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La mayoría de los tumores crece en huéspedes inmunocompetentes a pesar de que expresan ligandos de NKG2D (NKG2DLs) como MICA (MHC class I-chain related gene A) y MICB. Sin embargo, su participación en el escape tumoral no ha sido totalmente dilucidada. En esta Tesis demostramos que numerosos melanomas humanos (líneas celulares y metástasis aisladas de pacientes) no expresan MICA en la superficie pero poseen depósitos intracelulares de este NKG2DL. Observamos correlación entre la citotoxicidad mediada por células NK y la relación entre NKG2DLs y moléculas de clase I del HLA, pero no con los niveles de MICA en superficie celular. La sobre-expresión de MICA por transfección restauró la expresión en superficie y resultó en un aumento en la citotoxicidad y la secreción de IFN-? por células NK. Los melanomas que sobre-expresan MICA exhibieron un crecimiento retardado respecto de los controles en ratones atímicos (nude) debido a la inducción de apoptosis mediada por células NK in vivo. MICA fue retenida en el retículo endoplasmático (RE) aparentemente debido a la acumulación de formas inmaduras de MICA (sensibles a endoH), transporte retrógrado al citoplasma y degradación en el proteosoma. Por lo tanto la retención intracelular de MICA por acumulación de formas inmaduras del polipéptido en el RE constituye un novedoso mecanismo de escape tumoral que confiere privilegio inmunológico previniendo los mecanismos efectores anti-tumorales de las células NK. Sin embargo, este fenotipo puede ser revertido mediante estrategias de transfección que induzcan un aumento en la expresión de MICA. Estos resultados tienen importancia potencial para el desarrollo de estrategias de inmunoterapia en seres humanos empleando a MICA como blanco molecular.

Abstract:
Most tumors grow in immunocompetent hosts despite expressing NKG2D ligands (NKG2DLs) such as the MHC class I-chain related genes A and B (MICA and B). However, their participation in tumor cell evasion is still not completely understood. Here we demonstrate that several human melanomas (cell lines and freshly isolated metastases) do not express MICA on the cell surface but have intracellular deposits of this NKG2DL. Susceptibility to NK cell-mediated cytotoxicity correlated with the ratio of NKG2DLs to HLA class I molecules but not with the amounts of MICA on their cell surface. Transfection-mediated overexpression of MICA restored cell surface expression and resulted in an increased in vitro cytotoxicity and IFN-ã secretion by human NK cells. In xenografted nude mice, these melanomas exhibited a delayed growth and extensive in vivo apoptosis. Retardation of tumor growth was due to NK cell-mediated effector functions against MICA-transfected tumors because this effect was not observed in NK cell-depleted mice. Also, mouse NK cells killed MICA-overexpressing melanomas in vitro. MICA was retained in the endoplasmic reticulum which appeared to be due to an accumulation of endoH-sensitive (immature) forms of MICA, retrograde transport to the cytoplasm and degradation by the proteasome. Hence, our study identified a novel strategy developed by melanoma cells to evade NK-cell mediated immune surveillance based on the intracellular sequestration of immature forms of MICA in the endoplasmic reticulum and demonstrates that this tumor immune escape strategy can be overcome by gene therapy approaches aimed at over-expressing MICA on tumor cells

Fumaroni de Carnovali, Ada. "Investigaciones sobre sedimentos de las regiones petrolíferas del Norte argentino" (1944). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Funes, Gustavo Javier. "Factores que afectan el contenido de patulina y fumonisinas durante el procesamiento de alimentos" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las micotoxinas, son contaminantes naturales que afectan la producción de alimentos, provocando fuertes impactos económicos y sobre la salud humana y animal. Se realizo el primer estudio de ocurrencia natural de patulina en productos sólidos y semisólidos, elaborados con manaza y pera. Para ello se desarrolló y validó una metodología de análisis. El 21 % de los productos analizados presentaban contaminación. El puré de manzana fue el producto mas contaminado con el 50% de muestras positivas y con un nivel máximo de 221 μg/kg. Se procedió a aplicar una metodología emergente, luz pulsada con el fin de bajar la contaminación de patulina. La aplicación de esta técnica por 10 segundos permitió reducir un 49% la contaminación de patulina en pure de manzana y un 60% en jugos de manzana. Las fumonisinas afectan principalmente al maíz. Se estudió como se modifica el nivel de contaminación al procesarse el maíz por molienda húmeda a escala planta piloto y en una planta industrial. Se cuantificó las fumonisinas libres en los productos obtenidos. Se realizó un balance de masa mostrando una pérdida entre el 85-99 % de las fumonisinas que se encontraban originalmente en el maíz. Se estudió la posibilidad que esta reducción se deba a la transformación de las fumonisinas en alguno de sus derivados. Se desarrolló metodología para determinar fumonisinas unidas e hidrolizadas en harina de maíz y en un producto extrudado. Al realizar un balance entre las fumonisinas totales presentes en el maíz y las presentes en el chizito, se encontró mayor cantidad en el maíz, lo cual indicaría que la reducción de fumonisinas libres no se debería a una hidrólisis o unión a la matriz.

Abstract:
Mycotoxins, are natural contaminants that affect food production, causing heavy impacts on economic and animal and human health. The first study of natural occurrence of Patulin was conducted in solid and semi-solid products made with apple and pear. For this purpose it has been developed and validated a methodology of analysis. This study showed contamination on the 21% of the analyzed products. The apple puree was the most contaminated product with 50% of positive samples and a maximum level of 221 μg/kg. A new methodology was conducted, the use of pulsed light to reduce patulin contamination. The use of this light for 10 seconds reduces a 49% the contamination of Patulin in apple puree and 60% in apple juice. The fumonisins mainly affect maize. It was studied the changes on the level of contamination while the corn was processed by wet milling in a pilot scale and in an industrial plant. The amount of fumonisins in the final products was quantified and a loss between 85-99% of fumonisins was found. The possibility that this reduction is due to the transformation of the fumonisins in any of its derivatives was studied. A methodology to determine fumonisins and hydrolysed fumonisins in corn flour and in an extruded product was developed. In the study it was compared the amount of fumonisins in corn and in corn puff. It was found that in maize the concentration of fumonisins was higher than in the corn puff. This indicates that free fumonisins reduction should not be because the hydrolysis or the union to the matrix.

Funes, Jorge Armando. "Estudio de la composición química de la semilla y de los aceites de semilla de frutos de especies de "Prunus" de producción nacional. Harinas de extracción y aislamiento de proteínas" (1978). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Furlong, Laura Inés. "Caracterización bioquímica y molecular de los sitios de unión a zona pellucida presentes en proacrosina humana" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente trabajo tuvo como objetivo estudiar el rol de la proteina espermática humana proacrosina/acrosina como molécula de adhesión a las glicoproteínas de la zona pellucída (ZP). En una primera etapa, se llevó a cabo un análisis bioinformático sobre la secuencia aminoacídica de proacrosina con el propósito de identificar sitios potenciales de unión a glicoproteínas de la ZP. El resultado de este análisis reveló que los residuos Lys74. Lys169, Arg172, Arg199, Arg249, Lys251, Arg252 y la secuencia KRLQQKLIE, localizada entre los residuos 367-374, conformarían sitios potenciales de unión a la ZP. A continuación se realizaron experimentos para evaluar la interacción entre proacrosina/acrosina con glicoproteínas de la ZP. Para ello se desarrolló una estrategia de subclonado del ADNc de proacrosina humana en vectores de expresión procariotas (pET-22b, pGEX-3X) para la expresión de proacrosina recombinante. Utilizando el sistema de expresión en forma directa (pET-22b) se obtuvo un producto de expresión recombinante correspondiente a la proenzima (Rec-40), y productos truncados del extremo N-terminal de la proteína (Rec-30, Rec-20, Rec-10). Estas proteinas fueron caracterizadas mediante la utilización de anticuerpos especificos y análisis de secuenciación de aminoácidos, determinándose que Rec-30 correspondería a los residuos 1-300, Rec-20 a 1-190 y Rec-10 a 1-160 de proacrosina humana. Utilizando el mismo sistema de expresión se sintetizó un producto de expresión correspondiente a los residuos 1-59 de proacrosina (Rec-6). Los productos de expresión, obtenidos como cuerpos de inclusión, fueron solubilizados y aislados mediante electroforesis preparativa. El estudio de la interacción entre proacrosina/acrosina recombinante y las glicoproteínas de la ZP se llevó a cabo utilizando ensayos de unión en fase sólida ("Ligand blot", "Dot blot", ensayo en placa de poliestireno). Se utilizaron glicoproteínas obtenidas de ovocitos humanos de descarte de programas de fecundación in vitro, así como glicoproteínas obtenidas por expresión en células CHO a partir del ADNc (rec-hZPA, rec-hZPB, rec-hZPC). El resultado de estos estudios indicó que proacrosina recombinante (Rec-40) y fragmentos del extremo N-terminal de la proteína (Rec-30, 20 y 10) tienen capacidad de unión a glicoproteínas de la ZP y a azúcares. Las glicoproteínas de la ZP mostraron diferente capacidad de unión a proacrosina/acrosina, siendo hZPA el ligando principal. El mecanismo de unión involucraría interacciones electrostáticas entre aminoácidos cargados positivamente en proacrosina/acrosina, y oligosacáridos sulfatados en la ZP, así como el reconocimiento de residuos de fucosa y manosa presentes en los oligosacáridos de la ZP. El resultado del mapeo de los sitios de unión en la molécula de proacrosina permite proponer que éstos estarían localizados en dos regiones de la proteína. Una región estaría comprendida entre los residuos 59-160 (Dominio II), y otra entre los residuos 300-402 (Dominio III). Los sitios de unión localizados en el Dominio II de la proteina estarían estabilizados por uniones no covalentes y puentes disulfuro, mientras que los sitios localizados en el Domino II estarían estabilizados por interacciones no covalentes, y tendrían una contribución principal a la afinidad de la interacción. En dichas regiones, los residuos Lys74, Lys108, Lys114 y el motivo KRLQQKLIE (residuos 367-374), identificados mediante el análisis de secuencias, participarían en la interacción con glicoproteinas de la ZP y azúcares. En resumen, este trabajo muestra que proacrosina/acrosina humana presenta La capacidad de reconocer glicoproteinas de la ZP. de manera independiente de la actividad de proteasa. Esto permite proponer que proacrosina/acrosina participaría como molécula de adhesión en la unión secundaria del espermatozoide a la ZP en el humano.

Furman, Nicolás. "Desarrollo de alternativas biotecnológicas para la obtención de plantas de Citrus sinensis (L.) Osbeck resistentes a la enfermedad de la Cancrosis de los cítricos" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Entre las enfermedades bacterianas más relevantes para la citricultura argentina se encuentra la Cancrosis de los cítricos, presente en la mayoría de las zonas productoras de todo el mundo, a excepción de Europa. Las pérdidas económicas más importantes son ocasionadas por las restricciones cuarentenarias a los frutos, impuestas por países libres de estas enfermedades, que limitan las exportaciones a tales destinos. Dado que no se ha encontrado resistencia natural a la enfermedad, ni en el germoplasma disponible para el mejoramiento, ni en las especies utilizadas como pie para propagar las variedades comerciales de citrus, actualmente se intenta controlar al patógeno causante de la Cancrosis (Xanthomonas axonopodis pv. citri) mediante la aplicación de bactericidas de contacto a base de cobre. Si bien éstos permiten controlar parcialmente el desarrollo de la enfermedad, no sólo son eliminados por las lluvias y el viento, sino que también resultan contaminantes para el ambiente y para el hombre. Por estas razones el desarrollo de estrategias biotecnológicas representa una alternativa atractiva para la búsqueda de la resistencia a la Cancrosis. En tal sentido, el objetivo principal de esta Tesis fue desarrollar plantas transgénicas de Citrus sinensis (naranjo dulce) resistentes a la enfermedad, a partir de la expresión del péptido antimicrobiano dermaseptina. En primer lugar, se demostró el efecto bactericida del péptido frente a Xanthomonas spp. en ensayos in vitro. Siguiendo estos resultados, se realizó una construcción que permite la expresión constitutiva de dermaseptina y su exportación a apoplasto, región donde se multiplica la bacteria durante la infección. Luego, se transformaron plantas de C. sinensis y se obtuvieron 7 positivas para los genes marcadores de selección utilizados (resistencia kanamicina y GFP), cuya posterior caracterización molecular confirmó la presencia de la secuencia de dermaseptina en el genoma de las plantas. Finalmente, mediante ensayos de infección en cámaras de crecimiento, se estableció que la expresión del péptido antimicrobiano en las plantas transgénicas de naranjo indujo resistencia parcial frente a la infección con X. axonopodis. Si bien aún resta desarrollar ensayos de infección en invernadero, estos resultados permitieron convalidar la estrategia biotecnológica escogida para conferir resistencia a la Cancrosis.

Abstract:
Canker disease is one of the most important bacterial diseases affecting citric production in Argentina, and it is also present in most producing areas around the world, except in Europe. Since that a substantial percentage of lemon, grapefruit and orange is intended for export, outbreaks of this disease provoke an immediate quarantine for the fruits harvested in the affected areas, with the subsequent losses of economic income. As no natural resistance has been found, neither in commercial orange varieties nor in any of the common graft stock varieties, current attempts to control the Canker causative pathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri consists of preventive sprayings with copper-based bactericides. Despite this approach confers partial disease control, copper-based bactericides are not only be eliminated by rain and wind, but they also result harmful to the environment and to human beings. Due to these limitations, biotechnological strategies represent an attractive alternative for the search of Canker resistance. In that way, the main aim of this work was to obtain transgenic Citrus sinensis (sweet orange) plants expressing an antimicrobial peptide (dermaseptin) in order to confer resistance against Xanthomonas axonopodis pv. citri infections. First of all, bactericidal effect of dermaseptin against Xanthomonas spp. was demonstrated by in vitro assays. Following these results, a genetic construct allowing the constitutive expression of dermaseptin and its export to apoplast was generated. That´s where bacteria multiplies during infection. Then, C. sinensis plants where transformed with this construction, obtaining seven positive plants for the GFP and kanamycin marker genes. Later molecular characterization confirmed the presence of dermaseptin sequence in the corresponding genomes. Finally, controlled X. axonopodis infection assays showed significant reduction of disease symptoms in transgenic plants. Even though the results obtained in this work should be confirmed at the level of greenhouse and field trial assays (since controlled infection assays cannot be directly extrapolated to real agricultural conditions), they indicate that the strategy used in this work could be effective in achieving Canker resistance.

Furnari, Juan Carlos. "Estudio de reacciones nucleares inducidas por neutrones sobre germanio. Determinación, trazabilidad y aplicaciones de los datos nucleares" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En la presente Tesis se estudió al germanio desde aspectos poco explorados. Se determinaron y publicaron varias constantes nucleares de isótopos del elemento y se encontraron dos aplicaciones originales en el campo de los reactores nucleares y del análisis por activación. Para mejorar los escasos y discrepantes (o inexistentes) datos bibliográficos referidos a las constantes nucleares del germanio, se determinaron las secciones eficaces de las reacciones umbral 70Ge(n,p)70Ga, 72Ge(n,p)72Ga y 74Ge(n,p)74Ga. Asimismo se midieron los factores k0 correspondientes a 74Ge y 76Ge con exactitud y precisión comparables a otros datos publicados. Se desarrolló también un método radioquímico de separación de galio y germanio. Adicionalmente, se descubrieron nuevas transiciones gamma del 77mGe. Se planteó así la primera derivación de esta Tesis, referida a la viabilidad de utilizar germanio como monitor integral de flujo neutrónico en reactores de investigación. A ese respecto, se demostró su potencialidad en el análisis por activación paramétrico de muestras biológicas; se desarrolló en tales matrices una aplicación novedosa, la determinación simultánea de fósforo y aluminio empleando germanio como monitor de flujo integral y comparador. Consecuentemente, se determinó la sección eficaz de la reacción 31P(n,α)28Al, mejorando sustancialmente los valores previos de dicha constante. También se desarrolló, como herramienta, un novedoso método para determinar simultáneamente los factores f y α en reactores de investigación. Por último, se elaboraron varios trabajos concernientes al estudio, la determinación, la evaluación y la compilación de datos nucleares, que se incluyen en una de las secciones más relevantes de esta Tesis. De resultas de todos los temas tratados, se han realizado ocho publicaciones en revistas internacionales con referato y catorce presentaciones en congresos nacionales e internacionales.

Abstract:
In the present thesis, germanium was studied in aspects seldom explored. Several nuclear constants of isotopes of the element were determined and published. Two original applications, in the field of nuclear reactors and activation analysis, were found. In order to improve the scarce and discrepant (or inexistent) bibliographical data, referred to the nuclear constants of germanium, the cross-sections of the threshold reactions: 70Ge(n,p)70Ga, 72Ge(n,p)72Ga and 74Ge(n,p)74Ga were determined; the k0 factors corresponding to 74Ge and 76Ge were measured, as well, with accuracy and precision comparable to other published data. A radiochemical method for separation of germanium and gallium was also developed. In addition, new gamma transitions of 77mGe were discovered. Thus, the first derivation of this thesis was outlined; it was referred to the viability of using germanium as integral neutron flux monitor in research reactors. In this respect, its potentiality in parametric activation analysis of biological samples was demonstrated; in such matrixes, an innovative application, the simultaneous determination of aluminium and phosphorus employing germanium as integral flux monitor and comparator, was developed. Consequently, the cross-section of the 31P(n,α)28Al reaction was determined, substantially improving the previous values for this constant. As a tool, a new method for simultaneous determination of f and α research reactor parameters, was also developed. Finally, several works, connected with study, determination, evaluation and compilation of nuclear constants were elaborated and published; they are including in one of the most relevant sections of this thesis. As a result of all these subjects, eight publications in international journals and fourteen presentations in national and international conferences have been carried out.

Fusari, Corina Mariana. "Mapeo por asociación en girasol: diversidad nucleotídica, desequilibrio de ligamiento e identificación de genes involucrados en la resistencia a la podredumbre húmeda del capítulo" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El mapeo por asociación es una herramienta poderosa que permite la identificación de loci cuya contribución explica parte de la variación fenotípica observada. En general, los marcadores utilizados en estos estudios son los Polimorfismos de Nucleótido Simple (SNPs, Single Nucleotide Polymorphisms) y los indels (eventos de inserción, insertion/deletion). Los objetivos de este trabajo comprendieron el estudio de la diversidad nucleotídica y el alcance del desequilibrio de ligamiento (DL) en girasol cultivado, y el diseño de una estrategia de mapeo por asociación para la resistencia a la Podredumbre Húmeda del Capítulo (PHC), causada por Sclerotinia sclerotiorum. La frecuencia de SNPs (1/61) y la diversidad nucleotídica (θ=0,0067) se determinaron sobre un panel de 31 genes y 19 líneas endocriadas de girasol. La frecuencia de SNPs en conjunto con un alcance del DL hasta 100 kb (r2~0,1) permitieron diseñar un estudio de asociación a través de la estrategia de genotipificación de genes candidatos. Un total de 30 genes candidatos fueron seleccionados a partir de: (1) el análisis de los perfiles transcripcionales de un genotipo de Brassica napus resistente a S. sclerotiorum, (2) una colección de transcriptos de expresión diferencial de una línea de girasol moderadamente resistente desafiada con S. sclerotiorum y (3) genes descriptos en literatura como partícipes en los procesos de defensa frente a PHC. La elección, caracterización y genotipificación de genes candidatos implicó la generación de herramientas para la selección de los mismos y la optimización de técnicas de genotipificación de SNPs a gran escala. La detección de moléculas heterodúplex mediante: (1) corte con la enzima endonucleasa CEL1 (CEL1CH) y (2) cromatografía líquida de alto rendimiento en condiciones de desnaturalización parcial (dHPLC), demostraron ser técnicas robustas y versátiles para aumentar el número de loci e individuos a incluir en los estudios de mapeo por asociación. Un total de 16 genes se genotipificaron exitosamente en la población de mapeo por asociación constituida por 134 accesos del Banco Activo de Girasol de la Estación Experimental Agropecuaria (EEA) INTA Manfredi. El análisis estadístico de asociación incluyó el uso de modelos lineales mixtos que corrigieron los problemas de estructuración y las relaciones de parentesco entre los individuos de la población de mapeo. Un alelo del gen RhoBP_B exhibió una asociación estadísticamente significativa con una menor incidencia de PHC (pp<0,05). Los resultados obtenidos demuestran que es posible encontrar alelos útiles implicados en caracteres complejos a través de los estudios de mapeo por asociación en girasol.

Abstract:
Association mapping is a powerful tool to identify gene loci that may contribute to phenotypic variation. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertions/deletions (indels) have become the markers of choice to conduct these studies. The aims of this thesis were to study nucleotide diversity and the extent of linkage disequilibrium (LD) in cultivated sunflower to conduct association mapping for the resistance to Sclerotinia Head Rot disease. SNP frequency and nucleotide diversity were assessed using a set of 31 genes and 19 sunflower inbred lines (1SNP/61 pb, θ=0.0067). The relatively high frequency of SNPs found here, along with the predicted extent of LD over distances of 100 kb (r2~0.1) allowed the development of an association mapping strategy through candidate gene approach. A total of 30 genes were selected based on: (1) a microarray analysis from Brassica napus genotypes resistant to S. sclerotiorum, (2) differentially expressed genes from cDNA libraries from sunflower infected tissues; (3) previous literature reports. Different methods of candidate gene selection and optimization of SNP genotyping technologies for scale-up throughput were explored. CEL1 cleavage of heteroduplex (CEL1CH) and denaturing high performance liquid chromatography (dHPLC) proved to be robust and versatile techniques to increase the amount of loci and individuals to be included in the association panel. Sixteen genes were successfully genotyped in the association population composed by 134 inbred lines from INTA Manfredi Sunflower Germplasm Bank. Mixed linear models accounting for population structure and kinship relatedness were used for the statistical analysis of associations. One candidate gene, RhoBP_B, had significant results from association analysis, indicating that it might affect the quantitave variation in sunflower resistance to Sclerotinia Head Rot disease. These results demonstrate the potential of candidate gene association mapping for complex trait dissection in sunflower.

Fustiñana, María Sol. "Análisis comparativo de mecanismos de plasticidad neuronal involucrados en la labilización y reconsolidación de la memoria" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Una vez que la memoria de largo término es almacenada mediante el proceso de consolidación, la presentación de un recordatorio, tal como claves contextuales presentes durante el aprendizaje, puede desencadenar un proceso de labilización y reconsolidación. La labilización-reconsolidación de la memoria posee procesos que le son inherentes: reactivación, labilización y reestabilización de la traza mnésica. Si cualquiera de ellos es interrumpido, el proceso completo no tendrá lugar. La determinación de los mecanismos moleculares que subyacen a cada proceso es uno de los temas de intenso estudio y debate en este momento en el campo de la neurobiología de la memoria. La primera parte de esta Tesis consistió en la puesta a punto de un nuevo protocolo de condicionamiento pavloviano contextual (CPC) en el cangrejo Neohelice granulata. Esto nos permitió realizar posteriormente estudios comparativos con otro paradigma de condicionamiento contextual en el ratón, Mus musculus. De esta manera, obtuvimos evidencias que indican que el cangrejo Neohelice granulata establece una asociación entre un contexto (estímulo condicionado, EC) y un estímulo aversivo (estímulo incondicionado, EI). El EC está compuesto por las características del contexto (iluminación, textura, color, patrón, etc.) y el EI es un estímulo visual de peligro. Al inhibir la vía de señalización del factor de transcripción NF-κB encontramos que tanto la consolidación como la reconsolidación de la memoria se ven impedidas. Este efecto permitió el estudio de las características del recordatorio capaces de desencadenar la labilizaciónreconsolidación de la memoria. Observamos que el proceso de labilización-reconsolidación es desencadenado únicamente ante la presentación específica del estímulo condicionado. Posteriormente realizamos un estudio comparativo entre el CPC en cangrejos y el condicionamiento de miedo contextual en el ratón. Estudiamos mecanismos moleculares que subyacen a la labilización de la memoria, encontrando que la degradación de proteínas a través del sistema de ubiquitina-proteasoma juega un rol importante en la labilización tanto en cangrejos como en ratones. Finalmente, pudimos determinar que una de las funciones que puede cumplir el proceso de reconsolidación está vinculada al reforzamiento de la memoria. Este fenómeno de reforzamiento ocurre en el CPC de Neohelice, mientras que no fue encontrado en el condicionamiento de miedo contextual en el ratón.

Abstract:
After a long-term memory is stored through the memory consolidation process, the occurrence of a reminder, such as contextual cues present during learning, can trigger the labilization-reconsolidation process. Memory labilization-reconsolidation requires inherent steps: reactivation, labilization and stabilization of the memory trace. If any of these steps is interrupted, the entire process can not take place. Currently, the identification of the molecular mechanisms underlying each step is a topic of intense study and debate in the learning and memory field. A new contextual pavlovian conditioning (CPC) protocol was developed for the Neohélice granulata crab in the first stage of this Thesis. This protocol allowed us to perform a comparative study with contextual conditioning in the Mus musculus mouse. We found that Neohélice can associate a specific environment (the conditioned stimulus, CS) with an aversive unconditioned stimulus (US). The CS is composed by the contextual cues (including illumination, texture, color, patterns, etc.) while the US is a visual danger stimulus. We found that the inhibition of the NF-κB transcription factor pathway leads to the absence of both, consolidation and reconsolidation of this new CPC paradigm. This allowed us to study which features of the reminder are able to trigger memory labilization. We found that the labilizationreconsolidation process is triggered specifically and only by the presentation of the CS. After the characterization of the CPC in the crab, we performed a comparative study between this contextual associative memory in crabs and the contextual fear conditioning in mice. We studied molecular mechanisms underlying memory labilization finding that the ubiquitin-proteasome system plays a key role during labilization in both, crabs and mice. Finally, we found that reconsolidation could may play a role in the memory reinforcement process, a role that we found in the CPC in crabs but not in the contextual conditioning in mice.

Fuxman Bass, Juan Ignacio. "Reconocimiento del ADN bacteriano extracelular por neutrófilos humanos: su impacto en la respuesta a biofilms" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Previamente demostramos que el ADN bacteriano extracelular activa a los neutrófilos a través de un mecanismo diferente al canónico CpG-dependiente. El ADN extracelular es un componente central en la formación y estructura de los biofilms bacterianos, comunidades responsables de más del 60% de las infecciones ocasionadas por estos microorganismos. La presente tesis tuvo como objetivos centrales determinar el impacto del ADN de la matriz de los biofilms en la activación de los neutrófilos humanos y la identificaron del receptor involucrado en el reconocimiento de ADN. Los estudios realizados indicaron que la degradación con DNAsa I del ADN de la matriz extracelular de los biofilms de P. aeruginosa redujo marcadamente su capacidad de inducir la activación de los neutrófilos, determinada en función de su habilidad para producir citoquinas proinflamatorias, incrementar marcadores de activación fisiológicamente relevantes, de mediar la fagocitosis y de liberar trampas extracelulares de los neutrófilos (NET). La aplicación de técnicas de MALDI-TOF nos permitió identificar, en el neutrófilo, 16 proteínas con capacidad de unir ADN bacteriano. A pesar de que ninguna de ellas resultó ser el receptor de la superficie celular para ADN, es posible que dos de las proteínas encontradas constituyan sensores intracelulares de ADN, cuya relevancia queda por ser explorada. Los hallazgos realizados en la presente Tesis confirman la existencia de una proteína de la superficie del neutrófilo capaz de mediar el reconocimiento de ADN y la activación celular por esta molécula. Además, indican que el ADN de la matriz extracelular representa un componente proinflamatorio relevante de los biofilms de P. aeruginosa. Los mismos permiten especular que el reconocimiento del ADN de la matriz de biofilms podría representar un mecanismo seleccionado evolutivamente para permitir al huésped incrementar su capacidad de responder a este tipo de infecciones bacterianas persistentes

Abstract:
We have previously demonstrated that extracellular bacterial DNA activates neutrophils through a non-canonical mechanism. Extracelular DNA is a key component in the formation and composition of bacterial biofilms, that are communities responsible for more than 60% of the infections caused by these microorganisms. The aims of this Thesis were to determine the impact of DNA present in the biofilm matrix in triggering human neutrophil activation and to identify the receptor involved in DNA recognition. We found that extracelluar DNA degradation of P. aeruginosa biofilm matrix with DNase I markedly reduced its ability to induce neutrophil activation, determined by evaluating proinflammatoy cytokines production, the increase of physiologically relevant activation markers, phagocytosis and neutrophil extracelullar traps (NET) release. By application of MALDI-TOF techniques we identified 16 neutrophil proteins that bind bacterial DNA. Although none of them proved to be the DNA surface receptor, it is possible that two of these proteins correspond to intracellular DNA sensors whose relevance remains to be explored. The findings presented in this Thesis confirm the existence of a neutrophil surface protein capable of mediating DNA recognition and cell activation. Additionaly, they indicate that extracellular matrix DNA represents a relevant proinflammatory component of P. aeruginosa biofilms. Thus, it is possible to speculate that recognition of extracellular DNA of the biofilm matrix represents an evolutionary selected mechanism that increases the ability of the host to respond to these types of persistent bacterial infections.

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