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Zadunaisky Bustillos, Pablo. "Propiedades de regularidad homológica de variedades de banderas cuánticas y álgebras asociadas" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los objetos de estudio de esta tesis pertenecen a dos familias de ”variedades no conmutativas”, es decir álgebras N-graduadas conexas noetherianas a las que consideramos, siguiendo la perspectiva de la geometría no conmutativa, como análogos de anillos de coordenadas homogéneas sobre ciertas variedades proyectivas. La primera familia es la de las variedades tóricas cuánticas, subálgebras graduadas de toros cuánticos. Clasificamos estas álgebras y estudiamos en detalle sus propiedades de regularidad homológica, definidas por Artin-Schelter, Zhang, Van den Bergh, etc. La segunda familia es la de las álgebras conocidas como variedades de banderas cuánticas y otras álgebras asociadas, análogos no conmutativos de las álgebras de coordenadas homogeneas de las variedades de banderas y de sus subvariedades de Schubert. Demostramos que los miembros de esta segunda familia pueden filtrarse de forma que sus álgebras graduadas asociadas son variedades tóricas cuánticas. Luego probamos que las propiedades de regularidad homológica de las álgebras de las variedades de bandera y de Schubert cuánticas se deducen de las propiedades de las variedades tóricas cuánticas. Abstract: The objects of study of this thesis are two families of ”noncommutative varieties”, that is noetherian connected N-graded algebras which, following the general notions of noncommutative geometry, we regard as analogues of homogeneous coordinate rings of certain projective varieties. The first family is that of quantum toric varieties, which are graded subalgebras of quantum tori. We classify these algebras and study their homological regularity properties as defined by Artin-Schelter, Zhang, Van den Bergh, etc. The second family is that of quantum flag varieties and associated algebras, noncommutative analogues of the homogeneous coordinate rings of flag varieties and their Schubert subvarieties. We show that the members of this second family can be endowed with a filtration such that their associated graded algebras are quantum toric varieties. We then show that the homological regularity properties of quantum flag and Schubert varieties can be deduced from those of quantum toric varieties.
Cita tipo APA: Zadunaisky Bustillos, Pablo . (2014). Propiedades de regularidad homológica de variedades de banderas cuánticas y álgebras asociadas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5470_ZadunaiskyBustillos.pdf Cita tipo Chicago: Zadunaisky Bustillos, Pablo. "Propiedades de regularidad homológica de variedades de banderas cuánticas y álgebras asociadas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5470_ZadunaiskyBustillos.pdf |
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Tolivia, Analía Alejandra. "Prospección biotecnológica de cultivos de Euglena gracilis (Euglenozoa)" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este estudio, extractos libres de paramilon, de dos cepas de Euglena gracilis (Klebs), se sometieron a un cribado químico para detectar metabolitos secundarios. Ambas cepas fueron estudiadas en sus formas fotosintéticas y blanqueadas, en sus fases de crecimiento exponencial y estacionaria. Se realizaron análisis cromatográficos y se estudiaron sus capacidades bioactivas mediante ensayos primarios. Se detectó así la presencia de esteroides, cardenólidos, triterpenos, taninos y flavonoides. En correlación con la presencia de polifenoles, los extractos polares mostraron actividad antioxidante frente al radical estable DPPH• e inhibición de crecimiento in vitro, incluso en ausencia de paramilon, sustancia con propiedades antioxidantes y antitumorales. También se evaluó la producción de paramilon resultando las cepas blanqueadas cultivadas en medio mineral con exceso de acetato las más eficientes. Por derivatización de este polisacárido se obtuvo un producto con propiedades antivirales frente al Herpes virus tipo I, y su inclusión en la dieta de Cherax quadricarinatus, especie de importancia comercial, tuvo un efecto protector e inmunoestimulante de los efectores humorales sin afectar su crecimiento. Finalmente, dado que estas microalgas poseen una película formada por bandas superpuestas que se asemeja a una red de difracción, se investigó desde el punto de vista electromagnético el papel que esta estructura desempeña en la protección frente a la radiación UV. Aplicando el método de Chandezón para resolver el problema de difracción de una red iluminada por una onda plana, se calculó la reflectancia de esta estructura, mostrando que el patrón periódico exhibido por la película podría proporcionar un método de protección frente a los rayos UV. Abstract: In this study, Euglena gracilis (Klebs) extracts from two strains were screened for the identification of secondary metabolites. Both strains were studied in their photosynthetic and bleached forms, on their exponential and stationary growth phases. Chromatographic analyses were performed and bioactive capabilities were studied using primary assays. Steroids, cardenolids, triterpenes, tannins, and flavonoids were found. In agreement with the presence of polyphenols, the polar fractions showed antioxidant activity against DPPH• and growth inhibition activity in vitro even in the absence of paramylon, which has been previously reported to have antioxidant and antitumoral properties. The bleached strain grown in mineral medium with an excess of acetate was the most efficient at paramylon production. By derivatization of this polysaccharide, a product was obtained with antiviral properties against herpes virus type I. Its inclusion in the diet of Cherax quadricarinatus, a commercially important species, had a protective and immunostimulant effect of the humoral effectors without affecting their growth. Finally, since these microalgae are covered by a typical surface pellicle formed by overlapping bands which resemble a diffraction grating, we investigated from an electromagnetic point of view the role this pellicle might play in the protection against UV radiation. The reflectance of the structure, calculated by applying the C-method to solve the diffraction problem of a grating illuminated by a plane wave, showed that the periodic pattern exhibited by the pellicle has the potential to provide protection against UV damage.
Cita tipo APA: Tolivia, Analía Alejandra . (2014). Prospección biotecnológica de cultivos de Euglena gracilis (Euglenozoa). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5512_Tolivia.pdf Cita tipo Chicago: Tolivia, Analía Alejandra. "Prospección biotecnológica de cultivos de Euglena gracilis (Euglenozoa)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5512_Tolivia.pdf |
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Salomone, Vanesa Natalia. "Estudios mecanísticos y cinéticos en el tratamiento de uranio (VI) en solución acuosa por procesos fotoquímicos" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se estudió la eliminación del U(VI) mediante dos procesos fotoquímicos. Se analizó la transformación fotoquímica del U(VI) bajo irradiación UV-vis sin catalizador (TF) (Cap. 2) y con TiO2 (FHR) en distintas condiciones experimentales (Cap. 3 y 4). El objetivo de la tesis fue analizar el rol de distintas variables relevantes en procesos fotoquímicos, dilucidar mecanismos de reacción y determinar parámetros cinéticos involucrados en la remoción de U(VI) de solución acuosa, para generar herramientas que permitan controlar los procesos involucrados en aplicaciones como tratamiento de aguas naturales o de desecho. En el Cap. 2 se evaluó la eficiencia de la TF en la remoción de U(VI) (0,25 mM), pH 3, bajo atmósfera de N2 y en presencia de 2-propanol (2-PrOH) y ácido fórmico (AF) como agentes reductores. Se estudiaron los efectos del contraión de la sal de uranio utilizada (nitrato, acetato, y perclorato), y del rango de longitud de onda empleada (lámpara de inmersión de Hg de media presión con reactor de cuarzo (230 < λ/nm < 450) o de vidrio (λ > 300 nm). En ausencia de donores, no hubo variación en la concentración de U(VI), excepto en los experimentos con acetato de uranilo, donde la remoción llegó al 16%; el espectro de la solución al final de la reacción mostró la presencia de U(V). Se obtuvieron altos valores de transformación con 2-PrOH y AF. La remoción de U(VI) y la velocidad inicial de reacción fueron mayores con el reactor de cuarzo, atribuible a la mayor intensidad de luz incidente en la solución. El menor rendimiento se obtuvo con acetato, debido a la formación de un complejo de U(IV)- acetato hidrolizable y fácilmente reoxidable en contacto con O2. La mayor eficiencia se obtuvo con nitrato de uranilo, 2-PrOH 1 M y reactor de cuarzo, obteniéndose una disminución en la concentración de U(VI) superior al 95% en 15 min de reacción. En este caso, se generó un depósito gris oscuro muy estable, cuyo análisis por DRX indicó que se trataba de un óxido mixto de U(VI)-U(IV), hecho que confirma la reducción del U(VI). En presencia de AF 1 M, si bien se produce la reducción de U(VI), la especie resultante es un complejo de U(IV)-formiato, soluble en agua, que fue detectado espectrofotométricamente. El sistema fotoquímico más eficiente es el que usa 2-PrOH. En el Cap. 3, se evaluó la eficiencia de la FHR en la remoción de U(VI) (0,25 y 1,25 mM) a pH 3 en presencia de 2-PrOH a distintas concentraciones empleando dos sistemas de irradiación (S), uno de ellos denominado SI (lámpara de alta presión de Xe provista de un filtro BG12 300 < λ < 500, λmáx. = 400 nm) y el otro el mismo usado en la TF (SII). Los mejores resultados se obtuvieron con el SII y reactor de cuarzo, lo cual indicó que los procesos son favorecidos por un mayor número de fotones. La eficiencia de remoción con U(VI) 0,25 mM sin donor fue baja, alcanzándose el 20% en 30 min. La presencia de 2-PrOH es necesaria para que ocurra una mayor remoción de U(VI). La máxima eliminación (80%) se obtuvo con la mayor concentración de 2-PrOH (10 M), en 10 min de reacción. El mayor rendimiento fotocatalítico se obtuvo con nitrato o perclorato de uranilo, tanto en ausencia como en presencia de 2-PrOH (1 ó 10 M). Se comprobó, al igual que en ausencia de TiO2 (Cap. 2), que el acetato afecta negativamente la eliminación de U(VI), ya que el U reducido queda en solución y no puede ser recuperado. El análisis por DRX confirma la deposición de óxidos de U(IV) de estequiometria variable según las condiciones, demostrando que el proceso fotocatalítico ocurre por reducción del U(VI) y precipitación. El análisis por XPS de los sólidos también confirmó la presencia de U(IV) sobre el TiO2. Por otra parte, la transformación fue más eficiente partiendo de U(VI) 1,25 mM, llegando a valores cercanos al 100%. Sin embargo, en estas condiciones, la contribución de la TF de U(VI) fue muy significativa. Por último, en el Cap. 4, se evaluó la eficiencia de la FHR de 0,25 mM U(VI), pH 3 y AF empleando los sistemas de irradiación antes mencionados. Se obtuvieron altos valores de remoción para todas las concentraciones de AF ensayadas, obteniéndose 80% con AF 0,01 M en 10 min de reacción. Se comprobó que altas concentraciones de AF resultan contraproducentes debido a que favorecen la reoxidación del uranio reducido (Cap. 2). Se concluye que es más apropiado el uso de la FH frente a la transformación fotoquímica homogénea como método de remoción de uranio de aguas, debido a que, en presencia del catalizador, se facilita la recuperación del uranio reducido por su deposición sobre el TiO2, lo que hace más estable los depósitos generados y menos dificultosa su separación de la fase líquida. Abstract: The removal of U(VI) was study by two photochemical processes. We analyzed the photochemical transformation of U(VI) under UV-vis irradiation without catalyst (PT) (Chapter 2) and with TiO2 (RHP) in different experimental conditions (Chapter 3 and 4). The aim of the thesis was to analyze the role of relevant variables photochemical processes, elucidate reaction mechanisms and determine kinetic parameters involved in the removal of U(VI) from aqueous solution to generate tools to control the processes involved in applications such as natural water treatment or waste. In the Chapter 2 was evaluated PT efficiency in removal of U(VI) (0.25 mM), pH 3, under N2 atmosphere and in the presence of 2-propanol (2-PrOH) and formic acid (FA) as reducing agent. The effects of salt counterion used uranium (nitrate, acetate and perchlorate), and the wavelength range used (Hg immersion lamp medium pressure quartz reactor (230 <λ / nm <450 ) or glass (> λ 300 nm.). In the absence of donor, there was no variation in the concentration of U(VI) except in experiments with uranyl acetate, where removal reached 16%, the spectrum of the solution the end of the reaction showed the presence of U(V). High values were obtained from transformation with 2-PrOH and FA. Removal of U(VI) and the initial reaction rate was higher with the quartz reactor attributable to the greater intensity of light incident on the solution. The lower yields were obtained with acetate due to complex formation of U(IV)-acetate easily hydrolyzable and reoxidizable in contact with O2. The highest efficiency was obtained with uranyl nitrate, 2-PrOH 1 M and quartz reactor, resulting in a decrease in the concentration of U(VI) greater than 95% at 15 min reaction. In this case, we generated a very stable dark gray deposit whose XRD analysis indicated that it was a mixed oxide of U(VI)-U(IV), which confirms the reduction of U(VI). In the presence of FA 1 M, although the U(VI) reduction occurs, the resulting species is a complex of U(IV)-formate, soluble in water, which was detected spectrophotometrically. Photochemical system with 2-PrOH was more efficient. In the Chapter 3, we assessed the efficiency of the RHP in the removal of U(VI) (0.25 and 1.25 mM) at pH 3 in the presence of 2-PrOH in different concentrations using two irradiation systems (S), one of they called SI (high pressure lamp equipped with a filter Xe BG12 300 <λ <500, λ max. = 400 nm) and the other the same used in the PT (SII). The best results were obtained with SII and quartz reactor, which indicated that the processes are favored by a large number of photons. The removal efficiency with U(VI) 0.25 mM without donor was low, reaching 20% in 30 min. The presence of 2- PrOH is necessary for the occurrence of a important removal of U(VI). Maximum removal (80 %) was obtained with the highest concentration of 2-PrOH (10 M) , in 10 min of reaction. The highest yield was obtained with photocatalytic perchlorate or uranyl nitrate, both in the absence and presence of 2-PrOH (1 or 10 M). It was found, as in the absence of TiO2 (Chapter 2), acetate presence adversely affects the removal of U(VI), due the reduced U remains in solution and can not be recovered. XRD analysis confirmed the deposition of oxides of U(IV) of variable stoichiometry depending on conditions, demonstrating that the photocatalytic process occurs by reduction of U(VI) and precipitation. The XPS analysis of the solids also confirmed the presence of U(IV) on the TiO2 . Moreover, the conversion was more efficient starting of U(VI) 1.25 mM, reaching values close to 100 %. However, in these conditions, the contribution of the PT of U(VI) was very significant. Finally, in Chapter 4, we assessed the efficiency of RHP with U(VI) 0.25 mM, pH 3 and FA using the irradiation systems aforementioned. High values were obtained for all removal FA concentrations tested, yielding 80% with AF 0.01 M in 10 min of reaction. It was found that high concentrations of FA are counterproductive because they favor the reduced uranium reoxidation (Chapter 2). We conclude that it is more appropriate to use the HP versus homogeneous photochemical transformation as a method of removing uranium from water, because, in the presence of the catalyst, it facilitates the recovery of depleted uranium for its deposition on the TiO2, it becomes more stable generated deposits and less difficult separation from the liquid phase.
Cita tipo APA: Salomone, Vanesa Natalia . (2014). Estudios mecanísticos y cinéticos en el tratamiento de uranio (VI) en solución acuosa por procesos fotoquímicos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5427_Salomone.pdf Cita tipo Chicago: Salomone, Vanesa Natalia. "Estudios mecanísticos y cinéticos en el tratamiento de uranio (VI) en solución acuosa por procesos fotoquímicos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5427_Salomone.pdf |
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Ruiz, Verónica. "Factores involucrados en la interacción inicial de Brucella suis con el hospedador: rol de los autotransportadores triméricos" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El género Brucella comprende patógenos intracelulares facultativos que causan una zoonosis conocida como brucelosis. Esta zoonosis es una de las más dispersas alrededor del mundo y afecta a una amplia variedad de mamíferos, entre ellos muchos de importancia agropecuaria. Un aspecto fundamental en la virulencia de Brucella reside en su capacidad de invadir y replicar dentro de células fagocíticas y no fagocíticas. El objetivo del trabajo de tesis fue identificar y caracterizar moléculas de B. suis asociadas a la adhesión y/o invasión a las células del hospedador. Mediante análisis bioinformáticos del genoma de B. suis 1330 se identificaron posibles proteínas que potencialmente podrían cumplir una función en la adhesión y/o invasión. En esta tesis se estudiaron tres de las proteínas candidatas (BtaE, BtaF y MapA). Diferentes análisis in silico indicaron que BtaE y BtaF pertenecen a la familia de los autotransportadores triméricos, los cuales median su propia translocación a través de la membrana externa. Enfoques mutacionales y heterólogos demostraron que BtaE y BtaF están involucradas en la adhesión a células no fagocíticas del hospedador y a componentes de la matriz extracelular. En particular, BtaE confirió adhesión a ácido hialurónico mientras que BtaF conferiría una adhesión promiscua a una amplia variedad de componentes de la matriz extracelular del hospedador y participaría en la formación de un biofilm in vitro. La adhesina BtaF cumpliriría una función adicional ya que confirió a la bacteria que la porta tolerancia a la actividad bactericida del complemento presente en el suero. Ambos autotransportadores fueron necesarios para que B. suis genere una completa virulencia en ratones inoculados intragástricamente. Por otro lado, por inmunofluorescencia se pudo detectar a BtaE, BtaF y a la adhesina BmaC en un número reducido de células pero en todos los casos las adhesinas se localizaron en el polo nuevo bacteriano generado luego de la división asimétrica de Brucella. Se propuso que en Brucella dicho polo estaría funcionalmente diferenciado para la adhesión. En cuanto a MapA, la cepa mutante defectiva en esta proteína fue menos eficiente en la adhesión a células no fagocíticas. Sin embargo, la mutante también presentó una sensibilidad notable a diversos compuestos, como polimixina B, Triton X-100 y lisozima, sugiriendo que la membrana externa se encuentra alterada. Proponemos que MapA estaría involucrada en la síntesis de algún componente de membrana, lo cual a su vez podría afectar directa o indirectamente la adhesión a componentes del hospedador y alterar la resistencia característica de Brucella al sistema inmune del hospedador. Estudios futuros permitirán dilucidar la función bioquímica de MapA en la biogénesis de la membrana de Brucella y su rol en la interacción de la bacteria con el hospedador. Abstract: The Brucella genus contains facultative intracellular pathogens, which cause a zoonotic disease called brucellosis. This zoonos is spread around the world and affects a wide range of mammals, among them many of agricultural importance. A fundamental aspect in the virulence of Brucella is its ability to invade and replicate within phagocytic and non-phagocytic cells. The aim of this thesis was to identify and characterize Brucella suis molecules associated to adhesion and/or invasion of host cells. Proteins that potentially could play a role in adhesion and/or invasion were identified through bioinformatic analysis of the B. suis 1330 genome. In this thesis three of the candidate proteins (BtaE, BtaF and MapA) were studied. Different in silico analysis indicated that BtaE and BtaF belong to the trimeric autotransporter family, which mediate their own translocation across the outer membrane. Mutational and heterologous aproaches demostrated that BtaE and BtaF are involved in the adhesion to non-phagocytic cells and components of the extracellular matrix. Particularly, it was shown that BtaE confers adhesion to hyaluronic acid while BtaF confers a promiscuous adhesion to a variety of compounds of the extracellular matrix and it would be involved in the formation of biofilms in vitro. The adhesin BtaF was involved in an additional function since it conferred the bacteria that carried it, tolerance to the bactericidal activity of the complement present in serum. Both autotransporters were necessary for B. suis to exhibit a full virulence in mice inoculated intragastrically. On the other hand, by immunofluorescence BtaE, BtaF and BmaC were detected in a reduced number of cells but in all cases the adhesins were localized at the new bacterial pole generated after the asymmetric division of Brucella. We propose that this pole of Brucella is functionally differentiated for adhesion. Regarding MapA, the mutant strain defective in this protein was less efficient in the adhesion to non-phagocytic cells. However, this mutant also presented a remarkable sensitivity to several compounds such as polymyxin B, Triton x-100 and lysozyme, suggesting that the bacterial outer membrane is altered. We propose that MapA would be involved in the synthesis of some membrane component, which could directly or indirectly affect the adhesion to components of the host and alter the characteristic resistance of Brucella to the immune system of the host. Future studies will be carried out to determine the biochemical function of MapA in the biogenesis of Brucella´s membrane and its role in the interaction of the bacteria with the host.
Cita tipo APA: Ruiz, Verónica . (2014). Factores involucrados en la interacción inicial de Brucella suis con el hospedador: rol de los autotransportadores triméricos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5501_Ruiz.pdf Cita tipo Chicago: Ruiz, Verónica. "Factores involucrados en la interacción inicial de Brucella suis con el hospedador: rol de los autotransportadores triméricos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5501_Ruiz.pdf |
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Rossi, Soledad Paola. "Interacciones neuro-inmuno-endócrinas en el testículo: rol de la melatonina" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La melatonina, hormona secretada por la glándula pineal, modula los ritmos biológicos diarios y los ciclos de sueño/vigilia. A través de su acción regulatoria sobre la producción y secreción de hormonas hipotalámicas e hipofisarias, participa también en la modulación de la actividad sexual en especies con ciclos reproductivos anuales controlados por el fotoperíodo. En este Trabajo de Tesis Doctoral se investigaron dos mecanismos de acción diferenciales de la melatonina en el testículo: su rol como hormona y su rol como agente anti/pro oxidante. Los estudios realizados permitieron establecer: a) las señales intracelulares asociadas al rol inhibitorio ejercido por el sistema melatonina/CRH sobre la regulación de la esteroidogénesis en células de Leydig del hámster Dorado, b) la concentración testicular de melatonina y la expresión de los principales componentes de la cascada de señalización del sistema melatonina/CRH en el testículo de pacientes que padecen infertilidad idiopática, y c) la acción regulatoria ejercida por melatonina sobre la proliferación, estado oxidativo y capacidad secretoria en macrófagos y mastocitos testiculares. La melatonina desempeñaría un rol clave en la modulación de la esteroidogénesis testicular en el hámster. En el testículo humano patológico, ejercería además acciones regulatorias sobre la población local de macrófagos y mastocitos. Abstract: Melatonin is a hormone secreted by the pineal gland that mediates the physiological regulation of both daily rhythms and sleeping/waking cycles. In seasonal breeders, this hormone also participates in the modulation of annual reproductive activity through its action on the hypothalamic-pituitary axis. In this Doctoral Thesis two differential mechanisms of action of melatonin in the testis were studied: its role as a hormone and its role as an anti/pro-oxidant agent. Studies performed in this Thesis allowed us to establish: a) the intracellular events triggered by melatonin/CRH that lead to a down-regulation of the steroidogenic process in Syrian hamster Leydig cells, b) the testicular melatonin concentration and the expression of the main components of the signaling cascade linked to the melatonin/CRH system in testicular biopsies of men suffering from idiopathic infertility, c) the effects of melatonin on proliferation, oxidative state and secretory capability in testicular macrophages and mast cells. Thus, melatonin would play a key role in the regulation of testicular steroidogenesis in the hamster. In the pathological human testis, melatonin would also participate in the modulation of the local macrophage and mast cell populations.
Cita tipo APA: Rossi, Soledad Paola . (2014). Interacciones neuro-inmuno-endócrinas en el testículo: rol de la melatonina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5477_Rossi.pdf Cita tipo Chicago: Rossi, Soledad Paola. "Interacciones neuro-inmuno-endócrinas en el testículo: rol de la melatonina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5477_Rossi.pdf |
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Rodríguez Imazio, Paola Carolina. "Transporte anisótropo de escalares pasivos en turbulencia rotante" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Un escalar pasivo es un contaminante difusivo presente en un fluido con un grado de concentración tan pequeño que no produce un efecto dinámico en el campo de velocidad. Aerosoles, contaminantes en pequeñas concentraciones en la atmósfera y los océanos, elementos químicos en el interior de las estrellas, o bajo ciertas aproximaciones pequeñas fluctuaciones en la temperatura de un fluido son ejemplos de escalares pasivos. La correcta comprensión de la dinámica de estas magnitudes es relevante para muchas aplicaciones, pero también tiene implicancias importantes en el entendimiento general de la turbulencia. Por este motivo, muchos estudios de escalares pasivos se concentraron en el caso de flujos turbulentos isótropos y homogéneos, aunque en flujos geofísicos, astrofísicos e industriales muchas veces la presencia de fuerzas externas introduce anisotropías en el campo de velocidad que no pueden despreciarse. En esta tesis se presenta un estudio detallado de la advección, el mezclado y la difusión de escalares pasivos en flujos turbulentos rotantes, con y sin helicidad neta. La rotación está presente en muchos flujos en la atmósfera, mientras que se cree que la helicidad (una magnitud conservada por un fluido ideal, asociada a la ruptura de simetría de reflexión en el flujo) es relevante en algunos fenómenos como las tormentas rotantes convectivas. Para caracterizar la advección de los escalares pasivos en el campo de velocidades turbulento, se estudian sus leyes de escala y el desarrollo de anisotropías en el espacio espectral, y en el espacio real usando una descomposición axisimétrica para las funciones de estructura de la velocidad y el escalar pasivo. En el caso rotante no helicoidal, confirmamos que el escalar pasivo es más anisótropo que el campo de velocidad y observamos que su espectro de potencias sigue una ley espectral consistente con un espectro V (k┴) ~ k┴−3/2. En el caso helicoidal, observamos que las leyes de escala son consistentes con un espectro mas empinado para la energía, y menos empinado para el espectro de varianza escalar. Ambos casos se explican con argumentos fenomenológicos que consideran el efecto de la rotación y de la helicidad. La intermitencia del escalar pasivo y del campo de velocidad se caracteriza usando exponentes de escala y funciones de densidad de probabilidad de los incrementos de la velocidad y el escalar pasivo. En presencia de rotación, mostramos que los exponentes de escala pueden ser correctamente predichos usando el modelo de Kraichnan en dos dimensiones. Esta reducción en la dimensionalidad efectiva del problema está asociada a la fuerte anisotropía en la distribución espacial del escalar pasivo. Finalmente, estudiamos y medimos en simulaciones numéricas la difusión turbulenta de escalares pasivos en flujos con y sin rotación y con y sin helicidad neta, y calculamos coeficientes efectivos de transporte usando las leyes de difusión de Fick. Para los flujos rotantes, los coeficientes se calculan en las direcciones paralela y perpendicular al eje de rotación para tener en cuenta la anisotropía en el mezclado y transporte turbulento. Se varían también los números de Rossby y de Schmidt para cuantificar su efecto sobre la difusión efectiva. Para flujos rotantes sin helicidad neta, encontramos que la rotación reduce la difusividad del escalar en el plano perpendicular al eje de rotación, pero no modifica la difusión en la dirección paralela. En presencia de helicidad y ausencia de rotación, los coeficientes de transporte turbulento aumentan ligeramente, en buen acuerdo con resultados previos. Finalmente, en el caso rotante helicoidal, encontramos que la difusión perpendicular disminuye aún mas que en el caso rotante sin helicidad, mientras que la difusión paralela se ve levemente incrementada respecto al mismo caso. Abstract: A passive scalar is a diffusive contaminant present in a fluid in such a small concentration that it produces a negligible dynamic effect on the velocity field. Aerosols, contaminants in the atmosphere and the oceans in small concentrations, chemical elements in stellar interiors, and under certain approximations small fluctuations in the fluid temperature are all examples of passive scalars. The correct understanding of the dynamics of these quantities is relevant for many applications, but it also has important implications for our general understanding of turbulence theory. For this reason, previous studies in many cases focused on passive scalar dynamics in isotropic and homogeneous turbulence, although geophysical, astrophysical, and industrial flows are often anisotropic as the result of the presence of external forces with preferred directions. In this thesis we present a detailed study of the advection, mixing, and diffusion of passive scalars in turbulent rotating flows with and without net helicity. Rotation is relevant in atmospheric flows, and it is believed that the helicity (an ideal invariant of rotating fluids, and a quantity associated with mirror symmetry in the flow) is relevant in such phenomena as supercell thunderstorms. To characterize the advection of passive scalars in a turbulent velocity field, we study scaling laws and the development of anisotropy in spectral space as well as in real space using an axisymmetric decomposition for the structure functions of the velocity and the passive scalar. In the non-helical rotating case, we confirm that the passive scale is more anisotropic than the velocity field, and found that its power spectrum is consistent with a power law V (k┴) ~ k┴−3/2. In the helical case rotating case, we find that the scaling laws are consistent with a steeper spectrum for the energy and a shallower spectrum for the scalar variance. Both cases are correctly explained by phenomenological arguments that take into account the effect of rotation and helicity. Intermittency of the passive scalar and of the velocity field is characterized using scaling exponents and probability density functions of velocity increments and passive scalar increments. In the presence of rotation, we show that scaling exponents are in good agreement with those obtained from Kraichnan’s model in two dimensions. This effective reduction in the dimensionality of the problem is associated with the strong anisotropy observed in the spatial distribution of passive scalar. Finally, we study and measure in numerical simulations the turbulent diffusion of passive scalars in flows with and without rotation, and with and without net helicity. Effective transport coefficients are calculated using Fick’s diffusion laws. For rotating flows, the transport coefficients are calculated in directions parallel and perpendicular to the rotational axis, to account for any anisotropy in the turbulent mixing and diffusion. We also vary the Rossby and Schmidt numbers to quantify their effect on the effective diffusion. For non-helical rotating flows, we find that turbulent diffusion is reduced in the plane perpendicular to the rotation axis, while it does not change in the parallel direction. In the absence of rotation, helicity causes a slight increase in the turbulent transport coefficients, in good agreement with previous results. Finally, for rotating helical flow, the perpendicular diffusion further decreases (compared to the non-helical rotating case), while the parallel diffusion is slightly increased (compared to the same case).
Cita tipo APA: Rodríguez Imazio, Paola Carolina . (2014). Transporte anisótropo de escalares pasivos en turbulencia rotante. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5419_RodriguezImazio.pdf Cita tipo Chicago: Rodríguez Imazio, Paola Carolina. "Transporte anisótropo de escalares pasivos en turbulencia rotante". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5419_RodriguezImazio.pdf |
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Rivera, Juan Antonio. "Aspectos climatológicos de las sequías meteorológicas en el sur de Sudamérica. Análisis regional y proyecciones futuras" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La sequía se percibe como uno de los desastres naturales más costosos y menos entendidos, dada la dificultad para definir su comienzo y fin, su lento desarrollo y las múltiples facetas que posee a nivel regional. A esto se suma la gran cantidad de índices existentes en la literatura que posibilitan su monitoreo, los cuales brindan numerosas definiciones que suelen confundir a los encargados de la planificación agrícola y de los recursos hídricos. El objetivo principal de esta investigación de tesis propone mejorar el conocimiento de la variabilidad espacio-temporal de las sequías meteorológicas en el sur de Sudamérica en base a la comparación de diversos índices de sequía en múltiples escalas de tiempo y la elaboración de una climatología para el período 1961-2008. A partir de una regionalización objetiva, se identificaron siete regiones homogéneas coherentes desde el punto de vista geográfico y climático, y se analizaron las diferentes variabilidades temporales del índice de sequía. Esta regionalización permitió identificar la posible influencia de los eventos El Niño/La Niña en las series de tiempo, con énfasis en la ocurrencia de sequías. Finalmente, se analizaron aplicaciones de interés para los sectores agrícola y de recursos hídricos y se evaluaron los cambios futuros en las características de las sequías en la región de estudio. Abstract: Drought is perceived as one of the costliest natural disasters and the least understood, given the difficulty in defining its beginning and end, its slow development and its multiple regional features. This is compounded by the large number of indices that enable their monitoring, which provide numerous definitions that often confuse agricultural and water resources planners. This research aims to improve the knowledge of the spatio-temporal variability of meteorological droughts in southern South America, based on the comparison of various drought indices at multiple time scales and the development of a climatology for the 1961-2008 period. From an objective regionalization, seven homogeneous regions were identified, which are geographical and climatically coherent, and the different temporal variabilities of the drought index were analyzed. This regionalization allowed identifying the possible influence of the El Niño/La Niña in the time series, with emphasis on drought occurrences. Finally, some applications relevant for the agricultural and water resources sectors were analyzed, and the future changes of drought characteristics were estimated for the study area.
Cita tipo APA: Rivera, Juan Antonio . (2014). Aspectos climatológicos de las sequías meteorológicas en el sur de Sudamérica. Análisis regional y proyecciones futuras. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5504_Rivera.pdf Cita tipo Chicago: Rivera, Juan Antonio. "Aspectos climatológicos de las sequías meteorológicas en el sur de Sudamérica. Análisis regional y proyecciones futuras". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5504_Rivera.pdf |
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Reisin, Hernán Diego. "Búsqueda de partículas supersimétricas en estados finales con muchos jets y energía faltante" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Muchas extensiones del modelo estándar (ME) de física de partículas predicen la existencia de partículas con masas en la escala del TeV que interactúan por la fuerza fuerte y decaen a descendientes que interactúan débilemente. Supersymetría (SUSY) es una de las teorías más estudiada y un firme candidato para describir la física más allá del ME pues provee una explicación consistente a diversos conflictos teóricos como el problema de jerarquía del ME. En el contexto de ésta teoría, las partículas que interactúan fuertemente son los supercompañeros de los quarks (squarks, q) y los gluones (gluinos, g). Si resultan ser accesibles cinemáticamente, los squarks y los gluinos podrían ser producidos en las interacciones protón-protón (pp) en el Gran Colisionador de Hadrones (LHC). Este trabajo de tésis presenta el resultado de la búsqueda de nuevas partículas que decaen a estados finales con un gran número (desde al menos 7 a al menos 10) jets junto con energía faltante en ausencia de electrones y muones aislados. El análisis se desarrolló con datos de colisiones pp a una energía en el centro de masa de √s = 8 TeV colectados por el detector Atlas en el LHC, correspondientes a una luminosidad integrada total de 20.3 fbˉ¹. Se incrementó la sensibilidad de la búsqueda para identificar posibles eventos de Susy al considerar regiones de señal definidas en función variables de subestructura de jets como el número de jets provenientes de quarks b y de la suma de las masas de jets de gran radio. La búsqueda no revela un exceso significativo respecto de los valores predichos por el ME. Los resultados son interpretados en el contexto de un modelo cMssm y de varios modelos simplificados inspirados en SUSY. Los límites de exclusión extienden los resultados previos restringiendo varios modelos supersimétricos. Por ejemplo, en un modelo donde los gluinos producidos decaen vía g→t+t+x01 , se excluyen masas del gluino menores que 1,1 TeV para masas del neutralino (x01 ) por debajo de 350 GeV. Abstract: Many extensions of the Standard Model (SM) of particle physics predict the existence of TeV-scale strongly interacting particles that decay to weakly interacting descendants. Among them, Supersymmetry (Susy) is one of the most studied and a leading candidate theory for describing physics beyond SM since provides a consistent explanation to several theoretical concerns like the hierarchy problem of the SM. In the context of this theory, the strongly interacting parent particles are the partners of the quarks (squarks, q) and gluons (gluinos, g). If they are kinematically accessible, the squarks and gluinos could be produced in the proton-proton (pp) interactions at the Large Hadron Collider (LHC). This thesis presents the results of the search for new particles decaying to final states with large numbers (from at least 7 to at least 10) of jets together with significant missing transverse momentum and no isolated electrons or muons. The analysis is performed with a total integrated luminosity corresponding to 20.3 fbˉ¹ of pp collision data at center-of-mass energy √s = 8 TeV collected by the Atlas experiment at the LHC. The sensitivity of the search to identify possible Susy-like event candidates is enhanced by considering signal regions defined in terms of the number of b-tagged jets and the scalar sum of masses of large-radius jets in an event. These searches found no significant excess over the Standard Model expectation. The results are interpreted in the context of an cMssm model and various simplified supersymmetry-inspired models. The exclusion limits substantially extend previous results constraining several supersymmetric models. For example, in a model where both of the pair-produced gluinos decay via g→t+t+x01 , gluino masses smaller than 1.1 TeV are excluded for neutralino (x01 ) masses below 350 GeV.
Cita tipo APA: Reisin, Hernán Diego . (2014). Búsqueda de partículas supersimétricas en estados finales con muchos jets y energía faltante. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5487_Reisin.pdf Cita tipo Chicago: Reisin, Hernán Diego. "Búsqueda de partículas supersimétricas en estados finales con muchos jets y energía faltante". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5487_Reisin.pdf |
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Regis, Germán Enrique. "Especificación formal y verificación de propiedades temporales de procesos de negocios" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El uso de diferentes métodos y herramientas que asistan en la organización y el control de procesos, ha tomado relevancia debido a la necesidad constante de eficiencia por parte de la industria y a la adecuación de sus prácticas a las emergentes y novedosas técnicas de desarrollo y producción. Como producto de estas necesidades, diversos lenguajes para la descripción de procesos de negocios capturaron el interés tanto del sector productivo, para su aplicación en sus actividades, como así también del sector académico, con el fin de aportar conocimiento y generar nuevas herramientas para tal fin. Si bien la mayor parte de los lenguajes para la especificación de procesos de negocios son informales, existen algunos fundados en formalismos matemáticos. Esto brinda a estos lenguajes formales para procesos de negocios la eliminación de ambigüedades en la interpretación de especificaciones, y la posibilidad de realizar diferentes análisis formales, como chequeos de sanidad. Sin embargo, las alternativas existentes poseen en general limitaciones, o bien en poder expresivo, o, para las alternativas más expresivas, la imposibilidad de realizar algunas tareas de análisis automáticamente. En este trabajo presentamos un enfoque formal para la especificación y el análisis de procesos de negocios, que permite dar semántica a construcciones complejas de procesos de negocios, a la vez que admite el análisis de chequeos de sanidad usuales de manera automática mediante model checking. Más aún, nuestra propuesta abarca la posibilidad de que el usuario especifique y analice propiedades de interés acerca de las especificaciones, mediante lógicas temporales, un mecanismo con frecuencia ausente en los lenguajes existentes. Además del desarrollo de una semántica formal para un lenguaje de proceso de negocios sumamente expresivo, nuestro trabajo toma como base para la especificación de propiedades de procesos de negocios el uso de lógicas temporales. Identificamos algunos elementos que hacen particularmente complicada la expresión de algunos tipos de propiedades, en particular cuando las mismas demandan expresar repeticiones de eventos o tareas, y proponemos una lógica temporal que permite describir tales propiedades con mayor facilidad. Con el fin de no perder capacidad de análisis, desarrollamos traducciones que nos permiten capturar los elementos novedosos de esta lógica en términos de otros elementos, soportados por lógicas temporales tradicionales, con soporte de herramientas. Por otra parte, observamos la tendencia de los lenguajes de descripción de procesos de negocios a no tratar formalmente la descripción de los productos que manipulan. Tomamos un formalismo excepcional en este sentido, PPML, y definimos a partir del mismo un lenguaje de especificaciones, una semántica simplificada para el mismo, y una técnica de análisis de especificaciones basada en una caracterización de sus modelos en UPPAAL. Nuestro enfoque está claramente orientado a la producción de herramientas de soporte al proceso de especificación. Para los lenguajes tratados brindamos herramientas de especificación y análisis de procesos de negocios, como así también la posibilidad de construir descripciones de procesos de negocios a partir de las propiedades que los mismos deben cumplir. Estas tareas son evaluadas en este trabajo a través del desarrollo de casos de estudio tomados de la literatura del área, en lo que respecta a descripción de procesos y chequeos de sanidad de los mismos, y en base a variantes de estos casos en las cuales se enfatiza la necesidad de contar con propiedades descriptas por el usuario, y de dar más relevancia a la descripción de los productos manipulados por los procesos de negocios. Abstract: The use of methods and tools to assist in process organization and control is receiving increasing attention. This is due to the constant need for efficiency in industry, and the pressure on industry to adopt emergent development and production techniques, and adapt current practices to these emergent technologies. As a consequence, various languages for describing business processes have attracted both industry, which applies them in its activities, and academia, which can contribute knowledge and help provide novel tools for these languages. Even though most languages for business process specification are informal, some of these languages are founded on mathematical formalisms. Formal business process specification languages profit from the elimination of ambiguities in the interpretation of their specifications, and the possibility of performing different kinds of formal analyses, such as soundess checks. However, the available formal alternatives have limitations, either in expressive power, or, in the case of the more expressive formalisms, the impossibility of performing some analysis tasks fully automatically. In this work we present a formal approach for the specification and analysis of business processes, that allows us to provide suitable semantics to complex constructions in business process specifications, while at the same time allowing us to perform typical soundness checks fully automatically via model checking. Moreover, our approach includes the possibility of enabling users to specify and analyze properties of their interest about specifications, using temporal logics, a mechanism often missing from existing languages. Besides the development of a formal semantics for a very expressive business process language, our work is based on the use of temporal logics for specifying properties of business processes. We identify some elements that make it difficult to express some kinds of properties, in particular those demanding referring to repetitions of events or tasks, and propose a temporal logic that allows us to specify these properties more conveniently. In order to maintain the possibility of automatically analyzing specifications, we develop translations that enable us to capture the novel elements in our logic in terms of other elements, supported by traditional temporal logics with tool support. Also, we observe a tendency in business process languages to disregard, in their formalizations, the description of the products that processes manipulate. We take a formalism that is exceptional in this respect, PPML, and define a formal specification language in terms of it, a simplified semantics for it, and an analysis technique for its specifications, based on a characterization of its models in UPPAAL. Our approach is clearly oriented towards producing tool support for business process specification. For the languages that we deal with in this work, we provide tools for business process specification, property specification, and automated analysis. We also enable the user to build business process descriptions from the properties these processes are required to fullfil. These tasks are assessed in our work via case studies taken from the literature, for the case of business process description and soundness checks, and variants of these case studies in which the need of referring to event repetitions, and the role of products in process descriptions, are emphasized.
Cita tipo APA: Regis, Germán Enrique . (2014). Especificación formal y verificación de propiedades temporales de procesos de negocios. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5429_Regis.pdf Cita tipo Chicago: Regis, Germán Enrique. "Especificación formal y verificación de propiedades temporales de procesos de negocios". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5429_Regis.pdf |
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Pretel, Miguel Esteban. "La proteína no-estructural NS1 exclusiva del virus respiratorio sincicial: mecanismo de plegamiento y ensamblado quasi-espontáneo de oligómeros esféricos estables" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los Paramixovirus son una familia diversa de virus ARN de cadena negativa pertenecientes al orden de los Mononegavirales. Estos virus han evolucionado diversas estrategias para bloquear los mecanismos de respuesta inmune innata del huésped en el curso de un proceso infeccioso. El virus respiratorio sincicial (RSV) es la mayor causa de enfermedad pediátrica en el mundo. Este virus, contiene a dos proteínas no estructurales (NS1/NS2) la cuáles sólo se encuentran en RSV y no muestran homología con ninguna otra proteína. NS1 y NS2 han sido postuladas como los principales factores de virulencia de RSV, interviniendo en el bloqueo de la respuesta inmune inducida por el virus. Se han identificado múltiple blancos celulares que interactúan con NS1 y NS2, principalmente relacionados a las vías de inducción y respuesta a interferón. En este trabajo de tesis, se realizó el estudio de la conformación de NS1 en solución, haciendo uso de métodos bioquímicos y biofísicos para su estudio. Como primera medida, se desarrolló un protocolo de expresión y purificación que permitió obtener un rendimiento de 10 mg/L de proteína homogénea en solución. Se determinó que NS1 es un monómero plegado globular, el cual contiene regiones flexibles que presentan intercambio conformacional. La temperatura induce cambios estructurales que llevan a la formación de oligómeros esféricos solubles (NS1SOs) los cuales presentan propiedades amiloides. Se analizó la cinética de formación de estos oligómeros, a partir de lo cual se propone un modelo de ensamblado identificando eventos clave para el proceso. Por otro lado, estudios de plegamiento al equilibrio indican que NS1 se despliega cooperativamente en un proceso reversible de dos estados (Nativo – Desplegado), mientras que NS1SOs primero se disocia a monómeros nativos y luego se despliega. Estudios de cinética de plegado de NS1, indican que mientras que el desplegado de la proteína es relativamente sencillo, su plegado es complejo y limitado cinéticamente por la presencia de múltiples intermediarios, compatible con heterogeneidad cis/trans de prolinas en el estado desplegado. En resumen, en el presente trabajo se describe la diversidad conformacional de la proteína NS1. Esta proteína se encuentra en cuasi-equilibrio con oligómeros esféricos y estables, los cuales se forman en condiciones compatibles con un entorno celular. Estos estudios constituyen los primeros en analizar los equilibrios conformacionales para esta proteína y podrían explicar sus múltiples blancos y funciones reportadas. Abstract: Paramixoviruses are a diverse family of negative-strand RNA viruses that belong to the order of Mononegavirales. These viruses evolved different strategies in order to block the host innate immunity during infection. Respiratory Syncytial Virus (RSV) is the major infectious agent that causes pediatric respiratory disease worldwide. RSV contains the two non structural proteins (NS1 and NS2) which are unique to RSV and show no homology to any other protein in relation to its primary structure. These two proteins were postulated as the RSV major virulence factors, and play a central role in blocking the immune response induced by the virus. Multiple cellular targets have been reported for NS1 and NS2, mainly related to the interferon pathways. In this thesis, we studied the NS1 conformation in solution, making use of different biochemical and biophysical techniques. First, we developed an expression and purification protocol which allowed us to obtain 10 mg/L of highly purified protein. We observed that NS1 is a folded and globular monomer which contains some flexible regions subject to slow conformational motions. Temperature induces a cooperative structural change leading to soluble and spherical oligomers (NS1SOs) with amyloid properties. We performed a kinetic analysis which allowed us to propose a model in relation to oligomer formation, identifying key events of the process. Equilibrium folding studies revealed that NS1 unfolds following a two-state reaction, in a fully reversible process, whereas NS1SOs first dissociates into native monomers and them unfolds. On the other hand, kinetic folding studies indicated that although unfolding is a rather simple process, refolding is complex, limited by multiple kinetic intermediates, compatible with prolyl cis/trans heterogeneity in the unfolded state. In summary, the present work describes the conformational diversity of the NS1 protein. NS1 exists in quasi-equilibrium with stable and spherical oligomers, which are formed in conditions compatible with a cellular environment. This work represents the first study in relation to conformational equilibria of the NS1 protein and may explain its multiple binding partners and functions reported.
Cita tipo APA: Pretel, Miguel Esteban . (2014). La proteína no-estructural NS1 exclusiva del virus respiratorio sincicial: mecanismo de plegamiento y ensamblado quasi-espontáneo de oligómeros esféricos estables. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5494_Pretel.pdf Cita tipo Chicago: Pretel, Miguel Esteban. "La proteína no-estructural NS1 exclusiva del virus respiratorio sincicial: mecanismo de plegamiento y ensamblado quasi-espontáneo de oligómeros esféricos estables". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5494_Pretel.pdf |
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Polo, María Laura. "Caracterización de los mecanismos celulares involucrados en la regresión tumoral según la dependencia hormonal de los tumores mamarios" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las similitudes morfológicas y fenotípicas entre los carcinomas mamarios más frecuentes en mujeres (carcinomas ductales, positivos para los receptores de estrógenos (ER) y progesterona (PR)), y el modelo de carcinomas mamarios murinos inducidos con acetato de medroxiprogesterona (MPA), hacen de este modelo una herramienta útil para estudiar los mecanismos celulares asociados al tratamiento antitumoral con agentes endocrinos (antagonistas del ER y PR), e inhibidores de quinasas, entre otros. En este trabajo de Tesis hemos evaluado en el modelo de carcinomas mamarios inducidos con MPA, mecanismos tempranos de regresión tumoral asociados al tratamiento endocrino con el antiprogestágeno mifepristona (MFP) y el inhibidor de PI3K wortmanin (WORT). En vista de la evidencia clínica actual, que demuestra que la combinación de agentes endocrinos e inhibidores de la vía PI3K/Akt resulta beneficiosa para el tratamiento adyuvante de pacientes con tumores ER y PR positivos, y de los estudios que señalan a los antiprogestágenos como una terapia válida para el tratamiento del cáncer de mama, creemos que este trabajo resulta valioso ya que constituye el primer estudio realizado en un modelo experimental de cáncer de mama en donde se evalúan los efectos de la terapia combinada de antiprogestágenos e inhibidores de PI3K. Analizando variantes tumorales que representan distintos estadios dentro de la progresión del cáncer de mama (desde la hormono-dependencia a la resistencia endocrina), comprobamos que los agentes MFP y WORT poseen mecanismos diferenciales de acción, tanto en el parénquima como en el estroma tumoral. Dichos mecanismos posibilitan en ciertas variantes que la combinación de ambos sea más efectiva que el tratamiento con cada droga por separado, y que en otras variantes, en cambio, la combinación no sea beneficiosa. De acuerdo a la creciente importancia que ha adquirido el microambiente tumoral tanto en la regulación del crecimiento de los tumores como en la respuesta a las terapias, demostramos que en algunas de las variantes analizadas el estroma tumoral juega un papel activo durante la regresión inducida por el tratamiento endocrino y por la inhibición de PI3K. Los resultados obtenidos en el modelo experimental plantean la posibilidad de que la expansión del compartimiento estromal que se asocia tempranamente con la regresión de los tumores (fenómeno definido como reacción estromal), actúe como un indicador de la eficacia de la terapia antitumoral utilizada. Hemos demostrado también que el modelo de cultivo tridimensional en Matrigel es una herramienta eficaz para evaluar in vitro la sensibilidad diferencial de las células epiteliales derivadas de las variantes tumorales a los distintos agentes ensayados, lo que apoya el uso de este sistema para predecir el comportamiento de las células neoplásicas frente a distintos compuestos antitumorales. En conclusión, los resultados obtenidos en este trabajo de Tesis contribuyen al estudio de la terapia endocrina del cáncer de mama, presentando evidencia que se suma a los trabajos que plantean el uso de los antiprogestágenos en el tratamiento de esta patología, y demostrando por primera vez el beneficio potencial, para determinado grupo de tumores, de una terapia combinada de antiprogestágenos con inhibidores de vías de señalización como la vía PI3K/Akt. Abstract: The morphological and phenotypic similarities among the most frequent mammary carcinomas in women (ductal carcinomas, positive for estrogen (ER) and progesterone receptors (PR)) and the medroxyprogesterone acetate (MPA)- induced mammary tumor model in mice, make this model suitable for the evaluation of mechanisms associated with endocrine treatment (ER and PR antagonists), and protein kinase inhibitors, among others. In this Thesis we evaluated for the first time cellular mechanisms of early tumor regression after antiprogestin therapy in combination with PI3K inhibitors. In light of the current clinical evidence, showing that combination therapies with endocrine agents and PI3K/Akt inhibitors are beneficial for ER and PR positive patients, and based on recent studies pointing to PR as a valid target for breast cancer treatment, we believe that these results may shed light to choose which patients may be selected for this kind of adjuvant therapies. Evaluating tumor variants from the MPA–induced breast cancer model that represent different stages of breast cancer progression (from hormone dependency to endocrine resistance), we found that the antiprogestin mifepristone (MFP) and the PI3K inhibitor, wortmannin (WORT) inhibit tumor growth affecting both the parenchyma and the tumor stroma. However, different type of tumors showed a differential sensitivity to both agents and their combination resulted to be effective in certain tumor variants and not in others. In agreement with the increasing evidence supporting that the tumor microenvironment exerts a pivotal role regulating tumor growth and influencing their response to therapies, we have demonstrated that tumor stroma plays an active role during the early stages of endocrine and PI3K inhibition-induced regression. According to our results, stromal reaction (defined as the increase in the stromal compartment that occurs during tumor regression), may act as a biological marker for antitumor therapy’s effectiveness. Furthermore, we have also confirmed that three-dimensional culture on Matrigel is an effective tool to evaluate in vitro, tumor cell differential responses to several agents, and thus supports the use of this system to predict neoplastic cell behavior after anti-tumor treatment. In conclusion, this Thesis contributes to the study of endocrine therapy, by presenting evidence that supports the use of antiprogestins in breast cancer treatment, and by showing for the first time the potential benefit in certain type of tumors of combined therapies of antiprogestins together with signaling pathway inhibitors such as those of the PI3K/Akt pathway.
Cita tipo APA: Polo, María Laura . (2014). Caracterización de los mecanismos celulares involucrados en la regresión tumoral según la dependencia hormonal de los tumores mamarios. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5486_Polo.pdf Cita tipo Chicago: Polo, María Laura. "Caracterización de los mecanismos celulares involucrados en la regresión tumoral según la dependencia hormonal de los tumores mamarios". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5486_Polo.pdf |
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Ojea, Ignacio. "Algunos problemas de análisis sobre cúspides exteriores" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita
Cita tipo APA: Ojea, Ignacio . (2014). Algunos problemas de análisis sobre cúspides exteriores. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5472_Ojea.pdf Cita tipo Chicago: Ojea, Ignacio. "Algunos problemas de análisis sobre cúspides exteriores". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5472_Ojea.pdf |
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Nussenbaum, Ana Laura. "Aislamientos de Beauveria bassiana y Metarhizium anisopliae virulentos para el control del picudo del algodonero, Anthonomus grandis (Coleoptera: Curculionidae)" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El picudo del algodonero, Anthonomus grandis Boheman (Coleoptera: Curculionidae), es considerado una de las plagas más importantes de algodón en América, presente en Argentina desde 1993. El objetivo general del trabajo fue seleccionar aislamientos nativos de los hongos entomopatógenos Beauveria bassiana y Metarhizium anisopliae (Ascomycota: Hypocreales) virulentos para el picudo del algodonero. Para ello se obtuvieron aislamientos nativos provenientes de muestras de suelo e insectos, así como cepas pertenecientes a la micoteca del Laboratorio de Hongos Entomopatógenos (IMYZA, INTA). Se evaluó la patogenicidad y virulencia de 28 aislamientos de M. anisopliae y 66 aislamientos de B. bassiana sobre adultos de picudo y se estudiaron los efectos subletales sobre la alimentación y oviposición producidos por estos hongos. Por otro lado, fueron evaluadas distintas características de los aislamientos seleccionados, como la compatibilidad con los insecticidas químicos utilizados en campo, el efecto conjunto de los insecticidas químicos y los aislamientos sobre la plaga, y la tolerancia a altas temperaturas de los aislamientos. Finalmente, se evaluaron parámetros de producción masiva de conidios de los aislamientos seleccionados y se realizaron evaluaciones en campo de las formulaciones experimentales. Los aislamientos de M. anisopliae (Ma 50 y Ma 20) resultaron los más virulentos donde la concentración letal media fue 1,13 x 10*7 y 1,20 x 10*7 conidios/ml, respectivamente. Además, se encontró una disminución en la alimentación de las hembras infectadas con los aislamientos Ma20 y Bb23, y una disminución de la oviposición con Ma 20. Por otro lado, los aislamientos de M. anisopliae evaluados fueron compatibles con los insecticidas piretroides y más tolerantes a temperaturas altas. Los resultados obtenidos indican la posibilidad de utilizar M. anisopliae como agente de control microbiano incluyéndolo en un programa de Manejo Integrado del Picudo del Algodonero. Abstract: The boll weevil, Anthonomus grandis (Coleoptera: Curculionidae), is the main pest of cotton in the Americas, present in Argentina since 1993. The aim of this work was to select native isolates of the entomopathogenic fungi Beauveria bassiana and Metarhizium anisopliae (Ascomycota: Hypocreales), both virulent against A. grandis. The native isolates were obtained from soil and insects, and from the Laboratory of Entomopathogenic Fungi collection (IMYZA, INTA). Screening was performed to evaluate the pathogenicity of 28 isolates of M. anisopliae and 66 isolates of B. bassiana against boll weevil adults. To select the isolates, LC50 values of the most virulent isolates were calculated, and the effects of these isolates on the feeding and reproductive behavior of the adults were evaluated. In addition, different characteristics of the selected isolates were evaluated, which included compatibility between the isolates and insecticides, the combined effect of insecticides and isolates on boll weevil adults, and high temperatures tolerance of the isolates. Finally, massive production parameters were calculated for the selected isolates, and formulations were applied in cotton crops. Isolates Ma 50 and Ma 20 (M. anisopliae) were the most virulent against A. grandis and their LC50 values were 1.13 x 10*7 and 1.20 x 10*7 conidia/ml, respectively. Also, we found a decrease on the feeding behavior caused by infected females treated with Ma 20 and Bb 23 isolates, and the decrease of the eggs laying of females treated with Ma 20 isolate. In addition, these isolates were compatible with pyrethroid insecticides, and showed tolerance to higher temperatures. In summary, these results indicate the possibility of the use of M. anisopliae as a microbiological control agent against boll weevils, included in an Integrated Pest Management program.
Cita tipo APA: Nussenbaum, Ana Laura . (2014). Aislamientos de Beauveria bassiana y Metarhizium anisopliae virulentos para el control del picudo del algodonero, Anthonomus grandis (Coleoptera: Curculionidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5511_Nussenbaum.pdf Cita tipo Chicago: Nussenbaum, Ana Laura. "Aislamientos de Beauveria bassiana y Metarhizium anisopliae virulentos para el control del picudo del algodonero, Anthonomus grandis (Coleoptera: Curculionidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5511_Nussenbaum.pdf |
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Nobua Behrmann, Beatriz E.. "Interacciones tróficas entre dos especies simpátricas de hormigas cortadoras y el ensamble de plantas en el Monte central" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Aunque la disponibilidad de agua es considerada el principal factor que regula a las comunidades de plantas en los ecosistemas áridos, las interacciones con los herbívoros también pueden jugar un rol importante. En ecosistemas neotropicales, el gremio de los herbívoros se caracteriza por la ausencia de grandes ungulados y la presencia destacada de las hormigas cortadoras. Estas hormigas pueden interactuar de diversas maneras con la comunidad de plantas, generando cambios en su dinámica y composición. El objetivo de este trabajo fue analizar los efectos recíprocos entre las plantas y las hormigas cortadoras en el Monte central, y en particular las posibles consecuencias de la acción de las hormigas sobre la estructura y la dinámica de las comunidades de plantas. Para ello se estudiaron diferentes aspectos de la ecología trófica de Acromyrmex lobicornis y Acromyrmex striatus. Ambas especies forrajean activamente desde la primavera hasta el otoño, pero A. lobicornis es mayoritariamente nocturna y A. striatus es exclusivamente diurna. En general, A. lobicornis forrajea a temperaturas menores que A. striatus sin superponerse en sus temperaturas de forrajeo óptimo, lo cual podría deberse a que las especies tienen distintos rangos de tolerancia a la temperatura o a que presentan cierto grado de evitación. Ambas muestran una dieta generalista y oportunista, cosechando un alto porcentaje de las especies de plantas disponibles en su entorno. La composición de su dieta y su grado de selectividad depende principalmente de las variaciones estacionales e interanuales en la disponibilidad de los recursos. A nivel de colonia, A. lobicornis cosecha mucho más material vegetal que A. striatus, aunque esta diferencia no se observa a nivel poblacional ya que las colonias de A. striatus son mucho más abundantes. Cada especie llega a cosechar 70–72 Kg/ha·año, o, entre ambas, el ~20% de la productividad primaria en el área de estudio. Estas hormigas también cosechan una gran cantidad de frutos y pueden actuar como dispersoras de semillas. En el caso del arbusto Condalia microphylla, no solo depositan las semillas lejos de la planta madre y en micrositios favorables sino que, además, estas semillas dispersadas tienen mayor capacidad de germinación que las que no fueron manipuladas por las hormigas. Este estudio muestra que en estos ecosistemas desérticos las interacciones entre las hormigas cortadoras y las plantas son frecuentes e intensas, y pueden jugar un rol importante en la dinámica de las comunidades de plantas. Abstract: Though water availability is considered the main factor regulating desert plant communities, interactions with herbivores may also play an important role in arid ecosystems. Herbivore’s guild in the Neotropics is characterized by the absence of big ungulates, and the presence of leafcutter ants. These ants interact in diverse ways with the plant community, generating changes in its dynamics and composition. The goal of this work was to analyze the reciprocal effects among plants and leaf-cutter ants in the central portion of the Monte desert, and particularly the possible consequences of ants’ activity on the structure and dynamics of desert plant communities. To do so, I studied different aspects of Acromyrmex lobicornis and Acromyrmex striatus’ trophic ecology. Both ant species actively forage from spring to autumn, but A. lobicornis is mostly noctunal, while A. striatus is exclusively diurnal. In general, A. lobicornis forages at lower temperatures than A. striatus, and doesn’t overlap in its optimal foraging temperatures, which might relate to differences in their thermal tolerance ranges or certain degree of avoidance to each other. Both species show a generalist and opportunist diet and harvest a high percentage of the available plants. Diet composition and degree of selectivity mostly depends on seasonal and inter-annual variations of resource availability. At the colony level, A. lobicornis harvests much more vegetation than A. striatus, though this difference can’t be found at the population level because A. striatus colonies are more abundant. Each species can harvest 70–72 Kg/ha·year, or, among both of them, ~20% of primary productivity in the study area. These ants also harvest a large amount of fruits and can act as seed dispersers. In the case of the shrub Condalia microphylla, they not only move the seeds far away from the parental plant and towards favourable microsites, but also they cause the dispersed seeds to germinate more often and faster than the seeds that weren’t manipulated by the ants. This study shows that in desert ecosystem interactions between leaf-cutter ants and plants are frequent and intense, and can play an important role in the dynamics of desert plant communities.
Cita tipo APA: Nobua Behrmann, Beatriz E. . (2014). Interacciones tróficas entre dos especies simpátricas de hormigas cortadoras y el ensamble de plantas en el Monte central. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5456_NobuaBehrmann.pdf Cita tipo Chicago: Nobua Behrmann, Beatriz E.. "Interacciones tróficas entre dos especies simpátricas de hormigas cortadoras y el ensamble de plantas en el Monte central". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5456_NobuaBehrmann.pdf |
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Moschen, Sebastián. "Identificación y caracterización funcional de genes candidatos asociados a la senescencia foliar en girasol basado en perfiles transcripcionales y metabólicos" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El proceso de senescencia en plantas es un mecanismo complejo controlado por múltiples variables genéticas y ambientales que condicionan el rendimiento de los cultivos. En el caso del girasol, el segundo cultivo oleaginoso en importancia económica para nuestro país, se trata de un proceso con impacto económico que interviene en la brecha existente entre el rendimiento potencial y el rendimiento real observado, por la mayor o menor oportunidad de las plantas para mantener el sistema fotosintético activo durante periodos prolongados. Los parámetros visuales resultan tardíos para evaluar el desencadenamiento y posterior tasa de evolución de la senescencia foliar. La clorosis, la variación en el contenido de clorofila así como también la necrosis de las hojas, son detectables mucho tiempo después que la señal iniciadora de la senescencia ha sido activada. Este trabajo tuvo como objetivo general el estudio del proceso de senescencia en girasol a través de distintos niveles de organización: ecofisiológico, metabolómico, transcriptómico, culminando con la integración de los diversos enfoques ómicos mediante una aproximación de biología de sistemas, con el objetivo final de identificar potenciales biomarcadores asociados al proceso de senescencia en girasol. Se condujeron distintos ensayos que fueron realizados tanto a campo, en la Estación Experimental INTA-Balcarce como en invernáculo, en el Instituto de Biotecnología INTA Castelar, para evaluar el progreso del proceso de senescencia tanto en condiciones naturales como controladas. Asimismo se evaluó la respuesta frente a condiciones de restricción hídrica impuesta en distintas etapas del desarrollo de las plantas. Se realizaron evaluaciones ecofisiológicas relacionadas con el avance de la senescencia, a través de la medición de variables como contenido de clorofila, azúcares solubles y nitrógeno total de hojas, mediciones a campo de área foliar verde, SPAD, intercepción de la radiación y materia seca por órganos, mediante las cuales fue posible evaluar la evolución del proceso en las diferentes hojas, en condiciones naturales de cultivo. Adicionalmente, se llevó adelante un análisis de los perfiles metabólicos utilizando técnicas de cromatografía gaseosa acoplada a espectrometría de masa (GC-MS) que permitió la optimización del protocolo de la extracción de metabolitos de hojas de girasol, y la detección de aproximadamente 60 metabolitos primarios incluyendo distintos aminoácidos, ácidos orgánicos, azúcares y azucares alcohol. Asimismo se optimizó la tecnología de cromatografía iónica, mediante la cual se cuantificaron diferentes nutrientes iónicos relevantes durante el proceso de senescencia tales como nitratos, sulfatos, fosfatos entre otros. En forma paralela se llevó a cabo un estudio a nivel transcriptómico considerando tanto estrategias de genes candidato, mediante la búsqueda de secuencias putativamente ortólogas a girasol asociadas a senescencia en especies modelo, como el análisis concertado de expresión génica utilizando una micromatriz de oligonucleótidos desarrollada para esta especie. A partir del análisis estadístico de los datos obtenidos con la micromatriz, se realizó un análisis de enriquecimiento funcional sobre el total de los unigenes que mostraron un comportamiento diferencial y significativo para las distintas condiciones evaluadas, utilizando la metodología de Gene Set Analysis basado en modelos de regresión logística. De este modo se identificaron las diferentes categorías funcionales asociadas a bloques de genes con un patrón de expresión similar. La búsqueda de genes candidato se profundizó con la consulta de bases de datos de genes asociados a senescencia (SAGs del inglés: Senescence Associated Genes), así como también sobre aquellos genes con dominios de factores de transcripción como posibles desencadenantes de las cascadas de señalización de este proceso. Por último, se realizó la integración de los datos obtenidos a partir de distintas estrategias (fisiológicas, metabolómicas y transcriptómicas) utilizando una aproximación basada en biología de sistemas con el objetivo de identificar biomarcadores asociados a la senescencia en girasol. Para este fin se usaron los programas Paintomics 2.0 (http://www.paintomics.org) (García-Alcalde y col 2011) y Mapman (http://mapman.gabipd.org/) (Thimm y col 2004) que fueron adaptados para su uso con datos provenientes de esta especie. Los resultados obtenidos a partir de la integración de datos mostraron una correspondencia entre los cambios detectados a través de los diferentes niveles analizados. A partir de una visión general del metabolismo celular se pudo observar una disminución de la actividad fotosintética y el crecimiento celular, y un incremento en el metabolismo de sacarosa, ácidos grasos, nucleótidos y aminoácidos así como también en aquellos procesos relacionados al reciclado de nutrientes. En particular, los factores de transcripción con dominios NAC, AP2- EREBP y MYB mostraron altos niveles de expresión y mayores niveles de correlación y co-expresión, puntualizándolos como importantes biomarcadores candidatos para la ejecución del programa de senescencia en girasol. Los resultados de este trabajo permitieron contribuir al conocimiento de los mecanismos moleculares involucrados en el desencadenamiento y evolución del proceso de senescencia en girasol, así como a la selección robusta de genes involucrados en las distintas etapas del desarrollo del proceso, especialmente factores de transcripción. Estos últimos fundamentalmente, podrán ser validados a futuro sobre materiales de mejora para ser incorporados a los programas de mejoramiento asistido de este cultivo de gran importancia agronómica para nuestro país. Finalmente, las estrategias, metodologías, herramientas y conocimientos desarrollados en esta tesis contribuyen al desarrollo del cultivo y promueven la adopción de la genómica y la post-genómica en las distintas etapas del mejoramiento de girasol. Abstract: Leaf senescence is a complex mechanism controlled by multiple variables, either from genetical and environmental origin that has strong impact on crop yield. In sunflower, the second economically important oil crop in Argentina, the senescence process has an economic impact involved in the gap between potential and real yield observed due to the incapacity of the plants in keeping their green leaf area for longer periods. Visual parameters are belated to assess the onset and the evolution of leaf senescence. Chlorosis, variation in chlorophyll content as well as leaf necrosis is detected long after the triggering signal has been activated. The main objective of this work was the study of the senescence process in sunflower through different organization levels: ecophysiological, metabolomic, transcriptomic, and finally an integration of the different omics strategies using a systems biology approach, in order to identify potential biomarkers associated to leaf senescence in sunflower. Different experiments were conducted in both, field and greenhouse condition at INTA-Balcarce Experimental Station and at the Biotechnology Institute, INTA Castelar respectively, assessing the senescence process under natural and controlled conditions. Response to water restrictions imposed at different plant development stages was also evaluated. Ecophysiological assessments related to the senescence progress were performed through different measurements such as chlorophyll, soluble sugars and total leaf nitrogen content, field measurements of green leaf area, SPAD, interception of radiation and dry material by organ, allowing the evaluation of the senescence process progression in different leaves growing under natural field conditions. Additionally, metabolic profiles analysis was performed by using Gas Chromatography - Mass Spectrometry technique (GC-MS), allowing the metabolite extraction protocol optimization in sunflower leaves and the detection of approximately 60 primary metabolites, including different amino acids, organic acids, sugars and sugar alcohol. Likewise, it was possible to optimize the ion chromatography technology, leading to the quantification of relevant ionic nutrients content such as nitrates, sulphates, phosphates and others, along the senescence process. In parallel, transcriptomic studies were performed considering both, candidate gene strategies by searching of sunflower orthologous gene sequences reported as senescence associated in model species, as well as through a concerted expression analysis using a customized oligonucleotide microarray developed for this species. Statistical functional enrichment analysis was conducted over the complete significant unigenes set derived from the microarray assay, for each evaluated conditions, using Gene Set Analysis methodology based on logistic regression models. In this way, different functional categories were identified for gene clusters with similar expression patterns. Moreover, the exploration for candidate genes was deepened by searching into the senescence associated gene databases for model species, as well as by identification of putative triggers of the signalling pathways leading to senescence in sunflower among the transcription factor domains gene database. Finally, a systems biology approach was achieved in order to integrate the information from the different physiological, metabolomic and transcriptomic strategies with the aim to identify biomarkers associated with leaf senescence in sunflower. These analyses were performed using Paintomics 2.0 (http://www.paintomics.org) (Garcia-Mayor et al 2011) and Mapman software (http://mapman.gabipd.org/) (Thimm et al 2004) that were adapted for sunflower data. These results showed a correspondence between the changes detected by the different strategies. Through a metabolism overview, a decrease of photosynthetic activity and cell growth was detected. Moreover, sucrose, fatty acids, nucleotides and amino acids metabolism as well as those pathways related to nutrient recycling processes showed an up-regulation during leaf development. In particular, NAC, AP2-EREBP and MYB transcription factors showed high expression levels and higher levels of correlation and co-expression making them important candidates biomarker in the execution of the senescence program in sunflower. The results of this work contributed to the knowledge of the molecular mechanisms involved at the onset and evolution of the senescence process in sunflower as well as to the identification of robust candidate genes involved in the different developmental stages of this process, especially transcription factors. These genes could be further validated on breeding materials to be incorporated into assisted breeding programs for this agronomic important crop for our country. Furthermore, the strategies, methodologies, tools and knowledge developed in this thesis, contribute to the crop development and promote the adoption of genomics and post-genomics in the different stages of sunflower breeding.
Cita tipo APA: Moschen, Sebastián . (2014). Identificación y caracterización funcional de genes candidatos asociados a la senescencia foliar en girasol basado en perfiles transcripcionales y metabólicos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5484_Moschen.pdf Cita tipo Chicago: Moschen, Sebastián. "Identificación y caracterización funcional de genes candidatos asociados a la senescencia foliar en girasol basado en perfiles transcripcionales y metabólicos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5484_Moschen.pdf |
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Mori Sequeiros Garcia, María de las Mercedes. "Expresión y función de las MAP quinasas fosfatasas 1 y 3 (MKP-1 y MKP-3) en células de Leydig" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: MKP-3 es una enzima inducible sólo por estímulos proliferativos que desfosforila específicamente a ERK1/2. En cambio MKP-1 desfosforila diferentes MAPKs y se induce por diversos tipos de estímulos. En este trabajo se analizaron aspectos regulatorios y funcionales de ambas enzimas en células de Leydig MA-10 bajo la estimulación del receptor de LH (RLH) con hCG o en presencia del derivado del segundo mensajero correspondiente, 8Br-AMPc. Este estudio pone en evidencia, por primera vez, que la activación del RLH regula la expresión de MKP-3. hCG y 8Br-AMPc aumentan los niveles de MKP-3 activando la expresión génica por eventos dependientes e independientes de ERK1/2 y promoviendo modificaciones post-traduccionales que estabilizan la proteína. Se demostró que la activación del RLH conduce a la inducción p21, un inhibidor de la proliferación, y que este efecto es dependiente de MKP-3. Respecto de la enzima nuclear MKP-1, se determinó que el AMPc regula su estabilidad por múltiples fosforilaciones, involucrando la fosforilación por ERK1/2 en sitios consenso relacionados con la estabilidad (S359 y S364) y con la inestabilidad (S296 y S323) de la proteína. Se demostró que la inducción del factor de transcripción NUR77 por 8Br-AMPc, factor que participa en expresión de genes cruciales para la esteroidogénesis, es dependiente de ERK1/2 y se determinó que MKP-1 y sus modificaciones post-traduccionales impactan en la inducción de NUR77 por 8Br-AMPc. Se concluye que la inducción de MKP-1 y MKP-3 por estimulación del RLH modula las acciones de LH sobre la esteroidogénesis y la proliferación de las células de Leydig. Abstract: MKP-3 is an enzyme inducible only by proliferative stimuli and involved specifically in ERK1/2 dephosphorylation. In contrast, MKP-1 is an enzyme inducible by different stimuli and able to dephosphorylate different MAPKs. This work analyzes regulatory and functional aspects of both phosphatases in MA-10 Leydig cells under the stimulation of the luteinizing hormone receptor (LHR) with human chorionic gonadotropin hormone (hCG) or a permeable derivative of the corresponding second messenger (8Br-cAMP). The present study demonstrates, for the first time, the expression of MKP-3 by the activation of LHR. hCG and cAMP increase MKP-3 levels by activating gene expression –through ERK1/2-dependent and independent events- and promoting posttranslational modifications that increase protein stabilization. This work also demonstrates that the activation of LHR leads to the induction of p21, an inhibitor of cell proliferation, by a mechanism involving MKP-3 expression. Regarding the nuclear enzyme MKP-1, this work shows that cAMP regulates MKP-1 half life by ERK1/2-mediated phosphorylation in sites involved in protein stabilization (S359 and S364) and destabilization (S259 and S263). It is also established that transcription factor NUR77, whose action is essential for the expression of crucial steroidogenic genes, is cAMP-induced by an ERK-dependent mechanism. In line with this finding, this study also demonstrates that MKP-1 and its post-translational modifications impact on MKP-3 expression. It is concluded that the induction of MKP-1 and MKP-3 by LHR activation modulates LH actions on steroidogenesis and proliferation of Leydig cells.
Cita tipo APA: Mori Sequeiros Garcia, María de las Mercedes . (2014). Expresión y función de las MAP quinasas fosfatasas 1 y 3 (MKP-1 y MKP-3) en células de Leydig. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5488_MoriSequeirosGarcia.pdf Cita tipo Chicago: Mori Sequeiros Garcia, María de las Mercedes. "Expresión y función de las MAP quinasas fosfatasas 1 y 3 (MKP-1 y MKP-3) en células de Leydig". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5488_MoriSequeirosGarcia.pdf |
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Morandeira, Natalia Soledad. "Tipos funcionales de plantas en humedales de la planicie de inundación del Bajo Río Paraná (Entre Ríos, Argentina) y su observación con datos polarimétricos de radar" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los humedales subtropical-templados de la planicie de inundación del Bajo Río Paraná están sometidos a un régimen fluvial y presentan mosaicos de vegetación herbácea. En un sector de 3650 km2 de extensión, encontré 124 especies de plantas herbáceas y pocas especies dominantes por sitio. Identifiqué 26 grupos florísticos distribuidos en zonas de vegetación con límites bien definidos. A partir de una matriz de 15 rasgos funcionales, clasifiqué a 95 poblaciones (de 44 especies) en 12 Tipos Funcionales de Plantas (TFP). Cada TFP tendría una particular respuesta a las condiciones ambientales de acuerdo a su estrategia de vida. El nicho de once de las especies dominantes, así como de dos de los TFP, estaba asociado con la posición topográfica, la unidad geomorfológica, las condiciones edáficas y el funcionamiento hidrológico. Analicé y discutí la relación entre la diversidad específica, la diversidad funcional y un gradiente de restricciones ambientales. Para discriminar áreas dominadas por distintos TFP, realicé clasificaciones con datos polarimétricos de los satélites de radar de apertura sintética ALOS/PALSAR-1 (Banda L) y RADARSAT-2 (Banda C). Las clasificaciones no supervisadas Wishart, basadas en descomposiciones de las matrices de coherencia y en los parámetros H y Alfa, presentaron mayor exactitud que las clasificaciones supervisadas, especialmente para ángulos de incidencia rasantes (43º, en comparación con 27º) y para las escenas de Banda C. Los mapas con los que estimé la cobertura de los principales TFP permitieron establecer un nexo entre la información recabada a escala local y su expresión a escala de paisaje. La estrategia de vida ruderal era aquella con mayor cobertura a escala de paisaje. En el marco de las reglas de ensamble y filtros ambientales, discutí la respuesta de las especies dominantes y de los TFP frente a las condiciones ambientales de los humedales de la planicie de inundación. Abstract: The subtropical-temperate wetlands of the Lower Paraná River floodplain are subjected to a fluvial hydrological regime and have mosaics of herbaceous vegetation. In an area of 3650 km2, I found 124 herbaceous plant species and few dominant species per site. I identified 26 floristic groups, distributed in vegetation zones with well defined limits. I constructed a matrix of 15 functional traits and classified 95 populations (belonging to 44 species) into 12 Plant Functional Types (PFT). Each PFT would have a particular response to the environmental conditions according to its life strategy. The distribution of eleven of the dominant species, as well as the distribution of two of the PFT and of the mean values of some of the traits was related to the topographical position, the geomorphological unit, the soil features and the hydrological functioning. I analyzed and discussed the relation between species diversity, functional diversity and a gradient of environmental constraints. To discriminate areas dominated by different PFT, I carried out classifications with polarimetric data from the Synthethic Aperture Radar systems ALOS/PALSAR-1 (L-Band) and RADARSAT-2 (C-Band). The unsupervised Wishart classifications based on the coherency matrices and on the H and Alpha parameters had higher accuracy than supervised classifications, especially for shallow incidence angles (43º, in comparison with a steeper angle of 27º) and for C Band. The maps that estimate the coverage of the main PFT allowed me to link the information that I recorded at local scale with their pattern at landscape scale. The ruderal strategy had the highest coverage at landscape scale. In the framework of assembly rules and environmental filters, I discussed the response of dominant species and of the PFT to the environmental conditions of the floodplain wetlands.
Cita tipo APA: Morandeira, Natalia Soledad . (2014). Tipos funcionales de plantas en humedales de la planicie de inundación del Bajo Río Paraná (Entre Ríos, Argentina) y su observación con datos polarimétricos de radar. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5490_Morandeira.pdf Cita tipo Chicago: Morandeira, Natalia Soledad. "Tipos funcionales de plantas en humedales de la planicie de inundación del Bajo Río Paraná (Entre Ríos, Argentina) y su observación con datos polarimétricos de radar". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5490_Morandeira.pdf |
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Luna, Diego Alejandro. "Estudio de ondas de gravedad mediante radio ocultamientos GPS: Limitaciones e incertidumbres" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El radio ocultamiento GPS (RO GPS) es una técnica de sensado remoto para la medición de propiedades físicas de la atmósfera. En este trabajo se estudiaron las limitaciones de las mediciones de RO para evaluar la actividad de las ondas de gravedad atmosféricas (OG). También se presenta un estudio del rango de variabilidad de actividad ondulatoria aplicado específicamente en la zona de la Patagonia y Península Antártica, por ser una región que exhibe una gran intensidad. Esto permite por lo tanto comparar la importancia de las incertidumbres de medición frente a los rangos típicos de variación de la actividad ondulatoria. La medición por RO GPS no es una medición puntual sino un promedio sobre una gran distancia horizontal y en una dada dirección. Para analizar las consecuencias de este promediado espacial en el estudio de OG se hizo uso de la alta densidad de eventos de RO en el lado Este de la cordillera de los Andes durante los meses iniciales de la misión COSMIC (Constellation Observing System for Meteorology, Ionosphere and Climate). Esta zona es conocida por su alta actividad ondulatoria. Se eligieron dos pares de perfiles de temperatura, ambos conteniendo dos radio ocultamientos cercanos en tiempo y espacio. Un par mostró diferencias significativas entre perfiles de temperatura. Se efectuaron simulaciones de mesoescala para entender esta discrepancia. La misma fue atribuida a la presencia de estructuras inhomogéneas en la atmósfera, causadas por OG. La actividad ondulatoria suele cuantificarse mediante el cálculo de la energía potencial (Ep) a través de la integración del cociente entre temperatura de fondo y perturbación (ondas), entre dos altitudes. En este estudio se analizan y cuantifican las contribuciones de diferentes parámetros y variables en la incertidumbres del cálculo de la Ep en la baja estratósfera en perfiles de medición de RO GPS. En particular, se utilizó el método de Monte Carlo para estudiar la incertidumbre en la Ep debida a diferentes distribuciones de errores en la temperatura. Se estudió la dependencia temporal y espacial de la actividad ondulatoria en la baja estratósfera sobre el extremo sur de la Cordillera de los Andes y la Península Antártica. El análisis cubrió los años 2006 a 2011. Se encontraron diferencias significativas entre las actividades mensuales, en concordancia con estudios previos realizados con otros instrumentos y en otros períodos. Las distribuciones de probabilidad de Ep se analizaron mediante tests de Kolmogorov-Smirnov. Dado que las distribuciones de Ep varían según la época del año y no poseen simetría respecto de la media, se propone el uso de la mediana de los valores de Ep como cuantificador de la actividad ondulatoria. Abstract: GPS Radio occultation (GPS RO) is a remote sensing technique used for measuring the physical properties of the atmosphere. In the present work, the limitations of RO measurements to evaluate atmospheric gravity wave (GW) activity have been studied. Also, an analysis of the variability range of GW activity applied over the Patagonia and Antarctic Peninsula, is presented. This region has been chosen due to its high activity. This fact allows a comparison between measurement uncertainties and typical ranges of variability of GW activity. A GPS RO measurement is the result of an average over a great horizontal distance in a given direction. In order to analize the impact of this average on the GW studies, it has been taken advantage of the anomalous high density of RO events at the eastern side of the highest Andes Mountains during the initial months of the mission COSMIC (Constellation Observing System for Meteorology, Ionosphere and Climate). This zone is known for its high GW activity. Two pairs of RO, both containing two occultations that occurred close in space and time, were chosen. One pair showed significant differences between both temperature profiles. Numerical simulations with a mesoscale model were performed, in order to understand this discrepancy. It has been attributed to the presence of a horizontal inhomogeneous structure caused by GW. GW activity is usually quantified by calculating the potential energy (Ep) through the integration of the ratio of perturbation (waves) and background temperatures between two given altitudes. In this study, the contributions of different parameters and variables to the uncertainty in the calculation of Ep in the lower stratosphere via GPS RO measurements were investigated and quantified. In particular, a Monte Carlo method was used to evaluate the uncertainty that results from different GPS RO temperature error distributions. The seasonal and geographical behaviour of GW activity in the lower stratosphere over the southernmost Andes mountains and their prolongation in the Antarctic Peninsula was studied. The study covered the years 2006 to 2011. Significant variation of monthly activity was found, in agreement with results from other instruments and other periods. Probability distributions of Ep were studied using Kolmogorv-Smirnov tests. As the distributions present monthly variations and are not symmetrical around the mean, the median of the Ep values was proposed as an activity quantifier.
Cita tipo APA: Luna, Diego Alejandro . (2014). Estudio de ondas de gravedad mediante radio ocultamientos GPS: Limitaciones e incertidumbres. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5463_Luna.pdf Cita tipo Chicago: Luna, Diego Alejandro. "Estudio de ondas de gravedad mediante radio ocultamientos GPS: Limitaciones e incertidumbres". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5463_Luna.pdf |
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Lucchina, Luciana. "Alteraciones periféricas y centrales en la respuesta inflamatoria en un modelo de autismo en ratón" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El autismo es un desorden severo del desarrollo neural que se encuentra principalmente caracterizado por un impedimento sostenido en la interacción social, habilidades comunicativas reducidas y por patrones de comportamiento estereotipados o restrictivos. Existen cada vez más evidencias clínicas y experimentales que relacionan alteraciones en el sistema inmune con la patogénesis del desorden de espectro autista (DEA). Los individuos autistas muestran en diversas etapas de su desarrollo signos de neuroinflamación, respuestas inflamatorias alteradas y anormalidades inmunes. El objetivo general de esta tesis fue el de estudiar el rol que juega la respuesta inflamatoria/glial del sistema nervioso central en la manifestación de comportamientos relacionados con el autismo. A tal fin utilizamos ratones expuestos en la preñez a 600 mg/kg de ácido valproico (VPA600), los cuales muestran deficiencias en la interacción social y han sido propuestos como un posible modelo de autismo. En este trabajo no sólo confirmamos el fenotipo en una filial 1 (F1) de dos cepas endocriadas de ratón, sino que extendimos el análisis conductual describiendo que los animales expuestos a VPA muestran niveles aumentados de comportamientos relacionados con la ansiedad. Evaluamos en estos animales la respuesta periférica y central a un estímulo inflamatorio, así como el estado basal de activación glial. Evidenciamos signos de activación glial crónica tanto en el hipocampo como en el cerebelo de los animales VPA600, así como una respuesta exacerbada al ser expuestos a un estímulo inflamatorio periférico (lipopolisacárido intraperitoneal, LPS): los animales VPA600 muestran niveles más altos de corticosterona en sangre y un aumento en los niveles de expresión de citoquinas pro-inflamatorias en el bazo respecto de animales control. Sumado a esto, luego del estímulo con LPS los VPA600 muestran signos de neuroinflamación: tienen mayor número de células de la microglia en el hipocampo y exhiben mayores niveles de citoquinas pro-inflamatorias en el cerebelo. A fin de evaluar la posible relación causal entre la neuroinflamación observada en el cerebro adulto de los animales expuestos a VPA y la disminución en la interacción social, inyectamos LPS directamente en el lobulillo VI-VII del cerebelo. Al evaluar el comportamiento a las 24 horas, observamos una disminución en la interacción social, acompañada de una marcada neuroinflamación. Los resultados que se presentan demuestran, por un lado, una neuroinflamación basal y una respuesta inflamatoria alterada en el modelo VPA de autismo y, por otro, sugieren que la inflamación en una región específica del cerebelo puede modular los niveles de interacción social. Teniendo ambas cosas en cuenta, proponemos a este modelo como una herramienta útil para evaluar la contribución de la inflamación al desarrollo de los comportamientos relacionados con el autismo. Consideramos que estos estudios contribuirán a dilucidar el rol de las desregulaciones inflamatorias observadas en individuos con ASD. Abstract: Autism is a severe neurodevelopmental disorder, characterized by impairment in social interactions, communication deficits and restricted repetitive and stereotyped interests and behaviors. There are clinical and experimental evidences linking alterations in the immune system and the pathogenesis of autism spectrum disorder (ASD). Autistic individuals show signs of neuroinflammation, altered inflammatory responses and immune abnormalities. The main aim of this thesis was to study the role of the inflammatory/glial response of the central nervous system on the manifestation of autism-related behaviors. To this aim, we used mice prenatally exposed to 600 mg/kg valproic acid (VPA600), which show reduced social interaction in adulthood and have been proposed as a mouse model of autism. In this work, we not only confirmed the phenotype in a F1 obtained from two inbred mouse strains, but we also extended the behavioral analysis describing that animals prenatally exposed to VPA also show increased anxiety-related behaviors. In these animals we evaluated the peripheral and central response to an inflammatory stimulus, along with the basal activation state of the glia. We found evidence of chronic glial activation in the hippocampus and the cerebellum of VPA600 animals, accompanied by an exacerbated response when they were challenged with a peripheral inflammatory stimulus (intraperitoneal lipopolysaccharides, LPS): VPA600 animals secrete more corticosterone to the blood and show increased levels of expression of proinflammatory cytokines in the spleen than control mice. Moreover, after a LPS challenge, VPA600 mice also show signs of increased neuroinflammation compared with control mice: they have more microglial cells in the hippocampus, and they show higher levels of proinflammatory cytokines in the cerebellum. To assess the possible causal relationship between the neuroinflammation observed in the adult brain of VPA-exposed animals and the deficit in social interaction, we injected LPS directly into the lobule VIVII of the cerebellum. 24 hours after injection, we analyzed the behavior and we observed a decrease in social interaction, accompanied by an evident neuroinflammation These results demonstrate, on the one hand, a basal neuroinflammation and altered inflammatory response in the VPA model of autism and, on the other hand, they suggest that inflammation in a specific region of the cerebellum can modulate the levels of social interaction. Taking both into account, we propose this model as a useful tool to evaluate the contribution of inflammation to the development of autism-related behaviors. We believe that these studies will help elucidate the role of the inflammatory alterations observed in individuals with ASD.
Cita tipo APA: Lucchina, Luciana . (2014). Alteraciones periféricas y centrales en la respuesta inflamatoria en un modelo de autismo en ratón. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5506_Lucchina.pdf Cita tipo Chicago: Lucchina, Luciana. "Alteraciones periféricas y centrales en la respuesta inflamatoria en un modelo de autismo en ratón". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5506_Lucchina.pdf |
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López Fernández, María Paula. "Estudio de la muerte celular programada durante el desarrollo de la semilla de quinoa" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En semillas de quinoa, el perisperma, junto al embrión y al endosperma, constituyen los tres compartimentos del grano donde se almacenan las diferentes reservas de la semilla madura. Aun cuando de origen diferente, el perisperma de quinoa comparte con el endosperma amiláceo de las Gramíneas las características de ser el principal tejido reservante de la semilla, estar formado por células muertas a la madurez y almacenar almidón como la principal reserva. En la presente tesis se estudió el desarrollo del perisperma de quinoa y el programa de muerte celular (MCP) que lo afecta. Este análisis se extendió al desarrollo del endosperma, del suspensor, de los tegumentos seminales y del pericarpio. La caracterización de la MCP se evaluó mediante estudios sobre la degradación del ADN nuclear, la expresión de proteasas tipo caspasas y de nucleasas, la endo-reduplicacion y los cambios morfológicos que se producen en el núcleo y en el citoplasma. Adicionalmente se comprobó, mediante técnicas inmunológicas, la presencia de ricinosomas como marcador asociado a la MCP de las células del suspensor y del endosperma predestinadas a morir durante el desarrollo de la semilla; los resultados de estos estudios demostraron la correspondencia entre la presencia de CysEP con la fragmentación del ADN. Como parte del desarrollo del perisperma, se analizaron aspectos relacionados con la síntesis del almidón de reserva en granos compuestos y se identificaron algunas de las enzimas involucradas en su síntesis. A partir de estos estudios fue posible concluir que en la semilla de quinoa: (i) diferentes tipos de muerte celular ocurren de forma simultánea, en los diferentes tejidos; (ii) el perisperma acumula almidón y degenera simultáneamente, durante el desarrollo; (iii) la detección muy temprana de ricinosomas prevé con anticipación la ocurrencia de la MCP; (iv) los granos de almidón compuesto del perisperma se originan en amiloplastos; en los últimos estados del desarrollo, los granos de almidón simple que llenan espacio entre los granos compuestos tienen origen extra- plastídico. Los resultados obtenidos constituyen aportes a la construccion de la sistemática filogenética de la familia Amaranthaceae. Abstract: In mature quinoa seeds, the perisperm is one of the three compartments that store reserves, in addition to the embryo and endosperm. Despite their different origins, the quinoa perisperm and starchy cereal endosperm share some characteristics, such as being the main reserve tissue, formed by dead cells at maturity and having starch as their main reserves. In this thesis we studied quinoa perisperm development and the program cell death (PCD) that affects this tissue. This study included the development of the endosperm, suspensor, seed integuments and pericarp. PCD was assessed by studies of nuclear DNA degradation, expression of caspase like-proteases and nucleases, endoreduplication and morphological changes in the nuclei and cytoplasm. Additionally, using immunological techniques we were able to identify associations between the presence of ricinosomes and other PCD hallmark in suspensor and endosperm cells predestined to die during quinoa seed development. These studies showed the relationship between the presence of CysEP and DNA fragmentation in the endosperm, the only seed tissue that dies without leaving a "corpse". As part of perisperm development, we analyzed aspects related to starch synthesis in simple and compound grains, including the detection of starch synthesis enzymes and starch pattern accumulation, among others, and concluded that: (i) simultaneous different cell death programs occurring simultaneously in different tissues of the same seed (ii) the quinoa perisperm accumulates starch while it degenerates, both processes occurring during quinoa seed development, (iii) the early detection of ricinosomes predicts the occurrence of the PCD; (iv) monitoring the development of perisperm can prove the plastidic and extra-plastic origin of the starch grains. The findings generated here are invaluable as they provide novel insight into the Amaranthaceae, as well as a starting point for phylogenetic studies.
Cita tipo APA: López Fernández, María Paula . (2014). Estudio de la muerte celular programada durante el desarrollo de la semilla de quinoa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5499_LopezFernandez.pdf Cita tipo Chicago: López Fernández, María Paula. "Estudio de la muerte celular programada durante el desarrollo de la semilla de quinoa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5499_LopezFernandez.pdf |
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Lombardi, Leandro Ezequiel. "Una estructura de álgebra asociativa a menos de homotopía en el operad de cactus" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita
Cita tipo APA: Lombardi, Leandro Ezequiel . (2014). Una estructura de álgebra asociativa a menos de homotopía en el operad de cactus. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5468_Lombardi.pdf Cita tipo Chicago: Lombardi, Leandro Ezequiel. "Una estructura de álgebra asociativa a menos de homotopía en el operad de cactus". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5468_Lombardi.pdf |
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Hurtado, Juan. "Selección sexual post-copulatoria en Drosophila: ¿cuántas moscas no nacen por causa de la competencia espermática?" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La competencia espermática (CE), ampliamente extendida entre las especies sexuales cuyas hembras son promiscuas, podría representar potentes presiones selectivas promoviendo conflictos intra e intersexuales. Por ello, es considerada un componente dominante de la selección sexual que teóricamente puede disparar evolución adaptativa rápida en caracteres sexuales. Estos caracteres constituyen potenciales barreras reproductivas entre poblaciones divergentes, por lo que la CE también podría facilitar la especiación. El verdadero rol de la CE en la evolución rápida o la especiación, sin embargo, permanece oculto. ¿Que tan frecuente es la promiscuidad de las hembras como para posibilitar la CE? ¿es la CE una fuerza selectiva intensa? ¿su intensidad varía entre las especies? Frente a estas cuestiones, en este trabajo estudiamos la intensidad de la CE y los factores del sistema de apareamiento (conjunto de comportamientos sexuales y reproductivos) que dan cuenta de ella en las especies hermanas Drosophila buzzatii y D. koepferae. Los análisis de promiscuidad que realizamos con hembras inseminadas en la naturaleza revelaron que la incidencia de paternidad múltiple y, por tanto, el riesgo de CE es mayor en D. buzzatii que en D. koepferae. El número estimado de padres por camada fue 3,57 en D. buzzatii y 1,95 en D. koepferae. En consecuencia, la proporción esperada de hembras inseminadas naturalmente por más de un macho fue 0,89 en D. buzzatii y 0,58 en D. koepferae. Según los experimentos de laboratorio, este patrón podría explicarse tanto por la mayor velocidad con la que las hembras inseminadas de D. koepferae utilizan el esperma almacenado, como por la mayor tasa de reapareamiento de las hembras de D. buzzatii. Además, encontramos que el costo reproductivo que la CE impone sobre los machos es también mayor en D. buzzatii. Cuando una hembra inseminada copula con un segundo macho, la fertilidad del primero se reduce alrededor de 71% en D. buzzatii y sólo 33% en D. koepferae. En vista de las estimaciones del riesgo y del costo reproductivo de la CE, concluimos que la selección sexual postcopulatoria o CE representa una fuerza selectiva intensa en D. buzzatii. En esta última pudimos inferir que el 71% del esperma funcional no alcanza la fertilización a causa de la CE, en tanto que en D. koepferae sólo el 6% del esperma funcional perece a causa de la CE. Frente a estos resultados contrastantes, extendimos los experimentos a una tercera especie cercanamente emparentada, D. antonietae, en la cual estimamos que la CE excluye al 69% del esperma funcional. Creemos entonces que la CE tiene un gran potencial para generar evolución adaptativa ya que, en promedio, uno de cada dos espermatozoides no consigue la fecundación a causa de la CE en estas moscas cactófilas. Abstract: Sperm competition (SC), which is widespread among sexual species with promiscuous females, may represent strong selective pressures by enhancing intra and intersexual conflicts. Therefore, it is considered a major component of sexual selection that can theoretically trigger rapid adaptive evolution in sexual characters. These traits may promote reproductive isolating barriers between divergent populations, thus SC may also facilitate speciation. The actual role of SC on rapid and adaptive evolution or speciation, however, is poorly understood. Are females promiscuous enough to enable SC? Does SC represent powerful selective pressures? Does its intensity vary among species? In the face of these issues, we studied in this thesis the intensity of SC and the mating system factors (sexual and reproductive behaviours) that account for it in the sibling Drosophila buzzatii and D. koepferae. Promiscuity analyses on wild inseminated females revealed that the incidence of multiple paternity and, in turn, SC risk are greater in D. buzzatii than in D. koepferae. The estimated number of sires per brood was 3,57 in D. buzzatii and 1,95 in D. koepferae. Therefore, the expected proportion of wild caught females inseminated by more than one male was 0,89 in D, buzzatii and 0,58 in D. koepferae. Lab experiments indicated that this pattern is accounted for by the fact that D. buzzatii females retain sperm for longer periods and remate more often than D. koepferae females. In addition, we found that SC imposes a greater reproductive cost in D. buzzatii. When sperm of two different males cooccurred inside a female, first mating male fertility was reduced by 71% in D. buzzatii and only 33% in D. koepferae. Based on the estimations of SC risk and cost, we concluded that postmating sexual selection or SC represents a powerful selective pressure in D. buzzatii. In the latter, we infer that 71% of functional sperm do not reach fertilization because of SC, while only 6% of functional sperm fail because of SC in D. koepferae. In view of these contrasting results, we extended the experiments to a third related species, D. antonietae, in which we estimated that SC excludes 69% of functional sperm. Then, we believe that SC has a great potential to generate adaptive evolution since, on average in these flies, one out of two spermatozoids does not reach fertilization because of SC.
Cita tipo APA: Hurtado, Juan . (2014). Selección sexual post-copulatoria en Drosophila: ¿cuántas moscas no nacen por causa de la competencia espermática?. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5458_Hurtado.pdf Cita tipo Chicago: Hurtado, Juan. "Selección sexual post-copulatoria en Drosophila: ¿cuántas moscas no nacen por causa de la competencia espermática?". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5458_Hurtado.pdf |
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Heiber, Pablo Ariel. "Una perspectiva computacional sobre números normales" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La normalidad es una forma débil de azar. Un número real es normal en una base entera dada si su expansión en esa base es balanceada: todos los bloques de la misma cantidad de dígitos tienen igual frecuencia en la expansión. La normalidad absoluta es normalidad en toda base. En esta tesis resolvemos varios problemas sobre normalidad: La existencia de números absolutamente normales computables era conocida, pero no se conocía ningún algoritmo que computara uno en tiempo polinomial. Nosotros damos un algoritmo que computa uno en tiempo apenas mayor a cuadrático. Mostramos que el conjunto de números absolutamente normales, como subconjunto de los reales, no tiene otras propiedades aritméticas que las impuestas por la definición de normalidad. Técnicamente, demostramos que el conjunto de números absolutamente normales es π°3-completo. Extendemos la caracterización conocida de normalidad en términos de incompresibilidad mediante autómatas finitos. Analizamos exhaustivamente todas las maneras de mejorar un simple autómata finito agregando memoria de diferentes formas, permitiendo no-determinismo y permitiendo la lectura de la entrada más de una vez. Demostramos que la normalidad se preserva bajo reglas de selección basadas en préfijos finitos o sufijos infinitos reconocidos por autómatas finitos, pero no ambos simultáneamente. Esto extiende un resultado conocido para el caso de prefijos. Abstract: Normality is a weak form of randomness. A real number is normal to a given integer base if its expansion in that base is balanced: all blocks of the same number of digits occur with the same frequency in the expansion. Absolute normality is normality to all bases. We solve several problems on normality: It was known that computable absolutely normal numbers exist, but no algorithm was known to compute one in polynomial time. We give an algorithm that computes one in just above quadratic time. We show that the set of absolutely normal numbers, as a subset of the real numbers, has no other arithmetical properties than those imposed by the definition of normality. Technically, we prove that the set of absolutely normal numbers is π°3-complete. We extend the known characterization of normality in terms of incompressibility by deterministic finite automata. We exhaust all ways of enhancing a simple finite state automaton by adding memory in different forms, allowing non-determinism, and allowing to read the input more than once. We prove that normality is preserved by selection rules based on finite pre- fixes or infinite suffixes being recognized by finite automata, but not both simultaneously. This extends a known result about the prefixes case.
Cita tipo APA: Heiber, Pablo Ariel . (2014). Una perspectiva computacional sobre números normales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5450_Heiber.pdf Cita tipo Chicago: Heiber, Pablo Ariel. "Una perspectiva computacional sobre números normales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5450_Heiber.pdf |
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Harris, Sabrina Evelyn. "Comportamiento de búsqueda de alimento del Cormorán Imperial (Phalacrocorax atriceps): caracterización, consistencias individuales y factores determinantes" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se estudió el comportamiento de búsqueda de alimento del Cormorán Imperial (Phalacrocorax atriceps) en la colonia de Punta León (42°05´S; 64°30´O) utilizando sistemas de posicionamiento global (GPS). A partir del análisis de diversos parámetros de los viajes de alimentación de individuos reproductores se distinguieron cuatro tipos de búsqueda. Se evaluó la consistencia que presentan los individuos en diversos parámetros de sus viajes entre días sucesivos, entre períodos y entre temporadas reproductivas, siendo en general más alta a menores intervalos de tiempo y menor a largo plazo. A su vez, al comparar los viajes de alimentación de individuos que se reproducían por primera vez con aquellos con experiencia, los machos sin experiencia reproductiva difirieron de aquellos que se habían reproducido anteriormente. Se registraron diferencias en el comportamiento de búsqueda de alimento entre aquellos que consumieron presas bentónicas y pelágicas, a partir del análisis de isótopos de carbono y nitrógeno. Por último, se describió el comportamiento de los individuos a lo largo del año a partir del uso de dispositivos de geolocalización (GLS). La consistencia en el comportamiento y la especialización en un tipo de presa particular por parte de los individuos podría estar reflejando una disponibilidad de recursos estable a largo plazo, pero también podría eventualmente disminuir la plasticidad que dichos individuos serían capaces de desarrollar frente a cambios en el ambiente. Abstract: Foraging behavior of Imperial Shags (Phalacrocorax atriceps) breeding at Punta León colony (42°05´S; 64°30´W) was analyzed with Global Positioning System (GPS) devices. Four types of prey search behavior were distinguished using several parameters of the foraging trips of breeding individuals. Consistency in foraging behavior was evaluated for the same individuals on successive days, between periods within the season and amongst years and consistency was highest for most parameters within short intervals of time than on longer intervals. Individuals breeding for the first time were compared with individuals with breeding experience and males without breeding experience differed in their prey search behavior from their experienced counterparts. Differences in some foraging trips parameters were associated with benthic and pelagic diets, evaluated through carbon and nitrogen stable isotope analysis. Behavior of individuals was assessed throughout the year with the use of Geolocation Light Sensors (GLS). Behavioral consistency and dietary specialization may reflect long term environmental stability and prey abundance, but may also eventually reduce the plasticity individuals are able to develop if the environment changes.
Cita tipo APA: Harris, Sabrina Evelyn . (2014). Comportamiento de búsqueda de alimento del Cormorán Imperial (Phalacrocorax atriceps): caracterización, consistencias individuales y factores determinantes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5496_Harris.pdf Cita tipo Chicago: Harris, Sabrina Evelyn. "Comportamiento de búsqueda de alimento del Cormorán Imperial (Phalacrocorax atriceps): caracterización, consistencias individuales y factores determinantes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5496_Harris.pdf |
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Gasulla, Javier. "Modulación por óxido nítrico de receptores ionotrópicos de GABA" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El NO es una molécula altamente difusible y reactiva producida en el sistema nervioso que actúa como mensajero neuronal y participa en procesos fisiológicos y patológicos. El NO modula la actividad de numerosos receptores de neurotransmisores y canales iónicos. En particular, los GABAARs pueden ser modulados por agentes rédox y por NO, aunque los efectos y mecanismos de este último no están claros. En esta tesis, caracterizamos los efectos del NO sobre GABAρ1Rs expresados de forma heteróloga y estudiamos la actividad de los GABAARs fásicos y tónicos de células piramidales en rebanadas de hipocampo con distintos niveles de NO. Los receptores homoméricos GABAρ1 se expresaron en ovocitos de Xenopus laevis, y las respuestas evocadas por GABA se registraron electrofisiológicamente, en presencia y ausencia de donantes de NO. Las respuestas se potenciaron significativamente por el NO de forma rápida, reversible y dosis-dependiente. El bloqueo químico de las cisteínas mediante reactivos selectivos para sulfhidrilos previno la potenciación por NO, indicando que las cisteínas participan de la modulación. Cada subunidad ρ1 tiene solo tres cisteínas, las dos extracelulares que forman el cys-loop (C177 y C191) y una intracelular (C364). El reemplazo por alanina de la C364 no modificó los efectos del NO sobre el receptor, lo que sugiere que el NO potencia los GABAρ1Rs a través de una interacción con el cys-loop extracelular. Por otra parte, en rebanadas de hipocampo, se realizaron registros con la técnica de patch-clamp en configuración célula entera, y se estudiaron los efectos del NO sobre los GABAARs. Las corrientes fásicas se registraron aplicando puffs de GABA y, las corrientes tónicas se midieron analizando la IH antes y después de la aplicación de bicuculina (BIM). El nivel de NO se incrementó por la aplicación de donantes de NO y se disminuyó bloqueando la producción de la NOS. El incremento en los niveles de NO no modificó significativamente la actividad de los GABAARs. Sin embargo, el bloqueo de la síntesis de NO endógeno potenció la corriente GABAérgica tónica y la evocada por puffs de GABA. Estos resultados indican que los efectos del NO sobre los GABAARs son dependientes de la subunidad y sugieren que las acciones del NO en el hipocampo estarían en parte mediadas por la modulación de la actividad inhibitoria. Abstract: NO is a highly diffusible and reactive molecule produced in the nervous system that act as a neuronal signal mediating both physiological and pathological mechanisms. NO can modulate the activity of neurotransmitter receptors and ion channels. In particular, GABAAR can be modulated by several redox agents and by NO, but the effects and mechanisms of this modulation were not clearly determined. In the present work, we characterized the effects of NO on the GABAρ1R and examined the function of phasic and tonic GABAAR on pyramidal cells of acute hippocampal slices under different NO levels. Homomeric GABAρ1Rs were heterologously expressed in Xenopus oocytes and GABA-evoked responses electrophysiologically recorded in the presence or absence of NO donors. Responses were significantly enhanced in a dose-dependent, fast and reversible manner by NO. Chemical protection of cysteines by selective sulfhydryl reagents prevented the NO effects indicating that cysteines are involved in NO actions. The ρ1 subunits contain only three cysteine residues, two extracellular at the cys-loop (C177 and C191) and one intracellular (C364). Mutation of C364 by alanine did not change the effects of NO on GABAρ1R, suggesting that GABAρ1R function can be enhanced by NO acting at the extracellular cys-loop. On the other hand, in hippocampal slices, whole-cell patch clamp technique was used to study the effects of NO on GABAAR. Phasic currents were evoked by puff application of GABA and tonic currents were determined through monitoring IH before and after application of bicuculine. NO level was increased by application of NO donors or decreased by blocking the NOS. Exogenously applied NO, had no effects on GABAARs. Meanwhile, depletion of endogenous level of NO enhanced both types of GABAergic currents. These results indicate that NO actions on GABAARs are extremely subunit dependent and suggest that physiological effects of NO on hippocampus can be in part mediated by modulation of the inhibitory synaptic activity.
Cita tipo APA: Gasulla, Javier . (2014). Modulación por óxido nítrico de receptores ionotrópicos de GABA. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5483_Gasulla.pdf Cita tipo Chicago: Gasulla, Javier. "Modulación por óxido nítrico de receptores ionotrópicos de GABA". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5483_Gasulla.pdf |
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Franco, Mariano Andrés. "Métodos de dispersión electromagnética aplicados a sistemas SAR" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis trabajamos con distintos métodos para calcular la sección eficaz observada por sistemas de radar activos, debido su interacción con superficies y medios aleatorios. En primer lugar describimos el método de la ecuación integral usado para calcular el campo dispersado por una superficie rugosa. Mostramos cuales son los resultados usuales del modelo y luego los que no se condicen con las observaciones. Proponemos entonces no usar las simplificaciones habituales para obtener valores no nulos en los coeficientes de retrodispersión de los canales de polarización cruzada. Concretamente, retener términos no lineales en la distribución de alturas de la superficie y calcular, numéricamente, la nueva sección eficaz del modelo. Luego, extendemos la formulación integral a un modelo de medios estratificados en el cual, debajo de la superficie iluminada por el radar, se encuentra una segunda interface (plana). Con este modelo damos una primer contribución a la dispersión de la onda debido a su interacción con el volumen que se haya debajo de la superficie observada por el radar. En particular, desarrollamos este modelo para estudiar el comportamiento de la emisivad respecto a la distancia media entre las capas, y como segundo objetivo, analizar la respuesta polarimétrica del sistema. Finalmente, basados en una teoría estadística de campos, formulamos el marco teórico para calcular la respuesta al radar de un medio inhomogéneo. Consideramos que debajo de la superficie se encuentra un medio caracterizado por una permitividad dieléctrica estocástica y haciendo uso de métodos funcionales resolvemos las ecuaciones para el campo medio observado por los sistemas de teledetección. Abstract: In this thesis we work with different methods to calculate the observed radar cross section by active radar systems due to their interaction with rough surfaces and random media. First, we describe the Integral Equation Method used to compute the scattered field of a random surface. We show that the results are not consistent with the observations and suggest not to use the usual simplifications to obtain nonzero values of the backscattering coeficients for the cross polarized channels. We propose retain the nonlinear terms in the height distribution of the rough surface and calculate, numerically, the new radar cross section. Then, we extend the integral formulation to a model of stratified media which, below the surface illuminated by the radar, there is a second at interface. With this model we give a first contribution to the wave dispersion due to its interaction with the volume to be below the surface. In particular, we develop this model to study the emissivity behavior as a function of the average distance between the layers, and as a second subject, analyzing the polarimetric response of the system. Finally, based on a statistical field theory, we give the theoretical framework in order to compute the radar cross section response in inhomogeneous medium. We consider that below surface there is a random media characterized by a stochastic dielectric permittivity and we use functional methods to solve the equations of the mean field observed by remote sensing systems.
Cita tipo APA: Franco, Mariano Andrés . (2014). Métodos de dispersión electromagnética aplicados a sistemas SAR. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5423_Franco.pdf Cita tipo Chicago: Franco, Mariano Andrés. "Métodos de dispersión electromagnética aplicados a sistemas SAR". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5423_Franco.pdf |
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Ferder, Ianina C.. "Implicancias del gen FMR1 en la función ovárica" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El gen FMR1, responsable del Síndrome de Fragilidad del X (SFX), se localiza en el sitio FRAXA en el brazo largo del cromosoma X (Xq27.3), está compuesto por 17 exones, abarca aproximadamente 38 kilobases (kb) y su producto transcripcional es un ARN mensajero de 3,9 kb que puede sufrir splicing alternativo. En su región 5’ no codificante presenta una zona de tripletes CGG que puede variar en longitud. Según el tamaño de la expansión, los alelos se clasifican en normales (5- 44 repeticiones), intermedios (45-54 repeticiones), premutados (55- 200 repeticiones) o con mutación completa (>200 repeticiones). Mientras que la mutación completa es la causante del SFX, el estado de premutación se asocia a otros 2 desórdenes clínicos: Síndrome de temblor/ ataxia asociado a la Fragilidad del X (FXTAS), un desorden neurodegenerativo de inicio tardío y a la Insuficiencia Ovárica Primaria (IOP) asociada a la Fragilidad del X (FXPOI). La IOP se define como la presencia de amenorrea (de al menos 4 meses) antes de los 40 años, que se acompaña de un aumento en los niveles séricos de FSH (a niveles menopáusicos) y de bajos niveles de estradiol (hipoestrogenismo). Es un síndrome muy heterogéneo de patogénesis multicausal tales como alteraciones cromosómicas, enzimáticas, autoinmunidad, causas iatrogénicas e infecciosas. Tiene una incidencia del 1% en mujeres menores de 40 años y del 0,1% en menores de 30. FXPOI es la causa genética conocida más común de la IOP 46, XX y la premutación en FMR1 es responsable del 4- 6% de todos los casos de IOP 46, XX. Aproximadamente el 2% de las mujeres 46, XX con IOP aislada y el 14% de la mujeres 46, XX con IOP familiar son portadoras de la premutación en el gen FMR1. Asimismo, se ha descripto que alrededor del 20% de las mujeres portadoras de la premutación desarrollan IOP. A su vez, las mujeres portadoras se vuelven menopáusicas aproximadamente 5 años antes que las no portadoras. Si bien no todas las mujeres portadoras de la premutación experimentan una temprana pérdida de la fertilidad, todas ellas enfrentan el potencial adelantamiento en la aparición de condiciones asociadas con la deficiencia estrogénica (aumento en el riesgo de osteoporosis y de enfermedades cardiovasculares). Estudios genéticos epidemiológicos sugieren que el comienzo y la gravedad de la disfunción ovárica asociada a FXPOI son variables y podrían estar moduladas, potencialmente, por el largo de las repeticiones CGG y otros factores ambientales. El status de premutación per se pareciera estar influyendo en la expresión de la enfermedad. De hecho, no se ha descripto que mujeres que poseen expansión completa de tripletes (>200 repeticiones y con signos clínicos de Síndrome de Fragilidad del X) desarrollen IOP. Si bien no se conoce el mecanismo por el cual la premutación del gen FMR1 puede causar la disfunción ovárica y la insuficiencia ovárica primaria, se ha postulado que puede ocurrir una disminución inicial del número de folículos o una velocidad acelerada de la atresia. Es sabido que la proteína que codifica este gen, FMRP, se expresa en altas cantidades en células germinales del ovario fetal. Asimismo, se ha descripto que esta proteína actúa como inhibidor de la traducción de algunos ARN mensajeros formando parte de los procesos de silenciamiento génicos mediados por miRNAs. Teniendo en cuenta su función, se ha postulado como posible hipótesis de la patogenia, que un aumento de FMRP en estadios tempranos del desarrollo de los ovocitos podría conducir a una haploinsuficiencia de proteínas involucradas en este proceso, provocando una disminución del pool inicial de folículos. Sin embargo, y dado que en FXTAS se ha observado un aumento del ARN mensajero del gen como consecuencia de la premutación, se postula como mecanismos alternativo la existencia de un aumento del ARN mensajero en el ovario que ejerza un efecto tóxico en el tiempo, con el consecuente incremento de la atresia folicular. Ninguno de estos mecanismos han sido aún comprobados en el ovario, más aún la función fisiológica de la proteína en el mismo no está establecida. No se conoce además, si existe expresión diferencial a lo largo del desarrollo folicular. Considerando la escasa información que existe acerca de FMR1 y su expresión en ovario, nuestro trabajo consistió, en una primera fase, en el estudio de la expresión de la proteína FMRP y su mensajero a lo largo de la foliculogénesis, en un modelo de rata. Se utilizaron 3 grupos de ratas: ratas prepuberales de 18 días, ratas prepuberales de 21-23 días tratadas con dietilestilbestrol (DES) para enriquecer a los ovarios en folículos antrales tempranos y ratas prepuberales de 21-23 días tratadas con gonadotrofina coriónica equina (PMSG) para enriquecer los ovarios en folículos preovulatorios. En la primera parte del trabajo analizamos, por inmunohistoquímica, la expresión de FMRP en los distintos tipos celulares del folículo. Hallamos que la proteína se expresa en células de la granulosa, de la teca y en células estromales, con excepción de un grupo de células que rodea al folículo. La expresión se detectó en los folículos en los tres estadios del desarrollo estudiados: preantrales, antrales tempranos y preovulatorios. La expresión de la proteína FMRP fue estudiada también por Western blot en los tres tipos foliculares. Observamos una menor expresión en folículos preantrales y una mayor expresión en estadios más avanzados de la foliculogénesis. Por otra parte, se detectaron al menos 4 isoformas de la proteína cuyos patrones de expresión resultaron diferentes a los observados en testículo y cerebro. Teniendo en cuenta la función de la proteína como parte del complejo de silenciamiento post-transcripcional, estos resultados nos permitirían estimar que las diferencias observadas en los niveles de expresión de la proteína tendrían un rol en el correcto desarrollo del folículo. Asimismo, la presencia de isoformas distintivas en el ovario sugeriría una función específica para algunas de ellas en la gónada. La segunda parte del trabajo consistió en el estudio de la expresión del ARN mensajero de Fmr1 en los 3 estadios foliculares. Por PCR en tiempo real observamos que el patrón de expresión era opuesto al que se obtuvo para la proteína. En los folículos preovulatorios, el nivel del ARN fue menor respecto al de los estadios anteriores. Estos resultados sugerirían que la expresión del mensajero y su proteína en el ovario están regulados de manera diferente y posiblemente independiente. Por otro lado, identificamos por RT-PCR y posterior secuenciación, la existencia de varias isoformas del ARNm del gen, resultantes del splicing alternativo del mismo. Entre ellas, detectamos la isoforma que contiene al exón 12, la cual no ha sido previamente descripta en rata. El último aspecto que quisimos abordar en nuestro estudio fue el efecto biológico de la introducción de tripletes en el rango de la premutación sobre una línea celular de células de granulosa humana (KGN). Par tal fin se transfectaron las células con un plásmido conteniendo tripletes en el rango normal o de la premutación, río arriba de un gen reportero (GFP). Luego de 18 horas de transfección, los niveles de ARNm del gen reportero resultaron más elevados en las células que poseían los tripletes en el rango de la premutación, en concordancia con lo observado en diferentes experimentos y pacientes con FXTAS. Asimismo, detectamos una menor cantidad de células que expresan la proteína GFP, en presencia del plásmido con la premutación, en todos los tiempos de transfección estudiados. A nivel neuronal se ha relacionado al estado de premutación con posibles efectos apoptóticos en la célula. Si bien nuestros estudios aún no demuestran que el efecto de la introducción de tripletes en el rango de la premutación resulte en un aumento en la apoptosis de las células KGN, los resultados obtenidos en esta tesis abren la posibilidad de que este mecanismo sea analizado en un futuro. En conclusión, en esta tesis se describe por primera vez la expresión de la proteína FMRP y de su mensajero a lo largo del desarrollo folicular, y la presencia de algunas isoformas distintivas, producto del splicing alternativo del gen. Asimismo, se iniciaron los estudios tendientes a demostrar el efecto patogénico que posee la expresión de tripletes expandidos en células del ovario. Abstract: The FMR1 gene, responsible for the Fragile X Syndrome (FXS), is located in the FRAXA site of chromosome X. The gene is composed of 17 exons, spans about 38 kb and encodes an messenger RNA (mRNA) of 3.9 kilobases (kb) that can be alternatively spliced into a number of different isoforms. The 5’ UTR of the FMR1 gene presents a CGG repeat that is unstable and therefore variable. Based on the size of the expansion, alleles are classified as normal (5–44 trinucleotide repeats), intermediate (45- 54 repeats), premutated (55–200 repeats), or fully mutated (>200 repeats). While full mutation is the responsible for FXS, the premutation condition has been associated to other 2 clinical disorders: Fragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS), a neurodegenerative disorder of late onset and to the Fragile X- associated primary ovarian insufficiency (FXPOI). Primary ovarian insufficiency (POI) is defined as amenorrhea (for at least 4 months) before age of 40, an increase in serum levels of FSH (to menopausal levels) and low levels of estradiol (hypoestrogenism). This syndrome is very heterogeneous with a multicausal pathogenesis, and any of the following: chromosomal, enzymatic, iatrogenic, autoimmune or infectious aberration may be the cause of the disease. It has an incidence of 1% in women under age of 40 and of 0.1% below 30 years of age. FXPOI is the most common known genetic cause for IOP and the premutation condition is responsible for 4-6% of all cases of 46, XX IOP. About 2% of women 46, XX with IOP and 14% of women 46, XX with familial IOP, carry the premutation in the FMR1 gene. Moreover, it has also been described that around 20% of women carrying the premutation, become menopausal around 5 years earlier than not carriers. The premutation status seems to influence the expression of the disease. In fact, no full mutated women with IOP have been described. While not all women carries of the permutation experience an early loss of fertility, all carriers face the potential advance in the onset of the conditions associated with estrogenic deficiency (higher risk for osteoporosis and hearth diseases). Epidemiologic genetic studies also suggest that the onset and severity of ovarian dysfunction associated to FXPOI is variable, and could be potentially modulated by the CGG repeat length and environmental factors. Even though the underlying mechanism by which the FMR1 premutation is responsible for the ovarian dysfunction and POI is not known, it has been suggested that an initial decrease of the number of follicles or an accelerated rate of atresia may take place. The protein encoded by the FMR1 gene, FMRP, is highly expressed in germ cells in the fetal ovary. The protein acts as a translation inhibitor of some target mRNA, most likely via the microRNA silencing complex. Given that in FXTAS an increase in FMR1 mRNA has been observed, another possible mechanism for FXPOI is that high levels of mRNA exert a toxic effect causing an increase in follicular atresia. None of the postulated pathogenic mechanisms has been demonstrated in the ovary. Moreover, the physiological role of FMRP in the gonad has not been established, and the expression pattern of the protein during follicular growth remains unknown. Considering that there is limited information related to FMR1 expression and function in the ovary, the goal of our work was, initially, to study the expression of FMRP protein and its messenger during folliculogenesis in a rat model. For this propose, three groups of rats were used: 1- prepubertal rats of 18 days, 2- prepubertal rats of 21-23 days treated with Diethylstilbestrol (DES) to enrich ovaries with early antral follicles and 3- prepubertal rats of 21-23 days treated with equine chorionic gonadotropin (PMSG) to enrich ovaries with preovulatory follicles. The expression of FMRP in the rat ovarian follicular cells was analyzed by immunohistochemistry (IHQ) and Western blot (WB). By IHQ we found that the protein is expressed in granulosa, theca and stromal cells, except in a group of cells surrounding the follicle, mainly in the cytoplasm. Expression was detected in follicles at all stages of folliculogenesis: preantral, early antral and preovulatory. After WB assays, lower expression in preantral follicle was detected, whereas higher levels of FMRP were observed in later stages of folliculogenesis. Moreover, at least 4 isoforms of the protein were detected whose expression pattern differed from that observed in testis and brain. Considering FMRP’s function as part of the post -transcriptional silencing complex, these results may suggest that the differences observed at FMRP expression levels, could exert a role in the proper development of the follicle. Furthermore, the presence of distinctive isoforms in the ovary could imply a specific function for some of them in de gonad. In the second part of the work we studied the messenger RNA (mRNA) expression of Fmr1 in the three follicular development stages. Using quantitative RT-PCR (qRT-PCR) we found that the mRNA expression pattern was opposite to that observed for the protein: in preovulatory follicles, mRNA level was lower compared to earlier stages. These results suggest that mRNA and protein expression in the ovary may be regulated at different and perhaps independent levels. In addition, by RT-PCR and subsequent sequencing, we identified several messenger isoforms resulting from alternative splicing. Among them, we detected the variant including exon 12, which has not been previously described in other rat tissues so far analyzed. The last aspect we addressed in our work was the biological effect that the CGG repeats in the permutation range could exert on a human ovarian granulosa cell line (KGN). Cells were transfected with a plasmid containing repeats in the normal or in the premutation range cloned upstream of the GFP reporter gene. After different times of transfection, mRNA of the reporter gene was measured by qRT- PCR. We found that after 18 hours, the levels of mRNA was higher in cells transfected with the repeats in the premutation range comparing to the levels found for those with the normal one. These results are in agreement with the observations reported for FXTAS patients and for animal models of the syndrome. Moreover, when cells were transfected with the permutated plasmid, we detected fewer cells expressing the GFP protein in all the transfection times assayed. In neurons, the permutation state has been associated with possible apoptotic effects in the cell. Even though our preliminary studies do not yet show that transfection of KGN cells with the premutation plasmid results in increased apoptosis, the results obtained in the present work open the possibility for this mechanism to be analyzed in a future. In conclusion, this work describes, for the first time, the expression of the FMRP protein and its messenger during folliculogenesis in a rat model. Moreover, the presence of some distinctive isoforms resulting from the alternative splicing of the gene in the ovary is also described. Although we found an increase in mRNA levels and reduced protein expression of the reporter gene containing permutated repeats, further studies are needed to elucidate the pathogenic mechanism of the expanded triplets in the ovary.
Cita tipo APA: Ferder, Ianina C. . (2014). Implicancias del gen FMR1 en la función ovárica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5469_Ferder.pdf Cita tipo Chicago: Ferder, Ianina C.. "Implicancias del gen FMR1 en la función ovárica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5469_Ferder.pdf |
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Faut, Mónica. "Rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales gamma frente al exceso de andrógenos durante la foliculogénesis temprana" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La reproducción es uno de los procesos fisiológicos con mayor costo energético, tal es así que los mecanismos fisiológicos que controlan el balance energético se hallan ligados a la fertilidad. Existen múltiples endocrinopatías asociadas a desbalances metabólicos, entre ellas el Síndrome de Ovario Poliquístico (SOP). Esta es una de las patologías más frecuentes en mujeres en edad reproductiva y cuya alteración principal es el hiperandrogenismo. Estas pacientes presentan alteraciones en la foliculogénesis temprana dado que, por mecanismos aun no conocidos, no ocurre la selección de folículos dominantes. Con el propósito de dilucidar estos mecanismos, en el laboratorio se ha generado un modelo murino de hiperandrogenización con dehidroepiandrosterona (DHEA) para el estudio del desarrollo folicular temprano. El objetivo principal de este trabajo es evaluar si “es el exceso de andrógenos durante la vida peripuberal el que genera alteraciones en la funcionalidad ovárica” y “cuál es el rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales de tipo γ (PPARγ) en esta alteración”. En el presente trabajo encontramos que el estímulo con eCG indujo un aumento en el número de folículos, disminuyendo la atresia folicular de manera controlada, sin alterar los procesos apoptóticos. Por otro lado, el aumento en los niveles de progesterona sérica (P4), indica la capacidad esteroidogénica de estos ovarios, permitiéndonos estudiar los efectos del hiperandrogenismo sobre las primeras etapas de la foliculogénesis y la regulación de la esteroidogénesis. En ovarios provenientes de animales hiperandrogenizados, encontramos un aumento en la expresión de proteínas fundamentales, como StAR, mientras que otras enzimas reguladoras, como P450scc, se encuentran disminuídas. Esta alteración provocó una disminución en la producción de P4, generando un efecto deletéreo en estos folículos. Los PPARγ actuarían como factores de transcripción, regulando la expresión de estas enzimas y estimulando la producción de P4 en las primeras etapas de la foliculogénesis, pero no siendo capaz de hacerlo en un ambiente hiperandrogénico. En estas condiciones, se produce un desbalance oxidativo en donde el GSHt es consumido rápidamente generándose daño a lípidos, lo cual alteraría la estructura de las membranas, provocando que las células no respondan correctamente al ambiente que las rodea, y entrando en un estado proapoptótico. De esta manera, el folículo entra en atresia. Abstract: Reproduction is one of the physiological processes with higher energy costs, that is so the physiological mechanisms that control energy balance are linked to fertility. There are multiple metabolic imbalances associated endocrinopathies, including Polycystic Ovary Syndrome (PCOS). This is one of the most frecuent pathology in women of childbearing age and whose main alteration is hyperandrogenism. Women with PCOS have many troubles during early folliculogenesis given that, by unknown mechanisms, the dominant follicles can´t be selected. To try to elucidate this phenomenon, in the laboratory we have generated a rat model of early follicular development with dehydroepiandrosterone (DHEA). The main objective of this work is to evaluate if "it´s the excess of androgens during peripubertal life that generates alterations in ovarian function" and "Which is the role of peroxisome proliferator-activeted receptors γ (PPARγ) in this condition". In this work, we found that ECG stimulation induces an increase in the number of follicles, decreasing the follicular atresia in a controlled manner, without exacerbating apoptotic processes. In the other hand, an increase in the serum progesterone (P4) indicates the steroidogenic capacity of these follicles, allowing us to study the effects of hyperandrogenism on the early stages of folliculogenesis and the regulation of the steroidogenic pathway. Ovaries from animals treated with DHEA, we found an increase in the expression of key proteins such as StAR, while others regulatory enzymes are diminished, such as P450scc. This alteration causes a decrease of P4, producing a deleterious effect on these follicles. PPARγ act as transcription factor of these enzymes by stimulating the production of P4 in the early stages of folliculogenesis, but not being able to do so in a hyperandrogenic environment. In these conditions, GSHt is rapidly consumed which increases the damage to lipids, altering the membrane structure and causing the cells do not respond to the surrounding environment, and entering into a proapoptotic state. In this manner, the follicle is leading to atresia.
Cita tipo APA: Faut, Mónica . (2014). Rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales gamma frente al exceso de andrógenos durante la foliculogénesis temprana. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5495_Faut.pdf Cita tipo Chicago: Faut, Mónica. "Rol de los receptores nucleares activados por proliferadores peroxisomales gamma frente al exceso de andrógenos durante la foliculogénesis temprana". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5495_Faut.pdf |
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Dodes Traian, Martín Miguel. "Estudio de las interacciones entre fosfolípidos y proteínas integrales de membrana. Efectos sobre la actividad enzimática de una ATPasa transportadora de Ca2+" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las membranas celulares son estructuras dinámicas complejas de composición bioquímica muy diversa. Las interacciones específicas lípidolípido y lípido-proteína pueden generar dominios estables o transientes de composición y función biológica diferenciales. En este trabajo, abordamos el estudio de la regulación de la actividad de una proteína integral de membrana, la bomba de calcio de membrana plasmática (PMCA) por anfifilos que integran el sistema en el cual se la reconstituye. En micelas de lípidos y detergente, pudimos verificar que la actividad depende de la proporción relativa de estas especies y postulamos un modelo que explica esta dependencia en base al intercambio de anfifilos a nivel del dominio transmembrana. El análisis realizado con diversos métodos espectroscópicos mostró que los cambios estructurales asociados a la activación por lípidos serían sutiles pero suficientes para transducir una señal de activación al dominio citoplasmático de PMCA. Utilizando espectroscopía de correlación de fluorescencia y la sonda fluorescente Laurdan observamos que la actividad depende además de la fluidez del entorno y del tamaño de las micelas. Para extender este estudio al entorno natural de las proteínas -la membrana celular- evaluamos diversas sondas fluorescentes y pudimos determinar que la sonda C-Laurdan permite estudiar por microscopía confocal la organización de membranas biológicas. Abstract: Cellular membranes are dynamic complex structures with a highly diverse biochemical composition. Specific lipid-lipid and lipid-protein interactions can generate transient or stable domains of particular composition and biological function. In this work, we study the regulation of the activity of an integral membrane protein, the plasma membrane calcium pump (PMCA), by phospholipids that make up the reconstitution system. Working in a mixed micelles lipid/detergent system, we verify that the activity depends on the relative proportion of these species and we posited a model that explains this relationship by the exchange between amphiphiles at the protein transmembrane domain. The analysis performed by spectroscopic methods showed that the structural changes associated with the activation by lipids are subtle but enough to transduce an activation signal to the cytoplasmic domain of PMCA. Using fluorescence correlation spectroscopy and the fluorescent probe Laurdan, we observed that the activity is also related to micelle size and the fluidity of the protein lipidic microenvironment. To extend this study to the natural environment of the protein –the cellular membrane- we assayed the performance of several fluorescent probes and we could determine that the probe CLaurdan allows studying the organization of biological membranes by confocal microscopy.
Cita tipo APA: Dodes Traian, Martín Miguel . (2014). Estudio de las interacciones entre fosfolípidos y proteínas integrales de membrana. Efectos sobre la actividad enzimática de una ATPasa transportadora de Ca2+. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5491_DodesTraian.pdf Cita tipo Chicago: Dodes Traian, Martín Miguel. "Estudio de las interacciones entre fosfolípidos y proteínas integrales de membrana. Efectos sobre la actividad enzimática de una ATPasa transportadora de Ca2+". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5491_DodesTraian.pdf |
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Coria, Mirta Lorena. "Estudio de la capacidad adyuvante de la proteína Omp19 de Brucella spp. sobre la respuesta inmune adaptativa" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En nuestro laboratorio nos encontramos investigando la utilidad de la porción proteica de la lipoproteína de membrana externa de 19 kiloDalton de Brucella abortus (U-Omp19) como adyuvante vacunal. Resultados previos proponían a U-Omp19 como un inhibidor de serin proteasas de estómago e intestino. En esta tesis hemos comprobado que U-Omp19 posee actividad de inhibidor de cisteín proteasas lisosomales y que la co-administración de U-Omp19 inhibe parcialmente la degradación del antígeno (Ag) dentro de las células presentadoras de Ag incrementando su vida media y promoviendo su presentación cruzada a las células T CD8+. UOmp19 también es capaz de activar células dendríticas (DCs) induciendo un aumento en la expresión de moléculas co-estimulatorias y secreción de citoquinas pro-inflamatorias. Por último, estudiamos la respuesta inmune inducida en ratones luego de la co-administración de OVA y U-Omp19 por vía subcutánea. Observamos que U-Omp19 como adyuvante de OVA induce una eficiente respuesta inmune celular de tipo T CD8+ y citotóxica con producción de IFN-γ. Los resultados obtenidos indican que la actividad adyuvante de U-Omp19 está dada, por un lado, por su capacidad de activar DCs y por otro lado, por promover la estabilidad y la presentación de Ags a través de su acción como inhibidor de proteasas, éste último representa un novedoso mecanismo aún no descripto para un adyuvante vacunal. Abstract: In our laboratory we are investigating the usefulness of the protein moeity of the outer membrane lipoprotein of 19 kiloDalton from Brucella abortus (U-Omp19) as a vaccine adjuvant. Previous results proposed U-Omp19 as a serine protease inhibitor. In this thesis we found that U-Omp19 possesses inhibitory activity of lysosomal cysteine proteases, and that the coadministration of U-Omp19 partially inhibits the antigen (Ag) degradation in Ag presenting cells increasing its half life and promoting its cross presentation to CD8+ T cells. U-Omp19 is also capable of activating dendritic cells (DCs) inducing the upregulation of co-stimulatory molecules and secretion of pro-inflammatory cytokines. Finally, we studied the immune response induced in mice after subcutaneously co-administration of U-Omp19 and OVA. We observed that UOmp19 as adjuvant of OVA induces an effective T CD8+ and cytotoxic cellular immune response with IFN-γ production. These results indicate that the adjuvant activity of U-Omp19 is given, in one hand, by its ability to activate DCs and in the other hand, by promoting Ag stability and presentation through its action as a protease inhibitor, the latter represents a novel mechanism not yet described for a vaccine adjuvant.
Cita tipo APA: Coria, Mirta Lorena . (2014). Estudio de la capacidad adyuvante de la proteína Omp19 de Brucella spp. sobre la respuesta inmune adaptativa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5460_Coria.pdf Cita tipo Chicago: Coria, Mirta Lorena. "Estudio de la capacidad adyuvante de la proteína Omp19 de Brucella spp. sobre la respuesta inmune adaptativa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5460_Coria.pdf |
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Carbonetto, María Belén. "Diversidad de las comunidades microbianas de los suelos pampeanos. Enfoques ecológicos y metagenómicos" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El suelo es uno de los ambientes más biodiversos y heterogéneos del planeta y los ciclos biogeoquímicos que en él suceden son de suma importancia para la vida. Estos procesos son llevados a cabo por microorganismos, mayoritariamente del grupo Bacteria y Arquea. A su vez, el suelo es un recurso esencial para los seres humanos ya que es su fuente principal de alimentos, pero como cualquier recurso natural, es finito. Por lo tanto el estudio del impacto de las modificaciones agrícolas en las características físicas, químicas y biológicas del suelo y por ende en los procesos del ecosistema, es imprescindible. El 50% de la superficie de Región Pampeana está dedicada a la agricultura. El impacto de las prácticas agrícolas sobre las características físicas y químicas del suelo, ha sido ampliamente estudiado en la región. Sin embargo, y más allá del gran esfuerzo realizado, todavía hay una deuda por comprender las consecuencias del uso agrícola sobre la biodiversidad y procesos biológicos. El trabajo aquí presentado pretende saldar parte de esta deuda estudiando el impacto que ejerce la agricultura sobre las comunidades bacterianas de suelos de la Región Pampeana. Se utilizaron técnicas de metagenómica y un enfoque ecológico. El primer capítulo se centró en estudiar el impacto de más de 100 años de agricultura sobre la estructura de las comunidades microbianas y sus perfiles metabólicos (metagenómicos). Se encontraron diferencias significativas entre comunidades de suelos con y sin historia de manejo agrícola. El segundo capítulo se dedicó a la comparación de dos sistemas de labranza. Se estudió la estructura de diversidad y el perfil metagenómico de comunidades de suelos bajo labranza convencional y bajo siembra directa. Vimos que las comunidades difirieron en su composición taxonómica y metabólica según el tipo de labranza a la cual fueran sometidas. El objetivo del tercer capítulo fue determinar el patrón regional de distribución bacteriano. Este análisis se realizó dentro del marco de la Teoría de Metacomunidades y utilizando datos de suelos con y sin historia de manejo de una transecta Este-Oeste que abarcó el gradiente edáfico y climático completo de la Región Pampena. Los resultados mostraron que los efectos de la dispersión fueron más importantes que los efectos contemporáneos a nivel regional, enmascarando así los impactos locales generados por el uso agrícola. Abstract: Soil is one of the most biodiverse and heterogeneous environments of Earth. Soil bio-chemical processes are essential for life and are carried out by microorganisms, mainly Bacteria and Archaea. Moreover soil is very important for humans, since it is the main source of food; but as any other natural resource it is not limitless. Though studying the impact of agriculture on soil physical, chemical and biological characteristics, and hence on ecosystem processes is imperative. The 50% of Pampas surface is devoted to agriculture. The impact of agricultural practices on soil physical and chemical properties has been extensively studied in the region. However, beyond the great effort made, there is a debt yet to understand the consequences of agriculture on biodiversity and biological processes. The work presented here aims to repay part of this debt by studying the impact of agriculture on soil bacterial communities of the Pampas. We used an ecological approach and 50% of the surface of Pampas is devoted to agriculture. The impact of agricultural practices on soil physical and chemical characteristics has been extensively studied in the region. However, beyond the great effort made, there is a debt yet to understand the consequences of agricultural biodiversity and biological processes. The work presented here aims to repay this debt of studying the impact that agriculture on soil bacterial communities of the Pampas. We used an ecological approach and metagenomics. The first chapter was focused on the study of the impact of over 100 years of farming on the structure of microbial communities and their metabolic (metagenomic) profiles. Significant differences between communities of soils with and without a history of agricultural management were found. The second chapter is devoted to the comparison of two tillage systems. We studied the structure and metagenomic profiles of soil communities under conventional tillage and no-tillage. We found that communities differ in their taxonomical composition and metabolisms. The aim of the third chapter was to determine the regional pattern of bacterial distribution. This analysis was performed within the framework of the theory of metacommunities. We sampled soils with and without soil management history, in an East-West transect that spanned the entire climatic and edaphic gradient of the Pampas. The results showed that dispersion was more important than environmental contemporaneous effects at the regional level, thus masking local impacts generated by agricultural use.
Cita tipo APA: Carbonetto, María Belén . (2014). Diversidad de las comunidades microbianas de los suelos pampeanos. Enfoques ecológicos y metagenómicos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5465_Carbonetto.pdf Cita tipo Chicago: Carbonetto, María Belén. "Diversidad de las comunidades microbianas de los suelos pampeanos. Enfoques ecológicos y metagenómicos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5465_Carbonetto.pdf |
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Bisceglia, Silvina Beatriz Catalina. "Los efectos de los cambios en las condiciones climáticas y ambientales sobre un ensamble de roedores sigmodontinos y la respuesta de sus principales depredadores en un área protegida de la ecorregión del Monte" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las interacciones inter-específicas y las condiciones ambientales (climáticas y de vegetación) son consideradas los principales factores que estructuran los ensambles de mamíferos del desierto. En esta tesis se evaluaron la abundancia y la estructura de los ensambles de micromamíferos de un área protegida en la ecorregión del Monte y su relación con los factores antes mencionados. El estudio se realizó en el Parque Nacional Lihué Calel (La Pampa, Argentina) durante cuatro años (2008-2011). Se describieron los principales parámetros climáticos y de vegetación. Se estimó la composición y la abundancia de las distintas especies que caracterizan el ensamble de micromamíferos presente y, en simultáneo, se estudiaron las composiciones dietarias del zorro gris pampeano (Pseudalopex gymnocercus) y del gato montés (Leopardus geoffroyi). Los resultados mostraron que la riqueza, abundancia y diversidad que caracterizan al ensamble de micromamíferos, presentaron variaciones abruptas debido a las variaciones contrastantes que se registraron en el régimen de precipitaciones ocurridas durante los primeros dos años del estudio (período relativamente más seco) con respecto a los dos últimos (período relativamente más húmedo). Se encontró que la variabilidad en la abundancia de los roedores cricétidos dependió, principalmente, de la continuidad de las precipitaciones y de la intensidad de la evapotranspiración. Sin embargo la relación entre dichas variables climáticas y la abundancia poblacional fue diferente para cada una de las especies estudiadas. La presencia de las distintas especies de roedores, en todos los tipos de ambientes estudiados (arbustales, pastizales y bosques), estuvo principalmente relacionada con el porcentaje de cobertura de las formas de vida que se encontraban en los estratos bajos y, por lo tanto, con el porcentaje de suelo desnudo. En cuanto a los depredadores, los zorros y los gatos respondieron diferencialmente ante los cambios en los niveles de abundancia de los roedores. El consumo por parte de los gatos aumentó mientras que el de los zorros se mantuvo constante ante el aumento de la abundancia. De esta manera, se pudo inferir que los gatos ejercen un mayor impacto sobre la estructura del ensamble de roedores al presentar una respuesta inmediata ante las variaciones de abundancia. Los resultados de esta tesis mostraron la respuesta de algunos de los componentes del ecosistema ante los cambios ambientales que ocurren en los ambientes del Monte y la interpretación de los mismos como una primera aproximación al grado de vulnerabilidad y resiliencia de estos ecosistemas áridos. Se considera que la infomación generada resulta de utilidad para implementar medidas de manejo tendientes a mantener la estabilidad ecológica en el área protegida mencionada. Abstract: The inter-specific interactions and environmental conditions (climate and vegetation) are considered the main factors in structuring the desert small mammal assemblages. In this work, the abundance and structure of small mammal assemblages of a protected area in the Monte ecoregion and its relationship with the cited factors were evaluated. The study was carried out in Lihue Calel National Park (La Pampa, Argentina) during four year (2008-2012). The main climate and vegetation parameters were described. The composition and abundance of the different species that characterize the small mammal assemblage were estimated and, simultaneously, the dietary compositions of the pampa gray fox (Pseudalopex gymnocercus) and the geoffroy´s cat (Leopardus geoffroyi) were studied. The results showed that the richness, abundance and diversity that characterize the mammal assemblage showed abrupt changes due to contrasting variation of the registred precipitation patterns occurred during the first two years (relatively drier) in comparison with the latter two (relatively wet). It was found that the variability in the abundance of rodent cricetids depended mainly on the continuity of rainfall and on the evapotranspiration intensity. However, the relationship between these climatic variables and population abundance was different for each species studied. The presence of different species of rodents, in every type of environment studied (shrublands, grasslands and forests), was mainly related to the cover of life forms found in the lower strata and, therefore, to the percentage of bare soil. Regarding predators, foxes and cats had different responses to the changes in the rodent abundance levels. The consumption by cats increased while the consumption by foxes remained constant when the abundance increased. Thus, it could be inferred that cats have a greater impact on rodent assemblage structure by presenting an immediate response to abundance changes. The results of this thesis showed the response of some of the components of the ecosystem to environmental changes that take place on Monte regions and their interpretation as a proxy for the degree of vulnerability and resilience of arids ecosystems. It is considered that the generated data are useful for the implementation of environmental management measures tending to keep the ecological stability in the protected area.
Cita tipo APA: Bisceglia, Silvina Beatriz Catalina . (2014). Los efectos de los cambios en las condiciones climáticas y ambientales sobre un ensamble de roedores sigmodontinos y la respuesta de sus principales depredadores en un área protegida de la ecorregión del Monte. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5489_Bisceglia.pdf Cita tipo Chicago: Bisceglia, Silvina Beatriz Catalina. "Los efectos de los cambios en las condiciones climáticas y ambientales sobre un ensamble de roedores sigmodontinos y la respuesta de sus principales depredadores en un área protegida de la ecorregión del Monte". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5489_Bisceglia.pdf |
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Belluscio, Laura María. "Malnutrición proteica como modelo de adversidad perinatal y su influencia sobre el desarrollo de capacidades cognitivas y socioemotivas" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El desarrollo perinatal representa un período crítico en la vida de un individuo caracterizado por una sensibilidad extrema a experiencias e interacciones con el medio ambiente que originan efectos duraderos, y muchas veces permanentes, sobre la estructura y función del cerebro. La calidad del período embrionario como la calidad del ambiente y experiencias postnatales tempranas tienen una enorme influencia sobre el desarrollo emocional y cognitivo con consecuencias que se extienden durante toda la vida. Una de las causas más difundidas entre la población mundial y con consecuencias más deletéreas sobre el desarrollo y la plasticidad neuronal es la que proviene de la desnutrición o la malnutrición. Esta provoca, según su severidad, desde problemas y retardos en el aprendizaje hasta retrasos mentales con profundas consecuencias en la sociabilidad del sujeto a lo largo de toda su vida. Los modelos en roedores han demostrado ser útiles ya que se observaron alteraciones neuroanatómicas comparables y deficiencias similares en las capacidades de aprendizaje y memoria(1). Estas evidencias convergentes sugieren una relación causal entre malnutrición proteica y alteraciones neurofisiológicas. Sin embargo, y pese a los avances realizados al respecto en los últimos años, diversos interrogantes permanecen aún sin respuesta. Algunas de estas cuestiones abiertas se refieren a cuales son las alteraciones conductuales y cognitivas afectadas por la malnutrición en la etapa perinatal, si las deficiencias observadas presentan dimorfismo sexual, cuáles son los mecanismos moleculares que median los efectos permanentes de la malnutrición en etapas tempranas de la vida y si los efectos observados son transmitidos a las siguientes generaciones que no hayan sido sometidas a esta adversidad perinatal. En este trabajo de tesis nos centramos en el establecimiento de un modelo de malnutrición proteica perinatal en ratones, estudiando el efecto sobre el comportamiento de las crías a diferentes edades, con el fin de dilucidar si las diferencias encontradas en la bibliografía se debían a la edad a la que se realizaron los estudios. Además se trabajó con crías machos y hembras con el objeto de identificar posibles efectos diferenciales de la dieta de acuerdo al sexo. Nuestra evaluación inicial del desarrollo morfológico y neurológico de las crías reveló un claro retraso en el grupo cuyas madres sufrieron una reducción del 55% en el contenido proteico de la dieta. Estas últimas sufrieron una alteración en su comportamiento tanto en lo referido al cuidado dedicado a las crías como en la presencia de un comportamiento de tipo ansioso. Este comportamiento de tipo ansioso también fue observado en las crías mediante los test de laberinto elevado en cruz y de campo abierto, junto con una menor motivación exploratoria revelada por el test de escape de la jaula. En relación a las capacidades cognitivas de las crías se encontró un defecto en la memoria declarativa de largo término y la memoria espacial de corto término solamente en machos. En hembras se evidenció además un mayor componente de comportamiento tipo depresivo, que no fue observado en machos. Con el fin de develar las bases moleculares de los defectos observados, realizamos un análisis de la expresión de génica y de los niveles de modificaciones epigenéticas, a diferentes edades en ambos sexos. Encontrando una disminución en la cantidad de mensajero de la neurotrofina BDNF y una acetilación diferencial global de las histonas 3 y 4. Este hallazgo resulta interesante debido a que está ampliamente documentado que BDNF es fundamental para el desarrollo del sistema nervioso y cumple diversos roles en procesos de aprendizaje y memoria. Además se ha visto que su expresión se encontraba disminuida en ratones que sufrieron de un estrés perinatal (como períodos de separación materna), y en modelos de enfermedades neurológicas y psiquiátricas. Por otro lado, la expresión de este gen es finamente regulada a través de diversas modificaciones epigenéticas por lo que es sensible a factores ambientales. En nuestro modelo, la acetilación anormal observada en ratones malnutridos perinatalmente podría producir un desbalance general en la expresión de diversos genes que podría llevar a una menor expresión de BDNF. Ambas alteraciones moleculares observadas podrían formar parte de los mecanismos moleculares causantes de las deficiencias cognitivas y conductuales observados. Finalmente, los diferentes niveles de acetilación observados, posibilitarían la herencia de las diferencias observadas a una generación sucesiva que nunca fue expuesta a este tipo de malnutrición. Un estudio preliminar realizado a partir de la descendencia de ratones que sufrieron de una malnutrición hipoproteica perinatal, mostró una tendencia hacia un retraso en el desarrollo de estas crías y a una alteración en la conducta motivacional, tal como se había visto en sus progenitores. En resumen, los resultados aquí presentados demostraron que una malnutrición materna durante una etapa perinatal afecta la maduración del sistema nervioso, provocando cambios que perduran a lo largo de la vida, más allá del tiempo de exposición a la dieta deficiente. Estos cambios se pueden observar a nivel molecular y en un amplio rango de comportamientos. Cabe destacar también que el trabajo de la presente tesis permitió establecer dicho modelo de estrés perinatal, el cual servirá de base para futuros estudios en el laboratorio y que podrá utilizarse para generar y responder numerosas preguntas. Abstract: Perinatal development represents a critical period in the life of an individual. It is characterized by extreme sensitivity to experiences and environmental interactions which may cause lasting and often permanent changes in brain’s structure and function. The quality of the embryonic period as the quality of the environment and early postnatal experiences, have a huge influence on emotional and cognitive development with consequences that extend throughout life. A common cause of poor development that has deep deleterious effects on brain’s growth and plasticity is that which comes from under nutrition or malnutrition. This provokes from problems and delays in learning to mental retardation with profound consequences for the sociability of the subject throughout his life. Rodents have proven useful as a model as they mimic the neuroanatomical disturbances and the learning and memory deficiencies observed in humans. These multiple evidences point to a causal relationship between protein malnutrition and neurophysiological alterations. However, despite the progress made in recent years in this regard, many questions remain unanswered. Some of these open questions concern which are the behavioral and cognitive alterations affected by malnutrition in the perinatal period, if these deficiencies are sexually dimorphic, which are the molecular mechanisms that mediate the permanent effects of malnutrition in early stages of life and whether the observed effects are transmitted to subsequent generations that have not been subjected to perinatal adversity. During this thesis we focused on the establishment of a perinatal protein malnutrition (pregnancy and lactation) model in mice, and studied the effect on the offspring behavior at different ages, in order to determine whether the differences found in the literature were due to the age at which the studies were conducted. We analyzed male and female offspring in order to identify possible differential effects of diet according to sex. Our initial evaluation of the offspring morphological and neurological development revealed a clear delay in the group whose mothers experienced a 55% reduction in the protein content of the diet. The latter suffered an alteration in their behavior both in terms of the care dedicated to the pups and in the presence of an anxiety-like behaviour. This anxiety-like behaviour was also observed in the offspring through the elevated plus maze and open field tests, along with a smaller exploratory motivation revealed by the cage escape test. We also found a defect in long-term declarative memory and spatial short-term memory, restricted to male individuals of the offspring. There was also evidence of a depression-like behaviour restricted to females. In order to unravel the molecular basis of the defects observed we analyzed gene expression and epigenetic modifications levels at different ages in both sexes. We found reduced BDNF mRNA levels and a differential global acetylation of histones 3 and 4. This is an interesting finding because it has been extensively reported that BDNF is crucial for brain development and has different roles in memory and learning. A reduced expression of BDNF has also been described in mice that had suffered from maternal separation during lactation, and for several neurological and psychiatric diseases models. Furthermore, BDNF expression is tightly regulated by epigenetic modifications so it is sensitive to environmental factors. In our model, the abnormal acetylation observed in perinatally malnourished mice could produce an overall imbalance in the expression of various genes that could lead to a lower expression of BDNF. Together, these molecular alterations could be part of the molecular mechanisms causing the cognitive and behavioral deficits observed. Finally, the different levels of acetylation observed would enable the inheritance of the observed differences to a later generation that was never exposed to this type of malnutrition. A preliminary study from the offspring of mice who suffered perinatal lowprotein malnutrition, showed a trend towards a delay in the development of these offspring and an alteration in motivational behavior, as was seen in their parents. In summary, the results presented here demonstrate that the quality of maternal nutrition during the perinatal stage affect maturation of the nervous system and causes changes that persist throughout life, even long after the exposure to the poor diet. These changes can be observed at the molecular level and in a wide range of behaviors. It is also noteworthy that the work of this thesis allowed us to establish a model of perinatal stress, which will be the basis for future studies in the laboratory and can be used to generate and answer many questions.
Cita tipo APA: Belluscio, Laura María . (2014). Malnutrición proteica como modelo de adversidad perinatal y su influencia sobre el desarrollo de capacidades cognitivas y socioemotivas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5478_Belluscio.pdf Cita tipo Chicago: Belluscio, Laura María. "Malnutrición proteica como modelo de adversidad perinatal y su influencia sobre el desarrollo de capacidades cognitivas y socioemotivas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5478_Belluscio.pdf |
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Arzeni, Carolina. "Modificación molecular y funcional de proteínas de clara de huevo mediante ultrasonidos de alta intensidad: aplicación de esta tecnología al diseño de nanovehículos para ácido fólico" (2014). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de este trabajo fue caracterizar el efecto de la aplicación de ultrasonidos de alta intensidad (USAI) en las propiedades moleculares y funcionales de un aislado de proteínas de albúmina de huevo comercial (EW) y desarrollar nanopartículas por agregación controlada mediante USAI, sólo o en combinación con altas temperaturas (termosonicación), con la finalidad de emplearlas como nanovehículos (nanocarriers) para ácido fólico (AF). Luego de la aplicación de USAI, la hidrofobicidad superficial aumentó, mientras que se produjo un leve descenso del contenido de grupos SH totales. La viscosidad aparente disminuyó con el tratamiento con USAI, lo que pudo ejercer una influencia negativa en la capacidad de espumado y la estabilidad de las espumas. Sin embargo, la estabilidad al colapso no se vio afectada. Las emulsiones preparadas a partir de soluciones sonicadas resultaron ser más estables al cremado y a la floculación. No hubo diferencias significativas en los parámetros reológicos de los geles estudiados. La velocidad de formación de agregados por efecto del calentamiento fue mayor para las soluciones sonicadas, lo cual puede atribuirse al aumento en la hidrofobicidad de la proteína luego de la sonicación. Luego, se realizaron tratamientos con USAI y termosonicación a pH 7 y 3, para determinar las condiciones óptimas para la formación de las nanopartículas. Se seleccionaron dos tipos de nanopartículas, ambas a pH 3: las obtenidas por USAI, que presentaron una población monomodal de 220,2 nm de diámetro y las obtenidas por termosonicación, porque contenían partículas de 37,8 nm en su mayoría. Luego de la unión con AF, el tamaño de partícula permaneció igual. El porcentaje de AF unido fue de alrededor de 80% para ambos nanovehículos. Luego de la liofilización, se observó una leve agregación de las nanopartículas reconstituidas. Finalmente, se determinó que, luego de la digestión gastrointestinal in vitro de los complejos, la biodisponibilidad del AF para Lactobacillus rhamnosus fue mayor en comparación con la de la vitamina libre. Abstract: The objective of this work was to characterize the effect of the application of high intensity ultrasound (USAI) on the molecular and functional properties of a commercial egg white protein isolate (EW) and to develop nanoparticles by means of controlled aggregation using USAI, alone or combined with high temperatures (thermosonication), with the aim of using them as nanocarriers for folic acid (AF). After the application of USAI, the surface hidrophobicity increased; while a slight decrease in the total SH groups content was observed. The apparent viscosity was lowered by USAI treatment, which could exert a negative influence on the foaming capacity and foam stability. However, the stability to collapse remained unaffected. The emulsions prepared from sonicated solutions turned out to be more stable to creaming and flocculation processes. There were no significant differences among the studied rheological parameters of the gels. The rate of aggregates formation by heating was higher for sonicated solutions, which can be attributed to the increase in surface hydrophobicity of the protein after USAI treatment. Then, USAI and thermosonication treatments were applied at pH 3 and 7 to determine the optimal conditions for the formation of nanoparticles. Two types of nanoparticles were selected, both at pH 3: one obtained by USAI, which presented a monomodal population of 220.2 nm of diameter and another produced by thermosonication, because it contained particles of 37.8 nm mostly. When binding the AF to the nanoparticles, the particle size was unaffected. The percentage of bound AF was approximately 80% for both nanocarriers. After freeze-drying the samples, a slight aggregation of the rehydrated nanoparticles was observed. Finally, it was determined that, after in vitro gastrointestinal digestion of the complexes, the bioavailability of AF for Lactobacillus rhamnosus was higher in comparison with the free vitamin.
Cita tipo APA: Arzeni, Carolina . (2014). Modificación molecular y funcional de proteínas de clara de huevo mediante ultrasonidos de alta intensidad: aplicación de esta tecnología al diseño de nanovehículos para ácido fólico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5480_Arzeni.pdf Cita tipo Chicago: Arzeni, Carolina. "Modificación molecular y funcional de proteínas de clara de huevo mediante ultrasonidos de alta intensidad: aplicación de esta tecnología al diseño de nanovehículos para ácido fólico". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5480_Arzeni.pdf |
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Rimondi, Agustina. "Estudio de la patogenia del Virus de Influenza Aviar de baja patogenicidad en aves de corral inmunosuprimidas por la afección con el virus de la Anemia Infecciosa Aviar" (2014-12-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Influenza Aviar es considerada una zoonosis con potencial pandémico. El agente etiológico responsable de esta enfermedad es el Virus de Influenza A, cuyo reservorio natural son las aves silvestres acuáticas. En ellas, la infección con el Virus de Influenza Aviar (AIV) generalmente es asintomática, mientras que en las aves de corral la infección con AIV puede producir una variedad de síntomas que se extienden desde presentaciones asintomáticas o suaves a una enfermedad aguda y fatal. En consecuencia, se generan grandes pérdidas económicas asociadas al control y erradicación de este agente en las aves domésticas. Por ello, en la presente tesis nos propusimos estudiar, primero, la presencia del AIV en las aves silvestres acuáticas de la Argentina y, luego, su introducción y difusión en aves de corral con diferente estado inmunológico. Los resultados obtenidos permitieron evidenciar la circulación de veinte Virus de Influenza Aviar de Baja Patogenicidad (LPAIV) de diversos subtipos en las aves silvestres que habitan en la Argentina. Estos LPAIV aislados presentaron características genéticas particulares en sus genes que los diferencian de los AIV aislados en otras regiones. En particular, se evidenció la existencia de un linaje Sudamericano con evolución independiente para los seis genes que codifican las proteínas internas del Virus de Influenza Aviar. Debido a que la mayoría de los LPAIV aislados en nuestro país fueron de subtipo H6, se estudió la patogenia de estos virus en las aves de corral. Los resultados demostraron que estos virus de subtipo H6 tienen capacidad de infectar pollos y de transmitirse por contacto, evidenciando el riesgo potencial de introducción de estos virus en las aves de corral. Por otra parte, se sabe que en la Argentina, como en cualquier país con una producción avícola intensiva, existe una alta incidencia del Virus de Anemia Infecciosa Aviar (CAV) dentro de los planteles de aves domésticas. Actualmente, se carece de conocimiento acerca de la importancia que puede tener el estado de inmunosupresión provocado por este agente en la evolución de la patogenia del AIV. Por ello, en el trabajo de tesis que se presenta a continuación se estudió de patogenia del LPAIV subtipo H6 en pollos inmunosuprimidos experimentalmente por la infección con una cepa de CAV autóctona. Los resultados obtenidos demostraron que el AIV utilizado, aislado de aves silvestres en la Argentina, tiene igual capacidad de infectar pollos y de transmitirse por contacto directo en aves inmunocompetentes e inmunosuprimidas con CAV. En conjunto, los resultados presentados en esta tesis permiten colaborar con mejores análisis de riesgo para el diseño de estrategias de control y prevención con el objetivo de proteger las aves domésticas de nuestro país. Además, haber aumentado la información acerca de la epidemiología de la Influenza Aviar en la región es de suma importancia para comprender en mayor profundidad las potenciales consecuencias de esta enfermedad, tanto en las aves silvestres como en las aves domésticas. Sumado a esto último, es importante destacar que la Influenza Aviar es una zoonosis, con lo cual el aumento de la información disponible sobre este agente infeccioso es de relevancia para el sistema de Salud Pública nacional. Abstract: Avian influenza is considered a zoonosis with pandemic potential. The etiologic agent responsible for this disease is influenza A virus, whose natural reservoir are aquatic wild birds. In this species, the infection with Avian Influenza Virus (AIV) is generally asymptomatic, while in poultry AIV infection can cause a variety of symptoms ranging from asymptomatic or mild presentations to an acute and fatal disease. Consequently, there are large economic losses associated with control and eradication of this agent in commercial sheds. Therefore, in this thesis we intended to study the presence of AIV in wild aquatic birds circulating in Argentina and their possible introduction and spread in poultry with different immunologic status. The results obtained showed the circulation of twenty Low Pathogenic Avian Influenza Virus (LPAIV) from wild birds in Argentina. These viruses were from different subtype and all showed particular genetic characteristics in their genes that differ from AIV isolated in other regions. Particularly, genetic and phylogenetic analyses of their internal gene segments revealed a close relationship with influenza viruses from South America, forming a unique clade and supporting the notion of independent evolution from influenza A viruses in other latitudes. Due to AIV from H6 subtype were most consistently isolated in Argentina, we investigated the replication and transmission of these Argentine H6 AIV in poultry. The results suggested that these Argentine H6 viruses could replicate and transmit in chickens, demonstrating the potential risk of introduction of these viruses in poultry. It is known that in Argentina, as in any country with intensive poultry production, there is a high incidence of Chicken Infectious Anemia Virus (CAV) in commercial flocks. Currently, there is a lack of knowledge about the importance of the immunosuppression caused by this agent in the evolution of the pathogenesis of AIV. Therefore, in this thesis we studied the pathogenesis of LPAIV H6 subtype in chickens experimentally immunosuppressed by infection with an Argentinean field CAV strain. The results obtained showed that, under our experimental conditions, Argentinean H6 AIVs have equal ability to infect chickens and be transmitted as a result of direct contact, either in immunocompetent chickens or immunosuppressed chickens with CAV. Overall, the results presented in this thesis allow cooperate with better risk analysis for the design of prevention and control strategies to protect commercial poultry farms in our country. Also, it has increased the information about the epidemiology of AIV in South America, critical to understand in greater depth the potential consequences of this disease in both wild birds and domestic poultry. In addition, it is noteworthy that avian influenza is a zoonosis, thereby our results increase the information available on this infectious agent which is relevant to the national public health system.
Cita tipo APA: Rimondi, Agustina . (2014-12-22). Estudio de la patogenia del Virus de Influenza Aviar de baja patogenicidad en aves de corral inmunosuprimidas por la afección con el virus de la Anemia Infecciosa Aviar. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5633_Rimondi.pdf Cita tipo Chicago: Rimondi, Agustina. "Estudio de la patogenia del Virus de Influenza Aviar de baja patogenicidad en aves de corral inmunosuprimidas por la afección con el virus de la Anemia Infecciosa Aviar". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5633_Rimondi.pdf |
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Pérez Tito, Leticia Gabriela. "Consumo materno de alcohol: impacto en el desarrollo embrio-trofoblástico temprano y en la gestación a término" (2014-12-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El consumo de alcohol durante la gestación produce el Síndrome de Alcoholismo Fetal. Postulamos que el consumo perigestacional de alcohol hasta períodos periimplantatorios, en el ratón, induce alteraciones embrio-trofoblásticas que resultan en defectos feto-placentarios a largo plazo. Utilizando modelos murinos (CF-1 y CD-1) y la administración oral de etanol (10%) previo a la fecundación y hasta los días 4, 5 u 8 de gestación (dg), los objetivos fueron: 1) analizar parámetros biométricos y el ciclo estral frente a la exposición pregestacional (17 días previos a la gestación); 2) evaluar la diferenciación, crecimiento embrionario y capacidad invasiva trofoblástica luego del consumo de alcohol hasta la etapa periimplantatoria (días 4 y 5 dg) y postimplantatoria temprana (día 8 dg); 3) analizar la incidencia de malformaciones fetales y anomalías placentarias en la gestación a término (día 18 dg). La exposición pregestacional a alcohol en CF-1 indujo interrupción del ciclo estral, resultados que determinaron la inducción de la ovulación. Al día 4 dg (preimplantación) en CF-1 y CD-1 se evidenció retraso en la diferenciación y crecimiento embrionario, alteración de la expresión y localización de moléculas de adhesión (ZO-1, E-cadherina) y aumento de apoptosis. Al día 5 dg (implantación), además de retraso de diferenciación, se halló desregulación en la dinámica de crecimiento y expansión trofoblástica durante la implantación in vitro. Al día 8 dg, se evidenció menor grado de diferenciación embrionaria, alteraciones histológicas junto a una alta tasa de apoptosis. La reducida expresión de E-cadherina en ectodermo embrionario e incremento de metaloproteasas -2 y -9 posiblemente se relaciona con la expansión trofoblástica anómala observada en cultivos de conos ectoplacentarios. Al día 18 dg, luego del consumo de alcohol hasta el día 4, 8 o 10 dg, se encontró aumento de reabsorciones embrionarias, alta incidencia de malformaciones craneofaciales, osificación fetal incompleta y alteraciones histológicas placentarias. La ingesta perigestacional de alcohol hasta la preñez temprana altera la dinámica de diferenciación y crecimiento del embrión periimplantatorio, las uniones celulares y la expresión de metaloproteasas en los tejidos embrionarios conduciendo a malformaciones fetales y posible restricción del crecimiento intrauterino al día 18 dg. La desregulación de la invasividad trofoblástica al día 5 y 8 dg podría vincularse con pérdida temprana de la gestación y con alteraciones placentarias observadas en la gestación a término. Abstract: Alcohol consumption during pregnancy causes Fetal Alcohol Syndrome. We postulate that perigestational consumption of alcohol to periimplantational periods in mouse, induces embryonic and trophoblast changes that result in fetal-placental defects at long term. Using murine models (CF-1 and CD-1) and oral administration of ethanol (10%) previously to fertilization and up to days 4, 5 or 8 of gestation (g), the objectives were: 1) to analyze biometric parameters and the estrous cycle upon pre-gestational exposure (17 days prior to gestation), 2) to evaluate the differentiation, the embryo growth and trophoblast invasiveness after alcohol drinking up to stages of peri-implantation (days 4 and 5 g) and early post-implantation (day 8 g), 3) to analyze the incidence of fetal malformations and placental abnormalities in pregnancy to term (day 18 g). The pregestational exposure to alcohol in CF-1 induced disruption of the estrous cycle, results that determined the induction of ovulation. By day 4 g (preimplantation) in CF- 1 and CD-1 delayed embryo differentiation and growth, disruption of expression and localization of adhesion molecules (ZO-1, Ecadherin) and increased apoptosis were evidenced. By day 5 g (implantation), besides the delayed differentiation, deregulation of trophoblast growth and expansion dynamics was found during in vitro implantation. At 8th gd, it were evidenced lower degree of embryonic differentiation, and histological anomalies with a high rate of apoptosis. The reduced E-cadherin expression in embryonic ectoderm and metalloproteases -2 and -9 increase possibly is related to abnormal trophoblast expansion observed in cultures of ectoplacental cones. At day 18 g, after alcohol consumption up to 4, 8 or 10 g, increased embryo resorptions, high incidence of craniofacial malformations, incomplete fetal ossification and placental histological abnormalities were found. The perigestational alcohol intake up to early pregnancy alters the dynamics of differentiation and growth of periimplantational embryo, the cell junctions and the expression of metalloproteinases in embryonic tissues leading to fetal malformations and possible intrauterine growth restriction day 18 g. Deregulation of trophoblast invasiveness on day 5 and 8 g could be linked to early pregnancy loss and placental alterations observed in the pregnancy to term.
Cita tipo APA: Pérez Tito, Leticia Gabriela . (2014-12-22). Consumo materno de alcohol: impacto en el desarrollo embrio-trofoblástico temprano y en la gestación a término. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5626_PerezTito.pdf Cita tipo Chicago: Pérez Tito, Leticia Gabriela. "Consumo materno de alcohol: impacto en el desarrollo embrio-trofoblástico temprano y en la gestación a término". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5626_PerezTito.pdf |
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Bernabó, Guillermo. "Caracterización de genes nuevos involucrados en neurodegeneración en Drosophila melanogaster" (2014-12-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de esta tesis es identificar nuevos genes involucrados en neurodegeneración en Drosophila melanogaster y comprender su función y el mecanismo por el cual provoca dicha patología. En particular, se hizo foco en orsai. Encontramos que adultos envejecidos con la expresión de orsai reducida en las neuronas que controlan el comportamiento rítmico locomotor presentaban una caída en la ritmicidad y un alargamiento del período. La reducción de ORSAI en el cerebro adulto envejecido provoca que estos presenten signos de neurodegeneración más severos que sus controles. También se encontró que la reducción de los niveles de este gen en larvas provoca arresto en el segundo estadio y la consiguiente letalidad temprana. Estas larvas tienen un comportamiento anómalo frente a la comida, alejándose de la misma y reptando en un modo de clásico forrajeo, a pesar de tener alimento disponible, hasta su muerte. Encontramos que acotando la reducción de ORSAI a las tráqueas fenocopia al mutante. También determinamos que la respiración mitocondrial está severamente reducida en el mutante. La alteración de los niveles de ORSAI en distintos tejidos, tanto larvales como adultos, provoca diversos fenotipos, lo que demuestra la importancia de este gen para la homeostasis celular. El fenotipo en las tráqueas podría, a través de procesos hipóxicos, explicar el comportamiento de forrajeo en larvas y, sumando a esto la disfunción mitocondrial, los fenotipos observados en adultos. Abstract: The goal of this thesis was to identify new genes involved in neurodegeneration in Drosophila melanogaster and to understand their function and the mechanisms triggered upon their deregulation. In particular, we focused on orsai. We found that aged adult flies with reduced orsai expression in neurons that control rhythmic locomotor behavior showed declined rhythmicity and a lengthened period. Reduced ORSAI levels in aged adult brains correlate with signs of neurodegeneration more severe than controls. We also found that reduced orsai levels cause second instar developmental arrest and the ensuing early mortality. These larvae display an anomalous feeding behavior; they crawl away from the food source as if were foraging, and, despite food availability, they do so until their death. We found that limiting ORSAI depletion to the tracheal system phenocopies the mutant behavior. We also determined that mitochondrial respiration is severely reduced in the mutant. Importantly, reducing ORSAI levels in different tissues, both larval as well as adult, triggers diverse phenotypes, highlighting its relevance in cellular homeostasis. The tracheal phenotype could, through hypoxic processes, account for the abnormal larval foraging behavior and, taking into account the mitochondrial dysfunction, the observed adult phenotypes.
Cita tipo APA: Bernabó, Guillermo . (2014-12-22). Caracterización de genes nuevos involucrados en neurodegeneración en Drosophila melanogaster. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5637_Bernabo.pdf Cita tipo Chicago: Bernabó, Guillermo. "Caracterización de genes nuevos involucrados en neurodegeneración en Drosophila melanogaster". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5637_Bernabo.pdf |
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Berenstein, Ariel José. "Análisis de redes complejas en sistemas biomoleculares" (2014-12-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Dentro de una célula coexisten diferentes tipos de biomoléculas que participan en intrincadas redes de interacciones físicas y bioquímicas. Las mismas facilitan la supervivencia de la célula y hacen de ella un sistema extremadamente complejo. La descripción de estas interacciones bajo la perspectiva de redes complejas ofrece la posibilidad de estudiar propiedades colectivas emergentes, detectar patrones de organización y proveer una visión global de la célula como sistema. Estas redes presentan estructura modular no trivial. Numerosos trabajos han puesto esfuerzos en correlacionar esta estructura modular con grupos de biomoléculas que llevan a cabo funciones biológicas específicas. No obstante, un problema de ese enfoque es el hecho de que la estructura modular observada en una red depende de la escala adoptada así como de los algoritmos de agrupamiento utilizados. Esta tesis hace especial énfasis en comprender cómo distintos algoritmos de agrupamiento y sus niveles de resolución implícitos pueden afectar a los análisis biológicos subsecuentes. Se consideró una red de interacción de proteínas, y distintos conjuntos de proteínas involucradas en procesos de envejecimiento celular y vías de se˜nalización. Se emplearon dos algoritmos de agrupamiento ampliamente reconocidos, uno basado en teoría de información y otro en optimización de la modularidad de la red. Mientras que el primer tipo es capaz de detectar estructuras topológicas libres de escala característica, el segundo tiene límite de resolución bien definido. Los resultados obtenidos sugieren que si bien ambos algoritmos obtienen particiones de similar modularidad, las mismas difieren significativamente en el nivel de congruencia biológica, el grado de granularidad de las descripciones modulares y en la capacidad para detectar asociaciones estadísticamente significativas entre los conjuntos de proteínas considerados y los respectivos roles cartográficos de la red. Por otro lado se abordó el problema de reposicionamiento de fármacos en el contexto de enfermedades tropicales desatendidas. Para ello, se construyó y caracterizó una red multicapa compuesta por fármacos, proteínas de múltiples especies y diversos tipos de relaciones estructurales, químicas, metabólicas y de bioactividad. Empleando técnicas de priorización en redes complejas se abordaron dos problemas biológicos de interés. Por un lado la priorización de potenciales blancos de droga en un organismo patógeno de interés. Por otro lado la búsqueda de blancos de drogas con actividad probada sobre un organismo, pero cuyos mecanismos y blancos de acción permanecen desconocidos. Los resultados fueron validados computacionalmente y discutidos desde un punto de vista biológico en base a bibliografía reciente. En suma los resultados indican que el enfoque adoptado resulta de gran utilidad para guiar experimentos que busquen entender los mecanismos de acción de drogas que aún permanecen desconocidos. Abstract: Inside a cell different types of biomolecules coexist, which are involved in intricate networks of physical and biochemical interactions. They facilitate the cell survival and make it an extremely complex system. The description of these interactions from complex network perspective allows to study emerging collective properties, to detect organization patterns and provides an overview of the cell as a system. These networks have nontrivial modular structure. Several works have concentrated on correlating this modular structure with groups of biomolecules that carry out specific biological functions. However, a concerning issue of this approach is that observed modular structure in a network depends on the adopted scale as well as the clustering algorithms used. This thesis is focused on understanding how different clustering algorithms and their implicit resolution levels may affect subsequent biological analysis. To this end, a protein-protein interaction network was considered and examined several protein sets related to cell aging and signaling pathways. Two clustering algorithms widely recognized were considered, one based on information theory and other based on network modularity optimization. While the first one is capable of scale-free recognition of topological structure, the second one has a well-defined resolution limit. The results suggest that although both algorithms result in partitions of similar modularity, they differ significantly on its biological congruence, the granularity of modular descriptions and its ability to detect statistically significant associations between considered protein sets and network cartographic roles. On the other hand the problem of drug repositioning is addressed in context of neglected tropical diseases. To achieve this, a multilayer network consisting of chemical compounds, proteins from multiple species and several classes of structural, chemical, and metabolic relationships as well as bioactivities between them was constructed and characterized. Taking advantage of prioritization techniques in complex networks, two interesting biological issues were addressed. Firstly, the prioritization of putative drugtargets in a given pathogenic species was tackled. Secondly, protein targets were looked for on tested active compounds whose mechanisms of action and targets remained unknown. The results were validated computationally and discussed from a biological point of view taking into account recent literature. In summary, the results suggest that the approach is useful for guiding experiments that seek to understand drugs mechanisms of action that are still unknown.
Cita tipo APA: Berenstein, Ariel José . (2014-12-22). Análisis de redes complejas en sistemas biomoleculares. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5636_Berenstein.pdf Cita tipo Chicago: Berenstein, Ariel José. "Análisis de redes complejas en sistemas biomoleculares". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5636_Berenstein.pdf |
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Patterson, Germán A.. "Estudio de la dinámica de los sistemas memristivos : efecto del ruido y la temperatura en el fenómeno de la conmutación resistiva" (2014-12-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de esta Tesis es el de estudiar el efecto del ruido eléctrico y la temperatura en sistemas memristivos. Este tipo de sistemas presenta el fenómeno conocido como conmutación resistiva (CR), en el cual se basan las memorias electrónicas ReRAM. Básicamente, la CR se caracteriza por el cambio abrupto de la resistencia eléctrica del material ante la presencia de un campo eléctrico externo. Se comienza por estudiar la influencia del ruido, tanto interno como externo, con un modelo memristivo sencillo. Según este modelo, solo el ruido interno produce un efecto beneficioso, esto es, aumenta el contraste resistivo. Luego, se presentan resultados de experimentos en una muestra del tipo manganita donde el ruido externo aumenta el contraste resistivo. Utilizando otro modelo que se encuentra en la literatura, se reproducen cualitativamente los resultados observados. A partir de este estudio, se encuentran las características generales que un modelo de la dinámica de la CR debe cumplir para que el ruido agregado externamente mejore el contraste resistivo tal como resulta en los experimentos. A continuación, se estudia el efecto combinado del ruido y la temperatura sobre la dinámica de la manganita. Se realizan experimentos a distintas temperaturas encontrando que el ruido aumenta el contraste en todo el rango considerado. Se logran reproducir los resultados experimentales, combinando un modelo que describe la CR con uno que da cuenta del cambio resistivo con la temperatura. Se estudian, también, tiempos de relajación luego de excitar la muestra. Asociando dicha relajación a la difusión de vacancias de oxígeno, se estiman el coeficiente de difusión y la energía de activación, obteniéndose valores consistentes a los encontrados en la literatura. Finalmente, en esta Tesis se demuestra que el ruido produce un efecto beneficioso en el fenómeno de la CR. Este resultado puede ser relevante en el área de los sistemas de almacenamiento y procesamiento de información, donde los altísimos niveles de integración electrónica hacen que la presencia del ruido no pueda ser soslayada. Abstract: The objective of this Thesis is to study the effect of electrical noise and temperature on memristive systems. These systems exhibit the phenomenon of resistive switching (RS), which ReRam electronic memories are based on. Basically, RS is characterized by an abrupt change of the resistance under the presence of an external electric field. We begin by studying the influence of both internal and external noise using a simple memristive model. In this model, only internal noise produces a beneficial effect, that is, leads to an increase in the resistive contrast. Then, results of experiments performed on a manganite sample are presented, showing that external noise does indeed increase the resistive contrast. These results are qualitatively reproduced by using another model found in the literature. From this study, some general characteristics are found for a model aimed at describing the RS phenomenon in the presence of noise. Further on, we study the influence of both noise and temperature on the dynamics of the manganite sample. Experiments are performed at different temperatures, and noise is found to increase the resistive contrast in the full temperature range. Experimental results are succesfully reproduced by combining a model that describes RS with another model that accounts for the change of the resistance with temperature. Relaxation times after pulsing are studied. Relating the relaxation process to oxygen-vacancy diffusion, the estimated activation energies and diffusion coefficients are found consistent with published results. Finally, in this Thesis it is shown that noise has a beneficial effect on the phenomenon of RS. This finding may prove relevant in the area of memory devices and data processing, where the high levels of electronic integration render the presence of noise unavoidable.
Cita tipo APA: Patterson, Germán A. . (2014-12-19). Estudio de la dinámica de los sistemas memristivos : efecto del ruido y la temperatura en el fenómeno de la conmutación resistiva. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5625_Patterson.pdf Cita tipo Chicago: Patterson, Germán A.. "Estudio de la dinámica de los sistemas memristivos : efecto del ruido y la temperatura en el fenómeno de la conmutación resistiva". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5625_Patterson.pdf |
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Narváez Apráez, Ana Lucía. "La precipitación en el humedal Laguna de la Cocha, Colombia, y su relación en la sustentabilidad de la región" (2014-12-19). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita
Cita tipo APA: Narváez Apráez, Ana Lucía . (2014-12-19). La precipitación en el humedal Laguna de la Cocha, Colombia, y su relación en la sustentabilidad de la región. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5823_NarvaezApraez.pdf Cita tipo Chicago: Narváez Apráez, Ana Lucía. "La precipitación en el humedal Laguna de la Cocha, Colombia, y su relación en la sustentabilidad de la región". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5823_NarvaezApraez.pdf |
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Brunetti, Andrés E.. "Comunicación química de anuros: una perspectiva integral a partir de aspectos comportamentales, morfológicos y químicos en dos especies de Hypsiboas (Amphibia: Anura: Hylidae)" (2014-12-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La piel de los anfibios es un órgano dinámico con una enorme diversidad de funciones. Una característica compartida por prácticamente todas las especies de anfibios es la presencia de dos tipos de glándulas dérmicas, mucosas y serosas. A pesar de la similitud estructural, estas glándulas pueden presentar una gran variabilidad morfológica alcanzando un alto grado de especialización en el cumplimiento de dos funciones, la comunicación química y la defensa contra predadores. Desde un aspecto bioquímico, el análisis de las secreciones glandulares posee un potencial enorme dado la diversidad de compuestos. Los estudios desarrollados en algunos de ellos (i.e., péptidos, alcaloides, aminas biogénicas) permite tener una idea aproximada de la variación estructural y funcional. Sin embargo, es limitado el conocimiento que se tiene sobre la química de los compuestos volátiles y de los componentes secretados por las glándulas de la piel sexualmente dimórficas (SDSGs); fuente potencial de feromonas. Tradicionalmente los estudios de comunicación en los anuros se focalizaron en el análisis de las señales acústicas, aunque existían reportes aislados de la participación de otras señales (i.e., visual, química, táctil) en algunas especies. Los trabajos recientes muestran que estas señales tienen una distribución taxonómica mucho mayor a la considerada inicialmente, en tanto que la co-ocurrencia de distintas señales sugieren la existencia de comunicación multimodal en algunas especies. En la presente tesis se abordaron aspectos morfológicos, químicos y comportamentales de las secreciones glandulares en dos especies de Hypsiboas, considerando un contexto reproductivo en H. punctatus y un contexto defensivo en H. pulchellus. Se analizó la estructura y la ultraestructura de la piel de las regiones mental, lateral, dorsal y ventral en machos y hembras de H. punctatus. Se identificaron dos tipos de SDSGs, en las regiones mental y lateral de los machos, representando el primer caso de co-ocurrencia de diferentes SDSGs en una misma especie de anuro. A partir de estos resultados se caracterizó la variación estructural e histoquímica, y se estudió la evolución de las glándulas mentales y laterales en 28 especies de Cophomantini, incluyendo representantes de prácticamente todos los grupos de especies. La ocurrencia de estas glándulas, al igual que la variación morfológica, presenta una distribución taxonómica compleja con diferentes niveles de homoplasia. A partir del análisis de las secreciones de las glándulas dorsales de machos y hembras se determinó la estructura primaria de 13 péptidos y se identificaron dos compuestos relaciones con alcaloides. Se identificó un péptido presente exclusivamente en las secreciones de las glándulas mental y lateral de los machos. Los estudios comportamentales en el campo y en condiciones controladas de laboratorio, mostraron que los machos de H. punctatus son territoriales y poseen un repertorio vocal complejo con al menos siete cantos diferentes asociados a contextos particulares. Las hembras elegirían a los machos en base a la información de las señales acústicas y químicas, lo que sugiere la existencia de comunicación multimodal en esta especie. El estudio morfológico e histoquímico de las glándulas de H. pulchellus evidenció la presencia de las dos glándulas comunes de los anfibios (mucosas y serosas). Sin embargo, los análisis de estructura, ultraestructura y de los mecanismos fisiológicos de descarga permiten inferir que las glándulas serosas cumplirían diversas funciones, entre ellas almacenar los componentes volátiles secretados en situaciones de estrés. Estas glándulas presentan una mayor concentración en la región escapular, lo que podría relacionarse con estrategias defensivas. A partir del análisis de las secreciones de las glándulas dorsales de machos y hembras se determinó la estructura primaria de 17 péptidos y se identificaron dos compuestos relaciones con alcaloides. Las secuencias peptídicas de H. pulchellus e H. punctatus presentan una gran variabilidad. Estos compuestos no fueron publicados anteriormente, aunque algunos de los péptidos presentaron una gran similitud con los descriptos en otras especies de Cophomantini. Se compararon las secuencias de todos los péptidos identificados hasta el momento en esta tribu. El solapamiento de las secuencias de los péptidos de H. pulchellus e H. punctatus con partes de péptidos mayores de otras especies sugiere la existencia de endopeptidasas específicas. Se caracterizó la fracción volátil de las secreciones de la región dorsal y lateral en H. pulchellus e H. riojanus. Se identificaron 42 compuestos (40 en H. pulchellus y 37 en H. riojanus) pertenecientes a nueve grupos funcionales, lo que constituye la mayor diversidad de compuestos volátiles identificados en una especie de anfibio. Los diferentes componentes tendrían distinto origen y función. Abstract: The skin of amphibians is a dynamic organ with diverse functions. Almost all the species of this group of vertebrates possess two types of dermal glands, mucous and serous glands. Despite the structural similarities within each glandular type, they may have a great morphological variation getting a high degree of specialization related to chemical communication and defense against predators. From a biochemical perspective, and given the high diversity of their compounds, researches on the glandular secretions have an enormous potential. In particular, the studies performed on some of them (i.e., peptides, alkaloids, biogenic amines) allowed a general understanding of their structural and functional diversity. However, knowledge of the chemical composition of the volatile secretions, as well as from the secretion of sexually dimorphic skin glands (SDSGs; a likely source of sexual pheromones) in anurans, is very limited. Although there are isolated reports of the existence of different signals used for communication in some species (i.e., visual, chemical, tactile), studies of communication in anurans have traditionally focused in the analysis of acoustic signals. Nonetheless, recent investigations show that those considered rare signals have a wide taxonomic distribution, whereas the simultaneous occurrence of some of them suggest the existence of multimodal communication in several species. In this thesis are examined morphological, chemical and behavioral aspects from de glandular secretions of two species of Hypsiboas, considering a reproductive context in H. punctatus, and a defensive context in H. pulchellus. The structure and ultrastructure of skin from mental, lateral, dorsal, and ventral regions, was examined in males and females of H. punctatus. Two types of SDSGs were identified en mental and lateral regions of males. These results represent the first case of co-occurrence of different SDSGs in a single species. The structural and histochemical variation, as well as the evolution, of mental and lateral glands was analyzed in Cophomantini from samples of 28 species including at least a representative of almost all group of species of this clade. The occurrence of mental and lateral glands and their morphological variation have an intricate taxonomic distribution with different levels of homoplasy. Thirteen peptides and two compounds related with alkaloids were identified from dorsal secretions of males and females. One peptide was found exclusively from mental and lateral secretions of males. Behavioral studies performed in the field and under laboratory controlled conditions showed that males are territorial. They emit at least seven different type of calls associated to specific biological contexts. Females would choose their mates on acoustic and chemical signals, which suggest the existence of multimodal communication in this species. Morphological and histochemical studies of the skin of H. pulchellus revealed the presence of the two typical mucous and serous glands of amphibians. However, a detailed structural and ultrastructural analysis, as well as the physiological assessment of the release mechanism of gland secretion, suggests that serous glands have several functions. One of these functions is to accumulate, and under stress situations, secrete volatile compounds. These glands are highly concentrated in the scapular region, which is possible related to defensive strategies. Seventeen peptides and two compounds related with alkaloids were identified from dorsal secretions of males and females. The peptide sequences of H. pulchellus and H. punctatus are highly variable. These compounds have not been published before, but some of them showed great similarities with peptides described in other species of Cophomantini. All peptides reported so far in species of this tribe were compared through sequence alignments. The sequences of H. pulchellus and H. punctatus overlapped longer sequences of other species suggesting the existence of specific endopeptidase. The volatile secretions of H. pulchellus and H. riojanus were characterized from dorsal and lateral skin by a simulated stress situation. Forty-two compounds (40 in H. pulchellus and 37 in H. riojanus) from nine different functional groups were identified in all samples. This represent the highest number of volatile compounds identified in a species of amphibian. The components would have different origin and functions.
Cita tipo APA: Brunetti, Andrés E. . (2014-12-19). Comunicación química de anuros: una perspectiva integral a partir de aspectos comportamentales, morfológicos y químicos en dos especies de Hypsiboas (Amphibia: Anura: Hylidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5622_Brunetti.pdf Cita tipo Chicago: Brunetti, Andrés E.. "Comunicación química de anuros: una perspectiva integral a partir de aspectos comportamentales, morfológicos y químicos en dos especies de Hypsiboas (Amphibia: Anura: Hylidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5622_Brunetti.pdf |
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Crisp, Renée Leonor. "Esferocitosis hereditaria: avance en la metodología diagnóstica, estudios demográficos e investigación de mecanismos involucrados" (2014-12-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Esferocitosis Hereditaria (ESH) es una anemia hemolítica de observación frecuente, caracterizada por alteraciones cuali y/o cuantitativas –genéticamente determinadas– de las proteínas de la membrana eritrocitaria. Consecuentemente, se debilita la unión entre la membrana eritrocitaria y el citoesqueleto subyacente, produciéndose la pérdida progresiva de la membrana con formación de hematíes de forma esférica, osmóticamente frágiles, que son selectivamente atrapados y destruidos en el bazo. Muchas alteraciones en diferentes genes pueden generar la misma enfermedad. Clínicamente se caracteriza por anemia, ictericia y esplenomegalia. La ESH es la anemia hemolítica hereditaria más frecuente en Argentina. A pesar de ello, es muy escasa la información sobre su comportamiento en nuestro país. Los objetivos de esta tesis son: a) Investigar avances en la metodología de diagnóstico a partir del análisis e implementación de nuevas pruebas que han sido desarrolladas durante la última década; b) Establecer aspectos demográficos de la ESH en la población atendida por nuestro grupo de trabajo; c) Dilucidar algunos mecanismos involucrados en la enfermedad. En este trabajo se utilizaron las pruebas tradicionales (fragilidad osmótica eritrocitaria y prueba de autohemólisis) y se desarrollaron por primera vez en nuestro país las nuevas pruebas diagnósticas (citometría de flujo con 5’eosina maleimida, criohemólisis hipertónica y fragilidad osmótica por citometría de flujo) estableciendo sus puntos de corte, sensibilidad, especificidad y valores predictivos. El análisis de los resultados de los ensayos electroforéticos de las membranas eritrocitarias permitió establecer que las deficiencias de espectrina y ankirina son las prevalentes en nuestra población. En los casos en que fue posible, el estudio se extendió al grupo familiar primario pudiendo detectar portadores sanos y establecer el patrón de herencia. Para poder realizar el diagnóstico en forma precoz, se desarrollaron las nuevas pruebas utilizando sangre capilar, estableciendo la presencia de la patología en neonatos de hasta 2 días de vida. El seguimiento clínico permitió observar la alta frecuencia de crisis hemolíticas asociadas a episodios febriles por lo que se decidió evaluar la posibilidad de que el agravamiento de la anemia fuera debido, en parte, a un efecto directo de la temperatura sobre los esferocitos. Se pudo observar que la hipertermia induce eriptosis mediada por la entrada de calcio a la célula, lo que podría contribuir al empeoramiento de la anemia o al desarrollo de la misma en individuos asintomáticos. La heterogeneidad clínica no pudo relacionarse al tipo de alteración proteica ni a los resultados de las pruebas diagnósticas. En la búsqueda de una alteración en común que pudiera correlacionar con la severidad de la anemia encontramos una expresión disminuida de acuaporina 1 (AQP-1), canal responsable del flujo de agua en el eritrocito, independientemente de la proteína de membrana afectada. El trabajo de tesis presentado implica un avance metodológico por haber desarrollado las nuevas técnicas diagnósticas en nuestro país y haber establecido la equivalencia para realizar los estudios con sangre capilar, conduciendo a un diagnóstico certero y precoz en los neonatos. Los antecedentes y el seguimiento clínico permitieron describir el comportamiento de la enfermedad en los pacientes pertenecientes a nuestra población. Por otra parte, los estudios in vitro, que mostraron sensibilidad de los eritrocitos de los pacientes a la temperatura y asociación de la disminución de AQP-1 en eritrocitos con la severidad de la enfermedad, abren un nuevo camino en la investigación de la esferocitosis hereditaria con una potencial aplicación terapéutica a futuro. Abstract: Hereditary spherocytosis (HS) is a common hemolytic anemia, characterized by genetically determined quantitative and/or qualitative abnormalities of the red cell membrane proteins. As a consequence, the connection of skeleton and bilayer gets weakened, loss of membrane surface occurs and changes in red cell lead to the formation of spherical, osmotically fragile erythrocytes, which are selectively trapped and destroyed in the spleen. Diverse mutations in different genes can generate the same disease. HS is characterized by anemia, jaundice, and splenomegaly. Although HS is the most common hereditary hemolytic anemia in Argentina, information concerning its behavior in our country is very scarce. Aims of this thesis are: a) To evaluate advances on diagnostic methodology since the development of new diagnostic tests described throughout the last decade; b) To establish demographics characteristics of HS in the population attended by our working group; c) To elucidate some mechanisms involved in the disease. In this study, standard screening tests –osmotic fragility and autohemolysis– and novel diagnostic tests –eosin-5’maleimide flow cytometry, hypertonic cryohemolysis, and flow cytometric osmotic fragility– were carried out. As these new diagnostic techniques were developed for the first time in our country, their cut-off points, sensitivity and specificity were established. Electrophoresis of membrane proteins established that spectrin and ankyrin are the most frequently found deficiencies in our population. As far as possible, direct relatives were also studied, allowing to detect silent carriers and to establish the inheritance pattern. Novel tests were also developed using capillary blood, to accomplish an earlier diagnosis. So, HS could be diagnosed in neonates aged only 2 days. Patients’ follow-up showed a high frequency of hemolytic crisis associated to febrile diseases. Therefore, we decided to evaluate whether the temperature increment on spherocytes may be one factor responsible for the worsening of hemolysis. Results showed that hyperthermia induced eriptosis mediated by calcium influx to the erythrocyte, which could play a role either for anemia worsening or for anemia development in previously asymptomatic individuals. No correlation between severity of the disease and either deficient protein or results of diagnostic tests could be demonstrated. Searching for an unique factor associated with severity of anemia, a decreased expression of aquaporin-1 (AQP-1), the channel responsible of water influx in the erythrocyte, was found irrespectively of the type of protein deficiency. This thesis implies a methodological advance due to the development for the first time in Argentina of the novel diagnostic tests, as well as the demonstration that they can also be performed with capillary blood, allowing an early and accurate diagnosis in neonates and small infants. Antecedents and clinical follow-up enabled to establish the behavior of the disease in the population of our country. Furthermore, results of in vitro studies showing a harmful effect of hyperthermia on erythrocytes of patients, and association of AQP-1 decrease with severity of the disease, open a new way on HS research with potential future applications.
Cita tipo APA: Crisp, Renée Leonor . (2014-12-18). Esferocitosis hereditaria: avance en la metodología diagnóstica, estudios demográficos e investigación de mecanismos involucrados. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5630_Crisp.pdf Cita tipo Chicago: Crisp, Renée Leonor. "Esferocitosis hereditaria: avance en la metodología diagnóstica, estudios demográficos e investigación de mecanismos involucrados". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5630_Crisp.pdf |
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Bourguignon, Nadia Soledad. "El arsenito de sodio, un disruptor endócrino que afecta el eje reproductivo y la homeostasis de la glucosa" (2014-12-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La contaminación con As (As) en el agua de bebida se considera una amenaza para la salud en todo el mundo, ya que está asociado a un mayor riesgo de contraer enfermedades como cáncer de piel y pulmón, provocar efectos indeseables sobre el desarrollo, la reproducción las secreciones internas y alteraciones cardiovasculares. Debido a que el As puede actuar como un disruptor endócrino aquí investigamos el efecto de la exposición a As, durante períodos críticos del desarrollo neuroendócrino como es la gestación y las semanas postparto, sobre el eje reproductivo y el metabolismo de la glucosa, en las madres y sus crías. Se administraron 5 (A5) o 50 ppm (A50) de arsenito de sodio en el agua de bebida a ratas Sprague Dawley preñadas, desde el día 1 de gestación hasta el sacrificio (2 meses postparto). Al destete, se dividieron las crías en dos grupos: uno continuó recibiendo el mismo tratamiento que la madre y el otro recibió agua destilada hasta el día del sacrificio (4 meses). En las madres, la exposición a As produjo alteraciones en la homeostasis de la glucosa durante la preñez, probablemente alterando la funcionalidad de las células β, incrementando el riesgo de desarrollar diabetes gestacional. Además, alteró la fisiología reproductiva, sugiriendo el desarrollo de una falla ovárica prematura. Las crías expuestas a As durante el desarrollo presentaron alteraciones en la fisiología reproductiva, principalmente las hembras, mientras que el metabolismo de la glucosa no se vio afectado. Abstract: Arsenic contamination in drinking water is considered a worldwide threat to health, that is associated with an increased risk of diseases such as skin and lung cancer, cause undesirable effects on development, internal reproduction secretions and cardiovascular disorders. Because As can act as an endocrine disruptor, here we investigated the effect of As exposure, during critical periods of neuroendocrine development as gestation and postnatal weeks, on the reproductive axis and metabolism of glucose in dams and their offspring. We administered 5 (A5) or 50 ppm (A50) of sodium arsenite in drinking water to Sprague Dawley rats from gestational day 1 until sacrifice (two months postpartum). At weaning the offspring were divided in two groups: one of each continued to receive the same treatment and the other one received distilled water until sacrifice (4 months of age). In dams, As exposure induces glucose homeostasis alterations during pregnancy, probably by altering β-cell function, increasing the risk of developing gestational diabetes. In addition, profoundly impaired reproductive physiology, suggesting premature ovarian failure due to arsenic exposure, may have developed. Offspring rats exposed to arsenic during development present altered reproductive physiology, mainly females, while metabolism is not affected.
Cita tipo APA: Bourguignon, Nadia Soledad . (2014-12-18). El arsenito de sodio, un disruptor endócrino que afecta el eje reproductivo y la homeostasis de la glucosa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5631_Bourguignon.pdf Cita tipo Chicago: Bourguignon, Nadia Soledad. "El arsenito de sodio, un disruptor endócrino que afecta el eje reproductivo y la homeostasis de la glucosa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5631_Bourguignon.pdf |
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Turco, Pablo. "Conjuntos y operadores A-compactos, propiedades de aproximación e ideales de funciones entre espacios de Banach" (2014-12-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo principal de esta tesis es llevar a cabo el estudio de un método general para comprender una amplia clase de propiedades de aproximación de espacios de Banach y de diferentes ideales de operadores compactos que pueden ser modelados por igual una vez que se ha elegido el sistema de conjuntos compactos. Para ello, usamos la noción de conjunto A-compacto definido por Carl y Stephani, donde A es un ideal de operadores. Relacionado con los conjuntos A-compactos surge el concepto de operadores A-compactos (aquellos operadores que aplican conjuntos acotados en A-compactos). En el caso de que A sea un ideal de operadores de Banach, introducimos una forma de medir a los conjuntos A-compactos que nos permitirá estudiar al espacio de operadores A-compactos como un espacio de Banach. La estrecha relación que hay entre conjuntos y operadores A-compactos nos permitirá aplicar la teoría operadores para formular distintas propiedades de los conjuntos A-compactos. El sistema de conjuntos A-compactos induce de forma natural dos clases distintas de propiedades de aproximación. La primera se obtiene de considerar que el operador identidad se aproxime uniformemente sobre conjuntos A-compactos por operadores de rango finito. Esta propiedad la llamaremos la propiedad de aproximación KA-uniforme. La otra clase de propiedad de aproximación que consideramos se obtiene de considerar la medida de conjunto A-compacto y se denomina la KA-propiedad de aproximación. En este contexto entra en juego la geometría del espacio de operadores A-compactos. El enfoque que damos nos permite estudiar ambas propiedades de aproximación en tandem. Además, estudiamos como "pasan" estas propiedades de aproximación de los espacios duales a los espacios subyacentes. Luego examinamos la interacción entre estas dos propiedades de aproximación y el espacio polinomios homogéneos y de funciones holomorfas entre espacios de Banach. Para ello, introduciremos las nociones de polinomios y funciones holomorfas A-compactas. Si bien el espacio de polinomios A-compactos tiene una estructura similar al espacio de operadores lineales A- compactos, el espacio de funciones holomorfas A-compactas tiene una estructura muy distinta. Para mostrar esto, expondremos ejemplos que clarifican los resultados obtenidos. Abstract: The main objective of this thesis is to undertake the study of a general method to understand a wide class of approximation properties and different ideals of compact operators which can be equally modeled once the system of compact sets has been chosen. To this end, we use the notion of A-compact sets introduced by Carl and Stephani, which is determined by an operator ideal A. In relation with A-compact sets, we have the concept of A-compact operators (those operators which sends bounded sets into A-compact sets). In the case that A is a Banach operator ideal, we introduce a measure for the A-compact sets and we use it to study the A-compact operatos as a Banach space. The close relationship between A-compact sets and operators allows us to apply the operator theory to develop various properties of the A-compact sets. The system of A-compact sets leads naturally two types of approximation properties. The first one is obtained by considering that the identity operator can be uniformly approximated by finite rank operators over A-compact sets. This property is called the uniform KA-approximation property. The other type of approximation property is obtained by considering the measure of A-compact sets and it is called the KA-approximation property. In this context, it comes into scene the geometry of the Banach space of A-compact operators. The approach that we make allows us to study both approximation propertis in tandem. In addition, we study how these approximation properties on a dual space affect to the underlying spaces. Then we examine the interaction between these two types of approximation properties and the spaces of homogeneous polynomials and holomorphic functions between Banach spaces. To this end, we introduce the concept of A-compact polynomials and A-compact holomorphic functions. While the space of A-compact polynomials has a similar structure to the space of A- compact operators, the space of A-compact holomorphic function has a very diferent structure. To show this, we will present some examples that clarify our results.
Cita tipo APA: Turco, Pablo . (2014-12-17). Conjuntos y operadores A-compactos, propiedades de aproximación e ideales de funciones entre espacios de Banach. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5624_Turco.pdf Cita tipo Chicago: Turco, Pablo. "Conjuntos y operadores A-compactos, propiedades de aproximación e ideales de funciones entre espacios de Banach". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5624_Turco.pdf |
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Cagnotti, Cynthia Lorena. "Desarrollo de la técnica del insecto estéril y su integración con el control biológico mediante entomófagos parasitoides para el control de la pollila del tomate Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)" (2014-12-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La polilla del tomate, Tuta absoluta, es una de las plagas más devastadoras del cultivo de tomate en Sudamérica, donde es originaria, y en Europa y África, donde ha ingresado recientemente. El control de T. absoluta se basa principalmente en el empleo de plaguicidas. El objetivo de esta tesis fue establecer las bases para el desarrollo de la Técnica del Insecto Estéril, mediante el empleo de la Esterilidad Heredada (EH) en T. absoluta, y evaluar su integración con el Control Biológico (CB) con entomófagos. Los principales aportes de esta tesis son: - Conocimiento del efecto de los rayos X sobre la biología de T. absoluta. - Determinación de la dosis óptima de radiación X para aplicar la EH en el control de T. absoluta. - Estudio del efecto de la radiación sobre la dispersión de machos irradiados. - Evaluación de la supresión de poblaciones silvestres de T. absoluta mediante la liberación de individuos irradiados en invernáculo. - Determinación del número mínimo de individuos irradiados a liberar para reducir poblaciones de T. absoluta. - Evaluación de la integración de la EH y el CB mediante el empleo de los entomófagos Trichogramma spp. y Tupiocoris cucurbitaceus. Abstract: The tomato leafminer, Tuta absoluta, is one of the most devastating pests of tomato crops. This species is native to South America, but it has been invading Europe, Africa and Asia recently. The main method of control of T. absoluta relies on the application of chemical insecticides. The objective of the thesis was to establish the basis for the development of the Sterile Insect Technique in this species through the Inherited Sterility (IS), and to evaluate its integration with Biological Control (BC) by entomophagous. The main contributions of this thesis are: - Knowledge of the effect of X rays on the T. absoluta biology. - Determination of the optimal dose of X radiation to be used in the IS against T. absoluta - Study of the effect of the radiation on the dispersion of irradiated males - Assessment of the suppression of wild populations of T. absoluta through the release of irradiated individuals under greenhouse conditions. - Determination of the minimum number of irradiated individuals that should be released to reduce wild T. absoluta populations - Evaluation of the integration of both IS and BC techniques using the entomophagous Trichogramma spp. and Tupiocoris cucurbitaceus
Cita tipo APA: Cagnotti, Cynthia Lorena . (2014-12-17). Desarrollo de la técnica del insecto estéril y su integración con el control biológico mediante entomófagos parasitoides para el control de la pollila del tomate Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5623_Cagnotti.pdf Cita tipo Chicago: Cagnotti, Cynthia Lorena. "Desarrollo de la técnica del insecto estéril y su integración con el control biológico mediante entomófagos parasitoides para el control de la pollila del tomate Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5623_Cagnotti.pdf |
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Mena Cabrera, Paolo Alexander. "Evaluación de la eficiencia de tratamiento de aguas residuales domésticas, implementando un sistema de humedales artificiales de flujo subsuperficial horizontal (HAFSSH) en el colegio comfamiliar siglo XXI, sede campestre corregimiento de San Fernando, Municipio de Pasto, Colombia" (2014-12-16). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los humedales artificiales son un reservorio construido en un terreno con paredes y pisos impermeabilizados que contienen un sustrato (grava o arena) y una vegetación acuática adecuada para tratar efluentes residuales; esta tecnología que busca una recuperación del recurso hídrico ha sido aplicada en países desarrollados y actualmente se está siendo implementada en países como Colombia por su bajos costos constructivos comparado con la tecnología convencional. El objetivo del presente estudio fue evaluar la eficiencia de tratamiento de aguas residuales domésticas, implementando un sistema de humedales Artificiales de flujo subsuperficial horizontal (HAFSSH) en el Colegio Comfamiliar Siglo XXI, sede Campestre Corregimiento de San Fernando, Municipio de Pasto, Colombia. Para el desarrollo del estudio se diseñó e implemento una trampa de grasas, un tanque séptico, un filtro anaerobio de flujo ascendente (FAFA), seguido del humedal artificial (HAFSSH), donde se llevó a cabo la evaluación del sistema mediante la medición y análisis de algunos determinantes de calidad del agua como DBO5, DQO, Sólidos suspendidos TOTALES SST, nitrógeno total N, fósforo total P, grasas y aceites, Coliformes Totales y Escherichia Coli. Se realizó un monitoreo de calidad de agua a la entrada y salida de cada componente, que permitió determinar la eficiencia de remoción del sistema en los parámetros establecidos, posteriormente se hizo una comparación de las eficiencias obtenidas del humedal artificial respecto al tanque séptico y el FAFA y las eficiencias calculadas con los modelos matemáticos aplicados para el diseño. Los resultados de la evaluación de la eficiencia del Humedal artificial de Flujo Subsuperficial Horizontal (HAFSSH) fueron los siguientes; Remoción de la DBO5 del 93.89% y de la DQO del 84.98%; la eficiencia de remoción de los SST fue del 40%. El N y las grasas y aceites no presentaron eficiencias de remoción, debido a que al igual que los SST, el agua que ingreso al humedal, ya presentaba excelentes condiciones en estos tres parámetros, por motivo de la eliminación en los componentes previos al humedal tal como tanque séptico y el FAFA. Para los parámetros microbiológicos como Coliformes Totales y E Coli, del humedal artificial se obtuvo eficiencias del 99,99 y 99,97% respectivamente. La remoción de los contaminantes a través del sistema implementado en este estudio, garantiza un aprovechamiento óptimo y eficaz del recurso hídrico. Sin embargo, se debe resaltar que la finalidad y uso de este recurso es para riego de los cultivos y jardines presentes en el Colegio.
Cita tipo APA: Mena Cabrera, Paolo Alexander . (2014-12-16). Evaluación de la eficiencia de tratamiento de aguas residuales domésticas, implementando un sistema de humedales artificiales de flujo subsuperficial horizontal (HAFSSH) en el colegio comfamiliar siglo XXI, sede campestre corregimiento de San Fernando, Municipio de Pasto, Colombia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5825_MenaCabrera.pdf Cita tipo Chicago: Mena Cabrera, Paolo Alexander. "Evaluación de la eficiencia de tratamiento de aguas residuales domésticas, implementando un sistema de humedales artificiales de flujo subsuperficial horizontal (HAFSSH) en el colegio comfamiliar siglo XXI, sede campestre corregimiento de San Fernando, Municipio de Pasto, Colombia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5825_MenaCabrera.pdf |
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Fuchs, Daniela Viviana. "Sistemática y distribución del género Bryconamericus (Teleostei: Characiformes: Characidae) de la Argentina" (2014-12-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El género Bryconamericus Eigenmann está compuesto por peces de pequeño a mediano tamaño que se encuentran distribuidos desde América Central hasta la cuenca del río Sauce Grande (38º56’S-61º23’O) en el sur de la provincia de Buenos Aires. Actualmente la definición del género consiste en la siguiente combinación de caracteres: premaxilar con dos series de dientes, serie interna con cuatro dientes de mayor tamaño que los de la serie externa, serie única de dientes en el dentario, número limitado de dientes a lo largo del margen anterior del maxilar, borde de la quijada superior con una curva simple, ausencia de escamas en la aleta caudal, tercer infraorbital amplio y en contacto con el preopérculo a lo largo de sus márgenes ventral y posterior, rastrillos branquiales setiformes, línea lateral completa y ausencia de bolsillo glandular en la aleta caudal de los machos. Si bien pueden encontrarse representantes en la mayoría de las cuencas de Argentina, no había antecedentes de estudios completos del género, por lo que el objetivo de este estudio fue realizar la revisión taxonómica actualizada del grupo para nuestro territorio. Se confirman 11 especies y se provee una clave de identificación de las mismas. Se considera a B. ikaa y B. agna sinónimos de B. iheringii y B. sylvicola respectivamente. Se menciona por primera vez al género Bryconamericus para la provincia de Santiago del Estero. Se reafirma la presencia de B. exodon para las cuencas de los ríos Paraná y Paraguay. Se amplían las distribuciones geográficas de las siguientes especies: B. eigenmanni, B. iheringii, B. pyahu y B. stramineus. Palabras clave: Teleostei - Characiformes - Characidae - Bryconamericus – Sistemática - Distribución Geográfica - Región Neotropical Abstract: The genus Bryconamericus Eigenmann comprises small sized fishes distributed from Central America to the Sauce Grande river basin (38º56’S-61º23’W) in the south of Buenos Aires province (Argentina). The genus is defined by the combination of a single row of teeth on the dentary, two rows of teeth on the premaxilla with four teeth in the inner series that are larger than those of the outer row, the limited number of teeth along the anterior margin of the maxilla, the simple curve to the border of the upper jaw, the lack of scales on the caudal fin, the large third infraorbital contacting the preopercle along its posterior and ventral margins, setiform gill-rakers, the complete laterosensory canal system on the body, and the absence of a glandular pouch on the caudal fin in males. Although representatives of this genus can be found in most drainage basins of Argentina, no complete studies on the genus had been made before, and thus the aim of this study was to perform an updated taxonomic review of this taxon in Argentina. Eleven species are confirmed for our country and an identification key is provided. Bryconamericus ikaa is considered to be a synonym of B. iheringii and B. agna as a synonym of B. sylvicola. The genus Bryconamericus is mentioned for the first time for Santiago del Estero province. The presence of Bryconamericus exodon is verified for the Paraguay and Paraná River basins. The geographical distributions of the following species are expanded: B. eigenmanni, B. iheringii, B. pyahu and B. stramineus. Keywords: Teleostei - Characiformes - Characidae - Bryconamericus - Systematics Geographic Distribution - Neotropical Region
Cita tipo APA: Fuchs, Daniela Viviana . (2014-12-16). Sistemática y distribución del género Bryconamericus (Teleostei: Characiformes: Characidae) de la Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5621_Fuchs.pdf Cita tipo Chicago: Fuchs, Daniela Viviana. "Sistemática y distribución del género Bryconamericus (Teleostei: Characiformes: Characidae) de la Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5621_Fuchs.pdf |
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Steren, Gabriela. "Dos temas en reescritura: combinadores para cálculos con patrones e isomorfismo de Curry-Howard para la Lógica de Pruebas" (2014-12-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Pattern matching es una herramienta fundamental de la programación funcional. Permite describir conjuntos de datos que tienen una misma forma (a través de una expresión llamada patrón"). Esta facilidad ha comenzado a adoptarse también en otros paradigmas, y ha demostrado su utilidad para analizar datos en diversos formatos, como por ejemplo datos semiestructurados. Los cálculos de patrones son lenguajes minimales basados en cálculo lambda en los que se introducen formas sofisticadas de pattern matching para estudiar sus fundamentos formales. La primera parte de esta tesis propone una contribución a este campo, desarrollando una lógica combinatoria para λP, un cálculo de patrones donde cualquier término puede ser un patrón. La lógica combinatoria carece de variables ligadas. Nos encontramos ante dos desafíos. Por un lado, tratar con las variables ligadas en los patrones, ya que una abstracción es un patrón válido en λP. Para esto contamos con la guía de la lógica combinatoria estándar. El segundo desafío consiste en computar, en un escenario combinatorio, la contraparte de la sustitución obtenida ante un matching exitoso. Esto requiere la introducción de reglas capaces de descomponer las aplicaciones. Proponemos una lógica combinatoria que logra este propósito, y estudiamos sus propiedades salientes y extensiones, incluyendo una presentación tipada y la representación de estructuras de datos. La segunda parte de esta tesis se centra en la interpretación computacional de la Lógica de Pruebas, o LP, via el isomorfismo de Curry-Howard. LP, dada a conocer por Artemov en 1995, es un refinamiento de la lógica modal en la cual la modalidad 2A es revisitada como ]A, donde t es una expresión que testifica sobre la validez de A. Es aritméticamente correcta y completa, puede realizar todos los teoremas de S4 y posee la capacidad de versar sobre sus propias pruebas (` A implica ` ]A, para algún t). Nuestra contribución principal es una formulación en Deducción Natural con buen comportamiento, desarrollada con el fin de develar las metáforas computacionales que surgen de esta capacidad de reflexión de LP. Esta es la primera formulación en Deducción Natural capaz de capturar a LP en su totalidad. Para esto, adoptamos la Deducción Natural Clásica de Parigot y la unimos al razonamiento hipotético. Como resultado, obtenemos una presentación en Deducción Natural de LP proposicional, para la cual se demuestran ciertas propiedades claves. Luego extendemos nuestro análisis al caso de primer orden, presentando FOHLP, una extensión de primer orden de HLP. Nuestro punto de partida es una reciente formulación de primer orden de LP, llamada FOLP, que goza de corrección aritmética y tiene una semántica de demostrabilidad exacta (la completitud es inalcanzable dado que no es finitamente axiomatizable). Presentamos una formulación en Deducción Natural llamada FOHLP, traducciones desde y hacia FOLP, una asignación de términos (cálculo lambda) y una prueba de terminación del proceso de normalización de derivaciones. Abstract: Pattern matching is a basic building block on which functional programming depends, where the computation mechanism is based on finding a correspondence between the argument of a function and an expression called pattern". It has also found its way into other programming paradigms and has proved convenient for querying data in different formats, such as semistructured data. In recognition of this, a recent effort is observed in which pattern matching is studied in its purest form, namely by means of pattern calculi. These are lambda calculi with sophisticated forms of pattern matching. The first part of this two part thesis proposes to contribute to this effort by developing a combinatory logic for one such pattern calculus, namely λP. We seek to mimic the computational process of λP where arguments can be matched against arbitrary terms, without the use of variables. Two challenges must be met. On the one hand, dealing with bound variables in patterns. Indeed, an abstraction is a valid pattern in λP. Here the standard combinatory logic will provide guidance. The second is computing the counterpart, in the combinatory setting, of the substitution that is obtained in a successful match. This requires devising rules that pull applications apart, so to speak. We propose a combinatory logic that serves this purpose and study its salient properties and extensions including typed presentations and modeling data structures. In the second part, we are concerned with the computational interpretation of a particular modal logic, the Logic of Proofs or LP, via the Curry-Howard isomorphism. LP, introduced by Artemov in 1995, is a refinement of modal logic in which the modality 2A is revisited as ]A where t is an expression that bears witness to the validity of A. It enjoys arithmetical soundness and completeness, can realize all S4 theorems and is capable of re ecting its own proofs (` A implies ` ]A, for some t). Esta es la primera formulación en Deducción Natural capaz de capturar a LP en su totalidad. Our main contribution is a well-behaved Natural Deduction presentation, developed with the aim of unveiling the computational metaphors which arise from the re ective capabilities of LP. This is the first Natural Deduction formulation capable of proving all LP-theorems. For that, we adopt Parigot's Classical Natural Deduction and merge it with a hypothetical reasoning which guide the construction of the inference schemes. As an outcome we obtain a Natural Deduction presentation of propositional LP for which a number of key properties are shown to hold. We then extend our analysis to the first-order case, introducing FOHLP, a first-order extension of HLP. Our point of departure is a recent first-order formulation of LP, called FOLP, which enjoys arithmetical soundness and has an exact provability semantics (completeness is unattainable given that a complete FOLP is not finitely axiomatizable). We provide a Natural Deduction presentation dubbed FOHLP, mappings to and from FOLP, a term assignment (λ-calculus) and a proof of termination of normalisation of derivations.
Cita tipo APA: Steren, Gabriela . (2014-12-15). Dos temas en reescritura: combinadores para cálculos con patrones e isomorfismo de Curry-Howard para la Lógica de Pruebas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5634_Steren.pdf Cita tipo Chicago: Steren, Gabriela. "Dos temas en reescritura: combinadores para cálculos con patrones e isomorfismo de Curry-Howard para la Lógica de Pruebas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5634_Steren.pdf |
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Sanz Perl Hernández, Yonatan. "Empleo de coordenadas motoras para decodificar el sistema motor en el canto de aves" (2014-12-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El trabajo que relata esta tesis se basa en la implementación de herramientas de análisis provenientes de la física en áreas vinculadas a las neurociencias. En particular esta tesis se encarga de mostrar la validez de estas herramientas y su capacidad de ser incorporadas como nuevas técnicas de analisis para abordar problemáticas típicas en neurociencias con otro punto de vista. Las aves canoras, modelo animal empleado en esta tesis, tienen la capacidad de aprender y generar un comportamiento complejo que es el canto. Para ello cuentan con un sofisticado órgano fonador, llamado Siringe, que es controlado mediante instrucciones provenientes del sistema nervioso. Durante la última década el Laboratorio de Sistemas Dinámicos ha realizado numerosos trabajos sobre el funcionamiento la Siringe, buscando comprender cuánto de la complejidad del canto se debe a la complejidad propia del organo fonador y cuánto se debe a complejidad en las instrucciones. Para ello se han realizado modelos matemáticos de baja dimensión, operacionales y predictivos capaces de generar sonidos sintéticos muy similares a los del ave, permitiendo asimismo comprender cuáles son las instrucciones necesarias para la obtención de dichos sonidos. Esta tesis se encarga en primera instacia de mostrar la pertinencia de dichos modelados para el caso del Diamante mandarín en términos de 3 observables distintos, para luego ir tras la pregunta de cómo están organizadas las instrucciones en el sistema nervioso. En términos de características acústicas se comprobó los sonidos generados con el modelo presentan la misma relación entre frecuencia fundamental y contenido espectral que los sonidos reales del ave, sonidos de baja frecuencia fundamental presentan alto contenido espectral y viceversa. Por otro lado, en términos de los gestos motores se comprobó que los gestos de presión y tensión que emplea el ave durante su canto para controlar la siringe, están fuertemente correlacionados con los parámetros del modelo que dan cuenta de la presión y la tensión. Finalmente, se confirmo la pertinencia del modelo en términos de respuesta neuronal en neuronas selectivas al canto propio en núcleos vinculados al aprendizaje y generación del canto. Para ello se realizaron experimentos de electro fisiología tanto en aves despiertas como dormidas mostrando que la respuesta neuronal presentada ante el estímulo de su propio canto grabado era muy similar a la presentada ante el estímulo del canto sintético. Vale aclarar que para lograr ese resultado fue necesario realizar una serie de mejoras al modelo, como la inclusión de un tracto vocal superior que actuara como filtro dinámico del sonido permitiendo incorporar mejoras tímbricas canto sintético. Finalmente con el modelado validado se abordo la pregunta de cómo codifica el cerebro la generación del canto. Para ello, se propuso realizar un cambio de coordenadas, de las acústicas (donde se venía estudiando el problema desde años) a las motoras. En estas coordenadas, se pudo observar una fuerte relación entre los disparos neuronales en el HVc (núcleo vinculado al aprendizaje y generación del canto) y los extremos de los gestos motores que se obtienen a partir del modelado del canto. Este resultado abrió un debate en el área, ya que hasta entonces el paradigma establecido afirmaba que los disparos en HVc eran cómo un "reloj" que dispara equidistante sin relación con la generación del canto. Este resultado, asimismo se suma a otros resultados que aparecen en la literatura de los últimos años que muestran observaciones contradictorias con el paradigma del "reloj". En esta tesis se plantea el debate como algo abierto aún y a la espera de la existencia de un modelo de sistema motor en el canto de ave que integre todas estas observaciones recientes. Abstract: This thesis is based on the implementation of analysis tools from physics in areas related to neuroscience. In particular, this thesis seeks to show the validity of these tools and their ability to be incorporated as new analytical techniques to approach typical problems in neuroscience from a different point of view. Songbirds, animal model used in this thesis, have the ability to learn and generate a complex behavior which is singing. In order to sing, they have a sophisticated vocal organ called Syrinx, which is controlled by instructions from the nervous system. During the last decade the Dynamical Systems Lab has performed extensively on the Syrinx operation, seeking to understand how much of song complexity is due to the complexity of the vocal organ and how much is due to complexity in the instructions. This has been done, operational and predictive low dimensional mathematical models capable of generating very similar to those of synthetic bird sounds, allowing also understand what the instructions for obtaining these sounds are. This thesis is responsible in the first instance to show the relevance of those modeled for the case in terms Zebra finch 3 different observables, then go after the question of how instructions are organized in the nervous system. In terms of acoustic characteristics of sounds generated was found to have the same pattern relationship between the fundamental frequency and the actual spectral content of the bird sounds, sounds of low fundamental frequency and vice versa at high spectral content. On the other hand, in terms of motor gestures it was found that the pressure and tension gestures employing the bird for its song to control the syrinx, are strongly correlated with the model parameters that account for the pressure and tension. Finally, the relevance of the model was confirmed in terms of selective neuronal response to own singing in nuclei related to song learning and generation of neurons. This electrophysiology experiments were conducted in both awake and asleep birds showing that the neural response to the stimulus presented their own recorded song was very similar to that presented to the stimulus of synthetic singing. It is clear that to achieve this result it was necessary to make a number of improvements to the model, the inclusion of an upper vocal tract act as dynamic filter allowing incorporate timbral sound improvements synthetic singing. Finally modeling validated with the question of how encoding celebrated singing generation board. To do this, it was proposed to make a change of coordinates, acoustic (where the problem had been studying for years) to the motor. In these coordinates, we observed a strong relationship between neuronal firing in HVC (nucleus linked to learning and singing generation) and the ends of the motor gestures obtained from the modeling of singing. This result opened a debate in the area, because until then the established paradigm claimed that the shots were HVc how a " clock 'equidistant firing unrelated to the generation of singing. This result also adds to other results reported in the literature in recent years that show contradictory observations with the paradigm of " clock '. In this thesis the discussion as open still and waiting for the existence of a power model in the singing bird that integrates all these recent observations system arises.
Cita tipo APA: Sanz Perl Hernández, Yonatan . (2014-12-15). Empleo de coordenadas motoras para decodificar el sistema motor en el canto de aves. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5680_SanzPerlHernandez.pdf Cita tipo Chicago: Sanz Perl Hernández, Yonatan. "Empleo de coordenadas motoras para decodificar el sistema motor en el canto de aves". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5680_SanzPerlHernandez.pdf |
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Ronchetti, Sonia Alejandra. "Efectos del arsénico sobre la adenohipófisis. Mecanismos de acción" (2014-12-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Introducción: El arsénico es un metaloide ampliamente distribuido en el ambiente el cual presenta potentes efectos tóxicos. La contaminación provocada por arsénico inorgánico (iAs) es uno de los mayores problemas sanitarios a nivel mundial. Si bien se han reportado efectos adversos del iAs sobre la función reproductiva, poco se conoce de sus acciones sobre la liberación hormonal y la fisiología adenohipofisaria. Objetivos: 1) Estudiar el efecto citotóxico del iAs sobre la fisiología adenohipofisaria y caracterizar los mecanismos de acción. 2) Investigar el papel del iAs como agente xenoestrogénico en la adenohipófisis y el útero. Resultados: 1) La exposición al iAs, a través del agua de bebida en diferentes concentraciones (5, 25 o 100 ppm) durante 30 días en ratas machos, disminuyó los niveles plasmáticos de prolactina (PRL) en forma dosis dependiente, mientas que la hormona luteinizante (LH) se vio afectada sólo con la máxima concentración utilizada. La administración del metaloide in vivo alteró la expresión del ARNm de genes de respuesta al estrés oxidativo en la adenohipófisis sugiriendo que, en estas condiciones, el iAs induce estrés oxidativo en la glándula. Confirmando los resultados in vivo, el iAs, en concentraciones micromolares, disminuyó la liberación de PRL en forma tiempo-dependiente sin afectar la de LH en cultivos primarios de células adenohipofisarias. Además, el iAs redujo la viabilidad celular adenohipofisaria, efecto debido principalmente a la inducción de apoptosis. Este proceso se caracterizó por un incremento de las especies reactivas del oxígeno, la despolarización del potencial de la membrana mitocondrial y un aumento en la expresión del ARNm de MT-1 y HO-1. El tratamiento con el antioxidante Nacetilcisteína previno el efecto citotóxico y la inhibición de la liberación de PRL inducida por iAs. 2) La administración del iAs a dosis bajas (0,1 ppm) durante 30 días a ratas hembras ovariectomizadas (OVX) indujo la aparición de proestros y estros respecto al control OVX. En la adenohipófisis, se observó un estímulo en la proliferación celular, especialmente de los lactotropos y un incremento en la secreción de PRL. Este metaloide también reguló la expresión proteica del REa y de su variante truncada. En el útero, la exposición al metaloide causó modificaciones citoestructurales mostrando un incremento del área glandular y de la altura del epitelio. Además, el iAs alteró la expresión del REa en las células epiteliales y en el estroma. Conclusiones: El iAs es un disruptor endocrino cuyos efectos varían con la dosis y el tiempo de exposición. A concentraciones micromolares, el iAs induce apoptosis e inhibe la secreción de prolactina. La generación de estrés oxidativo parece ser el principal mediador de los efectos tóxicos del metaloide. Por otro lado, a concentraciones más bajas, el iAs reproduce las acciones del estrógeno, estimulando la proliferación celular en tejidos hormona-dependientes. Abstract: Introduction: Arsenic is a metalloid ubiquitously present in the environment with potent toxic effects. Inorganic arsenic (iAs) contamination is considered one of the top environmental health threats worldwide. Many reports have shown that iAs affects reproductive system, however, little is known about the effect of iAs on hormone release and anterior pituitary physiology. Objectives: 1) To study the cytotoxic effect of iAs on anterior pituitary physiology and describe its mechanisms. 2) To investigate iAs xenoestrogenic role on anterior pituitary and uterus. Results: 1) iAs exposure (5, 25 or 100 ppm) to male rats through drinking water for 30 days decreased prolactin (PRL) serum levels in a dose-dependent manner whereas luteinizing hormone (LH) levels were affected only at the highest concentration used. In vivo iAs administration increased mRNA expression of several oxidative stress-responsive genes in anterior pituitary gland, suggesting that this metalloid induces oxidative stress in pituitary gland. iAs, at micromolar concentrations, significantly decreased PRL release in a timedependent fashion whereas LH levels remained unaltered in anterior pituitary cells in culture. Besides, iAs reduced cell viability mainly by apoptosis. This process is characterized by increased levels of reactive oxygen species, early depolarization of mitochondrial membrane potential and augmented expression of some key oxidative stress-responsive genes such as HO-1 and MT-1. The antioxidant N-acetylcysteine prevented iAs-induced cytotoxic effects and prolactin release inhibition. 2) iAs administration at lower doses (0,1 ppm) to female ovariectomized rats (OVX) for 30 days induced the apparition of proestrus and estrus. In the pituitary gland iAs stimulated cell proliferation, especially of lactotroph and increased PRL secretion. This metalloid also regulated protein expression of ERa and its truncated variant. In uterus, iAs exposure caused cytoarchitectural changes by increasing both glandular area and uterine epithelium height. Besides, iAs altered ERa expression in epithelial cells and stroma. Conclusions: iAs is an endocrine disruptor whose effects vary with dose and exposure time. At micromolar concentrations iAs induces apoptosis and inhibits PRL secretion. Oxidative stress generation seems to be the main mediator of the metalloid’s toxic effects. On the other hand, at lower concentrations, iAs mimics estrogen actions by stimulating cell proliferation on hormone-dependent tissues.
Cita tipo APA: Ronchetti, Sonia Alejandra . (2014-12-15). Efectos del arsénico sobre la adenohipófisis. Mecanismos de acción. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5628_Ronchetti.pdf Cita tipo Chicago: Ronchetti, Sonia Alejandra. "Efectos del arsénico sobre la adenohipófisis. Mecanismos de acción". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5628_Ronchetti.pdf |
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Vivas Leguizamón, Laura Vanessa. "Control de calidad de Hibiscus sabdariffa L. (Malvaceae): estudio farmacobotánico, análisis de polifenoles y actividad antioxidante aplicables en un laboratorio de baja complejidad" (2014-12-10). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Hibiscus sabdariffa L. (Malvaceae), conocida como “Hibiscus” y “Flor de Jamaica”, es empleada en la elaboración de té y de bebidas refrescantes libres de cafeína. El objetivo del trabajo fue determinar los parámetros farmacobotánicos y fitoquímicos (polifenoles) aplicables al control de calidad de muestras de “Hibiscus” en el marco de un laboratorio de baja complejidad. Se analizaron muestras comerciales de “Hibiscus” y se realizaron disociados leves, infusiones y extractos etanólicos. El análisis microscópico permitió observar la presencia de una epidermis con estomas anomocíticos; tricomas eglandulares cónicos y flexuosos; tricomas glandulares no capitados y capitados; tráqueas espiraladas y drusas. El análisis fitoquímico permitió determinar un perfil de antocianos caracterizado por la presencia de delfinidina-3-sambubiósido y cianidina-3-sambubiósido. En algunas muestras se detectó un tercer compuesto, en baja concentración, que correspondería a cianidina-3-glucósido. Estos compuestos se presentaron como importantes marcadores fitoquímicos permitiendo determinar su presencia en muestras complejas. Si bien el perfil de polifenoles se presentó sin modificaciones entre las diversas muestras analizadas, se observó una marcada variación cuantitativa entre las mismas. Tanto los extractos acuosos como los etanólicos presentaron importantes contenidos de polifenoles y una promisoria actividad antioxidante. En líneas generales, en el extracto etanólico se determinaron las mayores concentraciones de fenoles, flavonoides, ácidos hidroxicinámicos y particularmente de antocianos, como así también una mayor actividad antioxidante, respecto de los valores obtenidos en los extractos acuosos. Las técnicas empleadas son de rápida realización y bajo costo, aplicables en laboratorios de baja complejidad. PALABRAS CLAVES: Hibiscus sabdariffa, “Hibiscus”, “Flor de Jamaica”, tricomas, antocianos, delfinidina-3-sambubiósido, cianidina-3-sambubiósido, flavonoides, ácidos hidroxicinámicos, fenoles totales. Abstract: Hibiscus sabdariffa L. (Malvaceae), known as “Hibiscus” and “Jamaica flower”, is employed in the making of tea and refreshing caffeine-free beverages. The aim of this study was to determine the pharmacobotanical and phytochemical (polyphenols) parameters applicable to the quality control of “Hibiscus” samples in a low complexity laboratory. Commercial samples of “Hibiscus” were analyzed, and mild dissociation, infusions, and ethanol extracts were performed. Microscopic analysis revealed the presence of an epidermis with anomocitic stomata; conic and flexuous eglandular trichomes; non-capitated and capitated glandular trichomes; spiral trachea and druses. Phytochemical analysis helped identify an anthocyanin profile characterized by the presence of delphinidin-3-sambubioside, and cyanidin-3-sambubioside. In some samples, a third compound was identified, in low concentration, which would agree with cyaniding-3- glucoside. Given that these compounds were significant phytochemical indicators, their presence was allowed to be determined in complex samples. Even though polyphenol profile showed no modifications in the different analyzed samples, a strong quantitive variation was observed among them. Both aqueous, and ethanol extracts, showed high content of polyphenols, and a promising antioxidant activity. In general, the highest concentration of phenols, flavonoids, hydroxycinnamic acids, and specifically anthocyanins were determined in ethanol extract, as well as, higher antioxidant activity compared to the values obtained in aqueous extract. The techniques employed are low cost and can be performed rapidly, applicable in low complexity laboratories. KEYWORDS: Hibiscus sabdariffa, “Hibiscus”, “Flor de Jamaica”, trichomes, anthocyanins, delphinidin-3-sambubioside, cyanidin-3-sambubioside, flavonoids, hydroxycinnamic acids, total phenols.
Cita tipo APA: Vivas Leguizamón, Laura Vanessa . (2014-12-10). Control de calidad de Hibiscus sabdariffa L. (Malvaceae): estudio farmacobotánico, análisis de polifenoles y actividad antioxidante aplicables en un laboratorio de baja complejidad. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5824_VivasLeguizamon.pdf Cita tipo Chicago: Vivas Leguizamón, Laura Vanessa. "Control de calidad de Hibiscus sabdariffa L. (Malvaceae): estudio farmacobotánico, análisis de polifenoles y actividad antioxidante aplicables en un laboratorio de baja complejidad". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5824_VivasLeguizamon.pdf |
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Déboli, Alberto Fernando. "Métodos topológicos para algunas ecuaciones diferenciales funcionales resonantes no lineales" (2014-12-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se estudia la existencia de soluciones de dos ecuaciones diferenciales funcionales resonantes no lineales. Por un lado, se estudia existencia de al menos una solución de un problema de segundo orden con condiciones de Neumann bajo diferentes condiciones impuestas a la no linealidad, con la particularidad de que ésta depende de los valores de la solución desconocida en el borde del dominio. Más precisamente, se prueba la existencia de al menos una solución adaptando a este tipo de problemas las condiciones clásicas de Landesman-Lazer para el caso escalar y para el caso de un sistema, la condición de Nirenberg. Por otro lado, se estudia un problema de primer orden con una no linealidad que depende de varios retardos variables. Más precisamente, se prueba un resultado de existencia de al menos una solución periódica positiva para el caso escalar y para un sistema, y un resultado de estabilidad generalizando los obtenidos por otros autores. En todos los problemas estudiados, las no linealidades están condicionadas en sus argumentos y se trata de problemas resonantes en el sentido de que el operador lineal de diferenciación involucrado tiene núcleo no trivial. El principal método que se implementa, en cada caso, para probar existencia de solución se basa en la teoría del grado de coincidencia de Mawhin, el cual es una generalización del grado topológico de Leray Schauder. No obstante, existen problemas resonantes en los que el grado de coincidencia no se aplica; el problema de segundo orden bajo condiciones de Neumann en un dominio no acotado es un caso particular de ese tipo y se aborda recurriendo al método de las sub y super soluciones ordenadas combinado con un argumento del tipo diagonal. Abstract: In this work, we study the existence of solutions of two nonlinear resonant ordinary functional differential equations. In the first place, we consider an abstract second order problem under Neumann boundary conditions arising on an electro-diffusion model. This problem has the particularity that the nonlinear term depends on the Dirichlet values of the yet-to-be-determined solution. We shall prove the existence of solutions by adapting the classical Landesman-Lazer conditions for the scalar case, and a condition by Nirenberg for a system of equations. In the second place, we study a first order Nicholson type equation with several delays. We shall prove the existence of a positive periodic solution both for the scalar equation and for a system. Also, we shall prove an stability result. In both cases, the nonlinear term is a functional operator and the problems are resonant in the sense that the associated linear operators have nontrivial kernel. Our main tool for proving existence of solutions shall be Mawhin’s coincidence degree, which is a generalization of Leray-Schauder degree. There are, however, some cases in which this theory cannot be applied: for example, the case of a boundary value problem on the half-line, for which we adapt the method of upper and lower solutions combined with a diagonal argument.
Cita tipo APA: Déboli, Alberto Fernando . (2014-12-10). Métodos topológicos para algunas ecuaciones diferenciales funcionales resonantes no lineales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5620_Deboli.pdf Cita tipo Chicago: Déboli, Alberto Fernando. "Métodos topológicos para algunas ecuaciones diferenciales funcionales resonantes no lineales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5620_Deboli.pdf |
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Capitelli, Nicolás Ariel. "Variedades combinatorias no homogéneas y dualidad de Alexander" (2014-12-05). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta Tesis introducimos la teoría de NH-variedades, una extensión de la teoría clásica de variedades combinatorias al contexto no homogéneo. Las NH-variedades poseen una estructura local que consiste en versiones simpliciales de espacios euclídeos de distintas dimensiones, lo que les confiere propiedades muy parecidas a las de las variedades usuales. Nuestro trabajo permite extender los resultados principales de la teoría clásica de variedades a una clase mucho más amplia de espacios; entre estos resultados, el teorema de expansiones regulares de Alexander y la existencia de entornos regulares. A lo largo de esta Tesis exhibimos muchos ejemplos de espacios que forman parte de esta teoría pero no están incluidos en la teoría clásica. Introducimos también la noción de shelling no homogéneo y caracterizamos todas las NH-variedades shellables en el sentido de Björner y Wachs. La teoría de NH-variedades puede aplicarse al estudio de variedades clásicas y lo exhibimos en el caso concreto de la factorización de operaciones simpliciales entre variedades combinatorias (starrings, shellings y bistellar moves). En particular, se muestra que dos variedades son PL-homeomorfas si y sólo si pueden relacionarse por medio de NH-factorizaciones involucrando una sucesión de NH-variedades. En la segunda parte del trabajo analizamos la relación entre la teoría clásica y la no homogénea en el contexto de la dualidad de Alexander combinatoria. Estudiamos el dual de Alexander de las bolas y esferas combinatorias y mostramos que los doble duales de estos complejos son NH-bolas y NH-esferas, las versiones no homogéneas de las bolas y esferas clásicas. Además, definimos la noción de NH-bola y NH-esfera minimal, bolas y esferas no puras que satisfacen una condición de minimalidad en la cantidad de símplices maximales. Las NH-bolas y NH-esferas minimales caracterizan completamente la clase del simplex y del borde del simplex en la relación de equivalencia generada por tomar dual de Alexander. Uno de los resultados principales de este trabajo es la generalización al contexto no homogéneo de los resultados de Dong y Santos-Sturmfels sobre el tipo homotópico del dual de Alexander de las bolas y esferas combinatorias: el dual de Alexander de una NH-bola es un espacio contráctil y el dual de Alexander de una NH-esfera es homotópicamente equivalente a una esfera. Nuestra generalización muestra que el tipo homotópico del dual de Alexander es preservado para una clase mucho más amplia de espacios que los contemplados en los resultados originales de Dong y Santos-Sturmfels. Por ejemplo, incluye todas las NH-bolas y NH-esferas exhibidas (explícita o implícitamente) en esta Tesis. Abstract: In this Thesis we introduce the theory of NH-manifolds, an extension of the classical theory of combinatorial manifolds to the non-homogeneous setting. NH-manifolds have a local structure consisting of simplicial versions of euclidean spaces of different dimensions, giving them features very similar to those of polyhedral manifolds. In our work we extend the main results from the classical theory of manifolds to a larger class of spaces; among these results, the Alexander's theorem on regular expansions and the existence of regular neighbourhoods. Throughout this Thesis we present many examples of spaces which are part of this theory but are not included in the classical theory. We also introduce the notion of non pure shelling and characterize all shellable NH-manifolds in the sense of Bjorner and Wachs. The theory of NH-manifolds can be applied to the study of classical manifolds. This is exhibited in the concrete case of factorization of simplicial moves between combinatorial manifolds (starrings, shellings and bistellar moves). In particular, it is shown that two manifolds are PL-homeomorphic if and only if they are related through NH-factorizations involving a sequence of NH-manifolds. In the second part of this work we analyze the relation between the classical and the non-pure theory within the context of combinatorial Alexander duality. We study the Alexander dual of combinatorial balls and spheres and show that the double duals of these classes of complexes are NH-balls and NH-spheres, the non-homogeneous versions of classical balls and spheres. We also define the notion of minimal NH-ball and NH- sphere, a subfamily of non-pure manifolds satisfying a minimality condition on the number of maximal simplices. Minimal NH-balls and NH-spheres completely characterize the class of the simplex and the boundary of the simplex in the equivalence relation generated by taking Alexander dual. One of the main results of this Dissertation is a generalization to the non-homogeneous setting of the results of Dong and Santos-Sturmfels on the homotopy type of the Alexander dual of combinatorial balls and spheres: the Alexander dual of an NH-ball is a contractible space and the Alexander dual of an NH-sphere is homotopically equivalent to a sphere. Our generalization shows that the homotopy type of the Alexander dual is preserved for a far larger class of spaces than the original results by Dong and Santos-Sturmfels. For example, all NH-balls and NH-spheres exhibited (explicitly or implicitly) in this Thesis are included.
Cita tipo APA: Capitelli, Nicolás Ariel . (2014-12-05). Variedades combinatorias no homogéneas y dualidad de Alexander. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5635_Capitelli.pdf Cita tipo Chicago: Capitelli, Nicolás Ariel. "Variedades combinatorias no homogéneas y dualidad de Alexander". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-05. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5635_Capitelli.pdf |
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Scagliotti, Juan José. "Los quironómidos fósiles como paleoindicadores de cambios climáticos durante el Tardiglacial y Holoceno en Patagonia" (2014-12-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta investigación se presentan los resultados del estudio de los registros de quironómidos fósiles de Laguna Potrok Aike (Santa Cruz, Argentina) y de Lago Lepué (Distrito de los Lagos Chilenos, Chile), obtenidos a partir del análisis de testigos sedimentarios lacustres, los cuales se extienden hasta los 15500 años cal BP y los 17500 años cal BP respectivamente, abarcando el Tardiglacial y Holoceno. El estudio realizado en Laguna Potrok Aike constituye uno de los registros más completos de quironómidos fósiles de la estepa patagónica austral abarcando el Tardiglacial y el Holoceno. Este trabajo permitió identificar la presencia de 3141 restos de cápsulas cefálicas de larvas de quironómidos representados por cuatro morfogéneros pertenecientes a las subfamilias Chironominae (53%) y Orthocladiinae (47%). En este registro se observa una clara alternancia en las abundancias de los ensambles de quironómidos asociada a cambios en el nivel del lago, los cuales reflejan variaciones en las condiciones hidrológicas locales. Durante el Tardiglacial se observa inicialmente un intervalo más seco, seguido de uno más húmedo, aunque para todo este período el nivel de las aguas y la humedad habrían sido mayores a lo registrado durante la mayor parte del Holoceno. Si bien se detecta una perturbación contemporánea al YD, dicha señal no puede ser interpretada como una respuesta a un descenso en los registros térmicos, probablemente debido a que la fuerte influencia de las precipitaciones y los vientos en la distribución de los ensambles de quironómidos en Potrok Aike enmascaran la señal climática durante este intervalo. Tampoco se registran otros eventos fríos como el ACR o el HMCR. Los cambios más pronunciados en el ensamble de quironómidos de Laguna Potrok Aike se observan a partir de los 8700 años cal BP, evidenciando el inicio de una etapa de sequía extrema, durante la cual se alcanza el nivel más bajo de las aguas de todo este registro. A partir de los últimos 5000 años cal BP se detecta un período de oscilaciones, con alternancia de pulsos húmedos/secos durante los cuales el nivel de las aguas fue altamente variable. El registro de quironómidos de Lago Lepué arrojó un total de 1818 restos de cápsulas cefálicas de larvas de quironómidos, representados por las subfamilias Chironominae (57,53%), Orthocladiinae (26,67%), Tanypodinae (14,96%), Prodiamesinae (0,55%) y Podonominae (0,28%). Los cambios en los ensambles de quironómidos fósiles de Lago Lepué responden principalmente a cambios climáticos, en especial a la temperatura y a variaciones en el patrón de precipitaciones. Durante el Tardiglacial, los ensambles de quironómidos muestran condiciones frías y húmedas, con un período de registros térmicos más bajos entre los 17500- 15500 años cal BP y uno más húmedo entre los 12500-9000 años cal BP, sin evidencias de reversiones climáticas significativas. A partir de los 8800, hasta los 6800 años cal BP se identifica el inicio de una fase más cálida y seca, seguida de un intervalo caracterizado por un progresivo aumento en las precipitaciones y un descenso en la temperatura, el cual se extiende hasta el presente inclusive. Al integrar los resultados de los quironómidos de Lago Lepué y Laguna Potrok Aike con estudios paleoambientales preexistentes en la región no se observa una clara señal en relación a un patrón de temperatura, aunque resulta claro que el régimen de precipitaciones de Patagonia, al menos durante el Holoceno, obedecería a cambios en la posición latitudinal de los Westerlies. Palabras clave: Patagonia, Tardiglacial, Holoceno, quironómidos, Westerlies, testigos sedimentarios lacustres, cambio climático. Abstract: This research presents the results of the study of fossil chironomid records from Laguna Potrok Aike (Santa Cruz, Argentina) and Lago Lepué (Chilean Lake District, Chile), obtained from the analysis of lake sediment cores which extend to 15500 cal yr BP and 17500 cal yr BP respectively, embracing the Lateglacial and Holocene. The study in Laguna Potrok Aike is one of the few fossil chironomid records from Patagonian steppe, allowing the identification of 3141 fossil remains represented by 4 morphogenera belonging to the subfamilies Chironominae (53%) and Orthocladiinae (47%). Potrok Aike´s record presents a clear alternation in the abundance of chironomids genera associated with changes in lake level, reflecting variations in hydrological conditions. During the Late Glacial a drier interval was detected, followed by a wetter one, although along this period the water level and humidity were higher than those recorded during the Holocene. Despite disturbance is detected contemporaneously with YD, this signal can not be interpreted as a response to a drop in temperature recordings, probably due to the strong influence of precipitation and winds in the distribution of chironomid assemblages in Potrok Aike that mask the climate signal during this interval. There is also no evidence in this record of other cold events such as ACR or HMCR. The most pronounced change in chironomid assamblages from Laguna Potrok Aike is observed from 8700 cal yr BP, showing the begining of a period of extreme drougth, during which waters reached the lowest lake level according to this record. During the last 5000 cal yr BP, a period of oscillations is detected, alternating wet/dry pulses, during wich lake level was extremely variable. Lepué´s chironomid record yielded a total of 1818 head capsules remains of chironomid larvae, represented by the subfamilies Chironominae (57,53%), Orthocladiinae (26,67%), Prodiamesinae (0,55%) and Podonominae (0,28%). Changes in fossil chironomid assemblages from Lepué respond primarily to climate changes, particularly temperature and rainfall patterns. During the Lateglacial chironomids displayed cold and wet conditions, with a period of lower temperature between 17500-15500 cal yr BP, and a more humid period between 12500-9000 cal yr BP, with no evidence of significant climatic reversals. From 8800 to 6800 cal yr BP a warm and dry phase is identified, followed by an interval characterized by a progressive increase in precipitation and a reduction in temperature, which extends to the present inclusive. By integrating the results of chironomids from Lepué and Potrok Aike with existing paleoenvironmental studies from the region no clear signal regarding temperature pattern is found, although it emerges that the rainfall regime of Patagonia, at least during the Holocene, might be due to changes in the latitudinal position of the Southern Westerlies. Keywords: Patagonia, Lateglacial, Holocene, chironomids, Southern Westerlies, lake sediments cores, climate change.
Cita tipo APA: Scagliotti, Juan José . (2014-12-04). Los quironómidos fósiles como paleoindicadores de cambios climáticos durante el Tardiglacial y Holoceno en Patagonia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5638_Scagliotti.pdf Cita tipo Chicago: Scagliotti, Juan José. "Los quironómidos fósiles como paleoindicadores de cambios climáticos durante el Tardiglacial y Holoceno en Patagonia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5638_Scagliotti.pdf |
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Mezzina, Mariela Paula. "Análisis funcional y estructural de la phasina PhaP de Azotobacter sp. FA-8 y su rol en Escherichia coli recombinante" (2014-12-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las phasinas son un grupo de proteínas que se encuentran asociadas a gránulos de polihidroxialcanoatos (PHA). Además de su rol estructural como parte de la cubierta del gránulo, se han encontrado diferentes funciones estructurales y regulatorias asociadas a varias de estas proteínas, y se han desarrollado aplicaciones biotecnológicas utilizando proteínas fusionadas a phasinas. A pesar de su diversidad funcional, la estructura de estas proteínas ha sido analizada en detalle en muy pocos estudios. PhaP de Azotobacter sp. FA8 (PhaPAz) pertenece al grupo más representado de la multifuncional familia de las phasinas. Esta proteína ha sido clonada y expresada en Escherichia coli. Las cepas recombinantes de E. coli que sobreexpresan phaPAz crecen más y acumulan más polímero, lo que sugiere que PhaPAz ejerce un efecto promotor del crecimiento. Se observó también que la expresión de PhaPAz tiene un inesperado efecto protector en E. coli no productora de PHA, tanto en condiciones normales como en condiciones de estrés, resultando en un mayor crecimiento y mayor resistencia a estrés oxidativo y estrés térmico. El objetivo de este trabajo doctoral es realizar una caracterización funcional y estructural de esta phasina para estudiar sus diversas propiedades y dilucidar el mecanismo por el cual ejerce su efecto protector. Su estructura primaria reveló que no posee claros dominios hidrofóbicos, característica que parece ser común a la mayoría de las phasinas, a pesar de su capacidad de unión a gránulos lipídicos. La estructura secundaria de esta proteína consiste en α-hélices, combinadas con regiones desestructuradas que le confieren una notable flexibilidad dependiente del entorno. Los datos experimentales obtenidos revelaron que PhaPAz es un tetrámero formado por interacciones de tipo coiled coil entre los monómeros. Estas características estructurales tambén fueron encontradas en otras phasinas y podrían estar relacionadas con su diversidad funcional. Se realizaron experimentos de actividad chaperona in vitro para dilucidar el mecanismo por el cual PhaPAz ejerce su efecto protector. PhaPAz demostró evitar la agregación térmica de la proteína Citrato Sintasa (CS) y facilitar el proceso de replegado de la enzima luego de la desnaturalización por métodos químicos in vitro. Estos experimentos mostraron que PhaPAz tiene actividad chaperona in vitro. Se utilizaron técnicas de microscopía de fluorescencia y de transmisión electrónica para analizar la localización intracelular de PhaPAz en cepas de E. coli productoras y no productoras de PHB con el objetivo de estudiar el rol de PhaPAz en el plegado de proteínas in vivo, el agregado de proteínas y la dinámica de formación de cuerpos de inclusión. PhaPAz colocalizó con los cuerpos de inclusión de PD, proteína que forma grandes y visibles agregados cuando es sobreexpresada en E. coli. Se observó una reducción en el número de cuerpos de inclusión cuando PD fue coproducida con PhaPAz o con la chaperona GroELS. Estos resultados demuestran que PhaPAz presenta actividad chaperona tanto in vitro como in vivo en E. coli recombinante, y sugieren que las phasinas podrían tener un rol protector general en los productores naturales de PHA. Estas observaciones hacen posible el uso de esta proteína en el desarrollo de nuevas aplicaciones biotecnológicas, como por ejemplo la producción de proteínas recombinantes y otros productos heterólogos en E. coli. Abstract: Phasins are a group of proteins associated to granules of polyhydroxyalkanoates (PHAs). Apart from their structural role as part of the PHA granule cover, different structural and regulatory functions have been found associated to many of them, and several biotechnological applications have been developed using phasin protein fusions. Despite their remarkable functional diversity, the structure of these proteins has not been analyzed except in very few studies. PhaP from Azotobacter sp. FA8 (PhaPAz) is a representative of the prevailing type in the multifunctional phasin protein family. This protein has been cloned and expressed in Escherichia coli. Recombinant E. coli strains overexpressing phaPAz grow more, and accumulate more polymer, suggesting that PhaPAz exerts a growth promoting effect. Expression of PhaPAz was also observed to have an unexpected protective effect in E. coli strains that do not synthesize PHAs, under both normal and stress conditions, resulting in increased growth and higher resistance to both superoxide stress and heat shock. The aim of this work was to perform a physiological and structural characterization of this protein, to shed light on its properties. Its secondary structure revealed that it lacks clear hydrophobic domains, a characteristic that appears to be common to most phasins, despite their lipid granule binding capacity. The secondary structure of this protein, consisting of α- helices and disordered regions, has a remarkable capacity to change according to its environment. Several experimental data support that is a tetramer, probably due to interactions between coiled-coil regions. These structural features have also been detected in other phasins, and may be related to their functional diversity. In vitro chaperone activity experiments were performed in order to shed light on the mechanisms by which PhaPAz exerts its protective effect. PhaPAz was shown to prevent in vitro thermal aggregation of the model protein citrate sinthase (CS) and to facilitate the refolding process of the enzyme after chemical denaturation. These experiments showed that PhaPAz presents in vitro chaperone activity. Fluorescence microscopy and electron transmission microscopy were used to analyze the subcellular localization of PhaPAz in PHB producing and non PHB producing E. coli strains and to study the role of PhaPAz in in vivo protein folding, protein aggregation and inclusion body dynamics. PhaPAz was shown to colocalize with inclusion bodies of PD, a protein that forms large inclusion bodies when overexpressed. A reduction in the number of inclusion bodies of PD was observed when the insoluble protein PD was coexpressed with PhaPAz or with the known chaperone GroELS. These results demonstrate that PhaPAz has chaperone like functions both in vitro and in vivo in E. coli recombinants, and suggests that phasins could have a general protective role in natural PHA producers, that in these microorganisms is masked by the fitness enhancing properties of the polymer. These observations open the door for novel biotechnological applications of this protein, for example, in the production of recombinant proteins and other heterologous products in E. coli.
Cita tipo APA: Mezzina, Mariela Paula . (2014-12-04). Análisis funcional y estructural de la phasina PhaP de Azotobacter sp. FA-8 y su rol en Escherichia coli recombinante. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5648_Mezzina.pdf Cita tipo Chicago: Mezzina, Mariela Paula. "Análisis funcional y estructural de la phasina PhaP de Azotobacter sp. FA-8 y su rol en Escherichia coli recombinante". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5648_Mezzina.pdf |
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Velásquez, Silvia Melina. "Las modificaciones post-traduccionales en extensinas son esenciales en la expansión polarizada de pelos radiculares en Arabidopsis thaliana" (2014-12-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los pelos radiculares son células individuales especializadas en la absorción de agua y nutrientes que crecen mediante expansión polarizada, proceso compartido con los tubos polínicos, axones, e hifas de hongos. No obstante, las paredes celulares imponen límites al crecimiento por lo cual, en plantas, se debe estar constantemente incorporando nuevas moléculas para lograr el crecimiento. Sus paredes celulares están compuestas por polisacáridos y proteínas ricas en hidroxiprolina (hydroxyproline-rich glycoproteins; HRPGs) que incluyen a las extensinas (EXTs). La hidroxilación de Prolinas (Hyp), una modificación post-traduccional (MPT) temprana de las HRGPs, catalizada por las Prolil-4-hidroxilasas (P4Hs), define los subsecuentes sitios de Oglicosilación en las EXTs, que son principalmente arabinosiladas. En este trabajo se exploró la función biológica de las P4Hs, las arabinosiltransferasas y las EXTs asociadas al desarrollo del pelo radicular. Inhibición bioquímica o disrupción genética de las P4Hs resultó en una interrupción del crecimiento polarizado en los pelos radiculares y en una reducción de la arabinosilación de las EXTs. En segundo lugar, se demostró que la prolil-4-hidroxilasa 5 (P4H5) y en menor medida P4H2 y P4H13, son centrales para el desarrollo del pelo mediado por EXTs. Mediante experimentos de intercambio de promotores y regiones catalíticas, se pudo mostrar que P4H2 y P4H13 tienen funcionalidades intercambiables pero son incapaces de reemplazar a P4H5. Estas tres P4Hs son direccionadas a la vía secretoria, más específicamente al Retículo y Aparato de Golgi, donde P4H5 forma dímeros con P4H2 y P4H13, sugiriendo la existencia de complejos de proteínas P4Hs. En tercer lugar, se exploró la localización sub-celular y la especificidad de sustrato de P4H5, como también la arquitectura de la pared celular resultante en el mutante p4h5. También se analizó la significancia fisiológica de las MPTs en las EXTs. Específicamente, mutantes deficientes en Hyp-O-arabinosilación o en Ser-O-galactosialción mostraron pelos más cortos, debido al efecto conjunto de una tasa de crecimiento más lenta y una interrupción temprana del crecimiento. A su vez, nuestros hallazgos resaltan que ambos tipos de O-glicosilación (Hyp-O-arabinosilación y Ser-O-galactosilación) son necesarios y tienen efectos aditivos en el correcto funcionamiento de las EXTs durante la expansión del pelo radicular. Finalmente, a través de simulaciones de dinámicas moleculares se pudo explorar la influencia de los O-glicanos en una putativa, auto-ensamblada, conformación de triple hélice de EXTs. Nuestros resultados demostrarían que una correcta O-glicosilación de las EXTs sería esencial para el auto-ensamblado de la pared celular y por lo tanto en la elongación del pelo radicular en Arabidopsis thaliana. Abstract: Root hairs are single cells that develop by tip growth and are specialized in the absorption of nutrients, a process shared with pollen tubes, axons, and fungal hyphae. However, structural cell walls imposed constraints prompt utilization of new molecules to accomplish tip growth in plants. Their cell walls are composed of polysaccharides and hydroxyproline-rich glycoproteins (HRGPs) that include extensins (EXTs). Proline hydroxylation, an early post-translational modification (MPT) of HRGPs that is catalyzed by prolyl 4-hydroxylases (P4Hs), defines the subsequent O-glycosylation sites in EXTs, which are mainly arabinosylated. Here, we explored the biological function of P4Hs, arabinosyltransferases and EXTs in root hair cell growth. Biochemical inhibition or genetic disruption of P4Hs resulted in the blockage of polarized growth in root hairs and reduced arabinosylation of EXTs. Secondly, we demonstrate that prolyl-4- hydroxylase 5 (P4H5), and to a lower extent P4H2 and P4H13, are pivotal for EXT-mediated root hair tip-growth. By P4H promoter and protein swaps approaches, it was shown that P4H2 and P4H13 have interchangeable functionalities but they cannot replace P4H5. These three P4Hs are targeted to the secretory pathway, most specifically to the ER and Golgi compartments, where P4H5 forms dimers with P4H2 and P4H13 suggesting the existence of P4Hs protein complexes. Thirdly, we explored the subcellular localization and substrate specificity of the P4H5, as well as the resulting cell wall architecture in the p4h5 mutant. We also addressed the physiological significance of the MPTs of EXTs. In particular, mutants who were deficient in Hyp-Oarabinosylation or in Ser-O-galactosylation showed shorter root hairs, due to both slower kinetics and premature growth termination. In addition, our findings highlights that both Oglycosylation types (Hyp-O-arabinosylation and serine-O galactosylation) are required and have additive effects for correct EXT function in root hair cell expansion. Finally, molecular dynamics simulations addressed the influence of O-glycans on a putative EXT self-assembled triple helix conformation. Our results demonstrate that correct O-glycosylation on EXTs is essential for cell wall self-assembly and hence root hair elongation in Arabidopsis thaliana.
Cita tipo APA: Velásquez, Silvia Melina . (2014-12-02). Las modificaciones post-traduccionales en extensinas son esenciales en la expansión polarizada de pelos radiculares en Arabidopsis thaliana. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5632_Velasquez.pdf Cita tipo Chicago: Velásquez, Silvia Melina. "Las modificaciones post-traduccionales en extensinas son esenciales en la expansión polarizada de pelos radiculares en Arabidopsis thaliana". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-12-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5632_Velasquez.pdf |
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Goussies, Norberto Adrián. "Transferencia de aprendizaje mediante bosques de decisión" (2014-11-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los bosques de decisión son una herramienta que se han popularizado para resolver diferentes tareas de visión por computadora. Sus principales ventajas son su alta eficiencia computacional, los resultados competitivos con el estado del arte que se obtienen al emplearlos y que son inherentemente clasificadores multiclase. Usualmente, para cada nueva tarea de visión por computadora donde se tiene que entrenar un bosque de decisión, un nuevo conjunto de entrenamiento debe ser confeccionado desde cero. En esta tesis, presentamos un nuevo método de transferencia de aprendizaje que utiliza bosques de decisión y lo aplicamos para reconocer gestos y caracteres. El método propuesto extrae conocimiento de otras tareas de visión por computadora y lo aplica a una tarea destino, reduciendo el problema de crear nuevos conjuntos de entrenamiento. Introducimos dos extensiones en el modelo de los bosques de decisión para poder transferir conocimiento de varias tareas de origen a una tarea destino. La primera es la ganancia de información mixta, que se puede interpretar como un regularizador basado en los datos. La segunda es la propagación de etiquetas, que infiere el estructura de la variedad del espacio de características. Demostramos que ambas extensiones son importantes para obtener altas tasas de reconocimiento. Nuestros experimentos demuestran mejoras sobre los bosques de decisión tradicionales en el ChaLearn Gesture Challenge y en el conjunto de datos MNIST (Mixed National Institute of Standards and Technology) de dígitos escritos a mano. Además demostramos mejoras en tasas de reconocimiento en comparación con otros clasificadores del estado del arte. Abstract: Decision forests are an increasingly popular tool in computer vision tasks. Their advantages include high computational efficiency, stateof- the-art accuracy and multi-class support. Usually for each new computer vision task where a decision forest has to be learned a new training set is collected from scratch. In this thesis, we present a novel method for transfer learning which uses decision forests, and we apply it to recognize gestures and characters. This method extracts knowledge from previous computer vision tasks and applies it to the target task, thus reducing the problem of collecting new datasets. We introduce two extensions into the decision forest framework in order to transfer knowledge from several source tasks to a given target task. The first one is mixed information gain, which is a data-based regularizer. The second one is label propagation, which infers the manifold structure of the feature space. We show that both of them are important to achieve higher recognition rates. Our experiments demonstrate improvements over traditional decision forests in the ChaLearn Gesture Challenge and MNIST (Mixed National Institute of Standards and Technology) dataset of handwritten digits. Also, we show that the transfer learning decision forests compare favorably against other state-of-the-art classifiers.
Cita tipo APA: Goussies, Norberto Adrián . (2014-11-28). Transferencia de aprendizaje mediante bosques de decisión. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5641_Goussies.pdf Cita tipo Chicago: Goussies, Norberto Adrián. "Transferencia de aprendizaje mediante bosques de decisión". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5641_Goussies.pdf |
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Coccoz, Verónica. "Estudio de la modulación de la fase de reconsolidación de la memoria declarativa en humanos" (2014-11-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El redescubrimiento de la reconsolidación de la memoria desafió la clásica visión de las memorias fijas al mostrar que una memoria ya consolidada puede volverse lábil y susceptible a interferencia por agentes amnésicos. La teoría de la modulación endógena de la memoria propone que sistemas moduladores extrínsecos a los procesos de memoria actuarían sobre estos determinando el almacenamiento de la información. La administración de un estresor leve o de una bebida con alta concentración de azúcar permitió facilitar una memoria declarativa (una lista de 5 pares de sílaba clave-sílaba respuesta) luego de que esta fuera olvidada, durante la fase de reconsolidación. Puesto que ni el recordatorio ni los estímulos facilitadores empleados implican un re-entrenamiento de los sujetos, se descarta que el olvido se haya producido como consecuencia de la pérdida de la información. Controles específicos del proceso de reconsolidación permitieron probar que el acceso a la información olvidada es necesario para que el efecto facilitador ocurra, lo que descarta la falta de acceso a la información como un mecanismo para el olvido. Se propone un modelo alternativo a la clásica dicotomía "almacenamiento/acceso" para explicar este fenómeno. Abstract: The rediscovery of memory reconsolidation challenged the classical concept of fixed memories by showing that a consolidated memory can become labile again and susceptible to interference by amnesic agents. The theory of endogenous modulation of memory proposes that extrinsic modulatory systems would act on memory systems, determining the storage of information. The administration of a mild stressor or a sweet drink can enhance declarative memory (association between five cue-syllables and their respective responsesyllables) during reconsolidation, after forgetting had occurred. Since neither the reminder nor the facilitatory stimuli used involve retraining of the subjects, it is discarded that forgetting is the result of a loss of information. Specific controls over the reconsolidation process allowed proving that access to forgotten information is necessary for the occurrence of the facilitatory effect. That discards a deficit in access to information as a mechanism of forgetting. A new model, alternative to the classical "storage/access" dichotomy, is proposed to explain this phenomenon.
Cita tipo APA: Coccoz, Verónica . (2014-11-28). Estudio de la modulación de la fase de reconsolidación de la memoria declarativa en humanos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5639_Coccoz.pdf Cita tipo Chicago: Coccoz, Verónica. "Estudio de la modulación de la fase de reconsolidación de la memoria declarativa en humanos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5639_Coccoz.pdf |
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Fassolari, Marisol. "Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal: integración mecanística y estructural" (2014-11-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El reconocimiento de antígenos por medio de anticuerpos es un evento fundamental en la respuesta inmune adaptativa. A su vez la formación de los complejos Antígeno:Anticuerpo es extensivamente utilizada como modelo de estudio de interacción proteína-proteína. En la presente tesis estudiamos el mecanismo de reconocimiento de un anticuerpo monoclonal específico, M1, por la proteína E7 del papilomavirus humano (HPV). E7 es la oncoproteína que constituye la principal actividad transformante del virus y además es paradigma de proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP). E7 se expresa constitutivamente en tejidos de carcinoma y la aparición de anticuerpos específicos ocurre con alta frecuencia en pacientes con cáncer cervical. Llevando a cabo un mapeo epitópico determinamos que el anticuerpo M1 reconoce específicamente una región inmunodominante de la proteína de HPV- 16 denominada “bisagra”, por conectar el dominio IDP N-terminal con el dominio globular Cterminal de la misma. Experimentos cinéticos mostraron que la región reconocida por M1, la cual posee dos residuos de prolina, comprende al menos dos poblaciones separadas por una alta barrera energética (~ 22 Kcal/mol). Los estudios de Resonancia Magnética Nuclear identificaron el origen de esta barrera como un evento de isomerización cis-trans de las prolinas presentes en el epítope de reconocimiento. Se determinó que el anticuerpo M1 reconoce específicamente al epítope en su conformación minoritaria (10%), que posee sus prolinas en cis, mediante el mecanismo de selección conformacional. Por lo tanto, se requiere que el 90% de las moléculas que se encuentran en configuración trans isomericen previo a la unión con el anticuerpo. La velocidad de asociación del conformero cis por M1 ( kon = 6 x 107 M-1 s-1) se encuentra entre las más rápidas para las interacciones Antígeno:Anticuerpo, a pesar de que la reacción global es extremadamente lenta (t1/2 ~ 4 min). Esto indica que la reacción de asociación se encuentra limitada por un evento de isomerización de prolina. Utilizando mutantes puntuales demostramos que la P41 en su conformación cis es la requerida para la unión con el anticuerpo. Luego del evento lento de pre-equilibrio y de la unión con M1, ocurre un evento de rearreglo unimolecular, formándose finalmente un complejo consolidado de alta afinidad (KD 120 nM). Nuestros resultados sugieren que la presentación de este epítope viral por las células presentadoras de antígeno tiene que haber estado en su configuración minoritaria cis, al generar el clon que produce el anticuerpo específico. Finalmente, mostramos la importancia de los determinantes estructurales presentes en regiones desordenadas en el reconocimiento entre macromoléculas. Dado que numerosas proteínas virales son multifuncionales debido a su naturaleza IDP, los resultados presentados en esta tesis sientan la bases para el análisis del mecanismo de reconocimiento por medio de anticuerpos de epítopes virales intrínsecamente desordenados. Abstract: Recognition of antigens by antibodies is a critical event in the adaptive immune response. Furthermore, the Antigen:Antibody complex is extensively used as a model of protein-protein interactions. In the present thesis, we present a detailed mechanistic study of the interaction between a specific monoclonal antibody, M1, with the E7 oncoprotein of human papillomavirus. E7 is the main transforming factor of this virus and also emerges as a paradigmatic example of an intrinsically disordered protein or IDP. E7 is constitutively expressed at high levels in carcinoma tissues and antibodies are frequently raised in patients with cervical cancer. Epitope mapping studies reveal that the M1 antibody specifically recognizes an immunodominant region of the HPV-16 E7 protein called "hinge", located between the IDP N-terminal and the globular C-terminal domains of the protein. Kinetic experiments show that this hinge, which has two proline residues, has at least two populations separated by a high energy barrier (~ 22 kcal / mol). Nuclear magnetic resonance traced the origin of this barrier to a very slow trans/cis prolyl isomerization event present in E7 epitope. The less populated (10%) cis isomer is the binding-competent species. Thus, the 90% of the molecules in the trans configuration require isomerization before binding. The association rate for the cis isomer approaches 6x107 M-1s-1, a ceiling for antigen-antibody interactions, although the overall reaction is extremely slow (t1/2 ~ 4 min). Therefore, the E7 epitope:M1 antibody complex formation is limited by a proline isomerization event. Mutagenesis experiments showed that Pro 41 in the epitope was required for both binding and isomerization. After the slow pre-equilibrium event and M1 binding, a post-binding unimolecular event occurs and a consolidated complex with a KD = 1.2!10-7 M is reached. Our results suggest that presentation of this viral epitope by the antigen presenting cells would have to be “locked” in the cis conformation in opposition to the most populated trans isomer in order to select the specific antibody clone. Finally, we show the importance of the structural determinants within disordered regions in the recognition mechanism between macromolecules. Many viral proteins are multifunctional due to its IDP nature. Therefore, the results presented in this thesis establish the basis for the analysis of the recognition mechanism by antibodies of intrinsically disordered viral epitopes.
Cita tipo APA: Fassolari, Marisol . (2014-11-27). Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal: integración mecanística y estructural. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5629_Fassolari.pdf Cita tipo Chicago: Fassolari, Marisol. "Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal: integración mecanística y estructural". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5629_Fassolari.pdf |
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Mizrahi, Michel Jonathan. "Algoritmos y complejidad para algunos problemas de dominación" (2014-11-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los problemas de dominación forman un área de investigación en crecimiento, debido a la cantidad de aplicaciones que pueden modelar, entre las cuales podemos nombrar redes sociales, sistemas distribuidos, redes biológicas, problemas de localización de instalaciones, etc. En esta tesis estudiamos los siguientes problemas de dominación (i) el conjunto dominante mínimo, (ii) dominación romana, (iii) dominación eficiente por vértices, (iv) dominación eficiente por aristas (también conocida como matching inducido dominante), (v) dominación perfecta por vértices (vi) dominación perfecta por aristas, y (vii) subgrafo cordal máximo inducido sin vertices propiamente dominados (también conocido como eliminación de vértices para formar clusters). Para el problema (i) determinamos su complejidad para clases de grafos donde se prohiben subgrafos inducidos con a lo sumo cuatro vértices. Estudiamos los problemas (i) y (ii) para varias subclases de grafos P5-free, dando algoritmos eficientes, robustos y simples en ambos casos. Algoritmos de complejidad lineal para grafos arco-circulares fueron presentados para los problemas (iv), (v), (vi) usando algoritmos existentes para el problema (iii). Damos tres algoritmos de tiempo exponencial para resolver el problema (iv) en grafos generales. Además, para el problema (iv), presentamos algoritmos de complejidad O(n) restringidos a grafos cordales, dualmente-cordales, biconvexos, y claw-free. Estudiamos cuatro variantes del problema (vii) y presentamos algoritmos eficientes para todos ellos cuando nos restringimos a grafos de intervalos propios, grafos de intervalos, grafos arco-circulares, grafos de permutación, y grafos trapezoide. Por otro lado, probamos que las cuatro variantes son NP-Dificil para grafos bipartitos. Finalmente, mostramos que dos variantes son NP-Dificil para grafos split, mientras que las otras dos variantes se pueden resolver en tiempo polinomial. Abstract: Domination is a growing research area in graph theory, with a vast number of applications across different disciplines, which include social networks, distributed computing, biological networks, facility location problems, etc. In this thesis we studied the following domination problems (i) minimum dominating set problem (ii) Roman domination (iii) efficient vertex domination (iv) efficient edge domination (also known as dominating induced matching or DIM) (v) perfect vertex domination (vi) perfect edge domination (vii) maximum induced chordal subgraph without properly dominated vertices (also known as cluster vertex deletion). For problem (i) we determined its complexity for graph classes defined by forbidding as induced subgraphs all graphs with at most four vertices. We studied problems (i) and (ii) for some subclasses of P5-free graphs, giving efficient, robust and simple algorithms for both of them. Linear time algorithms restricted to circular-arc graphs were presented for problems (iv), (v), (vi) using existent linear algorithms from problem (iii). We described three exact exponential time algorithms solving problem (iv) for general graphs. Also, for problem (iv), O(n) time algorithms were given restricted to chordal, dually-chordal, bi-convex and claw-free graphs. We studied four variants of problem (vii) and presented efficient algorithms for all variants whenever the graphs were proper-interval graphs, interval graphs, circular-arc graphs, permutation graphs and trapezoid graphs. On the other hand we proved that the four variants are NP-Hard for bipartite graphs. Finally we showed that two of the variants are NP-Hard for split graphs while the other two variants are polynomially solvable.
Cita tipo APA: Mizrahi, Michel Jonathan . (2014-11-21). Algoritmos y complejidad para algunos problemas de dominación. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5627_Mizrahi.pdf Cita tipo Chicago: Mizrahi, Michel Jonathan. "Algoritmos y complejidad para algunos problemas de dominación". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5627_Mizrahi.pdf |
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Mobbili, Marcos. "Residuos hidrofóbicos en clusters polares. Deflexión eléctrica de cresol (NH3)n(H2O)m" (2014-11-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de esta tesis es estudiar, a escala molecular, la interacción de una molécula modelo con un número peque˜no y controlado de moléculas de solvente capaces de formar uniones H. Se ha elegido como prueba a la molécula de cresol, ya que es capaz de participar en la red de uniones H, y al mismo tiempo posee una región hidrofóbica (anillo aromático y grupo metilo) cuya interacción se desea investigar. Los sistemas elegidos para tal fin son clusters binarios formados por una molécula de p-cresol u o-cresol embebida en un número peque˜no (entre 1 y 8) de moléculas de agua y/o amoníaco. También se evalúa la existencia de procesos reactivos, como la tranferencia de carga del soluto al solvente a escala molecular, en función de la cantidad de moléculas de solvente presentes en el cluster. La técnica experimental utilizada fue la deflexión eléctrica en haces moleculares, asistida por diversas herramientas de cálculo como: métodos basados en el cálculo de estructura electrónica, simulaciones clásicas de dinámicas en campos eléctricos, dinámicas en campos de fuerza clásicos y dinámicas cuánticas. Los experimentos fueron realizados en diferentes condiciones, de manera de poder caracterizar a los clusters cuando son rígidos y cuando son flexibles. En esta última condición, se obtuvieron valores de susceptibilidad eléctrica de las diferentes familias de clusters en función de la cantidad de moléculas de solvente que forman el mismo. A partir de esas medidas se determinó el momento dipolar de dichas partículas. Estas propiedades nos permitieron revelar características estructurales y dinámicas del entorno de solvatación del cresol. Abstract: The goal of this thesis is to study, at a molecular level, the interaction of a model molecule with a small and controlled number of solvent molecules capables of forming H bonds. The test molecule is cresol, since it can share H bonds, and at the same time has a hydrophobic region (aromatic ring and methyl group), whose interaction we wish to investigate. The system chosen to perform the experiments are binary clusters, composed by a molecule of p-cresol or o-cresol immersed in a small number (1 to 8) of water or ammonia molecules. We also study the existence of reactive processes, like the charge transfer to solvent at the molecular scale, as a function of the amount of solvent molecules present in the cluster. The experimental technique used is the electric deflection in molecular beams, together with several computational calculations, such as: methods based in the calculation of electronic structure, molecular mechanics in electric fields, molecular mechanics in classic force fileds and quantum dynamics. The experiments were performed in several different conditions, as a mean to characterize the clusters when they are rigid and when they are flexible. In this latter case, we obtained electric susceptibility values for the different clusters families as a function of the solvent molecules. From these measurements, we determined the dipole moment of the particles. These properties allowed us to reveal structural and dynamical characteristics for the solvation environment of the cresol.
Cita tipo APA: Mobbili, Marcos . (2014-11-17). Residuos hidrofóbicos en clusters polares. Deflexión eléctrica de cresol (NH3)n(H2O)m. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5640_Mobbili.pdf Cita tipo Chicago: Mobbili, Marcos. "Residuos hidrofóbicos en clusters polares. Deflexión eléctrica de cresol (NH3)n(H2O)m". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5640_Mobbili.pdf |
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Andreone, Luz. "Nuevos aspectos de la regulación endocrina y paracrina de la producción gonadal de inhibinas y activina A" (2014-11-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las inhibinas y activinas, son glicoproteínas diméricas formadas por subunidades α y β. Las inhibinas, producidas en las células de la granulosa en el ovario y en las células de Sertoli (CS) en el testículo, han sido aisladas por su capacidad de inhibir selectivamente la producción de la hormona folículo estimulante (FSH) en el gonadotropo. Las activinas, potentes estimuladores de la síntesis y secreción de FSH, actúan además como factores de crecimiento en distintos tipos celulares. Ambos factores resultan esenciales en la regulación del eje hipotálamo-hipófiso- gonadal. El presente trabajo de Tesis tuvo como objetivo esclarecer, utilizando diferentes modelos experimentales, nuevos mecanismos de regulación involucrados en la expresión de las subunidades de inhibina/activina (α, βA y βB) y la producción de inhibinas y activina A en células ováricas y testiculares. Los resultados obtenidos en cultivos de folículos antrales tempranos de rata, evidenciaron la importancia de la interacción de los distintos tipos celulares para mantener el predominio de la inhibina B en los primeros estadios del desarrollo folicular. Asimismo, permitieron describir el efecto modulador diferencial del entorno esteroideo intrafolicular y su interacción con la FSH sobre la producción de inhibinas y activina A. Un hallazgo particularmente original fue la acción regulatoria del 25-hidroxicolesterol sobre la expresión de estos péptidos. Los estudios realizados en cultivos de CS de rata demostraron que la acción de FSH y de factores paracrinos sobre la producción de inhibinas y activina A varía de acuerdo al grado de maduración de la gonada. En la CS inmadura, factores provenientes de las células peritubulares tendrían un papel importante en el sostenimiento de la alta producción de inhibina B característica de esta etapa del desarrollo. En las CS en estadios avanzados de maduración, la FSH, en forma conjunta con factores provenientes de las células germinales, constituiría el estímulo más relevante para estimular la producción de inhibina B. La FSH se sintetiza y secreta como una familia de variantes de glicosilación, las cuales difieren en la composición de sus oligosacáridos y en la capacidad de inducción de respuestas biológicas. Los estudios in vitro realizados en CS en estadios avanzados de maduración demostraron que el grado de sialilación y complejidad de los oligosacáridos presentes en la FSH sería un factor regulatorio adicional de la producción de inhibinas en la gonada masculina. Finalmente, la incapacidad de producir inhibina B in vivo observada en un paciente con un desorden del desarrollo sexual, impulsó el estudio de factores inhibitorios de la producción de inhibinas en cultivos de túbulos seminíferos humanos y CS de rata. Los resultados obtenidos en el presente trabajo de Tesis contribuyen a esclarecer los mecanismos de regulación de la producción de inhibinas y activina A en la gonada y confirman el valor de estos péptidos como marcadores de la función ovárica y testicular. Abstract: Inhibins and activins are structurally related dimeric glycoproteins composed of α and/or β subunits. Inhibins, produced by granulosa cells in the ovaries and in Sertoli cells (SC) in the testes, were isolated on the basis of their capacity to specifically suppress follicle stimulating hormone (FSH) secretion by the gonadotropes. Activins are potent stimulators of FSH synthesis and secretion and they act as growth factors on different cell types. Both peptides are essential for the modulation of the hypothalamic–pituitary–gonadal axis function. The present study was aimed at elucidating, using different in vitro experimental models, new regulatory mechanisms involved in inhibin/activin subunit (α, βA y βB) expression as well as inhibins and activin A production in ovarian and testicular cells. The results obtained in cultured rat early antral follicles, revealed the importance of the interaction among different types of follicular cells to sustain the predominance of inhibin B at early stages of follicular development. Furthermore, the results showed that the complex interplay between FSH and the steroid follicular microenvironment differentially modulate the gene expression of inhibin/activin subunits, their assembly and secretion. In addition, a novel modulatory action of 25-hydroxycholesterol on inhibin/activin follicular expression was described. The studies carried on using rat SC cultures demonstrated that the action of FSH and paracrine factors on inhibin and activina A production varies according to the stage of gonadal maturation. Factors produced by peritubular cells might have an important role in sustaining the high production of inhibin B in the immature SC. At later stages of SC maturation, FSH and factors derived from germ cells, constitute the most relevant stimulus for modulating inhibin B production. FSH is synthesized and secreted as a family of glycosylation variants, which differ in their oligosaccharide composition and in their ability to induce biological responses. The in vitro studies performed in SC at more advanced stages of maturation demonstrated that the sialylation degree as well as the complexity of oligosaccharides present in the FSH molecule should be considered as additional factors in the modulation of inhibin production in the pubertal male gonad. In the last section of this study, the incapacity to produce inhibin B in vivo, observed in a patient with a disorder of sex development, led us to study inhibitory factors of inhibin production in cultured human seminiferous tubules and rat SC. The results obtained herein contribute to deepen the knowledge of the regulatory mechanisms underlying inhibins and activin A production, confirming their usefulness as peripheral markers of ovarian and testicular function from birth to adulthood.
Cita tipo APA: Andreone, Luz . (2014-11-11). Nuevos aspectos de la regulación endocrina y paracrina de la producción gonadal de inhibinas y activina A. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5646_Andreone.pdf Cita tipo Chicago: Andreone, Luz. "Nuevos aspectos de la regulación endocrina y paracrina de la producción gonadal de inhibinas y activina A". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-11-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5646_Andreone.pdf |
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Fernández Bell Fano, Pablo. "Infección persistente del virus Junín in vitro: perturbación del equilibrio virus-célula como estrategia de estudio del mecanismo involucrado en este tipo de infecciones" (2014-10-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El virus Junín (JUNV), agente etiológico de la fiebre hemorrágica argentina, pertenece a la familia Arenaviridae. Los virus pertenecientes a esta familia son capaces de causar infecciones persistentes en roedores, los cuales actúan como reservorios naturales, asegurándose así su evolución y perpetuación en la naturaleza. Asimismo, son capaces de multiplicar en una amplia variedad de cultivos celulares pudiendo desarrollar el estadio de persistencia en la mayoría de ellos. El objetivo de este trabajo fue determinar las diferencias existentes entre infecciones agudas y persistentes en cultivos de células Vero frente a tratamientos que tienden a desestabilizar el equilibrio virus célula. A tal fin, mediante la infección experimental de células Vero con la cepa XJCl3, se obtuvo una línea celular persistentemente infectada con dicho virus, denominada V3, que se utilizó como modelo de estudio. En los ensayos realizados con el agente mutagénico 5-fluoruracilo (5-FU) se observó que la susceptibilidad a la inhibición ejercida por esta droga sobre JUNV dependió del lapso transcurrido entre el momento de la infección y el tratamiento, y de la m.o.i. utilizada sugiriendo que la proporción de células infectadas al momento de tratar definía la resistencia a la droga. En este sentido, las células V3 resultaron menos afectadas por el 5-FU en comparación con las células infectadas y tratadas durante la etapa aguda. Por otro lado, el análisis del ciclo celular de células Vero mostró que la infección con JUNV generó alteraciones en la respuesta del cultivo frente a estímulos como la confluencia de las células de la monocapa y el tratamiento con agentes inductores de arresto del ciclo. Durante ensayos de transfección con proteínas virales dicha alteración del ciclo fue asociada a la nucleoproteína viral N. Sin embargo, a pesar de la aparente manipulación del ciclo celular por parte del virus no se pudo asociar alteraciones inducidas del ciclo, a una disminución en el rendimiento viral. Teniendo en cuenta que los cultivos persistentemente infectados no presentan el efecto citopático (EC) típico de las infecciones agudas de este virus en células Vero, se evaluó en primer lugar la naturaleza de dicho fenómeno. El estudio de distintos indicadores de apoptosis mostró que dicho evento seguía una cinética similar a la desarrollada por el EC viral, observándose además un incremento en la expresión de p53 y en el clivaje de la caspasa 3. Cuando estos indicadores se analizaron en células V3, los valores encontrados presentaron valores similares a los de células Vero sin infectar. Por otro lado, al analizar la respuesta de los distintos cultivos frente a la inducción de apoptosis con staurosporina (STS) o luz ultravioleta (UV) los cultivos persistentemente infectados resultaron más resistentes que los cultivos infectados de forma aguda y las células sin infectar frente a la apoptosis inducida por luz UV y todos se comportaron de manera similar frente a la STS. Este comportamiento sugiere que JUNV podría estar modulando negativamente la apoptosis durante la persistencia de manera específica frente a ciertos estímulos aunque no frente a un inductor fuerte como la STS. La resistencia al estrés térmico también fue evaluada como un parámetro diferencial entre los distintos tipos de cultivos. En forma similar a lo que sucedió con el 5-FU el virus resultó más resistente al tratamiento con calor cuando éste se aplicó a tiempos de tratamiento p.i. tardíos y a mayores m.o.i.. La síntesis de HSP-70, principal efector de la respuesta celular al shock térmico, no se asoció temporalmente con la reducción de los títulos virales. De manera similar a lo observado con la respuesta al shock térmico, el tratamiento con arsenito de sodio (Ars), inductor de estrés oxidativo, resultó menos efectivo cuanto mayor era la proporción de células infectadas en los cultivos. El conjunto de resultados permite concluir que las características diferenciales presentadas por los cultivos infectados en forma persistente serían adquiridas durante el transcurso de la infección, al menos en el caso de la resistencia a los inductores de: extinción viral (5-FU), estrés térmico y oxidativo (HS y Ars) y alteraciones del ciclo. Esta estrategia estaría basada en la acumulación de suficiente cantidad de proteínas, en particular, la nucleoproteína N, a fin de controlar las respuestas a estrés, ya sea por intervención directa de dichas proteínas o a través de la modulación en la formación de gránulos de estrés citoplasmáticos y/o de cuerpos nucleares asociados a la proteína de leucemia promielocítica. Abstract: Junín virus (JUNV), the etiological agent of the Argentine Hemorrhagic Fever, belongs to the family Arenaviridae. Viruses belonging to this family are able to cause persistent infections in rodents, which act as natural reservoirs, thus ensuring their evolution and perpetuation in nature. They are also able to multiply in a wide variety of cell cultures having the capacity to develop persistence stage in most of them. The aim of this study was to determine the differences in the response of acute and persistent infection of JUNV in Vero cells to treatments that tend to disrupt the virus-cell equilibrium typical of the latter. To this end, we obtained a cell line persistently infected with the virus, called V3, through experimental infection of Vero cells with JUNV XJCl3 strain, which was used as a study model. Studies performed with the mutagenic agent 5-fluorouracil (5-FU) showed that susceptibility to inhibition exerted by this drug on JUNV depended on the time elapsed between the time of infection and treatment, and the m.o.i. used suggesting that the proportion of infected cells when treatment was applied defined the degree of drug resistance. In this sense, the V3 cells were less affected by the 5-FU compared with treated acutely infected cells. On the other hand, cell cycle profile of Vero cells infected with JUNV was different from acutely and non infected cultures when subjected to conditions of cell cycle arrest. During transfection assays with plasmids expressing viral proteins, alterations of cell cycle, similar to those observed by infection, were associated with the expression of the viral nucleocapsid N. However, despite the apparent alteration of cell cycle by the virus, no effect on viral replication could be associated with experimentally induced cell cycle alterations. Given that persistently infected cultures do not exhibit the typical cytopathic effect (CE) characteristic of acutely infected Vero cells, the nature of this phenomenon was evaluated in first place. The study of various indicators of apoptosis showed that this event followed similar kinetics as the CE that took place in infected cells, with a concomitant increase in expression of p53 and cleavage of caspase-3. By contrast, the level of these apoptotic markers was similar for V3 and non-infected Vero cells. On the other hand, the response to two apoptosis inducers, staurosporine (STS) and UV radiation revealed that persistently infected cultures showed resistance to the latter whereas acutely, persistently and non-infected cells were equally susceptible to STS. This is probably due to the fact that induction of apoptosis by UV treatment is carried out by a specific cellular pathway that might be modulated by the virus during persistence, while STS exerts its effect as a multitarget agent. The tests performed to determine the effect of HSP-70 induction on JUNV replication of the virus showed that this protein was not involved in the reduction of viral titer. Similar to the results obtained with 5-FU, the virus was more resistant at late p.i. treatment times and high m.o.i.. Both heat-shock and treatment with the oxidative stress-inducing drug sodium arsenite (Ars) were effective in reducing viral titers. Further analysis of the activity of heat shock showed that its range of action embraced 2 steps of the viral cycle: the processes leading to the budding of virions and protein translation. Heat-shock response was also evaluated as a differential parameter among the different types of infected and non-infected cell cultures. Similarly to the conclusions withdrawn with 5-FU, JUNV infections were more resistant to heat-shock when treatment was applied late during infection or when high m.o.i. were employed. Synthesis of HSP-70, main effector of heat-shock response, could not be associated to the decrease in virus titer observed in heat-shocked cultures. Also, arsenite, an oxidative stress inducer, diminished viral replication. The degree of arsenite inhibition was dependent of the proportion of infected cells in the monolayer. Altogether, the results allow to conclude that the differential characteristics between JUNV acutely and persistently infected Vero cells would be acquired during the course of infection, at least for the resistance to 5-FU, heat shock, oxidative stress and altered cell cycle. This strategy would be based on the premise of accumulation of viral proteins, particularly the nucleoprotein, in order to control cellular response to stress, either directly or by modulating stress granules formation and/or nuclear bodies associated to the promielocytic leukemia protein.
Cita tipo APA: Fernández Bell Fano, Pablo . (2014-10-31). Infección persistente del virus Junín in vitro: perturbación del equilibrio virus-célula como estrategia de estudio del mecanismo involucrado en este tipo de infecciones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5613_FernandezBellFano.pdf Cita tipo Chicago: Fernández Bell Fano, Pablo. "Infección persistente del virus Junín in vitro: perturbación del equilibrio virus-célula como estrategia de estudio del mecanismo involucrado en este tipo de infecciones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-10-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5613_FernandezBellFano.pdf |
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Español, Esteban. "Endofitos de Blepharocalyx salicifolius: diversidad y factores que modulan el ensamble de las comunidades fúngicas" (2014-10-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se conoce como endofítos fúngicos a los hongos que viven asociados a los distintos tejidos de las plantas. Estos organismos no ocasionan síntomas aparentes de infección y, en esta asociación, se reconoce o sospecha una relación mutualista entre sus integrantes. Un modelo interesante desde el punto de vista ecológico y aplicado son los endofítos No-Clavicipitaceos (tipo III). Estos son transmitidos horizontalmente y colonizan casi todos los linajes de plantas, comprendiendo una enorme riqueza específica. En este marco, este trabajo tuvo como objetivo el estudio de la diversidad de endófitos fúngicos tipo III en diferentes poblaciones de Blepharocalyx salicifolius (planta nativa) analizando la diversidad de la comunidad endofítica foliar y el posible impacto de diferentes factores sobre el ensamble. Por otro lado se llevaron a cabo diferentes análisis a fin de establecer si los endofítos fúngicos provienen de inóculos que circulan a través del corredor biológico, manteniendo el flujo genético entre las comunidades y, que la filiación de estas poblaciones puede ser detectada por el estudio poblacional mediante métodos moleculares. Se seleccionaron cuatro áreas, asociadas con el corredor biológico del Rio Paraná-Río de la Plata. Se estudiaron las comunidades fúngicas endofíticas foliares mediante: aislamiento de cepas y su posterior cultivo e identificación por métodos de análisis macro, micro morfológicos y a través de una aproximación multigénica. Se describen un total de 18 especies, solo 2 de ellas no habían sido previamente descriptas sobre este hospedante y una tercera constituye una nueva especie para la ciencia. El análisis de la composición de las distintas comunidades a través de sus índices de riqueza y diversidad, permitió reconocer que sitio con menor disturbio antropogénico presentaban mayor riqueza de organismos endófitos. Entre las cepas obtenidas, se seleccionó aquellas pertenecientes al género Colletotrichum como indicador, para el estudio de la influencia del corredor biológico sobre el ensamblaje de la comunidad fúngica, por ser el que presentó más cepas en común entre los sitios asociados al corredor. Los resultados indican la presencia de distintas especies de Colletotrichum asociadas a los diferentes sitios estudiados. Entre las conclusiones más relevantes de este trabajo se destaca que las comunidades fúngicas foliares de B. salicifolius poseen una importante riqueza de endófitos foliares que varía entre 5 y 13 especies, que los corredores biológicos no parecen tener una influencia clave en el ensamblaje de la comunidad y que el disturbio antropogénico podría ser un factor adicional a los ya considerados, modulando la comunidad endofítica foliar. Por lo expuesto, este estudio aporta datos que permiten entender alguno de los factores que determinan cómo se establecen las comunidades fúngicas en la naturaleza. Abstract: Fungal endophytes are associated with different living plant tissues. They do not present any external manifestation of their presence, and do not cause apparent symptoms of infection. This association is recognized as or suspected to be a mutualistic relationship between its members. From the ecological and applied point of view the Non-Clavicipitaceous (TypeIII) endophytes are an interesting model. They are transmitted horizontally and colonize almost all lineages of plants, comprising huge species richness. For these reasons, this study aimed to study the diversity of fungal endophytes type III on a native plant (Blepharocalyx salicifolius) analyzing the diversity of foliar endophytic community and the potential impact of different factors on the assembly. various analyzes was conducted to determine whether the fungal endophytes come from inoculums that flow through the biological corridor, maintaining a gene flow between populations, and that the relation of these populations can be detected by molecular methods. Four areas were selected related to the biological corridor of the Rio Paraná-Río de la Plata. Endophytic fungal foliar communities were studied by: isolation of strains and subsequent cultivation and identification methods of macro and micro analysis morphological and through a multigenic approximation. A total of 18 species are described, only 2 of them had been previously described on this host and one of them is a new species to science. The analysis of the composition of different communities allowed us to recognize, through richness and diversity indices, that sites with less anthropogenic disturbance had higher richness of endophytic organisms. Among the isolated organisms, the genus Colletotrichum was selected as a indicator, in order to study the influence of the biological corridor on fungal community assemblages, because this genus was one of the most common between the sites associated with the corridor. The results indicate that the presence of different species of Colletotrichum is associated with the different sites studied. The overall analysis of the results indicate that foliar endophytic fungal communities of B. salicifolius show significant richness of foliar endophytes that varies between 5 and 13 species, that biological corridors do not seem to have a key influence on the assemblage of the endophytic community and that anthropogenic disturbance could be an additional factor to those already considered, and that could modulates the foliar endophytic community. This study provides information that allows us to understand some of the factors that determine how fungal communities are established in nature.
Cita tipo APA: Español, Esteban . (2014-10-17). Endofitos de Blepharocalyx salicifolius: diversidad y factores que modulan el ensamble de las comunidades fúngicas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5614_Espanol.pdf Cita tipo Chicago: Español, Esteban. "Endofitos de Blepharocalyx salicifolius: diversidad y factores que modulan el ensamble de las comunidades fúngicas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-10-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5614_Espanol.pdf |
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Avigliano, Esteban. "Los otolitos y su aplicación en la determinación de stocks pesqueros de peces comerciales rioplatenses y de la costa Atlántica de Sudamérica" (2014-10-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En las últimas décadas, más del 25% de las pesquerías del mundo han colapsado. Las estrategias orientadas para garantizar la eficiencia en el manejo sustentable de las pesquerías se basan en la identificación de los stocks (unidad poblacional con integridad genética sobre la cual se realiza algún tipo particular de manejo). En los últimos años, la utilización de la morfometría y composición química de los otolitos (cuerpos policristalinos compuestos principalmente por carbonato de calcio alojados en el aparato vestibular) ha permitido la identificación de stocks y el estudio de las historias de vida de diferentes especies comerciales. En este sentido, el objetivo de esta tesis fue evaluar el uso de la morfometría y microquímica del otolito como una potencial herramienta para la determinación de stocks pesqueros y el estudio de la historia de vida de peces de importancia comercial del la Cuenca Baja del Plata y de la costa Atlántica de Sudamérica y Mar Caribe como el pejerrey (Odontesthes bonariensis), el bagre de mar (Genidens barbus), el pez palo (Percophis brasiliensis) y la lisa (Mugil curema). Los resultados obtenidos permitieron describir por primera vez la ruta migratoria del pejerrey utilizando la relación Sr:Ca del otolito, el cual permanece en los meses cálidos en aguas estuarinas y en los meses invernales migra hacia aguas de menor salinidad (Delta del Paraná). El uso simultáneo de la microquímica (relaciones Sr:Ca y Ba:Ca) y la morfometría del otolito de pejerrey sugirió la existencia de dos grupos de pejerrey, uno de los mismos se encontraría asociado a zonas de mayor salinidad (zona estuarina) y el otro a una región de menor salinidad (agua dulce-estuario). En el caso del bagre de mar (Genidens barbus) se analizaron las relaciones Sr:Ca, Ba:Ca y Mg:Ca por anillos de crecimiento en otolitos de esta especie procedente de Lagoa dos Patos (Brasil) y del estuario de Río de la Plata. Los resultados hallados permitieron sugerir la existencia de al menos dos zonas de cría y de dos stocks pesqueros diferentes en la región de estudio. Además, se pudo corroborar mediante el análisis de la microquímica del otolito que esta especie cambia de uso de hábitat a lo largo de su vida. En cuanto al pez palo (Percophis brasiliensis), la relación Sr:Ca no resultó un buen indicador de hábitat y no permitió distinguir entre diferentes stocks pesqueros. Sin embargo, la relación Zn:Ca permitió distinguir la presencia de dos stocks, uno correspondiente a la Zona Común de Pesca Argentina-Uruguaya y otro al área de El Rincón-Golfo San Matías, corroborando los resultados de otras metodologías de identificación de stocks aplicadas a esta especie. Por último, se estudió por primera vez la relación Sr:Ca y Ba:Ca del agua y otolitos de la lisa Mugil curema en estuarios y costas del Sudeste del Mar Caribe (estado de Nueva Esparta, Venezuela). Se encontraron diferencias significativas entre las muestras colectadas al norte y sur del estado de Nueva Esparta, sugiriendo la presencia de al menos dos stocks pesqueros de lisas. Por otro lado, con los resultados hallados se plantearon recomendaciones específicas para el manejo pesquero de estos recursos comerciales. En conclusión, los resultados de este trabajo permiten evidenciar que la morfometría y la microquímica de los otolitos son una herramienta útil para la determinación de stocks pesqueros de especies que poseen diferentes estrategias de vida, desplazándose entre ambientes con distintas características. Abstract: In the last decades more than 25% of world fisheries have collapsed. Strategies orientated on guaranteeing the efficiency of fisheries sustainable management are based on the identification of fish stocks (unit of population with genetic integrity to which some kind of particular effort is applied). In the last years, the use of morphometry and chemical composition of otoliths (policrystalline structures formed mainly of calcium carbonate located in the vestibular system) has allow the identification of fish stocks and life history of diverse commercial species. In this sense, the aim of this thesis was to evaluate the morphometry and microchemistry of the otolith as a potential tool for the determination of fish stocks and the study of life history of commercially important fish of the Cuenca Baja del Plata and the Atlantic coast of South America and Caribbean Sea, such as the silverside (Odontesthes bonariensis), the sea catfish (Genidens barbus), the brazilian flathead (Percophis brasiliensis) and the silver mullet (Mugil curema). The results obtained allowed for the first description of the migratory path of the silverside using otolith Sr:Ca ratios; this species stays during warm months in estuarine waters and in the cold season migrates towards waters with lower salinity (Delta del Parana). The simultaneous use of otolith microchemistry (Sr:Ca and Ba:Ca ratios) and morphometry suggest the existence of two groups of silverside, one associated to high salinity areas (estuarine area) and the other to a region of lower salinity (freshwater-estuarine). For sea catfish (Genidens barbus) Sr:Ca, Ba:Ca and Mg:Ca ratios were analyzed by growth rings in otoliths of fish from Lagoa dos Patos (Brazil) and Rio de la Plata estuary. Results obtained suggest the existence of at least two different breeding zones and two fish stocks in the study region. Furthermore, through the otolith microchemical analysis it could be corroborated that this species changes its habitat use during its lifetime. In regards to brazilian flathead (Percophis brasiliensis), Sr:Ca ratios were not good habitat indicators and did not allow to identify different fish stocks. However, Zn:Ca ratios allowed to differenciate two fish stocks, one from the Zona Común de Pesca Argentina-Uruguaya, and the other from the area El Rincón-Golfo San Matías, corroborating the results of other stock identification techniques applied to this species. Last, Sr:Ca and Ba:Ca ratios were studied for the first time in water and otoliths from silver mullet Mugil curema in estuaries and coasts of southeast Caribbean Sea (Nueva Esparta State, Venezuela). Significative differences were found among study areas from north and south of Nueva Sparta State, suggesting the presence of at least two silver mullet stocks. On the other hand, with all the results of this thesis, specific recommendations were proposed for the proper fish management of these commercial resourses. In conclusion, the results of this study allow demonstrating that otolith morphometry and microchemistry are a useful tool for the determination of fish stocks of species with diverse life strategies, that move among habitats with different characteristics.
Cita tipo APA: Avigliano, Esteban . (2014-10-14). Los otolitos y su aplicación en la determinación de stocks pesqueros de peces comerciales rioplatenses y de la costa Atlántica de Sudamérica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5615_Avigliano.pdf Cita tipo Chicago: Avigliano, Esteban. "Los otolitos y su aplicación en la determinación de stocks pesqueros de peces comerciales rioplatenses y de la costa Atlántica de Sudamérica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-10-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5615_Avigliano.pdf |
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Sepúlveda Díaz, Mónica Leonor. "Estudio comparativo de la variabilidad del potencial toxicogénico de cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo, cebada y maíz cultivados en Argentina" (2014-09-24). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El complejo de la especie Fusarium graminearum (FGSC) infecta el trigo, cebada, maíz y otros cultivos de cereales en todo el mundo, causando enfermedades como la Fusariosis de la espiga (FHB) y Pudrición de la mazorca (GER). Estas enfermedades reducen significativamente el rendimiento de grano y su calidad. Además, ocasionan problemas de seguridad alimentaria porque el grano infectado suele estar contaminado con micotoxinas que inhiben la síntesis de proteínas y producir complicaciones de salud en los seres humanos y animales. Se obtuvieron aislamientos de F. graminearum sembrando granos de trigo, cebada y maíz desinfectados superficialmente en medio Dicloran Cloranfenicol Malta Agar (DCMA), incubado a 25°C de 3 a 5 días. Para su identificación los aislamientos fueron sembrados en medio Spezieller Nährstoffarmer Agar (SNA), incubado a 25°C de 5 a 6 días. Las toxinas se extrajeron con una mezcla de acetonitrilo:acetato de etilo:agua (50:41:9, v/v) realizándose el clean-up en una columna con carbón activado:alúmina neutra:celite. La detección de tricotecenos se realizó por CG con detector de captura de electrones (ECD), previa derivatización con anhídrido trifluoroacético. Además los tricotecenos fueron confirmados por CG-MS. Todos los aislamientos estudiados produjeron al menos una sola toxina y la mayoría de ellos produjeron dos o más. NIV fue la toxina producida en menor cantidad y por un menor número de aislamientos. Casi la totalidad de los aislamientos produjeron 15-ADON en mayor cantidad que NIV, pero en menor proporción que 3-ADON y DON. Una gran proporción de aislamientos fue capaz de sintetizar 3-ADON en cantidades mucho mayores que las de las otras toxinas. Los aislamientos de maíz fueron los que produjeron los máximos valores de DON (290 μg/g) y 3-ADON (9218 μg/g). Los perfiles de producción de toxinas variaron según el sustrato de aislamiento. En trigo fue ampliamente dominante el perfil DON 3- y 15-ADON (89%) seguido por DON 3-ADON (8%) y DON 15-ADON (1,33%). En cebada los perfiles dominantes fueron los mismos que para trigo, pero con diferencias en las proporciones de incidencia DON 3- y 15-ADON (47%) y DON 3-ADON (33%). No se encontró el perfil DON 15-ADON en cebada. En maíz el perfil de mayor incidencia fue DON 3-ADON (36%) seguido por DON 3- y 15-ADON (30%). El perfil DON 15-ADON estuvo presente en maíz en un número mayor de aislamientos (10%) que en trigo y en cebada. Los perfiles que incluyen NIV se encontraron en cebada (NIV DON 3- y 15-ADON) y en maíz (NIV DON 15-ADON). Los perfiles NIV DON 3-ADON, NIV 3- y 15-ADON, NIV 15-ADON, 3- y 15-ADON, 3- ADON, DON presentaron una incidencia baja (menor al 6%). En todas las muestras se encontró 3-ADON en altas cantidades, seguido por DON. La mayor acumulación de toxina se produjo en las muestras de trigo. NIV y 15-ADON estaban presentes en menor cantidad. En todos los casos 15-ADON fue encontrado en valores mucho más bajos que 3-ADON. El monitoreo de las cosechas y el estudio de la influencia de los factores climáticos permitirá predecir el riesgo micotoxicológico al que están expuestos los cultivos. Abstract: The Fusarium graminearum species complex (FGSC) infects wheat, barley, maize and other cereal crops worldwide, causing diseases such as Fusarium head blight (FHB) and ear rot (GER). These diseases significantly reduce grain yield and quality. Moreover, they cause food safety problems because the infected grains are often contaminated with mycotoxins that inhibit protein synthesis and cause in human and animal diseases complications. F. graminearum isolates were obtained from wheat, barley and maize grains superficially disinfected, directly planted on Dicloran Chloramphenicol Malt Agar (DCMA), and incubated at 25°C for 3 to 5 days. For identification, the isolates were grown in medium Spezieller Nährstoffarmer Agar (SNA) and incubated at 25°C for 5-6 days. Toxins were extracted with acetonitrile:ethyl acetate:water (50:41:9, v/v) performing the clean-up in a column with activated charcoal:neutral alumina:celite. Detection of trichothecenes was performed by GC with electron capture detector (ECD) after derivatization with trifluoroacetic anhydride. Furthermore trichothecenes were confirmed by GC-MS. All isolates were able to synthesize at least one toxin and most of them two or more. NIV was the toxin produced in a lower proportion and by few isolates. Almost all of the isolates produced 15-ADON in greater proportion than NIV, but to a lesser extent than 3-ADON and DON. A high proportion of isolates were able to synthesize 3- ADON in much larger amounts than of the other toxins. Corn isolates were which accumulated the maximum values of DON (290 μg/g) and 3-ADON (9218 μg/g). The toxin production profiles varied with the isolation substrate. In wheat the DON 3- and 15-ADON (89%) was prevalent, followed by the DON 3-ADON (8%) and DON 15-ADON (1,33%) profiles. In barley the dominant profiles were the same as for wheat, but with differences in the incidence rates, DON 3- and 15-ADON (47%) and DON 3-ADON (33%). No profile DON 15-ADON was found in barley. In maize the profile of highest incidence was DON 3-ADON (36%) followed by DON 3- and 15- ADON (30%). The profile DON 15-ADON was present in corn (10%) in a greater proportion than in wheat and barley isolates. Profiles including NIV were found in barley (NIV DON 3- and 15-ADON) and maize (NIV DON 15-ADON). Profiles NIV DON 3-ADON, NIV 3- and 15-ADON, NIV 15-ADON, 3- and 15-ADON, 3-ADON, DON showed a low incidence (less than 6%). In all samples 3-ADON was found in high amounts, followed by DON. The greatest accumulation of toxin occurred in wheat samples. NIV and 15-ADON were present in smaller amounts. In all cases, 15-ADON was found at much lower values than 3- ADON. Crop monitoring and studies of the influence of climatic factors will predict the mycotoxicological risk at what crops are exposed.
Cita tipo APA: Sepúlveda Díaz, Mónica Leonor . (2014-09-24). Estudio comparativo de la variabilidad del potencial toxicogénico de cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo, cebada y maíz cultivados en Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5610_SepulvedaDiaz.pdf Cita tipo Chicago: Sepúlveda Díaz, Mónica Leonor. "Estudio comparativo de la variabilidad del potencial toxicogénico de cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo, cebada y maíz cultivados en Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5610_SepulvedaDiaz.pdf |
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Taboas, Melisa. "Estudio de mutaciones noveles como causa de la deficiencia de 21-hidroxilasa" (2014-09-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Con el nombre de Hiperplasia Suprarrenal Congénita (HSC) se conoce a un conjunto de enfermedades autosómicas recesivas en las que se encuentra afectada la esteroidogénesis adrenal. En el 95% de los casos, la HSC se produce por deficiencia de la enzima 21- hidroxilasa. Esta deficiencia puede manifestarse en forma severa o clásica (FC), o leve o no clásica (FNC). La enzima está codificada por el gen CYP21A2, que se encuentra duplicado y repetido en tándem junto a un pseudogen CYP21A1P con el que comparte 98% de identidad de secuencia. La elevada identidad de secuencia produce que la región sea propensa al alineamiento incorrecto y a la recombinación desigual, como así también a la transferencia de secuencias del pseudogen al gen mediante el mecanismo de conversión génica. La mayor parte de los afectados son compuesto heterocigotas ya que poseen diferentes mutaciones en cada uno de sus alelos. En estos casos, la manifestación clínica de la enfermedad será aquella que se relaciona con el alelo con mayor actividad enzimática. Si bien la mayor parte de los pacientes presentan mutaciones derivadas del pseudogen, hasta la fecha se identificaron más de 240 mutaciones diferentes como causales de la patología. En un trabajo previo de nuestro laboratorio se analizó la presencia de las 10 mutaciones más frecuentes derivadas del pseudogén en pacientes con deficiencia de 21-hidoxilasa de nuestra población. En esta tesis se estudió por secuenciación todo el gen CYP21A2 y su región promotora en muestras de ADN de 87 pacientes (15 FC y 72 FNC) en los cuales restaba determinar el defecto causante de la patología en uno o en ambos alelos del gen. Nuestro análisis reveló la presencia de 12 mutaciones poco frecuentes ya descriptas previamente y 7 mutaciones noveles, 6 en la región codificante y 1 en un sitio aceptor de splicing en el intrón 5. Para todas las mutaciones noveles halladas se analizaron 50 individuos de la población general mediante amplificación de la región de interés y cortes con enzimas de restricción y en ningún caso se halló la presencia de las mismas. Se hallaron asimismo, variantes de secuencias no descriptas previamente en regiones promotoras e intrónicas que se clasificaron como polimorfismos ya sea porque las mismas se observaron también en individuos de la población general, o bien porque no se encuentran en sitios que a priori pudieran afectar el splicing, respectivamente.A los efectos de analizar la implicancia biológica de las mutaciones noveles halladas, se realizaron aproximaciones bioinformáticas y ensayos funcionales. Dado que la proteína CYP21A2 humana no está cristalizada, la misma se modeló mediante herramientas in silico a partir de 18 cristalografías de otras proteínas de la familia CYP. Una vez obtenido el modelo, se analizó la estabilidad de las mutantes aminoacídicas halladas que no generaban corrimiento del marco de lectura. Las predicciones indicaron cambios en la estabilidad y/o carga de la superficie de la proteína que sugerirían un posible efecto deletéreo de las mismas. Para los ensayos funcionales, se realizaron mutagénesis dirigidas sobre un vector que contiene al ADNc de CYP21A2, transfección en células COS-7 y estimación de la expresión de la proteína y de su actividad mediante Western Blot y cromatografía en placa delgada (TLC), respectivamente. En todos los casos, las mutantes presentaron una actividad enzimática residual (AER) entre el 15 y el 50%, que se corresponderían con alelos relacionados a la FNC de la patología. En uno de los pacientes, una de las mutaciones noveles se encontraba en el mismo alelo con otra descripta previamente. Los ensayos funcionales demostraron que si bien las mismas en forma aislada son leves, la presencia de ambas en cis predice un alelo severo con una AER cercana al 2%. Para algunas de las mutaciones puntuales y para la doble mutante se observó una disminución en la cantidad de proteína resultante. Para la mutación en el sitio aceptor de splicing en el intrón 5, los análisis bioinformáticos predijeron la anulación del sitio canónico y la presencia de 2 sitios crípticos de splicing, uno en la mitad del intrón 5 y otro en el exón 6. Para evaluar la eficiencia de splicing in vitro, los estudios funcionales consistieron en la construcción de un minigén mediante amplificación de un fragmento entre el exón 4 y el exón 7 del gen, posterior clonado en un vector de expresión, transfección en células HeLa, HEK-293 e Y-1 y valoración del ARNm obtenido por RTPCR. Los ensayos revelaron que la mutante presentaba un ARNm más corto que la salvaje producto de una deleción de 16 nucleótidos debido a la utilización del sitio críptico de splicing dentro del exón 6. Esta deleción generaría un codón de terminación prematuro que predice un alelo severo relacionado con la FC de la patología. Mediante este estudio, el genotipo se completó en 27 de los 87 pacientes (100% de los pacientes FC y 16,6% FNC). Estos resultados señalarían que es probable que el valor de 17- hidroxiprogesterona (17-OHP) post estímulo con ACTH (test que se realiza para incluir a los pacientes de la FNC), esté sobreestimando la prevalencia de la patología. A los efectos de disciminar si los valores hormonales difieren entre los pacientes FNC totalmente genotipificados y aquellos que no, se compararon los valores hormonales de 17-OHP basal y post estimulación con ACTH, así como los de Dehidroepiandrosterona-sulfato (DHEA-S), Testosterona (T) y Androstenediona (A) de 271 pacientes diagnosticados como FNC. Los mismos fueron agrupados de acuerdo a si poseen los 2 alelos mutados, uno o ninguno. Los resultados obtenidos indican que no hay diferencias significativas entre los grupos estudiados cuando se analizaron los valores de A, T y DHEA-S. Sin embargo, en el caso de 17-OHP basal y post ACTH, se observan diferencias significativas entre aquellos que poseen ambos alelos con mutación y los demás grupos de estudio. Asimismo, se observó que si los pacientes presentaban valores de 17-OHP post ACTH entre 10 (valor hormonal de corte para la inclusión de pacientes) y 20 ng/ml, sólo en el 23% se hallaban los 2 alelos mutados Si el valor hormonal era mayor a 20 ng/ml, el 85% posee ambos alelos con mutación. Por último, analizando los genotipos encontrados en todos los pacientes de nuestra cohorte, ya sea mediante secuenciación o mediante el estudio de las 10 mutaciónes más frecuentes, observamos que en un 97,7% de los pacientes el fenotipo se correspondía con el genotipo hallado. Las principales discordancias se hallaron en pacientes con la mutación p.I172N, ya que la misma se asoció tanto a la forma virilizante simple (VS) como a la forma perdedora de sal. Por otro lado, si bien la mutación p.R356W está altamente relacionada a la forma PS de la enfermedad, un paciente VS presentaba esta mutación en heterocigosis compuesta con otra mutación que predice una enzima sin actividad en el alelo homólogo. Asimismo, en la literatura se describe a la mutación poco frecuente p.H62L como una mutación leve y asociada a la FNC de la patología. En esta tesis, sin embargo, se refiere que la misma se relacionaría también con la forma VS de la enfermedad. Por último, la mutación poco frecuente p.R341P se asocia a la forma VS, si bien en este trabajo se describe un paciente PS que poseía esta mutación en heterocigosis compuesta con la mutación c.283-13A/C>G en el otro alelo. Abstract: Congenital Adrenal Hyperplasia (CAH) is an autosomal recessive disease caused, in 95 % of cases, by the deficiency of the 21–hydroxylase enzyme. This disorder, which is the most frequent inborn error of metabolism, has a broad spectrum of clinical forms, ranging from severe or classical, which includes the salt-wasting (SW) and simple virilising (SV) forms, to the mild late onset or non-classical form of CAH (NCCAH). The enzyme is encoded by the CYP21A2 gene, which is duplicated and repeated in tandem along with the CYP21A1P pseudogene with which it shares 98 % of sequence identity. The high degree of sequence identity makes this region prone to misalignment and unequal recombination, as well as the transference of sequences from the pseudogene to the gene by gene conversion. Although most of the patients presented pseudogene derived mutations, approximately 240 mutations haven been described up to date. In this work, DNA from 87 patients (15 CCAH and 72 NCCAH) was analyzed by complete gene sequencing. In these patients the determination of the defect causing the disease remained inconclusive after the study of the 10 most frequent pseudogen-derived mutations. We found 12 less frequent mutations previously described, and 7 novel ones, 6 of them in the coding region and one in an acceptor splice site in intron 5. For all the novel mutations, DNA from 50 randomly selected individuals from the general population were analyzed by PCR amplification followed by restriction enzyme assays, but none of these mutations were found. We also found novel sequence variants in in the promoter region of the gene and in introns that were classified as polymorphisms, either because they were found in individuals from the general population, or because they are placed in regions that might not affect splicing outcome, respectively. In order to study the biological consequences of the novel mutations, bioinformatic approaches and functional assays were performed. Since human CYP21A2 was not crystallized yet, the protein was modeled by means of in silico tools using 18 other CYP proteins as templates followed by the estimation of the mutant protein stability. Molecular modeling studies revealed changes in the stability and/or surface charge of the protein that could be related to the clinical manifestations found in the patients. For functional assays, site-directed mutagenesis of a vector containing the CYP21A2 cDNA were performed, followed by transfection into COS-7 cells and estimation of the protein expression by Western blotting (WB) and its activity by TLC. In all cases, the mutants showed a residual enzymatic activity (REA) lesser than 50% of the wild type protein. Accordingly, all the variants predict alleles compatible to the mild NCCAH form of the disease. In one patient, one of the novel mutations was found in the same allele with another previously described. Functional assays showed that while the mutations in isolation are mild, the presence of both mutations in cis predict a severe allele with a REA close to 2%. In the WB assays, some of the isolated mutants and the double one showed less amount of the protein in comparison with the wild type. For the novel mutation in the acceptor splcing site of intron 5, in silico analyses predicted the disruption of the canonical site. Besides, two strong putative cryptic splicing sites, one located in the intron 5 and one in exon 6 were predicted. For functional assays, splicing reporter minigenes were constructed comprising the genomic region from exon 4 to exon 7 of the CYP21A2 gene. The vector was transiently transfected into HEK-293, HeLa, Y-1 cells and splicing was assessed by RT-PCR. We demonstrate that the allele with the intron 5 mutation completely abolishes the use of the canonical splicing site. Instead, the use of the cryptic splicing acceptor site within exon 6 created an mRNA with a 16 nt deletion leading to the appearance of a premature stop codon. A severe allele related to the classical form of the disease is strongly suggested by this mutation. After our work, the genotype was completed in 27 out of 87 patients (100 % of the CCAH and 16,6% of the NCCAH). This results may indicate that the currently cut-off hormonal levels used for the diagnosis of NCCAH is overestimating the prevalence of the disease. To evaluate if hormone values differ between the NCCAH patients fully genotyped and those with at least one non-determined allele, basal and post ACTH stimulation 17-hydroxyprogesterone (17-OHP), dehydroepiandrosterone-sulfate (DHEA-S), testosterone (T) and androstenedione (A) values were compared in 271 patients diagnosed as NCCAH. Patients were grouped according to whether they had 2 mutated alleles, one or no one. Our analysis revealed no significant differences between groups when the values of A, T and DHEA-S were compared. However, basal and post ACTH 17-OHP levels were statistically different between those patients having both mutated alleles and those with one or no one. Among patients with 17-OHP post ACTH values between 10 (currently cut-off value) and 20 ng/ml, only a 23 % had 2 mutated alleles, whereas if the values were greater than 20 ng/ml, 85 % of patients had mutations in both alleles. Finally, analyzing the genotypes found in all our patients, either after sequencing or by studying the 10 most frequent mutations, we observed a 97,7% phenotype-genotype correlation, while discrepancies were found mostly associated to the p.I172N mutation. Patients having this mutation presented either with the SV form or with the SW one. In addition, while p.R356W mutation is strongly associated with the SW form of the disease, we found the mutation in one patient SV with another severe mutation in the homologous allele. On the other hand, the less frequent p.H62L is described in literature related to the mild NCCAH form. In this work, however, it is reported associated to the SV form of the disease. Finally, the less frequent SV p.R341P mutation, is herein described in a SW patient having the c.283-13A / C> G mutation in the homologous allele.
Cita tipo APA: Taboas, Melisa . (2014-09-16). Estudio de mutaciones noveles como causa de la deficiencia de 21-hidroxilasa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5617_Taboas.pdf Cita tipo Chicago: Taboas, Melisa. "Estudio de mutaciones noveles como causa de la deficiencia de 21-hidroxilasa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5617_Taboas.pdf |
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Assaneo, María Florencia. "Modelado del sistema vocal humano y su aplicación a estudios de percepción y producción de habla" (2014-09-09). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Desde el punto de vista biológico el proceso del habla puede separarse en dos etapas moduladas entre sí: la producción y la percepción. En este trabajo nos ocupamos de ambas, concentrándonos especialmente en la primera. El sistema vocal humano está formado por dos grandes bloques: las cuerdas vocales y el tracto vocal. Las cuerdas vocales constituyen la fuente acústica, determinando la entonación del discurso, mientras que el contenido fonético (los sonidos propios de la lengua) es definido por la dinámica del tracto vocal. En esta tesis presentamos un modelo completo de producción vocal, incluyendo el estudio dinámico de un modelo detallado de cuerdas vocales y su adaptación a un modelo de baja dimensión del tracto vocal. Para evaluar la calidad de la voz sintetizada con el modelo, utilizamos una combinación de test perceptuales y de resonancia magnética funcional, cuyos resultados muestran que la voz sintética es indistinguible de segmentos de voz real. Los sintetizadores basados en la física de la producción de voz permiten además el estudio de la percepción de voz controlando parámetros biológicos. En particular, en este trabajo mostramos que la identidad de la voz está codificada en términos de las dimensiones relativas entre las cuerdas vocales y el tracto vocal. Usamos este modelo de voz verificado experimentalmente para responder preguntas de la biolingüística y la biomimética. En primer lugar, investigamos el rol de la física del aparato vocal en la formación de las onomatopeyas. A pesar de considerarse palabras vinculadas directamente con la imitación, es difícil establecer qué se preserva acústicamente entre los sonidos y sus onomatopeyas. Utilizamos el modelo vocal para mostrar que las configuraciones del tracto vocal que producen los sonidos más parecidos a los originales corresponden a consonantes co-articuladas. Estos pares vocal-consonante se corresponden, además, con las sílabas más estables de las onomatopeyas en distintos idiomas, sugiriendo un mecanismo por el cual la imitación vocal permite asociar sonidos simples a estructuras de habla más complejas. Por otra parte, nos preguntamos cuál es la dimensionalidad del espacio motor que gobierna la producción de habla. Para abordar este problema diseñamos un dispositivo experimental que permite monitorear tres puntos de la cavidad oral durante el discurso. Con esta herramienta, logramos una descripción discreta para las coordenadas motoras de las vocales y consonantes oclusivas del español, mostrando además la viabilidad de controlar el modelo de producción vocal con variables anatómicas para la síntesis de voz en tiempo real a partir de los gestos anatómicos producidos durante el habla. Abstract: From a biological point of view the ability of speaking can be split in two intermodulated processes: production and perception. In this work we investigated both of them from a physical perspective, focusing on the first one. The physical process associated with the production of voice rely on the vocal anatomy, composed of two main blocks: the vocal folds and the vocal tract. The folds are the acoustic source that specify the intonation of the speech, while the phonetic content is determined by the vocal tract dynamics. In this thesis we developed a complete model of voice production, we studied the different dynamic regimes of a detailed mathematical model of the folds, and adjusted it to a low dimensional model of the tract. This model allows to synthesize voice by controlling physical parameters of the vocal system. In order to evaluate the quality of the synthetic voices, we carried out a combination of perceptual and fMRI tests, showing that synthetic voices are indistinguishable from real ones. Such an articulatory synthesizer, based on the physics processes involved in the voice production, allows to study the perceptual effects of precise variations in the anatomical parameters. We used it to show that the voice identity is encoded in the relative dimensions of the tract and the folds. Using this validated model, we addressed two specific questions. First, we investigated the role of imitation within the generation of onomatopoeias. Despite it is widely know that onomatopoeias are based on imitation, it remains unclear which are the acoustic features shared between the sounds and their onomatopoeias. Using our vocal model we show that co-articulated consonants are the sounds that best fit the original noises. This pairs of vowel-consonant also are the more stable syllables within the onomatopoeias across languages, suggesting a mechanism through which vocal imitation associates simple sounds with more complex speech structures. We also inquire about the dimension of the vocal motor space controlling the production of speech, in order to study this problem we designed an experimental device that allows monitoring 3 points of the upper vocal tract while speaking. Making use of this novel tool, we reach a discrete description for the motor coordinates of Spanish vowels and occlusive consonants. This results show the plausibility to control the vocal model with direct anatomical measures, synthesizing speech in real time from simple motor gestures produced during the vocalization.
Cita tipo APA: Assaneo, María Florencia . (2014-09-09). Modelado del sistema vocal humano y su aplicación a estudios de percepción y producción de habla. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5601_Assaneo.pdf Cita tipo Chicago: Assaneo, María Florencia. "Modelado del sistema vocal humano y su aplicación a estudios de percepción y producción de habla". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-09. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5601_Assaneo.pdf |
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Sborlini, Germán Fabricio Roberto. "Comportamiento singular de las amplitudes de scattering en el límite colineal" (2014-09-03). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Actualmente los grandes aceleradores de partículas permiten obtener resultados experimentales muy certeros. Como máximo ejemplo tenemos el LHC, que recientemente descubrió una nueva partícula con propiedades compatibles con las correspondientes al bosón de Higgs. Para poder comprender mejor la naturaleza de dicha partícula, así como también otros fenómenos en el área de física de altas energías, se está realizando un gran esfuerzo para mejorar las mediciones experimentales. Es por ello que las predicciones teóricas deben tener una precisión acorde, de forma tal de poder realizar una comparación relevante entre los modelos disponibles y los datos experimentales. Trabajando desde la perspectiva teórica, la principal motivación de esta tesis fue el estudio de métodos que permitan efectuar cálculos precisos en el contexto de teoría de perturbaciones aplicada al modelo estándar. En particular, nos restringimos al análisis de los límites colineales de amplitudes de scattering en teorías de gauge a next-to-leading order (NLO). Los teoremas de factorización establecen que, en ciertas configuraciones cinemáticas generales, es posible caracterizar de forma universal el comportamiento divergente de las amplitudes de scattering en el límite colineal. Este comportamiento es regido por las llamadas splitting functions o splitting amplitudes, que son los objetos de estudio centrales en este trabajo. Cuando se consideran correcciones a órdenes superiores es necesario tener en cuenta las contribuciones que involucran estados virtuales o loops, las cuales se asocian a integrales de Feynman. Por lo tanto, en la primer parte del trabajo, se estudiaron estos objetos y se exploraron algunos métodos de cálculo. Tras comentar los procedimientos estándar, nos centramos en el estudio de las identidades de integración por partes (IBP, por sus siglas en inglés) y en el método de ecuaciones diferenciales. Esta técnica permite reescribir las integrales de Feynman en términos de ecuaciones diferenciales acopladas de primer orden. Bajo ciertas circunstancias, es sencillo determinar las condiciones de contorno y resolver el sistema, lo que nos provee de un poderosa herramienta para tratar este problema. Por otro lado, también se analizaron las integrales tensoriales y técnicas de reducción que permiten expresarlas utilizando únicamente integrales escalares. El próximo paso consistió en estudiar los límites colineales de amplitudes de scattering mediante el cálculo de las funciones de splitting a NLO. Debido a que hay ciertas singularidades al momento de considerar estos límites, es necesario complementar la teoría con un método de regularización. A su vez, la implementación concreta de un método de regularización permite definir un esquema de regularización. Usando regularización dimensional (DREG), empezamos analizando como se manifiesta la dependencia con el esquema elegido al momento de calcular las funciones de splitting en el límite doble colineal. Ello nos llevó a adentrarnos en las definiciones y convenciones de DREG, así como también a introducir partículas artificiales (esto es, los gluones escalares) para conectar los diversos esquemas usando argumentos físicos. Tras investigar el límite doble colineal, procedimos al cálculo de las funciones de splitting a NLO para el caso en el cual tres partículas se vuelven colineales. Se trata de resultados que son cruciales para llevar a cabo cálculos de secciones eficaces hadrónicas a órdenes superiores. De hecho, muchos métodos de cálculo y simuladores aprovechan las propiedades del límite colineal para dar resultados aproximados de observables de interés experimental. En concreto, en este trabajo nos limitaremos a presentar las funciones de splitting para procesos que involucren al menos la presencia de un fotón. Apelando a las técnicas de reducción tensorial estudiadas en la primer parte, se pudieron calcular los núcleos de Altarelli-Parisi polarizados, los cuales son esenciales para caracterizar el límite colineal cuando el estado intermedio es una partícula vectorial. Todos los resultados provistos en este trabajo revisten interés práctico en el contexto de la fenomenología de colisionadores hadrónicos, puesto que apuntan al fin último de mejorar la precisión de los cálculos teóricos. El conocimiento de las funciones de splitting colineal de orden superior es crucial para avanzar en la descripción de procesos multipartícula con niveles de precisión next-to-next-to-next-to-leading order (NNNLO) o incluso superior. Abstract: Singular behaviour of scattering amplitudes in the collinear limit Modern particle accelerators allow to obtain highly-accurate experimental results. As the summit example, we can consider the LHC, which recently allowed to discover a new particle whose properties are compatible with Higgs boson. In order to better understand the origin of this particle as well as many other phenomena in high-energy physics, a huge effort is being done to improve experimental measures. For this reason, theoretical predictions have to be done with a compatible accuracy level, since that is relevant to perform a comparison among available models and experimental data. Working from the theoretical point of view, the main motivation of this thesis is the study of methods to perform accurate computations in the context of perturbation theory applied to the standard model. In particular, we restrict ourselves to the analysis of the collinear limit of scattering amplitudes in gauge theories, up to next-to-leading order (NLO). The factorization theorems assert that, in some general kinematic configurations, it is possible to obtain a universal description of the divergent behaviour of scattering amplitudes in the collinear limit. This behaviour is controlled by the so-called splitting functions or splitting amplitudes, which are the main objects studied in this work. When higher-order corrections are considered, it is mandatory to take into account contributions that involve virtual states or loops, which are associated with Feynman integrals. So, in the first part of this work, this objects were studied and we explored some computational techniques. After describing standard procedures, we centered the discussion in the study of integration by parts identities (IBP) and the differential equations method. These techniques allow to rewrite Feynman integrals in terms of a coupled system of first-order differential equations. Under certain circumstances, it is easy to work out boundary conditions and to solve the system, which constitutes a powerful tool for treating this problem. On the other hand, we also studied tensor integrals and reduction techniques in order to express them using only scalar integrals. The following step was studying the collinear limit of scattering amplitudes through the computation of NLO splitting functions. Due to the existence of singularities when treating these limits, it is mandatory to complement the theory with a regularization method. Moreover, the particular implementation of a regularization technique defines a scheme. Using dimensional regularization (DREG), we started with the analysis of the scheme dependence in the computation of splitting functions in the double-collinear limit. This led us to deepen into the definitions and conventions of DREG, besides of introducing some artificial particles (i.e. scalar gluons) with the objetive of connecting different schemes through physical arguments. After investigating the double-collinear limit, we treated the computation of NLO corrections to splitting functions when three particles become collinear. These results are crucial to carry on the computation of hadronic cross sections at higher orders. In fact, many computational techniques and simulators take advantage of collinear factorization properties to obtain approximations of some experimentally relevant observables. In particular, in this work we limited ourselves to calculate splitting functions for processes involving at least one photon. Applying tensorial reduction techniques analyzed in the first part, we were able to calculate polarized Altarelli-Parisi kernels, which are essential to give a complete description of the collinear limit of processes with intermediate vector particles. All the results provided in this thesis have practical applications in the context of hadron colliders phenomenology, since they point to improve theoretical accuracy. The knowledge of higher-order splitting functions is crucial in order to move forward on the description of multiparticle processes at next-to-next-to-next-to-leading order (NNNLO) or even higher accuracy.
Cita tipo APA: Sborlini, Germán Fabricio Roberto . (2014-09-03). Comportamiento singular de las amplitudes de scattering en el límite colineal. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5574_Sborlini.pdf Cita tipo Chicago: Sborlini, Germán Fabricio Roberto. "Comportamiento singular de las amplitudes de scattering en el límite colineal". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-03. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5574_Sborlini.pdf |
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Valdora, Marina Silvia. "Métodos robustos basados en transformaciones con aplicaciones al modelo lineal generalizado" (2014-09-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Esta tesis consta de 2 partes que corresponden a los Capítulos 1 y 2. En el Capítulo 1 proponemos una familia de estimadores robustos para modelos lineales generalizados. En el Capítulo 2 se introduce una familia de estimadores robustos para distribuciones dependientes de un parámetro. Los estimadores definidos en el Capítulo 1 son M-estimadores redescendientes basados en transformaciones (MT-estimadores) y, más generalmente, M-estimadores pesados basados en transformaciones (WMT-estimadores). La idea principal es usar un M-estimador después de aplicar una función estabilizadora de la varianza a las respuestas. Mostramos la consistencia y la normalidad asintótica de estos estimadores. También calculamos una cota inferior para su punto de ruptura asintótico. Un estudio de Monte Carlo muestra que estos estimadores se comparan favorablemente con otros estimadores robustos para modelos lineales generalizados con respuesta Poisson y log link. Por último, consideramos un ejemplo de datos reales y comparamos el ajuste dado por el MT-estimador con los ajustes correspondientes a otros estimadores existentes. Los estimadores definidos en el Capítulo 2 son estimadores para datos univariados basados en la transformación integral de probabilidad (MI-estimadores). Estos estimadores tienen una definición simple y son muy simples de calcular. Mostramos la consistencia y normalidad asintótica de los mismos y hallamos cotas para su punto de ruptura asintótico. Estudiamos en especial el caso de la distribución de Poisson, en el que probamos que el punto de ruptura es óptimo. Para el caso de la distribución de Poisson realizamos un estudio de Monte Carlo para comparar el desempeño de estos estimadores con el de otros estimadores robustos para datos univariados. Abstract: This thesis consists of two parts corresponding to Chapters 1 and 2. In Chapter 1 we propose a family of robust estimators for generalized linear models. In Chapter 2 we introduce a family of robust estimators for distributions that depend on a single parameter. The estimators defined in Chapter 1 are redescending M-estimators based on transformations (MT-estimators) and, more generally, weighted M-estimators based on transformations (WMT-estimators). The main idea is to use an Mestimator after applying a variance stabilizing function to the responses.We show the consistency and asymptotic normality of these estimators. We also compute a lower bound for their asymptotic breakdown point. A Monte Carlo study shows that these estimators compare favourably to other robust estimators for generalized linear models with Poisson response and log link. Finally, we consider an example of real data and compare the fit obtained using the MT-estimator to the fits corresponding to other existing estimators. The estimators defined in Chapter 2 are estimators for univariate data based on the probability integral transformation (MI-estimators). These estimators have a simple definition and are very easy to compute. We show their consistency and asymptotic normality and find bounds for their asymptotic breakdown point. We study in particular the case of the Poisson distribution, in which we prove that the breakdown point is optimum. For the case of the Poisson distribution we perform a Monte Carlo study to compare the performance of MI-estimators to that of other robust estimators for univariate data.
Cita tipo APA: Valdora, Marina Silvia . (2014-09-02). Métodos robustos basados en transformaciones con aplicaciones al modelo lineal generalizado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5575_Valdora.pdf Cita tipo Chicago: Valdora, Marina Silvia. "Métodos robustos basados en transformaciones con aplicaciones al modelo lineal generalizado". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5575_Valdora.pdf |
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Vidal, Luciano. "Convección extrema sobre Sudamérica: estructura interna, ciclos de vida e influencia de la topografía en la iniciación" (2014-09-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El conocimiento de las áreas donde se inicia y desarrolla la convección húmeda profunda es de crucial importancia para la comprensión del tiempo y clima en Sudamérica debido a que está relacionada con fenómenos de alto impacto social (inundaciones, vientos severos, granizo, tornados). El objetivo de esta tesis se centra en la caracterización de los sistemas convectivos de mesoescala con propiedades extremas que se desarrollan en la región del sudeste de Sudamérica (SESA), avanzando en la comprensión de sus ciclos de vida y las áreas de iniciación. A fin de avanzar en el conocimiento de los procesos involucrados en el disparo de la convección se analizan los rasgos más sobresalientes que pre-condicionan el entorno y se indagan posibles mecanismos en relación con la topografía. Para alcanzar dicho objetivo se utilizan datos de distintos sensores remotos (TRMM y GOES) en combinación con los reanálisis NCEP-CFSR para el período 1998-2010. Los resultados encontrados muestran que en la región tropical del continente predominan los sistemas con convección chata y de poca extensión horizontal, mientras que sobre SESA los sistemas convectivos presentan un predominio de celdas convectivas profundas, para luego desarrollar amplias regiones de precipitación estratiforme. En particular, en esta última dos regiones con topografía compleja son muy favorables para el inicio de los sistemas convectivos: las Sierras de Córdoba (CBA) y el Noroeste Argentino (NOA). Los sistemas en CBA se inician preferencialmente hacia el final del día, resultando ser más grandes (~240.000 km2 en promedio) y longevos (~22 horas en promedio), con una dirección preferencial de desplazamiento hacia el noroeste. En cambio sus pares del NOA, se inician mayormente en horas de la tarde en fase con el calentamiento radiativo y mostrando un comportamiento más estacionario, además de ser más chicos (~140.000 km2) y durar menos horas (~14 horas). La circulación y la estructura termodinámica de la atmósfera previo al desarrollo de los MCSs en el área de CBA en las primeras horas de la tarde (18Z) presenta un máximo extremo de condiciones inestables sobre la pendiente de los Andes. Estas condiciones termodinámicas ideales se combinan con una zona frontal que ayuda a la convergencia en niveles bajos cercano a la topografía por debajo de los 1000 metros promoviendo la iniciación de la convección. Los sistemas que se inician en las últimas horas del día (00Z) lo hacen en un entorno sinóptico débil donde dominan las circulaciones locales asociadas con el máximo calentamiento radiativo y el flujo hacia la topografía. En cambio, los sistemas que se inician en NOA lo hacen en un entorno dominado por un flujo anticiclónico en niveles altos (Alta Boliviana), una débil zona frontal estacionaria y un marcado flujo del noroeste en capas bajas. En esta región las circulaciones locales dominan el inicio de la convección. Abstract: Due to the high socio-economic impact of severe weather events like floods, strong winds, hail, and tornadoes the study of the areas that are most frequently affected by deep moist convection and where the convection initiation takes place is of paramount importance. The main goal of this Thesis is to characterize extreme mesoscale convective systems that develop over southeastern South America (SESA), through the analysis of their life cycle and their genesis region. In order to advance in the understanding of synoptic and mesoscale processes involved in the triggering of convection, the environment associated to the genesis of these systems is characterized. Particular attention is paid to the role of mesoscale circulations associated to the topography. This goal is achieved combining remote sensing data collected by two satellites: TRMM and GOES; with the NCEP-CFSR reanalysis for the period 1998-2010. Results show that over SESA, deep moist cells predominate during the early stages of the life of the system, while a broad stratiform structure is usually found after maturity. Most of the analyzed mesoscale convective systems originate over the eastern slopes of the Andes where two main genesis regions are identified: Sierras de Córdoba (CBA) and Northwestern Argentina (NOA). Most systems that originated in CBA, initiate around sunset, tend to last longer (~22 hours on average) and reach larger sizes (~240,000 km2 on average) than their NOA counterparts. Most systems that originated over NOA, initiate during the afternoon in phase with the radiative heating. Most of them show a stationary behavior, reach an average size of 140,000 km2 and last for 14 hours on average. Composites for several variables have been constructed to characterize the synoptic and mesoscale circulation associated with the initiation of convective systems in both regions. The pre-storm environments, corresponding to convective systems that originated in CBA in the early afternoon (18Z), are characterized by extreme convective instability over the eastern slopes of the Andes. A frontal zone helps to generate low-level convergence close to the topography thus promoting convection initiation. The systems that start near sunset (00Z) do so in a weaker synoptic environment, at this time, local circulations associated with heating over a sloping terrain enhances low level convergence, playing a fundamental role in the initiation of convection. Systems that start over NOA do so in an environment dominated by upper level anticyclonic flow (Bolivian High), a weak stationary frontal zone and a strong low-level northwesterly flow. In this region, mesoscale circulations dominate the initiation of convection.
Cita tipo APA: Vidal, Luciano . (2014-09-01). Convección extrema sobre Sudamérica: estructura interna, ciclos de vida e influencia de la topografía en la iniciación. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5573_Vidal.pdf Cita tipo Chicago: Vidal, Luciano. "Convección extrema sobre Sudamérica: estructura interna, ciclos de vida e influencia de la topografía en la iniciación". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-09-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5573_Vidal.pdf |
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Koch, Ivo Valerio. "Un enfoque algorítmico sobre algunas variantes del problema de coloreo de grafos y el problema de conjunto independiente máximo" (2014-08-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta Tesis estudiamos variantes del problema de coloreo de grafos para varias familias de grafos, y analizamos el problema del conjunto independiente máximo bajo un enfoque de generación de planos de corte. En el problema del k; i-coloreo, asignamos conjuntos de colores de cardinalidad k a los vértices de un grafo G, de manera que los conjuntos que correspondan a vértices adyacentes en G intersequen en no más de i elementos y la cantidad total de colores usados sea mínima. Esta cantidad mínima recibe el nombre de número k; i-cromático y es denotada por Xik(G). Este parámetro, que generaliza el número cromático X01(G), es tan difícil de trabajar que su valor es desconocido aún para grafos completos. Desarrollamos un algoritmo de orden lineal para el cómputo de Xik para ciclos y generalizamos este resultado a grafos cactus. Adicionalmente, estudiamos la relación entre este problema en grafos completos y un problema abierto clásico de teoría de códigos. Un b-coloreo de un grafo es un coloreo tal que cada clase color admite un vértice adyacente a por lo menos un vértice perteneciente a cada una de las demás clases color. El número b-cromático de un grafo G, denotado como Xb(G), es el máximo número t tal que G admite un b-coloreo con t colores. Describimos un algoritmo polinomial para computar el número b-cromático de la clase de los grafos P4-tidy y estudiamos para esta clase dos propiedades conocidas: la b-continuidad y la b-monotonía. Estudiamos además la versión sobre aristas del b-coloreo y su índice b-cromático asociado. Presentamos cotas para el índice b-cromático del producto directo de grafos y damos resultados generales para varios productos directos de grafos regulares. Introducimos también un modelo sencillo de programación lineal para el b-coloreo de aristas, que utilizamos para calcular resultados exactos para el producto directo de algunas clases de grafos. Finalmente, proponemos un nuevo método de generación de planos de corte para el problema del conjunto independiente máximo. El algoritmo genera desigualdades de rango y otras desigualdades válidas, y utiliza un procedimiento de lifting basado en la resolución del conjunto independiente máximo con pesos sobre un grafo de menor tamaño. Abstract: In this Thesis we study variants of the graph coloring problem for several families of graphs, and we address the stable set problem under a new cutting plane generation approach. In the k; i-coloring problem, we assign sets of colors of size k to the vertices of a graph G, so that the sets which belong to adjacent vertices of G intersect in no more than i elements and the total number of colors used is minimum. This minimum number of colors is called k; i-chromatic number and is denoted by Xik(G). This parameter, which generalizes the chromatic number X01 (G), is so difficult to deal with, that its value is unknown even for complete graphs. We develop a linear time algorithm to compute Xik for cycles and generalize the result to cacti. Further, we study the relation between this problem on complete graphs and a classic open problem in coding theory. A b-coloring of a graph is a coloring such that every color class admits a vertex adjacent to at least one vertex receiving each of the colors not assigned to it. The b-chromatic number of a graph G, denoted by Xb(G), is the maximum number t such that G admits a b-coloring with t colors. We describe a polynomial time algorithm to compute the b-chromatic number for the class of P4-tidy graphs and study this class for two known properties: the b-continuity and the b-monotonicity. We study also the edge version of the b-coloring problem and its associated b-chromatic index for the direct product of graphs and provide general results for many direct products of regular graphs. We introduce a simple linear programming model for the b-edge coloring problem, which we use for computing exact results for the direct product of some special graph classes. Finally, we propose a general procedure for generating cuts for the maximum stable set problem. The algorithm generates both rank and non-rank valid inequalities, and employs a lifting method based on the resolution of a maximum weighted stable set problem on a smaller graph.
Cita tipo APA: Koch, Ivo Valerio . (2014-08-21). Un enfoque algorítmico sobre algunas variantes del problema de coloreo de grafos y el problema de conjunto independiente máximo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5607_Koch.pdf Cita tipo Chicago: Koch, Ivo Valerio. "Un enfoque algorítmico sobre algunas variantes del problema de coloreo de grafos y el problema de conjunto independiente máximo". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5607_Koch.pdf |
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Torres Fuenzalida, José Hugo. "Biología molecular y celular de las células troncales hepáticas" (2014-08-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las células troncales se definen por su con capacidad de automantenimiento y por la potencialidad de generar tipos celulares diferenciados. El hígado posee una notable capacidad regenerativa; frente a un daño extenso o reiterado la regeneración se produce por la activación de las células troncales hepáticas. Estas células se originan durante la embriogénesis hepática y se mantienen latentes durante toda la vida adulta del individuo. La historia del estudio de las células troncales hepáticas ha estado marcada por diversas controversias en torno a su existencia, su origen e identificación. Objetivo: aislar, identificar y caracterizar células troncales hepáticas y evaluar la potencialidad de la utilización de éstas como herramienta en el tratamiento de enfermedades degenerativas del hígado. Resultados: las células troncales/progenitoras hepáticas (LSPC) de rata expresaron OC2, OC3 y Thy-1, y fueron capaces de proliferar (dando origen a las células tipo ovales) cuando se cultivaron in vitro en presencia del factor de crecimiento de hepatocitos (HGF). La expresión de EpCAM de las LSPC de ratón se utilizó como criterio de selección para su aislamiento. La subpoblación EpCAM (+) presentó (por PCR en tiempo real) una expresión significativamente superior de citoqueratina 19, Claudina3, alfa-fetoproteína y Dlk-1. La subpoblación EpCAM (+) mostró una distribución espacial característica de secuencias repetitivas pericentroméricas y un patrón homogéneo de acetilación (K14, K23) y metilación (K9) de la histona H3. Las células EpCAM (+) fueron capaces de anidar en el bazo y migrar hacia el hígado luego del trasplante intraesplénico en ratones. Conclusión: las células EpCAM (+) presentan un patrón de expresión de genes característico y una organización nuclear particular que se correlaciona con el carácter troncal que se les atribuye a las LSCP. En este trabajo se presenta un método sencillo y eficiente para aislar LSPC de ratón. Abstract: Stem cells are defined by their capacity of self-renewal and by the potential to give rise to differentiated cell types. The liver has a remarkable regenerative capacity; when the damage is extended or repeated the regeneration is carried out by the activation of the liver stem cells. These cells are originated during the hepatic embryogenesis and they stay latent during the whole life of the individual. The history of the study of liver stem cells was characterized by controversies around their existence, their origin and identification. Objective: to isolate, identify and characterize liver stem cells and to evaluate their potential use as tools for the treatment of degenerative disorders of the liver. Results: the liver stem/progenitor cells (LSPC) from rat expressed OC2, OC3 and Thy-1, and they were capable of proliferate (giving rise to oval-like cells) when they were cultured in vitro in presence of hepatocyte grow factor (HGF). The expression of EpCAM by the LSPC was used as selection criteria for the isolation. The subpopulation EpCAM (+) showed (by Real-time PCR) a significantly superior expression of citoqueratin 19, claudin3, alpha-fetoprotein and Dlk-1. The sub-population of EpCAM (+) cells presented a characteristic spatial distribution of the repetitive sequences peri-centromeric and a homogeneous pattern of acetylation (K14, K23) and methylation (K9) of the histone H3. The EpCAM (+) cells were able to home in the spleen and migrate to the liver after the intra-splenic transplant in mice. Conclusion: EpCAM (+) cells exhibit a characteristic pattern of gene expression and a distinctive nuclear organization that correlate with the stemness attributed to LSPC. In this thesis, I present a simple and efficient method to isolate mouse LSPC.
Cita tipo APA: Torres Fuenzalida, José Hugo . (2014-08-19). Biología molecular y celular de las células troncales hepáticas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5569_TorresFuenzalida.pdf Cita tipo Chicago: Torres Fuenzalida, José Hugo. "Biología molecular y celular de las células troncales hepáticas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5569_TorresFuenzalida.pdf |
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Díaz Carrasco, Juan María. "Compartimentación de variantes virales entre plasma y células mononucleares de sangre periférica en pacientes con infección crónica por virus de hepatitis C" (2014-08-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El virus de hepatitis C (VHC) afecta al 3% de la población mundial, representando una de las principales causas de hepatitis crónica y trasplante hepático. En el paciente infectado, el virus existe como un espectro de mutantes que difieren en su potencial de replicación, denominado cuasiespecie. La extensa variabilidad del VHC proporciona a la cuasiespecie una alta plasticidad fenotípica y capacidad de adaptación, que favorece el mantenimiento de la infección crónica. Si bien el principal sitio de replicación del VHC es el hígado, numerosos estudios han descripto la replicación del virus en tejidos extrahepáticos, en particular en células mononucleares de sangre periférica (CMSP) y esto se ha asociado con el desarrollo de distintas manifestaciones extrahepáticas. Se ha relacionado a distintos genes del VHC con la compartimentación en CMSP, pero aún no está claro cuáles son los factores celulares y virales requeridos para la infección de las células linfoides, por lo que la búsqueda de patrones moleculares asociados con el linfotropismo podría aportar datos valiosos para la comprensión de este fenómeno. Además, la gran mayoría de los estudios de compartimentación se han realizado en pacientes adultos y se basan únicamente en la región HVR1 de E2. El objetivo del trabajo fue evaluar la compartimentación del VHC en CMSP y su dinámica durante la infección crónica por VHC en pacientes pediátricos mediante el análisis de genes virales involucrados en distintas etapas del ciclo de replicación viral. Se evaluó la compartimentación y la existencia de patrones moleculares asociados con el linfotropismo mediante el análisis filogenético de las secuencias de tres regiones del genoma viral: IRES, E1E2 y NS5B, obtenidas a partir de muestras seriadas de plasma y CMSP de 6 niños. Se demostró estadísticamente que existe compartimentación viral en niños, principalmente en regiones discretas dentro de E1E2 que incluyen sitios de unión a receptores, lo que sugiere que el linfotropismo del VHC podría estar determinado por restricciones en la interacción de las glucoproteínas con factores celulares involucrados en el proceso de adsorción y entrada. Si bien no se evidenció un patrón molecular asociado con el linfotropismo común a todos los casos estudiados, se observó que las regiones identificadas están sujetas a presiones selectivas diferentes en plasma y CMSP y se describieron variaciones aminoacídicas asociadas con las variantes linfotrópicas. Además de contribuir al conocimiento general acerca de la compartimentación del VHC, nuestro trabajo pone de manifiesto el importante papel que juegan las CMSP como reservorios de variabilidad genética y como compartimentos de replicación extrahepática, favoreciendo la persistencia y contribuyendo al mantenimiento de la cronicidad durante la infección por VHC en niños. Abstract: Worldwide prevalence of chronic hepatitis C virus (HCV) infection is estimated at 3%, representing the major cause of chronic hepatitis and liver transplantation. Within the infected patient, the virus exists as a spectrum of mutants which differ in their replication potential, termed quasispecies. The large variability of HCV quasispecies provides high phenotypic plasticity and adaptability, which favors the maintenance of chronic infection. Although the primary site of HCV replication is the liver, numerous studies have described replication in extrahepatic tissues, particularly in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and this has been associated with the development of different extrahepatic manifestations. Several viral genes have been linked to HCV PBMCs compartmentalization, but the factors required for the infection of lymphoid cells still remain unclear, and therefore the search for molecular patterns associated with lymphotropism could provide valuable data for the understanding of this phenomenon. In addition, most studies examining compartmentalization have been conducted in adult patients and are based solely on the HVR1 region of E2. The aim of this study was to assess the compartmentalization of HCV in PBMCs and its evolution dynamics during chronic HCV infection in pediatric patients by means of the analysis of certain genes involved in different stages of the viral replication cycle. Compartmentalization and the existence of molecular patterns associated with lymphotropism were evaluated by phylogenetic analysis of the sequences of three viral genes, namely IRES, E1E2 and NS5B, which were obtained from serial samples of plasma and PBMCs of 6 children. We showed that there is statistically significant compartmentalization in children, mainly in discrete regions within E1E2 that includes receptor binding sites, suggesting that HCV lymphotropism could be influenced by restrictions in the interaction of the glycoproteins with cellular factors involved in viral attachment and entry. While a common molecular pattern associated with lymphotropism was not evident in all the studied cases, it was found that the identified regions were influenced by different selective pressures both in plasma and PBMCs. Moreover, amino acid variations associated with lymphotropic variants were described. Besides contributing to general knowledge about the compartmentalization of HCV, our work highlights the important role played by PBMCs as reservoirs of genetic variability and as compartments for extrahepatic replication, favoring persistence and contributing to the maintenance of chronicity during HCV infection in children.
Cita tipo APA: Díaz Carrasco, Juan María . (2014-08-19). Compartimentación de variantes virales entre plasma y células mononucleares de sangre periférica en pacientes con infección crónica por virus de hepatitis C. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5551_DiazCarrasco.pdf Cita tipo Chicago: Díaz Carrasco, Juan María. "Compartimentación de variantes virales entre plasma y células mononucleares de sangre periférica en pacientes con infección crónica por virus de hepatitis C". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5551_DiazCarrasco.pdf |
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Muñoz, Fernando Francisco. "Correlación entre las propiedades morfológicas, estructurales y catalíticas de soluciones sólidas nanoestructuradas de GdxCe1-xO2-x/2" (2014-08-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En la presente tesis de doctorado se llevó a cabo el estudio de soluciones sólidas nanoestructuradas de ceria dopada con gadolinia, GdxCe1-xO2-x/2 (GDC), con el objetivo principal de correlacionar las propiedades morfológicas, estructurales, óxido-reductoras y catalíticas de este tipo de compuestos. El control de estas propiedades es fundamental para su aplicación en dispositivos tecnológicos, ya sea como catalizadores para diferentes reacciones o como materiales para la generación de energía, mediante su empleo como ánodo en celdas de combustible de óxido sólido (SOFC). La síntesis de soluciones sólidas GDC se realizó mediante el empleo de diferentes métodos, especialmente aquellos que permiten un amplio control sobre la morfología de los productos finales. En particular, para la obtención de polvos nanoestructurados se utilizaron los métodos de complejación de cationes y microemulsión inversa. En el caso de nanoestructuras con morfología tubular se empleó el método de llenado de moldes poliméricos, mientras que para la obtención de esferas nanoestructuradas se usó el método de síntesis hidrotérmica asistida por microondas. Las soluciones sólidas de GDC fueron caracterizadas mediante difracción de rayos X (XRD), análisis de área superficial específica (isoterma de adsorción BET) y microscopía electrónica de barrido y transmisión (SEM y TEM). El estudio de las propiedades estructurales y físicoquímicas se realizó mediante en el empleo de técnicas de radiación sincrotrón, tales como XRD y espectroscopia de absorción de rayos X (XANES), tanto en atmósferas oxidantes como reductoras a diferentes temperaturas. En todos los casos se comprobó la formación de soluciones sólidas de Gd-Ce-O, las cuales estaban compuestas por cristalitas de tamaño nanométrico, exhibiendo la fase cúbica (estructura tipo fluorita). En particular, se reportó por primera vez la obtención de GDC nanostructurada con morfología tubular, la cual exhibió los más altos valores de área específica (100 m2.g-1) respecto de las otras morfologías. Se estudió la adición de pequeñas cantidades de Pd por distintas vías de síntesis en muestras de GDC. Las muestras obtenidas se caracterizaron con las técnicas citadas y se determinó que el Pd puede encontrarse tanto distribuido homogéneamente en la red cristalina como en forma de una fase segregada, PdO, según el método de síntesis. Mediante estudios realizados por XANES en el borde Ce-L3 en atmósferas reductoras, se mostró que la incorporación de Pd afecta notoriamente el comportamiento de la cupla Ce3+/Ce4+ de las soluciones sólidas de GDC. Finalmente, estudios de la actividad catalítica frente a la combustión de CH4 usando como catalizadores GDC puro o dopado con Pd mostraron que la adición de bajas cantidades de Pd conduce a una mayor combustión de CH4 a más bajas temperaturas. Los estudios aquí realizados mostraron que los óxidos mixtos nanoestructurados de GDC presentan propiedades que los convierten en muy buenos candidatos para ser empleados como ánodos en dispositivos SOFC. Abstract: In the present doctoral thesis work, nanostructured solid solutions of gadolinia doped ceria, GdxCe1-xO2-x/2 (GDC), were studied with the aim of correlating their morphological, structural, catalytic and redox properties. It is fundamental to control these properties, since they are strictly related to the uses of these compounds and their applications in technological devices, i.e. several applied catalytic reactions, as well as clean energy generation in the form of anodes for solid oxide fuel cells (SOFCs). GDC synthesis was carried out via different methods, especially those that allow good control over the final product morphology. Specifically, nanostructured powders were obtained by the cation complexation and reverse microemulsion methods. For tubular nanostructured morphologies, the polymeric template-filling method was employed; while nanostructured spheres were obtained by microwave assisted hydrothermal synthesis. GDC characterisation were carried out using X-ray diffraction (XRD), specific surface analysis (BET adsorption isotherm), and scanning and transmission electronic microscopy (SEM and TEM). Physico-chemical characterisation involved synchrotron radiation techniques, particularly XRD and X-ray absorption spectroscopy (XANES), taking measurements under controlled reducing or oxidizing atmospheres, as well as at controlled applied temperatures. Gd-Ce-O solid solutions were observed in all above cases, which exhibited fluorite type cubic crystalline structure, made up of nanometric size crystallites. Particularly, nanostructured GDC materials with tubular morphology, which exhibited the highest specific surface areas (100 m2.g-1) compared with the other morphologies, was reported for the first time. Small Pd additions TO GDC samples were MADE using several synthesis methods. The samples so obtained were characterized with the procedures already mentioned, and it was found that the Pd can be found not only homogeneously distributed in the crystal lattice but also as a segregated secondary PdO phase, depending on the synthesis method. Ce L3–edge XANES measurements carried out under reducing atmosphere showed that Pd noticeably affects the Ce3+/Ce4+ couple behaviour in the GDC solid solutions. Finally, catalytic studies on CH4 combustion were performed, using pure or Pd-doped GDC as catalysts. Those studies showed that small Pd additions lead to an improved CH4 combustion, that is, at lower temperatures for the total CH4 conversion than for conventional materials. The studies here performed showed that GDC nanostructured mixed oxides exhibit properties that make them suitable as candidates for anodes in SOFC devices.
Cita tipo APA: Muñoz, Fernando Francisco . (2014-08-14). Correlación entre las propiedades morfológicas, estructurales y catalíticas de soluciones sólidas nanoestructuradas de GdxCe1-xO2-x/2. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5600_Munoz.pdf Cita tipo Chicago: Muñoz, Fernando Francisco. "Correlación entre las propiedades morfológicas, estructurales y catalíticas de soluciones sólidas nanoestructuradas de GdxCe1-xO2-x/2". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5600_Munoz.pdf |
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Volonteri, María Clara. "Efecto de los esteroides testiculares y del órgano de Bidder sobre la actividad del eje hipotálamo-hipófisis-gonadal en el sapo macho Rhinella arenarum (Amphibia, Anura)" (2014-08-13). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los machos de anfibios anuros tienen variaciones estacionales en los andrógenos y los estrógenos plasmáticos, aunque poco se conoce acerca de los cambios estacionales en las gonadotrofinas. En Rhinella arenarum, los andrógenos plasmáticos disminuyen durante el período reproductivo y los estrógenos aumentan. Los objetivos de esta tesis fueron: caracterizar la histología de los órganos involucrados y analizar la localización de factores como GnRH y Kispeptinas en el eje hipotálamo-hipófisis-gonadal; caracterizar la secuencia del ADNc de LHβ y FSHβ de la hipófisis del sapo; estudiar los cambios estacionales en los dos mensajeros por RT-PCR en tiempo real, relacionando dichos cambios con la concentración de esteroides sexuales y la espermatogénesis y estudiar el rol de dichos esteroides en la regulación de las gonadotrofinas. El análisis de los marcos de lectura abiertos de los ADNc de LHβ y FSHβ indicó que las proteínas tienen, respectivamente, 113 y 104 aminoácidos. Los alineamientos múltiples de la secuencia de aminoácidos de ambas subunidades β sugieren que los tetrápodos estudiados tienen 12 cisteínas conservadas y uno (LH) y dos (FSH) sitios de N-glicosilación. LHβ de sapo es más cercana a los teleósteos que a los mamíferos y las aves mientras que FSHβ es más parecida a los mamíferos. La expresión del ARNm de LHβ y FSHβ tiene cambios estacionales, con un perfil de expresión opuesto a la concentración de andrógenos y el tratamiento con andrógenos durante el período reproductivo inhibe la expresión de ARNm LHβ. En conclusión, existe una buena correlación entre los andrógenos y estrógenos plasmáticos y la expresión de LHβ, y entre FSHβ y la espermatogénesis. Abstract: Male anuran amphibians have seasonal changes in androgens and estrogens. However, information regarding seasonal variations in gonadotropins is scarce, probably due to the lack of a suitable method for the determination. In Rhinella arenarum, plasma androgens decrease during the reproductive season while estrogens increase. The main objectives of this thesis were to characterize the histology of the brain and the pituitary gland as well as to localize the distribution of GnRH and Kisspeptins in the hypothalamus-pituitary-gonadal axis; to characterize the cDNA sequence of LHβ and FSHβ from toad pituitary, to study seasonal variation in both mRNA by using quantitative real-time RT-PCR and to analyze the relationship between both mRNA with plasma steroids and spermatogenesis. Besides, the role of androgens and estrogens in gonadotropin regulation was studied. The open reading frames analysis of LHβ and FSHβ cDNAs indicate that mature proteins have 113 and 104 amino acids, respectively. Multiple alignments of aminoacid deduced sequences of both β subunits showed that all the tetrapods studied conserve 12 cysteins and one (LH) or two (FSH) N-Glycosylation sites. LHβ is closer to teleosts than to mammals and birds while FSHβ is closer to mammals. The analysis of seasonal changes in LHβ and FSHβ mRNA indicates that transcript levels have seasonal variations and that the profile of androgens is opposite to that of the gonadotropins mRNA. As well, androgen treatments inhibit the expression of LHβ during the reproductive season. In conclusion, there is a good correlation between plasma androgens and estrogens and the expression of LHβ, and between spermatogenesis and FSHβ.
Cita tipo APA: Volonteri, María Clara . (2014-08-13). Efecto de los esteroides testiculares y del órgano de Bidder sobre la actividad del eje hipotálamo-hipófisis-gonadal en el sapo macho Rhinella arenarum (Amphibia, Anura). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5587_Volonteri.pdf Cita tipo Chicago: Volonteri, María Clara. "Efecto de los esteroides testiculares y del órgano de Bidder sobre la actividad del eje hipotálamo-hipófisis-gonadal en el sapo macho Rhinella arenarum (Amphibia, Anura)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-13. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5587_Volonteri.pdf |
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Costa, Martín Elías. "Aportes al estudio cuantitativo del lenguaje y la comunicación animal en tres etapas: recepción, elaboración y emisión de un mensaje" (2014-08-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Este trabajo de tesis trata sobre la comunicación oral y está dividida en tres grandes subtemas. El primero de ellos comprende la conversión de ondas de presión en el tímpano (sonido) en conceptos; el segundo aborda la transición mental entre ideas y finalmente el tercero, la emisión de una vocalización. De esta manera cubrimos el recorrido completo que experimenta una señal en un hablante. Cada una de estas tres secciones es un campo en si mismo y lo que se encuentra en este trabajo son pequeños aportes a cada uno de ellos. En el área del proceso de comprensión del habla estudiamos un efecto que se conoce como Efecto de Transformación Verbal (ETV) que se produce frente a la escucha repetida de la misma palabra y mostramos que su dinámica cumple con todas las características de percepción biestable. Esto agrega al ETV a la lista de fenómenos biestables junto con las figuras ambiguas, tonos galopantes, rivalidad binocular, etc. y sugiere modificaciones a los modelos vigentes de reconocimiento de palabras. En el campo de la semántica cuantitativa, construimos un grafo semántico de co-ocurrencias (una medida estadística de la similitud entre palabras a partir de la estructura de sus ocurrencias en texto escrito) y mostramos que el proceso de asociación libre (decir la primera palabra que se nos viene a la cabeza frente a la presentaci ón de una palabra estímulo) puede ser capturado, en esencia, por un proceso difusivo anómalo dentro de dicho grafo. Finalmente, estudiamos la emisión de vocalizaciones, no ya en humanos sino en ratas, analizando la riqueza de su comportamiento vocal con miras a establecerlas como un modelo animal de comunicación vocal. En particular, desarrollamos algoritmos de clasificación automática para sus vocalizaciones ultrasónicas y mostramos que se estructuran de manera probabilística en el tiempo. Con esto se cierra nuestro ciclo de recepción, elaboración y emisión de un mensaje. Abstract: The work presented here is a study on oral communication and is subdivided into three big areas. The first one deals with the translation of pressure waves at the eardrums (sound) into concepts in the brain; the second one explores the mental transition between thoughts and finally, the third one investigates vocal output. In this manner, we cover the whole excursion of a signal through a communicating agent. Each one of these stages represents an active and broad field of research. Here, we present our contributions to each one of those areas. In the area of spoken word recognition we study the Verbal Transformation Effect (VTE) which entails a change in the perceived word after repeated presentations. We show that the dynamics of this effect has all the characteristics of bistable perception. This appends the VTE to the list of bistable percepts (together with ambiguous figures, galloping tones, binocular rivalry, etc) and suggests corrections to current models of spoken word recognition. In the field of quantitative semantics, we constructed a semantic graph of word co-occurrence (a statistical measure of similarity between words based on the structure of occurrences in written text) and showed that the process of free association (i.e saying first thing that comes to mind upon the presentation of a stimulus word) can be understood as an anomalous diffusion process in the mentioned graph. Finally, we study the production of vocalizations, not in humans but in the rat. We analyze the richness of their vocal behavior in an attempt to establish them as an animal model for vocal communication. In particular, we developed algorithms for automatic classification of ultrasonic vocalizations and showed that they are probabilistically structured in time. This closes the communication loop: to receive, elaborate and send a message.
Cita tipo APA: Costa, Martín Elías . (2014-08-11). Aportes al estudio cuantitativo del lenguaje y la comunicación animal en tres etapas: recepción, elaboración y emisión de un mensaje. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5616_Costa.pdf Cita tipo Chicago: Costa, Martín Elías. "Aportes al estudio cuantitativo del lenguaje y la comunicación animal en tres etapas: recepción, elaboración y emisión de un mensaje". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5616_Costa.pdf |
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Morales Mendoza, Noé Javier. "Síntesis de nanocargas de base carbono y su aplicación al desarrollo de bio-nanocompuestos" (2014-08-08). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Muchos materiales convencionales, tales como metales, cerámicos y polímeros no pueden cumplir con todos los requerimientos que las nuevas tecnologías buscan para resolver los problemas más inmediatos del mundo relacionados con la energía y el ambiente. La combinación de dos ó más de estos materiales en la nano-escala busca generar nuevos materiales compuestos con propiedades inalcanzables desde sus constituyentes individuales. Las nanoestructuras de carbono han surgido como un material de considerable interés debido a su estructura única, alta estabilidad química y alta relación de superficie a volumen que le confieren valores extraordinarios a propiedades tales como conductividad eléctrica y térmica, resistencia y rigidez mecánica. Más aún, la superficie de las nanoestructuras de carbono puede cubrirse en la nano-escala con un compuesto inorgánico creando una nanoestructura híbrida que adiciona nuevas propiedades a las ya mencionadas. Por lo tanto, es esperable transferir parte de estas propiedades excepcionales a los materiales compuestos de matriz polimérica conteniendo nanoestructuras de carbono y/o nanoestructuras híbridas que las contengan. En este trabajo de Tesis, se desarrolló un proceso de síntesis en un solo paso por deposición química en fase vapor (CVD) de una nanoestructura híbrida, nanotubo de carbono (NTC)/hercinita (FeAl2O4), utilizando acetileno como fuente de carbono y un xerogel FeOx-AlOOH como catalizador. El desarrollo fue consecuencia de un estudio sistemático sobre el efecto de las condiciones de síntesis del xerogel en el rendimiento de la preparación de NTC por CVD. Las propiedades del híbrido son una asociación de ferromagnetismo con superparamagnetismo y su fácil dispersión en solventes próticos y apróticos. Con esta nanoestructura híbrida se fabricaron por colada compuestos de matriz almidón ó de poliuretano termoplástico (TPU) en forma de películas y por electrohilado compuestos de matriz de alcohol polivinílico (PVA) más almidón en forma de nanofibras. Las aplicaciones tecnológicas propuestas para estos materiales compuestos son envases biodegradables, pinturas antiestáticas y membranas de tejido filtrantes biodegradables, respectivamente. Abstract: Many conventional materials as metals, ceramics and polymers do not accomplish the requirements that the new technologies need to solve some of the more pressing problems of the world, related with the growing energy demand, environmental problems and food supply between others. However, the appropriate combination of different materials at the nanoscale, produce composites with improved and novel mechanical, physical and chemical properties. Carbon nanostructures have emerged as materials of considerable interest due to their unique structure, high chemical stability and high surface to volume ratio which confer outstanding values to properties such as electrical and thermal conductivity, strength and mechanical stiffness. Moreover, the surface of the carbon nanostructures can be coated with an inorganic compound in the nanoscale, creating a hybrid nanostructure with modified physicochemical properties with respect to the parent materials. Therefore, it is expected to transfer some of these unique properties to polymer matrix composites containing carbon nanostructures and/or hybrid nanostructures. In this work a chemical vapor deposition (CVD) single step synthesis procedure for the preparation of a hybrid carbon nanotube/hercynite nanostructure (CNT/FeAl2O4) was developed. A sol-gel made FeOx-AlOOH xerogel was used as catalyst and acetylene was the carbon source. The development was the result of a systematic study on the effect of the xerogel synthesis conditions on the performance of the production of NTC by CVD. The hybrid display ferromagnetism associated with superparamagnetism and a high dispersibility in protic and aprotic solvents. Several composites containing this hybrid nanostructure were prepared: starch/hybrid (casting); polyurethane/hybrid (casting), polyvinyl alcohol/hybrid (electrospinning). These materials may find applications in packaging (biodegradable); antistatic coatings and filter membranes, respectively.
Cita tipo APA: Morales Mendoza, Noé Javier . (2014-08-08). Síntesis de nanocargas de base carbono y su aplicación al desarrollo de bio-nanocompuestos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5550_MoralesMendoza.pdf Cita tipo Chicago: Morales Mendoza, Noé Javier. "Síntesis de nanocargas de base carbono y su aplicación al desarrollo de bio-nanocompuestos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-08. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5550_MoralesMendoza.pdf |
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Luna, Ana Eugenia. "Producción de color en materiales microestructurados naturales y artificiales" (2014-08-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las estructuras fotónicas naturales exhiben notables efectos de color como el aspecto metálico y la iridiscencia. En este trabajo se investigan algunas de las microestructuras de este tipo que se han identificado en coleópteros, específicamente en los escarabajos de la especie Ceroglossus suturalis, que exhiben una coloración iridiscente y son endémicos del extremo sur de América del Sur y del sur de Chile. Este fenómeno de iridiscencia se produce por reflexiones múltiples de la luz dentro de la epicutícula del élitro (ala delantera modificada por endurecimiento que encierra a las alas posteriores utilizadas en el vuelo), que es un sistema de multicapas alternadas de materiales de diferente densidad óptica. Por medio del empleo de técnicas de microscopía electrónica de barrido (SEM) y de transmisión (TEM), y a través del procesamiento de las imágenes y micrografías, se obtuvieron los parámetros geométricos más relevantes de las microestructuras responsables del color estructural en estos escarabajos, tales como el número de capas y sus espesores. Utilizando un espectrofotómetro acoplado a fibra óptica se midieron los espectros de reflectancia y se obtuvieron los diagramas de cromaticidad para diferentes muestras, y bajo distintas condiciones de iluminación. Una vez confirmado el mecanismo físico involucrado en la producción de color en los especímenes estudiados, se aplicaron diferentes algoritmos de optimización para recuperar tanto la parte real como la imaginaria de la constante dieléctrica y los espesores de las capas de los materiales que componen el sistema natural de multicapas. Los resultados obtenidos mediante la aplicación de diferentes estrategias de optimización heurística confirman que este tipo de algoritmos tiene un gran potencial como herramienta para investigar las estructuras fotónicas naturales. El estudio de la generación de color estructural en el mundo natural ya ha comenzado a inspirar el desarrollo de dispositivos artificiales con aplicaciones tecnológicas, tales como sensores inteligentes y nuevos tipos de filtros. Abstract: Natural photonic structures exhibit remarkable color effects such as metallic appearance and iridescence. In this work, we investigate some of the microstructures of this kind that have been identified in Coleoptera, specifically in the beetles of the species Ceroglossus suturalis, which exhibit an iridescent coloration and mostly live endemically in the southern end of South America and the south of Chile. This phenomenon of iridescence is produced by multiple reflections of light within the epicuticle of their elytra (modified forewing of a beetle that encases the thin hind wings used in flight), which is a multilayer system that alternates materials of different optical density. By means of scanning (SEM) and transmission (TEM) electron microscopy techniques, and after processing the images and micrographs, the significant geometrical parameters of the microestructure responsible for the structural color in these beetles, such as the number of layers and their thicknesses, have been obtained. By using an optical fiber coupled spectrophotometer, reflectance spectra have been measured, and the chromaticity diagrams have been obtained for several samples under different illumination conditions. Once the physical mechanism underlying the color production in the studied specimens was confirmed, different optimization algorithms have been applied to retrieve the real and imaginary parts of the relative permittivity of the materials comprising the natural multilayer system, as well as the layers thicknesses. The results obtained by applying different heuristic optimization strategies confirm that this kind of algorithms have a great potential as a tool to investigate natural photonic structures. The study of structural color generation in the natural world has already started to inspire the development of artificial devices for technological applications, such as smart sensors and new kinds of filters.
Cita tipo APA: Luna, Ana Eugenia . (2014-08-06). Producción de color en materiales microestructurados naturales y artificiales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5606_Luna.pdf Cita tipo Chicago: Luna, Ana Eugenia. "Producción de color en materiales microestructurados naturales y artificiales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5606_Luna.pdf |
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Gómez Romero, Blanca Andreína. "Aplicación de técnicas analíticas y espectroscópicas para el estudio de la influencia de colorantes orgánicos naturales en la degradación de matrices complejas. Caracterización de materiales en arte colonial y patrimonio arqueológico" (2014-08-05). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los colorantes naturales extraídos de insectos y plantas fueron ampliamente utilizados como pigmentos artísticos, por precipitación con sales inorgánicas para la preparación de lacas, y como tintes de textiles en combinación con mordientes para lograr distintas tonalidades en los procesos de teñido. Una característica de estos colorantes es su estabilidad variable frente a la luz, dependiente de su estructura química y de las matrices que los contienen. Las investigaciones realizadas en este trabajo de tesis doctoral se centraron principalmente en dos aspectos, a saber: 1) la caracterización de los colorantes orgánicos rojos presentes en extractos del insecto cochinilla y las raíces de Rubia, así como del colorante azul índigo, mediante distintas técnicas instrumentales, y 2) el estudio de la estabilidad de estos colorantes y su influencia en la degradación de lípidos y proteínas en muestras experimentales que simulaban un textil o una pintura al óleo en condiciones de envejecimiento acelerado por irradiación con luz UV. La primera parte del trabajo comprendió el estudio de los colorantes antraquinónicos rojos ácido carmínico, alizarina y purpurina. Se presentan los resultados de los estudios de envejecimiento acelerado por irradiación con luz UV de lanas teñidas con el colorante carmín, extraído del insecto cochinilla, en ausencia de mordiente y en presencia de sales de estaño (SnCl2), alumbre (KAl(SO4)2.12H2O) y cobre (CuSO4.5H2O) utilizadas como mordientes. El análisis de la composición química de los extractos del colorante por HPLCDAD mostró la alta estabilidad a la luz del ácido carmínico en las lanas mordentadas con estaño y alumbre, en comparación con cobre y en ausencia de mordiente. Así mismo, se detectaron productos de degradación del ácido carmínico, dependiendo de los procedimientos de teñido y las condiciones de envejecimiento acelerado. La degradación de la fibra se estudió por espectroscopia infrarroja en modo de reflectancia total atenuada (ATR), observándose que las lanas teñidas con extracto de cochinilla mordentadas con estaño y en ausencia de mordiente presentaban una mayor proporción de los productos de degradación de la proteína en comparación con las mordentadas con alumbre y sulfato de cobre. De manera similar, se realizaron estudios de envejecimiento acelerado por luz UV en lanas teñidas con alizarina y purpurina, colorantes principales del extracto de las raíces de Rubia, en presencia de mordiente de alumbre. Se observó que la purpurina es más sensible a la degradación que la alizarina y que la degradación de la fibra es mayor que en las lanas teñidas con el colorante carmín. Se identificaron los colorantes ácido carmínico y purpurina en muestras de textiles arqueológicos de sitios de Perú y Argentina y se comparó el estado de degradación de la lana con los correspondientes a las muestras de referencia. Por otro lado, se estudió la influencia de las condiciones de envejecimiento acelerado por luz UV en la degradación de lípidos del aceite de lino conteniendo las lacas de los colorantes orgánicos carmín y Rubia, en ausencia y en presencia del pigmento blanco de plomo, un carbonato básico de plomo muy utilizado como agente secante. Las condiciones de envejecimiento utilizando ciclos de luz-oscuridad produjeron un efecto mayor en la degradación del aceite de lino de acuerdo con los resultados del análisis del perfil lípidico por CG-EM y por espectroscopía infrarroja (ATR). Se identificó la formación de carboxilatos y ácidos grasos libres como productos de la degradación y se observaron diferencias notables en las concentraciones del ácido oleico y en su producto de degradación, el ácido azelaico. Una segunda parte comprendió el estudio de la aplicación de distintas técnicas analíticas y espectroscópicas para la identificación del colorante azul índigo en muestras complejas. Se obtuvieron resultados interesantes utilizando espectrometría de masa por inserción directa, ya que se identificó el índigo sin un paso previo de extracción, en matrices complejas como las de textiles arqueológicos y en pintura mural sobre yeso. Por último, la tercera parte presenta los resultados de la caracterización de materiales orgánicos e inorgánicos de las capas pictóricas y bases de preparación de esculturas policromadas jesuíticas y de pintura de caballete y mural de iglesias coloniales andinas. Para ello se aplicó una combinación de técnicas analíticas que incluyeron ensayos microquímicos, microscopía de barrido electrónico con microsonda de detección de rayos X (SEM-EDX), HPLC-DAD, HPLC-EM, CG-FID, CG-EM, FT-IR, FTIR-ATR, microscopia Raman y EM por inserción directa. La discusión de los resultados obtenidos en el marco de un trabajo interdisciplinario con historiadores de arte acentuó la relevancia de los resultados, al ser contrastados con manuales y tratados de la época. Abstract: Natural organic dyes extracted from insects and plants have been widely used as artists’ pigments by precipitation with inorganic salts as lakes and as textile dyes in combination with mordants to achieve different hues in the dyeing process. One feature of these compounds is their varying stability against light, which depends on their chemical structure and on the matrices in which they are contained. This research is mainly focused on two aspects: 1) the characterization of organic dyes present in extracts from cochineal insect and roots of Rubia, as well as Indigo, by a variety of instrumental techniques, and 2) the study of the stability of these colorants and their influence on the degradation of lipids and proteins in experimental samples that simulate a textile or an oil painting under accelerated aging conditions by irradiation with UV light. The first part of this thesis describes the study of the red anthraquinone dyes carminic acid, alizarin and purpurin. It shows the results of accelerated aging studies by UV light in wool dyed with cochineal extract, both with and without mordant salts based on tin (SnCl2), alum (KAl(SO4)2.12H2O) and copper (CuSO4.5H2O). Analysis by HPLC-DAD revealed a higher lightfastness of tin and alum-mordanted textiles, compared to copper-mordanted and nonmordanted textiles. Degradation products of carminic acid were detected depending on the dyeing process and the accelerated aging conditions. The fiber’s degradation was examined by infrared spectroscopy in Attenuated Total Reflectance (ATR) mode and showed that tinmordanted and non-mordanted dyed textiles produced a higher proportion of wool degradation products in comparison with alum and copper-mordanted dyed textiles. Similarly, UV accelerated aging studies were performed on wool dyed with alizarin and purpurin (main components of Rubia’s extract) in the presence of alum mordant. The results showed that purpurin is more sensitive to degradation than alizarin, and that the fiber’s degradation was higher, compared to the wools dyed with carmine. Carminic acid and purpurin were identified in samples of archaeological textiles from Peru and Argentina, and the fiber’s degradation was compared with other dyed textiles used as references. Furthermore, in this work we studied the influence of UV accelerated aging conditions on lipid degradation of flax oil containing Madder and Carmine lakes, with or without lead white pigment. Lead white is a basic carbonate, widely used as drier agent. Aging conditions including light-dark cycles produced a greater effect on the degradation of flax oil according to the lipid profile results by GC-MS and ATR-FTIR. Upon degradation, carboxylates as well as free-fatty-acids were identified. There were significant differences in the concentrations of oleic acid and azelaic acid (its degradation product). The second part of this work comprised the application of several analytical and spectroscopic techniques to the identification of indigo dye in complex samples. Interesting results were obtained by applying direct-insertion mass spectrometry technique to the identification of the indigotin component, without following a prior extraction step. Indigotin was identified in samples taken from archaeological textiles and in a sample of a mural painting. Finally, the third part shows the results of the characterization of organic and inorganic materials in pictorial layers and grounds of some polychrome Jesuit sculptures, canvas and mural paints of colonial Andean churches. A combination of techniques was applied, including micro-chemical testing, SEM-EDX, HPLC-DAD, HPLC-MS, GC-FID, GC-MS, FT-IR, ATR-FTIR, Raman microscopy and mass spectrometry by direct insertion. Interdisciplinary work with art historians stressed out the results’ relevance, when contrasted to manuals and treatises of the period.
Cita tipo APA: Gómez Romero, Blanca Andreína . (2014-08-05). Aplicación de técnicas analíticas y espectroscópicas para el estudio de la influencia de colorantes orgánicos naturales en la degradación de matrices complejas. Caracterización de materiales en arte colonial y patrimonio arqueológico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5579_GomezRomero.pdf Cita tipo Chicago: Gómez Romero, Blanca Andreína. "Aplicación de técnicas analíticas y espectroscópicas para el estudio de la influencia de colorantes orgánicos naturales en la degradación de matrices complejas. Caracterización de materiales en arte colonial y patrimonio arqueológico". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-05. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5579_GomezRomero.pdf |
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Robledo, Fabiana Elizabeth. "Innovaciones metodológicas en métodos geofísicos con aplicación a diversas problemáticas ambientales" (2014-08-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los sistemas de inducción electromagnética portátiles espira-espira (EMI o SLEM) constituyen un método geofísico ampliamente utilizado para estudiar la conductividad eléctrica del subsuelo hasta unas decenas de metros de profundidad. En ocasiones, también permiten estudiar sus propiedades magnéticas. El principal objetivo de este Trabajo de Tesis ha sido desarrollar innovaciones metodológicas en las técnicas de adquisición, procesamiento e interpretación de los datos EMI, para mejorar la información que puede obtenerse mediante este método. Los desarrollos se orientaron a aplicaciones relacionadas con diversas problemáticas medioambientales, las cuales incluyeron la detección y/o caracterización de tuberías y otros objetos enterrados, y el mapeo de plumas de contaminación por hidrocarburos en el subsuelo y las napas de agua. Se puso especial atención al caso de prospecciones realizadas en zonas urbanas y suburbanas, donde la aplicación del método suele ser dificultosa, debido a que el nivel de ruido electromagnético generalmente es elevado y a que la presencia de estructuras u objetos metálicos cercanos a las zonas estudiadas puede introducir distorsiones en los datos. En particular, se desarrollaron metodologías de adquisición alternativas a las usuales, que permiten obtener estimaciones confiables de los errores de los datos (los cuales no son informados por los instrumentos), reducir las distorsiones e incrementar la relación señal-ruido. Las metodologías presentadas tienen una excelente relación costo-beneficio, ya que son relativamente sencillas de implementar en los trabajos de campo y brindan mejoras significativas tanto respecto de la sensibilidad de los datos a las anomalías de interés, como respecto de la precisión y la resolución de los modelos obtenidos al aplicar métodos de inversión. Asimismo, se desarrolló un método para determinar el grado de confiabilidad de los modelos inversos en función de la posición y la profundidad, y se investigó qué orientaciones del instrumento resultan óptimas para prospectar blancos de pequeñas dimensiones localizados a profundidades someras. La validez de las metodologías propuestas se comprobó mediante simulaciones numéricas, trabajos de campo y experimentos controlados. En las aplicaciones correspondientes a contaminación de suelos y acuíferos, además, se investigaron las ventajas ofrecidas por la utilización conjunta de los métodos EMI y Geoeléctrico. Abstract: Small-loop electromagnetic induction systems (EMI or SLEM) are a geophysical method widely used for studying the electrical conductivity of the subsoil up to a few tens of meters deep. Sometimes, they also allow studying its magnetic properties. The main objective of this PhD Thesis has been to develop methodological advances in the techniques of acquisition, processing and interpretation of EMI data, for improving the information that can be obtained using this method. The developments were oriented to applications related to various environmental problems, which included the detection and/or characterization of pipes and other underground objects, and the mapping of hydrocarbon contamination plumes in the subsoil and groundwater layers. Special attention was paid to the case of surveys carried out in urban and suburban areas, where the application of this method can be difficult, because the electromagnetic noise level is usually high, and the presence of metal objects or structures near the studied areas near can introduce distortions in the data. In particular, acquisition methodologies were developed, alternative to the usual, which allow obtaining reliable estimates of the errors of the data (which are not reported by the instruments), reducing the distortions and increasing the signal to noise ratio. The proposed methodologies have an excellent cost-benefit ratio, since they are relatively simple to implement in field work, and provide significant improvements regarding both the sensitivity of the data to the target anomalies, and the accuracy and resolution of the models obtained when applying inversion methods. In addition, a method was developed for determining the degree of reliability of the inverse models as a function of the position and depth. Also, the optimal instrument orientations for prospecting objects of small size located at shallow depths were investigated. The validity of the proposed methodologies was ascertained by numerical simulations, field work and controlled experiments. In the applications corresponding to contamination of soils and aquifers, the advantages offered by the joint use of the EMI and Geoelectrical methods were also investigated.
Cita tipo APA: Robledo, Fabiana Elizabeth . (2014-08-01). Innovaciones metodológicas en métodos geofísicos con aplicación a diversas problemáticas ambientales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5562_Robledo.pdf Cita tipo Chicago: Robledo, Fabiana Elizabeth. "Innovaciones metodológicas en métodos geofísicos con aplicación a diversas problemáticas ambientales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-08-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5562_Robledo.pdf |
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Padua, Luciana María. "Comparación interactiva de modelos de minería de datos utilizando técnicas de visualización" (2014-07-24). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El siguiente trabajo presenta una metodología para la generación automática de múltiples árboles de decisión y la posterior evaluación de los resultados en forma visual e interactiva. El foco principal reside en el análisis de la incidencia de los parámetros de configuración de árboles de decisión en los resultados de los múltiples modelos generados. El objetivo del mismo consiste en contribuir a la creciente disciplina de Visual Analytics, la cual es en una combinación de técnicas de Visualización de la Información y Minería de Datos con el fin de involucrar a las personas en los procesos de aprendizaje automático. El enfoque presentado se basa en herramientas disponibles en el mercado, sugiriendo la adaptación de las mismas para lograr los objetivos de interacción del usuario. Con el fin de demostrar la potencialidad de la metodología se presenta al finalizar un caso de uso real de una empresa de Telecomunicaciones. Abstract: The following work presents a methodology to automatically generate multiple decision trees and to evaluate their results in an interactive and visual way. The focal point is the analysis of the influence of the configuration of decision trees’ parameters in the several results generated. The goal is to contribute to the growing Visual Analytics discipline, which consists on a combination of Information Visualization and Data Mining techniques that aims to involve people in automatic processes. The developed approach is based on available software solutions in the market, suggesting their modifications to achieve human interaction. To demonstrate the application of the methodology we present a real use case from a Telecommunications company.
Cita tipo APA: Padua, Luciana María . (2014-07-24). Comparación interactiva de modelos de minería de datos utilizando técnicas de visualización. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5612_Padua.pdf Cita tipo Chicago: Padua, Luciana María. "Comparación interactiva de modelos de minería de datos utilizando técnicas de visualización". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5612_Padua.pdf |
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Guadagnoli, Tamara. "¿La neurotoxicidad del etanol depende del estadío de diferenciación neuronal? Estudio en cultivos primarios de neuronas corticales" (2014-07-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El abuso de alcohol conduce a graves problemas sanitarios y sociales, tanto por la elevada incidencia de su consumo como por las diferentes patologías asociadas a él, entre las que merecen destacarse las producidas a nivel del Sistema Nervioso Central (SNC). Las neuronas son particularmente sensibles al efecto neurotóxico del etanol (EtOH). En este trabajo se demostró que las neuronas corticales en cultivo son suceptibles al daño inducido por el EtOH. Es sabido que no todas las neuronas son igualmente susceptibles al daño inducido por el EtOH, y que hay estadíos en el desarrollo de las neuronas en que son más vulnerables, por ello se analizaron los efectos del EtOH en dos estadíos distintos del desarrollo neuronal. Se trató a las neuronas corticales con EtOH a los 7 y a los 14 días de crecimiento in vitro y se observó que cuanto más maduras son las neuronas más sensibles se vuelven al daño, aumentando el número de células que mueren por apoptosis y necrosis. En este trabajo se demostró también, un aumento en la expresión de caspasa-9 activa y de caspasa-3 activa en los cultivos tratados con EtOH. Asi mismo, se demostró que la exposición a EtOH afecta la morfología neuronal, ya que se observó una disminución en la longitud del árbol dendrítico, como consecuencia de una reducción en el largo de las dendritas primarias y secundarias, y del número de dendritas secundarias. La exposición a EtOH también produjó cambios en la expresión de las proteínas sinápticas como PSD-95 y sinaptofisina. Ademas se observaron cambios ultraestructurales en los cultivos tratados con EtOH, como la presencia de cuerpos en degeneración, núcleos identados, aumento del lumen del retículo endoplasmatico, del número de gotas de lípidos y de lisosomas, así como también, desorganización del aparato de Golgi y de las mitocondrias. Abstract: Alcohol abuse leads to serious health and social problems, both for the high incidence of consumption as different associated pathologies, including those produced in the central nervous system (CNS). Neurons are particularly susceptible to neurotoxic effects of ethanol (EtOH). This work showed that cultured cortical neurons are susceptible to damage induced by EtOH. It is known that not all neurons are equally susceptible to damage induced by EtOH, and there are stages in the development of neurons in which they are most vulnerable, so we analyze the effects of EtOH at two different stages of neuronal development. Cortical neurons were exposed to EtOH at 7 and 14 days of in vitro growth and found that mature neurons become more susceptible to damage, increasing the number of apoptotic and necrotic cells. In this work, an increase in the expression of caspase-9 active and caspase-3 active in cultures treated with EtOH was shown. Likewise, it was shown that EtOH exposure affects neuronal morphology, characterized by a decrease in the length of dendrite tree as a result of a reduction in the length of the primary and secondary dendrite, and the number of secondary dendrites. EtOH exposure also produced changes in the expression of synaptic proteins such as PSD- 95 and synaptophysin. Furthermore ultrastructural changes were observed in cultures treated with EtOH, the presence of degenerating bodies and indented nuclei, dilated lumen of the endoplasmic reticulum, and increased of the number of lipid droplets and lysosomes, and also disruption of the Golgi apparatus and mitochondria.
Cita tipo APA: Guadagnoli, Tamara . (2014-07-18). ¿La neurotoxicidad del etanol depende del estadío de diferenciación neuronal? Estudio en cultivos primarios de neuronas corticales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5552_Guadagnoli.pdf Cita tipo Chicago: Guadagnoli, Tamara. "¿La neurotoxicidad del etanol depende del estadío de diferenciación neuronal? Estudio en cultivos primarios de neuronas corticales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5552_Guadagnoli.pdf |
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Gorojod, Roxana Mayra. "Rol de la vía autofágica-lisosomal en la muerte celular inducida por manganeso en células gliales" (2014-07-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El manganismo es un desorden neurodegenerativo originado por la sobreexposición crónica a Mn, cuyo cuadro clínico y vías de señales se asemejan a los de la Enfermedad de Parkinson Idiopática. El Mn se acumula preferentemente en los ganglios basales y en particular, en las mitocondrias y lisosomas, donde puede generar especies reactivas de oxígeno y afectar las membranas de estas organelas. La permeabilización de la membrana lisosomal (PML) conduce a la liberación de hidrolasas al citosol y a la apoptosis y puede también comprometer la degradación autofágica. En el presente trabajo se investigó el daño lisosomal inducido por Mn y el impacto de este evento en la muerte de las células C6 de glioma de rata. Parte de los resultados obtenidos fueron trasladados a un modelo in vivo de intoxicación aguda con Mn. Por lo tanto, el enfoque estuvo dirigido al estudio de la posible participación de la vía lisosomal en la apoptosis inducida por Mn y al rol potencial de la autofagia en este contexto celular. Los ensayos in vitro se realizaron empleando células expuestas a MnCl2 en distintas condiciones de incubación. Se demostró que el Mn induce un aumento en el tamaño de las vesículas ácidas que puede ser totalmente prevenido por preincubación con antioxidantes. Asimismo, la exposición al metal genera PML y liberación de Catepsina D (CatD) al citosol, procesos que tienen lugar rio arriba de la injuria a la mitocondria. El estudio del rol de las catepsinas en la vía de muerte celular apoptótica demostró que las CatD y B regulan los niveles de expresión de FasL, intervienen en el clivaje de caspasa-8 y Bid y en la activación de la vía de muerte mitocondrial. En este contexto, el Mn activó la autofagia como un mecanismo de supervivencia celular. Los estudios in vivo sugieren que los efectos tóxicos del Mn resultan en un daño a los astrocitos del striatum y en la alteración de los niveles de expresión de la CatD en las neuronas de ciertos ganglios basales involucrados en el manganismo. En conjunto, nuestros resultados demuestran por primera vez que los lisosomas constituyen un blanco estratégico de la toxicidad del Mn, integrando la cascada de señales implicadas en la apoptosis. En este escenario, la autofagia se desencadena en un intento de rescatar a las células de la muerte. Estos hallazgos contribuyen al conocimiento de los mecanismos de daño posiblemente activados en el manganismo y probablemente en otras enfermedades neurodegenerativas. Abstract: Manganism is a neurodegenerative disorder caused by chronic Mn overexposure whose symptoms and signaling pathways resemble those of idiopathic Parkinson's disease. Mn accumulates within the basal ganglia, particularly in mitochondria and lysosomes. Hence, Mn- induced reactive oxygen species may disrupt the integrity of these organelles. Lysosomal membrane permeabilization (LMP) causes the release of cathepsins and other hydrolases from the lysosomal lumen to the cytosol leading to apoptotic cell death. Moreover, LMP may induce alterations in the autophagic degradation pathway. In the present study, Mn-induced lysosomal damage and its impact on C6 rat glioma cell death were investigated. Some of these results were validated in an acute Mn intoxication in vivo model. Our approach was to study the possible involvement of the lisosomal pathway in manganese-induced apoptosis and the potential role of autophagy in this cellular context. For in vitro assays, cells were exposed to MnCl2 in different incubation conditions. We found that Mn induces an increase in acidic vesicles size, which is completely prevented by antioxidants. Moreover, Mn exposure generates PML and the release of cathepsin D (CatD) to the cytosol, both processes taking place upstream to the mitochondrial damage. CatD and B are involved in both caspase-8 and Bid cleavage, leading to the activation of the mitochondrial apoptotic pathway. Moreover, they regulate FasL expression levels. In this context, autophagy is activated as a survival pathway. In vivo studies suggested that the toxic effects of Mn result in both striatal astrocyte damage and altered expression of CatD in neurons of the basal ganglia. Taken together, our results demonstrate for the first time that lysosomes are a strategic target for Mn toxicity, integrating the signal cascades involved in apoptosis. In this scenario, autophagy is triggered as an attempt to rescue the cells from death. These findings contribute to the understanding of the damage mechanisms possibly activated in manganism and probably in other neurodegenerative diseases.
Cita tipo APA: Gorojod, Roxana Mayra . (2014-07-17). Rol de la vía autofágica-lisosomal en la muerte celular inducida por manganeso en células gliales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5568_Gorojod.pdf Cita tipo Chicago: Gorojod, Roxana Mayra. "Rol de la vía autofágica-lisosomal en la muerte celular inducida por manganeso en células gliales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5568_Gorojod.pdf |
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Mac Keon, Soledad. "Vacunación con células dendríticas y regulación de la respuesta inmune en melanoma experimental" (2014-07-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo del presente trabajo de Tesis fue explorar el mecanismo mediante el cual la vacuna CD-Apo/Nec, constituida por células dendríticas cocultivadas con células apoptóticas y necróticas del melanoma murino B16-F1, genera protección antitumoral, y establecer condiciones que potencien la capacidad inmunoestimuladora de la misma. En el trabajo de Tesis que se presenta se demuestra que la protección generada por la vacuna es sistémica, evitando el desarrollo s.c. de melanoma B16-F1 y controlando micrometástasis latentes. Se detectó en el sitio de vacunación la novedosa formación de una estructura linfoide terciaria, la cual no se evidenció con otras vacunas que no desarrollan protección antitumoral. En esta estructura se observaron vénulas con expresión de Adresina de Nódulo Linfático Periférico y el reclutamiento de linfocitos T CD4+ y CD8+ en estrecho contacto con células dendríticas. Para la formación de la estructura linfoide terciaria fue necesario el cocultivo ex vivo durante 24 horas de las células dendríticas con células Apo/Nec. En los ganglios linfáticos drenantes, la vacunación no indujo la acumulación de linfocitos T regulatorios, pero sí fue posible detectar allí el reclutamiento y proliferación de linfocitos T CD8+ vírgenes B16-F1-específicos. Se determinó al finalizar el esquema de vacunación la producción anticuerpos IgM/IgG anti-B16-F1, que podrían actuar opsonizando células B16-F1. Se ensayaron diferentes estrategias de maduración in vitro de las células CD-Apo/Nec. Sin embargo, no fue posible generar un aumento significativo en su capacidad inmunoestimuladora. Se dedujo que las células apoptóticas y necróticas de melanoma inducen una pérdida en la capacidad funcional de las células dendríticas. Se comprobó la acumulación de lípidos neutros en las células dendríticas, que podría estar afectando el procesamiento y presentación de antígenos tumorales. En este trabajo de Tesis se logró determinar diferentes aspectos de la respuesta inmune anti-tumoral gatillados en los animales vacunados con CD-Apo/Nec. Creemos que las células de melanoma irradiadas son una fuente completa de antígenos de melanoma, y que este trabajo contribuye a planear nuevas aproximaciones y estrategias de combinación que logren mejorar las terapias anti-melanoma existentes. Abstract: The aim of this Ph.D. Thesis was to explore the mechanisms of antitumor protection elicited by DC-Apo/Nec vaccine, constituted by dendritic cells charged with apoptotic and necrotic murine B16-F1 melanoma cells, and to establish new conditions to enhance it´s immunostimulatory capacity. In this PhD Thesis it is demonstrated that the DC-Apo/Nec vaccine generates systemic protection against s.c. B16-F1 melanoma and dormant micrometastasis. The neoformation of a tertiary lymphoid structure was described at the vaccination site, which was not evidenced with other vaccines lacking antitumor capacity. Within this structure the expression of Peripheral Lymph Node Addressin and the recruitment of CD4+ and CD8+ T lymphocytes, in close contact with dendritic cells, were observed. For the tertiary lymphoid structure to be formed, a 24 hour coculture of dendritic cells with apoptotic and necrotic melanoma cells was required. In draining lymph nodes, B16-F1 specific T CD8+ lymphocyte recruitment and proliferation was detected, and regulatory T lymphocytes were not induced. Anti- B16-F1 antibodies were detected, which could be assisting by opsonization in the immune detection of B16-F1 melanoma cells. New maturation approaches for DC-Apo/Nec cells were assayed, but it was not possible to enhance significantly their immunostimulatory capacity. It was deduced that during the coculture period the apoptotic and necrotic melanoma cells induce a loss in the functional properties of dendritic cells. Lipid accumulation was shown in these dendritic cells, which could be affecting the processing and presentation of tumoral antigens. Different aspects of the antitumor response elicited by DC-Apo/Nec vaccination were determined in this Ph.D. Thesis. We believe that apoptotic and necrotic melanoma cells are an complete melanoma antigen source, and that this work contributes on the search for new approximations and combination strategies to improve actual anti-melanoma therapies.
Cita tipo APA: Mac Keon, Soledad . (2014-07-16). Vacunación con células dendríticas y regulación de la respuesta inmune en melanoma experimental. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5605_MacKeon.pdf Cita tipo Chicago: Mac Keon, Soledad. "Vacunación con células dendríticas y regulación de la respuesta inmune en melanoma experimental". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5605_MacKeon.pdf |
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Saborido, Mariano Diego. "Bases farmacológicas y moleculares de las disquinesias inducidas por L-dopa en un modelo experimental de la enfermedad de Parkinson" (2014-07-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La enfermedad de Parkinson se caracteriza por una deficiencia de dopamina estriatal debida a la pérdida progresiva de neuronas de la substantia nigra pars compacta. La L-dopa es el antiparkinsoniano más eficaz, aun cuando luego de algunos años de tratamiento la mayoría de los pacientes presentan complicaciones motoras como las disquinesias. Éstas reducen la calidad de vida del paciente e interfieren con el beneficio terapéutico de la Ldopa. Se sabe que la exposición repetida a agonistas dopaminérgicos, la estimulación pulsátil de receptores dopaminérgicos estriatales y una severa degeneración nigroestriatal favorecen la aparición de disquinesias. Existe consenso respecto a que la aparición de disquinesias involucra profundos y persistentes cambios moleculares en el estriado. El objetivo general del presente trabajo fue examinar los mecanismos farmacológicos y moleculares que dan origen a las complicaciones motoras que se presentan durante la terapéutica sustitutiva con L-dopa en un modelo animal de la enfermedad de Parkinson. Nuestros resultados avalan la participación de los receptores dopaminérgicos D1 y sugieren la participación de la proteína Fyn en el desarrollo de disquinesias. Aunque no hemos sido capaces de reducir la severidad de las disquinesias mediante la inhibición de la vía mediada por mTOR, no podemos descartar su participación en el desarrollo y consolidación del fenómeno disquinético. Abstract: Parkinson's disease is characterized by a deficiency of striatal dopamine due to the progressive loss of neurons in the substantia nigra pars compacta. L-dopa is the most effective anti-Parkinsonian drug, even though after a few years of treatment, the majority of patients present motor complications such as dyskinesias. They reduce the quality of life of the patients and interfere with the L-dopa therapeutic benefit. It is known that repeated exposure to dopamine agonists, pulsatile stimulation of striatal dopaminergic receptors and a severe striatonigral degeneration favor the emergence of dyskinesias. There is consensus that the occurrence of dyskinesias involves deep and persistent molecular changes in the striatum. The general objective of this work was to examine the pharmacological and molecular mechanisms that give rise to complications that arise during substitutive therapy with L-dopa in an animal model of Parkinson´s disease. Our results support the participation of D1 dopamine receptors and suggest the involvement of the protein Fyn in the development of dyskinesias. Although we have not been able to reduce the severity of dyskinesias by inhibiting the mTOR-mediated pathway, we cannot dismiss its participation in the development and maintenance of the dyskinetic phenomenon.
Cita tipo APA: Saborido, Mariano Diego . (2014-07-15). Bases farmacológicas y moleculares de las disquinesias inducidas por L-dopa en un modelo experimental de la enfermedad de Parkinson. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5567_Saborido.pdf Cita tipo Chicago: Saborido, Mariano Diego. "Bases farmacológicas y moleculares de las disquinesias inducidas por L-dopa en un modelo experimental de la enfermedad de Parkinson". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5567_Saborido.pdf |
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Privitelli, Melina Lorena. "Estimaciones y resultados de existencia de puntos racionales de variedades singulares sobre cuerpos finitos y aplicaciones" (2014-07-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El primer objetivo de esta tesis es proporcionar estimaciones y resultados de existencia de puntos racionales de intersecciones completas singulares definidas sobre el cuerpo finito Fq. Nuestros resultados se basan en la obtención de nuevas versiones efectivas del segundo teorema de Bertini que garantizan la existencia de secciones lineales no singulares de una variedad singular, definidas sobre Fq. Así, aplicando la conocida estimación de P. Deligne para variedades no singulares, obtenemos estimaciones y resultados de existencia para intersecciones completas cuyo lugar singular tiene codimensión al menos dos o tres. Dichas estimaciones se expresan en términos de la dimensión del lugar singular, el grado y la dimensión de la variedad. Además, proporcionamos una versión explícita de la estimación de Hooley para variedades singulares. En la segunda parte de este trabajo aplicamos nuestras estimaciones a dos problemas concretos de teoría de códigos y combinatoria. En ambos casos las variedades involucradas son intersecciones completas simétricas, es decir, están definidas por polinomios invariantes bajo la acción del grupo de permutaciones de sus coordenadas. Es por esto que, en primer lugar, estudiamos las propiedades geométricas de dichas variedades, más concretamente la dimensión del lugar singular de las mismas. El problema de teoría de códigos que abordamos es el de determinar la existencia de deep holes en un código de Reed-Solomon estándar. En lo que respecta a problemas de combinatoria, analizamos el comportamiento del valor promedio del conjunto de valores (o “value set”) de ciertas familias de polinomios definidas sobre Fq. En ambos casos, mejoramos los resultados existentes en la literatura. Abstract: The first aim of this thesis is to obtain estimates and existence results for rational points of singular complete intersections defined over a finite field Fq. Our results rely on obtaining new effective versions of the second Bertini theorem. This theorem asserts that there exists a nonsingular linear section defined over Fq of a singular variety defined over Fq. Thus, by applying the well known Deligne estimate, we provide estimates and existence results for rational points of singular complete intersections for which the singular locus has codimension at least two or three. Our estimates are expressed in terms of the dimension of the singular locus, the degree and the dimension of the variety. Furthermore, we obtain an explicit version of the Hooley estimate for singular complete intersections. In the second part of this thesis we apply our estimates to concrete problems of coding theory and combinatorics. In both cases, the varieties under consideration are symmetric complete intersections, namely, they are defined by polynomials which are invariant under the action of the group of permutations of their coordinates. Hence, we first study some geometric properties of symmetric complete intersections; more precisely, we obtain information about the dimension of the singular locus of these varieties. Concerning coding theory, we study the existence of deep holes of the standard Reed-Solomon code. With respect to combinatorics, we analyze the average value set of families of univariate polynomials with coefficients in Fq. In both cases, we improve the existing results in the literature.
Cita tipo APA: Privitelli, Melina Lorena . (2014-07-15). Estimaciones y resultados de existencia de puntos racionales de variedades singulares sobre cuerpos finitos y aplicaciones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5561_Privitelli.pdf Cita tipo Chicago: Privitelli, Melina Lorena. "Estimaciones y resultados de existencia de puntos racionales de variedades singulares sobre cuerpos finitos y aplicaciones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5561_Privitelli.pdf |
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Ramírez, Gabriela P.. "Aprendizaje olfativo pre-imaginal en la abeja Apis mellifera: sus efectos luego de la metamorfosis" (2014-07-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Dentro de las colmenas de abejas Apis mellifera la información relativa a un recurso floral se distribuye rápidamente entre individuos de todas las edades mediante contactos boca a boca (trofalaxia). Estas interacciones sociales permiten establecer memorias asociativas estables y de largo término en individuos adultos. Sin embargo, hasta el presente se desconoce si la adquisición de esta información alcanza a individuos en desarrollo (pre-imaginales). Mediante eventos trofalácticos las larvas pueden recibir el recurso ingresado a la colmena, siendo factible que aquellos individuos en desarrollo puedan establecer memorias asociativas, y que incluso las mismas sean funcionales en estadios avanzados. Se plantea si las experiencias olfativas de naturaleza apetitiva adquiridas en estadios larvales pueden ser retenidas luego de la metamorfosis y afectar la conducta del adulto. Para ello, se ofreció una solución azucarada aromatizada en el interior de colmenas experimentales con el fin de circular alimento aromatizado que pueda ser potencialmente ingerido por individuos en desarrollo. Por un lado, se cuantificó la adquisición y la retención de memorias olfativas bajo el paradigma de respuesta de extensión de probóscide (REP) en adultos, tanto hacia los olores preexpuestos como hacia olores novedosos. Sólo las abejas más jóvenes (3-5 días de edad) mostraron un mayor nivel de REP espontánea hacia el olor pre-expuesto al compararlo con el grupo control, sugiriendo que el adulto puede retener información adquirida antes de emerger. Curiosamente se obtuvieron altos niveles de REP hacia nuevos olores en concordancia con la similitud perceptual entre éstos y el olor pre-expuesto. Esto sugiere un fenómeno de generalización a largo término que persiste luego de la metamorfosis. Se demostró también que incluso aquellas abejas que no respondieron espontáneamente al olor pre-expuesto poseen una mayor capacidad de aprendizaje en un condicionamiento olfativo clásico que abejas sin experiencias. Se evaluaron además posibles cambios en el sistema sensorial periférico del adulto producto de esas experiencias, realizándose registros electrofisiológicos en antenas (EAG) de abejas adultas jóvenes. Se observó una sensibilidad diferencial de los receptores olfativos dependiendo de las experiencias olfativas tempranas. Para estudiar el comportamiento motor de las larvas se realizaron bioensayos de laboratorio que indicaron que la experiencia previa hacia un olor elimina la preferencia innata hacia un olor novedoso. Para establecer correlatos entre experiencias tempranas y aspectos neurobiológicos, se cuantificaron los volúmenes de determinadas estructuras cerebrales de abejas adultas jóvenes involucradas en el procesamiento de información olfativa. Los resultados obtenidos no revelaron diferencias al comparar cerebros de abejas con o sin experiencias olfativas pre-imaginales así como tampoco en la expresión de genes asociados a procesos sinápticos involucrados en eventos de aprendizaje. Concluimos que las experiencias olfativas pre-imaginales condujeron a cambios comportamentales y fisiológicos en las abejas recientemente emergidas. Estos resultados indican que las abejas pueden acceder muy tempranamente a la información relacionada con el alimento que ingresa a la colonia, situación que podría afectar a aquellas conductas mediadas por claves olfativas, como es el caso de la recolección de recursos. Abstract: Inside the Apis mellifera hive, incoming information from a floral source is quickly propagated between nestmates of different ages through mouth to mouth contacts (trophallaxis). These interactions allow establishing long term and stable odor-rewarded memories. However, until now it is unknown whether acquisition of this information achieves developing individuals (pre-imaginal stages). Given that larvae could receive the incoming resources through trophallaxis, it is probably that they could establish olfactory memories that might be useful in later stages. Specifically, we wonder if olfactory appetitive experiences acquired during larval stages can be retained after metamorphosis and if they can induce behavioral changes in the adult stage, inquiring into the underlying cognitive and sensory processes. To address these aims, scented sucrose solution was offered inside the experimental hives in order to allow that circulating scented-food can be ingested by larvae. On one hand, acquisition and retention of olfactory memories were quantified in adults under the proboscis extension response (PER) protocol, by presenting the pre-exposed odor as well as novel ones. Only young bees (3-5 days old) showed a higher spontaneous PER level towards the preexposed odor, suggesting that the adult can retain information acquired before emergence. Curiously, high PER levels were obtained towards odors according to their perceptual similarity between these and the pre-exposed odor. This suggests the existence of a long-term generalization phenomenon that persists after metamorphosis. Bees that failed to respond to the pre-exposed odor where able to learn it more efficiently in a classical olfactory conditioning than naïve bees. On another hand, we also studied possible changes in the adult’s periferic sensory system due to these experiences performing electro-physiological records in the antenna (EAG) of young bees. These recordings showed differential sensitivity of olfactory receptors, depending on the bee’s previous experience. Moreover, laboratory assays performed with larvae showed that pre-exposure to an odor eliminates innate preference towards another novel odor. Finally, to correlate early experiences and neurobiological issues, volumes of certain brain structures involved in olfactory information processing were quantified in young adult bees. Pre-exposure to an odor at a larval stage had no effect on the size of certain adult brain structures or on the amount of expression of genes associated with synaptic processes involved in learning events. We conclude that pre-imaginal olfactory experiences led to both behavioral and physiological changed in newly emerged bees. These results show that honeybee can prematurely access information associated with incoming food gathered by its mates, this situation could affect odor-mediated behaviors like foraging.
Cita tipo APA: Ramírez, Gabriela P. . (2014-07-11). Aprendizaje olfativo pre-imaginal en la abeja Apis mellifera: sus efectos luego de la metamorfosis. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5576_Ramirez.pdf Cita tipo Chicago: Ramírez, Gabriela P.. "Aprendizaje olfativo pre-imaginal en la abeja Apis mellifera: sus efectos luego de la metamorfosis". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5576_Ramirez.pdf |
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Langle, Yanina Verónica. "Participación del estroma en la regresión del cáncer de vejiga inducida por Bacilo Calmette-Guérin (BCG)" (2014-07-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Bacilo Calmette-Guérin (BCG) es el tratamiento estándar para prevenir recidivas y progresión del cáncer vejiga (CaV) no invasor de alto grado histológico. Utilizando un modelo de CaV murino (MB49) demostramos que BCG reduce el crecimiento tumoral a través de a) la inhibición del crecimiento de las células tumorales y b) la generación de un estroma anti-tumoral. El crecimiento de células tumorales es inhibido por la activación del receptor activador de la proliferación de peroxisomas (PPARɣ) y la regulación negativa del receptor 3 del factor de crecimiento de fibroblastos (FGFR3). BCG también induce la remodelación del estroma, incrementando la proliferación y diferenciación de los fibroblastos en forma directa o a través de factores producidos por los macrófagos. Este proceso es regulado negativamente por el óxido nítrico. Uno de los factores liberados por los macrófagos es el FGF-2, el cual induce esta activación de los fibroblastos. En tumores, se observa que BCG induce la disminución de la expresión del FGFR3 en las células tumorales y el incremento en la expresión de FGFR1 y FGFR2 en el estroma. En el 50% de los tumores de vejiga de pacientes, la expresión del FGFR3 disminuye por tratamiento ex vivo con BCG. El presente trabajo describe un nuevo mecanismo de acción de BCG, plantea nuevos blancos terapéuticos y posibles marcadores pronósticos para pacientes con CaV. Abstract: Bacillus Calmette-Guérin (BCG) is the standard treatment to prevent recurrences and progression of non-muscle invasive high histological grade bladder cancer (BCa). Using a murine BCa model (MB49) we have demonstrated that BCG reduces tumor growth by a) inhibiting the growth of tumor cells b) generating an anti-tumor stroma. Tumor cell growth is inhibited by activating peroxisome proliferation activated receptor gamma (PPARɣ) and the fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3) down-regulation. BCG also induces stromal remodeling, increasing fibroblast proliferation and differentiation, directly or indirectly through soluble factors produced by macrophages. This process is negatively regulated by nitric oxide. FGF-2 is one of the factors released by macrophages, which induces activation and proliferation of fibroblasts. BCG induces a decrease of FGFR3 expression in tumoral cells, while inducing an increase of FGFR1 and FGFR2 expression in stromal cells. Ex vivo treatment of bladder tumors patients with BCG produced a down-regulation of FGFR3 expression in the 50% of the cases. This paper describes a novel mechanism of action of BCG that could be useful to find new therapeutic targets and prognostic markers for patients with BCa.
Cita tipo APA: Langle, Yanina Verónica . (2014-07-11). Participación del estroma en la regresión del cáncer de vejiga inducida por Bacilo Calmette-Guérin (BCG). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5557_Langle.pdf Cita tipo Chicago: Langle, Yanina Verónica. "Participación del estroma en la regresión del cáncer de vejiga inducida por Bacilo Calmette-Guérin (BCG)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-07-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5557_Langle.pdf |
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Palottini, Florencia. "Feromona de alarma de Triatoma infestans (Hemiptera: Reduviidae). Aspectos químicos y comportamentales" (2014-06-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo general de esta Tesis fue analizar la feromona de alarma de la vinchuca Triatoma infestans y la respuesta de escape asociada. El estudio se realizó a través de experimentos comportamentales de olfatometría complementados con técnicas de química analítica (e.g. SPME y GC-MS). Adicionalmente, se estudiaron procesos cognitivos asociados a la respuesta de escape. Hasta el presente, no se ha descripto en estadios larvales de Triatominae la presencia de glándulas exocrinas que típicamente se encuentran en estadios inmaduros de Heteroptera con funciones de alarma o defensa. Sin embargo, en nuestros experimentos encontramos una clara respuesta de escape de larvas de 4° estadio enfrentadas a olores provenientes de larvas del 5° estadio mecánicamente perturbadas; y una tendencia similar frente a olores de larvas del 3er y 4º estadio perturbadas. Al analizar químicamente estos olores, se identificó un compuesto volátil sugerido como, o parte de, una feromona de alarma emitida por estadios inmaduros de T. infestans (Capítulo1). En adultos, el componente principal de la feromona de alarma, el ácido isobutírico, es liberado por las glándulas de Brindley. Se analizó la dinámica de llenado de estas glándulas, a partir de la cuantificación de la masa de dicho compuesto en insectos con distintos estados de desarrollo y condiciones de ayuno y perturbación. El contenido de ácido isobutírico en glándulas llenas de adultos sin perturbar (1 equivalente a adulto= 1EA) fue de 11,36 μg. Este contenido fue alcanzado gradualmente desde la ecdisis del imago hasta el endurecimiento de su cutícula. Luego, fue disminuyendo gradualmente al aumentar el número de perturbaciones, siendo posible la recuperación de dicho contenido luego de una alimentación. Esta dependencia de la alimentación también se evidenció con la ausencia de la respuesta de escape de larvas frente a volátiles emitidos por adultos perturbados ayunados (Capítulo 2). Con el fin de determinar qué compuestos volátiles de la feromona de alarma resultan activos, se analizó la respuesta de escape de larvas frente a distintas dosis de volátiles individuales. Se encontró que las larvas fueron repelidas por ácido isobutírico, ácido butírico, ácido acético y 2-metil-1-butanol. Frente a distintas mezclas de estos compuestos activos, se observaron respuestas de repelencia o de atracción (Capítulo 3). Finalmente, se analizó la plasticidad comportamental controlada por la experiencia previa en T. infestans, bajo un contexto de escape mediado por la feromona de alarma. Se pusieron a prueba distintas formas de aprendizaje, incluyendo protocolos asociativos y no asociativos, condicionamientos clásicos y operantes, y en todos los casos se obtuvo en mayor o menor grado algún tipo de modulación cognitiva en la respuesta de escape de las larvas frente al ácido isobutírico (Capítulo 4). Abstract: The general aim of this Thesis was to analyze the alarm pheromone of the kissing bug Triatoma infestans and the associated escape response. The study was carried out through behavioural experiments of olfactometry complemented by analytical chemistry techniques (e.g. SPME and GC-MS). In addition, we studied cognitive processes associated to the escape response. Until now, the presence of exocrine glands typically found on immature stages of Heteroptera with alarm or defence functions, has not been described in the larval stages of Triatominae. However, in our experiments we found a clear escape response of 4th instar larvae against odours coming from mechanically disturbed 5th instar larvae, and a similar trend against odours from disturbed 3rd and 4th instar larvae. A volatile suggested as, or part of, the alarm pheromone released by T. infestans larvae was identified by chemical analyses (Chapter 1). In adults, the main component of the alarm pheromone, the isobutyric acid, is released by the Brindley’s glands. We analyzed the filling dynamics of these glands by quantifying this compound in insects with different states of development and conditions of starvation and disturbance. The isobutyric acid content in full glands of undisturbed adults (1 adult equivalent= 1AE) was 11.36 μg per adult. This content was achieved gradually from the imaginal ecdysis up to the hardening of the cuticle. Then, it decreased gradually with the number of disturbance events, and fully recovered after feeding. This feeding dependence was also evidenced with the absence of escape response by the larvae when they were submitted to volatiles emitted by starved disturbed adults (Chapter 2). In order to determine which volatile compounds of the alarm pheromone are active, we analyzed the escape response of larvae exposed to individual compounds at different doses. We found that larvae were repelled by isobutyric acid, butyric acid, acetic acid and 2-methyl-1-butanol. When tested against different mixtures of these active compounds, we observed both attraction and rejection responses (Chapter 3). Finally, we analyzed the behavioural plasticity of the escape response of larvae as determined by previous exposure to the alarm pheromone. Different forms of learning were tested, including associative and non-associative protocols, classic and operant conditioning, and in all cases there was at least some degree of cognitive modulation in the escape response of larvae exposed to isobutyric acid (Chapter 4).
Cita tipo APA: Palottini, Florencia . (2014-06-30). Feromona de alarma de Triatoma infestans (Hemiptera: Reduviidae). Aspectos químicos y comportamentales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5618_Palottini.pdf Cita tipo Chicago: Palottini, Florencia. "Feromona de alarma de Triatoma infestans (Hemiptera: Reduviidae). Aspectos químicos y comportamentales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5618_Palottini.pdf |
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Eberhardt, María Ayelén Teresita. "Evaluación de la dinámica de salud en poblaciones de Hydrochoerus hydrochaeris L. 1766 (RODENTIA: Caviidae): intensidad del parasitismo gastrointestinal" (2014-06-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Con la premisa que los helmintos son causa y consecuencia de la condición de salud de sus hospedadores, este trabajo tuvo como objetivos: i. Evaluar el uso de la intensidad de los parásitos gastrointestinales específicos como herramienta para el estudio de la salud poblacional en carpinchos ii. Relacionar cargas parasitarias con factores ambientales, demográficos e interacciones interespecíficcas de parásitos co-infectantes, iii. Evaluar la relación de la intensidad del parasitismo de determinados helmintos y/o protozoarios específicos con el estrés y el estado inmuno-fisiológico del carpincho. Se recolectaron 1600 heces frescas en la ecoregión “LLagunas y Esteros del iberá”, Corrientes, desde septiembre 2010 hasta febrero de 2013. Se realizaron 72 necropsias de ejemplares de carpinchos silvestres, y se realizó un experimento con 30 carpinchos de cautiverio. A partir de los análisis coproparasitologico de las heces y los parásitos adultos, se identificaron y contabilizaron los nematodes: Vianella hydrochoeri, Hydrocherisnema anomalobursata, Trichostrongylus cf axei, Strongyloides cf. chapini, Echinocoleus hydrochoeri, Trichuris sp. y Protozoophaga obesa; cestodes del género Monoecocestus sp.; trematodes de las especies Taxorchis cabrali, T. schistocotyle e Hippocrepis hippocrepis y ooquistes de especies del genero Eimeria spp. Según los resultados obtenidos, los conteos de las formas evolutivas en materia fecal son indicativos en niveles aceptables de la carga parasitaria interna para la superfamilia Trichostrongyloidea, S. chapini y Trichuris sp. En general, no se evidenció estacionalidad marcada para ningún taxón de parásito encontrado en las heces debido a que existió una interacción entre las estaciones y el año de muestreo. Además la abundancia de las distintas especies parasitarias estuvo asociada (positiva o negativamente dependiendo del parásito) a factores ambientales (precipitaciones y temperaturas) y a las densidades del hospedador. La interacción entre nematodos (Viannaiidae) y Eimeria spp. dependió de factores ambientales y del hospedador. La relación fue positiva en algunas circunstancias (dependió de la temporada, año, sexo o tamaño de los animales), y antagónica bajo diferentes escenarios. Estas interacciones antagonistas no siguieron un patrón estacional en particular y se encontraron predominantemente en el sexo femenino (cuando dependieron del sexo) o en 2010 y 2011 (cuando dependieron del año de muestreo). Los carpinchos estresados del experimento, tuvieron significativamente mayores intensidades de infección de coccidios, pero los individuos de menor tamaño, consistentemente mostraron bajas cargas de helmintos comparado con los controles. El estrés tuvo un marcado impacto negativo sobre el crecimiento y la condición corporal, pero un efecto positivo significativo en algunos de los componentes del sistema inmune. Nuestros resultados sugieren que: i. durante los períodos prolongados de estrés los carpinchos preventivamente invierten energía en algunos componentes de su sistema inmunológico, lo que podría considerarse una profilaxis dependiente del estrés, ii. se encontró que el estrés provoca una mayor intensidad de infección de protozoos, pero cargas más bajas de nematodos, lo que indica que la relación entre el estrés, las regulaciones fisiológicas y la infección depende del tipo de parásito en cuestión. Se propone que la inversión inmune contexto-dependiente documentada en este experimento con carpinchos podría ser la causa de las diversas interacciones intra e interespecíficas documentadas para los parásitos de los carpinchos silvestres. Abstract: Helminths are cause and consequence of the health of their host condition, so the overall objetives of this study were: i. Evaluate the use of intensity of specific gastrointestinal parasites as a tool to asses the population health in capybaras; ii. Establish link between parasites loads and environmental factors, demography of the host and interspecific interactions of parasite co-infection; iii. Evaluate the impact of food restriction and physical restraint on the infection intensity of specific gastrointestinal nematodes and coccidia, and how these stressors affected the growth, body condition, and some immuno-physiological parameters. 1600 feces were collected from September 2010 to February 2013 from a population of capybaras from Esteros del Iberá, Corrientes, Argentina. 72 necropsy of wild capybaras were performed and a experiment with 30 female captive capybara was carried out. There were identified and counted nematodes: Vianella hydrochoeri, Hydrocherisnema anomalobursata, Trichostrongylus cf axei, Strongyloides cf. chapini, Echinocoleus hydrochoeri, Trichuris sp. and Protozoophaga obesa; cestodes of gen Monoecocestus sp.; trematodes: Taxorchis cabrali, T. schistocotyle and Hippocrepis hippocrepis and oocytes of species of Eimeria spp. According to results, counts of fecal evolutionary forms are indicative at acceptable levels of internal parasite burdens of Trichostrongyloidea, S. chapini and Trichuris sp. In general, no seasonality was evident for any taxon of parasite found in feces due to an interaction existed between seasons and years of sampling. Besides the abundance of different parasite species was associated (positively or negatively depending on the parasite) with environmental factors (rainfall and temperature) and densities of the host. The interaction between nematodes (Viannaiidae) and Eimeria spp. depended on environmental and host factors. The relationship was positive in some circumstances (depending on season, year, sex, or animal size), but it appeared to become antagonistic under different scenarios. These antagonist interactions did not follow a particular seasonal pattern, but they were predominantly found in females (when they depended on sex) or in 2010 and 2011 (when they depended on the sampling year). These results suggest that the relationship between coccidia and nematodes in capybaras may be context dependent. Stressed capybaras had significantly higher coccidia infection intensities; but among individuals that were smaller, those stressed consistently showed lower helminth burdens than controls. Both stress treatments had a marked negative impact on growth and body condition, but they had a significant positive effect on some components of the immune system. Our results suggest, on the one hand, that during prolonged periods of stress capybaras preventatively invest in some components of their immunity, which could be considered a stress-dependent prophylaxis. On the other hand, stress was found to cause greater infection intensities of protozoans but lower burdens of nematodes, indicating that the relationship between stress, physiological trade-offs and infection depends on the type of parasite in question. We propose that the context-dependent immune investment documented in capybaras may be the cause of these varying interactions.
Cita tipo APA: Eberhardt, María Ayelén Teresita . (2014-06-30). Evaluación de la dinámica de salud en poblaciones de Hydrochoerus hydrochaeris L. 1766 (RODENTIA: Caviidae): intensidad del parasitismo gastrointestinal. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5566_Eberhardt.pdf Cita tipo Chicago: Eberhardt, María Ayelén Teresita. "Evaluación de la dinámica de salud en poblaciones de Hydrochoerus hydrochaeris L. 1766 (RODENTIA: Caviidae): intensidad del parasitismo gastrointestinal". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5566_Eberhardt.pdf |
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Rodríguez Batiller, María José. "Regulación de la expresión de genes en plantas por fotorreceptores" (2014-06-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La luz es uno de los factores más importantes en el desarrollo de las plantas. Las mismas poseen sistemas que les permiten percibir la calidad, intensidad, dirección y duración de la luz. Existen fotorreceptores específicos que registran la señal lumínica, la cual es traducida produciendo cambios en la expresión de los genes. Los fitocromos pertenecen al grupo de fotorreceptores que absorben predominantemente longitudes de onda del rojo (R) y rojo lejano (RL). El promotor del gen Lhcb es regulado por la luz a través del sistema de los fitocromos, ya que responde a muy bajas fluencias (VLFR) y altas irradiancias (HIR) de luz mediante el fitocromo A, y a bajas fluencias (LFR) de luz mediante el fitocromo B. El análisis del promotor Lhcb reveló un motivo necesario para la respuesta HIR pero no para la respuesta VLFR. Este motivo es a su vez necesario para la unión de la proteína BEL-LIKE HOMEODOMAIN 1 (BLH1) al promotor, lo cual se pudo observar tanto en experimentos in vitro como en experimentos de simple híbrido en levaduras. Sustituciones de promotor que aumentaron la unión de BLH1 también aumentaron la respuesta HIR. En contraparte, plantas mutantes blh1 mostraron una disminución en la respuesta al RL continuo pero mantuvieron valores normales a los pulsos de RL. Esto indica que el factor de transcripción BLH1 regula específicamente el HIR y no la VLFR del fitocromo A. De este modo se pone de manifiesto un mecanismo central de control de la sensibilidad a la luz por las plantas. Entre las diversas proteínas de la familia BLH se encuentran las proteínas BLH6 y BLH5, las cual es se caracterizan por presentar una alta homología estructural con la proteína BLH1. Se estudió la expresión de BLH1 y BLH6 en plantas deficientes en blh1 y blh6 y dobles mutantes blh1 blh6. Por la medida de expresión del gen β-glucuronidasa se pudo determinar que existe una regulación mutua entre las proteínas BLH1 y BLH6. Estudios fisiológicos sobre múltiples mutantes blh1, blh5 y blh6, indicaron una función aditiva de miembros de la familia BLH. Abstract: Light is one of the most important in plant growth factors. Plants possess sensory systems that allow them to perceive quality, intensity, direction and duration of light. Specific photoreceptors perceive selected light signals, which are transmitted to produce changes in the expression of genes. Phytochromes absorb predominantly red light (R) and far-red light (FR). The promoter of the Lhcb1*2 gene is regulated by light through the system of phytochromes, as phytochrome A mediates the very-lowfluence responses (VLFR) and the high-irradiance responses (HIR), and phytochrome B mediates the low-fluence responses. Lhcb1*2 promoter analysis revealed a motif necessary for HIR but not for VLFR. This motif is necessary for binding of the protein BEL-LIKE HOMEODOMAIN 1 (BLH1) to the promoter, as revealed by both in experiments in vitro and experiments using the one hybrid system in yeast. Substitutions that increased promoter binding BLH1 also increased HIR. The blh1 mutant showed a decrease in the response to continuous FR but retained normal to pulses of RL values. This indicates that the transcription factor BLH1 specifically regulates the HIR but not the VLFR of the phytochrome A. This reveals a mechanism of control of sensitivity to light in plants. Among the various members of the BLH family, the BLH5 and BLH6 proteins are characterized by high structural similarity to BLH1. There is mutual regulation of expression between BLH1 and BLH6 proteins. Physiological studies involving double and triple mutants among blh1, blh5 and blh6 indicate an additive function of BLH family members.
Cita tipo APA: Rodríguez Batiller, María José . (2014-06-27). Regulación de la expresión de genes en plantas por fotorreceptores. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5564_RodriguezBatiller.pdf Cita tipo Chicago: Rodríguez Batiller, María José. "Regulación de la expresión de genes en plantas por fotorreceptores". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5564_RodriguezBatiller.pdf |
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Carabajal, Maira Lía. "Degradación de compuestos fenólicos por el hongo causante de pudrición blanca Trametes versicolor" (2014-06-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los hongos causantes de pudrición blanca, producen enzimas lignolíticas, inespecíficas y altamente oxidativas, con capacidad para degradar distintos contaminantes. Los compuestos fenólicos son un grupo de moléculas orgánicas cuyo uso masivo industrial condujo a la contaminación de ecosistemas acuáticos y terrestres, resultando en su clasificación como contaminantes prioritarios. En el presente trabajo se realizó un relevamiento de cepas nativas de hongos de pudrición blanca en búsqueda de microorganismos capaces de ser empleados en la degradación y detoxificación de fenoles y derivados. Como resultado de dicho relevamiento se seleccionó a Trametes versicolor BAFC 2234 por su capacidad para degradar distintos compuestos fenólicos (fenol, ácido gálico, 2,6 dimetoxifenol y guayacol) y por su habilidad para utilizar el fenol como única fuente de carbono. Se analizó el secretoma de T. versicolor creciendo en medio de cultivo natural jugo de tomate suplementado con cobre y manganeso empleando el enfoque proteómico. Se identificó un número considerable de las proteínas relacionadas con la degradación de la biomasa lignocelulósica y entre éstas, hidrolasas, peroxidasas y oxidasas fueron las enzimas más abundantes. Se purificaron diversas enzimas lignolíticas: una polifenol oxidasa (lacasa), tres Mn-peroxidasas y una versatil peroxidasa. Esta última enzima no había sido purificada previamente en esta especie. Se detectó también por primera vez presencia de peroxidasa decolorante de tintes en T. versicolor. Cultivos de T. versicolor removieron eficientemente fenol y nitrofenol, pudieron también decolorar el tinte Azure B y el licor negro, residuo proveniente de la producción de papel. T. versicolor removió el 71, 62, 74 y 73% del fenol 15 mM adicionado en tres ciclos repetidos en un periodo de 23 días, inmovilizado en esponja vegetal (Luffa aegyptiaca). El hongo inmovilizado removió el 97% del 4- nitrofenol (1 mM) luego de 3 días. Esta cepa además disminuyó la fitotoxicidad de las respectivas muestras tratadas. Se investigó la transformación del fenol por acción de sus enzimas purificadas lacasa y Mn-peroxidasa; y la del 2-, 3- y 4-nitrofenol adicionalmente por la enzima versatil peroxidasa. El hongo produjo lacasa como principal enzima lignolítica, pero esta enzima purificada no fue capaz de degradar el nitrofenol. Mn-peroxidasa y versatil peroxidasa degradaron 2- y 4-nitrofenol in vitro en porcentajes cercanos al 50%. La lacasa de T. versicolor removió 84% del fenol en 4 hs, mientras que un 43% fue removido por la Mn-peroxidasa. Tanto el estudio del secretoma de esta cepa como los ensayos de degradación in vivo e in vitro llevados a cabo, aportan información valiosa sobre el potencial empleo de esta cepa de T. versicolor en la biorremediación de efluentes industriales. Abstract: White-rot fungi produce highly oxidative ligninolytic enzymes, nonspecific, with the ability to degrade different pollutants. Phenolic compounds are a group of organic molecules which led to massive industrial pollution of aquatic and terrestrial ecosystems, and as a consequence they are classified as priority pollutants. In this research a selection of Argentinean white-rot fungi was screened for their ability to tolerate and degrade phenolic compounds, searching for organisms capable of being employed in the degradation and detoxification of phenols and derivatives. As a result of this survey was selected Trametes versicolor BAFC 2234 because of its capacity to degrade different phenolic compounds (phenol, gallic acid, 2,6 dimethoxyphenol and guaiacol) and its ability to use phenol as sole carbon source. The secretome of T. versicolor growing in tomato juice, a natural culture medium, supplemented with copper and manganese was analyzed using the proteomic approach. A considerable number of the identified proteins were related to the degradation/modification of lignocelluloses. Hydrolases, peroxidases and phenoloxidases were the most abundant enzymes produced under the above-mentioned culture conditions. Various ligninmodifying oxidoreductases were successfully purified: one polyphenol oxidase (laccase), three manganese peroxidases (MnP) and one versatile peroxidase (VP), the latter for the first time from T. versicolor. The native VP protein has a molecular mass of 45 kDa and an isoelectric point of pH 3.7. Dye decolorizing peroxidases, a just recently discovered group of heme peroxidases, were also found to be secreted by T. versicolor for the first time. The study clearly showed that complex plant-based media being rich in phenolics, such as tomato juice, can stimulate the secretion of a broad set of extracellular lignocellulolytic enzymes. Using such natural products as fungal culture media may give the opportunity to investigate plant biomass decomposition as well as the biodegradation of organic pollutants in an environment close to nature. Cultures of T. versicolor efficiently removed phenol and nitrophenol, they could also discolor the dye Azure B and black liquor, a residue from paper production. T. versicolor immobilized on a natural sponge-like material from Luffa aegyptiaca, removed between 62% and 74% of phenol (15 mM) in three repeated cycles (fed-batch) over a period of 23 days. The immobilized fungus removed 97% of 4-nitrophenol (1 mM) after 3 days. This strain also reduced phytotoxicity of the respective treated samples. Phenol conversion by the action of the purified laccase and MnP was investigated, additionally 2- , 3- and 4-nitrophenol transformation was evaluated by the action of VP. Laccase was the main oxidative enzyme activity measured during the cultivation, and the isolated enzyme oxidized in vitro 84% of phenol (0.5 mM) within 4 h, while 43% was converted by a purified MnP of this strain. After fungal treatment, phenol phytotoxicity decreased noticeably. The purified laccase was not able to degrade nitrophenol, but MnP and VP degraded around 50% of 2- and 4-nitrophenol in vitro. The concentrations of phenol removed by T. versicolor are among the highest reported so far, thus, the investigated strain may have good prospects for application in industrial wastewater treatment. For the evaluation of the degradative potential of a fungus and its lignin-modifying system, the characterization of the secretome has proven to be a useful tool, additionally the in vivo and in vitro degradation studies performed during this research, provide valuable information about the potential use of T. versicolor in bioremediation of industrial effluents.
Cita tipo APA: Carabajal, Maira Lía . (2014-06-27). Degradación de compuestos fenólicos por el hongo causante de pudrición blanca Trametes versicolor. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5571_Carabajal.pdf Cita tipo Chicago: Carabajal, Maira Lía. "Degradación de compuestos fenólicos por el hongo causante de pudrición blanca Trametes versicolor". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5571_Carabajal.pdf |
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Svartz, Gabriela Verónica. "Evaluación de la toxicidad del endosulfán, la cipermetrina y un fungicida de uso comercial, solos y en mezclas sobre el desarrollo temprano de Rhinella arenarum (Amphibia: Anura: Bufonidae)" (2014-06-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se evaluó la toxicidad aguda y crónica de dos insecticidas, endosulfán (ES) y cipermetrina (CY), y del fungicida Maxim® XL (2,5% fludioxonil, 1,0% metalaxil- M), sobre el desarrollo embrio-larval de Rhinella arenarum, un anfibio autóctono de Argentina. Los resultados mostraron que los insecticidas fueron más tóxicos (el ES en el período agudo y la CY en el periodo crónico) en relación al fungicida. La susceptibilidad a estos agroquímicos fue estadio-dependiente encontrándose un patrón diferente para las tres sustancias de acuerdo al modo de acción de cada una de ellas. La toxicidad de los insecticidas aumentó significativamente en los estadios tardíos, siendo el periodo larval el más sensible y causando severas alteraciones en el comportamiento en concordancia con su acción neurotóxica. Por el contrario, la mayor toxicidad del Maxim® XL fue observada en los estadios embrionarios tempranos (blástula el más sensible), con severos efectos teratogénicos. La interacción de ES y CY en mezclas, mostraron tanto un efecto antagónico como aditivo durante los periodos agudo y crónico corto, así como sinergismo durante el periodo crónico. La toxicidad de un formulado comercial con CY resultó hasta 7 veces mayor que la del ingrediente activo, hecho muy relevante considerando que es el producto comercial el que efectivamente se aplica en los cultivos. Teniendo en cuenta los resultados de toxicidad y el análisis de peligrosidad, estos tres agroquímicos utilizados a nivel mundial, y en particular en nuestro país, podrían poner en riesgo la continuidad de las poblaciones de esta especie representativa de la herpetofauna regional asociada a los agroecosistemas de nuestro país. Abstract: The acute and chronic toxicity of two insecticides, endosulfan (ES) and cypermethrin (CY), and of the Maxim® XL fungicide (2.5% fludioxonil, 1.0% metalaxyl- M) was assessed on the embryo-larval development of Rhinella arenarum, a native amphibian of Argentina. The results showed that the insecticides were more toxic (ES during the acute exposure period and CY during the chronic exposure period) than the fungicide. The sensitivity to these agrochemicals was stage-dependent establishing a different pattern for the three substances according to their mode of action. The toxicity of the insecticides was significantly increased in later stages, the larval period being the most sensitive, and causing severe alterations in behaviour consistent with its neurotoxic action. In contrast, the greater toxicity of Maxim® XL was observed at early embryonic stages (blastula stage being the most sensitive), with severe teratogenic effects. The interaction of ES and CY in mixtures showed antagonistic and additive effects during the acute and short term chronic periods, and synergism during the chronic period. The toxicity of a CY commercial formulation was 7 times greater than the active ingredient, a very relevant fact considering that the commercial product is actually applied on crops. Taking into account the results of toxicity and hazard assessment, these three agrochemicals worldwide used, and particularly in our country, could threaten the continuity of populations of this species, representative of the regional herpetofauna associated to agroecosystems of our country.
Cita tipo APA: Svartz, Gabriela Verónica . (2014-06-26). Evaluación de la toxicidad del endosulfán, la cipermetrina y un fungicida de uso comercial, solos y en mezclas sobre el desarrollo temprano de Rhinella arenarum (Amphibia: Anura: Bufonidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5572_Svartz.pdf Cita tipo Chicago: Svartz, Gabriela Verónica. "Evaluación de la toxicidad del endosulfán, la cipermetrina y un fungicida de uso comercial, solos y en mezclas sobre el desarrollo temprano de Rhinella arenarum (Amphibia: Anura: Bufonidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5572_Svartz.pdf |
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Arrieta, Alejandro Matías. "Los endofitos fúngicos como inductores de cambios en la rizósfera de gramíneas nativas" (2014-06-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las especies asexuales del género Epichloë Tul (Clavicipictaceae, Hypocreales, Ascomycota) establecen simbiosis mutualista con diferentes especies de gramíneas (C3) muchas de ellas de interés agronómico. El objetivo de esta tesis fue evaluar el efecto de las simbiosis entre gramíneas nativas y endofitos asexuales Epichloë sobre la diversidad fúngica de la rizósfera. Se postuló que la simbiosis Bromus auleticus – Epichloë pampeana modificaría la estructura de la comunidad del suelo debido a que los endofitos producen metabolitos en el interior de la planta los cuales son excretados por el sistema radical. Para poner a prueba la hipótesis, se realizó un ensayo en vivero con diversos tiempos de muestreo en el cual se evaluaron diferentes parámetros. Semillas de B. auleticus asociadas (E+) o no asociadas (E-) a E. pampeana fueron sembradas en macetas con dos tipos de suelo (Agronómico y No Agronómico). Se evaluó el efecto de la interacción gramínea-endofito y del uso agronómico del suelo mediante identificación por análisis macro y micromorfológico, metagenómico y cultivo en medios selectivos. La presencia de E. pampeana en las plantas de B. auleticus se asoció con un aumento de la diversidad de hongos saprobios de la rizósfera, un aumento del porcentaje de micorrización, y sumado a esto, un incremento de la diversidad de los hongos micorrícicos en suelos No Agronómico. También se evidenció un incremento de especies micorrícicas con mayor capacidad para movilizar fósforo (P), en asociación a plantas E+ en comparación a las E-, en muestras de suelo Agronómico. No se detectó un efecto significativo del estatus endofítico ni de los suelos sobre la cantidad de hongos solubilizadores de P, pero si se observó un efecto sobre su diversidad atribuible a la introducción de B. auleticus. En cuanto a su rol defensivo frente a especies parásitas y/o potenciales patógenos, no se observaron deferencias entre los diferentes tratamientos en cuanto al porcentaje de colonización de las raíces por Chytridiomycetes, pero si se detectó un aumento en el porcentaje de mortalidad de plantas E- de B. auleticus en comparación a las E+. Los resultados obtenidos en ésta tesis ponen en evidencia el efecto de los endofitos asexuales Epichloë en el entorno en el que se desarrolla su hospedante, lo cual señala la relevancia de este modelo para el estudio no sólo de la simbiosis planta-endofito sino también de múltiples interacciones, con el valor agregado de ser B. auleticus una gramínea nativa de interés agronómico. Abstract: Asexual species of the genus Epichloë Tul (Clavicipitaceae, Hypocreales, Ascomycota) establish mutualistic symbiosis with different species of C3 grasses, many of them of agronomic interest. The aim of this work was to evaluate the effect of the symbiosis established between native grasses and asexual Epichloë endophytes on the fungal diversity of the rhizosphere. It was postulated that the symbiosis Bromus auleticus – Epichloë pampeana could modify the structure of the soil community as endophytes produce metabolites within the plant which are excreted by the root system. To test this hypothesis, a greenhouse assay was conducted in with different sampling times, in which different parameters were evaluated. Seeds of B. auleticus associated (E+) or not (E-) with E. pampeana were sown in pots with two different soil types (Agricultural and Non- Agricultural). The effect of the interaction grass - endophyte and the agronomical management of soil was evaluated through identification by clasical taxonomic techniques, high-throughput analysis and cultivation on selective media. The presence of E. pampeana in plants of B. auleticus was associated with an increase in the diversity of saprobe fungi in the rhizosphere, in the percentage of mycorrhizal colonization, and also, in the diversity of mycorrhizal fungi in Non Agricultural soil. In addition, an increase was evidenced on mycorrhizal species with a greater capacity to mobilize phosphorus (P) in E+ plants in comparison to E-, in Agricultural soil samples. However, it was not detected a significant effect of the association nor the soils used over the P solubilizing fungi amount. But it did was observed an increase in its diversity, attributable to the introduction of B. auleticus. Regarding the defensive role against parasitic species and/or potential pathogens, although no significant differences on the percentage of root colonization by Chytridiomycetes were found between the different treatments, it was detected a significant increase in the mortality percentage of B. auleticus E- plants of compared to E +. The results obtained in this thesis highlight the effect of Epichloë asexual endophytes in the environment where the host develops , which indicates the relevance of this model for the study not only of the symbiosis established between plant-endophytes but also for multiple interactions, combined with the agronomic interest B. auleticus a native grass.
Cita tipo APA: Arrieta, Alejandro Matías . (2014-06-23). Los endofitos fúngicos como inductores de cambios en la rizósfera de gramíneas nativas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5559_Arrieta.pdf Cita tipo Chicago: Arrieta, Alejandro Matías. "Los endofitos fúngicos como inductores de cambios en la rizósfera de gramíneas nativas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5559_Arrieta.pdf |
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Villarreal, Alejandro. "El papel de la interacción entre neuronas y glía mediada por S100B/RAGE en la propagación del daño luego de la isquemia cerebral" (2014-06-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La isquemia cerebral es un grave problema para la Salud Pública en países emergentes como la Argentina. Aún no se conocen completamente los mecanismos celulares y moleculares que participan de la propagación del daño desde la zona del infarto isquémico (core) hacia las zonas cercanas del cerebro que se definen como área de la penumbra isquémica. Esta expansión del daño hacia zonas distales a la lesión isquémica original es lo que define el mal pronóstico de los pacientes. Las moléculas asociadas al daño o DAMP (del inglés Damage Associatted Molecular Pattern) como la proteína astroglial S100B aumentan en el espacio extracelular luego de la isquemia y son capaces de activar la respuesta inmune innata mediada por los receptores de patrones moleculares (PRR, del inglés Pattern Recognition Receptor). Considerando que S100B ha demostrado tener acciones sobre astrocitos y neuronas en cultivo, nuestra hipótesis de trabajo propuso que la liberación local de S100B desde el core isquémico activaría el PRR RAGE, facilitando la respuesta inflamatoria, y extendería así el daño hacia el tejido cerebral circundante. Utilizando un modelo de isquemia cerebral en animales de experimentación, administraciones intra-corticales de S100B purificada, cultivos puros neuronales y cultivos enriquecidos en astrocitos pudimos establecer que: i) S100B induce la sobrevida o muerte neuronal en neuronas expuestas a excitotoxicidad por glutamato en una forma dependiente de la dosis, de la expresión de RAGE y de la activación del factor de transcripción NF-κB; ii) S100B facilita la conversión de los astrocitos hacia el fenotipo reactivo proinflamatorio en forma RAGE/NF-κB dependiente; iii) S100B liberada desde un foco en el parénquima cerebral induce cambios en astrocitos similares a los observados días después de la lesión isquémica. En función de nuestros resultados proponemos que en las zonas vecinas al core isquemico S100B tendría efectos neurodegenerativos directos o en forma secundaria promoviendo la conversión astroglial hacia un fenotipo proinflamatorio activando la ruta RAGE/NF-κB. Esta cascada intracelular emerge como un tentador blanco molecular para futuras estrategias terapéuticas. Abstract: Brain ischemia represents a serious problem for Public Health in developing countries such as Argentina. The molecular and cellular mechanisms that participate in damage propagation from the ischemic infarct region (core) towards neighbor regions of the brain (defined as ischemic penumbra) are not fully understood. The penumbra damage determines the bad prognosis for patient outcome. Damage associated molecular patterns (DAMPs) like astroglial protein S100B are increased in the extracellular space after ischemia and are capable of activating innate immune response by engaging pattern recognition receptors (PPR). Considering that S100B has shown to have effects on astrocytes and neurons in vitro, our work hypothesis proposed that local release of S100B from the ischemic core could activate the PRR receptor named RAGE, facilitating inflammatory response and expanding damage to the limiting regions of brain tissue. Using an experimental model of brain ischemia in laboratory animals, intra-cortical infusions of purified S100B and neuronal or astroglial cultures we have been able to establish that: i) S100B promotes death or survival in neurons exposed to glutamate induced excitotoxicity in a dose dependent manner and requiring, RAGE expression and activation of transcription factor NF-κB ii) S100B facilitates astrocyte conversion towards a reactive and proinflamatory phenotype in a RAGE/NF-κB dependent manner; iii) S100B released from a focal spot in brain parenchyma induces changes on astrocytes that are similar to those observed in ischemic injury in vivo. Based on our results we propose that S100B might have neurodegenerative effects directly on neurons or indirectly by promoting the astroglial conversion towards a pro-immflamatory phenotype after engaging the RAGE/NF-κB pathway. This intracellular pathway emerges as a tempting molecular target for future therapeutic strategies.
Cita tipo APA: Villarreal, Alejandro . (2014-06-18). El papel de la interacción entre neuronas y glía mediada por S100B/RAGE en la propagación del daño luego de la isquemia cerebral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5543_Villarreal.pdf Cita tipo Chicago: Villarreal, Alejandro. "El papel de la interacción entre neuronas y glía mediada por S100B/RAGE en la propagación del daño luego de la isquemia cerebral". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5543_Villarreal.pdf |
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Ponzio, Pablo Daniel. "Cómputo secuencial eficiente de cotas ajustadas, y su impacto en la performance de los análisis de programas basados en SAT" (2014-06-13). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Dada una descripción formal de los estados válidos del heap -por ejemplo, un invariante de una estructuras de datos- las cotas ajustadas para los campos del heap son el conjunto de los valores que pueden tomar los campos en alguna instancia válida. Así, los valores de campos que no pertenecen a las cotas ajustadas pueden ser ignorados por los análisis automáticos (acotados) de código, reduciendo así el espacio de estados a explorar, y mejorando la performance del análisis. Sin embargo, el cómputo de cotas ajustadas es costoso. El único enfoque conocido que computa estas cotas en un tiempo aceptable, TACO+, es intrínsecamente paralelo, y requiere de un cluster con varias computadoras para su ejecución eficiente. En este trabajo se aborda el problema de computar eficientemente cotas ajustadas en entornos de ejecución secuenciales. Así, se presentan dos nuevos enfoques para resolver este problema. El primero, denominado bottom-up, utiliza un procedimiento de decisión basado en SAT para visitar instancias válidas del heap, y computa cotas ajustadas usando los valores de los campos de estas instancias. bottom-up, al igual que TACO+, requiere de una especificación en algún lenguaje declarativo de alto nivel -como JML para JAVA- de los estados válidos del heap. De esta manera, bottom-up y TACO+ generan cotas ajustadas equivalentes. El segundo, SLBD, se basa en una especificación del heap en términos de un predicado inductivo de la lógica de separación. Este enfoque computa cotas ajustadas mientras realiza (un número finito de) desplegados del predicado inductivo de entrada. En algunos casos SLBD puede producir cotas ajustadas diferentes a las de TACO+ (y bottom-up). Se evaluaron experimentalmente los enfoques bottom-up, SLBD y la técnica relacionada TACO+, en la generación de cotas ajustadas para varias clases contenedoras JAVA. Los resultados muestran que, en un ambiente de ejecución secuencial, bottom-up es un orden de magnitud más rápido que TACO+ (secuencializado), y que SLBD es dos órdenes de magnitud más rápido que bottom-up. Además, se evaluó el impacto de las cotas ajustadas generadas por nuestros enfoques en la veri ficación de código y en la generación exhaustiva de estructuras (que satisfacen un predicado) basados en SAT. Los resultados indican que los enfoques que computan cotas ajustadas secuencialmente (vía bottom-up o SLBD), y luego las aprovechan durante el análisis, son significativamente más eficientes que los análisis convencionales, que no explotan la idea de cotas ajustadas. Además, para los análisis basados en SAT mencionados, los resultados muestran que las cotas ajustadas computadas por SLBD tienen un impacto similar a las computadas por TACO+ y bottom-up. Abstract: Given a formal description of the feasible heap states -for example, an invariant for a data structure-, tight field bounds for heap fields are the set of values that the fields can take in any valid instance. Thus, field values that do not belong to the tight field bounds can be safely ignored by automated (bounded) program analyses, reducing the state space to be explored, and improving the performance of the analysis. However, computing tight field bounds is an expensive process. The only known approach to compute these bounds that performs reasonably, TACO+, is intrinsically parallel, and it requires a cluster of several computers to run efficiently. In this work we address the problem of computing tight field bounds efficiently under a secuential execution environment. Thus, we introduce two novel approaches to solve this problem. The first, called bottom-up, uses a SAT based decision procedure to traverse valid heap instances, and computes tight field bounds using the field values of the visited instances. bottom-up, like TACO+, requires a description of the feasible heap states in a high level declarative language -like JML for JAVA-. In this way, bottom-up and TACO+ yield equivalent tight field bounds. The second, SLBD, is based on a specification of the valid heap states in terms of a separation logic's inductive predicate. This approach computes tight field bounds during the process of unfolding its input's inductive predicate (a finite number of times). In some cases, the tight field bounds computed by SLBD and TACO+ (and bottom-up) might differ. We assessed bottom-up, SLBD and the related technique TACO+ experimentally, in generating tight field bounds for several JAVA container classes. The results show that, under a secuential execution environment, bottom-up is an order of magnitude faster than TACO+ (secuentialized), and that SLBD is two orders of magnitude faster than bottom-up. Moreover, we assesed the impact of the tight field bounds produced by our approaches in SAT based code analysis and in exhaustive bounded generation of structures (satisfying a predicate). The results show that the approaches that compute tight field bounds secuentially (via bottom-up or SLBD), and subsecuently exploit them during analysis, are significatively faster than the more conventional analyses that do not take advantage of tight field bounds. Furthermore, for the aformentioned SAT based analyses, the experiments show that the tight field bounds computed by SLBD have a similar impact to those computed by TACO+ and bottom-up.
Cita tipo APA: Ponzio, Pablo Daniel . (2014-06-13). Cómputo secuencial eficiente de cotas ajustadas, y su impacto en la performance de los análisis de programas basados en SAT. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5547_Ponzio.pdf Cita tipo Chicago: Ponzio, Pablo Daniel. "Cómputo secuencial eficiente de cotas ajustadas, y su impacto en la performance de los análisis de programas basados en SAT". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-13. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5547_Ponzio.pdf |
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Krzymuski, Martín Javier. "Determinantes moleculares involucrados en la relación cuantitativa entre el tiempo a floración y el fotoperíodo en Arabidopsis thaliana" (2014-06-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El éxito reproductivo de las angiospermas se encuentra fuertemente afectado por el momento del año en que ocurra la floración, que en numerosas especies es ajustado mediante la percepción del fotoperíodo. En la presente tesis se demuestra que en Arabidopsis thaliana el requerimiento de varios días largos para florecer se vincula a la necesidad de mantener elevados niveles de expresión de FLOWERING LOCUS T (FT) durante varios días para inducir la expresión de genes florales del meristema, siendo los tiempos a floración proporcionales a la integral de la expresión de FT. A su vez, este proceso presenta un ritmo de sensibilidad a FT, cuya fase de alta sensibilidad se encuentra entre ZT12 y ZT20. Por otro lado, CONSTANS (CO), que promueve la expresión de FT en condiciones fotoperiódicas inductoras, demora la floración en Arabidopsis bajo días cortos. Este efecto no está mediado por la represión de FT, como sucede en arroz con el homólogo de CO, sino vía el represor meristemático TERMINAL FLOWER 1 (TFL1). CO modula el momento diario expresión de TFL1, registrándose los mayores valores en la ventana del día en que plantas son más sensibles a FT. La presencia de TFL1 en este rango ayudaría a establecer un umbral mínimo de FT. En conjunto, los resultados sugieren que los mecanismos de integración de la señal fotoperiódica tenderían a reducir las probabilidades que la floración ocurra cuando las condiciones externas son adversas, debido a fluctuaciones en la expresión de FT vinculadas a otros factores del ambiente. Abstract: Reproductive success in angiosperms is closely related to the time of the year when flowering occurs, which in many species is adjusted via the perception of the photoperiod. This thesis shows that in Arabidopsis thaliana the requirement of several long days for flowering to occur is related to the need of maintaining high levels of FLOWERING LOCUS T (FT) expression for several days to induce the expression of floral identity genes. This process involves a rhythm of sensitivity to FT, in which the phase of high sensitivity is between ZT12 and ZT20. Additionally, CONSTANS (CO), which promotes FT expression under inductive photoperiod conditions, delays flowering in Arabidopsis under short days. This effect is not mediated by FT repression, as it occurs in rice with the CO homolog, but it involves the meristem repressor TERMINAL FLOWER 1 (TLF1). CO modulates the daily pattern of TFL1 expression, with higher values within the daily window in which plants are actually more sensitive to FT. Taken together, the results suggest that the mechanism of photoperiod signal integration could reduce the chances of flowering when the external conditions are adverse, due to fluctuations in FT expression linked with other environmental factors.
Cita tipo APA: Krzymuski, Martín Javier . (2014-06-10). Determinantes moleculares involucrados en la relación cuantitativa entre el tiempo a floración y el fotoperíodo en Arabidopsis thaliana. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5597_Krzymuski.pdf Cita tipo Chicago: Krzymuski, Martín Javier. "Determinantes moleculares involucrados en la relación cuantitativa entre el tiempo a floración y el fotoperíodo en Arabidopsis thaliana". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-06-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5597_Krzymuski.pdf |
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Guardia, Carlos M.A.. "Del átomo a la célula: determinantes moleculares que definen la función de galectinas humanas" (2014-05-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las galectinas constituyen una familia de proteínas altamente conservadas a través de la evolución con capacidad de unir carbohidratos presentes en diferentes glicoproteínas de la membrana plasmática y la matriz extracelular. Estas proteínas reconocen en forma específica unidades repetidas de N-acetil lactosamina presentes en N- y O-glicanos. El énfasis del trabajo se centró en determinar los detalles estructurales que diferencian a cada una de estas proteínas, buscando correlaciones entre la dinámica molecular, la estabilidad y la selectividad de unión a glicanos para desencadenar la función celular para la que han sido evolutivamente selecccionadas. A través de una aproximación multidisciplinaria, se empleó una variedad de técnicas de simulación computacional y diversas estrategias experimentales para estudiar los mecanismos y determinantes moleculares de regulación de la unión a glicanos en galectinas y posterior activación de su función en diversos cultivos celulares. Las metodologías empleadas consistieron desde simulaciones de dinámica molecular clásica hasta la expresión y purificación de proteínas recombinantes y ensayos de unión al ligando, cinéticas de oxidación y apoptosis in vitro mediantes citometría de flujo y diversas técnicas de microscopía óptica y electrónica. En primer lugar, este estudio se ha centrado en la caracterización y comparacion estructural y dinámica de cada galectina y su especificidad por diversos glicanos fisiológicamente relevantes. En segundo lugar, se ha estudiado el mecanismo de oxidación y función de enlaces disulfuro en galectina-1, proponiendo la existencia de un interruptor molecular presente sólo en este miembro de la familia. El mismo explicaría el cambio de función al cambiar de estado redox. Por último, se estudió el impacto de la estructura cuaternaria en la unión a glicanos específicos en glicoproteínas y la formación de redes supramoleculares de glicanos en la superficie de la célula. Abstract: Galectins are members of a family of highly conserved proteins characterized by the ability to bind saccharide motifs in various cell glycoproteins and the extracellular matrix. These proteins specifically recognize repeating units of N-acetyl lactosamine present in N- and O-glycans. The aim of this work was to define the details and structural motifs that distinguish each individual member of the galectin family, seeking for correlations between the molecular dynamics, stability and selectivity for glycans displayed by these lectins and their proposed functional activity. Using a multidisciplinary approach, in the present study we used a wide variety of computational simulation tools and different experimental approaches to explore the mechanisms and molecular determinants that regulate glycan binding of galectins in cell cultures. The employed methodologies ranged from classical molecular dynamics simulations to the expression and purification of recombinant proteins and ligand-binding assays, oxidation kinetics and apoptosis assays using flow cytometry and various optical and electronic microscopy techniques. First, we have focused on the structural characterization and comparison of molecular dynamics of each galectin in the vicinity of their ligand binding site and mechanism of oxidation and disulfide bond formation in galectin-1 protein, seggesting the presence of a molecular switch that explains the function change during redox state turnover. Finally, we studied the impact of the quaternary structure in the binding properties of galectins to specific glycans and analyzed the ability of galectin-1 to form supramolecular membrane structures called lattices when they interact with specific glycans on the surface of target cells.
Cita tipo APA: Guardia, Carlos M.A. . (2014-05-30). Del átomo a la célula: determinantes moleculares que definen la función de galectinas humanas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5585_Guardia.pdf Cita tipo Chicago: Guardia, Carlos M.A.. "Del átomo a la célula: determinantes moleculares que definen la función de galectinas humanas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-05-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5585_Guardia.pdf |
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Giménez Molinelli, Pedro A.. "Transiciones de fase en sistemas nucleares finitos e infinitos" (2014-05-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En la presente tesis estudiamos transiciones de fase en sistemas formados por partículas que interactúan a través de potenciales clásicos que modelan las interacciones entre nucleones. Mediante técnicas de dinámica molecular, simulamos colisiones de Iones Pesados en el rango de energías en el que se observa Multifragmentación. Auxiliados con avanzados algoritmos de reconocimiento de fragmentos, que utilizan información de correlaciones en el espacio de fases y no solo configuracional, investigamos el origen de diversas señales que permiten caracterizar el proceso de multifragmentación como una transición de fase: bimodalidad en la distribución del parámetro de orden, y fluctuaciones en el tamaño del fragmento más pesado. Mostramos que esas señales están determinadas en etapas muy tempranas, antes de que el sistema logre alcanzar un equilibrio que justifique plenamente el uso de herramientas de la termodinámica usual. Asimismo, determinamos que la observación de bimodalidad está fuertemente relacionada con los protocolos de selección de eventos. Investigamos además la factibilidad de utilizar el parámetro α de Isoscaling para determinar el término de simetría en la ecuación de estado, como se ha propuesto. Con ese fin, ajustamos las energías de “núcleos” con una fórmula en el espíritu de la “fórmula semi-empírica de masas” para dos parametrizaciones del potencial nuclear y mostramos que presentan distintos términos de simetría. Y luego, a partir de simulaciones adecuadas, observamos que en general es imposible distinguir los resultados de los dos modelos debido a efectos entrópicos. Con el mismo modelo de interacción nuclear y un tratamiento adecuado de la interacción de Coulomb, extendimos el estudio a transiciones de fase morfológicas en sistemas “infinitos” de nucleones, como un modelo de “materia de estrellas de neutrones”. Para ello realizamos simulaciones de dinámica molecular bajo condiciones periódicas de contorno a temperatura y densidad fijas. A densidades de sub-saturación y bajas temperaturas, como las que ocurrirían en la corteza de las estrellas de neutrones, este modelo logra producir una serie de fases in-homogéneas llamadas “Pasta Nuclear”, que surgen de la competencia entre las interacciones Nuclear y Coulombiana para nucleones en “bulk”. Desarrollamos un conjunto de herramientas de caracterización dinámica y topológica que permiten una clasificación unívoca de esas fases. Estudiando el rol de la interacción de Coulomb en la formación de estas estructuras, hallamos que estructuras similares pueden ser producidas en simulaciones incluso sin esa interacción, debido a efectos secundarios de las condiciones periódicas de contorno que, sorprendentemente, no habían sido descritos en la literatura. Esto nos permitió describir con precisión los “efectos de tamaño finito”, propios de este tipo de simulaciones, e identificar las estructuras “reales” de aquellas que están afectadas por aspectos artificiales de las simulaciones. Abstract: In the present thesis we study phase transitions in systems of particles that interact through classical potentials which mimic the nuclear interaction. Using molecular dynamics techniques we simulate Heavy Ion collisions in the energy range where multifragmentation is observed. Assisted with advanced fragment recognition algorithms, which use information from the whole phase space and not only configurational, we investigated the origin of several signals that allow to characterize multifragmentation as a phase transition: bimodality in the order parameter distribution and large fluctuations in the mass of the largest fragment. We show these signals to be established at early stages, before the system can reach an equilibrium which would justify the use of usual thermodynamics tools. Also, we determined that bimodality is strongly related to the event selection criterion. In addition, we investigated the factibility of using the isoscaling parameter α to determine the value of the symmetry term in the nuclear equation of state. To that effect, we adjusted the energy of “nuclei” with a formula in the spirit of the “Semi-empirical Mass Formula” for two parametrizations of the nuclear potential and showed that they present different symmetry terms. Then, with the appropriate simulations, we showed that it is in general impossible to distinguish the results from both models due to entropic effects dominating. With the same model of nuclear interaction and an adequate treatment of the Coulomb interaction, we extended the study to morphological phase transitions in “infinite” systems of nucleons, as a model of “neutron star matter”. To do so we performed molecular dynamics simulations under periodic boundary conditions at fixed temperature and density. At sub-saturation densities and low temperatures, as those expected in the crust of neutron stars, this model is able to produce a series of non-homogeneous phases known as “Nuclear Pasta”, which emerge from the competition of nuclear and Coulomb interaction for nucleons in bulk. We developed a set of dynamical and topological characterization tools that allow for a thorough classification of those phases. When studying the role of the Coulomb interaction in the formation of these structures, we found that similar structures can be produced in simulations without said interaction but due to secondary effects of the periodic boundary conditions which, surprisingly, had not been described in the literature. This enabled us to describe with precision the role of “finite size effects” and to identify the “true Pasta” from those affected by artificial aspects of the simulations.
Cita tipo APA: Giménez Molinelli, Pedro A. . (2014-05-21). Transiciones de fase en sistemas nucleares finitos e infinitos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5545_GimenezMolinelli.pdf Cita tipo Chicago: Giménez Molinelli, Pedro A.. "Transiciones de fase en sistemas nucleares finitos e infinitos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-05-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5545_GimenezMolinelli.pdf |
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Semino, Rocío. "Solvatación de protones en soluciones y agregados mesoscópicos agua-acetona" (2014-05-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El fenómeno de transferencia protónica es ubicuo y de fundamental importancia en la química de soluciones. En medio acuoso, la dinámica del protón está controlada por el mecanismo de Grotthuss, que considera a la carga en exceso como un "defecto" en la red de puentes hidrógeno del agua. El protón se transfiere entre moléculas vecinas a través de rupturas y formaciones de uniones hidrógeno, en tiempos del orden del picosegundo. En este trabajo analizamos las características de la solvatación y dinámica de protones en exceso en dos sistemas que involucran mezclas agua-acetona: por un lado, soluciones macroscópicas homogéneas; por otro, agregados de dimensiones nanométricas. Para ello, hemos realizado simulaciones de dinámica molecular, utilizando un Hamiltoniano de multiestados de enlaces de valencia, que incluye la posibilidad de translocación de protón. Para el análisis de las mezclas macroscópicas, también hemos realizado mediciones directas de conductividad eléctrica. Nuestros experimentos directos muestran que la incorporación de acetona provoca una paulatina disminución de la brecha que separa las conductividades molares a dilución infinita de HCl y LiCl, hasta igualarse para xw ~ 0,25. Esto sugiere que la contribución del mecanismo de Grotthuss a la movilidad protónica se vuelve cada vez menos significativa al aumentar el contenido de acetona. Asimismo, observamos un cambio cualitativo en la tendencia de la conductividad de HCl con la composición, alrededor de Xw ~ 0,8. Por otra parte, nuestras simulaciones muestran tendencias similares a las de los resultados experimentales. En todas las mezclas estudiadas, la estructura más estable para el protón es la de un complejo Eigen, +, que incluye tres moléculas de agua aceptoras de puente hidrógeno, y ausencia de conectividad de tipo HOH ... +. Las modificaciones en el entorno del protón tienen lugar en la segunda capa de solvatación del "hidronio", que comienza a incorporar solvente aprótico en mezclas con Xw ≤ 0,8. El incremento en el contenido de acetona se traduce en velocidades de transferencia y difusión menores. El mecanismo de transferencia protónica en soluciones de composiciones intermedias, 0,25 ≤ Xw ≤ 0,8, parece estar controlado por intercambios agua - acetona en la segunda capa de solvatación del "hidronio". Este proceso daría lugar a la formación de un complejo activado con estructura Zundel, +, completamente hidratado. La probabilidad de que se forme el complejo activado comienza a ser apreciable para Xw ~ 0,25, lo que coincide con el comienzo de aportes significativos de mecanismos de tipo Grotthuss a la difusión del protón. Por último, analizamos agregados mesoscópicos mixtos de tipo + con m = 50 y n = 6, 25 y 100. Encontramos que los agregados en los que predomina el agua exhiben un núcleo acuoso parcialmente recubierto por una capa de acetona. En este caso, el protón forma un complejo Eigen que se encuentra predominantemente en la superficie del núcleo acuoso, con 3-4 moléculas de acetona en su segunda capa de solvatación. Esto lleva a que la dinámica de translocación del protón se vuelva mucho más lenta respecto de la observada para las mezclas macroscópicas de igual composición, llegando a la escala del nanosegundo. El mecanismo de transferencia parece ser similar al propuesto para mezclas macroscópicas, con un ingrediente adicional: una "inmersión" preliminar de la carga en el núcleo acuoso. Por último, para n = 100, observamos incipiente miscibilidad. En este caso, el protón se ubica en dominios acuosos de forma irregular, de manera tal que su segunda capa de solvatación se encuentra completamente saturada de acetona. No hemos observado transferencias para este agregado en trayectorias de ~ 30 ns de duración. Abstract: Proton transfer is an ubiquitous phenomenon and it is of paramount relevance in solution chemistry. In aqueous media, proton transfer episodes take place in the picosecond timescale, and are controlled by the well-known Grotthuss mechanism. The transferences involve translocations of the average position of the excess charge, which require successive spatial rearrangements along chains of hydrogen bonds. In this work, we analyze structural and dynamical characteristics of the proton solvation in two different systems involving water-acetone mixtures: on the one hand, bulk mixtures; on the other hand, mesoscopic nanoclusters. We used molecular dynamics simulation techniques and, in the bulk study, we complemented our simulation results with direct electrical conductivity measurements. The theoretical approach was based on a multistate empirical valence bond Hamiltonian model that incorporates a proton translocation mechanism. Our direct experiments show that the ratio between HCl and LiCl conductivities at infinite dilution is practically unity for acetone-rich solutions, up to Xw ~ 0,25. At this composition, the acid conductivity exceeds the corresponding one for the salt, and the Grotthuss mechanism gradually activates, as the water content is increased. Moreover, we observed a qualitative change in HCl conductivity around Xw ~ 0,8. Furthermore, our simulations are in excellent agreement with the experimental results. For all mixtures studied, we have verified that the structure of the first solvation shell of the hydronium moiety is composed of three water molecules acting as hydrogen bond acceptors, +, with no evidence of HOH ... + connectivity. At Xw ~ 0,8, the concentration dependences of rates of proton transfer and diffusivity, change at a qualitative level. The origins of this transition can be traced back to modifications operated in the nearby, second solvation shell of the excess charge which, in acetone rich solutions, normally includes at least one acetone molecule. Our results suggest that one possible mechanism controlling the proton transfer in 0,25 < Xw < 0,8 solutions, is the exchange of one of these tagged acetone molecules by nearby water ones. This exchange would give rise to a Zundel-like activated complex, +, exhibiting a symmetric, first solvation shell composed exclusively of water molecules. The probability of finding such a structure becomes physically meaningful at Xw ~ 0,25, a composition that coincides with the onset of significant contributions from Grotthuss-like mechanisms to the proton diffusion. Finally, we present results for binary mesoscopic aggregates of the type +, with m = 50 and n = 6, 25 and 100. We found that, at low acetone contents, the clusters consist of a water core partially coated by acetone. The proton lies at the surface of the water core, with at least three acetone molecules in its second solvation shell. The transfer dynamics appears to be much slower than in bulk mixtures of equal composition, reaching the nanosecond timescale. In these clusters, the proton transfer mechanism seems to be controlled not only by water-acetone exchanges at the second solvation shell of the hydronium, as it was in bulk mixtures, but also by a preliminary proton "immersion" in the underlying water core. For n = 100, we found evidence of incipient water-acetone miscibility. At this composition, the proton resides in aqueous domains of irregular shape, fully embedded within the acetone phase, with its closest solvation shell comprising three water molecules, followed by a second one fully composed of acetone. In the latter case, we did not detect proton transfer events along ~ 30 ns trajectories.
Cita tipo APA: Semino, Rocío . (2014-05-16). Solvatación de protones en soluciones y agregados mesoscópicos agua-acetona. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5539_Semino.pdf Cita tipo Chicago: Semino, Rocío. "Solvatación de protones en soluciones y agregados mesoscópicos agua-acetona". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-05-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5539_Semino.pdf |
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Di Fiori, Eugenia. "Impacto conjunto de dos agentes antropogénicos de cambio ambiental: efecto del herbicida glifosato y del mejillón invasor Limnoperna fortunei en ecosistemas de agua dulce" (2014-05-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El hombre ha generado durante las últimas décadas un importante cambio en los ecosistemas que lo sostienen. En la naturaleza los agentes de impacto ambiental no actúan de forma aislada sino por el contrario operan de manera conjunta, pudiendo provocar importantes cambios sobre las comunidades afectadas. En este sentido, el objetivo de la tesis fue analizar el efecto de la interacción de dos factores de cambio introducidos por la actividad humana sobre los ecosistemas de agua dulce: el herbicida glifosato y el molusco invasor Limnoperna fortunei. Se estudió el impacto conjunto sobre la estructura de las principales comunidades microbianas y sobre la calidad del agua mediante aproximaciones en ensayos controlados de laboratorio y a escala ecosistémica en microcosmos al aire libre. Se encontró que bajo las mismas condiciones, la presencia de L. fortunei acelera la disipación del glifosato en agua en casi 4 veces, con una velocidad de hasta 50,2 ± 3,4 gs por gramo de peso seco del tejido blando de mejillones por día, excretando fosfatos como producto de su degradación. Asimismo, pudimos detectar que tanto el mejillón íntegro como sus valvas por separado participan en la reducción del glifosato disuelto, determinando de forma más precisa el modo de acción de este factor sobre el herbicida. Si bien la presencia del molusco favorece la disipación del glifosato, la acción conjunta del agroquímico y L. fortunei sería perjudicial para los ecosistemas de agua dulce ya que presentan un efecto sinérgico, producto de su interacción. El aporte de nutrientes a partir de la degradación del herbicida promueve el desarrollo del bacterioplancton, estimula el crecimiento de algas filamentosas y aumenta la turbidez acelerando el deterioro de la calidad del agua en el corto plazo. Los estudios a escala ecosistémica sobre el impacto de agentes de estrés ambiental y su interacción sobre comunidades en microcosmos a la intemperie permiten predecir con mayor grado de realismo los efectos de la actividad del hombre sobre el ambiente natural. Abstract: During the past decades human activity has created a major shift in surrounding ecosystems. In nature, the environmental impact agents do not act separately but rather interact and operate together, being able to generate major changes on affected communities. Accordingly, the aim of this Thesis was to analyze the effect of the interaction of two environmental impact agents introduced by human activity on freshwater ecosystem: the glyphosate herbicide and the invasive mussel Limnoperna fortunei. We studied the joint impact on the structure of the main microbial communities and on water quality through experimental approaches in laboratory and in outdoor microcosms. We found that under the same conditions, the presence of L. fortunei accelerates glyphosate dissipation in water at about 4 times, with a speed of up to 50,2 ± 3,4 gs per gram of mussell dry weight per day, excreting phosphates as a breakdown product. Moreover, we detected that both the entire mussel as well as its empty valves participate in glyphosate dissipation in water column, determining more accurately its mode of action on the herbicide. Although mussels’s presence favours glyphosate dissipation, the combined effect of the agrochemical and L. fortunei would be detrimental to freshwater ecosystems as they present a synergic effect, due to their interaction. Nutrient overload due to herbicide degradation accelerated bacterioplankton development, stimulates the growth of filamentous algae and enhances water turbidity through time, promoting the impoverishment of the water quality in the short term. Ecosystem-scale studies on the impact of environmental stressors and their interaction on outdoor microcosms communities become more realistic approaches when predicting the effect of human activity on natural environment.
Cita tipo APA: Di Fiori, Eugenia . (2014-05-16). Impacto conjunto de dos agentes antropogénicos de cambio ambiental: efecto del herbicida glifosato y del mejillón invasor Limnoperna fortunei en ecosistemas de agua dulce. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5582_DiFiori.pdf Cita tipo Chicago: Di Fiori, Eugenia. "Impacto conjunto de dos agentes antropogénicos de cambio ambiental: efecto del herbicida glifosato y del mejillón invasor Limnoperna fortunei en ecosistemas de agua dulce". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-05-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5582_DiFiori.pdf |
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Ramírez Albuquerque, L. Diana. "Estudio comparativo de las condiciones ambientales que influencian la producción de tricotecenos en cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo cultivado en Argentina" (2014-04-29). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El trigo es uno de los cultivos de mayor importancia en Argentina ya sea para consumo local o como producto de exportación. Una de las principales enfermedades que afectan el cultivo es la “Fusariosis de la Espiga de Trigo” (FET). Es una enfermedad endémica en nuestro país causada por Fusarium graminearum, el agente más común de la Fusariosis de la espiga (FET) en muchas partes el mundo. La infección está fuertemente influenciada por parámetros ambientales y ocurre principalmente cuando se dan las condiciones favorables de humedad y temperatura durante la antesis o floración del trigo. Esta destructiva enfermedad afecta al trigo, cebada y otros granos pequeños y tiene la capacidad de destruir cultivos, causando grandes pérdidas económicas debido a la reducción de la calidad de los granos pudiéndose además acumular niveles significativos de micotoxinas, como los tricotecenos. La presente Tesis abarcó el estudio de la influencia de la temperatura y la aw sobre el crecimiento y la biosíntesis de micotoxinas utilizando una cepa de Fusarium graminearum productora de deoxinivalenol (DON), 3- y 15-acetildeoxinivalenol (3- y 15-ADON). El análisis en este estudio mostró que los factores ambientales tuvieron gran influencia en la síntesis relativa de los derivados acetilados, siendo esta influencia más marcada en el caso de la temperatura. Las interacciones entre estos factores: aw, temperatura y el tiempo de incubación, resultaron significativos sobre la producción de DON y 3-ADON. En cambio, la aw no produjo un efecto significativo sobre la producción de 15-ADON, aunque sí lo hicieron la temperatura, y el tiempo de incubación, así como sus interacciones. Las diferentes condiciones estudiadas mostraron que, para DON, no existen diferencias significativas entre las cantidades producidas en las condiciones óptimas (0.99 aw, 30 ºC, 14 días) y las observadas a la misma aw a 25 y 20 ºC, luego de 14 días de incubación, o la producción a 0,95 aw, 25 ºC y 21 días de incubación. El resto de las condiciones resultaron en una acumulación significativamente menor de DON. En cambio, para 3-ADON, las condiciones de máxima producción (0,99 aw, 30 ºC y 21 días) resultaron en una cantidad de toxina significativamente mayor que para el resto de las condiciones estudiadas. Lo mismo se observó para 15-ADON, para el cual las condiciones óptimas de producción fueron de 0,99 aw, 10 ºC y 7 días de incubación y la cantidad de toxina acumulada difirió significativamente con la que se detectó en el resto de las condiciones de estudio. De acuerdo a estudios realizados los últimos años, se demostró que el quimiotipo 3- ADON está desplazando rápidamente al quimiotipo 15-ADON en poblaciones de F. graminearum del oeste de Canadá. Estudios efectuados en invernadero demostraron que aislamientos pertenecientes al quimiotipo 3-ADON producían concentraciones de DON superiores a los aislamientos pertenecientes al quimiotipo 15-ADON, lo cual es motivo de preocupación para los productores de granos y las industrias relacionadas. Tanto la distribución geográfica de las especies como de los quimiotipos está influenciada fuertemente por los factores climáticos, el calentamiento global tendrá entonces un gran impacto en esta distribución. Por este motivo, el estudio del efecto de los factores climáticos (temperatura y actividad acuosa) sobre la producción relativa de tricotecenos por Fusarium graminearum permitirá predecir el riesgo al que están expuestos los cultivos susceptibles en este nuevo escenario. Abstract: Wheat is one of the most important crops in Argentina, either for local consumption or export. One of the major diseases affecting the crop is the Fusarium Head Blight (FHB). It is an endemic disease in our country caused by Fusarium graminearum, the most common agent of Fusarium head blight (FHB) around the world. The infection is strongly influenced by environmental parameters and occurs mostly when there are favorable conditions of moisture and temperature during wheat anthesis or flowering. This destructive disease affects wheat, barley and other small grains and has the capability of destroying crops, causing great economic losses due to reduced grain quality, and accumulating significant levels of mycotoxins such as trichothecenes. This thesis involved the study of the influence of temperature and aw on growth and mycotoxins biosynthesis, using a strain of Fusarium graminearum producing deoxynivalenol (DON), 3- and 15 acetyldeoxynivalenol (3- and 15-ADON). The analyses showed that environmental factors greatly influenced the relative synthesis of the acetylated derivatives, this influence being more pronounced in the case of temperature. The interactions between these factors: aw, temperature and incubation time were significant on DON production and 3-ADON. However, aw showed no significant effect on the production of 15-ADON, although temperature and incubation time incubation were significant, as well as their interactions. The different conditions studied showed that there are no significant differences between the amount of DON produced under optimal conditions (0.99 aw, 30 °C, 14 days) and those at the same aw, 25 and 20 °C, after 14 days of incubation, or 0.95 aw, 25 °C and 21 days of incubation. The rest of the conditions resulted in significantly lower accumulation of DON. In contrast, for 3-ADON, the maximum production conditions (0.99 aw, 30 and 21 days) resulted in a significantly greater amount of toxin than for the rest of the conditions studied. The same effect was observed for 15-ADON, for which the optimal production conditions were 0.99 aw, 10 °C and 7 days of incubation, and the amount of accumulated toxin differed significantly with those detected in the rest of the studied environmental conditions. According to studies conducted in recent years, it was demonstrated that the 3-ADON chemotype is rapidly displacing the 15-ADON chemotype of F. graminearum populations from western Canada. Greenhouse studies showed that isolates belonging to 3-ADON chemotype produced higher concentrations of DON than isolates belonging to the 15-ADON chemotype, which is of concern to grain producers and related industries. Both the geographical distribution of species and chemotypes is strongly influenced by climatic factors, and thus global warming will have a major impact on this distribution. For this reason, the study of the effect of climatic factors (temperature and water activity) on the relative production of trichothecenes by Fusarium graminearum will allow to predict the risk to which susceptible crops are exposed in this new scenario.
Cita tipo APA: Ramírez Albuquerque, L. Diana . (2014-04-29). Estudio comparativo de las condiciones ambientales que influencian la producción de tricotecenos en cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo cultivado en Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5609_RamirezAlbuquerque.pdf Cita tipo Chicago: Ramírez Albuquerque, L. Diana. "Estudio comparativo de las condiciones ambientales que influencian la producción de tricotecenos en cepas de Fusarium graminearum aislados de trigo cultivado en Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5609_RamirezAlbuquerque.pdf |
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Mestre Citrinovitz, Ana Cecilia. "Regulación de la proliferación y diferenciación de células de endometrio por hormonas esteroideas ováricas" (2014-04-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El estroma uterino experimenta cambios morfológicos y funcionales que dan lugar a la decidua, un tejido compacto cuya función es el correcto progreso de la preñez. El receptor de progesterona (RP) y el receptor de estradiol (RE) participan en el crecimiento y la diferenciación de las distintas áreas deciduales del endometrio de la rata. En esta tesis se estudia el papel de estos receptores, sus vías de señalización y la participación de nuevas moléculas involucradas en las etapas iniciales de la decidualización. Caracterizamos, mediante el uso de ARN pequeño de interferencia específico, el papel de una nueva proteína regulada en la decidualización, la proteína de unión a ARN CSD-C2. Encontramos que el bloqueo del RP, mediante su antagonista onapristona, produjo la reabsorción de los sitios de implantación (SIs) y la disminución en la expresión proteica del RP, RE, PCNA, DESMINA y CCND3, en los niveles de ARNm de Prl8a2, y de Hand2 y Bmp2, y en la activación de ERK. El efecto deletéreo de onapristona fue parcialmente contrarrestado por el antagonista del RE faslodex, restituyendo los niveles de los receptores de hormonas, de los marcadores de proliferación y diferenciación analizados, y aumentando compensatoriamente los niveles de Hand2 y Bmp2, y pERK. El tratamiento de ratas preñadas con el inhibidor de pERK, evidenció su importancia en la formación de la decidua, manteniendo la capacidad proliferativa de las células estromales y limitando su diferenciación en las distintas áreas deciduales. Estos hallazgos muestran la importancia del balance de señalización de los receptores hormonales, a la vez que describen nuevas moléculas responsables de la decidualización endometrial durante la preñez temprana. Abstract: The uterine stroma undergoes complex morphological and functional shifts that build the decidua, a specialized compact tissue leading to successful pregnancy. Progesterone receptor (PR) and estrogen receptor (ER) participate in growth and differentiation of several rat decidual regions. This thesis studies the role of these receptors, related signalling pathways and novel molecules during the initial steps of pregnancy. We characterized the role of the RNA binding protein, CSD-C2, during decidualization by specific siRNA in vivo administration. Early suppression of progesterone receptor activity by treatment with the progesterone antagonist (onapristone) resulted in resorption of the implantation sites (ISs) with concomitant decrease in the expression of PR, ER, PCNA, DESMIN, CCND3, Prl8a2, and signalling players such as Hand2, Bmp2 and ERK activation. The deleterious effect of onapristone was partially counteracted by the ER antagonist (Faslodex) with rescue of hormone steroid receptors, markers of proliferation and differentiation and the probably compensatory increase of Hand2, Bmp2 and ERK activation compared to oil treated controls. The treatment of pregnant rats with MEK inhibitor showed ERK activation relevance during the late stage of decidua development, keeping the proliferation capacity of stromal cells and limiting the differentiation process in specified regions of decidual tissues. These findings highlight the balance of ovarian steroid hormone receptors during early pregnancy, and describe new players in the decidualization process.
Cita tipo APA: Mestre Citrinovitz, Ana Cecilia . (2014-04-28). Regulación de la proliferación y diferenciación de células de endometrio por hormonas esteroideas ováricas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5502_MestreCitrinovitz.pdf Cita tipo Chicago: Mestre Citrinovitz, Ana Cecilia. "Regulación de la proliferación y diferenciación de células de endometrio por hormonas esteroideas ováricas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5502_MestreCitrinovitz.pdf |
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Kamm, Gretel Betiana. "Bases genéticas de la evolución del cerebro humano: estudio evolutivo y funcional del gen NPAS3" (2014-04-24). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Comprender el origen y la evolución del cerebro humano es uno de los desafíos más sobresalientes que enfrenta la ciencia. Los cambios genéticos que llevaron a la adquisición de las capacidades distintivas del cerebro humano están codificados en nuestro genoma. La disponibilidad de más de cincuenta genomas de vertebrados permite hoy reconstruir nuestra historia evolutiva. Nuestra hipótesis es que la adquisición de nuevos patrones de expresión de genes relacionados con el desarrollo y la función cerebral en el linaje humano, habría sido crítica para la evolución de las capacidades cognitivas excepcionales de nuestro cerebro. Haciendo uso de bases de datos públicas de secuencias no codificantes conservadas con evidencia de evolución acelerada en el linaje humano (denominados HAEs por human accelerated elements), se encontró que el factor de transcripción neuronal PAS domain-containing protein 3 (NPAS3) contiene 14 HAEs, el mayor número de HAEs para un solo gen en todo el genoma humano. Usando un ensayo de expresión en peces cebra transgénicos se demostró que 11 de los 14 HAEs son capaces de activar la expresión de la proteína reportera EGFP durante el desarrollo embrionario, particularmente en el sistema nervioso. Además, utilizando ratones transgénicos, se realizó un análisis comparativo estudiando los patrones de expresión de uno de los HAEs de NPAS3 y secuencias ortólogas de chimpancé y ratón. El enhancer humano muestra una extensión del patrón de expresión en el telencéfalo. Este cambio humano específico pudo haber contribuido con la evolución de alguna de las características de nuestro cerebro. Abstract: Understanding the origin and evolution of the human brain is one of the greatest challenges that today science faces. The genetic changes that led to the acquisition of the distinctive capacities of the human brain are encoded in our genome. The availability of more than fifty vertebrate genomes allows unraveling our evolutionary history. Our hypothesis is that the acquisition of new expression patterns in the human lineage of genes involved with the development and functioning of the brain would have been critical for the evolution of our unique cognitive capacities. Using public databases of human accelerated conserved non coding sequences (HAEs or human accelerated elements), we found that the transcription factor neuronal PAS domain-containing protein 3 (NPAS3) contains 14 HAEs, the largest number detected for a human gene. Using an enhancer transcription assay in transgenic zebrafish we show that 11 out of the 14 HAEs activated the expression of the reporter gen EGFP during zebrafish development in the central nervous system. In addition, using transgenic mice we performed an expression pattern comparative analysis of human, chimpanzee and mouse ortholog sequences of a selected HAE. We found that the human enhancer shows an extended expression pattern in the forebrain. This human-specific change could have contributed to the evolution of some of the distinctive capacities of our brain.
Cita tipo APA: Kamm, Gretel Betiana . (2014-04-24). Bases genéticas de la evolución del cerebro humano: estudio evolutivo y funcional del gen NPAS3. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5993_Kamm.pdf Cita tipo Chicago: Kamm, Gretel Betiana. "Bases genéticas de la evolución del cerebro humano: estudio evolutivo y funcional del gen NPAS3". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5993_Kamm.pdf |
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Bruzzo Iraola, Juan. "Rol de la inflamación sistémica en la patología generada por tumores murinos" (2014-04-24). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La asociación entre cáncer e inflamación en un órgano o tejido se encuentra sólidamente establecida. En efecto, se sabe que ciertos tumores, tienen una mayor probabilidad de originarse en sitios de inflamación crónica y que procesos inflamatorios locales pueden acelerar el crecimiento de tumores preexistentes en animales y seres humanos. Por otro lado, la relación entre cáncer e inflamación sistémica no ha sido particularmente estudiada. En esta tesis, demostramos que durante el crecimiento de 4 tumores murinos, de diferente origen, estirpe histológico e inmunogenicidad y de un tumor humano creciendo en ratones nude, se generaron 2 picos temporalmente separados de inflamación sistémica. El primer pico fue relativamente pequeño y transitorio ya que fue detectado durante la primera semana luego de la inoculación del tumor. Tal vez represente, en parte, una respuesta del organismo al trauma mecánico de la inoculación de elementos extraños, ya que la inoculación de fibroblastos murinos normales también produjo una manifestación de inflamación sistémica, aunque menor, que la observada después de la inoculación de células tumorales. Por otro lado, el inicio del segundo pico de inflamación sistémica fue observado cuando el volumen tumoral fue mayor que 500 mm3 y coincidente con el inicio del crecimiento exponencial de cada tumor. Este segundo pico de inflamación sistémica fue significativamente más prominente que el primero y su intensidad aumentó en relación directa con el incremento de la masa tumoral. Estos resultados sugieren que la inflamación sistémica podría ser un fenómeno general de la patología neoplásica y su importancia se puso de manifiesto en el hecho de que, en nuestra colección de tumores, se observó, sorpresivamente, una correlación directa entre la magnitud de la inflamación sistémica generada por cada tumor y su agresividad, correlación que no se observó con la capacidad de generar metástasis. Esto indica, al menos en los tumores analizados por nosotros, que la capacidad de generar una potente respuesta inflamatoria sistémica, produce más efectos deletéreos sobre el organismo que la propia capacidad metastásica, disminuyendo de este modo la sobrevida. En este sentido, se encontró gran infiltración de neutrófilos y alteraciones estructurales en diferentes órganos, que son compatibles con disminución y aún pérdida de función, independiente de la capacidad metastásica de cada tumor. La inflamación sistémica generada por el tumor exacerba el propio crecimiento tumoral estableciendo un circuito de retroalimentación positivo entre ambos, al menos en parte por la activación del receptor TLR-4. Además, la disminución de las manifestaciones de inflamación sistémica mejoró los efectos anti-tumorales obtenidos con quimioterapia y radioterapia, aunque estos resultados fueron relativamente modestos. Esto se debe a que el tumor cuando supera los 1500 mm3, comienza un crecimiento exponencial, generando un fenómeno de inflamación sistémica progresivo, a pesar de que se continúan administrando las drogas antiinflamatorias, que hasta ese momento habían sido bastante efectivas para limitar la naciente inflamación sistémica y para retardar el crecimiento tumoral. En cambio, un excelente resultado terapéutico fue alcanzado cuando se realizó el tratamiento antiinflamatorio junto con la escisión quirúrgica de tumores > 2000 mm3. En este caso, la eliminación quirúrgica de la fuente principal de inflamación sistémica y de posible refractariedad, permitió al tratamiento antiinflamatorio tener muchas más chances de actuar, contra la inflamación sistémica residual, pero aún deletérea, que perdura al menos 2 semanas después de la extirpación del tumor. Si esta condición inflamatoria sistémica fuera una característica distintiva de muchos canceres avanzados, un conocimiento más preciso de los mecanismos por los cuales esta inflamación sistémica promueve el crecimiento tumoral y produce múltiples daños en el organismo y la búsqueda de sustancias antiinflamatorias más efectivas y con menores efectos adversos, serían muy importantes para complementar y mejorar las terapias actuales contra el cáncer. Abstract: The link between cancer and inflammation in an organ or tissue has firmly been established on the basis that cancer tends to occur at sites of chronic inflammation and that local inflammatory processes can accelerate the growth of preexisting tumors in both animals and human beings. In contrast, the relationship between cancer and systemic inflammation has been less studied. In this work, we demonstrated that during the growth of 4 murine tumors of different origin, histological type and immunogenicity and 1 human tumor in nude mice, two temporally separate peaks of systemic inflammation were detected. The first peak was relatively small and transient detected during the first week after tumor inoculation. It probably represented, at least in part, the response of the organism to the mechanical trauma of inoculation of foreign bodies, because the inoculation of normal fibroblasts produced a rather similar manifestation of systemic inflammation than that observed after the inoculation of tumor cells. On the other hand, the onset of the second peak was observed when the tumor was 500 mm3, coincidental with the beginning of the exponential tumor growth. This second peak of systemic inflammation was significantly more prominent than the first one and its magnitude increased progressively in parallel with the increase of tumor mass. These results suggest that systemic inflammation could be a general phenomenon of neoplastic pathology and its importance became manifest in the fact, that in our tumor collection, was observed, surprisely, a direct correlation between the magnitude of systemic inflammation generated by each tumor and its aggressiveness. On the other hand, in our tumor models, tumor aggressiveness did not correlate to the tumor´s ability to disseminate or metastasize, suggesting that the magnitude of systemic inflammation rather than the metastatic ability produce more deleterious effects in the organism, diminishing survival. In fact, was observed a large number of PMN and damage in tissues and organs, that are compatible with impair function, indepently of tumor´s metastatic ability. The systemic inflammation generated by tumor enhance tumor growth, establishing a positive feedback between both, at least in part, by activation of TLR-4 receptor. In addition, the attenuation of the manifestations of systemic inflammation improves the anti-tumor effects obtained with radiotherapy and chemotherapy. However, this results were relatively modest. This is probably due to the fact that when tumor surpass 1500 mm3, begins an exponential growth, generating a systemic inflammation which magnitude increase progressively, even though the continue inoculation of the anti-inflammatory drugs. Instead, an excellent therapeutic result was obtained when the anti-inflammatory treatment schedule was combined with surgery. In this case, the surgery eliminated the main source of systemic inflammation and in consequence an anti-inflammatory treatment had a better chance to act against the residual, but still deleterious, systemic inflammation. If a systemic inflammatory condition were a hallmark of many advanced cancers, a more accurate knowledge of the underlying mechanisms by which systemic inflammation promotes tumor growth and produces multiple deleterious effects on the organism and the search for new more effectives and with lesser side effects anti-inflammatory factors will help to design new strategies to complement and to improve the current therapies against cancer.
Cita tipo APA: Bruzzo Iraola, Juan . (2014-04-24). Rol de la inflamación sistémica en la patología generada por tumores murinos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5528_BruzzoIraola.pdf Cita tipo Chicago: Bruzzo Iraola, Juan. "Rol de la inflamación sistémica en la patología generada por tumores murinos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5528_BruzzoIraola.pdf |
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Pereira, Susana. "Aspergillus spp. en plantas de maní nativo y cultivado. Identificación, capacidad toxicogénica y control biológico" (2014-04-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las especies del género Aspergillus son productoras de aflatoxinas, ácido ciclopiazónico y ocratoxina A, importantes por su impacto en la salud humana. El maní es un cultivo económicamente importante en Argentina, susceptible a la colonización por A. flavus y A. parasiticus, con posterior contaminación con aflatoxinas. A fin de reducir dicha contaminación, surgió el biocontrol como alternativa de manejo. Se aislaron Aspergillus spp. a partir de diferentes sustratos de plantas nativas y cultivadas. Se estudió la capacidad toxicogénica en las secciones Nigri y Flavi y la contaminación natural de toxinas en maní, a fin de realizar ensayos de biocontrol in vitro. Se analizó la cinética de crecimiento de cepas seleccionadas como potenciales biocontroladores. Los resultados muestran que las secciones Flavi y Nigri resultan más abundantes en plantas cultivadas, mostrando una elevada habilidad competitiva para colonizar la semilla. La distribución de quimiotipos y esclerocios en A. flavus, podría relacionarse con factores climáticos. Muy bajo porcentaje de cepas de A. niger resultaron ocratoxicogénicas, ninguna asociada a semilla. Su mayor frecuencia en este sustrato podría determinar una menor incidencia de la sección Flavi, debido tal vez a su cinética de crecimiento. Estas características apoyan la hipótesis sobre la capacidad de A. niger como biocontrolador de cepas toxicogénicas de Aspergillus de la sección Flavi. Se encontraron tres cepas atoxicogénicas (A. niger 1636, A. flavus 1639 y A. parasiticus 1640) cuyas características demostraron que podrían ser utilizadas como agentes de control biológico. Abstract: The genus Aspergillus contains several species capable of producing aflatoxins, cyclopiazonic acid and ochratoxin A, all important for their impact on human health. The peanut is an economically important crop in Argentina and one of the crops most susceptible to colonization by A. flavus and A. parasiticus from the soil, with the subsequent aflatoxin contamination. In order to reduce the effects of mycotoxins, biological control emerged as an alternative. Aspergillus spp. were isolated from different substrates of native and cultivated plants. Toxigenic capacity in sections Flavi and Nigri and natural contamination in peanuts by toxins were studied, in order to perform biological control tests in vitro. The results show that sections Flavi and Nigri are often found in cultivated and native peanuts, although they are more abundant in cultivated plants, showing a higher competitive ability to colonize the seed. The distribution of chemotypes and sclerotia of A. flavus could be related to climatic factors. A very low percentage of A. niger strains were ochratoxin-producers, and none were associated with seeds. Its higher frequency on this substrate could determine a low incidence of Flavi section, perhaps due to its growth kinetics. These features support the hypothesis that A. niger could be a good biocontrol agent against toxigenic strains of Aspergillus section Nigri. Three atoxigenic strains (A. niger 1636, A. flavus 1639 and A. parasiticus 1640) showed characteristics that suggest that they could be used as biological control agents.
Cita tipo APA: Pereira, Susana . (2014-04-21). Aspergillus spp. en plantas de maní nativo y cultivado. Identificación, capacidad toxicogénica y control biológico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5554_Pereira.pdf Cita tipo Chicago: Pereira, Susana. "Aspergillus spp. en plantas de maní nativo y cultivado. Identificación, capacidad toxicogénica y control biológico". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5554_Pereira.pdf |
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Videla Richardson, Guillermo Agustín. "Establecimiento y estudio in vitro de células madre/progenitoras tumorales derivadas de gliomas de alto grado como fuente renovable para desarrollos terapéuticos" (2014-04-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los gliomas de alto grado son los tumores cerebrales primarios más frecuentes y son altamente agresivos e invasivos. Éstos parecen exhibir una organización jerárquica y se ha postulado que su generación ocurre a partir de células madre tumorales (CMT), las cuales corresponderían a una subpoblación minoritaria capaz de generar y propagar tumores al ser inyectadas en ratones inmunodeficientes. De esta forma, el aislamiento y la caracterización de células tumorales derivadas de pacientes con fenotipo de células madre o progenitoras permite contar con un valioso modelo de estudio para comprender en mayor profundidad la biología de los gliomas. En el presente trabajo logramos establecer con éxito nueve líneas de células madre/progenitoras tumorales (CMPT) a partir de biopsias de gliomas de alto grado. Éstas fueron capaces de generar tumores luego de ser inyectadas en el sistema nervioso central en ratones inmunodeficientes y presentaron las mismas alteraciones genéticas que se encontraron en los tumores parentales. Además, todas ellas fueron positivas para los marcadores de CMT: Nestina, Vimentina, CD44 y Sox2. Sin embargo, el grado de expresión de CD133 resultó ser variable en todas las líneas analizadas. A pesar de las similitudes entre las CMPT y las células madre neurales, es concebible pensar que pueden existir diferencias en sus respectivos potenciales de diferenciación. Para responder este interrogante hemos sometido a estas líneas celulares a diversos protocolos de diferenciación basados principalmente en el agregado de BMP4 recombinante humano y en la deprivación de factores de crecimiento. Luego de analizar la expresión de distintos marcadores de diferenciación y de evaluar cambios en la morfología celular, determinamos que estas líneas de CMPT poseen un grado variable de multipotencia, en donde cada una de ellas presenta un grado de compromiso particular hacia los linajes astroglial y neuronal. Además, pudimos observar que la adición de BMP4 recombinante redujo marcadamente la tasa de proliferación de todas las líneas celulares estudiadas. Por último, hemos determinado los niveles de expresión del ARNm de distintos ligandos y receptores involucrados en la señalización dependiente de BMPs en seis líneas de CMPT, encontrando en ellas ciertos patrones de expresión característicos. Dado que las CMT probablemente dependan de determinadas señales del microambiente tumoral para mantener su identidad, un tratamiento efectivo podría basarse en el bloqueo de mediadores generados en el nicho perivascular. Por este motivo y dado el gran potencial de este modelo experimental para el testeo de drogas, decidimos estudiar los niveles de expresión de los ARNm de los componentes del eje endotelinérgico en diferentes líneas de CMPT. Pudimos observar que todas las líneas celulares analizadas mostraron una expresión elevada de los transcriptos del receptor ETRB, mientras que el grado de expresión de los componentes restantes del sistema fue dependiente de cada línea celular. Más aún, en dos de cuatro líneas analizadas, el agregado de endotelinas recombinantes produjo una disminución significativa de los niveles de apoptosis generados en condiciones de deprivación de factores de crecimiento y nutrientes. Dada la variabilidad observada en las respuestas celulares a diferentes tratamientos en las distintas líneas de CMPT, este trabajo pone de menifiesto la relevancia de contar con un modelo in vitro basado en cultivos derivados de gliomas que permita contribuir al desarrollo de terapias personalizadas. Abstract: High grade gliomas are the most frequent and malignant primary brain tumors in adults and appear to have a hierarchical organization suggestive of a stem cell foundation. Glioma stem cells (GSC) have been recently isolated from tumors of patients and were characterized as a small subset of stem-like tumor cells capable of initiating and sustaining tumor growth when grafted into mice. Thus, isolation and expansion of these putative cancer stem/progenitor cells, harboring tumor-specific phenotypes, constitutes a powerful model to study glioma biology. Significantly, GSC lines from different tumors exhibit divergent gene expression signatures and distinct differentiation behavior. In the present study, we successfully established nine glioma stem/progenitor cell (GSPC) lines obtained from malignant gliomas which display stem cell properties and initiate high-grade gliomas following xenotransplantation. Importantly, all the established cell lines presented the same genomic alterations as parental tumors. Additionally, they were all positive for the stem cell markers: Nestin, Vimentin, CD44 and Sox2. In contrast, CD133 expression levels widely varied among GSPC lines. Despite similarities between GSPC and normal neural stem cells, we hypothesized that there may be differences in their differentiation potentials. To address this issue, first, we exposed these cell lines to several differentiation conditions that principally include BMP4 treatment and growth factors withdrawal. After analyzing the expression of various markers of differentiation and assessing changes in cell morphology, we determined that these GSPC lines possess a varying degree of multipotency. Moreover, we observed that the addition of recombinant BMP4 markedly reduced the rate of proliferation of all the studied cell lines. Finally, we determined the expression levels of different ligands and receptors involved in BMP-signaling, and found that the GSPC lines show characteristic patterns of expression. As many cancer stem cells might depend on a niche to maintain their identity, targeting molecules triggered by the perivascular niche could be a strategy to deplete or differentiate them. For this reason and given the potential of the present experimental model for drug screening, we studied the expression profile of the endothelin (EDN) axis members in different GSPC lines grown in vitro. Our findings revealed that all tested cell lines robustly express ETRB receptor. Nevertheless, the expression levels of the other components of this axis resulted cell line specific. Furthermore, in two from four GSPC lines, the addition of recombinant EDNs (1, 2 and 3) reduced apoptotic rates upon qrowth factors and nutrients withdrawal. Given the diversity of the responses displayed by patient-derived CSC lines, the present study highlights the relevance of the in vitro model presented herein for the development of tailor-made therapies.
Cita tipo APA: Videla Richardson, Guillermo Agustín . (2014-04-16). Establecimiento y estudio in vitro de células madre/progenitoras tumorales derivadas de gliomas de alto grado como fuente renovable para desarrollos terapéuticos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5515_VidelaRichardson.pdf Cita tipo Chicago: Videla Richardson, Guillermo Agustín. "Establecimiento y estudio in vitro de células madre/progenitoras tumorales derivadas de gliomas de alto grado como fuente renovable para desarrollos terapéuticos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5515_VidelaRichardson.pdf |
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González Solveyra, Estefanía. "Efectos de nanoconfinamiento de agua en óxidos mesoporosos: de la simulación molecular al diseño y la síntesis de materiales" (2014-04-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo de tesis se emplearon herramientas de simulación molecular clásica junto con distintas estrategias de síntesis y caracterización para explorar la relación entre nanoconfinamiento y propiedades de agua en materiales mesoporosos. Los óxidos mesoporosos son materiales que presentan poros monodispersos (2-50 nm) altamente ordenados y de elevada área específica (100-1000 m2/g). La precisión con que pueden controlarse las dimensiones, la interconectividad y la morfología de los poros en la escala nanométrica, da lugar a propiedades sumamente particulares, de interés en multitud de aplicaciones tecnológicas: (foto)catálisis, sorción, sensores, biomateriales, involucrando casi todas ellas la inteacción con H2O. En base a ello, se decidió investigar los aspectos físico-químicos del agua confinada en estos entornos, haciendo foco en fenómenos de equilibrio de fase (equilibrio líquido-vapor y sólido-líquido), estructura y transporte. Además de la motiva- ción tecnológica, estos sistemas son de interés desde el punto de vista fundamental, pues ofrecen un modelo donde estudiar los efectos del confinamiento en la nanoescala. Se emplearon en primer lugar herramientas de simulación molecular de distinta escala (Dinámica Molecular atomística y coarse-grained), caracterizando el comportamiento de agua confinada en matrices porosas de 1-8 nm de diámetro. De esta manera, fue posible describir, desde una perspectiva molecular, la estructura y dinámica del agua, sus propiedades ópticas, así como los diferentes mecanismos de llenado de los nanoporos y los fenómenos de histéresis. También se logró una descripción microscópica del equilibrio sólido-líquido en estos entornos altamente confinados. Se estudió la incidencia del radio del poro, la filicidad y la rugosidad de las paredes sobre los fenómenos mencionados y en particular sobre las isotermas de sorción. Asimismo, se recurrió a un esquema experimental para complementar los resultados computacionales. Los óxidos mesoporosos se sintetizaron en forma de películas delgadas y xerogeles mediante estrategias de síntesis sol-gel y procesos de autoensamblado inducido por evaporación, que combinan la polimerización del óxido inorgánico junto con el autoensamblado de moléculas anfifílicas, que actúan como agentes moldeantes del arreglo poroso. Para la caracterización estructural de los sistemas sintetizados se utilizaron diver- sas técnicas: TEM, SEM, SAXS-2D, GISAXS, XRR, WAXRD. Las propiedades de sorción de agua en mesoporos fueron investigadas en películas delgadas obtenidas por spin y dip coating, mediante Porosimetría Elipsométrica Ambiental y XRR. El aporte original de esta tesis reside en la complementación de técnicas experimentales avanzadas con herramientas de simulación computacional para atender cuestiones de gran interés para la comunidad experimental pero de difícil elucidación dadas las limitaciones de resolución espacio-temporales de las técnicas actuales. Esta estrategia dual constituye una vía extremadamente poderosa para la descripción de fenómenos físicos y químicos en estos sistemas. Abstract: In this thesis, classical molecular dynamics along with several synthesis and characterization techniques were employed to explore the relation between nanoconfinement and properties of water in mesoporous materials. Mesoporous oxides present highly ordered monodisperse pores (2-50 nm) and high surface area (100-1000 m2/g). The precision achieved in controlling pore dimensions, interconnectivity, and morphology in the nanometer range gives rise to unique properties with several technological applications, such as (photo) catalysis, sorption, sensors, biomaterials, all of which involve water interactions. Based on this fact, we decided to investigate the physical-chemical aspects of water confined in such environments, focusing on phase transitions phenomena (solid-liquid and liquid-vapor equilibria), structure and transport. Besides the technological motivations, these systems are also very interesting from a fundamental point of view, given that they offer a model in which to study confinement effects in the nanoscale. Firstly we employed molecular simulation techniques at different scales (atomistic and coarse-grained Molecular Dynamics) to characterize the behavior of water confined in porous matrices of 1-8 nm diameter. In his way, we were able to describe from a molecular perspective, water structure and dynamics, its optical properties as well as different filling mechanisms and hysteresis in the nanopores. We also achieved a microscopic description of the liquid-solid equilibrium in these highly confining environments. We study the effect of pore radius, hydrophilicity/hydrophobicity, and surface roughness on the mentioned phenomena, particularly on the sorption isotherms. We also resorted to an experimental scheme to encompass our computational findings. Mesoporous oxides were synthesized as thin films and xerogels by sol-gel reactions and evaporation-induced self-assembly processes, which combine inorganic oxide polymerization with the self-assembly of amphiphilic molecules that act as a template of the porous arrange. Structural characterization of the synthesized materials involved several techniques: TEM, SEM, SAXS-2D, GISAXS, XRR, WAXRD. Water sorption properties in thin films obtained by spin and dip-coating were investigated by Environmental Ellipsometric Porosimetry and XRR. The original contribution of this thesis lies in the complementation of state of the art experimental techniques with computational simulation tools to address issues of great deal of interest for the experimental community but difficult to elucidate given the temporal and spatial limitations of existing techniques. This dual strategy represents a very powerful scheme for the description of physical-chemical phenomena in these systems.
Cita tipo APA: González Solveyra, Estefanía . (2014-04-16). Efectos de nanoconfinamiento de agua en óxidos mesoporosos: de la simulación molecular al diseño y la síntesis de materiales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5527_GonzalezSolveyra.pdf Cita tipo Chicago: González Solveyra, Estefanía. "Efectos de nanoconfinamiento de agua en óxidos mesoporosos: de la simulación molecular al diseño y la síntesis de materiales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5527_GonzalezSolveyra.pdf |
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Aprile García, Fernando. "Estudio de las vías de señalización e inflamatorias del canal P2X7 y su variante polimórfica Gln460Arg en células del sistema nervioso central" (2014-04-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los receptores P2X7 son canales de calcio activados por ATP conformados por subunidades de dos pasos de membrana que se asocian como homotrímeros. Sus efectos son mediados por activación de la vía de las MAPK que incluye a BRaf y ERK 1/2. En el sistema nervioso central, regulan la liberación de neurotransmisores y citoquinas, y la activación glial frente a situaciones inflamatorias. Mediante distintos estudios genéticos se encontró que pacientes con trastornos depresivos poseen, con una incidencia significativa, una variante polimórfica del gen P2X7, que consiste en un cambio de un único nucleótido que produce la sustitución de Glutamina por Arginina en la posición 460 (Gln460Arg). El objetivo principal de esta tesis consiste en investigar la relación funcional entre esta variante polimórfica del receptor y la aparición de trastornos psiquiátricos. En particular, se estudiaron las cascadas de señalización activadas por el receptor P2X7, poniendo énfasis en el ingreso de calcio extracelular tras dicha activación, el rol de la cascada de las MAPK y los efectos funcionales y transcripcionales que derivan de dicha activación. Primeramente, se observó que en homocigosis la variante mutada de P2X7 tiene la misma funcionalidad que el receptor wild-type (WT). En cambio, cuando ambas subunidades fueron coexpresadas se produjo una marcada disminución en la entrada de calcio y en la activación de la MAPK ERK 1/2. Se demostró además que ambas subunidades interactúan físicamente en la membrana celular de células coexpresoras, asociándose para formar trímeros funcionales de P2X7 compuestos por subunidades WT y Gln460Arg. A su vez, nuestro grupo colaborador en el Max-Planck en Munich, Alemania, demostró que solamente los ratones knock-in que expresan ambas variantes del receptor P2X7 humano, y no aquellos que expresan una única variante, muestran alteraciones del comportamiento similares a aquellas que presentan pacientes con depresión. A continuación, se buscaron proteínas involucradas en la transducción de señales de P2X7 de interés en el marco de mecanismos inflamatorios o con un posible rol en depresión. Se detectó asociada a BRaf a la proteína Poli ADP-ribosa polimerasa 1 (PARP1), enzima clave en la respuesta celular a procesos inflamatorios. Se demostró que P2X7 activa a PARP1, aumentando los niveles totales de poli ADP-ribosilación. Estos resultados identifican a PARP1 como un modulador clave de la transducción de señales de P2X7, y describen por primera vez a P2X7 como activador de PARP1. Además se realizó un microarray de expresión génica con el fin de caracterizar las consecuencias de la coexpresión de ambas variantes a nivel transcripcional. Con estos datos se realizó un análisis bioinformático global de los perfiles de expresión génica, con el cual se hallaron alteradas distintas vías de señalización relacionadas con inflamación y depresión. También identificamos genes candidatos con expresión alterada que resultan de máximo interés en el mismo contexto: CHUK (o IKKα, quinasa del inhibidor de NFκB α) y RCAN1 (regulador de calcineurina 1). Esta expresión diferencial detectada en el microarray fue posteriormente confirmada en distintos modelos, validando y profundizando dichos hallazgos. En conclusión, mediante la caracterización de las vías de transducción de señales asociadas a la activación de las distintas variantes de P2X7, el análisis de su impacto transcripcional y su asociación con nuevas moléculas se describen por primera vez los mecanismos moleculares y celulares que podrían proveer una explicación a la asociación entre la presencia de la variante mutada de P2X7 y la aparición de trastornos psiquiátricos como la depresión. Abstract: P2X7 receptors are ATP-gated calcium channels conformed by subunits with two transmembrane domains that assemble as homotrimers. Its effects are mediated by activation of the MAPK pathway that involves BRaf and ERK 1/2. In the central nervous system, they regulate neurotransmitter and cytokine release, as well as glial activation after inflammatory injury. Different genetic approaches have demonstrated that a significant amount of psychiatric patients suffering from major depression possess a polymorphic variant of the P2X7 gene, consisting in a single nucleotide change leading to a Glutamine for Arginine subtitution at the position 460 (Gln460Arg). The main aim of this thesis is to investigate the functional interplay between this polymorphic variant and the onset of psychiatric symptoms. More specifically, signaling pathways elicited by P2X7 receptor were studied, with special emphasis in calcium uptake, MAPK role and the functional and transcriptional effects derived from their activation. First of all, we report that the P2X7 polymorphic variant show the same functionality than its wild-type (WT) counterpart when expressed in homocygosis. In contrast, calcium uptake and MAPK ERK 1/2 activation were severely diminished when both subunits were coexpressed. We also show that both subunits physically interact in coexpressing cells, therefore assembling P2X7 receptors that bear WT and Gln460Arg subunits. At the same time, our partner research group at the Max-Planck Institute in Munich, Germany, showed that only knock-in mice for both variants of the human P2X7 receptor show behavior alterations reminiscent of those observed in psychiatric patients, while homozygous knock-in mice do not. Afterwards, we looked for novel proteins involved in P2X7 signaling pathways that would be of interest in the context of inflammation and depression. We detected Poly ADPribose polymerase (PARP1), a key enzime for cellular response to inflammatory processes. P2X7 activates PARP1, enhancing cellular levels of ADP-ribose. These results identify PARP1 as a key modulator of P2X7 signaling mechanisms, and describe P2X7 as a novel activator of PARP1. Also, we performed an expression microarray with the aim of depicting the transcriptional consequences of coexpressing both variants. This data was used to carry out a global bioinformatic analysis of gene expression profile. We found that different signaling pathways related to inflammation and depression were altered. We also found candidate genes with altered gene expression that are of interest in this context: CHUK and RCAN1. Their differential expression detected on the microarray was confirmed employing different models, therefore validating and gaining insight into these findings. Summing up, by means of characterizing the signaling pathways associated to the activation of the different P2X7 variants, the analysis of their transcriptional impact and the association with novel molecules we describe for the first time the molecular and cellular mechanisms that could provide an explanation for the association between the P2X7 polymorphic variant and the appearance of psychiatric illnesses such as depression.
Cita tipo APA: Aprile García, Fernando . (2014-04-11). Estudio de las vías de señalización e inflamatorias del canal P2X7 y su variante polimórfica Gln460Arg en células del sistema nervioso central. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5590_AprileGarcia.pdf Cita tipo Chicago: Aprile García, Fernando. "Estudio de las vías de señalización e inflamatorias del canal P2X7 y su variante polimórfica Gln460Arg en células del sistema nervioso central". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5590_AprileGarcia.pdf |
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Legisa, Danilo Mario. "Estudio de aislamientos nacionales y desarrollo de una vacuna a subunidad, direccionada a células presentadoras de antígenos, para el Virus de la Lengua Azul" (2014-04-03). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Lengua Azul es una enfermedad que afecta principalmente rumiantes salvajes y doméstico, y representa una importante barrera para el comercio internacional de animales y sus subproductos. El Virus de la Lengua Azul es el causante etiológico de la enfermedad y es transmitido por insectos hematófagos del género Culicoides. El Virus de la Lengua Azul , es el miembro prototipo del género Orbivirus dentro de la familia Reoviridae. El virión está compuesto por una doble capa proteica desnuda que envuelve un genoma de 10 segmentos lineales de ARNdc, los cuales codifican para al menos diez proteínas, 7 proteínas estructurales y al menos 4 no estructurales. La distribución del Virus de la Lengua Azul es global aunque en ciertas zonas la información es escasa. En Sudamérica, evidencia serológica de la presencia del virus fue encontrada todos los países menos Uruguay y Bolivia. Argentina y Brasil son los únicos países donde ha sido aislado el virus. En Argentina han sido obtenidos 5 aislamientos de Virus de la Lengua Azul serotipo4 en ganado bovino. Tres de estos aislamientos fueron logrados entre los años 1999-2001, mientras los dos restantes fueron obtenidos en los años 2009 y 2010 como parte del presente trabajo de tesis. La medida de control más práctica y eficaz es la inmunización profiláctica de los animales susceptibles. Desde principios del siglo XX se han desarrollado vacunas atenuadas e inactivadas eficientes para la Lengua Azul. Sin embargo, las desventajas en cuanto a bioseguridad y efectos adversos impulsan el desarrollo de vacunas a subunidad, no infecciosas como alternativa a las vacunas convencionales. En este trabajo de tesis se abordó un análisis epidemiológico molecular de los aislamientos argentinos del VLA y el desarrollo de una vacuna a subunidad direccionada a células presentadoras de antígeno. El análisis epidemiológico molecular se basó en la obtención y análisis de las secuencias de 5 de los 10 segmentos virales (Segmentos 2, 3, 6, 7 y 10). El análisis de los segmentos 2 y 6 resultó en un cluster de secuencias argentinas dentro del clado del serotipo 4 y también dentro del grupo del nucleotipo A (definido para cada segmento). El análisis de los segmentos 3, 7 y 10 mostró que los aislamientos argentinos agrupan dentro del cluster de aislamientos de topotipo occidental o western, indicando que su origen se remontaría a África/Europa. El análisis filogenético reveló que, además de este origen, las secuencias argentinas representaron un fuerte linaje Sudamericano de evolución independiente. El desarrollo de la vacuna a subunidad se basó en la expresión de la proteína VP2, mayoritaria de la cápside externa e inmunodominante, sola o fusionada a la molécula APCH (Antigen Presenting Cell Homing) capaz de dirigir moléculas a células presentadoras de antígeno, utilizando el sistema de expresión de baculovirus. Los ensayos de inmunogenicidad en cobayos y bovinos utilizando estos dos antígenos, resultaron en altos títulos de anticuerpos neutralizantes similares a los evocados por la vacuna formulada con virus inactivado. Más aún, se obtuvieron títulos comparables para VP2 y dosis 4 veces menores de APCH-VP2 demostrando la capacidad APCH de potenciar la generación de anticuerpos. Como caracterización de la respuesta inmune asociada se analizó el perfil de inmunoglobulinas G y la presencia de células T de memoria. El perfil de IgG en los bovinos inmunizados con APCH-VP2 mostró una mayor proporción de IgG1 en comparación con los grupos vacunados con VP2 sola o con el virus inactivado. Por otro lado, la inmunización con las vacunas experimentales, mostró generación de células T de memoria para VP2 sola. Además, se comprobó la capacidad de las vacunas recombinantes de diferencias animales vacunados de infectados. Esta sección constituye un aporte en el desarrollo de vacunas a subunidad, capaces de generar una respuesta inmune comparable a vacunas inactivadas pero con características emergentes. Abstract: Bluetongue disease affects principally wild and domestic ruminants and represents a major barrier to animal trade and their sub products. The etiological agent is the Bluetongue Virus, it is transmitted by hematophagous arthropods from the genus Culicoides. Bluetongue Virus is the prototype member of genus Orbivirus and it belongs to Reoviridae family. The non enveloped virión is composed by two concentric protein layer which contents the viral genome, composed by ten dsRNA segments. This genome codifies for 7 structural proteins and at least, 4 non structural proteins. Bluetongue Virus is worldwide distributed, although there is a lack of information in certain regions. In Southamerica, serologic evidences of Bluetongue Virus were recorded in all countries except Uruguay and Bolivia. Argentina and Brazil are the only two countries where the virus was isolated. In Argentina, five Bluetongue Virus serotype 4 isolates have been obtained from asymptomatic cattle. Three isolates were obtained in years 1999-2001, and two in years 2009 and 2010 as result of this thesis work. Prophylactic immunization of susceptible animals is the most practical and effective measure to prevent Bluetongue disease. From beginning of XX century, attenuated and inactivated vaccines against Bluetongue Virus have been developed, however, biosafety issues and the well known adverse effects lead to the development of subunit vaccines as an alternative to classic ones. In this work, we performed a molecular epidemiology study of Argentinean Bluetongue Virus isolates and we also developed a subunit vaccine delivered to antigen presenting cells. The molecular epidemiology approach was based on the sequence analysis from 5 out of 10 genome segments (Segments 2, 3, 6, 7, and 10). Segments 2 and 6 analysis showed that Argentinean sequences grouped into the serotype 4 cluster and nucleotype A group, and even more, they grouped in a unique Argentinean cluster whit high bootstrap value. Segments 3, 7 and 10 analysis, showed that Argentinean isolates grouped into a western topotype cluster, along with sequences already classified as originated in Africa and/or Europe. Phylogenetic analysis revealed that all Argentinean sequences formed a well supported Southamerican lineage with independent evolutionary history. The subunit vaccine development was based on the baculoviral expression of VP2 protein, the major and immunodominant component of the outer capsid, alone or fussed to a molecule named APCH (antigen presenting cell homing), capable to deliver peptides or molecules to antigen presenting cells. Immunogenicity assays conducted in guinea pigs and cattle showed that both antigens were able to induce high neutralizing antibodies titers similar to those evoked by the inactivated vaccine. Moreover, VP2 antibody titers were comparable to APCH-VP2 titers which were generated using a 4 times lower dose of antigen, demonstrating the ability of APCH molecule to enhance the generation of antibodies. As part of the immune response characterization, immunoglobulin G profile and the presence of memory T cells were analyzed. IgG profile in animals vaccinated whit APCH-VP2 showed a higher proportion of IgG1 in comparison with VP2 and inactivated BTV groups. On the other hand, immunization with both candidate vaccines showed the generation of memory T cells specific to VP2. In addition, the capacity of the recombinant vaccine to differentiate vaccinated animal from infected ones was confirmed. This section represents a contribution in the development of Bluetongue Virus subunit vaccines capable of generating an immune response comparable to inactivated vaccines but with new and advance features.
Cita tipo APA: Legisa, Danilo Mario . (2014-04-03). Estudio de aislamientos nacionales y desarrollo de una vacuna a subunidad, direccionada a células presentadoras de antígenos, para el Virus de la Lengua Azul. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5526_Legisa.pdf Cita tipo Chicago: Legisa, Danilo Mario. "Estudio de aislamientos nacionales y desarrollo de una vacuna a subunidad, direccionada a células presentadoras de antígenos, para el Virus de la Lengua Azul". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-04-03. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5526_Legisa.pdf |
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Sganga, Leonardo. "Identificación de ejes quimiotácticos que guían células madre mesenquimales al estroma tumoral en adenocarcinomas mamarios" (2014-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El crecimiento tumoral depende en gran medida en la interacción de las células tumorales con el microambiente que las circunda. Entre otras células que componen el estroma tumoral se encuentran precursores locales y precursores estromales o células madre mesenquimales (MSCs) que se alojan en el tumor tras ser reclutadas desde la médula ósea. En base a esto surge la pregunta: ¿cuáles de los factores del microambiente tumoral son los responsables de la migración de MSCs provenientes de médula ósea? Utilizando un modelo in vitro del microambiente tumoral representado por medios condicionados (MC) por muestras humanas de adenocarcinomas mamarios realizamos un estudio proteómico de citoquinas y quimioquinas sobre 8 muestras tumorales, destacándose IL-6, GRO, IL-8 y MCP-1 como los factores más representados de los medios condicionados por tumores, siendo el perfil muy similar entre todas las muestras tumorales. En busca de un modelo que remede el aporte de factores quimiotácticos por parte de los tumores humanos, se crecieron tumores ortotópicos en ratones nude combinando una línea tumoral mamaria humana con fibroblastos humanos adultos. Utilizando este modelo, se logró cuantificar las MSCs llegadas tras migración local luego de ser inyectadas de modo peritumoral. En una validación técnica y funcional in vitro, IL-6 resultó ser quimiotáctico para MSCs pero en concentraciones mucho mayores a las encontradas en los tumores; sin embargo no se descarta un rol de IL-6 directo o indirecto. Por otra parte los ejes quimiotácticos de GRO, IL-8 y MCP-1 no revelaron un aporte significativo sobre la migración de MSCs. Por otro lado, de un análisis estadístico y funcional comparando los MC provenientes de tumores y tejidos adyacentes libres de patología, resultó una lista de factores diferencialmente representados de los cuales MIP-3α o proteína inflamatoria de macrófagos 3 alfa surge como el factor más relevante como posible mediador del reclutamiento de las MSCs hacia el tumor. La validación funcional del eje quimiotáctico MIP-3α / CCR6 sugiere que este eje estaría involucrado, al menos en parte, en la migración de MSCs hacia tumores. En suma, hemos logrado identificar un factor relevante para la modulación de la migración de las MSCs hacia el tumor, factible de ser utilizado en estudios posteriores para el diseño de terapias celulares contra el cáncer. Abstract: Tumor growth depends greatly on the interaction of tumor cells with the surrounding microenvironment. Among other cells comprising the tumor stroma, there are local precursors and stromal precursors or mesenchymal stem cells (MSCs) that home into the tumor after being recruited from the bone marrow. Based on this, the question arises: which of the factors from the tumor microenvironment are responsible for the migration of bone marrow-derived MSCs? Using an in vitro model for the tumor microenvironment represented by conditioned media (CM) from human samples of breast adenocarcinomas, we performed a proteomic study of cytokines and chemokines in 8 tumor samples, highlighting IL-6, GRO, IL-8 and MCP-1 as the most represented factors in tumor -conditioned media, with a very similar profile among all tumor samples. Looking for a model that represents the contribution of chemotactic factors from human tumors, orthotopic tumors were grown in nude mice by combining a human mammary tumor cell line with human adult fibroblasts. Using this model, we were able to quantify MSCs arriving after local migration after being injected in a peritumoral way. In a technical and functional in vitro validation, IL-6 was found to be chemotactic for MSCs but at much higher concentrations than those found in tumors; however, we cannot disregard a direct or indirect role for IL-6. Moreover, chemotactic axis involving GRO, IL-8 and MCP-1 did not reveal a significant contribution on MSCs migration. Furthermore, a statistical and functional analysis comparing MC from tumors and adjacent tissues free of pathology, resulted in a list of factors differentially represented where MIP-3α or macrophage inflammatory protein- 3 alpha emerges as the most relevant factor as possible mediator for the recruitment of MSCs to the tumor. Functional validation of the chemotactic axis MIP-3α / CCR6 suggested that this axis would be involved, at least in part, on MSCs migration to tumors. In summary, we could identify a factor relevant for the modulation of MSCs migration into the tumor, likely to be used in subsequent studies to design cell therapies against cancer.
Cita tipo APA: Sganga, Leonardo . (2014-03-31). Identificación de ejes quimiotácticos que guían células madre mesenquimales al estroma tumoral en adenocarcinomas mamarios. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5518_Sganga.pdf Cita tipo Chicago: Sganga, Leonardo. "Identificación de ejes quimiotácticos que guían células madre mesenquimales al estroma tumoral en adenocarcinomas mamarios". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5518_Sganga.pdf |
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Kasulin, Luciana. "Variación genética natural en las respuestas de escape al sombreado en Arabidopsis thaliana" (2014-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las señales lumínicas percibidas por los fotorreceptores son importantes para una aclimatación adecuada de las plantas a su ambiente natural. Las plantas detectan la baja relación rojo:rojo-lejano (R/RL) reflejada por la proximidad de las plantas vecinas respondiendo morfológicamente antes de ser sombreadas. La disminución de luz R/RL promueve en las plantas el síndrome de escape al sombreado, SAS (del inglés, Shade Avoidance Syndrome) un conjunto de respuestas morfológicas que promueve el crecimiento de las estructuras vegetativas y mejora la competencia por luz evitando el sombreo por plantas vecinas. Es común encontrar una importante variación natural entre poblaciones de una misma especie en respuesta a la luz. El objetivo de esta tesis fue estudiar la variación natural en las respuestas asociadas al SAS en Arabidopsis thaliana, un modelo funcional muy atrayente para comprender cómo el genotipo determina la expresión de la plasticidad adaptativa de las plantas en ambientes lumínicos cambiantes. Mediante el mapeo de QTL en tres líneas recombinantes y endrocriadas, RILs (del inglés, Recombinant Inbred Lines) que comparten una misma línea parental, Landsberg erecta, se identificaron los QTL comunes y divergentes en la respuesta de crecimiento del hipocotilo entre las poblaciones. Además se determinó y caracterizó la contribución de ERECTA en distintas respuestas asociadas al SAS en las cuales los efectos pleiotrópicos de este gen fueron dependientes del fondo genético. Por otro parte, se realizaron mapeos de asociación de GWAS (del inglés, Genome Wide Association Study) para caracteres vegetativos, florales y reproductivos en plantas cultivadas en condiciones de radiación natural y sombreado en el invernáculo. Si bien la resolución de los mapeos GWAS fue baja, se identificaron dos QTNs (del inglés, Quantitative Trait Nucleotide) asociados al largo de la lámina y del vástago floral. Además, se estudió la fisiología y la diversidad genética de plantas de A.thaliana recolectadas en la Patagonia Argentina. El árbol de similitud genética sugiere que las poblaciones patagónicas son idénticas entre sí y similares a las accesiones originarias de Italia, siendo la más cercana Tívoli. Por otra parte, se determinó que la accesión Patagonia es hiposensible a la luz roja y a la SAS, y tiene requerimientos de vernalización que correlacionan con los patrones de expresión de FLC. Finalmente, esta tesis ha contribuido a la incorporación de un nuevo genotipo de A.thaliana al germoplasma de esta especie que puede ser de interés para estudios futuros. Abstract: Light signals perceived by photoreceptors are important for acclimation of plants to their natural environment. Plants detect low Red/Far-Red (R/FR) ratio reflected by the proximity of neighboring plants responding morphologically before being shaded. The decrease of R/FR ratio promotes the shade avoidance syndrome, SAS, a set of morphological responses that promotes the growth of vegetative structures to improve competition for photosynthesis light. It is common to find a large natural variation among populations of the same species in response to light. The aim of this thesis was to study the SAS natural variation in Arabidopsis thaliana, a small crucifera and an attractive model to understand how genotype determines the expression of plant adaptive plasticity in changing light environments. By mapping strategies, we explored the genetic bases of allelic variations associated to the phenotype. We found common and divergent QTL (Quantitative Trait Loci) for hypocotyl growth induced by simulated shade among three RIL (Recombinant Inbred Lines) populations sharing the same parental line, Landsberg erecta. Furthermore we characterized the contribution of ERECTA in the shade. We found ERECTA pleiotropic effects in the SAS being its effects dependent on the genetic background. Also we carried out genome wide mapping association study (GWAS) for vegetative, floral and reproductive traits for plants grown under natural radiation and shade light in a greenhouse. However GWAS resolution was low in our conditions, we mapped two QTNs (Quantitative Trait Nucleotide) associated with the length of leaf and flowering stem. Moreover, we studied the physiology and genetic diversity of A.thaliana plants collected in Patagonia, Argentina. The genetic similarity analysis suggests that Patagonia populations are identical between them, and similar to genotypes from Italy, being the closest Tivoli accession. In addition, we demonstrated that Patagonia accession is hyposensitive to red light and SAS, and it has vernalization requirements that correlate with the expression patterns of FLC. This thesis also contributes adding a new genotype in the A.thaliana germplasm that may be of interest for future studies.
Cita tipo APA: Kasulin, Luciana . (2014-03-31). Variación genética natural en las respuestas de escape al sombreado en Arabidopsis thaliana. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5493_Kasulin.pdf Cita tipo Chicago: Kasulin, Luciana. "Variación genética natural en las respuestas de escape al sombreado en Arabidopsis thaliana". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5493_Kasulin.pdf |
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Fernández Di Pardo, Agustina. "Contaminación en suelos de la provincia de Buenos Aires con el herbicida organofosforado (glifosato) : impacto sobre la comunidad de hongos filamentosos" (2014-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El herbicida más utilizado en Argentina es el N-phosphonomethylglycine (nombre comercial: Glifosato). Éste puede ser rápida y completamente degradado por los microorganismos, por lo que el tiempo de vida en el suelo es bajo. Sin embargo, el comportamiento del glifosato puede variar en función de las características físicas y químicas del suelo sobre el que se aplique. Por lo tanto, el tiempo de permanencia en el suelo podría ser mayor. Es importante estudiar el comportamiento de este herbicida dada las potenciales alteraciones que puede provocar en las comunidades de microorganismos que viven en el suelo y en algunos de sus procesos. La contaminación de los suelos no sólo está afectando su biodiversidad microbiana sino también a su fertilidad, dado que los microorganismos son fundamentales para el proceso de reciclaje de nutrientes. En este trabajo, se compararon comunidades de hongos filamentosos provenientes de suelos con y sin historia de aplicación de glifosato y se evaluó la capacidad de los hongos filamentosos en la recuperación de suelos contaminados por el herbicida glifosato. Para ello, se aislaron y caracterizaron hongos filamentosos del suelo en dos sitios con distinta historia de aplicación de glifosato utilizando dos técnicas distintas (método tradicional de lavado de muestras múltiples y siembra de partículas de suelo y el método de pirosecuenciación). Se seleccionaron cepas tolerantes a glifosato, se estudiaron los efectos del glifosato sobre los hongos luego de una aplicación puntual y se evaluó la presencia de glifosato en el suelo. Se observó que las poblaciones fúngicas del suelo varían en su composición específica y en su biomasa en suelos expuestos a glifosato en comparación con suelos sin exposición. La mayor riqueza específica y los mayores valores de ergosterol, como medida indirecta de biomasa, se obtuvieron en suelos sin historia de prácticas agrícolas. Se lograron obtener cepas tolerantes al glifosato: T. harzianum; F. oxysporum; P. lilacinus; C. didymum. Finalmente, los valores de concentración de glifosato en suelos fueron bajos y prácticamente nulos luego de 3 meses de la aplicación en la mayoría de los casos. Abstract: The most widely used herbicide in Argentina in de N-phosphonomethylglycine (glyphosate). Because it can be rapidly and completely degraded by microorganisms, it disappears quickly from soil. However, the destiny of glyphosate in soil may vary depending on the physical and chemical soil characteristics. It is important to study the behavior of this herbicide given the potential changes that may produce in the communities of microorganisms and in the processes that involves them. The soil contamination with this herbicide no only affects the microbial biodiversity, but also its fertility, considering that microorganisms are a fundamental part of the nutrient recycling process in soil. In this study, changes in filamentous fungi communities’ from soils that were previously or not exposed to the herbicide and the capacity of some strains of remediating contaminated soils were evaluated. Soil fungi were isolated and communities were characterizes in two sites with different history of exposure to glyphosate, using two techniques: traditional isolation method (morphological) and pyrosequencing (molecular). Tolerant strains of fungi were selected; effects of recent glyphosate application on soils fungal communities was evaluated and remnant glyphosate in soil was quantified. In conclusion, soil fungal community changes and fungal biomass reduction were observed after glyphosate application. Six tolerant strains were obtained: T. harzianum; F. oxysporum; P. lilacinus; C. didymum. The concentration of glyphosate in soil was practically zero after 3 month from application.
Cita tipo APA: Fernández Di Pardo, Agustina . (2014-03-31). Contaminación en suelos de la provincia de Buenos Aires con el herbicida organofosforado (glifosato) : impacto sobre la comunidad de hongos filamentosos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5443_FernandezDiPardo.pdf Cita tipo Chicago: Fernández Di Pardo, Agustina. "Contaminación en suelos de la provincia de Buenos Aires con el herbicida organofosforado (glifosato) : impacto sobre la comunidad de hongos filamentosos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5443_FernandezDiPardo.pdf |
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Boffi, Juan Carlos. "Receptor nicotínico colinérgico alfa9alfa10: propiedades funcionales y farmacológicas" (2014-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La activación del receptor nicotínico colinérgico α9α10 presente en los contactos sinápticos entre las fibras colinérgicas eferentes olivococleares y las células ciliadas del órgano de Corti puede prevenir el trauma acústico. En consecuencia, incrementar su activación mediante el uso de potenciadores farmacológicos, conocer las condiciones en las cuales este receptor alcanza una activación óptima o estudiar su mecanismo de activación, podría tener un potencial valor terapéutico para la prevención de la pérdida de audición causada por exposición a intensidades altas de sonido. Por lo tanto, los objetivos de este trabajo fueron: caracterizar nuevos moduladores positivos para el receptor α9α10, estudiar las condiciones en las que alcanza una activación óptima y describir los requerimientos estructurales para su activación. En relación a la búsqueda de potenciadores farmacológicos, en este trabajo caracterizamos al ácido ascórbico (ASC) como modulador positivo de receptores recombinantes α9α10 expresados en oocitos de Xenopus laevis, mediante fijado de voltaje con dos electrodos. Evidenciamos que la potenciación por ASC de α9α10 no afecta la afinidad aparente por acetilcolina (ACh) ni la sensibilidad al voltaje del receptor, pero si incrementa significativamente las amplitudes máximas de corriente evocada. Este efecto es estereoespecífico de la forma L y reducida de ASC. Nuestros resultados sugieren que el mecanismo de potenciación involucraría una interacción alostérica estereoespecífica. Para caracterizar las condiciones en las cuales el receptor α9α10 alcanza una activación óptima, estudiamos la influencia del Ca2+ extracelular en la activación del receptor recombinante α9α10. Este receptor es potenciado a concentraciones sub-mM de Ca2+ y es bloqueado a concentraciones superiores. La incorporación de la subunidad α10 al pentámero es responsable de la potenciación a concentraciones sub-mM de Ca2+. Mediante mutagénesis dirigida y generación de receptores quiméricos, evidenciamos que las interfaces entre los dominios extracelulares de una subunidad α9 y otra α10 adyacente son clave en este proceso. Finalmente, estudiamos el proceso de activación de receptores recombinantes α9α10, caracterizando la importancia de cada subunidad en la formación de sitios de unión a ACh funcionales. Evidenciamos que los componentes principales del sitio de unión a ACh de tanto las subunidades α9 como de las α10 son necesarios para la activación del receptor α9α10 y que los componentes complementarios de α9 son indispensables para este proceso. Abstract: The activation of the α9α10 nicotinic cholinergic receptor present at the synaptic contacts between efferent olivocochlear cholinergic fibers and hair cells of the organ of Corti can prevent acoustic trauma. In consequence, to enhance its activation by means of a pharmacological potentiator, to know the conditions in which it reaches maximal activation or to study its activation mechanism, could have a potential therapeutic use in the prevention of noise induced hearing loss. Hence, the aims of this work were to characterize new positive modulators of the α9α10 receptor, to study the conditions in which it reaches optimal activation and to describe its structural requirements for activation. Searching for new positive modulators of α9α10, in this work we characterized ascorbic acid (ASC) as a potentiator of recombinant α9α10 receptors expressed in Xenopus laevis oocytes by two electrode voltage clamp recordings. We evidenced that the potentiation produced by ASC does not affect the receptor’s apparent affinity for acetylcholine (ACh) or its voltage sensitivity, but it significantly increases the maximal evoked current amplitudes (Imax). This effect is stereospecific of the reduced L stereoisomer of ASC. Our results suggest that the potentiation mechanism could involve a stereospecific allosteric interaction. To characterize the conditions in which the receptor reaches optimal activation, we studied the influence of extracellular Ca2+ on the activation levels of the recombinant α9α10 receptor. This receptor is potentiated at sub-mM Ca2+ concentrations and is blocked by higher concentrations. The incorporation of α10 subunits to the pentamer is responsible for the potentiation observed at sub-mM Ca2+ concentrations. Using site directed mutagenesis and generating chimeric receptors, we evidenced that the interphase between the extracellular domains of adjacent α9 and α10 subunits is a key structural determinant in this process. Finally, we studied the process of activation of recombinant α9α10 receptors characterizing the importance of each subunit in the conformation of functional ACh binding sites. We evidenced that the principal components of the ACh binding site provided by both α9 and α10 subunits are necessary for the activation of α9α10 receptors and that the complementary components provided by α9 subunits are essential for this process.
Cita tipo APA: Boffi, Juan Carlos . (2014-03-31). Receptor nicotínico colinérgico alfa9alfa10: propiedades funcionales y farmacológicas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5593_Boffi.pdf Cita tipo Chicago: Boffi, Juan Carlos. "Receptor nicotínico colinérgico alfa9alfa10: propiedades funcionales y farmacológicas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5593_Boffi.pdf |
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Pieslinger, German Eduardo. "Ajuste del acoplamiento electrónico en oligómeros lineales de iones rutenio puenteados por cianuro" (2014-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo se desarrolla la síntesis, caracterización estructural y análisis de las propiedades espectroscópicas y electroquímicas de una serie de oligómeros de rutenios puenteados por cianuro. El objetivo principal de esta tesis es explorar el efecto de sintonizar la energía de los centros metálicos cambiando los ligandos auxiliares con el fin de obtener complejos que estén en la frontera de delocalización electrónica. Estos compuestos se preparan a partir de la reacción de tetrapiridinas de rutenio dicianuradas (trans-) con fragmentos RuII(T)(bpy)}, siendo L = piridina (py), 4- metoxipiridina (MeOpy) o 4-dimetilaminopiridina (DMAP); T = 2,2’;6’,2’’-terpiridina (tpy) o tris(1-pirazolil)metano (tpm) y bpy = 2,2’-bipiridina. Todos los complejos dinucleares y trinucleares así obtenidos mantienen sus centros metálicos como RuII, los cuales adoptan una configuración lineal en todos los casos. Algunos de ellos fueron caracterizados por cristalografía de rayos X de monocristal, la cual mostró que los oligómeros están formados por fragmentos robustos ya que el cambio de ligandos auxiliares no impacta apreciablemente en las distancias de enlaces al comparar compuestos análogos. Mediante la técnica de espectroelectroquímica se estudió la espectroscopía UV-vis, NIR e IR de todos los estados de oxidación de los compuestos sintetizados. La espectroscopía electrónica de los estados de valencia mixta presenta intensas bandas de transferencia de carga metalmetal, las cuales aumentan en intensidad y se hacen asimétricas a medida que aumenta el acoplamiento electrónico entre los rutenios. En la familia de complejos trinucleares trans- 3+, mientras más básico es el ligando L, mayor es la comunicación electrónica entre los fragmentos terminales. El caso extremo se da con L = DMAP donde se logra la completa delocalización electrónica; siendo este, el primer ejemplo reportado en literatura de un trímero puenteado por cianuro Clase III. Resultados similares se obtienen al reemplazar los cloros terminales por acetonitrilos en el complejo trans-2+. Para estudiar la interacción metal-cianuro-metal y la naturaleza de las transiciones electrónicas asociadas, se realizaron cálculos de DFT (Density Functional Theory) y TD-DFT (Time- Dependent Density Functional Theory), tanto en vacío como en solvente, para todas las especies redox de los complejos medidos experimentalmente. Estos cálculos resultaron una herramienta muy útil para asignar a algunos de los sistemas estudiados como delocalizados (Clase III). Además, nos permitieron explicar el drástico cambio en el acoplamiento electrónico al cambiar la py por MeOpy en los dímeros trans-3+, donde el análisis de orbitales moleculares del sistema más desacoplado muestra que el orbital donor y el aceptor se encuentran perpendiculares. Esto nos permite concluir que es necesario considerar la orientación relativa de los orbitales moleculares del sitio donor y el aceptor, además de sintonizar las energías de los fragmentos cuando se desea ajustar el acoplamiento de los centros metálicos. Abstract: In this work, we present the synthesis, structural characterization and analysis of the spectroscopic and electrochemical properties of several mixed-valence cyanide-bridged linear oligomers of ruthenium ions. The main purpose of this work is the exploration of result of tuning the energy of metal ions through changes in the auxiliary ligands in order to obtain complexes in the frontier of electronic delocalization. These compounds are prepared from the reaction of dicyanotetrapyridines ruthenium complexes (trans-) with fragments like RuII(T)(bpy)}, with L = pyridine (py), 4-methoxipyridine (MeOpy) or 4-dimethylaminopyridine (DMAP); T = 2,2’;6’,2’’- terpyridine (tpy) o tris(1-pirazolyl)methane (tpm) and bpy = 2,2’-bipyridine. All the dinuclear and trinuclear complexes contain RuII ions in linear configuration. It was to possible to determine the crystal structure of some of the reported complexes and their structure show the geometry of the resulting oligomers is not greatly changed by the substitution of the ligands. Through spectroelectrochemical experiments in the vis-NIR and in the IR we have been able to characterize the spectroscopy of the ion studied in all their redox states. The mixed valence ion show intense intervalence transitions in the NIR. The properties of these bands together with behavior of the cyanide stretches in the IR, allowed us to assess the degree of delocalization of the ground state of the mixed-valence complexes. In the family of complexes trans-3+, a more basic L ligand result in increase of electronic communication between the terminal ions. When L = DMAP, the spectroscopy indicates that ion is a Class III system, being this the first example of this behavior for a cyanide-bridged system in the literature. Similar results can be obtain by the replacement of the terminal chlorides by acetonitrile in the ion trans-3+. In order to study the interaction metal-cyanide-metal and the nature of the electronic transitions observed, we performed DFT (Density Functional Theory) y TD-DFT (Time- Dependent Density Functional Theory), both in vacuum and in modeled solvent, on all the redox states of the reported complexes. These results reproduce the observed spectroscopy for all the systems in Class II-III or Class III and this coincidence in a strong indicator that the systems under study belong to these classes. Additionally, the calculation provided an explication of the contrasting spectroscopies in trans-3+ when the py ligand is replaced by MeOpy. In the latter case, acceptor orbital is perpendicular to the cyanide bridge, which results in a weaker electronic coupling. This result emphasis the importance to consider the orientation of the interacting orbital in addition of their energy.
Cita tipo APA: Pieslinger, German Eduardo . (2014-03-28). Ajuste del acoplamiento electrónico en oligómeros lineales de iones rutenio puenteados por cianuro. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5435_Pieslinger.pdf Cita tipo Chicago: Pieslinger, German Eduardo. "Ajuste del acoplamiento electrónico en oligómeros lineales de iones rutenio puenteados por cianuro". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5435_Pieslinger.pdf |
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Gulizia, Carla Natalia. "Estudio de la variabilidad hidrológica de la Cuenca del Plata en respuesta a diferentes forzantes climáticos locales y regionales" (2014-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La relación entre el cambio climático y los recursos de agua dulce es una de las principales preocupaciones de la comunidad científica y la sociedad en general. Sin embargo, el cambio climático es sólo uno de los diversos factores que ponen en riesgo los recursos hídricos. Los cambios en el uso de suelo, el manejo de agroquímicos y la instalación de represas, entre otros factores, también pueden alterar el sistema hidrológico. El presente trabajo se centra en Sudamérica, en particular en la cuenca del Plata, dado que esta región es sumamente relevante por ser una de las principales fuentes de agua dulce en el mundo y por tener una gran importancia socio-económica. Una mejor comprensión de la variabilidad hidrológica de la cuenca en el contexto de la variabilidad y el cambio climático es imprescindible para generar información que pueda ser relevante para hidrólogos y responsables de la gestión de los recursos hídricos. En consecuencia, el objetivo general en el que se enmarca la presente Tesis Doctoral consiste en avanzar en el conocimiento y caracterización estadística de la variabilidad hidrológica de los grandes ríos de la cuenca del Plata en respuesta a diferentes forzantes climáticos locales y regionales y realizar una evaluación de la habilidad de Modelos Climáticos Globales (MCGs) para representar dichos forzantes. Los MCGs analizados en cuanto a su habilidad para representar el clima presente (precipitación, transporte y convergencia de humedad) fueron los que conforman las bases denominadas WCRP/CMIP3 y CMIP5. En esta tarea se utilizaron los valores mensuales provistos por cada MCG para el clima presente (experimentos 20C3M para CMIP3 e historical para CMIP5) y se realizó un estudio comparativo del desempeño de ambas generaciones de MCGs. Asimismo, se elaboraron escenarios futuros de precipitación y transporte/convergencia de humedad a partir de los MCGs que mejor habilidad demostraron para representar el clima presente. En particular las simulaciones que se utilizaron correspondieron a los escenarios SRESA1B para CMIP3, y RCP4.5, para CMIP5. El principal objetivo de este último estudio fue el de analizar si la convergencia de humedad podría ser el principal mecanismo que permita explicar los escenarios futuros de precipitación. Por otra parte, se realizó una caracterización estadística de la precipitación y de los caudales de diferentes ríos que conforman la cuenca del Plata en términos de escalas espaciales y temporales. Más aún, se estudió exhaustivamente la variabilidad temporal de los caudales correspondientes a los puntos de cierre de 6 sub-cuencas definidas dentro de la Cuenca del Plata a través de un análisis espectral realizado en el marco MEM (en inglés, Maximum Entropy Method). Finalmente se propuso evaluar en qué medida la variabilidad de la precipitación permitía explicar la variabilidad de los caudales. Para este propósito se diseñaron dos modelos estadísticos de relación entre el caudal y la precipitación (RRM, rainfall-runoff model) a partir del planteo de balance de agua para escalas temporales donde el almacenaje de agua en el suelo es despreciable. A partir de la regresión lineal entre la información histórica de la precipitación caída en cada sub-cuenca y los caudales en los puntos de cierre correspondientes, se dedujeron los hidrogramas unitarios en cada caso para estudiar el retardo de los caudales y se compararon los espectros correspondientes a los caudales simulados y observados. Finalmente, la evapotranspiración se estimó a través de diversas parametrizaciones propuestas en la literatura, entre ellas una que considera el efecto de la vegetación con el objetivo de estimar las consecuencias de los cambios en el uso de suelo sobre los caudales. Palabras claves: Cuenca del Plata, Cambio Climático, Variabilidad Climática, Modelos Climáticos Globales, Modelo Estadístico, Precipitación, Transporte de Humedad, Caudales Superficiales Abstract: The link between climate change and freshwater resources is a major concern of the scientific community and the society as a whole. However, climate change is only one of several factors that threaten water resources. Land use changes, agrochemicals management and dams’ installation, among others, may also alter the hydrological system. The present study focuses in South America, particularly in La Plata basin, since this region is extremely important for being one of the main sources of freshwater in the world and because it has a great socio-economic importance. A better understanding of hydrological variability of the basin in the context of climate change and variability is essential to generate information that may be relevant to hydrologists and water resources managers. Consequently, the overall objective, in which this PhD thesis is framed, is to advance in the knowledge and statistical characterization of hydrological variability of the great rivers of the Plata Basin in response to different local and regional climate forcings and to evaluate the ability of Global Climate Models (GCMs) to represent these forcings. The GCMs which were assessed for their ability to represent the present climate (precipitation, moisture transport and convergence) were those which are part of the known multi-model datasets WCRP/CMIP3 and CMIP5. In this task monthly values provided by each GCM for present climate (experiments were 20C3M for CMIP3 and historical for CMIP5) were used to perform a comparative study of the ability of both generations of GCMs. Precipitation and moisture convergence/transport future scenarios were also developed from those GCMs that had shown the best representation of the present climate. The particular analyzed scenarios were SRESA1B for CMIP3 and RCP4.5 for CMIP5. The main objective of the latter study was to assess if the moisture convergence could be the main mechanism to explain the precipitation projections. On the other hand, a statistical characterization of precipitation and runoff data from different rivers within La Plata basin was assessed in terms of spatial and temporal scales. Moreover, runoff temporal variability corresponding to the closing points of 6 defined subbasins within La Plata Basin was studied extensively through spectral analysis based on the maximum entropy method (MEM). Finally, it was aimed to evaluate to what extent the precipitation variability helps to explain the runoff variability. For this purpose two runoff-rainfall statistical models were designed based on the water balance equation for temporal scales where the soil water storage can be considered negligible. In order to study the river discharges delay, unit hydrographs for each sub-basin were deduced from the linear regression between the areal mean of historical precipitation and the corresponding closing point’s runoff data. Spectral densities derived from observed and simulated runoff time series were compared. Finally, the evapotranspiration was estimated through various parameterizations proposed in the literature, including one that considers the effect of vegetation in order to assess the runoff response to land use changes. Key words: La Plata Basin, Climate Change, Climate Variability, Global Climate Models, Statistical Model, Precipitation, Moisture Transport, Surface Discharges
Cita tipo APA: Gulizia, Carla Natalia . (2014-03-28). Estudio de la variabilidad hidrológica de la Cuenca del Plata en respuesta a diferentes forzantes climáticos locales y regionales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5520_Gulizia.pdf Cita tipo Chicago: Gulizia, Carla Natalia. "Estudio de la variabilidad hidrológica de la Cuenca del Plata en respuesta a diferentes forzantes climáticos locales y regionales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5520_Gulizia.pdf |
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Godoy, Manuel Santiago. "Efectos del sistema regulador CreBC sobre el flujo de carbono en Escherichia coli y su manipulación para incrementar la síntesis de compuestos de interés industrial" (2014-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La supervivencia de un organismo depende, al menos en parte, de su habilidad para sensar y responder a cambios en el ambiente. En las bacterias, los cambios en las características físicas y nutricionales del ambiente generan respuestas inmediatas, a través de la regulación de conjuntos de genes en respuesta a un estímulo específico del ambiente y a señales metabólicas. En el presente trabajo se evaluó el efecto de cambios en CreC, el sensor del sistema regulador de dos componentes CreBC, sobre el metabolismo central de E. coli. Se estudió el efecto de mutaciones en el gen creC en cepas crecidas en medio mineral M9 con glucosa y glicerol como fuente de carbono, y en distintas condiciones de aerobiosis. La ausencia de CreC generó mayores efectos en M9 glucosa y en bajas tensiones de oxígeno tanto para la secreción de metabolitos (acetato, formiato, lactato y succinato) como para las actividades enzimáticas acetato quinasa (ACK) y lactato deshidrogenasa (LDH). De los cuatro metabolitos mencionados, la cepa ΔcreC (DC1060) produjo más acetato, formiato y succinato y menos lactato, y reportó una mayor actividad ACK y menor actividad LDH. El estudio de los niveles de transcripción a través de fusiones trascripcionales del gen gfp (codifica la proteína verde fluorescente, Gfp) a los promotores de los genes de las enzimas estudiadas ackA (ACK) y ldhA (LDH) confirmaron que la menor actividad LDH de la cepa DC1060 se correspondía con niveles inferiores de transcripto del gen (en la fase exponencial). Para la fusión ackA-gfp, en cambio, los niveles de transcripción fueron leve pero significativamente menores en la cepa mutante respecto a la salvaje (K1060) en esta fase, en contraposición a lo observado para la actividad ACK. La trascripción de este gen en la fase estacionaria, pasó a ser mayor en la cepa DC1060, demostrando un alto nivel de complejidad en la dinámica regulatoria de CreC sobre ackA. Mediante estudios similares a los antes descriptospero realizados con mutantes para los genes ΔcreB, ΔcreC y la doble mutante ΔcreBC, se estableció que los efectos de CreC están mediados exclusivamente por CreB. Se realizaron ensayos fisiológicos en los que se observó que la cepa mutante es más sensible a agentes oxidantes como el peróxido de hidrógeno y el paraquat, probablemente como resultado de un estado intracelular más oxidado respecto de la cepa salvaje (como se pudo establecer a partir de los coeficientes /, y los niveles de NADH/NAD+ intracelulares). También se observó que esta cepa tiene un consumo de oxígeno más bajo (- 30%) que la salvaje. Se realizaron ensayos en biorreactor con diferentes niveles de aireación (bajo, medio y alto) y dos fuentes de carbono (glicerol y glucosa) para caracterizar fermentativamente a las cepas K1060 y DC1060, a fin de establecer una estrategia para mejorar la producción de succinato y PHB, en conjunto con los resultados mencionados. Las mayores diferencias entre ambas cepas se observaron nuevamente a bajas concentraciones de oxígeno. De estas diferencias se destacan los siguientes resultados: (i) No hubo producción de lactato, y los niveles de etanol fueron muy bajos para ambas cepas y fuentes de carbono; (ii) el succinato fue detectable sólo en la cepa mutante con glucosa, pero a niveles inferiores que los obtenidos en los cultivos de frasco agitado; (iii) el formiato y el acetato, en medio mineral con glucosa, se produjeron en mayor cantidad para la cepa ΔcreC; (iv) la relación / volvió a reflejar un estado de mayor oxidación intracelular en la cepa ΔcreC (sólo con glucosa); (v) en glicerol como fuente de carbono, se observó un lag más pronunciado y una mayor energía de mantenimiento en la cepa DC1060 respecto a la K1060. Cuando se evaluó la producción de PHB mediante la expresión heteróloga de los genes phaCAB de R. eutropha, se vio que en glucosa la cepa mutante produce casi un 50% más de este polímero. Al probar los efectos del bicarbonato sobre la producción de succinato, vimos que la síntesis de este último aumentaba sólo en la cepa mutante. Para ver si era posible mejorar la producción de estos metabolitos, construimos una colección de cepas con distintas mutaciones de forma de anular las vías metabólicas competitivas. Estas mutaciones involucraron a los genes ackA, ldhA, ptsG, adhE y, por su puesto, creC. En el caso del PHB, ninguna de las cepas mejoró el desempeño de la simple mutante ΔcreC, quizás debido a que ya se alcanzó el máximo nivel de polímero tolerable por la célula. En el caso del succinato, además se sobre-expresaron dos carboxilasas de E. coli (la PEP carboxilasa y la PEP carboxiquinasa), cada una en combinación con la enzima formiato deshidorgenasa (Fdh1) de Candida Boidinii. De las distintas combinaciones estudiadas, la cepa que tuvo mayor producción de succinato fue la triple mutante ΔcreC, ΔackA, ΔadhE, sobreexpresando las enzimas PEP carboxilasa y la Fdh1, llegando a alcanzar una concentración de 6 mM de succinato. Abstract: The survival of an organism depends, at least in part, on its ability to sense and respond to changes in the environment. In bacteria, changes in the physical and nutritional characteristics of the environment generate immediate responses, controlled through the regulation of sets of genes in response to specific environmental stimuli and metabolic signals. The effect of changes in CreC, the sensor of the two component CreBC control system, on the central metabolism of E. coli was evaluated In this work. The effect of mutations in creC on central metabolism, were analyzed in M9 mineral medium with glucose and glycerol as the carbon source, and under different oxygen availability conditions. The absence of CreC generated more changes in glucose and low oxygen tensions for the secretion of metabolites (acetate, formate, lactate and succinate) and for the activity of the enzyme acetate kinase (ACK) and lactate dehydrogenase (LDH). Of the four metabolites mentioned, the ΔcreC (DC1060) strain produced more acetate, formate and succinate and less lactate, and reported a higher activity of ACK and lower activity of LDH. The study of the transcription levels via transcriptional fusions of gfp (coding for the green fluorescent protein, Gfp), to the promoters of the genes of the enzymes studied: ackA (ACK) and ldhA (LDH), confirmed that the reduced LDH activity of strain DC1060 matched lower levels of gene transcript (in exponential phase) For the ackA-gfp fusion, however, transcript levels were slightly but significantly lower in the mutant strain compared to the wild type (K1060) at this stage, as opposed to the enzymatic activity observed for ACK. The transcript of this gene in the stationary phase became higher in the DC1060 strain, demonstrating a high level of complexity in the regulatory dynamics of CreC over ackA. On similar studies using a ΔcreB mutant, and a ΔcreBC double mutant, it was established that the observed effects are exclusively mediated by CreB. Physiological studies indicated that the mutant strain is more sensitive to oxidizing agents such as hydrogen peroxide and paraquat, probably resulting from a more oxidized intracellular state when compared to the wild type (as could be established through the / ratio, and the intracellular levels of NADH / NAD+). It was also noted that this strain has a lower oxygen consumption rate than the wild type (-30 %). Tests were performed in a bioreactor with different aeration levels (low, medium and high) and two carbon sources (glycerol and glucose) to characterize the fermentation behavior of K1060 and DC1060 strains in order to establish a strategy to improve the production of succinate and PHB. The largest differences between the two strains were again observed at low oxygen concentrations. These differences can be summarized as : (i) there was no lactate production, and ethanol levels were very low for both strains and carbon sources , (ii) succinate was detectable only in the mutant strain with glucose, but to lower levels than in shake flask cultures , (iii) acetate and formate were produced in greater quantities by the ΔcreC strain in mineral medium with glucose, (iv) the ratio /
Cita tipo APA: Godoy, Manuel Santiago . (2014-03-28). Efectos del sistema regulador CreBC sobre el flujo de carbono en Escherichia coli y su manipulación para incrementar la síntesis de compuestos de interés industrial. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5464_Godoy.pdf Cita tipo Chicago: Godoy, Manuel Santiago. "Efectos del sistema regulador CreBC sobre el flujo de carbono en Escherichia coli y su manipulación para incrementar la síntesis de compuestos de interés industrial". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5464_Godoy.pdf |
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Urdaníz, María Corina. "Interacciones magnéticas en nanoestructuras de metales de transición depositadas sobre sustratos no metálicos" (2014-03-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo de tesis, a partir de cálculos de primeros principios, realizamos un estudio sistemático de la interacción magnética entre átomos de metales de transición 3d (Cr,Mn, Fe, y Co) al depositar cadenas de losmismos sobre unamonocapamolecular de nitruro de cobre (Cu2N) crecida sobre Cu(001). Nos propusimos reconocer el tipo de interacción magnética que subyace al magnetismo de estas cadenas y analizar, a su vez, como las propiedades magnéticas dependen del sitio de depósito de las mismas. Se comprobó que el efecto del sustrato, que es fuertemente covalente, es muy importante, obteniéndose que distintas geometrías de adsorción dan distinto estado fundamental magnético para una misma cadena y una misma distancia interatómica. Nuestros cálculos indican que en una de las geometrías, la interacción magnética más importante entre los átomos 3d es la de superintercambio. En esta configuración, el estado fundamental como función del llenado de la banda d, pasa de ser no magnético a ser ferromagnético, para finalmente ser antiferromagnético al final de la serie 3d. Posteriormente, y debido a la importancia de la interacción sp-d en la determinación de las interacciones magnéticas en estos sistemas, realizamos los cálculos reemplazando la monocapa de Cu2N por dióxido de cobre (Cu2O ). Estudiamos la dependencia de ls interacción magnética de tipo superintercambio entre los átomos de metal de transición (MT) de las cadenas, con el átomo mediador: nitrógeno (N) u oxígeno (O), según corresponda. Analizamos estos sistemas estudiando primero cadenas libres diatómicas del tipo MT-N y MT-O. Obtuvimos que el comportamiento de estas cadenas es muy similar a lo que se obtiene cuando las cadenas son depositadas sobre una monocapa de Cu2O. Con el objetivo de comprender la naturaleza de esta interacción, introdujimos un Hamiltoniano modelo de tipo superintercambio. Estimamos los parámetros necesarios que determinan la energía de intercambio utilizando la información procedente de las bandas obtenidas de los cálculos ab initio para las cadenas diatómicas MT-N y MT-O. Demostramos que un simple conjunto de parámetros y el uso de supuestos físicamente razonables podrían explicar las tendencias magnéticas observadas. Debido a su importancia para la espintrónica, se obtuvo además , la energía de anisotropía magnética de impurezas y cadenas de átomos de Cr, Mn y Fe depositadas sobre Cu2N/Cu(001). Determinamos los ejes fáciles de magnetización para todas las geometrías de adsorción. Finalmente, se presenta una discusión sobre cómo se modificarían las características de las interacciones mencionadas en función del ancho de capa de nitruro de cobre, considerando cadenas atómicas depositadas sobre bicapas y tricapas del nitruro. Abstract: In this thesis, we performed ab initio calculations, to do a systematic study of the magnetic interactions among 3d transition metal (TM) atoms (Cr, Mn, Fe and Co) building chains deposited on a molecular Cu2N monolayer, grown on Cu(001). The goal behind this study has been to recognize the type of magnetic interactions that underlie the magnetism of these chains, and also to analyze how the magnetic properties depend on the site of adsorption of the TM atoms. We find that the effect of the substrate, which is strongly covalent, is extremely important, obtaining that different adsorption geometries give rise to differentmagnetic ground states for the same chain and the same interatomic distances. Our calculations indicate that in one of the studied adsorption geometries, the more importantmagnetic interaction among the 3d atoms is superexchange-like. For this configuration, we find that the magnetic ground state as a function of increasing ’d’ filling, goes from non magnetic to ferromagnetic and finally to antiferromagnetic, at the end of the 3d series. Due to the importance of the sp-d interaction in determining the magnetic behavior of these systems, we performed calculations replacing the Cu2N monolayer by a copper oxide (Cu2O) monolayer and studied the dependence of the superexchange like magnetic interaction with the mediating atom: nitrogen (N) or oxygen (O). We started by studying unsupported diatomic chains of the TM-N and TM-O type, and obtained that the behavior of these chains is very similar to the one they show when deposited on the Cu2O monolayer. In order to understand the nature of this interaction, we introduced a superexchange model Hamiltonian and estimated the necessary parameters that determine the exchange energy using the information coming from the ab initio obtained bands for the unsupported diatomic chains. We demonstrated that a simple set of parameters and the application of physically reasonable assumptions are able to explain the observed magnetic trends. Due to its importance for spintronics, we also obtained themagnetic anisotropy energy of impurities and chains of Cr, Mn and Fe deposited on Cu2N/Cu(001).We determined the easy axis of magnetization for all adsorption geometries. Finally, a discussion is presented on how the characteristics of the interactions can be modified when the width of the underlying covalent substrate is increased.
Cita tipo APA: Urdaníz, María Corina . (2014-03-27). Interacciones magnéticas en nanoestructuras de metales de transición depositadas sobre sustratos no metálicos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5422_Urdaniz.pdf Cita tipo Chicago: Urdaníz, María Corina. "Interacciones magnéticas en nanoestructuras de metales de transición depositadas sobre sustratos no metálicos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5422_Urdaniz.pdf |
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Garate, Hernán. "Síntesis, caracterización y propiedades de materiales compuestos nanoestructurados reforzados con nanotubos de carbono" (2014-03-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La presente tesis tiene como objetivo desarrollar nuevos materiales compuestos nanoestructurados basados en matrices epoxi y reforzados con nanotubos de carbono (NTC) altamente dispersos. Los NTC son considerados como el refuerzo ideal para materiales compuestos de base polimérica, debido a sus excelentes propiedades mecánicas y eléctricas. Pese a esto, existe una gran dificultad para poder emplearlos satisfactoriamente como refuerzo debido a la gran tendencia que presentan a la formación de aglomerados. Para tal finalidad, se exploraron metodologías para funcionalizar covalentemente los NTC con poliestireno, mediante las que se lograron obtener dispersiones altamente estables en solventes orgánicos de interés. La metodología de funcionalización y dispersión fue exitosa para incorporar NTC en matrices poliméricas sin formación de aglomerados. Posteriormente, se implementaron diversas estrategias de epoxidación de copolímeros de bloque poli(estireno-b-isopreno-b-estireno) (SIS) de modo tal de obtener copolímeros con un bloque miscible con los precursores del sistema epoxi y otro bloque inmiscible. La mejor estrategia fue la epoxidación con dimetildioxirano, permitiendo lograr grados de epoxidación de hasta 100 % sin formación de subproductos ni alterando la integridad de la cadena polimérica. Estos copolímeros epoxidados fueron empleados para obtener matrices epoxi nanoestructuradas, estudiándose la secuencia de eventos que dieron origen a los nanodomios poliméricos. Se encontró que los copolímeros epoxidados reaccionaron parcialmente durante el curado de la resina epoxi y este hecho alteró la morfología final de los nanodominios obtenidos. Por este motivo, se diseñaron y sintetizaron nuevos copolímeros de bloque obtenidos a partir de SIS epoxidado, que presentaron reactividad frente al componente epoxi de la resina utilizada. El empleo de estos nuevos copolímeros en la modificación del sistema termoestable, permitió obtener un control morfológico sobre el nanodominio final. Finalmente, se determinaron propiedades mecánicas tales como módulo de Young y desgaste y las propiedades eléctricas de los materiales nanoestructurados termorrígidos reforzados con NTC. Abstract: Carbon nanotubes (CNT) are considered to be the ideal reinforcement to polymeric based composite materials due to their excellent mechanical and electrical properties. However, in order to be used as such, the high tendency of CNT to form agglomerates should be avoided. In this field, the present thesis objective is to develop novel nanostructured epoxy based composite materials reinforced with highly dispersed CNT. To achieve this goal, different strategies to covalently functionalize CNT with polystyrene were explored by which highly stable dispersions in organic solvents were obtained. The functionalization and dispersion methodology allowed the successful incorporation of CNT in polymeric matrices without agglomerate formation. In the next stage of the thesis, different epoxidation procedures were employed to epoxidize poly(styrene-b-isoprene-b-styrene) block copolymers (SIS), in order to obtain a product having an epoxy miscible block, and an epoxy immiscible block. The best strategy was the epoxidation with dimethyldioxirane, by which epoxidation degrees of up to 100 % were obtained avoiding the formation of undesirable subproducts and at the same time, preserving the initial polymer chain architecture. These epoxidized copolymers were employed to develop nanostructured epoxy matrices and the sequence of events that conducted to the final nanodomain morphology were investigated. Moreover, it was found that the epoxidized copolymers were able to react partially during the epoxy curing reaction leading to a morphological effect on the final nanodomains. In order to overcome the lack of reactivity of epoxidized SIS, novel block copolymers were designed and synthesized from epoxidized SIS having reactivity towards the epoxy precursor of the used epoxy system. The use of these block copolymers to modify the epoxy thermoset allowed a morphological control in the obtained nanodomains. Finally, mechanical properties such as Young modulus and wear and the electrical properties of the final nanostructured epoxy thermosets reinforced with CNT were measured.
Cita tipo APA: Garate, Hernán . (2014-03-27). Síntesis, caracterización y propiedades de materiales compuestos nanoestructurados reforzados con nanotubos de carbono. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5595_Garate.pdf Cita tipo Chicago: Garate, Hernán. "Síntesis, caracterización y propiedades de materiales compuestos nanoestructurados reforzados con nanotubos de carbono". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5595_Garate.pdf |
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di Pasquo, Federico Martín. "La norma global y la fractura ecológica. Una tesis de historia sincrónica" (2014-03-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo principal de esta tesis se encontró orientado a elucidar, desde una perspectiva histórica, cierta “influencia” que la problemática ambiental tuvo sobre la ecología disciplinar. Para ello, se hizo foco sobre una serie de sucesos que encontraron su momento durante la década de 1980. Dos resultados centrales se desprendieron del análisis propuesto. El primero, constata una serie de transformaciones a nivel disciplinar de la ecología como también, en sus planos fenomenológicos, epistemológicos y metodológicos. A nivel disciplinar se reconoció la emergencia de dos sub-áreas de la ecología −la ecología del paisaje y la macroecología−. En cuanto al plano fenomenológico se destacó el establecimiento de nuevos patrones y procesos ecológicos sobre grandes regiones geográficas. En relación con el plano epistemológico, se admitió la incorporación de nuevos conceptos y teorías −tales como la noción de escala y la teoría jerárquica−. Y finalmente, en el plano metodológico se estableció la consolidación de cierta distinción dada entre métodos experimentales −los enfoques manipulativos se diferenciaron de los mensurativos−. El segundo resultado que cabe destacar se vinculó, con una continuidad sincrónica entre la problemática ambiental y la ecología disciplinar mediada, por el reconocimiento de una norma global. Norma que a su vez, vino a configurar las transformaciones reconocidas en la matriz disciplinar. Abstract: The main objective of this thesis was oriented toward elucidating, form an historical perspective, certain “influence” that the environmental problematic had on disciplinary ecology. The focus was placed on a series of events that found their time during the 1980s. Two central results were detached from the proposed analysis. The first identifies a number of changes in ecology at a disciplinary level as well as in phenomenological, epistemological and methodological ones. At a disciplinary level, the emergency of two sub-areas of ecology was recognized −landscape ecology and macroecology−. On the phenomenological plane, the establishment of new ecological patterns and processes over large geographic regions was highlighted. In relation to epistemological plane, the incorporation of new concepts and theories was admitted −such as the scale notion and the hierarchical theory−. Finally, on the methodological plane, the consolidation of a differentiation in experimental methods was established −manipulative approaches were differentiated from mensurative ones−. The second result that deserves to be highlighted was associated with a synchronic continuity between environmental problematic and disciplinary ecology. This synchronic continuity was mediated by the recognition of a global norm. This norm, in turn, configured the recognized transformations in the disciplinary matrix.
Cita tipo APA: di Pasquo, Federico Martín . (2014-03-27). La norma global y la fractura ecológica. Una tesis de historia sincrónica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5588_DiPasquo.pdf Cita tipo Chicago: di Pasquo, Federico Martín. "La norma global y la fractura ecológica. Una tesis de historia sincrónica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5588_DiPasquo.pdf |
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Ruiz, María Emilia. "Evolución dinámica de la turbulencia en el viento solar" (2014-03-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La turbulencia es ubicua en el universo. Tanto observaciones remotas en el medio interestelar local como observaciones in situ en el viento solar (VS) han mostrado evidencia sobre la presencia de dinámica turbulenta en estos escenarios. El VS provee el túnel de viento con mayor número de Reynolds que permite estudiar turbulencia magnetohidrodinámica (MHD) con métodos de observación in situ. En este trabajo se estudia la evolución de la turbulencia MHD en el VS, caracterizando el proceso de envejecimiento y rejuvenecimiento de los estados turbulentos inicialmente desarrollados cerca del Sol. Como herramienta de diagnóstico de la turbulencia empleamos la función de correlación espacial R y la longitud de correlación asociada λ, calculadas ambas a partir de observaciones realizadas in situ en el VS por las sondas Helios 1, Helios 2, ACE y Ulysses. En esta tesis se muestra que en turbulencia MHD existe para R una escala de autosimilaridad dada por λ, y por primera vez se calcula el exponente espectral de las fluctuaciones magnéticas con una base estadística de 10 años. Realizamos un estudio evolutivo de la escala de similaridad en término de la edad de las parcelas de plasma. Además, caracterizamos la función de distribución de probabilidad (FDP) de λ a diferentes distancias heliocéntricas para dos regímenes de viento caracterizados por valores diferentes del beta de protones. Encontramos que la FDP de λ es lognormal y bi-modal, presentando diferentes parámetros en cada régimen, consistente con la variedad de procesos multiplicativos y no lineales que tienen lugar en el VS. Investigamos las propiedades anisótropas de las fluctuaciones a diferentes heliodistancias respecto del campo medio Bₒ. Mostramos que el VS rápido y el VS lento no son intrínsecamente diferentes, sino que la diferente manifestaci ón de la anisotropía en estos regímenes es consecuencia de la evolución dinámica de las fluctuaciones, independiente de la velocidad del viento e incluso de la etapa del ciclo de actividad solar. La cascada direccional de energía da lugar a una migración de la energía desde vectores de onda paralelos a Bₒ hacia vectores de onda perpendiculares a Bₒ a medida que el viento envejece. Abstract: Turbulence is ubiquitous in the Universe. Both, remote observations in the local interstellar medium and in situ observations in the Solar Wind (SW) have shown evidence for the presence of turbulent dynamics in these scenarios. The SW provides the wind tunnel with highest Reynolds number where to study magnetohydrodynamics (MHD) turbulence by means of observational in situ techniques. In this work we study the evolution of MHD turbulence in the SW, characterizing the process of aging and rejuvenation of the turbulent states initially developed near the Sun. As a diagnostic tool of the turbulence we employ the spatial correlation function R and the associated correlation length λ, both estimated from in situ SW observations performed by the spacecrafts Helios 1, Helios 2, ACE y Ulysses. In this Thesis we show that in MHD turbulence exists a scale of self-similarity for R given by λ, and for the first time we estimate the spectral exponent of the magnetic fluctuations with an extense statistical data base of ten years. We perform an evolutive study of the self-similarity scale in terms of the age of the plasma parcels. Besides, we characterize the probability distribution function (PDF) of λ at different heliocentric distances for two SW regimes distinguished by different values of proton beta. We find that the PDF of λ is lognormal and bi-modal, displaying distinct parameters in each regime, consistent with the variety of non-linear multiplicative processes taking place in the SW. We investigate the different anisotropic properties of the fluctuations at different heliodistances with respect to the mean field Bₒ. We show that the fast and slow SW are not intrinsically different, but the different manifestation of anisotropy in these regimes is a consequence of the dynamic evolution of the fluctuations, independent of wind speed and even of the activity solar cycle. Energy directional cascade leads to a migration of energy from wave vectors parallel to Bₒ to wave vectors perpendicular to Bₒ as the wind age.
Cita tipo APA: Ruiz, María Emilia . (2014-03-26). Evolución dinámica de la turbulencia en el viento solar. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5426_Ruiz.pdf Cita tipo Chicago: Ruiz, María Emilia. "Evolución dinámica de la turbulencia en el viento solar". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5426_Ruiz.pdf |
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Robles, Carolina Analía. "Biodeterioro fúngico de madera en el arbolado urbano : prospección, histopatología y control biológico en plátanos (Platanus acerifolia)" (2014-03-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Este trabajo tuvo como objetivo caracterizar el biodeterioro de madera de Platanus acerifolia de la Ciudad de Buenos Aires, en relación con los agentes etiológicos, los endófitos fúngicos y las variables ambientales. Se muestrearon árboles asintomáticos y sintomáticos en 4 sitios de muestreo. Se obtuvieron 27 especies de endofitos, 5 correspondientes a basidiomicetes. Tres especies de basidiomicetes fueron obtenidas de árboles sintomáticos. Las identificaciones fueron realizadas por métodos morfológicos y moleculares. Phanerochaete chrysosporium y Nodulisporium (Xylariales) presentaron los mayores valores de degradación in vitro y de producción de oxidasas. Los análisis multivariados sugieren que la biodiversidad de endofitos está altamente influenciada por el disturbio antrópico. Se encontró una asociación positiva entre la edad de los árboles y la riqueza de endofitos y entre la presencia de basidiomicetes endofíticos y patógenos en cada sitio. La confrontación en cultivos duales entre xilófagos y micromicetes, indican que Trichoderma harzianum y el endofito Granulobasidium vellereum presentan la mayor capacidad antagonista. Las observaciones en microscopia óptica y electrónica de los patrones de deterioro indican que Bjerkandera adusta e Inonotus rickii causan una pudrición blanca. B. adusta degrada más extensamente que I. rickii, con un patrón de degradación simultanea. I. rickii produjo un patrón de delignificación selectiva. Los resultados indican que existen hongos colonizando madera sana que poseen el potencial de degradarla, apoyando la hipótesis de la “infección latente”. Abstract: The aim of this study was to characterize the wood biodeterioration of Platanus acerifolia of Buenos Aires City, related to the causal agents, the fungal endophytes and the environmental variables. Asymptomatic and symptomatic trees were sampled in 4 sites of the city. A total of 27 endophytic taxa were obtained, 5 of them corresponding to Basidiomycetes. Three species of Basidiomycetes were obtained from symptomatic trees. Morphological and molecular identifications were performed. Phanerochaete chrysosporium and Nodulisporium (Xylariales) produced the highest degradation levels and oxidases production in vitro. Multivariate analyses suggest that the endophytes biodiversity is highly influenced by the level of anthropogenic disturbance. A positive relationship was found between tree age and endophyte richness and between the presence of endophytic and pathogenic Basidiomycetes in a same site. Confrontation assays in dual cultures between wood decay fungi and micromycetes, indicate that Trichoderma harzianum and the endophyte Granulobasidium vellereum showed the greatest antagonistic capacity. Analyses under optic and electronic microscopy indicate that Bjerkandera adusta and Inonotus rickii caused a white-rot pattern in London plane wood. B. adusta caused more biodeterioration than I. rickii and a simultaneous decay of wood. I. rickii, on the other hand, produced a selective delignification on wood. The results indicate that there are fungi colonizing healthy wood that have the capacity to cause wood rotting. This results support the “latent infection” hypothesis.
Cita tipo APA: Robles, Carolina Analía . (2014-03-26). Biodeterioro fúngico de madera en el arbolado urbano : prospección, histopatología y control biológico en plátanos (Platanus acerifolia). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5418_Robles.pdf Cita tipo Chicago: Robles, Carolina Analía. "Biodeterioro fúngico de madera en el arbolado urbano : prospección, histopatología y control biológico en plátanos (Platanus acerifolia)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5418_Robles.pdf |
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Pozzo Ardizzi, María Cristina. "Cancrosis del álamo en plantaciones comerciales de la región del Comahue. Estado actual y perspectivas" (2014-03-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El agente causal de la Cancrosis del Álamo es Septoria musiva y entre las especies e híbridos del género Populus hay genotipos que van desde tolerantes a muy susceptibles. La hipótesis de esta tesis estableció que esos diferentes comportamientos se debían a diferencias anatómicas y fisiológicas en los órganos susceptibles que constituían mecanismos de defensa pasiva que podían regular la intensidad de los síntomas. Utilizando métodos histológicos se describieron y compararon diversas características foliares y caulinares en clones susceptibles (´I 214`e ´I 488`) y tolerantes (´Conti 12` y ´Ballestra`). Mediante análisis de Componentes Principales se determinó que los clones tolerantes poseían hojas más gruesas, con células epidérmicas y cutículas de mayor espesor generando una superficie foliar lisa, con un menores densidades estomáticas y tallos con peridermis más gruesas, con una menor superficie lenticelar, y con cortezas que forman las peridermis necrofilacticas más próximas a las lesiones, que los clones susceptibles. Debido a que los clones más difundidos presentaban diferentes niveles de incidencia en los diferentes valles irrigados de la región del Comahue, se realizaron muestreos en diferentes localidades y el patógeno sólo fue encontrado en los valles de Viedma, General Conesa y Río Colorado. Abstract: The causal agent of the Septoria Leaf Spot and Stem Canker is Mycosphaerella populorum and there are genotypes that ranging from tolerant to very susceptible among Populus species and hybrids. The hypothesis of this thesis established that those different behaviors were due to anatomical and physiological differences in the susceptible organs constituting passive defense mechanisms that could regulate the symptoms intensity. Different characteristics of the stem and foliage were described and compared in susceptible (´I 214 'e ´I 488') and tolerant (´Conti 12' and ´Ballestra') clones using histological methods. Through Principles Components Analysis was determined that the tolerant clones had thicker leaves, with thicker epidermis and cuticles, with a lower stomata densities and thicker peridermis stems, with a lower lenticelar surfaces, and with cortex that form the necrophilactic periderm closer to injuries, than the susceptible clones. Since the most widespread clones had different levels of incidence in the different irrigated valleys of the region of Comahue, samplings were carried out in different locations and the pathogen was only found in the Viedma, General Conesa and Colorado River valleys.
Cita tipo APA: Pozzo Ardizzi, María Cristina . (2014-03-26). Cancrosis del álamo en plantaciones comerciales de la región del Comahue. Estado actual y perspectivas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5548_PozzoArdizzi.pdf Cita tipo Chicago: Pozzo Ardizzi, María Cristina. "Cancrosis del álamo en plantaciones comerciales de la región del Comahue. Estado actual y perspectivas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5548_PozzoArdizzi.pdf |
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Arístide, Pablo. "Apropiación de la naturaleza en agroecosistemas y bosques del Chaco semiárido (Santiago del Estero, Argentina)" (2014-03-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Pensar en las problemáticas presentes hoy en la Región Chaqueña argentina acerca del manejo de los recursos naturales y de la conservación de la biodiversidad, requiere conocer y comprender las modalidades de uso de la tierra y sus consecuencias sobre el paisaje. El concepto “apropiación de la naturaleza” refiere a la acción por la cual los seres humanos extraen elementos o se benefician de algún servicio de la naturaleza para volverlos un elemento social. El objetivo de esta tesis fue analizar este proceso de articulación sociedad-naturaleza en 4 comunidades rurales del departamento Figueroa, Santiago del Estero, ubicadas en zonas con o sin acceso a riego. Para esto identificamos los principales factores históricos, sociales y naturales, que estructuraron la situación socioecológica actual. Comparamos con datos cuali y cuantitativos las comunidades en cuanto a las formas actuales de apropiación de la naturaleza y estudiamos la distribución espacial del proceso, a escala comunitaria y de la totalidad del área de estudio mediante imágenes satelitales. Describimos, mediante censos de vegetación, las características de los ambientes y agroecosistemas que forman parte del proceso de apropiación. A partir de la utilización de indicadores socioecológicos vimos que las estrategias de apropiación de la naturaleza variaron entre las comunidades locales estudiadas. Si bien las cuatro comunidades presentaron estrategias diversificadas, la presencia, en tres de ellas, de bosques bajo propiedad comunitaria brindó servicios ecosistémicos adicionales. Esto caracteriza a las estrategias como de “uso múltiple de los recursos naturales”, articuladas más fuertemente con los ecosistemas y el paisaje local. Por su parte, los agroecosistemas locales se caracterizaron por sus parcelas agrícolas pequeñas de bordes vegetados arbóreos, arbustivos o herbáceos, generando en algunos casos una red de bordes vivos. A escala de paisaje, el área de estudio se caracteriza por una amplia y continua cobertura boscosa que casi no ha cambiado en el periodo analizado (1992-2011). La presencia de población campesina estrechamente vinculada al paisaje local, como elemento de producción y reproducción de sus condiciones de vida, refuerza la necesidad de considerar explícitamente la dimensión espacial del proceso de apropiación de la naturaleza, para colaborar en el diseño de paisajes multifuncionales que permitan mantener la capacidad de estos de proveer servicios ecosistémicos y mantener la biodiversidad a largo plazo. Abstract: Understand the currently situation about the management of natural resources and biodiversity conservation in the Chaco Region of Argentina requires to know and understand the land use decisions and its impact on the landscape. The term "appropriation of nature" refers to the action by which humans extract elements or benefit from a service of nature to turn them a social element. The aim of this thesis was to analyze the process of articulation between society and nature in 4 rural communities in the department Figueroa, Santiago del Estero, located in areas with or without access to irrigation. For this, we identify the main historical, social, and natural factors, which structured the current socio-ecological situation. We use qualitative and quantitative data to compare communities about current forms of appropriation of nature and spatial distribution of this process. By analyzing satellite images, we evaluate this process at two scales: the community and the total study area. We describe, through Vegetation surveys, the characteristics of the environments and agroecosystems that are part of the appropriation process. The socio-ecological indicators suggest that strategies of appropriation of nature varied between local communities studied. While the four communities had diversified strategies, in three of these communities the presence of forests under community ownership provided additional ecosystem services. This strategy is characterized as "multiple use of natural resources", articulated most strongly with the ecosystem and the local landscape. In addition, local agroecosystems were characterized by small agricultural plots with edges formed by tree, shrub or herbaceous vegetation. This results in some cases in a network of hedgerows. At the landscape scale, the study area is characterized by a wide and continuous forest cover that was slightly modified during the period analyzed (1992-2011). The presence of the peasant population, which is closely linked to the local landscape as an element of production and reproduction of their livelihoods, reinforces the need to explicitly consider the spatial dimension of the appropriation of nature, to collaborate in the design of multifunctional landscapes that maintain the ability to provide these ecosystem services and maintain long-term biodiversity.
Cita tipo APA: Arístide, Pablo . (2014-03-26). Apropiación de la naturaleza en agroecosistemas y bosques del Chaco semiárido (Santiago del Estero, Argentina). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5619_Aristide.pdf Cita tipo Chicago: Arístide, Pablo. "Apropiación de la naturaleza en agroecosistemas y bosques del Chaco semiárido (Santiago del Estero, Argentina)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5619_Aristide.pdf |
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Wolfson, Manuel Luis. "Participación del sistema endocannabinoide en el sitio de implantación y de las células infiltrantes en la reabsorción embrionaria inducida por LPS" (2014-03-25). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se ha demostrado una estrecha asociación entre el aborto y cambios en el sistema endocannabinoide (SEC) en linfocitos periféricos de mujeres. En un modelo murino de reabsorción embrionaria (RE) inducida por LPS estudiamos la participación del SEC tanto del sitio de implantación como de las células inmunes infiltrantes y su posible regulación por progesterona (P). En este modelo observamos niveles plasmáticos elevados del principal endocannabinoide, anandamida (AEA). Por otro lado encontramos que la RE inducida por LPS era mucho menor en ratones transgénicos deficientes en el receptor de cannabinoides tipo 1, como así también la disminución de los niveles séricos de P. Demostramos la presencia del SEC en las células mononucleares de sangre periférica (PBMC) de ratón y que la actividad de la enzima metabolizante de la AEA (hidrolasa de amidas de ácidos grasos, FAAH) de las PBMC de ratones preñados es mayor que la de los ratones no preñados. Asimismo observamos un efecto protector de la P sobre la actividad de la FAAH y que el mismo estaba mediado por los receptores clásicos de esta hormona (PR). Encontramos que el 70% de las PBMC estudiadas son linfocitos T, demostramos la presencia de los PR en estas células. Por otro lado el LPS incrementó tanto los niveles de óxido nítrico (NO), como de la enzima que lo sintetiza (NOSi). La P abolió el incremento inducido por el LPS, actuando a través de los receptores de glucocorticoides. Durante la RE, la decidua es infiltrada por células del sistema inmune, sufre importantes daños y finalmente es expulsada. Investigamos el efecto de la infiltración leucocitaria sobre la actividad de FAAH en las deciduas mediante un sistema de cocultivo. Cuando las deciduas de animales controles se cultivaron en presencia de PBMC provenientes de animales preñados tratados con LPS, la actividad de la FAAH decidual disminuyó, efecto que fue revertido por la coadministración de P o la de un inhibidor selectivo de la NOSi, aminoguanidina. Asimismo observamos un aumento en la nitración de las proteínas deciduales y específicamente de la FAAH cuando las decidua se co-cultivaban junto a las PBMC de animales tratados con LPS y que este efecto fue revertido por la P. Este trabajo demuestra que el SEC participa en la RE inducida por LPS y que los cambios de este sistema en la decidua están influenciados tanto por las células inmunes infiltrantes como por alteraciones en el sistema endócrino. Palabras claves: Reabsorción embrionaria - Lipopolisacárido - Sistema endocannabinoide - Células mononucleares de sangre periférica - Progesterona - Anandamida - Óxido nítrico Abstract: A close association between abortion and changes of the endocannabinoid system (eCS) in peripheral lymphocytes of women has been demonstrated. In a murine model of LPSinduced embryonic resorption (EmR), we studied the involvement of eCS in the site of implantation and in the infiltrating immune cells and its possible regulation by progesterone (P). We observed an elevated anandamide (AEA) plasma levels, a major endocannabinoid, in this model. On the other hand, we found that the LPS-induced less EmR in cannabinoid receptor 1 (CB1) knock-out mice, together with a lower drop of P plasma levels. We showed the presence of eCS in murine peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and that the PBMC’s fatty acid amide hydrolase activity (FAAH, the main catalytic enzyme for AEA) from pregnant mice was higher than from non pregnant mice. Moreover, we observed that P, via its classical receptors for this hormone (PR), has a protective effect on FAAH activity. Given that the 70% of PBMC are lymphocytes, we demonstrated the presence of PR in this subpopulation. Furthermore, LPS produced an increased levels of both nitric oxide (NO) and inducible NO synthase (iNOS). Interestingly, P abolished these LPS effects acting through glucocorticoid receptors. During EmR, decidua is infiltrated with immune system cells, suffers important damage and is finally expelled. Using a co-culture system, we investigated the effects of leukocytary infiltration on decidual FAAH activity. When deciduas from control mice were cultured in presence of PBMC from LPS-treated animals, decidual FAAH activity was abolished. This effect was reverted by the co-administration of P or aminoguanidine (a selective inhibitor of iNOS). When deciduas were co-cultured with PBMC from LPS treated mice, we observed an increase in decidual protein nitration and particularly in FAAH enzyme; an effect that was reverted by P. This work shows that the eCS is involved in the LPS-induced EmR and that changes in the decidua are influenced both by infiltrating immune cells as well as by alterations in the endocrine system. Keywords: Embryonic resorption - Lipopolysaccharide - Endocannabinoid system - Peripheral blood mononuclear cells - Progesterone - Anandamide - Nitric oxide
Cita tipo APA: Wolfson, Manuel Luis . (2014-03-25). Participación del sistema endocannabinoide en el sitio de implantación y de las células infiltrantes en la reabsorción embrionaria inducida por LPS. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5513_Wolfson.pdf Cita tipo Chicago: Wolfson, Manuel Luis. "Participación del sistema endocannabinoide en el sitio de implantación y de las células infiltrantes en la reabsorción embrionaria inducida por LPS". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-25. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5513_Wolfson.pdf |
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Richmond, Victoria. "Síntesis de análogos de esteroides sulfatados marinos con actividad citotóxica, antiviral y de inhibición de la enzima acetilcolinesterasa" (2014-03-25). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo de tesis se describe la síntesis de diferentes análogos de esteroides sulfatados marinos con el objeto de evaluar su actividad biológica y establecer correlaciones estructura-actividad. Los esteroides sintetizados poseen grupos sulfato en C-2 y C-3 con diferentes configuraciones y funciones oxigenadas en C-6 y fueron obtenidos a partir de la sulfatación de sus análogos hidroxilados. La reacción de sulfatación fue optimizada luego de probar diferentes condiciones, entre ellas, la selección del agente sulfatante, la relación de equivalentes entre el esteroide y el agente sulfatante, el tiempo y la temperatura de reacción y el método de calentamiento. Todos los análogos sintéticos se obtuvieron a partir de un precursor común, la 5α-colest-2-en-6-ona, que se sintetizó mediante sucesivas reacciones de oxidación y reordenamientos a partir del colesterol. Se ensayó la actividad de inhibición de la enzima acetilcolinesterasa de los compuestos sulfatados y sus análogos hidroxilados y se observó que el compuesto 2β,3α-dihidroxi-5α- colestan-6-ona disulfato resultó ser el más activo de la serie. Por ello, este compuesto fue el elegido como modelo para el estudio de la cinética de la reacción de inhibición. En base a la cinética de la reacción, se realizó un estudio de docking molecular del compuesto y de su análogo desulfatado, el cual no inhibe a la enzima acetilcolinesterasa. Luego se realizaron estudios de dinámica molecular verificándose la estabilidad de los complejos enzimaesteroide obtenidos en el estudio de docking. En el caso del análogo inactivo, si bien se comprobó la estabilidad del complejo, se observó la apertura de un canal secundario en la superficie de la enzima que comunica con el sitio activo, lo que explicaría la razón por la que dicho esteroide no inhibe a la enzima. Debido a los antecedentes de citotoxicidad de los 6E-hidroximino esteroides, se sintetizaron cuatro oximas novedosas a partir de los correspondientes 6-cetoesteroides obtenidos previamente. Se estudió la citotoxicidad de las oximas sintéticas y de algunos esteroides polihidroxilados sulfatados relacionados -para evaluar la influencia de grupos hidroxilo, sulfato y carbonilo en C-6 en la actividad- frente a dos líneas celulares tumorales de cáncer de próstata humano, PC-3 (andrógeno independiente) y LNCaP (andrógeno dependiente). Los resultados indicaron que el compuesto 2β,3α,6β-trihidroxi-5α-colestano trisulfato fue el más activo frente a la línea celular LNCaP y la oxima 2β,3α-dihidroxi-6E-hidroximino- 5α-colestano, frente a PC-3. Por último, se estudió la actividad antiviral y virucida de los compuestos sulfatados y sus análogos desulfatados frente a los virus herpes simplex tipo 1 (HSV-1) y Junín (JV), responsable de la fiebre hemorrágica argentina. La oxima 2β,3α-dihidroxi-6E-hidroximino- 5α-colestano resultó ser el compuesto más activo frente al virus HSV-1, mientras que los compuestos 2β,3α-dihidroxi-5α-colestan-6-ona disulfato y 2β,3α,6β-trihidroxi-5α-colestano- 2,3-disulfato fueron los más activos frente al virus Junín. Ambos resultados ponen de manifiesto la importancia de los grupos sulfato para la actividad antiviral de estos esteroides. Abstract: In this work we describe the synthesis of analogs of marine sulfated steroids in order to evaluate their biological activities and establish structure-activity correlations. The synthesized steroids depict sulfate groups at C-2 and C-3 with different configurations and oxygenated groups at C-6, and they were obtained by sulfation of their hydroxylated analogs. The sulfation reaction was optimized after selecting the sulfating agent, the relative proportions between steroid and sulfating agent, the reaction time and the heating conditions. The synthetic analogs were prepared from 5α-cholest-2-en-6-one, which was synthesized from cholesterol by successive oxidation and rearrangement reactions. The sulfated and desulfated analogs were evaluated for their inhibition activity on the acetylcholinesterase enzyme. Compound 2β,3α-dihydroxy-5α-cholestan-6-one disulfate proved to be the more active. Therefore it was selected as a model compound to study the kinetic of the inhibition reaction. Based on the kinetic results, a molecular docking study of the compound and the inactive desulfated analog was performed, together with dynamic molecular studies that confirmed the stability of the enzyme-steroid complexes obtained in the docking study. Although the inactive analog complex was stable, we observed the opening of a secondary channel on the enzyme surface that communicates with the active site. This fact would explain why the desulfated steroid fails to inhibit the enzyme. Taking into account the cytotoxic activities of 6E-hydroximino steroids, we prepared four new oximes of the 6-ketosteroids previously synthesized. We evaluated the cytotoxicity of the synthetic oximes and some related sulfated polyhydroxylated steroids on two human prostate carcinoma cell lines, PC-3 (androgen independent) and LNCaP (androgen dependent) in order to determine the influence of hydroxyl, sulfate and carbonyl groups on C-6 on the activity. Compound 2β,3α,6β-trihydroxy-5α-cholestane trisulfate showed remarkable activity against LNCaP cell line while oxime 2β,3α-dihydroxy-6E-hydroxymino- 5α-cholestane was the most active against PC-3. We also studied the antiviral and virucidal activities of the sulfated compounds and their desulfated analogs against herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and Junín virus (JV), responsible for the argentine hemorrhagic fever. The oxime 2β,3α-dihydroxy-6E-hydroxymino- 5α-cholestane disulfate was the most active compound against HSV-1, while compounds 2β,3α-dihydroxy-5α-cholestan-6-one disulfate and 2β,3α,6β-trihydroxy-5α- cholestane-2,3-disulfate were the most active against Junín virus. These results highlight the importance of the sulfate groups for the activity of these steroids.
Cita tipo APA: Richmond, Victoria . (2014-03-25). Síntesis de análogos de esteroides sulfatados marinos con actividad citotóxica, antiviral y de inhibición de la enzima acetilcolinesterasa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5596_Richmond.pdf Cita tipo Chicago: Richmond, Victoria. "Síntesis de análogos de esteroides sulfatados marinos con actividad citotóxica, antiviral y de inhibición de la enzima acetilcolinesterasa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-25. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5596_Richmond.pdf |
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Chamorro, María Eugenia. "Modificación de la funcionalidad de la eritropoyetina por carbamilación. Mecanismos de acción sobre células eritroides y neuronales" (2014-03-25). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La eritropoyetina (Epo) es conocida como la hormona que regula la producción de células eritroides. Sin embargo, su rol biológico se expandió a partir del hallazgo de la expresión de receptores específicos en otros tejidos, incluyendo el nervioso. Además, se describió un efecto neuroprotector de la hormona, el cual estaría asociado a inhibición de apoptosis. Debido al interés por expandir el uso farmacológico de la Epo hacia la protección de tejidos no hematopoyéticos, se intensificó la búsqueda de estructuras modificadas de la proteína. La entidad que merece, actualmente, mayor investigación es la Epo carbamilada en los residuos lisina (cEpo). Evidencia derivada de estudios in vitro y en animales de experimentación indican que esta forma de Epo mantiene su actividad neuroprotectora mientras que carece de actividad eritropoyética. Esta diferente función evitaría un aumento innecesario de la masa eritroide en el tratamiento de pacientes no anémicos con enfermedades neurodegenerativas. Con el objeto de profundizar el conocimiento sobre las diferencias observadas en la función de Epo debido a la carbamilación, en el presente trabajo se utilizó un modelo que involucra células fisiológicas y varias líneas celulares para evaluar, en conjunto y comparativamente, los efectos de cEpo y de Epo en ensayos paralelos. Fueron utilizados cultivos de células progenitoras eritroides de médula ósea de ratón, distintas líneas celulares con capacidad de diferenciación eritroide, tales como UT-7, dependiente de Epo para su supervivencia, TF-1, dependiente de GM-CSF y puede proliferar en presencia de Epo por períodos cortos y K562, independiente de factores de crecimiento específicos, así como la línea de origen neuronal SH-SY5Y. El primer paso consistió en realizar la carbamilación de Epo recombinante, utilizando cianato de potasio, empleando distintos tiempos y concentraciones de cianato apropiadas para asegurar un completo bloqueo de los residuos lisina de la Epo. El éxito de la carbamilación fue verificado mediante electroforesis en gel y Western blotting, demostrándose el aumento de la carga neta negativa de cEpo con respecto a la de Epo. La modificación de la estructura de la proteína por carbamilación puede causar alteraciones funcionales, cuyo estudio constituye el objetivo de este trabajo de tesis. Los cultivos de células UT-7 y TF-1 en presencia de cEpo mostraron una significativa disminución de la viabilidad celular, provocando la muerte celular por apoptosis, mientras que la Epo mantuvo la viabilidad e indujo la proliferación celular de ambas líneas celulares. La cEpo tampoco pudo estimular el desarrollo de unidades formadoras de colonias eritroides (CFU-E) en cultivos de células de médula ósea de ratón, ni previno la apoptosis inducida por la citoquina proinflamatoria TNF-α en células eritroileucémicas K562. En cambio, cEpo, al igual que Epo, actuó como factor antiapoptótico frente a la inducción de muerte celular programada inducida por TNF-α o staurosporina en células neuronales SH-SY5Y. Los resultados de ensayos de inhibición de vías de señalización intracelular permiten sugerir que las acciones neuroprotectoras de Epo y cEpo son mediadas por la activación de Jak2/PI3K. Estos resultados confirmaron que las modificaciones moleculares introducidas en la molécula de Epo por el proceso de carbamilación generan la pérdida de su habilidad para mantener la supervivencia de las células con capacidad de diferenciación eritroide pero no afecta su acción neuroprotectora mostrando, en este caso, una actividad similar a la de la Epo nativa. Mediante ensayos competitivos y de inhibición por anticuerpos, tanto en las células SH-SY5y como en las TF-1, se observó que la Epo puede actuar a través del receptor homodimérico (REpo/REpo) y el heterodimérico formado por una subunidad REpo y una subunidad ß common (Rßc), que es también subunidad del receptor de GM-CSF. En cambio, cEpo necesita de las subunidades REpo y Rßc para prevenir la apoptosis de las células neuronales. A partir de la hipótesis de que la carbamilación de Epo le permite conservar su capacidad neuroprotectora pero le impide inducir la proliferación de células eritroides, el siguiente objetivo fue la investigación de vías de señalización que juegan un papel clave en la proliferación celular inducida por Epo. Si bien en cultivos de células eritroides UT-7 y TF-1 cEpo indujo la fosforilación de Jak2, primer paso de activación celular, demostramos por primera vez la incapacidad de cEpo para mantener la fosforilaión de Akt y FOXO3a por el mismo periodo que lo hace Epo. Esto lleva a la translocación de FOXO3a al núcleo promoviendo la expresión de la proteína regulatoria del ciclo celular p27Kip1 y generando, así, el arresto del ciclo celular por cEpo. Dado que el efecto diferencial de cEpo y Epo con respecto a la proliferación celular se encontraría asociado al silenciamiento de vías de señalización por aumento de la velocidad de defosforilación analizamos la expresión y actividad de una fosfatasa, la tirosina fosfatasa 1B (PTP1B), involucrada en la desregulación de la señalización por Epo. Comprobamos que la inducción de PTP1B es significativamente mayor en presencia de cEpo, incremento que parece estar asociado al aumento de calcio intracelular inducido por este factor. La colocalización de PTP1B con el Rßc sustenta la conclusión de que la fosfatasa desfosforila la señalización de cEpo, interrumpiendo la vía de supervivencia y, en consecuencia, la proliferación celular, explicando, al menos en parte, la acción diferencial entre Epo y cEpo sobre células eritroides. Palabras claves: eritropoyetina carbamilada, eritropoyetina, proliferación celular, receptor de eritropoyetina, receptor ß common, tirosina fosfatasa 1B, eritropoyesis, neuroprotección. Abstract: Erythropoietin (Epo) is known as the hormone regulating the production of erythroid cells. However, its biological role was expanded after the discovery of specific receptors expressed in other tissues, including the nervous tissue. Moreover, a neuroprotective effect that could be associated to apoptosis inhibition was described for the hormone. Due to the interest in expanding the pharmacological use of Epo over the protection of non-hematopoietic tissues, the search for modified structures of the protein became more intense. The chemical entity currently under investigation is the Epo carbamylated in lysine residues (cEpo). Results from in vitro and in vivo experiments indicate that this form of Epo retains its neuroprotective ability, while lacking in erythropoietic activity. This different function would prevent an unnecessary increase in erythroid mass in non-anemic patients under treatment for neurodegenerative diseases. With an aim to further the existing knowledge of the changes observed in Epo after carbamylation, in the present work we used a model involving physiological cells as well as cell lines, to globally and comparatively evaluate the effects of Epo and cEpo in parallel assays. Erythoid progenitor cells from mouse bone marrow were used to study the development of colony-forming units-erythroid (CFU-E). The cell lines capable of erythroid differentiation employed were UT-7, dependent on Epo for survival, TF-1, dependent on GM-CSF and able to proliferate in the presence of Epo for short periods, and K562, independent of any specific growth factor where cell line of neuronal origin was SH-SY5Y. The first step in the work consisted in the carbamylation of rhuEpo using potassium cyanide. This salt decomposes when dissolved generating an anion which allows it to bind the protein’s lysine residues. The carbamylation process was carried out at different times and cyanide concentrations to ensure complete binding, and therefore the blockage of Epo’s lysine residues. The carbamylation of Epo was confirmed by gel electrophoresis, electrotransfer and immunodetection, where cEpo showed a decrease in positive charge due to the blockage of lysines, and consequently an increase in its net negative charge in comparison to Epo. In the carbamylation product (cEpo), a carbamyl group is coupled to each lysine residue in the Epo molecule, thus modifying the protein structure and potentially causing functional alterations. In the presence of cEpo, cultures of UT-7 and TF-1 cells showed a significant decrease in cell viability, leading to cell death by apoptosis, whereas Epo maintained viability and induced proliferation of both cell lines. cEpo did not support the development of colony-forming units-erythroid (CFU-E) in cultures of mouse bone marrow cells, nor did it prevent apoptosis induced by the proinflammatory cytokine TNF-α in erythroleucemic K562 cells differentiated with hemin. On the other hand, both cEpo and Epo acted as antiapoptotic agents protecting from the induction of programmed cell death by TNF-α or staurosporin in neuronal SH-SY5Y cells. Based on inhibition assays for intracellular signaling pathways, it may be suggested that the antiapoptotic action of cEpo and Epo is mediated by the activation of Jak2/PI3K. Our results confirmed that the modifications introduced in the Epo molecule after carbamylation produce a loss of its ability to support the survival of cells capable of erythroid differentiation, but it does not affect its neuroprotective action on SH-SY5Y cells, showing an activity similar to that of the native Epo. By carring out inhibition and competence assays, we found that Epo can act through both receptors involved in neuronal SH-SY5Y and TF-1 cells: the homodimer (REpo/REpo) and the heterodimer comprising a REpo monomer and a ßcommon subunit (Rßc), which is also present in the GM-CSF receptor. We observed that cEpo requires both REpo and the R c subunit to prevent apoptosis in neuronal cells. Owing to the fact that after carbamylation Epo maintains its antiapoptotic ability but can no longer induce erythroid cell proliferation, the following objective of this work was to investigate the signaling pathways playing a key role in Epoinduced cell proliferation. Although in cultures of erythroid UT-7 and TF-1 cells cEpo induced Jak2 phosphorylation, which is the first step of cell activation, we demonstrated for the first time that cEpo was unable to maintain Akt and FOXO3a phosphorylated for the same period of time as did Epo. Dephosphorylation of FOXO3a, which promotes its translocation to the nucleus as the transcription factor for the cell cycle regulatory protein p27kip1, was demonstrated through an increase in the expression of the latter in cultures with cEpo. Since the differential effect of Epo and cEpo on cell proliferation may be associated to the silencing of transduction pathways by an increase in the dephosphorylation rate, we analyzed the expression and activity of the tyrosine phosphatase 1B (PTP1B), involved in the the desregulation of Epo’s signalling. We found that PTP1B induction is significantly higher with cEpo, an increase which seems to be linked with the rise in intracellular calcium induced by this factor. Co-localization of PTP1B and Rßc supports the conclusion that the enzyme dephosphorylates Epo’s signalling faster than that of cEpo, thus interrupting pathways of survival, and consequently, of proliferation. This explains, at least in part, the differential effects of Epo and cEpo on erythroid cells. Keywords: erythropoietin, carbamylated erythropoietin, cell proliferation, erythropoietin receptor, ß common receptor, tyrosine phosphatase 1B, erythropoiesis, neuroprotection.
Cita tipo APA: Chamorro, María Eugenia . (2014-03-25). Modificación de la funcionalidad de la eritropoyetina por carbamilación. Mecanismos de acción sobre células eritroides y neuronales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5510_Chamorro.pdf Cita tipo Chicago: Chamorro, María Eugenia. "Modificación de la funcionalidad de la eritropoyetina por carbamilación. Mecanismos de acción sobre células eritroides y neuronales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-25. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5510_Chamorro.pdf |
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Quiroga, María Victoria. "Ecología de comunidades microbianas heterótrofas (bacterias y flagelados incoloros) de la turbera de Rancho Hambre, Provincia de Tierra del Fuego" (2014-03-20). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se caracterizó por primera vez la estructura y variación temporal de las comunidades que componen la trama trófica planctónica, en relación con parámetros ambientales en cinco lagunas de la turbera de Rancho Hambre, Tierra del Fuego. En primavera, la estructura del plancton fue similar en todas las lagunas. Por el contrario, en el verano tardío se observaron diferencias en la abundancia y biomasa de los distintos componentes tróficos entre los cuerpos de agua someros y profundos. Estas diferencias se explicaron parcialmente en función de los patrones característicos de variación de la temperatura, los cuales a su vez estuvieron regulados por la morfometría de los cuerpos de agua. El estudio en mayor profundidad de la comunidad de flagelados heterótrofos reveló un cambio en el tipo de regulación de la abundancia de los mismos en los dos períodos contrastantes, bottom-up en primavera vs. top-down en verano tardío, relacionado con cambios en la abundancia y composición del zooplancton. Además, se realizó un estudio polifásico de las bacterias heterótrofas utilizando microscopía de epifluorescencia, análisis de imágenes y citometría de flujo. De acuerdo con un análisis multivariado (RDA) la composición y abundancia de los distintos morfotipos del bacterioplancton estarían determinadas fundamentalmente por la temperatura, el pH y la calidad del carbono orgánico disuelto (índice a440). Se observaron a su vez patrones citométricos característicos para las bacterias heterótrofas de los distintos ambientes acuáticos dentro de la turbera, regulados principalmente por el pH, la conductividad y la clorofila a. Estos resultados demuestran que la alta diversidad y variabilidad temporal de los hábitats acuáticos de la turbera de Rancho Hambre influye fuertemente sobre la estructura de la comunidad de bacterias heterótrofas. Abstract: This is the first characterization of the structure and temporal variation of the communities composing the whole planktonic food web as related to environmental factors over two consecutive ice-free periods in five pools within the Rancho Hambre peat bog, Tierra del Fuego. Although the structures of the planktonic communities in spring were similar, in late summer the abundance and biomass of the different trophic compartments differed among small, shallow water bodies and large ones, partially dictated by distinct pool size-driven patterns of water temperature variation. Detailed analysis of the heterotrophic flagellates revealed a general shift in the regulation of their abundance, changing from bottom-up control in spring to top-down in late summer. This related to variations in zooplankton abundance and composition. Heterotrophic bacteria were studied using a polyphasic approach combining epifluorescence microscopy, image analysis and flow cytometry. A multivariate analysis (RDA) showed that temperature, pH and dissolved organic carbon quality (index a440) mainly regulated the abundance and composition of the different planktonic bacterial morphotypes, whereas the characteristic cytometric patterns of heterotrophic bacteria observed for the different aquatic habitats were influenced by pH, conductivity and chlorophyll a concentration. These results demonstrate that the high environmental diversity and temporal variability of Rancho Hambre peat bog aquatic systems drive the structure of their heterotrophic bacterial communities.
Cita tipo APA: Quiroga, María Victoria . (2014-03-20). Ecología de comunidades microbianas heterótrofas (bacterias y flagelados incoloros) de la turbera de Rancho Hambre, Provincia de Tierra del Fuego. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5433_Quiroga.pdf Cita tipo Chicago: Quiroga, María Victoria. "Ecología de comunidades microbianas heterótrofas (bacterias y flagelados incoloros) de la turbera de Rancho Hambre, Provincia de Tierra del Fuego". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5433_Quiroga.pdf |
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Martínez, Mariano Ignacio. "Diversidad de Dendrochirotida en el Mar Argentino (Echinodermata: Holothuroidea); aspectos taxonómicos, filogéneticos, ecológicos y biogeográficos" (2014-03-20). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se redescribieron 12 especies de Dendrochirotida del Mar Argentino de las cuales un 80 % se distribuye en la región Fueguina. También se hallaron y describieron dos especies de Dendrochirotida, Thandarum hernandezi (recolectada en 2009 a 15 metros de profundidad frente a Provincia de Buenos Aires), Havelockia pegi (recolectada entre los 10 y 48 metros desde la Provincia de Buenos Aires hasta Chubut) y una especie de Elasipodida Benthodytes violeta (recolectada entre 1500 hasta 1950 metros, en el cañón submarino Mar del Plata). La especie Psolidium disciformis fue encontrada en material de Isla de los Estados del Museo Argentino de Ciencias Naturales, permitiendo ampliar su distribución a aguas del Mar Argentino. Además se estudiaron e identificaron lotes correspondientes a zonas limítrofes. Se comprobó la estrecha relación filogenética que tienen las especies del orden Dendrochirotida de Argentina entre sí, en especial la familia Psolidae. Para esta tesis se revisaron las colecciones de los siguientes museos: Museo Argentino de Ciencias Naturales, Museo de La Plata, Museu de Zoologia da Universidad de São Paulo de Brasil, Colección Nacional de Equinodermos "María Elena Caso Muñoz” de México y National History Museum of Los Angeles County. Por otra parte también se estudió e identificó material proveniente de las campañas del B/O Puerto Deseado (Mejillón II 2009, CAV III 2010, CAV IV 2010, Talud Continental 2012, Talud Continental 2013) y de aquellas realizadas desde costa a regiones intermareales y someras desde Buenos Aires hasta Tierra del Fuego. De la comparación de la fauna de holotúridos entre Antártida, Chile y Argentina surge que hay especies con distribución continua entre Chile y Argentina, pero no así entre Argentina y Antártida. Esta división de ambientes ocurre también con el límite norte de Argentina. Estudios a futuro, tanto morfológicos como genéticos, permitirán comprender aún más la dinámica de distribución de las distintas especies cogenéricas con distribución en regiones limítrofes. Abstract: Twelve species of Dendrochirotida were redescripted, from which 80 % distributes in the Fuegian region, also were described two species of Dendrochirotida, Thandarum hernandezi (collected at 15 m depth in Buenos Aires Provinces waters), Havelockia pegi (collected 15 and 48 m from Buenos Aires Province to Chubut) and one species of Elasipodida Benthodytes violeta (collected between 1500 and 1950 m, at the Mar del Plata Submarine Canyon). The species Psolidium disciformis was founded among the Staten Island material deposited in the Museo Argentino de Ciencias Naturales, extending the distribution of this species to the Argentinian Sea. Additionally specimens from neighboring countries were studied. It was checked the close phylogenetic relationship between the species of Dendrochirotida from Argentina and particularly the family Psolidae. Types and reference material from the following museums were examined Museo Argentino de Ciencias Naturales, Museo de La Plata, Museu de Zoologia da Universidad de São Paulo de Brasil, Colección Nacional de Equinodermos "María Elena Caso Muñoz” de México y National History Museum of Los Angeles County. It was also studied the material from the campaigns of the B/O Puerto Deseado (Mejillón II 2009, CAV III 2010, CAV IV 2010, Talud Continental 2012, Talud Continental 2013) and from surveys carried out at intertidal and shallow waters, from Buenos Aires to Tierra del Fuego. The comparison of the holothuroids from Antarctica, Chile and Argentina shows that the species have continuous distribution between Chile and Argentina, but not between Argentina and Antarctica. This isolation of zones occurs also with the north region of Argentina. Future studies, based on morphological and molecular data, are going to allow a better understanding of the distribution dynamic of different cogeneric species with distribution at neighboring regions.
Cita tipo APA: Martínez, Mariano Ignacio . (2014-03-20). Diversidad de Dendrochirotida en el Mar Argentino (Echinodermata: Holothuroidea); aspectos taxonómicos, filogéneticos, ecológicos y biogeográficos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5603_Martinez.pdf Cita tipo Chicago: Martínez, Mariano Ignacio. "Diversidad de Dendrochirotida en el Mar Argentino (Echinodermata: Holothuroidea); aspectos taxonómicos, filogéneticos, ecológicos y biogeográficos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5603_Martinez.pdf |
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Mamone, Leandro Ariel. "Búsqueda de nuevos fotosensibilizantes para el tratamiento del cáncer, inactivación bacteriana y de principios activos antineoplásicos a partir de especies vegetales de Argentina" (2014-03-20). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Terapia Fotodinámica (TFD) es un tratamiento contra el cáncer que implica la administración de un Fotosensibilizante (FS) y su activación mediante luz visible, produciendo así, fotodaños mediados por oxígeno singlete en el tumor. Además de su uso en cáncer, los principales usos de la TFD incluyen el tratamiento de desórdenes inflamatorios e infecciones. El objetivo de este trabajo fue investigar una colección de plantas de la Argentina como fuente de nuevos FS naturales para ser usados en cáncer y Terapia Fotodinámica Antimicrobiana (TFDA), así como también de compuestos antitumorales y antibacterianos. Se realizó una colección de 113 extractos de plantas de Argentina, y se testeó la presencia de actividad fototóxica sobre la línea celular LM2 de adenocarcinoma mamario, y sobre la especie bacteriana Gram-positiva Staphylococcus epidermidis. En la línea celular LM2 se observó que la exposición a los extractos metanólicos de hoja de Combretum fruticosum y Scutia buxifolia indujo la muerte celular al aplicar TFD. Estos extractos se probaron en diferentes líneas celulares y el efecto fue selectivo contra las líneas tumorales. Se determinó además, que el extracto metanólico de hoja de Collaea argentina es fotoprotector contra la TFD. En bacterias S. epidermidis, tres extractos resultaron ser altamente fotoactivos: Solanum verbascifolium flor, Tecoma stans flor y Cissus verticillata raíz. Estos indujeron reducciones de 4, 2 y 3 órdenes de magnitud en la supervivencia de la bacteria, respectivamente al aplicar la TFDA. Es destacable que la TFDA empleando S. verbascifolium como FS, fue más eficiente con luz solar que empleando una fuente de luz artificial (erradicación total vs. 4 órdenes de reducción). El balance entre compuestos oxidantes y antioxidantes debe estar probablemente enmascarando potenciales FS de los extractos vegetales, pero empleando el extracto crudo, el nivel de fotoactividad de S. verbascifolium es similar al de algunos de los FS comerciales bajo la exposición a luz solar, demostrando que compuestos naturales vegetales son efectivos para ser usados en TFDA. Se llevó a cabo la caracterización fotoquímica de la TFDA empleando el extracto de S. verbascifolium. Las reacciones fueron mediadas principalmente por oxígeno singlete y en menor medida, por el radical hidroxilo. Se estableció un modelo de internalización bacteriana en queratinocitos PAM212 empleando las especies S. epidermidis y S. aureus. Sobre las células infectadas se aplicó TFDA con S. verbascifolium, resultando en la reducción de las bacterias intracelulares sin afectar la viabilidad de las células eucariotas. Desarrollamos, además, un método para el “screening” de potenciales FS de plantas basado en la generación de reacciones redox y producción de oxígeno singlete ante la aplicación de luz. En cuanto a la búsqueda de potenciales compuestos antitumorales, investigamos la citotoxicidad de los extractos en oscuridad. Empleamos 4 líneas tumorales y 3 no tumorales. Trece extractos resultaron ser altamente citotóxicos. Sin embargo, la inhibición del crecimiento celular fue dependiente de la línea celular y no se encontró selectividad por las líneas tumorales, excepto por el extracto de Ipomoea cairica. En general, las concentraciones inhibitorias 50 estuvieron en el rango de 10-150 μg/ml. Los extractos más citotóxicos correspondieron a las especies Solanum chacoense, Iochroma australe y Jacaranda mimosifolia. Se aislaron parcialmente los principios activos de estos tres extractos, y se encontró que estos indujeron un alto porcentaje de muerte celular mediante el arresto del ciclo celular e inhibición de la migración celular. En líneas generales, este es uno de los primeros estudios enfocado al análisis de las propiedades de las plantas nativas de Argentina como antitumorales y antibacterianos en presencia o ausencia de luz y sus efectos biológicos. Palabras clave: Terapia fotodinámica, extractos vegetales, nuevos fotosensibilizantes, compuestos antitumorales, líneas celulares, inactivación bacteriana. Abstract: Photodynamic therapy (PDT) is an anticancer treatment that involves administration of a photosensitizer (PS) and its subsequent activation by visible light to result primarily in singlet oxygen–induced photodamage to the tumor. In addition to cancer, mainstream uses for PDT include inflammatory disorders and infections. The aim of this work was to investigate a collection of plants from Argentina as a source of new natural PS to be used in cancer and antimicrobial Photodynamic Therapy (aPDT), as well as antitumor and antibacterial compounds. A collection of 113 Argentinean plant extracts was prepared and screened for phototoxicity on LM2 mammary adenocarcinoma cells and the Gram-positive species Staphylococcus epidermidis. In the mentioned cell line, it was found that exposure to the methanolic extracts of Combretum fruticosum and Scutia buxifolia leaves induced cell death after PDT. This extracts were tested in different cell lines. The effect was selective for tumor lines. It was also found that Collaea argentina leaf extract was photoprotective against PDT. In bacteria, three extracts turned out to be highly photoactive: Solanum verbascifolium flower, Tecoma stans flower and Cissus verticillata root. They induced 4, 2 and 3 logs decrease in bacterial survival, respectively. It was noticeable that S. verbascifolium– aPDT was more efficient under sunlight as compared to artificial light (total eradication vs. 4 logs). The balance between oxidant and antioxidant compounds is very likely to be masking or unmasking potential PS of plant extracts, but employing the crude extract, the level of photoactivity of S. verbascifolium is similar to some artificial PS upon exposure to sunlight, demonstrating that natural resources can be employed in aPDT. Photochemical characterization of S. verbascifolium flower extract upon exposure to light was carried out. aPDT reaction was dependent mainly on singlet oxygen and to a lesser extent, on hydroxyl radicals. We established a model of bacteria internalization into human keratinocytes employing S. aureus and E. epidermidis species. Afterwards, we applied aPDT on infected cells, and the response was a reduction in the number of intracellular bacteria without affecting viability of eukaryotic cells. We developed an easy method for the screening of potential PS from plants based on redox reactions and singlet oxygen production. Regarding to the search for potential new anti-cancer agents, we investigated the effect of plant extracts on cell growth (in dark conditions). Four tumor cell lines and 3 non tumor cell lines were assayed. Thirteen extracts were found to be highly cytotoxic. However, inhibition on cell growth was dependent on cell type and selectivity was not found except for Ipomoea cairica extract. In general, the inhibitory concentrations 50% were in the range of 10-150 μg/ml. The most cytotoxic extracts were Solanum chacoense, Iochroma australe and Jacaranda mimosifolia. Active compounds from these three extracts were partially isolated, finding that they induced a high percentage of cell death through cell cycle arrest and inhibition of cell migration. Overall, this is one of the first studies focusing on Argentinean native plants and their compounds biological effects on PDT, as antitumor and antibacterial. Keywords: Photodynamic therapy, plant extracts, new photosensitizers, anti-tumoral compounds, cell lines, bacterial inactivation.
Cita tipo APA: Mamone, Leandro Ariel . (2014-03-20). Búsqueda de nuevos fotosensibilizantes para el tratamiento del cáncer, inactivación bacteriana y de principios activos antineoplásicos a partir de especies vegetales de Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5514_Mamone.pdf Cita tipo Chicago: Mamone, Leandro Ariel. "Búsqueda de nuevos fotosensibilizantes para el tratamiento del cáncer, inactivación bacteriana y de principios activos antineoplásicos a partir de especies vegetales de Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5514_Mamone.pdf |
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Baccarini, Leticia Cecilia. "Interacción de la proteína quinasa dependiente de cAMP con sus genes blanco en Saccharomyces cerevisiae" (2014-03-20). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La regulación de la expresión génica mediada por proteínas quinasas es esencial para la correcta adaptación celular frente a un estímulo extracelular. En S. cerevisiae, la PKA está formada por tres subunidades catalíticas: Tpk1, Tpk2 y Tpk3 y una subunidad regulatoria: Bcy1. Existen antecedentes que indican la asociación de Tpk1 y Tpk2 a la cromatina durante el crecimiento en glucosa, glicerol y estrés oxidativo (Pokholok et al, 2006). El rol de la vía cAMP/PKA sobre la expresión génica en glucosa ha sido ampliamente estudiado (Livas et al, 2011). Por otro lado, se ha descripto, que la activación de la PKA limita la expresión de genes de respuesta a estrés (Leadsham et al, 2010; Ferretti et al, 2012). Durante el desarrollo de esta tesis analizamos la unión de Bcy1, Tpk1 y Tpk2 a diferentes regiones génicas en respuesta a estrés osmótico y oxidativo. Describimos que tanto las subunidades catalíticas como la subunidad regulatoria de la PKA se encuentran asociadas tanto a regiones transcriptas como a promotores de los genes blancos de manera estrés-dependiente. Además analizamos el requerimiento de la actividad quinasa y el papel de Bcy1 en la asociación de las Tpks a la cromatina. Versiones inactivas de Tpk1 y Tpk2 no se asociaron a la cromatina. La deleción de Bcy1 promueve una mayor asociación de Tpk1, mientras que anuló la asociación de Tpk2. Luego analizamos el posible rol de las Tpk en el remodelado de la cromatina en respuesta a estrés a través del análisis de la cinética de unión de factores remodeladores de la cromatina a las regiones donde encontramos asociadas a Tpk1 y Tpk2. Observamos unión transitoria a la cromatina de Arp8, Rsc1 y Snf2 seguido temporalmente por la asociación de las Tpk. Observamos también, la ocupación concomitante de Tpk2 y el factor de transcripción de unión al DNA Rap1. En conjunto los datos existentes y los resultados obtenidos en esta tesis sugieren que la PKA podría participar en la expresión génica mediante fosforilación in situ de los reguladores transcripcionales o de la cromatina. La distribución núcleo-citoplasmática permite regular la actividad diferencial de muchas proteínas quinasas. Hemos analizado la localización subcelular de las subunidades de PKA y su mecanismo de transporte durante estrés. Hemos observado que Tpk1-GFP y Tpk3-GFP acumulan en el núcleo post-estrés oxidativo y osmótico, sin embargo Tpk2- GFP y Bcy1-GFP no cambian su acumulación nuclear. El análisis cinético de la acumulación nuclear de Tpk1 mostró mayor velocidad en respuesta a estrés osmótico versus oxidativo. Hemos determinado que la acumulación nuclear de Tpk1, Tpk2, Tpk3 y Bcy1 es un mecanismo de transporte activo. Sorprendentemente, cada una de las subunidades de PKA es importada al núcleo por diferentes carioferinas. Por otra parte, las cepas defectivas en carioferinas las cuales impiden la acumulación nuclear específicamente de Tpk1 o Tpk2 no mostraron asociación a la cromatina las Tpks, lo que sugiere el requerimiento de acumulación nuclear de las subunidades catalíticas para la asociación a sus genes blancos. Abstract: Regulation of gene expression by intracellular stimulus-activated protein kinases is essential for cell adaptation to environmental changes. There are three PKA catalytic subunits in S. cerevisiae: Tpk1, Tpk2 and Tpk3 and one regulatory subunit: Bcy1. Previous data indicates that Tpk1 and Tpk2 were found associated to the chromatin during growth on glucose, glycerol and oxidative stress (Pokholok et al, 2006). Using ChIP-real time assay we analyzed the Bcy1, Tpk1 and Tpk2 association to 5 genes regions in response to osmotic and oxidative stresses. We had demonstrated that both catalytic and regulatory subunits of PKA were associated to transcribed regions and promoters of target genes in a stress dependent manner. Furthermore we analyze the requirement of kinase activity and the role of Bcy1 protein on Tpk chromatin association. Inactive versions of Tpk1 and Tpk2 do not associate to chromatin. Deletion of BCY1 promotes higher Tpk1 association, whereas it abolished Tpk2 association. We then analyze the possible role of Tpk on chromatin remodeling in response to stress conditions. We analyze the kinetics of binding chromatin remodelers in the regions bound by Tpk1 and Tpk2 in response to stress. During stress stimulus there is a transient binding to chromatin of Arp8, Rsc1 and Snf2 - chromatin remodelers followed temporarily by Tpk association. We also observe cooccupancy of Tpk2 and DNA-binding transcription factor Rap1. The role of cAMP / PKA on gene expression in glucose has been extensively studied (Livas et al, 2011). However PKA activation limits the expression of stress responsive genes (Leadsham et al, 2010; Ferretti et al, 2012). These results suggest that PKA could participate in gene expression by in situ phosphorylation of transcriptional or chromatin regulators. Actually it is known that a single protein kinase distributed dynamically between cytoplasm and nucleus, can regulate target genes expression by both nuclear and cytoplasmic signaling mechanisms. Thus, the nucleus-cytoplasmic kinases transport would be important to regulate differential activity in both compartments. Here we analyze stress subcellular localization of PKA subunits and their transport mechanism, using fluorescence microscopy. We observed that Tpk1 and Tpk3 accumulate in the nucleus post-oxidative and osmotic stress however Tpk2 and Bcy1 not change their nucleus-cytoplasmic distribution, staying preferentially nuclear. Our results over Tpk1 stress re-localization kinetics suggest that under osmotic stress is necessary its faster nuclear accumulation. We determined that Tpk1, Tpk2, Tpk3 and Bcy1 nuclear accumulation is ATP dependent suggesting an active transport mechanism. Surprisingly, we found that each PKA subunits is transported into the nucleus by different karyopherins. Moreover, karyopherin mutant strains which prevent nuclear accumulation of Tpk1 or Tpk2 prevented its association with chromatin, suggesting that nuclear accumulation of catalytic subunits to association to their targets genes is required.
Cita tipo APA: Baccarini, Leticia Cecilia . (2014-03-20). Interacción de la proteína quinasa dependiente de cAMP con sus genes blanco en Saccharomyces cerevisiae. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5535_Baccarini.pdf Cita tipo Chicago: Baccarini, Leticia Cecilia. "Interacción de la proteína quinasa dependiente de cAMP con sus genes blanco en Saccharomyces cerevisiae". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5535_Baccarini.pdf |
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Fuertes, Mariana. "Rol y mecanismos de acción de RSUME en la regulación de PTTG e impacto en un modelo tumoral hipofisario" (2014-03-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los tumores de hipófisis son adenomas benignos de incidencia frecuente que se originan a partir de los distintos tipos celulares hipofisarios por expansión clonal. En todos los tipos de adenomas hipofisarios se ha visto una sobreexpresión de pituitary tumor transforming gene (PTTG). PTTG facilita la progresión del ciclo celular ya que actúa como securina, regulando la correcta separación de las cromátidas hermanas en metafase, entre otras funciones. Por tratarse de un regulador del ciclo celular, el balance de los niveles de expresión de PTTG en la célula es importante, y la desregulación de estos niveles por defecto o exceso conduce a inestabilidad genómica, aneuploidía, apoptosis, daño al ADN, y conlleva al desarrollo de tumores. Se desconoce la causa que provoca el desbalance de PTTG al momento inicial del desarrollo de tumores de hipófisis. En este trabajo identificamos y describimos por primera vez un mecanismo de desregulación de los niveles de expresión de la proteína PTTG, que desencadena su acción como oncogen, permitiendo el avance de la tumorigenicidad hipofisaria. El mismo involucra la sobreexpresión de RWD-containing sumoylation enhancer (RSUME) al momento inicial del proceso tumoral y, como consecuencia, la inducción de la modificación de PTTG por SUMO, reduciendo su degradación por ubiquitinación y aumentando su estabilidad proteica. Este efecto de RSUME conduce a un aumento de la actividad PTTG y conlleva a hiperactividad del ciclo celular, aneuploidía, anormalidades cromosómicas, células multinucleadas y otros efectos tumorigénicos mediados por PTTG. Además, demostramos que PTTG y RSUME colocalizan a nivel celular y su expresión correlaciona positivamente en adenomas hipofisarios humanos. Abstract: Pituitary tumors are benign adenomas of frequent incidence originating from different pituitary cell types by clonal expansion. In all types of pituitary adenomas has been an overexpression of pituitary tumor transforming gene (PTTG). PTTG facilitates cell cycle progression by acting as securin, regulating the correct separation of sister chromatids in metaphase. Being a cell cycle regulator, the balance of PTTG expression levels in the cell is important, and deregulation of these default levels or excess leads to genetic instability, aneuploidy, apoptosis, DNA damage, among others, and leads to the development of tumors. The underlying cause of the imbalance of PTTG the initial stage of development of pituitary tumors is unknown. In this paper we identify and describe for the first time a mechanism for deregulation of the expression levels of PTTG protein, which triggers its action as oncogene, allowing the advance of pituitary tumorigenicity. It involves overexpression of RWD-containing sumoylation enhancer (RSUME) at the initial moment of the tumor process and, as a result, induction of PTTG by SUMO modification, reducing degradation by ubiquitination and increasing protein stability. This effect of RSUME leads to an increase of PTTG activity and leads to hyperactivity of the cell cycle, aneuploidy, chromosomal abnormalities, multinucleated cells and other tumorigenic effects mediated by PTTG. Furthermore, we demonstrate that PTTG and RSUME colocalize at the cellular level and its expression correlates positively in human pituitary adenomas.
Cita tipo APA: Fuertes, Mariana . (2014-03-19). Rol y mecanismos de acción de RSUME en la regulación de PTTG e impacto en un modelo tumoral hipofisario. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5592_Fuertes.pdf Cita tipo Chicago: Fuertes, Mariana. "Rol y mecanismos de acción de RSUME en la regulación de PTTG e impacto en un modelo tumoral hipofisario". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5592_Fuertes.pdf |
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Arribas, Lorena Pilar. "Efecto de los factores físico-químicos y biológicos en la estructura de la comunidad del intermareal rocoso en las provincias de Buenos Aires y Río Negro" (2014-03-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las comunidades intermareales se encuentran reguladas por factores físicos y biológicos. El objetivo general de este trabajo fue estudiar la estructura de la comunidad del intermareal rocoso, en especial los ingenieros ecosistémicos que allí habitan (e.g. mitílidos) y las especies asociadas a los mismos, en 6 localidades a lo largo de la costa argentina. Se analizó la variación a nivel espacial y estacional de los mitílidos y sus organismos asociados, además de procesos ecológicos como el reclutamiento de las dos especies de mejillines a lo largo de la costa argentina y la competencia de los mismos en la zona de coexistencia. Se encontró un reemplazo de mitílidos a lo largo de la costa, y se observaron diferencias en sus características poblacionales, en las especies asociadas y en el reclutamiento. Las fluctuaciones en la comunidad estuvieron relacionadas con características locales (sedimento y dureza de la roca) y factores físico-químicos (SST, clorofila-a, salinidad, pH). Además, el reclutamiento estuvo influenciado por la presencia de coespecíficos. La competencia dentro y entre mitílidos fue débil, siendo los procesos oceanográficos los que regulan las poblaciones de mitílidos en la zona de coexistencia. Resulta de gran importancia estudiar la comunidad intermareal, ya que preservando la biodiversidad permite a un ecosistema resistir mejor a los cambios ambientales extremos, haciéndolo menos vulnerable. Abstract: Intertidal communities are governed by physical and biological factors. The overall objective of this work was to study the community structure of rocky intertidal and especially ecosystem engineers that live there (e.g. mussels) and associated species, in 6 locations along Argentinean coast. The spatial and seasonal variation in mussels and their associated organisms were analyzed, in addition to ecological processes such as along coast recruitment of the two species of small mussels and competition of mussels in the area of coexistence. Replacement of mussels along the coast was found, and differences in population characteristics, associated species and recruitment were observed. Fluctuations in the community were related to local characteristics (sediment and rock hardness) and physical-chemical factors (SST, chlorophyll-a, salinity, pH). In addition, recruitment was influenced by the presence of conspecifics. Competition within and between mussels was weak, being oceanographic processes that regulate populations of mussels in the region of coexistence. It is of great importance to study the intertidal community, preserving the biodiversity allows an ecosystem better withstand extreme environmental changes, making it less vulnerable.
Cita tipo APA: Arribas, Lorena Pilar . (2014-03-17). Efecto de los factores físico-químicos y biológicos en la estructura de la comunidad del intermareal rocoso en las provincias de Buenos Aires y Río Negro. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5436_Arribas.pdf Cita tipo Chicago: Arribas, Lorena Pilar. "Efecto de los factores físico-químicos y biológicos en la estructura de la comunidad del intermareal rocoso en las provincias de Buenos Aires y Río Negro". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5436_Arribas.pdf |
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Groba, Hernán F.. "Caracterización morfológica de las larvas y de los receptores olfativos del parasitoide Mallophora ruficauda (Diptera: Asilidae) y determinación del origen de las claves químicas en el hospedador Cyclocephala signaticollis (Coleoptera: Scarabaeidae)" (2014-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En un ambiente complejo y heterogéneo, el éxito de los individuos y de su descendencia depende de la capacidad de localizar los recursos y las condiciones necesarias para su supervivencia. El encuentro de los recursos y la evaluación de las condiciones se logran a través de la percepción de estímulos o claves, y particularmente en los insectos, los estímulos químicos juegan un rol central en estos procesos. En los parasitoides, la búsqueda y localización de los hospedadores, los cuales constituyen el recurso fundamental en su vida, puede involucrar diferentes tipos de estímulos, pero en particular son las claves químicas volátiles las que están mayormente implicadas en este comportamiento. El moscardón cazador de abejas Mallophora ruficauda es un parasitoide solitario de larvas de coleópteros de la familia Scarabaeidae (gusanos blancos del suelo) y una plaga de la apicultura de la Región Pampeana Argentina. En estado adulto es depredador de insectos, en particular de abejas melíferas, y en estado larval parasita preferentemente a larvas de tercer estadio de Cyclocephala signaticollis. La localización del hospedador por M. ruficauda está compartida entre la hembra y la larva. En primer lugar, la hembra localiza el hábitat del hospedador y ovipone en sustratos altos maximizando la dispersión de su progenie por el viento. En una segunda fase, las larvas que llegan al suelo se entierran, mudan y buscan activamente a su hospedador por medio de claves químicas que se originan en el tubo digestivo del gusano blanco. Hasta el momento, existen algunos aspectos de este mecanismo de localización que se desconocen. Por tanto, en la presente Tesis se estudiaron aspectos asociados al comportamiento de localización del hospedador por parte de M. ruficauda, tales como las características morfológicas de las estructuras sensoriales de los adultos y las larvas, los aspectos fisiológicos y morfológicos de las larvas sociados al período de búsqueda, y el rol ecológico y origen de las claves químicas producidas por los hospedadores. Se encontró que las antenas de los adultos de M. ruficauda están especializadas en la captura e intercepción de estímulos químicos volátiles, posiblemente involucrados en los comportamientos de apareamiento y oviposición. Las larvas de primer y segundo estadio del parasitoide poseen una clara diferencia morfológica en sus estructuras cefálicas, lo que podría estar vinculado al comportamiento diferencial observado entre estos estadios durante el proceso de búsqueda del hospedador. Además el estudio del tamaño corporal de las larvas de primer estadio que nacen a lo largo de la temporada reproductiva sugiere que habría una asignación diferencial de recursos energéticos por parte de las hembras, pero no se ha encontrado un patrón claro al respecto. Por último, se determinó que tanto las larvas de estadio II de M. ruficauda como las de estadio III de C. signaticollis se orientan positivamente hacia extractos de la cámara de fermentación de las larvas de estadio III de C. signaticollis. Estos resultados sugieren que las larvas de M. ruficauda podrían estar explotando el sistema de comunicación química de su hospedador durante la búsqueda y localización. Se determinó indirectamente el origen de estas claves, observándose la presencia de microorganismos asociados al hospedador en esta región del tubo digestivo. Mediante experimentos comportamentales se demostró que los productos metabólicos de estos microorganismos serían las claves que orientan a las larvas del parasitoide durante la localización del hospedador. Sin embargo, no se determinó la función de estas sustancias químicas en las interacciones intraespecíficas de C. signaticollis. En conclusión, M. ruficauda presenta estructuras sensoriales especializadas vinculadas a la percepción de estímulos químicos volátiles, aspectos fisiológicos que permiten la sobrevida de las larvas hasta el encuentro con el hospedador, y el uso de claves altamente confiables y específicas durante la búsqueda, las cuales contribuyen a la eficiencia en la localización de recursos por larvas y hembras de M. ruficauda. Esta Tesis es una contribución al conocimiento de la historia de vida de M. ruficauda y un aporte al entendimiento de otras especies de parasitoides con características y estrategias de vida similares. Abstract: Individuals and their offspring success depend on their ability to locate the resources and optimal conditions required for survival in a complex and heterogeneous environment. The finding of resources and evaluation of these conditions is given through stimuli or cues. In most animals, especially insects, chemical cues play a central role in the location of resources. Parasitoid’s hosts are a fundamental resource on parasitoid life history, as without those parasitoids are not able to develop its life cycle. Host-seeking behaviour may include different types of cues or stimuli but particularly volatile chemicals are mainly involved. The robber fly Mallophora ruficauda is a solitary ectoparasitoid of scarab beetle larvae (white grubs) and a major pest of beekeeping in the Pampas Region of Argentina. Adults are predators of flying insects, especially honeybees, and larvae parasitized mainly third instar larvae of Cyclocephala signaticollis. Mallophora ruficauda have a split host location strategy between female and larva. First, female locates the host habitat and lay eggs in clusters on elevated available sites increasing larval dispersal and hence encounter success with larval hosts. Second, once in the ground, larva starts to dig and actively seeks for its host detecting chemical cues arisen from white grub’s digestive tube. So far, some characteristics of host finding mechanism are still unknown. Therefore, in this Thesis some features associated to M. ruficauda host searching behaviour, such as morphological characteristics of sensory structures of adults and larvae, larvae morphological and physiological aspects associated to searching process, and ecological role and origin of chemical cues produced by hosts were studied. Antennae of M. ruficauda adults are specialized for interception and capture of volatile chemical stimuli, possibly involved in mating and oviposition behaviour. First and second parasitoid larval instars showed morphological differences in cephalic structures which could be associated with the differential behaviour observed between them during host searching process. Furthermore, study of body size of first instar larvae that born along reproductive season suggests a differential energetic resources allocation, but a clear pattern have not found. Finally, it was established that both second instar larva of M. ruficauda and third instar larva of C. signaticollis are attracted to fermentation chamber’s extracts of third instar larva of C. signaticollis. These results suggest that M. ruficauda larvae could be exploiting the conspecific chemical communication system of their host during seeking behaviour. Study of cues origin indirectly revealed the presence of microorganisms associated to host in this region of the digestive tube. Experimental studies have shown that metabolic products of these microorganisms would be involved in the location of the host by parasitoid larvae. However, there were no conclusive results related to the role of the chemical cues involved in host conspecific interactions. In conclusion, M. ruficauda parasitoid presents different adaptations related to host location behaviour, such as specialized sensory structures involved in the volatile chemical stimuli perception, physiological aspects that ensure larval survival until the successful encounter occurs and the use of highly reliable and specific host cues during searching behaviour, which contribute to enhance M. ruficauda resources location. Therefore, this Thesis is a contribution to the knowledge of M. ruficauda life history, as well as to the understanding of the biology of other parasitoid species with similar characteristics and life strategies as those observed in this species.
Cita tipo APA: Groba, Hernán F. . (2014-03-14). Caracterización morfológica de las larvas y de los receptores olfativos del parasitoide Mallophora ruficauda (Diptera: Asilidae) y determinación del origen de las claves químicas en el hospedador Cyclocephala signaticollis (Coleoptera: Scarabaeidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5497_Groba.pdf Cita tipo Chicago: Groba, Hernán F.. "Caracterización morfológica de las larvas y de los receptores olfativos del parasitoide Mallophora ruficauda (Diptera: Asilidae) y determinación del origen de las claves químicas en el hospedador Cyclocephala signaticollis (Coleoptera: Scarabaeidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5497_Groba.pdf |
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Scarcia, Paola Inés. "Biomarcadores de contaminación de teleósteos dulceacuícolas como herramienta de evaluación de ambientes acuáticos afectados por compuestos orgánicos persistentes" (2014-03-12). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En el presente trabajo de tesis se evaluó la respuesta de una batería de parámetros biomarcadores fisiológicos, bioquímicos y moleculares en teleósteos dulceacuícolas, útiles y aplicables en la evaluación de la calidad de cuerpos de agua afectados por compuestos orgánicos persistentes (COPs) de origen antrópico. Se evaluaron biomarcadores de contaminación asociados a la biotransformación (actividad enzimática de glutatión-Stransferasa, inmunodetección de la proteína CYP1A y la actividad catalítica de la EROD, niveles de metabolitos biliares); al estrés oxidativo (actividad enzimática de la catalasa, superóxido dismutasa y niveles de TBARS) y asociado a la presencia de desorganizadores endócrinos (inmunodetección de vitelogenina plasmática). También se determinaron los índices fisiológicos factor de condición e índice hepatosomático. Se utilizaron como organismos prueba ejemplares juveniles de Cyprinus carpio y de diferentes especies nativas frecuentadoras de fondo. Se evaluaron los efectos adversos por exposición de dichas especies a diferentes tipos de COPs (hidrocarburos aromáticos policíclicos, bifenilos policlorados y compuestos con efecto desorganizador endócrino) por medio de ensayos de laboratorio y mediante evaluaciones a campo por exposición en jaulas (Río de la Plata y río Luján) y de recolección de especies nativas. Los resultados obtenidos permitieron caracterizar y comparar el efecto de los diferentes COPs sobre las respuestas de los biomarcadores en las especies prueba. Se demostró que el confinamiento de peces en jaulas es una metodología de trabajo útil en la evaluación de la calidad ecotoxicológica de ríos periurbanos. Se utilizaron técnicas que permitieron realizar un análisis de los resultados comparando e integrando las respuestas de los biomarcadores en los ensayos de laboratorio y de campo in situ. Se elaboró una línea de base para cada parámetro biomarcador y se proporcionó información de referencia sobre la variabilidad natural de los mismos que puede ser empleada en futuros ensayos de laboratorio y de evaluación de ambientes acuáticos afectados por COPs. Abstract: In this thesis we evaluated the response of a battery of physiological, biochemical and molecular biomarkers of freshwater teleost, useful and relevant in the evaluation of the quality of water bodies affected by anthropogenic inputs of persistent organic compounds (POCs). Biomarkers of contamination associated with biotransformation (enzymatic activity of glutathione-s transferase, immunodetection of CYP1A protein and catalytic activity of EROD, biliary metabolites levels), oxidative stress (enzymatic activity of catalase and superoxide dismutase, TBARS levels) and endocrine disruption (immunodetection of vitellogenin plasmatic protein) were assessed. Physiological indices, condition factor and liver somatic index were also assessed. Cyprinus carpio and bottom dweller native species juveniles were used as test organisms. Adverse effects were assessed by exposing those species to different kind of POCs (polycyclic aromatic hydrocarbons, polychlorinated biphenyls and endocrine- disrupting chemicals) by means of laboratory and field evaluations by cage exposure (Rio de la Plata and Luján river) and native collected fish. Results allowed comparing and characterizing the effect of different POCs on the responses of biomarkers in the test species. Fish exposure in cages proved to be a useful ecotoxicological methodology when evaluating the condition of periurbans rivers. An integrated analysis of the results allowed comparing laboratory assays and field in situ biomarker responses of test species. A baseline for each biomarker was developed and reference information was provided about their natural variability that can be used in future laboratory tests and in the assessment of aquatic environments affected by POCs.
Cita tipo APA: Scarcia, Paola Inés . (2014-03-12). Biomarcadores de contaminación de teleósteos dulceacuícolas como herramienta de evaluación de ambientes acuáticos afectados por compuestos orgánicos persistentes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5507_Scarcia.pdf Cita tipo Chicago: Scarcia, Paola Inés. "Biomarcadores de contaminación de teleósteos dulceacuícolas como herramienta de evaluación de ambientes acuáticos afectados por compuestos orgánicos persistentes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-12. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5507_Scarcia.pdf |
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Gianechini, Federico Abel. "Revisión de los Deinonychosauria (Dinosauria, Theropoda) de la Argentina: anatomía y filogenia" (2014-03-12). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Deinonychosauria es un grupo de dinosaurios terópodos celurosaurios, con un dígito pedal II con capacidad de hiperextensión, entre otros rasgos. Los registros son mayormente del hemisferio norte, aunque también existen registros del hemisferio sur. Del Cretácico de Argentina proceden Buitreraptor gonzalezorum, Unenlagia comahuensis, Unenlagia paynemili, Neuquenraptor argentinus, Austroraptor cabazai y Pamparaptor micros; ya descriptos, generalmente en forma preliminar. Mayormente son agrupados en una subfamilia de dromeosáuridos, incluida en Deinonychosauria: Unenlagiinae. Algunos estudios plantean, además, la posible sinonimia entre Unenlagia y Neuquenraptor. En esta tesis fueron descriptos y comparados detalladamente, incluyendo material inédito de B. gonzalezorum. Los huesos de B. gonzalezorum presentan numerosas marcas, morfológicamente diversas. Al analizarlas se concluyó que fueron producto de carroñeo y que el cuerpo tuvo un cierto tiempo de exposición subaérea. Se consideraron como productores más probables a mamíferos, crocodyliformes e insectos. Se realizó un análisis filogenético, buscando corroborar la monofilia del grupo y su inclusión en Deinonychosauria, resolver la identidad taxonómica de U.paynemili, la sinonimia entre Neuquenraptor y Unenlagia, y comprobar que P. micros es un deinonicosaurio. Se utilizó una matriz ya publicada como base, con modificaciones aquí realizadas. Unenlagiinae fue recuperado en el análisis e incluido dentro de Dromaeosauridae. U. comahuensis y U. paynemili pueden diferenciarse morfológicamente aunque no cladísticamente. Entre Unenlagia y Neuquenraptor hay diferencias anatómicas y los resultados cladísticos son distintos si Neuquenraptor es excluido del análisis, considerando válido a este taxón. Por otro lado, se pudo comprobar cladísticamente que P. micros es un deinonicosaurio. Abstract: Deinonychosauria is a group of coelurosaurian theropod dinosaurs, with a pedal digit II with capacity for hiperextension. Records are mainly from North Hemisphere, but also exist records from South Hemisphere. In the Cretaceous of Argentina were found Buitreraptor gonzalezorum, Unenlagia comahuensis, Unenlagia paynemili, Neuquenraptor argentinus, Austroraptor cabazai and Pamparaptor micros; already described, generally in preliminary form. They are clustered mainly in a subfamily of dromaeosaurids, included in Deinonychosauria: Unenlagiinae. Some studies also propose the possible synonymy between Unenlagia and Neuquenraptor. In this PhD work, the taxa were described and compared in detail, including unpublished materials of B. gonzalezorum. The bones of B. gonzalezorum show numerous traces morphologically diverse, which were analyzed arriving to the conclusion that they were the result of scavenging and that the corpse had a subaerial exposure. The more probable producers considered are mammals, crocodyliforms, and insects. A phylogenetic analysis was performed, in order to corroborate the monophyly of the group and its inclusion in Deinonychosauria, as well as solve the U.paynemili taxonomic identity, the synonymy between Neuquenraptor and Unenlagia, and to ascertain that P. micros is a deinonychosaur. It was used a published matrix, with some modifications. Unenlagiinae was recovered in the analysis and included within Dromaeosauridae. U. comahuensis and U. paynemili can be morphologically differentiated even though not cladistically. There are anatomical differences between Unenlagia and Neuquenraptor and cladistic results are different if Neuquenraptor is excluded from the analysis, considering it as a valid taxon. On the other hand, it was proved cladistically that P. micros is a deinonychosaur.
Cita tipo APA: Gianechini, Federico Abel . (2014-03-12). Revisión de los Deinonychosauria (Dinosauria, Theropoda) de la Argentina: anatomía y filogenia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5516_Gianechini.pdf Cita tipo Chicago: Gianechini, Federico Abel. "Revisión de los Deinonychosauria (Dinosauria, Theropoda) de la Argentina: anatomía y filogenia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-12. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5516_Gianechini.pdf |
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Martínez, Alejandra Mercedes. "Inferencia en modelos aditivos" (2014-03-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La inferencia estadística comúnmente utiliza modelos paramétricos y el supuesto es que las observaciones de la muestra pertenecen a una familia paramétrica conocida. En este caso, el problema consiste en estimar o hacer inferencia sobre los parámetros desconocidos, permitiendo llegar a conclusiones precisas cuando el modelo supuesto es cierto pero llevando posiblemente a conclusiones equivocadas cuando se aplica a un modelo ligeramente perturbado. Por esta razón, se han desarrollado modelos noparamétricos y semiparamétricos para analizar los datos. Recientemente, los modelos noparamétricos han ganado una importante atención en el estudio de fenómenos naturales con comportamiento de complejidad no lineal. Si bien estos modelos tienen menor precisión, están asociados con una alta estabilidad. En esta tesis nos enfocaremos en los modelos de regresión noparamétricos. Para los modelos de regresión noparamétricos multivariados, los estimadores de la función de regresión multivariada, tales como el estimador de Nadaraya–Watson, sufren de la bien conocida maldición de la dimensión, debido a que en entornos de radio fijo la cantidad de observaciones disminuye exponencialmente. Para evitar este problema, se introdujeron los modelos aditivos, que generalizan los modelos lineales, son de fácil interpretación y además resuelven la maldición de la dimensión. La mayoría de los procedimientos para estimar las componentes de un modelo aditivo se basan en promedios o polinomios locales usando ajustes por mínimos cuadrados. Por esta raz´on, tienen la desventaja de ser muy sensibles a la presencia de datos atípicos. Por otro lado, en muchas situaciones, sobre todo en estudios biomédicos, puede haber un conjunto de puntos del dise˜no con respuestas faltantes. En esta tesis, introducimos estimadores robustos basados en polinomios locales para resolver tanto la maldición de la dimensión, como la presencia de datos atípicos y así como también la existencia de respuestas faltantes. Estos estimadores están basados en un procedimiento de integración marginal adaptado a la situación de datos faltantes. Dichas propuestas resultaron ser consistentes y asintóticamente normalmente distribuidas bajo condiciones de regularidad. Además, se consideró una familia de estimadores robustos basados en el procedimiento de backfitting cuando no hay observaciones faltantes. Finalmente, se realizó un estudio de simulación para comparar el procedimiento de las propuestas bajo diferentes escenarios. Abstract: Most commonly used models in statistical inference are parametric and the assumption is that the observations in the sample belong to a known parametric family. In this case, the problem consists in estimating or making inference on the unkown parameters, leading to accurate conclusions when the model is correct, but they can lead to wrong conclusions when they are applied to a slightly disturbed models. For this reason, nonparametric and semiparametric models have been developed for data analysis. Recently, nonparametric regression models have gain importance when studying natural phenomenons with non lineal complexity behaviour. Even though these models are less accurate, they are associated with high stability. In this thesis, we will focus on nonparametric regression models. For the nonparamatric multivariate regression models, estimators of the multivariate regression function, such as the Nadaraya–Watson estimator, suffer from the well–known curse of dimensionality, due to in fixed-radius neiborhoods the amount of observations decreases exponentially. To overcome this drawback, additive regression models have been introduced. They generalize linear models, are easily interpretable, and they also solve the problem of the curse of the dimensionality. Most methods to estimate the components under an additive model are based on local averages or local polynomials, being sensitive to outliers. On the other hand, in many applied statistical analysis, for example in many biological experiments, it can be part of the design points on which the responses are missing. In this thesis, we introduce robust estimators based on local polynomials to solve either the curse of dimensionality, the sensitivity to atypical observations and also the existence of missing responses. The estimators are based on marginal integration adapted to the missing situation. The proposed estimators turn out to be consistent and asymptotically normally distributed under mild assumptions. Besides, a family of robust estimators based on backfitting is also considered for the situation where no missing responses arise. A simulation study allows to compare the behaviour of our procedures, under different scenarios.
Cita tipo APA: Martínez, Alejandra Mercedes . (2014-03-11). Inferencia en modelos aditivos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5604_Martinez.pdf Cita tipo Chicago: Martínez, Alejandra Mercedes. "Inferencia en modelos aditivos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5604_Martinez.pdf |
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Tejedor, Moira Luz Clara. "Cambios en la propagación de la onda de marea en la Plataforma Continental y el Río de la Plata, asociados a cambios en el nivel medio del mar y los ciclos de la descarga continental" (2014-03-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El conocimiento de la marea es de gran importancia para todas las regiones costeras del mundo, sobre todo aquellas que poseen grandes ciudades ubicadas sobre las costas. Aunque clásicamente la marea ha sido pensada como un fenómeno estable y determinístico, una serie de estudios recientes sugieren que las mismas podrían sufrir cambios significativos a lo largo del tiempo, como consecuencia de cambios morfológicos, de la ocurrencia de ciclos en el forzante atmosférico del océano o del aumento del nivel del mar debido al cambio climático. Las consecuencias ambientales, sociales y económicas que podrían provocar cambios en las mareas son amplias y variadas, e involucran las inundaciones, la generación de energía renovable, el transporte de sedimentos, la navegación, la morfología costera y de fondo, la ubicación de los frentes de marea y los hábitats inter-mareales y la circulación termohalina, entre otros aspectos. Los cambios de escala grande podrían tener impacto global, pero aún los cambios más regionales y locales deben ser comprendidos tanto como sea posible para incorporarlos en los esquemas de predicción de la marea y los modelos de marea que se utilizan con muchos fines prácticos. Por lo tanto, el estudio de dichos cambios ya sea a través del análisis de observaciones históricas como de modelado numérico es muy relevante. En consecuencia, el objetivo general de esta Tesis es estudiar y cuantificar potenciales cambios en la propagación de la marea en las aguas costeras argentinas que puedan resultar del cambio climático y la variabilidad climática, así como comprender los mecanismos intervinientes. La primera parte tiene como objetivo particular estudiar el impacto de un potencial aumento del nivel del mar que pudiera ocurrir como consecuencia del cambio climático en la propagación de la marea en la Plataforma Continental Argentina, contribuir a la comprensión de los mecanismos de los potenciales cambios e identificar las áreas más sensibles. En la segunda parte se postula que, en el caso particular del Río de la Plata, las constantes armónicas de marea podrían también cambiar con la descarga continental, que muestra significativas variaciones temporales asociadas a los ciclos de El Niño - Oscilación del Sur. Éste podría ser un efecto adicional y potencialmente mucho más significativo que el aumento del nivel del mar por efecto invernadero, al menos en el corto plazo. El segundo objetivo particular de esta Tesis fue, por lo tanto, estudiar el potencial impacto de los ciclos naturales de variabilidad inter-anual de la descarga continental en la propagación de la marea en el Río de la Plata, comprender los procesos físicos involucrados y determinar la porción del estuario que puede ser afectada por este fenómeno. El estudio, en general, es realizado mediante el análisis de las pocas observaciones históricas disponibles y simulaciones numéricas. Abstract: The knowledge of tides is very important for coastal regions, especially those with large cities located on their coasts. Although classically the tide has been thought as a stable and deterministic phenomenon, a number of recent studies suggest that they could undergo significant changes over time as a result of morphological changes, the occurrence of cycles in the atmospheric forcing of the ocean or the sea level rise due to climate change. The environmental, social and economic consequences of changes in the tides are wide and varied, and involve flooding, renewable energy generation, sediment transport, navigation, coastal and bottom morphology, location of tidal fronts and intertidal habitats, and the thermohaline circulation, among others. The large scale changes might have global impact, but even the more regional and local ones should be understood as much as possible to incorporate them into the tidal prediction schemes and tidal models used for many practical purposes. Therefore, the study of such changes either through the analysis of historical observations or numerical models is very relevant. Accordingly, the general aim of this Thesis is to study and quantify potential changes in the propagation of the tide in the Argentine coastal waters that may result from climate change and climate variability and to understand the mechanisms involved. The first part has the particular aim of studying the impact of a potential sea level rise that might occur as a consequence of climate change on the propagation of the tide in the Argentinean Continental Shelf, contributing to the understanding of the mechanisms of the potential changes, and identifying the most sensitive areas. In the second part it is postulated that, in the particular case of the Río de la Plata, tidal harmonic constants might also change with continental discharge, which shows significant temporal variations associated with El Niño - Southern Oscillation cycles. This could be an additional effect, potentially much more significant than the increase in sea level by greenhouse effect, at least in the short term. The second specific aim of this Thesis is, therefore, to study the potential impact of the natural cycles of inter-annual variability of the continental runoff in the propagation of the tide in the Río de la Plata, to understand the involved physical processes and to determine the portion of the estuary that may be affected by this phenomenon. The study, in general, is faced by analyzing the few available historical observations and by means of numerical simulations.
Cita tipo APA: Tejedor, Moira Luz Clara . (2014-03-07). Cambios en la propagación de la onda de marea en la Plataforma Continental y el Río de la Plata, asociados a cambios en el nivel medio del mar y los ciclos de la descarga continental. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5598_Tejedor.pdf Cita tipo Chicago: Tejedor, Moira Luz Clara. "Cambios en la propagación de la onda de marea en la Plataforma Continental y el Río de la Plata, asociados a cambios en el nivel medio del mar y los ciclos de la descarga continental". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5598_Tejedor.pdf |
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Mansilla, Sabrina Florencia. "La degradación de p21 inducida por luz UV facilita la replicación de ADN lesionado y preserva la estabilidad genómica" (2014-03-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Mientras que el incremento en los niveles del inhibidor de quinasas dependiente de ciclinas p21 ha sido reportado extensamente en respuesta a variados tratamientos genotóxicos, lo opuesto ocurre en respuesta a la irradiación UVC en donde p21 disminuye sus niveles de expresión como consecuencia de una proteólisis. Esta degradación sugiere que p21 podría estar reprimiendo algún proceso relevante para la respuesta celular a la irradiación UVC. En este trabajo demostramos que la estabilización forzada de p21 luego de luz UV bloquea la replicación sobre ADN lesionado. Este impedimento está relacionado con un defecto en el reclutamiento de polimerasas especializadas necesarias para replicar sobre ADN dañado, que forman parte de un proceso conocido como Síntesis de ADN por Translesión, TLS, (del inglés Translesion DNA Synthesis). Los defectos observados en la replicación de ADN lesionado correlacionan con un aumento en los marcadores de estrés replicativo, inestabilidad genómica y aumento de la muerte celular. Interesantemente estos efectos deletéreos desaparecen si se remueve el sitio de unión a PCNA, (PIP box) de p21, sugiriendo que la perdida de interacción entre p21 y PCNA es suficiente como para permitir el reclutamiento de proteínas de unión a PCNA (como las polimerasas especializadas) relevantes para la respuesta a irradiación UV. Por otro lado la expresión de una construcción degradable de p21 tuvo un efecto transiente sobre los eventos de replicación temprana y sobre el reclutamiento de las polimerasa de TLS en respuesta a irradiación UV. Estos defectos temporarios desaparecen en correlación con la degradación de p21, sin observarse consecuencias sobre eventos de replicación tardía o sobre la estabilidad genómica. En conjunto, nuestros datos sugieren que la función biológica asociada a la degradación de p21 en respuesta a irradiación UV es la de promover la replicación sobre ADN lesionado a través de una correcta y efectiva activación de los eventos de TLS. Abstract: While many genotoxic treatments upregulate the ciclin kinase inhibitor p21, agents such as UV irradiation trigger p21 degradation. This suggests that p21 blocks a process relevant for the cellular response to UV. Here we show that forced p21 stabilization after UV strongly impairs damaged-DNA replication, which is associated with permanent deficiencies in the recruitment of DNA polymerases from the Y family (involved in translesion DNA synthesis -TLS), with the accumulation of DNA damage markers and increased genomic instability. Remarkably, such noxious effects disappear when disrupting the PCNA interacting motif (PIP) of stable p21, thus suggesting that the release of PCNA from p21 interaction is sufficient to allow the recruitment to PCNA of partners (such as Y polymerases) relevant for the UV response. Expression of degradable p21 only transiently delays early replication events and Y polymerase recruitment after UV irradiation. These temporary defects disappear in a manner that correlates with p21 degradation with no detectable consequences on later replication events or genomic stability. Together, our findings suggest that the biological role of UV- triggered p21 degradation is to prevent replication defects by facilitating the tolerance of UV-induced DNA lesions.
Cita tipo APA: Mansilla, Sabrina Florencia . (2014-03-07). La degradación de p21 inducida por luz UV facilita la replicación de ADN lesionado y preserva la estabilidad genómica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5531_Mansilla.pdf Cita tipo Chicago: Mansilla, Sabrina Florencia. "La degradación de p21 inducida por luz UV facilita la replicación de ADN lesionado y preserva la estabilidad genómica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5531_Mansilla.pdf |
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Tagliaferro, Marina. "Estructura espacial, temporal y trófica de las comunidades acuáticas del río Santa Cruz" (2014-03-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se presenta el primer estudio integral de las comunidades acuáticas del río Santa Cruz. Se caracterizó la hidrología del río Santa Cruz enmarcado entre los grandes ríos de la Patagonia evidenciando una condición de baja variabilidad en el régimen de descargas hídricas y térmicas. Los ensambles comunitarios, incluyendo biofilms, macroinvertebrados bentónicos y peces fueron descriptos en función de la complejidad espacial y temporal del ambiente. Los peces mostraron un patrón de distribución con mayor riqueza de especies y mayor abundancia en la cuenca alta. Los macroinvertebrados no mostraron un patrón definido a gran escala y a lo largo del río. Temporalmente, se observó una menor abundancia y riqueza de los diferentes ensambles en el período de aguas altas (verano). Las tramas tróficas, estudiadas a través del contenido estomacal y los análisis de isótopos estables, exhibieron relaciones más complejas en la cuenca alta, donde la trucha arco iris, Oncorhynchus mykiss, tuvo un rol de presa o depredador tope según el período ontogenético. Además, en estadios tempranos presentó una gran superposición en la dieta con la especie nativa Galaxias maculatus, consumiendo principalmente macroinvertebrados bentónicos. La línea de base aquí encontrada podrá ser utilizada para futuras evaluaciones ante posibles cambios antropogénicos como los emprendimientos hidroeléctricos. Abstract: This thesis presents the first comprehensive study of the aquatic communities of the Santa Cruz River. The Santa Cruz River hydrology was characterized within the context of the largest rivers of Patagonia, revealing a condition of extremely low variability in the discharge and thermal regime. Community assemblages, including biofilms, benthic macroinvertebrates and fish were described in terms of spatial and temporal environmental complexity. Fish showed a greater species richness and abundance in the upper basin. Macroinvertebrates showed no clear pattern at the large scale along the river. Temporarily, there was a lower abundance and richness of the different assemblages in the high water period (summer). Food webs, studied using stomach contents and stable isotope analyzes, exhibited more complex relationships in the upper basin, where rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, had a role as prey or top predator along its ontogeny. In addition, in early stages it overlapped in diet with the native Galaxias maculatus, consuming mainly benthic macroinvertebrates. The baseline created could be used for future analysis of antropogenic effect like the implementation of hydroelectric projects.
Cita tipo APA: Tagliaferro, Marina . (2014-03-06). Estructura espacial, temporal y trófica de las comunidades acuáticas del río Santa Cruz. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5438_Tagliaferro.pdf Cita tipo Chicago: Tagliaferro, Marina. "Estructura espacial, temporal y trófica de las comunidades acuáticas del río Santa Cruz". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5438_Tagliaferro.pdf |
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Benavente, Cecilia Andrea. "Microbialitas lacustres de secuencias triásicas de Argentina" (2014-03-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las sucesiones triásicas Cerro de las Cabras y Cerro Puntudo corresponden al relleno sedimentario de la Cuenca Cuyana de rift. La cuenca presenta dos hemigrábenes asimétricos, uno ubicado al norte y otro al sur de polaridad opuesta y desvinculados por un alto topográfico. Los depocentros estudiados son Cerro Puntudo que forma parte del hemigraben norte en donde aflora la Formación Cerro Puntudo; y el depocentro Potrerillos que forma parte del hemigraben sur en el que aflora la Formación Cerro de las Cabras. Ambas unidades contienen depósitos enteramente continentales y presentan las típicas secuencias tripartitas de sedimentación aluvialesfluviales- lacustres en ambientes de rift. Los sistemas palustre-lacustre son carbonáticos y estos sedimentos presentan desarrollo de microbialitas. En ambos casos, trabajos previos han aportado dataciones absolutas para las sucesiones corroborando su correspondencia estratigráfica (Anisiano) y permitiendo el análisis comparativo de los resultados. El análisis sedimentológico de la Formación Cerro de las Cabras revela dos asociaciones de facies que caracterizan dos subambientes: Planicie arenosa y de finos conformada por las facies Areniscas conglomerádicas, Areniscas masivas intraclásticas y Fangolitas masivas; y Calizas palustres formada por las facies Calizas moteadas-nodulares y Calizas estromatolíticas. Estos ambientes formaron parte de un sistema depositacional de lago de barreal alcalino efímero, con frecuente exposición subaérea y abundante desarrollo de pedogénesis. Los datos de isótopos estables del carbono (C) y del oxígeno (O) han permitido determinar la paleohidrología del paleolago Cerro de las Cabras que resultó ser un sistema hidrológicamente abierto que actuó como zona de recarga del acuífero subterráneo. Además en la señal isotópica se han detectado efectos biológicos sobre el reservorio de C inorgánico total disuelto en el sistema lacustre. Este efecto se manifiesta como una tendencia altamente negativa de la señal isotópica del C y corresponde a efectos de bacterias heterótrofas descomponedoras de materia orgánica (MO). La señal isotópica del O refleja fluctuaciones entre valores negativos, interpretados como picos de aporte de aguas meteóricas, y valores menos negativos que indican tendencias evaporíticas. En la Formación Cerro de las Cabras la evidencia de desarrollo de biota se observa en la fábrica de las calizas estromatolíticas que indican la precipitación de carbonato de calcio por medio de acción biológica. A su vez las calizas palustres presentan abundantes rizohalos y rizolitos resultantes de paleosuelos vegetados. En la Formación Cerro Puntudo se han determinado cinco asociaciones de facies: Abanico aluvial, conformada por las facies Conglomerado matriz sostén y Areniscas intraclásticas estratificadas; Planicie arenosa, formada por las facies Areniscas masivas y Areniscas laminadas; Planicie de finos, en la que se reconocen las facies Fangolitas laminadas y Limolitas laminadas; Canales carbonáticos, en los que se determinaron las facies Fangolitas oncolíticas y Areniscas oncolíticas laminadas; Calizas palustres, con las facies Calizas moteadas, Calizas nodulares y Calizas estromatolíticas; y finalmente la asociación de facies Calizas lacustres, con las facies Margas laminadas y Boundstones oncolíticos. Estos subambientes conformaron un sistema depositacional de barreal alcalino en el que el aporte superficial era efímero. El principal sustento hídrico fue el aporte de agua subterránea a través de una tabla de agua elevada. Algunos rasgos sedimentológicos han permitido detectar una probable zona de surgencia de aguas subterráneas en el depocentro. Aún así, los subambientes excepto el lacustre presentan abundantes rasgos que indican exposición subaérea y pedogénesis. Los datos de isótopos estables del C y del O señalaron que el paleolago Cerro Puntudo era un sistema hidrológicamente abierto y que actuó como barreal de tipo through flow. La señal del C refleja excursiones negativas que se han asociado con blooms algales que implican incremento en la actividad fotosintética y se vinculan con cambios climáticos estacionales. La señal isotópica del O presenta tendencias muy similares a las observadas para el paleolago Cerro de las Cabras (evaporación-dilución) lo que avala una impronta climática regional en las señales isotópicas. En el caso de los carbonatos de Cerro Puntudo se analizó la relación isotópica 87Sr/86Sr para precisar la proveniencia de las calizas. Se determinó que el aporte dominante de Sr a las calizas triásicas provino del vulcanismo permo-triásico del Choiyoi. En el paleolago Cerro Puntudo las microbialitas presentan un ensamble paleontológico que refleja un paleoecosistema acuático complejo con una red trófica sencilla. El mismo está caracterizado por algas filamentosas y cocoides de afinidad con Cyanophyta que constituyen los productores primarios y que formaron las estructuras por precipitación biológicamente inducida. También se ha identificado representantes de algas Charophyta en el mismo rol. Además se hallaron invertebrados ostrácodos heterótrofos detritívoros y bacterias heterótrofas descomponedoras de MO. El hallazgo de algas carófitas tiene implicancias paleobiogeográficas ya que constituye el primer registro del taxón para el hemisferio sur durante el Triásico lo que permite ampliar su distribución a Gondwana. Los resultados sedimentológicos, paleontológicos y geoquímicos de esta contribución permitieron caracterizar a los sistemas lacustres estudiados como lagos de tipo balanceados, cuya evolución y sedimentación evidencia un control mixto tectónico y climático. El análisis comparativo con los depocentros del rift jurásico de la Cuenca Cañadón Asfalto demuestra que en zonas tectónicamente análogas, dominarán patrones similares de sedimentación. Esto permite el modelado de facies a futuro para sistemas de sedimentación lacustres carbonáticos en cuencas de rift. Abstract: The Triassic Cerro de las Cabras and Cerro Puntudo Formations represent the sedimentary infilling of the Cuyana rift basin. The basin is composed of two asymmetric half-grabens, situated from north to south and linked by a topographic high. These half-grabens are the Cerro Puntudo subbasin, in the north containing the Cerro Puntudo Formation and the Potrerillos sub-basin, in the south containing the Cerro de las Cabras Formation. Both formations contain continental deposits and conform to the typical alluvial-fluvial-lacustrine sequences of rift basins. Previous work has provided absolute dates, confirming that the deposits are coeval in age (Anisian). Most significantly, carbonate deposits with abundant microbialites are present in both units, allowing a comparative analysis across the Cuyana Basin. Sedimentologic studies in the Cerro de las Cabras Formation reveal two facies associations that characterize two subenvironments: (1) Sandflat and Mudflat facies association represented by the coarse sandstones, massive intraclastic sandstones, and massive mudstones facies, and (2) Palustrine limestone facies association represented by mottled-nodular limestones and stromatolitic limestones facies. These subenvironments are interpreted to represent an ephemeral playa lake depositional system with common features of subaerial exposure and pedogenesis. Carbon (C) and oxygen (O) stable isotopes data permit the determination of the paleohydrology of the paleolakes in the sub-basins. The Cerro de las Cabras paleolake was a hydrologically open system that functioned as the recharge zone of the regional groundwater. Also, the isotopic signature indicated biologic effects over the total dissolved inorganic C (TDIC) in the paleolake that has been attributed to heterotrophic bacteria, organic matter (OM) decomposers. The O isotope reflected a signature of the groundwater supply into the paleolake and fluctuation between evaporative and dilution tendencies. In the Cerro de las Cabras Formation evidence for biota in the stromatolitic limestone facies indicates induced precipitation of carbonate. Also the palustrine limestones facies with abundant rhizohaloes and rhizoliths indicate vegetated paleosols. Sedimentologic studies of the Cerro Puntudo Formation reveal six facies associations: (1) Alluvial fan with matrix-supported conglomerates and stratified intraclastic sandstones facies; (2) Sandflat represented by massive sandstones and laminated sandstones facies; (3) Mudflat with laminated mudstones and laminated siltstones facies; (4) Carbonate channelswith oncolitic mudstones and oncolitic laminated sandstones facies; (5) Palustrine limestones with mottled limestones, nodular limestones, and stromatolitic limestones facies; and (6) Lacustrine limestones with laminated mudrocks and oncolitic boundstones facies. These subenvironments formed part of an alkaline playa lake system fed mainly by groundwater and with ephemeral surface water supply. Some sedimentary features suggest the presence of an apron discharge area in the subbasin. All the facies associations except for the Lacustrine limestones show abundant subaerial exposure and pedogenesis. Carbon (C) and oxygen (O) stable isotopes data for the Cerro Puntudo paleolake indicate hydrologically open conditions and the system functioning as a through flow playa lake. The C isotopic signature shows negative excursions interpreted as the result of algal blooms with increased photosynthetic activity. This may correlate with seasonal climate fluctuations. The O isotopic signature presents hydrologic tendencies (evaporative and dilution) similar to the Cerro de las Cabras paleolake. This supports regional climate fluctuations imprinted in the isotopic signatures of both paleolakes. For the limestones of the Cerro Puntudo Formation, 87Sr / 86Sr data were analyzed to determine provenance. This confirmed that the dominant supply for Sr to the Triassic limestones was related to the Permian- Triassic Choiyoi volcanism in West Gondwana and the marine limestones in the drainage area. The Cerro Puntudo paleolake contains a microbialite assemblage that reflects a simple aquatic paleoecosystem with a simple trophic network. This is composed of filamentous and coccoid algae with Cyanophyta affinities that constitute the primary producers with lithified structure through bio-mediated carbonate precipitation. Also, charophytes have been identified fulfilling the same task. As heterotrophs, ostracodes were found probably feeding from detritus and bacteria as OM decomposers. The discovery of charophytes has paleobiogeographic implications since this is the first record for the group in the South Hemisphere in the Triassic, extending its distribution into Gondwana. The sedimentary, paleontologic, and geochemical data obtained allowed the characterization of the two lacustrine depositional systems containing balanced-filled lakes reflecting sedimentation controlled by tectonics (synrift stage) as well as climate (groundwater and surface water input). The comparison of these Triassic systems with the deposits of the Cañadón Asfalto Rift Basin of the Jurassic in West Gondwana shows that in the same tectonic frameworks similar sedimentary patterns prevail. This allows for future facies models development for carbonate lake systems in rift basins.
Cita tipo APA: Benavente, Cecilia Andrea . (2014-03-06). Microbialitas lacustres de secuencias triásicas de Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5553_Benavente.pdf Cita tipo Chicago: Benavente, Cecilia Andrea. "Microbialitas lacustres de secuencias triásicas de Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-03-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5553_Benavente.pdf |
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Abalde, Roberto. "Inducción de preferencias a partir del contexto de elección del usuario en sistemas de recomendación" (2014-02-28). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La mayoría de los sistemas de recomendación actuales que usan técnicas de filtrado colaborativo basado en memoria predicen las preferencias de un usuario usando solamente la información de los ítems sobre los que el usuario expresó su preferencia. Sin embargo no utilizan el contexto de elección del usuario, esto es, el conjunto de ítems que fueron recomendados al usuario pero que fueron ignorados. En este trabajo de tesis presentamos las modificaciones hechas a los algoritmos clásicos de filtrado colaborativo basado en memoria para que utilicen el contexto de elección del usuario al momento de predecir sus preferencias por nuevos ítems. Como no se conocen conjuntos de datos públicos que tengan el contexto de elección del usuario y que nos permitan probar los algoritmos modificados, implementamos dichas modificaciones en un sistema de recomendación real para poder recolectar los datos necesarios para la etapa de experimentación. Finalmente, realizamos una serie de experimentos sobre tres conjuntos de datos, que nos permitieron verificar que nuestra propuesta tiene un mejor desempeño que los sistemas de recomendación clásicos. Abstract: Most of existing recommendation systems use memory-based collaborative filtering techniques to predict the preferences of a user using only the information of the items for which the user expressed a preference. However, existent systems do not use the context of user choice, that is, the set of items that were recommended to the user but were ignored by her. In this thesis we present the modifications made to the classic memory-based collaborative filtering algorithms to use the context of user choice in the prediction of the user preferences. Since there are no known public datasets including the context of user choice that could allow us to test the modified algorithms, we implemented these changes in a real recommender system that allowed us to build a dataset with the information required. Finally, we conducted a series of experiments on three datasets, which allowed us to verify that our proposal has better performance than the traditional recommendation systems.
Cita tipo APA: Abalde, Roberto . (2014-02-28). Inducción de preferencias a partir del contexto de elección del usuario en sistemas de recomendación. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5611_Abalde.pdf Cita tipo Chicago: Abalde, Roberto. "Inducción de preferencias a partir del contexto de elección del usuario en sistemas de recomendación". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-02-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5611_Abalde.pdf |
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Jacobs, Melisa. "Análisis estructural y bioquímico de la proteína de membrana externa GumB de Xanthomonas campestris, y su participación en la síntesis del exopolisacárido xantano" (2014-02-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Muchas bacterias producen polisacáridos extracelulares que pueden asociarse a la superficie celular o ser secretados al medio extracelular. Numerosos polisacáridos bacterianos se encuentran asociados al desarrollo de patogenicidad, convirtiéndose en un importante factor de virulencia. Por otro lado, existe un gran interés industrial sobre muchos polisacáridos bacterianos debido a sus amplias aplicaciones. En general, se ha descripto en detalle los primeros pasos de la síntesis de polisacáridos, pero aún no se han esclarecido los mecanismos involucrados en la polimerización y transporte de los mismos hacia la superficie bacteriana o al medio extracelular. Se ha postulado que estos procesos serían llevados a cabo gracias a la formación de complejos proteicos que podrían atravesar la membrana plasmática, de forma similar a lo observado para los sistemas de secreción de proteínas. En esta tesis se presenta el estudio estructural y bioquímico de la proteína de membrana externa GumB, la cual se encontraría asociada a la síntesis/secreción del polisacárido xantano en Xanthomonas campestris. Fue posible sobreexpresar y purificar cantidades suficientes para ensayos estructurales de esta proteína de membrana, al expresarla en el citoplasma. Se obtuvieron cristales de la proteína nativa y de su derivado de selenio-metionina, a partir de los cuales fue posible resolver la estructura a 2,54 Å. Se encontró que en el cristal GumB forma un tetrámero, esta característica también se ha observado en solución mediante ensayos de dispersión de luz estática y entrecruzamiento químico. Por otro lado, ensayos de dispersión de neutrones a bajos ángulos mostraron que la forma de GumB en solución es similar a la observada en el cristal. El tetrámero de GumB mostró una gran cavidad con cargas positivas que podrían estar involucradas en la interacción con el xantano, el cual posee cargas negativas debido a sus residuos de ácido glucurónico y grupos cetalpiruvato. Asimismo, se presenta evidencia que sugiere la participación de GumB en un complejo proteico. Mediante ensayos de entrecruzamiento químico in vivo se observó que GumB forma complejos de alto peso molecular. Electroforesis azul nativa permitió identificar potenciales interacciones entre GumB y otras proteínas de X. campestris. Abstract: Many bacteria produce extracellular polysaccharides, which can be associated with the cell surface or secreted to the extracellular medium. Several bacterial polysaccharides are associated with pathogenesis development, making them an important virulence factor. On the other hand, there is an important industrial interest in many bacterial polysaccharides because of their broad applications. The steps involved in polysaccharide synthesis are well described, but less is known about polysaccharide transport to the extracellular medium. It is believed that secretion is achieved due to a protein transenvelope complex, similar to those observed for protein secretion systems. In this thesis, the outer membrane protein GumB was studied structurally and biochemically. It has been previously shown that GumB is involved in the synthesis/secretion of xanthan gum in Xanthomonas campestris. Protein overexpression and purification, in quantities enough to set up structural assays, were achieved when this protein was expressed in the cytoplasm. Crystals of native protein and its selenium-methionine derivative were obtained, allowing the determination of GumB crystal structure to 2.54 Å. In the crystal, GumB is a tetramer, a feature also observed in solution by static light scattering and chemical crosslinking assays. Besides, small angle neutron scattering assays showed that GumB envelope in solution was similar to that observed in the crystal. GumB tetramer exhibited a cavity with positive charges that could be involved in the interaction with xanthan, which is a negatively charged polysaccharide due to its glucuronic acid residues and ketalpyruvate groups. In addition, evidence suggesting that GumB is part of a protein complex is presented. By in vivo chemical crosslinking, it was observed that GumB forms high molecular complexes. Blue native electrophoresis allowed the identification of potential interactions between GumB and other proteins from X. campestris.
Cita tipo APA: Jacobs, Melisa . (2014-02-26). Análisis estructural y bioquímico de la proteína de membrana externa GumB de Xanthomonas campestris, y su participación en la síntesis del exopolisacárido xantano. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5591_Jacobs.pdf Cita tipo Chicago: Jacobs, Melisa. "Análisis estructural y bioquímico de la proteína de membrana externa GumB de Xanthomonas campestris, y su participación en la síntesis del exopolisacárido xantano". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-02-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5591_Jacobs.pdf |
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Poloni, Pablo Alberto. "Nuevo Algoritmo de clasificación supervisado sin parámetros, no afectado por el desbalanceo y overfitting" (2014-02-24). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los algoritmos tradicionales orientados a la extracción de reglas de decisión y modelos de clasificación, han demostrado resultados no deseados al trabajar con conjuntos de datos con ciertas particularidades. Entre ellos se puede mencionar: árboles de decisión, regresiones logísticas, redes neuronales, algoritmos genéticos, etc. En cualquiera de estos algoritmos, es necesario configurar una gran cantidad de parámetros hasta lograr un resultado deseable. El manejar los parámetros inadecuadamente genera modelos probabilísticos con aparentemente buenos resultados. Estos modelos al ser validados no reflejan los resultados esperados. Este problema es conocido como overfitting. Muchas veces ocurre, que los individuos que se quieren clasificar son muy pocos comparados con la población total. Este inconveniente es conocido como “desbalanceo” de la clase. Los algoritmos tradicionales, en muchos de estos casos, no trabajan adecuadamente o es costoso hacerlos funcionar. Si las variables tienen un número reducido de valores muy alejados de los valores centrales, estos “valores extremos” deben ser tratados previamente para evitar el mal funcionamiento de los algoritmos. Todos estos inconvenientes han llevado a tratar de encontrar otras alternativas para obtener modelos con “reglas” que permitan predecir comportamientos o clasificar en diferentes segmentos. Son numerosos los autores que han escrito trabajos para generar combinaciones de predicados y utilizar la curva ROC para seleccionar los mejores. Entre algunos de ellos se pueden citar: Provost and Fawcett, 1998; Provost ad Fawcett, 2002; Ferri, C. Flash, P., Hernández –Orallo, 2002; Fawcett, 2003;Fürnkranz, J. and Flash, 2005. Esta tesis presenta un nuevo algoritmo, llamado DO-ROC2, para generar todas las combinaciones de reglas posibles de a 2 variables y seleccionar aquellas reglas que maximizan el área bajo la curva ROC. DO-ROC2 tiene como ventajas sobre los algoritmos tradicionales: no es afectado por el “desbalanceo”; tampoco por “valores extremos”; no necesita parámetros para su ejecución y el “overfitting” está controlado.
Cita tipo APA: Poloni, Pablo Alberto . (2014-02-24). Nuevo Algoritmo de clasificación supervisado sin parámetros, no afectado por el desbalanceo y overfitting. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5839_Poloni.pdf Cita tipo Chicago: Poloni, Pablo Alberto. "Nuevo Algoritmo de clasificación supervisado sin parámetros, no afectado por el desbalanceo y overfitting". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2014-02-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5839_Poloni.pdf |
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