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Mancini, Estefanía. "Identificación y caracterización de eventos de splicing alternativo en Arabidopsis thaliana utilizando herramientas de transcriptómica de alto rendimiento" (2016-12-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El mecanismo de splicing alternativo es un mecanismo de regulación post-transcipcional presente en los organismos eucariotas que amplía las capacidades regulatorias y funcionales de los genes mediante la generación de múltiples isoformas. Las consecuencias de este proceso son proteínas funcional y estructuralmente diferentes como así también productos no traducibles con funciones regulatorias en sí mismos. El advenimiento de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva, incluyendo las que se utilizan para ARN (RNA-Seq) permiten estudiar cambios transcripcionales incluyendo splicing alternativo de una manera inusitada. Sin embargo, la descripción de los cambios en los patrones de splicing bajo diferentes condiciones no es trivial y ha dado lugar durante los últimos años al desarrollo de múltiples herramientas bioinformáticas. En este trabajo de tesis, se describe ASpli, un paquete de R integrativo y fácil de usar que facilita el análisis de los cambios en el splicing alternativo tanto en eventos anotados como nuevos a partir de datos de RNA-Seq. Nuestra propuesta es combinar la información estadística del uso diferencial de exones, intrones y junturas junto con las métricas de inclusión (PSI) y retención de intrón (PIR) que se obtienen por el análisis de las junturas sobre cada región genómica en estudio. La utilización de este abordaje integral intenta cuantificar de manera más exacta la ocurrencia de eventos de splicing alternativo. El desarrollo del paquete fue fundamental para el análisis de la remodelación del transcriptoma ante numerosos tratamientos en la planta modelo Arabidopsis thaliana así como en otros organismos. Como parte de los resultados, se describen los análisis del efecto de un pulso de luz en plantas y sus consecuencias globales en la regulación del splicing alternativo. Abstract: Alternative splicing (AS) is a common mechanism of post-transcriptional gene regulation in eukaryotic organisms that expands the functional and regulatory diversity of a single gene by ge- nerating multiple mRNA isoforms that encode structurally and functionally distinct proteins. The development of novel high-throughput sequencing methods for RNA (RNA-Seq) has provided a powerful means of studying AS under multiple conditions and in a genome-wide manner. Despite the fact that a plethora of bioinformatic tools have been developed in the last few years, using RNA-Seq to study changes in AS under different experimental conditions is not trivial. In this thesis, we describe ASpli, an integrative and user-friendly R package that facilitates the analysis of changes in both annotated and novel AS events. Our method combines statistical information from exon, intron, and splice junction differential usage, with information from splice junction reads to calculate differences in the percentage of exon inclusion (PSI) and intron retention (PIR), which reliably reflect the magnitude of changes in the relative abundance of different annotated and novel AS events. This approach is intended to improve the analysis of RNA-Seq data for the quantification and discovery of AS events. The package has been intensively used for the analysis of alternative splicing in a genome-wide manner in Arabidopsis thaliana as well as other organisms. As part of the results, we present the analysis of the accute effects of light on alternative splicing in light-grown plants.
Cita tipo APA: Mancini, Estefanía . (2016-12-27). Identificación y caracterización de eventos de splicing alternativo en Arabidopsis thaliana utilizando herramientas de transcriptómica de alto rendimiento. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6166_Mancini.pdf Cita tipo Chicago: Mancini, Estefanía. "Identificación y caracterización de eventos de splicing alternativo en Arabidopsis thaliana utilizando herramientas de transcriptómica de alto rendimiento". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6166_Mancini.pdf |
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Russo, María Gabriela. "Análisis genéticos aplicados al estudio de la dinámica de poblaciones humanas prehispánicas del Noroeste Argentino" (2016-12-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Existen diversos procesos sociales, políticos y culturales de las poblaciones humanas que pueden dejar huellas en su acervo génico. En consecuencia, el análisis del ADN constituye una herramienta complementaria para su estudio. En esta tesis se abordaron distintos aspectos de las poblaciones que habitaron el actual Noroeste Argentino (NOA) y el resto del Área Centrosur Andina en tiempos prehispánicos a partir del análisis del ADN antiguo, es decir, del material genético extraído de restos óseos. Utilizando al ADN mitocondrial como el principal marcador y a fin de contribuir al estudio de la dinámica y el estilo de vida de estas poblaciones, se emplearon dos escalas de análisis: local y regional. A nivel local, en la Quebrada de Humahuaca se intentó establecer: a) la procedencia de los habitantes de un sitio del Período Incaico, hallándose evidencias del origen local de una parte de la población, que habría sido probablemente relocalizada desde otros poblados cercanos; y b) las relaciones de parentesco entre individuos de dos asentamientos, obteniéndose indicios de que aquellos enterrados en un mismo recinto o unidad habitacional se encontraban emparentados. En una escala de análisis regional, se evaluó la variabilidad y la diferenciación genética entre distintas poblaciones prehispánicas del Área Centrosur Andina. Por un lado, no se encontraron evidencias de diferenciación entre poblaciones como las de los actuales territorios del NOA, norte de Chile y Bolivia. Por el otro, en líneas generales se observó la existencia de estructuración considerando toda el área analizada, sobre la que habrían incidido factores como diferencias temporales y las características particulares de cada población en cuanto a su interacción con otras. Los resultados obtenidos en este trabajo han permitido poner a prueba hipótesis vinculadas al estilo de vida, los procesos migratorios y las interacciones entre distintos grupos, contribuyendo especialmente al conocimiento de las dinámicas poblacionales prehispánicas del NOA y del resto del Área Centrosur Andina. Abstract: The genetic pool of human populations can be influenced by several social, political and cultural processes. Consequently, DNA studies became a helpful tool to understand these phenomena. The present thesis comprises the study of different aspects of pre-Hispanic populations from north-western Argentina (NWA) and the rest of South-Central Andes area through the analysis of ancient DNA, meaning the genetic material recovered from human remains. Using mitochondrial DNA as the main genetic marker and with the aim of contributing to the study of population dynamics and lifestyle, two levels of analysis were employed: local and regional. At a local level in Quebrada de Humahuaca, we tried to establish: a) the origin of the inhabitants of a site from the Inca Period, finding that part of the population was probably resettled from other nearby sites; and b) the kinship relationships among individuals from two archaeological sites, detecting evidences of relatedness among those buried in the same grave or residential space. At a regional scale, genetic variability and differentiation among diverse pre-Hispanic populations from the South-Central Andes area were studied. On one hand, no evidence of differentiation was found among some groups like those from the current territories of NWA, northern Chile and Bolivia. On the other hand, we found a structured population considering the entire analyzed area as a whole with the probable influence of several factors, such as chronological differences and the characteristics of each population related with the interaction with others. The results obtained allowed to test hypothesis about the lifestyle, migratory processes and interactions among different groups, contributing to the study of pre-Hispanic population dynamics in NWA and the rest of the South-Central Andes area.
Cita tipo APA: Russo, María Gabriela . (2016-12-22). Análisis genéticos aplicados al estudio de la dinámica de poblaciones humanas prehispánicas del Noroeste Argentino. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6113_Russo.pdf Cita tipo Chicago: Russo, María Gabriela. "Análisis genéticos aplicados al estudio de la dinámica de poblaciones humanas prehispánicas del Noroeste Argentino". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6113_Russo.pdf |
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Rodríguez, María Eugenia. "Algebras de operadores en espacios Lp asociadas a grafos orientados" (2016-12-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Esta tesis está dedicada al estudio de representaciones por operadores acotados en espacios Lp del álgebra de Leavitt LQ de un grafo. Sean Q un grafo orientado finito por filas y LQ su álgebra de Leavitt sobre C. Para p ∈ Abstract: This thesis is devoted to the study of Leavitt path algebra representations by bounded operators on Lp spaces. Let Q be a row finite directed graph and LQ the associated Leavitt algebra over C. For p ∈
Cita tipo APA: Rodríguez, María Eugenia . (2016-12-21). Algebras de operadores en espacios Lp asociadas a grafos orientados. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6108_Rodriguez.pdf Cita tipo Chicago: Rodríguez, María Eugenia. "Algebras de operadores en espacios Lp asociadas a grafos orientados". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6108_Rodriguez.pdf |
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Peinetti, Ana Sol. "Uso de matrices nanoporosas como molde para la síntesis de nanopartículas/clusters metálicos. Aplicaciones a sensores y catálisis" (2016-12-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El control del tamaño y el entorno de nanopartículas cumplen un rol fundamental en sus propiedades. Se han utilizado diversas técnicas para su síntesis y en su mayoría es necesaria la adición de especies estabilizantes para controlar el tamaño y evitar su aglomeración. La presencia de estas moléculas puede resultar un inconveniente para su posterior modificación y afectar su funcionalidad. En este trabajo se presenta un método de síntesis basado en pulsos de corriente para la generación de nanopartículas (NPs) de oro, platino y níquel, dentro de una matriz nanoporosa de alúmina. El método permite la generación de NPs de diferentes metales con superficies activas, presentando una excelente respuesta a los procesos de transferencia de carga, ejemplificados con la respuesta electroquímica de diferentes especies, en particular, ferrocianuro. Se ha obtenido un control del tamaño de las nanopartículas y de las características del sistema a través del uso de nanoporos de distintos tamaños, distinta corriente de electrodeposición y de diferentes precursores del metal; permitiendo la obtención de nanopartículas pequeñas (2-10nm de diámetro) y clusters atómicos metálicos. Se ha logrado optimizar las condiciones para preparar materiales con la funcionalidad deseada. Estas nanopartículas confinadas en una matriz porosa actúan como un arreglo de nanoelectrodos. Para lograr una descripción completa de la respuesta electroquímica de estos sistemas, se ha desarrollado un modelo bidimensional para simular su comportamiento, el cual permite entender las diferentes respuestas obtenidas por voltametría cíclica dependiendo de las características geométricas del sistema y la velocidad de barrido. Este modelo puede extenderse a distintos arreglos de micro y nanoelectrodos, como se demuestra en el trabajo. Los clusters metálicos formados por menos de 100 átomos presentan interesantes propiedades, diferentes a las nanopartículas, que los hacen muy buenos candidatos para aplicaciones en catálisis. Se analiza la capacidad catalítica de los clusters de Ni y Au obtenidos, evaluándola a partir de la reacción de reducción de 4-nitrofenol y azul de metileno. Se obtuvieron valores de constantes de velocidad de pseudo-primer orden mayores a las reportadas para NPs sintetizadas en fase homogénea. Por otro lado, las nanopartículas de oro electrogeneradas en los nanoporos de alúmina con un tamaño controlado de 2nm fueron modificadas con aptámeros para la detección libre de marcadores, de moléculas pequeñas de relevancia biológica por espectroscopía de impedancia. Los resultados muestran que el uso de una superficie conductora confinada dentro de un entorno aislante puede ser muy sensible a cambios conformacionales de aptámeros, introduciendo un nuevo enfoque para la detección de moléculas pequeñas ejemplificada en este trabajo por la detección directa y selectiva de adenosina monofosfato en la escala nanomolar. Este trabajo demuestra las ventajas de controlar la arquitectura en la escala nanométrica para obtener una sensibilidad adecuada. Abstract: Nanoparticles properties are determined by their size and environment. Different techniques have been used for their synthesis, most of them introduce a capping agent to avoid the agglomeration of nanoparticles and to control size. However, the presence of these molecules can be inconvenient for further modification and can affect their functionality. The synthesis of metal nanoparticles (Au, Ni, Pt) by pulsed galvanostatic electrodeposition on nanoporous alumina is presented here. The method allows the production of different metal nanoparticles with activeuncapped surfaces. They present efficient electron transfer processes, exemplified here by the electrochemical response of different species, in particular ferrocyanide. The NPs size and the system features can be controlled through the nanoporous diameter, the electrodeposition current and different metal precursors; obtaining small nanoparticles (from 2 to 10nm diameter) and atomic metal clusters. Optimal conditions can be achieved to obtain materials with the desired functionality. These nanoparticles, confined in a porous matrix, work as a nanoelectrode array. For a complete description of the electrochemical response of these systems, a two-dimensional model was developed to simulate their behavior. This model allows understanding the different responses obtained by cyclic voltammetry depending on the geometric properties of the system and the scan rate. The obtained results can be extended to different micro and nanoarrays, as it is demonstrated in this work. Metallic cluster, consisting of less than 100 atoms, present interesting properties that differ from those of nanoparticles and make them good candidates for catalytic applications. The catalytic capabilities of Ni and Au clusters are analyzed through the reduction reaction of 4-nitrophenol and methylene blue. The obtained values of pseudo first rate constants are higher than those reported for NPs synthesized in homogeneous phase. As model system, gold nanoparticles electrogenerated in the alumina cavities with a controlled size (2 nm) are easily modified with a thiol-containing aptamer for the label-free detection of small molecules by electrochemical impedance spectroscopy. Our results show that the use of a confined electrical conducting surface inside an insulating environment can be very sensitive to the aptamer conformational changes, introducing a new approach to the detection of small molecules exemplified here by the direct and selective detection of adenosine monophosphate at nanomolar concentrations. This work demonstrates the advantages of this novel nanometer scale architecture for signal enhancing.
Cita tipo APA: Peinetti, Ana Sol . (2016-12-21). Uso de matrices nanoporosas como molde para la síntesis de nanopartículas/clusters metálicos. Aplicaciones a sensores y catálisis. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6122_Peinetti.pdf Cita tipo Chicago: Peinetti, Ana Sol. "Uso de matrices nanoporosas como molde para la síntesis de nanopartículas/clusters metálicos. Aplicaciones a sensores y catálisis". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6122_Peinetti.pdf |
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Baylé, Federico. "Detección de villas y asentamientos informales en el Partido de La Matanza mediante teledetección y sistemas de información geográfica" (2016-12-20). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Realizar un relevamiento de campo requiere contar con recursos logísticos para poder hacerlo de manera exhaustiva. La creciente disponibilidad de datos abiertos, imágenes satelitales de alta resolución y software libre para procesarlos abre la puerta a poder hacerlo de manera escalable a partir del análisis de esas fuentes de información. En el presente trabajo se hizo un ejercicio de ese tipo para detectar villas y asentamientos en el Partido de La Matanza considerando el relevamiento realizado por la ONG Techo en 2013. El objetivo es proponer una metodología que reduzca el área del territorio a relevar, teniendo en cuenta la periodicidad y actualización de los conjuntos de datos. Se utilizaron datos censales, viales y naturales georreferenciados, imágenes satelitales y algoritmos de aprendizaje automático. Los resultados muestran que usando la metodología propuesta con todas las fuentes de datos mencionadas se logra reducir el territorio a un 16 % (51km2), mientras que considerando solamente imágenes se reduce a 30 % (96km2).
Cita tipo APA: Baylé, Federico . (2016-12-20). Detección de villas y asentamientos informales en el Partido de La Matanza mediante teledetección y sistemas de información geográfica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6172_Bayle.pdf Cita tipo Chicago: Baylé, Federico. "Detección de villas y asentamientos informales en el Partido de La Matanza mediante teledetección y sistemas de información geográfica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6172_Bayle.pdf |
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Aguilera Sammaritano, Juan Alberto. "Control microbiano de Bemisia tabaci (mosca blanca) madiante el uso de hongos entomopatógenos" (2016-12-20). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los hongos entomopatógenos constituyen un grupo de organismos de gran importancia como bio-controladores de insectos plaga. En este estudio se obtuvieron aislamientos de suelos áridos de la Argentina utilizando Tenebrio molitor como método cebo. Los aislamientos seleccionados se cultivaron a 30 °C y 45-65% de humedad relativa. Los objetivos de este estudio fueron aislar hongos entomopatógenos del orden Hypocreales de suelos áridos y probar su comportamiento biológico a elevadas temperaturas y baja humedad relativa. Dentro de las variables fisiológicas se midió el crecimiento radial a 30 °C para seleccionar los aislamientos termo-tolerantes. Se llevaron a cabo ensayos de porcentaje de germinación en aceites vegetales a distintas concentraciones para evaluar su compatibilidad con formulaciones líquidas. Además, para demostrar su patogenicidad y su potencial como controladores de plagas, se realizaron bio-ensayos contra las ninfas de segundo instar de B. tabaci con las formulaciones de aceites seleccionadas. Se realizó la identificación molecular de los aislamientos seleccionados mediante las amplificaciones de segmentos de ADN específicos. Por último, se realizaron algunas pruebas anexas, como la producción de bio-polímeros relacionados a la tolerancia térmica y análisis de susceptibilidad a los fungicidas de uso común. Los aislamientos del género Metarhizium CEP401 (52,6 mm) y CEP381 (44,98 mm) mostraron los valores más altos de crecimiento a 30 °C. Los aislamientos de Metarhizium sp. CEP381 (Aceite de girasol 10% v/v), CEP401 (aceite de oliva 10% v/v), CEP413 (Aceite de oliva 10% v/v) y CEP 409 (aceite de maíz 10% v/v) tuvieron porcentajes de germinación similares a tratamientos control. Los ensayos de patogenicidad que se realizaron en ninfas de B. tabaci (CEP 381, CEP401, CEP409 y CEP413) arrojaron valores de mortalidad cercanos al 50%. Los valores más altos se encontraron en CEP381 (aceite de girasol) y CEP401 (aceite de oliva), siendo 46,94% y 45,83%, respectivamente. La identificación molecular de los aislamientos se realizó con primers ITS4-5. Todos los aislamientos pertenecen al género Metarhizium. Se han caracterizado aislamientos de hongos entomopatógenos capaces de crecer e infectar a ninfas de B. tabaci bajo condiciones de estrés térmico utilizando algunos aceites vegetales como portadores naturales. Este estudio proporciona nuevas posibilidades para el Manejo Integrado de Plagas tanto a nivel local y regional. Abstract: Entomopathogenic fungi are a group of organisms of great importance as bio-controllers agents of insect pests. In this study entomopathogenic fungi were isolated from arid soils in Argentina using Tenebrio molitor as bait method. Selected isolates were grown at 30 °C and 45-65% relative humidity. The objectives of this study were to isolate entomopathogenic Hypocreales of arid soils and test their biological performance at high temperatures and low relative humidity. Within physiological variables radial growth was measured at 30 °C to select the thermo-tolerant isolates. Tests of germination percentage in vegetable oils at different concentrations were carried out to evaluate their compatibility with liquid formulations. In addition, to demonstrate their pathogenicity and their potential as insect pest controllers, bioassays against second instar nymphs of B. tabaci with the selected oils formulations were made. Molecular identification of isolates were performed by amplification of specific DNA segments. Finally, some evidence as production of biopolymers related to thermal tolerance and susceptibility analysis fungicides commonly used were performed. All Metarhizium isolates CEP401 (52,6 mm) and CEP381 (44,98 mm) showed the highest values of radial growth at 30 °C. Isolates CEP381 (Sunflower oil 10% v/v), CEP401 (olive oil 10% v/v), CEP413 (Olive oil 10% v/v) and CEP409 (maize oil 10% v/v) had similar percentages of germination with control treatments. Pathogenicity tests performed on B. tabaci nymphs (CEP 381, CEP401, CEP409 and CEP413), yielded mortality values of close to 50%. The highest values were found in CEP381 (sunflower oil) and CEP401 (olive oil), 46,94% and 45,83%, respectively. The molecular identification of isolates was performed with primers ITS4-5. All isolates belong to the Metarhizium core group. A group of entomopathogenic fungi have been characterized. These isolates can grow and infect whitefly nymphs under heat stress conditions using some vegetable oils as natural carriers. This study provides new possibilities for Integrated Pest Management both locally and regionally.
Cita tipo APA: Aguilera Sammaritano, Juan Alberto . (2016-12-20). Control microbiano de Bemisia tabaci (mosca blanca) madiante el uso de hongos entomopatógenos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6126_AguileraSammaritano.pdf Cita tipo Chicago: Aguilera Sammaritano, Juan Alberto. "Control microbiano de Bemisia tabaci (mosca blanca) madiante el uso de hongos entomopatógenos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-20. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6126_AguileraSammaritano.pdf |
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Ramírez, Claudia Lilián. "Optimización en el cálculo de perfiles de energía libre. Desarrollo y aplicación a reacciones de interés biológico" (2016-12-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Uno de los objetivos principales de la química es comprender los principios que rigen las reacciones, tanto en términos de sus mecanismos como en la termodinámica que las gobierna. Utilizando dinámica molecular, en combinación con esquemas de muestreo sesgado, es posible simular y obtener perfiles de energía libre asociados a eventos que incluyen desde reacciones químicas en entornos complejos (en solución y/o enzimas) hasta movimientos conformacionales proteicos. Los primeros requieren un tratamiento cuántico, al menos del sitio activo, por lo que los métodos híbridos cuántico-clásicos son los escogidos. Mientras que para los segundos es posible emplear campos de fuerza clásicos, atomísticos o de grano grueso. Sin embargo, el costo computacional de la obtención de dichos perfiles es muy elevado para la gran mayoría de los sistemas biológicos, incluso imposibilitando en algunos casos su obtención. Siendo que en un perfil de energía libre se obtiene toda la termodinámica relevante para el sistema, y por ende todos los parámetros asociados de importancia, subsanar esta imposibilidad es de suma importancia. En esta tesis se realizaron desarrollos teóricos que permiten obtener perfiles de energía libre en menor tiempo computacional, para diversos niveles de teoría, permitiendo así el estudio termodinámico de procesos alostéricos y mecanismos de reacción de sistemas biológicos relevantes. Abstract: One of the main goals of chemistry is to understand the underlying principles of chemical reactions, in terms of both its reaction mechanism and the thermodynamics that govern it. Using hybrid Molecular Dynamics in combination with a biased sampling schemes, it is possible to simulate and obtain the Free Energy Profiles associated with biological events, ranging from chemical reactions occurring inside complex environments (enzyme or aqueous solution) to protein conformational movements. The first requiere a quantum treatment, at least for the active site, this is why Hybrid Quantum/Classical methods are choosen. While for the second, it is possible to only use classical force fields, either atomistic or coarse grain. However, the computational cost associated with the obtention of such Free Energy Profiles is enormous for most biological systems, making it even impracticable in some cases. Since the free energy profile offers all the relevant thermodynamics information for a system, and therefore all associated parameters of relevance, being able to obtain it, is of utmost importance. In this thesis we developed theoretical methodologies that allow to obtain Free Energy Profiles in less computational time, for different levels of theory, thus allowing the thermodynamic study of allosteric processes and reaction mechanisms of relevant biological systems.
Cita tipo APA: Ramírez, Claudia Lilián . (2016-12-16). Optimización en el cálculo de perfiles de energía libre. Desarrollo y aplicación a reacciones de interés biológico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6125_Ramirez.pdf Cita tipo Chicago: Ramírez, Claudia Lilián. "Optimización en el cálculo de perfiles de energía libre. Desarrollo y aplicación a reacciones de interés biológico". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6125_Ramirez.pdf |
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Maffey, Lucía. "Prevención y tratamiento de Rotavirus A mediante nanoanticuerpos VHH anti-VP6" (2016-12-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La diarrea asociada a Rotavirus A (RVA) representa una de las principales causas de mortalidad infantil a nivel mundial. Si bien la vacunación masiva contra RVA ha logrado disminuir significativamente las muertes causadas por este patógeno, la disponibilidad y la eficacia de las vacunas en zonas de bajos recursos es limitada. Por otra parte, el manejo clínico de la infección por RVA se basa en la administración de Sales de Rehidratación Oral (SRO), mientras que las opciones terapéuticas específicas resultan limitadas. El principal objetivo de este trabajo fue estudiar y optimizar la utilización de dos fragmentos correspondientes a la porción variable de anticuerpos de cadena pesada derivados de llama (VHH) dirigidos contra la proteína VP6 – 2KD1 y 3B2– para la prevención y el tratamiento de la diarrea asociada a RVA y comparar su eficacia respecto de otras opciones terapéuticas disponibles. En primer lugar, se analizó la eficacia de ambos clones de VHH anti-VP6 para la prevención y el tratamiento de la diarrea inducida por RVA en un modelo de ratón (BALB/c) lactante inoculado con una cepa virulenta de RVA murino (EcW, G16PI7). En el tratamiento profiláctico, los VHH fueron administrados oralmente dos horas antes de la inoculación viral mientras que en el tratamiento terapéutico, los VHH fueron administrados oralmente luego de la inoculación viral, tanto en forma previa a la aparición de los síntomas (pre-sintomático) como luego de la ocurrencia de diarrea (post-sintomático). En todos los casos, ratones lactantes de cuatro días de vida fueron inoculados con 1778 DD50 (Dosis Diarrea 50) de RVA murino a los 0 Días Post Inoculación (DPI) y examinados diariamente para determinar la ocurrencia de diarrea y recolectar muestras de heces. Los ratones tratados y el control no tratado fueron sacrificados en forma secuencial entre los 0 y los 6 DPI para el tratamiento profiláctico y los 0 a 7 DPI en el caso de los tratamientos terapéuticos pre y post-sintomáticos. Luego de la eutanasia, se colectaron muestras de intestinos y de suero. 1. Ensayos profilácticos. Se evaluó la eficacia de dos dosis de VHH, utilizando cuatro camadas de ratones lactantes para cada tratamiento diario: 160 μg de 2KD1+3B2 (N = 31) y 200 μg de 2KD1+3B2 (N = 30). En ambos casos, el tratamiento comenzó a los -1 DPI y continuó hasta los 6 DPI. En el DPI 0, los VHH fueron administrados dos horas antes de la inoculación viral. Los controles incluidos fueron ratones inoculados no tratados (control no tratado) y ratones no inoculados (control normal). 2. Ensayo terapéutico pre-sintomático. Se evaluaron cuatro tratamientos orales: 160 μg de 2KD1+3B2 (80 μg de cada uno) (N = 25), 200 μg de 2KD1+3B2 (100 μg de cada uno) (N = 28), 200 μg de 3B2 (N = 24), 200 μg de 2KD1 (N = 30). Para ambos ensayos, se determinó también la presencia de anticuerpos anti-RVA en muestras de sueros e intestino a los 0, 7 y 40 DPI. Asimismo, se evaluó el surgimiento de una respuesta inmune humoral contra el tratamiento de VHH por medición de anticuerpos anti-VHH intestinales y séricos a esos tiempos y el posible surgimiento de mutantes virales de escape al tratamiento mediante PCR, secuenciación completa y análisis filogenéticos del gen codificante de VP6 en muestras de intestinos y heces positivas para RVA luego de 4-6 días de tratamiento. Los resultados obtenidos mostraron que ambas dosis profilácticas de 2KD1+3B2 redujeron significativamente la duración y la severidad de la diarrea al igual que el título infeccioso en intestino y la excreción viral en heces. En relación al tratamiento terapéutico pre-sintomático, la administración conjunta de 2KD1 y 3B2 (200 μg) redujo significativamente la duración y severidad de la diarrea, la infección intestinal y la excreción fecal en relación al grupo no tratado. Mientras que la misma dosis de 2KD1 o 3B2 (200 μg) también redujo la duración de la diarrea por RVA con respecto al control, 2KD1 resultó más efectivo en la disminución de la infección intestinal y la excreción de RVA en heces. Si bien ambos clones presentaron amplia actividad neutralizante contra diferentes cepas de RVA in vitro, el clon 2KD1 requirió menores concentraciones que 3B2 para neutralizar algunas variedades, en particular la cepa de RVA murino usada en los ensayos previos. Asimismo, 2KD1 presentó valores de afinidad por las partículas de RVA tres veces mayor que 3B2 (EC50). Ni el tratamiento profiláctico ni el tratamiento terapéutico pre-sintomático con VHH anti-VP6 interfirieron con la respuesta inmune humoral del hospedador frente a RVA. Tampoco se detectaron mutantes virales de escape al tratamiento a nivel de la proteína VP6 en ningún caso. Tratamiento terapéutico post-sintomático. En este caso, los ratones fueron inoculados con 1778 DD50 de RVA murino al cuarto día de vida como ya fuera descripto y recibieron un tratamiento diario de 200 μg de 2KD1 a partir de los 2 DPI, cuando todos los ratones presentaban diarrea, hasta los 7 DPI. El tratamiento terapéutico post-sintomático con 200 μg de 2KD1 redujo la infección intestinal por RVA y la excreción viral en heces en relación al control no tratado. Aunque hubo una tendencia a reducir la duración de los síntomas, las diferencias no fueron significativas. Con el objetivo de evaluar la prevención de la diarrea por RVA en un modelo de administración continua de los VHH, se realizó un nuevo ensayo involucrando ratonas transgénicas que expresaban los VHH anti-VP6 (2KD1+3B2) en leche materna, regulados bajo el promotor del Virus de Tumor Mamario Murino. En este caso, los ratones fueron inoculados a los cuatro días de vida con una dosis menor de RVA murino (800 DD50) y se utilizaron cuatro camadas de ratones transgénicos amamantados por madres transgénicas y cuatro camadas de ratones wild type amamantados por madres wild type como control. Para descartar que la transgénesis de los ejemplares pudiera tener un efecto sobre el desarrollo de la enfermedad por RVA, se efectuó un ensayo de cross-fostering en el cual las progenies de cuatro madres transgénicas fueron amamantadas por madres wild type y viceversa. Los ratones transgénicos alimentados por madres transgénicas presentaron una menor prevalencia de diarrea a los 3, 4 y 7 DPI en relación al control. A los 8 DPI, estos ratones habían resuelto por completo el cuadro clínico. Asimismo, redujeron la infección intestinal por RVA y la excreción viral en heces en comparación con el control. Con respecto a los ensayos de cross-fostering, los resultados obtenidos fueron contradictorios. Si bien los ratones wild type amamantados por madres transgénicas redujeron la prevalencia y duración de la diarrea en relación a los ratones amamantados por madres wild type como se esperaba, presentaron mayores títulos infecciosos en el intestino y una mayor excreción viral fecal. Con el propósito de comparar la eficacia de la administración oral de VHH anti-VP6 con otras opciones terapéuticas disponibles para tratar la diarrea por RVA, se realizó un último experimento en el modelo de ratón lactante infectado con 1778 DD50 de RVA murino para comparar la eficacia de los nanoanticuerpos con dos drogas sintéticas (nitazoxanida, crema de bismuto) y dos hierbas aromáticas usadas tradicionalmente para el tratamiento de la diarrea (Aloysa citrodora, Piper aduncum): 2KD1+3B2 (50 mg/kg) + SRO, 2KD1(50 mg/kg) + SRO, nitazoxanida (15 mg/kg), crema de Bismuto (750 mg/kg), A. citrodora (infusión, 2 g/kg); P. aduncum (infusión, 2 g/kg). En este caso, los VHH fueron disueltos en SRO dado que la adición de este excipiente aumentaba significativamente la resistencia proteolítica frente a enzimas gástricas. A excepción de los ratones tratados con nitazoxanida, los restantes tratamientos redujeron significativamente la duración y la severidad de la diarrea por RVA en relación al control no tratado. En relación a los títulos infecciosos a nivel intestinal, los ratones tratados con VHH anti-VP6, crema de Bismuto y nitazoxanida disminuyeron la severidad de la infección mientras que aquellos tratados con A. citrodora y P. aduncum no mostraron mejoras. La excreción viral en heces sólo se redujo en los ratones tratados con VHH y nitazoxanida pero no se apreciaron diferencias significativas en el resto de los tratamientos. El presente trabajo de tesis muestra que la administración oral de VHH anti-VP6 constituye, no sólo un tratamiento profiláctico efectivo frente a la diarrea asociada a RVA, sino también una herramienta terapéutica eficaz y segura contra la infección por este virus, incluso luego de la aparición de los primeros síntomas. En este sentido, la terapia oral con VHH anti-VP6 representaría un mejoramiento considerable en relación a otras opciones terapéuticas disponibles actualmente. Asimismo, los VHH anti-VP6 podrían ser empleados como una estrategia complementaria a la vacunación, especialmente en poblaciones que han mostrado menor eficacia de inmunización. En términos generales, el uso de anticuerpos VHH dirigidos contra VP6 presenta un enorme potencial para su implementación en pacientes inmunocomprometidos y en países de bajos recursos, donde la mortalidad por RVA continúa siendo elevada y las actuales vacunas muestran menor eficacia. Abstract: Species A Rotaviruses (RVA) remain a worldwide leading cause of child mortality. Although extensive vaccination has achieved a significant reduction in RVA-associated deaths, vaccine efficacy in some impoverished areas remains low. On the other hand, mainstay clinical management of RVA-associated diarrhea consists of Oral Rehydration Solution (ORS) administration whereas specific therapeutic options are limited. The main goal of this study was to assess and optimize the use of two VP6-specific llama-derived heavy chain antibody fragments (VHH) -2KD1 and 3B2- in the prevention and treatment of RVA-associated diarrhea and to compare the obtained results with other available therapeutic options against the disease. We first assessed the efficacy of two VP6-specific llama-derived heavy chain antibody fragments (VHH) -2KD1 and 3B2- as an oral prophylactic and therapeutic treatment against RVAinduced diarrhea in a neonatal BALB/c mouse model inoculated with virulent murine RVA (ECw strain, G16PI7). Prophylactic treatment was administered two hours prior to inoculation whereas therapeutic treatment was delivered after viral inoculation, both prior to the symptoms (presymptomatic) and once diarrhea had already occurred (post-symptomatic). In all cases, four-day old pups were inoculated with 1778 DD50 murine RVA at PID 0 (Post Inoculation Day 0) and examined daily to assess occurrence of diarrhea and collect feces. Control and treated mice were euthanized sequentially from PID 0 to 6 for prophylactic groups and from PID 0 to 7 for pre-symptomatic and post-symptomatic therapeutic groups. After sacrifice, sera and intestinal samples were collected. Prophylactic assays: the efficacy of two doses of VHH was assessed, using four litters of suckling mice for each daily treatment: 160 μg of 2KD1+3B2 (N = 31) and 200 μg of 2KD1+3B2 (N = 30). In both cases the treatment started on PID -1 and was administered until PID 6. On PID 0, the VHH were administered 2 hours prior to viral challenge. Controls included: untreated ECw RVAinoculated mice (untreated control group); untreated and not RVA-inoculated mice (normal control group). Pre-symptomatic therapeutic assays: In order to study the therapeutic effect of 2KD1 and 3B2 against RVA-induced diarrhea, treatment administration started at PID 1 and four VHH daily treatments were tested from PID 1 to 7: 160 μg of 2KD1+3B2 (80 μg of each) (N = 25), 200 μg of 2KD1+3B2 (100 μg of each) (N = 28), 200 μg of 3B2 (N = 24), 200 μg of 2KD1 (N = 30). Included controls were the same as before. For both assays, anti-RVA murine antibodies (Abs) were determined in sera and intestinal samples at PID 0, 7 and 40. Occurrence of an immune response against the VHH was examined by measuring anti-VHH Abs titers at PID 0, 7 and 40 in sera and intestinal samples of treated mice and possible uprising of viral escape mutants to the treatment was assessed by PCR, complete sequencing and phylogenetic analyses of VP6. Prophylactic administration of both doses of 2KD1+3B2 successfully reduced diarrhea duration and severity as well as intestinal RVA titers and fecal shedding of viral particles. Joint presymptomatic therapeutic administration of 2KD1+3B2 (200 μg/dose) successfully reduced diarrhea duration, RVA infection severity and virus shedding in feces. While the same dose of 2KD1 or 3B2 (200 μg) significantly reduced duration of RVA-induced diarrhea, 2KD1 was more effective in diminishing the severity of intestinal infection and RVA shedding in feces. Although both clones showed extensive neutralizing properties against a wide range of RVA strains, 2KD1 required lower concentrations than 3B2 to neutralize some of them, particularly the murine RVA strain used in mice assays. Also, 2KD1 evidenced a three-fold higher affinity for RVA particles (EC50) than 3B2. Neither prophylactic nor pre-symptomatic therapeutic administration of the VHH interfered with the host’s humoral immune response against RVA. No viral escape mutants to the VHH treatment were detected. Post-symptomatic therapeutic assays: Mouse pups were also inoculated at PID 0 with 1778 DD50 of murine ECw RVA as described and received a daily dose of 200 μg of 2KD1 from PID 2, at which time all mice in the group had already developed diarrhea, to PID 7. When 2KD1 (200 μg) was administered after diarrhea development, it also significantly reduced RVA intestinal infection and fecal shedding. Although treated mice showed a trend towards reducing diarrhea duration, differences with the control group were not significant. In order to assess the prevention of RVA-induced diarrhea in a model of continuous administration of the VHH, a new assay was conducted, involving transgenic mice that expressed anti-VP6 VHH 2KD1+3B2 in maternal milk regulated under the MMTV (Mouse Mammary Tumor Virus) promoter. In this case, four-day old mice were inoculated with a lower dose of murine RVA (800 DD50) given that VHH levels in maternal milk were lower than in oral treatment experiments. Four litters of transgenic mice fed by transgenic dams were used and four litters of wild type mice fed by wild type dams were employed as control. In order to discard that the transgenesis per se could have an effect on the development of RVA disease, a cross- fostering assay was conducted. In this case transgenic pups were fed by wild type dams and vice versa. Neonatal transgenic mice fed by transgenic mothers showed lower severe diarrhea prevalence than the wild type control at PID 3, 4 and 7 and by PID 8 all mice in this group had resolved the symptoms completely. Pups nursed by transgenic dams also reduced intestinal infection with RVA and viral shedding in feces when compared with the control. Regarding cross-fostering experiments, the obtained results were inconsistent. Although mice nursed by transgenic dams successfully reduced diarrhea prevalence when compared with mice nursed by wild type dams, as expected, they showed higher intestinal infection and higher fecal shedding. To establish if oral administration of anti-VP6 VHH represents an improvement regarding current clinical management of RVA-associated diarrhea, a last experiment in the neonatal mouse model was conducted to compare the efficacy of the VHH against two synthetic drugs (nitazoxanide, Bismuth salicylate) and two aromatic herbal compounds used in folk medicine for the treatment of diarrhea (Aloysa citrodora, Piper aduncum): 2KD1+3B2 (50 mg/kg) + ORS; 2KD1(50 mg/kg) + ORS, nitazoxanide (15 mg/kg), Bismuth salicylate (750 mg/kg), A. citrodora (infusion, 2 g/kg); P. aduncum (infusion, 2 g/kg). In this case, anti-VP6 VHH were administered with ORS given that the addition increases proteolytic resistance to gastric enzymes. Four-day old mice were inoculated with 1778 DD50 of murine RVA and assessed daily as described before. The obtained results showed that, with the exception of mice treated with nitazoxanide, all other treatments achieved a significant reduction in diarrhea duration and severity when compared with the untreated control. Regarding intestinal RVA titers, mice administered with anti-VP6 VHH, Bismuth salicylate and nitazoxanide diminished the severity of the infection whereas mice treated with aromatic herbs showed no improvement. Similarly, fecal RVA shedding was only significantly reduced in mice receiving VHH and nitazoxanide but not those treated with other compounds. Our findings show that oral administration of anti-VP6 VHH constitute, not only an effective prophylactic treatment against RVA-associated diarrhea, but also a safe and effective therapeutic tool against RVA infection, even once diarrhea is present. These results suggest that oral administration of anti-VP6 VHH represents a significant improvement in the therapeutic treatment of RVA-associated diarrhea when compared with current available options. Anti-VP6 VHH could be used as a complement to ongoing vaccination, especially in populations that have shown lower immunization efficacy. Overall, oral therapy using anti-VP6 VHH has enormous potential to be implemented in developing countries, where RVA mortality is still high and current vaccines seem less efficacious, and also to be administered to prematurely born or immunosuppressed children worldwide.
Cita tipo APA: Maffey, Lucía . (2016-12-16). Prevención y tratamiento de Rotavirus A mediante nanoanticuerpos VHH anti-VP6. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6110_Maffey.pdf Cita tipo Chicago: Maffey, Lucía. "Prevención y tratamiento de Rotavirus A mediante nanoanticuerpos VHH anti-VP6". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6110_Maffey.pdf |
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Piantanida, Ana Paula. "Rol de la conexina 43 en las propiedades fisiológicas de la glía envolvente y en la plasticidad de la vía aferente olfatoria" (2016-12-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El epitelio olfatorio produce neuronas sensoriales durante toda la vida, que extienden axones a lo largo del nervio olfatorio y establecen sinapsis integrándose al circuito del bulbo olfatorio. Este nervio es plástico y regenera luego de daño. Los axones sensoriales están asociados a la glía envolvente olfatoria, a la cual se atribuye la permisividad para el reemplazo de neuronas sensoriales, ya que produce factores neurotróficos y promueve el crecimiento axonal, tanto in vitro como en modelos de daño. Sin embargo, prácticamente se desconocen los mecanismos subyacentes a este sostén del crecimiento axonal y a su potencial participación en el mantenimiento del circuito olfatorio. La glía envolvente forma redes mediadas por uniones comunicantes (gap junctions), formadas por conexinas, que en otros tipos de glía acompañan remodelaciones asociadas a daño y son esenciales para sostener funciones gliales. La glía envolvente expresa principalmente conexina 43 (Cx43), que podría ser esencial para el mantenimiento del nervio, promoviendo la liberación concertada de neurotrofinas o participando como molécula de adhesión. Evaluamos si la degeneración/regeneración posteriores al daño del nervio olfatorio se asocian con plasticidad en las redes gliales asociadas. Durante la recuperación del sistema luego de un daño, observamos inmunorreactividad reducida para Cx43 en la glía envolvente y aumento de dicha inmunomarca en el bulbo olfatorio, sugiriendo el remodelado diferencial de redes gliales durante la regeneración del nervio. Evaluamos también si la Cx43 media la conectividad de la glía envolvente y sostiene la integración de neuronas sensoriales nuevas, utilizando ratones genéticamente modificados para reducir la expresión de Cx43 en la glía envolvente. La reducción de la expresión fue eficiente y selectiva. En estos animales, la glía envolvente mostró menor conductancia de membrana y menor sensibilidad a un bloqueante de gap junctions, sugiriendo un acople reducido de la red. Además, estos ratones mostraron reducción en el número de interneuronas positivas para la hidroxilasa de tirosina en el bulbo, parámetro informativo de una entrada sensorial deficiente. En un ensayo olfativo de habituación-deshabituación, estos ratones mostraron reducción en los tiempos de exploración a estímulos olfativos y reducción del número de células positivas para cfos reclutadas en el bulbo ante estímulos. Estos resultados indican que la Cx43 es necesaria para una función normal del circuito olfatorio. Esta tesis contribuye al conocimiento sobre propiedades fisiológicas de la glía envolvente y aporta un modelo para identificar mecanismos subyacentes a sus propiedades neurotróficas in vivo, de potencial aplicación en terapias neuroregenerativas. Abstract: The olfactory epithelium produces sensory neurons during lifespan, which extend axons throughout the olfactory nerve and establish synapses integrating to the olfactory bulb circuit. This nerve is plastic and regenerates after damage. The sensory axons are associated to olfactory ensheathing glia, believed to underlie the permissiveness for the replacement of olfactory sensory neurons. This is based on the fact that they produce neurotrophic factors and promote axonal growth, in vitro and in models of injury. However, the mechanisms underlying the support of axonal growth and the potential participation of ensheathing glia in the maintenance of the olfactory circuit are poorly understood. The ensheathing glia establish networks mediated by gap junctions, formed by connexins. Gap junctions are essential to support glial functions in other glia types and are remodeled in damage conditions. The ensheathing glia expresses mainly connexin 43 (Cx43), which could participate in nerve maintenance, promoting a coordinated neurotrophin release or through adhesion properties. We evaluated whether the degeneration/regeneration after damage of the olfactory nerve is associated with plasticity of the associated glial networks. During recovery of the system after damage, we observed a reduced immunoreactivity for Cx43 in the ensheathing glia and an increase in Cx43 immunostaining in the olfactory bulb. This suggests a differential remodeling of the glial networks during nerve regeneration. We also evaluated whether Cx43 mediates the connectivity of ensheathing glia and supports the integration of new sensory neurons. For this, we used genetically modified mice to reduce Cx43 expression in ensheathing glia. This reduction was efficient and selective. In these animals, the ensheathing glia showed lower membrane conductance and lower sensitivity to a gap junction blocker. This suggests a reduced coupling within the network. Moreover, these mice exhibited a reduction in the number of tyrosine hydroxylase-positive neurons of the bulb, an informative parameter of sensory input deficiency. In an olfactory habituation-dishabituation test, these mice displayed a reduction in exploration time of olfactory stimuli and a reduction in the number of c-fos-positive cells recruited in the bulb by stimuli. These results indicate that Cx43 is necessary for normal recruitment of olfactory circuits. This thesis contributes to the knowledge about physiological properties of ensheathing glia and provides a model to identify mechanisms underlying their neurotrophic properties in vivo, for potential application in neuroregenerative therapies.
Cita tipo APA: Piantanida, Ana Paula . (2016-12-15). Rol de la conexina 43 en las propiedades fisiológicas de la glía envolvente y en la plasticidad de la vía aferente olfatoria. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6115_Piantanida.pdf Cita tipo Chicago: Piantanida, Ana Paula. "Rol de la conexina 43 en las propiedades fisiológicas de la glía envolvente y en la plasticidad de la vía aferente olfatoria". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6115_Piantanida.pdf |
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Mazzucco, María Belén. "El incremento de la ingesta materna de grasas saturadas programa alteraciones hepáticas en la descendencia de rata: rol de la desregulación en el accionar de leptina" (2016-12-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se estableció un modelo de sobrepeso mediante la alimentación de ratas Wistar con una dieta con exceso de grasas saturadas previamente y durante la gestación y la lactancia (grupo DGS). El grupo DGS presentó un aumento de los niveles plasmáticos de triglicéridos, insulina y leptina en madres y fetos, y un incremento en el peso placentario y fetal, respecto del grupo control. Se estudió el hígado de fetos y crías de 21 y 140 días de edad. En los hígados de fetos y crías provenientes del grupo DGS se observó un aumento de parámetros indicadores de ambiente prooxidante. Además, el grupo DGS presentó una disminución de los niveles de ARN mensajero de genes asociados a la detoxificación hepática y un aumento en la actividad de enzimas hepáticas en circulación. Los hígados del grupo DGS presentaron sobreacumulación de triglicéridos, una disminución de los niveles de ARN mensajero de genes involucrados en el catabolismo de lípidos y una alterada expresión del receptor de leptina. La administración de leptina a fetos control a término moduló los niveles placentarios de ARN mensajero del receptor de leptina y de la lipoproteína lipasa (LPL), clave en la transferencia de lípidos placentarios. Asimismo, la leptina administrada moduló los niveles de ARN mensajero del receptor de leptina y de LPL en el hígado fetal. Sin embargo, los hígados de fetos del grupo DGS no mostraron alteraciones en los niveles de ARN mensajero del receptor de leptina y de LPL a pesar de estar expuestos a hiperleptinemia fetal. Más aún, los resultados del cultivo de hígados fetales con leptina evidenciaron una falta de respuesta a las acciones lipolíticas de la leptina en el grupo DGS. Estos resultados sugieren que las alteraciones en el metabolismo lipídico hepático fetal observadas en el grupo DGS estarían asociadas a una desregulación del accionar de leptina. La persistencia de alteraciones hepáticas en las crías sugiere una programación de anomalías de manera intrauterina, desafiando la salud metabólica de la descendencia. Abstract: An overweight model was established by feeding Wistar rats with an overload of saturated fat previously and during pregnancy and lactation (DGS group). The DGS group showed increased maternal and fetal triglyceridemia, insulinemia and leptinemia, and increased placental and fetal weight when compared to the control group. The liver from fetuses and offspring of 21 and 140 days old was studied. The liver from fetuses and offspring from the DGS group showed an increase in the indicators of a pro-oxidant environment and a decrease in the levels of mRNA of genes associated with detoxifying functions. In addition, the DGS group showed an increase in the activity of hepatic enzymes in plasma. Besides, the livers from the DGS group showed triglyceride overaccumulation, decreased levels of mRNA of genes involved in lipid catabolism and altered expression of leptin receptor. The administration of leptin to control fetuses modulated placental mRNA levels of leptin receptor and of a key gene in placental lipid transfer, the lipoprotein lipase (LPL). Also, we found that the administration of leptin modulated the mRNA levels of LPL and leptin receptor in the fetal liver. Despite the fetuses from the DGS group are inmerse in a hyperleptinemic environment, the levels of the mRNA of LPL and leptin receptor in fetal liver showed no changes when compared to control. In addition, the culture of fetal livers with leptin showed no response to the lipolytic actions of leptin in the DGS group. These results suggest that the alterations in the lipid metabolism of fetal liver observed in the DGS group could be associated with the dysregulation of leptin action. The persistence of hepatic alterations in the offspring suggests that these anomalies are programmed during the intrauterine life, challenging the metabolic health of the offspring.
Cita tipo APA: Mazzucco, María Belén . (2016-12-15). El incremento de la ingesta materna de grasas saturadas programa alteraciones hepáticas en la descendencia de rata: rol de la desregulación en el accionar de leptina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6117_Mazzucco.pdf Cita tipo Chicago: Mazzucco, María Belén. "El incremento de la ingesta materna de grasas saturadas programa alteraciones hepáticas en la descendencia de rata: rol de la desregulación en el accionar de leptina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6117_Mazzucco.pdf |
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Esteva, María Jimena. "Caracterización funcional de virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) quiméricos expresando diferentes dominios de la proteína cápside del virus de la inmunodeficiencia de felinos (FIV)" (2016-12-12). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La formación de partículas lentivirales resulta de la multimerización de la poliproteína Gag, la cual contiene toda la información necesaria para autoensamblarse y brotar al medio extracelular a través de la membrana plasmática. Durante la maduración de los viriones, la proteína cápside (CA), que corresponde al dominio central de Gag, se condensa generando el core viral que preserva la integridad del complejo ribonucleoproteico requerido para iniciar un nuevo ciclo de replicación viral. Los virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) y de felinos (FIV) son dos lentivirus evolutivamente distantes cuyas proteínas CA no han sido aún estudiadas. Con el objeto de establecer la relación funcional entre los dominios CA de SIV y de FIV, construimos SIV quiméricos en los cuales la región codificante para la CA fue parcial o totalmente reemplazada por su equivalente de la CA de FIV. La caracterización fenotípica de las quimeras nos permitió agruparlas en tres categorías: un grupo formado por virus quiméricos capaces de ensamblarse en viriones, pero cuya maduración causa la inestabilidad de la CA de FIV; un segundo grupo representado únicamente por el SIV quimérico llevando el dominio N-terminal (NTD) de la CA de FIV y que exhibe un fenotipo de ensamblado defectivo; y un tercer grupo formado por los virus quiméricos que se ensamblan en viriones exhibiendo una CA de FIV madura estable, que incorporan la glicoproteína de envoltura, y que contienen niveles salvajes del ARN genómico viral y de la transcriptasa reversa. Sin embargo, este último grupo de SIV quiméricos resultó ser no infeccioso debido a defectos en alguna etapa posterior a la entrada viral. Por otra parte, demostramos que el dominio C-terminal (CTD) de la CA de FIV presenta la capacidad intrínseca de dimerizar in vitro y de formar oligómeros de alto peso molecular. Esto, junto con nuestros resultados que muestran que el CTD de la CA de FIV es suficiente para el ensamblado de la poliproteína quimérica Gag de SIV, provee evidencia de que el CTD de la CA exhibe mayor plasticidad funcional que el NTD. En su conjunto, nuestros resultados aportan información relevante sobre la homología funcional entre los dominios CA de las poliproteínas Gag de los lentivirus de primates y de no primates y contribuyen a nuestro conocimiento sobre cómo han evolucionado los requerimientos para el ensamblado de viriones infecciosos en los retrovirus. Abstract: The formation of lentiviral particles results from the multimerization of the Gag polyprotein, which contains all the information necessary for its self-assembly and budding into the extracellular medium. During virion maturation, the capsid (CA) protein, which corresponds to the central domain of Gag, generates the core structure that preserves the integrity of the ribonucleoprotein complex required to initiate a new round of viral replication. The simian and feline immunodeficiency viruses (SIV and FIV, respectively) are two evolutionarily distant lentiviruses whose CA proteins have not as yet been studied. To gain insight into the functional relationship between the SIV and FIV CA domains, we constructed chimeric SIVs in which the CA-coding region was partially or totally replaced by the equivalent region of the FIV CA. The phenotypic characterization of the chimeras allowed us to group them into three categories: the chimeric viruses that, while being assembly-competent, exhibit a virionassociated unstable FIV CA; a second group represented only by the chimeric SIV carrying the N-terminal domain (NTD) of the FIV CA which proved to be assemblydefective; and a third group constituted by the chimeric viruses that produce virions exhibiting a mature and stable FIV CA protein, and which incorporate the envelope glycoprotein and contain wild-type levels of viral genome RNA and reverse transcriptase. However, further analysis of the latter group of chimeric SIVs demonstrated that they are non-infectious due to a post-entry impairment. Furthermore, we show that the carboxyl-terminus domain (CTD) of the FIV CA has an intrinsic ability to dimerize in vitro and form high-molecular-weight oligomers, which, together with our finding that the FIV CA-CTD is sufficient to confer assembly competence to the resulting chimeric SIV Gag polyprotein, indicates that the CA-CTD exhibits more functional plasticity than the CA-NTD. Taken together, our results provide relevant information on the functional homology between the CA domains of primate and nonprimate lentiviral Gag polyproteins and contribute to our understanding of how the requirements for the assembly of infectious virions have evolved among retroviruses.
Cita tipo APA: Esteva, María Jimena . (2016-12-12). Caracterización funcional de virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) quiméricos expresando diferentes dominios de la proteína cápside del virus de la inmunodeficiencia de felinos (FIV). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6130_Esteva.pdf Cita tipo Chicago: Esteva, María Jimena. "Caracterización funcional de virus de la inmunodeficiencia de simios (SIV) quiméricos expresando diferentes dominios de la proteína cápside del virus de la inmunodeficiencia de felinos (FIV)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-12. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6130_Esteva.pdf |
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Pérez, Mariana Valeria. "Análisis probabilístico de algoritmos y problemas combinatorios sobre cuerpos finitos" (2016-12-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis analizamos la complejidad en promedio de dos algoritmos probabilísticos. Uno de ellos calcula puntos Fq-racionales de hipersuperficies definidas sobre el cuerpo finito Fq de q elementos en base a una estrategia de "búsqueda en bandas verticales". El otro es el algoritmo clásico de factorización de polinomios univariados con coeficientes en Fq. En este caso nos interesa su comportamiento cuando se aplica a familias de polinomios cuyos coeficientes satisfacen ciertas relaciones lineales. A fin de realizar dichos análisis, proporcionamos estimaciones explícitas del promedio del cardinal del conjunto de valores y la distribución de patrones de factorización en familias lineales de polinomios sobre cuerpos finitos. Los resultados expuestos, que mejoran los existentes en la literatura sobre el tema, se basan en un nuevo enfoque, que reduce estas cuestiones combinatorias a la estimación del número de puntos Fq-racionales de ciertas intersecciones completas singulares. Por tal motivo, parte de esta tesis se centra en el estudio de ciertas propiedades geométricas de dichas variedades. Abstract: In this thesis we analyze the average-case complexity of two probabilistic algorithms. The first one computes Fq-rational points of an hysuperface defined over the finite field Fq of q elements based on a search strategy in "vertical strips". The second one is the classical factorization algorithm for univariate polynomials with coeficients in Fq. In this case we are interested in the behavior of the algorithm applied to families of polynomials whose coeficients satisfy certain linear relations. For this purpose, we obtain explicit estimates on the average cardinality of the value set and on the distribution of factorization patterns on linear families of polynomials over a finite field. The above results, which improve the existing results in the literature, were obtained with a new approach that reduces these combinatorial issues to estimating the number of Fq-rational points of certain singular complete intersections. For this reason, part of this thesis focuses on the study of certain geometric properties of these varieties.
Cita tipo APA: Pérez, Mariana Valeria . (2016-12-06). Análisis probabilístico de algoritmos y problemas combinatorios sobre cuerpos finitos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6121_Perez.pdf Cita tipo Chicago: Pérez, Mariana Valeria. "Análisis probabilístico de algoritmos y problemas combinatorios sobre cuerpos finitos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6121_Perez.pdf |
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Saleh Medina, Leila María. "Compositos elastoméricos multiferroicos: aplicaciones en electrónica flexible" (2016-12-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los materiales multiferroicos poseen simultáneamente al menos dos órdenes ferroicos (por ejemplo, ferromagnético y ferroeléctrico), observándose acoplamiento cruzado entre propiedades. Dicha característica está presente en sistemas monofásicos o multifásicos de varios componentes. Las ferritas de bismuto son cerámicos multiferroicos a temperatura ambiente, si bien es difícil obtenerlas con alta pureza y el acoplamiento magneto-eléctrico suele ser bajo. El primer objetivo de la presente tesis ha sido sintetizar y caracterizar ferritas de bismuto de estequiometría definida (BiFeO3), excelente pureza, y sustituidas parcialmente con itrio como estrategia para modificar los órdenes magnéticos y eléctricos. Se observaron variaciones de las propiedades magnetoeléctricas que se correlacionan con cambios de tamaño de partícula e inducción de nuevas fases. El segundo objetivo fue desarrollar y caracterizar películas flexibles con propiedades dieléctricas que permitan su uso como capacitores multiferroicos para electrónica flexible. Se prepararon compositos flexibles, dados por dispersiones de BiFeO3 en diferentes elastómeros: caucho sintético (SBR, no ferroeléctrico) y difluoruro de polivinilideno (PVDF, ferroeléctrico). Se prepararon películas micrométricas flexibles que presentan altas constantes dieléctricas, ferroelectricidad y acoplamiento magneto-eléctrico. La respuesta dieléctrica se caracterizó en función del contenido de BiFeO3. En SBR estas propiedades se incrementan al preparar los compositos en presencia de campos magnéticos o eléctricos. También se sintetizaron ferritas de cobalto (ferromagnéticas), observándose acoplamiento magneto-eléctrico al ser dispersadas en PVDF. Se demostró que los compositos basados en SBR y PVDF pueden ser empleados como filtros de alta frecuencia en circuitos eléctricos, cuyo comportamiento puede regularse variando el contenido de cerámico. Abstract: Multiferroic materials have simultaneously at least two ferroic orders (e.g. ferromagnetic and ferroelectric), that allows cross coupling of properties. This characteristic is present in single-phase or multiphase (made of several components) systems. Bismuth ferrites are multiferroic ceramics at room temperature, although it is difficult to obtain them with high purity and they generally present low magnetoelectric coupling. The main objective of this thesis has been synthesising and characterising bismuth ferrite of defined stoichiometry (BiFeO3), excellent purity and partially substituted with yttrium in order to modify the magnetic and electric structural orders. Changes in magnetoelectric properties, that can be attributed to particle size and new phase induction, have been found. The second objective was to develop and characterise flexible films with dielectric properties that allow their use as multiferroic capacitors for flexible electronics. Flexible composites were prepared by adding BiFeO3 dispersions into different elastomers: synthetic rubber (SBR, non-ferroelectric) and polyvinylidene difluoride (PVDF, ferroelectric). Flexible micrometric films were obtained with large values of dielectric constant, ferroelectricity and magnetoelectric coupling. Dielectric response was characterised as a function of BiFeO3 content. These properties were enhanced in SBR films prepared under the application of electric or magnetic fields. Cobalt ferrites (ferromagnetic) were also synthesised. Magnetoelectric coupling was observed when they were dispersed in PVDF. It has been demonstrated that SBR and PVDF composites can be used as high frequency filters, whose behaviour can be adjusted by modifying the ceramic content.
Cita tipo APA: Saleh Medina, Leila María . (2016-12-02). Compositos elastoméricos multiferroicos: aplicaciones en electrónica flexible. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6124_SalehMedina.pdf Cita tipo Chicago: Saleh Medina, Leila María. "Compositos elastoméricos multiferroicos: aplicaciones en electrónica flexible". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6124_SalehMedina.pdf |
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Ramallo, Martín Roberto. "Aromatasa cerebral (Cyp19a1b): caracterización y relación con el comportamiento agonístico y el período de cuidado parental en el pez cíclido Cichlasoma dimerus" (2016-12-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En todos los vertebrados, la enzima citocromo P450 aromatasa, es la responsable de la síntesis de estrógenos a partir de andrógenos. En ciertas áreas específicas del cerebro de los peces teleósteos la producción de estrógenos cerebrales es entre 100 y 1000 veces mayor comparada con las regiones homólogas del cerebro de otros grupos de vertebrados. La base de tales niveles radica en parte a la expresión de una variante de la enzima aromatasa, conocida como aromatasa cerebral, producto de uno de los dos genes parálogos que codifican para aromatasas (cerebral y gonadal) en teleósteos. Ya que la distribución neuroanatómica de las células productoras de aromatasa cerebral coincide parcialmente con áreas del cerebro involucradas en la regulación de comportamientos sociales, decidimos analizar el papel de la misma en la regulación del comportamiento agonístico y del cuidado maternal, en la chanchita Cichlasoma dimerus. Por medio de un protocolo de inmunohitoquímica se detectó la presencia de esta enzima en el cerebro anterior de la chanchita, en áreas involucradas en la regulación de comportamientos sociales. Luego, se caracterizaron la fisiología y el comportamiento de machos de chanchita de distinto estatus social (dominante vs. subordinado), y su relación con la expresión de aromatasa cerebral en el cerebro y la hipófisis. Los machos dominantes presentaron niveles mayores de andrógenos circulantes, mientras que los machos subordinados se caracterizaron por poseer niveles más altos de 17β-estradiol, y una tasa espermatogénica relativamente menor. Si bien no se observó un efecto del estatus social sobre la expresión de la enzima, los niveles de expresión de la misma en hipófisis correlacionaron con la frecuencia de comportamientos agonísticos, sugiriendo un papel novedoso de la hipófisis en la regulación del comportamiento social a través de la síntesis de estrógenos. En las hembras se analizaron los perfiles de expresión de ambas variantes de la enzima aromatasa (cerebral y gonadal) a lo largo del período de cuidado parental, y su relación con parámetros fisiológicos y reproductivos. El inicio del cuidado maternal resultó en una caída específica de la síntesis de esteroides sexuales y de la tasa de maduración ovárica, mientras que los niveles de expresión de ambas aromatasas resultaron independientes de la presencia de la progenie. Por lo tanto, el estatus social en los machos y el cuidado parental en las hembras, repercuten fuertemente sobre los niveles de esteroides sexuales y el estado de las gónadas, o viceversa, sin que resulte afectada la expresión de aromatasa en cerebro anterior e hipófisis. Abstract: In all vertebrates, the enzyme aromatase cytochrome P450, is responsible for estrogen synthesis by aromatization of androgens. Estrogen synthesis within particular brain regions of the teleost brain is between 100 and 1000 times higher than that observed in the homologues brain areas of other vertebrates. The basis of such high levels lies in part due to the expression of a variant of the enzyme aromatase, known as brain aromatase, which is the product of one of two paralogous genes encoding aromatase enzymes (brain and gonadal aromatase) in teleosts. The neuroanatomical distribution of brain aromatase overlaps with brain areas involved in the regulation of social behavior. Thus, the objective of this thesis was to analyze the role of brain aromatase in the regulation of agonistic behavior and maternal care in Cichlasoma dimerus, locally known as chanchita. Through an immunohistochemical study, the presence of the enzyme was detected in forebrain regions, in areas involved in the regulation of social behaviors. Then, the physiology and behavior of male chanchitas of different social status (dominant vs. subordinate) were characterized, and their relationship with the expression of brain aromatase in the brain and pituitary was assessed. Dominant males had higher circulating androgen levels, while subordinate males were characterized by a higher 17β-estradiol plasma concentration, and a relatively lower spermatogenic rate. While the social status ha no effect on the expression of forebrain and pituitary brain aromatase, the expression levels at pituitary correlated with the frequency of agonistic behaviors, suggesting a novel role of the pituitary gland in the regulation of social behavior through estrogen synthesis. In female chanchitas, the expression profiles of both aromatase gene variants (brain and gonadal) were examined throughout the parental care period, and their relation to physiological and reproductive parameters were analyzed. The onset of maternal care resulted in a specific downregulation in sex steroid synthesis and ovarian maturation rate, while levels of expression of both aromatases were independent of the presence of the progeny. Therefore, the social status in males and parental care in females of the cichlid chanchita, have a strong effect on sex steroids levels and gonadal state, or vice versa, though aromatase expression in whole forebrain and pituitary samples was unaffected.
Cita tipo APA: Ramallo, Martín Roberto . (2016-12-02). Aromatasa cerebral (Cyp19a1b): caracterización y relación con el comportamiento agonístico y el período de cuidado parental en el pez cíclido Cichlasoma dimerus. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6127_Ramallo.pdf Cita tipo Chicago: Ramallo, Martín Roberto. "Aromatasa cerebral (Cyp19a1b): caracterización y relación con el comportamiento agonístico y el período de cuidado parental en el pez cíclido Cichlasoma dimerus". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6127_Ramallo.pdf |
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Allen, Pablo Guillermo. "Estudio de la estructura de fases de la Cromodinámica Cuántica (QCD) en presencia de campos magnéticos fuertes mediante modelos efectivos" (2016-12-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se estudian los efectos de campos magnéticos intensos sobre las propiedades de la materia fuertemente interactuante en el marco de modelos efectivos del tipo Nambu-Jona-Lasinio, haciendo especial énfasis en el análisis de los diagramas de fases y el comportamiento de los parámetros de orden. En el Cap.1, se realiza una introducción a los temas que se desarrollan en esta tesis, presentándose las motivaciones y los objetivos. En el Cap.2, se hace una revisión breve de algunos aspectos básicos de la Cromodinámica Cuántica (QCD), los cuales son usados como punto de partida para la construcción de los modelos efectivos utilizados. Luego se introducen el modelo de Nambu-Jona-Lasinio y las distintas extensiones a ser estudiadas en este trabajo. En el Cap.3, se introduce campo magnético en el modelo, prestando especial atención a los diferentes procedimientos de regularización posibles. Se realiza una comparación entre dichos procedimientos y además se comparan estos resultados con los correspondientes de Lattice QCD (Cromodinámica cuántica en red). En el Cap.4, se estudia la estructura de fases del modelo con campo magnético y potencial químico finito. Se realiza además un estudio exhaustivo de la dependencia de los diagramas de fase con la parametrización. Se analiza el comportamiento de los parámetros de orden y se discute el efecto de catálisis magnética inversa. En el Cap.5, se presentan los resultados correspondientes a una extensión del modelo que incluye interacciones generalizadas. Se tienen en cuenta interacciones de mezcla de sabor y de carácter vectorial. Luego, se imponen condiciones de neutralidad de carga y equilibrio β, relevantes al estudio de estrellas compactas. En el Cap.6, se analiza el modelo al considerar interacciones efectivas del tipo quark-quark, las cuales reproducen el efecto de superconductividad de color. Se detalla el procedimiento de regularización y se discute el comportamiento del parámetro de orden de simetría quiral y del gap superconductor. Nuevamente, se estudian los diagramas de fase en función de los parámetros del modelo. En el Cap.7, finalmente, se resume el trabajo realizado y se exponen las conclusiones. Abstract: In this thesis we study the effects of intense magnetic fields on the properties of strongly interacting matter within effective models of the Nambu-Jona-Lasinio type, emphasizing on the analysis of the corresponding phase diagrams and the behaviour of the relevant order parameters. In Chap.1, we briefly introduce the subjects to be developed in this thesis, and present the motivations and objectives. In Chap.2, we summarize some of the basic aspects of Quantum Chromodynamics (QCD), which are used as a starting point for the construction of the effective models used in this work. Then, we introduce the Nambu-Jona-Lasinio model and the different extensions to be studied. In Chap.3, we introduce magnetic field in the model, paying special attention to the different possible regularization procedures. We carry out a comparison between such procedures and also compare these results with the corresponding ones from Lattice QCD. In Chap.4, we study the phase structure of the model under finite magnetic field and chemical potential. We carry out an exhaustive study of the dependence of the phase diagram on the parameter choice. We analyse the behaviour of the dressed mass, order parameter for chiral symmetry breaking, and the density. The effect of inverse magnetic catalysis is also discussed. In Chap.5, we extend the model to include generalized interactions. We consider flavour mixing effects and vector interaction channels. Afterwards, charge neutrality and β equilibrium conditions are imposed, which are relevant to the study of compact stars. In Chap.6, we take into consideration effective quark-quark type interactions, which reproduce the effect of color superconductivity. The regularization procedure is shown in detail for this case, and the behaviour of the chiral symmetry breaking order parameter and superconducting gap are presented. Once again, we study the phase diagrams and their dependence on the parameter choice. In Chap.7, finally, we summarize the results of this work and the conclusions are presented.
Cita tipo APA: Allen, Pablo Guillermo . (2016-12-02). Estudio de la estructura de fases de la Cromodinámica Cuántica (QCD) en presencia de campos magnéticos fuertes mediante modelos efectivos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6111_Allen.pdf Cita tipo Chicago: Allen, Pablo Guillermo. "Estudio de la estructura de fases de la Cromodinámica Cuántica (QCD) en presencia de campos magnéticos fuertes mediante modelos efectivos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-12-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6111_Allen.pdf |
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Pizzurro, Gabriela Andrea. "Desarrollo de vacunas terapéuticas con células dendríticas humanas para melanoma: optimización de parámetros fenotípicos y funcionales in vitro e in vivo de la vacuna experimental CD/Apo-Nec" (2016-11-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El presente trabajo de Tesis se centra principalmente en el estudio en profundidad y la optimización del diseño de la vacuna experimental CD/Apo-Nec para el melanoma cutáneo humano, desarrollada previamente en nuestro laboratorio. En primer lugar, se caracterizó la interacción entre las células dendríticas y células de melanoma g-irradiadas (Apo-Nec) durante su co-cultivo. Luego de la detección de un incremento en los cuerpos lipídicos citoplasmáticos de las células Apo-Nec post-irradiación, se determinaron sus características bioquímicas y la dinámica de su formación. El desempeño de las células dendríticas fue evaluado en presencia de distinto contenido lipídico, caracterizando la fagocitosis, el cargado antigénico y su capacidad estimulatoria, en diferentes estados de maduración. Luego, se compararon características migratorias de la vacuna in vitro e in vivo en diferentes estados de maduración. Se describió la llegada de la vacuna a los ganglios linfáticos en ratones nude. Junto a la respuesta quemotáctica, se determinaron los factores del sistema responsables de la motilidad y distribución de la vacuna luego de su administración por vía subcutánea. Por último, se determinó el perfil inmunoestimulatorio de la vacuna, junto con su capacidad de activar clones de células T antígeno-específicos en el tiempo. Se caracterizó además la respuesta generada por la vacuna sobre linfocitos naïve, en cuanto a su activación y capacidad proliferativa y citotóxica frente a células de melanoma. En resumen, el análisis de distintas variables presentes en las sucesivas etapas de la generación de la vacuna CD/Apo-Nec permitió determinar condiciones que influyen y mejoran sus características finales. Este diseño optimizado, el cual presenta claras evidencias de generar una respuesta inmunitaria anti-tumoral eficaz, podrá ser evaluado con futuros estudios en la clínica. Abstract: The present PhD Thesis project is mainly focused on the thorough analysis of the experimental DC/Apo-Nec vaccine for human cutaneous melanoma, in order to obtain an optimized design of the vaccine previously developed in our laboratory. First, the interaction between dendritic cells and g-irradiated melanoma cells (Apo-Nec) was characterized during the co-culture. As an increase in the cytoplasmic lipid body formation was detected in Apo-Nec cells after irradiation, a biochemical analysis and a description of their formation was performed. Dendritic cell function was assessed in the presence of different lipid body content, analyzing phagocytosis, antigen loading and stimulating capacity, at different maturation status. Then, the migratory pattern of the vaccine was analyzed and compared in vitro and in vivo at different maturation status. Vaccine lymph node homing was described in the nude mouse model. Besides the chemotactic response, the main components responsible of vaccine motility and distribution after subcutaneous administration were determined. Finally, the immunostimulatory profile of the vaccine was determined, along with its capacity to activate antigen-specific T-cell clones at different times after co-culture. The vaccine-induced response on naïve lymphocytes was also evaluated, regarding cell activation, proliferative response and cytotoxic function against melanoma cells. Altogether, the analysis of variables present during several stages of the DC/Apo-Nec vaccine production and administration resulted in a more detailed and improved vaccine design. This optimized model has provided strong evidence that suggests it could generate an efficient anti-tumor immune response that should be further evaluated in the clinic.
Cita tipo APA: Pizzurro, Gabriela Andrea . (2016-11-29). Desarrollo de vacunas terapéuticas con células dendríticas humanas para melanoma: optimización de parámetros fenotípicos y funcionales in vitro e in vivo de la vacuna experimental CD/Apo-Nec. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6093_Pizzurro.pdf Cita tipo Chicago: Pizzurro, Gabriela Andrea. "Desarrollo de vacunas terapéuticas con células dendríticas humanas para melanoma: optimización de parámetros fenotípicos y funcionales in vitro e in vivo de la vacuna experimental CD/Apo-Nec". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6093_Pizzurro.pdf |
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Lamagna, Walter Marcelo. "Lectura artificial de números manuscritos en datos abiertos de elecciones legislativas en la Ciudad de Buenos Aires" (2016-11-24). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta última década, el acceso masivo a las nuevas tecnológicas con medios de almacenamiento reducidos en tamaño y precios accesibles han impulsado la creación y manipulaci´on de grandes volúmenes de datos. En este trabajo se utilizan datos públicos, abiertos, libres de origen gubernamental. Existen ciertos datos, que como resultado de la gestión de un país y puestos a disposición de la sociedad, significan un enorme beneficio. Los datos abiertos fortalecen la participación democrática motivando a los científicos de datos a utilizar su conocimiento para responder ciertas preguntas ó resolver problemas a través de la tecnología. Nuestro estudio consistió en tomar los Datos Abiertos Electorales que corresponden a las elecciones de diputados y senadores en Argentina, Buenos Aires, Capital Federal el 27 de Octubre de 2013 y nos propusimos comparar un mismo dato proveniente de dos fuentes diferentes de formato distinto: dígitos tipeados a partir de formularios en papel e imágenes escaneadas. Las planillas manuscritas escaneadas utilizadas en este trabajo albergan datos numéricos, que son datos certeros, ya que son producto del conteo manual supervisado por todos los actores presentes en el evento. Conociendo la metodología utilizada sabemos que este dato debería corresponderse entre ambas fuentes. Se busca determinar si existe una tasa de error entre dos orígenes de datos que deberían coincidir en sus valores. Se describe el preprocesamiento de las planillas-imágenes para detectar las regiones de interés que localizan cada número que luego será segmentado en sus correspondientes dígitos. La dificultad de decodificar el símbolo numérico que corresponde a cada número manuscrito se encuentra en la necesidad de utilizar técnicas de procesamiento de imágenes y aprendizaje automático. En esta tesis se evaluó la aplicación de un método de lectura artificial automatizado que clasifica los dígitos manuscritos de los telegramas y luego los compara con los datos tipeados manualmente buscando inconsistencias. En diferentes etapas de este trabajo se aplica minería de datos: se utilizan árboles de decisión en la clasificación de las regiones del telegrama y redes neuronales convolucionales en la clasificación de los dígitos manuscritos.
Cita tipo APA: Lamagna, Walter Marcelo . (2016-11-24). Lectura artificial de números manuscritos en datos abiertos de elecciones legislativas en la Ciudad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6105_Lamagna.pdf Cita tipo Chicago: Lamagna, Walter Marcelo. "Lectura artificial de números manuscritos en datos abiertos de elecciones legislativas en la Ciudad de Buenos Aires". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6105_Lamagna.pdf |
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Bellesi, Fernando Alberto. "Comportamiento de interfases y emulsiones submicrónicas estabilizadas por biopolímeros en simulaciones de procesos de digestión gastroduodenal in vitro" (2016-11-24). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En años recientes un gran número de trabajos se han enfocado a estudiar la forma de reducir la elevada absorción de lípidos, asociada a numerosos problemas de salud, tales como obesidad y problemas cardiovasculares. Si bien las metodologías para abordar el tema son variadas, al ser la lipólisis una reacción interfacial (la lipasa debe adsorberse a la interfase para llevar a cabo la digestión de los lípidos), las interfases aceite/agua (tanto la estructura como el área interfacial) resultan un punto crítico a estudiar. Por tal motivo, el objetivo del presente trabajo consiste en evaluar el impacto que presentan diferentes estructuras interfaciales en el proceso digestivo con el propósito de encontrar aquella que retarde (o inhiba) la acción digestiva llevada a cabo por la lipasa pancreática. Se analizaron estructuras interfaciales y emulsiones estabilizadas por: proteínas (β-lactoglobulina (βlg) y aislado proteico de soja (SPI)) y polisacáridos (hidroxipropilmetilcelulosa (HPMC)). Se desarrolló un modelo de digestión in vitro constituido por dos etapas: gástrica (1h, pH 2,5) y duodenal (1h, pH 7), que contemplan la presencia de las principales enzimas y biopolímeros a concentraciones fisiológicas. El estudio se realizó en dos niveles: (1) Estudios de digestión de interfases aceite/agua (tensiómetro interfacial de gota) para obtener información sobre cómo los fluidos característicos de la digestión perturban tales películas interfaciales, caracterizándolos mediante los parámetros: tensión interfacial y módulo dilatacional interfacial; (2) Estudios de digestión de emulsiones estabilizadas por los mismos emulsionantes obtenidas mediante la técnica de ultrasonidos de alta intensidad. Se analizaron los cambios microestructurales de las gotas de aceite (microscopía óptica y técnicas de dispersión de luz) y se monitoreó el porcentaje de ácidos grasos liberados (% AGL) por acción de la lipasa pancreática. Se comprobó que tanto las estructuras interfaciales como las emulsiones presentan diferencias en cuanto a la resistencia a la acción digestiva llevada a cabo por la lipasa. Estas vienen determinadas por la naturaleza de cada estructura y las características interfaciales de cada una. Las emulsiones estabilizadas por SPI y HPMC mostraron los menores % AGL en comparación con las emulsiones de βlg. El comportamiento observado no presentó relación con el área interfacial expuesta a la lipasa, sino más bien a la capacidad que presenta cada emulsionante en dificultar la acción de las sales biliares (SB), agentes indispensables para la acción de la lipasa. De esta manera, los resultados permitieron identificar a las SB como un factor clave en la regulación del proceso. En términos generales, los resultados contribuyen al mayor entendimiento sobre los mecanismos involucrados en la digestión de emulsiones y del rol crucial que juegan las estructuras interfaciales en el control de la lipólisis. Abstract: In recent years an important number of works have been focused on modulating the lipid digestion, since the high lipid absorption has been associated with an important number of health problems, such as obesity and cardiovascular diseases. Although different methodologies exist to evaluate the lipolysis process that is an interfacial reaction (pancreatic lipase has to bind to the oil-water (o/w) interface), o/w interfaces (both structure and interfacial area) suppose a critical issue to study. So, the objective of the present work is to evaluate the impact of different interfacial structures in the digestion in order to find the interfacial film that could retard (or inhibit) the pancreatic lipase activity. Different interfacial structures and proteins (ß-lactoglobulin (ßlg) and soy protein isolate (SPI)) and polysaccharides (hydroxypropylmethylcelullose (HPMC)) stabilized emulsions were analyzed. An in vitro digestion protocol was developed consisting of two stages: gastric (1h, pH 2.5) and duodenal phase (1h, pH 7.0), in the presence of the main enzymes and biopolymers at physiological concentrations. The investigation was carried out at two levels: (1) interfacial digestion of the different interfacial films formed (using a pendant drop tensiometer) to understand the way the digestive fluids affect the interfacial films, thus analyzing the evolution of interfacial tension and the dilatational interfacial modulus; (2) analysis of the behavior of emulsion (formed by using ultrasound techniques) stabilized by each emulsifier under in vitro gastrointestinal digestion. The microstructural changes of the oil droplets (optical microscopy and light scattering techniques) were analyzed and it was also monitored the free fatty acid release (% FFA) due to the pancreatic lipase activity. Both the interfacial structures as well as the o/w emulsions showed different resistance to the lipolysis. These differences depended on the nature of the interfacial structure and the interfacial properties formed by the emulsifiers. SPI and HPMC stabilized o/w emulsions presented the lowest % FFA values in comparison to ßlg stabilized emulsions. No correlation did exist with the interfacial available area for the lipase adsorption. It was the capacity of the different emulsifiers to reduce the bile salts (BS) activity (essential molecules for the lipase activity) the reason of the existing differences. The results allowed to identify the BS as the key molecules in the lipolysis modulation. These results have contributed to a better understanding of the mechanisms affecting the digestion of the emulsions and the important role of the interfacial structures in the vitro lipolysis control.
Cita tipo APA: Bellesi, Fernando Alberto . (2016-11-24). Comportamiento de interfases y emulsiones submicrónicas estabilizadas por biopolímeros en simulaciones de procesos de digestión gastroduodenal in vitro. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6088_Bellesi.pdf Cita tipo Chicago: Bellesi, Fernando Alberto. "Comportamiento de interfases y emulsiones submicrónicas estabilizadas por biopolímeros en simulaciones de procesos de digestión gastroduodenal in vitro". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6088_Bellesi.pdf |
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Bordenave, Martín Diego. "Mediciones con resolución nanométrica mediante depleción por emisión estimulada" (2016-11-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Desde los estudios de Ernst Abbe, a finales del siglo XIX, se dio por aceptado que la microscopía óptica de campo lejano tenía un límite en su poder de resolución espacial: objetos que se encontraran más cercanos entre sí que media longitud de onda de la luz utilizada no podrían distinguirse. Sin embargo, en las últimas dos décadas se han desarrollado un número de técnicas basadas en fluorescencia que mantienen las ventajas de la microscopía óptica de campo lejano, y proporcionan una resolución espacial limitada únicamente por el tamaño del marcador fluorescente. Estas técnicas se denominan microscopías de superresolución o nanoscopías de fluorescencia e involucran la transición entre estados moleculares de los fluoróforos que permitan o no la emisión de fluorescencia. En particular, en la nanoscopía STED (Stimulated Emission Depletion), se produce esta transición mediante depleción por emisión estimulada, con el fin de desactivar fluoróforos en regiones controladas del espacio y de esta forma reducir el volumen efectivo de observación. En el marco de esta tesis, y gracias a una colaboración formal y activa con Stefan W. Hell (Department of NanoBiophotonics, Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, Göttingen, Germany), galardonado en 2014 con el premio Nobel de Química por su trabajo pionero en las nanoscopías de fluorescencia, se construyó el primer nanoscopio STED de Argentina (Grupo de Nanofísica Aplicada, Centro de Investigaciones en Bionanociencias (CIBION), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires (BA), Argentina). El nanoscopio STED se aplicó para indagar y dilucidar problemas biofísicos con resolución nanométrica. En colaboraciones interdisciplinarias se estudió: (a) la organización de proteínas en la membrana del Trypanosoma cruzi, en colaboración con el Grupo de Inmunología Molecular, Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín (UNSAM), CONICET, BA, Argentina; (b) procesos de reestructuración del citoesqueleto de los conos de crecimiento durante la polarización neuronal, en colaboración con el Laboratorio de Neurobiología, Instituto de Investigación Médica de Córdoba (INIMEC), CONICET, Córdoba, Argentina; y (c) la formación y estabilidad de estructuras periódicas de actina en procesos de degeneración axonal, en colaboración con el Laboratorio de Neurobiología, INIMEC, CONICET, Córdoba, Argentina y el Grupo de Neurobiología Molecular, Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires (IBIOBA), CONICET, BA, Argentina. Asimismo, se desarrolló un nuevo esquema de implementación de la nanoscopía STED que expande considerablemente su campo de aplicación. Generalmente, luz de longitud de onda situada en la zona roja lejana del espectro de emisión del fluoróforo es utilizada para inducir el fenómeno de emisión estimulada. En esta tesis, se demuestra que STED continuo (CW) también es posible utilizando longitudes de onda de STED ubicadas en el máximo de emisión, donde la sección eficaz de emisión estimulada puede ser hasta 10 veces mayor. Como resultado, es posible obtener imágenes de STED utilizando potencias proporcionalmente menores. Además, fluoróforos que se consideraban inadecuados para ciertas configuraciones espectrales de nanoscopía STED, pueden ser utilizables. Abstract: Since the studies made by Ernst Abbe, by the end of the XIXth century, it was accepted that far field optical microscopy had a limit in its spatial resolution: objects found closer together than half the wavelength of the light used would not be distinguished apart. However, in the last two decades, a number of techniques based on fluorescence have been developed, that keep all the advantages of far-field optical microscopy and provide spatial resolution only limited by the size of the fluorescent marker. These techniques are called super-resolution fluorescence microscopies or fluorescence nanoscopies and they involve the transition between molecular states of the fluorophores that allow or not fluorescence emission. Particularly, in STED (Stimulated Emission Depletion) nanoscopy, this transition is produced by stimulated emission depletion, in order to disable fluorophores in controlled regions of space and thereby reduce the effective volume of observation. In the framework of this thesis, and supported by a formal and active collaboration with Stefan W. Hell (Department of NanoBiophotonics, Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, Göttingen, Germany), awarded in 2014 with the Nobel Prize in Chemistry for his pioneering work in fluorescence nanoscopies, the first STED nanoscope of Argentina was built (Grupo de Nanofísica Aplicada, Centro de Investigaciones en Bionanociencias (CIBION), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires (BA), Argentina). The STED nanoscope was applied to investigate and elucidate biophysical questions with nanometric resolution. In interdisciplinary collaborations it was studied: (a) the organization of proteins in the membrane of Trypanosoma cruzi, in collaboration with the Group of Molecular Immunology, Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB), Universidad Nacional de San Martín (UNSAM), CONICET, BA, Argentina; (b) processes of cytoskeleton restructuring in growth cones during neuronal polarization, in collaboration with the Laboratory of Neurobiology, Instituto de Investigación Médica de Córdoba (INIMEC), CONICET, Córdoba, Argentina; and (c) the formation and stability of periodic structures of actin in the process of axonal degeneration, in collaboration with the Laboratory of Neurobiology, INIMEC, CONICET, Córdoba, Argentina and the Group of Molecular Neurobiology, Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires (IBIOBA), CONICET, BA, Argentina. Also, a new implementation scheme of STED nanoscopy was developed, which expands considerably its field of application. Generally, light of a wavelength located in the far-red zone of the emission spectrum of the fluorophore is used to induce stimulated emission. In this thesis, it is shown that continuous wave STED (CW), is also feasible using STED wavelengths located at the maximum of emission, where the stimulated emission cross section can be up to 10 times higher. As a result, super-resolved STED images are obtained using proportionally less power. Also, fluorophores considered unsuitable for certain spectral configurations of STED nanoscopy, may become usable with this scheme.
Cita tipo APA: Bordenave, Martín Diego . (2016-11-14). Mediciones con resolución nanométrica mediante depleción por emisión estimulada. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6095_Bordenave.pdf Cita tipo Chicago: Bordenave, Martín Diego. "Mediciones con resolución nanométrica mediante depleción por emisión estimulada". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6095_Bordenave.pdf |
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Avila Velandia, María Fernanda. "Evaluación del riesgo de introducción de especies invasoras en agua de lastre en buques que operan en el puerto de Buenos Aires" (2016-11-11). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La creciente movilidad de personas y mercaderías entre los países del mundo generó un aumento de los impactos ecológicos en general, y de los relacionados con la introducción de especies exóticas en particular. Estas introducciones han causado dramáticos efectos en ambientes terrestres, marinos y de agua dulce, frecuentemente con severas consecuencias económicas y ambientales. Para los organismos acuáticos, la fuente de introducción de especies más importante es el agua de lastre de los buques comerciales. Se estima que en el mundo se movilizan entre 3000 y 5000 millones de toneladas de agua de lastre por año, transportando unas 7000 especies de animales y plantas. Si bien existe reglamentación tanto nacional como internacional orientada a mitigar estos problemas, el grado de cumplimiento de estas normas es cuestionable. Con el fin de verificar el cumplimiento de las reglas en vigencia, llevamos a cabo un relevamiento de las declaraciones de entrada y de manejo de agua de lastre presentadas por todos los buques que ingresaron al Puerto de Buenos Aires entre junio de 2010 y junio de 2011. Los resultados indican que en más del 70% de las entradas a puerto (del mismo o diferentes buques) la información referente al agua de lastre es inexistente o seriamente deficiente, imposibilitando una evaluación objetiva del grado de riesgo involucrado en el vertido de aguas de lastre en el puerto y sus inmediaciones. Para llevar a cabo una verificación independiente de las declaraciones de manejo de agua de lastre suministradas por los buques, contrastamos los volúmenes de agua descargada declarados con estimaciones de los volúmenes que potencialmente podrían haber sido eliminados en este puerto mediante la información del aumento en carga de los buques al zarpar con respecto a la carga al entrar a puerto (esta diferencia normalmente se compensa eliminando agua de lastre en el puerto correspondiente). Esta estimación sugiere que, si bien solamente menos de una decena de entradas a puerto informaron la intención de deslastrar en el mismo, en al menos 220 casos debe haber habido descarga de agua de lastre en las inmediaciones del puerto de Buenos Aires. El grado de riesgo de estas descargas en función de su probabilidad de introducir especies exóticas en el estuario del Río de la Plata se estimó comparando la similitud ambiental (salinidad y temperatura) entre los sitios declarados de origen del agua de lastre y el estuario, así como la proximidad geográfica y el grado de conexión natural entre ambas zonas. Este análisis indica que, para las zonas de agua dulce y mixohalina del estuario, el tráfico del período estudiado representa un riesgo nulo o muy bajo. Por el contrario, el riesgo para la zona marina de las costas de Buenos Aires fue alto según nuestras estimaciones. Se esbozan lineamientos generales orientados a mitigar los problemas detectados y fortalecer las capacidades locales para fiscalizar más eficientemente el cumplimiento de las normas vigentes en la materia. Abstract: The growing international mobility of people and goods around the world has had growing environmental impacts, in particular those associated with the introduction of alien species. Some of these introductions have had dramatic impacts on terrestrial, marine and freshwater habitats, often with severe economic and environmental consequences. For aquatic plants and animals, the most important source of biological introductions is the ballast water of commercial vessels. Around 3000-5000 millions metric tons of ballast water are carried around the world each year, transporting ~7000 species. Although transport and discharge of ballast water are regulated both on the international and on national levels, compliance with these regulations is questionable. In order to assess the degree of compliance with current regulations, we surveyed the ballast water reporting forms submitted by all incoming vessels in the port of Buenos Aires between June 2010 and June 2011. Our analyses show that for over 70% of the port calls (by the same or different vessels), ballast water-related information is severely flawed or missing altogether, precluding an objective assessment of the risk associated with the introduction of species in this area. In order to perform an independent assessment, we contrasted the information contained in the ballast water reporting forms with that on the weight of the cargo of each vessel on arrival and on departure, assuming that for ships that left with more cargo than they had upon arrival differences in weight have most probably been compensated with ballast water discharges in or close to Buenos Aires. This analysis suggests that, while only about 10 ships reported having deballasted in Buenos Aires, at least 220 port calls are very likely to have been associated with ballast water discharges. The risk of introduction of alien species associated with these discharges was analyzed assessing the environmental similarity (temperature and salinity) between the Río de la Plata estuary and the donor areas (according to the ballast water reporting forms), as well as the natural geographic connectedness between the two. Our results indicate that for the freshwater and the brackish sections of the estuary the risk was none or very low. On the other hand, for the offshore, marine section, the risk was much higher. We offer some guidelines aimed at mitigating the problems detected and discuss capacity-building measures for more efficiently dealing with the problem of enforcing compliance with current and future ballast water management regulations locally.
Cita tipo APA: Avila Velandia, María Fernanda . (2016-11-11). Evaluación del riesgo de introducción de especies invasoras en agua de lastre en buques que operan en el puerto de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6184_AvilaVelandia.pdf Cita tipo Chicago: Avila Velandia, María Fernanda. "Evaluación del riesgo de introducción de especies invasoras en agua de lastre en buques que operan en el puerto de Buenos Aires". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6184_AvilaVelandia.pdf |
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Fragalá, Marina. "Un S-estimador alternativo para el modelo de regresión lineal con datos censurados y distribución posiblemente asimétrica" (2016-11-04). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis comenzamos haciendo una revisión detallada de resultados sobre los S estimadores para el modelo de regresión lineal con datos no censurados y errores que pueden tener distribución simétrica o asimétrica. Para estos estimadores aportamos una prueba diferente de la propiedad de consistencia de Fisher y estudiamos la consistencia fuerte a partir del concepto de funcionales de regresión. Locatelli, Marazzi y Yohai (2010) desarrollaron S-estimadores para el modelo de regresión lineal con datos censurados y errores cuya distribución pertence a una familia paramétrica de posición y escala que también puede ser simétrica o asimétrica. En esta tesis proponemos y analizamos un nuevo procedimiento de estimación de tipo S para el mismo problema. Estos estimadores son altamente robustos pero ineficientes. Para mejorar la eficiencia, a partir de ellos definimos un estimador final utilizando un procedimiento de máxima verosimilitud truncada. Este estimador resulta altamente robusto y con una eficiencia asintótica alta si se compara con la del estimador de máxima verosimilitud para datos censurados. Las ventajas de este nuevo S-estimador para datos censurados sobre el propuesto en Locatelli et al. (2010) son las siguientes: (a) gracias a su estructura, podemos probar que el nuevo S-estimador tiene la propiedad de consistencia de Fisher y (b) el cálculo del nuevo S-estimador requiere un algoritmo de menor complejidad del que se usa para el S-estimador propuesto en Locatelli et al. (2010).
Cita tipo APA: Fragalá, Marina . (2016-11-04). Un S-estimador alternativo para el modelo de regresión lineal con datos censurados y distribución posiblemente asimétrica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6104_Fragala.pdf Cita tipo Chicago: Fragalá, Marina. "Un S-estimador alternativo para el modelo de regresión lineal con datos censurados y distribución posiblemente asimétrica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-11-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6104_Fragala.pdf |
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Cambados, Nadia. "Impacto del sistema renina angiotensina en la involución mamaria y en la progresión tumoral" (2016-10-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El desarrollo de la glándula mamaria es un proceso dinámico que involucra ciclos continuos de proliferación, diferenciación y regresión. Luego de la lactancia, comienza la involución de la misma. Dicho proceso, consiste en una masiva apoptosis de las células epiteliales alveolares y en un intenso remodelado tisular, acompañado de un aumento en la expresión de factores pro-inflamatorios, devolviéndole a la glándula una estructura similar al de una hembra virgen. Por otro lado, el sistema renina angiotensina (RAS) se vincula, actualmente, a una multiplicidad de procesos biológicos, tanto en condiciones fisiológicas como patológicas. La mayoría de los efectos de la AngII, principal efector del RAS, son mediados por el receptor AT1 (AT1-R), y se discute aún la participación del AT2 (AT2-R). En los últimos años, se descubrió que múltiples actividades biológicas del RAS involucran no sólo la acción de la AngII, sino también la de un conjunto de péptidos bioactivos como la Ang-(1-7). Diversas publicaciones indican que la Ang-(1-7) tendría una actividad antiproliferativa y antiangiogénica, contrarrestando los efectos de AngII en diversos tipos celulares. Dado que AngII puede actuar como una citoquina pro-inflamatoria, investigamos en primer lugar, si el RAS cumple algún rol durante la involución mamaria. Demostramos por primera vez, que la AngII induce una marcada activación de STAT3 en el epitelio mamario in vivo. Dicho efecto, es medidado por el AT1-R. Asimismo, observamosque la inyección de AngII intramamario induce una rápida activación de ERK1/2 y un aumento significativo en el porcentaje de células apoptóticas. Para evaluar el rol de AngII endógena, se trataron ratones con el inhibidor de AT1-R losartan, durante la involución mamaria. El bloqueo del AT1-R desencadenó un aumento en los niveles de factores de supervivencia celular AKT y Bcl-XL, y una disminución de la expresión de los genes de respuesta temprana LIF y TNF-α, del porcentaje de células apoptóticas y de la actividad de MMP-2 y MMP-9. Investigamos además, la relevancia de los dos subtipos del AT1-R, AT1a-R y AT1b-R, en la involución mamaria, mediante el uso de ratones deficientes para dichos receptores. Encontramos un retardo significativo en involución a las 72 y 96 hs en los ratones dobles KO AT1a/AT1b. Dicho retardo, se correlacionó con una disminución de células apoptóticas y de fibras de colágeno y reticulina. A continuación, estudiamos el rol de AngII y Ang-(1-7) en células mamarias normales y tumorales. En células normales epiteliales mamarias, encontramos que ambos péptidos inducen activación de AKT y ERK1/2. Sin embargo, Ang-(1-7) induce menor activación y, la estimulación simultánea con ambas angiotensinas, produce un patrón de activación de AKT similar al desencadenado por Ang-(1-7). Asimismo, AngII es capaz de promover la transición epitelio mesenquimal (TEM) en dichas células, induciendo la expresión de marcadores mesenquimales y disminuyendo la expresión de marcadores epiteliales. Nuevamente, dicho efecto es contrarrestado en células pre-tratadas con Ang-(1-7). En ensayos de migración e invasión, observamos que AngII aumenta significativamente la capacidad migratoria e invasiva de líneas celulares tumorales mamarias, mientras que el pre-tratamiento con Ang-(1-7) disminuye la migración inducida por AngII a valores similares al control. Por último, demostramos que Ang-(1-7) inhibe el aumento desencadenado por AngII sobre los niveles de expresión de ARNm de VEFG y MMP-9, así como en la actividad de dicha metaloproteasa. En conjunto, nuestros resultados sugieren que AngII, a través del receptor AT1-R, juega un papel preponderante en la involución mamaria, identificándose un nuevo rol para el RAS. Asimismo, mientras que AngII promueve el desarrollo tumoral, Ang-(1-7) contrarresta los efectos desencadenados por AngII en células tumorales mamarias. Abstract: Mammary gland development is a complex, dynamic process, which undergoes repeated cycles of growth, differentiation, and regression. After lactation, a rapid switch from survival to death signaling occurs, leading to involution. This process consists in massive apoptosis of alveolar epithelial cells and extensive tissue remodeling, together with an increase in the expression of pro-inflammatory factors. The gland is returned to a virgin-like state. On the other hand, the renin angiotensin system (RAS) is actually associated to multiple biological processes, both in physiological and pathological conditions. Most of the effects of AngII, the main effector peptide of the RAS, are mediated by the AT1 receptor (AT1-R), while the role of AT2 (AT2-R) receptor is still controversial. During the last years, it was discovered that multiple of the biological activities of the RAS involve not only the effects of AngII, but also of a group of bioactive peptides, like Ang-(1-7). Several publications suggest that Ang-(1-7) has an antiproliferative and antiangiogenic activity, counteracting the effects of AngII in different cell types. Since AngII can act as a pro-inflammatory cytokine, we first investigated the role of the RAS during mammary involution. We demonstrated for the first time, that AngII strongly induces STAT3 phosphorylation in the mammary epithelial cells in vivo. This effect is mediated by the AT1 receptor. Furthermore, we observed that intra-mammary injection of AngII induces a rapid activation of ERK1/2 and a significant increase in the percentage of apoptotic cells. To define the role of endogenous AngII, mice were treated with the AT1-R blocker losartan, during involution. Blocking the AT1-R triggered an increase in the levels of the survival factors AKT and Bcl-XL, and decreased the expression of the early responsive genes LIF and TNF-α, the percentage of apoptotic cells and the MMP-2 and MMP-9 activity. Moreover, we analyzed the relevance of the AT1 receptor isoforms, AT1a-R and AT1b-R, during involution, in mice deficient for one or both receptor’s subtypes. We found a significant delay in involution by 72 and 96 h in double KO mice AT1a/AT1b, which was correlated with a significantly lower rate of apoptotic epithelial cells and reduced collagen and reticulin deposition. We next studied the role of AngII and Ang-(1-7) in normal and tumor mammary cells. In normal epithelial cells, both peptides induce phosphorylation of AKT and ERK1/2, although Ang-(1-7) activated it in a lesser extent. However, pre-treatment with Ang-(1-7) prior to stimulation with AngII, produces an activation pattern similar to the one triggered by Ang-(1-7) alone. Furthermore, AngII is capable of promoting epithelial mesenchymal transition (EMT) in these cells, inducing the expression of mesenchymal markers and inhibiting the expression of epithelial ones. Once again, this effect was counteracted in cells pre-treated with Ang-(1-7). In migration and invasion assays, we found that AngII significantly increase the migration and invasion capacity of mammary tumor cell lines treated with AngII, while pre-treatment with Ang-(1-7) reduced this effect to control levels. Finally, we demonstrated that Ang-(1-7) inhibits AngII induced mRNA expression levels of VEGF and MMP-9, as well as the activity of this metalloprotease. Our results suggest that AngII, through AT1 receptor, plays a critical role in post-lactational regression, identifying a new function for the RAS. Moreover, while AngII promotes tumor progression, Ang-(1-7) counteracts the effects triggered by AngII in mammary tumor cells.
Cita tipo APA: Cambados, Nadia . (2016-10-26). Impacto del sistema renina angiotensina en la involución mamaria y en la progresión tumoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6091_Cambados.pdf Cita tipo Chicago: Cambados, Nadia. "Impacto del sistema renina angiotensina en la involución mamaria y en la progresión tumoral". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6091_Cambados.pdf |
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Moya Díaz, José. "Mecanismos involucrados en el desarrollo y sostenimiento de la exocitosis altamente acoplada en células cromafines" (2016-10-25). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se estudiaron los mecanismos asociados con la exocitosis vesicular altamente acoplada al estímulo, su recuperación, y su mantenimiento frente a la aplicación de potenciales de acción a bajas frecuencias de estimulación, propias del estado basal de estas células. En primer lugar, se evidenció que frente a la aplicación de un estímulo que simula un potencial de acción se libera un grupo de ≈ 8 vesículas, al que denominamos ETAP (por exocytosis triggered by action potential). Este pool vesicular está incluido en el pool inmediatamente liberable (IRP, ≈ 25 vesículas), y su exocitosis depende en un 50% de fuentes de Ca2+ extracelulares y en un 50% de un mecanismo independiente del influjo de Ca2+. Mientras que IRP recupera lentamente (τ ≈ 7 s) luego de ser deprimido, ETAP presenta una rápida cinética de recuperación (τ ≈ 0.7 s). Esta recuperación depende de dos procesos: (i) transferencia de vesículas desde pooles vesiculares río arriba, y (ii) una endocitosis rápida dependiente de dinamina y altamente acoplada a la exocitosis precedente. En la segunda parte de esta tesis se investigó el mecanismo de exocitosis independiente del influjo Ca2+ mencionado previamente. Utilizando despolarizaciones cuadradas de 100 ms (máxima respuesta), se determinaron la siguientes características para dicho fenómeno: (i) independencia de fuentes extracelulares e intracelulares de Ca2+; (ii) dependencia de la proteína SNARE sinaptobrevina; (iii) dependencia sigmoidea con el voltaje aplicado; (iv) los resultados sugieren que el sensor de voltaje sería el canal de Ca2+ tipo P/Q, y que interaccionaría con la maquinaria exocitótica a través de la secuencia synprint. En resumen, los resultados muestran que un potencial de acción induce una exocitosis altamente acoplada y sincrónica al estímulo que es dependiente en parte de un mecanismo activado por Ca2+ y en parte de otro activado directamente por voltaje. Finalmente, demostramos que esta exocitosis, gracias a su rápida velocidad de recuperación vesicular, es capaz de mantener la secreción de manera continua a frecuencias basales fisiológicas. Abstract: In resting conditions, chromaffin cells fire action potentials at frequencies of 0.2-0.5 Hz, while under stress the frequency increases to 10-15 Hz. In this thesis we studied the mechanisms involved in the development and maintenance of exocytosis in response to the application of action potentials, individually and at low frequencies. In first place, we showed that the application of a stimulus that resembles a single action potential induced the release of a group of ≈ 8 vesicles that we defined as “exocytosis triggered by action potential” (ETAP). Our results show that this pool is part of the immediately releasable pool (IRP ≈ 25 vesicles), and its exocytosis depends 50% on extracellular Ca2+ sources and 50% on a mechanism that is independent of Ca2+ influx. While IRP refilling is slow (τ ≈ 7 s) after depletion, ETAP showed a fast kinetic of recovery (τ ≈ 0.7 s). This recovery depends on two processes: (i) vesicular transference from upstream pools, and (ii) a fast dynamin-dependent endocytotic process, which is tightly coupled to the precedent exocytosis. In the second part of this thesis we investigated the Ca2+- independent exocytotic mechanism previously mentioned. Using square depolarizations pulses of 100 ms (maximal response), the following characteristics were determined for this phenomenon: (i) independence on external and internal Ca2+ sources; (ii) dependence on the SNARE protein synaptobrevin; (iii) sigmoidal dependence with the voltage applied; (iv) the results suggest that the voltage sensor could be the P/Q type Ca2+ channel, which can interact with the exocytotic machinery through its synprint sequence. In summary, our results show that an action potential induces an exocytotic response highly coupled, and synchronous with the stimuli, which depends in part on a mechanism activated by Ca2+ and in part on other mechanism activated directly by voltage. Finally, we demonstrated that this exocytosis, due to its fast vesicular recovery, is able to maintain the secretion under the application of action potentials at basal physiological frequencies.
Cita tipo APA: Moya Díaz, José . (2016-10-25). Mecanismos involucrados en el desarrollo y sostenimiento de la exocitosis altamente acoplada en células cromafines. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6098_MoyaDiaz.pdf Cita tipo Chicago: Moya Díaz, José. "Mecanismos involucrados en el desarrollo y sostenimiento de la exocitosis altamente acoplada en células cromafines". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-25. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6098_MoyaDiaz.pdf |
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Pecorari, Agustín. "Diseño de redes de comunicaciones mediante arquitecturas de p-ciclos y FIPP p-ciclos" (2016-10-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las redes de telecomunicaciones se han convertido en infraestructura fundamental para las economías y las sociedades. Debido a las altísimas velocidades de transferencia de datos, la supervivencia de la red es de primordial importancia. En caso de una falla accidental, es imperativo que la red logre una rápida recuperación para minimizar la pérdida de datos. Las redes de telecomunicaciones supervivientes son aquellas que siguen funcionando a pesar de la ocurrencia de fallas. Y esto se logra redirigiendo el tráfico afectado hacia otros sectores de la red en los cuales se instaló capacidad extra con ese fin. Al diseñar las redes de telecomunicaciones, el objetivo es que se pueda garantizar la protección del tráfico frente a ciertos tipos de fallas con el menor costo posible. Los especialistas desarrollaron inicialmente dos métodos: la protección basada en la restauración de la malla y las topologías basadas en anillos. La tecnología de p-ciclos fue propuesta a finales de la década de 1990 y se convirtió rápidamente en una técnica prometedora debido a que brinda los beneficios combinados de la velocidad de recuperación de la arquitectura de anillo y la eficiencia económica de la arquitectura de malla. Inicialmente se propusieron redes basadas en p-ciclos donde cada ciclo protege la red ante la falla de un vínculo que forma parte del ciclo o de uno que tiene sus dos extremos en éste (cuerda). Años mas tarde se desarrolló el concepto de FIPP p-ciclos (failure independent path protecting p-cycles), en el cual los p-ciclos protegen caminos entre dos de sus nodos. Nuestro trabajo se centra en los problemas de alocación de capacidades de repuesto (Spare Capacity Allocation Problem, SCA) para p-ciclos y FIPP p-ciclos. Estos problemas son NP-difíciles. Evaluamos nuestros resultados utilizando topologías de redes reales (de EEUU y Europa) y artificiales (grafos completos de hasta 12 nodos, K12). Para el primer poblema (SCA) propusimos tres nuevos modelos de programación lineal entera (PLE) y entera mixta (PLEM) que implementamos sobre CPLEX (Branchand- Cut), dos modelos de programación por restricciones (CP) sobre el motor CP de CPLEX, una metaheurística Greedy Randomized Adaptive Search Procedures (GRASP) con búsqueda local exacta y un algoritmo Branch-and-Price exacto. Con este último se obtuvieron excelentes resultados (menos de 1,5% del óptimo) para las instancias artificiales (K12 tiene mas de 59 millones de ciclos posibles). Para las redes reales de hasta 27 nodos obtuvimos resultados de menos de 4,5% del óptimo. Para el segundo problema (FIPP) propusimos un nuevo modelo PLEM que implementamos sobre CPLEX (Branch-and-Cut), un modelo de CP, una metaheurística GRASP con búsqueda local exacta y un algoritmo Branch-and-Price exacto. En este caso, el algoritmo Branch-and-Cut del modelo PLEM resultó ser el más eficiente, obteniendo la solución óptima dentro de los 5 minutos para todas nuestras instancias. Abstract: Telecommunications networks have become fundamental infrastructure for the economy and societies. Due to high speeds of data transfers, network survivability is of major importance. In case of an accidental failure, a fast recovery is imperative to minimize data loss. A telecommunication network is said survivable if it is still able to provide communication between sites it connects after certain component fails. Survivability is achived redirecting traffic to parts of the network where spare capacity have been installed for that porpouse. The objective of survivable network design is to guarantee the protection of the traffic on some failure scenarios at minimum cost. Mesh restoration schemes were widely used in the 1970s and early 1980s. Ring based topologies were introduced in the late 80s based on self-healing rings (SHR) networks technology. In the late 1990s the p-cycle networking concept was proposed. This new technology is reported to simultaneously provide the switching speed and simplicity of rings with the much greater efficiency and exibility for reconfiguration of a mesh network. A single unit capacity p-cycle is a cycle composed of one spare channel on each span it crosses. So a p-cycle provides one protection path for a failed span and it also protects spans that have both end nodes on the cycle but are not themselves on the cycle. In 2005, the FIPP (failure independent path protecting) p-cycle was proposed to protect paths. Our work centers on the Spare Capacity Allocation Problems (SCA) for p-cycles and FIPP p-cycles. These problems are NP-hard. We evaluated our work on topologies of real networks (USA and Europe) and artificial ones (complete graphs up to 12 nodes, K12). For the first problem (SCA) we present three new mixed integer programming (MIP) models implemented on CPLEX (Branch-and-Cut), two constraint programming (CP) models implemented on the CPLEX CP engine, one GRASP metaheuristics algorithm with exact local search and one exact Branch-and-Price algorithm. With the last algorithm we obtained excelents results (less than 1.5% optimality gap) on artificial networks with more than 59 millions cycles. For the real networks instances with up to 27 nodes we obtained less than 4.5% optimality gap. For the second problem (FIPP) we present one new mixed integer programming (MIP) model implemented on CPLEX (Branch-and-Cut), one constraint programming (CP) implemented on the CPLEX CP engine, one GRASP metaheuristics algorithm with exact local search and one exact Branch-and-Price algorithm. In this case the Branch-and- Cut algorithm based on the MIP model is the most efficient, obtaining the optimal solutions within 5 minutes for all our instancies.
Cita tipo APA: Pecorari, Agustín . (2016-10-19). Diseño de redes de comunicaciones mediante arquitecturas de p-ciclos y FIPP p-ciclos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6094_Pecorari.pdf Cita tipo Chicago: Pecorari, Agustín. "Diseño de redes de comunicaciones mediante arquitecturas de p-ciclos y FIPP p-ciclos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6094_Pecorari.pdf |
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Delle Donne, Diego Andrés. "Estudios poliedrales de problemas de coloreo de grafos" (2016-10-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los problemas de coloreo de vértices surgen en una amplia gama de situaciones de la vida real. Ejemplos de ellos son los problemas de asignación de frecuencias en redes de telecomunicaciones, problemas de asignación de aulas a las materias de una universidad e incluso algunos problemas de planificación (scheduling). En general, cualquier problema de asignación de recursos a tareas que contemple incompatibilidades entre pares de tareas para usar el mismo recurso, puede ser visto como un problema de coloreo de los vértices de un grafo. Existen muchas variantes de problemas de coloreo de grafos motivadas generalmente por restricciones reales, tales como Precoloring extension, μ-coloring, (γ, μ)-coloring y List-coloring, entre otras. La programación lineal entera (PLE) ha demostrado ser una herramienta muy adecuada para resolver problemas de optimización combinatoria. En los últimos 15 a˜nos la PLE fue aplicada con éxito a problemas de coloreo de vértices recurriendo a distintas formulaciones para el problema clásico de coloreo tales como el modelo estándar, la formulación por representantes, el orientation model y la formulación por conjuntos independientes, entre otras. Si bien muchos problemas de coloreo de grafos pueden ser resueltos en tiempo polinomial en ciertas familias de grafos, la mayoría de estos problemas no está “bajo control” desde el punto de vista poliedral. Es decir, no se conocen formulaciones de programación lineal entera con descripciones completas de los poliedros asociados. En el contexto de la teoría poliedral, la equivalencia entre los problemas de optimización y separación sugiere que para estos problemas debería existir alguna formulación cuyo problema de separación asociado pueda ser resuelto en tiempo polinomial y, más aun, tal que el poliedro asociado admita una caracterización “elegante”, en términos de desigualdades lineales. La búsqueda de tales caracterizaciones es el objetivo principal del presente trabajo de tesis. El objetivo teórico es completar la contraparte poliedral de aquellos problemas de coloreo de grafos que se encuentren ya bien resueltos por medio de técnicas combinatorias. El estudio de estos poliedros puede llevarnos a un mejor entendimiento de sus estructuras permitiéndonos de esta forma encontrar nuevas familias de grafos para las cuales algunos problemas de coloreo tengan resoluci ón polinomial, aportando así nuevos resultados útiles en la práctica. De este estudio surgen también nuevas familias de desigualdades válidas que pueden incorporarse a algoritmos de planos de corte para contribuir así a mejorar su performance en la práctica. Con estos objetivos, en esta tesis estudiamos los poliedros asociados a cuatro formulaciones distintas para el problema clásico de coloreo: el modelo estándar, la formulación por representantes, el orientation model y la formulación por conjuntos independientes. Presentamos adaptaciones de algunas de estas formulaciones para distintas variantes de coloreo y en algunos casos mostramos que los problemas de optimización en los poliedros asociados son polinomialmente equivalentes al problema de optimización sobre el poliedro de coloreo clásico. Damos caracterizaciones completas de los poliedros de coloreo para grafos que surgen de ciertas operaciones. Para algunas de las formulaciones estudiadas, hallamos descripciones completas de los poliedros asociados a distintas familias de grafos, entre ellas los árboles, grafos block, split y co-interval, entre otras. Estudiamos también la relaci ón entre los poliedros de coloreo Pcol y el poliedro de conjuntos independientes STAB y mostramos que en algunos casos, el primero es una cara del segundo (o hasta coincide con éste) para un grafo asociado al grafo original. Estos resultados nos permiten obtener nuevas familias de desigualdades válidas para Pcol basadas en desigualdades válidas conocidas para STAB. Más aun, a raíz de estos resultados hallamos descripciones completas de Pcol para algunas familias de grafos en las que se conoce una descripción de STAB para el grafo asociado. Presentamos también un estudio poliedral clásico para el orientation model en el cual describimos algunas familias de desigualdades válidas que definen facetas del poliedro asociado. Basados en la estructura de estas familias, presentamos el procedimiento de path lifting, que combina dos desigualdades válidas genéricas y un camino entre dos vértices particulares y genera una familia infinita de desigualdades válidas. Mostramos que este procedimiento puede generar facetas del poliedro de coloreo asociado y damos condiciones suficientes para que esto ocurra. Abstract: Vertex coloring problems arise in a wide range of real-life situations. Some common examples are frequency assignment problems in telecomunication networks, classroom assignment problems at universities and even certain scheduling problems. In general, any problem consisting in the assignment of some resources to jobs with incompatibility conditions among these jobs to use the same resource can be seen as a vertex coloring problem on some graph. There exist many variants of the vertex coloring problem, usually motivated by real restrictions, such as Precoloring extension, µ-coloring, (ɣ, µ)-coloring and List-coloring, among others. Integer linear programming (ILP) has prooved to be a powerful tool to solve combinatorial optimization problems. In the last 15 years it has been successfully applied to vertex coloring problems by resorting to different formulations for the classical coloring problem such as the standard model, the representatives formulation, the orientation model and the independent set formulation, among others. Despite the fact that many vertex coloring problems are polynomially solvable on certain graph classes, most of these problems are not “under control” from a polyhedral point of view. This is, we don’t know integer programming formulations with complete descriptions for the associated polytopes. In the context of polyhedral theory, the equivalence between optimization and separation suggests for these problems the existence of integer programming formulations with polynomially-solvable separation problems and, moreover, whose associated polytopes admit elegant characterizations, in terms of linear inequalities. The search for such characterizations is the main goal of this thesis. The theoretical goal is to complete the polyhedral counterpart of those coloring problems which we know can be solved in polynomial time by means of combinatorial techniques. The study of these polytopes can lead us to a better understanding of their structures revealing some insight by which we can find new classes of graphs where vertex coloring problems are polynomial, thus contributing with new practical results. This study also yields new families of valid inequalities which may be used in cutting plane schemes, thus improving the performance on the resolution of vertex coloring problems. With these objectives, in this thesis we study four different known formulations for the classical graph coloring problem: the standard model, the representatives formulation, the orientation model and the independent set formulation. We present adaptations of some of these formulations for several variants of vertex coloring and, in some cases, we show that the optimization problems associated with the corresponding polytopes are polynomially equivalent to the optimization problem associated to the polytope for the classical vertex coloring problem. We give complete characterizations of coloring polytopes for graphs that are the product of some graph operators. For some of the studied formulations, we found complete descriptions for the associated polytopes to several classes of graphs such as trees, block, split and co-interval graphs, among others. We further study the relation between coloring polytopes Pcol and stable set polytopes STAB and we show that, in some cases, the coloring polytope for a graph G corresponds to a face of (or even coincides with) STAB( ˜G ) for a particular graph ˜G. These results allowed us to deduce new families of valid inequalities for Pcol based on valid inequalities known for STAB. Furthermore, from these results we found complete descriptions for Pcol for some classes of graphs for which STAB is known for the associated graph. We also present a classical polyhedral study of the orientation model, where we introduce new families of facet-inducing valid inequalities. Based on the structure of these families, we introduce the path lifting procedure, which combines two generic valid inequalities and a path between two particular vertices and generates an infinite family of valid inequalities for the associated polytope. We show that this procedure is able to generate facets of the polytope and we give sufficient conditions for this to occur.
Cita tipo APA: Delle Donne, Diego Andrés . (2016-10-11). Estudios poliedrales de problemas de coloreo de grafos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6096_DelleDonne.pdf Cita tipo Chicago: Delle Donne, Diego Andrés. "Estudios poliedrales de problemas de coloreo de grafos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6096_DelleDonne.pdf |
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Bach, Ana Josefina. "Descubrimiento de patrones temporales en un corpus de letras de música folklórica y del rock rioplatense" (2016-10-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Culturomics es la aplicación de recopilación y análisis de datos para el estudio de la cultura humana. La minería de textos temporal se presenta como una herramienta para alcanzar los objetivos de Culturomics, mediante el procesamiento automático y el establecimiento de patrones para explicar la historia. El objetivo de este trabajo fue utilizar técnicas de explotación de datos y aprendizaje automático para detectar la existencia patrones temporales en las letras del rock y del folklore argentino. Para ello se armó un corpus de letras de rock y folklore comprendidas entre 1960 y 2014. A este corpus se le aplicaron técnicas de agrupamiento de tópicos y de clasificación para determinar la existencia de una relación entre los tópicos y los hitos históricos. Abstract: Culturomics is the application of high-throughput data collection and analysis to the study of human culture. Text mining is presented as a useful methodology to achieve the goals of Culturomics, performing automatic processing, and setting patterns to explain history. The aim of this study is to use data mining techniques and machine learning to detect any patterns in Argentine rock and folklore songs throughout history. For this purpose, a corpus of rock and folk song lyrics was built considering the periods between the year 1960 and 2014. This corpus was subject to clustering and classification of topics techniques to determine the presence of a relationship between topics and milestones.
Cita tipo APA: Bach, Ana Josefina . (2016-10-07). Descubrimiento de patrones temporales en un corpus de letras de música folklórica y del rock rioplatense. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6106_Bach.pdf Cita tipo Chicago: Bach, Ana Josefina. "Descubrimiento de patrones temporales en un corpus de letras de música folklórica y del rock rioplatense". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6106_Bach.pdf |
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Villar, María Eugenia. "Estudio de mecanismos de promoción e interferencia de la memoria de reconocimiento de objetos" (2016-10-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La memoria de reconocimiento hace referencia a la habilidad de identificar si un objeto o una situación fueron experimentados previamente. Esta memoria se evidencia en roedores por la tendencia natural a explorar por más tiempo aquellos estímulos novedosos respecto a los familiares. En el presente trabajo nos enfocamos en estudiar el fenómeno de interferencia retroactiva (IR) y de promoción de memorias de reconocimiento, utilizando diferentes versiones de la tarea: Reconocimiento de Objeto en contexto (ROC), Reconocimiento de Objeto Novedoso (RON) y Reconocimiento Espacial de Objetos (REO). Tanto para el fenómeno de IR estudiado en la tarea de ROC (Capítulo 1), y en la tarea de RON (Capítulo 2), como para el fenómeno de promoción estudiado en la tarea de REO (Capítulo 3), se caracterizaron las condiciones requeridas para que estos fenómenos ocurran (influencia del contexto y de los objetos), así como los requisitos temporales y los procesos mnemónicos afectados. Por último, inactivamos o bloqueamos la traducción proteica en el Hipocampo dorsal o en la Corteza medial prefrontal, con el fin de dilucidar si la colaboración o la competencia en el uso de la actividad cerebral o de recursos proteicos pueden explicar los fenómenos de promoción e interferencia de la memoria. Abstract: Recognition memory refers to the ability to identify an object or a situation and judge if it was previously experienced or not (Warburton y Brown, 2010).This memory is evidenced by the natural tendency of rodents to explore more novel over familiar stimuli. In the present work, we focused on retroactive interference (RI) and promotion phenomena in the formation of recognition memories. We used three different versions of it: the Object-in-Context (OIC) task, the Spontaneous Novel Object Recognition (SNOR) and the Object Location (OL) task. For both, the phenomenon of IR discussed in Chapter 1 using the task of ROC and in the Chapter 2 with the task of RON, and the phenomenon of promotion addressed in Chapter 3 using the task of REO, we characterized the temporary effectiveness and the types of inputs required for these phenomena to occur (by accessing the influence of context and objects). Finally, by inactivation or inhibition of protein translation in the dorsal hippocampus or medial prefrontal cortex, we determine whether the collaboration or the competition of brain activity or protein resources can explain the promotion or interference memory phenomena.
Cita tipo APA: Villar, María Eugenia . (2016-10-04). Estudio de mecanismos de promoción e interferencia de la memoria de reconocimiento de objetos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6081_Villar.pdf Cita tipo Chicago: Villar, María Eugenia. "Estudio de mecanismos de promoción e interferencia de la memoria de reconocimiento de objetos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-10-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6081_Villar.pdf |
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Goya, Andrés Fabio. "Renormalización holográfica y campos de espín-2 masivos en tres dimensiones" (2016-09-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis estudiaremos la renormalización holográfica de teorías de campos masivos de espín-2 en espacios Anti-de Sitter (AdS) y no Anti-de Sitter (no-AdS). Más precisamente, estudiaremos teorías de gravedad en 2+1 dimensiones con grados de libertad dinámicos. La principal motivación para estudiar estos modelos proviene de la correspondencia AdS/CFT y los ensayos por extender la misma a espacios asintóticamente no-AdS. Algunas de las extensiones de holograf ía más estudiadas involucran espacios no-AdS como los espacios de Schrödinger, de Lifsthiz y deformaciones "warped" de AdS (WAdS). Los dos primeros han sido propuestos como duales gravitatorios de modelos de materia condensada (con o sin simetría de Galileo, respectivamente) con invariancia de escala anisotrópica. Los espacios WAdS también aparecen en ese contexto, pero surgen además en el estudio de las geometrías de las regiones cercanas al horizonte de los agujeros negros rotantes extremales. Este tipo de geometrías, los espacios de Schrödinger, de Lifsthiz y WAdS, son soluciones de teorías de gravedad con campos de espín-2 masivos sin necesidad de la presencia de materia ni campos adicionales. Así, la gravedad masiva en tres dimensiones aparece como el escenario minimal en el que es posible abordar estos problemas, sin la necesidad de introducir campos de materia artificiales para sostener dichas geometrías. Entre muchas teorías de gravedad masiva en tres dimensiones, se destacan básicamente tres: Topologically Massive Gravity (TMG), New Massive Gravity (NMG), y Zwei-Dreibein Gravity (ZDG). En esta tesis nos dedicaremos a las dos últimas (aunque mencionaremos la relación con la primera), que son las que exhiben invariancia ante paridad. Asimismo, NMG y ZDG comparten la propiedad de corresponder a teorías de campos de espín-2 masivos, con dos grados de libertad locales. NMG es una teoría de derivadas superiores, invariante de paridad, y constituye una completación no-lineal completamente covariante de la teoría de Fierz-Pauli. Por otro lado, ZDG es una teoría de bi-gravedad; es decir, presenta dos campos de espín-2 como entidades dinámicas. Esta última teoría presenta la notable propiedad de ser capaz de lograr unitariedad tanto en el borde como en el bulk del espacio-tiempo, resolviendo por tanto la llamada "inconsistencia bulk-boundary". Además, ZDG tiene como límite particular a NMG, siendo, en un sentido que es necesario precisar, una generalización de ésta última. En esta tesis estudiaremos tanto NMG como ZDG en el contexto de AdS/CFT y de sus generalizaciones no-AdS. Lo haremos con la motivación de investigar cuáles son las propiedades de las teorías de campos duales en estos casos en los que hay gravitones masivos en el bulk. El foco central de nuestro estudio estará en: i) las técnicas de renormalización holográfica tanto en espacios AdS como en espacios no-AdS, ii) la obtención de soluciones exactas AdS y no-AdS que tengan interés en holografía. Un pieza fundamental en el estudio de toda teoría de campos es su tensor de energía-momentos y sus cargas conservadas. El cálculo de las mismas (o de sus valores de expectación en la versión cuántica de la teoría) mediante holografía es una herramienta sumamente útil para caracterizar las teorías del borde (por ejemplo, mediante el cálculo de las anomalías). Por ello, en esta tesis aplicaremos el método de renormalización holográfica en NMG para espacios con condiciones de borde tipo-AdS logarítmicas, lo que nos permitirá comprobar la robustez del método ante deformaciones que incluso cambian el comportamiento del orden más relevante en la expansión asintótica. También exploraremos hasta dónde es posible extender la receta de renormalización holográfica para geometrías no-AdS como los espacios WAdS, agujeros negros asintóticamente WAdS, y defectos angulares inmersos en WAdS que representan partículas masivas. También mostramos que ZDG posee un espectro de soluciones AdS y no-AdS muy rico e interesante para holografía, que incluye tanto espacios con asintóticas AdS diversas, como geometrías con invariancia de escala anisótropa tipo Schrödinger y Lifshitz, así también como espacios AdS x R y espacios WAdS. Esto permite dar el primer paso para considerar esta teoría de bi-gravedad como modelo para investigar extensiones de AdS/CFT. Abstract: In this thesis we will study holographic renormalization in theories with massive spin-2 fields in Anti-de Sitter (AdS) and non-Anti-de Sitter (non-AdS) spaces. More precisely, we will study gravity theories in 2+1 dimensions with dynamical degrees of freedom. The motivation to study these theories has its origin on the AdS/CFT correspondence and the attempts to extend it to spaces with non-AdS asymptotic boundary conditions. Some of the more studied extensions of holography involve non-AdS spaces; for example: Schrödinger spaces, Lifshitz spaces, and warped deformations of AdS space (WAdS). The first two have been proposed as gravity duals of condensed matter systems (with and without Galilei symmetry, respectively) with anisotropic scale invariant symmetry. The WAdS spaces appear in this context too, as well as in the study of near-horizon geometry of extremal rotating black holes. These type of geometries, the Schrödinger, Lifshitz, and WAdS spaces, are solutiones of gravity theories with masive spin-2 fields without any matter content. Hence, three-dimensional massive gravity is the minimal scenario in which it is possible to attack these problems without the addition of artificial matter fields. There are three massive gravity theories in 3D that stand out among others: Topologically Massive Gravity (TMG), New Massive Gravity (NMG), and Zwei-Dreibein Gravity (ZDG). In this thesis we will focus on the last two (even though we will mention the conection with the first one), which exhibit invariance under parity. Additionally, both NMG and ZDG are theories with massive spin-2 fields with two local degrees of freedom. NMG is a higher-derivative parity invariant theory and it is a fully covariant non-linear completion of Fierz-Pauli theory. On the other hand, ZDG is a bi-gravity theory, i.e. it has two spin-2 fields as dynamical entities. This last theory solves the so-called bulk-boundary unitarity clash, in other words, it achieves untarity both in the bulk and in the boundary at the same time. In addition, ZDG contains NMG as a particular limit, thus, ZDG is a generalization of the last one in a sense that must be precised. In this thesis we will study both NMG and ZDG in the context of AdS/CFT and its generalizations to non-AdS spaces. The goal is to investigate the properties of the dual field theories when there are massive gravitons in the bulk. The main focus will be: i) holographic renormalization techniques in AdS and non-AdS spaces, ii) exact AdS and non-AdS solutions relevant for holography. The stress-energy tensor and its associated conserved charges are fundamental quantities of any field theories. Holography is a useful tool to compute them (or their expectation values in the quantum version of the theory) in order to characterize the boundary theories (for instance, by the computation of anomalies). In this thesis we will apply the holographic renormalization method in NMG to spacetimes with logarithmic AdS boundary conditions. The idea is to test the robustness of the method under deformations that modify the leading-order behavior of the asymptotic expansion. We will also explore the possibilty to extend the holographic renormalization procedure to non-AdS geometries like WAdS spaces, asymptotically WAdS black holes, and angular defects that represents massive particles on WAdS spaces. We will show that ZDG has a rich spectrum of AdS and non-AdS solutions relevant in the context of holography; which includes AdS spaces with different asymptotics, as well as geometries with anisotropic scale invariant symmetry, like Schrödinger and Lifshitz spaces, AdS x R and WAdS spaces. This is the first step in order to take into consideration this bi-gravity theory to investigate extensions of AdS/CFT.
Cita tipo APA: Goya, Andrés Fabio . (2016-09-27). Renormalización holográfica y campos de espín-2 masivos en tres dimensiones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6084_Goya.pdf Cita tipo Chicago: Goya, Andrés Fabio. "Renormalización holográfica y campos de espín-2 masivos en tres dimensiones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6084_Goya.pdf |
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Nannavecchia, Paula Silvia. "Contaminación antrópica de los cuerpos de agua. Estudio de su efecto sobre organismos del fitoplancton a escala ecológica y de bioensayos de laboratorio" (2016-09-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se evaluó el impacto de la contaminación sobre organismos del fitoplancton, a nivel ecológico e in vitro. Se caracterizaron las condiciones ecológicas del arroyo Carabassa, contaminado por efluentes industriales y urbanos. Se analizó la composición del fitoplancton y biomarcadores de estrés oxidativo, determinándose un elevado deterioro de sus aguas. Los sitios más contaminados presentaron altas concentraciones de metales y materia orgánica, excediendo los niveles permitidos. Los grupos más abundantes fueron las Chlorophyceae, Cyanobacteria y Euglenophyceae y los parámetros de estrés oxidativo mostraron los valores más altos en el fitoplancton de los sitios más contaminados. Se realizaron bioensayos toxicológicos con microalgas aisladas de un río contaminado por exceso de materia orgánica (MO) y metales pesados (río Matanza). Se estudió la respuesta de Phacus brachykentron a diferentes concentraciones de MO. El aumento de MO determinó una menor tasa de crecimiento y deformaciones celulares. Se modificaron características sistemáticas específicas, lo que implica que organimos considerados como otras especies pueden ser ecomorfos del mismo taxón. Se analizó el efecto del arsenito de sodio sobre el crecimiento, morfología y parámetros de estrés oxidativo de dos cepas de Euglena gracilis, especie cosmopolita que también habita relaves mineros con altas concentraciones de arsénico. Se emplearon cultivos de dos cepas: UTEX (de una colección de cultivos) y MAT (aislada del río Matanza), en medio mineral y orgánico. El arsenito inhibió el crecimiento de manera dosis dependiente, independientemente del medio. Aumentó el contenido de la sustancia de reserva y el diámetro celular. Los resultados sugieren la participación de estrés oxidativo en la toxicidad del arsenito y diferencias en la respuesta antioxidante de ambas cepas. Abstract: The impact of contamination on phytoplankton organisms at an ecological scale and in laboratory bioassays was evaluated. The ecological conditions of the Carabassa stream, which is contaminated by urban and industrial effluents, were characterized. The analysis of the phytoplankton composition and oxidative stress biomarkers determined a high deterioration of its waters. The most contaminated sites had a high concentration of metals and organic material, which exceeded the maximum permitted levels. The most abundant groups were the Chlorophyceae, Cyanobacteria, and Euglenophyceae. The highest oxidative stress responses were measured on the most contaminated sites. Toxicological bioassays were performed in Phacus brachykentron, a microalgae strain isolated from a river contaminated with excess of organic matter (MO) and heavy metals (Matanza River). An increase in MO in the bioassays decreased the growth rate of the organisms and increased cellular deformations. Specific characteristics used to identify this species were modified, thus, organisms that might be consider a different species in the wild might be ecomorphs of the same taxa. The effect of sodium arsenite on the growth, morphology, and the oxidative stress response of Euglena gracilis were analyzed. This species has worldwide distribution and also inhabits mine tailings with high arsenic concentrations. Bioassays were performed in mineral and organic media in two strains: one from a culture collection (UTEX) and another isolated from the Matanza River (MAT). Regardless of the medium the experiments were performed, the arsenic inhibition on the growth rate of both strains was concentration dependent. The cellular reserves and the cellular diameter increased with increased arsenic concentration. The results suggest that oxidative stress could be involved in the toxicity of arsenite in Euglena, with differences in the antioxidant response between both strains.
Cita tipo APA: Nannavecchia, Paula Silvia . (2016-09-23). Contaminación antrópica de los cuerpos de agua. Estudio de su efecto sobre organismos del fitoplancton a escala ecológica y de bioensayos de laboratorio. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6085_Nannavecchia.pdf Cita tipo Chicago: Nannavecchia, Paula Silvia. "Contaminación antrópica de los cuerpos de agua. Estudio de su efecto sobre organismos del fitoplancton a escala ecológica y de bioensayos de laboratorio". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6085_Nannavecchia.pdf |
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Belingheri, Ana Verónica. "Endocitosis rápida en células cromafines de ratón: mecanismos asociados, su regulación por Ca2+ y su participación en el reciclado vesicular" (2016-09-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En las células cromafines se han descripto varios tipos de endocitosis (clatrina dependiente, kiss and run, bulk endocitosis), las cuales contribuyen a la recuperación y el reciclado de la membrana plasmática, de sus proteínas, y de las vesículas que se han fusionado por exocitosis. En esta Tesis doctoral se ha medido electrofisiológicamente la endocitosis rápida en células cromafines de ratón, observándose dos modalidades. Por un lado, una endocitosis compensatoria que evoluciona con una única constante temporal rápida de ~8 seg, e internaliza aproximadamente la misma cantidad de membrana que fue exocitada durante la estimulación. Esta modalidad se dispara en respuesta a una entrada de Ca2+ menor a 79 pC (grupo LCG, por “low current group”). Por otro lado, se identificó una endocitosis en exceso que internaliza una cantidad de membrana mayor a la exocitada previamente, evolucionando con dos constantes temporales, una rápida de cinética similar a la del LCG y una ultra-rápida de ~0,6 seg. Esta última modalidad es disparada por una entrada de Ca2+ mayor a 79 pC (grupo HCG, por “high current group”). Por medio de la utilización de fármacos específicos, se demuestra en esta Tesis que la endocitosis rápida depende específicamente tanto de la entrada de Ca2+ a través de canales dependientes de voltaje (CCDV) de tipo L como del Ca2+ liberado desde el retículo endoplasmático. Además, la utilización de BAPTA demostró que la endocitosis rápida sería dependiente de una señal de Ca2+ localizada. Por otro lado, dos inhibidores del reclutamiento de clatrina inhibieron totalmente la endocitosis en el grupo LCG, y parcialmente en el grupo HCG. Esto sugiere que en este último grupo, se activaría un mecanismo clatrino-independiente. En HCG ambos componentes cinéticos se vieron afectados por los inhibidores de clatrina, sugiriendo que cuando la entrada de Ca2+ es muy alta la endocitosis clatrina-dependiente puede evolucionar a velocidades aún no reportadas en la literatura. Finalmente, experimentos de imaging con FM1-43 mostraron que la endocitosis en exceso inducida por una despolarización con alto K+ se compone de una fracción reciclable a vesículas liberables y de otra no reciclable en un período de 30 minutos, siendo la primera inhibida parcialmente por un bloqueante del reclutamiento de clatrina. Estos resultados en su conjunto nos permiten sugerir un modelo en el cual: (a) la entrada localizada de Ca2+ por CCDV tipo L induce la liberación de más Ca2+ del retículo endoplásmico. (b) El consecuente aumento de este catión induce la activación de una endocitosis clatrina dependiente, que debido a su Ca2+ dependencia se muestra muy rápida al comienzo mientras el Ca2+ alto persiste en el citosol, y más lenta luego de que la concentración citosólica del catión ha disminuido. Esto explicaría la clatrino dependencia de ambos componentes. (c) Esta endocitosis clatrina dependiente resulta parcialmente en la generación de nuevas vesículas liberables. (d) La gran entrada de Ca2+ en el grupo HCG induciría además la activación de un proceso clatrina independiente, que no se recicla en vesículas liberables en los tiempos del experimento. Abstract: Chromaffin cells have various types of endocytosis (clathrin-dependent, kiss and run, bulk endocytosis), which allow the recovery and recycling of membrane and proteins of the previously fused vesicles. We measured two modes of rapid endocytosis in mouse chromaffin cells. On one hand, compensatory endocytosis (compensates approximately the same amount of membrane that was added during stimulation) is associated with a Ca2+ entry lower than 79 pC (LCG group) and a single time constant of ~8 sec. On the other hand, excess retrieval (the endocytosis surpasses the amount of the previously exocytosed membrane), is triggered by a Ca2+ entry bigger than 79 pC (HCG group) and has two time constants, a fast one (~8 sec) and an ultrafast one (~0,6 sec). The results of this Thesis show that the activation of rapid endocytosis is dependent on a localized Ca2+ signal, and specifically depends on Ca2+ influx through L-type voltage dependent Ca2+ channels (VDCC) and Ca2+ released from the endoplasmic reticulum. Additionally, we found that rapid endocytosis is clathrin dependent, almost entirely for the LCG group, and partially for the HCG group. Particularly in HCG, it is interesting that clathrin specific blockers inhibited the fast, but also the ultrafast component, what suggests that clathrin dependent endocytosis can progress at rapid speeds not previously reported when the Ca2+ entry is very big. The electrophysiological study on endocytosis was complemented with experiments of imaging using the membrane fluorescent probe FM1-43. After applying a high K+ depolarization that allows a large Ca2+ influx, we recorded an endocytosis that surpassed the previous exocytosis. We found that the internalized membrane was partially recycled to releasable vesicles, by a mechanism that is at least in part clathrin dependent. There was also a large internalized membrane fraction which was not releasable during the experimental period. We propose a tentative model in which: (a) Ca2+ entry through L-type VDCC triggers the release of more Ca2+ from endoplasmic reticulum; (b) the resulting increase of Ca2+ activates a rapid clathrin dependent endocytosis, and particularly in HCG the higher Ca2+ concentration during the first hundreds of milliseconds after the stimulus provokes the appearance of the ultrafast component; (c) clathrin dependent endocytosis partially results in the generation of new releasable vesicles in less than 30 min; (d) in HCG, the high Ca2+ entry also provokes the activation of a clathrin independent endocytosis that does not produce releasable vesicles in the experimental period.
Cita tipo APA: Belingheri, Ana Verónica . (2016-09-22). Endocitosis rápida en células cromafines de ratón: mecanismos asociados, su regulación por Ca2+ y su participación en el reciclado vesicular. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6083_Belingheri.pdf Cita tipo Chicago: Belingheri, Ana Verónica. "Endocitosis rápida en células cromafines de ratón: mecanismos asociados, su regulación por Ca2+ y su participación en el reciclado vesicular". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6083_Belingheri.pdf |
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Tolosa, Gabriel Hernán. "Técnicas de caching de intersecciones en motores de búsqueda" (2016-09-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los motores de búsqueda procesan enormes cantidades de datos (páginas web) para construir estructuras sofisticadas que soportan la búsqueda. La cantidad cada vez mayor de usuarios e información disponible en la web impone retos de rendimiento y el procesamiento de las consultas (queries) consume una cantidad significativa de recursos computacionales. En este contexto, se requieren muchas técnicas de optimización para manejar una alta carga de consultas. Uno de los mecanismos más importantes para abordar este tipo de problemas es el uso de cachés (caching), que básicamente consiste en mantener en memoria items utilizados previamente, en base a sus patrones de frecuencia, tiempo de aparición o costo. La arquitectura típica de un motor de búsqueda está compuesta por un nodo front- end (broker) que proporciona la interfaz de usuario y un conjunto (grande) de nodos de búsqueda que almacenan los datos y soportan las búsquedas. En este contexto, el almacenamiento en caché se puede implementar en varios niveles. A nivel del broker se mantiene generalmente un caché de resultados (results caché). Éste almacena la lista final de los resultados correspondientes a las consultas más frecuentes o recientes. Además, un caché de listas de posteo (posting list caché) se implementa en cada nodo de búsqueda. Este caché almacena en memoria las listas de posteo de términos populares o valiosos, para evitar el acceso al disco. Complementariamente, se puede implementar un caché de interscciones (intersection caché) para obtener mejoras de rendimiento adicionales. En este caso, se intenta explotar aquellos pares de términos que ocurren con mayor frecuencia guardando en la memoria del nodo de búsqueda el resultado de la intersección de las correspondientes listas invertidas de los términos (ahorrando no sólo tiempo de acceso a disco, sino también tiempo de CPU). Todos los tipos de caché se gestionan mediante una "política de reemplazo", la cual decide si va a desalojar algunas entradas del caché en el caso de que un elemento requiera ser insertado o no. Esta política desaloja idealmente entradas que son poco probables de que vayan a ser utilizadas nuevamente o aquellas que se espera que proporcionen un beneficio menor. Esta tesis se enfoca en el nivel del Intersection caché utilizando políticas de reemplazo que consideran el costo de los items para desalojar un elemento (cost-aware policies). Se diseñan, analizan y evalúan políticas de reemplazo estáticas, dinámicas e híbridas, adaptando algunos algoritmos utilizados en otros dominios a éste. Estas políticas se combinan con diferentes estrategias de resolución de las consultas y se diseñan algunas que aprovechan la existencia del caché de intersecciones, reordenando los términos de la consulta de una manera particular. También se explora la posibilidad de reservar todo el espacio de memoria asignada al almacenamiento en caché en los nodos de búsqueda para un nuevo caché integrado (Integrated caché) y se propone una versión estática que sustituye tanto al caché de listas de posting como al de intersecciones. Se diseña una estrategia de gestión específica para este caché que evita la duplicación de términos almacenados y, además, se tienen en cuenta diferentes estrategias para inicializar este nuevo Integrated caché. Por último, se propone, diseña y evalúa una política de admisión para el caché de intersecciones basada en principios del Aprendizaje Automático (Machine Learning) que reduce al mínimo el almacenamiento de pares de términos que no proporcionan suficiente beneficio. Se lo modela como un problema de clasificación con el objetivo de identificar los pares de términos que aparecen con poca frecuencia en el flujo de consultas. Los resultados experimentales de la aplicación de todos los métodos propuestos utilizando conjuntos de datos reales y un entorno de simulación muestran que se obtienen mejoras interesantes, incluso en este hiper-optimizado campo. Abstract: Search Engines process huge amounts of data (i.e. web pages) to build sophisticated structures that support search. The ever growing amount of users and information available on the web impose performance challenges and query processing consumes a significant amount of computational resources. In this context, many optimization techniques are required to cope with heavy query trafic. One of the most important mechanisms to address this kind of problems is caching, that basically consists of keeping in memory previously used items, based on its frequency, recency or cost patterns. A typical architecture of a search engine is composed of a front-end node (broker) that provides the user interface and a cluster of a large number of search nodes that store the data and support search. In this context, caching can be implemented at several levels. At broker level, a results cache is generally maintained. This stores the final list of results corresponding to the most frequent or recent queries. A posting list cache is implemented at each node that simply stores in a memory buffer the posting lists of popular or valuable terms, to avoid accessing disk. Complementarily, an intersection cache may be implemented to obtain additional performance gains. This cache attempts to exploit frequently occurring pairs of terms by keeping the results of intersecting the corresponding inverted lists in the memory of the search node (saving not only disk access time but CPU time as well). All cache types are managed using a so-called "replacement policy" that decides whether to evict some entry from the cache in the case of a cache miss or not. This policy ideally evicts entries that are unlikely to be a hit or those that are expected to provide less benefit. In this thesis we focus on the Intersection Cache level using cost-aware caching policies, that is, those policies that take into account the cost of the queries to evict an item from cache. We carefully design, analyze and evaluate static, dynamic and hybrid costaware eviction policies adapting some cost-aware policies from other domains to ours. These policies are combined with different query-evaluation strategies, some of them originally designed to take benefit of the existence of an intersection cache by reordering the query terms in a particular way. We also explore the possibility of reserving the whole memory space allocated to caching at search nodes to a new integrated cache and propose a static cache (namely Integrated Cache) that replaces both list and intersection caches. We design a specific cache management strategy that avoids the duplication of cached terms and we also consider different strategies to populate the integrated cache. Finally, we design and evaluate an admission policy for the Intersection Cache based in Machine Learning principles that minimize caching pair of terms that do not provide enough advantage. We model this as a classification problem with the aim of identifying those pairs of terms that appear infrequently in the query stream. The experimental results from applying all the proposed approaches using real datasets on a simulation framework show that we obtain useful improvements over the baseline even in this already hyper-optimized field.
Cita tipo APA: Tolosa, Gabriel Hernán . (2016-09-19). Técnicas de caching de intersecciones en motores de búsqueda. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6131_Tolosa.pdf Cita tipo Chicago: Tolosa, Gabriel Hernán. "Técnicas de caching de intersecciones en motores de búsqueda". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6131_Tolosa.pdf |
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Zalcman, Gisela Patricia. "Regulación de la expresión de genes de respuesta temprana y tardía en la formación y mantenimiento de la memoria de largo término" (2016-09-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: A lo largo de los últimos años, se ha acumulado una vasta evidencia experimental señalando a NF-κB como uno de los factores de transcripción (FT) más relevantes en la formación y reprocesamiento de memorias de largo término (MLT) en distintos modelos animales y tareas de aprendizaje. Sin embargo, poco se sabe de los genes que son regulados por este FT durante procesos mnésicos. El objetivo de mi tesis fue identificar y caracterizar algunos de los genes que son regulados por este FT durante la consolidación de la memoria de reconocimiento de objetos en el hipocampo de ratón. Los resultados obtenidos indican que durante este proceso, NF-κB regula la expresión de genes de respuesta temprana y tardía, en particular, del FT ZIF268 y de la proteinquinasa Ca(2+)-Calmodulina-quinasa II δ (CaMKIIδ), una sub-unidad de CaMKII cuya función en el sistema nervioso central se desconoce. El entrenamiento al paradigma de Reconocimiento de Objetos Novedosos, que lleva a la formación de una memoria de reconocimiento de largo término, indujo la expresión de ambos genes. ZIF268 se expresa de manera rápida y transitoria dentro de las primeras horas postentrenamiento y su expresión es necesaria para la formación de una MLT. Por el contrario, la expresión de CaMKIIδ se induce en forma tardía y sostenida, y persiste hasta por lo menos 7 días luego del entrenamiento. Sorprendentemente, nuestros resultados indican que CaMKIIδ no afecta la formación de la MLT, sino la formación y mantenimiento de una forma de MLT más persistente. A continuación, mostramos que la ocupación nucleosomal en ciertas regiones claves del promotor de CaMKIIδ se ve afectada hasta 7 días luego del entrenamiento. Esta es la primera vez que se demuestra que este tipo de modificaciones epigenéticas tienen lugar durante la formación y mantenimiento de la MLT. Por último, hallamos que, en neuronas piramidales del hipocampo, CaMKIIδ se localiza principalmente en el núcleo, dendritas y terminales pre-sinapticas. Nuestros estudios funcionales, junto con los de localización sub-celular aportan los primeros indicios respecto a los mecanismos moleculares en los que podría intervenir CaMKIIδ en el sistema nervioso central. Abstract: An important body of evidence supports NF-kappaB as one of the most relevant transcription factors (TF) involved in the consolidation of long-term memories (LTM) in different animal models and behavioural tasks. However, little is known about the genes that are regulated by this TF in mnemonic processes. The aim of my PhD research was to identify and characterize some of the genes that are regulated by this TF during the consolidation of object recognition memory in the mouse hippocampus. The results obtained indicate that during this process NF-kappaB regulates the expression of immediate-early and late genes, which include TF ZIF268 and Calcium- Calmodulin Kinase II δ- (CaMKIIδ), an isoform of CaMKII whose precise function in the central nervous system is unknown. Training on the Novel Object Recognition task, which leads to the formation of an object recognition LTM, induced the expression of both genes. Zif268 was expressed rapidly and transiently within the first hours after training and its expression was required for the formation of LTM. On the contrary, CaMKIIδ expression was induced in a late and sustained manner, being up-regulated upto 7 days after training. Surprisingly, inhibition of CaMKIIδ expression did not affect the formation of LTM, but it impaired the formation and mainteinance of a persistenf form of LTM. Moreover, we showed that nucleosomal occupancy in certain key regions of CaMKIIδ promoter was affected as a result of NOR training upto 7 days later. This is the first evidence that this type of epigenetic modification occurs during the formation and mainteinance of LTM. Finally, we found that in hippocampal pyramidal neurons, CaMKIIδ is primarily located in the nucleus, dendrites and pre-synaptic terminals. The information on its subcellular-localization together with our functional studies provide the first hint regarding the signaling mechanisms that may be affected by CaMKIIδ in the CNS.
Cita tipo APA: Zalcman, Gisela Patricia . (2016-09-15). Regulación de la expresión de genes de respuesta temprana y tardía en la formación y mantenimiento de la memoria de largo término. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6074_Zalcman.pdf Cita tipo Chicago: Zalcman, Gisela Patricia. "Regulación de la expresión de genes de respuesta temprana y tardía en la formación y mantenimiento de la memoria de largo término". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6074_Zalcman.pdf |
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Scarola, Cristian. "Problemas nodales inversos para ecuaciones ordinarias de segundo orden" (2016-09-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis centramos nuestra atención en la ecuación de Sturm-Liouville de segundo orden -u''= λρ(x)u, x ∈ (0,1), con cierta condición de borde homogénea. Estudiamos la densidad asintótica de los ceros de las autofunciones y analizamos el problema inverso de caracterizar la función peso ρ a partir de los ceros. Consideramos también el problema para el operador Δμ, definido a partir de una medida Boreliana μ soportada en un conjunto posiblemente fractal, y estudiamos cuándo y cómo puede recuperarse el peso en este caso. Para este problema es necesario un mayor análisis del crecimiento de los autovalores, y de la dimensión espectral asociada a μ. Proponemos una dimensión que acota superiormente la dimensión espectral de estos operadores, y obtenemos cotas inferiores de los autovalores. Abstract: In this thesis we focus on the second order Sturm-Liouville equation -u''= λρ(x)u, x ∈ (0,1), with some homogeneous boundary condition. We study the asymptotic density of zeros of eigenfunctions and the inverse problem of characterizing the weight function ρ knowing the zeros of eigenfunctions. Given a Borel measure μ, we also study this problem for fractal Laplacians Δμ. However, a deeper knowledge of the eigenvalues and the spectral dimension is needed, so we propose a new fractal dimension which bounds by above the spectral dimension, and we obtain lower bounds for the eigenvalues.
Cita tipo APA: Scarola, Cristian . (2016-09-14). Problemas nodales inversos para ecuaciones ordinarias de segundo orden. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6075_Scarola.pdf Cita tipo Chicago: Scarola, Cristian. "Problemas nodales inversos para ecuaciones ordinarias de segundo orden". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6075_Scarola.pdf |
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Smucler, Ezequiel. "Estimadores robustos para el modelo de regresión lineal con datos de alta dimensión" (2016-09-13). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los estimadores de regresión penalizados son una herramienta popular para analizar conjuntos de datos ralos y de alta dimensión. Sin embargo, los estimadores de regresión penalizados definidos utilizando funciones de pérdida no acotadas, como la pérdida cuadrática, pueden verse muy afectados por la presencia de observaciones atípicas en la muestra, especialmente aquellas de alto leverage, y por lo tanto no son robustos. Esta tesis consiste de dos partes. En la primera, proponemos una familia de estimadores penalizados para la estimación robusta en modelos lineales ralos y de alta dimensión basados en los MM-estimadores de Yohai (1987). Estudiamos las propiedades asintóticas de estos estimadores en modelos lineales con una cantidad fija de variables predictoras aleatorias. Proponemos un algoritmo para computar una subfamilia de los estimadores propuestos. Las ventajas relativas que ofrecen los estimadores propuestos son demostradas mediante un extenso estudio de simulación y el análisis de un conjunto de datos reales. Esta primer parte está basada en Smucler and Yohai (2015 b). En la segunda parte, estudiamos las propiedades asintóticas de los estimadores propuestos en modelos lineales con un número de variables predictoras fijas que diverge, dentro del régimen p << n. Probamos la consistencia de los estimadores asumiendo solo p/n → 0, y que si la función de penalización es elegida convenientemente entonces los estimadores resultantes tienen la propiedad oráculo definida en Fan and Li (2001). La misma técnica de demostración nos permite probar la consistencia y derivar la distribución asintótica de M-estimadores de regresión definidos utilizando una función de perdida acotada y un estimador de escala, en modelos lineales con un número de variables predictoras fijas que diverge. En particular, probamos la consistencia y derivamos la distribución asintótica de los S-estimadores (Rousseeuw and Yohai (1984)) y MM-estimadores de regresión. Abstract: Penalized regression estimators are a popular tool for the analysis of sparse and high-dimensional data sets. However, penalized regression estimators defined using unbounded loss functions, such as the quadratic loss, can be very sensitive to the presence of outlying observations, especially high leverage outliers, and hence are not robust. This thesis consists of two parts. In the first one, we propose a family of penalized estimators for robust estimation in sparse and high-dimensional linear models based on the MM-estimators of Yohai (1987). We study the asymptotic properties of these estimators in linear models with a fixed number of random predictor variables. We propose an algorithm to compute a subset of this family. The relative advantages of these estimators are demonstrated through an extensive simulation study and the analysis of a real high-dimensional data set. This first part is based on Smucler and Yohai (2015 b). In the second part, we study the asymptotic properties of the proposed estimators in linear models with a diverging number of fixed predictor variables in the p << n regime. We prove the consistency of the estimators assuming only p/n → 0 and that if the penalty function is chosen appropriately then the resulting estimators have the oracle property of Fan and Li (2001). The same proof technique allows us to prove the consistency and derive the asymptotic distribution of regression M-estimators defined using a bounded loss function and an estimate of scale, in linear models with a diverging number of fixed predictor variables. In particular, we prove the consistency and derive the asymptotic distribution of S-estimators (Rousseeuw and Yohai (1984)) and MM-estimators.
Cita tipo APA: Smucler, Ezequiel . (2016-09-13). Estimadores robustos para el modelo de regresión lineal con datos de alta dimensión. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6087_Smucler.pdf Cita tipo Chicago: Smucler, Ezequiel. "Estimadores robustos para el modelo de regresión lineal con datos de alta dimensión". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-13. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6087_Smucler.pdf |
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Tubert, Cecilia. "Canales Kv1.3 median la hiperexcitabilidad de las interneuronas colinérgicas estriatales en un modelo de ratón de la enfermedad de Parkinson" (2016-09-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La acetilcolina moduladores de la función córticoestriatal. Desbalances en su disponibilidad pueden resultar en desórdenes neuropsiquiátricos como la enfermedad de Parkinson. La acetilcolina es liberada por las interneuronas colinérgicas estriatales (ICE), que presentan actividad tónica dependiente de mecanismos intrínsecos, y respuestas fásicas a entradas excitatorias talámicas que codifican eventos ambientales relevantes como recompensas. Un trabajo reciente demostró que las ICE se encuentran hiperactivas en un modelo de rata de la enfermedad de Parkinson. Nuestro primer objetivo fue identificar las corrientes que regulan la excitabilidad de las ICE en rodajas de cerebro de ratón, utilizando la acomodación (disminución de la descarga de potenciales de acción durante una despolarización sostenida) como indicador. Encontramos que la margatoxina, así como otros bloqueantes selectivos y el knock out de la subunidad Kv1.3, reducen fuertemente la acomodación de las ICE y la corriente de K+ subyacente. También encontramos que este canal regula la actividad tónica de estas neuronas, como así también la integración sináptica de inputs glutamatérgicos. Sorprendentemente, también encontramos que este canal participa de la corriente IsAHP de las ICE, descripta clásicamente como una corriente de K+ sensible a Ca2+, pero de la cual hasta el momento no se habían identificado sus componentes. Luego nos propusimos evaluar si cambios en los canales que contienen la subunidad Kv1.3 contribuyen generar las alteraciones de excitabilidad que se observan en ICE de ratones modelo de la enfermedad de Parkinson. Observamos que, al igual que en ratas, las ICE tienen una excitabilidad aumentada en ratones modelos de la enfermedad de Parkinson, la cual es insensible a la margatoxina. También encontramos que las ICE de los ratones parkinsonianos poseen una integración sináptica aumentada y que las corrientes sensibles a margatoxina son de menor amplitud. En conjunto, nuestros resultados revelan un rol importante de los canales que contienen la subunidad Kv1.3 en la excitabilidad de las ICE, en la regulación de su actividad tónica y en la integración de señales externas. En animales modelo de la enfermedad de Parkinson la función de estos canales estaría alterada, contribuyendo a su fenotipo hiperexcitable. Estos resultados nos permiten pensar en los canales Kv1.3 como un potencial nuevo blanco terapéutico para el tratamiento de la enfermedad de Parkinson. Abstract: Acetylcholine (ACh) and dopamine are the main modulators of corticostriatal function. Disbalances in their availability may result in neuropsychiatric disorders like Parkinson´s disease (PD). ACh is released by striatal cholinergic interneurons (SCINs), which present tonic activity that depends on intrinsic mechanisms, and phasic responses to excitatory thalamic inputs that codify salient stimuli like rewards. Recent work showed hyperactive SCINs in a rat model of PD. Here our first aim was to identify currents that regulate SCINs excitability in mouse brain slices, using accommodation (reduction of firing during a sustained depolarization) as an index of excitability. Our results show that margatoxin, as well as other selective blockers and the knock-out of Kv1.3 subunit, reduce accommodation and the underlying K+ current in SCINs. We also found that this channel regulates tonic activity and integration of glutamateric inputs in SCINs. Surprisingly, we also found that in SCINs this channel contributes to the IsAHP current, which so far is described as a Ca2+ dependent K+ current whose molecular correlates have not been identified. We then decided to evaluate if changes in the kv1.3 current contribute to alterations observed in SCINs excitability in a mouse model of PD. As it is the case in rats, SCINs become hyperactive after chronic nigrostrital degeneration in the mouse. Importantly, hiperexcitable SCINs are insensitive to margatoxin in the mouse PD model. Moreover, SCINs of parkinsonian mice have an increased synaptic integration and smaller margatoxin sensitive currents compared to sham mice SCINs. Altogether, our results reveal an important role of channels containing Kv1.3 subunit in SCINs excitability, in the regulation of their tonic activity and in their synaptic integration of external signals. In PD the function of these channels might be altered, contributing to their hyperexcitable phenotype. These results let as nominate Kv1.3 channels as potential new target of antiparkinsonian therapy.
Cita tipo APA: Tubert, Cecilia . (2016-09-01). Canales Kv1.3 median la hiperexcitabilidad de las interneuronas colinérgicas estriatales en un modelo de ratón de la enfermedad de Parkinson. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6056_Tubert.pdf Cita tipo Chicago: Tubert, Cecilia. "Canales Kv1.3 median la hiperexcitabilidad de las interneuronas colinérgicas estriatales en un modelo de ratón de la enfermedad de Parkinson". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-09-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6056_Tubert.pdf |
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Fernández, Natalia Brenda. "Caracterización de los mecanismos moleculares y celulares activados por ROR1 durante la progresión de melanoma" (2016-08-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El receptor huérfano de tipo tirosina quinasa, ROR1, se expresa y cumple diversas funciones durante el desarrollo embrionario, mientras que en la adultez, su expresión en los tejidos normales es baja o nula. Sin embargo, se ha descripto que ROR1 se expresa abundantemente en diversos tipos de tumores y leucemias. A su vez, ROR1 actúa como un receptor celular de Wnt5a, un ligando extracelular que ha sido implicado en la tumorigénesis. Es por esto que decidimos determinar la expresión y participación de ROR1 en los procesos celulares y moleculares implicados en la progresión de melanoma. Nuestros resultados indican que ROR1 se expresa en líneas celulares y muestras tumorales de melanoma humano, y que su expresión se asocia con una menor sobrevida postrecurrencia de los pacientes. Empleando estrategias de pérdida y ganancia de función determinamos que ROR1 favorece el crecimiento celular, tanto de manera dependiente como independiente de un sustrato sólido. A su vez, ROR1 disminuye la adhesión y aumenta la motilidad y migración de las células de melanoma. Estos procesos son mediados, en parte, a través de la regulación positiva de la vía de Akt y del aumento de la expresión de los marcadores mesenquimales N-cadherina y vimentina. La regulación de N-cadherina depende tanto de la presencia de ROR1 como de la activación de la vía de Akt. En conclusión, demostramos que ROR1 contribuye a la progresión de melanoma y constituye un posible nuevo marcador pronóstico y blanco terapéutico. Abstract: The Receptor tyrosine kinase-like Orphan Receptor 1, ROR1, is primarily expressed during different stages of embryogenesis, while in the adult its expression in the normal tissues is downregulated. However, it has been shown that ROR1 re-express in various types of cancers and leukaemias. Interestingly, ROR1 acts as a Wnt5a receptor, an extracellular ligand that has been implicated in tumorigenesis. For these reasons, we decided to study ROR1 expression in melanoma and its role in the cellular and molecular processes implicated in melanoma progression. Here we show that ROR1 is aberrantly expressed in melanoma cell lines and tumours, and that its expression associates with poor post-recurrence survival of patients with melanoma. Using gain- and loss-of-function approaches we found that ROR1 enhances both anchoragedependent and -independent growth of melanoma cells. In addition, ROR1 decreases cell adhesion and increases cell motility and migration. These processes are mediated, in part, by an upregulation of the Akt pathway and an increased expression of the mesenquimal markers N-cadherin and vimentin. The regulation of N-cadherin relies on the presence of ROR1 and the activation of Akt. In summary, we show that ROR1 contributes to melanoma progression and is a candidate biomarker and a prospective therapy target.
Cita tipo APA: Fernández, Natalia Brenda . (2016-08-30). Caracterización de los mecanismos moleculares y celulares activados por ROR1 durante la progresión de melanoma. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6073_Fernandez.pdf Cita tipo Chicago: Fernández, Natalia Brenda. "Caracterización de los mecanismos moleculares y celulares activados por ROR1 durante la progresión de melanoma". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6073_Fernandez.pdf |
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Guerrero León, Beatriz Alexandra. "Nanopartículas cargadas con antioxidantes naturales para el desarrollo de films biodegradables para la preservación de alimentos" (2016-08-26). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de este estudio fue optimizar la producción y caracterizar nanopartículas cargadas con un extracto de antioxidantes provenientes de la piel de la batata. En primera instancia se realizó la obtención y caracterización del extracto de la piel de batata, variedad Arapey. Se determinó la presencia de cinco ácidos fenólicos en altas concentraciones: ácido clorogénico, ácido cafeico y tres isómeros de dicafeoilquínicos. Además se realizó un análisis térmico en el cual se determinó que las primeras degradaciones en el extracto comienzan a partir de los 135°C, y que el método propuesto para la encapsulación no interfiere en las propiedades de los antioxidantes. Para la producción de nanopartículas se utilizó el método de emulsificación evaporación. Se partió de ácido poliláctico (PLA) de bajos pesos moleculares, previamente sintetizados en el laboratorio, para optimizar el método se realizaron tres síntesis de nanopartículas de PLA, modificando variables como el tiempo de centrifugado y el peso molecular del PLA. La caracterización se realizó por microscopia electrónica de barrido (SEM) y dispersión dinámica de luz (DLS). A partir del ensayo que presentó las mejores morfologías y distribuciones de tamaño, se realizó la encapsulación del extracto. La eficiencia de encapsulación del extracto en las nanopartículas de PLA fue evaluada observando el efecto que tiene el sistema de solventes de la fase orgánica, el peso molecular del PLA, la velocidad y tiempo de centrifugación y la concentración del extracto. Las nanopartículas obtenidas se caracterizaron por SEM, DLS y se calculó la eficiencia de encapsulación en porcentaje (E.E%). Se realizó un avance en el desarrollo de materiales compuestos de ácido poliláctico con las nanopartículas previamente cargadas con los antioxidantes. Los films fueron caracterizados por SEM observándose la existencia de una alta compatibilidad entre el PLA comercial utilizado para la matriz y el PLA sintetizado en el laboratorio con el cual se preparó las nanopartículas. Abstract: The objective of this study was to optimize production and characterize loaded nanoparticles with antioxidants extracted from sweet potato skin. In the first instance the preparation and characterization of skin extract sweet potato variety Arapey was made. The presence of five phenolic acids in high concentrations was determined: chlorogenic acid, caffeic acid and three isomers of dicaffeoylquinic acid. Furthermore, a thermal analysis in which it was determined that the first degradations of the extract start from 135 °C, and that the technique proposed for encapsulation does not interfere with the antioxidants properties was performed. The evaporation emulsion technique was used for production of nanoparticles. It began with low molecular weight polylactic acid (PLA) previously synthesized in the laboratory, to optimize the method, three PLA nanoparticles synthesis were made by modifying variables as time centrifuged and the molecular weight of PLA. The characterization was performed by scanning electron microscopy (SEM) and dynamic light scattering (DLS). From the trial that presented the best morphologies and size distributions, encapsulation of the extract was made. The encapsulation efficiency of extract PLA nanoparticles was evaluated by observing the effect of the solvent system of the organic phase, the molecular weight of PLA, speed and time of centrifugation and the concentration of the extract. The obtained nanoparticles were characterized by SEM, DLS and the encapsulation efficiency in percent (E.E. %) was calculated. Progress was made in developing polylactic acid composites with nanoparticles loaded with antioxidants previously. The films were characterized by SEM observing the existence of high compatibility between the commercial PLA used as matrix and PLA synthesized in the laboratory with which nanoparticles was prepared.
Cita tipo APA: Guerrero León, Beatriz Alexandra . (2016-08-26). Nanopartículas cargadas con antioxidantes naturales para el desarrollo de films biodegradables para la preservación de alimentos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6060_GuerreroLeon.pdf Cita tipo Chicago: Guerrero León, Beatriz Alexandra. "Nanopartículas cargadas con antioxidantes naturales para el desarrollo de films biodegradables para la preservación de alimentos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6060_GuerreroLeon.pdf |
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Guerra Navarro, Carolina Isabel. "Comportamiento de alimentación de las aves insectívoras del desierto del Monte central: aspectos espaciales y temporales" (2016-08-26). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo se estudió el comportamiento de alimentación de tres especies de aves insectívoras en el desierto del Monte central: Stigmatura budytoides, Poospiza torquata y Serpophaga griseicapilla. Se evaluó la selección de especies de plantas como sitios de alimentación, el comportamiento de búsqueda del alimento y las maniobras utilizadas por las aves para capturar a sus presas. El comportamiento fue analizado tanto a escala espacial (entre ambientes con diferente estructura de la vegetación: algarrobales y jarillales), como a escala temporal (cambios estacionales e interanuales). Durante las estaciones de primavera-verano las tres especies de aves mostraron un fuerte patrón de selección por Prosopis flexuosa (algarrobo) como sitio de alimentación en los dos tipos de ambientes estudiados. Además, para S. budytoides este patrón se mantuvo durante el otoño-invierno. Comparado con el resto de las especies leñosas, la mayor abundancia y biomasa de artrópodos por individuo de algarrobo, tanto en la época estival como la invernal, podría estar explicando esta selección por parte de las tres especies. No obstante, se registraron para S. budytoides cambios estacionales en el uso de maniobras de captura. Durante la época invernal se observó un mayor uso de maniobras aéreas y menor uso de maniobras de recolección comparado con las temporadas de primavera-verano; esto podría deberse a los cambios en el tipo de artrópodos y sus abundancias. Las tres especies de aves variaron interanualmente el uso de los distintos tipos de movimientos de búsqueda, y en S. griseicapilla se observó además una variación interanual en el tipo de maniobras de captura utilizado. La variación en los tipos y tamaños de presas podría haber determinado los cambios observados interanualmente en el comportamiento de las aves. A escala espacial no se encontraron diferencias en el comportamiento de las aves a pesar de las diferencias estructurales de los ambientes estudiados. La flexibilidad encontrada en algunas variables del comportamiento de alimentación de las aves estudiadas aporta información sobre los posibles mecanismos que les permitirían mantener el patrón de selección por Prosopis flexuosa como sitio de alimentación en la porción central del desierto del Monte. Abstract: I studied the foraging behavior of three species of insectivorous birds in central Monte desert: Stigmatura budytoides, Poospiza torquata and Serpophaga griseicapilla. For each species I evaluated their selection of plant species as feeding sites, searching behavior, and maneuvers used to capture prey. I also evaluated the changes in their foraging behavior both at a temporal (seasonal and interannual) and spatial scale (i.e., between two habitats with different vegetation structure: mesquite open woodland and creosotebush shrubland). The three bird species strongly selected Prosopis flexuosa (mesquite) as feeding site on both habitat types during spring-summer. Stigmatura budytoides also selected P. flexuosa during autumn-winter despite phenological changes of these trees. Prosopis flexuosa showed the highest arthropod abundance and biomass per individual plant (both in summer and winter), which could explain the strong selection patterns observed in the insectivorous birds. The maneuvers, used for catching prey by S. budytoides changed seasonally (with more aerial maneuvers used and less use of gleaning maneuvers in autumn-winter, compared to the spring-summer seasons); probably due to the seasonal changes in the abundance and types of arthropods by the loss of foliage in P. flexuosa trees. The three bird species showed interannual variation in their searching movements, and S. griseicapilla also showed interannual variation in the type of capture maneuvers. Interannual variation in prey type and size could have determined the observed changes in the bird behavior. I did not observe differences at the spatial scale, since foraging behavior was similar in both habitats. The flexibility in some foraging behavior variables observed in the bird species studied in this thesis, provides information on the possible mechanisms that would allow these birds to maintain a strong selection for P. flexuosa trees as feeding site in central Monte desert.
Cita tipo APA: Guerra Navarro, Carolina Isabel . (2016-08-26). Comportamiento de alimentación de las aves insectívoras del desierto del Monte central: aspectos espaciales y temporales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6078_GuerraNavarro.pdf Cita tipo Chicago: Guerra Navarro, Carolina Isabel. "Comportamiento de alimentación de las aves insectívoras del desierto del Monte central: aspectos espaciales y temporales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6078_GuerraNavarro.pdf |
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Carmona Córdova, Sandra Juliana. "Control de calidad de ¨Maíz Morado¨ (Zea Mays L.- Poaceae, raza ¨Culli¨): estudio farmacobotánico, análisis de antocianos y actividad antioxidante" (2016-08-26). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El “maíz morado”, es la variedad morada de Zea mays L. originaria de Perú, Bolivia y del Nordeste Argentino. Es empleada en la elaboración de “chicha morada”, “mazamorra morada” y “api”. El objetivo del trabajo fue determinar los parámetros farmacobotánicos y fitoquímicos (polifenoles) aplicables al control de calidad de muestras de “maíz morado” en el marco de un laboratorio de baja complejidad. Se analizaron muestras vegetales y muestras industrializadas que indicaban al “maíz morado” como parte de su composición. Se realizaron disociados y cortes en el estudio farmacobotánico y cocimientos (extracto acuoso), extractos etanólicos y metanólicos para el estudio de polifenoles. El análisis microscópico para las muestras vegetales nos permitió observar caracteres presentes en el grano, como almidón (de estructura característica para la especie), esclereidas y tricomas de diferentes tipos en la gluma y marlo, como así también tráqueas anilladas en éste último. Para las muestras industrializadas, solamente en una de ellas se observó la presencia del almidón característico de Zea mays. El análisis fitoquímico en las muestras vegetales permitió determinar un perfil de antocianos caracterizado por la presencia de cianidina-3-glucósido en mayor proporción y en menor proporción pelargonidina-3-glucósido y peonidina-3-glucósido. Aunque el perfil de polifenoles se presentó sin modificaciones entre las diversas muestras vegetales analizadas, se observó una marcada variación cuantitativa entre las mismas. En el caso de las muestras industrializadas, sólo se detectó la presencia de cianidina-3-glucósido en una muestra, mientras que en el resto no se pudo observar ningún carácter fitoquímico relacionado con el “maíz morado”, ya que en su composición sólo se observaron colorantes artificiales. Las técnicas empleadas son de rápida realización y bajo costo, aplicables en laboratorios de baja complejidad. Abstract: The "purple corn" is the purple variety of Zea mays L., originating in Peru, Bolivia and the northeastern of Argentina. It is used in the preparation of "chicha morada", "mazamorra morada" and “api”. The objective of this study was to determine the pharmacobotanical and phytochemical (polyphenols) parameters applicable to quality control samples of "purple corn" in the context of a low-complexity laboratory. Plant samples (corn) and industrial samples that indicated "purple corn" as part of their composition were analyzed. Macerations and sections for the pharmacobotanical analysis were performed and decoctions (aqueous extract), ethanolic and methanolic extracts for the polyphenols study. Microscopic analysis of plant samples allowed us to observe characters present in the grain, such as starch (characteristic structure for this species), sclereids and trichomes of different types in the glume and cob, as well as spiral tracheas in the latter. For industrial samples, in only one of them the presence of characteristic starch of Zea mays was observed. Phytochemical analysis in plant samples allowed us to determine an anthocyanins profile characterized by the presence of cyanidin-3-glucoside on a greater extent and lesser pelargonidin-3- glucoside and peonidin-3-glucoside. Although the profile of polyphenols showed no changes between different plant samples analyzed, a strong quantitative variation was observed between them. In the case of industrialized samples, only in one of them cyanidin-3-glucoside was detected while in the remainder no phytochemical character related to the "purple corn", could be observed, because in its composition only artificial coloring were observed. The techniques used are of fast implementation and low cost, applicable in low complexity laboratories.
Cita tipo APA: Carmona Córdova, Sandra Juliana . (2016-08-26). Control de calidad de ¨Maíz Morado¨ (Zea Mays L.- Poaceae, raza ¨Culli¨): estudio farmacobotánico, análisis de antocianos y actividad antioxidante. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6177_CarmonaCordova.pdf Cita tipo Chicago: Carmona Córdova, Sandra Juliana. "Control de calidad de ¨Maíz Morado¨ (Zea Mays L.- Poaceae, raza ¨Culli¨): estudio farmacobotánico, análisis de antocianos y actividad antioxidante". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-26. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6177_CarmonaCordova.pdf |
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Gantuz, Magdalena. "Identificación y caracterización molecular y funcional de variantes de la Proteína Latente de Membrana 1 del virus de Epstein Barr" (2016-08-24). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El Virus de Epstein Barr (EBV), agente etiológico de la mononucleosis infecciosa (MNI), se asocia también a neoplasias. Si bien las causas por las cuales contribuye a la linfomagénesis están aún en estudio, la identificación de variantes virales asociadas a tumores podrían responder en parte este interrogante. Dado que LMP1 es la principal proteína oncogénica de EBV, el objetivo fue identificar y caracterizar las variantes moleculares en sus regiones promotora y codificante, y determinar su participación en la patogenia de las enfermedades asociadas. Se incluyeron 29 pacientes pediátricos con linfomas asociados a EBV, 30 con MNI y 14 controles con hiperplasia reactiva. Se amplificaron mediante PCR las regiones promotora ED-L1 y codificante, se secuenciaron y se realizó análisis filogenético. Se analizó además in vitro la actividad del promotor. Región ED-L1: se definieron 4 clados denominados según las líneas celulares B95.8, Cao, Raji and P3HR1. B95.8 fue el más frecuente (47%), pero no se asoció a a ninguna patología en particular. Se observaron mutaciones en sitios de unión a factores de transcripción, la pérdida del C/EBP disminuye 3 veces la actividad de ED-L1. Región codificante: se identificaron 6 clados (China1, China2, Med-, Alaskan, B95.8 and Argentina ) de los cuales prevaleció la variante de circulación local, Arg, (46%) potencialmente originada por recombinación Raji/China1 y que podría tener un origen africano. No se observó una asociación entre variantes específicas y linfomagénesis, aunque algunos polimorfismos tuvieron mayor frecuencia en linfomas. Se estimó una tasa de evolución acelerada en comparación a lo esperado para un herpesvirus, quizás influenciado por la presión de selección positiva sobre codones específicos. Este análisis muestra una evolución compleja de este gen y revela la importancia de su potencial utilización como marcador de variantes virales geográficas. Abstract: Epstein Barr virus (EBV), the etiological agent of infectious mononucleosis, is also associated with neoplasia. Little is known about variants prevalence and their influence in EBV diseases. Our aim was to study viral LMP1 variant distribution among children with EBV+ malignant and benign conditions as well as healthy carriers. Oral secretions (OS) and blood cells (PBMC) from 30 children with IM, and biopsies from 14 EBV+ reactive hyperplasia (RH) and 29 EBV+ lymphomas (L) were included. LMP1 sequences were amplified by nested PCR. Sequencing and phylogenetic analysis was performed. Promoter activity was assayed in EDL1 variants. ED-L1: Phylogenetic reconstruction defined 4 clades termed after B95.8, Cao, Raji and P3HR1. B95.8 clade was the most frequent (47%), but it was not associated with any particular condition. Mutations were found in transcription factor binding sites; the abolition of C/EBP caused a 3-fold diminish in EDL1 activity. Coding region: 6 clades were defined (China1, China2, Med-, Alaskan, B95.8 and Argentine (Arg)). Arg clade, the most prevalent (46%), proved to be a Raji and China1 recombinant. No pathology or compartment associations were observed for LMP1 variants, however some polymorphisms presented a higher prevalence in lymphoma patients. Viral evolutionary rate estimated from LMP1 was faster than the expected for a herpesvirus, perhaps due to positive selection influence. These results contribute to the knowledge of EBV genetic diversity and evolution. LMP1 appears to have a complex evolution pattern and reveals the importance of its potential use as a marker of geographical viral variants.
Cita tipo APA: Gantuz, Magdalena . (2016-08-24). Identificación y caracterización molecular y funcional de variantes de la Proteína Latente de Membrana 1 del virus de Epstein Barr. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6055_Gantuz.pdf Cita tipo Chicago: Gantuz, Magdalena. "Identificación y caracterización molecular y funcional de variantes de la Proteína Latente de Membrana 1 del virus de Epstein Barr". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-24. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6055_Gantuz.pdf |
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Rosciano, Natalia Gimena. "Comportamiento de alimentación del pingüino penacho amarillo del sur Eudyptes chrysocome y del pingüino de Magallanes Spheniscus magellanicus en Isla de los Estados, Tierra del Fuego, Argentina" (2016-08-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El comportamiento de alimentación y dieta de las aves marinas, en general, varía con la localidad, el sexo y el estadio del ciclo anual. Además, en una misma región pueden alimentarse distintas especies con requerimientos tróficos similares, aunque no podrían co-existir sin diferencias ecológicas (principio de exclusión competitiva). Así, estudiar la segregación inter- e intra-específica es relevante para entender la estructura y funcionamiento de estas comunidades. Dos especies de pingüino anidan en simpatría en Bahía Franklin, Isla de los Estados, el pingüino penacho amarillo del sur Eudyptes chrysocome (PPA) y el pingüino de Magallanes Spheniscus magellanicus (PM). El objetivo general de esta tesis fue estudiar las áreas de alimentación, las estrategias de búsqueda de alimento y el uso de la columna de agua y el nivel trófico durante distintas etapas del ciclo anual de dichas especies y sus diferencias inter- e intra-específicas. El estudio se realizó durante tres temporadas reproductivas (2011–2013), utilizando registradores con sensores de posicionamiento satelital, profundidad y temperatura, modelados en un sistema de información geográfico e isótopos estables. Los PM mostraron leves diferencias entre sexos en su comportamiento de buceo y una gran superposición en las áreas del mar utilizadas para alimentarse. También se registró variabilidad inter-anual en el comportamiento alimentación y el nivel trófico de la especie, aunque no se reflejó en una menor supervivencia de los pichones. Por su parte, las hembras de PPA mostraron segregación intra-específica en la población, utilizando distintas áreas de alimentación y zonas en la columna de agua, durante la etapa de cuidado temprano de pichones. Durante la etapa de cuidado tardío, los análisis de isótopos estables de PPA mostraron un comportamiento de aprovisionamiento selectivo, siendo los pichones alimentados con presas de mayor calidad energética que las que ingieren sus padres; aunque no se observaron diferencias en las áreas utilizadas por los adultos para auto-aprovisionamiento y aprovisionamiento de los pichones. Los nichos isotópicos de ambas especies mostraron una fuerte segregación inter-específica durante la etapa de cuidado temprano, reduciendo la competencia durante esta etapa, en la que están restringidos a explotar recursos dentro de un área limitada. Las hembras de PPA se alimentaron en un nivel trófico menor y en aguas abiertas en comparación con los PM, que se alimentaron en un nivel trófico mayor y en aguas costeras. Fuera de la temporada reproductiva, durante el viaje de pre-muda, se mantuvo la segregación inter-específica en las áreas utilizadas para alimentarse y el nivel trófico, prevaleciendo las diferencias ecológicas observadas dentro la temporada de cría en el comportamiento de alimentación de ambas especies en esta localidad. Este estudio aporta aspectos novedosos sobre el comportamiento y la ecología trófica de las dos especies de pingüinos que viven en simpatría en Isla de los Estados. Además, resulta importante para comprender el funcionamiento del ecosistema marino del Atlántico Sudoccidental a través de sus predadores tope, y para realizar futuras acciones de conservación en el área de estudio, a través de la información sobre las áreas de importancia para los pingüinos en la región. Abstract: Foraging behavior and diet of seabirds, in general, varies with locality, sex and the life stage. Also, different species with similar trophic requirements can feed in the same region, though they could not co-exist without ecological differences (principal of competitive exclusion). Studying the inter- and intra-specific segregation is relevant to understand the structure and functioning of this communities. Two penguin species nest in sympatry in Bahia Franklin, Isla de los Estados, southern rockhopper penguins Eudyptes chrysocome (RHP) and Magellanic penguins Spheniscus magellanicus (MP). The general objective of this thesis was to study the foraging areas, search for food strategies, the use of the water column and trophic level during different stages of the annual cycle of the species mentioned and their inter- and intra-specific differences. The study was carried on during three breeding seasons (2011-2013) using devices with GPS, depth and temperature sensor, modelling in geographic information system and stable isotopes. MP showed small differences between sexes in their diving behavior and great overlap in the foraging areas at sea. Even though they showed inter-annual variability in the foraging behavior and the trophic level, it was not reflected in a smaller survival of the chicks. On their behalf, female RHP showed intra-specific segregation in the population, using different foraging areas and zones in the water column, during the early chick rearing period. During the late chick rearing period, stable isotope analysis on RHP showed a selective provisioning behavior, being the chicks fed with higher quality prey type than their parents; though no differences were found in the foraging areas used for adult self-provisioning and chick provisioning. Isotopic niche of both species showed a strong inter-specific segregation during early chick rearing period. Female RHP fed on a lower trophic level and off-shore compared to MP that fed at higher trophic leve coastal areas. Outside the breeding season, during the pre-molt trip, the inter-specific segregation in the foraging areas and trophic level was maintained, suggesting that the ecological differences observed in the foraging behaviour during the breeding season prevailed on this location. This study shows novel aspects of the behavior and trophic ecology of the two species of penguins that live in sympatry on Isla de los Estados. Also, it is important to understand how the South-Atlantic marine ecosystem works though their top predators and for future conservation actions regarding marine protected areas for penguins in the region.
Cita tipo APA: Rosciano, Natalia Gimena . (2016-08-22). Comportamiento de alimentación del pingüino penacho amarillo del sur Eudyptes chrysocome y del pingüino de Magallanes Spheniscus magellanicus en Isla de los Estados, Tierra del Fuego, Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6079_Rosciano.pdf Cita tipo Chicago: Rosciano, Natalia Gimena. "Comportamiento de alimentación del pingüino penacho amarillo del sur Eudyptes chrysocome y del pingüino de Magallanes Spheniscus magellanicus en Isla de los Estados, Tierra del Fuego, Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6079_Rosciano.pdf |
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Cardona Velásquez, Crhistian. "Búsqueda de mecanismos regulatorios en redes biológicas usando multigrados en base de datos no relacionadas" (2016-08-18). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El análisis de redes de interacciones se aplica en forma creciente en investigación biológica. Se han reportado análisis derivados de los métodos desarrollados para análisis de redes sociales en diferentes organismos y con distintos objetivos. Para el análisis de redes biológicas se manipulan estructuras de datos en memoria que en su mayoría no están optimizadas para grandes cantidades de datos y en las cuales no es posible realizar exploración de datos conectados en red de manera ágil y flexible. Una alternativa de uso creciente para este tipo de situaciones, no solo en biología, es el uso de bases de datos no relacionales orientadas a grafos. En este trabajo investigamos el uso de bases de datos no relacionales orientadas a grafos para el análisis de datos moleculares de la bacteria Mycobacterium tuberculosis, causante de la tuberculosis humana. Específicamente utilizamos datos de experimentos que cubren diversos procesos biológicos: expresión génica, interacciones proteína - proteína e interacciones proteína - ADN. Este tipo de enfoque integrado se conoce como biología de sistemas y es un área donde el uso de bases de datos de grafos todavía está en su infancia, pero tiene enorme potencial. Para los análisis se construye un multigrafo mixto y se definen preguntas a nivel biológico que posteriormente se traducen en patrones de consultas con quasi-cliques; las consultas se implementan en dos bases de datos no relacionales orientadas a grafos: Neo4J (http://neo4j.com/) y Titan (http://thinkaurelius.github.io/titan/) haciendo uso de lenguajes de consulta tales como Cypher y Gremlin. Abstract: The Interaction Network Analysis applies increasingly in biological research. Derivatives methods have been reported developed for analysis of social networks in different organisms and different objectives. For the analysis of biological networks in memory data structures that mostly are not optimized for large amounts of data and where not possible exploration network data online swiftly and flexibly handled. An alternative scenario growing use such situations, not only in biology, is the use of non-relational graph databases. We investigated the use of non-relational graph databases oriented to analysis of molecular data of the bacterium Mycobacterium tuberculosis, which causes human tuberculosis. Specifically, we use data from experiments covering various biological processes: gene expression, protein-protein interactions and protein – DNA interactions. Such an approach known as Integrated Systems Biology and is an area where the use of bases graph databases is still in its infancy but has huge potential. For analyzes a mixed multigraph is constructed and biologically questions later translate into patterns of queries with quasi-cliques are defined; the queries are implemented in two non-relational graph databases: Neo4J (http://neo4j.com/) and Titan (http://thinkaurelius.github.io/titan/) by use query languages like Cypher and Gremlin.
Cita tipo APA: Cardona Velásquez, Crhistian . (2016-08-18). Búsqueda de mecanismos regulatorios en redes biológicas usando multigrados en base de datos no relacionadas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6182_CardonaVelasquez.pdf Cita tipo Chicago: Cardona Velásquez, Crhistian. "Búsqueda de mecanismos regulatorios en redes biológicas usando multigrados en base de datos no relacionadas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6182_CardonaVelasquez.pdf |
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Farall, Rodolfo Andrés. "Detección de errores e inhomogeneidades en series de datos meteorológicos" (2016-08-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los problemas de calidad en series de datos meteorológicos resultan principalmente de errores de medición o registro y de cambios en las condiciones de medición o en el entorno de la estación meteorológica (inhomogeneidades). Cuando no se dispone de información adicional (metadata) es necesario contar con una metodología confiable de control de calidad que permita detectar, en una serie de datos meteorológicos proveniente de una estación, errores e inhomogeneidades. En esta tesis se presenta una caracterización detallada de las series de datos de temperatura y precipitación, y se discuten las diferencias entre estos dos tipos de variables. Se introduce un marco conceptual basado en modelos estadísticos para los problemas de detección de errores y de detección de inhomogeneidades (puntos de corte en la serie). Se muestra la importancia de la apropiada selección del modelo y se propone metodología para cada uno de los problemas en los dos tipos de variables meteorológicas. Características de los métodos propuestos para controlar la serie de datos de una estación objetivo: 1) Multivariados, usan las series de observaciones de estaciones cercanas; 2) No hacen supuestos sobre la distribución de los datos; 3) Usan procedimientos de estimación robustos; 4) Atienden a la estructura de correlación presente en la serie de datos; 5) Son capaces de detectar múltiples tipos de inhomogeneidades. Usando datos de modelos numéricos regionales se estudia el desempeño de los métodos propuestos bajo diferentes escenarios. Abstract: The lack of quality in climate data is mostly the result of measurement or recording errors and arbitrary changes in the monitoring conditions or surrounding environment (inhomogeneities). When additional information (metadata) is not available, a reliable methodology to detect errors and inhomogeneities is required. In this thesis we present a detailed characterization of temperature and precipitation time series, while discussing their basic differences. We introduce a conceptual framework based on statistical models for the error and inhomogeneity detection issues. The relevance in the choice of the statistical model is shown, and separate methods are developed for both problems and these two main meteorological variables. Main features of the proposed methods, to control the target station time series, are: 1) Multivariate, they use data from nearby stations; 2) No specific assumptions about the distribution of data; 3) Use of robust estimation procedures; 4) They respond to the actual correlation structure present in data; 5) Capable of detecting several types of inhomogeneities. Finally, we study the performance of the methods through the use of numerical regional models under changing scenarios.
Cita tipo APA: Farall, Rodolfo Andrés . (2016-08-16). Detección de errores e inhomogeneidades en series de datos meteorológicos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6099_Farall.pdf Cita tipo Chicago: Farall, Rodolfo Andrés. "Detección de errores e inhomogeneidades en series de datos meteorológicos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6099_Farall.pdf |
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Shigler Siles, Wendelin Karem. "Evaluación de la calidad botánica y química de polifenoles de los productos comercializados como ¨Yerba mate aromatizada¨ en la ciudad de Buenos Aires" (2016-08-11). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El control de calidad de los productos alimenticios es fundamental para garantizar el bienestar y la salud de la población. Desde el cultivo hasta la distribución del producto terminado, se requiere de cuidados especiales para el éxito final. Cuando se producen negligencias, controles incompletos o inadecuados, la calidad del producto se ve seriamente afectada. Las mezclas de yerbas aromatizadas constituidas por Ilex paraguariensis y otras especies trozadas o trituradas, presentan iguales problemas que las mezclas de hierbas medicinales: genuinidad incierta de las especies presentes, errores en los nombres, porcentajes de los componentes sin especificar, presencia de materia extraña, adulteraciones y sustituciones. Los objetivos fueron realizar un muestreo de los productos comercializados, establecer caracteres relevantes para identificar los componentes y detectar materia extraña. Se analizaron aspectos macroscópicos y microscópicos de los productos mediante técnicas farmacobotánicas. Se completó el estudio con un análisis fitoquímico de polifenoles. Los resultados demostraron que los caracteres establecidos constituyen parámetros diagnósticos para el control botánico de las muestras con métodos sencillos, aplicables en laboratorios de baja complejidad. El estudio fitoquímico reveló que el aporte de polifenoles de los componentes adicionales a la yerba es mínimo. El producto yerba mate, de consumo masivo entre la población, está contemplado en el Código Alimentario Argentino. Dado que la yerba aromatizada contiene especies con propiedades farmacológicas, es importante considerar su correcto control de calidad en el área alimenticia. Abstract: Quality control of food products is essential to ensure the welfare and health of the population. From cultivation to distribution of the finished product, special cares are required for final success. When negligence, incomplete or inadequate control occurs, the product quality is seriously affected. Flavored “yerba” mixtures consisting of Ilex paraguariensis and other species cut in pieces or very crushed, present the same problems as mixtures of medicinal herbs: uncertain authenticity of the species present, errors in names, percentages of components unspecified, presence of foreign material, adulterations and substitutions. Objectives in this work were to perform a sampling of the products marketed, establish relevant characters to identify the components and detect foreign matter. Macroscopic and microscopic aspects of the products were analyzed, using pharmacobotanical techniques. The study was completed with a phytochemical analysis of polyphenols. Results showed that the characters established were diagnostic parameters for botanical control of the samples, with simple methods applicable in laboratories of low complexity. The phytochemical study revealed that the contribution of the additional components to polyphenols content is minimal. “Yerba mate” product, of mass consumption among the population, is included in the Argentine Food Code. Since flavored “yerba” contains species with pharmacological properties, it is important to consider a proper quality control in the food area.
Cita tipo APA: Shigler Siles, Wendelin Karem . (2016-08-11). Evaluación de la calidad botánica y química de polifenoles de los productos comercializados como ¨Yerba mate aromatizada¨ en la ciudad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6062_ShiglerSiles.pdf Cita tipo Chicago: Shigler Siles, Wendelin Karem. "Evaluación de la calidad botánica y química de polifenoles de los productos comercializados como ¨Yerba mate aromatizada¨ en la ciudad de Buenos Aires". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-08-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6062_ShiglerSiles.pdf |
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Hita, Francisco Javier. "La familia de proteínas Lrig: nuevas funciones biológicas y mecanismos de señalización en neuronas" (2016-07-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Estudios recientes aportaron evidencias convincentes acerca de las funciones que cumplen diversas proteínas transmembrana que contienen dominios extra-celulares ricos en leucina (LRR) durante el desarrollo del sistema nervioso. Los procesos celulares que subyacen al establecimiento de la conectividad neuronal, como la regulación del guiado axonal, el crecimiento dendrítico, la formación de contactos sinápticos y en parte, la plasticidad sináptica; a menudo requieren la participación de proteínas que contienen estos dominios. En efecto, existe una gran variedad de proteínas con dominios LRR altamente enriquecidas en el hipocampo y la corteza cerebral de mamíferos, que juegan roles claves en el armado de los circuitos neuronales. Se sabe que un mal funcionamiento de estos genes en ocasiones puede comprometer la función neuronal y derivar en enfermedades del neurodesarrollo, déficits cognitivos y/o desórdenes neuropsiquiátricos. Evidencias previas demostraron que la proteína transmembrana Lrig1 (proteína rica en dominios leucina e inmunoglobulina) se asocia con múltiples receptores tirosina kinasa y regula así la actividad trófica inducida por los factores de crecimiento EGF, HGF y el factor neurotrófico GDNF, entre otros. A pesar de que Lrig1 se expresa en neuronas centrales (motoneuronas espinales) y periféricas (del ganglio anexo de la raíz dorsal) en desarrollo, su contribución fisiológica para el desarrollo del sistema nervioso, aún no ha sido determinada. Por lo tanto, el objetivo del presente trabajo de tesis, fue caracterizar las poblaciones neuronales Lrig1 positivas en las estructuras cerebrales estudiadas y determinar la contribución de las Lrigs para el desarrollo y el desempeño del sistema nervioso central. Basándonos principalmente en su prominente patrón de expresión durante el desarrollo hipocampal y utilizando ensayos de pérdida y ganancia de función, hemos determinado que Lrig1 es un regulador de la arborización dendrítica y de la espinogénesis hipocampal. Nuestros ensayos celulares y bioquímicos indican que Lrig1 controla la formación de dendritas primarias y la ramificación dendrítica de neuronas hipocampales, a través de un mecanismo de regulación negativa de la actividad neurotrófica de BDNF. Debido a que los otros dos miembros de la familia, Lrig2 y Lrig3 también se expresan en neuronas hipocampales en desarrollo, se ha estudiado de qué manera la pérdida de función de Lrig2 o Lrig3 podría afectar la morfología de neuronas hipocampales. Nuestros resultados sugieren que a diferencia de Lrig1, la ausencia de Lrig2 o Lrig3 inhibe la dendritogénesis de neuronas primarias hipocampales. Por otra parte, ensayos conductuales llevados a cabo con ratones transgénicos deficientes en Lrig1 han demostrado que la ausencia de Lrig1 afecta procesos de memoria dependientes de hipocampo y corteza, tales como la codificación de información espacial y la capacidad de reconocer la identidad de objetos novedosos. De esta manera, nuestros estudios demuestran que Lrig1 controla la morfología neuronal y la plasticidad estructural de las neuronas hipocampales, así como también la plasticidad funcional del hipocampo. En este trabajo de tesis doctoral hemos identificado a las proteínas Lrig como nuevos reguladores endógenos de la complejidad dendrítica hipocampal y a la vez hemos establecido por primera vez un fenotipo conductual asociado a funciones hipocampales y corticales, en los ratones deficientes para Lrig1. En su conjunto nuestros hallazgos revelan un nuevo rol de Lrig1 en el control de los procesos morfogénicos que forman el sistema nervioso durante su desarrollo; y evidencian la relevancia fisiológica de Lrig1 en el comportamiento animal. Abstract: Recent studies provided convincing evidence about the roles driven by various trans-membrane proteins containing extracellular Lucine-rich domains (LRR) during development of the nervous system. Cellular processes underlying the establishment of neuronal connectivity, regulation of axon guidance, dendrite growth, or formation of synaptic contacts and synaptic plasticity, often require the involvement of proteins containing these domains. In fact, there are a variety of proteins with LRR domains, highly enriched in the hippocampus and cerebral cortex of mammals, playing key roles in the assembly of neural circuits. It is known that a malfunction of these genes can sometimes compromise neuronal function and lead to neurodevelopmental diseases related to cognitive deficits and / or neuropsychiatric disorders. Previous evidence showed that the trans-membrane protein LRIG1 (Lucine-rich protein and immunoglobulin domains) is associated with multiple receptor tyrosine kinases regulating trophic activity through growth factors like EGF, HGF and GDNF, among others. Although LRIG1 is expressed in central (spinal motor neurons) and peripheral (Dorsal root ganglion) neurons, its physiological contribution to the development of the nervous system, has not been determined yet. Therefore, the objective of this thesis was to characterize the LRIG1 positive neuronal populations in brain structures, and determine the contribution of LRIG1 for the development and function of the central nervous system. Based mainly on its prominent expression pattern during hippocampal development and through loss and gain of function experiments, we have determined that LRIG1 is a regulator of dendrite arborization and hippocampal spine genesis. Our biochemical and cellular assays indicate that LRIG1 controls the formation of primary dendrites and dendrite branching of hippocampal neurons through a mechanism involving down-regulation of BDNF neurotrophic activity. Given that other two members of the family, Lrig3 and Lrig2, are also expressed in hippocampal neurons during development, we asked ourselves how the loss of function of Lrig2 or Lrig3 could affect the morphology of hippocampal neurons too. Our results suggest that unlike Lrig1, the absence of Lrig2 or Lrig3 inhibits 14 hippocampal primary neurons dendritogenesis and reduces their complexity. Moreover, behavioral tests conducted with mutant mice, deficient in LRIG1, have shown that absence of LRIG1 affects memory processes dependent of cortical and hippocampal circuitry. Among them, the encoding of spatial information and recognition of objects identity or novelty. Thus, our studies show that LRIG1 controls neuronal morphology and structural plasticity of hippocampal neurons as well as functional hippocampal plasticity. In this doctoral thesis we have identified Lrigs proteins as new endogenous regulators of hippocampal dendrite complexity and at the same time we have established for the first time a behavioral phenotype associated with hippocampal and cortical functions in mice deficient for LRIG1. Taken together our findings reveal a new role for LRIG1, in controlling morphologic processes that form the nervous system during development; and also, the physiological relevance of LRIG1 in animal behavior.
Cita tipo APA: Hita, Francisco Javier . (2016-07-27). La familia de proteínas Lrig: nuevas funciones biológicas y mecanismos de señalización en neuronas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6063_Hita.pdf Cita tipo Chicago: Hita, Francisco Javier. "La familia de proteínas Lrig: nuevas funciones biológicas y mecanismos de señalización en neuronas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6063_Hita.pdf |
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Mazzitelli, Javier. "Efectos de la cromodinámica cuántica en la física del bosón de Higgs" (2016-07-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: A lo largo de la presente tesis hemos llevado a cabo el cálculo de las correcciones predichas por la cromodinámica cuántica para distintas secciones eficaces que son relevantes para la caracterización del bosón de Higgs descubierto en el LHC, hasta el momento compatible con aquel del modelo estándar. En particular, hemos analizado la producción de uno y dos bosones de Higgs a través del mecanismo de fusión de gluones, principal canal de producción en el LHC. En todos los casos, trabajamos en el límite en que la masa del quark top es grande, a través del cual se obtiene un Lagrangiano de interacción efectivo entre el bosón de Higgs y gluones. Para la sección eficaz correspondiente a la producción de un bosón de Higgs, uno de los procesos más relevantes en el LHC, hemos obtenido expresiones aproximadas a tercer y cuarto orden, mejorando los resultados disponibles anteriormente, y observando una reducción de las incertezas teóricas respecto de órdenes anteriores. En el caso de la producción de dos bosones de Higgs, cuyo interés reside en la posibilidad de medir en el futuro la auto-interacción del bosón de Higgs y por lo tanto el potencial escalar del modelo estándar, hemos calculado las correcciones a segundo orden, obteniendo la predicción más precisa disponible hasta el momento. Además, hemos considerado la emisión de gluones soft a todo orden en la expansión perturbativa, a través de la denominada resumación de umbral, alcanzando de esta forma resultados aún más confiables. Nuestras predicciones, incluídas en el informe anual del Higgs Cross Section Working Group del LHC, son utilizadas por las colaboraciones experimentales ATLAS y CMS. Abstract: In this Thesis we have carried on the calculation of the corrections predicted by quantum chromodynamics for different cross sections which are relevant for the characterization of the Higgs boson discovered at the LHC, so far compatible with that of the standard model. In particular, we have analysed the production of one and two Higgs bosons through the gluon fusion mechanism, which is the main production channel at the LHC. We worked in the large top-quark mass limit, in which an effective Lagrangian arises for the interaction between the Higgs boson and the gluons. For the cross section corresponding to the production of a single Higgs boson, one of the most relevant processes at the LHC, we have obtained approximate expressions for the third and fourth order corrections, improving the previously available results, and observing a reduction of the theoretical uncertainties with respect to previous orders. For the case of the double Higgs production, which gives the opportunity to measure in the future the Higgs self-interaction and therefore the scalar potential of the standard model, we have obtained the second order corrections, reaching the most precise prediction available for the moment. Furthermore, we have considered the all-orders soft gluon emission, through the so called threshold resummation, obtaining even more reliable results. Our predictions, which are included in the annual report of the LHC Higgs Cross Section Working Group, are used by the experimental collaborations ATLAS and CMS.
Cita tipo APA: Mazzitelli, Javier . (2016-07-22). Efectos de la cromodinámica cuántica en la física del bosón de Higgs. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6047_Mazzitelli.pdf Cita tipo Chicago: Mazzitelli, Javier. "Efectos de la cromodinámica cuántica en la física del bosón de Higgs". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6047_Mazzitelli.pdf |
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Imberti, Marcos Agustín. "Análisis ecológico-evolutivo de la especie invasora Zaprionus indianus (Diptera: Drosophilidae), una potencial plaga de frutales" (2016-07-13). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las especies introducidas que rápidamente colonizan grandes áreas ofrecen una oportunidad para investigar las causas que les permiten una colonización exitosa (invasión biológica), así como el cambio que provocan en las comunidades ya establecidas. Zaprionus indianus Gupta (1970) es un drosofílido (Diptera: Drosophilidae) originario de la región Afrotropical y que recientemente colonizó toda América desde su ingreso a Brasil en 1999. En esta Tesis de Doctorado se han estudiado características ecológicas y genéticas que podrían relacionarse con la exitosa invasión de Z. indianus. En particular, a) se caracterizó la distribución, abundancia y utilización de recursos alimenticios por parte de Z. indianus en la Argentina; b) se analizaron aspectos histórico-demográficos, los niveles de estructuración poblacional y los niveles de variación genética mitocondrial en las poblaciones de Z. indianus establecidas en la Argentina; c) se describieron patrones de variación genética y de plasticidad fenotípica en caracteres morfológicos y de historia de vida en poblaciones argentinas de Z. indianus y d) se realizaron experimentos de competencia interespecífica entre Z. indianus y drosofílidos preestablecidos en la Argentina. Los resultados mostraron que: Z. indianus tiene la capacidad de utilizar como hospedador los frutos de diversas especies como guayaba, mango, naranja, caqui, papaya, banana, nísperos e higos; que el proceso de invasión al continente dejó rastros en la variación genética mitocondrial de Z. indianus caracterizando un proceso sin cambios demográficos abruptos; que tanto la variación genética y la plasticidad fenotípica de caracteres morfológicos y de historia de vida presentan patrones complejos en las poblaciones invasoras y, finalmente, que la habilidad competitiva larval de Z. indianus respecto de otros drosofílidos sería una de las causas del éxito de la colonización de esta especie en la Argentina. Abstract: Introduced species that colonize large areas, rapidly offer an opportunity to research the causes that allow their successful colonization (biological invasion) as well as the changes it makes in established communities. Zaprionus indianus Gupta (1970) is a drosophilid (Diptera: Drosophilidae) originated from the Afrotropical region that recently colonized all America since it arrival to Brazil in 1999. In this Doctoral Thesis we have studied the biological and genetic features that might relate to the successful invasion of Z. indianus. In particular, a) we have characterized the distribution, abundance and usage of food resources by Z. indianus in Argentina; b) we have analyzed historical and demographic aspects of this invasion, the levels of population structuration and the levels mitochondrial genetic variation in populations of Z. indianus established in Argentina; c) we have described the patterns of genetic variation and phenotypic plasticity in morphological and life history traits in Argentine populations of Z. indianus and d) we have made experiments of interspecific competition between Z. indianus and frugivore drosophilids preset in Argentina. The results showed that: Z. indianus has the ability to use the fruits of various species such as guava, mango, orange, persimmon, papaya, banana and figs as host; that the process of invasion in the continent left traces in their mitochondrial genetic variation of a history characterized by a lack of abrupt demographic changes; that genetic morphological and life history traits’ variation and phenotypic plasticity show complex patterns in invasive populations, and lastly, that larval competitive ability of Z. indianus over other drosophilids can be proposed as one of the causes of the successful colonization of this species in Argentina.
Cita tipo APA: Imberti, Marcos Agustín . (2016-07-13). Análisis ecológico-evolutivo de la especie invasora Zaprionus indianus (Diptera: Drosophilidae), una potencial plaga de frutales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6026_Imberti.pdf Cita tipo Chicago: Imberti, Marcos Agustín. "Análisis ecológico-evolutivo de la especie invasora Zaprionus indianus (Diptera: Drosophilidae), una potencial plaga de frutales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-13. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6026_Imberti.pdf |
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Arcaya Arhuata, Ludmer Edward. "Caracterización de la confianza en las instituciones del gobierno del Perú" (2016-07-12). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Este trabajo consiste en un análisis sobre la percepción de la confianza en las instituciones públicas del gobierno, usando técnicas de Minería de datos, se busca obtener los 5 factores más influyentes en el año 2014, con respecto a la percepción de confianza en las instituciones del gobierno del Perú, y cómo es su comportamiento desde el 2007 al 2014. Para conseguir este objetivo se usan datos públicos de encuestas, que están disponibles en el repositorio digital del Instituto Nacional de Estadísticas e Informática de Perú (INEI), que, siendo órgano rector de las estadísticas del Perú, ejecuta todos los años un programa de Encuestas Nacional de Hogares (ENAHO), el cual cuenta con 29 categorías de estudios, siendo algunas de ellas: Educación, Empleabilidad, Características del hogar, Gobernabilidad y Democracia. El trabajo comenzó con la búsqueda de datos en los repositorios del INEI, continúo con la carga en una base de datos, luego se efectuó la limpieza e integración usando SQL, hasta la construcción de una tabla Analítica. Sobre estos datos se aplicaron métodos descriptivos para la selección de variables potenciales. Luego ejecutando el algoritmo de árbol de decisión, se obtuvieron las 5 variables más influyentes, con el Análisis Factorial de correspondencias se vio las atracciones entre las modalidades de estas variables y la confianza. Los resultados del trabajo muestran que el Congreso de la República es la institución con mayor desconfianza, seguida por el Gobierno regional, La Policía Nacional y el Poder Judicial. Estas instituciones fueron las que se seleccionaron para realizar el análisis de influencia, no combinando estas ya que las instituciones son autónomas y se sospecha que las influencias son independientes. Las variables más influyentes son: , y y estas son las mismas para las instituciones estudiadas, las variables restantes son y , y . El trabajo también muestra la evolución temporal de influencia, comportamiento de las variables.
Cita tipo APA: Arcaya Arhuata, Ludmer Edward . (2016-07-12). Caracterización de la confianza en las instituciones del gobierno del Perú. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6061_ArcayaArhuata.pdf Cita tipo Chicago: Arcaya Arhuata, Ludmer Edward. "Caracterización de la confianza en las instituciones del gobierno del Perú". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-12. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6061_ArcayaArhuata.pdf |
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Kniznik, Laura. "Defectos constitucionales y energía de migración de aluminio en UAI4" (2016-07-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El compuesto UAl4 es de interés en la tecnología de los elementos combustibles para reactores nucleares de investigación, ya que estos tienen un diseño donde partículas de un compuesto intermetálico conteniendo uranio se dispersan en un polvo de aluminio. Durante su fabricación y uso, el UAl4 y otros aluminuros crecen por interdifusión entre la aleación de uranio y el aluminio. Esta Tesis aporta conocimiento sobre la formación de los defectos puntuales y la energía de migración de Al en UAl4 a partir de métodos basados en la teoría de la funcional densidad electrónica (DFT), y muestra cómo estos resultados pueden transferirse a modelos semi-empíricos tipo CALPHAD para la simulación del proceso de crecimiento por difusión. En la primera parte de esta Tesis modelamos el crecimiento de UAl4 en un par de difusión UAl3/Al y construimos bases de datos semi-empíricas. Estimamos el coeficiente de heterodifusión a dilución infinita de Al en UAl4. En la segunda parte, realizamos cálculos DFT según el código VASP de las estabilidades del sistema binario U-Al y un análisis estructural, electrónico y magnético del cristal perfecto de UAl4. Investigamos la formación de defectos puntuales en el compuesto y estimamos las entalpías de formación de monovacancias y antisitios. Mediante un modelo estadístico-termodinámico obtuvimos concentraciones de defectos en función de la temperatura y la desviación de la estequiometría. Encontramos los defectos constitucionales y térmicos a ambos lados de la estequiometría, así como los defectos térmicos para UAl4 estequiométrico. Además, estudiamos la relajación estructural local, el ordenamiento magnético y la redistribución electrónica inducidos por el defecto. Luego, modificamos la base de datos para el modelado CALPHAD con las entalpías obtenidas y re-calculamos el diagrama de equilibrio del sistema U-Al. Finalmente, identificamos los mecanismos más probables de migración de Al en UAl4 y calculamos su energía de migración mediante el método NEB implementado en VASP. Proponemos que la difusión de Al en UAl4 ocurre por el mecanismo a primeros vecinos de átomos Al1 con una energía de activación de 1.90 eV que compara relativamente bien con el valor 2.06 eV observado experimentalmente o con el valor 2.17 eV obtenido en esta Tesis utilizando el modelo semi-empírico. Abstract: UAl4 compound is of interest in nuclear fuel elements technology for research and test reactors, due to their design where particles of an intermetallic compound containing uranium are dispersed in aluminum powder. During production and utilization, UAl4 and other aluminides grow by interdiffusion between the uranium-based alloy and aluminum. This Thesis provides knowledge about point defects formation and aluminum migration energy in UAl4 from Density Functional Theory (DFT) methods, and also shows how these results can be transferred to semi-empirical CALPHAD models for the simulation of the interdiffusion growth process. In the first part of this Thesis we modeled UAl4 compound growth in a UAl3/Al diffusion couple and we built semi-empirical databases. The tracer diffusion coefficient of Al in UAl4 was estimated. In the second part, we performed DFT calculations implemented in the VASP code for U-Al binary system stabilities and a structural, electronic and magnetic analysis of UAl4 perfect crystal. We investigated point defects formation in the compound and monovacancies and antisites formation enthalpies were estimated. We obtained defect concentrations as a function of temperature and deviation from stoichiometry by means of a statistical thermodynamical model. We found constitutional and thermal defects at both sides of stoichiometry, as well as thermal defects for stoichiometric UAl4. Furthermore, we studied local structural relaxation, defect induced magnetic ordering and electronic density redistribution. Then, using the obtained enthalpies, the database for the CALPHAD modeling was modified and we re-calculated the phase diagram for U-Al system. Finally, we identified the most likely mechanisms for Al migration in UAl4 and the migration energy was calculated using the NEB method implemented in VASP. We propose that Al diffusion in UAl4 occurs by means of the nearest neighbors mechanism of Al1 atoms with activation energy of 1.90 eV, in good agreement with the experimental observed value 2.06 eV or the one obtained in this Thesis with the semi-empirical model, 2.17 eV.
Cita tipo APA: Kniznik, Laura . (2016-07-07). Defectos constitucionales y energía de migración de aluminio en UAI4. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6030_Kniznik.pdf Cita tipo Chicago: Kniznik, Laura. "Defectos constitucionales y energía de migración de aluminio en UAI4". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6030_Kniznik.pdf |
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Ursino, Cynthia Alejandra. "Efecto de dos parásitos de cría sobre el cuidado parental de una especie con cría cooperativa, el Músico (Agelaioides badius)" (2016-07-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las crías de las especies parásitas son capaces de manipular el comportamiento de sus hospedadores a través de sus despliegues de pedido de alimento, mimetizando alguna señal del despliegue (acústica o visual) o exagerando una señal no específica. Mediante experimentos de campo y de laboratorio, se estudió el efecto de dos especies parásitas de cría, el Tordo Pico Corto (TPC), Molothrus rufoaxillaris, y el Tordo Renegrido (TR), M. bonariensis, sobre el comportamiento de cuidado parental de los adultos, la dinámica del grupo social y la competencia entre las crías, en un hospedador compartido que presenta cría cooperativa, el Músico (Agelaioides badius). Además, se estudió el sistema de apareamiento del Músico, las relaciones de parentesco de los ayudantes del nido y la pareja reproductiva y el comportamiento de remoción de las larvas de moscas del género Philornis sp., causantes de miasis en pichones. El sistema de apareamiento del Músico se analizó a nivel genético con 7 loci microsatélites. Se observó que el 34% de los nidos tuvo al menos un pichón producto de paternidad por fuera de la pareja (PPP), resultando en un 10% de los pichones con evidencia de PPP. El 50% de los ayudantes estuvo emparentado con la pareja reproductiva y los pichones del nido. Para evaluar el efecto del parasitismo sobre el comportamiento parental del Músico se midió la frecuencia de entrega de alimento al nido controlando el tamaño y composición de las nidadas. Los resultados mostraron que la frecuencia de entrega de alimento fue similar entre nidadas parasitadas con TPC, TR y nidadas no parasitadas. Para complementar estos análisis, se evaluó experimentalmente el efecto de las vocalizaciones de pichones de TPC y TR sobre la frecuencia de entrega de alimento del hospedador. Los resultados mostraron que la frecuencia de entrega de alimento fue mayor en respuesta a llamados de pichones de Músico y TPC que del grupo control (sin llamados), similares entre llamados de Músico y de TPC y similares entre el control y TR. La competencia entre los pichones de la nidada se evaluó en las nidadas controladas. Los pichones de ambas especies parásitas recibieron una mayor proporción del alimento entregado al nido que la esperada por azar y que del pichón de Músico de mayor tamaño de su misma nidada. El TR, pero no el TPC, mostró una mayor habilidad competitiva que el Músico de mayor tamaño de las nidadas no parasitadas. Con respecto al parasitismo de Philornis sp., la prevalencia en los nidos de Músico fue del 57%. La intensidad de parasitismo fue de 5,6 ± 3,6 y de 7,3 ± 5,1 larvas por pichón de Músico y TPC, respectivamente. Se obtuvieron las primeras evidencias directas de remoción de larvas de Philornis por parte del Músico, mostrando que este comportamiento es dirigido indistintamente hacia pichones propios y parásitos. Los resultados muestran que ambos parásitos de cría logran manipular el comportamiento parental del hospedador en la etapa de pichones aunque a través de diferentes mecanismos. Abstract: Many young brood-parasitic birds can manipulate host parental behavior via their begging display by mimicking some begging signals (acoustic or visual) of host young or by exaggerating a non-specific cues. By means of field experiments and labwork, we have studied the effect of two brood parasites, the Screaming Cowbird, Molothrus rufoaxillaris, and the Shiny Cowbird, M. bonariensis, on the parental behavior, dynamic of the social group and within-brood competition in a shared cooperatively breeding host, the Baywing (Agelaioides badius). We studied the Baywing’s mating system and the peculiar preening behavior and removal of Philornis sp. larvae, which cause myiasis in chicks. The genetic mating system of Baywings was analyzed using 7 microsatellite loci. It has been observed that 34% of the females were involved in some extra-pair paternity events (EPP), yielding 10% of the chicks derived from EPP. 50% of the helpers were related to the reproductive couple and chicks, being males. To evaluate the effect of parasitism on Baywing’s parental behavior and within-brood competition, we measured the frequency of food delivery to the nest, manipulating experimentally brood size and composition. Results showed that food delivery rates were similar between broods parasitized by Screaming Cowbird and the non-parasitized ones, but lower in nests parasitized with Shiny Cowbird compared to non-parasitized broods. To complement this analysis, we evaluated the effect of Shiny and Screaming Cowbird’s begging calls on the food delivery by Baywings. Results showed that Baywings increased nest provisioning rates in response to Baywing and Screaming Cowbird calls compared to Shiny Cowbird calls, but there was no difference between the feeding rates elicited by Baywing and Screaming Cowbird calls. Regarding the food distribution, parasitic chicks from both species received a higher proportion than the random expected and the biggest Baywing from their nests. Shiny, but not Screaming, showed a higher competitive ability than the biggest Baywing of the non-parasitized nests. Regarding Philornis parasitism, the prevalence on Baywing’s nests was 57%. The parasitism intensity was 5.6 ± 3.6 and 7.3 ± 5.1 larvae per Baywing and Screaming Cowbird chick, respectably. Baywings were recorded for the first time removing Philornis sp. larvae from the brood, showing that this behavior is directed indistinctly towards own and parasite chicks. These results showed for the first time that both parasites are able to manipulate this host in the chick stage by means of different mechanisms.
Cita tipo APA: Ursino, Cynthia Alejandra . (2016-07-01). Efecto de dos parásitos de cría sobre el cuidado parental de una especie con cría cooperativa, el Músico (Agelaioides badius). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6025_Ursino.pdf Cita tipo Chicago: Ursino, Cynthia Alejandra. "Efecto de dos parásitos de cría sobre el cuidado parental de una especie con cría cooperativa, el Músico (Agelaioides badius)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6025_Ursino.pdf |
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Mietta, José Luis. "Compositos elastoméricos estructurados: estudio de los efectos magneto-piezoresistivos y su aplicación en dispositivos piezométricos" (2016-07-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los Compositos Elastoméricos Estructurados (SEC, por sus siglas en inglés) están formados por dispersiones de material inorgánico en una matriz elastomérica, en la cual se inducen propiedades anisotrópicas. La presente Tesis consta de un estudio experimental y teórico de sistemas SEC. En los sistemas experimentales estudiados, partículas que son simultáneamente magnéticas y conductoras de la electricidad se encuentran dispersas en polidimetilsiloxano (PDMS). La estructuración del material (por formación de cadenas de material inorgánico en la matriz polimérica) se logra curando la dispersión en presencia de un campo magnético intenso. El estudio experimental comenzó con la síntesis y caracterización de nanopart ículas de magnetita (NPs) y la formación de agregados micrométricos NPs/plata, que están en estado superparamagnético y son conductores óhmicos. El sistema SEC obtenido luego del curado presenta piezoresistividad (la resistividad eléctrica, ρ, es función de la tensión mecánica aplicada) y magnetoresistencia (ρ es función del campo magnético aplicado luego del curado del material). En esta Tesis se ha desarrollado también un sensor de tensión mecánica basado en dicho SEC, incluyendo la implementación de contactos, encapsulamiento y la calibración de su respuesta. Estos sistemas pueden presentar Anisotropía Eléctrica Total (TEA, por sus siglas en inglés), es decir, conductividad eléctrica apreciable únicamente en una dirección espacial, la de aplicación del campo magnético durante la preparación. El estudio teórico comienza con el análisis mediante simulaciones Monte Carlo de cómo los parámetros estructurales de los sistemas SEC influyen en la probabilidad de obtener TEA. En dichas simulaciones se comput ó la probabilidad de percolación en cada una de las direcciones características del material estructurado. En la segunda etapa teórica se desarrolló un modelo constitutivo de la respuesta piezoresistiva anisotrópica bajo la condici ón de TEA. Finalmente, se extendió dicho modelo con el fin de predecir la respuesta magnetoresistiva observada. Abstract: Elastomeric Structured Composites (SEC) are formed by inorganic material dispersions in an elastomeric matrix, in which anisotropic properties are induced. This Thesis presents an experimental and theoretical study of SEC systems. In the studied experimental systems, particles which are simultaneously magnetic and electrically conductive are dispersed in polydimethylsiloxane (PDMS). The structuring of the material (by formation of chains of inorganic material in the polymer matrix) is achieved by curing it in the presence of an intense magnetic field. The experimental study started with the synthesis and characterization of magnetite nanoparticles (NPs) and aggregate formation of micrometer NPs/silver, which are in a superparamagnetic state and are ohmic conductors. The SEC system obtained after curing has piezoresistivity (the electrical resitivity, ρ, is a function of applied stress) and magnetoresistance (ρ is a function of a magnetic field applied after curing). In this Thesis it has been developed also a mechanical stress sensor based on that SEC, including the implementation of contacts, encapsulation and calibration of the response. These systems may present Total Electrical Anisotropy (TEA), that is, appreciable electrical conductivity only in one spatial direction, the one of application of the magnetic field during preparation. The theoretical study starts with the analysis by Monte Carlo simulations of how the structural parameters of SECs ifluence the probability of TEA. In these simulations the percolation probability in each of the characteristic directions is computed. In the second theoretical stage a constitutive model of the anisotropic piezoresistive response under conditions of TEA has been developed. Finally, this model is extended in order to predict the observed magnetoresistance response.
Cita tipo APA: Mietta, José Luis . (2016-07-01). Compositos elastoméricos estructurados: estudio de los efectos magneto-piezoresistivos y su aplicación en dispositivos piezométricos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6032_Mietta.pdf Cita tipo Chicago: Mietta, José Luis. "Compositos elastoméricos estructurados: estudio de los efectos magneto-piezoresistivos y su aplicación en dispositivos piezométricos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-07-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6032_Mietta.pdf |
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Buenhombre, Ana Josefa. "Diseño y evaluación biológica de un alimento destinado a mejorar el estado nutricional proteico-energético, de niños de 10 años, de Colombia" (2016-06-30). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo del presente trabajo fue diseñar y elaborar una colación con alimentos Colombianos típicos, que cubriera 25% de las necesidades de energía y de proteínas de escolares. Se diseñaron 2 preparaciones: F1: plátano maduro, polvo de hornear, canela, esencia de vainilla, huevo entero, leche en polvo semi descremada, azúcar, manteca, miel, y harina de trigo; F2: caseína vs leche en polvo, aceite alto oleico vs manteca y sin miel. Se realizó el análisis proximal (AOAC 1990). Se evaluó la calidad proteica en ratas Wistar, determinando relación proteica neta (RPN) y digestibilidad. La composición química fue, para F1 y F2, respectivamente, g/100 g: humedad: 23,20 y 32,00; proteína: 9,69 y 13,15; lípidos: 10,35; carbohidratos digeribles 48,4 y 36,15; cenizas: 2,75; fibra: 4,30 y 3,80, aportando por colación de 160 g 24 % y 22% del requerimiento energético de un escolar de 10 años. Las colaciones presentaron sabor a plátano, tradicional en alimentos colombianos. Los ensayos biológicos indicaron en ambos casos un deterioro importante de la proteína (47 a 31% c/r a caseína), cubriendo de 24 a 22% del requerimiento del escolar. Sería de interés futuro estudiar condiciones industriales que minimicen la reacción de Maillard en relación al proceso casero de elaboración de las formulaciones diseñadas. Abstract: The objective of the present research was to design, with Colombian food products, a cake, covering 25% of energy and protein requirements of children. Two formulas were formulated which composition was: F1: ripe banana, baking powder, canela, vanila, whole egg, sugar, semi skimmed milk, butter, honey and wheat flour. F2: casein vs milk powder, high oleic oil vs butter and without honey. Proximal composition was determined (AOAC, 1990). Protein biologic evaluation was carried out in rats. Proximal composition was, for F1 y F2, respectively, g/100 g: humidity: 23,20 y 32,00; protein: 9,69 and 13,15; lipids: 10,35; digestible carbohydrates: 48,4 and 36,15; ashes: 2,75; fiber: 4,30 and 3,80. A serving size of 160 g provides 24% y 22% of energy requirements. Protein quality evaluation indicated, in both formulas, a biologic value regarding casein of 47 a 31%, covering 24 - 22 % from protein recommended allowances. Cakes presented the banana flavour accepted by colombian children. It would be of interest to study the possibility to decrease Maillard reaction applying industrial processes of preparation.
Cita tipo APA: Buenhombre, Ana Josefa . (2016-06-30). Diseño y evaluación biológica de un alimento destinado a mejorar el estado nutricional proteico-energético, de niños de 10 años, de Colombia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6059_Buenhombre.pdf Cita tipo Chicago: Buenhombre, Ana Josefa. "Diseño y evaluación biológica de un alimento destinado a mejorar el estado nutricional proteico-energético, de niños de 10 años, de Colombia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6059_Buenhombre.pdf |
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Alvarez, Natalia Clara. "Estudio de propiedades de materiales mediante la generación de ultrasonido con luz láser" (2016-06-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los ensayos no destructivos involucran técnicas de análisis que permiten el estudio de materiales sin modificar sus propiedades y manteniendo sus características funcionales luego del ensayo. Estas técnicas se emplean tanto en el ámbito industrial como en el ámbito de la investigación. Existe gran interés en el desarrollo de este tipo de herramientas, ya que permiten el ahorro de costos y tiempos en la producción y evaluación de materiales y productos. En el método de ultrasonido láser un pulso de luz incide sobre la superficie del material bajo estudio y éste es parcialmente absorbido. A partir de este fenómeno se pueden producir diversos procesos (expansión térmica, evaporación y eyección de material, etc.) que generan una perturbación que se propaga en el medio, denominada ultrasonido. Para generar ondas de ultrasonido con un gran ancho de banda se utilizan pulsos cortos de láser de alta potencia. Las características del ultrasonido generado dependen de la forma y duración del pulso, de la extensión del área iluminada y de la potencia incidente. Si la potencia incidente es demasiado alta, puede producirse la ablación de la superficie. La ablación es en la mayoría de los casos algo que se desea evitar, ya que deteriora el material que se está estudiando. En los ensayos no destructivos se emplean potencias en el régimen denominado termoelástico, donde el material sólo se ve afectado por la expansión térmica y, por consiguiente, su estructura no resulta afectada. En la técnica de ultrasonido láser, las ondas de ultrasonido generadas en el material son detectadas sobre su superficie mediante métodos ópticos de interferometría. Esta técnica es de no contacto y por lo tanto es ideal para ensayar materiales en situaciones donde el acoplamiento de un sensor con la muestra puede ser riesgoso o puede degradar la exactitud de la medición. Una de las principales ventajas de la detección interferométrica es su gran ancho de banda, a diferencia del caso de sensores de contacto, como por ejemplo, los transductores piezoeléctricos. No obstante, la limitación más importante de este método de detección es su gran sensibilidad a las diferencias de camino óptico introducidas por el ambiente, ya sea por vibraciones, fluctuaciones térmicas, etc. En esta Tesis se desarrolla, en el marco de los ensayos no destructivos, una técnica de ultrasonido láser de características robustas. Esta técnica puede ser aplicable aún en entornos industriales, donde las técnicas interferométricas tradicionales suelen presentar serios problemas debido a la presencia de fuertes vibraciones. Por un lado, en este trabajo se exploran técnicas interferométricas de detección de ondas superficiales de ultrasonido en régimen termoelástico. Se proponen métodos de recuperación de fase que permiten obtener el desplazamiento medio de la superficie bajo análisis, aún en presencia de fluctuaciones en la longitud de camino óptico de varios órdenes de magnitud mayores a las generadas por el ultrasonido. Por otro lado, se estudia la capacidad de la técnica de ultrasonido láser propuesta para caracterizar diversos aspectos de la muestra bajo análisis, como son sus constantes elásticas y su espesor. También se generan defectos controlados en las muestras y se realiza la caracterización de su profundidad y localización a través del análisis, en tiempo y frecuencia, de las señales de ultrasonido. Para validar los resultados obtenidos experimentalmente se desarrolla un esquema numérico que simula el fenómeno termoelástico de generación de ultrasonido en materiales elásticos lineales, a partir de la incidencia de ondas electromagnéticas. Este método numérico permite modelar, también, la propagación de las ondas de ultrasonido en presencia de defectos en el material. Abstract: Nondestructive testing involves analysis techniques that allow the study of materials without altering their properties and maintaining their functional characteristics after testing. This methods are employed both in industrial applications and science research. There is great interest in the development of these kind of tools, since they allow to save costs and time in the production and evaluation of materials and products. In the laser ultrasonics method, a light pulse impinges on the surface of the material under test and it is partially absorbed, after which, diverse mechanisms may occur (such as thermal expansion, vaporization and material ejection) generating a perturbation that propagates in the medium, called ultrasound. In order to produce high bandwidth ultrasound waves, a short high power laser pulse is employed. The ultrasound wavefront properties depend on the shape and temporal length of the pulse, as well as, on the extension of the illuminated area and the laser power. If the laser power is too high, ablation can occur. Ablation is usually undesirable since it deteriorates the material under study. Hence, in nondestructive testing, the laser power is kept within the thermoelastic regime where the material undergoes thermal expansion only. Thus, maintaining its structural health. In the laser ultrasonics technique, ultrasound detection is achieved on the sample surface by means of optical interferometric methods. Since this technique does not involve physical contact with the sample, it is ideal for performing material testing in situations where the coupling of the sensor and the sample is risky or may jeopardize the validity of the test. One of the main advantages of interferometric detection, in contrast to contact sensors such as piezoelectric transducers, is its high bandwidth. However, the major limitation of this method comes from its high sensitivity to optical path modifications introduced by vibrations, thermal fluctuations and other undesired environmental variations. In this Thesis we develop a nondestructive technique based in laser ultrasonics which presents robust properties. This technique can be satisfactorily employed in industrial environments, where traditional optical interferometric detection fails due to the presence of strong vibrations. On the one hand, we explore interferometric techniques to achieve detection of surface ultrasonic waves in thermoelastic regime. We propose phase retrieval methods which allow to recover the surface mean displacement successfully, even under situations in which the undesired fluctuations in the optical path length are several orders of magnitude higher than the optical path differences introduced by the ultrasound. On the other hand, we study the ability of the proposed laser ultrasonic technique to successfully characterize several properties of the sample under test, such as, elastic parameters and thickness. We also create controlled defects in aluminium samples and estimate experimentally its depth and position by means of time-frequency signal analysis techniques. In order to validate the experimental results, we also develop a numerical method that allows to simulate the thermoelastic ultrasound generation, in linear elastic materials, from incident electromagnetic waves. This method is also capable of modeling the ultrasound propagation under the presence of defects in the simulated sample.
Cita tipo APA: Alvarez, Natalia Clara . (2016-06-30). Estudio de propiedades de materiales mediante la generación de ultrasonido con luz láser. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6009_Alvarez.pdf Cita tipo Chicago: Alvarez, Natalia Clara. "Estudio de propiedades de materiales mediante la generación de ultrasonido con luz láser". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6009_Alvarez.pdf |
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Martínez Curci, Natalia Soledad. "Ecología de aves playeras migratorias durante la invernada, migración y el sobre-veraneo en Bahía Samborombón, Buenos Aires, Argentina" (2016-06-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las poblaciones mundiales de aves playeras han disminuido drásticamente en las últimas décadas, principalmente a causa de la degradación de los hábitats sobre los que tienen estrecha dependencia. El objetivo general de esta tesis fue evaluar de manera integral las causas que condicionan la distribución y la abundancia de las aves playeras en la Bahía Samborombón, trabajando en escalas con diferente extensión espacial (escala de hábitat y paisaje) y temporal (largo y corto plazo). Para ello se caracterizaron los ensambles en función a la época del año y el tipo de ambiente que utilizan para alimentarse (Capítulo II); se describieron la dieta y las interacciones tróficas de las especies más abundantes (Capítulo III); se evaluó la importancia del área para el sobre-veraneo de una de las especies de mayor prioridad de conservación (Capítulo IV) y las posibles causas de este comportamiento (Capítulo V); y finalmente se evaluó la capacidad de variables ambientales medidas a escala de paisaje para explicar los patrones de distribución y abundancia observados (Capítulo VI). La Bahía Samborombón albergó los mayores números de aves playeras durante la primavera, otoño y verano, estaciones en las que el ensamble estuvo dominado por migrantes neárticas. Se estimó que utilizan el área porcentajes significativos de las poblaciones globales de Chorlo Pampa, Becasa de Mar, Playerito Rabadilla Blanca, Chorlito Doble Collar y Ostrero Común. Los principales ambientes de alimentación durante la bajamar fueron las planicies de marea estuariales. Allí los patrones de abundancia variaron mostrando una correlación espacio-temporal que indicó mayor similitud entre estaciones consecutivas. De este modo, las áreas con mayores densidades de aves playeras se desplazaron desde el sur hacia el centro de la bahía en el transcurso del año; recibiendo el sector que abarca desde canal 15 hasta Punta Rasa el mayor uso. Los patrones anuales fueron explicados significativamente por una relación negativa con la distancia al mar, variable que también explicó las variaciones en los patrones de abundancia durante el verano y el otoño. En el otoño también fue significativa la distancia a las desembocaduras de cuerpos de agua dulce. Las aves no respondieron a variables asociadas a características del paisaje que rodea a las áreas de alimentación o a la disponibilidad de áreas de descanso. Las especies coexistentes exhibieron diferenciación complementaria en dos dimensiones de su nicho trófico: composición taxonómica y talla del principal ítem presa. Se concluyó que la competencia interespecífica por explotación es capaz de modelar la composición del ensamble durante el otoño y el invierno. Nueve especies de migrantes neárticas permanecieron en el área durante el invierno (comportamiento conocido como sobre-veraneo), estación en la que la mayoría de las aves de este grupo se encuentra en áreas de cría septentrionales. Se identificó que Punta Rasa constituye el sitio de sobre-veraneo de mayor importancia conocido para la amenazada población de playeros rojizos de Tierra del Fuego. Se investigaron las causas de este fenómeno y se concluyó que los sobre-veraneantes son aves tanto adultas como juveniles que presentan al inicio del sobre-veraneo escasa o nula acumulación de reservas pre-migratorias y ausencia o retraso en los patrones de muda esperados para individuos en condiciones de migrar. El porcentaje de playeros rojizos adultos sobre-veraneantes incrementó en los últimos años. Sin embargo, la mayoría de estos individuos lograron reestablecer sus migraciones en años subsiguientes. Este conjunto de resultados permitirá mejorar la conservación y manejo regional de las especies para las cuales la Bahía Samborombón mostró alberga números significativos. Además podrán aplicarse a estrategias locales que permitan un manejo efectivo del área, basando las acciones en información detallada sobre requerimientos tróficos y de uso de hábitat. Específicamente, se destaca la necesidad de incrementar las medidas de protección de Punta Rasa no solo en las épocas de paso migratorio y descanso no reproductivo, sino también en la etapa de sobre-veraneo que no había sido considerada previamente. Asimismo, el conocimiento de la variación temporal en el uso del espacio, permitirá desarrollar estrategias específicas de protección que contemplen la mayor importancia de los sectores sur y centro de la Bahía Samborombón, y especialmente de las áreas cercanas a desembocaduras de arroyos, ríos y canales. Abstract: World shorebird populations have declined drastically in recent decades, mainly due to the degradation of the habitats on which they rely on. The main objective of this thesis was to comprehensively evaluate the causes affecting the distribution and abundance of shorebird at Samborombón Bay, considering different spatial (habitat- and landscape-scale) and temporal (short and long term) scales. To achieve this goal, assemblages were characterized according to season and feeding habitat (Chapter II); diet and trophic relationships of the most abundant species were described (Chapter III); the importance of the area for over-summering (Chapter IV) and the plausible causes of this behavior (Chapter V) were evaluated; and the ability of environmental variables measured at landscape scale to explain patterns of shorebirds distribution and abundance was assessed (Chapter VI). Samborombón Bay hosted the largest numbers of shorebirds during spring, autumn and summer, seasons when the assembly was largely dominated by Nearctic migrants. Estimates indicate that the area hosts significant percentages of the global populations of American Golden Plover, Hudsonian Godwit and White-rumped Sandpiper, Two-banded Plover and American Oystercatcher. The main feeding habitats during low tide were the estuarine intertidal mudflats. Abundance patterns in feeding areas do not remained constant through the year, but rather varied showing a spatiotemporal correlation that indicates greater similarity between consecutive seasons. Thus, areas with highest shorebird densities moved from the south to the center of the bay throughout the year. In this sense, the area from Canal 15 to Punta Rasa showed the greatest intensity of use. These annual patterns were significantly explained by a negative relationship with the distance to the sea, variable that also explained the variations in abundance observed during summer and autumn. During the latter season, a negative association with distance to rivers, streams and creeks was also identified. Shorebirds’ abundance was not related to variables associated to the surrounding soil coverage or to the availability of resting areas. Co-occurring species showed complementary differentiation in two dimensions of their trophic niches: taxonomic composition and size-class. It was concluded that interspecific competition for food resources might shape the composition of the assemblage during autumn and winter. Individuals of nine Nearctic migrants’ species remained at Samborombón Bay during the breeding season (phenomenon known as over-summering). In this sense, the southern tip was identified as the most important over-summering site for the endangered Red Knot population of Tierra del Fuego. The causes of this phenomenon were investigated and it was concluded that oversummerers are both juvenile and adult birds with absent or delayed pre-migratory conditions, showing low fat accumulation and delayed moult of flight and body feathers. The percentage of adult oversummering Red Knots increased in recent years. However, most of these individuals were able to resume their migrations in subsequent years. This set of results might help to improve regional management and conservation efforts focused on the species for which Samborombón Bay hold significant numbers. They might also be applied to local strategies that allow an effective management based on detailed information on shorebirds’ requirements. Specifically, this work highlights the need to increase protection measures not only during migration and wintering of Nearctic migrants, but also during over-summering. In addition, the knowledge of the spatio-temporal distribution patterns might allow the development of specific management strategies that consider the importance of southern and central sector of the bay, and particularly of the mouths of streams, channels and creeks.
Cita tipo APA: Martínez Curci, Natalia Soledad . (2016-06-29). Ecología de aves playeras migratorias durante la invernada, migración y el sobre-veraneo en Bahía Samborombón, Buenos Aires, Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6043_MartinezCurci.pdf Cita tipo Chicago: Martínez Curci, Natalia Soledad. "Ecología de aves playeras migratorias durante la invernada, migración y el sobre-veraneo en Bahía Samborombón, Buenos Aires, Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6043_MartinezCurci.pdf |
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de Errasti, Andrés. "Hongos manchadores de albura en especies forestales exóticas y nativas de los Andes Patagónicos: taxonomía, patogenicidad y manejo" (2016-06-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Esta tesis constituye el primer relevamiento sistemático de hongos manchadores de albura de la Patagonia argentina. La ‘mancha de albura’ es una modificación de las propiedades ópticas de la madera como consecuencia de la colonización fúngica. El cuerpo (hifas) pigmentado del hongo penetra el parénquima radial y los tejidos vasculares ocasionando una mancha profunda. La mayoría de especies manchadoras pertenecen a los hongos ‘ofiostomatoides’. Este grupo polifilético dentro de los Ascomycota se encuentra asociado íntimamente con artrópodos, en particular, a escarabajos de corteza y ambrosía (Coleoptera: Scolytinae/Platypodinae). Existen casos bien documentados de patógenos primarios dentro del grupo (por ejemplo Ceratocystis fagacearum, Ceratocystis fimbriata, Ophiostoma ulmi), sin embargo, la mayoría de las especies manchan la madera recién cosechada, como saprobios. La madera manchada tiene un precio de venta menor y su aceptación en el mercado disminuye. Ante la falta de información en el país sobre la diversidad y biología de este grupo, se planificó su recolección y estudio en la Patagonia durante el período 2009-2014. El relevamiento fue realizado durante 3 años. Se visitaron diferentes plantaciones y zonas de bosque nativo en las regiones cordilleranas de las provincias del Chubut, del Río Negro y del Neuquén. Los taxones fueron identificados mediante técnicas morfológicas y moleculares (regiones LSU, ITS, β-Tubulina y el factor TEF 1-α). Sus asociaciones con insectos también fueron informadas. En base a la diversidad encontrada sobre árboles enfermos (Nothofagus, Schinus) se diagramaron ensayos para estimar la patogenicidad de algunos aislamientos sobre árboles sanos. Paralelamente, se caracterizó el ciclo del manchado en pináceas utilizadas por la industria forestal, intentando cuantificar la colonización fúngica en función del tiempo, para árboles apeados en distintas épocas del año. Se coleccionaron 588 muestras de las que se obtuvieron 370 aislamientos. Estos fueron clasificados en 28 taxones: 18 taxones conocidos y 10 taxones nuevos para la ciencia. De los nuevos, 5 fueron descriptos formalmente: Huntiella decorticans, Leptographium gestamen, Ophiostoma patagonicum, Ophiostoma peregrinum y Sporothrix cabralii. El bosque andino-patagónico evidenció una importante diversidad con un 80% de taxones endémicos (12/15). Por el contrario, las plantaciones de pináceas estuvieron asociadas a especies que han sido introducidas junto con éstas, tal como se ha constatado en otras regiones del Hemisferio Sur. Los primeros datos moleculares de Ophiostoma nothofagi han permitido identificar un linaje independiente dentro de la familia Ophiostomataceae, cuyas características morfológicas y ecológicas particulares respaldan la posibilidad de erigir un género nuevo para ésta y otras especies relacionadas. En los ensayos de patogenicidad a campo, Huntiella decorticans colonizó satisfactoriamente árboles sanos, de acuerdo con los postulados de Koch. Su relación con escarabajos que se alimentan de savia fresca y la formación de una estructura tipo ‘pressure pad’ indican un comportamiento patogénico. Sin embargo, la formación de cancros fue consecuencia de lesiones localizadas y no de infecciones sistémicas típicas de un marchitamiento. Por el contrario L. gestamen y O. patagonicum no pudieron colonizar sus hospedantes (Nothofagus spp. y Schinus patagonicus, respectivamente), por lo que serían saprobios oportunistas dispersados por escarabajos de ambrosía hacia hospedantes bajo estrés severo. En las plantaciones de coníferas, Ophiostoma piliferum y O. peregrinum fueron las especies de mayor frecuencia, si bien la tasa de colonización de Diplodia pinea fue superior. Las dos primeras están asociadas a las especies de escarabajos Hylurgus ligniperda y Orthotomicus laricis. Las especies de Grosmannia fueron aisladas principalmente de Hylastes ater. Los ensayos a campo indican que los troncos estuvieron libres de mancha por 3 meses, independientemente de su época de apeo. A partir del tercer mes los árboles cosechados en primavera y, en menor medida en otoño, son altamente susceptibles al ataque de hongos ‘ofiostomatoides’, probablemente porque en esas épocas se producen los picos de vuelo de los escarabajos adultos. Las cosechas de verano son críticas si el rodal está afectado por Diplodia. La colonización de ésta especie, usualmente en estado latente dentro del tejido sano del hospedante, se ve favorecida por las altas temperaturas de la estación. El invierno es la época más favorable para la cosecha. Ophiostoma peregrinum, especie que inicialmente fue reportada en el hemisferio Norte sobre Betula sp., mostró en la Patagonia una amplia distribución y frecuencia en plantaciones (inclusive colonizando hospedantes nativos) remarcando los peligros del comercio entre regiones distantes. Abstract: This thesis comprehends the first survey of sap-stain fungi on exotic conifers and native broad-leaved species (Nothofagus) from Patagonia, Argentina. ‘Sap-stain’ is a dark discoloration of wood as a consequence of fungal colonization. Pigmented fungal hyphae penetrate the radial parenchyma and the vascular tissue, causing a deep stain. Most sapstain species belong to the so-named ‘ophiostomatoid fungi’ a polyphyletic group of ascomycetes with similar morphology and taxonomic history. These species are adapted to arthropod dispersal, especially bark and ambrosia beetles (Coleoptera: Scolytinae/Platypodinae). Pathogens are well documented among sap-stain species (e.g. Ceratocystis fagacearum, Ceratocystis fimbriata, Ophiostoma ulmi). Nevertheless, most species are saprobes, colonizing timber after harvest. Stained wood has a lower market value and a decreased acceptance, causing major losses to the forest industry worldwide. Addressing the need to characterize ophiostomatoid diversity and biology in Patagonia, a five-year project was undertaken (2009-2014). A three-year survey (2009-2012) in Neuquén, Río Negro and Chubut Provinces included milling companies, pine plantations and native forests. Species were collected and identified based on morphology and DNA sequence comparisons of multiple loci (LSU, ITS, β-Tubulin, TEF 1-α). Insect associates were also informed. Isolates obtained from diseased trees (Nothofagus, Schinus) were selected for pathogenicity trials. On pine plantations, colonization of logs was estimated at different intervals, for logs harvested in different seasons. A total of 588 samples were collected, and 370 isolates were obtained. These were classified under 28 taxa: 18 known species and 10 new taxa. In the present study, 5 out of these new 10 species were described: Huntiella decorticans, Leptographium gestamen, Ophiostoma patagonicum, Ophiostoma peregrinum and Sporothrix cabralii. Nothofagus forests include several, previously unknown, sap-stain taxa. The 80% of these (12/15) are considered to be endemic. On the other hand, species present on pine plantations have been most likely introduced, similarly to other Southern Hemisphere Countries. The first molecular data of Ophiostoma nothofagi strongly suggests the presence of an independent lineage within the Ophiostomataceae. Its morphological characteristics and ecological features also support the possibility to erect a new genus for this and other related taxa. Huntiella decorticans was able to colonize healthy trees in pathogenicity trials. Its relation to sap-feeding beetles (Coleoptera:Nitidulidae) as well as the formation of a ‘pressure-pad’ structure, points out a pathogenic capability. Nevertheless, the formation of cankers indicates a localized lesion and not a systemic colonization, typical of a wilted tree. On the contrary, Leptographium gestamen and Ophiostoma patagonicum could not colonize healthy trees and both species probably behave as opportunistic saprobes vectored by ambrosia beetles to severely stressed trees. On pine plantations, the most frequent species were Ophiostoma piliferum and O. peregrinum. However, Diplodia registered higher colonization rates. The former ophiostomatoid species are associated to Hylurgus ligniperda and Orthotomicus laricis galleries. Grosmannia species were found in association with Hylaster ater galleries. At every site logs were stain-free for 3 months, no matter which season they were harvested. After this period, harvest in spring (and sometimes autumn) is highly susceptible to ‘ophiostomatoid’ stain, probably because it is also beetle flying season. Summer harvest is critical if the stand is infected with Diplodia, because this endophytic fungus grows vigorously at high temperatures. Field trials indicate winter as the most favorable season to harvest. Ophiostoma peregrinum, initially reported from the Northern Hemisphere associated with Scolytus ratzeburgi on Betula, evidenced a wide geographical distribution and host range (even on native species) in Patagonia, showing the risks associated to commercial trade between distant regions.
Cita tipo APA: de Errasti, Andrés . (2016-06-27). Hongos manchadores de albura en especies forestales exóticas y nativas de los Andes Patagónicos: taxonomía, patogenicidad y manejo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6014_DeErrasti.pdf Cita tipo Chicago: de Errasti, Andrés. "Hongos manchadores de albura en especies forestales exóticas y nativas de los Andes Patagónicos: taxonomía, patogenicidad y manejo". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6014_DeErrasti.pdf |
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Martínez, Jimena Hebe. "Rol de alfa-sinucleína en la función y dinámica mitocondrial en modelos experimentales de la Enfermedad de Parkinson" (2016-06-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La enfermedad de Parkinson es una patología neurodegenerativa que afecta al 1% de la población mayor de 60 años. Se caracteriza por déficits motores, temblor en reposo y una pérdida selectiva de las neuronas dopaminérgicas de la Substantia Nigra Pars Compacta. Otro rasgo típico es la aparición de agregados proteicos conocidos como cuerpos de Lewy cuyo principal componente es una pequeña proteína, α-sinucleína. Esta proteína se une a las membranas lipídicas y en su conformación de α-hélice podría modular la fusión de las vesículas sinápticas con las membranas pre-sinápticas e influiría en la liberación de neurotransmisores. En condiciones patológicas, α-sinucleína sería capaz de unirse a las mitocondrias y se ha propuesto que esta unión provocaría disfunción mitocondrial y estrés oxidativo que colaborarían en el desarrollo de la enfermedad. La hipótesis de este trabajo propone que AS se incorpora a la mitocondria y se distribuye en sus distintos compartimientos. En esas localizaciones, esta proteína generaría disfunción mitocondrial incidiendo negativamente sobre distintos parámetros metabólicos, sobre la dinámica mitocondrial y la autofagia. En el presente trabajo se estudió la localización específica de α-sinucleína en mitocondrias aisladas de cerebro de rata. Se emplearon técnicas de microscopía de fluorescencia, microscopía electrónica de transmisión, Transferencia de energía de resonancia de Förster (FRET), fraccionamientos celulares y mitocondriales, western blots y distintos ensayos bioquímicos. Los resultados obtenidos en mitocondrias aisladas mostraron que AS 1μM se asocia a la mitocondria, mayoritariamente en la membrana externa y AS 10μM y 50 μM se encuentra principalmente internalizada. La microscopía electrónica confirmó la localización de α-sinucleína en el interior de la mitocondria y también en la periferia. Mediante un experimento de FRET se demostró un posible rol para el transportador de membrana externa TOM en la incorporación de AS. El análisis de la funcionalidad mitocondrial reveló que α-sinucleína altera el consumo de O2, el potencial de membrana, la producción de ATP y aumenta la generación de especies reactivas de oxígeno. Por otra parte, se utilizaron células SH-SY5Y transfectadas con α-sinucleína para estudiar el efecto sobre la viabilidad celular, la producción de ATP, la generación de especies reactivas de oxígeno, la dinámica mitocondrial y la autofagia. Los resultados revelaron una disminución significativa de la viabilidad, en paralelo a una disminución en la producción de ATP y generación aumentada de especies reactivas. Además, α-sinucleína indujo disipación del potencial de membrana mitocondrial, desbalance de los procesos de fisión-fusión y desencadenamiento de la autofagia y mitofagia. Estos últimos procesos actuarían como un mecanismo de rescate celular disminuyendo la muerte y eliminando la mitocondrias dañadas. Este trabajo agrega evidencia novedosa al conocimiento de la localización de α-sinucleína en los distintos compartimientos mitocondriales, sus efectos sobre la funcionalidad mitocondrial y la relevancia de la disfunción de la organela en el destino celular. De este modo representan una contribución a la comprensión de los procesos que llevan a la patogénesis de la Enfermedad de Parkinson. Abstract: Parkinson disease is a neurodegenerative pathology of the central nervous system affecting 1% of the population over 60 years old. This disease is characterized by motor deficiency, rest tremor, and the selective loss of dopaminergic neurons of the Substantia Nigra Pars Compacta. Another typical feature is the occurrence of protein aggregates known as Lewy’s bodies. The main component of Lewy’s bodies is a small protein named α-synuclein. This protein binds to lipidic membranes. The α-helix conformation could regulate the fusion between synaptic vesicles and pre-synaptic membranes modulating the neurotransmitter release. In pathological conditions, α-synuclein is associated to mitochondria. This interaction would trigger mitochondrial impairment and reactive oxygen species generation both events involved in the development of Parkinson's disease. This study hypothesizes that α-synuclein could be incorporated into the mitochondria and distribute in their different compartments. In these locations, this protein would be able to impair the mitochondrial function implying processes such as metabolic imbalance, mitochondrial dynamics and autophagy. The present work studies the specific location of α-synuclein in isolated rat brain- mitochondria. Techniques of fluorescence microscopy, transmission electron microscopy, Förster Resonance Energy Transfer (FRET), cellular and mitochondrial fractionation, western blots and several biochemical assays were used. Results showed that α-synuclein 1μM was associated to mitochondria mainly on the outer membrane while α-synuclein 10μM and 50μM were internalized. Electron microscopy supported α-synuclein location inside the mitochondrion and also in the periphery. A possible role for the transporter outer membrane (TOM) in the incorporation of α-synuclein to mitochondria was suggested by FRET assay. The analysis of mitochondrial functionality revealed that α-synuclein alters O2 consumption, mitochondrial membrane potential and ATP production. In addition, an increase in the reactive oxygen species generation was observed. On the other hand, employing a cellular experimental model (SH-SY5Y cells transfected with α-synuclein) we demonstrated that this protein diminished cell viability and reduced ATP production with a concomitant increase in reactive oxygen species generation. In addition, α-synuclein was able to trigger mitochondrial membrane dissipation, imbalance in fission-fusion processes, autophagy and mitophagy. Both autophagy and mitophagy could act as rescue cellular mechanisms by decreasing cell death and damaged mitochondria. Taken together, these results add new evidence to the knowledge of mitochondrial specific α-synuclein location, the effects of this protein on the mitochondrial functionality and the relevance of this organelle dysfunction on cell viability. Thereby, these studies represent a contribution to understand the processes leading to development of Parkinson Disease.
Cita tipo APA: Martínez, Jimena Hebe . (2016-06-10). Rol de alfa-sinucleína en la función y dinámica mitocondrial en modelos experimentales de la Enfermedad de Parkinson. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6010_Martinez.pdf Cita tipo Chicago: Martínez, Jimena Hebe. "Rol de alfa-sinucleína en la función y dinámica mitocondrial en modelos experimentales de la Enfermedad de Parkinson". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6010_Martinez.pdf |
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Toro, Ayelén Rayen. "Leptina regula la supervivencia e invasión de células trofoblásticas" (2016-06-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En los mamíferos el crecimiento y la supervivencia del feto durante su desarrollo dependen exclusivamente de la placenta, un órgano altamente especializado que produce un gran número de factores de crecimiento. Leptina, una hormona producida principalmente por el tejido adiposo que se asocia con la saciedad y el balance energético, presenta un papel importante en reproducción. Se ha evidenciado la expresión de leptina y de sus receptores en placenta y se ha demostrado que durante la gestación tiene efectos sobre el crecimiento, la angiogénesis y la inmunomodulación, afectando tanto funciones maternas como fetales. Sin embargo, muchos de los mecanismos de acción de leptina sobre la implantación y el crecimiento embrionario son aún desconocidos. El presente trabajo ha sido desarrollado con el objetivo de investigar la acción de leptina sobre la supervivencia e invasión de células placentarias. Se utilizaron como modelos la línea celular Swan-71 y explantos de placenta humana a término bajo distintas condiciones de estrés celular y daño como el hambreado de factores de crecimiento, la radiación UV, la hipertermia y la acidificación del medio de cultivo. Determinamos que leptina promueve la proliferación de células Swan-71, aumentando la expresión de ciclina D1, Ki-67 y p21. Asimismo demostramos que leptina disminuye la muerte celular por apoptosis evidenciada por la disminución de distintos parámetros como la activación de caspasa-3, el clivado de PARP-1 y la fragmentación del ADN. También hallamos que leptina modifica los niveles de intermediarios mitocondriales aumentando la relación Bcl-2/Bax y disminuyendo la expresión de Bid. Al profundizar en el mecanismo involucrado en el efecto de leptina sobre la sobrevida de células trofoblásticas, evidenciamos que leptina disminuye los niveles de expresión, actividad y fosforilación en serina 46 del factor de transcripción p53, pieza clave en la modulación del ciclo celular y apoptosis. Leptina además aumenta los niveles de la proteína Mdm-2, reguladora principal de la vida media de p53. Más aún, por ensayos con cicloheximida demostramos que la vida media de p53 disminuye en presencia de leptina. Por otro lado mediante el uso de inhibidores farmacológicos y de ensayos de transfección transitoria, observamos que las vías de MAPK (ERK 1/2) y PI3K/Akt median los efectos de leptina sobre p53. En último lugar, demostramos que leptina promueve la migración e invasión trofoblástica. Analizamos la expresión de proteínas involucradas en la adhesión celular y observamos que en presencia de leptina disminuye la expresión de E-cadherina y aumentan los niveles de Integrina β1. Probamos también que leptina modula la expresión y actividad de metaloproteasas, favoreciendo la invasión celular. Los resultados obtenidos refuerzan la noción de leptina como una citoquina placentaria involucrada en la regulación de procesos de suma relevancia durante la gestación como la proliferación, apoptosis e invasión, sustentando su importancia en la biología de la reproducción. Abstract: In mammals the growth and survival of the fetus during its development depend exclusively on the placenta, a highly specialized organ that produces several growth factors. Leptin, a hormone produced mainly by adipose tissue that is associated with satiety and energy balance, has an important role in reproduction. It has been found that leptin and its receptor are expressed in placenta and it has been shown that during pregnancy leptin modulates growth, angiogenesis and immunomodulation, affecting both maternal and fetal functions. However, many of the mechanisms of leptin action on embryo implantation and growth are still unknown. This work has been developed in order to investigate leptin action on survival and invasion of placental cells. Swan-71 cell line and human placental explants were used as models and were exposed under different conditions of cellular stress and damage as starved of growth factors, UV irradiation, hyperthermia and acidification of the culture medium. We found that leptin promotes proliferation of Swan-71 cells by increasing cyclin D1, Ki-67 and p21 expressions. We demonstrated that leptin decreases cell death by apoptosis as evidenced by reduction of various parameters such as the activation of caspase-3, cleaved PARP-1 and DNA fragmentation. We also found that leptin influences mitochondrial intermediates by augmenting Bcl-2/Bax ratio and decreasing Bid expression. By delving into the mechanisms involved in leptin effect on the survival of trophoblast cells, we showed that leptin decreased expression, activity and phosphorylation of serine 46 of p53 transcription factor, a key element in the modulation of cell cycle and apoptosis. Leptin also increases the levels of Mdm-2, the main regulator of p53 protein half-life. Moreover, using cycloheximide we showed that p53 half-life decreases in the presence of leptin. Furthermore by using pharmacological inhibitors and transient transfection assays, we observed that MAPK (ERK 1/2) and PI3K/Akt pathways mediate leptin effects on p53. Moreover, we showed that leptin promotes trophoblastic migration and invasion. We analyzed the expression of proteins involved in cell adhesion and found that leptin decreases E-cadherin expression and increased β1 integrin levels. We also demonstrated that leptin modulates the expression and activity of metalloproteinases, promoting cell invasion. In summary, our results reinforce the notion of leptin as a placental cytokine involved in the regulation of processes extremely important during pregnancy as proliferation, apoptosis and invasion, supporting the importance of leptin in the biology of reproduction.
Cita tipo APA: Toro, Ayelén Rayen . (2016-06-07). Leptina regula la supervivencia e invasión de células trofoblásticas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6000_Toro.pdf Cita tipo Chicago: Toro, Ayelén Rayen. "Leptina regula la supervivencia e invasión de células trofoblásticas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6000_Toro.pdf |
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Radovani, Natalia Inés. "Cambios poblacionales y comportamentales en guanacos (Lama guanicoe) asociados con la caza furtiva y su restricción en Patagonia norte" (2016-06-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La sobreexplotación por cacería es una de las amenazas más importantes para la supervivencia de los mamíferos a escala mundial, siendo los ungulados uno de los grupos de mamíferos más afectados. En algunos casos el aumento de la caza está asociado a la apertura de accesos que facilitan la llegada de cazadores a sitios previamente inaccesibles. El guanaco ha sido extirpado del 70% de su rango de distribución debido al impacto de actividades humanas como la caza y la ganadería. En esta tesis presento un análisis de los cambios poblacionales y comportamentales del guanaco asociados al incremento del acceso de cazadores a través de una extensa red de caminos de exploración petrolera en el norte de Patagonia y la reversión de algunos de esos cambios luego de 10 años de cierre de caminos y aumento del contralor. En el capítulo 1 analizo los cambios en la densidad, estructura social y proporción de crías de guanaco en un área de 15.000 km² en el norte de la provincia de Neuquén en el período 1982 a 2007. Estimé estas variables por medio de transectas de conteo estacional de guanacos a lo largo de caminos secundarios durante 2002-2007 y las comparé con datos disponibles para 1982-3 de transectas terrestres y aéreas. Luego de 25 años de caza furtiva desde una amplia red de caminos petroleros y con escaso contralor por guardas las densidades promedio disminuyeron 93-96% en tres sitios. El tamaño promedio de los grupos se redujo de 11.4 (ES=1.4) y 8.1 (ES=1.6) a 5.0 (ES=0.7) y 5.0 (ES 0.4) guanacos por grupo en dos de los sitios de muestreo. Las proporciones de crías no cambiaron significativamente. En base a una comparación entre siete sitios con diferente densidad de caminos petroleros, puntos de acceso desde caminos principales y densidad de ganado concluí que la densidad en 2002-2007 estuvo asociada de manera negativa principalmente con la disponibilidad de puntos de acceso a los caminos petroleros y en menor medida con la densidad de ganado. En el capítulo 2 presento los resultados de un experimento de restricción de caza furtiva en un sector de 3.990 km² del área de estudio considerada en el capítulo 1. Entre 2002 y 2005 diseñé junto a mi grupo de trabajo y técnicos provinciales una serie de cierres para restringir el acceso por cazadores furtivos. Hipoteticé que la caza furtiva limita la abundancia de guanacos y provoca cambios en su estructura social, distribución y comportamiento a través del aumento de la mortalidad y el acoso y que si la caza es restringida sus efectos se revierten. En febrero de 2006 una empresa petrolera, por solicitud de la Dirección de Áreas Protegidas de Neuquén, cerró 376 caminos petroleros en los sitios que indiqué y en 2010 reforzó 94 de esos cierres en un área de 2200 km² que abarcó cinco de los sitios experimentales, manteniéndose tres sitios sin cierres. Paralelamente a partir de 2005 la Dirección de Áreas Protegidas y la de Contralor incrementaron el esfuerzo de patrullaje. Entre 2002 y 2015 registré en los ocho sitios el esfuerzo de patrullaje y el ingreso de vehículos no autorizados por medio de sensores de tránsito y monitoreé la densidad estacional, estructura social, proporción de crías y comportamiento de escape relevando 6.417 km en 37 transectas permanentes. Clasifiqué a los ocho sitios por esfuerzo de restricción de caza alto, medio y bajo por el porcentaje de caminos cerrados y los kilómetros recorridos mensuales para contralor por guardafaunas y guardaparques. El contralor se incrementó en el período 2005-15. El número de vehículos por mes no autorizados que registré con los sensores disminuyó significativamente en todos los sitios de estudio y fue menor en los sitios con esfuerzo medio y alto de restricción. Registré un total de 5.978 grupos de guanacos en las transectas. En dos de los cinco sitios con esfuerzo medio y alto de restricción de caza hubo aumentos de densidad de guanacos. En otros dos de esos cinco sitios hubo aumentos iniciales de densidad pero en ambos las densidades se redujeron significativamente durante el resto del estudio. Estas tendencias declinantes pudieron estar asociadas a la actividad de caza de las únicas dos familias de pobladores locales que cazaron con frecuencia en el área de estudio. En los tres sitios sin cierre de caminos (esfuerzo bajo de restricción) y en otro de los sitios de esfuerzo medio no hubo aumentos de densidad durante el estudio. La distancia de acercamiento hasta escape aumentó en todos los sitios con esfuerzo medio y alto de restricción de caza y no se modificó en los sitios con esfuerzo bajo. El tamaño de grupos familiares y de solteros y la proporción de solitarios no respondieron positivamente en ninguno de los sitios. Otros factores que pueden haber afectado mis resultados fueron las distancias de cada sitio a las ciudades de las que provienen los cazadores que operan con vehículos y las distancias a fuentes de inmigración poblacional de guanacos. Mis resultados ilustran la necesidad de enfoques de largo plazo y gran escala espacial para entender los procesos biológicos que afectan a las poblaciones sometidas a intensa caza furtiva y provee fundamentos para planificar acciones de recuperación y monitoreo de poblaciones y de evaluaciones de la efectividad de las intervenciones. En el capítulo 3 evalué la contribución relativa de la restricción de caza furtiva, la densidad relativa de ganado y la productividad primaria (EVI) sobre la densidad de guanacos durante un período de restricción progresiva de la caza). Analicé la asociación entre las estimaciones de densidad anuales de guanacos durante 2004-10 y las covariables mencionadas mediante un modelo lineal mixto de tipo Poisson considerando el año como variable aleatoria. El análisis indicó que la productividad primaria y la tasa de encuentro de ganado tuvieron asociaciones negativas con la densidad de guanacos y que hubo más guanacos en sitios con alta y media restricción de caza. Sin embargo, para ganado y EVI los coeficientes de la regresión fueron muy bajos, indicando que estas dos variables tuvieron escasa influencia sobre la densidad de guanacos. El ganado en la región tuvo una tendencia declinante en el período de estudio. Este estudio resalta la importancia de la restricción de caza furtiva (a través de un conjunto de acciones como el cierre de caminos y el aumento de contralor como algo fundamental en la recuperación de guanacos a través de los años. Esta tesis es la primera evaluación sistemática de las respuestas poblacionales y comportamentales del guanaco a la caza y su restricción. En el estudio consideré diferentes escalas temporales y espaciales para evaluar los efectos de la caza favorecida por el desarrollo hidrocarburífero y compararlos con otros disturbios antrópicos y ambientales. Mis resultados pueden ser aplicados a la remediación de los impactos de la caza y al monitoreo de la efectividad de las acciones implementadas y de las respuestas de las poblaciones a dicha remediación. Abstract: Unsustainable hunting is one of the major threats to the persistence of mammals worldwide, and ungulates are one of the groups of mammals that is most affected. In some cases hunting is greatly increased when hunters gain access to previously inaccessible sites with the construction of new roads. Guanacos have been extirpated from 70% of their range due to the impact of human activities such as hunting and livestock husbandry. In this thesis I present an analysis of the changes in demography and behavior of guanacos associated with an increase in access for hunters through an extensive network of oil exploration trails in northern Patagonia, and the reversal of some of these changes over 10 years after closing of oil trails and an increase in control of illegal hunting. In Chapter 1, I analyze the changes in density, social structure, and proportion of guanaco young in a 15,000 km² area in northern Neuquén Province in the period between 1982 and 2007. I estimated these variables by means of seasonal transect counts of guanacos along secondary roads during 2002-2007 and compared them to data available for 1982-3 from terrestrial and aerial transects. After 25 years of poaching from a wide network of oil trails and with little control by rangers the mean densities decreased 93-96% in three sites. The mean group size reduced from 11.4 (SE=1.4) and 8.1 (SE=1.6) to 5.0 (SE=0.7) and 5.0 (SE=0.4) in two of the study sites. The proportions of young did not change significantly. Based on a comparison between seven sites with different density of oil trails, access points from main roads, and guanaco density, I concluded that the density in 2002-2007 was negatively associated mainly with availability of access points to oil trails and to a lesser extent with livestock density. In Chapter 2, I present the results of an experiment of restriction of poaching in a 3,990 km² section of the study area considered in Chapter 1. Between 2002 and 2005 I designed together with my work group and provincial technicians a series of oil trail closings to restrict access by poachers. I hypothesized that poaching limits the abundance of guanacos and causes changes in their social structure, distribution, and behavior due to increase in mortality and harassment, and that if poaching is restricted its effects will be reverted. In February 2006 an oil company, by request of the Department of Protected Areas of Neuquén, closed 376 oil trails and in 2010 reinforced 94 of those closings in sites which I indicated in a 2,200 km² area that included five of the experimental sites. Three of the sites remained without closings. Simultaneously, since 2005 the Department of Protected Areas of Neuquén and the Department of Wildlife Rangers increased their patrolling efforts. Between 2002 and 2015 I obtained records of patrolling by rangers and recorded entrance of unauthorized vehicles in the eight sites by means of traffic sensors. I also monitored the seasonal density, social structure, proportion of young, and flight behavior of guanacos in these sites by surveying 6,417 km in 37 permanent transects. I classified the eight sites into high, medium, and low effort of restriction of poaching based on the percentage of oil trails that were closed and kilometers traveled each month by rangers for control of poachers. Control increased in the 2005-15 period. The number of unauthorized vehicles entering per month that I registered with traffic sensors diminished significantly in all the study sites, but was lower in the sites with medium and high restriction efforts. I registered a total of 5,978 guanaco groups in the transects. In two of the five sites with medium and high restriction effort there was an increase in guanaco density. In another two of the five sites there were initial increases in density, but in both the densities were reduced significantly during the rest of the study. These declining tendencies may have been associated with hunting activities by the only two families of local residents who hunted with frequency in the study area. In the three sites without road closings (low restriction effort) and the other medium effort site there was no increase in density during the study. The distance observers could approach until there was a flight response increased in every site with medium and high hunting restriction and was not modified in the sites with low effort. The size of family groups and bachelor groups and the proportion of solitary animals did not respond positively in any of the sites. Other factors that could have affected my results were the distances of each site to the cities that hunters with vehicles come from and the distances to source populations for immigration by guanacos. My results illustrate the need for long-term and large-scale approaches in order to understand the biological processes that affect the populations subjected to intensive poaching, and provide foundations for planning population recovery and monitoring effectiveness of interventions. In Chapter 3, I evaluated the relative contributions of restriction of poaching, livestock density, and primary productivity (EVI) on guanaco densities, during a period of increasing restriction of hunting. I analyzed the association between annual guanaco density during 2004- 10 and the covariates by means of a mixed linear Poisson model considering the year of the survey as a random variable. The analysis indicated that primary productivity and had negative associations with the density of guanacos, and that there were more guanacos in sites of high and medium restriction of hunting. Nevertheless, the coefficients for EVI and livestock were very small, indicating that these two variables had a very small influence on density of guanacos. Livestock density had a declining tendency during the study period. This study demonstrates the importance of reducing poaching (through a combination of actions such as closing roads and increasing patrols as fundamental for the recuperation of guanaco populations over time. This thesis is the first systematic evaluation of the population and behavioral responses of guanacos to hunting and its restriction. I considered different temporal and spatial scales to evaluate the effects of hunting that was favored by hydrocarbon development and compare them to other human and environmental disturbances. My results can be applied to the mitigation of poaching, and to monitoring the effectiveness of actions implemented and population responses of guanacos to mitigation efforts.
Cita tipo APA: Radovani, Natalia Inés . (2016-06-06). Cambios poblacionales y comportamentales en guanacos (Lama guanicoe) asociados con la caza furtiva y su restricción en Patagonia norte. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6071_Radovani.pdf Cita tipo Chicago: Radovani, Natalia Inés. "Cambios poblacionales y comportamentales en guanacos (Lama guanicoe) asociados con la caza furtiva y su restricción en Patagonia norte". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6071_Radovani.pdf |
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Rivas, Nicolás. "Dinámica ultrarrápida de fotoelectrones generados en NH3 líquido y supercrítico" (2016-06-01). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Esta tesis presenta un estudio experimental sobre la dinámica de solvatación de electrones en amoníaco. El sistema se genera irradiando con luz ultravioleta una solución de iones ioduro en amoníaco. Inicialmente, el electrón 5p del ión ioduro se promueve verticalmente al entorno del solvente a través de una transferencia de carga del tipo CTTS (del inglés Charge Transfer To Solvent). Dicho electrón puede recombinarse o eventualmente separarse del átomo progenitor, transformándose finalmente en una especie solvatada, eˉ(sv.). Con el objeto de caracterizar el comportamiento dinámico del proceso se estudió la evolución de la absorbancia del electrón en función del tiempo, en distintas condiciones de densidad y temperatura. Se realizaron experimentos de espectroscopía láser pump-probe con resolución temporal por debajo del picosegundo en soluciones de ioduro de potasio en amoníaco líquido y supercrítico, empleando una celda óptica de alta presión. Los fotoelectrones se producen utilizando un pulso láser ultravioleta y la absorción transitoria de las especies generadas se sigue en el infrarrojo cercano, controlando el retardo entre ambos pulsos. Los cambios registrados en el perfil temporal de absorbancia permiten caracterizar el comportamiento del sistema en las distintas condiciones. En amoníaco líquido, los electrones que escapan más allá de la primera esfera de solvatación: i) difunden y se recombinan con el átomo de yodo en las centenas de picosegundos, o ii) son capturados en trampas de solvente formadas en el líquido para convertirse finalmente en eˉ(sv.). A diferencia de lo que ocurre en el líquido, en amoníaco supercrítico la especie mayoritaria es el par iónico de contacto, (sv.), por lo cual los procesos de recombinación del fotoelectrón se ven afectados por la proximidad del ion K+. A baja densidad, la producción de eˉ(sv.) es moderada, y la casi totalidad de fotoelectrones se recombinan con tiempos de vida de ~ 300 ps. En cambio, a mayor densidad, un alto porcentaje de electrones quedan atrapados en pares iónicos del tipo (sv.), que sobreviven en solución por tiempos mayores. Abstract: This thesis presents an experimental study on the solvation dynamics of electrons in ammonia. The system is generated by irradiating a solution of iodide ions using ultraviolet light. Iodide 5p electrons are injected vertically into the solvent environment through a CTTS (charge transfer to solvent) transition. The excited electron can recombine with or eventually separate from the parent iodine atom and become a solvated electron, eˉ(sv.). With the aim to characterize the dynamics of the process, the time evolution of the electron absorption was studied in different density and temperature conditions. Ultrafast time-resolved pump-probe spectroscopic measurements were performed in a high pressure optical cell containing potassium iodide solutions in liquid and supercritical ammonia. Photoelectrons were generated by an ultraviolet laser pulse and the transient absorption of the resulting species was followed in the near-infrared region, controlling the delay between the two laser pulses. Changes observed in the transient absorption profile allowed us to characterize the dynamics of the system in different conditions. In liquid ammonia, electrons escaping from the first solvation shell: i) diffuse and recombine with parent iodine atoms, or ii) are trapped in solvent cavities and become finally eˉ(sv.). On the other hand, in supercritical ammonia the main species is the contact ion pair, (sv.), where the proximity of the potassium ion strongly affects the recombination processes of photoelectrons. At lower densities, most photoelectrons were found to recombine with a lifetime of ~ 300 ps, and only a very small amount of them became solvated. However, when the density is high enough, electrons are more likely trapped in longer-living (sv.) ion pairs.
Cita tipo APA: Rivas, Nicolás . (2016-06-01). Dinámica ultrarrápida de fotoelectrones generados en NH3 líquido y supercrítico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5998_Rivas.pdf Cita tipo Chicago: Rivas, Nicolás. "Dinámica ultrarrápida de fotoelectrones generados en NH3 líquido y supercrítico". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-06-01. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5998_Rivas.pdf |
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Maselli, Gustavo Ariel. "Fosfatasas de proteínas con dominios Kelch en Arabidopsis thaliana. Estudios funcionales, estructurales y evolutivos" (2016-05-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las fosfatasas de proteínas con dominios Kelch (PPKL) son miembros de la familia PPP de fosfatasas de serinas y treoninas que están presentes sólo en algas verdes, plantas y alveolados. Las PPKL son proteínas bimodulares con un dominio N-terminal de tipo turbina β y un dominio catalítico en el extremo C-terminal, separados por una extensa secuencia conectora sin homología con otras conocidas. En las plantas, las PPKLs han sido descriptas como efectoras de la señalización por brassinosteroides y aparecen involucradas en el control de la proliferación celular. En este trabajo se han reevaluado los roles de los cuatro miembros de la familia PPKL presentes en Arabidopsis thaliana (BSL1, BSL2, BSL3 y BSU1) mediante análisis filogenéticos, funcionales y genéticos. BSL1 y BSL2/BSL3 pertenecen a dos clados evolutivos antiguos que han sido altamente conservados en las plantas terrestres; en cambio, los genes de tipo BSU1 se encuentran exclusivamente en la familia Brassicaceae y muestran una notable divergencia de secuencia, incluso entre especies estrechamente emparentadas. La pérdida de función simultánea de dos parálogos cercanamente relacionados, BSL2 y BSL3, causa un conjunto de alteraciones fenotípicas peculiares y novedosas; la pérdida de función de BSL1 es, en cambio, fenotípicamente silenciosa. Sin embargo, los tres parálogos más importantes cumplen juntos un papel esencial en etapas tempranas del desarrollo, en el cual BSU1 no puede suplantarlos. Estos patrones evolutivos se ven reflejados en un comportamiento inusual de las PPKL que las diferencia del resto de las fosfatasas de tipo PPP: su capacidad de participar en interacciones homotípicas. BSL1, BSL2 y BSL3 se comportan in vivo como homodímeros, mientras que BSU1 sólo es capaz de realizar interacciones débiles y/o transitorias consigo misma. Curiosamente, se encontró que los determinantes de la interacción son diferentes entre los miembros de los clados principales. En BSL1, el dominio catalítico es el principal impulsor de la interacción; en contraste, el dominio catalítico de BSL2 es necesario, pero no suficiente, y la dimerización requiere de dos porciones de secuencia en el dominio conector. El dominio conector de BSL2 se comporta en solución como una proteína intrínsecamente desordenada propensa a formar elementos de estructura secundaria frente a perturbaciones leves del medio. La presencia de un miembro altamente divergente, en conjunto con la inusual capacidad de formar homodímeros y las diferencias presentes entre parálogos con alto grado de conservación, ponen de manifiesto la complejidad de esta pequeña y esencial familia génica, al tiempo que cuestionan los fundamentos de la asignación de sus roles funcionales. Abstract: Protein phosphatases with Kelch-like domains (PPKL) are members of the PPP family present in green algae, plants and alveolates. PPKL are bimodular proteins with a β-propeller domain at the N-terminus and a catalytic domain akin to PP1 at the C-terminus; both domains are tethered by an intermediate sequence of unknown affiliations. In plants, PPKLs have been described as effectors of brassinosteroid signaling and cell proliferation. We reappraised the roles of the four members of the family present in Arabidopsis thaliana -BSL1, BSL2, BSL3 and BSU1- through phylogenetic, functional and genetic analyses. BSL1 and BSL2/BSL3 belong to two ancient evolutionary clades that have been highly conserved in land plants; in contrast, BSU1-type genes are exclusively found in the Brassicaceae and display a remarkable sequence divergence, even among closely related species. Simultaneous loss of function of the closely related paralogs BSL2 and BSL3 causes a peculiar array of phenotypic alterations; loss of function of BSL1 is, in turn, phenotypically silent. However, the three major paralogs play together an essential role in early stages of development, that BSU1 is unable to supplement. These evolutionary patterns mirror an unusual behaviour in PPP phosphatases: the ability of PPKL to form homotypic interactions. BSL1, BSL2 and BSL3 behave in vivo as homodimers, whereas BSU1 is only able of transient interactions. The interaction determinants are, however, different among members of the main clades. In BSL1, the catalytic domain is the main driver of interaction; in contrast, the catalytic domain of BSL2 is necessary but not sufficient, and dimerization requires two conserved sequence stretches in the linker domain. The linker domain of BSL2 behaves in solution as an intrinsically disordered protein prone to form secondary structure elements upon mild perturbations. The presence of a highly divergent member, together with the unusual ability to form homodimers and the existing differences between paralogs with a high degree of conservation, reveal the complexity of this small and essential gene family, while questioning the foundations of their functional role assignment.
Cita tipo APA: Maselli, Gustavo Ariel . (2016-05-31). Fosfatasas de proteínas con dominios Kelch en Arabidopsis thaliana. Estudios funcionales, estructurales y evolutivos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6002_Maselli.pdf Cita tipo Chicago: Maselli, Gustavo Ariel. "Fosfatasas de proteínas con dominios Kelch en Arabidopsis thaliana. Estudios funcionales, estructurales y evolutivos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6002_Maselli.pdf |
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Najenson, Ana Clara. "El Factor Natriurético Atrial en el páncreas exocrino: papel en eventos tempranos que conducen al desarrollo de pancreatitis aguda" (2016-05-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La pancreatitis aguda constituye una entidad nosológica prevalente caracterizada por la autodigestión del páncreas exocrino provocada por la activación in situ de las mismas enzimas que el páncreas produce. Se expresa como una forma leve autolimitada, o bien como una forma severa con elevada mortalidad principalmente como resultado de falla multiorgánica. Las causas y/o mecanismos que llevan a una u otra expresión son desconocidos, por lo que debido a su curso incierto constituye una preocupación clínica. Los eventos tempranos que conducen a su desarrollo no se hayan aún esclarecidos, si bien la activación del tripsinógeno y de la respuesta inflamatoria constituyen dos mecanismos disparadores independientes. En este trabajo de tesis abordamos el estudio del posible papel protector del factor natriurético atrial (ANF) en los eventos temprano que disparan la patología, particularmente la respuesta inflamatoria que lleva a la muerte de las células acinares eventualmente por necrosis y apoptosis mediante la utilización de un modelo animal (rata) validado de pancreatitis aguda. Asimismo, evaluamos la posibilidad de que el páncreas exocrino constituya una fuente extracardíaca de ANF. El presente estudio se sustenta en trabajos previos en los que observamos que el ANF regula fisiológicamente la funcionalidad del páncreas exocrino y atenúa la pancreatitis aguda experimental al estimular la exclusión de AMPc a través de proteína asociada a resistencia a multidrogas tipo 4 (MRP4). No obstante, este mecanismo no explicaría en su totalidad el papel protector del ANF. Los resultados mostraron que el ANF disminuye la respuesta inflamatoria desencadenada durante la pancreatitis aguda al reducir la expresión de los principales mediadores inflamatorios. El ANF redujo la activación del factor de transcripción NF-κB, íntimamente relacionado con la activación de genes que codifican para citoquinas pro-inflamatorias. En este sentido, disminuyó asimismo los niveles intrapancreáticos del factor de necrosis tumoral α (TNF-α), citoquina que juega un papel clave en la propagación de la respuesta inflamatoria. Por otra parte, disminuyó la expresión de enzimas inducibles durante la inflamación como la enzima óxido nítrico sintasa (iNOS) y ciclo oxigenasa 2 (COX-2) así como también su principal producto, la prostaglandina E2 (PGE2). La atenuación de la respuesta inflamatoria se correlacionó con modificaciones de la ultraestructura de las células acinares observada mediante microscopía electrónica de transmisión. El ANF atenuó el daño generado en la ultraestructura celular ya que disminuyó el swelling del retículo endoplásmico, el edema intra e intercelular y la presencia de autofagolisosomas. El ANF asimismo estimula la muerte celular por apoptosis y disminuye la necrosis, lo que constituye un efecto beneficioso, ya que en la pancreatitis aguda la apoptosis se correlaciona inversamente con la necrosis y así con la severidad de la patología. El ANF incrementa las células TUNEL positivas y la activación de las caspasas, lo que se relaciona la morfología de los núcleos observados por microscopia electrónica. Se observó asimismo que el ANF se expresa en el páncreas exocrino tanto a nivel de su ARN mensajero como a nivel de proteína, lo que implica que el páncreas sintetiza y expresa ANF maduro. Mediante la técnica de inmuno-oro se observó que el ANF se localiza en el retículo endoplásmico, mitocondrias y gránulos de zimógeno. En resumen, en este trabajo de tesis demostramos que el ANF atenúa la respuesta inflamatoria y estimula la apoptosis en la pancreatitis aguda experimental lo sustenta su papel protector en el desarrollo de la patología. Asimismo, observamos que el páncreas exocrino sintetiza y expresa ANF maduro, sugiriendo que tendría funciones paracrinas y/o autocrinas a nivel de las células acinares pancreáticas, en las que hemos demostrado la presencia de sus receptores. Abstract: Acute pancreatitis is a prevalent disease characterized by the pathologic autodigestion of the gland promoted by the digestive enzymes synthesized and secreted by the pancreas as a result of premature intra-pancreatic activation. The condition is usually mild and selflimiting, but in 10–15% of cases, it can be severe with associated multiorgan dysfunction and high mortality. The causes leading to one or other form of pancreatitis are presently unknown and due to its uncertain course, the disease still remains a clinical concern. The early events in the development of pancreatitis are not fully understood yet, although trypsinogen activation and the inflammatory response are two independent triggering mechanisms associated with the onset of the disease. In the present thesis we investigated the possible protective role of atrial natriuretic factor (ANF) in the early events triggering acute pancreatitis, particularly the inflammatory response that leads to acinar cell death either by necrosis, apoptosis or both. We also evaluated the exocrine pancreas as a possible extra cardiac source of ANF production. The present study is based on previous works from our laboratory showing that ANF regulates pancreatic functionality and attenuates acute pancreatitis by stimulating cAMP extrusion through multidrug resistance associated protein type 4 (MRP4). However, this mechanism would partially explain ANF beneficial role in the disease. Results showed that ANF attenuated the inflammatory response triggered in acute pancreatitis by reducing the expression and/or level of the major inflammatory mediators. ANF reduced the activation of the transcription factor NF-κB, intimately involved in the stimulation of genes encoding pro-inflammatory cytokines. In this sense, ANF also diminished tumor necrosis factor α (TNF-α) intrapancreatic levels, a key cytokine involved in the propagation of the inflammatory response. The atrial factor also reduced the expression of inducible enzymes like nitric oxide synthase (iNOS) and cyclooxygenase 2 (COX-2) and its main metabolite, prostaglandin E2 (PGE2). The attenuation of the inflammatory mediators correlated well with the ultrastructural changes observed in pancreatic acinar cells by transmission electron microscopy. ANF reduced acinar cell damage, it diminished endoplasmic reticulum swelling, intra and intercellular edema, and the presence of autophagosomes. ANF also stimulated programmed cell death (apoptosis) and diminished necrosis, which is a beneficial effect, given that in acute pancreatitis apoptosis inversely correlates with necrosis and with the severity of the disesase. ANF increased the number of positive TUNEL cells and caspases activation. These findings correlate well with the morphology of the nuclei observed by transmission electron microscopy. In the present study it was also observed that ANF mRNA and protein are expressed in the exocrine pancreas, supporting that the gland synthetizes and expresses mature ANF. Immunogold labeling electron microscopy studies showed that ANF localizes to endoplasmic reticulum, mitochondria and zymogen granules. In summary, this thesis shows that in experimental acute pancreatitis ANF attenuates the inflammatory response and stimulates apoptosis, supporting the protective role of this peptide in the development of the disease. Furthermore, the exocrine pancreas synthetizes and expresses mature ANF, suggesting that the atrial peptide may act in a paracrine and/or autocrine fashion on the acinar cells where we have previously reported the presence of natriuretic factor receptors expression.
Cita tipo APA: Najenson, Ana Clara . (2016-05-30). El Factor Natriurético Atrial en el páncreas exocrino: papel en eventos tempranos que conducen al desarrollo de pancreatitis aguda. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6033_Najenson.pdf Cita tipo Chicago: Najenson, Ana Clara. "El Factor Natriurético Atrial en el páncreas exocrino: papel en eventos tempranos que conducen al desarrollo de pancreatitis aguda". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6033_Najenson.pdf |
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Bazzalo, Mariel. "Comportamiento social, uso de hábitat e impacto antrópico en el delfín gris Sotalia fluviatilis (Gervais, 1853) en Santa Catarina (Brasil) extremo austral de su distribución" (2016-05-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La unidad de manejo poblacional más austral del delfín gris Sotalia guianensis (anteriormente denominado S. fluviatilis), en la Bahía Norte de la Isla de Santa Catarina, Brasil, se encuentra en el Área de Protección Ambiental de Anhatomirim (APAA), creada para la protección de este cetáceo. El estatus de la especie de acuerdo a la UICN era deconocido en los años del inicio de la esta tesis y en la actualidad se registra con datos insuficientes. El hábitat del delfín gris en dicha bahía se encuentra bajo la presión de acciones antrópicas desarrolladas por la importante población humana costera en la zona. Sobre la base de estudios preliminares se observó un cambio en la distribución en el uso del hábitat en el área de estudio. Esta investigación evaluó aspectos de abundancia y comportamiento del delfín gris, así como la influencia de variables ambientales y acciones antrópicas en la distribución de uso del hábitat. Entre los años 1996 y 2005 se realizaron recorridos en una embarcación en el área previamente zonificada empleando marcas del terreno. Una vez avistado el grupo de delfines se registraron cada 5 minutos la posición geográfica, la zona, la estructura y el comportamiento social. Se calculó la abundancia por diferentes índices. El uso del hábitat fue calculado a nivel zonal, en celdas de 0,25 km2 y por el método de Kernel, caracterizados a partir de las variables ambientales y acciones antrópicas. Entre los años 2002 al 2005 en total fueron registrados 175 avistajes en la margen oeste de la Bahía Norte, en 397 horas de esfuerzo de búsqueda y en 329 horas de observación directa; se avistó un único grupo en 95% de las salidas. La abundancia no presentó variación anual aunque tuvo una tendencia a aumentar en verano, y siendo las zonas EDC y BDA las de mayor abundancia. Los grupos más frecuentes estuvieron formados por 61 a 80 individuos (adultos, juveniles y crías); se encontraron principalmente en alimentación y desplazamiento, sin presentar variacion estacional, mientras que los comportamientos de socialización, reposo y nado errático fueron registrados en menos del 5% del tiempo. El uso del hábitat fue más frecuente en aguas playas de menos de 5 metros de profundidad, a menos de 1 km de la costa oeste, alejadas del área urbanizada y dentro del APAA. El modelo que explicó mejor las variaciones en el uso de hábitat dentro de las celdas incluyó cinco variables explicativas de manera individual: profundidad, distancia a la costa, distancia al área urbanizada, año, presencia del APAA, y la interacción entre estos dos últimos. Estos resultados sugieren que no existe una única variable ambiental que determina el uso de hábitat por parte de los delfines sino que depende de una combinación de factores que establecen una condición particular del hábitat. Al mismo tiempo, se evidencia la variación temporal en el uso. En relación a las acciones antrópicas, el modelo que explicó mejor las variaciones en el uso de hábitat incluyó todas las consideradas: contaminación, turismo de observación de delfines, maricultura y pesca artesanal, pero la interacción únicamente entre estas dos últimas. A partir del modelo de Kernel se pudo apreciar la gran superposición del hábitat principalmente con el turismo y la pesca artesanal. Estos resultados sugieren que el uso de hábitat por parte de los delfines depende de una combinación de efectos de las acciones antrópicas que pueden determinar el estado de conservación del hábitat. Estas acciones tienen un efecto sinérgico con el deterioro y la fragmentación del hábitat del delfín gris. Debido a que aún no existen datos suficientes para la conservación del delfín gris los resultados de este estudio sobre el comportamiento y el uso de hábitat en la unidad poblacional ubicada en el extremo de su distribución resultan de gran importancia para el manejo y conservación de la especie, principalmente por hallarse en un área de protección. Abstract: The southernmost population of the gray dolphin Sotalia guianensis (formerly S. fluviatilis ) inhabit in the ‘Bahía Norte’ zone, in the Island of Santa Catarina, Brazil, inside the area of Environmental Protection Anhatomirim (APAA in Portuguese), created for the protection of this cetacean. The species status was unknown whenthesis begun, but according to the IUCN is registered as ‘data deficient’. The anthropogenic actions of the coastal human population impact in the habitat use of this dolphin. Anthropogenic activities such as tourism, fishing, water contamination and aquiculture mussel have been proposed as important factors affecting the habitat use in preliminary studies. This research evaluates abundance, behavior, and the potential effects of anthropogenic actions on the distribution on the habitat use by the grey dolphin. From 1996 to 2005, surveys were conducted on a boat in the area previously zoned using landmarks. Once the group of dolphins was sighted, environmental variables were recorded and, every 5 minutes, also the geographical position, the zone, the social structure and group behaviour. Abundance was calculated for different indixes and models were used to predict the size of the groups. The habitat use was calculated at zonal level and cells as 0,25 km2 that were characterized by environmental varaibles and anthropogenic actions. Kernel analyses were used to analyze overlyaing between habitat use and any considered variable and activity. In totally were recorded 272 sightings of grey dolphin, meanwhile 175 sightings were recorded between 2002 to 2005 in 397 hours of research survey effort, and 329 hours of focal observation time, with only one sighting in the 95% of de surveys. Sightings were registered in shallow (<5 m), turbid (>90 cm) and warm waters (mean 22°C), similar for the same species in others bays. Abundance showed low variation in the time, but realtively higher in summer and the EDC and BDA zones. Most frequent group size included 61 to 80 adult, juvenile and calf individuals.The more frequent behaviors were feeding and bay travelling, whereas socialization, resting and erratic swimming were registered in <5% of total time. Habitat use was simoultaneously related to all five environmental variables: water deep, distance to seashore, distance to the urban zone, and APAA presence.Habitat use was more frecuent in shallow waters (<5 m deep), near to the West seashore (<1 km), but also away from urban zones, and also inside the APAA. It was related with time, decreasing in some zones (i.e. EDC) but increasing in others (i.e. BDA). Habitat use was also related to anthropogenic activities such eswater contamination, tourism activity, fishing, and aquiculture mussel farm. However, Kernel analysis showed that habitat use is particularly not ovelyaing with fishing and tourism. These activities could have synergic effects with fragmentation and deterioration of the grey dolphin habitat. The result of this study about behavior and the habitat use of this species in the southern distribution are important for management and conservation of this species in the AEPA.
Cita tipo APA: Bazzalo, Mariel . (2016-05-23). Comportamiento social, uso de hábitat e impacto antrópico en el delfín gris Sotalia fluviatilis (Gervais, 1853) en Santa Catarina (Brasil) extremo austral de su distribución. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6006_Bazzalo.pdf Cita tipo Chicago: Bazzalo, Mariel. "Comportamiento social, uso de hábitat e impacto antrópico en el delfín gris Sotalia fluviatilis (Gervais, 1853) en Santa Catarina (Brasil) extremo austral de su distribución". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6006_Bazzalo.pdf |
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Gillanders, Florencia. "Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia" (2016-05-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las técnicas modernas de microscopía de fluorescencia requieren sondas cuyos comportamientos fotoquímicos, combinados con las características ópticas del equipamiento, permitan resolver estructuras de dimensiones menores al límite impuesto por la difracción natural de la luz. Además de ser brillantes, estables, pequeñas y compatibles con el medio biológico, las sondas ideales fluorescen y se tornan oscuras de manera controlada y conocida. En esta tesis se diseñaron nuevas sondas basadas en los diheteroariletenos oxidados (DHAOs) como plataforma de fluorescencia controlada. Los DHAOs son compuestos fotocrómicos que presentan dos isómeros fotoestables, uno fluorescente y uno oscuro, alcanzados por irradiación con luz ultravioleta y visible respectivamente. Las propiedades espectroscópicas de los DHAOs se optimizaron estudiando el efecto de sustituyentes dadores y aceptores de electrones sobre las mismas. La demandante caracterización espectrofotométrica de los DHAOs se abordó con un espectrofotómetro y fotomodulador de construcción propia, el cual permitió automatizar las mediciones y explorar sistemáticamente diferentes condiciones de fotoconversión. Se descubrió que al aumentar el carácter dador de electrones del sustituyente, se estabiliza particularmente el estado excitado del isómero fluorescente, resultando en un aumento del desplazamiento de Stokes y un pronunciado solvatocromismo del fluoróforo. El solvatocromismo se utilizó para estudiar el cambio de polaridad del entorno de monómeros de α-sinucleína durante su agregación. A fin de conservar la fluoresencia fotomodulable de los DHAOs en agua, se exploraron diversas estrategias de solubilización con modificaciones covalentes y no-covalentes. La inclusión en cavidades de ciclodextrina, la adsorción a albúmina, y la funcionalización con grupos hidrofílicos sirvieron para solubilizar efectivamente a los DHAOs en medios acuosos. Las propiedades de fluorescencia y fotoconversión se retuvieron exitosamente dentro de la cavidad de las proteínas de unión de ácidos grasos y mediante la conjugación a entidades protéicas de mayor tamaño, indicando la preferencia de los DHAOs a un entorno protegido del agua. Anticuerpos secundarios conjugados a DHAOs se utilizaron para marcar β-tubulina en neuronas, y se lograron fotoconvertir selectivamente distintas áreas de las muestras en un microscopio que incorpora un arreglo programable para generar patrones espaciales de excitación. El particular comportamiento fotoquímico de los diheteroariletenos permitió desarrollar una estrategia para aumentar la resolución microscópica combinando DHAOs con fotocrómicos no-fluorescentes. Utilizando el fenómeno de transferencia de energía por resonancia de Förster, se postulan sondas que requieren de múltiples estímulos para la activación de la emisión, disminuyendo el volúmen de activación por debajo del límite de difracción de la luz y aumentando la resolución axial. La aplicación de las sondas sintetizadas y la propuesta de nuevas estrategias relacionadas con los DHAOs denotan el potencial que tienen los mismos en la búsqueda de mayor resolución en la microscopía de fluorescencia. Abstract: Modern fluorescence microscopy techniques require probes whose photochemical behaviour, combined with the optical characteristics of the microscope, enable the resolution of structures smaller than the natural diffraction limit of light. In addition to being bright, stable, small and compatible with the biological environment, the ideal probe’s fluorescence is activated and deactivated in a controlled and predictable manner. New probes were designed using oxidized diheteroarylethenes (ODHAs) as a platform for controlled fluorescence and are presented in this thesis. ODHAs are photochromic compounds with two photostable isomers, one fluorescent and one dark, which are formed upon irradiation with ultraviolet and visible light, respectively. In order to optimize their spectroscopic and photochemical properties, the ODHAs were modified with electron-donating and -withdrawing substituents. The demanding spectroscopic characterization of the photochromes was tackled with a custom built spectrophotometer and photoconverter, which enabled automatization of the measurements and the systematic exploration of varying photoconversion conditions. By increasing the electron-donating character of the substituents, the excited state of the fluorescent isomer is particularly stabilized, resulting in an increase in the Stokes shift and pronounced solvatochromism of the fluorophore. The solvatochromic ODHA was used to probe the changes in local polarity around monomers of the amyloid protein α-synuclein during their aggregation. Diverse solubilization strategies involving both covalent and non-covalent modifications were employed with the aim of conserving the photoswitchable fluorescence of ODHAs in water. Inclusion in cyclodextrin cavities, adsorption onto albumin, and functionalization with hydrophilic groups all served to effectively solubilize the ODHAs in aqueous solutions. The fluorescence and photoconversion properties were conserved inside the cavities of fatty acid binding proteins and by conjugation to larger protein entities, indicating the preference of the ODHAs for surroundings devoid of water. Secondary antibodies conjugated to ODHAs were used to immunostain β-tubulin in fixed neurons, and different areas of the sample were selectively photoconverted using structured illumination with a structured illumination (programmable array) microscope. A new strategy for increasing microscopic resolution was developed, harnessing the unique photochemical behaviour of diheteroarylethenes by combining ODHAs with non-fluorescent photochromes. The proposed probes require multiple stimuli for activation of the Förster resonance energy transfer-modulated emission, reducing the activation volume below the diffraction limit and increasing axial resolution. The application of the synthesized probes and the description of novel strategies related to ODHAs denote their potential in the search for increased resolution in fluorescence microscopy.
Cita tipo APA: Gillanders, Florencia . (2016-05-18). Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5997_Gillanders.pdf Cita tipo Chicago: Gillanders, Florencia. "Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5997_Gillanders.pdf |
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Fiszbein, Ana. "Regulación ¨epigenética¨ del splicing alternativo durante la diferenciación neuronal" (2016-05-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las modificaciones epigenéticas son cruciales para el establecimiento y mantenimiento de programas de diferenciación celular. Un posible mecanismo de regulación está determinado por el efecto de la estructura de la cromatina en los patrones de splicing alternativo. Las marcas epigenéticas pueden provocar cambios en la tasa de elongación de la ARN polimerasa II, así como afectar el reclutamiento de diversos factores y, de esta manera, modular los patrones de splicing alternativo. Aquí descubrimos el mecanismo por el cual el splicing alternativo de la molécula de adhesión celular neural (NCAM) es regulado durante la diferenciación neuronal mediante la estructura cromatínica. Por otra parte, nos centramos en la regulación del splicing alternativo de G9a, la enzima responsable de la dimetilación en lisina 9 de histona H3 (H3K9me2) en eucromatina de mamíferos. Demostramos que G9a es necesaria para la diferenciación de la línea celular neuronal de ratón N2a y que la inclusión de su exón alternativo (E10) aumenta la localización nuclear de G9a, probablemente debido a la mayor exposición de una secuencia de localización nuclear cercana. Por último, mostramos que la isoforma de G9a que incluye el E10 es necesaria para la diferenciación neuronal y que regula el patrón de splicing alternativo de su propio ARN mensajero precursor promoviendo una mayor inclusión del E10. Nuestros resultados indican que, mediante el control de su splicing alternativo, G9a promueve la diferenciación neuronal y gatilla un mecanismo de retroalimentación positiva que reafirma el compromiso a la diferenciación celular. Abstract: Epigenetic modifications are critical for the establishment and maintenance of differentiation programs. One possible mechanism of regulation is determined by the effect of chromatin structure on alternative splicing patterns. Epigenetic marks can cause changes in elongation rate of RNA polymerase II, as well as affect the recruitment of different factors, and thus modulate alternative splicing choices. Here we discovered the mechanism by which the alternative splicing of the neural cell adhesion molecule (NCAM) is regulated during neuronal differentiation by chromatin structure. Moreover, we focused on the regulation of G9a alternative splicing, the enzyme responsible for dimethylation of lysine 9 in histone H3 (H3K9me2) in mammalian euchromatin. We demonstrate here that the G9a methyltransferase is required for differentiation of the mouse neuronal cell line N2a and that inclusion of its alternative exon 10 (E10) increases during neuronal differentiation of cultured cells, as well as in the developing mouse brain. Although E10 inclusion greatly stimulates overall H3K9me2 levels, it does not affect G9a catalytic activity. Instead, E10 increases G9a nuclear localization, predictably due to higher exposure of a neighboring nuclear localization signal. We show that G9a inclusion of E10 isoform is necessary for neuron differentiation and regulates the alternative splicing pattern of its own pre-mRNA, enhancing E10 inclusion. Overall, our findings indicate that, by regulating its own alternative splicing, G9a promotes neuron differentiation and creates a positive feedback loop that reinforces the cellular commitment to differentiation.
Cita tipo APA: Fiszbein, Ana . (2016-05-17). Regulación ¨epigenética¨ del splicing alternativo durante la diferenciación neuronal. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5999_Fiszbein.pdf Cita tipo Chicago: Fiszbein, Ana. "Regulación ¨epigenética¨ del splicing alternativo durante la diferenciación neuronal". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5999_Fiszbein.pdf |
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Gianni, Guido M.. "Evolución tectónica de los Bernárdides entre los 44°30´S y los 46°s" (2016-05-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta Tesis se presenta una descripción de la evolución tectónica Mesozoica a Cenozoica del sistema de los Bernárdides o como se lo conoce más recientemente, faja plegada y corrida de San Bernardo entre los 44°30‘S y los 46°S. Esta área constituye el sector central de una zona de deformación de intraplaca recientemente definida como antepaís fragmentado Patagónico. En esta disertación se presentan datos estructurales de campo, sísmicos, geocronológicos y resultados de modelamiento análogo que en conjunto permiten caracterizar las fases de alzamiento y los mecanismos de deformación que afectaron el interior Patagónico. Un análisis integrado de datos estructurales y sísmicos (2-D y 3-D) en la faja plegada y corrida de San Bernardo y la Sub-cuenca de Río Mayo con foco en los depósitos continentales del Grupo Chubut (Cretácico Inferior tardío-Cretácico Superior) permitió inferir un carácter sinorogénico para las diferentes unidades que lo componen. Esto sugeriría el desarrollo temprano de un sistema de antepaís fragmentado asociado al crecimiento de la faja plegada y corrida de San Bernardo, sugiriendo un levantamiento inicial del mismo durante el Cretácico Inferior tardío a Cretácico Superior. Estos resultados implican la coexistencia de campos de esfuerzos contrastantes donde la compresión andina E-O actuó coetáneamente con una reactivación extensional transversal en sentido aproximado N-S en el sector oriental de la cuenca del Golfo de San Jorge. Aquí se propone una relación causal entre ambos fenómenos donde la compresión gatilló una reactivación de rifting sinorogénico en estructuras extensionales previas. El origen de los esfuerzos compresivos se discuten en relación a múltiples procesos que abarcan desde estadios de alta convergencia de placas y alta velocidad de la placa Sudamericana, colisión de dorsales oceánicas hasta cambios en el ángulo de subducción, como lo evidencia la migración hacia el este del frente volcánico durante el Cretácico Inferior tardío y el posterior cese del volcanismo de arco durante el Paleoceno. El estudio del registro sedimentario Terciario en la faja plegada y corrida de San Bernardo, la Sub-cuenca de Río Mayo y La Meseta de Chalía en el pié de monte andino, permitió desentrañar una serie de eventos de deformación contraccional en el Paleoceno a Eoceno que afectaron el sector de intraplaca patagónico en el Cenozoico temprano. Luego, en el Eoceno terminal el frente de deformación se habría retraído desde el antepaís fragmentado hacia los Andes Nordpatagónicos como lo indican, el cese de la compresión en el sector de la faja plegada y corrida de San Bernardo y la detección de estratos de crecimiento datados en ~40 Ma en la Meseta de Chalía. En el Oligoceno superior a Mioceno inferior, el sector del antepaís fragmentado fue afectado por un episodio extensional como lo revelan la depositación sinextensional de rocas volcánicas máficas. Este escenario cambió a un régimen compresivo en el Mioceno medio basado en la presencia de plateaus volcánicos cenozoicos plegados y la datación de secuencias sinorogénicas marinas. Finalmente, la actividad tectónica se habría reinstaurado recientemente en el área precordillerana como lo indica la presencia de depósitos cuaternarios fallados y plegados en el área de estudio. Un análisis integrando la historia de deformación cretácica y cenozoica revela que la deformación se propagó de manera rápida (~2 Ma) desde los Andes hacia el sector de intraplaca en el antepaís fragmentado (~200 km) en dos oportunidades, a los ~120 Ma y ~17-16 Ma. En este sentido, los resultados del modelamiento análogo, indican que la rápida propagación de la deformación hacia el interior patagónico pudo haber estado favorecida por una variación lateral en la resistencia cortical, donde zonas de debilidad vinculadas a la presencia de cuencas de rift mesozoicas en la Patagonia, actuaron como focalizadores efectivos de la deformación durante la orogenia Andina. Otro aspecto a destacar en la evolución general del área de estudio es la falta de correlación entre el ángulo de subducción y el estado de esfuerzos de la placa superior. Se considera en esta Tesis que el amplio registro de procesos de intraplaca en el área de estudio podría contribuir al entendimiento, aún escaso, de la orogénesis de intraplaca en márgenes de subducción tipo-Andino. Finalmente, una revisión de la evolución tectónica de las cuencas del Golfo de San Jorge, Grupo Salta y Taubaté en el sureste de Brasil; y la comparación con la historia de alzamiento de los Andes Nordpatagónicos y Centrales, permiten plantear la posibilidad de procesos de rifting y/o transtensionales en el antepaís de sistemas orogénicos directamente inducidos por compresión regional en un margen tipo-Andino. Abstract: This dissertation describes the Meso-Cenozoic tectonic evolution between 44°30‘S and 46°S of the Bernárdides system, also known as the San Bernardo fold and thrust belt. This area is located in the central zone of the Patagonian broken foreland, a broad morphostructural unit characterized by intense intraplate deformation. This Thesis presents field structural, seismic, geochronological data, as well as results of analog modeling that allowed the characterization of uplift phases and deformational mechanics in the Patagonian interior. An integrated analysis of structural and seismic (2-D and 3-D) data in the San Bernardo fold and thrust belt and the Río Mayo Sub-basin, focused in the continental beds of the Chubut Group (late Early to Late Cretaceous), allowed the recognition of a synorogenic character in all units belonging to this group, suggesting the early development of a broken foreland system related to the initial uplift of the San Bernardo fold and thrust belt since late Early Cretaceous times. These results imply the coexistence between contrasting stress-fields, where E-O-directed compression took place in concert with transversal N-S- directed extension further east in the San Jorge Gulf Basin. A causal relation between both processes is here proposed, where regional compression may have triggered a synorogenic foreland rift reactivation of an earlier extensional fabric. The origin of the compressional stress-field is then discussed in relation to multiple factors that go from changes in plate dynamics to subduction of mid-ocean ridges that converged to induce a shallow angle to the subducting slab, as evidenced by an eastward migration of the arc front in late Early Cretaceous and a volcanic arc gap until Paleocene times. The study of the Cenozoic sedimentary record in the San Bernardo fold and thrust belt, Río Mayo Sub-basin and the Meseta de Chalía in the Andean foothills, unraveled a series of intraplate deformational events spanning the Paleocene to Eocene periods. In the latest Eocene the orogenic front retracted westwards to the North Patagonian Andes as indicated by the cessation of intraplate deformation in the San Bernardo fold and thrust belt and the local U-Pb zircon dating of synorogenic deposits in the Meseta de Chalía over the eastern Andean front. In the Oligocene to early Miocene, the broken foreland sector was subjected to intraplate extension as revealed by the eruption of widespread within-plate magmatism over the entire area and field description of sinextensional deposits. This scenario changed to generalized compression in middle Miocene as suggested by the presence of folded and thrust volcanic rocks and U-Pb zircon dating of marine synorogenic deposits. Then, tectonic activity in the San Bernardo fold and thrust belt resumed as evidenced by faulting of Quaternary fluvial deposits in the study area. An integrated analysis of the Mesozoic to Cenozoic deformational record reveals a rapid propagation of the deformational front (~2 Ma) from the Andes to the broken foreland sector (~200 km) in two opportunities, at ~120 Ma and ~17-16 Ma. In this sense, analog modeling results indicate that fast migration of the orogenic front could be facilitated by the presence of weak zones located in the intraplate sector related to Early Mesozoic rift basins, acting as stress focalizers during Andean orogeny. Another aspect to highlight from the presented Meso-Cenozoic evolution is that there seems to be no clear correlation between slab angle and the stress state in the upper plate. As a whole, the complete record of intraplate tectonic processes unraveled in the study area may contribute to the understanding of intraplate orogenesis in Andean-type tectonic settings. Finally, a revision of the tectonic evolution of the San Jorge Gulf Basin, Grupo Salta and Taubaté Basin in southeast Brazil and its comparison with the main uplift phases of the Central and North Patagonian Andes, allow considering the possibility of a rifting event or a transtensional reactivation of the foreland sectors in orogenic systems directly related to regional compression related to Andean-type margins.
Cita tipo APA: Gianni, Guido M. . (2016-05-16). Evolución tectónica de los Bernárdides entre los 44°30´S y los 46°s. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6012_Gianni.pdf Cita tipo Chicago: Gianni, Guido M.. "Evolución tectónica de los Bernárdides entre los 44°30´S y los 46°s". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6012_Gianni.pdf |
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Venturutti, Leandro. "Rol de los micro-ARN 21 y 16 en la diseminación metastásica y resistencia a terapias dirigidas en el cáncer de mama ErbB-2 positivo" (2016-05-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La sobreexpresión/amplificación del receptor con actividad tirosina-quinasa ErbB-2 define un subtipo agresivo de cáncer de mama (CM) con incidencia elevada de metástasis, denominado ErbB-2 positivo. En esta Tesis revelamos un nuevo sentido de la interacción entre el ErbB-2 y Stat3, otro actor clave en CM, la cual subyace la diseminación metastásica. Encontramos que Stat3 no solo induce la expresión del ErbB-2, sino que también lo recluta como coactivador en el promotor del microARN-21, un microARN promotor de metástasis. El ErbB-2 induce además la expresión del microARN-21 actuando como factor de transcripción. El microARN-21, a su vez, inhibe la expresión de PDCD4, un supresor de metástasis. En la clínica, encontramos en tumores ErbB-2 positivos una correlación inversa entre la coexpresión nuclear Stat3/ErbB-2 y la expresión de PDCD4, la expresión del microARN-21 y de PDCD4, y la expresión de PDCD4 y la presencia de metástasis ganglionares. A pesar de que terapias dirigidas al ErbB-2, como el trastuzumab y el lapatinib, han probado ser beneficiosas, las respuestas tienden a ser limitadas en magnitud y duración. Aquí, describimos un mecanismo de acción novedoso para estos agentes. Encontramos que el trastuzumab y el lapatinib, a través del bloqueo de las vías de PI3K/AKT y MAPK, inhiben al oncogén c-Myc, lo cual aumenta los niveles del microARN-16, un potente supresor tumoral. La incapacidad de inducir la expresión del microARN-16 subyace fenómenos de resistencia. Identificamos a CCNJ y FUBP1 como blancos novedosos del microARN-16, responsables de sus efectos antiprolfierativos, y demostramos que los niveles del microARN-16 y FUBP1 predicen la respuesta al trastuzumab en adyuvancia, en pacientes con CM ErbB-2 positivo. Postulamos al microARN-16 como un agente terapéutico innovador para tumores resistentes al trastuzumab y/o lapatinib. Abstract: Overexpression/amplification of the receptor tyrosine kinase ErbB-2 accounts for an aggressive breast cancer (BC) subtype (ErbB-2 positive) with increased incidence of metastases. In the present Thesis, we revealed a novel direction of the interaction between ErbB-2 and Stat3 (another key player in BC), underlying BC metastasis. We found that Stat3 not only induces ErbB-2 expression, but it also recruits ErbB-2 as its co-activator at the promoter of microRNA-21, a metastasis-promoting microRNA. ErbB-2 also up-regulates microRNA-21 through its direct role as transcription factor. MicroRNA-21, in turn, downregulates the expression of the metastasis-suppressor protein PDCD4. In the clinic, we found an inverse correlation between ErbB-2/Stat3 nuclear coexpression and PDCD4 expression, microRNA-21 and PDCD4 expression, and PDCD4 expression and nodal metastasis in ErbB-2 positive tumors. Although the ErbB-2-targeted therapies trastuzumab and lapatinib have proven beneficial, responses are usually limited in length and magnitude. Here, we revealed a novel mechanism of action of these agents. We found that that blockade of PI3K/AKT and MAPK by trastuzumab or lapatinib inhibits the oncogene c-Myc, resulting in upregulation of microRNA-16, a potent tumor suppressor. Accordingly, we found that failure to upregulate microRNA-16 underlies resistance. We identified two novel microRNA-16 targets, CCNJ and FUBP1, which mediate microRNA-16 antiproliferative effects, and identified microRNA-16 and FUBP1 as predictive biomarkers of adjuvant trastuzumab response in patients with ErbB-2 positive BC. We propose microRNA-16 as an innovative therapeutic agent for trastuzumab- and lapatinib-resistant tumors.
Cita tipo APA: Venturutti, Leandro . (2016-05-04). Rol de los micro-ARN 21 y 16 en la diseminación metastásica y resistencia a terapias dirigidas en el cáncer de mama ErbB-2 positivo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5974_Venturutti.pdf Cita tipo Chicago: Venturutti, Leandro. "Rol de los micro-ARN 21 y 16 en la diseminación metastásica y resistencia a terapias dirigidas en el cáncer de mama ErbB-2 positivo". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5974_Venturutti.pdf |
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Tabacman, Maximiliano. "Métricas de complejidad de grafos para clasificación en múltiples dominios" (2016-05-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de esta tesis es investigar y ofrecer nuevas ideas para clasificar redes complejas basadas en sus propiedades topológicas de gran escala. Estamos interesados en estudiar las propiedades de redes de diferentes dominios, y encontrar características comunes que son compartidas por las redes en cada una de ellas. Con las mismas pretendemos desarrollar algoritmos y técnicas que aprovechen los elementos comunes, para automatizar la clasificación de redes en sus respectivos dominios. Esta información también será de utilidad para determinar si una red artificial presenta las características esperadas para el dominio al que pretende pertenecer. Revisamos un gran número de métricas de complejidad encontradas en la literatura. De ellas, elegimos 13 que luego derivan en un total de 43 métricas. Creamos un conjunto de redes de distintas fuentes, con 240 redes distribuidas en 11 dominios. Aplicamos un análisis exhaustivo a las medidas obtenidas para ellas, analizamos su correlación y distribución estadística, e intentamos predecir las posibilidades de clasificación que tendría un algoritmo automático a la hora de discriminarlas correctamente en sus respectivos dominios. Intentamos determinar si las mediciones obtenidas pueden ser usadas para discriminar los distintos dominios estudiados. Para ello, presentamos 3 tipos de algoritmos de clasificación de la literatura (K Nearest Neighbors, Support Vector Machines y el sistema de Evolutionary Rule Learning BioHEL). Las mediciones son utilizadas como valores de entrada para la tarea de clasificación de distinguir el dominio al que pertenece cada red. Además, para entender el potencial que tienen para clasificar dominios de redes, usamos el generador de grafos CiGRAM para crear un conjunto de 160 redes artificiales distribuidas en 8 dominios a modo de ejemplo. Analizamos su distribución estadística y ejecutamos los experimentos propuestos, donde algunos de los algoritmos logran una precisión de hasta 80%. Adicionalmente, observamos que es fácil interpretar los resultados que ofrece el sistema BioHEL, ya que su salida está compuesta de reglas legibles por una persona, que explican cómo clasificar redes en base a los valores de las métricas calculadas. Finalmente, aplicamos los experimentos propuestos usando las técnicas de clasificación revisadas, con los valores de métricas calculados para las redes reales elegidas. Observamos una clasificación de menor precisión con respecto a lo obtenido para las redes artificiales, y continuamos con escenarios experimentales adicionales para estudiar posibles mejoras, como eliminación de outliers y particionamiento manual de los conjunto de entrenamiento y prueba. Luego de ejecutarlos, a pesar de que en promedio los resultados siguen siendo peores a los obtenidos para las redes artificiales, un subconjunto de los experimentos presenta una precisión de 80% como habíamos obtenido anteriormente. Nuestras conclusiones permiten confirmar que es posible clasificar redes de distintos dominios considerando únicamente las mediciones obtenidas de un conjunto específico de métricas de complejidad, y también ofrecemos posibles mejoras a ser aplicadas en investigaciones futuras. Abstract: The objective of this thesis is to research and offer insights into the possibilities of classifying complex networks based on their large scale topological features. We are interested in studying the properties of networks from different domains, and find common characteristics that may be shared by the networks in each of them. With them, we aim to develop algorithms and techniques that take advantage of the shared features, to automate the classification of networks to their respective domains. This information would also be useful in determining if an artificial network shares the expected characteristics of its intended domain. We research and review a large number of complexity measures from the literature. From them, we choose 13 that are then derived to reach a total of 43 measures. We created a network data set from different sources, with 240 networks distributed across 11 domains. Exhaustive analysis is applied to the measurements obtained from them, to analyze their correlation and statistical distribution, and attempt to predict the classification possibilities an automated algorithm might have of correctly discriminating between the domains. We attempt to determine if the measures computed can be used as discriminators between the domains under study. To that end, we present 3 different classification algorithms from the literature (K Nearest Neighbors, Support Vector Machines and the Evolutionary Rule Learning system BioHEL). The measures obtained are used as the input for the classification task of distinguishing the domain to which each network belongs. Furthermore, to understand their potential ability to correctly classify network domains, we use the CiGRAM graph generator to build a set of 160 artificial networks distributed across 8 sample domains. We analyze their statistical distribution, and run the experiments proposed, where some of the algorithms presented achieve up to 80% accuracy. Moreover, we observe the ease of interpretation in the results offered by the BioHEL system, since its output is composed of human readable rules that explain how to classify the networks based on their computed measures. Finally, we apply the proposed experiments using the classification techniques reviewed to the computed measures of the set of real networks chosen. We observe a lower classification accuracy with regard to the values obtained for the artificial networks, and continue with additional experimental scenarios to study possible improvements, such as outlier elimination, and manual partitioning of the training and testing sets. After running them, we observe that despite the average results are still below those obtained for artificial networks, a subset of the experiments present the previously attained accuracy nearing 80%. Our conclusions imply that it is possible to classify networks into different domains just by considering the measurements obtained from a speciFinally, we apply the proposed experiments using the classification techniques reviewed to the computed measures of the set of real networks chosen. We observe a lower classification accuracy with regard to the values obtained for the artificial networks, and continue with additional experimental scenarios to study possible improvements, such as outlier elimination, and manual partitioning of the training and testing sets. After running them, we observe that despite the average results are still below those obtained for artificial networks, a subset of the experiments present the previously attained accuracy nearing 80%. Our conclusions imply that it is possible to classify networks into different domains just by considering the measurements obtained from a specific set of complexity measures, and we also offer a number of possible improvements in future related research.
Cita tipo APA: Tabacman, Maximiliano . (2016-05-02). Métricas de complejidad de grafos para clasificación en múltiples dominios. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5978_Tabacman.pdf Cita tipo Chicago: Tabacman, Maximiliano. "Métricas de complejidad de grafos para clasificación en múltiples dominios". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5978_Tabacman.pdf |
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Diehl, Alexandra. "Visualización de datos geoespaciales aplicada a la meteorología" (2016-05-02). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La visualización de datos geoespaciales cubre un gran espectro de técnicas visuales e interactivas para la representación, interacción y análisis de datos geoespaciales. Este tipo de datos se caracteriza por tener una referencia geográfica, también puede contener una componente temporal, y usualmente proviene de fuentes masivas y heterogéneas. El diseño de herramientas efectivas para asistir a los usuarios en el proceso de razonamiento analítico de datos complejos y dinámicos constituye un gran desafío. Un diseño efectivo comprende una combinación correcta de representaciones visuales, mecanismos interactivos, y procesamiento semiautomático. Una selección equilibrada de estos elementos depende del dominio específico de aplicación. Esto puede ser sólo alcanzado por un enfoque integral donde el usuario cumple un rol central, colaborando en cada paso de su diseño y evaluación. Diferentes factores influencian este proceso, por ejemplo, el flujo de trabajo de tareas específico del dominio de aplicación, los requerimientos del usuario, y la complejidad de los datos. La presente tesis conduce al lector a través de diferentes enfoques que abordan el desafío de diseñar soluciones de visualización geoespacial eficientes, con aplicaciones específicas para la meteorología. Estos enfoques combinan distintas estrategias de visualización analítica para asistir a los pronosticadores en el análisis del pronóstico operativo del estado del tiempo. Los pronosticadores necesitan realizar un análisis rápido de la información, en el día a día. Proponemos un diseño novedoso que balancea la experiencia del usuario y el análisis semiautomático. Este diseño permite al usuario identificar tendencias y anomalías, analizar incertidumbre, y detectar errores del modelo numérico en forma ágil. También analizamos la integración de tecnologías de juegos serios y visualización científica. Nuestro diseño incorpora técnicas de visualización y tecnologías de juegos serios, en particular de simuladores de vuelo. El mismo demuestra los beneficios que esta integración puede brindar a la interacción con datos geoespaciales por medio de una aplicación de visualización 3D que explora ambientes topográficos y datos atmosféricos. Hemos evaluado la factibilidad y eficiencia de ambos enfoques por medio de diferentes casos de estudio diseñados en estrecha colaboración con meteorólogos, expertos del dominio. Esta evaluación fue realizada usando una metodología de diseño participativa e iterativa. Las conclusiones discutidas en este trabajo abrirán nuevas oportunidades de investigación para el diseño de soluciones de visualización de datos geoespaciales eficientes en el área de meteorología, en el análisis del estado del tiempo y soporte para la toma de decisiones. Abstract: Geospatial data visualization covers a huge scope of visual techniques and interactive mechanisms for the representation, interaction and analysis of geospatial data. This kind of data is characterized for having a geographic reference, it can have a temporal component and often comes from massive and heterogeneous sources. The design of effective tools to assist users on analytical reasoning on these complex and dynamic data constitutes a big challenge. Effective design entails a right combination of visual representations, interactive mechanisms and semi-automatic processing. A carefully chosen selection of these elements depends on the specific domain of application. This can be achieved by an integral approach where the user plays a central role, collaborating in each step of the design and evaluation. Different factors influence this process, for example, the specific domain task workflow, user’s needs and data complexity. This thesis guides readers through different approaches that address the challenge of designing efficient geospatial visualization solutions with specific applications in meteorology. Our approaches face different visual analytical strategies to assist forecasters in the analysis of operational weather forecasts. Forecasters need to perform quick analysis of the data on a daily basis. We propose novel designs that balance user experience and semiautomated analysis. They allow the user to identify trends and anomalies, to analyze uncertainty, and to detect numerical model errors in an agile process. We also analyze the integration of serious games technologies and scientific visualization. Our design combines visualization techniques and serious games technologies, in particular flight simulators. It puts forward the benefits that this integration can bring to the interaction with geospatial data by means of a specific data model design and a 3D visualizer of topographic environments and weather information. We evaluated the feasibility and efficiency of our approaches by means of several case studies designed in close collaboration with meteorologists, who are the domain experts. This evaluation was performed using an iterative and participatory methodology. Conclusions discussed in this work will open new research opportunities to enhance the design of efficient geospatial visualization tools for meteorology, weather analysis and decision-making support.
Cita tipo APA: Diehl, Alexandra . (2016-05-02). Visualización de datos geoespaciales aplicada a la meteorología. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6053_Diehl.pdf Cita tipo Chicago: Diehl, Alexandra. "Visualización de datos geoespaciales aplicada a la meteorología". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-05-02. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6053_Diehl.pdf |
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Villafañe, Norberto Román. "Ideales de operadores multilineales en espacios de Banach y espacios de sucesiones" (2016-04-27). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo definimos el espacio de sucesiones asociado a un ideal de operadores multilineales en espacios de sucesiones. Es decir, para cada ideal de operadores multilineales U, para cada par de espacios de sucesiones E y F y para cada n Є N, asociamos un espacio de sucesiones que lo notamos ln(U;E, F). Vamos a utilizar dicho espacio para comparar los ideales de operadores multilineales nucleares, integrales, extendibles y continuos en espacios de sucesiones lp. También vamos a estudiar características estructurales de dichos espacios de sucesiones -como maximalidad, minimalidad y dualidad- en relación con ciertas características del ideal y de los espacios de sucesiones involucrados. Damos aplicaciones para los ideales de operadores multilineales r-dominados y (E, p)-dominados. Definimos la propiedad de Radon-Nikodým vectorial para un ideal de operadores multilineales y mostramos, bajo ciertas hipótesis, que los ideales de operadores multilineales con dicha propiedad coinciden isométricamente con su núcleo minimal en espacios Asplund. Como consecuencia, probamos la existencia de ciertas estructuras en algunos ideales de operadores multilineales clásicos (existencia de bases, separabilidad o la propiedad de Radon-Nikodým). Por otra parte, damos una demostración alternativa a dos resultados ya conocidos. Uno es la versión vectorial del Teorema de Littlewood-Bogdanowicz-Pelczyński que dice que los operadores multilineales de c0 X ... X c0 en Y son aproximables si y solo si Y no contiene copia de c0. El otro dice que el ideal de operadores multilineales Pietsch-integrales coincide isométricamente con el ideal de operadores multilineales nucleares en espacios Asplund. Abstract: In this work we define the sequence space associated with an ideal of multilinear operators between sequence spaces. That is, for each ideal of multilinear operators U, for each pair of sequence spaces E and F and for each n Є N, we associate a sequence space that we note ln(U;E, F). We will use that space to compare the ideals of nuclear, integral, extendible and continuous multilinear operators between lp-spaces. We will also study structural characteristics of such sequence spaces - as maximality, minimality and duality - regarding certain characteristics of the ideal and the sequence spaces involved. We will give applications to the ideals of r-dominated and (E, p)-dominated multilinear operators. We define the vector Radon-Nikodým property for an ideal of multilinear operators and show, under certain assumptions, that the ideals of multilinear operators with that property coincides isometrically with its minimal kernel on Asplund spaces. As a consequence, we prove the existence of certain structures in some classical ideals of multilinear operators (existence of bases, separability or the Radon-Nikodým property). Furthermore, we give an alternative proof of two results already known. One is the vector version of the theorem of Littlewood- Bogdanowicz-Pelczyński that says that the multilinear operators from cₒ X ··· X cₒ to Y are aproximables if and only if Y does not contain a copy of cₒ. The other one says that the ideal of multilinear operators Pietsch-integral coincides isometrically with the ideal of nuclear multilinear operators on Asplund spaces.
Cita tipo APA: Villafañe, Norberto Román . (2016-04-27). Ideales de operadores multilineales en espacios de Banach y espacios de sucesiones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6031_Villafane.pdf Cita tipo Chicago: Villafañe, Norberto Román. "Ideales de operadores multilineales en espacios de Banach y espacios de sucesiones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-27. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6031_Villafane.pdf |
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Pozzi, Emiliano César Cayetano. "Estudios radiobiológicos de la Terapia por Captura Neutrónica en Boro (BNCT) para el tratamiento de cáncer bucal y metástasis hepáticas a nivel experimental" (2016-04-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Terapia por Captura Neutrónica en Boro (BNCT) es una aplicación de la tecnología nuclear al área biomédica, que se basa en la acumulación selectiva de compuestos borados dentro del tumor y la subsiguiente irradiación con neutrones, generando una reacción de captura neutrónica que libera radiación de partículas de alta transferencia lineal de energía (LET) y corto alcance que resultan letales para la célula. De esta manera BNCT dañaría preferencialmente el tumor sin causar daño significativo al tejido normal. Nuestro grupo demostró la eficacia terapéutica de la aplicación a nivel experimental de distintos protocolos de BNCT in vivo, utilizando las fuentes de neutrones disponibles inicialmente, es decir los reactores nucleares de experimentación RA-1 (San Martín, Buenos Aires) y RA-6 (Bariloche, Río Negro). Luego, en 2005, la Comisión Nacional de Energía Atómica (CNEA) construyó una fuente de neutrones térmicos para aplicaciones biomédicas de BNCT en el reactor nuclear RA-3 (Ezeiza, Buenos Aires). Entre los objetivos del presente trabajo se planteó realizar una adaptación y caracterización dosimétrica de la nueva fuente que permitiera realizar estudios radiobiológicos de BNCT en el modelo experimental de cáncer bucal de la bolsa de la mejilla del hámster. Se evaluaron las respuestas del tumor, tejido precanceroso y tejido normal en forma comparativa con las otras fuentes utilizadas anteriormente. Los conocimientos obtenidos en estos estudios se emplearon para llevar adelante líneas de investigación para optimizar los protocolos de BNCT, maximizando su eficacia terapéutica, minimizando su radiotoxicidad y evaluando su potencial aplicación a otras patologías. En este contexto y dado el interés de la comunidad internacional de explorar el potencial terapéutico de BNCT para el tratamiento de metástasis hepáticas, otro objetivo principal de esta tesis doctoral fue realizar una evaluación sistemática de la eficacia terapéutica del BNCT en un modelo experimental de metástasis hepática, y considerar la potencial radiotoxicidad del tratamiento sobre el hígado. Se realizó la puesta a punto de un modelo in vivo en ratas, se desarrolló y caracterizó dosimétricamente un sistema adecuado de blindaje para luego realizar los estudios de BNCT in vivo en la fuente del reactor RA-3. Se evaluó la respuesta del tumor y aspectos de la radiotoxicidad en hígado para contribuir al conocimiento de la radiobiología de BNCT en el tratamiento de esta enfermedad. Los conocimientos de la radiobiología de BNCT obtenidos en modelos experimentales permitirían optimizar BNCT para distintas patologías. Abstract: Boron Neutron Capture Therapy (BNCT) applies nuclear technology to biomedicine. BNCT is based on the selective accumulation of boron compounds in tumor cells, followed by irradiation with neutrons. The capture reaction between a thermal neutron and a 10B atom gives rise to short range particles with high linear energy transfer (LET) that are lethal for the cell. Thus BNCT would damage tumor without causing significant damage to normal tissue. Our group demonstrated the therapeutic efficacy of the application of different experimental BNCT protocols in vivo employing the neutron sources initially available, i.e. the experimental nuclear reactors RA-1 (San Martín, Buenos Aires) and RA-6 (Bariloche, Río Negro). After that, in 2005, the National Atomic Energy Commission of Argentina (CNEA) built a neutron source for BNCT biomedical applications at the nuclear reactor RA-3 (Ezeiza, Buenos Aires). The first aim of the present PhD thesis was to adapt and dosimetrically characterize the new source to be able to perform BNCT radiobiological studies in the hamster cheek pouch oral cancer model. We evaluated the response of tumor, precancerous tissue and normal tissue, as compared to studies performed previously at other neutron sources. The knowledge contributed by these studies made it possible to undertake research projects devoted to optimize BNCT protocols, maximizing their therapeutic efficacy and minimizing their toxicity, and examining their potential for the treatment of other pathologies. Within this context, and based on the interest of the international community to explore the therapeutic potential of BNCT for liver metastasis, the next major aim of this PhD thesis was to perform a systematic evaluation of the therapeutic efficacy of BNCT in an experimental model of liver metastasis, considering the potential toxicity in liver. The in vivo experimental model in rats was adapted and characterized. Subsequently, a shielding device to perform the in vivo BNCT studies at the RA-3 facility was designed, constructed and characterized dosimetrically. Tumor response and potential liver toxicity were evaluated to contribute to the knowledge of BNCT radiobiology for the treatment of this pathology. The knowledge of BNCT radiobiology derived from experimental models would allow for the optimization of BNCT for different pathologies.
Cita tipo APA: Pozzi, Emiliano César Cayetano . (2016-04-22). Estudios radiobiológicos de la Terapia por Captura Neutrónica en Boro (BNCT) para el tratamiento de cáncer bucal y metástasis hepáticas a nivel experimental. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6022_Pozzi.pdf Cita tipo Chicago: Pozzi, Emiliano César Cayetano. "Estudios radiobiológicos de la Terapia por Captura Neutrónica en Boro (BNCT) para el tratamiento de cáncer bucal y metástasis hepáticas a nivel experimental". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6022_Pozzi.pdf |
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Noval, María Gabriela. "Proteínas virales intrínsecamente desordenadas: disección estructural de la oncoproteína E7 del virus del papiloma humano y de la fosfoproteína P del virus sincicial respiratorio" (2016-04-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las proteínas intrínsecamente desordenadas (IDPs) son proteínas funcionales que carecen de estructura secundaria y terciaria definidas en solución. Este tipo de categoría estructural se encuentra sobrerepresentada en proteínas virales, otorgándole multifuncionalidad y versatilidad en las interacciones que establecen. Debido a flexibilidad asociada a las distintas transiciones conformacionales que presentan, las IDPs son muy difíciles de caracterizar estructuralmente, debiéndose recurrir principalmente a técnicas de estudio en solución. En este trabajo se estudiaron dos modelos de IDPs virales: el dominio amino-terminal de la oncoproteína E7 (E7N) del virus del papiloma humano (HPV-16) y la fosfoproteína P del virus sincicial respiratorio humano (RSV). En primer lugar, utilizando un abordaje de fragmentación en conjunto con medidas de dicroismo circular y resonancia magnética nuclear, se estudiaron las tendencias conformacionales del dominio E7N. Identificamos tres regiones con estructura secundaria local y transitoria: dos α- hélices dentro de las regiones conservadas CR1 y CR2, y una región que adopta hélice de poliprolinas tipo II (PII) dentro del CR2. Las dos α-hélices se encuentran pobladas en forma parcial, representando solo al 20% de la población de moléculas de E7N. Por otro lado, demostramos que la hélice-II presenta transiciones conformacionales entre PII y α-hélice moduladas por cambios de pH. Estas regiones de estructura local coinciden con los motivos lineales de interacción descriptos para este dominio, así como con sitios que experimentan modificaciones post-traduccionales. Estas características sugieren que dichas transiciones estructurales podrían modular la accesibilidad a estos motivos, regulando la interacción con sus proteínas blanco. En segundo lugar, utilizando distintas proteínas recombinantes, demostramos por primera vez la naturaleza IDP de la proteína P de RSV. La misma contiene dos módulos intrínsecamente desordenados, los cuales presentan distinto contenido de desorden. Definimos al dominio Cterminal de P como un dominio con características en solución de tipo pre-molten globule like IDP, y al dominio N-terminal como un dominio con características de tipo random-coil like IDP. Describimos que P presenta un comportamiento térmico anómalo, conteniendo en el dominio C-terminal un elemento marginalmente estable modulable por variaciones de temperatura dentro del rango de temperaturas fisiológico. En conclusión, estos ejemplos resaltan la flexibilidad funcional inherente de las IDPs, la cual les permite ser moduladas por cambios en el entorno. Esta capacidad permite a su vez explicar la plétora de procesos biológicos en los cuales se encuentran involucradas. Abstract: The intrinsically disordered proteins (IDPs) are functional proteins that lack defined secondary or tertiary structure in solution. This type of structural category is overrepresented in viral proteins, giving multi-functionality and versatility in interactions. Because of the flexibility generated by the different structural transitions, the structural characterization of IDPs represents a challenging task, being necessary to use in solution techniques for their characterization. In this work we studied the structural and functional determinants of two IDP models: the human papilloma virus E7 aminoterminal IDP domain (E7N HPV-16) and the respiratory syncytial virus P phosphoprotein. First, using a fragmentation approach in combination with circular dichroism and nuclear magnetic resonance experiments we studied the conformational tendencies within the E7N domain. We identified three regions with local secondary structure: two α-helixes within the CR1 and CR2 conserved regions, and a polyproline type II helix (PII) within the CR2. The two α- helixes were partially populated, representing only the 20% of the conformational ensemble within E7N. On the other hand, we demonstrated that the Helix-II presents a conformational transition between PII and α-helix triggered by pH changes. The small linear motifs as well as the post-translational modification sites are located within the mapped local secondary structural elements within E7N, suggesting that the structural transitions within these regions modulated the accessibility of the motives and in consequence regulates the interactions with target proteins. In the second part of this thesis, we experimentally demonstrate for the first time the IDP nature of the P phosphoprotein, reveling the existence of two IDPs modules with different degree of disorder. The C-terminal domain behaves as a pre molten globule like IDP, whereas the N- terminal domain presents random coil-like IDP features. P presents a pronounced reversible secondary structure transition. We identified a marginal stable element within the C-terminal domain which could be tuned by temperature changes in the physiological range. To conclude, these examples highlights the capability of the IDPs to be modulated by changes in their environment, bringing functional flexibility that may explain the plethora of biological processes where their are involved.
Cita tipo APA: Noval, María Gabriela . (2016-04-19). Proteínas virales intrínsecamente desordenadas: disección estructural de la oncoproteína E7 del virus del papiloma humano y de la fosfoproteína P del virus sincicial respiratorio. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6035_Noval.pdf Cita tipo Chicago: Noval, María Gabriela. "Proteínas virales intrínsecamente desordenadas: disección estructural de la oncoproteína E7 del virus del papiloma humano y de la fosfoproteína P del virus sincicial respiratorio". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6035_Noval.pdf |
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Angerami, Matías Tomás. "Distribución y análisis funcional de Linfocitos T CD4+ regulatorios y T CD4+ convencionales en el contexto de la coinfección por HIV-1 y M. tuberculosis y su modulación por la hormona adrenal Dehidroepiandrosterona" (2016-04-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Tuberculosis representa el principal agente de mortalidad a nivel mundial en pacientes infectados con el HIV-1. Ambas infecciones conllevan a una desregulación de los ejes inmune y adrenal que influirán en el desarrollo de las correctas respuestas frente a los patógenos. Así, investigamos la subpoblacion de LT CD4+CD25-FoxP3+ (uTreg, LTreg “no convencionales”) en pacientes co infectados con tuberculosis activa (HIV-TB), en individuos HIV+ con TB latente (HIV-TBL), en individuos HIV+ sin TB y en dadores sanos (DS). En primer lugar se comparó la expresión de CD39, PD1, GITR y el estado de maduración (CD27/CD45RA) de las células uTreg entre los distintos grupos de estudio. Los pacientes HIV-TB mostraron menores niveles de expresión de CD39 y mayores de PD1 que los DS, así como un estado de maduración alterado con respecto a los demás grupos. Más aun, se observaron menores niveles de CD39 y mayores de PD1 en células uTreg de pacientes HIV-TB y DS, al compararse con la expresión en LT CD4+CD25+FoxP3+ (cTreg). Además la población uTreg mostro mayores frecuencias de la subpoblacionTreg EM, así como una capacidad de producción de IFN-γ incrementada respecto de cTreg, en ambos grupos e pacientes. Luego, evaluamos una cohorte de pacientes HIV-TB durante el transcurso del tratamiento anti tuberculoso (TaT), analizando parámetros endocrinos e inmunológicos. De esta forma se observaron valores disminuidos de DHEA-s al incio del TaT con respecto a las concentraciones presentadas por DS, que se normalizaron a través del tiempo. Además, esto se vio acompañado por un aumento en la frecuencia de células productoras de IFN-γ Mtb específicas, y por una disminución del número de células uTreg hasta alcanzar los valores presentes en DS. Finalmente, al analizar citoquinas asociadas a inflamación, se observaron niveles incrementados al inicio del TaT, que luego de seis meses retornaron a valores normales. Por último, se investigó la respuesta Mtb especifica de linfocitos T CD4+ de pacientes HIV-TB y DS, caracterizando la producción de IFN-γ y TNF-α, su distribución memoria/efectora, y la modulación por parte de DHEA sobre la respuesta y la maduración de LT. En principio se observó que el agregado de DHEA no logro modular la respuesta antígeno especifica ni en HIV-TB ni en DS. Por otro lado, se encontró una disminución de células Naive y un aumento de LT EM en el grupo HIV-TB. Además, al evaluar la producción de citoquinas de cada subpoblacion de memoria, los DS presentaron mayores niveles de IFN-γ/TNF-α en las LT EM, mientras en HIV-TB todas las poblaciones presentaron niveles similares de producción de dichas citoquinas. La adición de DHEA moduló la producción de citoquinas en los LT CM de DS y logró disminuir las diferencias existentes en la distribución memoria/efectora observadas en los LT CD4 Mtbespecíficos entre los HIV-TB y DS. El conjunto de resultados demuestran que la población uTreg a pesar de presentar diferencias en el fenotipo, el grado de maduración y en su capacidad de producir IFN-γ, posee una acción supresora similar a la de las células cTreg. Además, el trabajo permite evidenciar que el TaT logro normalizar parámetros endocrinos e inmunes a lo largo de 6 meses de terapia. Por último, se consiguió discriminar la producción de citoquinas Th1 para distintas subpoblaciones de Memoria en el contexto de la coinfeccion, y sugerir un rol modulador de DHEA sobre la diferenciación de las células antígeno específicas. Abstract: Tuberculosis is the most common opportunistic infection and represents the main cause of death worldwide in HIV-1 infected patients. Both infections lead to a deregulation of the immune and adrenal axes that influence the development of normal responses to pathogens, resulting in alterations of lymphocyte frequencies and in their functional capabilities. In this context, we aimed to investigate the previously described expanded subpopulation of LT CD4+CD25-FoxP3 + (uTreg) in co-infected patients with active tuberculosis (HIV-TB) and compared them with those uTregs analyzed in HIV+ individuals with latent TB (HIV- TBL), HIV+ individuals without TB (HIV) and a group of healthy donors (HD). So, first we evaluated the expression of CD39, PD1, GITR and the maturation status through CD27/CD45RA in the uTreg population along the different study groups. HIV-TB patients showed higher expression levels of CD39 and PD1 compared with HD. Moreover, we found significant differences in the maturation status of uTregs from HIV-TB when compared with the other study groups. We also compared uTreg vs. cTreg (CD4+CD25+FoxP3+) in HIV-TB patients and in HD. Besides this, the production of IFN-γ, TGF-β, IL-10 and suppressor capacity between both cell populations was assessed. Thus, we observed lower levels of CD39 and increased expression of PD1 in uTreg cells of both groups. Similar differences were found in these groups of individuals when maturation profile and cytokine production was analyzed, showing that uTreg cells had higher frequencies of Treg EM, as well as an increased capacity to produce IFN-γ than cTreg cells both in HIV-TB and HD groups. Secondly, we evaluated a cohort of HIV-TB patients during the course of the antituberculosis therapy (ATT), evaluating both endocrine and immunological markers. Thus, diminished plasma levels of DHEA-s were observed at the initiation of therapy, reaching normal levels after 6 months. Moreover, this was accompanied by an increase in the frequency of IFN-γMtb specific-producing cells, and a decrease in uTreg frequencies, which reached HD values at six months of therapy. Furthermore, when several cytokines associated with inflammation were analyzed during ATT, we observed a modulation of IL -6, IL-8, IL-7 and IL-12 levels, whose values decreased along anti TB therapy. Finally, we compared the responsiveness of Mtb specific LT CD4+ of HIV-TB and HD, analyzing the IFN-γ and TNF-α production, memory/effector distribution, and the modulation by DHEA of functionality and maturation status of CD4+ T cells.We observed that the DHEA did not modulate Mtb specific responses of CD4+ T cells in either group. On the other hand, when the memory/ effector distribution was compared between HIV-TB and HD, decreased proportions of naïve T cells and increased percentages of LTEM cells in HIV-TB group were found. In addition, cytokine production of memory subsets was assessed, therefore while the T CM subset produced a greater amount of IFN-γ/TNF-α compared with the other subsets of HD individuals, HIV-TB memory/effector subsets showed a similar production capacity. Addition of DHEA modified cytokine production only in TCM cells from HD. Interestingly, DHEA reduced the existing differences in CD4 T cells memory/effector distributions between Mtb-specific CD4+ cells from HIV-TB and HD. Together, these results uncover alterations of the immune-endocrine axes during HIVTB co infection. Our work also demonstrates that uTreg population, despite having an altered phenotype, maturation status and ability to produce IFN-γ, has a conserved suppressive capacity. Furthermore, this work demonstrates that ATT normalizes immune-endocrine parameters over 6 months of therapy. Finally, it was possible to discriminate Th1 cytokine production from different memory/effector subpopulations in the context of this coinfection, and to suggest a modulatory role for DHEA on the differentiation of Mtb-specific cells.
Cita tipo APA: Angerami, Matías Tomás . (2016-04-19). Distribución y análisis funcional de Linfocitos T CD4+ regulatorios y T CD4+ convencionales en el contexto de la coinfección por HIV-1 y M. tuberculosis y su modulación por la hormona adrenal Dehidroepiandrosterona. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5980_Angerami.pdf Cita tipo Chicago: Angerami, Matías Tomás. "Distribución y análisis funcional de Linfocitos T CD4+ regulatorios y T CD4+ convencionales en el contexto de la coinfección por HIV-1 y M. tuberculosis y su modulación por la hormona adrenal Dehidroepiandrosterona". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5980_Angerami.pdf |
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Ibarbalz, Federico Matías. "Metagenómica de lodos activados. Factores determinantes del ensamblado de comunidades bacterianas en el tratamiento de efluentes" (2016-04-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El tratamiento biológico de efluentes domésticos o industriales por lodos activados se basa en la actividad de poblaciones microbianas capaces de autoensamblarse para constituir una comunidad dinámica de alta diversidad. Revelar los factores que determinan la estructura de las comunidades microbianas y los mecanismos que conducen a su ensamblado es crítico para mejorar la gestión del proceso de tratamiento y para proveer un marco conceptual que pueda ser aplicado a comunidades microbianas en otros procesos de biotecnología ambiental. Varios estudios previos realizados en plantas de tratamiento de lodos activados municipales, de diferente configuración y provenientes de sitios geográficamente distantes, sugerían la presencia de taxones bacterianos de alto rango (filos) comunes a todos los sistemas estudiados. En base a estos antecedentes, se planteó la hipótesis de que los determinantes ecológicos del proceso de tratamiento relacionados con la formación del agregado biológico (floc), que permite la retención de la biomasa en el sistema, serían los principales responsables de definir la composición de la comunidad bacteriana en lodos activados. Los objetivos de esta tesis fueron: 1) comprobar si existe un grupo común (core) de taxones bacterianos y funciones en plantas de tratamiento de efluentes municipales e industriales, y 2) determinar cuáles son las variables ambientales y operacionales relevantes en la estructuración de las comunidades bacterianas de los lodos activados. Se realizaron estudios de metagenómica comparativa, utilizando técnicas de pirosecuenciación de amplicones de las regiones variables V1-V3 del gen de ARN ribosomal 16S (ARNr 16S), y secuenciación al azar de ADN metagenómico. Se analizaron lodos activados de 9 plantas de tratamiento de efluentes ubicadas en Argentina, dos municipales y siete industriales, cada una muestreada en dos oportunidades, separadas por períodos de hasta 4 años, conjuntamente con los datos metagenómicos de 12 plantas de tratamiento industriales y municipales localizadas en China, India, Singapur y Corea del Sur, generados en otros laboratorios. Se determinó que la diversidad taxonómica y funcional es significativamente mayor en lodos activados municipales que en industriales. Cada sistema de lodos activados que trata un efluente industrial particular presentó una composición bacteriana característica, reproducible en el tiempo, y marcadamente distinguible del patrón de filos y clases bacterianas observado en plantas municipales. A pesar de los cambios a nivel de género dentro de cada planta, se observó una conservación de los perfiles de contenido de GC en los metagenomas. Se detectó una preferencia particular de ciertos grupos bacterianos consistente con diferencias subyacentes en las abundancias de categorías funcionales particulares, que a su vez se relacionaron con la metabolización de constituyentes específicos de los efluentes. Se concluye que las características del efluente son el principal determinante de la estructuración de las comunidades bacterianas en sistemas de lodos activados. Asimismo, se sugiere que el aumento en la variedad de sustratos que ingresan a los procesos de tratamiento, por ejemplo combinando efluentes de diferentes orígenes en parques industriales, permitiría la conformación de comunidades microbianas más robustas en términos de resistencia y resiliencia frente a perturbaciones. Los modelos mecanicísticos como el ASM1 o el ASM3, que son herramientas valiosas para la representación de procesos biológicos que ocurren en biorreactores, son calibrados utilizando parámetros derivados de plantas de tratamiento municipales. Los resultados obtenidos en esta Tesis resaltan la importancia de considerar las diferencias taxonómicas y funcionales entre lodos activados industriales y municipales, ya que las mismas podrían reflejar cambios en la cinética de consumo de sustratos y en la formación de productos de almacenamiento. Abstract: Biological treatment of domestic and industrial wastewater by activated sludge relies on a self-assembled, highly diverse and dynamic microbial community. Revealing the factors that determine the community structure and the mechanisms that drive microbial community assembly in activated sludge is critical to improve the reliability of wastewater treatment management and to help developing a conceptual framework that could be applied to microbial communities in other processes of environmental biotechnology. Several previous studies, conducted on municipal wastewater treatment plants of varying configuration and geographical location, indicated the presence of a common core of high-rank bacterial taxa (phyla). Based on these results, it was hypothesized that the ecological drivers related to the floc formation, a biological aggregate that allows biomass retention, would be the main factors defining the bacterial community composition in activated sludge. The objectives of this work were: 1) to test the existence of a common core of bacterial taxa and functions across municipal and industrial wastewater treatment plants, and 2) to determine which environmental and operational variables are relevant in structuring the bacterial communities of activated sludge. Comparative metagenomic studies were performed utilizing amplicon-sequencing of V1-V3 variable regions of the 16S rRNA gene, and shotgun-sequencing of metagenomic DNA. Two municipal and seven industrial wastewater treatment plants located in Argentina were surveyed, each sampled twice, at times separated by periods of up to 4 years, and analyzed in conjunction with the metagenomic data sets of 12 other municipal and industrial wastewater treatment plants located in China, India, Singapore and South Korea, generated in other laboratories. The taxonomic and functional diversity in municipal activated sludge was found to be significantly higher than that of industrial activated sludge. Each industrial activated sludge exhibited a unique bacterial composition, occurring in a reproducible manner, clearly distinguishable from the high-rank bacterial taxa pattern present in municipal plants. Interestingly, in spite of a changing genera profile within each community, there was a distinct GC content profile in their metagenomes. A particular preference of certain bacterial groups was detected, and it was consistent with underlying differences in the abundance of specific functional categories, which were at the same time related with metabolic pathways involving specific wastewater components. The conclusion is that wastewater features are the main drivers for bacterial community structure in activated sludge. Moreover, an increase in the variety of influent substrates, e.g. by the combination of different influents within an industrial park, would allow the existence of more robust microbial communities, in terms of resistance and resilience against disturbances. Mechanistic models like ASM1 or ASM3, which are valuable tools for the representation of biological processes taking place in bioreactors, are calibrated using parameters from municipal treatment plants. The results obtained in this Thesis highlight the importance of considering the taxonomic and functional differences between municipal and industrial activated sludge, as these may reflect changes in the kinetics of substrate consumption and storage products formation.
Cita tipo APA: Ibarbalz, Federico Matías . (2016-04-18). Metagenómica de lodos activados. Factores determinantes del ensamblado de comunidades bacterianas en el tratamiento de efluentes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5986_Ibarbalz.pdf Cita tipo Chicago: Ibarbalz, Federico Matías. "Metagenómica de lodos activados. Factores determinantes del ensamblado de comunidades bacterianas en el tratamiento de efluentes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5986_Ibarbalz.pdf |
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Da Re, Cristina Verónica. "Relevamiento de cepas argentinas de hongos ligninolíticos para su aplicación en procesos biotecnológicos ligados a la industria celulósico-papelera" (2016-04-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los materiales lignocelulósicos dan origen a múltiples industrias, siendo la fabricación de pulpa y papel una actividad económica de importancia global. Estudios previos demostraron que las enzimas de hongos ligninolíticos podrían resultar útiles en distintas etapas del procesamiento de la madera, así como en la biorremediación de los efluentes. El presente trabajo se centró en el relevamiento y la caracterización enzimática de 35 cepas de hongos causantes de pudrición blanca de la República Argentina y en su posible utilización en tres etapas específicas de la producción de pulpa y papel: biopulpado, bioblanqueo y degradación del licor negro. Los resultados de esta investigación permitieron identificar una cepa con potencial para el biopulpado de madera de Pinus taeda. Pycnoporus sanguineus no sólo fue capaz de reducir el contenido de lignina un 11% en 14 días de tratamiento, sino que también produjo cambios estructurales notables en la lignina y la hemicelulosa, incrementando la porosidad 15%. Además de la modificación química causada por delignificación selectiva, los cambios físicos producidos, como el aumento del tamaño de poro, afectan directamente la penetración de productos químicos de cocción, reduciendo el consumo de energía en el proceso. En referencia al bioblanqueo, se lograron resultados promisorios mediante una secuencia sencilla, totalmente libre de cloro, que involucró sobrenadantes de cultivo de Trametes trogii y Coriolus antarcticus, y posterior blanqueo con peróxido de hidrógeno. La misma funcionó aun en condiciones moderadas (28°C) lo que permite minimizar el consumo de energía y la pérdida de pulpa. La utilización de crudos enzimáticos evita el costo elevado de la purificación enzimática y el uso de mediadores adicionales. Entre las cepas investigadas para su posible uso en el tratamiento del licor negro, Lenzites elegans fue capaz de lograr buenos porcentajes de decoloración, y sólo requirió para ello de la disminución del pH del efluente con el agregado de ácido cítrico. Irpex lacteus también resultó capaz de decolorarlo, pero fue necesario un dializado previo. Como resultado de esta investigación, se identificaron nuevas cepas de hongos ligninolíticos con potencial en biopulpado, bioblanqueo y decoloración del licor negro y se analizaron condiciones a ser tenidas en cuenta a la hora de utilizar a estos organismos o sus enzimas en dichos procesos. Abstract: Lignocellulosic materials give rise to multiple industries, being the pulp and paper an economic activity of global importance. Previous studies demonstrated that fungal ligninolytic enzymes may be useful in various stages of wood processing and effluents bioremediation. This work focuses on the screening and enzymatic characterization of 35 strains of Argentinean white-rot fungi and their possible use in three specific stages of pulp and paper elaboration: biopulping, biobleaching and black liquor degradation. As a result of this research a strain with potential for biopulping Pinus taeda wood was identified. Pycnoporus sanguineus was not only able to reduce the lignin content 11% in 14 days of treatment, but also caused significant structural changes in lignin and hemicellulose, increasing the porosity of treated wood 15%. In addition to the chemical modification caused by selective delignification, the produced physical changes such as increased pore size, directly affect the penetration of cooking chemicals, reducing energy consumption in the process. Promising results were achieved through a totally chlorine free biobleaching sequence, involving culture supernatants of Trametes trogii and Coriolus antarcticus and a subsequent step of hydrogen peroxide bleaching. This sequence was functional even under mild conditions (28°C), thus minimizing power consumption and pulp loss. Using crude enzyme avoids the high cost of enzyme purification and the need of additional mediators. Among the strains investigated for their potential use in the treatment of black liquor, Lenzites elegans was able to attain good levels of decolorization, and only required lowering the pH of the effluent with citric acid addition. An important decolorization was also achieved by Irpex lacteus but only after the dialyzation of the effluent. As a result of this research, new strains of ligninolytic fungi with potential for biopulping, biobleaching and black liquor decolorization were identified, and several parameters that may affect the use of these organisms or their enzymes in the pulp and paper industry, were optimized.
Cita tipo APA: Da Re, Cristina Verónica . (2016-04-15). Relevamiento de cepas argentinas de hongos ligninolíticos para su aplicación en procesos biotecnológicos ligados a la industria celulósico-papelera. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5992_DaRe.pdf Cita tipo Chicago: Da Re, Cristina Verónica. "Relevamiento de cepas argentinas de hongos ligninolíticos para su aplicación en procesos biotecnológicos ligados a la industria celulósico-papelera". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5992_DaRe.pdf |
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Mild, Jesica Gabriela. "Búsqueda de extractos naturales con propiedades antiparasitarias y nuevos blancos moleculares para la terapia contra la enfermedad de Chagas" (2016-04-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los tratamientos disponibles contra la Enfermedad de Chagas son poco efectivos y pueden presentar efectos secundarios severos. Existe una urgente necesidad de encontrar nuevos blancos moleculares y nuevas terapias antiparasitarias. El primer objetivo de este trabajo consistió en la búsqueda de extractos naturales con capacidad de interrumpir interacciones entre proteínas que participan en procesos esenciales del parásito y presentan características divergentes respecto de su contraparte en humanos. El rastreo se realizó sobre la interacción entre las proteínas p14 y Sf3b155 a través de un ensayo basado en la transferencia de energía resonante bioluminiscente (BRET). Contrariamente al objetivo original, encontramos que un extracto de Nardophyllum bryoides provocó un aumento de la señal de BRET, lo cual reflejaría su capacidad de modular positivamente la interacción; asimismo, el extracto presentó propiedades antiproliferativas sobre cultivos de epimastigotes. Por otra parte, se planteó la identificación de nuevos blancos moleculares a partir de dos estrategias. La primera se basó en la caracterización de potenciales interacciones entre proteínas del parásito, en particular, a través de la búsqueda de ligandos de una proteína exclusiva de T. cruzi, TcCLB.504427.180, que presenta dominios WW y podría participar en diversos procesos fisiológicos. La segunda, se enfocó en la búsqueda de nuevos efectores de la vía del AMPc en T. cruzi. Si bien la primera estrategia no arrojó resultados positivos, el segundo enfoque nos permitió demostrar que la proteína TcCLB.508523.80 es capaz de unir AMPc y que podría estar involucrada en la invasión de la célula hospedadora. Estas evidencias sugieren que TcCLB.508523.80 sería un novedoso sensor primario del AMPc en la biología del parásito. Abstract: Available treatments against Chagas Disease are not completely effective and may present severe side effects. There is an urgent need to find new molecular targets and new antiparasitic therapies. The first objective of this work was to search for natural extracts with the ability to interrupt interactions between proteins that are involved in essential processes of the parasite and posses divergent characteristics regarding its human counterparts. The screen was performed on the interaction between the proteins p14 and Sf3b155 through a bioluminescent resonance energy transfer (BRET) assay. Contrary to the original goal, we found that an extract of Nardophyllum bryoides caused an increase in BRET signal, which might reflect its ability to positively modulate the interaction; in accordance, the extract showed antiproliferative properties on epimastigote cultures. Moreover, we intended to identify new molecular targets by using two approaches. The first was based on the characterization of potential interactions between parasite proteins, in particular, through searching ligands for TcCLB.504427.180, a T. cruzi exclusive protein, which contains WW domains and could be involved in various physiological processes. The second, was focused on finding new effectors of the cAMP pathway in T. cruzi. While the first strategy showed no positive results, the second approach allowed us to demonstrate that the protein TcCLB.508523.80 is able to bind cAMP and could be involved in host cell invasion. These evidences suggest that TcCLB.508523.80 could be a novel primary cAMP sensor in the parasite biology.
Cita tipo APA: Mild, Jesica Gabriela . (2016-04-14). Búsqueda de extractos naturales con propiedades antiparasitarias y nuevos blancos moleculares para la terapia contra la enfermedad de Chagas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5937_Mild.pdf Cita tipo Chicago: Mild, Jesica Gabriela. "Búsqueda de extractos naturales con propiedades antiparasitarias y nuevos blancos moleculares para la terapia contra la enfermedad de Chagas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5937_Mild.pdf |
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Riggio, Marina. "Rol de la vía PI3K/AKT/mTOR en la progresión del cáncer de mama" (2016-04-12). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Antecedentes: El cáncer de mama es la neoplasia maligna más común en mujeres y una de las primeras causas de muerte por cáncer en el mundo. A pesar de los avances en el diagnóstico y en el tratamiento para esta enfermedad, un alto porcentaje de los tumores progresan y metastatizan en órganos distantes. PI3K/AKT/mTOR es la vía mutada con mayor frecuencia en tumores sólidos; alrededor del 70% de los tumores de mama presentan alguna mutación en esta vía, lo cual se asocia con un peor pronóstico y resistencia a la terapia endócrina, contra HER-2, radio y quimioterapia. Existen tres isoformas para Akt: AKT1, AKT2 y AKT3, con discrepancias sobre sus funciones específicas. Objetivo: El objetivo de este trabajo fue estudiar el rol diferencial de AKT1 y AKT2 en los procesos de proliferación, migración e invasión celular a lo largo de la progresión tumoral en cáncer de mama. Antecedentes: En trabajos previos del laboratorio utilizando un modelo de carcinomas mamarios murinos habíamos demostrado que la sobreactivación de la isoforma AKT1 era capaz de inducir el crecimiento tumoral hormono-independiente. Los tumores generados resultaron ser más diferenciados que los tumores de los que derivaron, con formación de estructuras ductales y mayor expresión de citoqueratina 8 y laminina I, y menor expresión de citoqueratina 14. Metodología: Para extrapolar los resultados obtenidos en otros modelos experimentales, utilizamos tres líneas celulares humanas de cáncer de mama (IBH-7, IBH-6 y T47D), analizamos el efecto de sobreactivar o silenciar específicamente cada isoforma sobre el fenotipo tumoral en cultivo y en xenotransplantes. Resultados: En las líneas celulares IBH-7 e IBH-6 demostramos que AKT1 induce el crecimiento de tumores mamarios, a través de la activación de la proteína ribosomal S6 y el aumento en la expresión de ciclina D1. Además, la sobreactivación de AKT1 induce el crecimiento tumoral hormono-independiente a través de la fosforilación de receptores hormonales en ausencia de agergado exógeno de hormona. En consecuencia, la sobreactivación de AKT1 fue capaz de inducir resistencia al tratamiento con ICI182780 (Fulvestrant), un antagonista del receptor de estrógenos. Coincidente con los antecedentes mencionados, el fenotipo tumoral obtenido con la sobreactivación de AKT1 es de tipo glandular diferenciado, con aumento en la expresión de las proteínas luminales E-cadherina y laminina-I. Sorprendentemente, el silenciamiento de AKT1 endógeno disminuyó la proliferación e incrementó la migración e invasión celular in vitro a través de la inducción del eje β1-integrina/FAK/MMP9, e in vivo, siendo los tumores resultantes altamente infiltrantes. Por otro lado, la sobreactivación de AKT2 también indujo tumores con características infiltrantes pero sin modificar el crecimiento tumoral. Por el contrario, el silenciamiento de AKT2 endógeno disminuyó la motilidad celular en cultivo, regulando proteínas del citoesqueleto como F-actina y vimentina. El grado de invasión de los xenotransplantes IBH-6 y T47D con distintos niveles de AKT1 y AKT2 se asoció con la pérdida en la expresión de E-cadherina y un aumento en la expresión de vimentina, marcadores de progresión tumoral. Encontramos además que el silenciamiento de AKT1 induce un aumento en la expresión de AKT2 endógeno, sugiriendo una regulación entre isoformas. Por último, en un ensayo preliminar encontramos que el tratamiento con inhibidores de PI3K/AKT/mTOR si bien disminuye el crecimiento tumoral, aumenta la incidencia de metástasis pulmonares. Este resultado puede ser relevante en el diseño de terapias con inhibidores específicos de dicha vía. En conjunto, nuestros resultados muestran funciones diferentes, y en algunos casos opuestas, para AKT1 y AKT2 en la progresión del cáncer de mama. Demostramos que AKT1 tiene un rol relevante en el crecimiento tumoral, regulando proteínas involucradas en la sobrevida y proliferación celular y activando en forma ligando-independiente los receptores hormonales, esto último conlleva a la adquisición de resistencia a la terapia endócrina. En un estadio tumoral más avanzado, tanto la disminución de AKT1 a través de la activación del eje β1-integrina/FAK/MMP9, como el aumento de AKT2 a través de la regulación del citoesqueleto de actina, llevarían a una mayor agresividad tumoral dada por un aumento de la invasión celular. Conclusión: En base a nuestros resultados, proponemos que tanto la pérdida de AKT1 como la ganancia de AKT2 podrían ser consideradas como biomarcadores para clasificar a los tumores mamarios con características más agresivas. La relevancia de nuestro trabajo radica en el análisis exhaustivo de la función de la vía PI3K/AKT/mTOR, diferenciando el rol particular de AKT1 y AKT2 y de sus proteínas target downstream, que a futuro podría aplicarse en el diseño de terapias dirigidas a cada tipo y estadio tumoral para lograr un mayor efecto terapéutico. Abstract: Background: Breast cancer is the most frequently diagnosed cancer and the leading cause of cancer death among females worldwide. Despite the early diagnosis and the improvement in the treatments, a considerable amount of tumors progress and metastasize. PI3K/AKT/mTOR is the most frequently mutated pathway in solid tumors; approximately 70% of breast tumors display an activating mutation in one component of the pathway, and it is associated with a poor outcome and resistance to conventional therapy. There are three AKT isoforms: AKT1, AKT2 and AKT3, with different specific functions. Specific aims: The main aim of this thesis was to study the specific role of AKT1 and AKT2 during proliferation, cell migration and invasion through breast cancer progression. Background: We have previously demonstrated that AKT1 overactivation was sufficient to induce hormone-independent breast tumor growth. The resultant tumors were differentiated, with high levels of cytokeratin 8 and laminin-I and low levels of cytokeratin 14 expression. Methodology: In this study, we used three human breast cancer cell lines, IBH-7, IBH-6 and T47D and we analyzed the effect of up- or downregulation of AKT1 or AKT2 on tumor phenotype, in culture and in xenografts. Results: We demonstrated that AKT1 induced tumor growth through ribosomal S6 protein and cyclin D1 increase. Moreover, AKT1 upregulation lead to hormone-receptors activation, even in the absence of exogenous hormone supply. Consequently, AKT1 overexpression induced resistance to the estrogen receptor downregulator, ICI182780 (Fulvestrant). Moreover, AKT1 overexpressing tumors displayed glandular differentiation, with high levels of E-cadherin and laminin-I. AKT1 silencing decreased cell proliferation and, surprisingly, increased cell migration and invasion in cell culture, through the β1-integrin/FAK/MMP9 axe. Besides, silenced AKT1 tumors were highly invasive of the adjacent adipose and muscle tissue, and induced lung metastasis. On the other hand, AKT2 overactivation also induced more invasive tumors and lung metastasis, with no changes in tumor growth although. On the opposite, AKT2 downregulation decreased motility in cell culture, by regulating citoskeleton proteins as F-actin and vimentin. We also found that AKT1 silencing induced an upregulation in AKT2 expression, suggesting a cross regulation between the two isoforms. Finally, in a preliminary study we found that PI3K/AKT/mTOR inhibitors are capable of decreasing breast tumor size but of inducing more aggressive tumors and lung metastasis. This effect could have great implications in the management of new targeted therapies against the pathway. Altogether, our results clearly show different, and in some cases opposite roles for AKT1 and AKT2 isoforms in breast cancer progression. We demonstrated that AKT1 has a relevant role in tumor growth, through the regulation of proteins involved in cell survival and proliferation, and trough the activation of hormone receptors, ultimately leading to endocrine resistance. On the other hand, the downregulation of AKT1, as well as the upregulation of AKT2, can increase cell invasion and tumor aggressiveness. Conclusion: We propose that AKT1 loss and/or AKT2 gain should be considered as biomarkers to better classify invasive mammary tumors. The relevance of this work is the deep analyses of PI3K/AKT/mTOR pathway, differentiating AKT1 and AKT2 functions, and its downstream proteins in breast cancer progression, which could be useful in the future to design targeted therapies for each tumor type and stage.
Cita tipo APA: Riggio, Marina . (2016-04-12). Rol de la vía PI3K/AKT/mTOR en la progresión del cáncer de mama. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6003_Riggio.pdf Cita tipo Chicago: Riggio, Marina. "Rol de la vía PI3K/AKT/mTOR en la progresión del cáncer de mama". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-12. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6003_Riggio.pdf |
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Villordo, Sergio Manuel. "Estudios de estructuras de ARN que regulan la replicación del virus del dengue en humanos y mosquitos" (2016-04-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El virus de dengue es el principal patógeno humano transmitido por mosquitos para el cual aún no existen tratamientos antivirales efectivos. El genoma viral es una molécula de ARN compuesta por un único marco de lectura abierto flanqueado por las regiones 5' y 3' no codificantes. Mediante la manipulación genética de clones infecciosos y ensayos funcionales hemos, demostrado que la estructura del ARN en los extremos del genoma es dinámica y que la formación regulada de conformaciones alternativas es necesaria para la síntesis del ARN viral en células de mamíferos. Experimentos complementarios en células de mosquito confirmaron además la importancia de este fenómeno en ambos hospedadores y permitieron detectar una secuencia en el extremo 3' del genoma que funciona como un determinante específico para la replicación del virus en insectos. Por otro lado, la combinación de estudios de mapeo químico y análisis de conservación de la región 3' no codificante han revelado la existencia de estructuras de ARN que se mantienen conservadas entre distintos flavivirus transmitidos por insectos. El análisis de esta región mediante experimentos de adaptación en células y técnicas de secuenciación masiva ha permitido caracterizar una estructura de ARN que se adapta de manera diferencial durante la infección en mosquitos y mamíferos. Además a través de ensayos de mutagénesis dirigida y el estudio del fitness viral en células y mosquitos adultos se demostró que la duplicación de dicha estructura facilita la alternancia de hospedadores con requerimientos diferentes. En conjunto los resultados de esta tesis proveen nuevos conocimientos sobre la biología del dengue de posible utilidad para el desarrollo racional de estrategias antivirales. Asimismo, la información aquí presentada permitirá entender aspectos epidemiológicos y evolutivos de virus de ARN transmitidos por insectos con relevancia en salud pública. Abstract: Dengue virus is the most important mosquito-borne human pathogen for which there are no vaccines and no effective antiviral treatments available. The viral genome is an RNA molecule coding for a single open reading frame flanked by highly structured 5' and 3' non coding regions. Using infectious clones and evaluating replication of recombinant viruses, we have demonstrated that the ends of the viral genome are dynamic and that the regulation of alternative conformations of the viral RNA is crucial for infectivity. Additional experiments using mosquito cells confirmed the relevance of our findings for mosquito and human hosts, and allowed the identification of specific sequence requirements for viral replication in insects. Furthermore, by combining chemical probing and sequence conservation analysis of viral 3' non coding regions, the existence of RNA structure motifs that are conserved in mosquitoborne flaviviruses was demonstrated. In this regard, new models and patterns of 3’UTR conservation among all known flaviviruses were constructed. Employing host adaptation assays and deep sequencing analysis, different viral populations were characterized from distinct hosts. Interestingly, the sequence variations detected modified the secondary structure of a single RNA structure. Mutational analysis and virus fitness measurements in mosquito cells and infected mosquitoes showed the requirement of RNA structure duplication as a mechanism to maintain high viral fitness during host mosquito-human switch. Together, these results provide new knowledge about dengue virus biology useful for rational development of antiviral strategies. Importantly, in these studies we present new mechanisms of virus-host adaptation that will help the understanding of epidemiological and evolutionary aspects of viral pathogens transmitted by insects.
Cita tipo APA: Villordo, Sergio Manuel . (2016-04-11). Estudios de estructuras de ARN que regulan la replicación del virus del dengue en humanos y mosquitos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6001_Villordo.pdf Cita tipo Chicago: Villordo, Sergio Manuel. "Estudios de estructuras de ARN que regulan la replicación del virus del dengue en humanos y mosquitos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6001_Villordo.pdf |
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Girard, Gisele. "Protocolo de control de calidad y comisionamiento de fantoma para imágenes de tomografía computada" (2016-04-08). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El control de los equipos de tomografía computada es indispensable para obtener una adecuada calidad de imagen y asegurar que la dosis recibida por el paciente sea tan baja como sea posible. Fue diseñado un plan de comisionamiento para el fantoma Catphan® 700, el cual consta de 17 pruebas relativas al control de calidad en TC. Mediante la utilización de este fantoma se han logrado verificar 22 parámetros que hacen al control y aseguramiento de calidad del sistema de TC: sistema de alineación del paciente, ancho de corte, desplazamiento de la camilla, simetría circular del sistema de visualización, linealidad espacial en los ejes x, y, z, dimensiones de pixel, linealidad de volumen, resolución espacial, MTF, sensitometría, linealidad del número CT, escala de contraste, curva de calibración para planificación de radioterapia, resolución de bajo contraste, exactitud de número CT, nivel de ruido, uniformidad del número CT, fracción de uniformidad, artefactos y consistencia en tres dimensiones. En ciertos parámetros fueron descriptos más de un método de medición, por ejemplo, ancho de corte y resolución espacial, entre otros. También se midieron parámetros dosímetricos: CTDI en aire y en volumen con maniquíes de cabeza y de abdomen y fue calculado el producto dosis-longitud. El protocolo de utilización del fantoma fue puesto en práctica en dos tomógrafos pertenecientes a Hospitales de la Ciudad de Buenos Aires: Hospital General de Agudos “Dr Ignacio Pirovano” e Instituto de Oncología “Ángel H. Roffo”. En ambos casos, los parámetros evaluados se encuentran dentro de las tolerancias especificadas en las correspondientes referencias internacionales. Como herramienta de cálculo y de registro, fueron creadas diversas planillas en formato hoja de cálculo que facilitan las tareas gráficas y analíticas de los profesionales encargados del aseguramiento de la calidad en el servicio. Finalmente, se elaboró un modelo de informe para proporcionar a los usuarios de los equipos al final de las mediciones. Las pruebas de control de calidad descriptas en este documento proporcionan una base para el establecimiento de un programa de control de calidad de TC y de este modo velar por la mejora continua del sistema de salud en Argentina. Abstract: The quality control of CT equipments is essential to obtain an adequate image quality and ensure that the dose received by the patient is as low as possible. It was designed a plan for commissioning Catphan® 700 phantom, which consists of 17 tests relating to quality control in CT. Using this phantom has been able to verify 22 parameters that make control and quality assurance of the CT system: slice thickness, patient alignment system, spatial resolution, displacement of the table, circular symmetry display system, spatial linearity in the x, y, z axis, pixel dimensions, linearity volume, spatial resolution, MTF, sensitometry, linearity of the number CT, contrast scale, calibration curve for radiotherapy planning, low contrast resolution, accuracy CT number, noise, uniformity number CT, fraction uniformity, artifacts and consistency in three dimensions. In certain parameters they were described over a measurement method, for example, slice thickness and spatial resolution, among others. Dosimetric parameters were also measured: CTDI in air and in volume with head and abdomen phantom, and was calculated dose-length product. The use of phantom protocol was implemented on two CT scanners Hospital belonging to the City of Buenos Aires: Acute General Hospital "Dr Ignacio Pirovano" and Institute of Oncology "Angel H. Roffo". In both cases, the evaluated parameters are within the tolerances specified in the relevant international references. As a tool for calculating and recording, various forms were created in sheet format to facilitate calculation and analytical graphics professionals responsible for quality assurance in service tasks. Finally, a report model was developed to provide users of the equipment at the end of the measurements. The quality control tests described in this paper provide a basis for the establishment of a quality control program of TC and thus ensure continuous improvement of the health system in Argentina.
Cita tipo APA: Girard, Gisele . (2016-04-08). Protocolo de control de calidad y comisionamiento de fantoma para imágenes de tomografía computada. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5952_Girard.pdf Cita tipo Chicago: Girard, Gisele. "Protocolo de control de calidad y comisionamiento de fantoma para imágenes de tomografía computada". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-08. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5952_Girard.pdf |
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Di Napoli, Jennifer. "Rol del sistema Eph/ephrinas en el desarrollo del sistema nervioso central y su posible utilidad en estrategias de regeneración de las conexiones topográficamente ordenadas" (2016-04-08). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo central de este trabajo es estudiar los mecanismos moleculares que regulan la potencialidad evolutiva de las células madre/progenitoras de la retina, haciendo hincapié en el rol del sistema Eph/ephrinas. Se pretende que los hallazgos de este trabajo aporten: a) conocimientos básicos sobre los mecanismos celulares y moleculares del desarrollo del SNC y del sistema visual y b) conocimientos que sirvan de base para el diseño de estrategias de terapias regenerativas en la retina. Para tal efecto se emplea el sistema retinotectal del embrión de pollo como modelo experimental. El principal nicho de células madre/progenitoras de la retina reside en un anillo tisular que rodea a la retina llamado margen ciliar (MC). Éste contiene a las células madre/progenitoras del cuerpo ciliar (CC) y las células madre/progenitoras localizadas en la zona marginal ciliar (ZMC). Esta zona provee células retinianas durante la vida postnatal en peces y anfibios, permitiendo el crecimiento de la retina y su regeneración. Las aves y los mamíferos en cambio, pierden esta capacidad regenerativa. En aves, donde el crecimiento retiniano se produce durante el desarrollo, un pequeño MC persiste postnatalmente pero carece de la potencialidad evolutiva para aportar todos los tipos celulares de la retina. Las células madre/progenitoras del MC son capaces de 1) proliferar in vitro formando neuroesferas ó 2) de proliferar in vivo al ser estimuladas formando nueva retina neural. Sin embargo, se ha mostrado que no todas las células madre “son iguales” y que varían en su potencialidad evolutiva. En el presente trabajo: 1. Se evalúa si las células madre del MC se diferencian in vitro en células ganglionares de la retina (CGR) que posean información posicional y que sean competentes para responder a las moléculas del sistema Eph/ephrinas que guían el crecimiento axonal durante la formación del mapa retinotectal. 2. Se investiga si las retinas regeneradas a partir del MC y de la transdiferenciación expresan las moléculas del sistema Eph/ephrinas y presentan información posicional. 3. Se determina si la estimulación de la vía de señalización de Shh con su análogo activador SAG permite obtener retinas con regeneración completa a partir de las células madre/progenitoras del MC. En este trabajo se han establecido las condiciones in vitro que permiten obtener un alto grado de diferenciación de CGR a partir de células madre provenientes del MC. Estas CGR expresan moléculas del sistema Eph/ephrinas en forma topográficamente específica y son competentes para responder a moléculas del sistema Eph/ephrinas que guían a los axones durante la formación del mapa retinotectal. Se ha demostrado que la activación de la vía canónica de Shh con SAG induce la regeneración completa de la retina a partir de las células madre/progenitoras del MC in vivo y que las CGR de la misma tienen información posicional expresando el sistema Eph/ephrinas en forma de gradiente como las retinas en desarrollo. Nuestros resultados aumentan las probabilidades de obtener una eferencia que establezca conexiones topográficamente ordenadas en el tectum. Abstract: The central aim of this work is to study the molecular mechanisms that regulate the evolutionary potential of the stem/progenitor cells of the retina, focusing on the role of the Eph/ephrin system. It is intended for the findings on this work to provide: a) basic knowledge on the cellular and molecular mechanisms of the CNS and visual system development, and b) knowledge to be used to design of regenerative therapy strategies for the retina. For this work we used the chick embryo retinotectal system is used as experimental model. The retina stem/progenitor cell niche resides in a ring around the retina called the ciliary margin (CM), which holds the stem/progenitor cells of the ciliary body (CB) and of the ciliary margin zone (CMZ). This zone provides retinal cells during the postnatal life in fish and amphibians, allowing for retinal growth and regeneration. However, avian and mammals have lost this regenerative capability. In avian, where retina growing takes place during development, a small CM persists postnatally, but it lacks of potenctial to generate all the cellular types of retina. The stem/progenitor cells of the CM are capable of 1) proliferating in vitro forming neurospheres, or 2) proliferating in vivo when stimulated forming new neural retina. However, it has been shown that not all the stem cells are ‘equal’ and that they vary in their evolutionary potentiality. In the present work: 1. Stem/progenitor cells of the CM are evaluated for their differentiation potential in vitro into retinal ganglion cells (RGC) which have positional information and are competent to respond to molecules of the Eph/ephrin system which guies axonal growth during the retinotectal map formation. 2. The expression patterns of Eph/ephrin and their positional information are studied during retina regeneration initiated from the CM and from retinal pigmented epithelium (RPE) transdifferentiation. 3. The sonic hedgehog (Shh) pathway and its analog activator SAG are evaluated for their potential to induce complete retina regeneration from the stem/progenitor cells of the CM. In this work we defined in vitro conditions that optimized for a high degree of RGC differentiation from the stem/progenitor cells present in the CM. These RGCs express molecules of the Eph/ephrin system in a topographic specific way and respond to the cues that guide the axons during the formation of the retinotectal map. We also show that activating the Shh canonical with SAG induces the complete retina regeneration from the CM stem/progenitor cells in vivo and that the RGCs from this regenerated retina have the same positional information expressing the Eph/ephrin system in a gradient form just as the retinas during development. Our results increase the probability of obtaining an efference that establishes a topographic order of connections in the tectum.
Cita tipo APA: Di Napoli, Jennifer . (2016-04-08). Rol del sistema Eph/ephrinas en el desarrollo del sistema nervioso central y su posible utilidad en estrategias de regeneración de las conexiones topográficamente ordenadas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5965_DiNapoli.pdf Cita tipo Chicago: Di Napoli, Jennifer. "Rol del sistema Eph/ephrinas en el desarrollo del sistema nervioso central y su posible utilidad en estrategias de regeneración de las conexiones topográficamente ordenadas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-08. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5965_DiNapoli.pdf |
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Mengoni, Eleonora Soledad. "Búsqueda y aislamiento de metabolitos secundarios en plantas y su caracterización como antiinflamatorio y antimicrobiano. Potencial uso de estos en pacientes con fibrosis quística" (2016-04-06). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La Fibrosis Quística (FQ) es una enfermedad autosómica recesiva producida por mutaciones en el gen que codifica un canal para iones cloruro, el CFTR. La principal complicación a la que se enfrentan las personas que padecen FQ es el daño pulmonar crónico y progresivo causado principalmente por el patógeno oportunista Pseudomonas aeruginosa. En esta tesis, se estudiaron compuestos provenientes de fuentes naturales con el objetivo de establecer si alguno de ellos poseía actividad antimicrobiana sobre P. aeruginosa PAO1 y/o anti-inflamatoria en modelos in vitro e in vivo. En una etapa preliminar, se empleó un extracto acuoso (RACU) y otro etanólico (RETOH) obtenidos a partir de hojas frescas de romero, y posteriormente se evaluaron sus compuestos mayoritarios: el ácido rosmarínico (RA), el ácido carnósico (CA) y el carnosol (CS). De todos, el CA, disminuyó el crecimiento de P. aeruginosa de manera dosis dependiente, potenció la actividad del antibiótico tobramicina, redujo la adhesión bacteriana a placas de poliestireno, e interfirió con la motilidad a concentraciones subinhibitorias. Mediante el uso de la cepa sensora de acil homoserina lactonas (AHLs), C. violaceum CV026,se observó que el CA afectó la producción de las AHLs C4-AHL, C6-AHL, C8-AHL y C12-AHL, responsables de la activación de genes reguladores del sistema quorum sensing (QS). En los ensayos de inflamación, tanto CA como el CS presentaron una importante actividad anti-inflamatoria tópica en modelos de ratón, corroborándose este efecto por estudios histopatológicos, y demostrándose por primera vez que el CA y el CS decrecen significantemente la expresión de IL-1β y TNF-α, e inhiben completamente la expresión de COX-2. Otro compuesto estudiado fue el xilitol debido a que es empleado en la prevención de patologías relacionadas con la colonización bacteriana en las fauces y vías aéreas superiores, se hipotetizó sobre la posibilidad de que se pueda emplear para inhibir el crecimiento de P. aeruginosa. Los resultados revelaron efectos pleiotrópicos del xilitol sobre los genes controlados por QS tanto en la producción de elastasa, piocianina, los movimientos de swarming, twitching y la formación de biofilm, sugiriendo que la producción de AHLs se encontraba afectada. El empleo de los plásmidos pME3853 (lasl::LacZ) y pME3846 (rhll::LacZ) en PAO1, permitieron demostrar la disminución de la producción de AHLs en presencia del xilitol. Por otra parte el cultivo de PAO1 crecido durante toda la noche en presencia de xilitol, se adhirió menos a las células epiteliales bronquiales Calu-3 crecidas en monocapa, disminuyendo el daño oxidativo producido por el proceso inflamatorio y la liberación de IL-8 por parte del epitelio bronquial comparado con el control (crecido sin xilitol). En conclusión, esta tesis presenta evidencias sobre el potencial uso de compuestos bioactivos provenientes de plantas en la inhibición del crecimiento de microorganismos de difícil erradicación y los posibles mecanismos involucrados. Abstract: Cystic Fibrosis (CF) is an autosomal recessive disease caused by mutations in the gene encoding the CFTR chloride channel. The main complication for people with CF is chronic and progressive lung damage caused mainly by the opportunistic pathogen, P. aeruginosa. In this thesis, natural compounds were studied in order to determine if these, had antimicrobial activity on P. aeruginosa PAO1 and/or anti-inflammatory activity in vitro and in vivo models. In the first stage, an aqueous (RACU) and ethanolic (RETOH) extracts, from fresh leaves of rosemary, and its main constituents such as rosmarinic acid (RA), carnosic acid (CA) and carnosol (CS) were studied. From these compounds, CA, not only reduced the growth of P. aeruginosa in a dose-dependent manner, but also enhanced the activity of tobramycin antibiotic. Also decreased adhesion on polystyrene plates, and interfered with bacterial motility at subinhibitory concentrations. However, the production of AHLs (C4-AHLs, C6-AHL, C8-C12-AHLs) molecules responsible for the activation of genes regulating system quorum sensing (QS), were increased by CA, when C. violaceum CV026 was employed. In inflammatory test, both CA and CS had higher topical anti-inflammatory activity in mouse models, being corroborated by histopathological studies and demonstrating for the first time that CA and CS decreased significantly, the expression of IL-1β and TNF-α, and a complete inhibition of COX-2 expression. Subsequently, xylitol other natural component employed in the prevention of pathologies related to bacterial colonization of fauces and upper airways was studied. This compound showed pleiotropics effects on genes controlled by QS, such as elastase, pyocyanin, swarming, twitching and biofilm, suggesting that the production of AHLs were affected. To confirm this point, pME3853 (lasl::LacZ) and pME3846 (rhll::lacZ) plasmids were employed in PAO1, confirming that AHLs expression were decreased. In vitro, the growing of PAO1 with xylitol, reduced the adhesion of the bacteria on bronchial epithelial Calu-3 cells, also reduced the oxidative damage and decreased significantly the IL-8 release by bronchial epithelium. In conclusion, the plant kingdom offers a large number of components and bioactive compounds with its potential use against microorganisms where their eradication is difficult to control.
Cita tipo APA: Mengoni, Eleonora Soledad . (2016-04-06). Búsqueda y aislamiento de metabolitos secundarios en plantas y su caracterización como antiinflamatorio y antimicrobiano. Potencial uso de estos en pacientes con fibrosis quística. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6017_Mengoni.pdf Cita tipo Chicago: Mengoni, Eleonora Soledad. "Búsqueda y aislamiento de metabolitos secundarios en plantas y su caracterización como antiinflamatorio y antimicrobiano. Potencial uso de estos en pacientes con fibrosis quística". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-04-06. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6017_Mengoni.pdf |
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García Galofre, Juliana. "Soluciones conjuntistas a la ecuación de Yang-Baxter, invariantes de nudos y cohomología" (2016-03-31). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En el Capítulo 2 definimos una biálgebra B cuya homología y cohomología coinciden con las de biquandle definidas en y otras generalizaciones de cohomología del caso quandle o rack (por ejemplo la definida en ). La estructura algebraica encontrada permite demostrar con transparencia la existencia de un producto asociativo en la cohomología de biquandles. Este producto era conocido para el caso rack (con una demostración topológica, por lo que nuestra construcción provee de una prueba completamente algebraica e independiente) pero era desconocido en el caso general de biquandles. También esta estructura algebraica descubierta permite mostrar la existencia de morfismos de comparación con cohomología de Hochschild que, eventualmente, podrán proveer de ejemplos de cálculo de cociclos, que (en grado dos para nudos, y en grado tres para superficies) pueden ser utilizados para calcular invariantes. Más aún, explicitamos un morfismo de comparación que se factoriza por un complejo que, como bimódulo, es la extensión de escalares de un álgebra de Nichols. En se define un 2-cociclo de quandle como una aplicación β : X × X → H donde (X,★) es un quandle y H es un grupo (no necesariamente abeliano) tal que β(x1,x2)β(x1★x2,x3) = β(x1,x3)β(x1★x3,x2★x3) y β(x,x) = 1. En el Capítulo 3 generalizamos esa definición para biquandles (X,σ) adaptando las ecuaciones existentes y agregando una equación más: Una función f : X × X → H es un 2-cociclo trenzado no conmutativo si • f(x1,x2) f(σ2(x1,x2),x3) = f(x1,σ1(x2,x3)) f(σ2(x1,σ1(x2,x3)),σ2(x2,x3)), y • f(σ1(x1,x2),σ1(σ2(x1,x2),x3))= f(x2,x3) ∀x1,x2,x3 ∈ X. Definimos un grupo, Unc, y un 2-cociclo no conmutativo universal, π, tales que para todo grupo H y f : X × X → H 2-cociclo no conmutativo, existe un único morfismo de grupos ḟ : Unc → H tal que f = ḟ ◦ π. Mostramos que Unc es funtorial. Definimos una asignación de pesos a cada cruce en un nudo/link y, probando que cierto producto es invariante por movimientos de Reidemeister obtuvimos un nuevo invariante de nudos/links que generaliza el invariante obtenido en . Para cada grupo Unc definimos cocientes Uᵞnc y mostramos que estos, si bien son en general mucho más chicos que Unc, guardan la misma información que el primero con respecto al cálculo de invariantes. Hemos calculado Unc y Uᵞnc para ciertos ejemplos de biquandles pequeños. Para poder trabajar con ejemplos de cardinal mayor a tres utilizamos GAP (System for Computational Discrete Algebra). Esto último nos permitió colorear links con biquandles (no provenientes de quanldles) de mayor cardinal y así distinguir nudos-links concretos (e.g.: el trebol de su imagen especular, la no trivialidad del link Whitehead, etc). Es decir, encontramos ejemplos que muestran que nuestro invariante generaliza estrictamente el definido en . Estos ejemplos ya se dan con biquandles de tamaño muy chico (cardinal 3) y permiten distinguir sensiblemente nudos distintos (e.g.: link Borromeo de tres "no nudos" separados , link de Whitehead de dos "no nudos", trebol de su imagen especular). Palabras clave: invariante de knot-links, cohomología de Yang-Baxter. Quandle, biquandle, rack, biálgebra, álgebra de Hopf, algebra trenzada. Abstract: In Chapter 2, we define a bialgebra B such that its homology and cohomology are the same as the biquandle ones defined in and other genalizations of cohomology of the quandle-rack case (for example defined in ).This algebraic structure enable us to show an associative product in biquandle cohomology. This product was known for the rack case (with topological proof) but unknown in biquandle case. This algebraic structure also allows to define comparison morphisms with other cohomology theories that could eventually provide cocycle examples (of degree two for knots and degree three for surfaces) for computing invariants. Furthermore, we give an explicit comparison morphism that factorizes by a complex that, as bimodule, is the scalar extension of a Nichols algebra. In a quandle 2-cocycle is defined as a map β : X × X → H where (X,★) is a quandle and H is a group (not necessarily abelian) such that β(x1,x2)β(x1★x2,x3) = β(x1,x3)β(x1★x3,x2★x3) and β(x,x) = 1. In Chapter 3 we generalized this definition to biquandles (X,σ): A function f : X × X → H is a non commutative braided 2-cocycle if verifies both • f(x1,x2) f(σ2(x1,x2),x3) = f(x1,σ1(x2,x3)) f(σ2(x1,σ1(x2,x3)),σ2(x2,x3)), and • f(σ1(x1,x2),σ1(σ2(x1,x2),x3))= f(x2,x3) ∀x1,x2,x3 ∈ X. We define a group, Unc and a universal non commutative 2-cocycle π such that for every group H and f : X × X → H a non commutative 2-cocycle, exist a unique group morphism ḟ : Unc H such that f = ḟ ◦ π. We show that Unc is functorial. Define an assignment of a weight to each crossing in a knot-link. A certain product of these weights is invariant under Reidemester moves, then a new invariant for knot-links is obtained generalising the one obtained in . For each group Unc we defined quotients Uᵞnc which keep the same data when computing the invariant and have smaller cardinal. We calculated Unc and Uᵞnc for certain biquandles of small cardinality. To be able to work with more examples we worked with GAP (System for Computational Discrete Algebra). Creating programs we were able to color links with bigger biquandles (not coming from quandles) and found examples that show our invariant generalizes the one defined in . This examples are achived using biquandles of cardinality three and distinguish knots-links (e.g.: Borromean link from three separeted unknots, Whitehead link from two unknots, trefoil knot and its mirror). .
Cita tipo APA: García Galofre, Juliana . (2016-03-31). Soluciones conjuntistas a la ecuación de Yang-Baxter, invariantes de nudos y cohomología. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5942_GarciaGalofre.pdf Cita tipo Chicago: García Galofre, Juliana. "Soluciones conjuntistas a la ecuación de Yang-Baxter, invariantes de nudos y cohomología". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-31. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5942_GarciaGalofre.pdf |
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Tonti, Natalia Edith. "Estudio de los flujos turbulentos de energía y masa a través del uso de la metodología de covarianzas turbulentas sobre un ecosistema de marisma" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las regiones templadas son las áreas de mayor concentración de población del planeta, por lo que sus ecosistemas están sujetos a la influencia humana. Por ejemplo, grandes áreas de bosques y pastizales han sido convertidas a la agricultura. Estos cambios en el uso de la tierra tienen el potencial de producir efectos importantes en los ciclos biogeoquímicos que regulan el equilibrio y dinámica de los ambientes naturales a través de los intercambios (flujos) de energía y masa (vapor y dióxido de carbono -CO2) entre la atmósfera y el ecosistema. Las marismas saladas son pastizales naturales costeros, ubicados en áreas preferenciales para el asentamiento urbano y por ende son vulnerables. Se consideran altamente productivas en energía y biomasa y son de sumo interés debido a las funciones que cumplen. El método de las covarianzas turbulentas es la herramienta actual que permite determinar con mayor precisión, de forma continua e integrada los flujos de energía y masa sobre los distintos ecosistemas terrestres. Los objetivos de esta Tesis son estudiar y analizar mediante este método, las dinámicas de los flujos de energía, CO2 y vapor de agua de una marisma del sudeste de la Provincia de Buenos Aires y caracterizar su producción primaria neta. Para alcanzar estos objetivos se realizó una campaña experimental en la que se midieron los flujos, además de observaciones de contenido de agua en el suelo, meteorológicas convencionales, muestreos destructivos de biomasa aérea y censos de vegetación complementarios. Los resultados muestran que la marisma actúa como sumidero de CO2 durante todo el año, a diferencia de otros ambientes en los que durante el período invernal la superficie actúa como fuente. Estos resultados contribuyen al conocimiento general de las interacciones entre la atmósfera y los ecosistemas y en particular provee la línea de base para caracterizar estados de equilibrio futuros en el sistema atmósfera - biósfera. Abstract: Temperate regions are the areas of greatest population in the world, so their ecosystems are subject to human influence. For example, large areas of forests and grasslands have been converted to agriculture. These changes in land use have the potential to produce significant effects on biogeochemical cycles that regulate the balance and dynamics of natural environments through energy and mass exchanges (water vapour and carbon dioxide -CO2- fluxes) between the atmosphere and the ecosystem. Salt marshes are coastal grasslands located in preferential areas for urban settling which therefore are vulnerable. They produce great amounts of energy and biomass, and also are of great interest because of the ecosystem services they provide. Eddy covariance is the method that nowadays provides the most precise, continuous and integrated energy and mass fluxes of terrestrial ecosystems. This doctoral thesis aims to study and analyze by this method, the dynamics of energy, water vapour and CO2 fluxes of a salt marsh located in southeastern Buenos Aires Province as well as, characterize its net primary productivity. To achieve these goals a field campaign was designed to monitor atmospheric flows, along with soil water content, conventional weather observations, and complementary destructive biomass sampling and vegetation census. Unlike other environments where the surface acts as a source in winter, results show that the marsh is a sink for CO2 throughout the year. These findings contribute to the knowledge of the interactions between the atmosphere and ecosystems and particularly provide the baseline to characterize future states of equilibrium in the atmosphere - biosphere system.
Cita tipo APA: Tonti, Natalia Edith . (2016-03-30). Estudio de los flujos turbulentos de energía y masa a través del uso de la metodología de covarianzas turbulentas sobre un ecosistema de marisma. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5959_Tonti.pdf Cita tipo Chicago: Tonti, Natalia Edith. "Estudio de los flujos turbulentos de energía y masa a través del uso de la metodología de covarianzas turbulentas sobre un ecosistema de marisma". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5959_Tonti.pdf |
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Schultz, Sabina. "Estudios ecofisiológicos en microalgas del sistema ácido Río Agrio-Lago Caviahue (provincia del Neuquén, Argentina)" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se realizaron aislamientos de 11 especies algales cocoides y filamentosas del Río Agrio-Lago Caviahue y del complejo termal Copahue (considerados ambientes extremos por su bajo pH y alta temperatura, respectivamente). Las especies se determinaron taxonómicamente al microscopio óptico y mediante microscopía electrónica de barrido y transmisión. Las especies seleccionadas para los bioensayos (Keratococcus rhaphidioides, Pseudococcomyxa simplex y Watanabea caviahuensis) se llevaron a axenicidad. A cada una de ellas se les midió la tasa de fotosíntesis y se les determinó el óptimo de crecimiento en bioensayos con pH entre 2 y 7. El efecto de los nutrientes sobre el crecimiento algal se evaluó con dos fuentes de fósforo (fosfato y glicerofosfato), con distintas fuentes de nitrógeno (nitrato, nitrito, amonio, urea, leucina y ácido aspártico) y con distintas fuentes de carbono en luz y oscuridad (CO2, glucosa, acetato de etilo y urea). Las curvas de fotosíntesis revelaron que la irradiancia de saturación fue relativamente baja (100-200 μmol fotón m^-2 s^-1) así como el punto de compensación lumínica, mientras que el pH de crecimiento óptimo estuvo alrededor de 4. Con respecto a los nutrientes, el P no mostró mayores diferencias de crecimiento entre la fuente inorgánica y la orgánica, sin embargo con N las mayores densidades se obtuvieron con nitrato, urea y leucina. En cuanto al carbono, K. rhaphidioides lo incorporó principalmente de manera inorgánica (CO2) aunque fue capaz de crecer con fuentes orgánicas en presencia de luz. Fue notable que en oscuridad las células permanecieran en estado estacionario manteniendo constante la densidad a lo largo del experimento. K. rhaphidioides, la especie mayoritaria en biomasa y densidad del fitoplancton del lago Caviahue, mostró que no posee mecanismos de concentración de carbono, con lo que su tasa de fotosíntesis depende principalmente de la disponibilidad de CO2 externo. Los hallazgos de laboratorio permitieron relacionar la distribución espacial y temporal de las especies estudiadas con las características ambientales observadas en el sistema ácido natural Río Agrio-Lago Caviahue. Abstract: Eleven algal strains of cocoidal and filamentous habits, were isolated from the Rio Agrio-Lago Caviahue system. These environments are considered extreme due to its low pH and high temperature, respectively. The species were determined and characterized under light and electronic microscopy (SEM and TEM). Three strains were selected for the bioassays (Keratococcus rhaphidioides, Pseudococcomyxa simplex and Watanabea caviahuensis) and axenic cultures of these were obtained. The photosynthesis rate and optimal growth conditions were determined in bioassays with pH between 2 and 7. The effect of different nutrients was also addressed. Among them, two phosphorus sources (phosphate and glicerophosphate), six sources of nitrogen (nitrate, nitrite, ammonium, urea, leucine and aspartic acid) and four sources of carbon (CO2, glucose, etil-acetate and urea) were studied. The photosynthesis studies reveled that the light compensation point and irradiance saturation were low (100-200 μmol photon m^-2 s^-1) while optimum pH was 4. Moreover, no significant differences were found for the growth with the different P sources, but for N, nitrate, urea and leucine yielded higher growth rates and cell densities. With regard to the carbon sources, K. rhaphidioides incorporated all the carbon sources under constant illumination, although the better growth parameters were obtained with CO2. Regardless of the source, no growth was registered in darkness, the algae were arrested for the whole experiment. K. rhaphidioides is the most abundant algal species of Lake Caviahue phytoplankton, in biomass and cell number. It was shown that this algae has no carbon concentrating mechanisms (CCM), reason why the photosynthesis rate depends only on the external CO2 concentration. The laboratory findings of this thesys allowed to connect the seasonal and spatial distribution of the studied species with the environmental features of the Rio Agrio-Lake Caviahue system.
Cita tipo APA: Schultz, Sabina . (2016-03-30). Estudios ecofisiológicos en microalgas del sistema ácido Río Agrio-Lago Caviahue (provincia del Neuquén, Argentina). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6069_Schultz.pdf Cita tipo Chicago: Schultz, Sabina. "Estudios ecofisiológicos en microalgas del sistema ácido Río Agrio-Lago Caviahue (provincia del Neuquén, Argentina)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6069_Schultz.pdf |
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Salierno, Gabriel Leonardo. "Caracterización de equipos y medios multifásicos con métodos que emplean fuentes radiactivas" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los sistemas multifásicos se encuentran en una gran cantidad de operaciones y en la gran mayoría de los procesos de la industria química, donde es necesario contactar reactivos presentes en distintas fases. Ejemplos de ellos pueden ser los procesos de fermentación que requieren del aireado de una suspensión densa de aglomerados de biomasa o la producción de jugos, que requiere de la trituración de frutas de manera continua minimizando el contacto con aire, o el proceso Fisher-Tropsch, que produce combustibles líquidos a partir de gas natural por reacción catalítica en torres de lecho fluidizado gas-líquido-sólido. Un ejemplo de creciente impacto económico-social son los tratamientos de efluentes líquidos o gaseosos, que requieren lidiar con sistemas de composición y reología complejos. Para controlar, diseñar u optimizar un equipo a escala industrial o para contrastar resultados de simulación computacional de fluido dinámica o de dinámica granular, se requiere de información experimental del movimiento y la distribución de las fases presentes. La información que se utiliza para evaluar la performance y verificar modelos que describen el movimiento de las fases presentes en un reactor, vinculando la fluidodinámica del sistema con el transporte de materia y energía son los campos de velocidad de las fases presentes, parámetros de turbulencia, distribución de fases o patrón de flujo, tiempos de residencia y de mezclado. Los equipos industriales suelen ser de paredes opacas y, aún si se operara con paredes translúcidas, los mismos sistemas multifásicos tienen la característica de dispersar la luz intensamente. En consecuencia, las técnicas que explotan la interacción con la luz visible por parte del sistema poseen aplicaciones muy limitadas y resulta apropiado recurrir a técnicas que utilizan radiación de alta energía para obtener información sobre el comportamiento de las fases en sistemas multifásicos que contribuya a optimizar diseños y monitorear la operación de un equipo. El objetivo general de este trabajo es el estudio de la fluido dinámica de sistemas multifásicos en equipos de escala piloto, empleando técnicas no-invasivas basadas en el uso de métodos que utilizan la detección de radiación γ. En particular, se optimizó y utilizó la técnica conocida como Radioactive Particle Tracking (RPT) para caracterizar la fluidodinámica de columnas de burbujeo bifásicas y trifásicas y de un reactor slurry agitado. Además, se propuso una simplificación de la técnica de RPT que facilitaría su empleo en instalaciones industriales, comparándose la información extraíble. Abstract: Multiphase systems are found in a large number of operations and in most of the processes of the chemical industry where contact of reagents present in different phases is necessary. Examples of these processes are the aerated fermentation that requires a slurry of biomass agglomerates, or juice production, requiring crushing fruit continuously minimizing contact with air, or Fisher-Tropsch process, that produces liquid fuels from natural gas by gas-liquid-solid catalytic reaction fluidized beds. An example of growing economic and social impact are gaseous or liquid effluent treatments that deal with systems of complex composition and rheology. To control, design or optimize industrial scale of multiphase units, or for validation of computational fluid or granular dynamics simulations, experimental data of the motion and distribution of the phases present is required. The information used to assess the performance and verify models describing the motion of the phases present in a reactor are the velocity fields of the phases present, turbulence parameters, phases distribution, flow patterns, residence times and mixing times. Industrial equipments have usually opaque walls, and they were translucent, multiphase systems have the property of scattering light intensely. Consequently, techniques that exploit interaction of the system with visible light have very limited applications, high-energy radiation is more appropriate to use to obtain information about the behavior of the phases in multiphase systems with the aim to optimizing design and monitoring. The objective of this work is the study of fluid dynamics of multiphase pilot scale vessels, using and developing non-invasive techniques based on detecting γ radiation. Particularly, the technique known as Radioactive Particle Tracking (RPT) was used to characterize the fluid dynamics of two and three phase bubble columns and a slurry stirred tank. Moreover, a simplification of the RPT technique is proposed to promote its use in industrial installations, making a comparison of the arising information.
Cita tipo APA: Salierno, Gabriel Leonardo . (2016-03-30). Caracterización de equipos y medios multifásicos con métodos que emplean fuentes radiactivas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5951_Salierno.pdf Cita tipo Chicago: Salierno, Gabriel Leonardo. "Caracterización de equipos y medios multifásicos con métodos que emplean fuentes radiactivas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5951_Salierno.pdf |
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Piegari, Estefanía. "Interacción entre geometría y dinámica en la modulación de señales intracelulares de calcio" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las señales de Ca²⁺ son ubicuas y juegan un rol importante en numerosos procesos fisiológicos como la fertilización o la muerte celular. Su versatilidad se basa en la variedad de comportamientos espacio-temporales que puede mostrar la concentración de calcio intracelular y en que distintos comportamientos pueden inducir respuestas diferentes. La liberación de Ca²⁺ desde el retículo endoplasmático (RE) hacia el citosol a través de receptores de inositol 1,4,5-trifosfato (RIP3s) es una componente clave dentro de los mecanismos de señalización por Ca²⁺. Los RIP3s necesitan unir IP3 y Ca²⁺ para abrirse por lo que la liberación de Ca²⁺ a través de un único RIP3 puede inducir la apertura de otros canales vecinos, mecanismo que se conoce como liberación de calcio inducida por calcio o CICR por las siglas en inglés. Los RIP3s aparentemente se organizan en cúmulos sobre la membrana del RE (clusters). Si el CICR se encuentra limitado a un cluster, las señales pueden permanecer localizadas (puffs). En caso contrario, pueden convertirse en ondas que se propagan entre clusters. Los puffs son los ladrillos de construcción de esas señales más globales que se propagan por toda la célula. Por este motivo, existe un gran interés en la determinación de las propiedades de los puffs, especialmente en vista de la actual controversia sobre la distribución espacial de los RIP3s activables. Las señales de calcio, por otro lado, pueden remodelarse a través de varios mecanismos, entre ellos, el atrapado del Ca²⁺ por parte de buffers. Éstos no sólo disminuyen la concentración de Ca²⁺ libre sino que modifican su distribución espacio-temporal de distintos modos dependiendo de su cinética. Los puffs de Ca²⁺ se han observado en células intactas con técnicas ópticas mostrando que son intrínsecamente estocásticos. La obtención de una imagen correcta de la dinámica de los eventos entonces implica ser capaz de detectar todo el rango de tama~ nos de puffs. Éstos se observan usando indicadores de Ca²⁺ de una longitud de onda visible y buffers exógenos lentos (por ej; EGTA) para disrumpir el CICR entre clusters. Los indicadores de única longitud de onda aumentan su uorescencia al ligar calcio. De esta manera, generan imágenes que dependen fuertemente de su cinética, transporte y propiedades fotofísicas. Por este motivo, es de particular importancia determinar los artefactos que generan las condiciones del experimento. La propia existencia de los puffs depende de que los RIP3s están organizados en cúmulos. Una distribución uniforme de receptores debería dar lugar típicamente a señales propagantes tipo ondas. Los ovocitos de Xenopus laevis son un sistema experimental ventajoso para estudiar estas señales. Durante la fertilización se evoca una onda de Ca²⁺ que se propaga por toda la célula. La fertilización ocurre en el huevo maduro. Se ha observado que, al madurar el ovocito, su RE se configura y la distribución de los RIP3s parece ser más uniforme. Esto tiene un correlato en las características de las señales evocadas en los ovocitos maduros. En esta Tesis se combinaron experimentos, un análisis teórico y simulaciones numéricas para evaluar de qué modo la geometría de la distribución de canales se combina con alguno de los otros aspectos que in uyen sobre la distribución de calcio libre para determinar las características de las señales. El primer aporte fue introducir un método que permite establecer clases equivalentes de experimentos de obtención de imágenes realizados en condiciones diferentes, donde la clase está determinada por la relación señal-ruido que predice el método. Éste también puede utilizarse para estimar el tamaño de las señales más pequeñas que pueden observarse de manera confiable con cada arreglo y para generar imágenes de uorescencia numéricamente con ruido realista. Esta Tesis también contribuyó a estudiar si la presencia del indicador o del EGTA en distintas condiciones experimentales altera la dinámica intracelular de Ca²⁺, en particular, analizar si son capaces de detectar puffs de Ca²⁺ con similar precisión y de qué modo las distintas configuraciones experimentales afectan las propiedades de los puffs observados y la dinámica del Ca²⁺ subyacente. Se pudo determinar que aunque el indicador o el EGTA no alteran la dinámica intracluster del Ca²⁺, el conjunto de eventos observables del experimento es diferente dependiendo del grado de acoplamiento entre clusters. El estudio, por otro lado, permitió inferir que los puffs con mayor liberación de Ca²⁺ provienen de cúmulos donde los RIP3s están muy cerca unos de otros. Para estudiar en más detalle la disrupción del CICR entre clusters vecinos que inducen los buffers lentos, se realizaron experimentos utilizando simultáneamente dos indicadores de calcio de distinta cinética. Utilizando el método introducido pudimos confirmar nuestra conclusión previa sobre cómo se modifica el conjunto de eventos que se evoca en presencia de buffers lentos. Por otro lado, determinamos que la presencia de buffers rápidos da lugar a liberaciones de Ca²⁺ más prolongadas tal vez debido a que reducen el efecto inhibidor del Ca²⁺ sobre los RIP3s. En relación a la razón por la que los buffers lentos disrumpen el acoplamiento entre clusters pudimos concluir que su presencia disminuye el Ca²⁺ basal, aunque no tanto como para explicar la disrupción. El análisis de la diferente distribución espacio-temporal de los buffers lentos y rápidos parecería indicar la presencia de RIP3s en el espacio entre clusters que podrían ser "silenciados" por los buffers lentos evitando así la propagación de las señales entre cúmulos. Finalmente, en la Tesis se han mostrado también resultados preliminares de señales de calcio que se observan en células maduradas, cuyos cambios pueden explicarse en términos de una distribución espacial distinta de RIP3s. Abstract: Ca²⁺ signals are ubiquitous and play a relevant role in numerous physiological processes as fertilization or cell death. Their versatility relies on the variety of spatiotemporal behaviors that the intracellular calcium concentration can display and that different behaviors can induce different end responses. Ca²⁺ release from the endoplasmic reticulum (ER) into the cytosol through inositol 1,4,5-trisphosphate receptors (IP3Rs) is a key component of the Ca²⁺ signaling toolkit. IP3Rs need to bind IP3 and Ca²⁺ to become open an therefore. Therefore, Ca²⁺ released through one open IP3R can induce the opening of neighboring ones, a mechanism that is knwon as Calcium Induced Calcium Release (CICR). IP3Rs are apparently organized in clusters. The signals can remain localized (i.e., Ca²⁺ puffs) if CICR is limited to one cluster or become waves that propagate between clusters. Puffs are the building blocks of global signals that propagate throughout the cell. Thus, there is great interest in determining puff properties, especially in view of the current controversy on the spatial distribution of activatable IP3Rs. Moreover, calcium signals can be remodeled through various mechanisms, such as Ca²⁺ buffers. Buffers not only decrease the concentration of free Ca²⁺ but also modify its spatial and temporal distribution in different ways depending on their kinetics. Ca²⁺ puffs have been observed in intact cells using optical techniques showing that they are intrinsically stochastic. Obtaining a correct picture of their dynamics then entails being able to detect the whole range of puff sizes. Puffs are usually observed using visible single-wavelength dyes and slow exogenous buffers (e.g., EGTA) to disrupt intercluster CICR. Single-wavelength dyes increase their uorescence upon calcium binding producing images that are strongly dependent on their kinetic, transport and photophysical properties. Thus, determining the artifacts that the imaging setting introduces is particularly relevant. The very existence of puffs depends on the fact that IP3Rs are organized in clusters. A uniform distribution of receptors should typically lead to waves-like (propagating) signals. Xenopus laevis oocytes are an advantageous biological system to study these signals since Ca²⁺ release from the ER only occurs through IP3Rs. During fertilization a Ca²⁺ wave that propagates throughout the cell is evoked. Fertilization occurs in the mature egg. It has been observed that maturation of the oocyte induces a reorganization of the ER whereas IP3Rs seem to be distributed more uniformly on its membrane. This has its counterpart on the properties of the Ca²⁺ signals that are evoked in mature oocytes. In this Thesis we have combined experiments, theoretical analyses and numerical simulations to evaluate in which ways the geometry of the channel distributions interacts with the other aspects that affect the intracellular Ca²⁺ dynamics to determine the characteristics of the signals. The first contribution of this Thesis was to introduce a method that establishes equivalence classes of Ca²⁺ imaging experimental conditions, where the class is determined by the signal-to-noise ratio that is predicted by the method. The method can also be used to estimate the smallest signals that can reliably be observed with each experimental setting and to produce numerically generated Ca²⁺ images with realistic noise. The Thesis also contributed to study to what extent experiments performed with different dyes and/or alter the intracellular Ca²⁺ dynamics, in particular, if they are able to detect Ca²⁺ puffs with similar accuracy and in which ways the different experimental conditions affect the observed puff properties or the underlying dynamics of Ca²⁺ itself. We could determine that, although the dye or EGTA does not alter the intra-cluster dynamics, the set of observable events is different depending on the degree of inter-cluster coupling/uncoupling that is induced by the experimental conditions. An analysis of the observations allowed us to show that the events with the largest amounts of released Ca²⁺ came from clusters with densely packed active IP3Rs. To study in more detail the way in which slow buffers disrupt the inter-cluster CICR experiments were performed using two calcium dyes of different kinetics simultaneously. Applying the method introduced previously in the Thesis we could confirm our previous conclusion on how the set of events that is evoked is modified in the presence of slow buffers. We determined that the presence of fast buffers, on the other hand, results in longer periods of Ca²⁺ release perhaps because they reduce the inhibitory effect of Ca²⁺ on IP3Rs. With respect to the way in which the slow buffers disrupt the inter-cluster coupling we could conclude that their presence decreases basal Ca²⁺, although not enough to explain the disruption. The analysis of the different spatial and temporal distribution of Ca²⁺ bound to slow and fast buffers that is observed in the experiments seems to indicate that there are IP3Rs in the space between clusters that could be silenced by the slow buffers thus preventing the propagation of signals between clusters. Finally, in the Thesis we have also shown preliminary results on calcium signals observed in mature cells, whose changes can be explained in terms of a different spatial distribution of IP3Rs with respect to the case of immature oocytes.
Cita tipo APA: Piegari, Estefanía . (2016-03-30). Interacción entre geometría y dinámica en la modulación de señales intracelulares de calcio. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5977_Piegari.pdf Cita tipo Chicago: Piegari, Estefanía. "Interacción entre geometría y dinámica en la modulación de señales intracelulares de calcio". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5977_Piegari.pdf |
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Gómez Fernández, Francisco Roberto. "Estimación de movimiento en secuencias de imágenes RGB y RGB-D" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El movimiento es una característica fundamental para el procesamiento de video y sus posteriores aplicaciones. La estimación de movimiento en video es de gran utilidad para definir la correspondencia de puntos en una escena, calcular sus velocidades y así poder discriminar objetos, acciones, segmentar movimiento, etc. El objetivo de este trabajo es realizar un seguimiento preciso y una estimación de movimiento de un gran conjunto de puntos. Esto se conoce como estimación densa de movimiento. Para ello, se proponen dos líneas principales de estudio: modelos estadísticos de movimiento utilizando texturas dinámicas y el cálculo del flujo óptico minimizando la energía con graph cuts, en ambos casos considerando secuencias de imágenes RGB y RGB-D. El modelo de texturas dinámicas está muy bien condicionado para la segmentación de movimiento, y dentro de este contexto desarrollamos una aplicación con características novedosas: (i) proceso de aprendizaje desacoplado y (ii) algoritmos optimizados para trabajar en placas gráficas GPU (Graphic Process Unit). Además, el modelo ha sido extendido para contemplar secuencias de imágenes RGB-D, el cual no había sido estudiado hasta el momento, permitiéndonos identificar procesos visuales en 3D. Experimentos sobre la base de datos DynTex muestran resultados exitosos de performance y de clasificación para la mayoría de las casos. Luego, nuestros análisis sobre secuencias RGB-D revelan la viabilidad de este modelo para aplicaciones 3D. El problema de la estimación del flujo óptico (optical flow) fue abordado mediante la minimización de la energía del campo de vectores utilizando la técnica de graph cuts con una formulación novedosa de la energía. Ampliamos esta formulación para tener en cuenta la profundidad y así calcular el flujo de la escena (scene flow). Hasta donde sabemos, en la literatura, nunca se había utilizado graph cuts para estimar el scene flow. Los resultados obtenidos sobre el dataset Middlebury muestran que nuestros algoritmos son competitivos comparados con los presentes en el estado del arte y los mejores con en términos de error angular. Abstract: Motion is a fundamental cue for video processing and its further applications. Video motion estimation is very useful to find correspondences of points in a scene, computing their velocities, discriminate objects, actions, segment motion, etc. The aim of this work is to accurately track the motion of a large set of points in videos. This is known as dense motion estimation. To this end, two main lines of study were proposed: statistical models of motion using dynamic textures and optical flow calculation using graph cuts for energy minimization, considering in both cases sequences of RGB and RGB-D images. The dynamic textures model is well suited for motion segmentation, and in this context we develop an application with novel features: (i) a decoupled learning step (ii) GPU-translated algorithms optimized to work on GPU (Graphic Process Unit). Also, the model has been extended to process RGB-D sequences, which had not been studied so far, allowing us to identify visual processes in 3D. Experiments on the Dyntex dataset show successful results of performance and classification for most cases. Then our analysis of RGB-D sequences reveal the viability of this model for 3D applications. The problem of optical flow estimation was addressed by minimizing the energy of the vector field using the graph cuts method with a novel formulation of energy. We extend this formulation to take depth into account and thus estimate the Scene Flow. To the best of our knowledge, scene flow estimation using graph cuts has never been used in the literature. The results obtained on the Middlebury dataset show that our algorithms are competitive with the state of the art and the best performing in terms of angular error.
Cita tipo APA: Gómez Fernández, Francisco Roberto . (2016-03-30). Estimación de movimiento en secuencias de imágenes RGB y RGB-D. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5985_GomezFernandez.pdf Cita tipo Chicago: Gómez Fernández, Francisco Roberto. "Estimación de movimiento en secuencias de imágenes RGB y RGB-D". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5985_GomezFernandez.pdf |
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Delgadin, Tomás Horacio. "Respuesta del eje hormona de crecimiento (GH)/factor de crecimiento tipo insulina-I (IGF-I) a alteraciones en la ingesta en el pez cíclido Cichlasoma dimerus" (2016-03-30). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El eje hormona de crecimiento (GH)/ factor de crecimiento tipo insulina 1 (IGF-1) es clave en la regulación del crecimiento somático en los vertebrados. Existen dos tipos de receptores para GH (GHR1 y GHR2), aunque actualmente no hay consenso sobre su especificidad. Cichlasoma dimerus en un pez cíclido social capaz de crecer a una tasa elevada en condiciones de laboratorio, pero la regulación de su crecimiento aún no ha sido estudiada. Esta Tesis se propone evaluar el crecimiento somático y su relación con el eje GH/IGF-1 bajo condiciones de ayuno y realimentación. Para ello en una primera etapa se caracterizó a GHR2, ya que en esta especie no estaba descripto. Se obtuvo una secuencia parcial que incluye parte de la región extracelular, el dominio transmembrana y parte de la región intracelular. Cuatro semanas de ayuno resultaron en un arresto del crecimiento somático, un incremento de la expresión de GHR2 en hígado y músculo y una disminución de IGF-1 muscular, sin variaciones en GHR1 ni en IGF-2 en ambos tejidos. Tres semanas de realimentación restituyeron completamente el estado nutricional y condujeron a un estado de “crecimiento acelerado” asociado a un incremento en la eficiencia de conversión alimentaria (FCE) sin observarse hiperfagia. Además, se restablecieron los niveles de expresión de GHR2 e IGF-1 a valores controles. Interesantemente la expresión de GH se incrementó a los 3 días de realimentación. Estos resultados muestran que no sólo hay una recuperación rápida del estado nutricional debido a la realimentación tras el ayuno prolongado, sino que se verifica una fase de crecimiento compensatorio asociado a cambios en el eje GH/IGF-1. Esto resultados nos permiten tener un conocimiento a nivel molecular de los cambios asociados al ayuno-realimentación que puede tener implicancias al momento de diseñar estrategias de crecimiento en acuicultura. Abstract: Growth hormone (GH)/insulin-like growth factor 1 (IGF-1) axis is the key regulator of somatic growth in vertebrates. Two types of growth hormone receptors have been described in teleost fish (GHR1 and GHR2) although its specificity is under debate. Cichlasoma dimerus is a social cichlid fish capable of growing at high rates under laboratory conditions, but knowledge on somatic growth regulation is still unclear. The aim of this study was to evaluate the somatic growth and changes in the GH/IGF-I axis after 4 weeks of food deprivation and refeeding in C. dimerus. As a first step, we obtained a partial sequence of GHR2, consisting of a fragment of the extracellular domain, the transmembrane domain and a region of the intracellular domain. Fasting impaired body growth and increased liver and muscle GHR2 expression along with a reduction in muscle IGF-1 mRNA levels. Additionally, no changes were observed in liver IGF-1, muscle and liver GHR1 and IGF-2 expression. Three weeks of refeeding completely restored nutritional status of fish and led to a fast growing period during the first week associated with higher feed conversion efficiency values but surprisingly, with no hyperphagia. In addition, expression of GHR2 and IGF-1 was recovered to control levels after three days of refeeding. Interestingly, GH mRNA levels were increased at day 3 of refeeding. These results not only show a complete recovery of nutritional status of fish with refeeding but also demonstrate a compensatory growth period associated with alterations on the GH/IGF-1 axis. Taken together, these results allow us to get knowledge on molecular aspects related to fasting-refeeding in fish that may have implications on feeding manipulation in aquaculture.
Cita tipo APA: Delgadin, Tomás Horacio . (2016-03-30). Respuesta del eje hormona de crecimiento (GH)/factor de crecimiento tipo insulina-I (IGF-I) a alteraciones en la ingesta en el pez cíclido Cichlasoma dimerus. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5962_Delgadin.pdf Cita tipo Chicago: Delgadin, Tomás Horacio. "Respuesta del eje hormona de crecimiento (GH)/factor de crecimiento tipo insulina-I (IGF-I) a alteraciones en la ingesta en el pez cíclido Cichlasoma dimerus". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-30. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5962_Delgadin.pdf |
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Trombetta, Leonardo Giuliano. "Efectos cuánticos en modelos cosmológicos inflacionarios" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La expansión del universo durante la etapa in acionaria puede ser descripta en una primera aproximación con la métrica de De Sitter. El cálculo de las funciones de correlación cuánticas de los campos en esta geometría es importante para contrastar los modelos con las observaciones de precisión del fondo cósmico de microondas. En el caso de campos muy livianos comparados con la curvatura del espacio tiempo, estos cálculos estan plagados con efectos infrarrojos, los cuales podrían estar indicando una falla en la teoría de perturbaciones. En este sentido, algunos cálculos no perturbativos han mostrado que las interacciones generan una masa dinámica, que tiene el efecto de regular las posibles divergencias infrarrojas. En esta tesis se estudian algunos aspectos de la teoría cuántica de campos en De Sitter mediante diversos métodos no perturbativos, con el objetivo de comprender los efectos infrarrojos asociados a campos livianos o no masivos en el universo temprano. Por un lado se considera la Acción Efectiva de dos partículas Irreducible (2PIEA) en la aproximación de Hartree, que si bien es exacta en el límite de N grande para un modelo con simetría O(N), para un número finito de campos deja de ser completamente consistente. Para recuperar en parte algunas propiedades de la 2PIEA exacta, se deben imponen ciertas relaciones de consistencia en el proceso de renormalización, lo cual afecta las partes finitas de los contratérminos. Se ha prestado particular atención a este proceso, generalizándolo a espacios curvos para obtener las ecuaciones de evolución del valor medio del campo renormalizadas. Se estudió el potencial efectivo en la aproximación de Hartree, buscando las condiciones para la existencia de soluciones con ruptura espontánea de simetría. Resultados previos en la literatura muestran que estas soluciones no existen en el límite de N grande, así como tampoco para N finito con el esquema de renormalización usual. Por otro lado, adoptando la renormalización consistente, se encuentran soluciones con ruptura de simetría, cuya existencia sin embargo depende del punto de renormalización. Luego, se consideraron las ecuaciones de Einstein Semiclásicas en la aproximación de Hartree, renormalizándolas con el método consistente. Se buscaron soluciones autoconsistentes de éstas ecuaciones en combinación con las ecuaciones del campo, estudiando si el efecto de los campos sobre la curvatura puede generar o no una restauración de la simetría. En particular se encontraron soluciones donde los efectos cuánticos son los responsables de la expansión acelerada del universo, en ausencia de constante cosmológica. Estos resultados también dependen del punto de renormalización. Otro método no perturbativo muy poderoso proviene de formular la Teoría de Campos en el espacio De Sitter Euclídeo, el cual tiene la propiedad de ser compacto. Debido a esto, el campo admite una descomposición en modos discreta que pone en evidencia que las divergencias infrarrojas provienen de las contribuciones del modo constante, o modo cero. Es posible formular una teoría sin problemas infrarrojos tratando no perturbativamente al modo cero, y de manera perturbativa a los modos inhomogéneos. Las correcciones provenientes de éstos últimos son de orden superior en una expansión infrarroja. Consideramos la generalización de esta formulación a la teoría con simetría O(N), calculando la masa dinámica y el potencial efectivo. Esto permite realizar una comparación adecuada con los resultados provenientes de la 2PIEA donde el límite de N grande permite obtener resultados más confiables. Abstract: The expansion of the Universe during the inflationary stage can be described, as a first approximation, with the De Sitter metric. It is important to calculate quantum correlation functions of fields living in this geometry in order to compare the different models with the high-precision observations of the Cosmic Microwave Background. For light fields compared to the space-time curvature, these calculations are plagued by infrared effects, which might be an indication of the breakdown of perturbation theory. In this regard, some non-perturbative calculations have shown that a mass is dynamically generated by the interactions, effectively regulating the possible infrared divergences. In this thesis, we study some aspects of the Quantum Field Theory in De Sitter space by means of non-perturbative methods, with the goal of better understanding the infrared effects associated with light and massless fields in the early Universe. On the one hand, we considered the Two-Particle Irreductible Effective Action (2PIEA) in the Hartree approximation, which, although being exact in the large-N limit of a model with O(N) symmetry, in the case of a finite number of fields it is no longer fully consistent. In order to partially recover some properties of the exact 2PIEA, some consistency conditions must be imposed on the renormalization procedure, which in turn affects the finite parts of the counterterms. We focused on this process, generalizing it to curved backgrounds in order to find the renormalized evolution equation for the mean value of the field. We studied the Effective Potential, looking for the conditions for the existence of spontaneous-symmetry- breaking solutions. Previous results in the literature show that there are no such solutions in the large-N limit, as well as for finite N under the usual renormalization scheme. Nevertheless, we found that these solutions can exist when adopting the consistent renormalization scheme, although their existence is dependent on the renormalization point. Then we studied the Einstein Semiclassical Equations in the Hartree approximation with the consistent renormali- zation procedure. We looked for self-consistent solutions of these equations together with the field equations, studying whether the quantum effects over the space-time curvature can induce a symmetry restoration or not. In particular, we found some solutions where the quantum effects are solely responsible for the accelerated expansion of the Universe, without the presence of a Cosmological Constant. This results are also dependent on the renormalization point chosen. Another very powerful non-perturbative method comes from the formulation of the Quantum Field Theory in euclidean De Sitter space, which has the characteristic property of being compact. Due to this, the field has a discrete mode decomposition which allows to identify the contributions of the constant -or zero- mode, as the origin of the infrared divergences. It is then possible to formulate a theory with no infrared problems by treating the zero mode non-perturbatively, while dealing with the inhomogeneous modes perturbatively. The corrections coming from the latter are of higher order in an infrared expansion. We considered the generalization of this formulation to a model with O(N) symmetry, calculating the dynamical mass and the Effective Potential. This allows for a comparison with the results obtained with the 2PIEA, for which the large-N limit is needed for the results to be trusted.
Cita tipo APA: Trombetta, Leonardo Giuliano . (2016-03-29). Efectos cuánticos en modelos cosmológicos inflacionarios. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6048_Trombetta.pdf Cita tipo Chicago: Trombetta, Leonardo Giuliano. "Efectos cuánticos en modelos cosmológicos inflacionarios". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6048_Trombetta.pdf |
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Sica, Yanina Vanesa. "Cambios en el uso del suelo y sus efectos a diferentes escalas espaciales y temporales sobre la diversidad de aves en el Bajo Delta del río Paraná" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las actividades humanas han modificado una gran proporción de la superficie terrestre. Sus impactos son extensos en particular sobre la biodiversidad y los bienes y servicios que proveen los ecosistemas. Los humedales son uno de los ecosistemas más afectados por el cambio en el uso del suelo poniendo en riesgo su elevada biodiversidad y los numerosos bienes y servicios ecosistémicos que brindan. En Argentina, el Bajo Delta del Río Paraná es un extenso mosaico de humedales que sostiene una alta biodiversidad. Sin embargo, es una región de alta vulnerabilidad frente a procesos naturales y actividades humanas. En los últimos años el incremento en la actividad ganadera y forestal en la zona ha propiciado una intensificación de las prácticas de manejo de agua (terraplenes, diques y zanjas) que provocan el desecamiento de la vegetación palustre generando un proceso de pampeanización del humedal. Los cambios en el uso y las coberturas del suelo pueden generar cambios e impactos negativos en la biodiversidad. El objetivo de este trabajo fue evaluar el cambio en la diversidad de aves asociado al cambio en el uso del suelo. En primer lugar, se caracterizó el cambio en el uso y las coberturas del Bajo Delta en los últimos 14 años. Mediante imágenes satelitales Landsat 5 TM y 8 OLI se desarrollaron mapas de cobertura y uso del suelo para 1994/99 y 2013, y con árboles de regresión potenciados (BRT) se cuantificó la influencia de variables socioeconómicas, biofísicas y de manejo en la pérdida de humedales (cobertura de vegetación palustre). En segundo lugar, se identificaron los efectos del cambio en el paisaje sobre las aves utilizando dos aproximaciones: un análisis espacial de la riqueza de especies asociada a la estructura del paisaje actual resultante del proceso de pampeanización, y un análisis temporal de los cambios en la riqueza de especies asociados a los cambios en el paisaje en los últimos 14 años. Por un lado, se estudió la relación entre las aves y la composición y configuración del paisaje. Se muestrearon aves por censo de puntos cubriendo todas las coberturas y usos del suelo del Bajo Delta no insular y se cuantificó la influencia de la estructura del paisaje y usos en la riqueza y densidad de aves. Por otro lado, se evaluó la relación entre el cambio temporal en la comunidad de aves (1997-99 vs. 2011-12-13) y el cambio temporal en la composición del paisaje (1999 y 2013). A partir de un muestreo de aves por censo de puntos realizado en 1997 y 1999 en el Bajo Delta no insular, se remuestrearon los mismos puntos en 2011, 2012 y 2013 y se analizó el cambio temporal en la riqueza y composición de aves asociado al cambio en el uso y la cobertura del suelo. En sólo 14 años, un tercio de la cobertura de vegetación palustre del Bajo Delta se perdieron (163.000ha), el 70% de los mismos fueron convertidos en tierras ganaderas y el 20% en plantaciones forestales. Las variables que representan el uso del suelo resultaron los factores determinantes de la pérdida de vegetación palustre, en particular la densidad ganadera y el área endicada. Aunque la densidad de ganado no tiene un efecto negativo sobre la riqueza de aves, la homogeneización del paisaje (producto de la pampeanización del Bajo Delta no insular) caracterizada por una reducción de la cobertura de vegetación palustre y una expansión de la cobertura de pastizales, tuvo un efecto negativo sobre la riqueza total de aves y por gremio de hábitat. La comunidad de aves cambió de 1997/99 a 2011/13. La especies de humedal fueron las más afectadas especialmente si se comparan años húmedos, indicando un efecto importante tanto de la dinámica hidrológica natural como de los cambios en las coberturas del Bajo Delta no insular. A largo plazo, la comunidad de aves estaría controlada por la estructura del paisaje, aunque respondería débilmente a los cambios en la estructura del paisaje en sólo 14 años. En resumen, el proceso de pampeanización del Bajo Delta se ha extendido, convirtiendo grandes extensiones de vegetación palustre en pastizales secos aptos para la actividad ganadera. Las aves del Bajo Delta no insular responden a esta pampeanización con cambios en la composición de especies. Por ello, es urgente y necesaria la gestión sostenible de los humedales del Delta del río Paraná. Los resultados de este trabajo pueden ser insumos para el desarrollo de normativas nuevas y otras existentes que, de manera efectiva, desaceleren la pérdida de humedales en esta región tan importante no sólo por la alta biodiversidad que alberga sino por los bienes y servicios que brinda a la comunidad local y a los pobladores de la principal área urbana de Argentina. Abstract: Wetlands are among the most productive and diverse ecosystems on Earth. Land use changes that modify its original landscape are one of the main threats to global biodiversity. In Argentina, the Lower Delta of Paraná River is characterized by its high biodiversity due to its particular environmental heterogeneity. However, it is being extremely modified. Forestation and intensification of livestock have caused profound landscape alterations by converting the original land covers (freshwater marshes and rushes) into pastures. This conversion can affect biodiversity in the region, especially birds that rely on wetland habitat. This project aims to understand fist, the effects of land use changes on land covers and second, avian response to land use change to contribute to landscape management and avian conservation in the Lower Delta of Paraná River. First, we detected land use change in the Lower Delta of Paraná River with Landsat images from 1999 and 2013. Then, we analyzed the relationship between birds and landscape composition and configuration. Finally, we related land use changes with changes detected in the avian community from 1997-99 to 2011-12-13. We found that one third of the freshwater marshes of the Lower Delta were lost in only 14 years (163,000 ha). The majority (70%) of the losses were due to conversion to pastures and 20% due to conversion to forestry plantations. Cattle density, dammed area and accessibility were the most important factors determining freshwater marshes conversion. Avian richness responded negatively to landscape homogenization on the long term, characterized by a decrease in freshwater marshes and an increase in grasslands. The community differed from 1997-99 to 2011-12-13, wetlands species richness decreased, especially when comparing years of wet hydrological condition. However, the relationship between avian richness change and landscape change in the last 14 years was weak. In summary, freshwater marshes loss is widespread in the Lower Delta, it has eroded the avian community, and further habitat loss seems imminent. Conservation efforts should be focused in this vulnerable ecosystem before full-scale land conversion occurs. Our results show that cattle management intensification has profoundly changed the landscape structure of the Lower Delta of Paraná River with substantial wetlands loss, likely having deep negative impacts in birds and potentially other biodiversity groups and ecosystem services. As a consequence, these results can be used as inputs for the development of land use planning and natural resource management to ensure conservation of biodiversity and ecosystem services to benefit local communities.
Cita tipo APA: Sica, Yanina Vanesa . (2016-03-29). Cambios en el uso del suelo y sus efectos a diferentes escalas espaciales y temporales sobre la diversidad de aves en el Bajo Delta del río Paraná. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6020_Sica.pdf Cita tipo Chicago: Sica, Yanina Vanesa. "Cambios en el uso del suelo y sus efectos a diferentes escalas espaciales y temporales sobre la diversidad de aves en el Bajo Delta del río Paraná". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6020_Sica.pdf |
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Maenza, Reinaldo A.. "Análisis de la variabilidad espacio-temporal de la precipitación en el sur de Argentina central y los posibles forzantes del sistema acoplado atmósfera-océano en las escalas interanual a interdecadal" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La región Sur de Argentina Central (SAC) comprende el sur de las provincias de San Luis y de Córdoba, sudeste de la provincia de Mendoza, la provincia de La Pampa y oeste de la provincia de Buenos Aires, el noreste de la provincia de Neuquén y norte de la provincia de Río Negro. Es sabido que la provincia de La Pampa (en el centro de SAC) ha experimentado en las últimas décadas una progresiva mejora en las condiciones hídricas acompañada por una expansión del área cubierta por la actividad agropecuaria, la cual resulta altamente sensible a las variaciones climáticas bruscas, dado que el proceso no fue acompañado por una mejora en la infraestructura. En el presente trabajo se desarrolla un estudio de la variabilidad espacio-temporal de la precipitación estacional sobre la SAC a partir del análisis de diversas series de precipitación mensual, acumulada en temporadas, provenientes de diversos sitios de medición. Los resultados destacan una fase húmeda (de setiembre a abril) y una seca (de mayo a agosto). El análisis espacial denota la existencia de distintas subregiones con similar variabilidad temporal entre las series que las componen. Las series de índice, representativas de la precipitación estacional en las subregiones, resaltan la presenciade saltos significativos en la variable hidroclimática en torno a la década de 1970 y comienzos del presente milenio. La exploración de los forzantes del sistema climático indica que la precipitación estacional sobre cada subregión puede estar modula desde regiones remotas a través de ondas de Rossby cuasi-estacionarias, así como también por circulaciones regionales asociadas a la Celda de Hadley, ocasionando comportamientos anómalos en la disponibilidad de humedad sobre la SAC. Estas relaciones varían a lo largo del período de estudio. Abstract: The southern Central Argentina region (SCA) comprises the south of San Luis and Córdoba Provinces, southeast of Mendoza Province, the La Pampa Province and the west of Buenos Aires Province, the northeast of Neuquén Province and the northern portions of the Río Negro Province. It is known that the province of La Pampa (located in the core of SCA) has undergone a progressive improvement in water conditions in recent decades, accompanied by an expansion of the area covered by farming. The agriculture and livestock industry on the area is highly sensitive to abrupt climate changes, since the process has not been accompanied by improvement in infrastructure. In this paper a study of the spatial and temporal variability of seasonal rainfall on the SAC is performed trough analyzing various time series of monthly precipitation, accumulated into specific seasons, from diverse gauge stations. The results highlight two distinct seasons of phases for the annual precipitation: wet season (from September to April) and dry season (from May to August). The spatial analysis indicates the existence of distinct sub-regions with a similar temporal variability among the component time series. Representative seasonal precipitation indices in each sub-region highlight the presence of significant jumps in precipitation around the 1970s and the beginning of the present millennium. The examination of different climate system forcings indicates that seasonal rainfall over a sub-region can be modulated from remote regions trough quasi-stationary Rossby waves, as well as by regional circulations associated with the Hadley Cell, causing anomalous behavior in the availability of moisture over the SAC. These relationships vary throughout the period of analysis
Cita tipo APA: Maenza, Reinaldo A. . (2016-03-29). Análisis de la variabilidad espacio-temporal de la precipitación en el sur de Argentina central y los posibles forzantes del sistema acoplado atmósfera-océano en las escalas interanual a interdecadal. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5931_Maenza.pdf Cita tipo Chicago: Maenza, Reinaldo A.. "Análisis de la variabilidad espacio-temporal de la precipitación en el sur de Argentina central y los posibles forzantes del sistema acoplado atmósfera-océano en las escalas interanual a interdecadal". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5931_Maenza.pdf |
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Etchemendy, Pablo Esteban. "Estudio de la codificación de las características temporales del sonido mediante experimentos psicofísicos y modelado computacional de la periferia auditiva" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El sistema auditivo utiliza dos mecanismos fundamentales para la percepción de altura tonal. Uno de ellos (conocido como "tonotópico", "espectral" o "de lugar") se basa en la capacidad de separar frecuencias que posee la membrana basilar: la misma muestra un patrón de excitación con máxima amplitud en un determinado lugar, en función de la frecuencia del estímulo sonoro. El otro (conocido como "mecanismo temporal") se basa en la capacidad de las neuronas del nervio auditivo de generar potenciales de acción sinápticos sincronizados con la fase del estímulo sonoro ("enganche de fase"). Existe un debate abierto respecto a cuál mecanismo interviene en la percepción de altura tonal para diferentes estímulos y rangos de frecuencia. Para el caso de tonos modulados en frecuencia, típicos en el contexto musical (vibratos) y en ciertos lenguajes tonales como el chino mandarín, se sabe que la modulación en frecuencia introduce modulaciones en amplitud en la forma del patrón de excitación de la membrana basilar. Además, existen resultados perceptuales que pueden ser explicados en función del tiempo que la señal pasa en los extremos de la modulación. Estos resultados muestran que la información temporal participa en la percepción de la altura tonal y que el mecanismo que la procesa muestra cierta "inercia" o "lentitud" ("sluggishness" en inglés), que dificulta la detección de la frecuencia cuando la modulación es rápida. En este trabajo utilizamos dos metodologías para estudiar la codificación de la altura tonal. En la primera parte se describen experimentos de percepción de altura tonal realizados con tonos puros modulados en frecuencia (vibratos) con perfiles asimétricos. Además se realiza una revisión de una variedad de modelos aplicables a la percepción de altura tonal. Se incluyen modelos basados en la información espectral, en la temporal, modelos mixtos y modelos fenomenológicos propuestos específicamente para explicar resultados de experimentos con vibratos. Se comparan las predicciones de dichos modelos con los resultados de los experimentos realizados. Se incluye también una revisión de resultados previos de experimentos similares y una contrastación de dichos resultados con las predicciones de los modelos. En la segunda parte se estudiaron algunos mecanismos biológicos que son importantes para explicar la codificación de la información temporal en la periferia auditiva. Se describe un modelo biofísico realista de la sinapsis de cinta de las células ciliadas internas, las células responsables de la transducción de las vibraciones mecánicas de la membrana basilar a impulsos neuronales en los nervios auditivos. Dicha sinapsis se destaca por su baja latencia, lo cuál es un requisito necesario para poder conservar en forma fidedigna la información de fase. Analizamos los parámetros del modelo y estudiamos diferentes mecanismos propuestos en la literatura para explicar su baja latencia. Finalmente estudiamos la capacidad para el enganche de fase de dicho modelo, en particular para tonos modulados en frecuencia, para comprender de qué modo se ve afectada por la rapidez de la modulación y cómo puede in uir en la percepción de la altura. Abstract: The auditory system employs two main mechanisms for the perception of pitch. The first mechanism (known as "tonotopic", "spectral" or "rate-place") is based on the frequency selectivity present at the basilar membrane: as the stimulus frequency varies, the basilar membrane displays an excitation pattern whose point of maximum amplitude also varies. The second mechanism (known as "temporal") is based on the ability of the auditory nerve fibers to generate spikes in synchrony with the phase of the auditory stimulus ("phase-locking"). There is an ongoing debate about which mechanism is responsible for the perception of pitch for different stimuli and frequency ranges. In the case of frequency-modulated tones, present in music (vibratos) and in some tonal languages as Mandarin Chinese, the modulation of frequency introduces a modulation of amplitude in the shape of the excitation pattern on the basilar membrane. Also, there is perceptual evidence of an effect of the time that the signal spents at the extremes of the modulation profile on the perception of pitch. These evidence suggests that the temporal information is involved in the perception of pitch and that the underlying mechanism displays some degree of "sluggishness", difficulting the perception of pitch for rapid modulations. In these work we used two methodologies in order to study the codification of pitch. In the first part we describe psychoacoustical pitch perception experiments with asymmetrical frequency-modulated tones. The work includes a review of several diverse models proposed in the literature for the perception of pitch. The predictions of the models are compared with the results of the experiments and also with a review of recent experiments on the same subject. In the second part, we studied some biological mechanisms that are key to the codification of the temporal information at the auditory periphery. We describe a realistic biophysical model of the internal hair cell ribbon synapse, the structure responsible for the transduction of the oscillations on the basilar membrane into neural impulses at the auditory fibers. The ribbon synapse displays a very low latency, which is a requisite for ensuring a faithful transmission of the temporal information of the stimulus. We analyzed the parameters of the model and studied mechanisms proposed in the literature to explain this characteristic. Finally, we analyzed the phase-locking capability of the model, in particular for frequency-modulated tones, in order to understand the effect of the modulation in the synchronization and its influence on pitch perception.
Cita tipo APA: Etchemendy, Pablo Esteban . (2016-03-29). Estudio de la codificación de las características temporales del sonido mediante experimentos psicofísicos y modelado computacional de la periferia auditiva. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5954_Etchemendy.pdf Cita tipo Chicago: Etchemendy, Pablo Esteban. "Estudio de la codificación de las características temporales del sonido mediante experimentos psicofísicos y modelado computacional de la periferia auditiva". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5954_Etchemendy.pdf |
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Braz, Bárbara Yael. "Rol de la dopamina en la maduración postnatal del sistema córticoestriatal y conductas dependientes del mismo" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los ganglios de la base (BG) son núcleos subcorticales interconectados con la corteza cerebral que están involucrados en el control motor voluntario y distintos aspectos de la conducta y el aprendizaje. La dopamina es un regulador clave del flujo de información desde la corteza al estriado, el principal núcleo de entrada de los BG. Algunas de las alteraciones conductuales observadas en desórdenes neuropsiquiátricos tales como el síndrome de Tourette, el trastorno de déficit de atención con hiperactividad y el desorden obsesivo compulsivo, son atribuidas a alteraciones madurativas de los circuitos córticoestriatales y su modulación dopaminérgica. Sin embargo, poco se sabe acerca del desarrollo funcional de estos circuitos y del rol de la dopamina en este proceso. El objetivo general de esta tesis es estudiar los mecanismos postnatales de la maduración del sistema córticoestriatal y su conexión con la adquisición de conductas normales y patológicas. Nuestra hipótesis es que las neuronas dopaminérgicas son importantes durante el desarrollo postnatal para el desarrollo funcional y anatómico de la conectividad córticoestriatal, y que alteraciones en este proceso dan lugar a condiciones neuropsiquiátricas. En este trabajo encontramos que la lesión neonatal de neuronas dopaminérgicas ocasiona déficits duraderos en el balance entre la búsqueda de recursos, tanto nutricionales como sociales, y el aprovechamiento de los mismos. Estos déficits emergen temprano en el desarrollo y empeoran en la vida adulta, en particular aquellos relacionados a la exploración global de ambientes complejos. Por otro lado, estudios electrofisiológicos in vivo y reconstrucciones morfológicas de las neuronas de proyección estriatales revelaron alteraciones córticoestriatales asociadas al fenotipo comportamental. Más específicamente, en los animales con lesión neonatal de neuronas dopaminérgicas se observó una reducción de la conectividad funcional córticoestriatal que afecta las entradas provenientes de la corteza prelímbica más marcadamente que las provenientes de las corteza cingular y motora. La atenuación en la conectividad observada para los inputs prelímbicos es más marcada en el adulto lesionado respecto del juvenil, se relaciona con una mayor susceptibilidad por sufrir procesos de depresión sináptica córticoestriatal, y se asocia a una contracción del árbol dendrítico de las neuronas de proyección estriatales, sin cambios en la densidad de espinas dendríticas. En conjunto, estos resultados son consistentes con la idea de que las neuronas dopaminérgicas son esenciales durante el desarrollo postnatal para la maduración funcional y estructural del sistema córticoestriatal. Desde una perspectiva bottom-up, nuestros hallazgos sugieren que condiciones neuropsiquiátricas presumiblemente relacionadas a alteraciones dopaminérgicas tempranas podrían presentar alteraciones en el reclutamiento de los circuitos córticoestriatales durante tareas de exploración y sociales. Abstract: Basal Ganglia (BG) comprise multiple subcortical nuclei involved in voluntary motor control and several aspects of behavior and learning. Dopamine is a key regulator of cortical information flow through the striatum, which is the main input nucleus of the BG. Some of the behavioral alterations observed in neuropsychiatric disorders such as Tourette syndrome, Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD) and Obsessive Compulsive Disorder have been attributed to developmental alterations in dopaminergic and corticostriatal circuits function. However, little is known about the functional development of these circuits and dopamine involvement in it. The general aim of this thesis is to study corticostriatal postnatal maturation and its connection with the acquisition of normal and pathological behaviors. Our hypothesis is that dopaminergic neurons activity is important during infancy and adolescence for the functional and anatomical development of corticostriatal connectivity, and that alterations in this process may lead to neuropsychiatric conditions. We found that early postnatal dopaminergic lesions cause long-lasting deficits in exploitation of shelter, social and nutritional resources, and an imbalanced exploratory behavior, where non-directed local exploration is exacerbated while sophisticated search behaviors involving sequences of goal directed actions are degraded. Importantly, some behavioral deficits do not diminish after adolescence but instead worsen or mutate, particularly, those related to the exploration of wide and spatially complex environments. In vivo electrophysiological recordings and morphological reconstructions of striatal medium spiny neurons reveal corticostriatal alterations associated to the behavioral phenotype. More specifically, we found an attenuation of corticostriatal functional connectivity affecting medial prefrontal inputs more markedly than cingulate and motor inputs. The reduction of prefrontostriatal inputs is more marked in adult lesioned mice compared to juvenile mice, and is related to an increase of corticostriatal long term depression. Moreover, these changes are accompanied by a contraction of the dendritic arbor of striatal projection neurons without changes in spine density. Thus, dopaminergic neurons are essential during postnatal development for the functional and structural maturation of corticostriatal connections. From a bottom-up viewpoint of neuropsychiatric disease modelling, our findings suggest that neuropsychiatric conditions presumably linked to developmental alterations of the dopaminergic system should be evaluated for deficits in foraging decision making, alterations in the recruitment of corticostriatal circuits during foraging and social tasks, and structural disorganization of the frontostriatal connections.
Cita tipo APA: Braz, Bárbara Yael . (2016-03-29). Rol de la dopamina en la maduración postnatal del sistema córticoestriatal y conductas dependientes del mismo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6041_Braz.pdf Cita tipo Chicago: Braz, Bárbara Yael. "Rol de la dopamina en la maduración postnatal del sistema córticoestriatal y conductas dependientes del mismo". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6041_Braz.pdf |
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Abrey Recalde, María Jimena. "Interacción entre la respuesta trombótica y la respuesta inflamatoria en el Síndrome Urémico Hemolítico (SUH)" (2016-03-29). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El Síndrome Urémico Hemolítico (SUH), enfermedad caracterizada por anemia hemolítica, trombocitopenia y falla renal aguda, está asociado a infecciones enterohemorrágicas con Escherichia coli productores de toxina Shiga (Stx) (STEC). Si bien el daño endotelial, generado por Stx, ha sido reconocido como el principal evento que conduce al estado protrombótico en el SUH, existen otros mecanismos que todavía no han sido completamente identificados. La interacción entre la respuesta trombótica e inflamatoria ha sido recientemente reportada en diversas patologías y dada la importancia de ambas en el SUH, hipotetizamos que podría tener un rol destacable en su desarrollo. En efecto, nuestro objetivo fue evaluar los mecanismos de activación de la respuesta trombótica y su interacción con la respuesta inflamatoria en el SUH. Utilizando un modelo murino de SUH, detectamos que Stx2 indujo directa o indirectamente una marcada activación plaquetaria que contribuyó con la respuesta inflamatoria a través de la activación del sistema de complemento y la formación de complejos entre Plaquetas y leucocitos polimorfonucleares (PMN). Por otro lado, en un sistema in vitro, se vió que Stx2 indujo un daño endotelial que derivó en la activación y adhesión plaquetaria. Por último, en ambos modelos, se observó la capacidad del antioxidante N-acetil-L-Cisteína (NAC) de prevenir los efectos protrombóticos de Stx2. En conclusión, en esta tesis hemos descripto como Stx2, mediante el daño endotelial, activa la respuesta trombótica y como el estrés oxidativo contribuye a este proceso. Asimismo hemos probado la participación de las plaquetas en la activación de la respuesta inflamatoria. Finalmente, dados los efectos preventivos de la NAC proponemos su uso en la etapa prodrómica de la diarrea. Abstract: Hemolytic uremic syndrome (HUS) is a disease caracterized by hemolytic anemia, thrombocytopenia and acute kidney failure. HUS is associated with Shiga toxin (Stx) producing Escherichia coli (STEC) infections. While endothelial damage induced by Stx , has been recognized as the main event leading to the prothrombotic state in HUS, there are other mechanisms that have not yet been fully identified. The interaction between thrombotic and inflammatory response has been recently reported in various diseases, since both are important in HUS, we hypothesize that could have a prominent role in its development. In fact, our objective was to evaluate the activation mechanisms of thrombotic response and its interaction with the inflammatory response in HUS. Using a mouse model of HUS, we found that Stx2 directly or indirectly induced a marked platelet activation wich contribute to the inflammatory response through activation of the complement system and the formation of complexes between platelets and polymorphonuclear leukocytes (PMN). Moreover, in an in vitro system, it was found that Stx2 induced endothelial damage that led to the activation and platelet adhesion. Finally, we observed in both models, the ability of antioxidant drug N-acetyl-L-Cysteine (NAC) to prevent Stx2 prothrombotic effects. In conclusion, in this thesis we have described that Stx2 through endothelial damage, enhances the thrombotic response and the oxidative stress contributes to this process. We have also tested the involvement of platelets in activation of inflammatory response. Finally, given the preventive effects of NAC we propose its use in the prodromal stage of diarrhea.
Cita tipo APA: Abrey Recalde, María Jimena . (2016-03-29). Interacción entre la respuesta trombótica y la respuesta inflamatoria en el Síndrome Urémico Hemolítico (SUH). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6076_AbreyRecalde.pdf Cita tipo Chicago: Abrey Recalde, María Jimena. "Interacción entre la respuesta trombótica y la respuesta inflamatoria en el Síndrome Urémico Hemolítico (SUH)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-29. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6076_AbreyRecalde.pdf |
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Tobal, Jonathan Elías. "Estructura de los Andes Patagónicos Septentrionales entre los 41°30´ y los 42° 30´ S" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se presentan en esta tesis los resultados del estudio del sector andino de los Andes Patagónicos Septentrionales ubicados entre los 41º30´ y los 42º30´S, en las provincias de Río Negro y Chubut. La región estudiada no contaba, hasta el momento, con levantamientos geológicos detallados debido a la dificultad de acceso que presenta este sector de los Andes. El análisis estratigráfico y morfoestructural del área constituyen los ejes principales del trabajo de investigación realizado. Las imágenes satelitales disponibles, así como los datos gravimétricos y relevamientos magnéticos con los que se pudo contar, complementan la información disponible y contribuyen a dar solidez a las interpretaciones realizadas. Además, se llevaron a cabo análisis petrográficos, geoquímicos y radimétricos. El análisis estratigráfico ha permitido realizar una caracterización de las unidades volcánicas y plutónicas jurásico-cretácicas que resulta considerablemente más precisa que las descripciones preexistentes. En particular, se ha reconocido además la existencia de una unidad volcánica miocena, previamente desconocida, que aflora en el sector interno de los Andes entre los 41º 30´ y los 41º 50´S. El análisis morfoestructural revela, a escala local, el carácter sinextensional de estas rocas y, a escala regional, la existencia de un importante evento de extensión. Las precisas dataciones radimétricas (U-Pb LAICPMS en circones) que se presentan en esta tesis permiten asignar este evento al Mioceno Medio a Superior. El análisis morfoestructural realizado permite postular que la faja plegada y corrida desarrollada a estas latitudes estuvo sometida a condiciones de evolución singulares que no han sido reconocidas en otros segmentos andinos. A la etapa compresiva que se inició durante el Mioceno Inferior a Medio, y continuó desarrollándose al menos hasta el Mioceno Superior en la zona de antepaís, se sobreimpusieron fenómenos extensionales en el sector occidental interno, de modo que ambos fenómenos podrían incluso haber coexistido durante una parte del proceso de estructuración de los Andes. El análisis morfoestructural aporta, por lo tanto, datos valiosos que permiten evaluar, en un sentido más amplio, el desarrollo de la deformación en el tiempo y el espacio. Adicionalmente, se discuten una serie de indicios que podrían indicar la existencia de uno o más eventos de deformación desarrollados durante el Jurásico-Cretácico, que deberán ser investigados a futuro. Abstract: This thesis is focused on the study of the Andean sector of the North Patagonian Andes located between 41º30´ and 42º30´S, in Río Negro and Chubut provinces. This area is characterized by a difficult access, reason by which no previous detailed geological surveys were done. A stratigraphical and morphostructural analysis of the study area was done on the basis of field mapping and interpretation of satellite images. The interpretations presented in this thesis were also complemented with gravity and magnetic data, and also with petrographical, geochemical and geochronological analysis. The stratigraphical analysis allowed a precise characterization of the Jurassic-Cretaceous to Cenozoic volcanic and plutonic units. Additionally, a previously unknown, Miocene volcanic unit outcropping at the inner sector of the Andes, between 41º30´ and 41º50´S, was recognized. A morphostructural analysis reveals, at a local scale, the synextensional character of these rocks. The new radiometric ages presented in this work constrain this event to the middle to late Miocene. The morphostructural analysis allows us to postulate that the fold and thrust belt was subjected to unique conditions during its evolution, which are not recognized through other neighbor Andean segments. After the beginning of the compression in the late Miocene, and during its progression to the foreland zone, middle to late Miocene extensional phenomena occurred in the inner Andean sector. Additionally, morphostructural analysis provides valuable information in order to evaluate spatial and temporal development of the deformation. Finally, the existence of one or more deformational events acting in Jurassic-Cretaceous times is discussed.
Cita tipo APA: Tobal, Jonathan Elías . (2016-03-28). Estructura de los Andes Patagónicos Septentrionales entre los 41°30´ y los 42° 30´ S. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5987_Tobal.pdf Cita tipo Chicago: Tobal, Jonathan Elías. "Estructura de los Andes Patagónicos Septentrionales entre los 41°30´ y los 42° 30´ S". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5987_Tobal.pdf |
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Spano, Paula Mercedes. "Inferencia robusta en modelos no lineales con respuestas faltantes" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El modelo lineal es uno de los más populares en Estadística. Sin embargo, en muchas situaciones la naturaleza del fenómeno en estudio es intrínsicamente no lineal y por lo tanto, no se pueden utilizar aproximaciones lineales teniéndose que ajustar a los datos un modelo no lineal. Es bien sabido que, en este contexto, el estimador clásico del parámetro de regresión basado en mínimos cuadrados es muy sensible a los datos atípicos y por esta razón, se necesitan métodos robustos de inferencia. Asimismo, en algunas ocasiones, los datos están incompletos por haberse perdido algunas respuestas al azar. En esta tesis, proponemos una familia de estimadores robustos para estimar al parámetro de regresión en un modelo no lineal con posibles respuestas faltantes al azar. Bajo condiciones de regularidad, estudiamos la consistencia y la distribución asintótica de los estimadores propuestos, dando un tratamiento unificado a muestras completas y a muestras con respuestas faltantes. Para estudiar la robustez local, deducimos su función de influencia y para comparar su comportamiento con el del estimador clásico y con otras alternativas robustas, consideramos dos ejemplos numéricos. Llevamos a cabo simulaciones de Monte Carlo para estudiar el comportamiento en muestras finitas de los estimadores propuestos bajo distintos esquemas de pérdida de respuestas y en diferentes escenarios de contaminación. Por otro lado, introducimos una familia de tests robustos utilizando un estadístico de tipo Wald basado en el estimador propuesto con el objetivo de testear hipótesis que involucren al parámetro de regresión. Deducimos su distribución asintótica bajo la hipótesis nula, como también bajo alternativas contiguas. Asimismo, deducimos su función de influencia. Realizamos un estudio de simulación para evaluar el comportamiento de los tests propuestos. Finalmente, el procedimiento propuesto también se ilustra a través del análisis de un conjunto de datos reales. Abstract: The linear model is one of the most popular models in Statistics. However, in many situations the nature of the phenomenon is intrinsically nonlinear and so, linear approximations are not valid and the data must be fitted using a nonlinear model. It is well known that, in this setting, the classical estimator of the regression parameter, based on least squares, is very sensitive to outliers and for this reason, robust methods are needed. Besides, in some occasions the data are incomplete since some responses are missing at random. In this thesis, we propose a family of robust estimators to estimate the regression parameter in a nonlinear model with responses missing at random. Under mild conditions, we study the consistency and asymptotic distribution of the proposal, giving a unified treatment to incomplete and complete samples. To study local robustness, we derive their influence function and, to compare its behaviour with that of the classical estimator and other robust alternatives, we consider two numerical examples. We perform Monte Carlo simulations to study the finite sample behavior of the proposed estimators under different schemes of missing responses and different scenarios of contaminations. On the other hand, we introduce a family of robust tests using a Wald–type statistic based on the proposed estimators in order to check hypotheses that involve the regression parameter. We derive their asymptotic distribution under the null hypothesis as well as under contiguous alternatives. Besides, we derive their influence function. We perform a simulation study to evaluate the behaviour of the proposed test. Finally, the proposed procedure is also illustrated analysing a real data set.
Cita tipo APA: Spano, Paula Mercedes . (2016-03-28). Inferencia robusta en modelos no lineales con respuestas faltantes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5991_Spano.pdf Cita tipo Chicago: Spano, Paula Mercedes. "Inferencia robusta en modelos no lineales con respuestas faltantes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5991_Spano.pdf |
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Losada, Marcelo Adrián. "El formalismo de contextos generalizados y sus aplicaciones" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En este trabajo se presenta un enfoque de historias cuánticas, alternativo a la teoría de Historias Consistentes, denominado formalismo de Contextos Generalizados y se demuestra que es adecuado para definir probabilidades a expresiones que involucran propiedades a distintos tiempos. Además se analizan las relaciones existentes entre estos dos formalismos y se prueba que cuando la condición de consistencia de Historias Consistentes se impone para todo estado, se obtiene la condición de compatibilidad del formalismo de Contextos Generalizados. En este caso se demuestra que ambos formalismos son equivalentes para describir propiedades a distintos tiempos. También se discute el problema de las retrodicciones de propiedades contrarias en ambos formalismos de historias cuánticas. Se muestra que en el caso de las Historias Consistentes es posible la retrodiccón de propiedades contrarias, mientras que en el formalismo de Contextos Generalizados esto no es posible. Por último, se presentan algunas aplicaciones del formalismo de Contextos Generalizados a situaciones físicas: el proceso de medición, el experimento de la doble rendija y el proceso de decaimiento. Abstract: We develop a quantum history approach, alternative to the theory of Consistent Histories, called formalism of Generalized Contexts and we prove that it is suitable to define probabilities of expressions involving properties at different times. We also analyze the relationships between these two formalisms and we show that when the consistency condition of Consistent Histories theory is imposed for all states, the compatibility condition of the formalism of Generalized Contexts is obtained. In this case we obtain that both formalism are equally useful to describe properties at different times. Furthermore, we discuss the retrodiction of contrary properties in both quantum histories formalisms. We show that in the Consistent Histories formulation it is possible to retrodict contrary properties, while in the formalism of Generalized Contexts this is not possible. Finally, we apply the formalism of Generalized Contexts to some physical situations: the measurement process, the double-slit experiment and the decay process.
Cita tipo APA: Losada, Marcelo Adrián . (2016-03-28). El formalismo de contextos generalizados y sus aplicaciones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5995_Losada.pdf Cita tipo Chicago: Losada, Marcelo Adrián. "El formalismo de contextos generalizados y sus aplicaciones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5995_Losada.pdf |
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Gálvez, Ramiro Heraclio. "Predicción de los rendimientos de acciones en Argentina en base a indicadores técnicos y al modelado de tópicos en foros bursátiles" (2016-03-28). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Entender fenómenos sociales utilizando datos provenientes de la interacción de personas en plataformas online es un área de estudio que cobra cada vez mayor relevancia. En el presente trabajo se utilizan técnicas de procesamiento del lenguaje natural y de aprendizaje automático para analizar si, sobre la base información obtenida de posts de un popular foro bursátil online de Argentina, se puede extraer información que contenga poder predictivo sobre el retorno diario futuro de un grupo de acciones. En concreto, para un conjunto de acciones, se procesan y normalizan los posts diarios que pertenecen al tema de cada acción, utilizando el modelo de bolsa de palabras para representar los posts de cada acción. Luego se lleva adelante un proceso de reducción de dimensionalidad (descomposición truncada en valores singulares). Como resultado de este proceso se obtiene una serie de atributos que, se presume, tienen contenido semántico y pueden ser asociados a tópicos que se debaten en los foros. Una vez hecho esto, se intenta responder dos preguntas. Primero, ¿tienen estos tópicos información predictiva referida al retorno futuro diario de una acción? Segundo, de haber información predictiva, ¿es la misma novedosa, o simplemente es otra forma de obtener información que ya se encontraba presente en el comportamiento pasado de los precios de una acción, y que podría ser captada simplemente analizando indicadores técnicos? Los resultados obtenidos son alentadores, pues parecen indicar que efectivamente los tópicos contienen información con valor predictivo y que la misma estaría complementando información contenida en el precio pasado de las acciones. Un resultado adicional interesante es que los tópicos detectados parecieran captar idiosincrasias de carácter político y económico que com´unmente se asocian a las empresas que la acción estudiada representa.
Cita tipo APA: Gálvez, Ramiro Heraclio . (2016-03-28). Predicción de los rendimientos de acciones en Argentina en base a indicadores técnicos y al modelado de tópicos en foros bursátiles. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6103_Galvez.pdf Cita tipo Chicago: Gálvez, Ramiro Heraclio. "Predicción de los rendimientos de acciones en Argentina en base a indicadores técnicos y al modelado de tópicos en foros bursátiles". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6103_Galvez.pdf |
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Díaz Bessone, María Inés. "Efecto de la sobreexpresión de distintas isoformas de la Proteína Quinasa C (PKC) en la modulación del fenotipo maligno de células mamarias epiteliales. Alteración en la sensibilidad al tratamiento con retinoides" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El cáncer de mama representa actualmente el tipo de cáncer más frecuente en mujeres y se calcula que más de un millón de nuevos casos son diagnosticados por año en todo el mundo. Se trata de una enfermedad compleja, que presenta una variedad de subgrupos con características histopatológicas y genéticas diferentes y por lo tanto con diversas respuestas a los tratamientos. De las múltiples vías de señalización comprometidas en la progresión maligna, algunas constituyen prometedores blancos de intervención terapéutica, entre ellas la vía de la proteína quinasa C (PKC), implicada en eventos celulares como proliferación, diferenciación y apoptosis y el sistema retinoideo ampliamente involucrado en diferenciación celular. Dado que los distintos carcinomas mamarios presentan una expresión diferencial de las isoformas de PKC, desarrollamos modelos celulares mamarios (humanos y murinos) que sobreexpresan las isoformas α o δ de PKC. Utilizando estos modelos estudiamos de qué manera la sobreexpresión de PKCα o PKCδ afecta parámetros celulares implicados en la progresión tumoral y diseminación metastásica evaluando al mismo tiempo la respuesta al tratamiento con retinoides (ATRA). Nuestros resultados sugieren que la sobreexpresión de PKCα torna a las células más sensibles a la acción del ácido retinoico, en líneas respondedoras, mediante un arresto en la fase G0/G1 del ciclo celular. La sobreexpresión de PKCδ, en las células MDA-MB231, confirió un fenotipo menos agresivo, disminuyendo significativamente su capacidad invasiva. Por último la falta de respuesta de esta línea celular al ATRA, se debería a la incapacidad de trans-reprimir los sitios AP-1. Abstract: Breast cancer represents the most common kind of cancer in women and it is estimated that more than one million new cases are diagnosed each year worldwide. It is a complex disease, which presents a variety of subgroups with different genetic and histopathologic features and therefore with different responses to treatments. Multiple signaling pathways are involved in malignant progression. Some of them are promising targets for therapeutic intervention, including protein kinase C (PKC), involved in cellular events such as proliferation, differentiation and apoptosis and the retinoid system, widely implicated in cell differentiation. Since different mammary malignancies exhibit differential expression of PKC isoforms, we have developed (human and murine) mammary cell models overexpressing α or δ PKC isoforms. Using these models we studied how PKCα or PKCδ alters cell parameters associated with tumor progression and metastatic dissemination while we assessed the response to treatment with retinoids (ATRA). Our results suggest that PKCα overexpression confers to the cells a retinoic acid-sensitive phenotype, through an arrest in the G0 / G1 phase of the cell cycle. Overexpression of PKCδ, in MDA-MB231 cells, induced a less aggressive phenotype, significantly reducing its invasive capability. Finally the lack of response of this cell line to ATRA treatment could be due to the inability to trans-repress AP-1 sites.
Cita tipo APA: Díaz Bessone, María Inés . (2016-03-28). Efecto de la sobreexpresión de distintas isoformas de la Proteína Quinasa C (PKC) en la modulación del fenotipo maligno de células mamarias epiteliales. Alteración en la sensibilidad al tratamiento con retinoides. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6034_DiazBessone.pdf Cita tipo Chicago: Díaz Bessone, María Inés. "Efecto de la sobreexpresión de distintas isoformas de la Proteína Quinasa C (PKC) en la modulación del fenotipo maligno de células mamarias epiteliales. Alteración en la sensibilidad al tratamiento con retinoides". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6034_DiazBessone.pdf |
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Davies Sala, Carol G.. "Desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas: silenciamiento de genes bacterianos mediante tecnología antisentido" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La emergencia de enfermedades infecciosas causadas por bacterias multiresistentes y la falta de antibióticos para su tratamiento constituyen una amenaza para la salud global. Ante la necesidad de desarrollo de nuevos antimicrobianos se ha considerado la posibilidad de emplear técnicas de silenciamiento génico mediado por ARNs antisentido. Una de estas estrategias de silenciamiento es la denominada tecnología EGS, que se encuentra mediada por la Ribozima P o ARNasa P, una ribozima presente en todos los dominios y que en bacterias Gram negativas está conformada por una subunidad ARN-catalítica y por otra proteica. La ARNasa P participa en la maduración de los ARN de transferencia generando el extremo 5´ maduro por un corte simple endonucleolítico de su precursor. Esta propiedad puede emplearse para mediar el corte de una molécula de ARN blanco - cuya expresión quiera ser silenciada- en presencia de un oligorribonucleótido complementario, conocido como External Guide Sequence (EGS). Una vez formado el dúplex ARN blanco : EGS, este complejo puede ser reconocido por la ARNasa P como sustrato y entonces promover el corte endonucleolítico del ARN blanco, inactivándolo. El objetivo global en el que se enmarca este trabajo de tesis consiste en evaluar estrategias de silenciamiento génico mediante tecnología antisentido como posibles antimicrobianos o para prolongar el uso de los antibióticos ya existentes. En este trabajo de tesis doctoral se exploró la posibilidad de inhibir la expresión de genes bacterianos a través del uso de tecnología EGS antisentido. Inicialmente se trabajó con cepas de Escherichia coli y como blanco se eligió al ARN mensajero del gen ftsZ cuyo producto, la proteína FtsZ es un análogo bacteriano de la tubulina y esencial para la división celular. Tanto la expresión de estos pequeños ARNs antisentido dirigidos contra el mensajero ftsZ como la administración exógena de análogos de ácidos nucleicos no hidrolizables por nucleasas bacterianas, generaron una inhibición de la división celular, originando un cambio en la morfología de las bacterias y una disminución de la viabilidad de las células tratadas. Estos resultados apoyan la idea que los EGSs dirigidos contra genes vitales bacterianos podrían considerarse como potenciales antimicrobianos. Con la intención de explorar la aplicación de esta tecnología de silenciamiento génico a una especie bacteriana de importancia clínica creciente, se logró identificar, clonar, transcribir y purificar los componentes de la ribozima P de Acinetobacter baumannii. Posteriormente, la ribozima se reconstituyó in vitro, presentando actividad tanto en presencia de un sustrato natural (pre-ARNtTyr) como de un sustrato bimolecular compuesto por una dupla ARNm-EGS. De esta manera, se generó un sistema de evaluación in vitro de EGSs candidatos para Acinetobacter baumannii, paso previo a la realización de ensayos in vivo sobre esta especie bacteriana. Abstract: The emergence of infectious diseases caused by multi-resistant bacteria and the lack of traditional antibiotics for its treatment are a concerning threat for global health. Facing the need for development of new antimicrobials, gene silencing through antisense RNAs have been considered as a viable solution. One of these antisense strategies is called EGS technology which is mediated by ribozyme P or RNase P, a ribozyme present in all domains of life that in Gram negative bacteria is composed of two subunits: one catalytic – RNA and another peptidic. The RNase P processes pre-transfer RNA, maturating the 5´end by a simple endonucleolitic cut of its precursor. This property can be used to cut any other target RNA molecule in the presence of a complementary oligoribonucleotide, known as External Guide Sequence (EGS). Once the duplex target-RNA: EGS is formed can be recognized by the ribozyme P as a substrate and hence cut the RNA target, leading to its inactivation. The general purpose in which this thesis work is immersed consists on the evaluation of different gene silencing strategies through antisense technology and their use as possible antimicrobial agents or to extend the usage of already existent antibiotics. In this thesis work the possibility of inhibiting bacterial gene expression through EGS antisense technology was explored. Initially, strains of Escherichia coli were employed and ftsZ mRNA was selected as target. FtsZ protein is a bacterial tubulin analogue essential for cell division. Expression of RNA-EGSs targeting ftsZ mRNA as well as exogenous administration of EGSs composed of nucleic acid analogues non hydrolysable by bacterial nucleases, led to a change in bacterial morphology and a decrease in cell viability, elicited by an impaired cell division. These results support the idea that EGSs targeting bacterial vital genes could be considered as potential antimicrobial agents. Pursuing the intention to apply this gene silencing technology to a bacterial species with growing clinical importance, the components of the ribozyme P from Acinetobacter baumannii were identified, cloned, transcribed and purified. Then, the RNase was reconstituted in vitro, showing activity in the presence of a natural substrate such as pre-tRNATyr and also with a bimolecular substrate conformed by mRNA and EGS. Thereby an in vitro evaluation system was generated in order to select candidate EGSs for Acinetobacter baumannii, previous procedure to in vivo assays.
Cita tipo APA: Davies Sala, Carol G. . (2016-03-28). Desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas: silenciamiento de genes bacterianos mediante tecnología antisentido. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5940_DaviesSala.pdf Cita tipo Chicago: Davies Sala, Carol G.. "Desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas: silenciamiento de genes bacterianos mediante tecnología antisentido". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5940_DaviesSala.pdf |
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Cabrera, Juan Manuel. "Relación entre materia orgánica, hierro, aluminio y manganeso y las algas acidófilas del Lago Caviahue, Neuquén, Argentina" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se estudio la distribución de hierro y de metales traza, como: Cu, Cr, Pb o Zn, en los sedimentos del lago ácido Caviahue, y se encontró que esta es distinta de la hallada para ambientes neutros o alcalinos, siendo los ácidos húmicos la fase más rica, seguidos de la pirita. Además se modeló la concentración de hierro en la columna de agua. El modelo reflejó precisamente la concentración del lago excepto en los períodos en que la carga de este metal estuvo por encima del promedio anual, en cuyo caso, las predicciones fueron superiores. Entendiendo que si el modelo es estrictamente físico, el exceso de hierro debería verse reflejado en la concentración. A partir de este dato, se propuso que el exceso de hierro precipita y que existe un sistema buffer. Luego se estudiaron los ácidos húmicos sedimentarios. Se determinó su origen exclusivamente fitoplanctónico, siendo la única característica distintiva, un aumento en el contenido de azufre. Además se estimaron las constantes de complejación del ácido húmico por hierro y los metales estudiados previamente. Se encontró que la afinidad por los trivalentes es mayor que por los divalentes. Además se estudió la tolerancia del alga acidófila del lago a los metales mayoritarios, Fe, Mn y Al con distintas fuentes orgánicas. El aluminio resulta tóxico en presencia de cualquier fuente orgánica mientras que el hierro es letal en presencia de ácidos fúlvicos. Además, el manganeso estimula el crecimiento. Luego, se estudió la composición de la pared celular. Se encontraron diferencias entre la composición de la pared amorfa y fibrilar, presentando cada una, los monosacáridos característicos. Finalmente se estudió la adsorción de estos metales y fósforo. Solo este último y el hierro presentaron adsorciones significativas a la pared. Palabras clave: Distribución de hierro, modelado de hierro, complejos metal-húmicos, tolerancia de algas a metales y adsorción de metales a paredes celulares. Abstract: The distribution of iron and trace metals, such as: copper, chromium, lead or zinc, in the sediments of the acidic lake Caviahue. It was found that the distribution is different compared with neutral or alkaline environments, being the humic acids the richest phase, followed by pyrite. Moreover, iron concentration in the water column was modeled and it was found that when above-average loadings occur, the model fails on the prediction. It was proposed that the excess iron precipitates and the existence of an iron buffer system. Furthermore, sedimentary humic acids were also studied, its origin was determined to be phytoplanktonic and the only distinctive characteristic was higher levels of sulfur in their structure. Finally, Stability constants were calculated for iron and all the metals studied on the sediments. Higher constants were found for trivalent than for divalent metals. Besides, the tolerance of the acidophilic algae from the lake to the mayor metals, Fe, Mn and Al with different sources of organic matter was investigated. It was found that aluminum is toxic complexed with any organic matter while iron is lethal only with humic acids. Manganese enhance growth only with organic quelators. Lately, the cell wall composition was addressed. Differences between the labile and fibrillar wall matrices were found, each of them with characteristic monosaccharides. Lastly, adsorption of phosphorus and the three metals was determined. Only phosphorus and iron were shown to be significantly adsorbed. Keywords: Iron distribution, iron modeling, humic-metal complexes, metal tolerance by algae and metal adsorption by cell walls
Cita tipo APA: Cabrera, Juan Manuel . (2016-03-28). Relación entre materia orgánica, hierro, aluminio y manganeso y las algas acidófilas del Lago Caviahue, Neuquén, Argentina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5941_Cabrera.pdf Cita tipo Chicago: Cabrera, Juan Manuel. "Relación entre materia orgánica, hierro, aluminio y manganeso y las algas acidófilas del Lago Caviahue, Neuquén, Argentina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5941_Cabrera.pdf |
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Bianchi, Micaela. "Mecanotransducción celular. Correlación entre las propiedades mecánicas y la organización-dinámica de proteínas de adhesión focal en células vivas" (2016-03-28). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las células pueden detectar, generar y responder a un amplio rango de señales externas, químicas y físicas, integrar y analizar esta información y, en consecuencia, cambiar su morfología, dinámica, comportamiento y, eventualmente, destino. A nivel celular, las respuestas biológicas a fuerzas externas se originan en dos tipos de estructuras especializadas: adhesiones focales (célula-matriz extracelular) y uniones adherentes (célula-célula). Las adhesiones focales son complejos de proteínas dispuestos en ensamblados multi-moleculares que unen la matriz extracelular, a través de receptores integrales de membrana, a componentes del citoesqueleto. Estos sitios de adhesión son estructuras planas, alargadas de unos pocos micrones cuadrados que a menudo están localizadas en la periferia de las células, y que además funcionarían como organelas de señalización en el proceso de mecanotransducción celular. Uno de los retos que se presenta para estudiar el sistema es el de poder integrar y combinar distintas técnicas que nos permitan analizar la dinámica intracelular, la biomecánica de la célula/sustrato, detección de las fuerzas generadas en/por la célula, y observar la respuesta global de la célula en las distintas condiciones. Entonces, el estudio de la estructura, mecánica y dinámica de las proteínas de adhesiones focales en respuesta a un estímulo mecánico en células vivas requiere de técnicas que permitan visualizar y caracterizar en forma integrada la dinámica de eventos localizados en la célula. Estos métodos deben contar con una resolución espacio-temporal alta, de forma tal que permitan detectar eventos transientes y altamente localizados. En este contexto, se han implementado, en este trabajo de Tesis, distintas microscopías y espectroscopías de alta resolución espacial y temporal, en combinación con técnicas de biología molecular y celular. Con el objetivo de caracterizar las propiedades mecánicas de sustratos y células, en una primera etapa se implementó un modo de operación avanzado en microscopía de fuerza atómica (AFM), denominado PF-QNM (del inglés, Peak Force Quantitative Nanomechanical Property Mapping). Este modo permite obtener simultáneamente la imagen de topografía, junto con los mapas cuantitativos sobre las propiedades de elasticidad, adhesión, dureza, disipación de energía y deformación superficial. Se utilizaron sistemas modelo con distintas propiedades mecánicas de manera tal de cubrir el amplio rango que va desde GPa a kPa, y estudiar las propiedades de sustratos (vidrio, membranas de silicona y geles de poliacrilamina), así también como la línea celular utilizada en la Tesis. A nivel de adhesión focal, la estrategia fue transfectar células de epitelio mamario de ratón (HC11), con proteínas componentes de la adhesión (por ejemplo, zixina, FAK, vinculina, paxilina) fusionadas a proteínas fluorescentes visibles. De esta forma, empleando microscopías y espectroscopías de fluorescencia, es posible visualizar la expresión de las proteínas, registrar su localización y evolución en el tiempo y, mediante diferentes análisis, extraer información cuantitativa de dinámica, cinética y organización de los complejos de adhesión focal. El análisis de la dinámica y difusión de los complejos de adhesión focal y sus interacciones, fueron realizados mediante la espectroscopía por correlación de fluorescencia (FCS). Se caracterizaron los coeficientes efectivos de difusión de las proteínas mencionadas. El análisis de la correlación cruzada de las fluctuaciones de fluorescencia de pares de proteínas de adhesión focal (FCCS) permitió evidenciar la interacción entre distintas proteínas adhesivas de la adhesión focal. La cinética de disociación de proteínas desde la adhesión focal fue evaluada mediante la recuperación de la fluorescencia luego del fotoblanqueo (FRAP) en diferentes condiciones. Para estudiar los cambios generados en la organización y dinámica de adhesiones focales en células vivas en respuesta a un estímulo mecánico externo global, se empleó un dispositivo de tracción equibiaxial adaptado para ser usado en simultáneo con el microscopio confocal FV1000. La tensión mecánica aplicada por el dispositivo de tracción es capaz de inducir cambios en el área de las células vivas al igual que en las adhesiones focales. En respuesta al estiramiento mecánico se observó un mayor reclutamiento y translocación de la proteína zixina acompañado de una disminución significativa de su constante de disociación. Con el fin de correlacionar las propiedades mecánicas del sustrato y la fuerza de tracción generada por la célula a nivel de las adhesiones focales, sin perder de vista la organización y dinámica de las proteínas en la adhesión focal, se implementó la Microscopía de Fuerzas de Tracción (TFM). Esta técnica posee la sensibilidad necesaria para medir la fuerza de tracción generada por la célula sobre un sustrato elástico y transparente, la cual se puede combinar con otras técnicas de microscopía de fluorescencia como FRAP o FCS. El análisis de los datos TFM para la proteína zixina permitió obtener los mapas de deformación y de fuerzas de tracción, a la vez que se evaluó la cinética de disociación mediante FRAP. Abstract: Cells can detect, generate and respond to a wide range of external, chemical and physical signals, integrate and analyze this information and, consequently, change their morphology, dynamics, behavior and, eventually, their fate. At the cellular level, biological responses to external forces are originated from two types of specialized structures: focal adhesions (cell-extracellular matrix) and adherens junctions (cell-cell). Focal adhesions are protein complexes arranged in multi-molecular assemblies that bind extracellular matrix, through integral membrane receptors, to cytoskeletal components. These adhesion sites are flat, elongated and few square microns which are often located in the periphery of the cells, and also function as signaling organelles in the cellular mechanotransduction process. One of the challenges presented to study the system is to be able to integrate and combine different techniques that allow us to analyze the intracellular dynamics, biomechanics of the cell/substrate, detection of the forces generated in/by the cell, and observing the global response of the cell in different conditions. Thus, the study of the structure, mechanics and dynamics of focal adhesion proteins in response to a mechanical stimulus in living cells requires to visualize and characterize in an integrated way the dynamics of events located in the cell. These methods must have a high spatial and temporal resolution, so as to detect transients and highly localized events. In this context, they have been implemented in this thesis, different microscopies and spectroscopies with high spatial and temporal resolution, combined with the techniques of molecular and cell biology. In order to characterize the mechanical properties of substrates and cells, in a first step, an advanced mode operation was implemented in atomic force microscopy (AFM), called PF- QNM (Peak Force Quantitative nanomechanical Property Mapping). This mode allows simultaneously obtaining the topography, together with quantitative maps of the properties such as elasticity, adhesion, hardness, energy dissipation and surface deformation. Various systems were used with different mechanical properties so as to cover the wide range from GPa to kPa, and study the properties of substrates (glass, silicone membranes and polyacrylamide gels), as well as the cell line used in the Thesis. At focal adhesion level, the strategy was to transfect mouse mammary epithelial cells (HC11), with adhesion proteins (eg zixina, FAK, vinculin, paxillin) fused to visible fluorescent proteins. Thus, using fluorescence microscopy and spectroscopy, it is possible to visualize the expression of proteins, register their location and evolution over time and through different analysis, extract quantitative information about the dynamics, kinetics and organization of focal adhesion complexes. The analysis of the dynamics and distribution of focal adhesion complexes and their interactions were performed by fluorescence correlation spectroscopy (FCS). The effective diffusion coefficients of the proteins mentioned were characterized. The analysis of the crosscorrelation of fluorescence fluctuations of pairs of focal adhesion proteins (FCCS) allowed to demonstrate the interaction between various adhesive proteins in focal adhesion. The dissociation kinetics of proteins from the focal adhesion was evaluated by fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) under different conditions. To study the changes generated in the organization and dynamics of focal adhesions in living cells, in response to a global external mechanical stimulus, an equibiaxial traction device adapted to be used simultaneously with the FV1000 confocal microscope was used. Mechanical tension applied by the pulling device is able to induce changes in the area of living cells as well as in focal adhesions. In response to mechanical stretch increased, the recruitment and translocation of the protein zyixin accompanied by a significant decrease in the dissociation constant was observed. To correlate the mechanical properties of the substrate and the traction force generated by the cell at a focal adhesions level, without losing sight of the organization and dynamics of proteins in focal adhesion, traction force microscopy was implemented (TFM). This technique has the sensitivity necessary to measure the traction force generated by the cell on an elastic and transparent substrate, which can be combined with other fluorescence microscopy techniques such as FRAP or FCS. Analysis of TFM data for zyxin yielded deformation and traction forces maps, while the dissociation kinetics was evaluated by FRAP.
Cita tipo APA: Bianchi, Micaela . (2016-03-28). Mecanotransducción celular. Correlación entre las propiedades mecánicas y la organización-dinámica de proteínas de adhesión focal en células vivas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5945_Bianchi.pdf Cita tipo Chicago: Bianchi, Micaela. "Mecanotransducción celular. Correlación entre las propiedades mecánicas y la organización-dinámica de proteínas de adhesión focal en células vivas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-28. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5945_Bianchi.pdf |
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Vignale, María Victoria. "Efecto de endofitos Epichloë sobre la micorrización y productividad de gramíneas hospedantes y no hospedantes" (2016-03-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las plantas a menudo establecen múltiples asociaciones simbióticas simultáneas con diferentes microorganismos; sin embargo, la forma en que cada simbionte afecta a los otros simbiontes y los efectos de estas múltiples interacciones en la productividad de las plantas hospedantes no son bien entendidos. Esta tesis está centrada en contribuir al conocimiento de las interacciones multitróficas entre gramíneas nativas y endofitos Epichloë. Particularmente, está dirigida a la caracterización de la triple asociación mutualista entre gramíneas, endofitos y hongos formadores de micorrizas arbusculares (HMA) y a establecer los mecanismos que expliquen la correlación positiva observada entre la presencia de endofitos Epichloë y la colonización de gramíneas nativas por HMA. Se realizaron ensayos in vitro, donde se analizó el efecto de los exudados de endofitos y de plantas infectadas con endofitos (E+) y no infectadas (E-) sobre la fase extramatrical de los HMA. Se estudiaron, en invernadero, el efecto de exudados de endofitos sobre la micorrización y la productividad vegetal en plantas de Bromus auleticus libres de endofitos (E-) y en plantas vecinas agronómicamente seleccionada: Lolium multiflorum (E+ y E-). Se analizaron, a campo, el efecto simultáneo en simbiosis de los endofitos y los HMA sobre el desarrollo vegetativo y otros caracteres de interés agronómico de gramíneas nativas como Bromus auleticus, seleccionadas agronómicamente: Lolium multiflorum y Schedonorus arundinaceus y sobre una gramínea libre de endofitos en la naturaleza: Bromus catharticus. Este plan comprende estudios básicos para el futuro aprovechamiento y manejo tecnológico de la triple simbiosis mutualista que se relacionan con el mejoramiento de pastos para el forraje y productividad vegetal. Abstract: Plants often establish multiple simultaneous symbiotic associations with different microorganisms; however, the way in which each symbiont affects the other symbionts and the effects of these multiple interactions on plant performance are not well understood. This thesis is focused on contributing to the knowledge of multitrophic interactions between native grasses and Epichloë endophytes. Particularly, it is directed to the characterization of the triple mutualist interaction between grasses, endophytes and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and to establish mechanisms that explain the observed positive correlation between the presence of Epichloë endophytes and the colonization of native grasses by HMA. In vitro tests where the effect of endophytes exudates and from infected (E+) and endophyte free plants (E-) on the AMF extramatrical phase were performed. Greenhouse experiments were also performed to study the effect of endophyte exudates on the mycorrhization and plant productivity of uninfected (E-) Bromus auleticus and Lolium multiflorum (ryegrass) (E+ and E-) (agronomically selected). We performed field trials to study the simultaneous effect of symbiotic endophytes and AMF on the vegetative development and other traits of agronomic interest of native grasses as Bromus auleticus, agronomically selected as Lolium multiflorum and Schedonorus arundinaceus and endophytE-free grass in nature: Bromus catharticus. This plan includes basic studies for the future development and technological management of a triple mutualistic symbiosis that relate to the improvement of pastures for forage and plant productivity.
Cita tipo APA: Vignale, María Victoria . (2016-03-23). Efecto de endofitos Epichloë sobre la micorrización y productividad de gramíneas hospedantes y no hospedantes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5956_Vignale.pdf Cita tipo Chicago: Vignale, María Victoria. "Efecto de endofitos Epichloë sobre la micorrización y productividad de gramíneas hospedantes y no hospedantes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5956_Vignale.pdf |
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Peña Cárcamo, José Rafael. "Viperina, un factor de restricción en la infección con el arenavirus Junín" (2016-03-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Viperina (VIP) es una proteína cuya expresión es inducida por interferón (IFN) y se ha reportado como factor de restricción viral de diversos virus. En el presente trabajo se analizó por primera vez la acción antiviral de viperina en células A549 sobre la multiplicación del virus Junín (JUNV). Asimismo, se analizó la importancia de las estructuras lipídicas en el ciclo de mutiplicación de JUNV y la localización subcelular en la cual VIP ejerce su acción antiviral. Mediante distintos ensayos se pudo comprobar que la respuesta de IFN/VIP se encuentra activada en las células A549 infectadas con JUNV. Del análisis de sobreexpresión de VIP se confirmó que esta proteína tiene un efecto antiviral sobre la multiplicación de JUNV. Cabe destacar que los aumentos de los niveles relativos de mRNAs/proteínas VIP encontrados se correlacionan con la progresión de la infección con JUNV. Interesantemente, las estructuras lipídicas denominadas lipid droplets (LDs) se observaron aumentadas tanto en número como en tamaño en los cultivos infectados con JUNV. Por otro lado, la disminución de los LDs afectó negativamente la producción de viriones extracelulares, y las imágenes de microscopía revelaron que en las células infectadas las nucleoproteínas virales se encuentran cerca de los LDs, lo que sugiere que los complejos de replicación de JUNV podrían estar utilizando estas estructuras. Por último, los estudios de localización en membrana plasmática de las glicoproteínas virales sugieren que la acción de VIP no sería directamente en membrana pero sí podría ser a través de un paso previo relacionado con el transporte de glicoproteínas a microdominios rafts. En su conjunto, estos resultados no solamente incrementan el conocimiento sobre la biología del arenavirus Junín, sino que ofrece un nuevo blanco para la intervención del ciclo de replicación y la búsqueda de agentes quimioterapéuticos específicos. Abstract: Viperin (VIP) is a cellular protein induced by interferon (IFN) reported as restriction factor for several viruses. In the present work and for the first time it has been analyzed viperin antiviral action in A549 cells infected with Junín virus (JUNV). The importance of cellular lipidic structures in JUNV multiplication and putative subcellular localization where VIP action could take place, were also studied. Different assays showed that IFN/VIP response is activated in A549 cells upon JUNV infection. Overexpression of VIP showed to exert a strong antiviral effect on JUNV multiplication. In this line relative amounts of mRNA/protein levels correlate with the progression of JUNV infection. Interestingly, lipid droplets structures (LDs) in infected cells were augmented both in numbers and size. Accordingly diminished of LDs negatively affected extracellular virion production. Microscopy analysis revealed viral nucleoproteins close to LDs, suggesting that viral replication complexes may make use of these structures. Finally, immunofluorescense assays and localization studies showed that the viral glycoproteins is almost absent from plasma membrane suggesting that VIP action might be exerted in an indirect fashion through lipids rafts negative modulation. All together these results enlighten the knowledge about the biology of the arenaviruses and additionally reveal a very new and interesting target for the intervention design and screening of specific chemotherapeutic agents to combat JUNV.
Cita tipo APA: Peña Cárcamo, José Rafael . (2016-03-23). Viperina, un factor de restricción en la infección con el arenavirus Junín. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5925_PenaCarcamo.pdf Cita tipo Chicago: Peña Cárcamo, José Rafael. "Viperina, un factor de restricción en la infección con el arenavirus Junín". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5925_PenaCarcamo.pdf |
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Parra, Rodrigo Gonzalo. "Estructuras, simetrías y paisajes energéticos en la familia de proteínas con repeticiones de Ankirina" (2016-03-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las proteínas repetitivas están compuestas por repeticiones en tándem de motivos estructurales. Estas unidades interaccionan entre sí de forma tal que coalescen en arquitecturas del tipo solenoidal o toroidal. Por su simplicidad topológica constituyen modelos útiles para el estudio del plegado de proteínas. Esta tesis se centra en el estudio de los miembros de la familia de proteínas con repeticiones de Ankirina (ANKs) que contienen entre 3 y 34 copias de un motivo de 33 residuos de largo. Siendo principalmente descriptas como mediadoras de interacciones proteína-proteína, las ANKs poseen una versatilidad para el reconocimiento de otras moléculas comparable a la de los anticuerpos. A pesar de su simplicidad estructural, las proteínas repetitivas presentan varios desafíos inherentes a su no globularidad. Las repeticiones pueden ser muy degeneradas en sus secuencias dificultando la deteccióon y definición de límites entre ellas, siendo este un problema aún no resuelto en este campo de estudio. Dado que las estructuras están mucho más conservadas que las secuencias, hemos desarrollado un método, llamado Teselado proteico" capaz de detectar repeticiones estructurales de forma objetiva, rigurosa y eficiente. Dicho algoritmo es independiente de la secuencia de las moléculas analizadas y es además generalizable a todos los tipos de proteínas repetitivas. Su aplicación a distintas clases de proteínas nos permitió caracterizar sus periodicidades y espectro de simetrías. Hemos aplicado nuestro algoritmo a todos los miembros de la familia ANK. Haciendo uso de nociones de la teoría de paisajes energéticos y con la hipótesis de que las repeticiones constituyen unidades de plegado, fuimos capaces de definir el largo y la fase de las repeticiones en todos los casos. Este estudio representa el primer caso reportado en que una estrategia de anotación de las unidades repetitivas consistente es aplicada a lo largo de toda una familia, lo cual permite realizar análisis comparativos al nivel de las repeticiones individuales. Los análisis subsiguientes muestran que las repeticiones ANKs pueden clasificarse en 3 tipos diferentes que corresponden a las repeticiones ubicadas en la región N-terminal, interna o C-terminal. Cada tipo de repetición muestra patrones de conservación en secuencia y en su energía de plegado específicos de su tipo. Pudimos observar además que los niveles de conservación de la secuencia y de la energía de plegado se encuentran correlacionados de forma lineal y positiva, lo cual indica que aquellas secuencias parecidas al consenso que se obtiene a partir del alineamiento múltiple de secuencias son más plegables que aquellas que se alejan del mismo. Existe una red de interacciones conservadas y energéticamente favorables en todas las repeticiones internas de las ANKs que conectan aquellos residuos más conservados en secuencia y que por tanto constituyen un núcleo de estabilidad estructural de las mismas. Al analizar en cambio todos los elementos que no forman parte de la estructura canónica de las repeticiones (inserciones y deleciones), las regiones cercanas a las mismas, se encuentran enriquecidas en interacciones frustradas, es decir, son desfavorables para el plegado de las mismas. Lo anterior sugiere que la presencia de inserciones y deleciones indica adaptaciones funcionales de las proteínas en que se encuentran. Este enriquecimiento de interacciones frustradas se observa también en los sitios de interacción con otras proteínas. Finalmente hemos estudiado la dinámica de plegado de estas moléculas usando métodos basados en estructura. Hemos caracterizado los mecanismos de plegado de varios miembros de la familia ANK y relacionando los mismos con los patrones energéticos previamente descriptos a partir de los estados nativos. Nuestros resultados ofrecen nuevas perspectivas acerca del funcionamiento de las proteínas de la familia ANK y pueden ser de gran utilidad para aquellos interesados en el dise~no de este tipo de moléculas para diferentes fines y el entendimiento biofísico de estas moléculas en forma general. Abstract: Repeat proteins are composed of specific structural motifs that are tandemly repeated. These units interact between each other leading to solenoidal or toroidal architectures. Given their topological simplicity these molecules constitute useful models to study the protein folding problem. This thesis is focused in studying the Ankyrin Repeat Protein Familiy (ANKs). Proteins from this family contain between 2 and 34 copies of a structural motif of 33 residues long. Being mainly described as protein-protein interactors, the ANKs have a high versatility to recognize other molecules, comparable to that of antibodies. Despite their structural simplicity, repeat proteins present several challenges that are inherent to their non-globularity. Repeats can be highly degenerated in their sequences difficulting their detection and the definition of limits in between them. Given that the structure is more conserved than the sequence, we have developed a method called Protein tiling" that is able to detect structural repetitions in an objective, rigorous and efficient manner. This algorithm is independent from the sequences of the proteins being analyzed and also it is generalizable to other repeat protein families and types. Its application to different protein classes allowed us to characterize their periodicities and symmetry spectra. We have applied the Protein Tiling algorithm to all the members in the ANK family. Using notions from the energy landscapes theory and the hypothesis of repeats as protein folding units, we were able to define the length and phase for the repeating units in all the ANKs. This study represents the first reported case in which a consistent repeats annotation strategy is applied to a whole family which allows to perform comparative analysis of repeats as individual units. Subsequent analysis showed that ANK repeats can be classified into 3 different types that correspond to repetitions localized at the N-terminal, internal or C-terminal regions. Each repeat type shows specific sequence and energy conservation patterns. We observed that the conservation degree at the sequences and the energy patterns are linearly and positively correlated, indicating that those sequences that are similar to the consensus obtained from the multiple sequence alignment are more foldable than those that have more differences with it. There exists a network of conserved interactions along all internal ANK repeats that connect those residues that are highly conserved in sequence and hence constitute a structural stability core for the overall structure. On the contrary, when analyzing those elements that do not belong to the canonical repeats structure (insertions and deletions), those regions that are close to them are enriched in frustrated interactions, i.e. where local folding is unfavorable. The latter suggests that the presence of insertions and deletions indicate functional adaptations of the proteins in which they are contained. This enrichment of frustrated interactions is also observed at the interaction sites of ANKs with other proteins. Finally we have studied the folding dynamics of several ANK members using state of the art computational methods. We have characterized the folding mechanisms of several members in the ANK family and related those with the energetic patterns previously described from the native states. Our results offer new insights into how ANK proteins function and can be of great value to those researchers that are interested in using these type of molecules for protein design with different aims and for the biophysical understanding of these molecules in general.
Cita tipo APA: Parra, Rodrigo Gonzalo . (2016-03-23). Estructuras, simetrías y paisajes energéticos en la familia de proteínas con repeticiones de Ankirina. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5914_Parra.pdf Cita tipo Chicago: Parra, Rodrigo Gonzalo. "Estructuras, simetrías y paisajes energéticos en la familia de proteínas con repeticiones de Ankirina". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5914_Parra.pdf |
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García, Natalia Cristina. "Estudio comparativo filogenético de los patrones de variación vocal y de coloración del plumaje en los Cardinalinos Azules (Passeriformes: Cardinalidae)" (2016-03-23). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El canto y la coloración del plumaje son dos de las formas de comunicación más explotadas por los paseriformes. El objetivo de este proyecto doctoral fue estudiar los patrones de variación vocal y de coloración del plumaje en un grupo de paseriformes oscines cercanamente emparentados, los Cardinalinos Azules. Se pusieron a prueba diferentes hipótesis sobre la influencia de diversos factores -como la morfología y el hábitat- en la evolución de dichas señales. Entre los Cardinalinos Azules, se encontró un notable grado de diversificación en estos caracteres, y niveles variables de diferenciación entre machos y hembras en el caso de la coloración. El tamaño corporal y del pico explicarían parte de las diferencias vocales entre las especies, y el tamaño corporal también estaría relacionado con el grado de dicromatismo sexual. Las características del hábitat, en cambio, no habrían tenido efecto en la evolución del canto o de la coloración del plumaje dentro del grupo en estudio. A su vez, el grado de complejidad del canto y de la coloración habrían evolucionado de manera independiente. Por último, la diversificación en estos caracteres a nivel intraespecífico en dos representantes del clado, Cyanocompsa cyanoides y C. brissonii, mostró diferentes grados de congruencia con la variación geográfica en marcadores moleculares. De esta manera, este estudio integrativo permite un mejor entendimiento del rol de diferentes factores en la evolución de señales acústicas y visuales, a la vez que aporta evidencia para resolver el status taxonómico de representantes de la avifauna neotropical, lo que es fundamental para una mejor comprensión de su historia evolutiva. Abstract: Song and plumage coloration are two of the most exploited forms of communication among passerines. The objective of this doctoral project was to study the patterns of vocal and plumage color variation in a group of closely related oscines, the Blue Clade of the Cardinalidae family. Different hypotheses about the influence of factors such as morphology and habitat in the evolution of acoustic and visual signals were tested. Among the Blue Clade, a remarkable degree of diversification in these characters was found, as well as varying levels of differentiation between males and females in the case of plumage coloration. Body and beak sizes partially explain vocal differences between species, and body size would also be related to the degree of sexual dichromatism. Habitat characteristics, however, would have had no effect on the evolution of song or plumage coloration within the study group. In turn, the degrees of complexity of song and plumage coloration evolved independently. Finally, diversification in these characters at the intraspecific level in two representatives of the clade, Cyanocompsa cyanoides and C. brissonii, showed varying degrees of consistency with geographical variation in molecular markers. This integrative study allows a better understanding of the role of different factors in the evolution of acoustic and visual signals. It also provides evidence to help resolve the taxonomic status of representatives of the neotropical avifauna, which is essential for a better understanding of their evolutionary history.
Cita tipo APA: García, Natalia Cristina . (2016-03-23). Estudio comparativo filogenético de los patrones de variación vocal y de coloración del plumaje en los Cardinalinos Azules (Passeriformes: Cardinalidae). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5932_Garcia.pdf Cita tipo Chicago: García, Natalia Cristina. "Estudio comparativo filogenético de los patrones de variación vocal y de coloración del plumaje en los Cardinalinos Azules (Passeriformes: Cardinalidae)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-23. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5932_Garcia.pdf |
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Zarco, Agustín. "Influencia de la estructura de la vegetación y del alimento sobre el uso del espacio por las aves granívoras del desierto del Monte Central" (2016-03-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Dependiendo de las diferentes restricciones dietarias y de los recursos que utilizan las aves para sus actividades sus comportamientos pueden verse afectados de diferente manera ante cambios en la abundancia del alimento o en la estructura del hábitat. En este trabajo se analizó cómo estos dos factores modifican en el desierto del Monte central el uso del espacio por parte de tres aves granívoras: Zonotrichia capensis, un granívoro generalista, Saltatricula multicolor, un graminívoro, y Poospiza torquata, graminívoro en la temporada no reproductiva. Durante la etapa reproductiva, a escala de hábitat, se encontró que S. multicolor ante la disminución de la abundancia de alimento y de la cobertura arbórea aumentó la superficie defendida, mientras que Z. capensis no modificó su territorio. A escala de microhábitat, la selección de perchas para cantar no difirió para ninguna de las especies en ambientes con diferente estructura de la vegetación. Durante la temporada no reproductiva se observó que los patrones de movimiento de individuos juveniles y la dispersión natal difiere entre las aves granívoras: mientras S. multicolor posee dispersión natal retrasada, Z. capensis y P. torquata abandonan la zona de cría al finalizar el período de dependencia alimenticia. La abundancia de alimento afectó también la estructura de las bandadas invernales, ya que una disminución del alimento provocó un decrecimiento en el tamaño de las bandadas y en la proporción de aves granívoras que las forman. Las evidencias sugieren que en la porción central del desierto del Monte el efecto que ejercen el alimento y la estructura del hábitat en el uso del espacio por las aves granívoras es especie-específico y depende de las características de éstas. Abstract: Birds behaviour could be differently influenced by changes in food abundance and habitat structure, depending on dietary restrictions and resources use. In these study was analyzed how those factors modified the use of space of three seed-eating birds in the central Monte desert during the breeding and non- breeding seasons: Zonotrichia capensis, a granivorous generalist, Saltatricula multicolor, a grass specialist, and Poospiza torquata, a grass specialist in the non-breeding season. During the breeding season and considering at an habitat scale, S. multicolor increased their territorial area due to the lack of food abundance and tree cover, while Z. capensis did not. At a microhabitat scale, there was no difference in song perch selection for any species besides the vegetation structure differences between environments. On the other hand, during the non-breeding season the movement patterns of young individuals and natal dispersal differed among species: S. multicolor shows a delayed natal dispersal and Z. capensis and P. torquata leaved their natal area after the nutritional dependence period. The structure of wintering flocks was affected by food abundance: size and seed-eating birds proportion in the flocks dimished with food decrease. This study results suggest that in the central Monte desert, food and habitat structure affect the space use, being species-specific and depending on bird characteristics.
Cita tipo APA: Zarco, Agustín . (2016-03-22). Influencia de la estructura de la vegetación y del alimento sobre el uso del espacio por las aves granívoras del desierto del Monte Central. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5928_Zarco.pdf Cita tipo Chicago: Zarco, Agustín. "Influencia de la estructura de la vegetación y del alimento sobre el uso del espacio por las aves granívoras del desierto del Monte Central". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5928_Zarco.pdf |
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Ubalde, Sebastián. "Reconocimiento de acciones en videos de profundidad" (2016-03-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El problema de reconocer automáticamente una acción llevada a cabo en un video está recibiendo mucha atención en la comunidad de visión por computadora, con aplicaciones que van desde el reconocimiento de personas hasta la interacción persona-computador. Podemos pensar al cuerpo humano como un sistema de segmentos rígidos conectados por articulaciones, y al movimiento del cuerpo como una transformación continua de la configuración espacial de dichos segmentos. La llegada de cámaras de profundidad de bajo costo hizo posible el desarrollo de un algoritmo de seguimiento de personas preciso y eficiente, que obtiene la ubicación 3D de varias articulaciones del esqueleto humano en tiempo real. Esta tesis presenta contribuciones al modelado de la evolución temporal de los esqueletos. El modelado de la evolución temporal de descriptores de esqueleto plantea varios desafíos. En primer lugar, la posición 3D estimada para las articulaciones suele ser imprecisa. En segundo lugar, las acciones humanas presentan gran variabilidad intra-clase. Esta variabilidad puede encontrarse no sólo en la configuración de los esqueletos por separado (por ejemplo, la misma acción da lugar a diferentes configuraciones para diestros y para zurdos) sino tambión en la dinámica de la acción: diferentes personas pueden ejecutar una misma acción a distintas velocidades; las acciones que involucran movimientos periódicos (como aplaudir) pueden presentar diferentes cantidades de repeticiones de esos movimientos; dos videos de la misma acción puede estar no-alineados temporalmente; etc. Por último, acciones diferentes pueden involucrar configuraciones de esqueleto y movimientos similares, dando lugar a un escenario de gran similaridad inter-clase. En este trabajo exploramos dos enfoques para hacer frente a estas dificultades. En el primer enfoque presentamos una extensión a Edit Distance on Real sequence (EDR), una medida de similaridad entre series temporales robusta y precisa. Proponemos dos mejoras clave a EDR: una función de costo suave para el alineamiento de puntos y un algoritmo de alineamiento modificado basado en el concepto de Instancia-a-Clase (I2C, por el término en inglés: Instance-to-Class). La función de distancia resultante tiene en cuenta el ordenamiento temporal de las secuencias comparadas, no requiere aprendizaje de parámetros y es altamente tolerante al ruido y al desfasaje temporal. Además, mejora los resultados de métodos no-paramótricos de clasificación de secuencias, sobre todo en casos de alta variabilidad intra-clase y pocos datos de entrenamiento. En el segundo enfoque, reconocemos que la cantidad de esqueletos discriminativos en una secuencia puede ser baja. Los esqueletos restantes pueden ser ruidosos, tener configuraciones comunes a varias acciones (por ejemplo, la configuración correspondiente a un esqueleto sentado e inmóvil) u ocurrir en instantes de tiempo poco comunes para la acción del video. Por lo tanto, el problema puede ser naturalmente encarado como uno de Aprendizaje Multi Instancia (MIL por el término en inglés Multiple Instance Learning). En MIL, las instancias de entrenamiento se organizan en conjuntos o bags. Cada bag de entrenamiento tiene asignada una etiqueta que indica la clase a la que pertenece. Un bag etiquetado con una determinada clase contiene instancias que son características de la clase, pero puede (y generalmente así ocurre) también contener instancias que no lo son. Siguiendo esta idea, representamos los videos como bags de descriptores de esqueleto con marcas de tiempo, y proponemos un framework basado en MIL para el reconocimiento de acciones. Nuestro enfoque resulta muy tolerante al ruido, la variabilidad intra-clase y la similaridad inter-clase. El framework propuesto es simple y provee un mecanismo claro para regular la tolerancia al ruido, a la poca alineación temporal y a la variación en las velocidades de ejecución. Evaluamos los enfoques presentados en cuatro bases de datos públicas capturadas con cámaras de profundidad. En todos los casos, se trata de bases desafiantes. Los resultados muestran una comparación favorable de nuestras propuestas respecto al estado del arte. Abstract: The problem of automatically identifying an action performed in a video is receiving a great deal of attention in the computer vision community, with applications ranging from people recognition to human computer interaction. We can think the human body as an articulated system of rigid segments connected by joints, and human motion as a continuous transformation of the spatial arrangement of those segments. The arrival of low-cost depth cameras has made possible the development of an accurate and efficient human body tracking algorithm, that computes the 3D location of several skeleton joints in real time. This thesis presents contributions concerning the modeling of the skeletons temporal evolution. Modeling the temporal evolution of skeleton descriptors is a challenging task. First, the estimated location of the 3D joints are usually inaccurate. Second, human actions have large intra-class variability. This variability may be found not only in the spatial configuration of individual skeletons (for example, the same action involves different configurations for righthanded and left-handed people) but also on the action dynamics: different people have different execution speeds; actions with periodic movements (like clapping) may involve different numbers of repetitions; two videos of the same action may be temporally misaligned; etc. Finally, different actions may involve similar skeletal configurations, as well as similar movements, effectively yielding large inter-class similarity. We explore two approaches to the problem that aim at tackling this difficulties. In the first approach, we present an extension to the Edit Distance on Real sequence (EDR), a robust and accurate similarity measure between time series. We introduce two key improvements to EDR: a weighted matching scheme for the points in the series and a modified aligning algorithm based on the concept of Instance-to-Class distance. The resulting distance function takes into account temporal ordering, requires no learning of parameters and is highly tolerant to noise and temporal misalignment. Furthermore, it improves the results of non-parametric sequence classification methods, specially in cases of large intra-class variability and small training sets. In the second approach, we explicitly acknowledge that the number of discriminative skeletons in a sequence might be low. The rest of the skeletons might be noisy or too person-specific, have a configuration common to several actions (for example, a sit still configuration), or occur at uncommon frames. Thus, the problem can be naturally treated as a Multiple Instance Learning (MIL) problem. In MIL, training instances are organized into bags. A bag from a given class contains some instances that are characteristic of that class, but might (and most probably will) contain instances that are not. Following this idea, we represent videos as bags of time-stamped skeleton descriptors, and we propose a new MIL framework for action recognition from skeleton sequences. We found that our approach is highly tolerant to noise, intra-class variability and inter-class similarity. The proposed framework is simple and provides a clear way of regulating tolerance to noise, temporal misalignment and variations in execution speed. We evaluate the proposed approaches on four publicly available challenging datasets captured by depth cameras, and we show that they compare favorably against other state-of-the-art methods.
Cita tipo APA: Ubalde, Sebastián . (2016-03-22). Reconocimiento de acciones en videos de profundidad. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5922_Ubalde.pdf Cita tipo Chicago: Ubalde, Sebastián. "Reconocimiento de acciones en videos de profundidad". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5922_Ubalde.pdf |
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Temprana, Silvio Gabriel. "Mapeo espacio-temporal de la conectividad postsináptica en neuronas jóvenes del hipocampo adulto" (2016-03-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las células granulares en desarrollo en el giro dentado adulto (nCGs) atraviesan un periodo crítico de exacerbada excitabilidad y plasticidad sináptica antes de alcanzar la madurez. Se desconoce el impacto que estas nuevas unidades de procesamiento tienen en el circuito preexistente del giro dentado. En este trabajo combinamos la utilización de optogenética, electrofisiología en rodajas y quemogenética in vivo para activar nCGs de diferentes edades y analizar el reclutamiento de sus redes postsinápticas. Observamos que nCGs inmaduras (4 semanas de edad) reclutan eficientemente blancos distales en el área CA3 pero fallan en activar interneuronas proximales responsables de la inhibición feedback. A medida que atraviesan el proceso de maduración, las nCGs comienzan a activar circuitos de retroalimentación GABAérgica controlando el disparo de CGs vecinas, un mecanismo que podría promover la codificación dispersa de inputs. Dicho control inhibitorio impacta sólo débilmente en poblaciones de nCGs jóvenes. Simulaciones computacionales revelan que este retraso en el acoplamiento de las nCGs a los circuitos de retroalimentación negativa podría tener un rol crucial con el objetivo de lograr una representación dispersa de inputs nuevos en el giro dentado. Abstract: Developing granule cells (nGCs) of the adult dentate gyrus undergo a critical period of enhanced activity and synaptic plasticity before becoming mature. The impact of developing nGCs on the activity of preexisting dentate circuits remains unknown. Here we combine optogenetics, acute slice electrophysiology, and in vivo chemogenetics to activate nGCs at different stages of maturation to study the recruitment of local target networks. We show that immature (4-week-old) nGCs can efficiently drive distal CA3 targets but poorly activate proximal interneurons responsible for feedback inhibition (FBI). As nGCs transition toward maturity, they reliably recruit GABAergic feedback loops that restrict spiking of neighbor GCs, a mechanism that would promote sparse coding. Such inhibitory loop impinges only weakly in new cohorts of young nGCs. A computational model reveals that the delayed coupling of nGCs to FBI could be crucial to achieve a fine grain representation of novel inputs in the dentate gyrus.
Cita tipo APA: Temprana, Silvio Gabriel . (2016-03-22). Mapeo espacio-temporal de la conectividad postsináptica en neuronas jóvenes del hipocampo adulto. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5918_Temprana.pdf Cita tipo Chicago: Temprana, Silvio Gabriel. "Mapeo espacio-temporal de la conectividad postsináptica en neuronas jóvenes del hipocampo adulto". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5918_Temprana.pdf |
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Nitsche, Matías Alejandro. "Método de navegación basado en aprendizaje y repetición autónoma para vehículos aéreos no tripulados" (2016-03-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis se presenta un método basado en la técnica de Aprendizaje y Repetición (teach & repeat o TnR) para la navegación autónoma de Vehículos Aéreos No Tripulados (VANTs). Bajo esta técnica se distinguen dos fases: una de aprendizaje (teach) y otra de navegación autónoma (repeat). Durante la etapa de aprendizaje, el VANT es guiado manualmente a través del entorno, definiendo así un camino a repetir. Luego, el VANT puede ser ubicado en cualquier punto del camino (generalmente, al comienzo del mismo) e iniciar la etapa de navegación autónoma. En esta segunda fase el sistema opera a lazo cerrado controlando el VANT con el objetivo de repetir en forma precisa y robusta el camino previamente aprendido. Como principal sensado se utiliza un sistema de visión monocular, en conjunción con sensores que permitan estimar a corto plazo el desplazamiento del robot respecto del entorno, tales como sensores inerciales y de flujo óptico. El principal objetivo de este trabajo es el de proponer un método de navegación tipo T&R que pueda ser ejecutado en tiempo real y a bordo del mismo vehículo, sin depender de una estación terrena a la cual se delegue parte del procesamiento o de un sistema de localización externa (como por ejemplo GPS, en ambientes exteriores) o de captura de movimiento (como por ejemplo ViCon, en ambientes interiores). En otras palabras, se busca un sistema completamente autónomo. Para ello, se propone el uso de un enfoque basado en apariencias (o appearance-based, del inglés), que permite resolver el problema de la localización del vehículo respecto del mapa en forma cualitativa y que es computacionalmente eficiente, lo que permite su ejecución en hardware disponible a bordo del vehículo. La solución propuesta se diferencia del típico esquema de Localización y Mapeo Simultáneo (Simultaneous Localization and Mapping o SLAM) mediante el cual se estima la pose del robot (y la de los objetos del entorno) en forma absoluta con respecto a un sistema de coordenadas global. Bajo dicho esquema, como consecuencia, el error en la estimación de la pose se acumula en forma no acotada, limitando su utilización en el contexto de una navegación a largo plazo, a menos que se realicen correcciones globales en forma periódica (detección y cierre de ciclos). Esto impone el uso de técnicas computacionalmente costosas, lo cual dificulta su ejecución en tiempo real sobre hardware que pueda ser llevado a bordo de un robot aéreo. En contraste, bajo el enfoque propuesto en esta tesis, la localización se resuelve en forma relativa a un sistema de coordenadas local cercano al vehículo (es decir, una referencia sobre el camino) que es determinado mediante un esquema de filtro de partículas (Localización de Monte Carlo). Esto se logra comparando la apariencia del entorno entre la etapa de aprendizaje y la de navegación, mediante el empleo de características visuales salientes (image features) detectadas en dichas etapas. Finalmente, utilizando una ley de control simple, se logra guiar al robot sobre el camino, a partir de reducir la diferencia entre la posición aparente de los objetos del entorno entre ambas etapas, producto del desplazamiento y diferencias de orientacion del robot respecto del mismo. Como parte del desarrollo del trabajo de tesis, se presenta tanto la formulación y descripción del método como el diseño y construcción de una plataforma VANT, sobre la cual se realizaron los experimentos de navegación. Asimismo, se exhiben experimentos tanto con plataformas aéreas en entornos simulados como sobre plataformas terrestres, dado que el método es aplicable también a los mismos. Con los resultados obtenidos se demuestra la factibilidad y precisión de los métodos de localización y navegación propuestos, ejecutando en hardware a bordo de un robot aéreo en tiempo-real. Así, con esta tesis se presenta un aporte al estado del arte en lo que refiere a temas de navegación autónoma basada en visión, particularmente (pero no exclusivamente) para el caso de robots aéreos. Abstract: This thesis presents a method based on the Teach & Repeat (TnR) technique for the autonomous navigation of Unmanned Aerial Vehicles (UAVs). With this technique, two phases can be distinguished: a learning phase (teach) and an autonomous navigation (repeat) phase. During the learning stage, the UAV is manually guided through the environment, thus defining a path to repeat. Then, the UAV can be positioned in any point of the path (usually at the beginning of it) and the autonomous navigation phase can be started. In this second phase the system operates in closed-loop controlling the UAV in order to accurately and robustly repeat the previously learned path. Monocular vision is used as the main sensing system in conjunction with other sensors used to obtained short-term estimates of the movement of the robot with respect to the environment, such as inertial and optical flow sensors. The main goal of this work is to propose a T&R navigation method that can be run in real-time and on-board the same vehicle, without relying on a ground control-station to which part of the processing is delegated or on external localization (for example GPS, in outdoor environments) or motion capture (such as VICON, for indoor settings) systems. In other words, a completely autonomous system is sought. To this end, an appearance-based approach is employed, which allows to solve the localization problem with respect to the map qualitatively and computationally efficient, which in turns allows its execution on hardware available on-board the vehicle. The proposed solution scheme differs from the typical Simultaneous Localization and Mapping (SLAM) approach under which the pose of the robot (and the objects in the environment) are estimated in absolute terms with respect to a global coordinate system. Under SLAM, therefore, the error in the pose estimation accumulates in unbounded form, limiting its use in the context of long-term navigation unless global corrections are made periodically (loop detection and closure). This imposes the use of computationally expensive techniques, which hinders its execution in real time on hardware that can be carried on-board an aerial robot. In contrast, under the approach proposed in this thesis, the localization is solved relative to a local coordinate system near the vehicle (i.e. a reference over the path) which is determined by a particle-filter scheme (Monte Carlo Localization or MCL). This is accomplished by comparing the appearance of the environment between the learning and navigation stages through the use of salient visual features detected in said steps. Finally, using a simple control law, the robot is effectively guided over the path, by means of reducing the difference in the apparent position of objects in the environment between the two stages, caused by the vehicle’s displacement with respect to the path. As part of the development of the thesis, both the formulation and description of the method, and the design and construction of a UAV platform, on which navigation experiments were conducted, are presented. Moreover, experiments using aerial platforms in simulated environments and using terrestrial platforms are also presented, given that the proposed method is also applicable to the latter. With the obtained results the feasibility and precision of the proposed localization and navigation methods are demonstrated, while executing on-board an aerial robot and in real-time. Thus, this thesis represents a contribution to the state of the art when it comes to the problem of vision-based autonomous navigation, particularly (but not exclusively) for the case of aerial robots.
Cita tipo APA: Nitsche, Matías Alejandro . (2016-03-22). Método de navegación basado en aprendizaje y repetición autónoma para vehículos aéreos no tripulados. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6036_Nitsche.pdf Cita tipo Chicago: Nitsche, Matías Alejandro. "Método de navegación basado en aprendizaje y repetición autónoma para vehículos aéreos no tripulados". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6036_Nitsche.pdf |
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Quinteros, Cynthia Paula. "Oxidos delgados para micro y nanoelectrónica: degradación, ruptura y aplicaciones tecnológicas" (2016-03-21). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El trabajo desarrollado en esta Tesis se focaliza en el estudio de mecanismos de transporte eléctrico involucrados en la degradación y eventual ruptura de películas dieléctricas (óxidos delgados). Éstos forman parte de una infinidad de dispositivos que son fabricados en vistas de posibles aplicaciones tecnológicas. El estudio de la degradación adquiere relevancia debido a que es preciso saber cómo se degrada cada componente y cómo ello incide en el comportamiento eléctrico general del dispositivo. Las estructuras estudiadas consisten en apilamientos metal/ óxido/ semiconductor (del inglés MIS) que pueden ser pensados como capacitores y que, en particular, constituyen la estructura básica para la construcción de transistores de efecto campo (MOSFET, según su sigla en inglés). A su vez, la misma estructura se encuentra presente en otro tipo de dispositivo con que se trabajó: las NROM (Nitride Read-Only Memories); que constituyen un tipo particular de las ampliamente difundidas memorias FLASH. Se trata de apilamientos fabricados a nivel comercial que se emplean actualmente como memorias no volátiles. Además, en la misma línea de analizar propiedades eléctricas de óxidos bajo distinto tipo de estímulos, se incursionó en el estudio de estructuras metal/ aislante/ metal (del inglés MIM). En ellas, la conmutación resistiva se muestra como una de las posibles aplicaciones de algunos de los mismos óxidos mencionados con anterioridad. Complementariamente, se analiza la factibilidad de su uso como mecanismo de memoria, en comparación con los mencionados NROM. El trabajo consistió en la caracterización eléctrica, comprensión de los mecanismos de conducción y/o conmutación así como el estudio bajo condiciones de degradación tales como radiación (de fotones , de iones pesados, protones y rayos X) y operación prolongada (procesos de estrés eléctrico). Si bien las distintas estructuras provienen de diversas colaboraciones con otros grupos de investigación, también se efectuaron algunas incursiones en los procesos de fabricación. Este trabajo comienza con la descripción de los efectos producidos por la incidencia de distintos tipos de radiación en estructuras MIS (metal/ aislante/ semiconductor), a partir de un análisis comparativo. Complementariamente, en los mismos apilamientos, se estudió la degradación debida a la aplicación prolongada de un voltaje. Luego se presenta un estudio orientado a comprender si la descarga producida por rayos X incidiendo en estructuras MOSFET condiciona la persistencia de las cargas atrapadas en las cercanías del dato perdido. A continuación, la incursión en estructuras de tipo MIM dio lugar a una serie de indagaciones vinculadas con el tópico de la conmutación resistiva. Se verá que muchas de las técnicas y aprendizajes adquiridos, durante los estudios precedentes, resultaron ventajosos al momento de encarar esta línea. Se puso de manifiesto la conmutación resistiva en muestras basadas en MgO y HfO2. En el primer caso, una conmutación entre estados muy disímiles (en orden de magnitud de la corriente) sugirió la propuesta de alternativas de fabricación. En el segundo, una amplia variedad de experimentos fueron empleados con la finalidad de comprender el comportamiento evidenciado por dicho material, que resultó destacarse por la particularidad de sus propiedades (autolimitación de corriente, ausencia de electroformado, resistencia al estrés eléctrico, etc.). Abstract: Studies carried out in this Thesis have been focused on thin film oxide degradation and breakdown mechanisms. Motivation arises from the fact that those films are part of a huge number of devices manufactured for possible technological applications. Degradation analysis becomes relevant since it is necessary to know the way in which each component is modified. Electrical behavior of degraded components is also of paramount importance. Analyzed structures consist of capacitive stacks composed of metal / insulator / semiconductor (MIS) which constitute the basic structure for transistor construction such as MIS - Field Effect technology. The same structure may be observed in the well-known memory technology: NROM devices, which consist of a variety of the so called FLASH memories. Within the same research framework of studying electrical properties of oxide films under different stimuli, resistive switching was dealt with. In this case, stack is somewhat different from that previously mentioned: semiconductor bottom contact is replaced by another metal contact (metal / insulator / metal or MIM). The main goal of this work is to improve the understanding of degradation and breakdown causes as well as the variety of techniques employed to reach that target (electrical characterization, stress measurements, radiation incidence). Although samples were provided by collaborators, some fabrication processes were carried out within the Thesis development. Firstly, radiation incidence on high k based MIS structures was comparatively analyzed from different radiation sources. Afterwards, a complementary degradation mechanism was studied in the same sample type: electrical stress. Since it was shown that radiation incidence is a cause of oxide degradation (producing trapped charge or modifying charge densities) a comprehensive study on simultaneous discharge of NROM based memories was carried out. As it was demonstrated, current technology of FLASH memories (i.e. NROM) seems not to be appropriate for hazard environments, so a different memory type was analyzed: ReRAM devices. Two high k based materials were tested during this work: MgO and HfO2. The first one presented an unusual switching ratio with a low rate of repetition; soft breakdown regime was identified to justify such behavior. The second one, remarkable for its properties (self current limitation, electroforming free, electrical stress hardness), showed that the complex fabrication process produced a more complex stack than the one usually employed.
Cita tipo APA: Quinteros, Cynthia Paula . (2016-03-21). Oxidos delgados para micro y nanoelectrónica: degradación, ruptura y aplicaciones tecnológicas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5923_Quinteros.pdf Cita tipo Chicago: Quinteros, Cynthia Paula. "Oxidos delgados para micro y nanoelectrónica: degradación, ruptura y aplicaciones tecnológicas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-21. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5923_Quinteros.pdf |
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Sánchez, Melisa Celeste. "La descondensación de la cromatina de espermatozoides de mamíferos: estudio de su mecanismo molecular y su posible utilidad como bioindicador del efecto de disruptores endócrinos" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: A diferencia de las células somáticas, el espermatozoide posee su cromatina empaquetada principalmente por protaminas en lugar de histonas. Las cisteínas presentes en las protaminas forman puentes disulfuro intra e intercatenarios, lo que le proporciona al núcleo espermático gran estabilidad y resistencia para poder atravesar el tracto masculino, el femenino y llegar con su ADN intacto hasta el sitio de fecundación. Luego que el espermatozoide penetra el oocito es imprescindible que se produzca la descondensación de su cromatina para que se reemplacen las protaminas espermáticas por histonas oocitarias. La descondensación de la cromatina involucra dos eventos: se deben reducir los puentes disulfuro (tiorreducción) y removerse las protaminas. Las moléculas involucradas en estos procesos serían el glutatión reducido (GSH) y el heparán sulfato (HS) oocitarios. Cuando este proceso de condensación de la cromatina, que ocurre durante la espermatogénesis para mantener la integridad del espermatozoide, se ve afectado por diversas causas, puede resultar en fallas de la descondensación que se evidencian una vez que el oocito es penetrado. Por otro lado, es sabido que la exposición a tóxicos ambientales puede provocar efectos deletéreos sobre la calidad de los espermatozoides y la fertilidad masculina. Las técnicas de reproducción asistida han podido resolver problemas de motilidad, defectos espermáticos, concentración de gametas muy reducida en el fluido seminal (oligozoospermia) pero todavía no pueden solucionar los defectos de la descondensación del núcleo espermático dentro del oocito. Esto pone en evidencia la importancia del proceso de descondensación, que no puede ser reemplazado por las técnicas de reproducción asistida, y permite pensar en utilizarlo como un posible indicador del efecto de disruptores endocrinos, tanto in vivo como in vitro. Los objetivos de esta tesis fueron (1) avanzar en el estudio del mecanismo de la descondensación de la cromatina de espermatozoides, así como también en su (2) rol como posible bioindicador de efectos deletéreos causados por tóxicos ambientales o ingeridos, tales como el alcohol y el plaguicida endosulfán. En primer lugar, fue posible caracterizar el sistema de descondensación in vitro en el modelo de ratón al coincubar los espermatozoides con distintos glicosaminoglicanos y GSH, determinándose de esta manera las moléculas candidatas a ser posibles agentes descondensantes, las concentraciones y tiempos óptimos de incubación. Como consecuencia de esto, fue posible detectar un efecto sinérgico existente entre la heparina (utilizada como equivalente molecular del heparán sulfato) y el dermatán sulfato, los únicos glicosaminoglicanos estudiados con potencial capacidad descondensante. El efecto de estos dos glicosaminoglicanos también fue evaluado mediante la técnica de microscopia electrónica de transmisión, la cual puso en evidencia los cambios sufridos por los espermatozoides durante el proceso de descondensación. Una vez caracterizado el sistema, se logró evidenciar el aumento de la descondensación in vitro que ocurre cuando se incuban los espermatozoides con endosulfán o etanol, como también luego de la ingesta de etanol. Además, fue posible evaluar el efecto del plaguicida sobre la fragmentación del ADN, así como también si existe alguna correlación entre la misma y la descondensación de la cromatina. Los efectos del etanol observados in vitro fueron confirmados en experimentos in vivo, en los cuales se intoxicaron ratones macho para realizar experimentos de fecundación in vitro. Estos son los primeros resultados obtenidos descondensando in vitro en presencia de heparina y GSH, espermatozoides previamente incubados con endosulfán o etanol, que ponen de manifiesto que este ensayo podría utilizarse como centinela para evaluar posibles efectos de tóxicos ambientales o ingeridos. Abstract: In contrast to somatic cells, sperm has its DNA packed mainly by protamines rather than histones. The presence of cystein in protamines allows for the formation of intra and interchain disulfide bonds, giving great stability and resistance to the sperm nucleus, enabling it to travel through the male and female reproductive tracts and reach the site of fertilization with its DNA intact. An essential step, once the sperm enters the oocyte, is the decondensation of its chromatin by replacing sperm protamines by oocyte histones. Chromatin decondensation involves two events: disulfide bridges should be reduced (thio-reduction) and the protamines removed. The molecules involved in these processes in vivo would be reduced Glutathione (GSH) and heparan sulfate (HS) present in the oocyte. When this process of chromatin condensation, which occurs during spermatogenesis to maintain the integrity of sperm, is affected by various causes, decondensation failure may result following oocyte penetration at fertilization. It is also well known that exposure to a toxic environment can cause deletereous effects on sperm quality and male fertility. Assisted reproduction techniques have been successful in solving problems of motility, various sperm defects, very low concentration of gametes in seminal fluid (oligozoospermy) but still cannot solve the shortcomings of the decondensation of the sperm nucleus within the oocyte. This highlights the importance of the decondensation process, which cannot be replaced by assisted reproduction techniques and led us to think of its possible use as a bioindicator of the effect of endocrine disruptors, both in vivo and in vitro. The objectives of this thesis were (1) to advance in the study of the mechanism of sperm chromatin decondensation as well as (2) its role as a possible bioindicator of environmental toxicity caused by toxic agents, such as alcohol and the pesticide endosulfán. First, it was possible to characterize the process of decondensation in vitro in the mouse by incubating sperm with different glycosaminoglycans and GSH, which led us to identify molecules which could behave as putative decondensing agents, concentrations and optimal incubation times. Subsequently, it was possible to detect a synergistic effect between heparin (as a substitute for heparan sulfate) and dermatan sulfate, the only glycosaminoglycans studied with potential to decondense the sperm nucleus in vitro. The effect of these two glycosaminoglycans was also evaluated on sperm morphology and ultrastructure through transmission electron microscopy, which allowed us to visualize the changes suffered by sperm during the decondensation process. Once the system was characterized, we were able to demonstrate the increase in in vitro decondensation that occurs when sperm are incubated with endosulfán or ethanol, as well as after ethanol ingestion. In addition, it was possible to assess the effect of this pesticide on DNA fragmentation as well as its possible correlation to chromatin decondensation. The alcohol effects observed in vitro were confirmed with in vivo experiments in which male mice were intoxicated and their sperm subsequently used to perform in vitro fertilization. These are, to our knowledge, the first results obtained decondensing in vitro in the presence of heparin and GSH, sperm previously incubated with endosulfán or ethanol, suggesting that the sperm decondensation assay could be used as sentinel to evaluate possible effects of environmental or ingested toxic agents.
Cita tipo APA: Sánchez, Melisa Celeste . (2016-03-18). La descondensación de la cromatina de espermatozoides de mamíferos: estudio de su mecanismo molecular y su posible utilidad como bioindicador del efecto de disruptores endócrinos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5924_Sanchez.pdf Cita tipo Chicago: Sánchez, Melisa Celeste. "La descondensación de la cromatina de espermatozoides de mamíferos: estudio de su mecanismo molecular y su posible utilidad como bioindicador del efecto de disruptores endócrinos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5924_Sanchez.pdf |
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Morales Vásquez, Miguel Angel. "Electrocatálisis y fotocatálisis para la producción de hidrógeno a partir de agua, utilizando metalocorrolatos y metalopofirinas" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Debido al incremento de la población mundial y la creciente industrialización de muchos países, el desarrollo de fuentes de energía renovable se ha vuelto un campo científico y tecnológico muy importante. Entre las diversas tecnologías (solar, eólica, hidroeléctrica, biocombustibles), la producción de H2 a partir de H2O es muy atractiva como método de almacenamiento de energía provista por cualquiera de las otras fuentes, incluyendo la conversión directa de energía lumínica en energía química en la forma de H2. En la fotosíntesis natural, la energía de la luz solar se utiliza para reorganizar los enlaces presentes en el agua para producir oxígeno e hidrógeno. Los distintos sistemas artificiales que realizan disociación del agua requieren catalizadores que ayudan a la producción de hidrógeno a partir de agua, sin el uso de un potencial de reducción excesivo. Todos estos esquemas que existen para el almacenamiento de energía por la reducción electroquímica o fotoquímica del agua a hidrógeno requieren de un catalizador, dada la energía de activación necesaria para la ruptura del enlace O-H. El platino es un excelente catalizador para este fin y es ampliamente utilizado en estudios de ruptura de agua. Pero el platino es un metal muy costoso y también puede ser fácilmente envenenado por los contaminantes en el agua, tales como moléculas que contienen azufre. Las metaloporfirinas han sido ampliamente estudiadas para el uso en aplicaciones técnicas como, sensores de gas y catálisis acoplados a superficies, a diferencia de sus “primos”; los metalocorroles, que son moléculas que han sido estudiadas muy poco en el campo de la catálisis, y presentan una gran oportunidad para usarlos como catalizadores para la obtención de hidrógeno (H2) a partir de agua. Es por ello que decidimos estudiar el uso de metalocorrolatos y metaloporfirinas con centros metálicos de Fe y Co para la producción de hidrógeno a partir de agua por vías electroquímicas y/o fotoquímicas, en solución, ancladas y/o adsorbidas sobre superficies, en presencia de trietilamina (TEA) como donor de electrones y p-terfenilo (TP), como sensibilizador, mostrando una excelente actividad en la producción de hidrógeno y una alta capacidad catalítica. Esto se logró mediante la reducción de los catalizadores promovida por la irradiación con una lámpara UV, asi como electroquímicamente y fotoelectroquímicamente. En algunos casos estos procesos son MIIIP → MIIP y en otros MIIP → MIP; siendo estas las cuplas que dan pie a la formación de H2, el cual se detectó y cuantificó y por distintos métodos. Abstract: Due to the increase in world population and the industrialization of many countries, the development of renewable energy sources has become an important scientific and technological field. Among the available technologies (solar, wind, hydroelectricity, biofuels), producing H2 from H2O is very attractive as a method of storing energy provided by any other sources, including direct conversion of light energy into chemical energy In natural photosynthesis, the energy from sunlight is used to rearrange the bonds present in water to produce oxygen and hydrogen. Artificial systems that perform water splitting require catalysts that assist hydrogen production from water without using an excessive reduction potential. All of these schemes that exist for storing energy by electrochemical or photochemical reduction of water to hydrogen require a catalyst, given the activation energy needed for breaking the O-H bond. Platinum is an excellent catalyst for this purpose and it is widely used in water-splitting studies However, platinum is a very expensive metal and can be easily contaminated by pollutants in water, such as sulfurcontaining molecules. Metalloporphyrins have been extensively studied for their many technical applications such as gas sensors and catalysis coupled surfaces. This is not the case for their "cousins", the metallocorrols, which are molecules that have few or no studies in the field of catalysis. Therefore they present a great opportunity to be used as catalysts for the production of hydrogen (H2) from water. That is why we decided to take advantage of metallocorrols and metalloporphyrins with Fe and Co centers to produce hydrogen from water by electrochemical and/or photochemical pathways, in solution, anchored and/or adsorbed on surfaces in the presence of triethylamine (TEA) as an electron donor, and pterphenyl (TP), as a sensitizer. Both compounds have shown excellent activity in the production of hydrogen and high catalytic ability. This was achieved by reducing the catalyst by irradiation with an UV-lamp, electro or photochemically. In some cases these processes are MIIIP → MIIP and in others MIIP → MIP. These are the couples that give rise to the formation of H2, which is in turn detected and quantified by different methods.
Cita tipo APA: Morales Vásquez, Miguel Angel . (2016-03-18). Electrocatálisis y fotocatálisis para la producción de hidrógeno a partir de agua, utilizando metalocorrolatos y metalopofirinas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5920_MoralesVasquez.pdf Cita tipo Chicago: Morales Vásquez, Miguel Angel. "Electrocatálisis y fotocatálisis para la producción de hidrógeno a partir de agua, utilizando metalocorrolatos y metalopofirinas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5920_MoralesVasquez.pdf |
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Lanzarotti, Esteban. "Herramientas bioinformáticas para la predicción y análisis de estructuras de proteínas: de genomas a motivos estructurales" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Durante la última decada, varios estudios han mostrado que la anotación automática de genomas resuelve muy bien el problema de recuperar informaci ón a partir de una secuenciación. A su vez, esto favoreció el crecimiento desmedido en la cantidad de genomas depositados en bases de datos que poseen una anotación automática, para los cuales se volvería imposible realizar experimentos sobre cada uno de los genes presentes en éstos genomas de manera de mejorar el conocimiento disponible. Es por esto que, obtener una estructura molde para construir un modelo 3D de una determinada secuencia, es una herramienta poderosa para entender las funciones de las proteínas. Una vez modelada la estructura, las interacciones presentes en ella aportan información de la función proteica. En esta tesis desarrollamos un pipeline bioinformático que a partir de la secuencia de un genoma bacteriano puede identificar las regiones codificantes, anotar su función y computa diversas propiedades de las proteínas codificadas. En una segunda etapa desarrollamos un pipeline de predicción de estructura secundaria y terciaria de proteínas que se integró con el sistema anterior. Finalmente, mediante el desarrollo de una base de datos de interacciones de amino ácidos basada en el PDB, estudiamos en detalle las interacciones aromáticas. Los anillos aromáticos forman clusters de interacciones que tienen particularidades que difieren según hayan sido encontrados en el interior de las proteínas o regiones de interacción proteína-ligando o interfaces de interacción proteína-proteína. Abstract: During the last decade, numerous studies have shown that automatic genome anotation performs quiet well in solving the problem of information retrieval from sequenced genomes. Also, this has favored an excesive growth of deposited (automatically) anotated genomes, which is imposible to design experiments over each of these genes present in each genome in order to improve the available knowledge. For this reason, obtaining a template structure to build a 3D model for a fixed sequence, is a powerful tool to understand protein functions. Once obtained the structure, the interactions involved in it, bring information about protein function. In this thesis we developed a bioinformatic pipeline which from a genomic sequence, identifies coding regions, anotates their functions and computes diverse properties. In a second stage, we developed a pipeline for prediction of protein secondary and tertiary structure, which was integrated to the previous system. Finally, by developing a structural database of amino acid interactions based ob PDB, we studied in detail aromatic interactions. Aromatics clusters have features that difer according they have been found i) in the core of the protein, ii) in small ligand binding regions and, iii) protein-protein interaction interfaces.
Cita tipo APA: Lanzarotti, Esteban . (2016-03-18). Herramientas bioinformáticas para la predicción y análisis de estructuras de proteínas: de genomas a motivos estructurales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5960_Lanzarotti.pdf Cita tipo Chicago: Lanzarotti, Esteban. "Herramientas bioinformáticas para la predicción y análisis de estructuras de proteínas: de genomas a motivos estructurales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5960_Lanzarotti.pdf |
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Ferrario, Mariana Inés. "Estudio de la aplicación de luz UV pulsada y su combinación con otras tecnologías emergentes en matrices frutales" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo principal de este trabajo residió en evaluar la eficiencia de la aplicación de luz pulsada (LP) en modo estanco (LPe) y en flujo continuo (LPc) y su combinación con ultrasonido de alta intensidad (US) y temperatura moderada (44-56 °C) para preservar jugos frutales. Se estudió la cinética de inactivación y la dinámica del crecimiento en el almacenamiento refrigerado de diversos microorganismos patógenos y deteriorativos inoculados y la flora nativa de varios jugos frutales (manzana, frutilla, naranja y melón) tratados por las tecnologías simples o combinadas mediante los modelos de Weibull, bifásico y doble Weibull. La efectividad de los tratamientos dependió de la absorbancia en el rango UV y turbidez de los jugos y del microorganismo evaluado. Estudios de citometría de flujo mostraron que células de S. cerevisiae, evidenciaron desestabilización de la integridad de la membrana y presencia de una subpoblación con daño subletal a bajas dosis de LP (12 J/cm2) y mediante microscopía electrónica de transmisión, presencia de vacuolas expandidas, pérdida y coagulación del contenido intracelular, y menor densidad electrónica. Los estudios de flora nativa, color y análisis sensorial concluyeron en la definición de un jugo de manzana preservado por LPc (0,73 J/cm2; 155 mL/min) combinado con US (30 min) y temperatura moderada, seguro y de buena calidad organoléptica, cuya vida útil refrigerada fue de 6 días. El producto propuesto evidenció mediante un análisis de conglomerados aceptabilidad por un grupo específico de consumidores interesados en la acidez y el intenso sabor a manzana del producto. Abstract: The overall objective of this study was to evaluate the efficacy of pulsed light technology (PL) in a static (PLs) or continuous flow (PLc) modes in combination with high intensity ultrasound (US) to preserve fruit juices. The inactivation kinetics and growth dynamics under refrigeration conditions of relevant microorganisms and native flora in apple, strawberry, orange and melon juices treated by the proposed single or combined technologies were studied by Weibull, biphasic and double Weibull models. The antimicrobial efficiency of the applied treatments depended on absorptivity and turbidity of juices as well as the strains. Flow cytometry studies revealed sub-lethal damage at low PL doses (< 12 J/cm2) and loss of membrane integrity in PL treated S. cerevisiae cells, while transmission electron microscopy observations showed expanded vacuoles, loss of inner content by puncture sites, less electronic density, among others. The combination US and PLs showed additive effects in S. cerevisiae inactivation in apple juice. Analysis of native flora, colour and sensory properties of apple juice processed by the combined PLc (0.73 J/cm2, 155 mL/min) and US (30 min) treatment ratified a product microbiologically safe with good organoleptic quality, with a 6 day shelf life. Apple juice treated by the combined PL/US method exhibited high acceptability by a group of consumers interested in the acidity and intense apple flavour of the juice.
Cita tipo APA: Ferrario, Mariana Inés . (2016-03-18). Estudio de la aplicación de luz UV pulsada y su combinación con otras tecnologías emergentes en matrices frutales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5935_Ferrario.pdf Cita tipo Chicago: Ferrario, Mariana Inés. "Estudio de la aplicación de luz UV pulsada y su combinación con otras tecnologías emergentes en matrices frutales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5935_Ferrario.pdf |
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Bush, Alan. "Robustez y sensibilidad en la respuesta a feromona de Saccharomyces cerevisiae" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las células deben sensar y responder a cambios en su ambiente para poder sobrevivir, reproducirse y desempeñar sus funciones fisiológicas. En particular, las células eucariotas usan muchos y variados mecanismos a en de transducir señales del exterior al interior de la célula. Uno muy importante es el que involucra a receptores acoplados a proteínas G heterotriméricas. Estos receptores de siete pasos de membrana, al ser ocupados por sus ligandos, catalizan el intercambio de GDP por GTP en la subunidad Gα de la proteína G asociada, lo que causa la disociación de la proteína G heterotrimérica en Gα y Gβγ. La respuesta a feromona sexual de levaduras es un sistema prototípico de este tipo de mecanismos, muy estudiado bioquímica y genéticamente. En esta vía de transducción de señales, la proteína de andamiaje Ste5 se une a Gβγ libre, lo que causa su reclutamiento a membrana y la activación de una cascada de MAP kinasas, resultando en arresto del ciclo celular y cambios en el patrón de expresión génica. Las curvas dosis-respuesta (DoR) a feromona medidas en distintos puntos de la vía de transducción, como ocupación del receptor, fosforilación de la MAPK del sistema o inducción transcripcional, muestran una sensibilidad muy similar, un fenómeno al que llamamos alineamiento de las curvas dosis-respuesta (DoRA). En esta tesis estudiamos de manera cuantitativa los primeros pasos en la activación de la respuesta a feromona en levaduras; la ocupación del receptor, la activación de la proteína G heterotrimérica y el reclutamiento a membrana de Ste5. Encontramos que el sistema es notablemente robusto a variaciones en la cantidad de receptores, algo que no es fácilmente explicable por la teoría clásica de receptores. Estudiamos el mecanismo responsable de esta robustez, cuyo punto de acción pudimos mapear río arriba del reclutamiento de Ste5. Construimos un modelo matemático completo de la interacción entre el receptor y la proteína G: el modelo Carrousel. El análisis del mismo nos sugirió un mecanismo por el cuál el sistema puede medir la fracción de receptores ocupados en lugar de la cantidad de los mismos, lo que además explica el fenómeno de DoRA. Este mecanismo depende de la interacción fósica reportada entre la proteína RGS (reguladora de la señalización por proteína G, que inactiva al sistema) y el receptor (que lo activa). Pudimos probar que cepas mutantes en las que esta interacción no está presente, no muestran robustez a la cantidad de receptores. Por otro lado medimos curvas DoR del cambio de localización de Ste5 en células con cantidades variables de Ste5. En base a esta información pudimos estimar la afinidad entre esta proteína de andamiaje y sus sitios de unión a membrana en células vivas, y cómo esta afinidad se modula durante la respuesta. Además, estudiamos el efecto de cambios en la abundancia de Ste5 sobre la respuesta, encontrando que la cantidad de esta proteína es un parámetro crítico del sistema. Abstract: Cells need to respond to changes in their environment to be able to survive and proliferate. Here, we study in a quantitative manner the pheromone response pathway in Saccharomyces cerevisiae, a canonical GPCR signal transduction system. Upon activation of the pathway, occupied receptors increase the exchange rate of GDP for GTP in the Gα subunit of the heterotrimeric G protein. This causes the dissociation of the G protein, liberating free Gβγ, which in turn recruits to the membrane the scaffold protein Ste5, activating the MAP kinase cascade and downstream effectors. Dose-response (DoR) curves measured at different activation steps of this pathway show very similar sensitivity, a phenomena we call dose-response alignment (DoRA). In this thesis we study the first activation steps of the pheromone response; receptor occupation by ligand, activation of the G protein and recruitment of Ste5. We found the system to be notoriously robust to changes in the levels of the receptors, something not easily explained by classical receptor theory. We mapped the mechanism responsible for this robustness upstream of Ste5 membrane recruitment. Therefore, we built a complete mathematical model of the G protein activation process: the Carrousel model. This model suggested that the system responds to the fraction of occupied receptor and not to the absolute amount of ligand-receptor complexes. As predicted by the model, this mechanism requires the reported physical interaction between the RGS of the system and the receptor, since disruption of this interaction abolishes robustness to receptor abundance. We also determined the affinity with which Ste5 binds to free Gβγ, causing its membrane recruitment. We determined this in live cells, and studied the way in which the affinity is modulated during the response. Furthermore, we studied the effect of changes in the abundance of Ste5, finding that the expression level of this protein is critical for a normal sensitivity of the response.
Cita tipo APA: Bush, Alan . (2016-03-18). Robustez y sensibilidad en la respuesta a feromona de Saccharomyces cerevisiae. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5892_Bush.pdf Cita tipo Chicago: Bush, Alan. "Robustez y sensibilidad en la respuesta a feromona de Saccharomyces cerevisiae". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5892_Bush.pdf |
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Belgorosky, Denise. "Rol del óxido nítrico en la progresión del cáncer de vejiga" (2016-03-18). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El óxido nítrico (NO) es un radical libre altamente reactivo, que puede actuar como mensajero intracelular e influir en el desarrollo tumoral. Resultados de nuestro grupo de investigación indican que la expresión de la enzima óxido nítrico (NO) sintasa inducible (iNOS) en tumores vesicales humanos es un factor de mal pronóstico que se asocia con recurrencias más tempranas y con un mayor grado histológico. Teniendo en cuenta que iNOS no se expresa en el urotelio vesical de individuos sanos, y que es una entidad clave del proceso inflamatorio, característico del cáncer de vejiga (CaV), surgió la hipótesis de que la inhibición de esta enzima puede ser un blanco terapéutico para pacientes cuyos tumores expresen iNOS. Para analizar esta hipótesis comenzamos estudiando el rol del NO como consecuencia de la expresión de iNOS, en la progresión del CaV. Para ello utilizamos un modelo murino de CaV que imita muy bien la patología en humanos. Cuando las líneas celulares MB49 y MB49-I son inoculadas en la vejiga de ratones singeneicos generan tumores no invasores del musculo (NMI) y tumores invasores del músculo detrusor (MI), respectivamente. La línea invasora MB49-I, expresa altos niveles de iNOS, y en consecuencia mayores niveles de NO, comparado con la línea MB49. Asimismo, posee incrementados varios pasos del proceso de invasión y metástasis como es su capacidad de migración e invasión, la actividad de enzimas proteolíticas, y la capacidad de generar metástasis pulmonares. Detectamos que el NO es un factor de sobrevida para células de CaV, que expresan iNOS y que al inhibirlo, se reduce la activación de vías de proliferación como la vía de las MAPK, y parámetros de progresión tumoral como la producción de enzimas proteolíticas, migración, angiogénesis y el crecimiento metástatico en pulmón. Analizamos, por otra parte las consecuencias de la inhibición de iNOS en el crecimiento tumoral empleando tres estrategias. La primera fue evaluar la actividad de L-NAME (inhibidor farmacológico pan NOS) de manera sistémica en ratones portadores de tumores de vejiga creciendo en el subcutáneo o en la vejiga de ratones singeneicos. La segunda, fue también una inhibición farmacológica, utilizando el inhibidor específico de iNOS 1400w, en forma local, y la tercera aproximación involucró el silenciamiento genético de la enzima iNOS en la línea invasora. Las tres estrategias mostraron resultados similares demostrando que tanto L-NAME sistémico, como 1400w local y la ablación genética reducen significativamente el crecimiento tumoral de células que expresan iNOS. Asimismo, hemos demostrado que los niveles urinarios de NO, determinados como nitrito, son un marcador de seguimiento en tumores de vejiga, y que la disminución de dichos niveles está asociado a una respuesta a tratamiento. Es así que proponemos que la inhibición de la actividad iNOS sería una terapia promisoria para pacientes cuyos tumores expresen la enzima. Abstract: Nitric oxide (NO) is a highly reactive free radical, which may act as an intracellular messenger and influence tumor development. Results of our research group indicate that the nitric oxide (NO) production through inducible nitric oxide synthase (iNOS) expression is a poor prognostic factor associated to earlier recurrences and progression in patients with bladder cancer (Bca). Since iNOS it is not express in bladder urothelium of healthy individuals, and it is a key on inflammatory processes, -characteristic of Bca-, we hypothesize that the inhibition of this enzyme may be a therapeutic target for Bca patients whose tumors express iNOS. To test this hypothesis we began studying the role of NO produced by iNOS, in Bca progression. We used a murine Bca model that mimics well the pathology in humans. When Bca cell lines MB49 and MB49-I were inoculated in bladders of syngeneic mice, non-muscle invasive tumors (NMI) and invasive muscle tumors (MI), respectively, were generated. Invasive MB49-I cell line expressed high levels of iNOS and therefore higher levels of NO, compared with MB49. Several properties involved in metastases and invasion such as the activity of proteolytic enzymes, migration ability and angiogénesis were higher in the invasive line. We detected that NO is a survival factor for Bca cells that express iNOS, and that inhibition of NO, reduced proliferation pathways, such as MAPK and parameters involved in tumor progression, like the activity of metalloproteinase, migration, angiogénesis and metastases development. We also analyze the consequences of iNOS inhibition in tumor growth, using three different strategies. The first one was administered systemically, L-NAME (pan NOS pharmacological inhibitor). The second one consisted on using 1400w (specific pharmacological iNOS inhibitor) directly on the bladder, and the third approach involved iNOS gene silencing in the invasive line. The three strategies showed similar results, demonstrating that systemically L-NAME, intravesical 1400w and iNOS genetic ablation, significantly reduced tumor growth of Bca cells. Several substances have been described as markers to monitor or predict patients with Bca, but none of them has proved to be useful enough. We have shown urinary levels of NO determined as nitrite, are a marker for monitoring bladder tumors and their reduction is associated with response to treatment. In conclusion, we propose iNOS inhibition as a promising therapy for Bca patients whose tumors express the enzyme.
Cita tipo APA: Belgorosky, Denise . (2016-03-18). Rol del óxido nítrico en la progresión del cáncer de vejiga. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5957_Belgorosky.pdf Cita tipo Chicago: Belgorosky, Denise. "Rol del óxido nítrico en la progresión del cáncer de vejiga". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-18. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5957_Belgorosky.pdf |
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Sahores, Ana. "Rol de la vía FGF2/FGFR en la resistencia a la terapia hormonal en cáncer de mama" (2016-03-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El 75% de los carcinomas mamarios expresan receptores de estrógenos (RE) y progesterona (RP) y son susceptibles a una terapia endocrina. Sin embargo, con el tiempo, algunos pacientes desarrollan resistencia (resistencia hormonal adquirida) y otros no responden al tratamiento desde el comienzo (resistencia constitutiva). En nuestro laboratorio, utilizando modelos de carcinomas mamarios murinos y humanos, hemos demostrado que los tumores respondedores a la terapia con el antiprogestágeno mifepristona (MFP) tienen mayor expresión de la isoforma A del RP (RPA) que de la isoforma B (RPB). A su vez, los tumores con resistencia constitutiva o adquirida, se caracterizan por manifestar la relación inversa (RPB>RPA). Se han propuesto diversas hipótesis para explicar los mecanismos que conducen a la resistencia endócrina, entre ellas, la activación constitutiva de vías de transducción de señales. La vía que involucra al FGF2 y sus receptores está constituida por cuatro receptores (FGFR1-4) y cinco isoformas de FGF2 con distinto peso molecular: la isoforma de 18 kDa o LMW-FGF2 y las de alto peso o HMW-FGF2 de 22; 22,5; 24 y 34 kDa. En trabajos previos demostramos que, en muestras de carcinomas mamarios humanos, existe una asociación significativa entre la expresión de FGFR2 y REα; también observamos una correlación positiva entre la expresión de FGFR1 y un alto grado histológico. Demostramos también que, en tumores sensibles a la terapia endocrina, el FGFR2 activado por el FGF2 estromal participa en el crecimiento tumoral a través de la activación de los RP. Si bien se ha demostrado que la vía del FGF2/FGFR se encuentra desregulada en numerosas neoplasias y patologías del desarrollo, en muestras de pacientes con cáncer de mama aún es controvertida la asociación entre la expresión de FGF2 y el pronóstico de la enfermedad. En base a estos antecedentes, nuestra hipótesis de trabajo es que durante la adquisición de la resistencia endocrina se produce un cambio en la expresión y señalización de FGF2 que favorece el crecimiento y la progresión tumoral. Nuestro objetivo general fue evaluar el rol de la vía FGF2/FGFR en el crecimiento y la progresión del cáncer de mama. En primer lugar, utilizamos el modelo murino de carcinomas mamarios generados en nuestro laboratorio. Observamos, tanto por inmunohistoquímica como por Western blot, que las variantes resistentes de tres familias tumorales diferentes (C4, 59 y C7) expresan mayores niveles de FGFR1 y FGF2 que los tumores sensibles. Por inmunohistoquímica, observamos que el FGF2 se localiza predominantemente en el epitelio o en el estroma tumoral de las variantes resistentes y sensibles, respectivamente. Es interesante observar que, el análisis de la expresión de las distintas isoformas de FGF2 reveló que las variantes resistentes expresan mayores niveles de las isoformas HMW-FGF2 que las variantes sensibles. Asimismo, mediante ensayos de ELISA mostramos que, en los tumores resistentes adquiridos y constitutivos, la localización es mayormente intracelular y extracelular, respectivamente. Luego, evaluamos la funcionalidad de la vía de FGF2/FGFR en cultivos primarios de células epiteliales de las tres familias tumorales. Observamos que el agregado de LMW-FGF2 estimula la proliferación celular de tumores sensibles y resistentes constitutivos, pero no afecta la proliferación celular de los tumores resistentes adquiridos de la familia C4. Por otra parte, el tratamiento con dos inhibidores distintos de FGFR, PD 173074 y BGJ398, inhibe significativamente la proliferación celular basal e inducida por LMW-FGF2 en las tres familias tumorales, lo que indica un rol proliferativo de esta vía. Sin embargo, al realizar ensayos in vivo con el inhibidor BGJ398, éste sólo reduce parcialmente el crecimiento tumoral de las variantes C4-HI (sensible) y C7-HI (resistente constitutiva). El inhibidor no tuvo efectos significativos sobre el crecimiento tumoral de las variantes resistentes de la familia C4, aunque indujo signos de regresión tumoral temprana en todas las variantes tumorales ensayadas (C4-HI, C4-2-HI, C4-HIR, 59-HI, C7-HI). Las diferencias en el alcance de los efectos observados en cultivo e in vivo sugieren que deben desarrollarse inhibidores con mayor eficacia in vivo. En conjunto, los resultados obtenidos con el modelo murino muestran una correlación positiva entre la expresión de HMW-FGF2 y FGFR1 con la resistencia hormonal y sugieren que, en la progresión tumoral, habría un aumento en la expresión de HMW-FGF2 y FGFR1 en el epitelio tumoral. Este aumento conduce a un cambio de una señalización paracrina en las variantes sensibles, a una autocrina o intracrina en los tumores resistentes constitutivos o adquiridos, respectivamente. A continuación, validamos los resultados en un modelo de cáncer de mama humano, para lo cual utilizamos la línea celular T47D-WT y sus variantes: la línea T47D-YA, con alta expresión de RPA y sensible a MFP, y la línea T47D-YB, con alta expresión de RPB y resistente a MFP. Por inmunofluorescencia, inmunohistoquímica y Western blot, observamos que la línea T47D-YB expresa mayores niveles de FGFR1, FGFR2 y HMW-FGF2 respecto de la línea T47DYA. Por otro lado, el agregado de LMW-FGF2 estimula la proliferación celular en las líneas T47D-WT e -YA pero no altera su proliferación en las células T47D-YB. La línea resistente presenta mayor actividad basal de la vía de FGF2/FGFR, ejemplificada en la fosforilación de FRS2 y activación predominantemente de la vía de AKT, en comparación con la línea sensible. El LMW-FGF2 modularía principalmente la activación de las vías mencionadas en las líneas T47D-WT e -YA, lo que sugiere una activación constitutiva en la línea resistente. El BGJ398 inhibe significativamente la proliferación celular basal e inducida por LMW-FGF2 en las tres líneas celulares, indicando que la vía de FGF2/FGFR cumple un rol proliferativo. Finalmente, generamos variantes de la línea T47D-YA que sobreexpresan las isoformas de 18 y 22,5 kDa de FGF2 y evaluamos su efecto sobre la sensibilidad a MFP, TLP y TAM. En ensayos de recuento celular observamos que la sobreexpresión de las isoformas de 18 y 22,5 kDa promovió un aumento en la tasa de proliferación celular y resistencia al tratamiento endocrino en comparación con la línea T47D-YA infectada con el plásmido vacío (T47D-YA-Vac). La resistencia a MFP se mantuvo aún en ensayos in vivo y se observaron signos de malignidad en los tumores primarios, particularmente en la línea T47D-YA-22,5. Esto se evidenció en la capacidad para invadir tejidos adyacentes al tumor, como piel, músculo y tejido adiposo. Si bien algunos de los animales portadores de tumores T47D-YA-Vac e -YA-18 kDa focos metastásicos en los pulmones, 100% de los ratones con T47D-YA-22,5 presentaron metástasis pulmonares y un mayor número de focos con respecto a T47D-YA-Vac e -YA-18 kDa. Nuestras observaciones indican que el FGF2 promueve el crecimiento tumoral en ambas variantes, sensibles y resistentes. Sin embargo, los resultados sugieren que, en los tumores sensibles, el estroma proveería el FGF2 que induciría el crecimiento tumoral a través de sus receptores de membrana y el RP de forma paracrina. Por otro lado, en los tumores resistentes, el propio parénquima tumoral expresaría elevados niveles de FGF2 (particularmente LMW-FGF2) y que, a través de un loop autocrino que involucra al FGFR1, gatillaría señales de proliferación, independientemente de la presencia de progestágenos o antiprogestágenos. No descartamos que exista también un loop intracrino, donde el FGF2 intracelular, particularmente las HMW-FGF2, serían responsables de la proliferación celular, resistencia a endocrina y diseminación metastásica. Nuestros estudios contribuyen a esclarecer el rol de las isoformas de FGF2 en la progresión tumoral mamaria y representan la primera evidencia de resistencia hormonal vinculada a HMW-FGF2. Abstract: Two-thirds of breast cancers express estrogen and progesterone receptors (ER and PR, respectively) and are standard targets for endocrine therapy. Most tumors initially respond to endocrine therapy, but many will eventually develop resistance (acquired hormone resistance) while others will fail to respond from the beginning (constitutive hormonal resistance) despite expressing hormone receptors. In our lab, using murine and human mammary carcinomas, we have demonstrated that tumors which respond to antiprogestin therapy (mifepristone; MFP) express higher levels of the isoform A of PR (PRA) than the isoform B (PRB), whereas tumors with constitutive or acquired hormonal resistance have the inverse ratio (PRB>PRA). Many hypothesis have been proposed to explain the mechanisms that lead to endocrine resistance, among them, the constitutive activation of proliferative pathways. In humans, the FGF2/FGFR pathway is formed by four receptors (FGFR1-4) and five FGF2 isoforms with different molecular weight: low molecular weight isoform or LMW-FGF2 of 18 kDa and high molecular weight isoform or HMW-FGF2 of 22; 22,5; 24 and 34 kDa. In previous experiments and using human breast cancer samples, we found a significant association between the expression of FGFR2 and ERα, and reported a positive correlation between the expression of FGFR1 and a higher histological grade. We also demonstrated that stromal FGF2 activates FGFR2 and PR pathways, inducing tumor growth in hormone responsive carcinomas. It has been proved that the FGF2/FGFR pathway is dysregulated in numerous neoplasias and developmental pathologies. However, its association with breast cancer progression is still controversial. Taking into account these findings, our working hypothesis is that during tumor progression there is a switch in FGF2 expression and signaling that favors tumor growth and progression. Our main goal, therefore, was to study the role of the FGF2/FGFR pathway in breast tumor growth and progression. We used a murine model of mammary carcinomas developed in our laboratory. By immunohistochemistry and Western blot assays, we observed that all the resistant variants of three different tumor families (C4, 59 y C7) express higher FGFR1 and FGF2 levels than the responsive variants. By immunohistochemistry assays we observed that FGF2 labeling was predominantly localized in the epithelium and in the tumor stroma of the resistant and responsive variants, respectively. Analysis of the expression of the different FGF2 isoforms revealed that the resistant variants express higher levels of total FGF2, especially HMW-FGF2, compared to the responsive variants. We confirmed these findings using an ELISA assay and observed that acquired and constitutive resistant tumors differ in their FGF2 localization; whereas the former predominantly accumulate it within the cell, the latter also secrete it to the conditioned media. Next, we studied the activity of the FGF2/FGFR pathway in primary cultures of epithelial cells from three tumor families (C4, 59, and C7). Treatment with LMW-FGF2 induced cell proliferation in responsive and constitutive resistant tumors, though failed to affect cell proliferation of acquired resistant tumors of the C4 family. Furthermore, treatment with two different FGFR inhibitors, PD 173074 and BGJ398, significantly inhibited basal and FGF2- induced cell proliferation in the three tumor families, indicating a proliferative role of FGF2/FGFR pathway. In in vivo experiments, BGJ398 only inhibited tumor growth of C4-HI (responsive) and C7-HI (constitutive resistant) tumors. However, blocking the pathway induced early signs of regression in all evaluated variants (C4-HI, C4-2-HI, C4-HIR, 59-HI, and C7-HI). The observed differences in the in vitro and in vivo assays suggest that more efficient inhibitors should be developed. Altogether, these findings show a positive correlation between HMW-FGF2, FGFR1 expression, and hormone resistance. Moreover, during tumor progression there would be an increase in HMW-FGF2 and FGFR1 expression in the tumor epithelium, leading to a switch from a paracrine signaling in the responsive variants to an autocrine or intracrine loop in constitutive and acquired resistant tumors, respectively. Later, we validated the results in a human breast cancer model using the T47D-WT cell line and its variants: T47D-YA with high expression of PRA and responsive to MFP, and T47D-YB with high expression of PRB and resistant to MFP. By immunofluorescence, immunohistochemistry and Western blot, we observed that T47D-YB cells express higher levels of FGFR1, FGFR2, and HMW-FGF2 compared to the T47D-YA cells. By contrast, treatment with LMW-FGF2 induces cell proliferation only in T47D-WT and -YA cells and does not affect cell proliferation in the -YB line. The resistant variant presents higher basal activation of the FGF2/FGFR pathway, evidenced by phosphorylation of FRS2 and activation of the AKT pathway, compared to the responsive cell line. Consistent with the results obtained in the murine model, LMW-FGF2 regulates the activation of the mentioned pathways only in T47D-WT and -YA cells, suggesting a constitutive activation in the resistant cell line. Treatment with BGJ398 significantly inhibits basal and FGF2-induced cell proliferation in the three cell lines, indicating that the FGF2/FGFR pathway has a proliferative role in these cell lines. Finally, we generated T47D-YA cell line variants over-expressing the 18 and 22,5 kDa FGF2 isoforms, and studied their effect over MFP, TLP, and TAM sensibility. The over-expression of both isoforms increased cell proliferation and conferred resistance to endocrine therapy compared to the T47D-YA cell line infected with the control plasmid (T47D-YA-Vac). The MFP resistance was confirmed in in vivo assays and interestingly, we even observed malignant signs in the primary tumors, particularly in the YA-22,5 kDa cell line. These tumors were able to invade adjacent tissue, such as skin, muscle, and adipose tissue. Only some animals bearing -YA-Vac and -YA-18 kDa primary tumors registered lung metastasis, while 100% of the mice bearing -YA 22,5 kDa tumors presented lung metastasis and had more foci compared to YA-Vac and -YA-18 kDa. Our results suggest that FGF2 promotes tumor growth in both responsive and resistant tumor variants. However, we believe the underlying mechanisms are not the same, given that in responsive variants the stroma is the main producer of FGF2, which induces tumor growth through its membrane receptors and PR forming a paracrine loop. In resistant tumors, the parenchyma expresses high levels of FGF2 (mostly LMW-FGF2) that triggers proliferative and survival signals through an autocrine loop involving membrane FGFR1, regardless of the presence of progestins or antiprogestins. We still cannot rule out the existence of an intracrine loop, where the intracellular FGF2 (mostly HMW-FGF2) would be responsible for cell proliferation, resistance to antiprogestins, and metastatic dissemination. Altogether, these findings help to clarify the role of the FGF2 isoforms in breast tumor progression and are the first evidence of endocrine resistance associated to HMW-FGF2.
Cita tipo APA: Sahores, Ana . (2016-03-17). Rol de la vía FGF2/FGFR en la resistencia a la terapia hormonal en cáncer de mama. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5943_Sahores.pdf Cita tipo Chicago: Sahores, Ana. "Rol de la vía FGF2/FGFR en la resistencia a la terapia hormonal en cáncer de mama". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5943_Sahores.pdf |
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Perez-Santangelo, Ma. Soledad. "El rol de los genes LSM en la regulación de los ritmos circadianos" (2016-03-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Los relojes circadianos son mecanismos auto-regulatorios endógenos que controlan la periodicidad de múltiples procesos biológicos. Éstos proporcionan a los organismos una ventaja adaptativa que permite sincronizar distintos eventos fisiológicos y del desarrollo al momento más adecuado del día. La regulación del reloj circadiano ocurre principalmente mediante circuitos de retroalimentación transcripcional. Sin embargo, estudios recientes muestran que se requiere de mecanismos post-transcripcionales para el correcto funcionamiento del reloj. Uno de estos mecanismos es el splicing alternativo, mediante el cual se producen múltiples variantes de ARNm a partir de un único gen. En esta tesis se caracterizó el comportamiento circadiano de mutantes de factores de splicing cuyos transcriptos están regulados por el reloj. Se encontró que mutaciones en los genes LSM5 y LSM4, que codifican para componentes del complejo spliceosomal U6 snRNP, alteran el período circadiano. Un análisis global del transcriptoma de ambas mutantes reveló enriquecimiento en genes implicados en la regulación de la transcripción y respuestas de estrés, así como alteraciones en el splicing alternativo de un subconjunto de genes, incluyendo genes centrales y de vías de salida del reloj. Los genes LSM también forman parte de otro complejo involucrado en el decaimiento del ARNm. Dado que LSM4 y LSM5 son parte de los dos complejos nos preguntamos si parte del efecto circadiano observado era debido a su rol sobre el decaimiento de ARNm. Se encontró que mutaciones en varios genes involucrados en decaimiento de ARNm también generan alteraciones en los ritmos circadianos. Estos resultados apoyan la idea de que ciertos genes LSM desempeñan un rol en los ritmos circadianos, mediante la regulación del splicing alternativo y del decaimiento de ARNm, lo cual contribuye a la sincronización de los ritmos biológicos con cambios ambientales. Abstract: Circadian clocks are endogenous self-regulatory mechanisms that control the periodicity of multiple biological processes. These provide organisms with an adaptive advantage that allows them to synchronize different physiological and developmental events to the most appropriate time of day. The regulation of the biological clock occurs mainly through transcriptional feedback loops. However, recent studies show that post-transcriptional mechanisms are required for proper functioning of the clock. One of these mechanisms is alternative splicing, a process through which multiple mRNA variants are produced from a single gene. In this thesis we characterized the circadian behavior of splicing factors mutants, affected in genes whose transcripts are regulated by the clock. We found that mutations in LSM5 and LSM4 genes, encoding U6 snRNP spliceosomal complex components, change the circadian period. Genome-wide transcriptome analysis of both mutants revealed enrichment in genes involved in transcriptional regulation and stress responses, as well as changes in alternative splicing of a subset of genes, including central and output clock genes. The LSM genes are also part of another complex involved in mRNA decay. Since LSM5 and LSM4 are part of both complexes, we wondered if part of the circadian effect observed in the mutants was due to their role on mRNA decay. We found that mutations in other genes involved in mRNA decay also generate changes in circadian rhythms. These findings support the idea that some LSM genes play a role in circadian rhythms through the regulation of alternative splicing and mRNA decay, which helps synchronize biological rhythms with environmental changes.
Cita tipo APA: Perez-Santangelo, Ma. Soledad . (2016-03-17). El rol de los genes LSM en la regulación de los ritmos circadianos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5921_PerezSantangelo.pdf Cita tipo Chicago: Perez-Santangelo, Ma. Soledad. "El rol de los genes LSM en la regulación de los ritmos circadianos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5921_PerezSantangelo.pdf |
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De Rossi, María Cecilia. "Dinámica y transporte de organelas en células vivas estudiados por técnicas de partícula única" (2016-03-17). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La organización intracelular depende de motores moleculares, proteínas que transportan diversos componentes celulares con una alta precisión espacio-temporal. En los últimos años, el desarrollo de nuevas técnicas de molécula y partícula única aplicadas a motores aislados han provisto información valiosa sobre las propiedades biomecánicas de estas proteínas. Sin embargo, el mecanismo de acción de las mismas en las células aún se desconoce. El objetivo general del presente trabajo es comprender los principios que gobiernan la dinámica de organelas en células vivas. Utilizando técnicas avanzadas de microscopía y de seguimiento de partícula única, estudiamos los procesos difusivos y activos que experimentan las organelas en el entorno citoplasmático. Por un lado, exploramos cómo diversos componentes del citoesqueleto influyen en el transporte conducido por motores moleculares en la célula. En una segunda instancia, evaluamos cómo se ve afectada la dinámica del transporte bidireccional al variar las propiedades biofísicas de los motores moleculares involucrados. Los resultados obtenidos nos permitieron construir un modelo teórico para comprender ciertos aspectos claves del transporte activo en células vivas. Abstract: Molecular motors transport a wide variety of cellular components in the cytoplasm with high spatio-temporal accuracy ensuring the correct organization within the cell. In recent years, the development of new single molecule and single particle techniques applied to isolated motors have provided valuable information on the biomechanical properties of these proteins. However, the mechanism of action of motors in living cells is still poorly understood. The aim of this study was to understand the principles that govern the intracellular dynamics of organelles in living cells. We used advanced optical microscopy and single particle tracking techniques to study the diffusive and active processes experienced by organelles in the complex cytoplasmic environment. First, we explored how different cytoskeleton components influence the transport driven by molecular motors in the cell. Then, we assessed how the biophysical properties of molecular motors affect the dynamics of transport. The obtained results allowed us to construct a theoretical model to understand certain key aspects of transport in living cells.
Cita tipo APA: De Rossi, María Cecilia . (2016-03-17). Dinámica y transporte de organelas en células vivas estudiados por técnicas de partícula única. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5895_DeRossi.pdf Cita tipo Chicago: De Rossi, María Cecilia. "Dinámica y transporte de organelas en células vivas estudiados por técnicas de partícula única". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-17. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5895_DeRossi.pdf |
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Jaramillo Ortiz, José Manuel. "Desarrollo de candidatos vacunales contra Babesia bovis basados en vectores virales y proteínas recombinantes" (2016-03-16). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La babesiosis bovina es una enfermedad parasitaria trasmitida por garrapatas y causada por los protozooarios intraeritrocíticos Babesia bovis y B. bigemina. Esta infección provoca importantes pérdidas económicas en varias regiones tropicales y subtropicales del mundo donde el vector está presente. En nuestro país, la zona ganadera afectada incluye el noreste y noroeste por encima del paralelo 33°S en donde la garrapata vector Rhipicephalus microplus encuentra las condiciones ecológicas adecuadas para su desarrollo. La vacunación contra la babesiosis bovina es una de las medidas de control existente para esta parasitosis y se realiza en terneros menores a los nueve meses de edad utilizando principalmente hemovacunas refrigeradas a base de cepas vivas atenuadas de estos parásitos. Si bien esta vacuna es efectiva en una única dosis, confiriendo protección durante toda la vida útil del bovino, presenta algunas desventajas en su producción, vida media y logística de distribución. Por este motivo, el desarrollo de alternativas vacunales que superen estas dificultades resulta de interés para mejorar las condiciones sanitarias de la región y aumentar la competitividad del sector. En este presente trabajo de tesis, se han desarrollado tres candidatos vacunales basados en las regiones inmunodominantes de tres antígenos de B. bovis altamente conservados e inmunodominantes para el bovino; estos son las proteínas MSA-2c (del inglés, Merozoite Surface protein – 2c), RAP-1 (Rhoptry Associated Protein – 1) y HSP20 (Heat Shock Protein 20). Estos 3 antígenos se han obtenido en dos plataformas de expresión diferentes: como vectores virales no replicativos y como proteínas recombinantes. El primer candidato es un virus vaccinia Ankara modificado (rMVA), un poxvirus no replicativo que codifica en un único marco de lectura estas tres regiones antigénicas como un multiantígeno al que denominamos rMABbo. Asimismo se ha desarrollado un Adenovirus recombinante (rAd) que codifica el mismo multiantígeno. También, se han obtenido en un sistema procariota las tres proteínas por separado y el multiantígeno recombinante como única poliproteína. Con los tres inmunógenos desarrollados, se estudió la respuesta inmune celular y humoral inducida por los mismos en el modelo murino en esquemas de vacunación “prime – boost” homólogos y heterólogos. Los resultados mostraron que la vacunación heteróloga que combinó el prime con rAd o con el rMABbo y el boost con el virus rMVA resultaron ser más efectivas que sus esquemas homólogos, pudiendo detectarse en ambos tipos de esquemas heterólogos altos títulos de anticuerpos específicos de tipo IgG con una mayor proporción del isotipo IgG2a, niveles significativos de IFN secretado y un alto porcentaje de células CD4+ y CD8+ productoras de una y ambas citoquinas de perfil Th1: IFNγ y TNFα Los aportes de este trabajo de tesis permitieron desarrollar nuevos inmunógenos recombinantes basados en un diseño racional de antígenos y plataformas de expresión para optimizar la respuesta inmune protectiva hacia Babesia bovis. Además se ha caracterizado la respuesta inmune inducida en el modelo murino, permitiendo dilucidar los aspectos claves a tener en cuenta para seleccionar la mejor estrategia vacunal a ser evaluada frente al desafío con Babesia bovis en bovinos, único modelo biológico para este parásito. Abstract: Bovine babesiosis is a tick – borne disease caused by the intraerythrocytic protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina. This infection causes economic losses in tropical and subtropical areas where the tick is present. In Argentina, the livestock area affected includes the northeast and northwest of the parallel 33° S, where the natural vector Rhipicephalus (Boophilus) microplus finds the ecological conditions for its development. To prevent babesiosis outbreaks in endemic areas, 4-9-month-old calves are vaccinated with live attenuated strains of both parasites. Even though these vaccines are effective in a single dose, conferring protection throughout the life of the bovine, they have some disadvantages in their production, half-life and distribution logistics. Hence, the development of alternative vaccines to overcome these difficulties is of great interest to improve sanitary conditions in order to increase the competitiveness of the livestock production. In this present work, three vaccine candidates have been developed. These immunogens are based on the immunodominant regions of three highly conserved B. bovis antigens that are also immunodominant for cattle: MSA-2c (Merozoite Surface protein - 2c), RAP-1 (Rhoptry Associated Protein - 1) and HSP20 (Heat Shock Protein 20). These three antigens were obtained on two different expression platforms: as non-replicative viral vectors and as recombinant proteins. The first candidate is a recombinant modified vaccinia Ankara vector (rMVA), a nonreplicative poxvirus which encodes an open reading frame of a multi-antigen (rMABbo) . This multi-antigen includes B and T cells epitopes of the three antigens mentioned above. In addition, a recombinant adenovirus (rAd) expressing the same rMABbo was developed. Besides, the complete rMABbo and each of the three antigens were expressed separately in E.coli and purified by affinity chromatography for delivery as subunit vaccines. The humoral and cellular immune responses induced by the three vaccine candidate were evaluated in both homologous and heterologous prime – boost immunizations. The results show that heterologous immunization combining the rAd or the rMABbo as a prime, with rMVA as a boost elicit the most effective immune response in terms of high specific IgG antibody titters with a major IgG2a subclass proportion (indicating a Th1 immune response), a significant level of secreted IFNγ and high percentages of both CD4+ and CD8+ T cells producing both IFNγ and TNFα cytokines. The present work contributes to the development of a new generation vaccine candidates based on a rational design and antigen expression platforms to optimize the protective immune response to Babesia bovis. The characterization of the immune response in the murine model is also an accessible approach to optimize the best vaccination strategy to be evaluated in cattle which is the only biological model against Babesia bovis infection.
Cita tipo APA: Jaramillo Ortiz, José Manuel . (2016-03-16). Desarrollo de candidatos vacunales contra Babesia bovis basados en vectores virales y proteínas recombinantes. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6007_JaramilloOrtiz.pdf Cita tipo Chicago: Jaramillo Ortiz, José Manuel. "Desarrollo de candidatos vacunales contra Babesia bovis basados en vectores virales y proteínas recombinantes". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-16. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6007_JaramilloOrtiz.pdf |
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Roesler, Carlos Ignacio. "Conservación del Macá Tobiano (Podiceps gallardoi): factores que afectan la viabilidad de sus poblaciones" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La tasa actual de extinción de especies ha aumentado al menos dos órdenes de magnitud respecto a los valores históricos del registro fósil por lo que la conservación de la biodiversidad se ha vuelto prioritaria en Biología. El Macá Tobiano se encuentra entre las c. 220 especies de aves enpeligro crítico de desaparecer y es la única que se distribuye casi exclusivamente en Argentina. Fue descubierto por la ciencia occidental en 1974 en las mesetas de altura del oeste de la provincia de Santa Cruz, donde se reproduce. Durante el invierno migra hacia las rías y estuarios de los grandes ríos de la misma provincia. Hasta mediados de la década de 1990’s se estimaba que la población incluía entre 3000 y 5000 individuos, pero a mediados del 2000’s se detectó una importante reducción poblacional. El objetivo de esta Tesis fue evaluar la viabilidad de las poblaciones y generar información que permita realizar acciones de conservación y manejo con base científica. Se estudió la historia natural, tendencias poblacionales recientes, éxito reproductivo, comportamiento migratorio y su consecuencias en la estructuración genética (ADNmt), y el impacto de las especies invasoras sobre la especie. Se realizaron un total 1041 días/hombre de trabajo de campo, en c. 450 lagunas de nueve mesetas de altura del oeste de Santa Cruz. Se realizaron censos poblacionales, seguimiento regular de las colonias de nidificación, se marcaron y se tomaron muestras de sangre de individuos y se evaluó la presencia de tres especies invasoras que constituyen una amenaza para el Macá Tobiano (el Visón Americano Neovison vison, la Trucha Arcoíris Oncorhynchus mykiss y la Gaviota Cocinera Larus dominicanus). Se encontró que la población global del Macá Tobiano se redujo mas de un 80% en 25 años, que la reducción no fue homogénea en toda su distribución y que los factores causales de esta heterogeneidad varían de meseta a meseta. El éxito de reclutamiento (juveniles que llegan a la edad de la migración por intento de nidificación) fue variable entre temporadas y estuvo muy influenciado por las características de las lagunas en las que ocurrió la nidificación. Las causas principales que afectaron el éxito reproductivo fueron de origen climático, principalmente las tormentas de viento, aunque todos los factores de amenaza detectados tienen un efecto negativo sobre el reclutamiento. El marcado de individuos y los censos poblacionales mostraron que existe un comportamiento migratorio de tipo filopátrico. Esta filopatría se vio además reflejada en una estructuración genética de las poblaciones de distintas mesetas. Las especies invasoras afectaron al macá en distintas etapas del ciclo de vida y en diferentes zonas de la distribución. Los resultados indican que la población se habría reducido como resultado de una multiplicidad de factores, por lo que deben desarrollarse una variedad de acciones de manejo para proteger las poblaciones remanentes. Estas acciones deben realizarse diferencialmente en las distintas etapas del ciclo de vida y en las distintas mesetas. En función de las primeras experiencias de medidas de manejo aplicadas, se concluye que la conservación del Macá Tobiano depende hoy de la aplicación de acciones de conservación directa. Asimismo, resulta muy importante continuar con los estudios sobre las principales amenazas que enfrentan las poblaciones del Macá Tobiano y de los aspectos aún desconocidos de su biología. Abstract: The extinction rate of the species has increased by at least two orders of magnitude compared to the historical values of fossil records, which is why the conservation of biodiversity has become a priority in biology. The Hooded Grebe is among the c. 220 critically endangered bird species and it is the only one with a distribution almost exclusively within Argentina. It was discovered in 1974 in the highland plateaus of the western Santa Cruz province, where it reproduces. During winter it migrates to the estuaries of the same province. During the mid 1990’s the population was estimated at 3000 to 5000 individuals, but by mid 2000’s, a drastic reduction of the population was detected. The objective of this Thesis was to assess the viability of the populations and to generate information that will lead to conservation actions and management with a scientific basis. Studies on its natural history, recent population trends, reproductive success, migratory behavior and its consequences in the genetic structure of the population were carried out, as well as the impact of alien species on the viability of the populations. A total amount of 1041 man-days of fieldwork was carried out on the c. 450 lakes of nine highland plateaus in west Santa Cruz province, including population censuses, regular monitoring of the breeding colonies, marking of individuals, blood samples collection and evaluation of the presence of invasive species which present a threat to the Hooded Grebe: the American Mink Neovison vison, the Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss, and the Kelp Gull Larus dominicanus. Results showed that the global population of the Hooded Grebe was reduced by more than 80% in the past 25 years, that this reduction was not homogeneous in all its distribution and that the causing factors of this heterogeneity varied from one plateau to another. The recruitment rate (juveniles that reach to migration per reproductive pair) varied between seasons and was influenced heavily by the characteristics of the lakes where breeding had occurred. The main causes that affected the reproductive success had climatic origins (such as windstorms), but all threat factors found were shown to have a negative impact on recruitment. The marking of individuals and population censuses showed the existence of a philopatric migratory behavior. This philopatry was also reflected in the genetic structure among populations in different plateaus. Each of the invasive species affected the Hooded Grebe in different stages of its lifecycle and on different areas of its distribution. The results indicate that the population has been reduced as a result of a multiplicity of factors, which is why a variety of management actions need to be developed in order to protect the remaining populations of the Hooded Grebe. These actions must be carried out differently in the distinct lifecycle stages and plateaus. According to the first management measures applied, it can be concluded that the conservation of the Hooded Grebe nowadays depends on the implementation of direct conservation actions. Also, it will be very important to carry out further studies on the main threats that the Hooded Grebe populations face and the yet unknown aspects of its biology.
Cita tipo APA: Roesler, Carlos Ignacio . (2016-03-15). Conservación del Macá Tobiano (Podiceps gallardoi): factores que afectan la viabilidad de sus poblaciones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5958_Roesler.pdf Cita tipo Chicago: Roesler, Carlos Ignacio. "Conservación del Macá Tobiano (Podiceps gallardoi): factores que afectan la viabilidad de sus poblaciones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5958_Roesler.pdf |
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Rodrígues Ferreira Maltez, Darío Pablo. "Detección de radionucleidos cosmogénicos mediante la técnica de espectrometría de masas con aceleradores" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Una extensa variedad de radionucleidos son producidos por la interacción de los rayos cósmicos de alta energía con la atmósfera de nuestro planeta y con el polvo interplanetario que eventualmente puede arribar a él. Entre estos radionucleidos se encuentran el 10Be (T1/2 ~ 1,4 x 10^6 a˜nos) y el 53Mn (T1/2 ~ 3,7 x 10^6 a˜nos), que gracias a sus largos períodos de semidesintegración, resultan adecuados como trazadores en procesos de interés geofísico cuyos tiempos característicos son del orden de los millones de a˜nos. Además, el 53Mn, por producirse esencialmente fuera de nuestro planeta, es un excelente trazador de la depositación de material extraterrestre sobre la Tierra. Debido a sus concentraciones, de una parte en 10^9 hasta una parte en 10^15 respecto de sus isótopos estables, y actividades específicas extremadamente bajas, estos radionucleidos sólo pueden ser identificados y cuantificados mediante la técnica de espectrometría de masas con aceleradores (AMS). En este trabajo se aplicó la técnica AMS para la detección de estos radionucleidos con el objeto de estudiar el reciclado de sedimentos submarinos durante la subducción de placas tectónicas y la tasa de depositación de polvo interplanetario en nuestro planeta. En el primer caso las muestras analizadas fueron cenizas y rocas volcánicas y sedimentos extraídos de hasta 250 metros de profundidad por debajo del fondo submarino. En el segundo caso, se analizó una muestra de 1.400 kg de nieve antártica. Todas las muestras fueron procesadas químicamente para la extracción y concentración del elemento de interés y la supresión del isóbaro que interfiere en las mediciones de AMS. Las mediciones de las relaciones isotópicas fueron llevadas a cabo utilizando cuatro aceleradores de diferentes laboratorios, aprovechando las ventajas técnicas de cada uno. Finalmente, mediante el modelado de estos procesos y sobre la base de los resultados obtenidos fue posible determinar rangos para el porcentaje de sedimentos submarinos que participan de la formación de magmas durante la subducción de la placa tectónica de Nazca y establecer una cota superior para la cantidad de polvo interplanetario que ingresa a nuestro planeta. Además de estas dos aplicaciones geofísicas, en el marco de este trabajo se implementó la técnica AMS en las instalaciones del Acelerador TANDAR de forma cuantitativa. Para ello se construyó un sistema de detección que, haciendo uso de las altas energías posibles en este acelerador, permitió la identificación del radionucleido 10Be con la completa supresión de su isóbaro estable 10B. De este modo, se consiguieron en el Acelerador TANDAR, mediciones de relaciones isotópicas 10Be/9Be tan bajas como 5 x 10^−13, nivel de sensibilidad suficiente para realizar la mayoría de los estudios geofísicos con este radionucleido. Abstract: A wide variety of radionuclides are produced by the interaction of high-energy cosmic rays with the Earth’s atmosphere and with the interplanetary dust that can eventually reach it. Among these radionuclides are the 10Be (T1/2 ~ 1,4 x 10^6 years) and 53Mn (T1/2 ~ 3,7 x 10^6 years), that thanks to its long half-lives, are suitable as tracers in processes of geophysical interest whose characteristic times are of the order of millions of years. In addition, the 53Mn is an excellent tracer for deposition of extraterrestrial material on Earth because is essentially produced outside our planet. Due to its concentrations of one part in 10^9 to a part in 10^15 with respect to their stable isotopes, and extremely low specific activities, these radionuclides can only be identified and quantified by Accelerator Mass Spectrometry (AMS) technique. In this work, we applied the AMS technique for the detection of these radionuclides in order to study the marine sediment recycling during subduction of tectonic plates and the deposition rate of interplanetary dust on our planet. In the first case, the analyzed samples were volcanic ashes and sediments taken from up to 250 meters deep below the seabed rocks. In the second case, a sample of 1400 kg of Antarctic snow was analyzed. All samples were chemically processed for extraction and concentration of the element of interest and for suppressing the interfering isobar in AMS measurements. The measurements of isotopic ratios were carried out using four different accelerators, taking advantage of the technical characteristics of each one. Finally, by modeling these processes and on the basis of the results obtained it was possible to determine the ranges of percentage of submarine sediments involved in the formation of magmas during the subduction of the Nazca tectonic plate and, set an upper limit for the amount of interplanetary dust entering our planet. Besides these two geophysical applications, in the context of this work, the AMS technique was quantitatively implemented in TANDAR accelerator facility. For this, capitalizing the high potential energy in this accelerator, a detection system was built. It allowed the identification of radionuclide 10Be with complete suppression of its stable isobar 10B. Thus, 10Be/9Be isotope ratio measurements as low as 5 x 10^−13 were achieved in the accelerator TANDAR, sensitive enough for most geophysical studies with this radionuclide.
Cita tipo APA: Rodrígues Ferreira Maltez, Darío Pablo . (2016-03-15). Detección de radionucleidos cosmogénicos mediante la técnica de espectrometría de masas con aceleradores. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5944_RodriguesFerreiraMaltez.pdf Cita tipo Chicago: Rodrígues Ferreira Maltez, Darío Pablo. "Detección de radionucleidos cosmogénicos mediante la técnica de espectrometría de masas con aceleradores". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5944_RodriguesFerreiraMaltez.pdf |
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Paz, Luciano. "Ensamblando operaciones mentales. Desarrollo de un marco teórico y computacional para la toma de decisiones humanas" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: A lo largo de esta tesis, estudiamos el problema de la toma de decisiones en el cerebro. Nuestro enfoque fue abarcativo, intentando analizar las diversas escalas del problema, desde modelos neurofisiológicos para decisiones sencillas hasta el encadenamiento de decisiones individuales para formar programas complejos. Es claro que el cerebro es una máquina capaz de realizar cómputos de manera flexible y versátil, pero que además presenta circuitos especializados en ciertos cómputos específicos como el trazado visual de una curva, la detección de la orientación, del contraste, del mo- vimiento, etc. Estos circuitos configuran una red de procesadores especializados, capaces de operar en paralelo pero que para realizar los cómputos flexibles y versátiles, a veces deben encadenarse de forma serial. Los mecanismos específicos detrás del encadenamiento de las operaciones `elementales' del cerebro son mayormente desconocidos. Durante esta tesis ex- ponemos los requisitos computacionales que deben ser satisfechos para que las operaciones configuren programas comportamentales flexibles y complejos. Actualmente se tiene un conocimiento bastante detallado del mecanismo subyacente a las decisiones perceptuales. A partir de registros electrofisiológicos en monos y ratas que fueron entrenados para hacer tareas de discriminación perceptual, se observó que existen neuronas sensibles a las categorías que se deben responder, cuya actividad rampea hasta un nivel donde señalan la decisión. Esto se interpreta como que las neuronas integran evi- dencia sensorial ruidosa hasta alcanzar un nivel de certeza suficiente como para decidir. Esta interpretación se deriva de la estrategia de inferencia bayesiana óptima para toma de decisiones en presencia de ruido, que reproduce varias de las observaciones experimenta- les. Sin embargo, no está claro cómo es que esta inferencia se instancia en el cerebro, ni a nivel algorítmico ni neurofisiológico. En esta tesis estudiamos una propuesta particular, la inferencia aproximada por un proceso de muestreo de una distribución de probabilidad. Estudiamos este mecanismo al nivel neurofisiológico, implementando una red de neuronas que forman varios atractores dinámicos. En particular, nos enfocamos en cómo es que esta implementación permite codificar de forma natural la medida de la confianza que tienen los sujetos en la elección que tomaron. La confianza, junto al tiempo de respuesta y la tasa de errores, es uno de los observables del proceso de toma de decisión que fueron estudiados por psicólogos y neurocientíficos cognitivos. Se considera que es una medida interna crucial para el comportamiento, desde la política de toma decisiones hasta la modulación del aprendizaje en tareas complejas, cuyas bases neurofisiológicas siguen siendo mayormente desconocidas. Por último, extendemos la implementación del proceso de muestreo para explicar, al nivel algorítmico, una forma de encadenamiento de decisiones individuales. En particular, estudiamos cómo es que chicos de entre 6 y 7 años se desempe~nan en un juego sencillo de planeamiento. Proponemos un mecanismo de encadenamiento de acciones individuales (proceso de planeamiento o de búsqueda) que nos permite ajustar el desempe~no de los chicos en la tarea. Más importante aún, nos permite sondear las estrategias de los chicos para orientar o sesgar la búsqueda de cadenas de acciones (el mecanismo de asignación de valor de las acciones o la heurística). Palabras clave: Toma de decisiones, confianza, planeamiento, inferencia, computabili- dad Abstract: During this thesis, we studied decision making in the brain. We used a broad approach, attempting to analyze the various scales of decision making, from neurophysiological models for simple decision to chains of many individual decisions that form complex behavioral programs. It is clear that the brain is capable of performing flexible and versatile computations on demand, but also has specialized circuits devoted to specific operations such as curve visual tracing, orientation detection, contrast or movement sensing, etc. These circuits form a network of specialized processors, capable of parallel operations but to retain flexibility, they must sometimes work in serial manner. The specific mechanisms that underly the chaining of the brain's `elemental' operations is mostly unknown. During this thesis, we expose the computational requirement that must be satisfied to allow the operations to configure flexible and complex behavioral programs. Presently, the underlying mechanism behind perceptual decisions is known with a lot of detail. It was seen in electrophysiological recordings in monkeys and rats that were trained to perform perceptual discrimination tasks, that there are neurons, sensitive to the response category, whose activity ramps to a level that signals the decision. The neurons' ramping is interpreted as a noisy sensory evidence integration, which continues up to a level of certainty that is sufficient to decide. This interpretation derives from the optimal bayesian inference decision strategy, which is also able to reproduce various experimental observations. However, it is still unclear how the inference is instantiated in the brain at both the algorithmic and neurophysiological levels. In the present thesis, we study a particular proposal: inference is approximated by a sampling process. We study this mechanism at the neurophysiological level by implementing a network of neurons that form dynamic attractors. In particular, we study how this implementation is able to naturally encode a measure of the confidence subjects have in their decision. Confidence, along with response time and error rates, is one of the behavioral observables of the decision making process that have been studied by psychologists and cognitive neuroscientists for many decades. Confidence is considered a measure that subjects rely on to shape their behavior, from the decision making policy to the modulation of complex task learning, and whose neurological underpinning is mostly unknown. Finally, we extend the implementation of the sampling process to explain, at the algo- rithmic level, a form of simple decision chaining. In particular, we study how children, that have between 6 and 7 years of age, play a simple planning game. We propose a mechanism of action chaining (planning process or search process) that allows us to fit children's task accuracy. More importantly, we are able to probe the strategies that children use to shape their plans of action chains (the action value assignment mechanism or heuristic). Keywords: Decision making, confidence, planning, inference, computability
Cita tipo APA: Paz, Luciano . (2016-03-15). Ensamblando operaciones mentales. Desarrollo de un marco teórico y computacional para la toma de decisiones humanas. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5897_Paz.pdf Cita tipo Chicago: Paz, Luciano. "Ensamblando operaciones mentales. Desarrollo de un marco teórico y computacional para la toma de decisiones humanas". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5897_Paz.pdf |
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Forlenza, María Belén. "Eventos tempranos del ciclo de replicación del virus Junín: interacción del virus con lectinas del tipo C" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El virus Junín (JUNV) es el agente etiológico de la fiebre hemorrágica argentina (FHA), una enfermedad zoonótica que afecta el área central de la Pampa húmeda de la República Argentina. Distintos mecanismos de endocitosis son utilizados en las infecciones virales. En la línea celular Vero, el complejo glicoproteico presente en los viriones es el responsable de las interacciones iniciales con el receptor celular de transferrina 1 (TfR1) y la entrada a la célula es por endocitosis mediada por vesículas recubiertas de clatrina. En varias familias de virus envueltos, su entrada y diseminación pueden estar mediadas por lectinas de tipo C. Las mismas son proteínas transmembrana tipo 2, constituyen una amplia familia de receptores que reconocen estructuras específicas de carbohidratos presentes en patógenos y se encuentra presente principalmente en células dendríticas inmaduras, macrófagos y células endoteliales. Una de ellas, DC-SIGN posee un rol importante en los estadios iniciales de la respuesta inmune, reconoce estructuras internas ramificadas de manosas y posee funciones de receptor para varios virus. DC-SIGN se compone por un dominio extracelular de reconocimiento a carbohidratos (DRC) que une residuos con carbohidratos de alta manosa y una cola citoplasmática con motivos conservados de dileucinas (LL) y un cluster triacídico (EEE). Debido a que JUNV presenta proteínas altamente glicosiladas, y que en los estadíos de la infección temprana interactuaría con células dendríticas y otras del sistema inmune, en este trabajo se estudió la interacción de JUNV con DC-SIGN y el mecanismo endocítico asociado a la misma. Los resultados demuestran que DC-SIGN actúa como un auténtico receptor para JUNV en las células que la expresan y que la entrada a las mismas es a través de endocitosis utilizando vesículas recubiertas de clatrina con dependencia de colesterol y filamentos de actina corticales intactos. Abstract: Junin Virus (JUNV) is a member of the Arenaviridae family and the etiologic agent of Argentine Hemorrhagic fever (AHF), a zoonotic illness affecting the farming land of Argentina. Several endocytic pathways are used during viral infections. In Vero cell line, the glycoprotein complex present in virions is responsible of interaction with Transferrin receptor type I (TfR1) and internalization is clathrin mediated. Entry and dissemination of several envelope viruses are mediated by C-type lectins. These are transmembrane proteins that are expressed in immature dendritic, macrophages and endothelial cells, integrating a family of receptors which recognize specific carbohydrates present in pathogens. One of them, Dendritic Cell-Specific ICAM-3 Grabbing Nonintegrin (DC-SIGN) has an important role during the initial stages of the immune response, recognizes high mannose residues and is considered as a receptor for several viruses. DC-SIGN is composed by an extracellular carbohydrate recognition domain (CRD) and a cytoplasmic tail containing conserved motives as dileucine (LL) and triacidic cluster (EEE). As JUNV presents highly glycosylated proteins and that during initial steps of the infection, JUNV would interact with dendritic cells and others belonging to the immune system, in this work we studied the interaction between JUNV and DC-SIGN and the entry pathway associated with this. Taken together our results demonstrate that DC-SIGN is a real receptor for JUNV and that the main entry pathway involved is clathrin mediated endocytosis and it depends on cholesterol and intact cortical actin filaments.
Cita tipo APA: Forlenza, María Belén . (2016-03-15). Eventos tempranos del ciclo de replicación del virus Junín: interacción del virus con lectinas del tipo C. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5930_Forlenza.pdf Cita tipo Chicago: Forlenza, María Belén. "Eventos tempranos del ciclo de replicación del virus Junín: interacción del virus con lectinas del tipo C". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5930_Forlenza.pdf |
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Carrone, Guillermo Alejandro. "Sensores y actuadores moleculares de alta resolución espacial y temporal" (2016-03-15). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se diseñaron sistemas de sensores y actuadores de dimensión molecular con el fin de tomar datos analíticos con una alta resolución espacial y temporal, y a la vez poder actuar químicamente sobre el sistema de la misma forma. Para ello se utilizó un enfoque que consiste en el diseño de actuadores en base a la química de los compuestos de coordinación de Ru(II)-bipiridina, los cuales fueron caracterizados, analizando en particular su fotoquímica. La interface entre los sensores y actuadores moleculares y el entorno macroscópico se desarrolló mediante cámaras digitales de alta resolución y de videocámaras digitales de alta velocidad y bajo costo, acopladas a microscopios iluminados por LEDs o láseres de estado sólido. Se ha sintetizado un fotoliberador de una base, la cual permite aumentar el pH de forma localizada, el cual fue utilizado en forma simultánea con un sensor basado en un indicador ácido-base, tanto en un sistema FIA como en otra clase de sistemas. La técnica utilizada para la determinación de la variable pH fue el uso de microscopía de trasmisión, lo que tiene la ventaja de evitar la necesidad de utilizar intensidades de irradiación elevadas como en el caso de técnicas de fluorescencia. También se diseñó y sintetizó un sensor de potencial redox con las bandas de absorción sintonizadas para aplicar en mediciones utilizando el mismo método de detección con cámaras CCD. Por otro lado, se diseñaron distintas sondas fluorescentes en las cuales actúa un proceso de transferencia de energía que fue utilizado para favorecer la fotoliberación de moléculas enjauladas a longitudes de ondas largas. Este fenómeno de transferencia de energía fue aplicado al desarrollo de un compuesto capaz de producir un efecto de las mismas características que la excitación convencional de dos fotones, donde la luz emitida mantiene una dependencia no lineal, sino cuadrática, respecto de la luz de irradiación, evitando la necesidad de las altísimas potencias instantáneas necesarias en la excitación de dos fotones convencional, en la que ambos fotones deben llegar en un tiempo del orden de las transiciones electrónicas. Este tipo de sondas podrían ser la base, de nuevas técnicas de microscopía de fluorescencia, permitiendo reducir enormemente los costos de equipamiento. Abstract: The present work involves the development of sensors and actuators with molecular dimensions to obtain analytical data with high spatial and temporal resolution and to chemically actuate on the system in the same way. The approach chosen involves the design of actuators based on the chemistry of Ru(II)-bipyridine coordination compounds which were characterised photochemically. The interface between the molecular probes and the macroscopic environment was based on high-resolution digital cameras and low cost high speed digital video cameras that were coupled to a microscope illuminated by LEDs or solid-state lasers. A caged base that photodeliveries an amine was synthesized. After irradiation the expelled base increases the pH in a localized area. It was used simultaneously an acid-base indicator as probe, in a FIA system model and other types of systems. The pH data was obtained by transmission microscopy. This provides the advantage of avoiding the need to use high irradiation intensities as with fluorescence techniques. It was also designed and synthesized a redox probe with absorption bands that were tuned in order to be compatible with the color filters of digital color cameras. Several fluorescent probes were also designed in which an energy transfer process allows the photodelivery of caged molecules with long wavelength light. This phenomenon of energy transfer was also applied to the development of a compound capable of producing an effect of the same characteristics as conventional two-photon excitation, where the emitted light maintains a nonlinear dependence but quadratic with respect to the irradiation light while avoiding the usual need of very high instantaneous power to get both photons arriving at a time on the electronic transitions. This kind of probes could be the base of new techniques of fluorescence microscopy, allowing a significant reduction on equipment costs.
Cita tipo APA: Carrone, Guillermo Alejandro . (2016-03-15). Sensores y actuadores moleculares de alta resolución espacial y temporal. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5912_Carrone.pdf Cita tipo Chicago: Carrone, Guillermo Alejandro. "Sensores y actuadores moleculares de alta resolución espacial y temporal". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-15. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5912_Carrone.pdf |
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Scarpin, María Regina. "Análisis genético de la regulación del almacenamiento de ARNm en cuerpos citoplasmáticos de granos de polen maduro en Arabidopsis thaliana" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se ha descripto que algunos ARNm de polen son sintetizados durante el desarrollo del polen y acumulados en grano de polen maduro deshidratado, para ser traducidos luego de la germinación del polen. Nuestra hipótesis es que la regulación de la acumulación de estos ARNm de polen pre-sintetizados está mediada por cuerpos citoplasmáticos. Para probar dicha hipótesis, analizamos la localización celular de algunos ARNm pre-sintetizados durante el desarrollo del polen utilizando el sistema MS2-CP. Utilizamos como sistema biológico a Arabidopsis thaliana que permite llevar a cabo un análisis genético, molecular y de desarrollo de la expresión específica de genes de polen. Por otro lado, estudiamos gránulos de estrés (SG) y cuerpos de procesamiento (PB) en polen maduro de Arabidopsis como posibles estructuras celulares donde estos ARNm pre-sintetizados polínicos puedan ser almacenados. En otra línea de estudio, caracterizamos cuerpos de cajal (CB) para investigar si su número y tamaño varían durante los procesos de división celular y diferenciación celular que ocurren en el desarrollo del grano de polen. Nuestros resultados demuestran la presencia de agregados de ARNm citoplasmáticos en polen maduro en líneas transgénicas que contienen el sistema MS2-CP. Validamos y cuantificamos estos agregados de ARNm usando un análisis automatizado de MATLAB. Luego verificamos si estos agregados de ARNm co-localizan con gránulos de estrés y/o cuerpos de procesamiento mediante el análisis de líneas transgénicas que expresan el sistema MS2-CP y a la vez proteínas marcadas de SG o PB. Hemos demostrado que uno de cada cinco agregados, aproximadamente, co-localiza con alguna de las proteínas marcadoras de PB, lo que sugiere que los PB son sitios de almacenamiento de los ARNm en granos de polen maduro. Además, analizamos de qué manera se afecta la presencia y la localización de los agregados citoplasmáticos en ausencia de los genes marcadores de SG y PB. Hemos determinado que dichas proteínas serían necesarias para la localización de los ARNm en acúmulos citoplasmáticos. Nuestros resultados además sugieren que los CB responden durante el desarrollo del polen a las diferentes necesidades fisiológicas de los distintos tipos de células gametofíticas masculinas. Estos resultados contribuirán a entender los mecanismos de regulación transcripcional y traduccional en granos de polen de Arabidopsis thaliana. Abstract: It has been described that some pollen mRNAs are synthesized during pollen development and accumulated in dehydrated mature pollen grains, being translated only after pollen germination. Our hypothesis is that the regulation of the accumulation of these presynthesized pollen mRNAs is mediated by cytoplasmic bodies. To probe this, we analyzed the cellular localization of some defined pollen pre-synthesized mRNAs during pollen development using the MS2-CP system. We used Arabidopsis thaliana a good system to carry genetic, molecular and developmental analysis of specific expression of pollen genes. We study stress granules (SG) and processing bodies (PB) in Arabidopsis mature pollen as possible cellular structures where these pre-synthesized pollen mRNAs can be stored before being translated. We also characterized Cajal Bodies (CB) in order to investigate whether their number and size vary during cell division and cellular differentiation processes that occur during pollen development. Our results showed the presence of cytoplasmic mRNA aggregates in mature pollen on transgenic lines containing the MS2-CP system. We validated and quantified these mRNA aggregates using a MATLAB automated analysis. Once confirmed, we studied whether these mRNA aggregates co-localized with stress granules and processing bodies by analyzing transgenic lines expressing both the MS2-CP system and tagged marker proteins from either SG or PB. Our findings showed that one of five aggregates, approximately, co-localized with some marker protein from PBs, which indicates that these pre-synthesized pollen mRNAs cab be stored in PB. Otherwise, we analyzed whether the localization of these cytoplasmic aggregates is modified in the absence of the marker for SG and PB. Our results further suggested that CB respond during pollen development to the diverse physiological needs of the different types of male gametophytic cells. Our results would contribute to understand the mechanisms of transcriptional and translational regulation in Arabidopsis thaliana pollen.
Cita tipo APA: Scarpin, María Regina . (2016-03-14). Análisis genético de la regulación del almacenamiento de ARNm en cuerpos citoplasmáticos de granos de polen maduro en Arabidopsis thaliana. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5893_Scarpin.pdf Cita tipo Chicago: Scarpin, María Regina. "Análisis genético de la regulación del almacenamiento de ARNm en cuerpos citoplasmáticos de granos de polen maduro en Arabidopsis thaliana". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5893_Scarpin.pdf |
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Rodríguez, Jorge Tomás. "Desigualdades polinomiales en espacios de Banach" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En esta tesis estudiamos desigualdades para el producto de polinomios en espacios de Banach. Nos enfocamos principalmente en los llamados factor problem y plank problem. El factor problem consiste en buscar cotas inferiores para la norma del producto de polinomios de grados previamente fijados. Estudiamos este problema en diferentes contextos. Consideramos el producto de funciones lineales (i.e. polinomios homogéneos de grado uno), polinomios homogéneos y no homogéneos de grados arbitrarios. También investigamos el problema en diferentes espacios: finito e infinito dimensionales, espacios Lp, las clases de Schatten Sp y ultraproductos de espacios de Banach, entre otros. En algunos casos, como en los espacios Lp y las clases de Schatten Sp, obtenemos cotas inferiores óptimas, mientras que en otros sólo estimamos la cota inferior óptima. En un espacio de Banach X, el plank problem para polinomios consiste en encontrar condiciones sobre escalares no negativos a₁,...,an que aseguren que para cualquier conjunto de polinomios de norma uno P₁,...,Pn : X → K exista un vector z de norma uno tal que ∣Pi(z)∣ ai^deg(Pi) para i = 1,...,n. Aplicamos las cotas inferiores obtenidas para el producto de polinomios al estudio de este problema y obtenemos condiciones suficientes para espacios de Banach complejos. También obtenemos condiciones menos restrictivas para ciertos espacios de Banach, como los espacios Lp o las clases Schatten Sp. Abstract: In this thesis we study inequalities for the product of polynomials on Banach spaces. We focus mainly on the so called factor problem and plank problem. The factor problem is the problem of finding lower bounds for the norm of the product of polynomials of some prescribed degrees. We study this problem in different contexts. We consider the product of linear functions (i.e. homogeneous polynomials of degree one), homogeneous and non homogeneous polynomials of arbitrary degrees. We also study this problem on different spaces: finite and infinite dimensional spaces, Lp spaces, Schatten classes Sp and ultraproducts of Banach spaces, among others. In some case, like in the Lp spaces and the Schatten classes Sp, we obtain optimal lower bounds, while for other spaces we only give some estimates of the optimal lower bounds. On a Banach space X, the plank problem for polynomials consists in finding conditions on nonnegative scalars a₁,...,an ensuring that for any set of norm one polynomials P₁,...,Pn : X → K there is an element in the ball of X such that ∣Pi(z)∣ ai^deg(Pi) for i = 1,...,n. We apply our lower bounds for products of polynomials to study the plank problem, and obtain sufficient conditions for complex Banach spaces. We also obtain some less restrictive conditions for some particular Banach spaces, like the Lp spaces or Schatten classes Sp.
Cita tipo APA: Rodríguez, Jorge Tomás . (2016-03-14). Desigualdades polinomiales en espacios de Banach. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5915_Rodriguez.pdf Cita tipo Chicago: Rodríguez, Jorge Tomás. "Desigualdades polinomiales en espacios de Banach". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5915_Rodriguez.pdf |
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Pieroni, Pablo Emanuel. "Medición del flujo de neutrinos cósmicos ultra energéticos mediante detectores de superficie" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Esta Tesis estudia la medición de neutrinos cósmicos ultra energéticos mediante detectores de superficie. Básicamente existen dos mecanismos a través de los cuales los neutrinos en el rango del EeV pueden inducir señales distinguibles a nivel de superficie. El primero consiste en la interacción de un neutrino en la atmósfera, via corrientes cargadas o neutras, y la subsiguiente producción de una cascada atmosférica extendida descendente. El segundo se basa en la interacción de un neutrino tau en la corteza terrestre al atravesarla de manera rasante. Este proceso da lugar a un leptón tau capaz de escapar hacia la atmósfera e iniciar en su decaimiento una lluvia extendida ascendente de alto ángulo. En ambos casos, cuando la cascada se inicia cerca del detector, existen características en la señal producida, relacionadas con la presencia de componente electromagnética en la lluvia, que permiten discriminar este tipo de eventos del fondo dominante debido a rayos cósmicos de origen hadrónico. Este trabajo se divide en dos partes, que abordan dos tecnologías diferentes para estudiar las lluvias atmosféricas producidas por neutrinos. La primera parte trata la búsqueda de neutrinos basada en la interacción de las partículas de la lluvia con el Detector de Superficie del Observatorio Pierre Auger. En particular se describe el procedimiento de identificación, las posibles fuentes de fondo, el método desarrollado para calcular la exposición y sus incertezas sistemáticas asociadas en la búsqueda. Asimismo, se presenta por primera vez la integración de los distintos análisis complementarios desarrollados en Auger, que incluyen dos criterios de reconocimiento de neutrinos descendentes y uno de neutrinos rasantes, en un único resultado, así como la inclusión del envejecimiento del detector en el cálculo de la exposición. Ningún candidato a neutrino fue encontrado en los datos adquiridos entre el 1 de enero de 2004 y el 20 de junio de 2013. Suponiendo un flujo diferencial típico ϕ(Ev) = k * Ev^-2 y una relación entre sabores de 1 : 1 : 1, se fijó un límite sobre el flujo de neutrinos de cada sabor, de k < 6,4*10^9 GeV cm^2 s^-1 sr^-1 con un nivel de confianza del 90% en el rango de 1,0*10^17 eV - 2,5*10^19 eV, el más estricto hasta la fecha. En la segunda parte de este trabajo se estudia el potencial de la detección de las ondas de radio producidas por lluvias atmosféricas para identificar aquellas producidas por neutrinos, y se investigan las capacidades y limitaciones de un arreglo de antenas de radio a la hora de detectar neutrinos ultra energéticos rasantes. Para ello se utilizaron simulaciones que incluyen la interacción del neutrino en la Tierra, el decaimiento del leptón tau en la atmósfera, el subsiguiente desarrollo de la lluvia atmosférica extendida con producción de radiación electromagnética en frecuencias de radio, y la generación de la señal en las antenas del detector. A partir de estas simulaciones se desarrollaron algoritmos de reconstrucción e identi ficación que permiten distinguir eventos iniciados por neutrinos de los generados por el fondo de lluvias hadrónicas. Se utilizaron estos criterios para calcular la exposición que podrían alcanzar detectores de diferentes tamaños y topologías, concluyendo que la técnica puede ser competitiva para la siguiente generación de detectores de neutrinos. Abstract: This Thesis studies the measurement of ultra energetic cosmic neutrino by means of surface detectors. There are basically two mechanisms by which neutrinos in the EeV range may induce surface level distinguishable signals. The first one consists in the interaction of a neutrino in the atmosphere, either through charged or neutral currents, and the subsequent production of a down-going extended air shower. The second one is based on the interaction of an earth skimming tau neutrino in the earth crust. This process gives rise to a tau lepton that can escape into the atmosphere and start in its decay a high angle extended air shower. In both cases, when the shower starts near the detector, characteristics related to the presence of an electromagnetic component allow to discriminate this kind of events from the dominant hadronic cosmic ray background. This work is divided in two parts, which address two different technologies to study atmospheric showers induced by neutrinos. The first one deals with neutrino searches based in the interaction of shower particles with the Surface Detector of the Pierre Auger Observatory. In particular a detailed description is presented of the identification procedure, the possible background sources, the method developed to compute the exposure and its systematic uncertanties. Additionally, the integration of the different complementary neutrino search analyses developed in Auger is presented for the first time, which include two criteria to recognise downgoing neutrinos and one for earth-skimming neutrinos, as well as the inclusion of detector ageing in the exposure calculation. No candidate neutrinos have been found in the data collected from 1 January 2004 to 20 June 2013. Assuming a differential flux ϕ(Ev) = k * Ev^-2 and a flavor relation of 1 : 1 : 1, we place a 90% CL upper limit on the single flavour neutrino flux of k < 6,4*10^9 GeV cm^2 s^-1 sr^-1 in the energy range from 1,0*10^17 eV - 2,5*10^19 eV, the most stringent to this date. The second part of this work studies the potential of the detection of the radio waves produced by atmospheric showers to identify those induced by neutrinos, as well as the capabilities and limitations of an antenna array to detect ultra high energy earth-skimming neutrinos. This involved simulations of the different intervening processes, including the neutrino interaction in the Earth, the tau lepton decay in the atmosphere, the subsequent development of the shower including the production of electromagnetic radiation in radio frecuencies, and the signal production in the detector antennas. From these simulations, reconstruction and identification algorithms were developed that allow to distinguish events initiated by neutrinos from the hadronic background. Finally these criteria were used to compute the exposure achieved by detectors with different sizes and topologies, concluding that the technique can be a competitive option in the next generation of neutrinos detectors.
Cita tipo APA: Pieroni, Pablo Emanuel . (2016-03-14). Medición del flujo de neutrinos cósmicos ultra energéticos mediante detectores de superficie. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5927_Pieroni.pdf Cita tipo Chicago: Pieroni, Pablo Emanuel. "Medición del flujo de neutrinos cósmicos ultra energéticos mediante detectores de superficie". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5927_Pieroni.pdf |
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López Galván, Alberto Manuel. "Geometría Riemanniana de grupos de operadores y espacios homogéneos" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo de esta tesis es el estudio de la geometría de diferentes grupos de operadores, los cuales son perturbaciones de la identidad por un operador Hilbert-Schmidt. A través de este trabajo dotaremos a los espacios tangentes con distintas métricas Riemanianas y estudiaremos sus problemas métricos. La nueva métrica introducida aquí es la métrica polar que es definida usando la descomposición polar de los operadores inversibles. Compararemos esta métrica con las métricas clasicas invariantes a izquierda de los grupos de Lie. Además nos centraremos en algunos espacios homogéneos y analizaremos que métricas pueden ser definidas y que propiedades tienen. Abstract: The aim of this thesis is the geometric study of different groups of operators which are a perturbation of the identity by a Hilbert- Schmidt operator. Throughout this work we will endow the tangent spaces with different Riemannian metrics and we will study their metric problems. The new metric introduced here is the polar metric, which is defined using the classical polar decomposition of invertible operators. We will compare this new metric with the classical left-invariant metric of Lie groups. Moreover we will focus in some homogeneous spaces given by the action of these operator groups and we analyse which metrics can be defined and study their properties.
Cita tipo APA: López Galván, Alberto Manuel . (2016-03-14). Geometría Riemanniana de grupos de operadores y espacios homogéneos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5968_LopezGalvan.pdf Cita tipo Chicago: López Galván, Alberto Manuel. "Geometría Riemanniana de grupos de operadores y espacios homogéneos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5968_LopezGalvan.pdf |
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Kuna, Mariel Paula. "Acerca del rango y propiedades topológicas de algunos operadores no lineales" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Estudiamos el siguiente tipo de problemas de segundo orden: u"= g(x,u) + p(x) x ∈ 2 (a,b)⊂R, where g ∈ C( X R^N,R^N). El objetivo principal de esta tesis es estudiar, bajo distintas condiciones de contorno, qué funciones p ∈ L^2((a,b),R^N) garantizan la existencia de solución. Donde la definición de solución sería dada en cada caso. En otras palabras, analizamos la imagen del operador semilineal S(u) := u"-g(x,u), considerado como un operador continuo de H ⊂ H^2((a,b),R^N) to L^2((a,b),R^N), donde H es un subespacio cerrado que depende de las condiciones de contorno. En primer lugar, estudiamos problemas resonantes bajo condiciones periódicas, que generalizan, por un lado, la ecuación del péndulo forzado y, por otro, las condiciones de Landesman-Lazer. Consideramos el caso variacional S(u) = u"-∇G(u), para el cual logramos caracterizar Im(S) y dar algunas de sus propiedades topológicas. En segundo lugar, estudiamos problemas con condiciones de contorno de radiación, es decir, u'(0) = a0u(0), u'(1) = a1u(1), con a0,a1 > 0. Encontramos una condición de Hartman generalizada que garantiza existencia de solución. En particular, si g es superlineal, probamos que el operador S es suryectivo. Para este caso, estudiamos también condiciones necesarias y suficientes para la unicidad o multiplicidad de soluciones. Logramos obtener resultados más precisos para el caso N = 1 empleando métodos topológicos y variacionales y Teorema de la Función Implícita. Abstract: We study the following type of second order problems: u"= g(x,u) + p(x) x ∈ 2 (a,b)⊂R, where g ∈ C( X R^N,R^N). The thesis is devoted to the following problem: which functions p ∈ L^2((a,b),R^N) guarantee the existence of solution under different boundary conditions? Where, in each case, the definition of solution will be given. In other words, we try to characterize and prove different properties of the range of the semilinear operator S(u) := u"-g(x,u), regarded as a continuous function from H ⊂ H^2((a,b),R^N) to L^2((a,b),R^N), where H is a closed subspace depending on the boundary conditions. Firstly, we study resonant periodic problems that generalize, on the one hand, the forced pendulum equation and, on the other hand, the Landesman-Lazer conditions. For the variational case S(u) = u"-∇G(u) we give a characterization of the set Im(S) and prove some of its topological properties. Secondly, we consider the so-called radiation boundary conditions, namely u'(0) = a0u(0), u'(1) = a1u(1), with a0,a1 > 0. We obtain a generalized Hartman condition that ensures the existence of solution. In particular, if g is a superlinear function, we prove that S is onto. For this case, we study sufficient and necessary conditions for uniqueness or multiplicity of solutions. More accurate results are obtained for the scalar case N = 1, using variational and topological methods and Implicit Function Theorem.
Cita tipo APA: Kuna, Mariel Paula . (2016-03-14). Acerca del rango y propiedades topológicas de algunos operadores no lineales. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5887_Kuna.pdf Cita tipo Chicago: Kuna, Mariel Paula. "Acerca del rango y propiedades topológicas de algunos operadores no lineales". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5887_Kuna.pdf |
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Alvarez, Mariano Sebastián. "Estudio de las fuentes de variabilidad intraestacional en Sudamérica" (2016-03-14). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Este trabajo de tesis tiene como objetivo general estudiar el ciclo estacional que la variabilidad intraestacional (IS) exhibe en Sudamérica y explorar sus posibles fuentes, poniendo especial énfasis en analizar su relación con aquella variabilidad observada en la circulación del hemisferio sur y, en particular, con la Oscilación de Madden y Julian (MJO). La variabilidad IS (10-90 días) de la precipitación es representada a través de un análisis de funciones ortogonales empíricas de la radiación de onda larga saliente filtrada en la banda IS en el este de Sudamérica. Se estudiaron los patrones dominantes en toda la banda IS, así como en la escala IS corta (10-30 días) y larga (30-90 días), y su variación a lo largo del año. Las series temporales de las Componentes Principales fueron utilizadas para estudiar la dinámica de gran escala de la variabilidad IS asociada a la evolución de los patrones a través de un estudio de regresiones lineales desfasadas. Posteriormente, se analizó la variabilidad estacional de la influencia de la MJO en Sudamérica. Para esto se utilizó el Real-Time Multivariate MJO index (RMM) de Wheeler y Hendon y el OLR-based MJO index (OMI) propuesto por Kiladis y coautores. Se estudiaron las variaciones de la dinámica de la circulación del hemisferio sur en las 8 fases de los índices de la MJO, así como también de las anomalías de temperatura de superficie en Sudamérica. Además, se realizaron composiciones probabilísticas para mostrar la probabilidad de que en cada trimestre y durante cada fase de la MJO, la precipitación en Sudamérica supere el tercil superior de ese trimestre Finalmente, se utilizaron los pronósticos retrospectivos en escala intraestacional del modelo Climate Forecast System en su versión 2 (CFSv2) del NCEP para detectar si los patrones principales de variabilidad en Sudamérica son representados por el modelo. Además, se realizó un análisis sobre la representación de la MJO en estas salidas de 123 días del CFSv2. Palabras clave: variabilidad intraestacional, precipitación, Sudamérica, oscilación de Madden-Julian, ciclo estacional, ondas de Rossby Abstract: This thesis aims to study the seasonal cycle that intraseasonal (IS) variability presents in South America and to explore its sources, particularly analyzing its relation to the variability observed in the circulation in the Sotthern Hemisphere and especially with the Madden-Julian oscillation (MJO). The IS variability (10-90 days) of rainfall is represented by means of an empirical orthogonal function analysis of the outgoing long wave radiation filtered in the IS band in eastern South America. The leading patterns of the IS band, as well as of the short (10-30 days) and long (30-90 days) IS timescales were studied, and their variation throughout the year. The time series of the principal components were used to study the large scale dynamics of the IS variability associated to the evolution of the patterns through linear lagged regressions studies. The seasonal variability of the influence of the MJO in South America was afterwards studied. The Real-Time Multivariate MJO (RMM) index of Wheeler and Hendon and the OLR-based MJO index (OMI) proposed by Kiladis and coauthors were used to characterize the evolution of the MJO. The variations in the dynamics of the circulation of the Southern Hemisphere during the 8 phases of the MJO indexes and for each trimester of the year was studied, as well as those variations in the surface air temperature anomalies in South America. Furthermore, probabilistic composites were computed to show the probability that during each trimester and each MJO phase, the rainfall in South America exceed the upper tercile. Finally, the reforecasts provided by the Climate Forecast System in its version 2 (CFSv2) of the NCEP were used to detect if the leading patterns of variability in South America are represented by the model. Also, an analysis of the representation of the MJO in this 123-days-length runs of the CFSv2 was done. Keywords: intraseasonal variability, precipitation, South America, Madden-Julian oscillation, seasonal cycle, Rossby wave trains
Cita tipo APA: Alvarez, Mariano Sebastián . (2016-03-14). Estudio de las fuentes de variabilidad intraestacional en Sudamérica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5885_Alvarez.pdf Cita tipo Chicago: Alvarez, Mariano Sebastián. "Estudio de las fuentes de variabilidad intraestacional en Sudamérica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-14. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5885_Alvarez.pdf |
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Hancke, Diego. "La comunidad de helmintos en roedores sinantrópicos de la Ciudad de Buenos Aires: su relación con los ensambles de especies hospedadoras y su importancia zoonótica" (2016-03-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El objetivo general de esta tesis fue conocer el efecto del ensamble de roedores sobre la estructura de las comunidades de parásitos en diferentes ambientes de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires (CABA). Para esto se identificaron las especies de helmintos presentes en muestras de roedores capturados en tres ambientes representativos de la CABA: barrios residenciales donde la especie de roedor dominante es Rattus rattus, villas de emergencia donde las especies dominantes son R. norvegicus y Mus musculus y espacios verdes donde existe una dominancia de R. norvegicus y M. musculus, acompañados por la especie nativa Oligoryzomys flavescens. Los resultados mostraron que el 75.4% del total de roedores prospectados (n=203) estuvieron parasitados con al menos una de las 12 especies de helmintos identificadas (1 acantocéfalo, 3 cestodes y 8 nematodes). Las infracomunidades se agruparon a partir de las características de su composición y abundancias relativas y lo hacen en relación a la comunidad componente a la cual pertenecen. Las comunidades componentes de mayor diversidad de helmintos correspondieron a R. norvegicus que estuvieron caracterizadas por la presencia de dos especies centrales, Nippostrongylus brasiliensis y Heterakis spumosa. La comunidad componente de O. flavescens presentó una única especies central, Stilestrongylus brasiliensis, y se detectó además la presencia de especies de helmintos típicos de hospedadores múridos, producto de la coexistencia entre roedores invasores y nativos. En cambio, el reducido valor de diversidad que mostraron R. rattus y M. musculus puede interpretarse a partir de que solamente presentaron especies satélites de helmintos. Las unidades de paisaje fueron los predictores más fuertes de los niveles de infección de las especies de helmintos más abundantes del ensamble. Entre los parásitos identificados, encontramos Hymenolepis nana e H. diminuta, cuya reconocida importancia sanitaria confirma a los roedores urbanos como potenciales reservorios de enfermedades zoonóticas. Palabras clave: roedores, helmintos, ecología, infracomunidades, comunidades componentes, ambientes urbanos, importancia sanitaria Abstract: The overall goal of this thesis was to study the effect of rodents assembly on the structure of parasite communities in different environments of the city of Buenos Aires (CBA) (Argentina). To this end, we identified the helminth species present in samples of rodents captured in three representative CBA environments: residential neighborhoods where Rattus rattus the dominant rodent species is, slums where R. norvegicus and Mus musculus the dominant species are and open green spaces where also R. norvegicus and M. musculus there dominants are but accompanied by the native species Oligoryzomys flavescens. The results showed that 75.4% of the prospected rodents (n = 203) were parasitized with at least one of 12 identified helminth species (1 acanthocephalan, 3 cestodes and nematodes 8). The infracommunities were grouped according the characteristics of their composition and relative abundance and they did it in relation to the component community to which they belonged. The most diverse helminth componente communities corresponded to R. norvegicus wich were characterized by the presence of two main species, Nippostrongylus brasiliensis and Heterakis spumosa. The component community of O. flavescens presented a single central species, Stilestrongylus brasiliensis, but typical murine helminths species were also detected due to the coexistence between invaders and native rodents. Instead, the reduced diversity showed by R. rattus and M. musculus could be interpreted by the fact that they harbourded only satellites helminth species. The landscape units were the strongest predictors of helminth infection levels. Among the parasites identified, Hymenolepis nana and H.diminuta, whose recognized health importance confirmed urban rodents as potential reservoirs of zoonotic diseases. Key words: rodents, helminths, ecology, infracommunities, componente communities, urban environments, health importance
Cita tipo APA: Hancke, Diego . (2016-03-11). La comunidad de helmintos en roedores sinantrópicos de la Ciudad de Buenos Aires: su relación con los ensambles de especies hospedadoras y su importancia zoonótica. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5886_Hancke.pdf Cita tipo Chicago: Hancke, Diego. "La comunidad de helmintos en roedores sinantrópicos de la Ciudad de Buenos Aires: su relación con los ensambles de especies hospedadoras y su importancia zoonótica". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5886_Hancke.pdf |
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Chifflet, Lucila. "Estudios ecológicos y genéticos de la hormiga invasora Wasmannia auropunctata en Argentina, el límite sur de su distribución nativa" (2016-03-11). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La historia evolutiva de especies invasoras en su área nativa puede involucrar procesos clave en su éxito fuera de ésta. Wasmannia auropunctata es una hormiga neotropical, que ha invadido diversos sitos tropicales del mundo, aunque recientemente también se estableció en la región Mediterránea. La posible población fuente de esta última invasión se localizó en Argentina, el límite sur de su distribución nativa. Resulta entonces interesante estudiar las poblaciones de W. auropunctata en esta región para entender su éxito fuera de la zona intertropical. En este trabajo se estudiaron distintos aspectos -ecológicos, genéticos y comportamentales- de W. auropunctata en el límite sur de su distribución nativa, con el fin de entender qué factores son responsables de su éxito y analizar si su historia evolutiva se corresponde con la reciente introducción en el Mediterráneo. Se analizó si las poblaciones en esta región presentan características invasoras, estudiando la asociación entre su dominancia y la perturbación del ambiente, su sistema de reproducción, por medio de microsatélites, y su sistema de organización social, por medio de ensayos de agresión. Se realizó un estudio filogeográfico, utilizando ADN mitocondrial y nuclear, para analizar su historia de dispersión y diversificación. Por medio de un modelado de nicho ecológico se determinaron áreas centrales y marginales de distribución y se analizó cómo cambiaron a lo largo del Cuaternario. Finalmente, se analizó su habilidad competitiva en un ensamble local, utilizando cebos y trampas de caída. Wasmannia auropunctata resultó estar ampliamente distribuida en esta región, siendo abundante y dominante en sitios perturbados, principalmente antrópicos. La organización social fue mayormente supercolonial independientemente del nivel de perturbación del ambiente. El sistema de reproducción fue principalmente clonal en sitios antrópicos; mixto en sitios con perturbación antrópica media y en las planicies de inundación; y sexual en sitios naturales. Los marcadores mitocondriales y nucleares corroboraron la existencia de dos clados principales (A y B), como había sido propuesto en otros trabajos. Un análisis filogeográfico bayesiano sugirió que el ancestro común de ambos clados habría existido en el centro de Brasil hace 3,9 millones de años aproximadamente, desde done el clado A se expandió hacia el norte y el B (el mismo que invadió el Mediterráneo) hacia el sur. El modelado de nicho ecológico sugirió que su diferenciación genética podría estar acompañada de una diferenciación de nicho ecológico, siendo el clado A un linaje tropical y el B un linaje subtropical y templado. Sólo el clado B alcanzó altas latitudes en el sur de Sudamérica, hasta Argentina, caracterizado por un clima más frío que el norte de este continente. Esto es compatible con su posterior establecimiento en la región Mediterránea. Wasmannia auropunctata presentó una baja habilidad competitiva, indicando que ésta no es un factor asociado a su éxito. En conjunto, nuestros resultados sugieren que los ambientes naturalmente perturbados (como las planicies de inundación) habrían jugado un papel importante en la aparición de características, como la clonalidad y la supercolonialidad, que posteriormente favorecerían a W. auropunctata en ambientes antrópicos, clave para su introducción fuera de su rango nativo. Por otro lado, su expansión natural a altas latitudes hacia el sur de Sudamérica, le habría permitido una adaptación a climas más fríos y con marcada estacionalidad, clave para su establecimiento en la región Mediterránea. El presente estudio refleja la utilidad de la exploración de la historia de vida de una especie invasora dentro de su rango nativo para lograr una mejor comprensión de su escenario de invasión. Abstract: The evolutionary history of exotic species within their native range may involve key processes for colonizing new habitats. Native from the Neotropics, the little fire ant Wasmannia auropunctata has invaded many tropical sites around the world, and it has recently been introduced in the Mediterranean region. The putative source population of this last invasion was located in Argentina, its native southernmost distribution limit. Therefore, it is interesting to study the populations of W. auropunctata in this region to understand its success outside the tropics. We studied different -biological, genetic and behavioural- aspects of W. auropunctata within its native southernmost distribution limit, in order to understand which factors are responsible for its success and analyze whether its evolutionary history agrees with the recent introduction into the Mediterranean. We examined whether the populations in this region have invasive characteristics, studying the association between their dominance and the habitat disturbance, the reproductive system, using microsatellite markers, and the social organization, through aggression tests. We analyzed mitochondrial and nuclear DNA markers, to perform a phylogeographic analysis in order to infer its dispersion and genetic differentiation history. Through an ecological niche modelling, we identified central and marginal distribution areas and analyzed how they changed over the Quaternary. Finally, we analyzed its competitive ability in a local assembly, using baits and pitfall traps. Wasmannia auropunctata was widespread at the southernmost limit of its native distribution range, with higher abundances being mainly recorded in anthropic habitats. The social organization was mainly supercolonial in all habitat types. The reproductive system was mainly clonal in anthropic habitats, mixed in partially disturbed sites and floodplains, and sexual in natural sites. The genetic analysis corroborated the existence of two main clades (A and B), as had been proposed in other works. Phylogeographical Bayesian analysis suggested that the common ancestor of both clades would have existed in central Brazil about 3.9 million years ago, from where clade A would have expanded and differentiated northward and clade B (the same that invaded the Mediterranean) southward. The ecological niche modelling suggested that genetic differentiation could be accompanied by a differentiation in the ecological niche requirements, clade A being a tropical lineage and clade B a subtropical and temperate lineage. Clade B was the only one which reached high latitudes in southern South America, which is characterized by colder temperatures than the north of the continent. This agrees with the subsequent establishment in the Mediterranean region. Wasmannia auropunctata had a low competitive ability, indicating that interspecific competition is not a factor associated with its success. Taken together, our results suggest that naturally disturbed environments (such as floodplains) may have played an important role in the appearance of features such as clonality and supercoloniality, which would have later favor W. auropunctata in anthropic habitats, key to its dispersal outside its native range. Aditionally, the natural expansion at high latitudes to the south of South America, would have allowed it to adapt to colder climates and seasonality, key to its later establishment in the Mediterranean region. This study highlights the usefulness and value of exploring the life history and biology of invasive species within their native range to better understand invasion scenario.
Cita tipo APA: Chifflet, Lucila . (2016-03-11). Estudios ecológicos y genéticos de la hormiga invasora Wasmannia auropunctata en Argentina, el límite sur de su distribución nativa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5989_Chifflet.pdf Cita tipo Chicago: Chifflet, Lucila. "Estudios ecológicos y genéticos de la hormiga invasora Wasmannia auropunctata en Argentina, el límite sur de su distribución nativa". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-11. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5989_Chifflet.pdf |
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Ruiz, Mariano Manuel. "Estudio de compositos magnetoelásticos estructurados. Síntesis y caracterización de partículas magnéticas y conductoras para obtener propiedades de Piezo y Magneto resistencia" (2016-03-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se estudiaron propiedades magnéticas, elásticas y eléctricas de compositos magneto-elásticos estructurados. Los mismos están formados por dispersiones de material inorgánico magnético en una matriz orgánica elastómera, preparando el composito en presencia de un campo magnético uniforme. Como material inorgánico se utilizaron agregados formados por nanopartículas magnéticas sobre las cuales se redujo plata metálica, los cuales son simultáneamente magnéticos y conductores eléctricos. El hecho de que sean magnéticos permite alinearlos dentro del medio orgánico fluido cuando se aplica el campo magnético. Este proceso se realiza juntamente con el curado térmico o la evaporación del solvente. La preparación en presencia de campo magnético, mientras la matriz es aún fluida, induce la agregación del material inorgánico en estructuras de tipo cadenas, que se ubican una tras otra en la dirección del campo. Los compositos así obtenidos son magnéticos, conductores de la electricidad y elásticos (pues las matrices utilizadas son polímeros elastómeros). Dichas propiedades son anisotrópicas, pues el sistema está estructurado. Las condiciones de preparación, concentración y naturaleza de las partículas, condiciones de curado y tipo de polímero fueron variadas para obtener compositos con distintas propiedades. La tesis comprendió la síntesis y caracterización de nanopartículas de magnetita y ferritas de cobalto (5-15 nm). El paso posterior consistió en obtener agregados de dichas nanopartículas y plata (Ag) por reducción de Ag+ sobre las nanopartículas obtenidas. De esta forma se obtuvieron micro agregados (1-5 μm) que resultaron conductores óhmicos y magnéticos. Se emplearon distintas técnicas de caracterización química, morfológica, magnética y eléctrica, entre ellas DRX, SAXS, SEM, EDS, TEM, Espectroscopía Mossbauer, VSM, SQUID, FMR, STM, potenciometría, etc. Se utilizaron dos tipos de elastómeros: poli-dimetil-siloxano (PDMS) con distinto grado de entrecruzamiento y goma de estireno-butadieno (SBR, por sus siglas en inglés). En el caso de PDMS se obtuvieron cortes milimétricos cuya superficie se puede mecanizar para obtener conductividad a través de los cortes. El curado térmico con las micropartículas incluidas se realizó en moldes rotantes ubicados entre los polos de un electroimán. En el caso de SBR se obtuvieron películas de 100-150 μm utilizando un dispositivo especialmente diseñado. Los compositos se caracterizaron por FTIR, TGA, RMN, DSC, curvas deformación-tensión, profilometría, etc. Se estudiaron las propiedades de magnetoresistencia y piezoresistencia de los compositos obtenidos, analizando la variación de la conductancia eléctrica con campos magnéticos externos (magnetoresistencia) y con tensiones mecánicas aplicadas (piezoresistencia). Siempre se observó aumentó de la conducción eléctrica al aplicar dichos campos en la dirección de las cadenas formadas en el material. La reversibilidad de las respuestas obtenidas es dependiente del tipo de partícula magnética empleada (superparamagnéticas o ferromagnéticas). Estos aspectos, fundamentales para el diseño de sensores piezo y/o magneto resistivos, son discutidos en la presente tesis. Abstract: Magnetic, elastic and electrical properties of magneto-elastic structured composites were studied. They are formed by magnetic inorganic material dispersions in an organic elastomeric matrix, preparing the composite in the presence of a uniform magnetic field. The inorganic material is formed by clusters of magnetic nanoparticles and metallic silver, which are simultaneously magnetic and electrical conductors. These clusters can be aligned within the organic medium when the magnetic field is applied during preparation. This process is performed in conjunction with thermal curing or solvent evaporation. The preparation in the presence of magnetic field, while the array is still fluid, induces aggregation of inorganic material in chain structures, which are located one after another in the direction of the field. The composites thus obtained are magnetic, electrically conductive and elastic (for the matrices used are elastomeric polymers). These properties are anisotropic as the system is structured. The preparation conditions, concentration and nature of the particles, curing conditions and type of polymer were varied to obtain composites with different properties. The thesis includes the synthesis and characterization of nanoparticles of magnetite and cobalt ferrites (5-15 nm). The subsequent step was to obtain aggregates of those nanoparticles and silver (Ag) by reduction of Ag + on the nanoparticles. Thus micro aggregates (1-5 μm) ,which are magnetic and ohmic conductors, were obtained. Several techniques of chemical, morphological, magnetic and electric characterization were used, including XRD, SAXS, SEM, EDS, TEM, Mossbauer spectroscopy, VSM, SQUID, FMR, STM, potentiometry, etc. Poly-dimethyl-siloxane (PDMS) with different degrees of cross-linking, and styrene-butadiene rubber (SBR) were used as elastomers. For PDMS millimetre slides were obtained whose surface was machined to obtain conductivity through the material. Thermal curing was performed (after adding the microparticles) using rotating moulds placed between the poles of an electromagnet. In the case of SBR, films of 100-150 μm were obtained using a specially designed device. The composites were characterized by FTIR, TGA, NMR, DSC, stress-strain curves, profilometry, etc. Magnetoresistance and piezoresistance of the composites were studied by analyzing the change in electrical conductance with external magnetic field (magnetoresistance) and applied mechanical stress (piezoresistance). The electrical conductance increases when applying those fields in the direction of the chains formed in the material. The reversibility of the responses depends on the type of magnetic particle (superparamagnetic or ferromagnetic). These aspects, which are essentials to the design of piezo and / or magneto resistive sensors, are discussed in this thesis.
Cita tipo APA: Ruiz, Mariano Manuel . (2016-03-10). Estudio de compositos magnetoelásticos estructurados. Síntesis y caracterización de partículas magnéticas y conductoras para obtener propiedades de Piezo y Magneto resistencia. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5929_Ruiz.pdf Cita tipo Chicago: Ruiz, Mariano Manuel. "Estudio de compositos magnetoelásticos estructurados. Síntesis y caracterización de partículas magnéticas y conductoras para obtener propiedades de Piezo y Magneto resistencia". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5929_Ruiz.pdf |
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de Paola, María Matilde. "Caracterización molecular de las proteínas SNSP y NSF en ovocito de ratón: su rol en la exocitosis de gránulos corticales e implicancias en la fertilidad" (2016-03-10). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La exocitosis de gránulos corticales (EGC) es un tipo de secreción regulada por Calcio que involucra un proceso de fusión de membranas esencial para la fecundación. Luego de la fusión del espermatozoide, los gránulos corticales son exocitados y liberan su contenido al espacio perivitelino. Esta secreción difunde hacia la zona pelúcida, y la transforma en una barrera física, evitando así la poliespermia, y asegurando un desarrollo embrionario normal. El mecanismo molecular que media la fusión de membranas durante la EGC se encuentra escasamente caracterizado y se cree que es mediado por la vía de las SNARE (SNAP receptors). El objetivo principal de este trabajo fue investigar si las SNAP (soluble NSF attachment proteins) y NSF (N-ethilmaleimide sensitive factor), proteínas clave en la vía de las SNARE, median la EGC en ovocito. El análisis de la expresión génica mostró que α SNAP, γ SNAP y NSF se expresan en ovocitos de ratón. Ensayos de Western blot mostraron que la expresión de estas proteínas se mantiene en niveles similares durante la maduración y activación temprana del ovocito. Su localización fue observada principalmente en la región cortical, enriquecida en GC. Para evaluar la función de estas proteínas en la EGC, se perturbó a las SNAP y NSF endógenas previo a la activación de ovocitos en metafase II. La microinyección de α SNAP salvaje y de la mutante dominante negativa L294A de α SNAP inhibió la EGC estimulada por Estroncio. NEM, un inhibidor irreversible de NSF y la microinyección de la mutante dominante negativa D1EQ de NSF inhibieron la EGC. La microinyección de los anticuerpos anti-α SNAP y anti-NSF fueron capaces de inhibir la EGC. Para comprender el rol de α SNAP en la fertilidad femenina, utilizamos la cepa de ratones hyh (hydrocephalus with hop gait), portadora de una mutación puntual (M105I) en el gen de α SNAP. Debido a que el ratón knockout para α SNAP es letal embrionario, los ratones hyh proveen un modelo único para el estudio de su función in vivo. Los resultados obtenidos indicaron que las hembras hyh presentan una severa reducción en su fertilidad debido a una combinación de defectos producidos por la proteína mutada. Nuestros resultados revelan que α SNAP, γ SNAP y NSF son expresados en ovocitos de ratón, que α SNAP y NSF son requeridos para la EGC y que la mutación M105I en α SNAP conduce a defectos multifactoriales en la fertilidad de las hembras hyh. Estos datos demuestran por primera vez que α SNAP y NSF juegan un rol importante en la reproducción femenina. Abstract: Cortical granule exocytosis (CGE) is a calcium-regulated secretion that represents a membrane fusion process essential for fertilization. Following sperm fusion, cortical granules (CG) undergo exocytosis to release their content into the perivitelline space. The secretion diffuses into the zona pellucida and transforms it into a physical barrier, avoiding polyspermy and ensuring normal embryonic development. The molecular mechanism of membrane fusion during CGE is still poorly understood and is thought to be mediated by the SNARE (SNAP receptors) pathway. The main purpose of the present study was to investigate if SNAP (soluble NSF attachment proteins) and NSF (N-ethilmaleimide sensitive factor), two key proteins in the SNARE pathway, mediate CGE in an oocyte model. We first investigated the gene expression of SNAP and NSF. RT-PCR results showed that α and γ SNAP (but not β), and NSF are expressed in mouse oocytes. Immunoblotting analysis showed that the expression of these proteins maintains a similar level during oocyte maturation and early activation. Their localization was mainly observed at the cortical region, which is enriched in CGs. To evaluate the function of these proteins in CGE, endogenous SNAP and NSF proteins were perturbed prior to CGE activation in metaphase II oocytes. The microinjection of wild type α SNAP and L294A mutant of α SNAP inhibited CGE stimulated by strontium. NEM, an irreversibly inhibitor of NSF, and the microinjection of the dominant negative mutant D1EQ NSF inhibited CGE. The microinjection of anti-α SNAP and anti-NSF antibodies was able to abolish CGE. Furthermore, in an attempt to further understand the role of α SNAP in female fertility, we used a spontaneous mutant mouse model for α SNAP known as hyh (hydrocephalus with hop gait), carrying a point mutation M105I. Due to α SNAP knockout mice is embryonic lethal, the hyh mice provide a unique in vivo model for in-depth research of α SNAP function. We have demonstrated that hyh female mice exhibit strongly reduced fertility parameters. Our findings revealed that α SNAP, γ SNAP, and NSF are expressed in mouse oocytes, that α SNAP and NSF are required for CGE and that M105I mutation in α SNAP leads to multifactorial fertility defects in hyh female mice. These data demonstrate for the first time that α SNAP and NSF play an important role in female reproduction.
Cita tipo APA: de Paola, María Matilde . (2016-03-10). Caracterización molecular de las proteínas SNSP y NSF en ovocito de ratón: su rol en la exocitosis de gránulos corticales e implicancias en la fertilidad. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5911_DePaola.pdf Cita tipo Chicago: de Paola, María Matilde. "Caracterización molecular de las proteínas SNSP y NSF en ovocito de ratón: su rol en la exocitosis de gránulos corticales e implicancias en la fertilidad". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-10. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5911_DePaola.pdf |
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Mininni, Camilo Juan. "Rol de la corteza prefrontal y el área tegmental ventral en la toma de decisiones" (2016-03-08). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La corteza prefrontal (CPF) y el área tegmental ventral (ATV) son regiones cerebrales clave dentro del circuito neuronal del refuerzo. La CPF integra información multisensorial e información relacionada sobre recompensas y orquesta la conducta a través de sus conexiones con estructuras motoras. Por otro lado, el ATV codifica información acerca de recompensas y estímulos condicionados, y ejerce efectos modulatorios sobre la CPF que permiten la correcta ejecución de numerosas tareas cognitivas. Sin embargo, los mecanismos subyacentes a la interacción CPF-ATV no han sido esclarecidos. En la presente tesis se estudió el rol que desempeñan la CPF y el ATV en la codificación de estímulos condicionados, en el contexto de una toma de decisión. Para ello se registraron simultáneamente poblaciones de neuronas de CPF y ATV de ratas mientras realizaban una discriminación auditiva en un paradigma GO/NOGO. Las neuronas de CPF y ATV aumentaron su tasa de disparo preferencialmente durante la presentación de los estímulos sonoros asociados con la recompensa. En el ATV se encontró una subpoblación de neuronas que responden de manera rápida y transitoria durante el inicio del estímulo, y otra subpoblación de respuesta más lenta y persistente, que codifica la respuesta conductual elegida. Por otro lado, las neuronas de CPF incrementaron tanto su capacidad máxima de codificar información (CI), como la información sobre la clase del estímulo presentado. El aumento en CI ocurrió de manera eficiente, y tanto la CI como la eficiencia del aumento fueron directamente proporcionales a la tasa de disparo del ATV. Lo observado es explicado en términos de un modelo computacional en donde el aumento eficiente de CI en la CPF ocurre debido a dos factores: un aumento en la tasa de disparo ocasionada por el estímulo condicionado, y una decorrelación inducida por el disparo de las neuronas del ATV. Los resultados obtenidos demuestran que la interacción CPF-ATV instancia mecanismos que permiten la codificación eficiente de información relevante en la actividad ruidosa de las poblaciones de neuronas. Abstract: The prefrontal cortex (PFC) and ventral tegmental area (VTA) are key brain regions within the neural circuit of reward. The PFC integrates multisensory and reward-related information, and orchestrate behavior through its connections with motor structures. On the other hand, the VTA conveys information about reward and conditioned stimuli, and exerts modulatory effects onto the PFC, enabling the proper execution of several cognitive functions. Nevertheless, the underlying mechanisms behind the PFC-VTA interaction have not been elucidated. In this work I studied the role carried by the PFC and VTA during conditioned stimuli coding in decision making context. To that end, neural populations from PFC and VTA were recorded simultaneously in rats performing in a sound discrimination task under a GO/NOGO paradigm. Neurons from PFC and VTA increased their firing rate preferentially during presentation of reward-associated stimuli. In VTA a subpopulation of neurons displayed a fast and transient response during stimuli onset, while another subpopulation displayed a slower, persistent response related to the selected behavioral response. On the other hand, PFC neurons increased both their maximum information coding capacity (IC) and the information conveyed about the identity of the conditioned stimulus. The growth in IC occurred in an efficient way, and both IC and the efficiency in IC growth were proportional to the VTA firing rate. These results are explained in terms of a computational model where efficient IC growth occurs as the result of two factors: an increase in firing rate due to the presentation of the conditioned stimuli, and a decorrelation induced by the firing of VTA neurons. These results demonstrate that the PFC-VTA interaction instantiate mechanisms that enable the efficient coding of relevant information in the noise activity of neuron populations.
Cita tipo APA: Mininni, Camilo Juan . (2016-03-08). Rol de la corteza prefrontal y el área tegmental ventral en la toma de decisiones. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5894_Mininni.pdf Cita tipo Chicago: Mininni, Camilo Juan. "Rol de la corteza prefrontal y el área tegmental ventral en la toma de decisiones". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-08. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5894_Mininni.pdf |
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Falivene, Juliana. "Estudio del impacto del balance Th17/Treg en periferia y en mucosas sobre la funcionalidad de la respuesta celular antiviral y la inmunopatogénesis de la infección HIV/SIDA" (2016-03-08). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Las subpoblaciones de linfocitos Th17 y T regulatorios (Treg) han sido relacionados con la progresión a enfermedad en el contexto de la infección por HIV-1. Sin embargo, su relación con la respuesta adaptativa T CD8+ antiviral durante la infección aguda/temprana por HIV (PHI, primary HIV infection) no ha sido aún estudiada. En este contexto, el primer objetivo general de este trabajo de tesis consistió en analizar las subpoblaciones Th17 y Treg y su relación con la respuesta celular T CD8+ específica frente a HIV y parámetros de seguimiento de la infección durante la infección aguda/temprana y hasta un año postinfección (p.i). Para ello se utilizaron muestras de sangre de 14 dadores sanos (DSs), 40 PHI, 17 Crónicos y 13 controladores elite (ECs, Elite Controllers). Los porcentajes de células Th17 y Treg se encontraban severamente alterados en individuos Crónicos, mientras que todos los pacientes infectados con HIV evidenciaron un desbalance Th17/Treg comparados con DSs (incluso ECs), en concordancia con sus mayores proporciones de células T CD8+ activadas (HLA-DR+/CD38+). Un mejor estatus clínico (evidenciado por mayores recuentos de células T CD4+ y menores cargas virales y activación inmune) se asoció con mayores niveles de Th17 y menores niveles de Treg. Notablemente, se encontraron correlaciones positivas entre los niveles basales de Th17 y la funcionalidad de la respuesta T CD8+ específica frente a HIV: la capacidad de suprimir la replicación viral (VIA, viral inhibitory activity) y la proporción de células polifuncionales (IFN-γ+/CD107A/B +) tanto a tiempos tempranos como tardíos p.i, resaltando el valor pronóstico de la subpoblación Th17 en la preservación de una inmunidad celular antiviral más eficiente. La relación Th17/Treg y la intensidad media de fluorescencia relativa (IMFr) de IL-17 también se correlacionaron positivamente con VIA. Debido a la importancia del tratamiento antirretroviral (TARV) en la reconstitución inmune de individuos infectados, a continuación se decidió caracterizar las subpoblaciones Th17, Treg y su balance en sangre periférica y mucosa cervical y su implicancia en la inmunopatogénesis de HIV-1 en ausencia o presencia de TARV. Para ello se utilizaron muestras de 19 individuos TARV+ (más de 2 años con supresión efectiva de la CV), 22 pacientes crónicamente infectados naïve de tratamiento (TARV-) y 20 DSs. Tras el tratamiento, tanto la frecuencia de Th17 como la relación Th17/Treg en periferia alcanzaron valores similares a los observados en DSs, en contraste a lo observado en células Treg cuyos niveles se mantuvieron altos. Asimismo, en individuos TARV+ se observó una disminución de los niveles de activación inmune a pesar de lo cual no se alcanzaron valores normales, hallándose correlaciones negativas entre los niveles de activación celular y el balance Th17/Treg. Por otro lado, mayores niveles de la citoquina proinflamatoria IL-1β en exocervix se correlacionaron positivamente con los niveles de activación celular periféricos, sugiriendo que existiría una relación entre los niveles de inflamación sistémicos y lo observado en sitios de mucosas. Es importante destacar que el tratamiento no indujo un incremento de los recuentos de células T CD4+ CD161+ (subpoblación de células precursoras de Th17 que migran a intestino) los cuales resultaron significativamente menores a los observados en DSs. Asimismo, al estudiar el patrón de secreción de citoquinas por parte de células mononucleares de cérvix (CMCs) estimuladas, se observó que las CMCs provenientes de individuos TARV+ secretan menores niveles de IL-17A e IL-10 en relación a las de DSs. En conjunto, los resultados de la presente tesis sugieren, por un lado, la existencia de una potencial relación entre la subpoblación Th17 y el balance Th17/Treg con respuestas T CD8+ HIV-específicas que juegan un rol clave en la contención de la infección. Por otro lado, aunque el tratamiento antirretroviral parece tener un impacto positivo sobre la restauración de las funciones inmunes a nivel sistémico, tanto los niveles de precursores de células Th17 que migran a intestino como la secreción de IL-17A e IL-10 por CMCs no alcanzaron valores normales, sugiriendo que en sitios de mucosas la restauración inmune es incompleta. Abstract: Th17 and Treg subsets have been related to disease progression during HIV-1 infection. However, the potential relation of these T cell subsets with antiviral T-cell responses during primary HIV infection (PHI) has not been studied yet. In this context, the first aim of this study was to analyze Th17 and Treg subsets and their relation with anti-HIV T-cell responses and clinical parameters during PHI and up to one year post-infection (p.i). Samples from 14 healthy donors (HDs), 40 PHI patients, 17 Chronics, and 13 Elite controllers (ECs) were studied. The percentages of Th17 and Treg subsets were severely altered in Chronics, whereas all HIV-infected individuals (including ECs) showed Th17/Treg imbalance compared to HDs, in concordance with higher frequencies of activated CD8+ Tcells (HLA-DR+/CD38+). Better clinical status (higher CD4+ T-cell counts, lower viral loads and immune activation) was associated with higher Th17 and lower Treg levels. Positive correlations were found between Th17 at baseline and anti-HIV CD8+ T-cell functionality: viral inhibitory activity (VIA) and key polyfunctions (IFN-γ+/CD107A/B +) at both early and later times p.i, highlighting the prognostic value of Th17 cells to preserve an effective antiviral T-cell immunity. Th17/Treg ratio and the IL-17 relative mean fluorescence intensity were also positively correlated with VIA. Due to the importance that antiretroviral treatment (ART) has in the immune reconstitution of HIV+ patients, the second aim of this study was to characterize Th17 and Treg subsets and their balance in peripheral blood and female genital tract and their implications in the immunopathogenesis of HIV-1 infection comparing ART+ with ARTpatients. Samples from 19 HIV+ ART+ patients (more than 2 years under treatment), 22 HIV+ ART naïve patients (ART-) and 20 HDs were used. After treatment, both the frequency of Th17 cells as well as Th17/Treg ratio in peripheral blood reached similar levels compared to HDs, in contrast to that observed for Treg cells that remained at high levels despite ART. Also, ART was accompanied by a reduction in the immune activation levels, yet not to normal values, finding negative correlations between cellular immune activation and Th17/Treg ratio. On the other hand, high levels of the proinflammatory cytokine IL-1β in exocervix samples were positively correlated with higher levels of cellular immune activation in the blood, suggesting a relationship exists between systemic and mucosal activation/inflammation. Importantly, ART did not induce a proper restoration of CD4+ CD161+ T-cell counts (a subset of Th17 precursor cells with GALT homing properties) which were significantly lower compared to HDs. Interestingly, it was observed that cervix mononuclear cells (CMCs) from ART+ subjects secreted lower amounts of IL-17A and IL-10 upon stimulation than those obtained from HDs. Taken together, these results suggested, first, a potential link between Th17 and Th17/Treg ratio with key HIV-specific CD8+ T-cell responses against the infection. On the other hand, although ART has a positive impact on immune restoration in blood, both the levels of Th17 precursor subset with GALT homing properties and the ability of CMCs to secrete IL-17A and IL-10 did not reach normal values, suggesting that immune restoration at mucosal sites is impaired or incomplete.
Cita tipo APA: Falivene, Juliana . (2016-03-08). Estudio del impacto del balance Th17/Treg en periferia y en mucosas sobre la funcionalidad de la respuesta celular antiviral y la inmunopatogénesis de la infección HIV/SIDA. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5906_Falivene.pdf Cita tipo Chicago: Falivene, Juliana. "Estudio del impacto del balance Th17/Treg en periferia y en mucosas sobre la funcionalidad de la respuesta celular antiviral y la inmunopatogénesis de la infección HIV/SIDA". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-08. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5906_Falivene.pdf |
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Kurtz, Melisa Lidia Amelia. "Agonistas de los PPAR como reguladores de anomalías fetales inducidas por la diabetes materna" (2016-03-07). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: En el presente trabajo se estudiaron anomalías en el corazón y el pulmón fetal en un modelo de diabetes moderada en rata y se evaluaron los efectos de la administración de agonistas de los receptores activados por proliferadores peroxisomales α y γ (PPARα, PPARγ) sobre dichas alteraciones. En el corazón y el pulmón fetal de rata diabética se evidenció en forma sexodependiente, sobreacumulación de lípidos, disminución en la expresión de enzimas de oxidación lipídica, aumento en la producción de óxido nítrico (NO) y lipoperoxidos y disminución de la expresión de PPARα y PPARγ. La administración intrafetal de agonistas de PPARα (LTB4) y PPARγ (15dPGJ2) hacia finales de la gestación o tratamientos maternos con dietas enriquecidas en ácidos grasos agonistas de los PPAR durante toda la preñez, mostraron regular varios parámetros alterados por la diabetes materna en corazón y pulmón fetal, entre ellos la anómala expresión de los PPAR y de enzimas y transportadores involucrados en el metabolismo lipídico, la sobreproducción de NO y el daño oxidativo a lípidos. Varios de los efectos de los agonistas de PPAR variaron de acuerdo al órgano y el sexo fetal. Además, los tratamientos dietarios mostraron efectos particulares de acuerdo al tipo de ácido graso suplementado en la dieta materna. De esta forma se identificaron anomalías en el metabolismo de lípidos y marcadores de un estado pro-inflamatorio y pro-oxidante en corazones y pulmones fetales durante la gestación de rata diabética a término, que se vinculan con alteraciones en la expresión y función de los receptores nucleares PPAR. Estas anomalías podrían condicionar el desarrollo y función de dichos órganos teniendo consecuencias en la vida posnatal. A su vez, se describieron efectos benéficos de los agonistas de PPAR como moduladores de las alteraciones fetales provocadas por la diabetes materna. Abstract: In this study, anomalies in the fetal heart and lungs were evaluated using a mild diabetes rat model. Moreover, the effects of administrating peroxisome proliferator activated receptor α and γ (PPARα, PPARγ) agonists on these alterations were evaluated. Regarding the anomalies produced as a consequence of the maternal diabetes, in this study, fetal hearts and lungs from diabetic rats showed over-accumulation of lipids, reduced lipid oxidation enzymes expression, increased nitric oxide (NO) and lipoperoxides production and decreased expression of PPARα and PPARγ. For studying the effects of PPAR agonists administration on these anomalies, two protocols were used, finding that the effect of the intrafetal administration of PPARα and PPARγ agonists (LTB4 and 15dPGJ2 respectively) at the end of pregnancy were similar to those observed when mothers received troughout pregnancy diets enriched in fatty acids capable of activating PPARs. Both protocols regulated those alterations induced by maternal diabetes in the fetal hearts and lungs; such as impaired expression of PPARs and enzymes/transporters involved in lipid metabolism, NO overproduction and lipid oxidative damage. The effects of PPAR agonists varied depending on the fetal sex or organ analyzed. Moreover, the effect of the maternal diet was related to the type of fatty acid enriched that it has. Therefore, anomalies in the metabolism of lipids, pro-inflammatory and prooxidant state markers were here identified in fetal hearts and lungs as consequence of maternal diabetes in rats at term gestation. These anomalies were linked to alterations in the expression and function of PPAR; that may influence the development and functions of those organs, impacting on postnatal life. On the other hand, the beneficial effects of PPAR agonists on these alterations were also here described.
Cita tipo APA: Kurtz, Melisa Lidia Amelia . (2016-03-07). Agonistas de los PPAR como reguladores de anomalías fetales inducidas por la diabetes materna. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5904_Kurtz.pdf Cita tipo Chicago: Kurtz, Melisa Lidia Amelia. "Agonistas de los PPAR como reguladores de anomalías fetales inducidas por la diabetes materna". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-07. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5904_Kurtz.pdf |
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Saucedo, Marcos Adolfo. "Estudio de los efectos de diferentes fuentes de error sobre la calidad de los análisis generados por un sistema de asimilación por filtros de Kalman" (2016-03-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El presente trabajo de tesis plantea la realización de experimentos idealizados de asimilación de datos basado en un Filtro de Kalman por ensambles (EnKF) sobre un dominio regional centrado en Sudamérica. En particular se emplea el algoritmo conocido como Local Ensemble Transform Kalman Filter (LETKF) acoplado al modelo numérico Weather Research and Forecasting (WRF). Los experimentos exploran la sensibilidad del sistema de asimilación frente a los errores de modelo y los errores presentes en las condiciones de borde lateral. Los resultados indican que las regiones tropicales son más sensibles a los errores de modelo, mientras que las latitudes medias están más directamente influenciadas por los errores en las condiciones de borde lateral. Para reducir los errores del análisis se evalúan diferentes metodologías que buscan representar de manera explícita los errores en el sistema de asimilación: la inflación multiplicativa adaptativa estimada, los ensambles físicos y la introducción de perturbaciones en las condiciones de borde lateral. El empleo de dichas técnicas permite reducir el del error del análisis y contribuye a mejorar la representación de su incertidumbre. Sin embargo, los mejores resultados se obtienen al combinar dichas técnicas de forma simultánea. Finalmente, se llevan adelante experimentos utilizando observaciones reales en los que se explora el impacto de la resolución del modelo en la calidad del análisis y de los pronósticos a corto plazo. En estos experimentos se encuentra que el aumento de la resolución del modelo numérico genera una mejora tanto de la calidad del análisis como del pronóstico resultante. Sin embargo, los resultados sugieren que un tratamiento adecuado de las diferentes fuentes de incertidumbre que afectan a un sistema de análisis - pronóstico regional, junto con la incorporación de una mayor cantidad de observaciones, podría producir un impacto mayor sobre la calidad del análisis. Abstract: The present work proposes the realization of idealized data assimilation experiments based on an Ensemble Kalman Filter (EnKF) in a regional domain centered in South America. In particular, the Local Ensemble Transform Kalman Filter (LETKF) coupled with the Weather Research and Forecasting (WRF) model is employed. These experiments explore the sensitivity of the assimilation system to the model and lateral boundary condition errors. Results indicate that tropical regions are more sensitive to model errors, whereas mid-latitudes are more affected by lateral boundary condition errors. In order to reduce analysis errors different methodologies that seek to represent explicitly errors present in the assimilation system are employed: the estimated adaptive multiplicative inflation, perturbed physic ensemble and perturbed lateral boundary conditions. The employment of these techniques provides a reduction of the analysis error and contributes to improve the representation of the uncertainty. Nevertheless, the best results are obtained when these techniques are employed simultaneously. Finally, data assimilation experiments using real observations exploring the impact of model’s horizontal resolution in both the analysis and short term forecast are carried on. In these experiments it is found that the increment in model resolution results in an improvement of both the analysis and the forecast. However, results suggest that an adequate treatment of the different error sources that affect a regional analysis - forecast system and the inclusion of a greater amount of observations in the assimilation process further enhance the improvement on the analysis quality.
Cita tipo APA: Saucedo, Marcos Adolfo . (2016-03-04). Estudio de los efectos de diferentes fuentes de error sobre la calidad de los análisis generados por un sistema de asimilación por filtros de Kalman. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5939_Saucedo.pdf Cita tipo Chicago: Saucedo, Marcos Adolfo. "Estudio de los efectos de diferentes fuentes de error sobre la calidad de los análisis generados por un sistema de asimilación por filtros de Kalman". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5939_Saucedo.pdf |
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Sabbione, Florencia. "Propiedades inmunomodulatorias de las trampas extracelulares de neutrófilos (NETs)" (2016-03-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La injuria pulmonar produce la liberación de ácido úrico que, a concentraciones locales elevadas, precipita formando cristales de urato monosódico (MSU). Estos cristales producen una considerable inflamación asociada a infiltración neutrofílica. Luego de la estimulación con MSU, los neutrófilos liberan trampas extracelulares (NETs), compuestas por cromatina y proteínas granulares, nucleares y citoplasmáticas asociadas. En este trabajo se estudió si las NETs inducidas por MSU (NETs-MSU), poseen propiedades inmunoregulatorias tanto sobre células epiteliales pulmonares como sobre otras células del sistema inmune innato como células dendríticas y macrófagos. Se observó que las NETs-MSU incrementaron significativamente la secreción de interleuquina (IL) 8 e IL-6 por células epiteliales pulmonares y bronquiales. Estos efectos no fueron reproducidos por sobrenadantes de neutrófilos estimulados con MSU en presencia de inhibidores de la netosis, como un inhibidor de elastasa o el inhibidor de la NADPH oxidasa DPI. Las NETs-MSU no afectaron la viabilidad de las células epiteliales, ni su morfología, como tampoco la integridad de la barrera epitelial formada por células epiteliales polarizadas. La capacidad estimulatoria de citoquinas de las NETs no fue afectada por la degradación del ADN con nucleasa micrococal, ni tampoco por el tratamiento de las mismas con heparina o cuando la actividad de la elastasa asociada a las NETs fue bloqueada con un inhibidor. Sin embargo, el efecto observado fue revertido al tratar a las NETs con un anticuerpo bloqueante de la proteína del grupo de alta movilidad (HMGB1). El efecto proinflamatorio de las NETs se observó también en macrófagos humanos derivados de monocitos pero no en células dendríticas derivadas de monocitos, indicando que las propiedades proinflamatorias de las NETs-MSU son específicas de ciertos tipos celulares. En conjunto, los resultados de esta tesis indican que las NETs inducidas por MSU inducen efectos proinflamatorios en células de las vías respiratorias, que podrían contribuir al reclutamiento de neutrófilos in vivo y a la perpetuación de la inflamación y al daño del tejido pulmonar. Nuestros hallazgos podrían ser relevantes para el tratamiento de enfermedades caracterizadas por una inflamación marcada del tracto respiratorio, como la fibrosis quística y el daño pulmonar agudo (ALI). En estas patologías, a pesar de haberse corroborado la presencia de grandes cantidades de NETs en el tracto respiratorio, el tratamiento con DNasas no logra resolver el cuadro inflamatorio. Los resultados de este trabajo de tesis, indicando que el tratamiento de las NETs con MNasa no reduce su capacidad proinflamatoria permiten especular que tratamientos tendientes a limitar la producción de las NETs o a bloquear a la molécula HMGB1, podrían representar opciones terapéuticas más apropiadas a fin de mitigar la inflamación que acompaña a estas patologías. Abstract: Lung tissue injury leads to the release of uric acid which at high local concentrations forms monosodium urate crystals (MSU). These crystals trigger robust neutrophilic inflammation. Upon MSU stimulation, neutrophils release extracellular traps (NET) composed by chromatin and antimicrobial proteins associated. Here we investigated whether MSU-induced NET could be involved in the development of inflammation by stimulating cytokine release by airway epithelial cells and other relevant innate immune cells such as dendritic cells and macrophages. We found that MSU-induced NET significantly increased the secretion of IL-8 and IL-6 by lung and bronchial epithelial cells. These effects were not observed when NETosis was impaired by Diphenyleneiodonium or elastase inhibitor. Furthermore, NET did not affect the viability of airway epithelial cells, neither did they modify their morphology nor the barrier integrity of polarized cells. The epithelial stimulatory capacity of NET was not affected by degradation of DNA with micrococcal nuclease (MNase), treatment of NET with heparin or inhibition of the elastase immobilized to DNA, but was significantly reduced by pretreatment of NET with an anti-high mobility group box-1 blocking antibody (HMGB1). Additionally this proinflammatory effect was also observed in human monocyte- derived macrophages and not in human monocyte-derived dendritic cells. This indicates that the proinflammatory response is restricted to certain cell types. Altogether, our findings indicate that MSU-induced NET exert direct proinflammatory effects on airway epithelial cells that might contribute in vivo to further recruitment of neutrophils and perpetuation of inflammation upon lung tissue damage. These results could be relevant for treatment of pulmonary inflammatory pathologies, like cystic fibrosis and acute lung injury (ALI). Despite the fact that it has been proved the presence of large amounts of NET in these diseases, the current treatment with DNases does not resolve the associated inflammation. Our findings indicating that MNase treatment does not reduce the inflammatory capacity of NET suggest that treatments with NETosis inhibitors or HMGB1 blocking antibodies could be relevant therapeutics options to mitigate the inflammation in these pathologies.
Cita tipo APA: Sabbione, Florencia . (2016-03-04). Propiedades inmunomodulatorias de las trampas extracelulares de neutrófilos (NETs). Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5909_Sabbione.pdf Cita tipo Chicago: Sabbione, Florencia. "Propiedades inmunomodulatorias de las trampas extracelulares de neutrófilos (NETs)". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5909_Sabbione.pdf |
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Lavinia Oblanca, Pablo Damián. "Estudio de los patrones de diversificación de la avifauna neotropical a través del análisis de especies de ambientes selváticos" (2016-03-04). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: El Neotrópico posee la avifauna más diversa del mundo con más de 3.000 especies que se reproducen en sus tierras. Gran parte de esta diversidad se encuentra concentrada en sus ambientes selváticos, entre los cuales se incluyen la Selva Atlántica y las Yungas y su transición con la selva Amazónica. En esta tesis se estudiaron los patrones y procesos responsables de la diversificación de las aves neotropicales a través del análisis de tres especies de Passeriformes de ambientes selváticos sudamericanos: Habia rubica (Cardinalidae), Ramphotrigon megacephalum (Tyrannidae) y Pipraeidea melanonota (Thraupidae). Las tres especies poseen distribuciones disyuntas que incluyen poblaciones alopátricas en la Selva Atlántica y el complejo Yungas-Amazonas, y a su vez representan algunas de las principales radiaciones de Passeriformes del Neotrópico. Se utilizó un enfoque integrador, combinando análisis genéticos (marcadores nucleares y mitocondriales) con el estudio de la variación fenotípica (coloración del plumaje) y comportamental (vocalizaciones). Los resultados sugieren que las historias evolutivas de estas especies han sido afectadas de distinta forma por un factor común: el establecimiento del corredor de vegetación abierta que aisla actualmente a la Selva Atlántica del complejo Yungas-Amazonas. No obstante, la diversificación de cada una de estas especies evidenció, al mismo tiempo, ciertos atributos idiosincráticos, sugiriendo que sus historias evolutivas han sido moldeadas por factores tanto compartidos como específicos de las mismas. Las diferencias en las historias evolutivas de estas tres especies podrían asociarse a sus ecologías contrastantes. En conclusión, esta tesis sustenta la idea de que la diversificación de la avifauna neotropical no puede ser restringida a una única ventana temporal ni explicada a través de uno o unos pocos mecanismos evolutivos. PALABRAS CLAVE: Amazonas, Ambientes selváticos, Aves, Canto, Citocromo b, COI, Coloración, Diversificación, Especiación, Filogenética, Filogeografía, Habia rubica, Neotrópico, Pipraeidea melanonota, Ramphotrigon megacephalum, Selva Atlántica, Yungas. Abstract: The Neotropics possess the highest avian diversity of the world with over 3,000 breeding species. Most of this richness is found within its rainforests, which include some of the most biodiverse regions in the planet like the Atlantic Forest and the Yungas Forest together with the Amazonia. Here I studied the factors and processes that have promoted avian diversification in the Neotropics through the analysis of three species of Passeriformes that inhabit South American forests: Habia rubica (Cardinalidae), Ramphotrigon megacephalum (Tyrannidae) and Pipraeidea melanonota (Thraupidae). All of these species have disjunct distributions that include allopatric populations in the Atlantic Forest and the Yungas-Amazonia complex, and at the same time represent some of the main passerine radiations in the Neotropics. I applied an integrative approach combining genotypic (mitochondrial and nuclear markers) and phenotypic (plumage coloration and vocalizations) evidence. The results suggest that the evolutionary histories of these species have been differentially affected by one common factor: the establishment of the open vegetation corridor that currently isolates the Atlantic Forest from the Yungas-Amazonia complex. However, the diversification processes of each of these species showed some idiosyncratic features, suggesting that their evolutionary histories have been shaped by both shared and unique factors. The differences found among these species could be associated with their contrasting ecologies. In conclusion, this thesis supports the idea that the diversification of the Neotropical avifauna cannot be restricted to a single temporal period or explained by a single or a few evolutionary drivers. KEY-WORDS: Amazonia, Atlantic Forest, Birds, COI, Cytochrome b, Diversification, Habia rubica, Neotropics, Pipraeidea melanonota, Phylogenetics, Phylogeography, Plumage coloration, Rainforests, Ramphotrigon megacephalum, Song, Speciation, Yungas Forest.
Cita tipo APA: Lavinia Oblanca, Pablo Damián . (2016-03-04). Estudio de los patrones de diversificación de la avifauna neotropical a través del análisis de especies de ambientes selváticos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5896_LaviniaOblanca.pdf Cita tipo Chicago: Lavinia Oblanca, Pablo Damián. "Estudio de los patrones de diversificación de la avifauna neotropical a través del análisis de especies de ambientes selváticos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-04. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5896_LaviniaOblanca.pdf |
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Vicente, Sebastián. "Deshidratación osmótica de tejido de manzana: influencia de la naturaleza del agente osmótico y de la actividad de agua en la estructura, las propiedades reológicas y la movilidad molecular del agua" (2016-03-03). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Se evaluaron los efectos causados por el proceso de deshidratación osmótica con soluciones de glucosa, trehalosa, jarabe de maíz de alta maltosa y maltosa, para alcanzar actividades de agua (aw) en equilibrio de 0,97 y/o 0,94 en el tejido parenquimático de manzana. La estructura (estudiada mediante microscopía óptica y electrónica de transmisión), las propiedades reológicas (estudiadas a altas y bajas deformaciones) y la movilidad molecular del agua (estudiada mediante espectros de 1H–RMN) de la manzana fueron significativamente afectadas por los tratamientos. Los tejidos deshidratados presentaron una textura más blanda y deformable que los frescos y perdieron dureza y su estado crujiente. Las propiedades de compresión cambiaron abruptamente luego del tratamiento de deshidratación a aw 0,97, mientras que la reducción de la aw hasta 0,94 produjo una respuesta más similar a la de las muestras frescas. Luego de la ósmosis, los módulos G’ y G’’ indicaron una estructura que conservaba su comportamiento de gel débil. La deshidratación provocó un aumento de las capacitancias nombradas J0, J1 y J2 y de la fluidez 1/ηN de las matrices. Fue posible determinar una fuerte disminución en la movilidad del agua debido al descenso de humedad en el tejido. La relajación de los protones del agua exhibió un comportamiento bi y triexponencial, que indicó la presencia de poblaciones de agua de diferente movilidad. La naturaleza del agente osmótico empleado y el nivel de aw alcanzado influyeron en el comportamiento frente a la compresión, en la movilidad molecular del agua y en la estructura de la muestra, mientras que no se distinguieron diferencias físicas en los ensayos a bajas deformaciones. Abstract: The effects caused by the osmotic dehydration process with different impregnation glucose, trehalose, corn syrup high maltose and maltose solutions, reaching equilibrium water activities (aw) of 0.97 and / or 0.94 in apple parenchyma tissue were evaluated. The structure (studied by light and transmission electron microscopy), rheological properties (studied by high and low deformations) and molecular water mobility (studied by 1H NMR spectra) of apple were significantly affected by treatments. Dehydrated tissues showed softer and more deformable texture than fresh apples and lost crispness and hardness. The compression properties of tissue abruptly change after osmotic dehydration treatment at aw 0.97, while reducing aw to 0.94 resulted in a compression response similar to the fresh samples. The behavior of G’ and G’’ modules indicate a weaker gel behavior after osmosis. Dehydration caused an increase in the J0, J1 and J2 capacitances and the fluidity 1/ηN in the matrices. It was possible to determine a sharp decrease in water mobility due to lower humidity in the tissue. Water protons relaxation exhibited a bi and triexponential behavior which indicate the presence of different water mobility populations. The osmotic agent nature and the aw level reached influenced the performance of compression, water mobility and structure of the sample, whereas physical differences in low deformations tests could not be distinguished.
Cita tipo APA: Vicente, Sebastián . (2016-03-03). Deshidratación osmótica de tejido de manzana: influencia de la naturaleza del agente osmótico y de la actividad de agua en la estructura, las propiedades reológicas y la movilidad molecular del agua. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6082_Vicente.pdf Cita tipo Chicago: Vicente, Sebastián. "Deshidratación osmótica de tejido de manzana: influencia de la naturaleza del agente osmótico y de la actividad de agua en la estructura, las propiedades reológicas y la movilidad molecular del agua". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-03-03. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_6082_Vicente.pdf |
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Mercau, María Elisa. "Mecanismos celulares involucrados en la regulación del eje hipotálamo-hipófiso-adrenal en un modelo animal de insulinorresistencia inducida por la ingesta de carbohidratos simples" (2016-02-22). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: Diversas evidencias experimentales demostraron que el desarrollo de insulinorresistencia (IR) se acompaña de cambios en la actividad del eje hipotálamo-hipófiso_adrenal (HHA) que se traducen en variaciones en los niveles sanguíneos de glucocorticoides (GC), tanto en pacientes como en modelos animales de la enfermedad. En trabajos previos de nuestro laboratorio demostramos un aumento en los niveles de GC en animales tratados con una dieta rica en sacarosa (DRS) durante 7 semanas que se asoció con una respuesta adrenal disminuida en la prueba de estimulación con la hormona adrenocorticotropina (ACTH). Dado que la principal hormona reguladora de la secreción de GC es la ACTH, el objetivo central de este trabajo de tesis consistió en evaluar los efectos de la administración de DRS sobre la producción de ATCH en distintos estadios del dearrollo de IR y estudiar los mecanismos subyacentes a las alteraciones encontradas a nivel adenohipofisario. En ese marco, evaluamos los efectos del tratamiento antioxidante sobre cambios tempranos inducidos por el consumo de DRS y del ejercicio moderado como medida preventiva de los efectos de la exposición prolongada a la dieta. Los resultados obtenidos indicaron que en el modelo animal de IR por la administración de DRS, los animales presentaron cambios en la secreción de ACTH y corticosterona. En etapas tempranas del tratamiento (3 semanas) encontramos un aumento en la actividad del eje HHA, que fue previa a la detección de cambios en la insulinosensibilidad sistémica (evidente a partir de la séptima semana del inicio del consumo de DRS). Sin embargo, en animales tratados por períodos más prolongados (15 semanas) observamos una disminución de los niveles circulantes de ACTH y de corticosterona. Postulamos que la hiperactivación temprana del eje podría estar asociada con la generación de estrés oxidativo a nivel adenohipofisario, dado que el tratamiento antioxidante sistémico previno tanto el aumento de marcadores de este proceso como la hipersecreción de ACTH. La disminución en la actividad del eje HHA detectada en etapas más tardías del tratamiento podría ser consecuencia de la exposición crónica del tejido hipofisario al estrés oxidativo, inducido por concentraciones elevadas de ácidos grasos no esterificados (AGNE) circulantes, un efecto que podría ser medido por la inducción de autofagia. Demostramos que el ejercicio moderado previno la inducción de estos procesos y la inhibición de la secreción de ACTH en animales alimentados con DRS durante 15 semanas, además de evitar el incremento de AGNE. Finalmente, estudiamos con mayor profundidad estos procesos en células adenohipofisarias en cultivo evaluando el efecto de la incubación de células de la línea ArR-20 con ácido palmítico (C16:O) y con inductores de estrés oxidativo y autofagia. En suma, nuestros resultados indican que la administración de una DRS produce un incremento temprano en la expresión de Pomc y ACTH posiblemente mediada por la generación de estrés oxidativo tisular. Una exposición prolongada del tejido a niveles incrementados de nutrientes, como los ácidos grasos, adicionalmente induce el proceso autofágico, lo que lleva a una hipofunción de la glándula. Los GC afectan el metabolismo estimulando la movilización de las reservas energéticas. Sin embargo, un aumento sostenido de los niveles de estas hormonas podría contribuir al agravamiento de las características metabólicas del síndrome de IR, y precipitar la aparición de las complicaciones a largo plazo relacionadas con la enfermedad. En nuestro modelo, el estado de IR crónico se correlacionó con una inhibición de la actividad basal del eje HHA, lo que contribuiría al restablecimiento de la homeostasis metabólica. Sin embargo, también podría dar lugar a complicaciones adicionales, como la insuficiencia adrenal, afectando la respuesta del organismo frente a situaciones de estrés, lo que representaría otro factor de riesgo para los pacientes con IR. Abstract: It has been previously described that insulin resistant (IR) individuals (humans and animals) have an altered function of the hypothalamic-pituitary-adrenal axis (HPA), which translates into changes in their blood levels of glucocorticoids (GC). Previous studies from our group have shown that animals fed a sucrose-rich diet (SRD) for 7 weeks exhibit an increase in basal GC secretion, associated with an impairment os adrenal response to an exogenous ACTH challenge. Given that the adrenocorticotropic hormone (ACTH) secreted by the pituitary gland is the main regulator of adrenal function, the main goal of the present study was to analyse the effect of SRD consumption on ACTH production at different stages of the development of IR, and elucidate possible underlying mechanisms operating at pituitary level. In this context, we analyzed the effects of antioxidant treatment on the early changes induced by SRD consumption, and of moderate exercise as a preventive measure to counteract the effects of prolonged exposure to SRD. Our results indicate that in the experimental model of SRD-induced IR, animals present alterations in the production and blood levels of ACTH and corticosterone. In this sense, we observed that SRD treatment induces an early hyperactivation of the HPA axis (3rd week), which was prior to the observed changes in insulin sensitivity (only evident after 7 weeks os treatment). However, as treatment progresses, prolonges SRD-consumption (15 weeks) inhibits basal HPA activity, as evidenced by lower circulating ACTH and corticosterone levels. We propose that the early hyperactivation of the HPA axis found in SRD-treated animals could be associated with the generation of oxidative stress at pituitary level, given that systemic antioxidant treatment prevented the induction of these processes and also ACTH hypersecretion. The impairment in HPA activity induced by long-term SRD treatment (15 weeks), could ba a consequence of chronic overexposure of the pituitary tissue to increased levels of circulating non-esterified fatty acids (NEFA), which could trigger oxidative-stress induced autophagy in ACTH-producing cells. Our results show that moderate exercise prevented the induction of these cellular processes, as well as SRD-induced corticotroph dysfunction, while also normalizing NEFA levels. In order to confirm these results, we studied the underlying mechanisms in cultured corticotrophs by incubating ArT-20 cells in the presence of plamitic acid (C16:O), a main component of the NEFA fraction, or with oxidative stress and autophagy inductors. From these studies we concluded that oxidative stress generation and autophagy mediate POMC inhibition triggered by palmitic acid treatment. Taken together, our results show that SRD administration induces an early increase in Pomc expression and ACTH release, possibly mediated by an increase in oxidative stress at pituitary level. Chronic exposure of pituitary tissue to an increased concentration of nutrients (e.g. fatty acids, among others) additionally induces autophagy in corticotroph cells, which could lead to inhibition of ACTH production. Among other actions, GC affect metabolism by stimulating the mobilization of energy stores in order to cope with increased metabolic demands. However, a sustained increase in circulating GC levels could contribute to aggravate the clinical manifestations of metabolic syndrome. In our animal model, chronic IR correlated with inhibition of basal HPA axis activity, which could help to restore metabolic homeostasis. However, this could also lead to complications, such as adrenal insufficiency, that might affect the response to stressful stimuli, representing an additional risk for patients with IR.
Cita tipo APA: Mercau, María Elisa . (2016-02-22). Mecanismos celulares involucrados en la regulación del eje hipotálamo-hipófiso-adrenal en un modelo animal de insulinorresistencia inducida por la ingesta de carbohidratos simples. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5865_Mercau.pdf Cita tipo Chicago: Mercau, María Elisa. "Mecanismos celulares involucrados en la regulación del eje hipotálamo-hipófiso-adrenal en un modelo animal de insulinorresistencia inducida por la ingesta de carbohidratos simples". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-02-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5865_Mercau.pdf |
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Avalos Serrano, Verónica Nathalí. "Estrategia integrada basada en procesos, requerimientos, medición y evaluación para la construcción de almacenes de datos" (2016-02-22). Tesis de maestría. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita
Cita tipo APA: Avalos Serrano, Verónica Nathalí . (2016-02-22). Estrategia integrada basada en procesos, requerimientos, medición y evaluación para la construcción de almacenes de datos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5861_AvalosSerrano.pdf Cita tipo Chicago: Avalos Serrano, Verónica Nathalí. "Estrategia integrada basada en procesos, requerimientos, medición y evaluación para la construcción de almacenes de datos". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-02-22. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5861_AvalosSerrano.pdf |
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Ferreyroa, Gisele Verónica. "Retención, biodisponibilidad y remediación de Pb en suelos: efectos de la interacción suelo-planta (Brassica napus) y bioacumulación" (2016-02-19). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. pdf Resumen Ocultar Resumen Registro Ocultar Registro Cita Ocultar Cita Resumen: La contaminación en suelos por metales pesados, en particular por plomo, es una problemática ambiental de gran importancia; la movilidad y biodisponibilidad de dicho contaminante es fuertemente dependiente de los componentes bióticos y abióticos del suelo. Debido a la importancia toxicológica que la contaminación de Pb reviste en nuestro país, en esta tesis se propone analizar la interacción de este metal con los componentes del suelo y su posible remediación con plantas. Por lo tanto, los objetivos generales del presente trabajo son la determinación de la especiación del metal y su interacción con los componentes del suelo, y el estudio sobre la capacidad de acumulación del metal por parte de una planta de cultivo (Brassica napus, colza), analizando el efecto de dicha planta sobre la especiación del metal. En el estudio sobre la especiación química del metal en el suelo y su evolución temporal, se observó que el Pb se asocia rápidamente con las fracciones minerales, quedando una muy baja fracciónn en forma soluble e intercambiable al cabo de 60 días, que es en principio la fracciónn biodisponible. Luego, mediante el cultivo de Brassica napus en suelos con agregado de Pb reciente y otro con contaminación consolidada por Pb, se analizó la interacción e influencia de la rizosfera en la especiación del metal. El efecto resultó en una mayor concentración de Pb en la zona rizosférica del suelo con contaminación reciente, particularmente en la fracción mineral, y en la permanencia de fracciones intercambiables de Pb en la etapa de fructificación de la planta. En la madurez fisiológica de B. napus, no se detectó contenido de Pb en la fracción intercambiable. Brassica napus resultó ser una especie acumuladora de Pb en suelos con contaminación reciente. Se cuantificó su concentración en hojas, resultando mayor en hojas jóvenes y en granos. Se observaron efectos negativos en la ultraestructura celular (particularmente cloroplastos), y en el contenido de foto pigmentos, los cuales se cuantificaron exitosamente mediante metodos no invasivos. Aun así, no se observo un efecto negativo en su desarrollo fenológico. EN suelos con contaminación consolidada, no se detectó contenido del metal en los organos estudiados de B. napus. Se concluye entonces que la presencia de Pb recientemente incorporado al suelo resulta en la acumulación del metal por Brassica napus, mientras que si el metal ha permanecido en el suelo previamente sembrado, este no se encuentra disponible para la planta debido a que este evoluciona hacia formas químicas mas estables, no biodisponibles. Abstract: Soil contamination by heavy metals, in particular lead, is an environmental issue of great importance; the mobility and bioavailability of this pollutant are strongly dependent on the biotic and abiotic components of soil. Because of the toxicological significance of lead pollution in our country, in this thesis it is proposed to analyze the interaction of the metal with soil components and possible ways for phytoremediation. Therefore, the general objectives of this study are to determine the speciation of the metal and its interaction with soil components, and the study of metal storage capacity by a crop plant (Brassica napus, rapeseed) analyzing the effect of the plant on the speciation of the metal. In the study on the chemical speciation of Pb in soil, and its time evolution, it was observed that Pb is rapidly associated with mineral fractions; the soluble and exchangeable fraction, wich is considered bioavaliable, has a very low level after 60 years. The interaction and influence of the rhizosphere on the metal speciation was analyzed. This was accomplished, by growing Brassica napus in polluted soils, both with recent addition of Pb and with consolidated Pb pollution. A higher concentration of Pb in the rhizosphere zone in soil with recent pollution was determined, mainly in the mineral fraction; exchangeable Pb is still detectable in the fruiting stage of the plant. At physiological maturity of B. napus, Pb content is not detected in the exchangeable fraction. Brassica napus proved to be a good Pb accumulator from soils with recent contamination. Metal concentration was quantified in leaves, being higher in young leaves, and grains. negative effects were observed in cell ultrastructure (particularly in chloroplasts), and photo pigments content was successfully quantified by non-invasive methods. Still, no negative effect was observed in phenological development. Lead content is not detected in the studied organs of B. napus for soils with consolidated contamination. It is concluded that the presence of Pb recently incorporated into the soil results in the accumulation of the metal by Brassica napus; if the metal has remained in the soil prior to planting, it is not avaliable for the plant because it evolves into more stable and non-bioavaliable chemical forms.
Cita tipo APA: Ferreyroa, Gisele Verónica . (2016-02-19). Retención, biodisponibilidad y remediación de Pb en suelos: efectos de la interacción suelo-planta (Brassica napus) y bioacumulación. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5910_Ferreyroa.pdf Cita tipo Chicago: Ferreyroa, Gisele Verónica. "Retención, biodisponibilidad y remediación de Pb en suelos: efectos de la interacción suelo-planta (Brassica napus) y bioacumulación". Tesis de Doctorado. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2016-02-19. http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_5910_Ferreyroa.pdf |
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