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Eberhardt, María Ayelén Teresita. "Evaluación de la dinámica de salud en poblaciones de Hydrochoerus hydrochaeris L. 1766 (RODENTIA: Caviidae): intensidad del parasitismo gastrointestinal" (2014-06-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Con la premisa que los helmintos son causa y consecuencia de la condición de salud de sus hospedadores, este trabajo tuvo como objetivos: i. Evaluar el uso de la intensidad de los parásitos gastrointestinales específicos como herramienta para el estudio de la salud poblacional en carpinchos ii. Relacionar cargas parasitarias con factores ambientales, demográficos e interacciones interespecíficcas de parásitos co-infectantes, iii. Evaluar la relación de la intensidad del parasitismo de determinados helmintos y/o protozoarios específicos con el estrés y el estado inmuno-fisiológico del carpincho. Se recolectaron 1600 heces frescas en la ecoregión “LLagunas y Esteros del iberá”, Corrientes, desde septiembre 2010 hasta febrero de 2013. Se realizaron 72 necropsias de ejemplares de carpinchos silvestres, y se realizó un experimento con 30 carpinchos de cautiverio. A partir de los análisis coproparasitologico de las heces y los parásitos adultos, se identificaron y contabilizaron los nematodes: Vianella hydrochoeri, Hydrocherisnema anomalobursata, Trichostrongylus cf axei, Strongyloides cf. chapini, Echinocoleus hydrochoeri, Trichuris sp. y Protozoophaga obesa; cestodes del género Monoecocestus sp.; trematodes de las especies Taxorchis cabrali, T. schistocotyle e Hippocrepis hippocrepis y ooquistes de especies del genero Eimeria spp. Según los resultados obtenidos, los conteos de las formas evolutivas en materia fecal son indicativos en niveles aceptables de la carga parasitaria interna para la superfamilia Trichostrongyloidea, S. chapini y Trichuris sp. En general, no se evidenció estacionalidad marcada para ningún taxón de parásito encontrado en las heces debido a que existió una interacción entre las estaciones y el año de muestreo. Además la abundancia de las distintas especies parasitarias estuvo asociada (positiva o negativamente dependiendo del parásito) a factores ambientales (precipitaciones y temperaturas) y a las densidades del hospedador. La interacción entre nematodos (Viannaiidae) y Eimeria spp. dependió de factores ambientales y del hospedador. La relación fue positiva en algunas circunstancias (dependió de la temporada, año, sexo o tamaño de los animales), y antagónica bajo diferentes escenarios. Estas interacciones antagonistas no siguieron un patrón estacional en particular y se encontraron predominantemente en el sexo femenino (cuando dependieron del sexo) o en 2010 y 2011 (cuando dependieron del año de muestreo). Los carpinchos estresados del experimento, tuvieron significativamente mayores intensidades de infección de coccidios, pero los individuos de menor tamaño, consistentemente mostraron bajas cargas de helmintos comparado con los controles. El estrés tuvo un marcado impacto negativo sobre el crecimiento y la condición corporal, pero un efecto positivo significativo en algunos de los componentes del sistema inmune. Nuestros resultados sugieren que: i. durante los períodos prolongados de estrés los carpinchos preventivamente invierten energía en algunos componentes de su sistema inmunológico, lo que podría considerarse una profilaxis dependiente del estrés, ii. se encontró que el estrés provoca una mayor intensidad de infección de protozoos, pero cargas más bajas de nematodos, lo que indica que la relación entre el estrés, las regulaciones fisiológicas y la infección depende del tipo de parásito en cuestión. Se propone que la inversión inmune contexto-dependiente documentada en este experimento con carpinchos podría ser la causa de las diversas interacciones intra e interespecíficas documentadas para los parásitos de los carpinchos silvestres.

Abstract:
Helminths are cause and consequence of the health of their host condition, so the overall objetives of this study were: i. Evaluate the use of intensity of specific gastrointestinal parasites as a tool to asses the population health in capybaras; ii. Establish link between parasites loads and environmental factors, demography of the host and interspecific interactions of parasite co-infection; iii. Evaluate the impact of food restriction and physical restraint on the infection intensity of specific gastrointestinal nematodes and coccidia, and how these stressors affected the growth, body condition, and some immuno-physiological parameters. 1600 feces were collected from September 2010 to February 2013 from a population of capybaras from Esteros del Iberá, Corrientes, Argentina. 72 necropsy of wild capybaras were performed and a experiment with 30 female captive capybara was carried out. There were identified and counted nematodes: Vianella hydrochoeri, Hydrocherisnema anomalobursata, Trichostrongylus cf axei, Strongyloides cf. chapini, Echinocoleus hydrochoeri, Trichuris sp. and Protozoophaga obesa; cestodes of gen Monoecocestus sp.; trematodes: Taxorchis cabrali, T. schistocotyle and Hippocrepis hippocrepis and oocytes of species of Eimeria spp. According to results, counts of fecal evolutionary forms are indicative at acceptable levels of internal parasite burdens of Trichostrongyloidea, S. chapini and Trichuris sp. In general, no seasonality was evident for any taxon of parasite found in feces due to an interaction existed between seasons and years of sampling. Besides the abundance of different parasite species was associated (positively or negatively depending on the parasite) with environmental factors (rainfall and temperature) and densities of the host. The interaction between nematodes (Viannaiidae) and Eimeria spp. depended on environmental and host factors. The relationship was positive in some circumstances (depending on season, year, sex, or animal size), but it appeared to become antagonistic under different scenarios. These antagonist interactions did not follow a particular seasonal pattern, but they were predominantly found in females (when they depended on sex) or in 2010 and 2011 (when they depended on the sampling year). These results suggest that the relationship between coccidia and nematodes in capybaras may be context dependent. Stressed capybaras had significantly higher coccidia infection intensities; but among individuals that were smaller, those stressed consistently showed lower helminth burdens than controls. Both stress treatments had a marked negative impact on growth and body condition, but they had a significant positive effect on some components of the immune system. Our results suggest, on the one hand, that during prolonged periods of stress capybaras preventatively invest in some components of their immunity, which could be considered a stress-dependent prophylaxis. On the other hand, stress was found to cause greater infection intensities of protozoans but lower burdens of nematodes, indicating that the relationship between stress, physiological trade-offs and infection depends on the type of parasite in question. We propose that the context-dependent immune investment documented in capybaras may be the cause of these varying interactions.

Echazú, Daniela María. "Biodiversidad de diatomeas en humedales del sur de la Provincia de Santa Cruz, Argentina" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las diatomeas constituyen un importante componente de las comunidades acuáticas ya que tienen una distribución cosmopolita, ocupan una amplia variedad de hábitats y su distribución está relacionada con la química del agua, el clima y la geología. Además de ser utilizadas como bioindicadores actuales constituyen una valiosa herramienta para realizar inferencias paleoclimáticas. A pesar de su importancia, en Santa Cruz hay pocos antecedentes referidos a los ensambles diatomológicos y su relación con las características ambientales. El objetivo general de esta tesis fue relevar la biodiversidad de las diatomeas en humedales (turbales, lagos y lagunas) en Santa Cruz entre los 49º y 52º S y relacionarla con variables ambientales a fin de recopilar datos ecológicos útiles para la interpretación de secuencias fósiles en lagos y lagunas. Se registraron diatomeas en 41 sitios de los 45 muestreados. Se identificaron 80 géneros y 313 taxones infragenéricos, de los cuales 40 son nuevas citas para la Argentina y 108 son mencionadas por primera vez para la provincia. Se propone una nueva especie (Encyonopsis patagonensis Echazú & Maidana), una nueva variedad (Biremis schwabei var. undulata Echazú & Maidana) y cuatro nuevas combinaciones (Achnanthidium abundans (Manguin) Echazú & Maidana, Achnanthidium didymun (Hustedt) Echazú & Maidana, Achnanthidium exiguum var. angustirostrata (Krasske) Echazú & Maidana y Achnanthidium marginulatum (Grunow) Echazú & Maidana). Se registraron 10 taxones (3,2 % del total) aparentemente endémicos del Hemisferio Sur y, de los restantes, la mayoría son cosmopolitas o con distribución nórdico alpina. El 12 % no pudo ser identificado a nivel de especie y se estima que alrededor del 4 % podrían ser nuevas especies. La composición y la estructura de los ensambles de diatomeas tanto en los turbales como en los lagos y lagunas fueron altamente heterogéneas y no mostraron un claro patrón relacionado con la ubicación geográfica. Los ensambles diatomológicos en los sedimentos superficiales de los lagos y lagunas se correlacionaron positiva y significativamente con la conductividad, el Nitrógeno total, los nitratos, el Fósforo total, los cloruros y los iones calcio y fluor. Con los datos obtenidos se confeccionó un set de calibración que permitirá, luego de ser ampliado, la aplicación de funciones de transferencia en testigos sedimentarios.

Abstract:
Diatoms are important components of aquatic communities as they have a cosmopolitan distribution, occupy a wide variety of habitats and their distribution is related to water chemistry, climate and geology. Besides being used as current bioindicators, they are valuable tools for paleoclimatic inferences. Despite its importance, in Santa Cruz there are few records of studies of diatom assemblages and its relation to environmental characteristics. The main objective of this Thesis was to survey the biodiversity of diatoms in wetlands (peatlands, lakes and ponds) in Santa Cruz between 49° and 52° S and relate with environmental variables in order to collect ecological data useful for the interpretation of fossil sequences in lakes. Diatoms were recorded in 41 of the 45 sites sampled. We identified 80 genera and 313 infrageneric taxa, of which 40 are new records for Argentina and 108 are mentioned for the first time for the province. We propose a new species (Encyonopsis patagonensis Echazu & Maidana), a new variety (Biremis schwabei var. undulata Echazú & Maidana), and four new combinations (Achnanthidium abundans (Manguin) Echazú & Maidana, Achnanthidium didymun (Hustedt) Echazú & Maidana, Achnanthidium exiguum var. angustirostrata (Krasske) Echazú & Maidana y Achnanthidium marginulatum (Grunow) Echazú & Maidana). There were 10 taxa (3,2 % of total) apparently endemic to the southern hemisphere and most of the remaining taxa are cosmopolitan or they have Nordic-alpine distribution. 12 % of the taxa could not be identified to species and it is estimated that about 4% could be new for science. The composition and structure of diatom assemblages in both peatlands and in lakes and ponds were highly heterogeneous and showed no clear pattern related to geographic location. Diatom assemblages in surface sediments of lakes and ponds were positively and significantly correlated with conductivity, total nitrogen, nitrates, total phosphorus, chloride and calcium and fluorine ions. A set training was developed with the obtained data. After being enlarged, it could be used in the application of transfer functions for quantitative paleoenvironmental reconstructions.

Edelstein, Alexis. "Epidemiología molecular y caracterización genética del hantvirus Andes causante de síndrome pulmonar en Argentina" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
A partir de una zoonosis emergente en el año 1995, se determinó la presencia de un hantavirus asociado al sindrome pulmonar en la Argentina, desconociéndose la magnitud del problema. Este trabajo tiene como objetivo aportar al conocimiento de la infección por hantavirus, su replicación, transmisibilidad ecoepidemiología y caracterización de virus circulantes. El estudio de la caracterización viral de las muestras humanas provenientes de distintas regiones geográficas determinó la existencia de 3 regiones endémicas asociadas a hantavirosis responsables del SPH en nuestro país: La región Norte (Salta y Jujuy) donde se estableció la existencia del linaje viral AND Nort., la región Sur (Rio Negro, Chubut y Neuquén) donde circula el linaje AND Sout,. y la región Central (Provincia de Buenos Aires) donde se detectaron los linajes AND Cent. Lec, AND Cent Plata y AND Cent Bs.As Los distintos análisis filogenéticos realizados sobre las secuencias nucleotídicas de los segmentos genómicos S y M mostraron claramente la evolución monofilética de los hantavirus. En esta evolución, el antecesor del virus Andes sería el virus Laguna Negra. Este análisis filogenético es apoyado por el aparente desplazamiento migratorio realizado por los Sigmodontinos desde América del Norte hasta el extremo sur del continente. Dentro del grupo Andes, la divergencia evolutiva no resultó tan clara, probablemente debido a que este grupo monofilético es de reciente radiación. Se obtuvo por primera vez la secuencia completa del virus Andes amplificándose y secuenciándose los segmentos S y M correspondientes al genoma viral y una porción del segmento L. Del análisis de dicho genoma se identificó al virus Andes como una nueva especie viral. Se determinó además para los 3 segmentos virales, la composición nucleotídica no putativa de sus extremos, responsables de la estabilidad del ARN viral y asociados además a su replicación /trascripción. A diferencia del segmento S, los segmentos M y L presentaron deleciones en ambos extremos posiblemente asociadas a la regulación de la persistencia viral. El análisis del brote ocurrido en El Bolsón en el año 1996, demostró por primera vez en el mundo, la existencia de un hantavirus capaz de transmitirse a través de contacto interhumano. Esta vía de contagio representó un evento único entre los hantavirus del grupo renal y pulmonar, solamente asociada hasta el momento al linaje Andes Sout. Con el objeto de determinar las posibles alteraciones genéticas asociadas a la vía de contagio interhumano hallada en Andes Sout, se amplificaron y secuenciaron en forma completa los segmentos S y M de un hantavirus perteneciente al linaje Andes Cent Plata, hasta el momento no asociado a contagio interhumano. La comparación de los segmentos S y M de las cepa transmisora y no transmisora no presentó diferencias estructurales significativas. La transmisión interhumana no parecería ser dependiente de la cepa viral requiriéndose la evaluación de factores alternativos como la carga viral o la respuesta inmune dependiente del huésped. Los hallazgos del presente trabajo de tesis aportaron las bases para el estudio de los mecanismos que influyen en la interrelación genética-viral y los aspectos biológicos tales como factores ambientales y ecológicos, cuyos efectos provocan alteraciones demográficas en huéspedes infectados y susceptibles, que conducen a la emergencia de enfermedades zoonóticas humanas.

Abstract:
From an emergent zoonosis in 1995, it was determined the presence of hantavirus associated to the pulmonary syndrome in Argentina, not knowing the magnitude of the problem. This work takes as target to reach to the knowledge of the infection with hantavirus, its replication, contagiousness, ecoepidemiology and characterization of circulating viruses. Viral characterization of human samples from different geographic regions determined the existence of 3 endemic regions associated to hantavirus illness responsible for the hantavirus pulmonary syndrome in our country: north region (Salta and Jujuy) where settled down the existence of viral lineage AND Nort., south region (Rio Negro, Chubut and Neuquén) where circulates lineage AND Sout. and central region (Province of Buenos Aires) where cocirculate lineages AND Cent. Lec, AND Cent Plata and AND Cent Bs.As. The different phylogenetic analyses realized on the sequences of the genomic segments S and M clearly showed a monophyletic evolution of the hantavirus. In this evolution, the predecessor of the virus Andes would be the virus Laguna Negra. This phylogenetic analysis is supported by the apparent migratory displacement realized by the sigmodontines from North America up to the south end of the continent. Inside the group Andes, the evolutionary difference did not turn out to be so clear, probably due to the fact that this monophyletic group is of recent radiation. The complete sequence of Andes virus was obtained for the first time through complete S and M segments amplification corresponding to the viral genome and a portion of segment L. The analysis of this genome identified Andes virus as a new viral species. It was determined in addition for the 3 viral segments, the non putative nucleotidic extremes sequences, which are responsible of RNA viral stability and associated in addition to its replication/trascription. Unlike S segment, segments M and L displayed deletions in both extremes possibly associated to the regulation of viral persistence. Analysis of the outbreak happened in El Bolsón in the year 1996, demonstrated for the first time in the world, the existence of a hantavirus capable of being transmitted across interhuman contact. This route of contagion represented a unique event between hantaviruses of renal and pulmonary group, only associated up to the moment with the lineage Andes Sout. In order to determine the possible genetic alterations associated with the route of interhuman infection found in Andes Sout, the complete S and M segments of a hantavirus belonging to the lineage Andes Cent Plata, not associated to interhuman infection until the moment, were amplified and sequenced. The comparison of segments S and M of the transmitting and nontransmitting lineages did not display significant structural differences. The interhuman transmission would not seem to be dependent of the viral lineage requiring the evaluation of alternative factors like viral load or immune response dependent of the guest. The findings of the present thesis work contributed the bases for the study of the mechanisms that influence in the genetic-viral interrelation and the biological aspects such as environmental and ecological factors, whose effects cause demographic alterations in infected and susceptible guests, who lead to the emergency of human zoonotic diseases.

Edelsztein, Valeria Carolina. "Síntesis orientada al diseño de organogelificantes esteroidales de bajo peso molecular" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo de tesis describe la síntesis de nuevos organogelificantes esteroidales de bajo peso molecular y el estudio de las propiedades micro y macroscópicas de sus geles con el fin de lograr una mejor comprensión del proceso de autoensamblado molecular. En primer lugar se sintetizó el nuevo organogelificante 3ß-t-butildimetilsililoxi-20ß- acetiloxi-5α-hidroxi-6ß,19-epoxipregnano mediante una reacción fotoquímica y se caracterizaron sus geles con distintos solventes orgánicos por técnicas espectroscópicas, rayos X, modelado molecular y microscopía. Este organogelificante, además, resultó capaz de gelificar tetraetil ortosilicato (TEOS) y transcribir, en condiciones de coensamblado in situ, su estructura fibrilar a la sílica dando lugar a la formación de nanotubos de dióxido de silicio. Con el fin de analizar la influencia de una estructura preorganizada en las propiedades gelantes de este tipo de esteroides, se encaró la síntesis de análogos diméricos. Se desarrolló entonces una metodología para la obtención de dímeros unidos mediante enlaces C-C, por reacción de metátesis en microondas con catalizadores de Grubbs de segunda generación. Para ello, fue necesario desarrollar y optimizar una metodología para la obtención de olefinas terminales mediante reacciones de Wittig libres de sales sobre distintos sustratos y estudiar la reacción de metátesis en distintas posiciones del núcleo esteroidal. Por otra parte, se prepararon análogos funcionales (por reemplazo de los grupos 3ß-t-butildimetilsililoxi y/o 20ß-acetoxi por otras funcionalidades) y diméricos (con enlaces éster) con el fin de analizar la relación estructura-propiedad gelante. Se determinó qué funcionalidades eran indispensables en la formación del gel y se analizó la influencia de la variación del tamaño y la polaridad de los sustituyentes. Se encontró que uno de los análogos, el 3ß-dimetilalilsililoxi-5α-hidroxi-20ß- acetoxi-6ß,19-epoxipregnano, también era capaz de formar geles termorreversibles en hidrocarburos. Estos geles fueron caracterizados mediante técnicas espectroscópicas, modelado molecular y microscopía. Finalmente, se propuso un modelo para el proceso de autoensamblaje de las moléculas esteroidales y la formación de la red fibrilar autoensamblada (SAFIN) consistente con los datos reunidos en este trabajo de tesis. Estos resultados contribuyen a incrementar los conocimientos acerca del proceso de autoensamblado molecular de los organogelificantes de bajo peso molecular para poder, en un futuro, diseñar a priori compuestos con propiedades gelantes.

Abstract:
This thesis work describes the synthesis of a new steroid-based low molecular weight organogelator and the study of the properties of its gels in order to get a better understanding of the molecular self-assembly process. The new steroid-based organogelator 3β-t-butyldimethylsilyloxy-20β-acetyloxy-5α- hydroxy-6β,19-epoxypregnane was synthesized by a photochemical reaction and its gels with different organic solvents were characterized by spectroscopic methods, X-ray diffraction, microscopy and molecular modelling. This organogelator was also able to gelate tetraethyl orthosilicate (TEOS) and it was successfully used as a template to grow silica nanotubes through a catalyst-free in situ co-assembly polymerization process. In order to analyze the influence of a preorganized structure in the gelation properties of this kind of steroids, we undertook the synthesis of dimeric analogs. We developed a methodology for obtaining C–C bonded steroidal homodimers, by an olefin metathesis reaction assisted by microwave heating with a second generation Grubbs catalyst. This required developing and optimizing a methodology for the synthesis of terminal olefins using a salt free Wittig reaction on different substrates and to study the metathesis reaction in several positions of the steroidal skeleton. On the other hand, we prepared functional analogs (replacing the 3β-t-butyldimethylsilyl and/or 20β-acetoxy groups for other moieties) and dimeric analogs (with ester bonds) in order to analyze the structure-gelation relationship. We identified the functional moieties essential for the formation of the gel and analyzed the effect of the size and polarity of substituents. One of the analogs, 3β-dimethylallylsilyloxy-5α-hydroxy-20β-acetoxy-6β,19- epoxipregnane, was also capable of forming thermoreversible gels in hydrocarbons. These gels were also characterized by spectroscopic methods, molecular modelling and electron microscopy techniques. Finally, we proposed a model for the self-assembly of the steroidal molecules and the formation of the self-assembled fibrillar network (SAFIN) consistent with data collected in this thesis. These results contribute to the understanding on the molecular self-assembly process of low molecular weight steroid-based organogelators and pave the way for designing compounds with novel gelation properties in the future.

Edreira, Martín Miguel. "Influencia de la fosforilación dependiente de PKA sobre la conformación y función de la GTPasa Rap 1b" (2009-10-09). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La activación de Rap1b por la proteína de intercambio activada por AMPc (Epac) y su fosforilación mediada por la proteína quinasa dependiente de AMPc (PKA), son requeridas para la mitogénesis dependiente de AMPc. Sin embargo, el rol de la fosforilación permanece incierto. Evaluamos potenciales cambios conformacionales inducidos por la fosforilación de Rap1b, utilizando el intercambio hidrogeno/deuterio acoplado a espectroscopia de masa (DXMS) y cristalografía. Velocidades de intercambio hidrogeno/deuterio para Rap1b fosforilada (Rap1-P) y fosfomimética (Rap1-D) mostraron un perfil de intercambio idéntico, con velocidades incrementadas en regiones discretas a lo largo de la proteína, incluyendo un dominio alrededor del sitio de fosforilación y la región efectora. La estructura cristalina de Rap1b-G12V-S179D mostró que la presencia del S179D induce cambios en la interfase con los switch I y II. Nuestro segundo objetivo fue la búsqueda de efectores de Rap1b modulados por fosforilación. Entre los clones aislados por doble hibrido, se encontró la proteína asociada a la adenilil ciclasa 1 (CAP1). Rap y CAP presentaron una asociación independiente del nucleótido, pero dependiente de la isoprenilación de Rap1b. Aunque la fosforilación demostró modular negativamente esta interacción, su efecto sobre la señal mitogénica mediada por Rap1 fue positivo. CAP1, actuando como proteína andamio de Rap, resultó necesaria para la acción de Rap1, siendo requerida además para su activación y fosforilación, efecto que estaría mediado por la estimulación del aumento de los niveles de AMPc.

Abstract:
Activation of Rap1b by the exchange protein activated by cAMP (Epac) and its cAMPdependent protein kinase (PKA)-mediated phosphorylation are required for cAMP dependent mitogenesis. However, the role of phosphorylation remains unknown. We assessed potential conformational changes induced by phosphorylation of Rap1b using the amide hydrogen/deuterium exchange mass spectroscopy (DXMS) and Crystallography. Exchange rates PKA-phosphorylated (Rap1-P) and phosphomimetic (Rap1-D) Rap1b proteins showed the same pattern of exchange, revealing an increased exchange rate in discrete regions along the protein, including a domain around the phosphorylation site and the effector domain. Crystal structure for the full length Rap1b-G12V-S179D showed that the presence of the S179D induce changes at the interface with switch I and II. Our second objective was finding Rap1b effectors modulated in a phospho-dependent fashion.. Within the clones isolated by Two Hybrid, we found the adenylate cyclase-associated protein 1 (CAP1). Rap/CAP association showed to be nucleotide independent, but dependent on Raps’ isoprenylation. Although, phosphorylation showed to negatively modulate this interaction, it had positive effect on the mitogenic signal mediated by Rap1. CAP, acting as a scaffolding protein for Rap1b, was necessary for Rap1 mediated action, and required for Rap1b activation and phosphorylation, effect mediated by stimulating the increase of the levels of cAMP.

Eguia, Manuel Camilo. "Estadística y procesamiento de información en sistemas excitables con ruido" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo se centra en el estudio de los sistemas excitables bajo la acción del ruido. Aun los sistemas canónicos más simples presentan propiedades estadísticas no triviales que dan cuenta de la estructura topológica de su espacio de fases determinista. Algunos aspectos estructurales de estos sistemas se revelan en presencia de ruido y en proximidad de las bifurcaciones que los caracterizan. En particular las dos clases básicas de excitabilidad (tipo I y II) presentan huellas distintivas diferenciadas en los histogramas de tiempos entre pulsos cerca de sus respectivas bifurcaciones. En la primera parte de este trabajo se derivan expresiones analíticas y semianalíticas para los histogramas de tiempos entre pulsos excitables de dos sistemas clásicos: el péndulo con torque y el modelo de FitzHugh-Nagumo. Las aproximaciones abrevan de la teoría de escapes de un estado metaestable de Kramers y otros elementos de la teoría de procesos estocásticos. Se discute un posible impacto de los resultados en el estudio de la actividad espontánea estacionaria de neuronas. En la segunda parte de esta tesis abordamos algunos aspectos del acople de sistemas excitables. En particular mostramos cómo es posible realizar operaciones lógicas con sistemas excitables con ruido, sin sincronización externa. Para ello utilizamos las propiedades de saturación e integración temporal de un modelo simplificado de sinapsis qímicas rápidas. Finalmente aplicamos algunos elementos de teoría de la información a un modelo de neuronas que producen ráfagas con el propósito de poner en evidencia justamente algunas limitaciones de la aplicacion estándar de dicha teoría (concebida originalmente para elementos pasivos de trasducción) a los sistemas neuronales que son fuertemente no lineales y activos.

Abstract:
This thesis focuses on the behavior of excitable systems subjected to the action of external noise. Even the simplest systems display nontrivial statistical properties that account for the topological structure of its phase space. These features arise in the presence of noise and close to a characteristic bifurcation. For instance, the two basic types of excitability (class I and II) can be discriminated by means of the intespike histograms close to their respective bifurcations. In the first part of this work, we derive analytical and semianalytical expressions for the interspike histograms of two clasical models: the pendulum with friction and torque and the FitzHugh-Nagumo equations. The aproximations arise from Kramers’ escape theory and from the theory of stochastic processes. We discuss the potential impact of our results on the study of the spontaneous activity of neurons. In the second part of this thesis, we address the issue of coupling excitable systems. We show how to perform all the logical operations with excitable systems in a noisy environment and without external synchronization. In order to achieve this, we make use of the saturation and integration properties of a Simplified model of fast chemical synapse. Finally, we apply information theory to a bursting neuron model with the aim of revealing some limitations of a straightforward aplication of the information measures (originally concieved for pasive transducers) to a neural system, which is active and strongly nonlinear.

Ehrlich, Martín David. "Los primeros estadios de vida de la merluza Merluccius hubbsi, Marini 1933, en el Mar Argentino como aporte al conocimiento de su reclutamiento y estructura poblacional" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La merluza es la especie demersal más importante del Mar Argentino. Su captura en 1996 ha superado las 600.000 t y se encuentra en estado de sobrepesca. El estudio de los primeros estadios de esta especie se ha encarado bajo dos aspectos, por un lado el análisis de la condición reproductiva de los adultos a través de la determinación de su fecundidad y frecuencia reproductiva y por otra parte la determinación espacio-temporal de la distribución y abundancia de los primeros estadios de vida donde se incluyen huevos, larvas tempranas, larvas tardías y juveniles. Se ha observado que la merluza es un desovante parcial indeterminado que presenta desoves casi todo el año, pero con dos períodos de puesta más intensivos, el invernal (mayo-julio) en la zona norte de su amplia distribución (35°-38°S) y el estival (octubre-marzo) en la zona costera norpatagónica (43°-45°S). La fecundidad relativa para hembras entre 38-58 cm de largo total fue estimada, en este trabajo, entre 520 a 640 ovocitos por gramo de hembra. La fecundidad parcial o por camada osciló entre 267400 a 432240 ovocitos por puesta. La frecuencia reproductiva utilizando la presencia de folículos postovulatorios de edad 0 fue estimada en una puesta cada 22 días aproximadamente. De acuerdo a la presencia de folículos postovulatorios en las muestras y de huevos en estadio I en el plancton, la merluza desova a lo largo de todo el día con un pico matinal. Inmediatamente después del desove la proporción de machos se incrementa notablemente llegando a más del 80 %. A través de experimentos de fecundación artificial se ha establecido que la duración en días desde la fertilización del huevo hasta la eclosión es de 5,01 a 10°C y de 3,1 a 18°C. Con 1470 muestras de ictioplancton provenientes de 39 campañas realizadas entre 1973 y 1989 se ha logrado construir un cuadro sinóptico mensual bastante completo sobre las principales areas de desove de la merluza. En la parte norte de la plataforma (34°00’- 41°30°S) se observa la presencia de huevos en abril entre los 39°-37°S, en mayo y junio entre los 37°35° S y en julio y agosto entre los 34° y 35°S. Los desoves se producen en la plataforma entre los 50 a 160 m con temperaturas que a los 10 m de profundidad oscilan entre 9,4 a 13,3°C. En mayo, septiembre y noviembre se ha reconocido un área de desove entre los 40°- 42°S. En el norte del Golfo San Matías se encuentran huevos en septiembre y octubre. En la parte sur de la plataforma entre 41°30’-47°00’S existe una importante zona de puesta al sudoeste de Península Valdés y litoral del Chubut y otra menor al sur del Golfo San Jorge que se extiende desde noviembre a marzo con picos en diciembre. Los desoves estivales se producen en profundidades de 40 a 60 m en aguas con temperaturas entre l3-l8°C a 10 m. Se ha encontrado un patrón muy similar para la distribución de las larvas tardías y juveniles tempranos. Las áreas senaladas, tienen condiciones oceanográficas muy particulares que brindan a la merluza un hábitat reproductivo favorable por ser áreas de enriquecimiento, disponibilidad de alimento y/o retención. El área de desove invernal está bajo la influencia de frentes de variada naturaleza (talud, térmicos y halinos) y un transporte de Eckman hacia la costa que impide la deriva de larvas hacia las aguas subtropicales. El área de desove estival al sur y sudoeste de Peninsula Valdés está relacionado con frentes de marea. Las áreas de desove más restringidas localizadas en los Golfos San Matías y San Jorge están afectadas por frentes termohalinos. El ajuste que presentan las áreas y épocas de desove con los diferentes procesos hidrográficos, se corresponden con los distintos grupos o stocks de adultos, fortaleciéndose la hipótesis que la merluza presenta un stock múltiple en el Mar Argentino. En la zona de desove intensivo estival, caracterizada por frentes de marea, los huevos y larvas tempranas se encuentran en la zona frontal y estratificada donde las diferencias de temperatura entre la superficie y el fondo oscilan entre 3,8 a 4,0°C. No se ha notado ningún patrón definido en la distribución vertical de huevos en sus diferentes estadios de desarrollo y larvas tempranas. La presencia de larvas y juveniles en distintas épocas y áreas en el Mar Argentino ha permitido aplicar a los procesos de reclutamiento de la merluza la hipótesis de ajuste-desajuste a los ciclos de producción del mar de Cushing (1972) y la de miembro-errante de Sinclair e Iles (1989). Las modalidades reproductivas de los adultos y la distribución temporal y espacial de los primeros estadios permiten afirmar que la merluza es un exitoso desovante ubicuo y una especie eurioica a diversos factores de manera que le permite soportar una intensa presión pesquera.

Abstract:
Hake is the most important demersal species in the Argentine Sea. Its catch in 1996 exceeded 600.000 t and it seemed overfished. The study of the hake early life history was developed in two aspects, reproductive analysis like fecundity and spawning frequency, and early stags (eggs, early larvae, late larvae and juveniles) distribution and abundance. Hake is an indeterminate batch spawner, wich spawns all over the year, with two peak spawning times, one during winter (May-July) in the northern area of its wide distribution (35°-38°S) and the other in summer (October-March) in the north Patagonia coastal waters (43°-45°S). Female relative fecundity between 35-38 cm of total length, expressed as ovocites per ovary free-weight, varied between 520 to 640 and its batch fecundity ranged from 267400 to 432240 ovocites per spawn. The spawning frequency was estimated in 22 days. Considering the presence of post ovullatory follicles in the samples and stage 1 eggs in the plankton, hake spawns all over the day with a matinal peak. Male dominated schools after spawning have finished. The hatching time in reared eggs varied between 5,01 days at 10°C to 3,1 days at 18°C. The analysis of 1470 ichthyoplankton samples obtained in 39 research cruises between 1973 to 1989 allowed to study monthly the main important hake spawning and nursery areas. The eggs were caught in the northern area (34°-4l°30’S) during April (39°-37°S), May - June (37°-35°S) and July August (34°-35°S). Hake spawns in shelf, between 50 to l60 m depth, where temperatures at lO m ranged from 9,4 to l3,3°C. During May, September and November it spawns between 40°-42°S . In the San Matías Gulf northern area hake eggs were caught in September and October. ln the southern platform between 4l°30’ to 47°S it was detected an important spawning area off southwestern Peninsula Valdes and coastal Chubut and another less important in the southern San Jorge Gulf , both during November to March, with peaks in December. In summer hake spawns between 40 to 60 m depth, and temperatures at lO m ranged from l3 to 18°C. The late larvae and early juveniles distribution is consistent with spawning areas. The different spawning areas are related to very particular oceanographic conditions, wich determine an appropiate reproductive habitat associated with retention areas and disponibility of food. The winter spawning area is influenced by different fronts (shelf break and termohaline) and the Ekman’s transport to the coast prevents larval drift to subtropical waters. The summer spawning area is influenced in the south and southwestern Península Valdés by tidal fronts, while in San Matías and San Jorge Gulfs by termohaline ones. The spawning times and areas are related with different hidrographic processes, wich are associated with different adult groups or stocks, supporting the hypothesis that hake presents multiple stocks in the Argentine Sea. In the most important summer spawning area , related with tidal fronts, the eggs and larvae are distributed in frontal and stratified areas where differences of surface and bottom temperatures ranged between 3,8 to 4°C. Eggs in different stages and early larvae were distibuted in the whole water column. The presence of larvae and juveniles in different seasons and areas in the Argentine Sea allowed to associate to the hake recruitment process the match-mismatch production cycles (Cushing, 1972) and member vagrant hypothesis (Sinclair & Iles, l989). Because of the adults reproductive behavior and the early life history stages distribution, the hake may be considered as a succesful spawner, wich supports an important fishery pressure.

Einsenberg, Patricia. "Síntesis, caracterización y entrecruzamiento de silsesquioxanos derivados de (3-metacriloxipropil) trimetoxisilano" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo principal de esta tesis fue la síntesis y caracterización de 3-metacriloxipropilsilsesquioxanos, y su utilización en la formulación de materiales híbridos orgánico-inorgánicos a través de la copolimerización con estireno y el sistema estireno-resina poliéster. La reacción de policondensación de (3-metacriloxipropil) trimetoxisilano fue llevada a cabo en masa (sin agregado de solvente), empleando ácido fórmico 98 % (p/p) (relación molar HCOOH/Si = 3 o 6), a 50°C o 70°C, durante periodos de tiempo de hasta un mes. Los silsesquioxanos (SSO) resultantes fueron caracterizados por RMN ¹H, IR-FT, SEC, UV-MALDI- TOF MS (modo lineal, reflector y PSD) y ESI-TOF MS. La concentración de grupos metolxilo Si-OCH3 residual y de los productos volátiles CH3OH y HCOOCH3, generados en el transcurso de la reacción fue evaluada cuantitativamente por RMN ¹H durante la etapa inicial de la síntesis. Al cabo de 2 días de reacción a 50°C, o de alrededor de 6 horas a 70°C, los SSO resultantes presentaban principalmente grupos silanol (Si-OH) residual y sólo trazas de grupos Si-OCH, , resultado confirmado por IR-FT y UV-MALDI-TOF MS en modo reflector. La reacción de policondensación continúa lentamente, durante el periodo de almacenamiento a temperatura ambiente, principalmente a través de la condensación de los grupos silanol residual (Si-OH + Si-OH). La fracción promedio de ciclos intramoleculares aumenta continuamente durante la policondensación. Para un producto de reacción típico, con especies involucrando de 6 a 24 átomos de silicio, se obtuvo un valor de Fprom = 0,81. El valor obtenido evidencia la presencia de estructuras relativamente cerradas. El espectro MS/MS mostró la fragmentación de uno o más grupos ésteres unidos al átomo de silicio, seguido de un reordenamiento de McLafferty . La adición de agua a la formulación inicial (relación molar 3:1 H2O/Si), dio lugar a una disminución en la velocidad de policondensación y a una disminución de la fracción promedio de ciclos intramoleculares, resultando en la formación de estructuras más abiertas. El empleo de ácido fórmico produce entonces SSO que presentan una fracción de ciclos intramoleculares superior respecto de los SSO sintetizados a partir de formulaciones convencionales. Los 3-metacriloxipropil-SSO fueron copolimerizados con estireno empleando peróxido de benzoílo como iniciador. Cuando la relación molar de estireno (S) a insaturaciones metacrílica (M), (S/M), fue > 1 la reacción de copolimerización alcanza conversión completa, resultado verificado a través del valor de reacción obtenido por calorimetría diferencial de barrido (DSC). Las propiedades térmicas y mecánicas de los materiales híbridos orgánico-inorgánicos fueron determinadas en función del contenido de SSO en la formulación. Al aumentar el contenido de SSO se observó un aumento en la temperatura de transición vítrea (hasta un punto donde no se observó devitrificación del material antes de la descomposición térmica del mismo), módulo elástico en estado goma, estabilidad térmica y dureza Barcol. Soluciones de 3-metacriloxipropil-SSO en estireno (S) fueron empleados como agentes de entrecruzamiento en formulaciones de resinas poliéster insaturadas (UP). La reacción de copolimerización se llevó a cabo empleando peróxido de benzoílo como iniciador, alcanzándose una alta conversión de insaturaciones como lo mostraron las mediciones de calor de reacción obtenidas por DSC. Las propiedades dinámico-mecánicas de los materiales híbridos obtenidos mostraron una fuerte dependencia con el contenido de SSO en la formulación inicial. Cuando el contenido de SSO era bajo o intermedio se observó un aumento en la temperatura de transición vítrea (Tg) y en el módulo elástico en estado goma. Cuando el contenido de SSO era mayor, el material mostró un comportamiento típico de un material compuesto formado por una matriz rica en SSO incluyendo un dominio "flexible" UP-S. El módulo elástico mantuvo un alto valor luego de la devitrificación del dominio “flexible” UP-S. En estos materiales también se observó un aumento en la resistencia a la degradación térmica.

Abstract:
The main objective of this thesis was the synthesis and characterization of 3-methacryloxypropyl- silsesquioxanes, and their utilization in the formulation of hybrid organic-inorganic polymer networks based on the copolymerization with styrene and styrene-polyester resins. The polycondensation of (3-methacryloxypropyl) trimethoxysilane was performed in bulk, using 98 wt% formic acid (molar ratio HCOOH/Si = 3 or 6), at 50°C or 70°C, for periods of time up to one month. The resulting silsesquioxanes (SSO's) were characterized by ¹H NMR, FTIR, SEC, UV-MALDI-TOF MS (linear, reflector and PSD modes), and ESI-TOF MS. The residual concentrations of Si-OCH3 groups, and generated CH3OH and HCOOCH3, were quantitatively monitored by ¹H NMR during the initial stage of the synthesis. After 2 days of reaction at 50 °C, or about 6 hours at 70 °C, the resulting SSO mainly contained residual SiOH groups with only traces of Si-OCH3 groups, as was also confirmed by FTIR and UV-MALDl- TOF MS in the reflector mode. After this time, the polycondensation continued sIowa during storage at room temperature, basically through Si-OH + Si-OH reactions. The average fraction of intramolecular cycles increased continuously during the polycondensation. An average value, Fav= 0.81, was found for species containing 6 to 24 Si atoms in a typical reaction product. This evidenced the presence of species with relatively closed structures. In MS/MS spectra, fragmentation of one or more ester groups attached to Si atoms was observed, following a McLafferty rearrangement. The addition of water to the initial formulation (about 3:1 H20/Si molar ratio), led to a slower polycondensation rate, and to a decrease of the average fraction of intramolecular cycles (formation of more open structures). Therefore, the use of 98 wt% formic acid was useful to synthesize SSO’s containing a higher fraction of intramolecular cycles than those resulting from conventional formulations. The 3-methacryloxypropyl-SSO were copolymerized with styrene using benzoyl peroxide as initiator. When the ratio of styrene (S) to methacrylic (M) unsaturations was S/M > 1, the reaction attained an almost complete conversion as shown by the total reaction heat determined by differential scanning calorimetry. Several properties of the resulting hybrid organic-inorganic polymer networks were determined as a function of the silsesquioxane amount used in the formulation. Increasing the silsesquioxane fraction led to an increase of the glass transition temperature up to a point where devitrification was not observed prior to decomposition, an increase of the elastic modulus in the rubbery state, a decrease of the intensity of tan δ, and an increase of both Barcol hardness and thermal stability. Solutions of 3-methacryloxypropyl-SSO in styrene (S) were used as hardeners of unsaturated polyesters (UP) based on phthalic and maleic anhydrides and propylene glycol. The cure with benzoyl peroxide was carried out to a high conversion of double bonds as revealed by the reaction heat measured by differential scanning calorimetry. Dynamic mechanical properties of the cured materials showed significant differences depending on the amount of SSO in the initial formulation. At low to medium SSO fractions, an increase in both the glass transition temperature (Tg) and the rubbery modulus was observed. But at large SSO fractions the material showed a typical behavior of a composite with a SSO-rich matrix including “soft” UP-S domains. The elastic modulus remained at high values after devitrification of the “soft” domains. Also, the addition of the SSO led to an improvement in the resistance to thermal degradation.

Eirin, María Emilia. "Epidemiología molecular del virus linfotrópico T-humano tipo 1 (HTLV-1) en Argentina: análisis étnico-geográfico y variabilidad viral" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo principal de esta tesis fue profundizar los conocimientos sobre la infección por HTLV-1 en Argentina. Con tal fin, se estimó la prevalencia de infección en comunidades originarias de las provincias de Jujuy, San Juan, Misiones, Formosa y Chaco, detectándose una prevalencia en Kollas de 9.8% que confirmó un área naturalmente endémica en Jujuy con una restricción étnico-geográfica ya descripta. El análisis filogenético determinó que las secuencias HTLV-1, tanto de Jujuy como de Buenos Aires, eran subtipo Cosmopolita subgrupo Transcontinental (aA) a excepción de dos, cuyas muestras provenían de individuos residentes de Buenos Aires nacidos en Perú (Neu2 y Neu6) que fueron clasificados en un nuevo subgrupo denominado F. Por otro lado, se detectaron 4 secuencias evolutivamente relacionadas con referencias de Sudáfrica, demostrando la circulación de cepas virales de origen africano en Buenos Aires. Al estudiar el origen étnico de los individuos HTLV-1 positivos, se evidenció la presencia de un componente autóctono predominante, detectándose los cuatro haplogrupos panamericanos (A2, B2, C1, D1) en los Kollas y en el 73% de los residentes de Buenos Aires. En el resto se identificaron haplogrupos alóctonos con un 17,9% de origen Euroasiático Occidental (H, J, T, U, N1b), un 4,5% de origen Africano (L0 y L1) y un 1,5% de origen Asiático Oriental (M7a). Las cepas clasificadas filogenéticamente como de origen africano pertenecieron a individuos con haplogrupo B2 amerindio, mientras que una secuencia de Buenos Aires que agrupó junto a las de Jujuy provenía de un donante con haplogrupo de origen africano. Estos datos sugieren el contacto entre estas poblaciones y sustenta la hipótesis de introducción de la infección con la llegada de esclavos africanos en la época pos-colombina. El análisis in sílico de las secuencias LTR reveló una menor variabilidad en individuos asintomáticos en comparación con pacientes con HAM/TSP y ATL(p menor 0,05), mientras que la variabilidad de la proteína viral Tax fue significativamente menor en secuencias de portadores de Jujuy que en individuos asintomáticos o con enfermedad de Buenos Aires. De todos modos, no se detectó un polimorfismo determinado asociado con la presencia de patología.

Abstract:
The aim of this thesis was to gain an in-depth knowledge of HTLV-1 infection in Argentina. In order to achieve this, HTLV-1 prevalence was estimated in aboriginal populations of Jujuy, San Juan, Misiones, Formosa and Chaco provinces, yielding a 9.8% among Kollas and confirming a naturally endemic area in Jujuy, associated to an ethnic-geographic restriction as previously described. The phylogenetic analysis determined that HTLV-1 sequences, both from Jujuy and Buenos Aires, were Cosmopolitan subtype Transcontinental (aA) subgroup with the exception of two sequences belonging to residents of Buenos Aires city but born in Peru (Neu2 y Neu6) who were classified in a new subgroup named F. On the other hand, 4 sequences evolutionally related to South Africa were detected, demonstrating the presence of viral strains with African origin in Buenos Aires city. Regarding the ethnic origin of all HTLV-1 positive individuals, the presence of a predominant autochthonous component (Pan-American haplogroups A2, B2, C1, D1) was detected, being all four present in Kollas and in 73% of Buenos Aires inhabitants. In the other populations alloctonous haplogroups were identified with a 17,9% Occidental Eurasian origin (H, J, T, U, N1b), a 4,5% African origin (L0 y L1) and a 1,5% de Oriental Asian origin (M7a). The strains phylogenetically classified as African belonged to individuals with Amerindian B2 haplogroup, while a sequence from Buenos Aires which grouped together with sequences from Jujuy belonged to a blood donor with an African origin haplogroup. This data suggests contact between these populations and sustains the hypothesis of the introduction of HTLV-1 infection with the arrival of African slaves in the post-Columbian era. The analysis in sílico of LTR sequences revealed a lower variability in asymptomatic individuals compared to HAM/TSP and ATL patients (p < 0,05), while the variability of Tax viral protein was significantly lower in asymptomatic individuals from Jujuy compared to asymptomatic or HAM/TSP and ATL patients from Buenos Aires. Regardless this situation, not a specific polymorphism was detected in association to the presence of pathologies.

El Hasi, Claudio. "Efectos no-lineales en cosmología clásica y cuántica." (1994). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Una de los rasgos salientes de la Teoría de la Relatividad General es que las ecuaciones que gobiernan el campo gravitatorio son de caracter no-lineal. Debido a que los sistemas no lineales presentan una gran riqueza de comportamiento, aplicaremos nociones de Teoría de Sistemas Dinámicos a situaciones donde analizar estos efectos se hace ineludible en el Universo Primitivo. Comenzaremos con el estudio de un Universo de Friedmann - Robertson - Walker acoplado a un campo escalar, real y masivo. Dividiremos el Hamiltoniano del sistema en una parte integrable más una perturbación, analizando los límites de estabilidad y la existencia de resonancias de la dinámica no perturbada. Calcularemos el Espectro de Exponentes de Lyapunov en las regiones regular y caótica del espacio de fases. Dado que la noción de Exponente de Lyapunov es dependiente de la noción de medida, implementaremos el método de las Secciones de Poincaré como confirmación, independiente, de la aparición de caos. Para ampliar nuestra bateria de ejemplos consideraremos un modelo más completo, incluyendo constante cosmológica y autointeracción del campo escalar. Estudiando la estabilidad lineal de la dinámica, confirmaremos la posible existencia de caos en estos modelos generalizados. Implementaremos el método de las curvas Frecuencia - Frecuencia como forma sistemática de hallar condiciones iniciales para construir las Secciones de Poincaré en un entorno de las regiones resonantes. Al considerar un modelo de mayor relevancia cosmológica, confirmaremos la validez del Principio de Calvicie Cósmica en el mismo y verificaremos la aparición de estructuras en el espacio de fases (cantoros e islas de estabilidad), debido a cuya existencia el comportamiento del sistema dista mucho de ser trivial. Incluiremos un modo no homogéneo al campo escalar, para estudiar la reacción de estos modelos a1 incrementarse el número de grados de libertad del sistema, mostraremos que los resultados obtenidos son compatibles con un proceso de Difusión de Arnold. En un modelo semiclásico y autoconsistente, del Universo Primitivo, estudiaremos el proceso de creación de partículas. Confirmaremos que el mismo se debe a la presencia de interacciones resonantes entre los distintos grados de libertad. Esto muestra la estrecha relación entre caos a nivel clásico y creación de particulas a nivel semiclásico y la importancia de las contribuciones no lineales como fuente de efectos no triviales en Cosmología

Elguero, María Belén. "Rol de HO-1 en la regulación de la inflamación asociada al cáncer de próstata. Compartimentalización subcelular y función" (2013). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El cáncer de próstata (PCa) es la segunda causa de muerte por esta enfermedad entre los hombres occidentales. Los andrógenos y el receptor de andrógenos (AR) son críticos para el desarrollo del PCa. El AR recluta varios co-activadores/co-represores y factores de transcripción modificando la expresión de genes blanco. Se han identificado varios mecanismos que activan al AR entre ellos la vía de señalización de STAT3. Trabajos previos de nuestro laboratorio demostraron la expresión nuclear de HO-1 en carcinomas primarios de próstata. In vitro la inducción de HO-1 disminuyó la proliferación, la invasión y la migración celular y retardó el crecimiento tumoral y la angiogénesis in vivo. Nuestra hipótesis es que HO-1 podría actuar como un co-regulador de receptores nucleares o bien modificar el microambiente tumoral modulando la expresión de factores que actuarían como coreguladores. En este trabajo de tesis nos propusimos investigar si HO-1 afecta la actividad transcripcional del AR a través del eje STAT3. Demostramos que la inducción de HO-1 en las células de PCa reprime la activación del AR, disminuyendo la actividad del promotor y los niveles del ARNm del antígeno prostático específico (PSA). Comprobamos que la sobreexpresión de HO-1 induce arresto del ciclo celular en G2/M. Mediante inmunoprecipitación de la cromatina determinamos que HO-1 se asocia a promotores génicos, revelando una nueva función nuclear para esta proteína. Mediante ensayos de co-inmunoprecipitación mostramos que HO-1 y STAT3 interaccionan directamente. Por medio de microscopía confocal demostramos que HO-1 provoca la retención citoplasmática de STAT3. El tratamiento con hemina (inductor específico de HO-1) impidió la inducción de la expresión de los genes targets de STAT3, coincidente con la disminución de los niveles de pSTAT3 en el núcleo. Estudios in vivo confirmaron la reducción de la localización nuclear de STAT3 en los xenotransplantes de células PC3 que sobre-expresan HO-1. Adicionalmente, NFκB, un factor relevante en la inflamación y que forma complejos con STAT3, también queda inactivo retenido en el citoplasma cuando se induce HO-1. Estos resultados proveen una función nueva para HO-1 reprimiendo la actividad transcripcional del AR en PCa e interfiriendo con la señalización de STAT3. Estos hallazgos sustentan nuestra proposición acerca del nuevo rol que posee HO-1, más allá de su actividad catalítica.

Abstract:
Activation of the androgen receptor (AR) is a key step in the development of prostate cancer (PCa). Several mechanisms have been identified in AR activation, among them signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) signaling. Recent studies suggest that heme oxygenase 1 (HO-1) may play a key role in PCa, independent of its catalytic function. We sought to explore whether HO-1 operates on AR transcriptional activity through the STAT3 axis. Our results display that HO-1 induction in PCa cells represses AR activation by decreasing the prostate-specific antigen (PSA) promoter activity and mRNA levels. We also show that HO-1 over expression in PC3 cells induces the arrest of the cell cycle in G2/M. Strikingly, this is the first report to show by chromatin immunoprecipitation analysis that HO- 1 associates to gene promoters, revealing a novel function for HO-1 in the nucleus. Furthermore, HO-1 and STAT3 directly interact as determined by co-immunoprecipitation studies. Forced expression of HO-1 increases in vitro and in vivo STAT3 cytoplasmic retention. When PCa cells were transfected with a constitutively active STAT3 mutant, PSA and STAT3 downstream target genes were abrogated under hemin treatment. Additionally, a significant decrease in pSTAT3 protein levels was detected in the nuclear fraction of these cells. Confocal microscopy images exhibit a decreased rate of AR/STAT3 nuclear colocalization under hemin treatment. The inflammatory key factor NFκB was shown to interact with both STAT3 and AR and its nuclear translocation was impaired by hemin treatment. These results provide a novel function for HO-1 down-modulating AR transcriptional activity in PCa cells, interfering with STAT3 signaling, evidencing HO-1 role beyond heme degradation.

Elhalem, Eleonora. "Diseño y síntesis de nucleósidos carbocíclicos conformacionalmente restringidos" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los nucleósidos carbocíclicos son análogos de nucleósidos en los que el átomo de oxígeno del anillo furanósico está reemplazado por un grupo metileno. La ausencia de una verdadera unión glicosídica le otorga mayor estabilidad metabólica pues no son afectados por fosforilasas e hidrolasas que sí atacan a los nucleósidos convencionales. Las enzimas responsables de distintas acciones farmacológicas de los nucleósidos convencionales también reconocen los análogos carbocíclicos correspondientes, obteniéndose un amplio rango de propiedades biológicas, especialmente como agentes antivirales y antitumorales. La conformación en este tipo de drogas cumple un rol fundamental en la actividad biológica; sin embargo, los carbanucleósidos presentan una conformación distinta a la de los nucleósidos convencionales en solución, por lo que son menos efectivos. N-metano-carba-timidina (50), un carbanucleósido sintético rígido en la conformación Norte y estructuralmente relacionado al nucleósido carbocíclico natural neplanocina C (48), construido en un sistema bicíclicohexano, exhibió una potentísima acción antiherpética, incluso mayor que aciclovir. Por este motivo, se llevaron a cabo estudios sintéticos para optimizar su estructura química. En los dos primeros capítulos de esta tesis se describen los antecedentes de nucleósidos, sus análogos carbocíclicos y aquellos que presentan restricciones conformacionales. También se incluye un resumen de los métodos de síntesis más comunes para la preparación de carbanucleósidos y la síntesis y actividad biológica de los compuestos más relevantes de esta familia de análogos. En el tercer capítulo se extendió el estudio de la monoprotección regioselectiva de glicoles por tratamiento con DIBAL-H y ortoformiato de metilo catalizado por nitrato cérico amónico. Este estudio surgió de la necesidad de proteger regioselectivamente un hidroxilo alílico secundario frente a uno homoalílico, durante la síntesis enantioselectiva de (+)-neplanocina F (183), realizada en nuestro laboratorio. En los capítulos cuatro y cinco se presenta la primera síntesis de nucleósidos carbocíclicos conformacionalmente restringidos en una conformación de tipo Norte, construidos en un sistema tiabiciclohexano. Para dicho estudio se desarrollaron nuevos métodos para la preparación de episulfuros fusionados a anillos de cinco miembros sintetizándose primero modelos simples de carbanucleósidos construidos sobre este sistema azufrado. N-tia-carba-timidina (273) se comportó como un agente antiherpético muy potente, comparable a aciclovir.

Abstract:
Carbocyclic nucleosides are nucleosides analogues in which the oxygen atom of the furanose ring is substituted by a methylene group. These analogues have great metabolic stability because they are unaffected by phosphorylases and hydrolases that cleave the glycosidic bond of conventional nucleosides. The responsible enzymes for pharmacological actions of conventional nucleosides also recognize the carba-analogues displaying a wide range of biological properties, especially as antiviral and antitumoral agents. The conformation of this type of drugs plays an important role in the biological activity. In solution, carbanucleosides present a different conformation than for conventional nucleosides, for that reason they are less effective in molecular recognition processes. N-methano-carba-thymidine (50), a carbocyclic nucleoside locked in the North conformation and structurally related to the natural carbanucleoside neplanocin C (48), built on a bicyclohexane system, exhibited potent antiherpetic activity, even greater than acyclovir, a well-known antiherpetic agent. Synthetic studies motivated to optimize the chemical structure of 50 were performed. Chapters one and two provide an introduction to nucleosides, carbocyclic nucleosides and those with conformational restrictions. A summary of the most common synthetic methods to prepare carbanucleosides and the synthesis and biological activity of representative members of this family of compounds are included. Chapter three describes the study of the scope about the regioselective monoprotection of glycols by treatment with DIBAL and methyl orthoformate catalyzed by ceric ammonium nitrate. This study emerged as a consequence of the need of protecting regioselectively a secondary allylic hydroxyl group over a homoallylic in the course of the enantioselective synthesis of (+)-neplanocin F (183), developed in our laboratory. Chapter four and five present the first synthesis of conformationally locked carbocyclic nucleosides built on a thiabicyclohexane system, in a Northern-type geometry. For this purpose, new methods for the preparation of an episulfide group fused to a five-member ring were developed. At the beginning, simple models of carbanucleosides built on this sulfur-containing system were prepared. N-thia-carba-thymidine (273) behaved as a very potent antiherpetic agent showing potency comparable to acyclovir.

Elia, Evelin Mariel. "Efecto del hiperandrogenismo sobre la fisiología uterina. Acción de la Metformina como tratamiento" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El Síndrome del Ovario Poliquístico (SOP) es una de las endocrinopatías más frecuentes en mujeres en edad reproductiva. Su característica principal es el hiperandrogenismo, condición que tiene efectos perjudiciales sobre la función endometrial, contribuyendo a las altas tasas de aborto, de hiperplasia y cáncer endometrial. La administración de Metformina en pacientes SOP presenta numerosos beneficios aunque existe controversia sobre su efectividad para mejorar las tasas de embarazo. Además, muchas pacientes no responden a este tratamiento y en esos casos se obtienen mejores resultados al administrarla junto con Rosiglitazona. En el presente trabajo estudiamos los mecanismos por los cuales el hiperandrogenismo altera la funcionalidad uterina y la capacidad del tratamiento con Rosiglitazona y/o Metformina de prevenir dichas alteraciones. El hiperandrogenismo, a nivel uterino, alteró su histología, el balance apoptosis/proliferación celular, el metabolismo del ácido araquidónico, la activación de los factores de transcripción PPARγ e incrementó el estrés oxidativo. La administración de Metformina evitó muchas de dichas alteraciones excepto el estrés oxidativo uterino. La combinación Metformina+Rosiglitazona, mejoró las defensas antioxidantes. Concluimos que esta sería una de las causas por las cuales la terapia combinada daría mejores resultados en el tratamiento de mujeres SOP, especialmente en aquellas que no responden óptimamente a Metformina.

Abstract:
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is one of the most frequent endocrine diseases that affect women in their childbearing age. This syndrome is characterized by hyperandrogenism that shows detrimental effects on the endometrial function, contributing to the high rates of pregnancy loss, hyperplasia and endometrial cancer. Metformin in the treatment of PCOS shows numerous benefits although there is controversy about its effectiveness to improve pregnancy rates. In addition, many patients do not respond to Metformin-treatment and in those patients better results are obtained when Metformin is administered together with Rosiglitazone. In the present work, we studied the mechanisms by which hyperandrogenism alters uterine function and the capacity of Rosiglitazone and/or Metformin treatment/s to prevent such alterations. Hyperandrogenism altered the uterine histology, the balance between apoptosis/cell proliferation, the arachidonic acid metabolism, the activation of the transcription factors PPARγ and increase the oxidative stress. The administration of Metformin avoided many of these alterations except the oxidative stress. The combination Metformin+Rosiglitazone improved the antioxidant defenses. We conclude that this would be one of the reasons because of the fact that the combined therapy would give better results in the treatment of PCOS women, especially in those who do not respond optimally to Metformin.

Ellerman, Diego A.. "Relación estructura-función de la proteína epididimaria de rata "DE", y su potencial uso para el desarrollo de un método de regulación de la fertilidad" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La glicoproteína epididimaria de rata "DE" se asocia al espermatozoide durante la maduración, y participa en el proceso de fusión de gametas a través de sitios complementarios presentes en la superficie del ovocito. Con el fin de comprender los mecanismos involucrados en la participación de DE en dicho proceso, se estudió la importancia de la estructura de DE para la actividad de la proteína. El clonado del ADNc de DE permitió obtener la secuencia de los 227 aminoácidos (aa) de la proteína. El análisis de dicha secuencia indicó que DE pertenece a la familia CRISP (cystein rich secretory proteins), y la presencia de 16 cisteínas en la molécula. El ADNc fue utilizado luego para expresar la proteína recombinante en bacterias (recDE). El estudio de recDE y de la proteína nativa deglicosilada, indicó que la actividad biológica residiría en la porción peptídica de la molécula. Por otro lado, el análisis del estado de oxidación de las cisteínas indicó que la mayoría de ellas formaría puentes disulfuro, y que la ruptura de los mismos afectaría la actividad de la proteína. La expresión de distintos fragmentos recombinantes de DE y su empleo en ensayos biológicos, reveló que la actividad de la proteína residiria en la región comprendida entre los aa 62-158. Resultados previos de nuestro laboratorio indican que la inmunización de ratas con proteína DE produce una respuesta inmune y una inhibición significativa de la fertilidad. El presente trabajo indica que los mecanismos responsables de dicha inhibición involucrarían la entrada de anticuerpos anti-DE al tracto reproductivo, su interacción con los espermatozoides, y la disminución de la capacidad fertilizante de los mismos, abriendo la posibilidad del potencial uso de DE para el desarrollo de un método inmunológico de regulación de la fertilidad. Dado que para ello es necesario poder disponer del antígeno en grandes cantidades, la proteína recombinante fue utilizada en ensayos de inmunización, que indicaron que recDE, al igual que la proteína nativa, es capaz de producir una respuesta inmune y una reducción de la fertilidad. Con el fin de investigar la posible aplicación de este método inmunológico en el hombre, la capacidad inmunogénica de la proteína humana homóloga a DE, proteína ARP, fue estudiada en un modelo de primates no humanos, observándose la inducción de una elevada respuesta inmune en los animales inmunizados. En conjunto, los resultados obtenidos en este trabajo contribuyen al esclarecimiento de los mecanismos involucrados en la participación de DE en el proceso de fusión de gametas, y apoyan el potencial uso de esta proteína y sus homólogos para el desarrollo de un método inmunológicode regulación de la fertilidad tanto en animales como en el hombre.

Abstract:
Rat epididymal glycoprotein “DE” associates with sperm during maturation and participates in gamete fusion through complementary sites localized on the egg surface. To get a better understanding of the molecular mechanisms underlying the participation of DE in this process, the relevance of protein DE structure for its biological activity was studied. Cloning of DE cDNA allowed obtaining the sequence of the 227 aminoacids (aa) of the protein. The analysis of the sequence, indicated that DE belongs to the CRISP (cystein rich secretory proteins) family, and the presence of 16 cysteines in the molecule. DE cDNA was then used for the bacterial expression of the recombinant protein (recDE). The study of recDE as well as of the deglycosilated native DE (nDE) indicated that the activity of the protein resides on the peptidic portion of the molecule. The evaluation of the oxidative state of cysteines indicated that most of them would be involved in disulfide bridges, and that the rupture of these bridges would affect the protein activity. The expression of different recombinant fragments of DE, and their use in biological assays indicated that the biological activity of DE would be located within the region encompassed by aa 62-158. Previous results from our laboratory indicate that immunization of rats with protein DE induces an immune response and a significant inhibition of fertility. The present study indicated that the mechanisms responsible for this inhibition would involve the entry of antibodies into the reproductive tract, their association to sperm, and the reduction of sperm fertilizing ability. These results suggested the potential use of DE for developing and immunological method of fertility regulation. Since an important requirement for this purpose, is the possibility of obtaining the antigen in large quantities, recombinant DE was used in immunization studies, which revealed that, like native DE, recDE is able to produce an immune response as well as an inhibition of fertility. In order to explore the potential application of this immunological approach to humans, the immunogenic ability of the human protein homologue of DE, protein ARP, was evaluated in a non human primate model. The induction of a high immune response was observed in all the immunized animals. Together, the results obtained in this work contribute to a better understanding of the molecular mechanisms underlying the participation of DE in sperm-egg fusion, and support the potential use of DE for the development of an immunological method of both animal and human fertility regulation.

Elola, María Dolores. "Estudio computacional de reacciones químicas en entornos acuosos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo hemos estudiado aspectos dinámicos y de equilibrio relacionados con procesos reactivos que toman lugar en agregados acuosos, mediante técnicas de simulación de Dinámica Molecular. La metodología empleada consiste en un esquema mixto cuántico-clásico, que involucra un cálculo de estructura electrónica sobre una porción del sistema -aquella en la cual la densidad electrónica cambia sustancialmente durante la reacción- en conjunto con potenciales empíricos de campo medio para modelar el solvente. Investigamos en primer lugar la dinamica del desprendimiento electrónico en Ioduro producido por una excitación electrónica, en agregados acuosos, Iˉ(H2O)n, con N entre 6 y 100. Nuestro objetivo estuvo focalizada en el análisis de los efectos térmicos y de tamaño sobre los mecanismos microscópicos que gobiernan la reacción de desprendimiento. Nuestras simulaciones indican que la excitación electrónica genera estados electrónicos altamente difusos en los agregados más pequeños, favoreciendo la estabilización del solvente. Los tiempos característicos del proceso de relajación del solvente resultaron ser del orden de 0.05-0.1 p8. En segundo lugar estudiamos la reacción de disociación de ácido nítrico en agregados acuosos, HNO3(H20)n. Para ello utilizamos la metodología mixta, resolviendo el problema de estructura electrónica a través del formalismo de los Funcionales de la Densidad (DFT). Un aspecto importante de nuestra motivación fue saber el número mínimo de moléculas de agua necesarias para convertir la disociación del ácido en un proceso espontáneo. Al respecto, nuestras simulaciones muestran la existencia de un valor umbral por debajo del cual la disociación no ocurre, que se encuentra entre 3 ≤ N ≤ 10. Finalmente estudiamos la dinamica de la reacción de transferencia de protón entre ácido bromhídrico y el ion hidroxilo que toma lugar en agregados acuosos pequeños, con N = 2 y 6 moléculas de agua. En este último caso agregamos un ingrediente más en la modelización del solvente, incorporando explícitamente los efectos de polarización.

Abstract:
We have studied dynamical and equilibrium aspects of reactive processes taking place in aqueous clusters, using Molecular Dynamics techniques. The methodology employed consists in a mixed quantum-classical scheme that combines an electronic structure calculation for a portion of the system —where there is a substantial change in the electronic density- with empirical mean field potentials for the solvent. We have first investigated the solvation dynamics following electron photodetachment from Iodide in aqueous clusters, Iˉ(H2O)n, with N ranging between 6 and 100. Our main interest was focused on the analysis of thermal and size effects on the microscopic mechanisms that drive the electron photodetachment. Our simulations seem to indicate that the electronic excitation generates highly diffuse states in the smaller clusters, favoring solvent stabilization. The characteristic times of the solvent relaxation process were of the order of 0.05-0.1 ps. We have also studied the dissociation of nitric acid in aqueous clusters, HN03(H20)n, using a mixed quantum-classical methodology. The electronic structure was solved within the Density Functional formalism (DFT). A key question was how many water molecules are necessary to bring the acid dissociation of HN03 a spontaneous process? In this sense, our simulations show the existence of a threshold size of water molecules below which the reaction is not observed, in an intermediate value between 3 ≤ N ≤ 10. Finally we have studied the proton transfer reaction of bromidic acid with the hydroxile group taking place in small clusters, containing N = 2 and 6 water molecules. In this case we have included explicitly the solvent polarization degrees of freedom in the classical force field potentials.

Elola, María Teresa. "Detección, cuantificación y caracterización de Lectinas ß-Galactosídicas de Bufo arenarum" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Elvira, Víctor Daniel. "Medición de la sección eficaz diferencial inclusiva de jets en colisiones pp a raíz cuadrada de s = 1.8 TeV con el detector DO" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Elías, Cecilia. "Síntesis de inositoles nitrogenados y sulfonilados con actividad biológica potencial : Reacciones de funcionalización de hidratos de carbono" (1996). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
A partir del mio-inositol se llevó a cabo la síntesis de diversos inositoles nitrogenados y sulfonilados relacionados con el muco-inositol. El 3-azido-3-desoxi-1,5,6-tri-O-(metil- sulfonil)-muco-inositol fue el producto más importante de éstas síntesis y se empleó como materia prima para la obtención de mostazas nitrogenadas con diferentes estructuras.Se investigó también su aplicación a la síntesis de oligosacáridos aminociclitólicos. Como resultado de observaciones realizadas en forma paralela en éstos últimos estudios, surgió la posibilidad de emplear sales de nitrilio en general para funcionalizar el carbono anomérico de azúcares peracilados, generando N-acilglicosilaminas. Como modelo de ésta aplicación se estudió la reacción, catalizada por el tetracloruro de estaño, del acetilamino acetonitrilo con la penta-O-benzoíl-(-D-glucopiranosa, aislándose diferentes productos de acople y de transformación del azúcar de partida. Se discuten estudios biológicos "in vitro" realizados con el 1,5-dicloro-6-N-bis(2-cloroetil)amino-1,5,6-tridesoxi-2,3,4-tri-O-(metilsulfonil)-muco-inositol, sintetizado en ésta tesis.

Abstract:
Starting from myo-inositol, the synthesis of several nitrogenated and sulfonylated derivatives of muco-inositol were performed. The 3-azido-3-deoxy-1,5,6-tri-O-(methylsulfonyl)-muco-inositol was a relevant product obtained and it was employed to synthesize several nitrogen mustards. Its application to the synthesis of cyclitol oligosacarides was also investigated. In the latter studies, observations were made that suggested the possibility to employ nitrilium salts in general to functionalise the anomeric carbon atom of peracylated sugars, to give N-acylglycosylamines. As a model for that application, the reaction of acetylamino acetonitrile with penta-O-benzoyl-(-D-glucopyranose catalyzed by tin (IV) chloride was investigated, and different coupling and transformation products of the starting sugars were isolated. Biological studies conducted with one of the substances obtained, the 1,5-dichloro-6-N-bis(2-chloroethyl)amino-1,5,6-trideoxy-2,3,4-tri-O-(methylsulfonyl)-muco-inositol, are described.

Ernesto, Juan Ignacio. "Caracterización de distintos miembros de la familia de proteínas CAP en tracto reproductor masculino y femenino y su participación en el proceso de fertilización" (2012-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
A pesar de la importancia del proceso de fertilización, es aún muy escasa la información disponible acerca de las moléculas involucradas. Las evidencias de nuestro laboratorio indican que las proteínas de la familia CRISP, miembro de la superfamilia CAP, serían claros mediadores del proceso de interacción de gametas. Teniendo en cuenta que las CRISP se expresan principalmente en el tracto reproductor masculino, el primer objetivo de esta Tesis ha sido investigar si las mismas también se expresan en el tracto reproductor femenino y cumplen un rol en el proceso de fertilización. Los resultados obtenidos utilizando los modelos de rata y ratón indicaron que mientras CRISP1 se encuentra presente en útero, oviducto, ovario, y células del cúmulus, CRISP2 se detecta sólo en ovario, y CRISP4 no se expresaría en el tracto de la hembra. Ensayos de fertilización in vitro utilizando espermatozoides y COC (complejos ovocito-cúmulus) provenientes de ratones knockout para CRISP1 indicaron que la proteína presente en el cúmulus cumpliría una función en el proceso de fertilización. Estudios posteriores revelaron que CRISP1 exhibe propiedades quimioatractantes hacia los espermatozoides, sugiriendo que éste podría ser el mecanismo por el cual CRISP1 del cúmulus participa en el proceso de fertilización. Dada la gran homología entre las CRISP y las GLIPR1, las cuales constituyen las dos familias mejor caracterizadas de la superfamila CAP, el segundo objetivo de este trabajo consistió en estudiar la presencia de proteínas GLIPR1 en el tracto reproductor masculino y su participación en la fertilización. Los resultados indicaron la expresión de GLIPR1L1 a nivel testicular y de GLIPR1L2 tanto en testículo como en epidídimo de ratón. La generación de ambas proteínas en forma recombinante y de sus correspondientes anticuerpos confirmó la presencia de las mismas en el espermatozoide y su participación específica en la primera etapa de unión a la zona pellucida. La información obtenida acerca del rol de las proteínas CRISP y GLIPR1 contribuirá a una mayor comprensión de los mecanismos moleculares involucrados en la interacción de gametas como así también al desarrollo de futuros métodos de regulación de la fertilidad tanto en animales como en el humano.

Abstract:
Despite the importance of the fertilization process, there is still little information about the molecules involved in it. Evidence from our laboratory indicates that proteins from de CRISP family, members of the CAP super family, would be clear mediators of the gamete interaction process. Considering that the CRISP are expressed primarily in the male reproductive tract, the first objective of this thesis was to investigate whether these proteins are expressed in the female reproductive tract and if they play a role in the fertilization process. The results indicated that while CRISP1 is present in uterus, oviduct, ovary and cumulus cells, CRISP2 is detected only in the ovary and CRISP4 is not expressed is the female reproductive tract. In vitro fertilization assays using both sperm and COC (oocyte-cummulus complex) from CRISP1 knockout mice indicated that the protein present in the cumulus fulfill a role in the fertilization process. Further studies revealed that CRISP1 exhibit sperm chemoattractant properties, suggesting that this might be the mechanism by which CRISP1 present in the cumulus participates in the fertilization process. Given the high homology between CRISP and GLIPR1, which are the two best characterized families from the CAP super family, the second objective of the present work was to study the presence of GLIPR1 proteins in the male reproductive tract and their participation in the fertilization process. Our results indicated that GLIPR1L1 is expressed in the testis while GLIPR1L2 is present in the testis and the epididymis. The generation of both recombinant proteins and their corresponding antibodies confirmed the presence of these proteins in the sperm (human and mouse) and their specific involvement in the first stage of binding to the zona pellucida. The information obtained about the role CRISP and GLIPR1 proteins will contribute to a greater understanding of the molecular mechanisms involved in gamete interaction as well as to the development of future methods to regulate fertility both in animals and humans.

de Errasti, Andrés. "Hongos manchadores de albura en especies forestales exóticas y nativas de los Andes Patagónicos: taxonomía, patogenicidad y manejo" (2016-06-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Esta tesis constituye el primer relevamiento sistemático de hongos manchadores de albura de la Patagonia argentina. La ‘mancha de albura’ es una modificación de las propiedades ópticas de la madera como consecuencia de la colonización fúngica. El cuerpo (hifas) pigmentado del hongo penetra el parénquima radial y los tejidos vasculares ocasionando una mancha profunda. La mayoría de especies manchadoras pertenecen a los hongos ‘ofiostomatoides’. Este grupo polifilético dentro de los Ascomycota se encuentra asociado íntimamente con artrópodos, en particular, a escarabajos de corteza y ambrosía (Coleoptera: Scolytinae/Platypodinae). Existen casos bien documentados de patógenos primarios dentro del grupo (por ejemplo Ceratocystis fagacearum, Ceratocystis fimbriata, Ophiostoma ulmi), sin embargo, la mayoría de las especies manchan la madera recién cosechada, como saprobios. La madera manchada tiene un precio de venta menor y su aceptación en el mercado disminuye. Ante la falta de información en el país sobre la diversidad y biología de este grupo, se planificó su recolección y estudio en la Patagonia durante el período 2009-2014. El relevamiento fue realizado durante 3 años. Se visitaron diferentes plantaciones y zonas de bosque nativo en las regiones cordilleranas de las provincias del Chubut, del Río Negro y del Neuquén. Los taxones fueron identificados mediante técnicas morfológicas y moleculares (regiones LSU, ITS, β-Tubulina y el factor TEF 1-α). Sus asociaciones con insectos también fueron informadas. En base a la diversidad encontrada sobre árboles enfermos (Nothofagus, Schinus) se diagramaron ensayos para estimar la patogenicidad de algunos aislamientos sobre árboles sanos. Paralelamente, se caracterizó el ciclo del manchado en pináceas utilizadas por la industria forestal, intentando cuantificar la colonización fúngica en función del tiempo, para árboles apeados en distintas épocas del año. Se coleccionaron 588 muestras de las que se obtuvieron 370 aislamientos. Estos fueron clasificados en 28 taxones: 18 taxones conocidos y 10 taxones nuevos para la ciencia. De los nuevos, 5 fueron descriptos formalmente: Huntiella decorticans, Leptographium gestamen, Ophiostoma patagonicum, Ophiostoma peregrinum y Sporothrix cabralii. El bosque andino-patagónico evidenció una importante diversidad con un 80% de taxones endémicos (12/15). Por el contrario, las plantaciones de pináceas estuvieron asociadas a especies que han sido introducidas junto con éstas, tal como se ha constatado en otras regiones del Hemisferio Sur. Los primeros datos moleculares de Ophiostoma nothofagi han permitido identificar un linaje independiente dentro de la familia Ophiostomataceae, cuyas características morfológicas y ecológicas particulares respaldan la posibilidad de erigir un género nuevo para ésta y otras especies relacionadas. En los ensayos de patogenicidad a campo, Huntiella decorticans colonizó satisfactoriamente árboles sanos, de acuerdo con los postulados de Koch. Su relación con escarabajos que se alimentan de savia fresca y la formación de una estructura tipo ‘pressure pad’ indican un comportamiento patogénico. Sin embargo, la formación de cancros fue consecuencia de lesiones localizadas y no de infecciones sistémicas típicas de un marchitamiento. Por el contrario L. gestamen y O. patagonicum no pudieron colonizar sus hospedantes (Nothofagus spp. y Schinus patagonicus, respectivamente), por lo que serían saprobios oportunistas dispersados por escarabajos de ambrosía hacia hospedantes bajo estrés severo. En las plantaciones de coníferas, Ophiostoma piliferum y O. peregrinum fueron las especies de mayor frecuencia, si bien la tasa de colonización de Diplodia pinea fue superior. Las dos primeras están asociadas a las especies de escarabajos Hylurgus ligniperda y Orthotomicus laricis. Las especies de Grosmannia fueron aisladas principalmente de Hylastes ater. Los ensayos a campo indican que los troncos estuvieron libres de mancha por 3 meses, independientemente de su época de apeo. A partir del tercer mes los árboles cosechados en primavera y, en menor medida en otoño, son altamente susceptibles al ataque de hongos ‘ofiostomatoides’, probablemente porque en esas épocas se producen los picos de vuelo de los escarabajos adultos. Las cosechas de verano son críticas si el rodal está afectado por Diplodia. La colonización de ésta especie, usualmente en estado latente dentro del tejido sano del hospedante, se ve favorecida por las altas temperaturas de la estación. El invierno es la época más favorable para la cosecha. Ophiostoma peregrinum, especie que inicialmente fue reportada en el hemisferio Norte sobre Betula sp., mostró en la Patagonia una amplia distribución y frecuencia en plantaciones (inclusive colonizando hospedantes nativos) remarcando los peligros del comercio entre regiones distantes.

Abstract:
This thesis comprehends the first survey of sap-stain fungi on exotic conifers and native broad-leaved species (Nothofagus) from Patagonia, Argentina. ‘Sap-stain’ is a dark discoloration of wood as a consequence of fungal colonization. Pigmented fungal hyphae penetrate the radial parenchyma and the vascular tissue, causing a deep stain. Most sapstain species belong to the so-named ‘ophiostomatoid fungi’ a polyphyletic group of ascomycetes with similar morphology and taxonomic history. These species are adapted to arthropod dispersal, especially bark and ambrosia beetles (Coleoptera: Scolytinae/Platypodinae). Pathogens are well documented among sap-stain species (e.g. Ceratocystis fagacearum, Ceratocystis fimbriata, Ophiostoma ulmi). Nevertheless, most species are saprobes, colonizing timber after harvest. Stained wood has a lower market value and a decreased acceptance, causing major losses to the forest industry worldwide. Addressing the need to characterize ophiostomatoid diversity and biology in Patagonia, a five-year project was undertaken (2009-2014). A three-year survey (2009-2012) in Neuquén, Río Negro and Chubut Provinces included milling companies, pine plantations and native forests. Species were collected and identified based on morphology and DNA sequence comparisons of multiple loci (LSU, ITS, β-Tubulin, TEF 1-α). Insect associates were also informed. Isolates obtained from diseased trees (Nothofagus, Schinus) were selected for pathogenicity trials. On pine plantations, colonization of logs was estimated at different intervals, for logs harvested in different seasons. A total of 588 samples were collected, and 370 isolates were obtained. These were classified under 28 taxa: 18 known species and 10 new taxa. In the present study, 5 out of these new 10 species were described: Huntiella decorticans, Leptographium gestamen, Ophiostoma patagonicum, Ophiostoma peregrinum and Sporothrix cabralii. Nothofagus forests include several, previously unknown, sap-stain taxa. The 80% of these (12/15) are considered to be endemic. On the other hand, species present on pine plantations have been most likely introduced, similarly to other Southern Hemisphere Countries. The first molecular data of Ophiostoma nothofagi strongly suggests the presence of an independent lineage within the Ophiostomataceae. Its morphological characteristics and ecological features also support the possibility to erect a new genus for this and other related taxa. Huntiella decorticans was able to colonize healthy trees in pathogenicity trials. Its relation to sap-feeding beetles (Coleoptera:Nitidulidae) as well as the formation of a ‘pressure-pad’ structure, points out a pathogenic capability. Nevertheless, the formation of cankers indicates a localized lesion and not a systemic colonization, typical of a wilted tree. On the contrary, Leptographium gestamen and Ophiostoma patagonicum could not colonize healthy trees and both species probably behave as opportunistic saprobes vectored by ambrosia beetles to severely stressed trees. On pine plantations, the most frequent species were Ophiostoma piliferum and O. peregrinum. However, Diplodia registered higher colonization rates. The former ophiostomatoid species are associated to Hylurgus ligniperda and Orthotomicus laricis galleries. Grosmannia species were found in association with Hylaster ater galleries. At every site logs were stain-free for 3 months, no matter which season they were harvested. After this period, harvest in spring (and sometimes autumn) is highly susceptible to ‘ophiostomatoid’ stain, probably because it is also beetle flying season. Summer harvest is critical if the stand is infected with Diplodia, because this endophytic fungus grows vigorously at high temperatures. Field trials indicate winter as the most favorable season to harvest. Ophiostoma peregrinum, initially reported from the Northern Hemisphere associated with Scolytus ratzeburgi on Betula, evidenced a wide geographical distribution and host range (even on native species) in Patagonia, showing the risks associated to commercial trade between distant regions.

Errea, María Inés. "Estudio de los galactanos del alga roja pterocladiella Capillacea" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Existen dos familias de polisacáridos sintetizados por algas rojas, los carragenanos y el ágar, que, debido a sus propiedades reológicas, que les permiten estabilizar soluciones o emulsiones acuosas, son utilizados en la industria farmacéutica y alimentaria de todo el mundo. Este Trabajo de Tesis comprende los tópicos que se indican a continuación: a) Estudio de la estructura de los galactanos que componen el sistema de polisacáridos de la agarofita Plerocladíella capillacea (Gelidiales, Gelidiaceae). Hasta el momento, todos los estudios realizados indicaban que las algas pertenecientes al orden Gelidiales sintetizaban básicamente agarosa. La mayoría de dichos estudios se realizaron sobre el producto obtenido por tratamiento de las algas con agua a ebullición, y posterior purificación de la agarosa por congelamiento y descongelamiento; mediante esta técnica de purificación todos los polisacáridos que no gelificaban se despreciaban. En este Trabajo de Tesis se extrajo secuencialmente el alga con agua a distintas temperaturas (ambiente, 50°, 70° y 90°C) y se estudiaron los productos aislados a temperatura ambiente, 50° y 90°C. Los resultados obtenidos son sumamente interesantes dado que revelaron la presencia, en algunas de las fracciones estudiadas, de estructuras que, hasta el momento, no habían sido detectadas en algas pertenecientes al orden Gelidiales. b) Desarrollo de dos metodologías que representan un aporte original para el estudio estructural de los galactanos sintetizados por algas rojas. c) Investigación de la capacidad de gelificación del sistema de polisacáridos sintetizado por el alga Cryptopleura ramosa (Ceramiales, Delesseriaceae),que es epífita de P. capillacea. Es muy probable que, al recolectar el alga P. capillacea con fines industriales, resulte contaminada con C. ramosa y, si el sistema de polisacáridos sintetizado por C. ramosa gelificara en soluciones acuosas, podría contaminar la agarosa obtenida a partir de P. capíllacea afectando la calidad del gel. d) Evaluación de la actividad antiviral de algunos de los productos obtenidos a partir de P. capillacea y C. ramosa determinándose, en algunos casos, que los mismos poseen una elevada actividad antiviral.

Abstract:
Agars and carrageenans are synthesized by red seaweeds. These polysaccharides form gels or viscous solutions, which due to their reological properties are appropriate for pharmaceutical and food applications. This Thesis comprises the following topics: a) The structural study of the galactans from the agarophyte Pterocladiella capillacea (Gelidiales,Gelidiaceae). Previous studies carried out on algae belonging to Gelidiales indicated that these seaweeds produced mainly agarose. However, in these studies, the seaweeds were subjected to hot water extraction and the isolated products purified by freeze-thawing; thus, by this purification method the non-gelling polysaccharides were discarded. In the present work, P. capillacea was sequentially extracted with water at room temperature, 50°, 70° and 90°C and the products obtained at room temperature, 50° and 90°C were fractionated and subjected to structural analysis. The results were unexpected because they showed that, besides agarose, this seaweed synthesized polysaccharides with unsual structures for algae belonging to this order. b) Development of new methods for the analysis of these polysaccharides which involve determination of the absolute configuration of 3,6-anhydrogalactose and 2,6-di-0-alkylgalactose units. c) Investigation of the gelling capability of the polysaccharides from Cryptopleura ramosa (Ceramiales, Delesseriaceae), an epiphyte on P. capíllacea. In the collection of P. capillacea contamination with C. ramosa may occur. It must be considered that the eventual gelling properties of the polysaccharides from C. ramosa might affect those of the agarose from P. capíllacea. d) As several sulfated polysaccharides have proved to be useful antiviral agents, fractions from both seaweeds were tested against different herpesviruses.

de Escalada Pla, Marina Francisca. "Caracterización, procesamiento y optimización del aprovechamiento industrial de la calabacita Cucurbita moschata Duchesne ex Poiret" (2006). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Escobar, Gustavo Carlos Juan. "La circulación en la tropósfera asociada con irrupciones de aire frío en el centro de Argentina" (2001). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de esta Tesis es definir un criterio para detectar irrupciones de aire frío en la región central de Argentina determinada por los paralelos 25°S y 45°S, y encontrar los principales modelos de circulación en la tropósfera sobre el cono sur de Sudamérica asociados con estos eventos durante los meses de Mayo a Septiembre. En primer lugar, utilizando distintos parrámetros estadísticos, se realizó una caracterización regional y temporal de la temperatura media diaria, de su variación interdiurnal y particularmente de los descensos interdiurnos en la región de estudio. A continuación se analizaron en detalle los descensos intensos de temperatura y en función de los resultados obtenidos se definió un criterio de detección irrupciones de aire frío. Este criterio se definió en base a la variabilidad regional de la temperatura media diaria, y de las características térmicas antes y después del descenso interdiurno intenso. En la mayoría de los casos, las irrupciones de aire frío estaban asociadas con el pasaje de frentes fríos moderados o intensos sobre la región de estudio. Una vez definido este criterio, se procedió a realizar una clasificación sinóptica de secuencias diarias de campos de circulación asociados con irrupciones de aire frío en la región central de Argentina mediante el método de componentes principales. El objetivo planteado en esta oportunidad fue aumentar el valor predictivo de estas situaciones especiales que tienen importantes impactos sociales y económicos en la región. La información utilizada en esta Tesis consistió en datos diarios de temperaturas mínimas y máximas correspondientes al período 1967 - 1996 (SMN) y datos diarios de altura geopotencial de 1000 hPa y 500 hPa provistos por el Centro Europeo de Pronóstico de Mediano Plazo (período 1979 / 1993). Los resultados obtenidos mostraron que los descensos intensos de temperatura son más importantes en la región Centro Norte y Litoral Fluvial Argentino y que los procesos de escala sinóptica, reflejados principalmente por el pasaje de frentes fríos, presentaron una marcada periodicidad al sur del paralelo 35'. Las irrupciones de aire frío mostraron un mínimo de frecuencia porcentual durante Mayo en el Centro Oeste de la Provincia de Buenos Aires y Centro Oeste del país. Luego este mínimo se desplaza hacia el Litoral Fluvial Argentino en Junio y Julio y finalmente retrocede en Septiembre a una posición similar a la que ocupaba en Mayo. Una explicación posible de este comportamiento es la variación mensual de la posición media de la corriente en chorro polar en relación con el desplazamiento hacia el norte de las irrupciones de aire frío. La clasificación sinóptica de las secuencias diarias de campos de circulación en la tropósfera asociada con irrupciones de aire frío en la región central de Argentina mostró tres modelos patrones característicos. Dos de ellos corresponden a vaguadas de ondas largas en niveles altos que afectan el continente. Uno con el anticiclón de superficie moviéndose sobre latitudes medias, y el otro con un anticiclón en superficie afectando latitudes mas bajas sobre el continente. Por último, se obtuvo el patrón mas clásico de circulación asociado con irrupciones de aire frío en la región central de Argentina. Este modelo presentó una importante cuña en el Océano Pacífico al Oeste de la costa continental que provoca movimientos de descensos sobre el centro de Argentina y que se haya acompañado por un anticiclón postfrontal en niveles bajos que advecta aire frío desde el Sur.

Abstract:
The objective of this Thesis is to define a criterion to detect cold surges over central Argentina determined by parallels 25°S and 45°S, and to find the main models of circulation in the troposphere over the South cone of South America associated with these events during the months of May to September. At first, a regional and temporally characterisation of the daily mean temperature, the mean daily temperature differences and particularly of the interdiurnal descents in the study region were made by means of different statistical parameters. Then the intense descents of temperature were analysed in detail and based on the obtained results it was defined a detection criterion related to cold air surges. This criterion was defined on the basis of the regional variability of the daily mean temperature, and the thermal characteristics before and after of the intense descent. In most of the cases, the cold surges were associated with the passage of moderate or intense cold fionts over the analysed region. Once defined this criterion, it was come to make a synoptic classification of daily sequences of circulation fields associated with cold surges in the central of Argentina by means of Principal Components Analysis. The objective purposed in this opportunity was to increase the value predictive of these special situations that have important social and economic impacts in the region. The information used in this Thesis consisted of daily data of minimum and maximum temperatures corresponding to the period 1967 - 1996 (SMN) and daily geopotential heights at 1000 and 500 hPa based on 15 years (1979-1993) provided by the European Centre for Medium Range Weather (ECWMF). The results showed that the intense descents of temperature are more important in the Centre North region and in the Littoral Fluvial of Argentina and the processes of synoptic scale, reflected mainly by the passage of cold fionts, presented a major periodicity to the south of the parallel 35°. The cold surges showed a minimum of percentage fiequency during May in the Centre West of Buenos Aires Province and in the Centre West of the country. Then the minimum moves towards the Argentine Littoral in June and Julio and finally backs down in September to a similar position to which occupied in May. A possible explanation of this behaviour is the monthly variation of the mean position of the polar jet stream in relation to the displacement towards the north of the cold surges. The synoptic classification of the daily sequences of circulation fields in the tropo~pherea ssociated with cold surges in the central Argentina showed three basic patterns of sequences. Two of them correspond to long wave troughs in high levels that affect the continent. One of them shows the surface anticyclone moving over middle latitudes and the other with an anticyclone in surface affecting lower latitudes over the continent. Finally, it was obtained the most classic pattern of circulation associated with cold surges over central Argentina. This model presented an important wedge in the Pacific Ocean to the West of the continental coast that produces subsidence over the centre of country and that has been accompanied by a postfiontal anticyclone in low levels that advects cold air fiom the South.

Escolar, Mariana. "Variaciones espacio-temporales en la comunidad de invertebrados bentónicos asociada al frente de talud. Equinodermos como caso de estudio" (2010). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis se presentaron las variaciones espacio-temporales, durante el período 2002-2005, en la comunidad de invertebrados bentónicos dominada por Zygochlamys patagonica (Mollusca: Bivalvia: Pectinidae) asociada al frente de talud y sujeta a explotación pesquera. El phylum Echinodermata fue uno de los grupos más diversos y dominante dentro de la captura incidental de la pesquería en toda el área y periodo estudiado. Se estudió también la distribución espacial, biomasa y estructura de tallas de Ctenodiscus australis (Asteroidea), Sterechinus agassizi y Pseudechinus magellanicus (Echinoidea), y Ophiactis asperula, Ophiacantha vivipara y Ophiura lymani (Ophiuroidea), especies de equinodermos estrechamente relacionadas con la vieira patagónica y con una importante contribución en la comunidad. Las seis estudiadas presentaron un patrón de distribución latitudinal. Las especies de erizos y ofiuras presentaron además una evidente separación espacial con respecto a la profundidad. La biomasa de P. magellanicus y O. vivipara disminuyó durante el período 2002-2005 en toda el área estudiada. A su vez se comparó la biomasa y abundancia de las especies en áreas con y sin pesca comercial. Si bien las especies detritívoras y/u omnívoras se vieron beneficiadas por el aumento en la disponibilidad de alimento debido al descarte de la pesquería, las especies de mayor tamaño resultaron vulnerables al impacto. Esta tesis presentó los primeros estudios a nivel poblacional de invertebrados bentónicos colectados como parte conspicua de la fauna acompañante de una pesquería de arrastre, en este caso equinodermos, ampliando la información sobre la ecología de este grupo en áreas de la plataforma continental asociadas al frente de talud.

Abstract:
This thesis showed spatial and temporal variations, during the period 2002-2005, of the benthic invertebrates assemblage dominated by Zygochlamys patagonica (Mollusca: Bivalvia: Pectinidae) in shelf-break frontal areas subjected to commercial fishery. The phylum Echinodermata was one of the most diverse and dominant as part of the by-catch in the whole study area and period. The distribution, biomass and size structure of Ctenodiscus australis (Asteroidea), Sterechinus agassizi and Pseudechinus magellanicus (Echinoidea), and Ophiactis asperula, Ophiacantha vivipara and Ophiura lymani (Ophiuroidea) are studied, being these echinoderm species closely related with the Patagonian scallop assemblage. They showed a latitudinal distribution pattern. The sea urchins and ophiuroids also showed a spatial separation according to depth. The P. magellanicus and O. vivipara biomass decreased in the study area during the period 2002-2005. Biomass and abundance of echinoderms are also studied in relation with areas with and without commercial fishing. Although detritivores and/or omnivores were benefited by an increase in food availability due to fishery discards, the largest species resulted vulnerable to impact. This thesis showed the first populational studies of benthic invertebrates collected as conspicuous components of the by-catch in a trawling fishery, echinoderms in this case, and gives novel information about the ecology of the group in continental shelf areas associated to the shelf-break front.

Español, Esteban. "Endofitos de Blepharocalyx salicifolius: diversidad y factores que modulan el ensamble de las comunidades fúngicas" (2014-10-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se conoce como endofítos fúngicos a los hongos que viven asociados a los distintos tejidos de las plantas. Estos organismos no ocasionan síntomas aparentes de infección y, en esta asociación, se reconoce o sospecha una relación mutualista entre sus integrantes. Un modelo interesante desde el punto de vista ecológico y aplicado son los endofítos No-Clavicipitaceos (tipo III). Estos son transmitidos horizontalmente y colonizan casi todos los linajes de plantas, comprendiendo una enorme riqueza específica. En este marco, este trabajo tuvo como objetivo el estudio de la diversidad de endófitos fúngicos tipo III en diferentes poblaciones de Blepharocalyx salicifolius (planta nativa) analizando la diversidad de la comunidad endofítica foliar y el posible impacto de diferentes factores sobre el ensamble. Por otro lado se llevaron a cabo diferentes análisis a fin de establecer si los endofítos fúngicos provienen de inóculos que circulan a través del corredor biológico, manteniendo el flujo genético entre las comunidades y, que la filiación de estas poblaciones puede ser detectada por el estudio poblacional mediante métodos moleculares. Se seleccionaron cuatro áreas, asociadas con el corredor biológico del Rio Paraná-Río de la Plata. Se estudiaron las comunidades fúngicas endofíticas foliares mediante: aislamiento de cepas y su posterior cultivo e identificación por métodos de análisis macro, micro morfológicos y a través de una aproximación multigénica. Se describen un total de 18 especies, solo 2 de ellas no habían sido previamente descriptas sobre este hospedante y una tercera constituye una nueva especie para la ciencia. El análisis de la composición de las distintas comunidades a través de sus índices de riqueza y diversidad, permitió reconocer que sitio con menor disturbio antropogénico presentaban mayor riqueza de organismos endófitos. Entre las cepas obtenidas, se seleccionó aquellas pertenecientes al género Colletotrichum como indicador, para el estudio de la influencia del corredor biológico sobre el ensamblaje de la comunidad fúngica, por ser el que presentó más cepas en común entre los sitios asociados al corredor. Los resultados indican la presencia de distintas especies de Colletotrichum asociadas a los diferentes sitios estudiados. Entre las conclusiones más relevantes de este trabajo se destaca que las comunidades fúngicas foliares de B. salicifolius poseen una importante riqueza de endófitos foliares que varía entre 5 y 13 especies, que los corredores biológicos no parecen tener una influencia clave en el ensamblaje de la comunidad y que el disturbio antropogénico podría ser un factor adicional a los ya considerados, modulando la comunidad endofítica foliar. Por lo expuesto, este estudio aporta datos que permiten entender alguno de los factores que determinan cómo se establecen las comunidades fúngicas en la naturaleza.

Abstract:
Fungal endophytes are associated with different living plant tissues. They do not present any external manifestation of their presence, and do not cause apparent symptoms of infection. This association is recognized as or suspected to be a mutualistic relationship between its members. From the ecological and applied point of view the Non-Clavicipitaceous (TypeIII) endophytes are an interesting model. They are transmitted horizontally and colonize almost all lineages of plants, comprising huge species richness. For these reasons, this study aimed to study the diversity of fungal endophytes type III on a native plant (Blepharocalyx salicifolius) analyzing the diversity of foliar endophytic community and the potential impact of different factors on the assembly. various analyzes was conducted to determine whether the fungal endophytes come from inoculums that flow through the biological corridor, maintaining a gene flow between populations, and that the relation of these populations can be detected by molecular methods. Four areas were selected related to the biological corridor of the Rio Paraná-Río de la Plata. Endophytic fungal foliar communities were studied by: isolation of strains and subsequent cultivation and identification methods of macro and micro analysis morphological and through a multigenic approximation. A total of 18 species are described, only 2 of them had been previously described on this host and one of them is a new species to science. The analysis of the composition of different communities allowed us to recognize, through richness and diversity indices, that sites with less anthropogenic disturbance had higher richness of endophytic organisms. Among the isolated organisms, the genus Colletotrichum was selected as a indicator, in order to study the influence of the biological corridor on fungal community assemblages, because this genus was one of the most common between the sites associated with the corridor. The results indicate that the presence of different species of Colletotrichum is associated with the different sites studied. The overall analysis of the results indicate that foliar endophytic fungal communities of B. salicifolius show significant richness of foliar endophytes that varies between 5 and 13 species, that biological corridors do not seem to have a key influence on the assemblage of the endophytic community and that anthropogenic disturbance could be an additional factor to those already considered, and that could modulates the foliar endophytic community. This study provides information that allows us to understand some of the factors that determine how fungal communities are established in nature.

Espejo, Irene Silvina. "Análisis estratigráfico, paleoambiental y de proveniencia de la formación El Imperial, en los alrededores de los ríos Diamante y Atuel, Pcia. de Mendoza" (1990). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Espelt, María Victoria. "Mecanismos que determinan la tolerancia a la anoxia celular" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En la presente tesis se estudió la relación entre el volumen celular y los flujos transmembranales de K+ en hepatocitos de goldfish (Carassius auratus) expuestos a condiciones anisosmóticas o a limitación energética. La respuesta de volumen fue luego comparada con aquella presentada por hepatocitos de trucha (Oncorhynchus mykiss) y de rata (Rattus rattus). El volumen celular fue estudiado utilizando video microscopía y microscopía de epifluorescencia, mientras que la medición de los flujos de K+ se estimó a partir de los flujos unidireccionales de 86Rb+. En hepatocitos de trucha y rata, la exposición a medio hiposmótico (180 mosM) a pH 7.45 produjo el aumento de volumen celular seguido por disminución regulatoria de volumen (RVD), respuesta que es mediada por el eflujo neto de KCl seguido de agua. Por el contrario, los hepatocitos de goldfish aumentaron su volumen pero no presentaron RVD en esas condiciones. En hepatocitos de goldfish, si bien la N-etilmaleimida pudo activar la salida de K+, esto no ocurriió cuando las celulas fueron expuestas a medio hiposmótico (120-180 mosM). Se desarrolló un modelo matemático con el fin de analizar las interacciones existentes entre el volumen celular, el potencial de membrana, y la masa de los principales solutos difusibles bajo condiciones anisosmóticas. Este modelo pudo ser utilizado para simular las respuestas volumétricas de los hepatocitos de las tres especies. Los resultados del modelo apoyan la idea de que la ausencia de RVD observada en hepatocitos de goldfish se debe a la ausencia de un elemento sensor de volumen. La comparación entre los resultados obtenidos con el modelo matemático y los resultados experimentales sugiere que los hepatocitos de goldfish poseen una capacidad restringida para desarrollar RVD. El bloqueo de metabolismo energético puede generar gradientes osmoticos por aumento de la osmolaridad intracelular. En el presente estudio, la inhibición de la glucólisis por ácido iodoacético (IAA)no alteró el volumen celular en hepatocitos de goldfish, mientras que en presencia de cianuro (CN), inhibidor de la fosforilación oxidativa, o de CN y IAA (IAA+CN), el volumen celular disminuyó un 3—7%.A pesar de que en los hepatocitos de goldfish la limitación energética no tuvo efecto sobre el eflujo de K+, el influjo disminuyó un 57-66% en presencia de CN y CN+IAA pero no se vio alterada por el IAA sólo. La pérdida de K+ intracelular luego de 20 min de exposición a CN o IAA+CN fue solo de un 4% del K+ intracelular total. En general, los resultados de este estudio sugieren que los hepatocitos de goldfish, a diferencia de las células de especies sensibles a la anoxia, evitan el desacople de los flujos transmembranales de K+ en respuesta a un gradiente osmótico o limitación energética. Esto podría explicar por un lado la incapacidad de estas células para presentar RVD, pero al mismo tiempo la extraordinaria capacidad para mantener las concentraciones intracelulares de K+, prolongando de esta manera la viabilidad celular.

Abstract:
The relationship between cell volume and K+ transmembrane fluxes of goldfish (Carassius auratus) hepatocytes exposed to anisosmotic conditions or energetic limitation was studied, and compared with the volumetric response of hepatocytes from trout (Oncorhynchus mykiss) and rat (Rattus rattus). Cell volume was studied by video- and epifluorescence microscopy, while K+ fluxes were assessed by measuring unidirectional 86Rb+ fluxes. In trout and rat hepatocytes, hyposmotic (180 mosM) exposure at pH 7.45 caused cell swelling followed by a regulatory volume decrease (RVD), a response reported to be mediated by net efflux of KCI and osmotically obliged water. In contrast, goldfish hepatocytes swelled but showed no RVD under these conditions. Although in goldfish hepatocytes a net K+ efflux could be activated by N-ethylmaleimide. this flux was not, or only partially, activated by hyposmotic swelling (120-180 mosM). A mathematical model was developed in order to gain insight into the multiple interactions between cell volume, membrane potential and the masses of diffusible solutes under anisosmotic conditions. This model was successfully used to simulate the volumetric responses of hepatocytes from the three species. Results from the model gave support to the idea that the lack of RVD observed in goldfish hepatocytes is due to the absence of a volume sensor element. A comparison between data predicted by this model and that obtained experimentally suggests that goldfish hepatocytes have a limited capacity to enable RVD. Blockage of the metabolism can be viewed as an osmotic challenge where intracellular osmolarity may increase. In the present work, the inhibition of glycolysis by iodoacetic acid (IAA)did not alter cell volume in goldfish hepatocytes, whereas in the presence of cyanide (CN), an inhibitor of oxidative phosphorylation, or CN plus IAA (IAA+CN), cell volume decreased by 3—7%. While in goldfish hepatocytes, energetic limitation had no effect on K+ efflux, K+ influx decreased by 57-66% in the presence of CN and CN+IAA but was not significantly altered by IAA alone. Intracellular K+ loss after 20 min of exposure to CN and IAA+CN amounted to only 4% of total intracellular K+. Collectively, these observations suggest that goldfish hepatocytes, unlike hepatocytes of anoxia-intolerant species, avoid a decoupling of transmembrane K+ fluxes in response to an osmotic challenge. This may underlie both the inability of swollen cells to undergo RVD but also the capability of anoxic cells to maintain intracellular K+ concentrations almost unaltered, thereby prolonging cell survival.

Espinosa, Joaquín Maximiliano. "Estudio de proteínas de unión a ácidos nucleicos en el parásito Trypanosoma cruzi : identificación y caracterización de una proteína con múltiples dominios dedos de zinc" (1999). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Espinosa, María Beatriz. "Hembras hetero y homogaméticas en el roedor cricétido Akodon azarae : Su desempeño reproductivo y mantenimiento en condiciones de laboratorio" (1991). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Estalles, María Lourdes. "Características de historia de vida y explotación comercial de la raya Sympterygia bonapartii en el Golfo San Matías" (2012). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Sympterygia bonapartii se distribuye desde Río de Janeiro (23º S), Brasil hasta Santa Cruz (51º S), Argentina. El objetivo de este estudio fue estimar los parámetros de historia de vida y caracterizar los desembarques comerciales de la especie en la pesquería de arrastre de fondo del Golfo San Matías (GSM). Los ejemplares se colectaron en el GSM durante los años 2004-2010. Los mismos provinieron de las campañas de evaluación de recursos demersales realizadas por el Instituto de Biología Marina y Pesquera ―Alte. Storni‖; del programa de observadores a bordo de las embarcaciones pesqueras de la Provincia de Río Negro y de los muestreos mensuales de desembarques de la flota de arrastre local. Las mayores concentraciones de individuos se registraron entre los 80 y 100 m de profundidad en el sector este del golfo. La talla de madurez sexual para los machos y las hembras se estimó en 545 y 594 mm, respectivamente. La especie presentó un ciclo reproductivo estacional. La época de apareamiento ocurriría de julio a diciembre y la de puesta de septiembre- octubre a febrero. De acuerdo al análisis de la dieta, la especie se consideró como consumidora secundaria, de hábitos bentónicos. La dieta se describió como carcinófaga y presentó variaciones de acuerdo al sexo, talla y período del año. En la pesquería de arrastre local, S. bonapartii fue la raya con mayor cantidad de individuos desembarcados y la segunda por su contribución en peso. Los desembarques de la especie se caracterizaron por un predominio de ejemplares maduros y de hembras. Esto sugiere la presencia de segregación sexual y de una selección de tallas a bordo de las embarcaciones por parte de la tripulación.

Abstract:
Sympterygia bonapartii is distributed from Rio de Janeiro (23º S) Brazil to Santa Cruz (51º S) Argentina. The objective of this study was to describe its life history traits and to characterize its commercial landings in the bottom trawl fishery of San Matías Gulf (SMG). Individuals of S. bonapartii were sampled in GSM during 2004-2010. They were collected during research surveys performed by the Institute of Marine Biology and Fisheries ―Alte. Storni‖ aiming at assessing demersal resources; the onboard observer program of Río Negro Province and monthly samples of port landings from the local fishery. Sympterygia bonapartii showed the highest concentrations of individuals between 80 and 100 m deep, in the eastern region of SMG. Size at maturity (TL50%) was estimated at 545 and 594 mm for males and females respectively. The skate exhibited a seasonal reproductive pattern. The mating season was estimated to take place from July to December and the egg-laying season from September-October to February. The skate was considered a secondary consumer with benthic habits. Its diet was mainly composed of crabs and showed significant differences depending on sex, size group and period of the year. Sympterygia bonapartii exhibited the highest number of individuals and it was the second one for its contribution in weight in commercial landings from the local fishery. The presence of the species was detected throughout the year, with predominance of females and of mature individuals. These suggest that the species may segregate by sex and that the crew may perform a selection of the individuals on board the vessels.

Esteva, María Jimena. "Caracterización funcional de virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) quiméricos expresando diferentes dominios de la proteína cápside del virus de la inmunodeficiencia de felinos (FIV)" (2016-12-12). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La formación de partículas lentivirales resulta de la multimerización de la poliproteína Gag, la cual contiene toda la información necesaria para autoensamblarse y brotar al medio extracelular a través de la membrana plasmática. Durante la maduración de los viriones, la proteína cápside (CA), que corresponde al dominio central de Gag, se condensa generando el core viral que preserva la integridad del complejo ribonucleoproteico requerido para iniciar un nuevo ciclo de replicación viral. Los virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) y de felinos (FIV) son dos lentivirus evolutivamente distantes cuyas proteínas CA no han sido aún estudiadas. Con el objeto de establecer la relación funcional entre los dominios CA de SIV y de FIV, construimos SIV quiméricos en los cuales la región codificante para la CA fue parcial o totalmente reemplazada por su equivalente de la CA de FIV. La caracterización fenotípica de las quimeras nos permitió agruparlas en tres categorías: un grupo formado por virus quiméricos capaces de ensamblarse en viriones, pero cuya maduración causa la inestabilidad de la CA de FIV; un segundo grupo representado únicamente por el SIV quimérico llevando el dominio N-terminal (NTD) de la CA de FIV y que exhibe un fenotipo de ensamblado defectivo; y un tercer grupo formado por los virus quiméricos que se ensamblan en viriones exhibiendo una CA de FIV madura estable, que incorporan la glicoproteína de envoltura, y que contienen niveles salvajes del ARN genómico viral y de la transcriptasa reversa. Sin embargo, este último grupo de SIV quiméricos resultó ser no infeccioso debido a defectos en alguna etapa posterior a la entrada viral. Por otra parte, demostramos que el dominio C-terminal (CTD) de la CA de FIV presenta la capacidad intrínseca de dimerizar in vitro y de formar oligómeros de alto peso molecular. Esto, junto con nuestros resultados que muestran que el CTD de la CA de FIV es suficiente para el ensamblado de la poliproteína quimérica Gag de SIV, provee evidencia de que el CTD de la CA exhibe mayor plasticidad funcional que el NTD. En su conjunto, nuestros resultados aportan información relevante sobre la homología funcional entre los dominios CA de las poliproteínas Gag de los lentivirus de primates y de no primates y contribuyen a nuestro conocimiento sobre cómo han evolucionado los requerimientos para el ensamblado de viriones infecciosos en los retrovirus.

Abstract:
The formation of lentiviral particles results from the multimerization of the Gag polyprotein, which contains all the information necessary for its self-assembly and budding into the extracellular medium. During virion maturation, the capsid (CA) protein, which corresponds to the central domain of Gag, generates the core structure that preserves the integrity of the ribonucleoprotein complex required to initiate a new round of viral replication. The simian and feline immunodeficiency viruses (SIV and FIV, respectively) are two evolutionarily distant lentiviruses whose CA proteins have not as yet been studied. To gain insight into the functional relationship between the SIV and FIV CA domains, we constructed chimeric SIVs in which the CA-coding region was partially or totally replaced by the equivalent region of the FIV CA. The phenotypic characterization of the chimeras allowed us to group them into three categories: the chimeric viruses that, while being assembly-competent, exhibit a virionassociated unstable FIV CA; a second group represented only by the chimeric SIV carrying the N-terminal domain (NTD) of the FIV CA which proved to be assemblydefective; and a third group constituted by the chimeric viruses that produce virions exhibiting a mature and stable FIV CA protein, and which incorporate the envelope glycoprotein and contain wild-type levels of viral genome RNA and reverse transcriptase. However, further analysis of the latter group of chimeric SIVs demonstrated that they are non-infectious due to a post-entry impairment. Furthermore, we show that the carboxyl-terminus domain (CTD) of the FIV CA has an intrinsic ability to dimerize in vitro and form high-molecular-weight oligomers, which, together with our finding that the FIV CA-CTD is sufficient to confer assembly competence to the resulting chimeric SIV Gag polyprotein, indicates that the CA-CTD exhibits more functional plasticity than the CA-NTD. Taken together, our results provide relevant information on the functional homology between the CA domains of primate and nonprimate lentiviral Gag polyproteins and contribute to our understanding of how the requirements for the assembly of infectious virions have evolved among retroviruses.

Estevez, José Manuel. "Aspectos biológicos y químicos del alga roja gymnogongrus torulosus (Hooker et Harvey) Schmitz (Phyllophoraceae, Rhodophyta)" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo de Tesis abarca cuatro temas principales: l- Aspectos biológicos del alga roja Gymnogongrus torulosus (Phyllophoraceae, Rhodophyta). La ubicación taxonómica del material utilizado se basó en: (i) el análisis filogenético del gen rbcL para las especies del género; (ii) la formación de tetrasporofitos crustosos a partir de carposporas en cultivo. De acuerdo a las evidencias obtenidas, se postula tentativamente la transferencia de Gymnogongrus torulosus (Hooker et Harvey) Schmitz al género Ahnfeltiopsis. Además, se hizo un estudio de la morfología interna del talo por MO y MET. También, se determinó la ubicación de los polisacáridos sulfatados en el talo, encontrándose una distribución uniforme. A nivel de pared celular, se diferenciaron dos estratos: (i) una matriz fibrilar compuesta mayoritariamente por polisacáridos neutros y (ii) una matriz amorfa que se extiende a los espacios intercelulares, compuesta principalmente por pulisacáridos sulfatados. A su vez, se detectó por MET la presencia de una cutícula uniestratificada, “pit plugs” con “cap membranes", y vesículas asociadas al aparato de Golgi. Además, se observó la presencia de cloroplastos anómalos en células medulares. En este trabajo se cuestiona el valor taxonómico de la “inner cap layer" en la ultraestructura de las “pit plugs". 2- Análisis estructural del sistema de polisacáridos. Se estudiaron los extractos acuosos obtenidos a temperatura ambiente y a 90 °C. Los resultados obtenidos muestran la presencia de galactanos híbridos DL con: (l) estructuras mayoritarias de carragenanos de la familia kappa; (2) estructuras minoritarias de agaranos, formadas por un esqueleto de unidades altemantes de β-D-galactosa enlazadas por la posición 3 y unidades de ᵅ-L-galactosa enlazadas por la posición 4, con el siguiente esquema de sustitución: (i) sulfatación parcial en C-4 de la unidad ᵝ y, en las posiciones C-2 y C-3 o solamente en C-3 o C-6 de la unidad ᵅ; (ii) presencia de unidades de 3,6-anhidro- ᵅ-L-galactosa, en parte sulfatadas en C-2, reemplazando parcialmente las unidades de ᵅ-L-galactosa. La caracterización de todo el sistema de polisacáridos permitió estimar que la pared celular de esta alga roja presenta una relación carragenano:agarano ~2:l. La dispersión estructural que presentan estos galactanos sulfatados, plantea interrogantes sobre el significado quimiotaxonómico y filogenético de estos polisacáridos dentro de las algas rojas. 3- Dada la altenancia en la estructura de los carragenanos a lo largo del ciclo vital que presentan las algas rojas pertenecientes a las familias Phyllophoraceae y Gigartinaceae, se estudió la estructura química de los mismos en las fases reproductivas de Gymnogongrus torulosus (Phyllophoraceae) y Gigartina skottsbergii (Gigartinaceae) utilizando FT-IR, RMN ¹³C y métodos químicos de análisis. En base a los resultados obtenidos, se determinó que, para las algas estudiadas: (i) la biosíntesis de carragenanos no está directamente relacionada con el nivel de ploidía de las células que los producen; (ii) el cambio biosintético de carragenanos kappa a lambda (y de carragenanos lambda a kappa) se produce luego de la liberación y durante el desarrollo de las esporas (carposporas y tetrasporas) en las fases macroscópicas correspondientes (tetraspóricas y gametolïticas, respectivamente). 4- Actividad antiviral in vitro de los polisacáridos aislados y caracterizados de Gymnogongrus torulosus contra los virus herpes simplex (HSV-l y HSV-2) y virus dengue (DEN-2). Varias de las fracciones presentan: (i) alta actividad inhibitoria contra ambos tipos de virus, especialmente contra DEN-2. La misma estaría asociada con el bloqueo de la unión inicial virus-receptor celular, por parte de los polisacáridos sulfatados en la etapa de adsorción viral; (ii) ausencia de citotoxicidad para células Vero; (iii) baja o nula actividad anticoagulante. Las fracciones que están compuestas por estructuras mayoritarias de carragenanos son las que presentan una gran actividad antiviral. Por esta razón, la actividad inhibitoria estaría relacionada, al menos en parte, con la sulfatación en C-4 de las unidades B-D-galactosa y en C-2 de las unidades de 3,6-anhidro-ᵅ-D-galactosa. Estas características convierten a estos polisacáridos sulfatados en potenciales antivirales de aplicación tópica para los virus ensayados. Este trabajo presenta dos aspectos importantes a ser remarcados: (l) es la primera vez que se caracteriza un galactano híbrido DL desde el punto de vista de la actividad antiviral; (2) es el primero donde se evalúa la actividad antiviral de polisacáridos de algas rojas contra el virus del dengue (DEN-2).

Abstract:
This Thesis focuses on four major topics: l. Biological features of the red seaweed Gymnogongrus torulosus (Phyllophoraceae, Rhodophyta). The taxonomic identification of this material was based on: (i) phylogenetic analysis of rbcL gene for the species of the genera; (ii) development of the carpospores into crustose tetrasporophytes in culture. According to the evidences obtained, it is postulated tentatively that the red seaweed Gymnogongus torulosus (Hooker et Harvey) Schmitz should be transferred to the genera Ahnfeltiopsis. In addition, the internal morphology of the thallus was analyzed using LM y TEM. The sulphated polysaccharides were characterized all over the thallus, showing a homogeneous distribution. Two strata can be distinguished in the cell wall: (i) a fibrillar matrix, composed principally by neutral polysaccharides, and (ii) an amorphous matrix. extended to the intercellular spaces, composed mainly by sulphated polysaccharides. At the same time. a single-stratified cuticle, pit plugs with cap membrane, vesicles associated to the Golgi body were found by TEM. Also, anomalous chloroplasts were detected in medullar cells. In this work, the taxonomic significance of the inner cap layer on the pit plug fine structure is questioned. 2. Structural analysis of the polysaccharide system. The extracts obtained with water at room temperature and at 90 °C were studied. The results obtained show the presence of DL-galactan hybrids with: (l) carrageenans of the kappa family as major structures; (2) minor structures of agarans, built up mainly by a backbone of alternating 3-linked ᵝ-D-galactose and 4-linked ᵅ-L-galactose units, with the following substitution pattern: (i) partial sulfation on C-4 of the ᵝ-unit and on C-2 and C-3, or only on C-3, or C-6 of the ᵅ-unit; (ii) presence of 4-linked 3.6-anhydro-ᵅ-L-galactose, partially sulphated on C-2, replacing the ᵅ-L-galactose units. The whole cell wall polysaccharide system characterization allowed us to estimate a ratio of carrageenan: agaran of ~2:l for this red seaweed. The structural dispersion of these galactan sulphates, opens the question about chemotaxonomic and phylogenetic significance of these polysaccharides within the red seaweeds. 3. Based on the alternation of carrageenan structures during the life cycle of the red seaweeds belonging to Gigartinaceae y Phyllophoraceae, the chemical structure of these products was studied in the reproductive stages of Gymnogongrus torulosus (Phyllophoraceae) and Gigartina skottsbergii (Gigartinaceae) by FT-lR, ¹³C NMR and chemical methods of analysis. According to the results obtained, we concluded that for the seaweeds studied: (i) there is no direct relationship between the biosynthesis of carrageenans and the cell ploidy; (ii) the switch of kappa to lambda-carrageenan (and from lambda to kappa-carrageenan) happens after the dispersal and during the development of the spores (carpospores and tetraspores) into the macroscopic phases (tetrasporic y gametophytic phases, respectively). 4. In vitro antiviral activity of the isolated and well-characterized polysaccharides of Gymnogongrus torulosus against herpes simplex virus (llSV-l y HSV-2) and dengue virus (DEN-2). Several fractions show: (i) high inhibitory activity against both viruses, especially against DEN-2. It would be associated with the capacity of these sulfated polysaccharides to block the initial virus attachment to the cellular receptors on virus adsorption; (ii) lack of citotoxicity in Vero cells; (iii) low or lack of anticoagulant activity. The highest antiviral activity was observed in fractions composed mainly by carrageenan structures. Therefore, the inhibitory activity could be correlated with sulfation on C-4 of the ᵝ units and C-2 of the 3,6-anhydro-ᵅ-D-galactose units. These results indicate the relevance of these polysaccharides as potent antiviral agents, with promising perspectives of topical application for the viruses essayed. This work presents two remarkable aspects: (l) it is the first time that DL-galactan hybrids are characterized as antiviral agents; (2) dengue virus (DEN-2) is evaluated for the first time against this type of sulfated polysaccharides obtained from red seaweeds.

Estrada, Laura Cecilia. "Espectroscopía de correlación de fluorescencia en la nanoescala" (2009). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis se propone una nueva técnica que combina las ventajas de las microscopías basadas en la fuorescencia, con la altísima resolucióon espacial de las microscopías de campo cercano. El principio de funcionamiento de la Espectroscopía de Correlación de Campo Cercano que se presenta en este trabajo, se basa en la existencia de campos electromagnéticos fuertemente intensificados y confinados alrededor de nanopartículas metálicas, NPs. Este efecto aparece cuando la NP se ilumina con un haz cuya frecuencia corresponde a alguna de las frecuencias de resonancia de los electrones en el metal. Experimentos utilizando NPs esféricas de oro de 40 nm de radio, y una solución de Rosa de Bengala 150 microM en glicerol 80% en agua, demuestran una reducción del volumen de observación de alrededor de 4 órdenes de magnitud. Se mostró que es posible extender el uso de la Espectroscopía de Correlación de Campo Cercano al estudio de células vivas. Finalmente, se estudian exhaustivamente las propiedades de emisión de moléculas fluorescentes a distancias nanométricas de NPs metálicas. Se analiza el efecto de la separación NP-molécula; la eficiencia cuántica de fluorescencia, la orientación, las propiedades de absorción y emisión de la molécula; y el tamaño y la geometría de las NPs sobre la emisión de las moléculas.

Abstract:
In this Thesis we present a new technique which combine the advantages of the fluorescence based spectroscopies with the super resolution of the near field microscopies. This technique is based on the strong electromagnetic field localized in the proximity of metallic nanoparticles, NPs. This effect appears when a NP is irradiated with the resonance frequency of the electrons in the metal. Our experimental results using gold NPs and a 150 microM Rose Bengal solution in glycerol confirm a 4 orders of magnitude reduction in the observation volume. Experiments in cell membranes show that it is possible to use this technique even in living cells. Finally, we studied intensively the emission properties of fluorescent molecules at nanometric distances from metallic NPs. We analysed carefully the effect of NP-molecule separation, intrinsic molecule quantum yield, and molecule absorption and emission spectra to design new probes based on molecules coupled to MNPs

Estrella, María Julia. "Metabolismos de alfa y beta-glucanos en bacterias que interaccionan con plantas" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las bacterias sintetizan y acumulan diferentes polisacáridos de tipo α y β, los cuales cumplen funciones relevantes en la adaptación a los distintos entornos ambientales y en la interacción de las mismas con otros organismos. Los estudios que realizamos se refirieron especificamente al metabolismo de los glucanos cíclicos y del glucógeno en bacterias del suelo que interaccionan con plantas. Una parte del trabajo estuvo orientada a conocer el tipo de glucano que producen los rizobios que establecen simbiosis con el género Lotus. En dichos estudios se estableció que los glucanos cíclicos producidos por la cepa B. loti NZP 2309 tienen el mismo tipo de unión y estructuras estrechamente relacionadas con los descritos previamente en B. japonicum USDA 110, aunque la estructura de la especie mayoritaria de cada cepa es diferente. La cepa B. loti NZP 2309 produce una mezcla de glucanos cíclicos con uniones β(1-3), β(1-6), que están formados por especies neutras, no sustituidas, con DP= 10, 11 y 12, y la especie cíclica mayoritaria esta ramificada, tiene un DP=11 y está formada por un anillo de 10 residuos de glucosa con un único residuo terminal que forma la rama. La proporción de enlaces glucosidicos que tiene este glucano cíclico es 3:7:1 para las uniones β(1-3), β(1-6)y β(1-3, 6) respectivamente. La comparación de los glucanos cíclicos producidos por las cepas de B. loti NZP 2309 y B. japonicum USDA 110, sugiere que dichas moléculas tienen propiedades hidrofóbicas diferenciales y distinta capacidad de unión con flavonoides de leguminosas. Por otra parte, se observó que ambas cepas de Bradyrhizobium sintetizan in vitro, glucanos cíclicos β(l-3), β(1-6) por mecanismos similares y que dichos glucanos están estructuralmente relacionados. En B. loti NZP 2309 se identificó una proteína de membrana interna de 85 kDa que podría estar involucrada en la sintesis de glucanos solubles β(1-3) y β(1-6); insolubles β(1-3) tipo laminarina, o en la sintesis de ambos compuestos. Las moléculas sintetizadas in vitro están formadas principalmente por enlaces β(1-3), mientras que las moléculas producidas in vivo tienen mayor proporción de enlaces β(1-6). Nuestros resultados sugieren que la síntesis de glucanos cíclicos β(1-3), β(1-6)en Bradyrhizobium sp podria involucrar la formación de un glucano cíclico con uniones β(1-3), al que posteriormente se introducen uniones β(1-6)por transglicosilación, a través de la proteína NdvC Además, determinamos y comparamos el tipo de glucano que sintetizan y acumulan dos cepas de colección de M. loti, y evaluamos si la estrucutra de los mismos está relacionada con la capacidad que tienen dichas cepas para nodular distintas espcecies de Lotus. Se determinó que las cepas M. loti NZP 2213 y NZP 2037 producen glucanos cíclicos neutros y sustituidos con residuos aniónicos y uniones β(1-2), los que son similares a los reportados en otros rizobios de crecimiento rápido. La sintesis de los glucanos de M. loti se realiza a través de una proteína intermediaria que tiene una masa molecular similar a la proteína de 319 kDa reportada en otros rizobios que sintetizan glucanos cíclicos β(1-2).Se estableció que el tipo de glucano producido por las cepas M. loti NZP 2213, NZP 2037 y B. loti NZP 2309 no está relacionado con el rango de hospedante, ya que se determinó que las dos especies de M. loti producen glucanos similares con el mismo tipo de unión y presentan distinto rango de nodulación. Además, se observó que dos cepas con distinto tipo de glucano forman nódulos efectivos en una misma especies de Lotus. Otra parte de la tesis se centró en el metabolismo del glucógeno en bacterias que interaccionan con plantas. Se clonó y caracterizó un fragmento de ADN genómico de B. loti que tiene homologia con el genes de la síntesis de glucógeno y que contiene gran parte del gen glgC y el gen glgA completo, que codifican para las enzimas ADPGlc PPasa y GS, respectivamente. El fragmento clonado es similar a una región presente en el genoma de B. japonicum, indicando que la organización de los genes estructurales del metabolismo del glucógeno en el género Bradyrhizobium está conservada y es diferente a la reportada en otras bacterias. Las secuencias aminoacidicas de la ADPGlc PPasa y GS de B. loti presentan un grado de homologia mayor con las enzimas de B. japonicum que con otras enzimas homólogas de rizobios. La ADPGlc PPasa de B. loti pertenece al grupo V de ADPGlc PPasas que están altamente reguladas ya que se activan por Fru 6P, Fru 1,6 bisP y piruvato. La actividad de esta enzima en nódulos reveló que la ADPGlc PPasa de bacteroides de B.japonicum aumenta con la maduración del nódulo, cuando los mismos todavía tienen actividad reductora de acetileno. Por otra parte, se realizaron experimentos de mutagénesis sitio-dirigida con la ADPGlc PPasa de A. tumefaciens, que se tomó como modelo experimental, para determinar el rol que tienen los residuos de arginina que están conservados y ubicados en la región N-terminal de las ADPGlc PPasas reguladas positivamente por Fru 6P y piruvato. Se determinó que una carga positiva en la posición 32 sería necesaria para mantener la afinidad aparente de las ADPGlc PPasas activadas por hexosas-fosfato y/o piruvato y cualquier modificación de arginina por otro aminoácido que altere el tamaño o la hidrofobicidad, reduce la afinidad aparente por Fru 6P. El comportamiento de las mutantes en la posición 33 respecto a los activadores fue diferente, afectándose de manera más drástica la activación por Fru 6P que la activación por piruvato. La presencia de arginina en la posición 33 es muy importante para la activación de la ADPGlc PPasa de A. tumefaciens y no podría ser reemplazada por otro aminoácido. La presencia de arginina en la posición 45 es importante para la activación de la enzima por Fru 6P pero es poco probable que desempeñe un rol directo en la unión de un efector particular, ya que está completamente conservada entre todas las ADPGlcPPasas bacterianas analizadas.

Estévez, Alejandra. "Participación de la interleuquina-1ß en el mecanismo de regresión luteal en la rata" (2004). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En los mamíferos, la regresión luteal o luteólisis es un evento determinante para el proceso reproductivo ya que garantiza la finalización de un ciclo no concepcional, permitiendo el inicio de otro ciclo potencialmente fértil. Estudios recientes demostraron la acumulación de leucocitos durante la luteólisis, asociada a la producción de citoquinas pro-inflamatorias y radicales libres. Es por esto que el objetivo del presente trabajo de tesis fue estudiar la participación de la Interleuquina-1 beta (IL-1β) en la luteólisis funcional. Además, dado que inhibidores de la NOS prolongan la vida del CL, se analizó si el óxido nítrico (NO) estaba involucrado en el mecanismo de acción de la IL-lβ. Para ello, se utilizó el modelo de la rata pseudopreñada, en el cual la administración de PMSG induce la formación de CLs con una vida media de aproximadamente lO días. Al comparar el CL en regresión (día 9 de psp) respecto del CL funcional (día 5 de psp) se observó que durante la luteólisis espontánea aumentó la producción endógena de IL-lβ y de PGF2α, mientras que disminuyeron la biosíntesis de P, los niveles del mRNA y de la proteína StAR y el contenido de glutation reducido (molécula antioxidante). La IL-Iβ fue capaz de reducir la biosíntesis de P y de aumentar la producción de PGF2α, incrementando los niveles proteicos de la COX-II pero no los de COX-I, enzimas responsables de la síntesis de PGs. Además, la IL-lβ moduló el estado oxidativo del CL funcional ya que aumentó el índice de lipoperoxidación (TBARs) y redujo el contenido de glutation reducido. Por lo tanto, la incubación de los explantes ováricos (día 5 de psp) en presencia de la IL-lβ reprodujo, en los CLs funcionales, las características observadas en los CLs en regresión sugiriendo que la IL-lβ promueve la luteólisis funcional. Mientras que los niveles del mRNA de la iNOS aumentaron en el CL en regresión, el contenido del mRNA de la eNOS disminuyó en un 50% en el día 9 de psp. A su vez, la producción de NO fue mayor en el CL en regresión, evidenciando la presencia de un sistema generador de NO en los explantes ováricos en las distintas etapas del desarrollo luteal. La IL-lβ estimuló la síntesis de NO y la incubación con el sustrato de la NOS, la L-Arginina, disminuyó la síntesis de P y aumentó la de PGF2α. Por otro lado, la presencia del L-NAME revirtió los efectos inducidos por la IL-lβ, indicando que el NO estaría involucrado en el mecanismo de acción de la citoquina. La activación de la iNOS sería un evento necesario en la acción biológica de la IL-lβ, ya que la citoquina aumentó la expresión del mRNA y de la proteína iNOS, mientras que el 1400W, inhibidor selectivo la iNOS, revirtió completamente su acción sobre la P. La acumulación de GMPc se incrementó por el tratamiento con IL-lβ y, mientras que el 8-Bromo-GMPc, un análogo del GMPc, disminuyó la biosíntesis de P, la presencia del inhibidor de la guanilato ciclasa soluble, el ODQ, anuló la reducción en la esteroidogénesis inducida por la IL-lβ .Estos resultados sugieren que el GMPc participa en el mecanismo de acción de la IL-lβ. Más aún, dado que el ODQ anuló el efecto antiesteroidogénico inducido por la L-Arginina, el GMPc sería un intermediario necesario en el efecto inhibitorio del NO sobre la biosíntesis de P. Los resultados del presente trabajo de tesis sugieren que la IL-Iβ participa en la luteólisis funcional a través de un mecanismo que involucra al NO, la isoforma iNOS y el GMPc.

Abstract:
In mammals, luteal regression or luteolysis is a determinant event for the reproductive process as it guarantees the end of a non-conceptional cycle, enabling the onset of a new potentially fertile cycle. Recent studies demonstrated the accumulation of leukocytes in the regressing CL, associated to pro-inflammatory cytokine production and free radical generation. Thus, the aim of the present work was to study the participation of Interleukin-lbeta (IL-1β) in functional luteolysis. Also, as nitric oxide synthase inhibitors prolong CL lifespan, we evaluated if nitric oxide (NO) was involved in IL-lβ signaling pathway. We used the rat pseudopregnant model, in which the administration of PMSG induces the formation of CLs of approximately lO days of life. Comparative analysis between the regressive (day 9 psp) and functional (day 5 psp) CLs revealed that during spontaneous luteolysis the endogenous IL-1β and PGF2α production increased, whereas progesterone biosynthesis, StAR mRNA and protein expression as well as reduced glutathione diminished. IL-1β was able to reduce P biosynthesis yet augment PGF2α production, enhancing COX-II protein expression but not COX-I expression, rate-limiting enzymes of PGs synthesis. In addition, IL-1β affected the overall mid-luteal redox state, as reactive oxygen species generation (TBARs) was increased in the presence of IL-lβ while intracellular glutathione content was reduced. Therefore, the incubation of ovarian explants with IL-lβ mimicked, in the functional CLS, the features seen in the regressive CLs suggesting that IL-1β promotes functional luteolysis. While iNOS mRNA levels augmented in the regressive CL, eNOS mRNA levels diminished to a 50% on day 9 psp. This was accompanied by a higher production of NO in the regressing CL, unveiling the presence of a NO-generator system in ovarian explants at different stages of CL development. IL-lβ was able to stimulate NO synthesis and the incubation with L-Arginine exerted both a reduction in P production and an increase in PGF2α synthesis. On the other hand, the presence of L-NAME reverted IL-lβ-induced anti-steroidogenic effect, suggesting that NO is involved in lL-lβ signaling pathway. INOS activation might be a necessary event in lL-lβ biological actions, as IL-1β increased iNOS mRNA and protein expression and furthermore, the selective iNOS inhibitor 1400W completely reverted the anti-steroidogenic effect elicited by lL-lβ. IL-1β promoted GMPc accumulation and, whereas the permeable GMPc analogue, 8-Bromo- GMPc mimicked IL-lβ action, reducing P levels, the soluble guanylyl cyclase inhibitor ODQ blocked the IL-lβ-induced anti-steroidogenic effect. These results stroneg suggest that GMPc is involved in IL-Iβ transduction pathway. Moreover, as ODQ prevented L-Arginine-elicited anti-steroidogenic effect, GMPc could be regarded as a necessary intermediary molecule in the NO-induced inhibitory action on P biosynthesis. The results from the present study suggest that IL-lβ participates in functional luteal regression through a mechanism involving NO, the inducible NOS isoform and GMPc.

Estévez, Alvaro Germán. "Papel del óxido nítrico y de las especies reactivas derivadas del oxígeno en la muerte neuronal apoptótica" (1995). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Etala, María Paula. "Modelos hidrodinámicos anidados para el cálculo de la onda de tormenta en el estuario de Bahía Blanca" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo trata el problema de la onda de tormenta desde un punto de vista dinámico para el estudio de algunos aspectos generales de la misma y, en particular, de su comportamiento en el estuario de Bahía Blanca. Las herramientas utilizadas para este estudio son un conjunto de modelos numéricos desarrollados para tal fin en conjunción con datos observacionales que validan los resultados y conclusiones alcanzados. Los modelos hidrodinámicos utilizados son bidimensionales e integrados en la vertical. Un modelo abarca la plataforma continental y otro cubre el estuario con mayor resolución. Este último contempla el secado e inundación de puntos del dominio. Una condición de radiación modificada permite la introducción de la onda de marea al dominio a través de los bordes abiertos de ambos modelos. La información acerca de la onda de tormenta se transfiere desde el modelo de la plataforma hacia el modelo del estuario. Algunos aspectos teóricos del intercambio de cantidad de movimiento en la capa límite atmosférica son considerados para la estimación de la tensión del viento sobre la superficie del mar. El carácter regional y local de las perturbaciones del nivel del agua requiere la consideración del factor atmosférico en ambas escalas. Se encuentran características particulares de la estabilidad atmosférica en el área de estudio que influyen sobre la transferencia de cantidad de movimiento al agua. Este trabajo está enfocado principalmente sobre los aspectos no lineales de la propagación de la onda de tormenta desde la plataforma y sobre su importante modificación dentro del estuario debido a su comportamiento altamente no lineal. La interacción entre la marea y la onda de tormenta se estudia en un caso típico de viento del sudeste. Se encuentran dos diferentes tipos de respuesta en el estuario. El mecanismo de interacción por fricción de fondo predomina en los canales mientras que en las zonas menos profundas, con corrientes más débiles, la principal causa de la interacción es la baja profundidad. Las corrientes de interacción llegan a ser muy intensas tanto en los canales como en la descarga de las planicies. Esta interacción modifica fuertemente la onda de nivel resultante en una forma que depende de la intensidad relativa de ambos fenómenos. La fase relativa del forzante meteorológico con respecto a la marea puede alejar varias horas el máximo nivel del agua del momento que estaría dado por un efecto aislado de la onda de tormenta.

Abstract:
This work deals with the problem of the storm surge from a dynamical point of view for the study of some of its general aspects and, particularly, of its behavior in the Bahía Blanca estuary. The tools used in this study are a set of numerical models developed with that purpose in conjunction with observational data that validate the results and conclusions reached. The hidrodynamical models are bidimensional depth-averaged. One of them covers the continental shelf and the other one covers the estuary with higher resolution. The latter considers the drying and flooding of points in the domain. A modified radiation condition allows the input of the tidal wave to the domain through the open boundaries in both models. The information on the storm surge is transferred from the shelf model to the estuary model. Some theoretical aspects of momentum exchange in the atmospheric boundary layer are considered for the estimation of wind stress at the sea surface. The regional and local character of water level perturbations requires the treatment of the atmospheric factor in both scales. Particular characteristics of atmospheric stability that influence the momentum transfer to water are found in the area of study. This work is mainly focused on the non-linear aspects of the storm surge propagation from the shelf and on its important modification within the estuary due to its highly nonlinear behavior. The surge - tide interaction is studied in a typical case of southeasterly winds. Two different responses are found within the estuary. The bottom friction interaction mechanism dominates in the channels while in the shallower areas, with weaker currents, the main cause of interaction is limited depth. The interaction currents in the channels can be very strong as well as the changes in discharge currents from the intertidal flats. This interaction strongly modifies the resulting water level wave in a way that depends on the relative intensity of both phenomena. The relative phase between the meteorological forcing and the tide can shift the water level peak several hours from its corresponding value due to an isolated storm surge effect.

Etchemendy, Pablo Esteban. "Estudio de la codificación de las características temporales del sonido mediante experimentos psicofísicos y modelado computacional de la periferia auditiva" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El sistema auditivo utiliza dos mecanismos fundamentales para la percepción de altura tonal. Uno de ellos (conocido como "tonotópico", "espectral" o "de lugar") se basa en la capacidad de separar frecuencias que posee la membrana basilar: la misma muestra un patrón de excitación con máxima amplitud en un determinado lugar, en función de la frecuencia del estímulo sonoro. El otro (conocido como "mecanismo temporal") se basa en la capacidad de las neuronas del nervio auditivo de generar potenciales de acción sinápticos sincronizados con la fase del estímulo sonoro ("enganche de fase"). Existe un debate abierto respecto a cuál mecanismo interviene en la percepción de altura tonal para diferentes estímulos y rangos de frecuencia. Para el caso de tonos modulados en frecuencia, típicos en el contexto musical (vibratos) y en ciertos lenguajes tonales como el chino mandarín, se sabe que la modulación en frecuencia introduce modulaciones en amplitud en la forma del patrón de excitación de la membrana basilar. Además, existen resultados perceptuales que pueden ser explicados en función del tiempo que la señal pasa en los extremos de la modulación. Estos resultados muestran que la información temporal participa en la percepción de la altura tonal y que el mecanismo que la procesa muestra cierta "inercia" o "lentitud" ("sluggishness" en inglés), que dificulta la detección de la frecuencia cuando la modulación es rápida. En este trabajo utilizamos dos metodologías para estudiar la codificación de la altura tonal. En la primera parte se describen experimentos de percepción de altura tonal realizados con tonos puros modulados en frecuencia (vibratos) con perfiles asimétricos. Además se realiza una revisión de una variedad de modelos aplicables a la percepción de altura tonal. Se incluyen modelos basados en la información espectral, en la temporal, modelos mixtos y modelos fenomenológicos propuestos específicamente para explicar resultados de experimentos con vibratos. Se comparan las predicciones de dichos modelos con los resultados de los experimentos realizados. Se incluye también una revisión de resultados previos de experimentos similares y una contrastación de dichos resultados con las predicciones de los modelos. En la segunda parte se estudiaron algunos mecanismos biológicos que son importantes para explicar la codificación de la información temporal en la periferia auditiva. Se describe un modelo biofísico realista de la sinapsis de cinta de las células ciliadas internas, las células responsables de la transducción de las vibraciones mecánicas de la membrana basilar a impulsos neuronales en los nervios auditivos. Dicha sinapsis se destaca por su baja latencia, lo cuál es un requisito necesario para poder conservar en forma fidedigna la información de fase. Analizamos los parámetros del modelo y estudiamos diferentes mecanismos propuestos en la literatura para explicar su baja latencia. Finalmente estudiamos la capacidad para el enganche de fase de dicho modelo, en particular para tonos modulados en frecuencia, para comprender de qué modo se ve afectada por la rapidez de la modulación y cómo puede in uir en la percepción de la altura.

Abstract:
The auditory system employs two main mechanisms for the perception of pitch. The first mechanism (known as "tonotopic", "spectral" or "rate-place") is based on the frequency selectivity present at the basilar membrane: as the stimulus frequency varies, the basilar membrane displays an excitation pattern whose point of maximum amplitude also varies. The second mechanism (known as "temporal") is based on the ability of the auditory nerve fibers to generate spikes in synchrony with the phase of the auditory stimulus ("phase-locking"). There is an ongoing debate about which mechanism is responsible for the perception of pitch for different stimuli and frequency ranges. In the case of frequency-modulated tones, present in music (vibratos) and in some tonal languages as Mandarin Chinese, the modulation of frequency introduces a modulation of amplitude in the shape of the excitation pattern on the basilar membrane. Also, there is perceptual evidence of an effect of the time that the signal spents at the extremes of the modulation profile on the perception of pitch. These evidence suggests that the temporal information is involved in the perception of pitch and that the underlying mechanism displays some degree of "sluggishness", difficulting the perception of pitch for rapid modulations. In these work we used two methodologies in order to study the codification of pitch. In the first part we describe psychoacoustical pitch perception experiments with asymmetrical frequency-modulated tones. The work includes a review of several diverse models proposed in the literature for the perception of pitch. The predictions of the models are compared with the results of the experiments and also with a review of recent experiments on the same subject. In the second part, we studied some biological mechanisms that are key to the codification of the temporal information at the auditory periphery. We describe a realistic biophysical model of the internal hair cell ribbon synapse, the structure responsible for the transduction of the oscillations on the basilar membrane into neural impulses at the auditory fibers. The ribbon synapse displays a very low latency, which is a requisite for ensuring a faithful transmission of the temporal information of the stimulus. We analyzed the parameters of the model and studied mechanisms proposed in the literature to explain this characteristic. Finally, we analyzed the phase-locking capability of the model, in particular for frequency-modulated tones, in order to understand the effect of the modulation in the synchronization and its influence on pitch perception.

Etchenique, Roberto. "Aplicaciones analíticas de la balanza de cristal de cuarzo : microgravimetría y microrreología" (1998). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Etcheverry de Milou, Marta I.. "Estudio de doble y triple resonancia magnética nuclear" (1981). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Etcheverry, Javier Ignacio. "Un nuevo método de aproximación de soluciones de Ecuaciones Parabólicas No Lineales" (2000). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo se presenta el desarrollo y análisis de un nuevo método numérico para la aproximación de soluciones de ecuaciones diferenciales en derivadas parciales del tipo de difusión no lineal, υt = α(υ)xx con α muy general. El método está basado en considerar aproximaciones de α(υ) por grafos maximales monótonos no decrecientes constantes a trozos. Se demuestra que, para ciertos datos iniciales, la solución del problema aproximado puede construirse explícitamente, a partir de la resolución un sistema de ecuaciones diferenciales ordinarias. Se presentan numerosos ejemplos de aplicación de esta técnica a la resolución de diferentes problemas clásicos de difusión no lineal, así como un análisis detallado de las propiedades del sistema aproximado. Finalmente, se desarrolla una teoría de convergencia, basada en obtener estimaciones de la diferencia entre las soluciones de ecuaciones de difusión no lineal con distintos α, mediante una extensión adecuada de las técnicas de Kruzkov de duplicación de variables para analizar leyes de conservación hiperbólicas no lineales.

Abstract:
In this work, we present and analyze a new numerical method for the approximation of solutions of the nonlinear parabolic partial differential equations υt = α(υ)xx for very general nonlinearities α. The method is based on the approximation of a by means of a piecewise constant maximal monotone graph. We prove that the solution corresponding to this new constitutive relation can be expressed in terms of the solution of a system of ordinary differential equations. We present a detailed analysis of the properties of the resulting system of ordinary differential equations and give several numerical examples of application of the proposed technique. In particular, we demonstrate the method on the heat equation, the porous media equations, and Stefan problems. Finally, we develop error estimates based in the comparison of solutions corresponding to two different constitutive functions α. These estimates are obtained by means of a suitable extension of the Kruzkov technique for nonlinear hyperbolic conservation laws.

Etcheverría, Mariela Patricia. "Geología y petrología de los volcanes cenozoicos Pocitos, Del MEdio y Tul Tul, provinciade Salta, Argentina" (2003). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el NO de la provincia de Salta, Argentina, en el ambiente geológico de la Puna, existe un grupo de tres estratovolcanes de edad miocena superior (Pocítos, Del Medio y Tul Tul) dispuestos con rumbo noroeste-sudeste vinculados a un lineamiento regional conocido como Cerro Rincón - Cerro Quevar. En disposición transversal al volcán Del Medio se destacan cuatro domos lávicos denominados Pozo Cavado que son posteriores al conjunto nombrado. Sobre la base de la petrografía y los rasgos morfoestiucturales se determinó la secuencia estratigráfica y se estableció la morfogénesis del grupo. Geoquímicamente las composiciones son basáltico-andesíticas y andesíticas para el volcán Pocitos; andesíticas, traquiandesíticas y dacíticas para los volcanes Del Medio y Tul Tul; y andesíticas para los domos Pozo Cavado. Representan a series calcoalcalinas, muy cercanas a las levemente alcalinas, de alto contenido en potasio para el volcán Tul Tul y de potasio medio para los volcanes Pocitos y Del Medio y los domos Pozo Cavado. Los contenidos geoquímicos e isotópicos de Sr y evidencias petrográficas tanto texturales como mineralógicas permiten inferir que los magmas se originaron a partir de mezclas con importante participación de fundidos del manto (baja proporción de fusión) y fundidos corticales y que la cristalización fraccionada habría actuado en forma subordinada. La asimilación de rocas ultramáficas también habría jugado un papel importante. Los diseños geoquímicos ponen en evidencia la influencia del ambiente de subducción en su génesis y las asignan a ambientes transicionales entre arco y retroarco con la excepción de los domos Pozo Cavado, quizá pliocenos, que corresponderían a retroarco, localizando de ese modo, a la región cerca del límite arco-retroarco mioceno superior. La mineralogía de los fenocristales y el quimismo de anfíboles indican una presión de 8 kb para su formación lo que equivale a una profundidad de 26 km para la probable cámara magmática e indica un espesor mínimo de corteza para los tiempos del Mioceno superior (8,6-6,5 Ma).

Abstract:
Pocitos, Del Medio and Tul Tul are three Late Miocene (8,6-6,5 Ma) stratovolcanoes located in the Argentinian Puna, at northwestem Salta province. NW-SE trending, they are associated to a regional structure known as Cerro Rincón-Cerro Quevar lineament. Tentatively Pliocene, Pozo Cavado domes lie perpendicularly to the Del Medio volcano. The volcanic stratigraphy and morphogenesis were established, based on petrographic, geochemical and morphostructural studies. Pocitos volcano is composed of basaltic andesites and andesites, whereas Del Medio and Tul Tul centers encompas andesites, trachyandesites and dacites. Pozo Cavado lavas correspond to andesites. All of them represent calc-alkaline to slightly alkaline series; ranging from medium-K (Pocitos, Del Medio and Pozo Cavado) to high-K (Tul Tul). Sr isotopes, geochemical, mineralogical and textural evidences strongly indicate that the magmas had been originated by mixing of mantle and crustal melts, with low percentage of mantle melting. Fractional crystallization might have played a secondary role. The assimilation of ultramafic rocks might have been important. Trace-element indicate an transitinal signature between arc and back-arc for Pocitos, Del Medio and Tul Tul volcanoes and a retroarc signature for Pozo Cavado domes. Mineralogy and amphibole composition indicate an 8 kb pressure, equivalent to a depth of 26 km for the magmatic chamber, thus constraining the crustal thickness. A subduction-related tectonic setting, close to the boundary arc-retroarc, is inferred for the studied area during Late Miocene times.

Evin, Diego Alexis. "Incorporación de información suprasegmental en el proceso de reconocimiento automático del habla" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Desarrollar sistemas informáticos capaces de interactuar con sus usuarios de la forma más natural y eficiente posible es uno de los requisitos esenciales para lograr la integración del mundo tecnológico en la so- ciedad. En ese marco el habla se presenta como una de las formas de comu- nicación más eficientes y naturales que posee el ser humano. Es por ello que desde el origen mismo de la investigación en ciencias de la computación, el desarrollo de interfaces hombre-máquina a través de la voz ha despertado un gran interés. Uno de los elementos que componen dicha interfaz oral es el Re- conocimiento Automático del Habla (RAH), área de la Inteligencia Artificial que busca desarrollar sistemas computacionales capaces de transformar un fragmento de habla en su trascripción textual. El RAH es un problema de gran complejidad, lo que se puede atri- buir principalmente a dos factores: en primer lugar a la variabilidad de la señal de habla, que responde a múltiples factores como caracte- rísticas particulares del locutor y medio acústico donde se registra, la velocidad y estilos de elocución; y en segundo lugar a la necesidad de encontrar palabras individuales en un continuo acústico, es decir realizar al mismo tiempo las tareas de segmentación y clasificación. Si bien se pueden encontrar en los últimos años avances significa- tivos en el desempeño de los sistemas de RAH, aún hay mucho por mejorar en relación a la capacidad de reconocimiento que presentan los oyentes humanos para las mismas tareas y bajo las mismas con- diciones. Varias hipótesis intentan explicar esta diferencia de desem- peño: información insuficiente o representada de manera inadecuada en los sistemas automáticos, problemas en el modelado del sistema de reconocimiento, insuficientes cantidades de ejemplos empleados para lograr tasas de reconocimiento similares, etc. Con respecto al primero de estos puntos, los sistemas de RAH no utilizan toda la información acústica disponible en la señal de habla. Dichos sistemas interpretan el habla como secuencias de unidades cu- yas duraciones se encuentran a nivel segmental (fonético). Por lo tanto procesan la información acústica en la escala segmental para obtener las hipótesis de secuencias de unidades emitidas. Sin embargo estudios tanto psicoacústicos como psicolingüísticos resaltan el rol crucial que posee la información de una escala temporal mayor: la información su- prasegmental, en la percepción humana. Se entiende por información suprasegmental toda aquella que está dada en segmentos de duración superior al fonético, y cuyas propiedades están determinadas princi- palmente por la prosodia de una frase. Además se argumenta que en la tarea de reconocimiento e interpre- tación del habla los seres humanos emplean e integran varios niveles de conocimiento lingüístico, muchos de los cuales aún no han sido incorporados o aprovechados eficientemente en el RAH. A partir de esas evidencias resulta interesante investigar cuál es el aporte que puede brindar la información suprasegmental o prosódica para mejorar el desempeño de los sistemas de RAH estándar. En esta Tesis se investiga el empleo de información suprasegmental como factor de mejora en el desempeño, así como alternativas para su integración en sistemas de RAH estándar. En el Capítulo 1 se exponen argumentos que muestran la necesidad de mejorar los sistemas de RAH actuales a la luz del desempeño mos- trado en esta tarea por los seres humanos. Se presentan las bases de los mecanismos de producción, percepción y reconocimiento humano, así como un resumen de las principales aproximaciones al reconocimiento automático. Posteriormente se introducen los aspectos generales de la información suprasegmental y su rol en el mecanismo de comunica- ción oral. Seguidamente se hace una revisión de los antecedentes en el empleo de información suprasegmental dentro del proceso de RAH. Finalmente se delinean los objetivos de esta tesis. Debido a que en esta tesis se analiza la utilización de información suprasegmental en distintos módulos de los sistemas de RAH conven- cionales, en el Capítulo 2 se presenta la arquitectura y componentes principales de los reconocedores del habla actuales. Se detalla la arqui- tectura y forma de funcionamiento de estos sistemas, los fundamentos teóricos de los modelos de Markov, así como la forma de medir sus desempeños. El Capítulo 3 profundiza los aspectos de la información supraseg- mental introducidos en el Capítulo 1. Hace principal hincapié en las características prosódicas del español de Argentina, y presenta las téc- nicas computacionales empleadas en la tesis para la extracción auto- mática de sus atributos a partir de la señal de habla. El Capítulo 4 contiene una serie de estudios en que se busca vincular patrones de los atributos suprasegmentales con información lingüística útil para el proceso de RAH. En el primero de estos estudios se ana- liza la posibilidad de establecer agrupamientos de frases entonativas a partir de semejanzas en sus atributos suprasegmentales. El segundo experimento indaga la posibilidad de obtener información del número de palabras de contenido presentes en una frase, a partir de la mor- fología de sus curvas de F0. Finalmente el tercer estudio explora la viabilidad de establecer la tipología acentual de las palabras finales de frase utilizando rasgos suprasegmentales. En el Capítulo 5 se presenta una metodología para utilizar informa- ción suprasegmental a nivel de los modelos acústicos de un sistema de RAH. Específicamente se realiza una distinción entre modelos acústi- cos correspondientes a sonidos vocálicos acentuados y no acentuados. La metodología propuesta se evalúa y contrasta con distintas versiones de sistemas de RAH convencionales, empleando un corpus de habla continua. En el Capítulo 6 se expone una alternativa para emplear informa- ción suprasegmental durante la selección de hipótesis de reconoci- miento. Esta alternativa contempla la definición de un índice de se- mejanza entonativa entre la curva de F0 correspondiente a la frase a reconocer, y las posibles curvas de F0 correspondientes a las hipótesis de reconocimiento y obtenidas mediante un proceso de predicción. Se propone y desarrolla un modelo para su implementación y se realizan comparaciones de desempeño con respecto a un sistema de RAH de referencia. Finalmente en el Capítulo 7 se presentan las conclusiones y aportes de la tesis, juntamente con posibles líneas de investigación futura.

Abstract:
The development of computational systems capable of interacting with users in the most natural and efficient way is one of the essential re- quirements for the integration of the technological world in society. In this context speech is presented as one of the most efficient form of communication mechanisms available for human beings. That is why from the very beginning of research in computer science, the de- velopment of human-machine interfaces through voice have gain great interest. One of the elements that compose such interfaces is the Automatic Speech Recognition (ASR). ASR is a field of Artificial Intelligence which searches for the development of computational systems that transform speech segments into text transcriptions. ASR is a very complex problem, which can be attributed mainly to two factors: first, to the huge variability of the speech signal, depend- ing on multiple factors such as the speaker, the acoustic environment, linguistic context, speech rate, emotional states, locution styles, and many others; and secondly to the need of finding isolated words in an acoustic continuum, that is to say solving segmentation and classifica- tion problems simultaneously. Even thought we can find significant advances in the performance of ASR systems in recent years, there is still much space for improvement to match human recognition ability for the same tasks under the same conditions. Several hypotheses attempt to explain these differences on perfor- mance: insufficient information, inadequate way to represent it, prob- lems in modelling, insufficient quantities of used examples to achieve similar recognition rates, etc. Regarding the first point, ASR systems do not use all available acous- tic information in speech signal. These systems interpret the speech as sequences of units whose durations spans in a segmental (phonetic) level. Therefore they process the acoustic information at a segmental scale to obtain the hypotheses of sequences of uttered units. Nevertheless psychoacoustic and psycholinguistic research empha- size the essential role of information at a higher temporal level for the human speech perception: the suprasegmental information. Any information whose duration spans over several phonetic units can be thought as suprasegmental, and its properties are determined princi- pally by the prosody of an utterance. Furthermore, it is argued that during the task of speech recognition and interpretation, various linguistic knowledge are integrated and used. It has been also argued that no much of linguistic knowledge have yet been incorporated or utilized efficiently in the ASR From these evidences it seems relevant to investigate whether the suprasegmental or prosodic information could contribute to improve the performance of standard ASR systems. In this thesis the use of the suprasegmental information is investi- gated as a factor for improving performance, as well as an alternative for the integration of this information into the architecture of standard ASR systems. Chapter 1 arguments are presented that show the need to improve current ASR systems in the light of the performance showed by human speech recognition. The basis and mechanisms of production, perception and human speech recognition, as well as main approaches for ASR are revised. Subsequently the general aspects of the suprasegmental information and its roll in the mechanism of oral communication are introduced. After that, a review of the employment of information into the process of ASR is devised. Finally, we discuss the objectives of this thesis. Because this thesis examines the use of suprasegmental informa- tion in different modules of the conventional ASR systems, Chapter 2 presents the architecture and main components of current speech recognizers. The functionality, theoric foundations of hidden Markov models, and the performance evaluation methodology are detailed. Chapter 3 discusses in more detail the aspects of the suprasegmental information introduced in Chapter 1. Special emphasis is given to the prosodic characteristics of Argentinian Spanish. The computational techniques employed in this dissertation for the automatic extraction of these attributes from the speech signal are presented. Chapter 4 contains a series of studies that seeks to link attributes of suprasegmental patterns with linguistic information, useful in the ASR process. In the first experiment, the possibility of establishing groupings of intonative phrases based on similarities between their suprasegmental attributes is analyzed The second experiment explores the possibility of obtaining infor- mation about the number of content words contained in a phrase by analyzing the shape the of F0 curves. Finally the third study explores the feasibility of establishing the accentual typology of final words in sentences using suprasegmental features. Chapter 5 introduces a methodology for using suprasegmental in- formation at the level of acoustic models in a conventional ASR sys- tem. Specifically a distinction is made between acoustic models for accented and unaccented vowel sounds. The proposed methodology is evaluated and compared with different versions of conventional of ASR systems, using a corpus of continuous speech. Chapter 6 exposes an alternative for using suprasegmental informa- tion in the posprocessing of ASR. This alternative defines an index of intonative similarity, measured between the F0 contour estimated from the utterance to recognize, and the one corresponding to the alternative recognition hypotheses. This idea is implemented and compared to a reference standard ASR system. Finallly Chapter 7 concludes the Thesis. An overview of the main findings and contributions of this thesis is presented together with future works in this line of research.

Expósito, Verónica. "Estudio de las redes neuronales asociadas a procesos cerebrales espontáneos, atencionales y de planeamiento motor en sujetos sanos y en pacientes neurológicos mediante técnicas de RMN funcional" (2015-04-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La resonancia magnética funcional (RMf) es una técnica indirecta de medición de la actividad neuronal. La investigación por RMf de la función cerebral tanto de forma modular como integrada en redes tiene repercusión en el estudio de la actividad cognitiva normal así como de los desórdenes neurológicos. En el presente trabajo utilizamos la técnica de RMf para dilucidar aspectos de la función cognitiva en personas sanas y dos poblaciones de pacientes con síndromes de desconexión. En el primer estudio evaluamos la representación cerebral del planeamiento de gestos de uso de herramientas con distintos componentes motores: involucrando principalmente articulaciones del brazo y codo -gestos proximaleso de mano y dedos -gestos distales-. Hallamos una representación topográfica distinta para cada tipo de gesto, lo cual es importante para entender el patrón de errores en la pantomima e imitación de gestos que se observa en pacientes con apraxia. En el segundo estudio investigamos la actividad de las redes cerebrales involucradas en atención interna y externa y la conectividad dentro y entre esas redes, en pacientes con desórdenes de conciencia. Encontramos una estructura colectiva de regiones que aumenta su respuesta con el nivel de conciencia y una indiferenciación en la estructura de redes antagónicas como la red de modo por defecto y la red atencional, cuya especialización mejora en forma no lineal conforme el paciente progresa.

Abstract:
Functional magnetic resonance imaging (fMRI) is a technique that allows for indirect measurement of neuronal activity. The research of brain function with fMRI both as modular and as integrated into networks has impact in the study of normal cognitive activity as well as of neurological disorders. In the present work we used fMRI to elucidate aspects of cognitive function in healthy people and in two populations of patients with disconnection syndromes. In the first study we evaluated the brain representation of planning tool-use gestures with different motor components: involving mainly arm and elbow joints (proximal gestures) or hand and finger joints (distal gestures). We found a different topographic representation for each gesture, which is important to understand the error pattern in pantomime and imitation of gestures observed in patients with apraxia. In the second study we investigated the activity in the brain networks involved in internal and external attention, and the connectivity within and between that networks, in patients with disorders of consciousness. We found a collective structure of regions that increase their responsiveness with the level of consciousness and a de-differentiation in the structure of antagonic networks such as default-mode network and attentional network, whose specialization recovers non-linearly as the patients progresses.

Eyssartier, Cecilia. "Conocimiento hortícola y de recolección de recursos silvestres en comunidades rurales y semi-rurales del Noroeste de la Patagonia: Saber-cómo (know-how) y resiliencia" (2011). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En la presente tesis estudiamos el conocimiento ecológico tradicional, ligado a la horticultura y recolección de plantas silvestres, en cuatro comunidades locales del Noroeste patagónico. Dado que la actividad de cultivar y recolectar implica procesos cognitivos asociados a patrones de percepción-acción, íntimamente imbricados en contextos ecológicos y socio-culturales dinámicos, abordamos esta temática considerando el marco teórico de la cognición corporizada y la resiliencia. Se indagó sobre plantas recolectadas y cultivadas en huertas, invernaderos y jardines, denominación local de especies, origen biogeográfico, categorías de uso, estructura de áreas cultivadas, procedencia de semillas, cultivos preferidos, mediante entrevistas semi-estructuradas. Los resultados muestran que los pobladores de las comunidades más aisladas, con menor influencia occidental, cultivan y recolectan una mayor riqueza de plantas y presentan las huertas más extensas. En contraste, los habitantes de poblaciones semi-rurales, cultivan en invernaderos en una mayor proporción y en huertas más pequeñas. Observamos que las poblaciones más alejadas del centro urbano, conservan la tradición de cosechar sus propias semillas; mientras que la población más cercana, ha abandonado esta costumbre donde tampoco hay intercambio de germoplasma. La presente tesis además de indicar que la influencia occidental acentúa la erosión de conocimientos ecológicos tradicionales, brinda aportes para comprender la dinámica de estos procesos, propiciando herramientas que favorezcan la resiliencia de los pobladores locales. Dados los profundos cambios que estas comunidades están atravesando, el enfoque de la resiliencia y la cognición corporizada, son abordajes útiles para ilustrar estos procesos de transformación.

Abstract:
We investigated traditional ecological knowledge, related to horticultural and gathering practices, in four communities of Northwestern Patagonia, Argentina. As the activity of cultivating and gathering involves cognitive processes associated with perception-action patterns in intimate intricacy with dinamic ecological and socio-cultural contexts, we utilized the embodied cognition theory and resilient approach. By means of semi-structured interviews and field visits to the cultivated areas we analyzed floristic composition and structure of vegetable-gardens, greenhouses and gardens. We evaluated cultivated and gathered species, local names of plants, categories of use, seed origin, favourite crops, geographical origin, etc. Results showed that the inhabitants of isolated communities cultivate and gather a greater richness of plants using greater extensions of vegetable-gardens. In contrast, locals of semi-rural populations cultivate in greenhouses in a higher proportion using smaller vegetable-gardens. Moreover, the most isolated communities still maintain collection of seeds from their own production; whereas in the closer population this custom seems to be abandoned as well as germplasm exchange. This study not only indicates that conspicuous western influence increases traditional ecological knowledge erosion, but also provides evidence showing how resilient mechanisms could be promoted. Given the profound changes these populations are undergoing, we consider that the frame theory of resilience and embodied cognition are interesting tools to illustrate the dynamic of these transformations.

Ezeyza Cutó, Susana. "Crecimiento de tejidos normales y neoplásicos, "in vitro" : modificación en la reserva alcalina del medio" (1940). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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