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Tesis > TEMA

Biología [ 2301 tesis ]

Genética de Poblaciones [ 24 tesis ]

Rosato, Carmen Luisa Marcela. "Tamaño del genoma, heterocromatina, polimorfismo numérico y herencia de cromosomas B en razas nativas del maíz" (1997) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Se realizaron estudios citogenéticos en poblaciones nativas de maíz del norte argentino adaptadas a diferentes alturas de cultivo. Los mismos consistieron en: determinación del polimorfismo numérico para cromosomas B y del tamaño del genoma, caracterización de la heterocromatina mediante técnicas de bandeos cromosómicos y la relación de éstos con parámetros geográficos como la altitud. Además, se estudió la tasa de transmisión femenina de cromosomas B en una población de la raza Pisingallo. Se estudiaron 21 poblaciones (1120 individuos) cultivadas a diferentes altitudes (80-3620m). Se encontró polimorfismo numérico para cromosomas B en 19 poblaciones. Las frecuencias media de individuos portadores de cromosomas B varían entre 0 y 94%. El análisis de correlación entre el número medio de cromosomas B y la altitud indica que se correlacionan positivamente. El tamaño del genoma (contenido de ADN) fue determinado en 17 poblaciones (107 individuos). Con la finalidad de estudiar la variación del contenido de ADN en los cromosomas A (A-ADN) independientemente de la variación aportada por los Bs, ésta estimación fue llevada a cabo en plantas sin Bs. El rango de variación hallada entre las poblaciones estudiadas fue del 36% (5,00 - 6,8 pg). El contenido de ADN (A-ADN) se correlaciona negativamente con la altura de cultivo y el número medio de Bs. La variación clinal hallada del contenido de ADN y la consecuente correlación con la frecuencia de cromosomas B sobre un gradiente altitudinal tendría un significado adaptativo. En cuatro poblaciones se estudió el contenido de ADN en individuos con diferente dosis de cromosomas B. Se encontró que, dependiendo de la población analizada, la presencia de cromosomas B no siempre incrementa el contenido de ADN respecto a los individuos sin cromosomas B de la misma población. Con el fin de dilucidar sí esto se debe a un efecto de enmascaramiento producido por la variación en el contenido de heterocromatina, se analizaron individuos con distinta dosis de cromosomas B mediante la técnica de bandeo fluorescente utilizando DAPI como fluorocromo. Se encontró, en una población, que la distribución del número de bandas no es independiente de la presencia de cromosomas B. El resultado hallado indica que en individuos portadores de cromosomas B, la variación del número de bandas heterocromáticas estaría enmascarando la presencia de los cromosomas B, al medir el contenido de ADN. Debido a éste resultado existiría una estrecha relación entre el tamaño del genoma, el contenido de heterocromatina y los cromosomas B. En cada población, la frecuencia de Bs podría estar limitada por la variación del contenido de A-ADN o viceversa. Además la distribución de frecuencias en el número de bandas heterocromáticas está relacionada con la presencia de cromosomas B y por lo tanto, los individuos con Bs poseen en general menor número de bandas heterocromáticas en sus cromosomas A, que los individuos sin Bs. Por otro lado, se encontró una correlación altamente significativa entre el número de zonas heterocromáticas y la frecuencia de cromosomas B en 11 poblaciones. Estos resultados sugieren que, en cada población, el contenido de ADN total posee un limite máximo y el mismo sería alcanzado mediante un balance entre el contenido de heterocromatina (en los As) y la dosis de cromosomas B. Por otro lado, con la finalidad de conocer la tasa de transmisión de los cromosomas B por vía materna se realizaron cruzamientos entre plantas f.1B x m. 0B en una población de la raza Pisingallo. Se encontró una variación para la tasa de transmisión de los Bs en la G0. Un experimento de selección con cruzamientos controlados el cual consistió en seleccionar aquellas progenies que presentaron las menores y las mayores tasas de transmisión durante dos generaciones. Los resultados obtenidos en la G1 indican la presencia de dos diferentes grupos de plantas: alta y baja tasa de transmisión de cromosomas B por vía materna y demuestra la existencia de polimorfismo para genes que controlan la tasa de transmisión de los cromosomas B. En la G2 los grupos de alta y baja tasa de transmisión se mantuvieron separados, sin embargo, no fue posible obtener mayor progreso selectivo que el obtenido en la G1. Estos resultados indican que habría un componente genético en la variación obtenida para la tasa de transmisión de los cromosomas B en la generación parental (G0). El grupo seleccionado para alta tasa de transmisión de los cromosomas B por vía materna corresponde a genotipos que lo transmiten de manera mendeliana en cambio, el grupo seleccionado para baja tasa de transmisión lo transmiten a una tasa menor. Es decir que, sólo habría genes "anti-B" que podrían actuar promoviendo la pérdida meiótica del univalente B en la meiósis femenina o la migración del B hacia las megasporas no funcionales o ambos fenómenos. Los mecanismos de acumulación descriptos para maíz son suficiente para explicar el mantenimiento del polimorfismo de los Bs en las poblaciones, sin embargo, estos mecanismos no son suficiente para explicar las diferentes frecuencias de cromosomas B en las poblaciones. Diferentes frecuencias de los alelos que controlan la tasa de transmisión de cromosomas B podrían explicar las frecuencias de cromosomas B hallada en las diferentes poblaciones.

Abstract:
Maize native populations from northern Argentina adapted to different altitudes were cytogenetically studied. These studies consisted in: determination of B-chromosome numerical polymorphism, DNA content, characterisation of heterochromatin by techniques of chromosome banding and the study of the relationship with altitude of cultivation. Moreover, the transmission rate of B-chromosome was studied in a population of Pisingallo race. Twenty one native populations (1120 individuals) cultivated at different altitudes (80-3620m) were studied. A numerical polymorphism for B-chromosomes was found in 19 populations. The mean frequencies of individuals with Bs varied from 0 to 94%. A highly significant positive correlation between the mean number of Bs per plant and altitude of cultivation was demonstrated. The genome size (DNA content) was determined in 17 populations (107 individuals). With the aim to study the variation in DNA content of A-chromosomes (A-DNA) independently from the variation supplied by the Bs, this estimation was performed in plants without Bs. The range of variation was 36% (5,00 to 6,8 pg) among studied populations. A-DNA content was negatively correlationed with both altitude of cultivation and mean frequency of Bs. The clinal variation of A-DNA content found in individuals without Bs and the consequent inverse correlation of B frequencies over an altitudinal gradient could have an adaptive significance. The genome size in individuals with different doses of Bs in 4 populations was studied as well. It was found that the presence of Bs did not always increase the DNA content respect to individuals without Bs and it depended on each population. With the aim to know if this phenomenon was caused by a masking effect produced by the variation in heterochromatin amount, individuals with different B-chromosome doses were studied by means of fluorescent banding with DAPI. It was found that the distribution of number of bands is not independent of the presence of B-chromosomes. The found result indicates that in individuals carrying B chromosomes a variation in the number of heterochromatic bands would be masking the B chromosome presence in the DNA content. These results indicate that there is a close interrelationship between the DNA content, heterochromatin amount and B-chromosomes. In each population, the B-chromosome frequency would be limited by the variation of DNA content, or viceversa. Moreover, the distribution of frequency in number of heterochromatic bands is related with the presence of B-chromosomes and, therefore, individuals with Bs have fewer bands than individuals without Bs in the A-chromosomes. On the other hand, a highly significant negative correlation between the number of knobs and the mean number of Bs in eleven populations was found. These results suggest that, in each population, there would be a maximum range of mass of nuclear DNA and this could be reached balancing both heterochromatin amount and B-chromosomes. With the aim to know the transmission rate (TR) of the B chromosomes on the female side, crosses between f.1B X m. 0B plants were carried out in a population (VAV 6313) of the race Pisingallo. Variation of B-chromosome transmission rate in G0 was found. An experiment of selection with controlled crosses was carried out which consisted in selecting those progenies of f.1B X m. 0B crosses showing the highest and lowest TR along two generations. The results obtained in G1 indicate the presence of two different groups of plants, high and low B TR on the female side, and demonstrate the existence of polymorphism for genes controlling B TR. In G2 the high and low B-TR groups were kept up isolated, nevertheless it was not possible to obtain more selective progress than that obtained in G1. This indicates that there is a genetic component to the variation of B TR obtained in G0. The selected groups for high female B-TR corresponds to genotypes that transmit it in a mendelian inheritance, whereas the selected group for low B-TR transmit it at a lower rate tham that in the mendelian inheritance. In other words, there are "anti-B genes" which might act on the propensity for the meiotic loss of the B univalent, or on the nonrandom migration of the B toward the non-functional megaspore, or both. Drive mechanisms are sufficient to account for the maintenance of B polymorphism in maize populations. However, these mechanisms cannot account for the differences of B frequencies in different populations. Different frequencies of the alleles controlling B-TR may account for B frequency in different populations of maize.

Rodríguez, Constantina. "Por qué es adaptativo el polimorfismo cromosómico de Drosophila buzzatii (grupo repleta, Drosophilidae)" (1998) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En este trabajo, analizamos las posibles causas del valor adaptativo de las inversiones cromosómicas. Realizamos el análisis simultáneo de un componente de selección, la longevidad, a nivel cromosómico y morfométrico en una población natural de Drosophila buzzatii. La comparación de la distribución de tamaños y de frecuencias cromosómicas entre muestras de individuos recién emergidos con las de adultos de la población, muestra que los individuos más grandes, así como los individuos portadores de las inversiones que lo confieren, son más longevos. Los efectos de las inversiones sobre el tamaño, así como la intensidad de selección, son diferentes en ambos sexos, y en hembras el efecto medio de las inversiones sobre el tamaño y la mayor viabilidad de las moscas más grandes, explican la longevidad diferencial detectada entre ordenaciones. Para indagar acerca de las diferencias genéticas entre inversiones, se analizó el desequilibrio de ligamiento entre siete marcadores enzimáticos (Est-1, Est-2, Lap, Aldox, Pep-1, Pep-2 y Xdh) y las inversiones. En las siete poblaciones analizadas se detectaron desequilibrios gaméticos consistentes, que indican un origen (o cuello de botella) reciente de las inversiones. Los patrones de estructuración para las ordenaciones y las enzimas estudiadas son diferentes, y los análisis de regresión con variables ambientales, indican que las ordenaciones y los alelos de Est-2 y Xdh varían sus frecuencias en respuesta al ambiente. En cambio, Aldox lo hace por deriva y Est-1 muestra efecto de arrastre de las inversiones y estructuración aleatoria. Pep-2 presenta un polimorfismo muy conservado que sería adaptativo

Abstract:
The possible causes of the adaptive value of the inversion polymorphism of Drosophila buzzatii were analyzed. First, we addressed the analysis of the longevity component of selection at two levels: phenotypic and karyotypic in a natural population. Pairwise comparisons between adult samples of flies newly emerged from the natural breeding sites and bait collected adults showed that larger individuals have an extended adult lifetime. Similarly some arrangements showed frequency shifts that can be attributed to differential longevity. The average effects of inversions on thorax length as well as the intensity of phenotypic selection were different in both sexes. Moreover, the average effects of inversions on the studied trait and the longevity selection favouring larger flies can account for the differential longevity conferred by each arrangement. Likewise, the genetic differences between arrangements were assayed by the analysis of the linkage disequilibria between inversions and seven allozymic loci (Est-1, Est-2, Lap, Pep-1, Pep-2, Xdh and Aldox) in seven natural populations. Gametic associations were consistent accross populations suggesting a recent origin or a recent bottleneck. The pattern of population structuration for inversions was different than the pattern showed by the allozyme loci. These patterns as well as the observed clinal variation along geographic and/or climatic gradients indicate that inversions and allozyme variation for Est-2 and Xdh are the result of adaptation to different environmental conditions. On the other hand, Aldox varied at random and Est-1 varied as the result of hitchhiking with inversions. Finally, Pep-2 exhibited a very conserved polymorphism possibly maintained by heterotic balance

Clemente, Marina. "Análisis de los polimorfismos para el largo de los fragmentos de restricción de ADN en Dichroplus elongatus y Eyprepocnemis plorans (Orthoptera) y su relación con la evolución de los cromosomas B" (1999) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los insectos ortópteros ofrecen excelentes oportunidades para estudiar diferentes aspectos de la genética de poblaciones, tales como la divergencia genética, flujo génico, introgresión, selección natural y adaptación. El estudio de la evolución paralela entre ADN genómico, ADN extracromosómico (ADN mitocondrial) y cromosomas supemumerarios o B permite evaluar la importancia relativa de las diferentes fuerzas evolutivas sobre la variabilidad genética y cromosómica. Entre los insectos, Dichroplus elongatus y Eyprepocnemis plorans constituyen excelentes modelos para este tipo de estudio ya que en poblaciones naturales de estas especies se detectaron polimorfismos para cromosomas B aparentemente estables. Sin embargo, los mecanismos de mantenimiento de estos cromosomas parece diferir entre estas especies. Mientras que en E. plorans el mantenimiento de los cromosomas B se apoya sobre las bases de un modelo cercano a la neutralidad, en D. elongarus los resultados previos sugieren un posible efecto selectivo. D. elongatus es un saltamontes fitófago que se distribuye ampliamente en la Argentina. Las poblaciones argentinas de esta especie se caracterizan por presentar polimorfismos paralelos para cromosomas B y segmentos supernumerarios en los pares S10 (SS10), S9 (SS9) y M6 (SS6). Estudios cromosómicos previos revelaron que algunas poblaciones naturales de la provincia de Tucumán presentan polimorfismos para cromosomas B que afectan la condición de quiasmas y comprometerían la fertilidad de los portadores. Asimismo, se detectó interacción entre las distintas formas de heterocromatina. Esta interacción podría afectar los patrones de distribución de los polimorfismos con respecto a lo esperado por el azar. Estudios isoenzimáticos y citogenétícos previos demostraron que los B y dos loci alozímicos estuvieron asociados a variables geográficas o climáticas. Estas observaciones han abierto nuevos interrogantes acerca de los mecanismos de mantenimiento de las diferentes formas de heterocromatina supemumeraria en D. elongatus y cual es la importancia relativa de las diferentes fuerzas evolutivas sobre la diferenciación genética en esta especie. Se analizó la variación genética de D. elongatus a nivel del ADN mitocondrial (ADNmt), con un enfoque filogeográfico. Mediante la técnica de RFLP (polimorfismos para la longitud de fragmentos de restricción) se estudiaron 171 individuos provenientes de poblaciones cromosómicamente polimórficas localizadas en las regiones Noroeste y Este de Argentina pertenecientes a las provincias biogeográficas: Las Yungas, Espinal y Pampeana. Las 10 enzimas de restricción utilizadas generaron 59 fragmentos de ADNmt. Se detectaron polimorfismos para los fragmentos producidos por HindIII, HaeII y HinfI. El número de substituciones por sitio entre pares de haplotipos varió entre 0.65 y 3.84%. El fenograrna obtenido por el método de Neigbor-Joining (empleando el número de sustituciones nucleotídicas por sitio) mostró dos grupos principales: uno agrupa a los haplotipos propios de la región Este y el otro agrupa a los haplotipos presentes en la región Noroeste. El árbol filogenético de consenso entre haplotipos mitocondriales permitió postular al haplotipo ancestral. Este ocupa el centro de la red y de él habrian derivado los dos grupos principales de haplotipos (Noroeste y Este). El dendrograma de la divergencia nucleotídica entre poblaciones mostró un agrupamiento de las poblaciones de acuerdo con su distribución geográfica. El grado de heterogeneidad del ADNmt entre las poblaciones de las regiones del Noroeste y Este fueron altamente significativo. Dentro de la región Este se observó homogeneidad entre las poblaciones pertenecientes a la provincia biogeográfica del Espinal, pero heterogeneidad entre las pertenecientes a la provincia biogeográfica Pampeana. Se observó también heterogeneidad significativa entre diferentes zonas de la provincia de Las Yungas (región Noroeste). Estos resultados sugieren que los patrones de distribución del ADNmt en D. elongatus podrian deberse: l) Aislamiento por distancia entre las provincias biogeográficas y 2) Factores ecológicos dentro de las mismas. Se estudió la variación en el ADNr en las mismas poblaciones analizadas a nivel del ADNmt de D. elongatus con el fin de comparar los patrones de distribución detectada a ambos niveles y evaluar las diferentes fuerzas evolutivas asociadas a la diferenciación genética detectada, incluyendo, en el caso del ADNr, la importancia relativa de la evolución concertada. Se analizaron a través de RFLP, 156 individuos de las 13 poblaciones. Se utilizó una sonda de 0.8kb del espaciador no transcripto (NTS) del saltamontes Calediu captiva. Se analizaron los patrones de restricción producidos por cinco enzimas (BamHI, EcoRI, PstI, HindIII y XbaI) detectándose un total de 21 fragmentos. Todos ellos, excepto los de BamHI, mostraron variación intra e interpoblacional. PstI reveló tres fragmentos cuya combinación originó cinco patrones ampliamente distribuidos. HindIII produjo 5 fragmentos, que originaron 10 patrones, algunos de los cuales son privados de Las Yungas. Las digestiones con XbaI produjeron 2 fragmentos, uno de ellos polimórfico. El mayor número de bandas y los tamaños más pequeños se produjeron al digerir el ADN con EcoRI donde se encontraron 9 bandas. Se analizó la variación intrapoblacional e interpoblacional a través de los indices de distancia: i) Lynch (1990), basado en la presencia y ausencia de bandas y ii) Hedrick (1983), empleando la intensidad de las bandas. Las poblaciones que presentaron mayor variabilidad intraindividual e intrapoblacional pertenecen a Las Yungas. Los árboles obtenidos por Neighbor-Joining a partir de los índices de Lynch y Hedrick son muy semejantes y evidencian dos grandes grupos. El primero de ellos reúne a la mayoría de las poblaciones de la provincia Pampeana, a las de la región sudeste de Las Yungas y una población del Espinal. El otro nuclea al resto de las poblaciones del Espinal y la población restante de la provincia Pampeana. Un rasgo interesante es la alta distancia genética entre las poblaciones de la región oeste de Las Yungas entre sí y con respecto al resto de las poblaciones. El alto nivel de variación intraindividual, intra e interpoblacional implicaría que los mecanismos de evolución concertada serian poco eficientes en esta especie. Los patrones de distribución del ADNr no se corresponden con los hallados para el ADNmt sugiriendo que la deriva y la migración no podrían explicar por sí solas la variabilidad detectada para el ADNr, similarmente a lo encontrado para la heterocromatina supemumeraria, sugiriendo la posibilidad de que existan factores adaptativos que podrían afectar la variación de la heterocromatina supemumeraria y del ADNr limitando los efectos de los factores estocásticos. E. plorans se distribuye a lo largo de la costa mediterránea en Europa. En el sur de España las poblaciones naturales presentan un complejo polimorfismo para cromosomas B. Se han identificado hasta cuarenta tipos de cromosomas B, los cuales no solamente se generan por recombinación sino también como consecuencia de una alta tasa de mutación. El número de tipos de B predominante en las poblaciones naturales de E. plorans es comparativamente bajo pero es marcado el hecho de que cada uno de ellos dominan en diferentes regiones a lo largo de la costa sur de España. Se propuso a B1 como el tipo original. A este cromosoma lo reemplazó B2 en la provincia de Granada y este de Málaga, mientras que B5 lo hizo en la zona central de Málaga dejando una isla de B1 entre ambas áreas. No hay razones obvias que expliquen la sustitución de un B por otro. Se propuso un modelo cíclico para la evolución de los cromosomas B de E. plorans que sostiene que coadaptación y evolución de genes supresores en el complemento A eliminaría el mecanismo de acumulación de los B. El sistema alcanzaría un estado cercano a la neutralidad hasta que una nueva variante recupere el mecanismo de acumulación y todo el proceso comenzaría nuevamente. Este modelo sugeriría que factores preexistentes en el genoma A podrían favorecer o no a un determinado tipo de B. Si esto es cierto, entonces debería existir alguna diferenciación genética en E. plorans entre las regiones donde predominan diferentes variantes de B. En este trabajo se analizaron los patrones de restricción del ADNmt de E. plorans como marcador para detectar diferenciación genética entre poblaciones que difieren en el tipo de cromosoma B. Se analizaron 197 individuos provenientes de 12 poblaciones que comprenden el área en estudio. La digestión del ADN mitocondrial de E. plorans con nueve enzimas de restricción reveló una baja variabilidad. Solamente EcoRI produjo tres patrones diferentes, denominados morfo I, II y III. En los demos del área central está presente el B1 y el morfo II del ADNmt. Al sudoeste del área central, los demos vecinos muestran una zona híbrida entre el B1 y el B5 y entre los morfos I y II. Sin embargo, el morfo I presenta una amplia distribución en el área de estudio y en algunos casos es predominante o es el único encontrado en las poblaciones donde existen otros tipos de Bs. Considerando al ADNmt como un marcador no relacionado con los Bs, deberían existir ciertas diferencias entre la distribución del ADNmt y las áreas definidas por los cromosomas B. Sin embargo, estos resultados sugieren que la evolución de los cromosomas B en E. plorans no sería independiente del genoma básico y que la sustitución de un B por otro podría estar acompañada en algunos demos por cambios en el complemento extracromosómico, en contraposición a lo que sucede en D. elongatus, donde la distribución de las variantes heterocromáticas no puede ser explicada a través de marcadores supuestamente neutros como el ADNmt.

Abstract:
The orthopteran insects offer excellent opportunities to study many aspects of the population genetics, such as genetic divergence, gene flow, introgression, natural selection and adaptation. The study of parallel evolution among nuclear DNA, extrachromosomic DNA (mitochondrial DNA) and B chromosomes allow evaluating the relative importance of the different evolutive forces on the genetic and chromosomal variability. Among insects, Dichroplus elongatus and Eyprepocnemis plorans are excellent models for these studies because stable polymorphisms for B chromosomes were detected in natural populations of these species. However, the maintenance of these chromosomes differs between these Species. While in E. plorans the maintenance of B chromosomes is explained by a “near neutral” model, in D. elongatus the previous results suggest a possible selective effect. D. elongatus is a phytophagous grasshopper widely distributed in Argentina. Some Argentinean populations exhibit parallel polymorphisms for B chromosome and supernumerary segments in chromosomes S10 (SS10), S9 (SS9) and M6 (SS6). In populations of Tucumán province, the polymorphisms for B chromosomes would affect the quiasma conditions and fertility of the carriers. Besides, an interaction among the different forms of supernumerary heterochromatin was detected. This interaction may affect the random distribution of these polymorphisms. Simultaneous isoenzymatic and citogenetic studies revealed that B’s and two loci are associated with climatic and geographic variables. These results have opened new questions about the mechanisms of maintenance of the different forms of supernumerary heterochromatin and the relative importance of the different evolutive forces on the genetic differentiation in this species. The genetic variation and phylogeography of D. elongatus was studied at the mitochondrial DNA (mtDNA) level. A total of 171 individuals from Northwest (Las Yungas biogeographic province) and East (Espinal and Pampeana biogeographic provinces) Argentinean populations were analyzed using restriction fragment length polymorphism (RFLP). With 10 restriction endonucleases, 59 mtDNA fragments were generated. Polymorphisms for HindIII, HaeIII and HinfI were found. The number of substitutions per site between pairs of haplotypes ranged from 0.65 to 3.84 per cent. The Neighbor-Joining phenogram (using the number of nucleotide substitutions per site) yielded two main groups; one clusters together the private haplotypes of the East region and the other the private haplotypes of the Northwest. Phylogenetic consensus unrooted tree among mtDNA haplotypes allowed us to propose the ancestral haplotype. This haplotype occupies the central position of the network. Three groups of haplotypes would have derived from the ancestral one. The UPGMA dendrogram from nucleotide divergence among populations showed that populations are roughly grouped according to their geographic distribution. There was a significant heterogeneity of the mtDNA distribution when populations from the East and Northwest regions were compared. In the East region, homogeneity was observed among populations from “Espinal” province, but significant differences were detected within “Pampeana” province. Heterogeneity was also observed between different borders of “Las Yungas” province (Northwest region). The distribution patterns of mtDNA variation observed in D. elongatus may be explained by isolation by distance when referring to the main biogeographic provinces. In “Las Yungas” and “Pampeana” provinces ecological factors seem to have contributed to the genetic differentiation among populations. The patterns of rDNA variation were analysed in the same natural populations of D. elongatus. The results were compared with those obtained from mtDNA data. The relative importance of different evolutive forces and the concerted evolution were considered to discuses the observed distribution. A total of 156 individuals from 13 populations were analyzed using RFLP. The 0.8kb cloned sequence from a 26s nontranscribed Spacer (NTS) from the Caledia captiva rDNA was used as probe. A total of 21 restriction fragments were obtained by simple digestion with five enzymes (BamHI, EcoRI, PstI, HindIII and XbaI). All the enzymes, except BamHI, exhibit intra and interpopulation variation. PstI revealed three restriction fragments and five patterns wider distributed. HindIII digestions showed five restriction fragments and 10 patterns, some of them were private of Las Yungas. XbaI digestions revealed two fragments, one of them polymorphic. EcoRI produced the greatest number of bands and the smallest fragments. The intra and interpopulation variation was analyzed by two distance indices: i) Lynch (1990) using presence and absence of bands and ii) Hedrich (1983) using band intensities. The highest values of intraindividual and intrapopulation variability were observed in the populations of Las Yungas. Both Neighbor-Joining trees are very similar and yield two main groups: one clusters together some populations of Pampeana province, the two southeastern populations of Las Yungas and one population of Espinal. The other clusters together the remained populations of Pampeana and Espinal provinces. An interesting point is the high genetic distance between the two northwestern populations of Las Yungas and the high differentiation of both populations from the remaining ones. The high level of intraindivual, intra and interpopulation variation would imply that the mechanisms of concerted evolution are not efficient in this species. The rDNA distribution does not agree with the mtDNA distribution, suggesting that genetic drift and migration could not explain the detected rDNA variability. Similarly to supernumerary heterochromatin, these results suggest that adaptive factors may affect the supernumerary heterochromatin and rDNA variation limiting the effects of stochastic factors. The grasshopper E. plorans shows a very complex polymorphism for B chromosomes distributed along the Mediterranean coasts in the Iberian Peninsula. There are more than 40 different B chromosome described variants, which are originated not only from recombination but also from high mutation rate. The number of B types predominant in natural populations of E. plorans is comparatively low but it is remarkable the fact that they dominate in different regions along the southern coast of Spain. It has been proposed that the original type, B1 was replaced by B2 in the Granada province and eastern Málaga, B5 did the same in central Málaga, leaving a relict “island” of B1 between those two areas. There are no obvious reasons that explain the substitution of one B by other. A cycle model to the B chromosome evolution in E. plorans was proposed. Co-adaptation and suppressor genes’ evolution in A chromosome neutralizes the B drive. The system would become inn a “near neutral” status until a new variant recovers the accumulation mechanism and the whole process starts over. This model implies that pre-existing factors in the genome may or may not favor a given B. If it were true, then in E. plorans some genetic differentiation should exist among the regions where different B variants predominate. We analyzed the restriction patterns of mtDNA of E. plorans as a marker for detecting any genetic differentiation among populations that differ in the B chromosomes. A total of 197 individuals from 12 populations that encircle the studied area were analyzed. The digestion of the mtDNA of E. plorans with 9 restriction enzymes revealed a low variability as only EcoRI produced 3 distinguishable patterns named morphs I, II and III. The demes from the central area show the B1 type and also the morph II of mtDNA. In the southwestern neighboring demes, a hybrid zone is shown between B1 and B5 types and between morph I and II of mtDNA. However, the morph I had a wider distribution and is predominant of even the only one found in most other samples where other B’s exist. Taking into account that mtDNA is a marker nonrelated with B’s, some differences should be expected between mtDNA distribution and the B-defined areas. However, the present results suggest that the evolution of B chromosomes of E. plorans was not independent from the basic genome and the substitution of one B by other, in some demes, might be accompanied by changes in the mtDNA. In contrast, in D. elongatus neutral markers as mtDNA may not explain the distribution of heterochromatin variants.

Manifesto, María Marcela. "Caracterización de la variabilidad genética de germoplasma argentino de trigo (Triticum aestivum L) mediante marcadores moleculares" (2000) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen Registro Cita

Resumen:
105 cultivares de trigo pan (Triticum aestivum L.), liberados comercialmente en Argentina entre 1932 y 1995, fueron caracterizados utilizando marcadores genéticos de tipo morfológico y molecular (microsatélites y AFLP) para obtener una estimación cuantitativa de la diversidad genética y su evolución a lo largo del tiempo, programas de mejoramiento. Un subgrupo de 10 diez SSR (microsatélites) altamente informativos fue seleccionado y utilizado para la construcción de la Matriz de Identificación, que permitió la discriminación de todos los cultivares estudiados aqui. Los datos moleculares fueron comparados con los datos morfológicos. Se observaron valores de correlación significativos,aunque bajos, para las distintas técnicas comparadas con los datos fenotípicos, presentando valores de correlación mayores los AFLP y SSR (r= 0.1334) siguiéndole el de coeficientes de parentesco (r = 0.12239). Los datos obtenidos mediante los marcadores SSR se complementaron con la información de datos de AFLP a fin de evaluar las relaciones genéticas entre cultivares. La correlación entre las matrices de similitud de datos combinados de SSR con AFLP y la matriz de coeficientes de parentesco fue estadísticamente significativa (test de Mantel, P<0 01), aunque baja (r = 0.34) Los datos moleculares fueron usados para cuantificar la diversidad genética a través de los criaderos y para evaluar la erosión genética. No se hallaron diferencias significativas en la diversidad genética entre los principales programas de mejoramiento privados y públicos. Sólo se hallaron diferencias significativas entre los principales criaderos y los menores, tanto con SSR como con AFLP. Un resultado interesante es que no se hallaron diferencias significativas en los valores de diversidad genética de los grupos de cultivares liberados antes de 1960 y aquellos liberados en las siguientes tres décadas. Los valores de diversidad promedio basados en marcadores SSR fueron casi idénticos para los cuatro periodos analizados La diversidad genetica estimada basada en datos de AFLP fue similar, pero diferencias levemente significativas fueron halladas entre cultivares liberados en los '70 (PIC= 0.28) y en los 80's (PIC = 0.34). Estos resultados contradicen la visión generalizada de la erosión genética de los cultivares modernos y muestran que el germoplasma Argentino de trigo pan ha mantenido relativamente constante el nivel de diversidad genética durante la última mitad del siglo. Se corroboró la factibilidad de la aplicación de microsatélites en dos aspectos: a) el estudio de caracteres cuantitativos de interes agronómico, como es la calidad panadera, en poblaciones segregantes y b) su aplicación en la caracterización de germoplasma. a) El microsatélite Xgwm3000 ubicado dentro del locus del gen de las γ-gliadinas (Xps2(Gli-1)) se halló completamente ligado al locus de RFLP XGli-B1 y estrechamente ligado (1 6 cM) a XGlu-B3 en la poblacion segregante Chinese Spring-Klein 32. La presencia del alelo 252 pb detectado en Klein32 se correlacionó con los aumentos detectados en los parámetros de calidad. Los microsatélites Xgwm2999 y Xgwm3000 ubicados dentro de los loci de γ-gliadinas y gluteninas de bajo peso molecular, respectivamente fueron útiles en la caracterización de la variación alelica de los loci de proteínas de reserva en 105 cultivares de Argentina y 90 de California.

Abstract:
In this study, 105 Argentine cultivars of bread wheat (Triticumaestivum L.) released between 1932 and 1995 were characterized using SSR, AFLP markers and morphological characters to obtain a quantitative genetic diversity estimation, its evolution along time and different breeding programs. A selected subset of ten highly informative microsatellites was used to construct an Identification Matrix that allowed the discrimination of all the cultivars included in this study. Molecular data was compared with morphological data. Significant correlation values, although low, were obtained for morphological data matrix and molecular data matrix. AFLP and SSR showing highest values of correlation (r = 0.1334), followed by kinship data (r = 0.1224) Data obtained from SSR markers was complemented by information derived from AFLPs, to evaluate genetic relationships among cultivars. The correlation between a combined SSR and AFLP similarity matrix and a kinship coefficients matrix was highly significant (Mantel test. P<0.01). but low (r= 0.34) Molecular data were used to quantify genetic diversity across the wheat breeding programs and to evaluate genetic erosion. No significant differences in genetic diversity were found between the largest private and public breeding programs. Significant differences were found only between the large and smallest breeding programs for both SSR and AFLP An interesting result from this study was that no significant differences in genetic diversity were found between the group of cultivars released before 1960 and those released in each of the following three decades. Average diversity values based on SSR markers were almost identical for the four analyzed periods Genetic diversity estimates based on AFLP data were also very similar but slightly significant differences were found between bread wheat cultivars released in the 70's (PIC = 0.28) and those released in the 80's (PIC= 0.34). These results contradict the general vision of significant genetic erosion in modern cultivars and showed the Argentine bread wheat germplasm has maintained a relativer constant level of genetic diversity during the last half century. Microsatellite application was corroborated in both aspects: a) studies of qualitative characters of agronomic interest, as bread making quality, in segregating populations and b) germplasm characterisation. a) SSR located within the γ-gliadin gene (Xps2(Gli-1))was completely linked to RFLP locus XGli-B1 and closer linked (1.6 CM)to XGlu-B3 in Chinese Spring-Klein 32 segregating population. Allele 252 pb at this loci detected in Klein 32 variety, was associated with significant increment in bread making quality parameters. b) SSR loci Xpsp 2999 and Xpsp 3000 located within a low molecular weight glutenin gene and gamma-gliadin gene, respectively are useful to characterize allelic variation at these two storage protein loci in 105 bread wheat cultivars from Argentina and 96 from California.

Bottini, María Cecilia J.. "Estudios multidisciplinarios en las especies Patagónicas Argentinas del género Berberis L. (Berberidaceae)" (2000) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La familia Berberidaceae está integrada por 14 géneros que habitan Norteamérica. Sudamérica, Europa, Asia y Norte de Africa, de los cuales sólo Berberis extiende su distribución al Hemisferio Sur. El género Berberis esta representado en la Patagonia Argentina por 16 especies. Algunas de ellas presentan: delimitación morfológica inequívoca que pueden o no hibridar en zonas ecotonales y/o marginales sin perder su identidad; adaptación a ambientes muy contrastantes (rangos de precipitación, tipos de suelos. etc); distribución muy restringida a condiciones ambientales especificas; características de habitat similares a pesar de presentar un amplio rango de distribución. Se realizaron estudios multidisciplinarios con la finalidad de caracterizar y delimitar los taxa que componen al género y analizar los mecanismos de especiación del grupo con especial referencia a la "Especiación Hibrida Homoploide y Poliploide". A partir de diferentes metodologías (morfología, citogenetica, proteinas seminales, isoenzimas, AFLP e ITS) se analizaron numerosas poblaciones de las siguientes especies: B. bidentata, B. buxifolia, B. cabrerae, B. chillanensis, B. comberi, B. copahuensis, B. darwinii, B. empetrifolia, B. heterophylla, B. ilicifolia, B. linearifolia, B. michay, B. montana, B. parodii y B. serrato-dentata. Los principales resultados obtenidos a partir de las diferentes técnicas sugieren que: En Berberis se encontró que el contenido de ADN está fuertemente asociado con un conjunto de variables ambientales y ecológicas, apoyando la hipótesis del "nucleotipo". B. bidentata, B. darwinii y B. linearifolia conformarían un Complejo Hibrido Homogámico. B. buxifolia, B. heterophylla y B. parodii constituirian un Complejo Híbrido Poliploide. El proceso de especiación de B. montana, B. chillanensis y B. cabrerae no estaría completo y estas tres entidades podrian tratarse de semiespecies.

Abstract:
The Berberidaceae are a family of about 14 genera, widespread in Northern Hemisphere and with a single genus, Berberis, extending into South America. In the Argentinian Patagonian region there are 16 species of Berberis. Some of them present: sharp morphological discontinuities, although there are intermediate forms among some of the species indicating the probable ocurrence of hybridization; adaptation to very different habits (rainfall range. soil types, etc); restricted geographic range to specific environmental conditions; widespread distribution maintaing similar type of habit. Multidisciplinary studies were made wiht the aim to analyze the boundaries among the taxa of the genus. Moreover there studies could help to delimitate the mechanism of speciation of there taxa, with special enphasis in "Homoploid and Polyployd Hybrid Speciation". Morphological, cytogenetical, seed proteins and isozymes electrophoresis, AFLP and ITS studies were done to analize the relationships among several populations of: B. bidentata, B. buxifolia, B. cabrerae, B. chillanensis, B. comberi, B. copahuensis, B. darwinii, B. empetrifolia, B. heterophylla, B. ilicifolia, B. linearifolia, B. michay, B. montana, B. parodii and B. serratodentata. The principal conclusions suggest that: Berberis' DNA content is strongly associated with geographical and ecological variables, this data would support the nucleotype hypotesis. B. bidentata, B. darwinii and B. Linearifolia would constitute an Homogamic Hybrid Complex. B. buxifolia, B. heterophylla and B. parodii would conform a Polyployd Hybrid Complex. The speciation process of B. montana, B. chillanensis and B. cabrerae would not be complete being considered as semispecies.

Szapkievich, Valeria Beatriz. "El Río Paraná como modelador del ambiente de la distribución marginal sur de Alouatta caraya (Primates, Platyrrhini)" (2000) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En Primates, la distribución geográfica se asocia a diversos factores entre los cuales, los hábitos alimentarios y el tamaño corporal pueden ser considerados como los más importantes al momento de determinar su capacidad para superar posibles barreras ecológicas. Diversos estudios han tratado de caracterizar la posible relación entre la distribución geográfica y determinados parámetros biológicos. El genoma de las formas actuales de Platyrrhini y en especial el de ceboideos de distribución marginal sur, parecen mostrar diferentes estrategias adaptativas en su distribución. Es así como cobran importancia el estudio de las variantes alozímicas y su probable asociación con la distribución geográfica. La relación entre reordenamientos eucromáticos y heterocromáticos, como dos variables vinculadas con el proceso especiogénico no presentan los mismos patrones ya que mientras los cébídos muestran importantes regiones del cariotipo con secuencias altamente repetidas de tamaño y ubicación variables, detectables por bandas C, los atélidos exhiben una mínima proporción siendo el ejemplo paradigmático el de los aulladores. En especial la especie monotípica que muestra menor variabilidad estructural resulta ser Alouatta caraya cuya distribución marginal sur es la más austral dentro de los límites de nuestro país y se vincula con la cuenca del río Paraná. Esclarecer la posible relación entre Primates y grandes ríos en Argentina se consideró indispensable para comprender el proceso especiogénico. Para ello se caracterizó genéticamente poblaciones de Alouatta caraya y se la comparó con otros cinco ceboideos y en particular con Cebus apella de localidades argentinas y paraguayas cercanas al río Paraná. Para concretar los análisis comparativos se abordaron metodologías citogenéticas: técnicas de bandas G y C, y bioquímicas: electroforesis de proteínas. Siendo A. caraya una especie de gran tamaño, con dieta amplia y capacidad colonizadora, se esperaba que el río no se constituyera en una barrera, distnbuyéndose libremente en ambas márgenes. Esta especie constituyó así un modelo único para poner a prueba la hipótesis sobre los grandes ríos como barreras efectivas para la distribución en los Primates. En la distribución marginal sur de esta especie, el Paraná, por sus caracteristicas particulares de rio caudaloso podría comportarse como determinante del aislamiento reproductivo en la distribución marginal de Primates en Argentina. De allí que los objetivos fundamentales del trabajo de tesis fueron: Caracterizar la variabilidad genética de Alouatta caraya de Argentina y poner aprueba la hipótesis sobre los grandes ríos como barreras geográficas. Para ello se estudiaron 69 individuos de vida silvestre provenientes de 5 localidades y más de 70 individuos de Alouatta caraya, Cebus apella, Saimiri boliviensis, Aotus azarae y Ateles paniscus provenientes de diversos centros de cautiverio. Se observaron 4 loci polimórficos en Alouatta caraya, sobre 15 estudiados. Se compararon los perfiles electroforéticos de las 5 especies y los valores de diversidad y distancia genética de Alouatta caraya. A nivel citogenético se determinó el 2n de los individuos estudiados y se analizaron los patrones de bandas G y C. La similitud de los valores de las frecuencias alélicas y de la diversidad genética de las poblaciones, el bajo nivel de diferenciación observado entre las poblaciones y la homogeneidad cariotípica hallada, permitió decir que: en el límite austral de la distribución, el río Paraná no constituirá un barrera para los aulladores sino más bien actuaría como corredor, promoviendo la dispersión de la especie. La caracterización genética de las poblaciones de cautiverio pueden servir como reservorios de variabilidad para utilizar en programas de reproducción en cautiverio y reintroducción de especies amenazadas o en peligro de extinción.

Abstract:
In Primates, geographic distribution is associated to several factors among which, diet and body size can be considered as the most important ones when determining their ability to cross possible ecological barriers. Different studies have attempted to characterise the possible relationship between geographic distribution and certain biological patterns. The genome corresponding to the present Platyrrhini, specially the one of Ceboidea of southern marginal distribution, seems to show different adaptative strategies in its distribution. Thus the importance of the alozymic variability study and its probable association with geographic distribution. The relationship between the euchromatic and heterochromatic rearrangements, as two variables related to the speciogenic process, do not have the same pattern. While Cebidae shows important regions of the caryotype with highly repeated sequences of variable size and distribution, detected by C band pattern, Atelidae shows it in a minimun proportion, turning the howlers into the paradigmatical example. Alouatta caraya is a monotipic specie that shows less structural variability, whose distribution of the stream river banks is the southemmost within our country frontiers and is connected with the Paraná river. To understand the speciogenic process, the possible relationship between Primates and big rivers in Argentina was considered indispensable. To concrete the compared analysis, cytogenetic methodologies: G and C banding techniques and biochemical techniques: protein electrophoresis. Being Alouatta caraya a big species, with a huge diet and colonizing capacity, it was expected that the river wouldn't be a barrier, letting the species being freer distributed in both sides. This species became in that way an unique model to test the hypothesis about the big rivers as effective barriers for the distribution of the Primates. On the southern marginal distribution of this species, the Paraná river, because of their particular characteristics of being a river with strong currents could appear as the determining cause of the reproductive isolation in the marginal distribution of Primates in Argentina, So the objectives of this thesis were: characterise the genetic variability of Alouatta caraya of Argentina and to test the hypothesis about big rivers as geographic barriers. For that 69 Wildlife individuals from 5 localities and more than 70 captive specimens of A. caraya, Cebus apella, Saimiri boliviensis, Aotus azarae and Ateles paniscus from different breeding centres. From 15 loci studied, four of them were polymorphic in Aloualta caraya. Electrophoretic profiles from the 5 species were compared and diversity and genetic distances values from Alouatta caraya were obtained. To the cytogenetical level, 2n was determined for al the studied individuals and G and C banding patterns were analysed. The similar values of the allelic frequencies and those of the genetic diversity of the populations, the low level of differentiation observed between populations and the caryotipic homogeneity founded, allowed to say that: in the southernmost limit of black howlers distribution, the Paraná river wouldn't be a barrier, but a corridor , promoting the species dispersion. The genetic characterisation of captive populations could serve as variability reservoirs to use in reproductive programs in captivity and to reintroduce threatened species or in danger to extinction.

Ferreyra, Laura Inés. "Estudio de la variabilidad y la diferenciación genética por medio de técnicas de Isoenzimas y RAPD en poblaciones naturales de especies e híbridos del Género Prosopis (Leguminosae)" (2000) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Se estudió por medio de la electroforesis de isoenzímas y RAPDs la variabilidad, diferenciación y estructura genética en poblaciones naturales de P. alba, P. nigra, P. ruscifolia, P. flexuosa y P. vinalillo y poblaciones de híbridos interespecificos (P. alba x P. nigra y P. alba x P. flexuosa). Se estudió además la posible correlación entre variables ambientales con loci isoenzimáticos y de RAPDs y si la diferenciación genética entre poblaciones podría estar asociada con las distancias geográficas entre las mismas. Las técnicas de isoenzímas permitieron el análisis de 21 loci de los cuales 16 fueron polimórficos. No se encontraron loci diagnósticos de especies. Estas sólo se diferenciaron por sus fiecuencias alélicas. La técnica de RAPDs identificó 28 locí de los cuales 5 permitieron reconocer inequívocamente las especies. Los valores de variabilidad genética promedio observados para isoenzímas (P = 37.5 — 66.7%; H = 0.14- 0.332) y para RAPDs (P = 32.1- 46.4 % ; H = 0.123- 0.246) fueron similares entre sí y con respecto a los estimados en estudios previos con ambas metodologías en especies de Algarobia. Se observó un exceso de homocigotas (F IS >0) en todos los loci polimórficos estudiados. Esto podría deberse a la existencia de cruzamientos endogámicos dentro de las poblaciones como consecuencia de la limitada dispersión de las semillas y el polen y a la autogamia parcial estimada en estudios previos (hasta un 28 %). Los niveles de diferenciación genética obtenidos entre poblaciones a partir de los datos de isoenzímas y RAPDs fueron similares (F ST-0.36 y 0.4 respectivamente) e indicaron una diferenciación altamente significativa entre poblaciones de diferentes especies. En ambos casos el flujo génico estimado (Nm = 0.8 y 0.3) fue menor que l individuo por generación, mientras que el flujo génico entre poblaciones de igual especie fue mayor que uno. Tanto para datos de isoenzímas y RAPDs la mayor diversidad ocurre dentro de las poblaciones (54-69%), es intermedia entre especies (23-42%) y baja entre poblaciones (416%). Se observaron correlaciones significativas entre frecuencias alélicas isoenzimáticas y algunas variables geográfico-climáticas mientras que no se observaron correlaciones significativas entre las variables geográfico-climáticas y las bandas RAPDs. También se observaron diferencias en los resultados cuando se evaluó la correlación entre las matrices de distancias genéticas y geográficas a partir de los datos de isoenzímas (correlación significativa) y RAPDs (correlación no significativa). La asociación de las variables de algunos loci isoenzimáticos con variables geográficas y/o climáticas sugiere un efecto selectivo de los mismos. El intervalo de distancias genéticas entre poblaciones coespecíficas obtenidas a partir de los datos de isoenzímas (0.04 y 0.12) fue similar al obtenido a partir de los datos de RAPDs (0.02 a 0.10). Tanto las isoenzímas como los RAPDs muestran una alta afinidad entre las especies estudiadas de Algarobia, ya que estas comparten la mayoría de los loci con similares frecuencias alélicas. La diferenciación entre especies medida por las distancias de Nei fueron en promedio con ambas metodologías relativamente bajas (0.10-0.27). Estos valores son esperados para sub o semiespecies según Ayala (1974). Los fenogramas obtenidos con ambas metodologías fueron similares entre sí y mostraron a poblaciones coespecíficas agrupadas. Las poblaciones hibridas analizadas no fueron en ningún caso intermedias entre sus progenitores putativos.

Abstract:
Isoenzyme electrophoresis and RAPD techniques were applied to analyze the genetic variability, differentiation and structure of natural populations of P. alba, P. nigra, P. flexuosa, P. vinalillo, P. ruscifolia and interspecific hybrid populations (P. alba x P. nigra and P. alba x P. flexuosa). The present study also evaluated if genetic variables (isozyme and RAPD loci) are correlated with environmental variables and if the genetic distances between populations are associated with geographic distances. Isozyme technique allowed analyzing 21 loci, 16 of which were polymorphic. Diagnostic loci of species were not found. Species were differentiated only by allelic frequencies. RAPD technique identified 28 loci. Only 5 of them allowed unequivocal species recognition. Estimates of genetic variability obtained from isozyme (P =37.5 —66.7 % ; H = 0.14 — 0.32) and RAPD (P = 32.1- 46.4 % ; H =0.123 —0.246) were similar to each other, and to previous estimates obtained using both techniques in other Algarobia species. Significant homozygote excess (F IS > 0) was observed in all polymorphic loci studied. It might be caused by endogamic crosses within populations, due to limited pollen and seed dispersal, and/or partial selfing, which, according to previous works, may reach a rate of 28%. The genetic differentiation among populations obtained from RAPD and isozyme data were similar (F ST = 0.36 and 0.40 respectively) and indicated highly significant differentiation among populations of different species. In both cases estimated gene flow (Nm = 0.8 and 0.3) was lower than one individual per generation. In contrast, gene flow estimates among cospecific populations were higher than one. The highest proportion of variation occurred within population (54 —69 %), the among species variation was intermediate (23 —42 %) and the lower value was observed among conspecific populations (4 —16 %). Significant correlation between isoenzymatic allelic frequencies and geographical or climatic variables was observed. They suggest selective effects of these loci. By contrast, no significant associations were found by RAPD bands. Differences in results were also found when the correlation between geographic distances and genetic distances were evaluated for isozyme (significant correlation) and RAPD (no significant correlation) data. Genetic distance range among cospecific populations from isozyme data (0.04 - 0.121) were similar to that obtained from RAPD data (0.017 —0.10). Both isozyme and RAPDs showed high similarity among the studied species of Algarobia, since most alleles are shared by almost species. The diferentiation among species within this section measured through Nei distance was relative low with both techniques, with values ranging within the expected according to Ayala et al. (1974) for sub to semispecies. The phenogram obtained with both methodologies were consistent and showed clusters of cospecific populations. Hybrid populations were not intermediate between putative parents.

Bessega, Cecilia. "Estructura poblacional y relaciones filogenéticas (Distancia y Parsimonia) en especie de Prosopis (Leguminosae) en base a marcadores moleculares" (2001) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Prosopis es un género que presenta gran importancia desde el punto de vista económico, ecológico y evolutivo. Habita en las principales zonas áridas y semiáridas del mundo y en base a su morfología ha sido dividido en cinco secciones denominadas Prosopis, Anonychium, Monilicarpa, Strombocarpa y Algarobia. Esta última incluye 30 especies de las cuales la mayor parte habitan en América, con el principal centro de diversidad en Argentina. Algunas especies de esta sección hibridan frecuentemente en la naturaleza dando lugar a individuos con fenotipos intermedios, difíciles en algunos casos de determinar. En este trabajo se analizaron marcadores bioquímicos y moleculares en poblaciones de P. glanadulosa, P. velutina, P. alba, P. nigra, P. vinalillo, P. alpataco, P. caldenia, P. ruscifolia, P. flexuosa, P. chilensis, P. affinis, P. kuntzei de Algarobia, P. reptans de Strombocarpa y P. argentina de Monilicarpa. Se estudiaron poblaciones naturales mediante las técnicas de electroforesis de isoenzimas y RAPD con el objeto de identificar loci diagnóstico, estimar la variabilidad y analizar la estructura poblacional. Se compararon poblaciones naturales de diferente subcontinentes pertenecientes a Algarobia junto con P. reptans (Strombocarpa) y P. argentina (Monilicarpa). Los resultados señalaron que P. velutina y P. kuntzei son las únicas que presentaron loci isoenzimóticos diagnósticos. Las especies Norteamericanas P. grandulosa y P. velutina no presentaron bandas RAPD diagnósticas con los “primers” ensayados. Los niveles de variabilidad genética estimados en las poblaciones Norteamericanas son semejantes a los de las especies Sudamericanas de la misma sección; y las poblaciones presentan las misma variantes isoenzimóticas. Los niveles de variabilidad genética de P. reprans (Strombocarpa) y P. argentina (Monilicarpa) no difieren entre sí, aunque son significativamente menores que las de las especies de Algarobia. La diferenciación genética entre las poblaciones de la sección Monilicarpa es menor a la presentada por las especies de Algarobia estudiadas. Como consecuencia, el flujo génico estimado entre las poblaciones de P. argentina es mayor que el de las especies de Algarobia. Un estudio de individuos agrupados por familias fue realizado mediante electroforesis de isoenzimaspara inferir el sistema de apareamiento en siete especies de la sección Algarobia. Los resultados mostraron que las especies presentan en la mayoría de los casos fecundación cruzada pero que hasta un 28% de autofecundación puede ocurrir (tm varió entre 0.72 y 1). El valor promedio en todas las especies aquí estudiadas es de 15%. Las tasas de fecundación cruzada variaron entre los árboles dentro de las poblaciones y la mayoría de los individuos analizados (semillas) dentro de cada familia eran hermanos completos. Se realizó un estudio de RFLP utilizando como sonda 27.7 kb de cpDNA heterólogo de Nicotina tabacum en 11 especies del género. Los resultados no mostraron variación intraespecífica en ningún caso y sólo permitieron diferenciar a P. reptans y a P. kuntzei de las restantes especies de Algarobia estudiadas (P. alba, R nigra, P. vinalillo, P. alpataco, P. caldenia, P. ruscifolia, P. flexuosa, P.glandulosa, P. affinis). Por último, las relaciones filogenéticas entre las especies fueron reconstruidas mediante métodos de distancia y parsimonia a partir de las frecuencias alélicas isoenzimáticas, de las secuencias correspondientes al intergén TrnD-TrnT(cpDNA) y de las secuencias de los espaciadores internos transcriptos de ADN ribosómico (ITS-1 e ITS-2). Los fenogramas obtenidos a partir de los datos de enzimas señalaron que P. reptans (Strombocarpa), P argentina (Monilicarpa) y P. kuntzei son las especies mas diferenciadas. A pesar de que los cladogramas de cpDNA y de ADNr resultaron incongruentes, presentan consistencia. El orden relativo de divergencia señalado en ambos cladogramas concuerda con el nivel de diferenciación genética en los fenogramas. Además, ni los fenogramas ni los cladogramas están de acuerdo con la clasificación morfológica en series propuesta para este grupo.

Abstract:
Prosopis is a very important genus from the economic, ecological and evolutionary point of view. It occupies the main arid and semi-arid areas of the world and, based on the morphology, its species have been divided into five sections denominated Prosopis, Anonychium,Monilicarpa, Strombocarpa and Algarobia. The latter includes 30 species, most of which are American, with the main diversity center in Argentina. Some species of this section frequently hibridise in the nature producing individuals with intermediate phenotypes that sometimes are difficult to determine. In this work biochemical and molecular markers were analyzed in populations of P. glandulosa, P. velutina, P. alba, P. nigra, P. vinalillo, P. alpataco, P. caldenia, P. ruscifolia, P. flexuosa, P. chilensis, P. affinis, P. kuntzei of Algarobia, P. reptans of Strombocarpa and P. argentina of Monilicarpa. Natural populations were studied by means of isoenzyme electrophoresis and RAPD techniques, in order to identify diagnostic loci, to estimate the variability and to analyze the structure of populations. Populations of species from different subcontinents belonging to Algarobia were compared, together with P. reptans (Strombocarpa) and P. argentina (Monilicarpa).The results indicated that P. velutina and P. kuntzei are the only ones which showed isoenzymatic diagnostic loci. The North American species, P. glandulosa and P. velutina, did not present diagnostic RAPD bands with the primers here used. Genetic variability estimates in populations of North American species of Algarobia are similar to those of the South American ones of the same section, and they share most isoenzymatic alleles. P. reptans (Strombocarpa) and P. argentina (Monilicarpa)do not differ from each other in genetic variability, but their variability is significantly lower than that of species of Algarobia. The genetic differentiation among populations in the section Monilicarpa is lower than in the species studied of Algarobia. Thus, the estimated gene flow among populations of P. argentina is higher than those of Algarobia species. A study of individuals grouped by families was carried out by isoenzyme electrophoresis to estimate parameters of the mating system in seven species of the section Algarobia. The results showed that species are mostly outcrosser but up to 28% of selfing can occurs (tm varied between 0.72 and 1). The average value in all the species here studied is of 15%. Outcrossing rates vary among the trees within the populations and most of the analyzed individuals(seeds) within each family are full sibs. A study of RFLP using a heterologous cpDNA probe of Nicatiana tabacum (27.7 kb) was carried out in 11 species of the genus. The results did not show intraspecific variation in any of the species studied. Only P. reptans and P. kuntzei could be distinguished from the remaining studies species of Algarobia (P. alba, P. nigra, P. vinalilla, P. alpataco, P. caldenia, P. ruscifolia, P. flexuosa, P.glandulosa, P. affinis). Finally, the phylogenetic relationships among species were reconstructed through distance and parsimony methods from isoenzymatic allelic frequencies, the sequences corresponding to the intergenic region TrnT-TrnD(cpDNA) and the sequences of internal transcribed spacers from ribosomic DNA (ITS-1 and ITS-2). The phenograms obtained from the enzyme data indicated that P. reptans (Strombocarpa), P. argentina (Monilicarpa)and P. kuntzei are the most differentiated species. Although the cpDNA and rDNA cladograms were incongruent, they present some consistence. The relative divergences of basal nodes in both cladograms are consistent with the level of genetic differentiation in the phenograms. Furthermore, none of the trees agrees with the morphological classification of proposed series for this group.

Ascunce, Marina Sofía. "Variabilidad nucletídica en el ADN mitocondrial de Alouatta Caraya del NE de Argentina" (2002) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los primates como mamíferos de vida larga y socialmente complejos, constituyen modelos óptimos para observar los efectos del comportamiento y la demografía sobre la evolución de los grupos. Los Monos del Nuevo Mundo (Primates, Platyrrhini) presentan una gran diversidad taxonómica con l6 géneros, l10 especies y 205 especies y subespecies. Su gran radiación adaptativa permite observar una amplia variación en cuanto a parámetros de historias de vida, demografía y estructura social, entre otros. La diferenciación genética entre las poblaciones está determinada por la interacción de factores ecológicos y los procesos evolutivos tales como la selección natural, el flujo génico y la deriva génica. En este trabajo se han analizado los efectos de la organización social y los eventos históricos sobre la variabilidad nucleotídica mitocondrial en algunos platirrinos y particularmente en Alouatta caraya. Se analizaron los efectos de linaje sobre las tasas de evolución molecular mediante comparaciones entre dos familias de monos platirrinos: Atelidae (Ateles, Brachyteles Lagothrix y Alouatta) como representante de platirrinos de cuerpo grande y Cebidae (Cebus, Saimiri y Aotus) representativa de monos platirrinos de menor porte. Se empleó la secuencia nucleotídica del gen mitocondrial correspondiente a la subunidad II de la citocromo oxidasa c, de un total de 29 ejemplares de platirrinos, 11 de estas secuencias fueron obtenidas en el presente trabajo. Los resultados mostraron que el gen COII es un marcador útil para resolver relaciones filogenéticas intragenericas en este grupo. A su vez, en oposición a lo esperado en base a los efectos de linaje, Saimiri con un menor tamaño corporal mostró la menor tasa de sustitución nucleotídica a nivel del ADN mitocondrial, probablemente reflejando la retención de polimorfismos ancestrales, debido probablemente a tamaños poblacionales grandes asociados a características particulares de su organización social. En la segunda parte de la Tesis, se analizó la variabilidad en la secuencia nucleotídica del ADN mitocondrial observada en Alouatta caraya abarcando el área correspondiente a la porción marginal sur de su distribución, con el objetivo de establecer si ciertas características de su organización social afectan la estructura genética de sus poblaciones. Se obtuvo la secuencia de un fragmento de la región control mitocondrial (RC) para un total de 70 ejemplares de 7 localidades. La distribución de la variabilidad nucleotídica caracterizada por la presencia de dos linajes mitocondriales divergentes (clados A y B), se ajusta a un patrón filogeográfico de clase II. Para explicar este patrón se consideró a las selvas asociadas a los ríos Paraná y Paraguay como rutas de migración de la especie a través de las cuales A. caraya habría colonizado la región sur de la distribución. Los datos obtenidos indicarían que ambos linajes habrían sufrido un cuello de botella hace aproximadamente 10.000 años que coincide con un período de extrema aridez, que se conoce como Younger Dryas, considerado de transición entre el fin de las glaciaciones y el comienzo del calentamiento global. El estudio de la variación nucleotídica a nivel de la región control del mtADN en una población de ‘carayás' de un ambiente de selva de inundación (Isla Brasilera, Chaco) permitió observar una estructuración de la variabilidad mitocondrial coincidente con los grupos sociales (tropas) los cuales presentaron casi exclusivamente haplotipos asignables a uno de los dos linajes A ó B. Este patrón de variabilidad mitocondrial sugiere que en el albardón principal de Isla Brasilera (una zona rica en recursos). las tropas se habrían formado principalmente por eventos de fisión de matrilíneas, mientras que en la zona más periférica de la isla (más pobre en recursos), la formación de nuevos grupos se daría por dispersión de individuos desde el albardón o bien por nuevos eventos de colonización. Esto junto con el patrón de divergencia genética sexo específico sugeriría que las hembras presentan comportamiento filopátrico. En los platirrinos, si bien las características poblacionales y de estructuración social determinarían la probabilidad de fijación de los cambios genéticos, los eventos vicariantes parecen haber sido importantes en la especiación del grupo. A su vez, en este trabajo se observó que a nivel poblacional Alouatta caraya en su distribución marginal sur presentaría en la actualidad un patrón de variabilidad mitocondrial determinado no sólo por factores intrinsecos sino también signado por eventos demográficos históricos.

Abstract:
Primates as long-lived and socially complex mammals, offer the opportunity to assess the effects of behavior and demography on the evolution of the groups. New World Monkeys (Primates, Platyrrhini) show a great taxonomic diversity represented by l6 genera, ll0 species and 205 species and subspecies. Its great adaptive radiation is reflected by an extensive diversification of life histories, demography and social structure. Genetic differentiation among populations is determinated between ecological factors and evolutionary processes such as natural selection, gene flow and genetic drift. In this work, the effects of social organization and historic events on the nucleotide variability at the mtADN including some platyrrhine genera and particularly Alouatta caraya were analyzed. Lineage effects on the rates of molecular evolution were analyzed by means of comparisons between genera of two platyrrhine families Atelidae (Ateles, Bruchyteles Lagothrix and Alouatta) as representative of large-size genera and Cebidae (Cebus, Saimiri and Aotus) which are considered as medium size genera among platyrrhines. Nucleotide sequence variation at the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit II gene (COII) was analyzed in 29 New World monkey specimens, 11 obtained in this work. The results suggested that the main utility of COII in platyrrhine systematics lies at the intrageneric level. Contrary to the expectation considering the lineage effects, Saimiri, which is among the smallest size genera analyzed, showed low numbers of unique substitutions suggesting the maintenance of ancestral or plesiomorphic states of platyrrhine mt DNA nucleotide characters probably due to its large population sizes as compared to other platyrrhines, along with particularities in its social organization. In the second part of the Thesis, the nucleotide sequence variation at the mitochondrial DNA was analyzed considering the south marginal distribution area of Alouatta caraya, aiming to study the relationship between the pattern of genetic variation and features of its social organization. A fragment of the mitochondrial control region (CR) was sequenced in 70 specimens of 7 localities. The analysis of sequence variation revealed the presence of two divergent clades A and B which is concordant with a phylogeographic pattern type II. To explain this pattern, it was considered that the forest associated to the Paraná and Paraguay river margins have been used as migration routes by A. caraya. Sequence data suggested that both mitochondrial clades have passed through population bottlenecks about 10,000 years ago, in coincidence with a period of extreme dryness, known as Younger Dryas, during the transition between the end of the glaciations and the beginning of the global warming. The large sample size obtained for the ‘carayá' population of Isla Brasilera characterized as flooded forest, allowed a detailed study of microgeographic population structure. The analysis of genetic variability at the mitocondrial CR sequences showed that within the troops only haplotypes of clade A or B are mainly represented. This pattern of genetic variation suggested that at the main hillock (a zone rich in resources), the troops might be mainly form through the matrilineal fission, while in the peripheral area of the island (which is poorer in resources), the origin of new groups might be related to dispersion of individuals from the main hillock, or by means of new immigration events by new colonizers in the island. This observation together with a sex-specific pattern of genetic differentiation gives support to the hypothesis that females are phylopatric. In platyrrhines, although population and social organization traits may be important determinants of the probability of fixation of genetic changes, vicariant events seem to have played a central role in the diversification of the group. In addition, the present pattern of mitochondrial variability in A. caraya, in its south marginal distribution, appears to be the result of historical demographic events coupled with intrinsic factors such as social organization.

Abel, María Cecilia. "Estudio de la variabilidad y la diferenciación genética por medio de técnica de Isoenzimas y RAPD en poblaciones naturales de especies de pejerreyes de la República Argentina, género Odontesthes (Atherinopsidae, Atherinopsinae, Sorgentinini)" (2002) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Se estudió por medio de electroforesis de Isoenzimas y RAPD la variabilidad, diferenciación y estructura genética en poblaciones naturales de 0. argentinensis, 0. bonariensis y 0. hatcheri. Se analizó asimismo si la diferenciación genética entre poblaciones, detectada por Isoenzimas y RAPD, podria estar asociada con las distancias geográficas entre las mismas. La técnica de Isoenzimas permitió el análisis de 22 loci (19 para cada especie), de los cuales 8 fueron variables. Si bien las frecuencias alélicas de las poblaciones de cada especie para estos 8 loci mostraron algunas diferencias, la población de 0. bonariensis del Río de la Plata se destacó netamente entre las poblaciones de su especie por la presencia de un alelo fijado y diagnóstico (LDH-1*3). La comparación de frecuencias alélicas entre las distintas especies reveló importantes diferencias, siendo la especie más diferenciada 0. hatcheri. Esta especie se diferenció de 0. bonariensis y O. argentinensis por la presencia de 3 loci GOT exclusivos (diagnósticos) (GOT-2*, GOT-3*, GOT-5*). Además la expresión tisular diferencial permitió distinguir las 3 especies por los patrones de expresión de 3 loci (MEP-1*, MEP-2* y MEP3*). La técnica de RAPD permitió el análisis de 220 bandas. De éstas, sólo 4 resultaron monomórficas. La mayoría de las bandas amplificadas fueron compartidas por las especies y poblaciones variando sólo en sus frecuencias. Del análisis de estas frecuencias se deduce que existen 2 importantes grupos: uno conformado por las poblaciones de O. hatcheri y el otro compuesto por las poblaciones de 0. bonariensis y 0. argentinensis. Al igual que en el análisis isoenzimático la población de 0. bonariensis del Rio de la Plata fue las más diferenciada dentro de las de su especie. Los valores de variabilidad genética promedio por especie, calculados por Isoenzimas, fueron menores para 0. bonariensis (P= 6.31%, H=0.034) que para 0. argentinensis (P= 10.5%, H= 0.045) y 0. hatcheri (P= 10.5%, H=0.047). Esta disminución en los índices de variabilidad fueron asociados al tipo de distribución y a la alta presión pesquera que sufre 0. bonariensis. La población de 0. bonariensis de la laguna Salada Grande, fue la excepción a lo antedicho, registrando valores altos de variabilidad (P= 10.5%, H= 0.06). Siembras periódicas con alevinos obtenidos por inseminación artificial a partir de gametas parentales de dicha laguna mitigarían la disminucón de la variabilidad La estructura genética intrapoblacional estimada por el estadístico FIS de Wright (FIS promedio = 0.004 NS p>0.05) indicó que las frecuencias genotípicas en todas las poblaciones se ajustarían a lo esperado por la ley de Hardy-Weinberg; por ende el apareamiento sería aleatorio. El comportamiento promiscuo en el apareamiento, durante el cual muchos machos pueden fertilizar los huevos de una única hembra (descripto para otras especies de pejerreyes) ha sido sugerido para las especies en estudio, dado que este favorecería la panmixia. La diferenciación genética entre poblaciones de la misma y diferentes especies fue estimada por el índice de fijación FST para ambas metodologías, mientras que los índices de Distancia e Identidad de Nei solo fueron obtenidos para Isoenzimas. Los niveles de diferenciación genética entre poblaciones obtenidos a partir de los datos de Isoenzimas y RAPD fueron similares (FST promedio para todas las poblaciones igual a 0.807 y 0.78 respectivamente) e indicaron una diferenciación altamente significativa entre poblaciones de diferentes especies. Con ambas metodologías, el flujo génico estimado (Nm= 0.06 y 0.07) fue menor que 1 individuo por generación cuando se consideraron todas las poblaciones. La diferenciación entre poblaciones dentro de cada especie mostró valores de FST significativos a altamente significativos tanto para isoenzimas (FST= 0.022-0.130) como para RAPD (FST= 0.553-0.687) pero fue menor que la observada al incluir poblaciones de distintas especies (más evidente en Isoenzimas). Consecuentemente, la estimación indirecta del flujo génico a partir de la diferenciación isoenzimática fue mayor que un migrante por generación (Nm>1). Sin embargo, el Nm estimado a partir de los datos de RAPD (Nm= 0.114-0.202), si bien fue más alto que el obtenido considerando todas las poblaciones, no superó l migrante por generación. RAPD permitió una mayor diferenciación entre poblaciones de la misma especie que la observada mediante la técnica de lsozimas., como consecuencia del alto polmorfismo (bandas muy variables) encontrado por esta técnica. En Isoenzimas, la diferenciación también se estimó mediante los índices de Identidad y Distancia de Nei promedio entre especies. Los intervalos de distancias promedio para poblaciones coespecificas y de distintas especies se ajustaron a los valores encontrados por Shaklee y col. (1982) para peces. En cambio, el intervalo de distancia encontrado entre 0.bonariensis y 0. argentinensis (D=0.07 - 0.112) correspondería, según Thorpe (1979), al de poblaciones coespecificas. De acuerdo al intervalo de distancia genética de Nei (D) obtenido por Thorpe (1979) para especies congenéricas, tal vez sería necesario una revisión sistemática de estas poblaciones para dilucidar este problema. Sin embargo, si se tiene en cuenta el intervalo de distancias genéticas de Nei encontrado por Shaklee y col. (1982), para poblaciones de distintas especies, los valores de las asociaciones entre especies se ajustan a lo esperado por la taxonomía. La varianza genética total fue mayor para RAPD (49.58) que para isoenzimas (3.99). Esto se debió al mayor número de bandas analizadas para RAPD (220 ) que para isozimas (22 loci). A partir del análisis de la distribución de la variabilidad genética se determinó que la variación entre especies (variación especifica) fue la proporción mayor tanto para isoenzimas como para RAPD (73.9% y 44% respectivamente). De la comparación del porcentaje de variación especifica obtenido por ambos métodos se desprende que Isoenzimas detecta mejor este tipo de variación, pudiendo separar especies con mayor precisión. El porcentaje de variación entre poblaciones de la misma especie (variación poblacional) fue mayor para RAPD (34%) que para isoenzimas (6.8%), indicando que la variación poblacional fue mejor detectada por la primer técnica. El porcentaje de varianza dentro de las poblaciones (variación individual) fue similar para ambos métodos (19.3% y 22% para Isoenzimas y RAPD respectivamente). Asumiendo la hipótesis del reloj molecular, se estimó que 0. hatcheri divergió de su antecesor durante el Plioceno tardío; en cambio la divergencia obtenida entre 0.argentinesis y 0. bonariensis indicaría que ésta fue reciente, alrededor de 490.000 años (Pleistoceno medio). Dado el origen de la laguna Salada Grande donde se muestreo una de las poblaciones de O. bonariensis y la fuerte asociación entre esta población y 0. argentinensis obtenida mediante las técnicas de Isoenzimas como de RAPD, se postula un posible evento ancestral de hibridización introgresiva de 0. bonariensis proveniente de lagunas litorales con 0. argentinensis. La falta de correlación entre las distancias geográficas de las poblaciones de cada especie y la diferenciación genética obtenida tanto por RAPD como por Isoenzimas sugirió que la divergencia de las poblaciones de cada especie podría ser explicada por dos mecanismos evolutivos: la Selección o por Eventos fundadores recientes, no habiendose aún alcanzado el equilibrio entre deriva y migración. En cambio al incluir todas las poblaciones de las distintas especies la correlación positiva, tanto para Isozimas como RAPD, sugiere que pudo existir diferenciación de las mismas por Deriva Genética, aunque no se descarta a la Selección como probable fuerza operante. Al incluir todas las poblaciones de las diferentes especies se plantean distancias geográficas importantes, con ambientes muy disímiles donde las presiones selectivas podrían ser muy diferentes determinando una importante diferenciación génica que se correlacionaría con la distancia geográfica. El fenograma obtenido por Isoenzimas dejó visualizar 3 clusters correspondientes a las 3 especies estudiadas, permitiéndo este método una buena agrupación de las poblaciones de cada especie. El fenograma obtenido a partir de RAPD corroboró 2 de los cluster (O. hatcheri versus O. bonariensis y O. argentinensis) pero no tuvo buena resolución al momento de separar las poblaciones de 0. bonariensis y 0. argentinensis. La técnica de Isoenzimas permitió una mejor agrupación de las poblaciones de cada especie, indicando ser mejores marcadores que los RAPD al momento de comparar diferentes especies.

Abstract:
Isoenzyme electrophoresis and RAPD techniques were applied to analyze the genetic variability, differentiation and structure of natural populations of 0. argentinensis, 0. bonariensis y 0. hatcheri. The present study also evaluated if the genetic distances between populations are associated with geographic distances. Isozyme technique allowed analyzing 22 loci (19 for each specie), 8 of which were variables. Allelic frequencies of the populations of each species, for these 8 loci, showed some differences. Río de la Plata population was the most differentiated 0. bonariensis 'population, showing one fixed and diagnostic allele (LDH-1*3). The comparison of allelic frequencies among the different species revealed important differences, 0. hatcheri being the most differentiated one. This species differed from 0. bonariensis and 0. argentinensis by the presence of 3 GOT diagnostic loci (GOT-2 *, GOT-3 *, GOT-5 *). The analysis of tisular specificities also allowed to differentiate the 3 species by the relative expression of 3 loci (MEP-1*,MEP-2* and MEP-3*). RAPD technique allowed the analysis of 220 bands. Among them, 4 were monomorphic. Most of the amplified bands were shared by the species and populations, varyíng only in their frequencies. Two major groups emerged from RAPD analysis: one integrated by populations of O hatcheri and the other including populations of. 0. bonariensis and 0. argentinensis. Río de la Plata population was the most differentiated within O. bonariensis in both Isozyme and RAPD analyses. The average values of genetic variability for species, based on Isozyme data, were smaller in O. bonariensis (P = 6.31%, H = 0.034) than in 0. argentinensis (P = 10.5%, H = 0.045) and 0. hatcheri (P = 10.5%, H=0.047). The decrease of the genetic variability in 0.bonariensis could be associated with its distribution type and the fisheries pressure. The 0. bonariensis population belonging to the "Salada Grande" lagoon was the exception to the abovementioned, showing higher values of variability (P = 10.5%, H = 0.06). Periodic fingerlíngs sowing, obtained by artificial insemination from parental gametes of this lagoon, would mitigate the decrease of variability. The population 's genetic structure estimated by FIS Wright statistical (Average Fls = 0.004 NS p>0.05) indicated that all the populations would adjuste to Hardy-Weinberg, so there would be in random union of gametes. Panmixia could be reinforced through promiscuous behavior during the mating (many males fertilizing the eggs of one female) as was described for other silversides. The genetic differentiation among populations of the same and different species was estimated by the FST fixation index for both methods. Nei's Distance and Identity indexes were obtained only for Isozymes. The levels of genetic differentiation among populations obtained by means of Isozymes and RAPD data were similar (average FST for all populations was 0.807 and 0.78 respectively) and indicated a highly significant differentiation among populations of different species. With both methodologies, the genic flow (Nm = 0.06 and 0.07) was smaller than l individual for generation when all the populations were considered. The genetic differentiation among populations of each species showed significant to highly significant FST values, both for the Isozyme (FST=0.022-0.130) and RAPD (FST=0.553-0.687) analysis. However these values were smaller than the ones observed when including populations of different species (more evident in Isozymes). Consequently, for Isozymes, the estimation of gene flow among populations of the same species was bigger than a migrant for generation (Nm>l). For RAPD, although it was higher (Nm = 0.114-0.202) than the one obtained considering all the populations, it didn't reach l migrant for generation. RAPD allowed a higher differentiation among populations of the same species that the one observed by means of the Isozyme technique, as a consequence of the high polymorphism (very variable bands) found by this technique. In Isozymes, the differentiation also was estimated by means of the Nei average Identity and Distance indexes among species. The ranges of average distances for coespecific populations and for different species were similar to the values found by Shaklee el al. (1982) for fishes. On the other hand, according to Thorpe (1979) the range of average distance between 0.bonariensis and O. argentinensis (D=0.07 - 0.112) would correspond to that of coespecific populations. According to the range of average Nei distance obtained by Thorpe (1979) it would be necessary a systematic revision of these populations to elucidate this problem. However, applying the range of average Nei distance found by Shaklee et al. (1982) for populations of different species,the values adjust perfectly with the taxonomie. The total genetic variance was higher for RAPD (49.58) than for isozymes (3.99). This was due to the higher number of bands analyzed for RAPD (220) that for isozymes (22 loci). The analysis of the genetic variability's showed that the variation among species (specific variation) was the highest proportion, as much for isozymes as for RAPD (73.9% and 44% respectively). The variation percentage among species was higher for Isozyme (73,9%) than for RAPD (44%), indicating that the species variation is detected better by Isozyme analysis. The variation percentage within species (population variation) was higher for RAPD (34%) than for isozymes (6.8%), indicating that the population variation is detected better by RAPD. The percentage of variance within the populations (individual variation) was similar for both methods (19.3% and 22% for Isozymes and RAPD respectively). Assuming the hypothesis of the molecular clock, the divergence time was estimated. 0. hatcheri would have diverged from its predecessor during the late Plioceno; on the other hand, the divergence obtained between 0.argentinensis and 0. bonariensis would indicate that this was recent, around 490.000 years (Mid-Pleistoceno). A possible ancestral event of introgresive hibridazation is postuled for litoral lagoons. This could be the case of "Salada Grande" lagoon population (0. bonariensis) with 0. argentinensis., according to the origin of this lagoon and the strong association among the same ones, showed by means of Isozymes and RAPD techniques. The lack of correlation between geographical distances and genetic differentiation of the populations of each species obtained by RAPD and Isozyme, suggested that the divergence of the populations of each species could be explained by two evolutionary mechanisms: the Selection or by recent Founder Events, yet not having reached the balance between drift and migration. On the other hand, when all the populations of the different species were included, a positive correlation was showed, so much for Isozymes as for RAPD. Then it is suggested that the differentiation of these populations could have taken place by genetic drift, although the Selection could have been another operating force. Important geographical distances with very dissimilar environmental conditions should be consider when all the populations of different species were included. In these areas, the selective pressures could be very different determining an important genetic differentiation that would be correlated with the geographical distance The phenogram obtained by Isozymes showed 3 clusters corresponding to the 3 studied species. So this method allowed a good grouping of the populations of each species. The phenograms obtained by RAPD confirmed 2 of these clusters (O. hatcheri versus 0. bonariensis and 0. argentinensis) but didn't have good resolution to separate the populations of O. bonariensis and 0. argentinensis. Isozymes allowed a better grouping of the populations of each species, indicating to be better markers that the RAPD when comparing different species.

Alberti, Andrea Claudia. "Las poblaciones argentinas de Anastrepha fraterculus (Diptera: tephritidae) conforman una única especie biológica?" (2004) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Amavet, Patricia Susana. "Estudios de la distribución de la variabilidad genética y análisis del sistema de apareamiento en poblaciones naturales de Caiman latirostris (Yacaré overo) (Reptilia, Alligatoridae)" (2009) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Caiman latirostris (yacaré overo) es una de las dos especies de cocodrilianos citadas para nuestro país. Sus poblaciones silvestres son objeto de manejo en Argentina, mediante programas que utilizan el sistema de ranching (cosecha de huevos silvestres para cría en granjas), para su uso sustentable y la conservación de su hábitat. C. latirostris, en nuestro país, se encuentra en el Apéndice II de CITES, el cual permite el comercio regulado de su cuero y carne, y se ha convertido en una especie de gran importancia comercial, a nivel nacional e internacional. Esta tesis incluye estudios genético-poblacionales del yacaré overo en la provincia de Santa Fe, Argentina. Se realizaron análisis de variabilidad, diferenciación y estructura genética empleando isoenzimas, marcadores RAPD y caracteres morfométricos, y un estudio de paternidad utilizando marcadores microsatélites. Los resultados obtenidos indican que las poblaciones analizadas de yacaré overo poseen valores de variabilidad genética de bajos a intermedios, diferenciación poblacional significativa y variabilidad fenotípica alta para algunos de los rasgos morfométricos estudiados. Además, se hallaron indicios de que el sistema de apareamiento de C. latirostris podría incluir el comportamiento de múltiple paternidad, al detectar más de un progenitor paterno en al menos una de las familias analizadas.

Abstract:
Caiman latirostris (broad-snouted caiman) is one of the two crocodilian species cited for Argentina. Their wild populations are subject to management in our country, by means of programs that use ranching system (harvest of wild eggs, captive rearing and reintroduction to wild) for their sustainable use and habitat conservation. In Argentina, C. latirostris is included in the Appendix II of CITES, therefore, the regulated trade of meat and leather is allowed, and this species has turned into an important resource at both national and international levels. This thesis includes genetic population studies about broad-snouted caiman in Santa Fe province, Argentina. Analyses related to variability, differentiation and genetic structure were carried out through isozyme electrophoresis, RAPD markers, and quantitative traits. On the other hand, paternity studies were conducted using microsatellite markers. The obtained results indicate that analyzed broad-snouted caiman populations have low to intermediate genetic variability values, significant population differentiation, and high phenotypic variability for some of the studied morphometric traits. In addition, we found indications that C. latirostris mating system could include multiple paternity behavior, since we found more than one paternal progenitor in at least one of the analyzed families.

Carreira, Valeria Paula. "Bases y arquitectura genética de caracteres morfológicos en Drosophila melanogaster" (2009-04-29) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Ceballos, Santiago Guillermo. "Estructura genética poblacional, historia demográfica y variación fenotípica del róbalo, Eleginops maclovinus (Perciformes)" (2011) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Para comprender los fenómenos involucrados en la evolución de las especies es importante estudiar los patrones de variación geográfica de los atributos genéticos y fenotípicos de las poblaciones. El presente trabajo analiza la estructura genética y la variación fenotípica en el pez marino, Eleginops maclovinus (róbalo), una especie endémica del sur de Sudamérica que constituye uno de los recursos marinos costeros de mayor importancia socioeconómica de la región. El estudio genético se realizó con individuos colectados a lo largo de casi todo el rango latitudinal de la especie en la costa atlántica y pacífica. Se obtuvieron secuencias parciales del gen mitocondrial citocromo b de un total de 261 individuos provenientes de 9 localidades y también se analizaron 9 loci de microsatélites en 239 individuos provenientes de 5 localidades. El estudio de la variación fenotípica se realizó mediante morfometría geométrica en 140 individuos provenientes de 4 localidades ubicadas a lo largo de la costa atlántica. El ADN mitocondrial reveló un patrón general de baja estructuración poblacional y una clara señal de expansión demográfica ocurrida, probablemente, durante el Pleistoceno Medio. El análisis de microsatélites sugirió la existencia de dos grupos genéticos, uno principalmente de origen pacífico y otro atlántico. Considerando ambos tipos de marcadores fue posible modelar la historia de la especie a lo largo de diferentes ciclos glaciares. El estudio fenotípico permitió discriminar todas las poblaciones estudiadas. Futuros análisis serán necesarios para establecer la importancia relativa de los factores ambientales y genéticos en la variación fenotípica.

Abstract:
In order to understand the evolution of species it is important to study the patterns of geographic variation in phenotypic and genetic attributes of populations. This Thesis analyzes the genetic structure and phenotypic variation in the marine fish, Eleginops maclovinus (sea bass), an endemic species of southern South America and one of the most important coastal marine economic resources in the region. The genetic study was conducted with individuals collected throughout almost the entire latitudinal range of the species in the Atlantic and Pacific coasts. We obtained partial sequences of the mitochondrial gene cytochrome b from a total of 261 individuals from 9 localities, and we also analyzed 9 microsatellite loci in 239 individuals from 5 localities. The study of the phenotypic variation was performed using geometric morphometrics in 140 individuals from 4 localities along the Atlantic coast. The mitochondrial DNA revealed a general pattern of low population structure and a clear signal of population expansion occurred probably during the Middle Pleistocene. The microsatellite analysis suggested the existence of two genetic groups, one mainly from a Pacific origin and the other Atlantic. Taking into account both markers we were able to model the history of the species along different glacial cycles. The phenotypic study was able to discriminate all the populations studied. Future analysis will be required to establish the relative importance of environmental and genetic factors on phenotypic variation.

Campagna, Leonardo. "Especiación en passeriformes neotropicales de ambientes abiertos" (2012) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El Neotrópico es la región con mayor diversidad de aves a nivel mundial. Este trabajo estudia el proceso de especiación, focalizándose en grupos de passeriformes de ambientes abiertos, con el objetivo de comprender los procesos que generaron esta gran diversidad de aves. Se utilizaron herramientas moleculares y una perspectiva filogenética/filogeográfica, en conjunto con el análisis de sonogramas derivados de vocalizaciones, para estudiar la radiación de los capuchinos del sur (Sporophila) en los pastizales de Sudamérica, la diversificación del género Phrygilus en los ambientes abiertos de la cordillera de los Andes y la existencia de linajes endémicos de passeriformes en las islas Malvinas. Se encontró una marcada variación fenotípica pero pocas diferencias genéticas neutras entre especies de capuchinos del sur, resultado consistente con una radiación reciente que comenzó en el Pleistoceno. Los resultados indican que Phrygilus es polifilético, comprendido por cuatro clados distantemente relacionados, que se diversificaron en la altura de los Andes pero también asociados a cambios en los rangos altitudinales, durante el Pleistoceno. Por último, los patrones genéticos sugieren que las islas Malvinas fueron colonizadas a diferentes tiempos por las especies de passerifomes que las habitan. Finalmente, se discuten estos resultados en el contexto de la literatura existente al respecto de la especiación en aves, particularmente con respecto al papel de la selección natural, la deriva genética, el flujo génico, la predominancia de la alopatría y la función de la especialización ecológica en el proceso de especiación.

Abstract:
The Neotropics hold the largest avian diversity in the world. This thesis studies the process of speciation, focusing on groups of open habitat passerines, with the objective of understanding what factors have contributed to generating the vast avian diversity of the region. A combination of molecular tools and a phylogenetic/phylogeographic approach, together with the analysis of sonograms derived from vocalizations, was used to study the radiation of the southern capuchinos (Sporophila) in the grasslands of South America, the diversification of the genus Phrygilus in open habitats of the Andes Mountains and the existence of endemic passerine lineages in the Malvinas islands. The southern capuchinos show marked phenotypic variation despite few neutral genetic differences, a result that is consistent with a recent radiation that started in the Pleistocene. The genus Phrygilus proved to be polyphyletic, composed of four distantly related clades that have diversified in the Andean highlands but also associated with changes in altitudinal ranges, during the Pleistocene. The observed genetic patterns suggest that the Malvinas islands were colonized at different periods in time by the passerine species that inhabit them. Finally, these findings are discussed within the context of the existing literature on speciation in birds, focusing on the relevance of these results with respect to the roles of selection, genetic drift, gene flow, the prevalence of allopatry and the function of ecological specialization in the process of speciation.

Teich, Ingrid. "Análisis de la estructura genética espacial de especies arbóreas y su asociación con la variabilidad fenotípica y ambiental" (2012) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Este trabajo aborda el análisis de estructura genética espacial (EGE) en especies arbóreas nativas de importancia para Argentina, y su asociación a otras variables, desde un enfoque interdisciplinar que incluye perspectivas biológicas y metodológicas. Mediante la revisión y comparación del desempeño de métodos estadísticos para detectar y caracterizar EGE, según distintos escenarios biológicos, se recomiendan estrategias analíticas para el estudio espacial de la variabilidad genética y su asociación con variables ambientales y fenotípicas. Se analizó la EGE a escala fina en un enjambre híbrido de Prosopis spp., encontrando significativa asociación de ésta con la variabilidad morfológica; información relevante para el ordenamiento del recurso genético algarrobo. También se analizó la correspondencia entre la variación espacial de la diversidad genética de poblaciones de Polylepis australis, a lo largo de su rango de distribución, y la inestabilidad del ambiente usando nuevos índices de heterogeneidad temporal del paisaje derivados de imágenes satelitales. Se concluye, que sitios ambientalmente más estables albergan mayores niveles de diversidad genética para esta especie. El estudio de EGE en árboles, y su asociación con variabilidad fenotípica y ambiental, permite inferir procesos evolutivos-ecológicos, que aportan conocimiento para mejorar el manejo y conservación de los bosques.

Abstract:
In this work, the analysis of spatial genetic structure (SGS) of native tree species and its association with other variables is investigated with an interdisciplinary approach, including both the methodological and biological perspectives. Through the revision and comparison of the performance of statistical methods used to detect and characterize SGS, under different biological scenarios, we recommend and propose analytic strategies to spatially analyze genetic variability. We analyzed the SGS at fine scale of a Prosopis spp. hybrid swarm and found a significant correlation with its morphological variability, facilitating the differentiation of biological units that are object of management and improvement of the Algarrobo genetic resource. We also characterized the spatial pattern of Polylepis australis genetic diversity and differentiation along its entire distribution range and found that they differ from historical migration scenarios observed in the northern hemisphere. We found a significant correlation between genetic diversity and environmental instability indices derived from satellite imaginary, concluding that more environmentally stable sites show higher levels of P. australis genetic diversity. The study of SGS in tree species and its association with other variables allows the inference of ecological and evolutionary processes, providing relevant information for the management and conservation of native forests.

Labarque, Facundo Martín. "Evaluación de identificaciones taxonómicas mediante código de barras del ADN en un grupo tropical megadiverso" (2012-04-11) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El objetivo principal del proyecto fue evaluar las ventajas y limitaciones de los códigos de barras del ADN y de los métodos de la taxonomía clásica al estudiar la diversidad de arañas en los bosques montanos de Panamá. Se procesaron 29961 especímenes de arañas de 49 familias, de los cuales el 60% son juveniles, se secuenciaron 3553 fragmentos de cox1 y se generaron las bases de datos morfológica y molecular respectivas. Se identificaron los especímenes mediante tres estrategias concatenadas. Primero una identificación rápida utilizando caracteres somáticos externos, seguida por una identificación de grupos moleculares obtenidos con el modelo Generalizado Mixto de Yule y Coalescencia, finalizando con una identificación integrativa fruto de la comparación recíproca de las anteriores y del aporte de la disección de los órganos sexuales que son críticos a la hora de delimitar especies en artrópodos. Se identificaron 548 especies de manera integrativa, se estimó la diversidad alfa y beta según cada estrategia con los individuos adultos y, por primera vez, con los estadios inmaduros identificados molecularmente; se realizó una revisión taxonómica integrada de la familia Theridiosomatidae con el aporte de dos géneros nuevos y 27 especies nuevas y se asociaron los sacos de huevos con sus adultos mediante los códigos de barra, y se evaluaron las metodologías de colecta. Los códigos de barra sirvieron para estimar la diversidad, asociar diferentes estadios entre sí como machos y hembras y juveniles con sus adultos, revelar haplotipos endémicos, y sugirieron especies crípticas y nuevas especies putativas a partir de los estadios inmaduros no encontrados entre los adultos.

Abstract:
The main goal of the project was to evaluate the advantages and limitations of DNA barcoding and traditional taxonomy to study the spider diversity in the montane forests of Panama. We have sorted 29961 specimens of 49 families, 60% of which were immature, and we have sequenced 3553 cox1 fragments, to generate morphological and molecular data bases. Specimens were identified using three linked approaches. First, a fast identification approach using external somatic characters, followed by a General Mixed Yule‐Coalescent molecular cluster identification, ending with the reciprocal illumination of both previous approaches plus a close examination of sexual organs, known as critic characters to delimit arthropods species, called integrative identification. We have identified 548 integrative species, we have estimated alpha and beta diversity with adults using each identification approach and, for the first time, we also have used immature specimens. We have done a taxonomic integrative revision of the family Theridiosomatidae describing two new genera and 27 new species plus spider egg‐sacs association with their species using DNA barcodes, and we have evaluated collecting methods. DNA barcodes can be used to estimate diversity, to associate different life and gender stages such as immature to mature and male to female specimens, and to reveal endemic haplotypes. DNA barcodes also suggest cryptic species, and putative new species from immature specimens not found among adults.

Bracco, Mariana. "Caracterización genética del germoplasma de razas de maíz autóctonas provenientes del noreste argentino" (2012-11-13) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El maíz, Zea mays ssp. mays, se cultiva en todo el mundo y ocupa el tercer lugar entre los destinados al consumo alimentario. La Argentina es el segundo exportador mundial, precedida por los Estados Unidos. Esto coloca a la producción de maíz como una de las actividades económicas más rentables para nuestro país. En el norte de la Argentina habitan comunidades aborígenes que cultivan razas nativas de maíz. La caracterización genética del germoplasma autóctono de las razas de la región noreste de la Argentina (NEA) ha sido prácticamente nula hasta la concreción de esta Tesis. Con el fin de aportar al conocimiento de la diversidad genética y la estructura poblacional de las razas nativas del NEA, contribuir a su conservación y evaluar su potencial como reservorio de nuevos alelos, se evaluaron 15 loci microsatélites nucleares en 572 individuos. Los resultados del presente estudio permiten concluir que: 1) las razas de Misiones se encuentran constituidas por acervos génicos diferentes, que concuerdan con el tipo de grano que poseen (harinosos y córneo-harinosos vs. reventadores), éstos deberían ser considerados como unidades de conservación diferentes; 2) las razas nativas del NEA constituyen una reserva de diversidad significativa, con potencial para ampliar la base genética de los programas de fitomejoramiento; 3) las razas de Misiones no parecen haber sufrido un proceso de erosión genética severo en tiempos recientes, ya que los ejemplares actuales conservan gran parte de la diversidad detectada en las colecciones del NEA de los años 1977 y 1978; 4) la comparación entre las razas del NEA y del NOA apoyan la existencia de dos centros de diversidad diferentes en Sudamérica; la comparación con otras razas del Continente Americano avala la hipótesis de ocurrencia de una via de introducción del germoplasma nativo del NEA a través del este de Sudamérica; 5) la ausencia de cromosomas B en las razas del NEA coincide con la constitución cromosómica esperada para el grupo de las razas de regiones bajas.

Abstract:
Zea mays ssp. mays is cultivated worldwide and ranks third in importance among crops for human consumption. Argentina is the second largest exporter, preceded by the United States. Corn production is one of the most profitable economic activities in our country. Northern aboriginal communities from Argentina cultivate maize landraces for self-sufficiency. Genetic characterization of indigenous germplasm from the northeastern region of Argentina (NEA) was practically nil until the completion of this Thesis. To contribute to the knowledge and conservation of the genetic diversity of native maize landraces from NEA and to assess their potential as a reservoir of novel alleles, 572 individuals were evaluated using 15 nuclear microsatellite loci. The results of this study allow to conclude that: 1) landraces from Misiones can be divided into two different gene pools, which are consistent with the type of corn (flints and flours vs. popcorns), these should be regarded as different conservation units; 2) NEA landraces represent a significant reservoir of diversity, useful to broaden the genetic base of breeding programs; 3) landraces from Misiones do not seem to have undergone a severe genetic erosion in recent times, since much of the extant diversity is detected in NEA seed bank collections from 1977-1978; 4) the comparison between landraces from NEA and NOA support the existence of two different centers of diversity in South America; the comparison with other races of the Americas supports the hypothesis of the introduction of NEA germplasm through eastern South America; 5) the absence of B chromosomes in NEA landraces agrees with the expected chromosomal constitution of the landraces from lowland South America.

Calderón, Pablo Luciano S.. "Ecología molecular de dos especies de cormoranes endémicas de Patagonia (Phalacrocorax magellanicus y P. atriceps)" (2013-05-30) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En la presente tesis se abordarán diversos aspectos de la biología de dos especies hermanas de cormoranes: Phalacrocorax magellanicus (Cormorán cuello negro, CCN) y Phalacrocorax atriceps (Cormorán imperial, CI), utilizándo herramientas moleculares para responder a las preguntas de interés. Estas especies son endémicas de la Patagonia, y comparten muchos de sus requerimientos ecológicos, difiriendo principalmente en lo que respecta a la dispersión post-reproductiva y a los patrones de alimentación. Ambos aspectos han demostrado tener gran influencia en el moldeado de la estructura genética y filogeográfica de otros taxa de aves marinas. Nuestros análisis demostraron que ambas especies presentan una significativa estructuración genética; resultando todo los estimadores (i.e. Fst, Φst) mas altos en el CCN que en el CI, presentando el CI mayores tasas de migración (m) que el CCN, además solo la segunda de éstas especies presentó un clara estructura filogeográfica. Estos resultados son acordes a nuestras hipótesis iniciales, y con lo observado en otros taxa de aves marinas, dado que el CCN es una especie residente anual, que forrajea en las cercanías de su colonia; mientras que el CI es una especie dispersiva con un mayor campo de acción en el mar durante los viajes de forrajeo. Por otro lado, se revisaron aspectos taxonómicos y de la biología reproductiva del CI, la cual es una especie politípica y socialmente monogámica. En éste caso encontramos falta de sustento genético para las subespecies P. atriceps atriceps y P. a. albiventer, aunque si se encontró evidencia soportando la distinción entre P. atriceps y P. bransfieldensis. Además se demostró que el CI presenta una clara correspondencia entre las denominadas monogamia social y monogamia genética, ya que no se encontró evidencia de copulas por fuera de la pareja, como así tampoco de parasitismo intraespecífico de nidada. Palabras clave: Cormoranes, aves marinas, Patagonia, estructura genética, filogeografía, flujo génico, copulas extra pareja.

Abstract:
In this thesis we addressed different aspects of the biology of two sister shag species: Phalacrocorax magellanicus (Rock shag, RS) and Phalacrocorax atriceps (Imperial shag, IS), employing molecular tools to answer our questions. These species are endemic of Patagonia, and share most of their ecological requirements, differing strongly in relation to their non-breeding season dispersion and feeding patterns. These ecological traits have shown to be important at the time of shaping the genetic and phylogeographic structure of other seabird taxa. Our analysis showed that both species have a significant genetic structure, although all estimators (i.e. Fst, Φst) were higher in RS than in IS, the later showed the higher migration rate values (m), also only RS showed a neat phylogeographic structure. These results are in agreement with our staring hypothesis and with the observed in other seabird taxa, because RS is a year-round resident species that forages in the proximities of its colonies (inshore); whereas the IS is a dispersive species with offshore foraging habits. On the other hand, we addressed aspects realted to the taxonomic status and the reproductive biology of P. atriceps, which is a polytypic and socially monogamus species. In this case, we did not find genetic evidence supporting the P. a. atriceps and P. a. albiventer subspecies, although we did find support for the distinction between P. atriceps and P. bransfieldensis. Also, we showed that the Imperial shag presents a clear correspondence between social and genetic monogamy, because we did not find evidence of extra pair paternity, nor intraspecific brood parasitism in it. Key words: shags, seabirds, Patagonia, genetic structure, phylogeography, gene flow, extra pair paternity.

Lipko, Paula. "¿Qué historias nos cuentan el ADN mitocondrial y los microsatélites sobre la estructura poblacional de Drosophila koepferae y su especie hermana Drosophila buzzatii en Argentina?" (2013-10-29) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Recientemente, el papel de los factores ecológicos en la especiación ha comenzado a evaluarse críticamente. En insectos mariposas y moscas de la fruta, la evidencia disponible indica que los cambios de hábitat/dieta están correlacionados con el aislamiento reproductivo apuntando a que la adquisición de nuevas plantas hospedadoras podría ser clave en la sorprendente diversidad de los insectos fitófagos. Las especies cactófilas del género Drosophila son modelos ideales para estudiar el papel de los cambios de planta hospedadora en la adaptación y la especiación. D. buzzatii y D. koepferae se crían en los tejidos necróticos de cactáceas de los géneros Opuntia (tunas) y Trichocereus (cardones) y exhiben un cierto grado de especificidad de nicho. Se ha propuesto que los cactus columnares y las tunas podrían representar dos tipos de recursos claramente diferenciados, ya que difieren en varios aspectos relevantes para el ciclo de vida de las moscas, como por ejemplo en su composición química. Los primeros presentan una mayor concentración de compuestos tóxicos, como alcaloides, y por lo tanto representan un ambiente estresante durante el desarrollo larval; en tanto que las tunas ofrecen un ambiente químico más benigno y rico desde el punto de vista nutricional. Asimismo, cardones y tunas se diferencian en su predecibilidad espacial y temporal y sus patrones de distribución geográfica. Una predicción basada en la relación entre el uso de plantas hospedadoras diferentes y la estructuración poblacional es que el grado de compartimentalización del recurso impondría diferentes grados de restricción al flujo génico. En este trabajo se estudió la variación molecular y la estructura poblacional de estas dos especies utilizando dos marcadores moleculares, COI y un grupo de microsatélites específicos para estas especies. Se encontró que no hay estructuración genético-poblacional en D. buzzatii como cabría esperar para una especie que utiliza un recurso con una distribución espacialmente homogénea (más que los cardones) y espacialmente predecible; en cambio en D. koepferae, asociada a un recurso con una distribución más compartimentalizada y menos predecible espacialmente, se encontró una estructuración poblacional.

Abstract:
The role of ecological factors in speciation has recently began to be critically evaluated. In insects, the available evidence indicates that changes in habitat/diet are correlated with reproductive isolation, particularly, in butterflies and fruit flies, suggesting that the acquisition of new host plants could be a key factor in the amazing diversity of phytophagous insects. Cactophilic species of the genus Drosophila are ideal models for studying the role of changes in host plant adaptation and speciation. D. buzzatii and D. koepferae are two cactophilic species that inhabit the arid and semiarid lands of Argentina and Bolivia. These species exhibit a certain degree of niche specificity since the former breeds mainly in the necrotic tissues of cacti of the genus Opuntia (prickly pears) and the latter on the necroses of plants of the genera Trichocereus (cardón) and Cereus, however the available evidence points to a certain degree of niche overlap. Previous studies have proposed that columnar cacti and prickly pears represent two distinct types of resources since they differ in many aspects such as geographic distribution, chemical composition and spatial and temporal predictability that are relevant to the life cycle of flies. On one hand, columnar cacti represent stressful environments for larval development since they have a high concentration of toxic compounds such as alkaloids and triterpenes. On the other hand, unas offer a more benign chemical environment due to the absence of toxic compounds and greater nutritional richness. A prediction based on the relationship between the use of different host plants and population structure is that the degree of compartmentalization of the specific resource imposes varying constraints to gene flow. In this tesis, we studied molecular variation and population structure in D. buzzatii and D. koepferae using two types of molecular markers, the mitochondrial gene COI and a set of species-specific microsatellites. Our main findings are that natural populations of D. buzzatii are not genetically structured as expected for a species that uses a resource with a spatially homogeneous distribution, while significant population structure was detected in D. koepferae, a species associated with resources exhibiting more compartmentalized and spatially less predictable breeding sites.

Cagnotti, Cynthia Lorena. "Desarrollo de la técnica del insecto estéril y su integración con el control biológico mediante entomófagos parasitoides para el control de la pollila del tomate Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)" (2014-12-17) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La polilla del tomate, Tuta absoluta, es una de las plagas más devastadoras del cultivo de tomate en Sudamérica, donde es originaria, y en Europa y África, donde ha ingresado recientemente. El control de T. absoluta se basa principalmente en el empleo de plaguicidas. El objetivo de esta tesis fue establecer las bases para el desarrollo de la Técnica del Insecto Estéril, mediante el empleo de la Esterilidad Heredada (EH) en T. absoluta, y evaluar su integración con el Control Biológico (CB) con entomófagos. Los principales aportes de esta tesis son: - Conocimiento del efecto de los rayos X sobre la biología de T. absoluta. - Determinación de la dosis óptima de radiación X para aplicar la EH en el control de T. absoluta. - Estudio del efecto de la radiación sobre la dispersión de machos irradiados. - Evaluación de la supresión de poblaciones silvestres de T. absoluta mediante la liberación de individuos irradiados en invernáculo. - Determinación del número mínimo de individuos irradiados a liberar para reducir poblaciones de T. absoluta. - Evaluación de la integración de la EH y el CB mediante el empleo de los entomófagos Trichogramma spp. y Tupiocoris cucurbitaceus.

Abstract:
The tomato leafminer, Tuta absoluta, is one of the most devastating pests of tomato crops. This species is native to South America, but it has been invading Europe, Africa and Asia recently. The main method of control of T. absoluta relies on the application of chemical insecticides. The objective of the thesis was to establish the basis for the development of the Sterile Insect Technique in this species through the Inherited Sterility (IS), and to evaluate its integration with Biological Control (BC) by entomophagous. The main contributions of this thesis are: - Knowledge of the effect of X rays on the T. absoluta biology. - Determination of the optimal dose of X radiation to be used in the IS against T. absoluta - Study of the effect of the radiation on the dispersion of irradiated males - Assessment of the suppression of wild populations of T. absoluta through the release of irradiated individuals under greenhouse conditions. - Determination of the minimum number of irradiated individuals that should be released to reduce wild T. absoluta populations - Evaluation of the integration of both IS and BC techniques using the entomophagous Trichogramma spp. and Tupiocoris cucurbitaceus

Varni, Vanina Delia. "Epidemiología molecular y genómica comparativa de Leptospira spp. en Argentina" (2015-03-30) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La leptospirosis es una enfermedad infecciosa causada por bacterias del género Leptospira y constituye una zoonosis de amplia distribución mundial. La enfermedad puede ser contraída a través del contacto con ambientes contaminados con orina de animales infectados, donde la principal vía de transmisión es el agua. Los brotes de leptospirosis en Argentina están asociados a cambios climáticos y en particular a inundaciones. A pesar de ello, en nuestro país existe escasa información de la situación epidemiológica actual de la enfermedad, principalmente debido a la subnotificación de casos y a su persistencia de tipo endémico en los animales. En los últimos años se han reforzado los análisis tendientes al conocimiento epidemiológico de esta enfermedad. En el campo de la epidemiología molecular, se desarrollaron distintos enfoques basados en PCR para la identificación y tipificación de aislamientos de Leptospira, siendo las más utilizadas: MLVA (análisis de VNTRs en múltiples loci) y MLST (tipificación por secuenciación de múltiples loci). Ambas tecnologías se basan en la amplificación por PCR, con la diferencia de que en el primer caso se trata de elementos de tipo minisatélite (unidades repetitivas en un rango de 8 a 100 pares de bases) y en el segundo caso los blancos de amplificación constituyen fragmentos de genes conservados o housekeeping que son secuenciados para su posterior análisis. Esta última se ha convertido en una técnica líder entre los métodos de tipificación molecular, debido a su alto poder discriminatorio entre distintos aislamientos bacterianos, su fácil aplicación y estandarización, además de la posibilidad de transmitir la información obtenida en distintos laboratorios a través de bases de datos públicas. Asimismo, las secuencias génicas obtenidas son aplicables a estudios poblacionales y epidemiológicos. En este trabajo se evaluaron y desarrollaron los principales métodos para la tipificación de Leptospira; la evaluación y aplicación de las técnicas MLVA y MLST permitieron identificar genotipos circulantes de manera mayoritaria entre aislamientos argentinos, tanto provenientes de animales de producción como en humanos. Se logró generar un nuevo esquema de MLST (7LA) para leptospiras patógenas a partir de la combinación de dos esquemas existentes, optimizando y unificando la metodología de tipificación. Las secuencias génicas generadas en este trabajo se encuentran publicadas en una base de datos disponible en internet (http://pubmlst.org/leptospira/), donde además de acceder a las mismas, puede aplicarse la metodología para la determinación de genotipos a partir de nuevos aislamientos, posibilitando la comparación de cepas a nivel mundial. El nuevo esquema se aplicó no solamente a los aislamientos argentinos, sino que se utilizó en la tipificación in silico a partir de 283 secuencias genómicas de aislamientos y cepas de referencias mundiales que fueron generadas en el marco de un proyecto de secuenciación genómica de este género. Se establecieron 199 genotipos diferentes donde el perfil de MLST denominado ST47 agrupó el 34 % de los aislamientos estudiados, similarmente a lo ocurrido para las muestras argentinas. Como consecuencia de los análisis filogenéticos y de formación de complejos clonales, se logró establecer una correlación entre genotipos y serogrupos al que pertenecen los aislamientos, aportando de esta manera una alternativa complementaria al diagnóstico serológico actual. En este sentido, se logró también la generación de un esquema de MLST reducido utilizando tan sólo tres de los siete marcadores del esquema 7LA. El esquema reducido (3LA) permitió la tipificación molecular directamente a partir de muestras clínicas, sin necesidad de contar con el aislamiento, que muchas veces es sumamente difícil de lograr debido a las características propias de esta bacteria. Este trabajo permitió entonces profundizar en el conocimiento de la variabilidad genética del género Leptospira y así generar información epidemiológica adecuada que pueda ser utilizada en programas de control y métodos de diagnóstico de esta enfermedad, constituyendo el primer trabajo en su tipo realizado en nuestro país. PALABRAS CLAVE: Leptospira, epidemiología, Multilocus Sequence Typing, serogrupos, genotipos, diversidad genética.

Abstract:
Leptospirosis is an infectious disease caused by bacteria of the genus Leptospira, and constitutes a zoonosis of worldwide distribution. The water becomes the main route of transmission when it is contaminated by the urine of infected animals. The outbreaks of leptospirosis in Argentina are associated to climate changes and particularly to the occurrence of floods. However, there is little information on the current epidemiological situation of the disease in our country, mainly due to underreported cases and the persistence of endemicity in animals. Recently, epidemiological analyses have strengthened the understanding of this disease. In the field of molecular epidemiology, PCR-based approaches for the identification and typing of isolates of Leptospira have been developed. Currently, the most frequently used approaches are MLVA (Multiple Locus VNTRs Analysis) and MLST (Multilocus Sequence Typing). Both technologies are based on PCR amplification. However, for MLVA the amplification targets are minisatellite elements (repeats in a range of 8 to 100 base pairs), whereas MLST targets fragments of housekeeping genes that are sequenced for further analysis. MLST has become a leading technique among the molecular typing methods, because of its high discriminatory power between different bacterial isolates, easy application and standardization, plus the ability to share information obtained in different laboratories through public databases. Besides, the gene sequences generated by this method area applicable to population and epidemiological studies. In this work, we evaluated and developed the main methods for typing Leptospira. The implementation of MLVA and MLST techniques led to the identification of major genotypes circulating among Argentine isolates from both livestock and humans. A new MLST scheme (7LA) was generated for pathogenic leptospires by optimizing and unifying two pre-existing MLST strategies. The gene sequences generated through this work have been published in a database available online (http://pubmlst.org/leptospira/). The methodology can also be applied for the genotyping of new isolates, enabling the comparison of genotypes worldwide. In addition, the new scheme was applied not only to Argentine isolates, but was used in silico for the characterization of 283 genomic sequences of isolates and strains of global distribution, which were generated as part of a genome sequencing project dedicated to this genus. A total of 199 different genotypes were established, and the MLST allelic profile named ST47 grouped 34% of the studied isolates, in agreement with the previous studies on Argentine samples. As a result of the phylogenetic and clonal complexes analyses, we could establish a correlation between genotypes and serogroups, thus providing a complementary alternative to the current serological diagnosis. In this regard, the generation of a reduced MLST scheme was also achieved, by selecting only three of the seven markers from the 7LA scheme. The reduced MLST scheme (3LA) was applied to the molecular typing from clinical sample without the need of isolation, which is often difficult to achieve because of the particular characteristics of this bacterium. In summary, this work allowed us to deepen the understanding of the genetic variability of the genus Leptospira, thus contributing with suitable epidemiologic information useful to apply in the design of control strategies and also diagnostic methods for this illness. Thus, this study constitutes the first work of its kind conducted in our country. KEYWORDS: Leptospira, epidemiology, Multilocus Sequence Typing, serogroups, genotypes, genetic diversity.

Imberti, Marcos Agustín. "Análisis ecológico-evolutivo de la especie invasora Zaprionus indianus (Diptera: Drosophilidae), una potencial plaga de frutales" (2016-07-13) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Las especies introducidas que rápidamente colonizan grandes áreas ofrecen una oportunidad para investigar las causas que les permiten una colonización exitosa (invasión biológica), así como el cambio que provocan en las comunidades ya establecidas. Zaprionus indianus Gupta (1970) es un drosofílido (Diptera: Drosophilidae) originario de la región Afrotropical y que recientemente colonizó toda América desde su ingreso a Brasil en 1999. En esta Tesis de Doctorado se han estudiado características ecológicas y genéticas que podrían relacionarse con la exitosa invasión de Z. indianus. En particular, a) se caracterizó la distribución, abundancia y utilización de recursos alimenticios por parte de Z. indianus en la Argentina; b) se analizaron aspectos histórico-demográficos, los niveles de estructuración poblacional y los niveles de variación genética mitocondrial en las poblaciones de Z. indianus establecidas en la Argentina; c) se describieron patrones de variación genética y de plasticidad fenotípica en caracteres morfológicos y de historia de vida en poblaciones argentinas de Z. indianus y d) se realizaron experimentos de competencia interespecífica entre Z. indianus y drosofílidos preestablecidos en la Argentina. Los resultados mostraron que: Z. indianus tiene la capacidad de utilizar como hospedador los frutos de diversas especies como guayaba, mango, naranja, caqui, papaya, banana, nísperos e higos; que el proceso de invasión al continente dejó rastros en la variación genética mitocondrial de Z. indianus caracterizando un proceso sin cambios demográficos abruptos; que tanto la variación genética y la plasticidad fenotípica de caracteres morfológicos y de historia de vida presentan patrones complejos en las poblaciones invasoras y, finalmente, que la habilidad competitiva larval de Z. indianus respecto de otros drosofílidos sería una de las causas del éxito de la colonización de esta especie en la Argentina.

Abstract:
Introduced species that colonize large areas, rapidly offer an opportunity to research the causes that allow their successful colonization (biological invasion) as well as the changes it makes in established communities. Zaprionus indianus Gupta (1970) is a drosophilid (Diptera: Drosophilidae) originated from the Afrotropical region that recently colonized all America since it arrival to Brazil in 1999. In this Doctoral Thesis we have studied the biological and genetic features that might relate to the successful invasion of Z. indianus. In particular, a) we have characterized the distribution, abundance and usage of food resources by Z. indianus in Argentina; b) we have analyzed historical and demographic aspects of this invasion, the levels of population structuration and the levels mitochondrial genetic variation in populations of Z. indianus established in Argentina; c) we have described the patterns of genetic variation and phenotypic plasticity in morphological and life history traits in Argentine populations of Z. indianus and d) we have made experiments of interspecific competition between Z. indianus and frugivore drosophilids preset in Argentina. The results showed that: Z. indianus has the ability to use the fruits of various species such as guava, mango, orange, persimmon, papaya, banana and figs as host; that the process of invasion in the continent left traces in their mitochondrial genetic variation of a history characterized by a lack of abrupt demographic changes; that genetic morphological and life history traits’ variation and phenotypic plasticity show complex patterns in invasive populations, and lastly, that larval competitive ability of Z. indianus over other drosophilids can be proposed as one of the causes of the successful colonization of this species in Argentina.

Russo, María Gabriela. "Análisis genéticos aplicados al estudio de la dinámica de poblaciones humanas prehispánicas del Noroeste Argentino" (2016-12-22) Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Existen diversos procesos sociales, políticos y culturales de las poblaciones humanas que pueden dejar huellas en su acervo génico. En consecuencia, el análisis del ADN constituye una herramienta complementaria para su estudio. En esta tesis se abordaron distintos aspectos de las poblaciones que habitaron el actual Noroeste Argentino (NOA) y el resto del Área Centrosur Andina en tiempos prehispánicos a partir del análisis del ADN antiguo, es decir, del material genético extraído de restos óseos. Utilizando al ADN mitocondrial como el principal marcador y a fin de contribuir al estudio de la dinámica y el estilo de vida de estas poblaciones, se emplearon dos escalas de análisis: local y regional. A nivel local, en la Quebrada de Humahuaca se intentó establecer: a) la procedencia de los habitantes de un sitio del Período Incaico, hallándose evidencias del origen local de una parte de la población, que habría sido probablemente relocalizada desde otros poblados cercanos; y b) las relaciones de parentesco entre individuos de dos asentamientos, obteniéndose indicios de que aquellos enterrados en un mismo recinto o unidad habitacional se encontraban emparentados. En una escala de análisis regional, se evaluó la variabilidad y la diferenciación genética entre distintas poblaciones prehispánicas del Área Centrosur Andina. Por un lado, no se encontraron evidencias de diferenciación entre poblaciones como las de los actuales territorios del NOA, norte de Chile y Bolivia. Por el otro, en líneas generales se observó la existencia de estructuración considerando toda el área analizada, sobre la que habrían incidido factores como diferencias temporales y las características particulares de cada población en cuanto a su interacción con otras. Los resultados obtenidos en este trabajo han permitido poner a prueba hipótesis vinculadas al estilo de vida, los procesos migratorios y las interacciones entre distintos grupos, contribuyendo especialmente al conocimiento de las dinámicas poblacionales prehispánicas del NOA y del resto del Área Centrosur Andina.

Abstract:
The genetic pool of human populations can be influenced by several social, political and cultural processes. Consequently, DNA studies became a helpful tool to understand these phenomena. The present thesis comprises the study of different aspects of pre-Hispanic populations from north-western Argentina (NWA) and the rest of South-Central Andes area through the analysis of ancient DNA, meaning the genetic material recovered from human remains. Using mitochondrial DNA as the main genetic marker and with the aim of contributing to the study of population dynamics and lifestyle, two levels of analysis were employed: local and regional. At a local level in Quebrada de Humahuaca, we tried to establish: a) the origin of the inhabitants of a site from the Inca Period, finding that part of the population was probably resettled from other nearby sites; and b) the kinship relationships among individuals from two archaeological sites, detecting evidences of relatedness among those buried in the same grave or residential space. At a regional scale, genetic variability and differentiation among diverse pre-Hispanic populations from the South-Central Andes area were studied. On one hand, no evidence of differentiation was found among some groups like those from the current territories of NWA, northern Chile and Bolivia. On the other hand, we found a structured population considering the entire analyzed area as a whole with the probable influence of several factors, such as chronological differences and the characteristics of each population related with the interaction with others. The results obtained allowed to test hypothesis about the lifestyle, migratory processes and interactions among different groups, contributing to the study of pre-Hispanic population dynamics in NWA and the rest of the South-Central Andes area.

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