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Yacomiti, Alejandro M.. "Sistemas ópticos excitables" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Esta tesis es un estudio experimental y teórico sobre sistemas ópticos que presentan excitabilidad. La excitabilidad es un concepto que proviene de la biología, en particular de neurociencia, y se refiere a la propiedad de ciertos sistemas de generar pulsos sólo cuando una perturbación externa supera un dado umbral. Cuando un sistema excitable se encuentra en presencia de ruido, las fluctuaciones estocásticas pueden llevarlo por encima del umbral y así provocar una dinámica de pulsación. Nuestro trabajo se basa en la generación de herramientas para poder validar o refutar escenarios de excitabilidad y ruido en sistemas ópticos donde se conjetura la existencia de excitabilidad. Los sistemas estudiados son tres: un láser de semiconductor con retroacción óptica, dos tales sistemas acoplados simétricamente mediante mutua inyección de luz, y un láser de estado sólido con absorbente saturable. El procedimiento propuesto para validar o refutar escenarios de excitabilidad se basa en la modelización con sistemas dinámicos sencillos, junto con la construcción de observables adecuados con el objeto de comparar las medidas experimentales con los resultados teóricos. De esta manera pudimos demostrar que la dinámica de un laser de semiconductor con retroacción óptica de moderada a fuerte puede interpretarse con un paradigma de esqueleto determinista en dos dimensiones (con propiedades excitables) más ruido. Por su parte, la dinámica de las celdas acopladas en el régimen de alta disipación pudo explicarse a partir de un 2-toro en presencia de ruido, lo que permite interpretar dos láseres con retroacción acoplados ópticamente como dos sistemas excitables acoplados. Por último, mostramos por primera vez excitabilidad en un láser de estado sólido con absorbente saturable. Dicho sistema no es influenciado significativamente por ruido, con lo que pueden aplicarse técnicas convencionales de estimulación externa para evaluar excitabilidad.

Abstract:
This thesis is an experimental and theoretical study on several systems that present excitability. Excitability comes from biology, particularly from neuroscience, and it refers to the property of some systems of developing pulses only as some external stimulus overcomes a certain threshold. When an excitable system is in presence of noise, the stochastic kicks may drive it beyond the threshold, thus resulting in a pulsation dynamics. Our work relies on the generation of new tools to validate or to refuse scenarios of excitability and noise in optical systems, where the existence of excitability is already conjectured. The systems under study are three: a semiconductor laser with optical feedback, two such systems coupled, and a solid-state laser with saturable absorber. The procedure for validating or refusing excitability scenarios consists on the proposal of simple dynamical models, together with the construction of adequate observables in order to compare the experimental data with the theoretical results. In this way we have been able to demonstrate that the dynamical behavior of a semiconductor laser with strong to moderate optical feedback can be captured with a two-dimensional deterministic Skeleton (which accounts for excitability) plus noise. Furthermore, we have shown that two mutually coupled semiconductor laser with feedback (in the strong dissipation regime) can be interpreted as two coupled optical cells. This has been achieved by embedding the experimental time series-data in a two-torus. Finally, we have demonstrated for the first time excitability in a solid-state laser with saturable absorber. As the noise does not significantly affect this system, the usual excitability tests are likely to be applied, and the excitable nature can be recognized straightforwardly.

Wolosiuk, Ricardo Alejandro. "Sistemas supramoleculares organizados por ensamblado de capas monomoleculares de enzimas y polímeros rédox" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Un biosensor constituye un dispositivo de reconocimiento molecular donde una macromolécula, generalmente de origen biológico interactúa con un analito en forma específica e inicia asi un proceso que se transduce en una señal eléctrica. Dentro de esta categoría podemos distinguir a los electrodos enzimáticos amperométricos, donde son medidos cambios de corriente eléctrica sobre un electrodo de trabajo a partir de variaciones en el estado rédox de un mediador que participa del proceso biocatalítico con la enzima rédox. La regeneración del estado rédox inicial del mediador sobre la superficie de un electrodo — aplicando potenciales apropiados — permite que se produzca un estado estacionario en la catálisis y por ende una corriente eléctrica también estacionaria. Este flujo de electrones se halla correlacionado en forma directa con el consumo del analito. El estudio de electrodos enzimáticos amperométricos ha estado tradicionalmente ligado a la inmovilización de las enzimas rédox en matrices poliméricas. Lamentablemente, estos sistemas integrados presentan dificultades para su estudio a escala molecular dadas por la complejidad y falta de control en la organización espacial del biosensor. Esto impide un análisis microscópico de las variables que afectan la respuesta de estos biosensores tales como el espesor, la concentración de enzima y mediador rédox o la cinética de reacción entre la enzima rédox y el mediador. La presente tesis propone una estrategia para el diseño de electrodos enzimáticos amperométricos para su utilización como biosensores. Esto involucra el empleo de técnicas de autoensamblado electrostático con el objetivo de depositar en forma altemada y secuencial la enzima rédox y el mediador. De esta manera es posible evaluar distintos parámetros de la película formada: la cantidad de enzima adsorbida, empleando la microbalanza de cuarzo (QCM); los sitios rédox depositados, por medio de técnicas electroquímicas; el espesor, mediante elipsometría y la morfología de la superficie, utilizando microscopía de fuerza atómica (AFM). Por otra parte, es evidente que el grado de control en el diseño del electrodo enzimático amperométrico permite analizar su respuesta en función de la estructura construida. En este contexto, se trabajó con dos enzimas rédox aniónicas: glucosa oxidasa (GOx) y peroxidasa de soja (SBP), mientras que se empleó polialilamina catiónica modificada con un complejo de +(PAH-Os) y un polielectrolito rédox globular de origen dendrítico, poliamidoamina modificada con el mismos complejo (PAMAM-Os) como mediadores rédox. En una primera etapa, se estudió el efecto de la estructura electrostática sobre la respuesta electroquímica de la PAH-Os. Dado que el film depositado es multi-bipolar, posee la propiedad de excluir iones por fuerzas electrostáticas repulsivas. En este sentido, el autoensamblado de PAH-Os con polielectrolitos aniónicos como poliestirensulfonato (PSS) y polivinilsulfonato (PVS) permitió elaborar un modelo de membrana permselectiva para analizar este comportamiento. Las cargas positivas - dadas por los grupos amino - y negativas — dadas por los grupos sulfonato - determinan la aparición de un potencial de membrana que puede ser interpretado en términos del potencial de Donnan. De esta manera, en soluciones de baja fuerza iónica, la permselectividad impuesta por este potencial se torna evidente y el tipo de ion excluido depende de la identidad de la capa terminal y del pH de la solución, afectando el potencial formal de la cupla de PAH-Os en la estructura. Por otra parte, en soluciones de alta fuerza iónica, el potencial formal de la cupla de PAH-Os en la estructura se aproxima al valor del complejo de + en solución. El uso de la microbalanza de cuarzo electroquímica (EQCM) demostró la naturaleza de los iones intercambiados entre la película depositada y solución de electrolito en cada una de las situaciones descriptas anteriormente. Se reconocen tres procesos asociados en el diseño de un biosensor. Por un lado el mediador rédox inmovilizado electrostáticamente sobre el electrodo debe intercambiar electrones con esta superficie. En una segunda etapa, la carga rédox debe propagarse a lo largo de las capas sucesivas. Finalmente, el mediador rédox debe alcanzar el grupo prostético rédox de la enzima para realizar la transferencia electrónica. De esta forma es posible transducir el proceso de reconocimiento molecular del sustrato efectuado por la enzima en una corriente catalítica. En particular, un aumento de la concentración del sustrato resultará en un incremento de la señal amperométrica. En el marco de los procesos que hemos identificado, estudiamos la influencia de la disposición espacial de la GOx adsorbida en una monocapa sobre la comunicación eléctrica entre el mediador y la enzima. En este contexto, mediante medidas de QCM, AFM y técnicas electroquímicas determinamos que el nivel de agregación de proteína sobre la superficie del electrodo incide de manera negativa en la constante de velocidad aparente de la mediación catalítica de la PAH-Os en la oxidación del sustrato de la GOx, β-D-glucosa. Más aún, la cantidad de enzima que interactúa con el mediador es mucho menor a la enzima pesada por QCM. Sin embargo, al aumentar la relación de concentración superficial entre los sitios de Os adsorbidos y la enzima depositada, se incrementaba tanto la cantidad de enzima “cableada” por la PAH-Os como así también la constante de velocidad aparente con el grupo FADH2 de la GOx. El mecanismo de transporte de carga rédox en el sistema PAH-Os / GOx fue estudiado intercalando una capa de GOx activa con capas de apoenzima inactiva, apo-GOx. Ubicando la capa reactiva a distancia variable del electrodo fue posible determinar el coeficiente de difusión de la carga rédox, De, en la estructura electrostática autoensamblada. El valor de De obtenido - en el orden de 10ˉ9 cm² sˉ¹ — implica que el transporte de carga ocurre a través de un mecanismo de saltos electrónicos ya que la difusión fisica de las cadenas poliméricas de la PAH-Os se halla impedida. De esta manera, la construcción capa por capa de estos electrodos permitió definir espacialmente el sistema y estudiar el transporte de carga rédox a lo largo de distancias nanométricas. La posibilidad de propagar la estructura en forma repetida y construir un sistema de multicapas de PAH-Os / GOx permitió establecer similitudes y diferencias entre las distintas capas depositadas. En particular, se encontró que la primer bicapa de PAH-Os / GOx difiere notablemente del resto que le siguen debido a que la PAH-Os interactúa con la enzima únicamente por “debajo”. Por otra parte, al aumentar el pH desde donde se adsorbía la solución de PAH-Os las cantidades de enzima y carga rédox depositadas eran mayores. Esto es debido a que el polielectrolito rédox tiende a adoptar una conformación que expone una mayor proporción de segmentos poliméricos sobre la superficie que inducen la agregación de enzimas. Si bien la proporción de enzimas que reaccionan con la PAH-Os es mayor en este caso, la constante de velocidad permanece relativamente invariable. Exploramos también el uso de un mediador rédox globular de origen dendrítico, PAMAM-Os autoensamblado con la enzima GOx. Los estudios elipsométricos indicaron un ligero comportamiento elástico del dendrímero modificado al adsorberse en forma electrostática sobre una superficie. Más aún, si bien se encontró que la PAMAM-Os participa activamente en el proceso de catálisis de oxidación de la glucosa se encontraron dificultades para definir la concentración volumétrica de sitios de Os en el film. Finalmente, el autoensamblado electrostático permitió analizar la comunicación eléctrica entre la PAH-Os y SBP que posee un centro prostético constituido por un grupo hemo y reduce H2O2 a expensas de los sitios de PAH-Os reducidos. Por otra parte, dado que la GOx en presencia de O2 oxida la glucosa produciendo H2O2, se ensayó un esquema bienzimático donde se depositaron capas de SBP intercaladas con PAH-Os y una capa de GOx en el tope de la estructura. Trabajando a potenciales reductores se registró la respuesta amperométrica debida a la formación de peróxido de hidrógeno por la capa de GOx. En este sentido se logró definir con precisión de nanometros las distintas capas reactivas. En conclusión, los resultados obtenidos sugieren que el estudio de electrodos enzimáticos amperométricos autoensamblados electrostáticamente constituye una poderosa herramienta para analizar distintos aspectos relacionados a la transferencia electrónica entre enzimas y el mediador rédox, los mecanismos de propagación de electrones en sistemas químicos integrados y la distribución espacial de arreglos multienzimáticos.

Abstract:
A biosensor is a molecular recognition device where a biological macromolecule interacts with an analyte in a unique way that triggers a series of events that are finally transduced in an electrical signal. Among this category we can distinguish the enzymatic amperometric electrodes, where an electrical current is measured over a working electrode due to changes in the redox state of a mediator that panicipates in the biocatalytical process. The regeneration of the initial redox state of the mediator over the surface of the electrode — applying appropiate potentials - results in a catalytic steady state and so is the electrical current. This electron flux can be correlated to the analyte consumption. The study of enzymatic amperometric electrodes has always relied in the immobilization of the redox enzymes in a polymer matrix. Unfortunately, this integrated systems present difficulties in their study at a molecular scale because of their complexity and lack of spatial organization of the biosensor. This prevents a microscopic study of the variables that affect the biosensor response, such as thickness, enzyme concentration and redox mediator concentration or the kinetics between enzyme and mediator. In this thesis we propose a strategy for the design of biosensors based on cnzymatic amperometric electrodes. This involves the use of the electrostatic self-assembly in order to adsorb the redox enzyme and mediator in a sequential and alternate process. Using this technique. it is possible to monito different parameters of the sel-assembled system: the amount of enzyme adsorbed, with the quartz crystal microbalance (QCM); the redox sites deposited, can be obtained from electrochemical methods; the film thickness, using ellipsometry and the surface morfology via the atomic force microscopy (AFM). Moreover, the spatial control in the design of the enzymatic amperometric electrode allows to study the performance according to the structure built. In this context, we worked with two anionic redox enzymes: glucose oxidase (GOx) and soybean peroxidase (SBP), while as redox mediators we employed cationic poly(allylamine) modified with an osmium complex. ¹, (PAH-Os) and polyamidoamine modified with the same complex (PAMAM-Os). In a first stage, we studied the effect of the electrostatic structure on the electrochemical response of the PAH-Os. Given that the film formed is multi-bipolar. ions can be rejected by repulsive electrostatic forces. In this way, the self-assembly of PAH-Os with anionic polyelectrolytes like poly(styrene) sulfonate (PSS) or poly(vinyl) sulfonate (PVS) allowed to model this behavior as a permselective membrane. The positive charges — given by the amino groups — and the negative charges — given by the sulfonate groups — develop a membrane potential that can be interpreted in terms of the Donnan theory. At low ionic strength Donnan permselectivity of anions or cations is apparent and the nature of the ion exclusion from the film is determined by the charge of the topmost layer and solution pH. On the other hand, at high electrolyte concentration Donnan breakdown is observed and the osmium redox potential approaches the value for the redox couple in solution. The electrochemical quartz microbalance has been used to monitor the exchange ofions with the external electrolyte during redox switching. We can recognize three processes associated to the design of a biosensor. First, the electrostatically immobilized redox mediator must exchange electrons with the electrode surface. Second, the redox charge must travel along the successive immobilized layers. Finally, the redox mediator must reach the enzyme redox prosthetic group for electron transfer. This results in the transduction of the molecular recognition of the substrate by the enzyme and in an increase in the amperometric response. Having identified this series of processes, we studied the influence of the spatial distribution of a monolayer of GOx on the electrical communication between the mediator and the enzyme. QCM, AFM and electrochemical studies have shown that the formation of enzyme aggregates on the surface of the electrode lowers the apparent rate constant of the catalytic redox mediation of PAH-Os in the substrate oxidation of GOx, β-D-glucose. Moreover, the amount of enzyme that interacts with the mediator is lower than the enzyme weighed by the QCM. However, increasing the ratio between the surface concentration of Os adsorbed and enzyme deposited increased the amount of enzyme “Wired” by the PAH-Os and the apparent rate constant between the redox mediator and the FADH2 prostethic group. The redox charge transport mechanism in the PAH-Os / GOx system has been studied varying the relative position of the active GOx enzyme layer with inactive apoenzyme layers, apo-GOx. In this order we were able to determine the diffusion coefficient of the redox charge, De, in the electrostatic self assembled structure. The value of De obtained — in the order of lOˉ9 cm² sˉ¹ — implies that the charge transport mechanism proceeds via electron hopping as the physical diffusion of polymeric strands of PAHOS is hindered. Therefore, the layer-by-layer construction of this electrodes allowed to spatially define the system and to analyze the redox charge transport along nanometric distances. The possibility to expand the structure in a repetitive way and to build a system comprised of multilayers of PAH-Os / GOx allowed to establish similarities and differences between the different deposited layers. We found that the first bilayer of PAH-Os / GOx differs from the following layers on top because the PAH-Os only interacts with the enzyme from “below”. In addition, the pH rise of the PAH-Os solution resulted in larger amounts of enzyme and redox mediator deposited. Lowering the charge density of the redox polyelectrolyte induced a surface conformation where more polymer segments are exposed to the solution interface which in turn favored the enzyme aggregation. Despite that, in this case, the fraction of enzymes that react with PAH-Os is bigger the rate constant remains practically invariant. We also explored the use of a dendritic globular redox mediator. PAMAM-Os, self-assembled with GOx. Ellipsometric studies showed an elastic behaviour of the modified dendrimer when was electrostatically adsorbed on a surface. Moreover, we found that PAMAM-Os readily participates in the catalytic oxidation of glucose but the geometric distribution of the redox couple in the film makes difficult the calculation of the volumetric concentration of redox sites. Finally, the electrostatic self-assembly offered the possibility to analyze the electrical communication between PAH-Os and SBP which has an heme prosthetic group. This enzyme and the PAH-Os in the reduced state converts H2O2 to water. On the other hand, it is known that GOx oxidizes glucose to H2O2 in the presence of O2; in this order a bienzymatic scheme was evaluated where layers of SBP were adsorbed with PAH-Os and a layer of GOx on top of the structure. Working at negative potentials the production of H2O2 from the GOx layer was detected recording the amperometric response. In this sense, the precise nanometric control achieved the separation of the reactive layers. In conclusion, the results obtained suggest that the study of enzymatic amperometric electrodes electrostatically self-assembled is a powerful tool for analyzing different aspects related to electron transfer between enzymes and redox mediators, redox charge transports mechanisms in integrated chemical systems and the spatial distribution of multienzyme arrays.

Wainszelbaum, Marisa. "Trypanosoma cruzi : Mecanismos reguladores de la metaciclogénesis" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el intestino de su vector, insecto hematófago, Trypanosoma cruzi, se encuentra expuesto a una gran variedad de compuestos. Algunos de éstos inducen la diferenciación del parásito hacia su estadío de tripomastigote metacíclico, que es la forma infectante. Este proceso implica la activación de vias especificas de señalización. En esta Tesis investigamos la generación de moléculas liposolubles con actividad metaciclogénica y su mecanismo de acción. Demostramos que los ácidos grasos libres, juegan un rol importante en la metaciclogénesis, el que puede explicarse por la activación de la proteína kinasa C (PKC). La generación de estos ácidos grasos libres tiene lugar por efecto de fosfolipasas exógenas (del intestino del vector) y endógenas (del tripanosoma) actuando en forma concurrente. Estas fosfolipasas han sido aisladas y caracterizadas. Los ácidos grasos libres estimulan la generación de diacilglicerol, contribuyendo a explicar su efecto activador sobre la PKC. A este efecto, se suma la aparición de aumentos de calcio citoplásmico, por exposición a extractos intestinales, que ha sido demostrada anteriormente, con lo que se generan simultáneamente los dos segundos mensajeros (iones calcio y diacilglicerol), requeridos para la activación de la PKC. Estudios previos indicaron que la digestión de la hemoglobina genera péptidos metaciclogénicos que actúan a través de la proteina kinasa A (PKA) del parásito. Existen en consecuencia mecanismos redundantes, mediados por la PKC y la PKA, que aseguran la diferenciación celular en Trypanosoma cruzi. En ambos casos, péptidos de la hemoglobina y ácidos grasos libres, son productos de la digestión de la sangre. Un posible significado biológico de estas observaciones es que dichos productos desempeñen un rol coordinador entre la fisiología alimentaria del insecto y la aparición de las formas infectantes del parásito.

Abstract:
Inside the intestinal medium of its blood sucking vector, Trypanosoma cruzi is exposed to large variety of compounds. Some of these induce the differentiation of the parasite to its infective metacyclic trypomastigote stage. This process implies the activation of specific signaling pathways. In this Thesis we investigate the generation of lipid soluble molecules with metacyclogenic activity and their mechanism of action. We show that free fatty acids play a key role in this process which can be explained through the activation of protein kinase C (PKC). The generation of those free fatty acids takes place through exogenous (intestinal) and endogenous (trypanosomal) phospholipases which act concurrently. These phospholipases have been characterized in this work. The free fatty acids stimulate the formation of diacylglycerol thus, accounting for the PKC-activating effects. Cytoplasmic calcium peaks have been demonstrated to take place upon stimulation with the intestinal extracts. Therefore, both second messengers, diacylglycerol and calcium; appear simultaneously as required for PKC activation. Previous work has shown that peptides derived from the digestion of hemoglobin, have metacyclogenic activity through the activation of protein kinase A (PKA) in the parasite. Thus, there are redundant mechanisms, involving PKC and PKA that ensure cell differentiation in Trypanosoma cruzi. In both cases, hemoglobin peptides and free fatty acids, the regulatory compounds, are blood digestion products. A possible biological meaning of these observations is that such products serve a coordinated role between the feeding physiology of the insect and the appearance of the infective forms of the parasite.

Vásquez, Alberto Marcos. "Modelado de fenómenos de plasma en la corona solar" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La corona es la capa mas externa de la atmosfera del Sol, formada por un plasma relativamente tenue (nc ≈ 10 8ˉ9 cmˉ³) y de alta temperatura (T > 10 6ˉ7K). El plasma coronal, confinado y calentado por los campos magnéticos generados predominantemente en la región convectiva solar, exhibe una gran variedad de fenómenos (le plasma que a su vez abarcan regímenes muy diversos (colisionales, colectivos, estacionarios, impulsivos, emisión térmica, emisión coherente, etc.). Así, el modelado del plasma coronal puede hallar su descripción más adecuada tanto en el enfoque cinético, como en la aproximación magnetohidrodinamica (MHD), dependiendo del fenómeno particular que se investigue. En este contexto, presentamos el estudio y modelado de fenómenos coronales en dos escalas espacio-temporales muy diferentes. Por un lado, un modelo para la ordenada y estable estructura coronal a gran escala (l → 10Rʘ). Por otro lado, un modelo para fenómenos impulsivos de pequeña escala (<0,1Rʘ) que tienen lugar durante fulguracioncs solares. Los estudios presentados requieren del uso de distintos marcos teóricos de física de plasmas (MHD en el primer caso, teoría cinética en el segundo), asi como de datos observacionales de distinto rango espectral (ultravioleta y luz blanca en el el primer caso, ondas de radio y rayos X en el segundo). En ambos casos desarrollamos modelos teóricos semi-empíricos, y derivamos predicciones observables que cotejamos con datos observacionales recientes.

Abstract:
The solar corona, being the outer layer of the solar atmosphere, is formed by a relatively tenuous plasma (nc ≈ 10 8ˉ9 cmˉ³) at very high temperatures (T > 10 6ˉ7K). The coronal plasma, confined and heated by the magnetic fields generated in the underlying convective region, exhibits a wide variety of plasma phenomena which, in turn, display a diversity of physical regimes (collisional, collective, stationary, impulsive, thermal emission, coherent emission. elc.). Hence, coronal plasma modeling may find its more appropriate description either by a kinetic approach, or under the magnetohydrodynamical (MHD) approximation, depending upon the particular processes under consideration. Within this context, we present the study and modeling of coronal plasma phenomena at two very different space-time scales. On one hand, we present a model for the ordered and steady large-scale (l → 10Rʘ) coronal structure. On the other hand, we present a model for small-scale (<0,1Rʘ) impulsive phenomena, which take place during solar flares. The studies presented in this thesis require the use of different plasma physics theoretical frameworks (MHD in the first case, kinetic theory in the second one), as well as the use of observational data at different spectral ranges (ultraviolet and white light in the former case, radio waves and X rays in the later one). In both cases, we developed semi-empirical theoretical models and derived observable predictions that we compared with recently available observational data.

Vilá Ortiz, Guillermo. "Caracterización de la expresión y actividad de las fosfatasas de Serina y treonina durante el desarrollo del sistema nervioso central : función de la Calcineurina" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo en esta tesis fue caracterizar el comportamiento de las fosfatasas de serina y treonina (STPasas) durante el desarrollo del sistema nervioso. Como modelo experimental se empleó en primera instancia el desarrollo postnatal del cerebelo de ratón, ya que durante este período se dan numerosos procesos, como el crecimiento axonal, la formación de sinapsis y la apoptosis, en los cuales las distintas STPasas podrían llegar a estar involucradas. Para caracterizar la expresión de los ARNm de las fosfatasas, se diseño una nueva estrategia, SSDD (Single-Strand Differential Display), la cual nos permitió determinar como era la expresión de los distintos mensajeros a distintas edades. Esta técnica no solo nos permitió observar que cada una de las STPasas detectadas presenta una expresión diferencial, sino que también identificar una nueva variante de splicing de la isoforma gamma de la PP1. Esta técnica también fue empleada con éxito para el estudio de STPsas en tumores del sistema nervioso, pudiéndose observar que tanto la expresión de la isoforma alfa de la PP1 como de las isoformas alfa y beta de la PP2A era mayor en tumores de índole maligna que en benignos. Además, se detectó por primera vez la isoforma gamma de la calcineurina (CaN Aγ) en tumores del sistema nervioso. Durante el desarrollo del cerebelo, se observó que PP2A no muestra variaciones significativas ni en la expresión de proteínas ni en la actividad fosfatasa que posee. Por otro lado, PP1 sí muestra diferencias no solo en la expresión de proteínas, donde se observa un aumento a P13 y una disminución posterior a P20, sino también en lo que respecta a su actividad, cuyo incremento coincide con el período en el cual se empiezan a formar las sinapsis entre los axones de las células grano y las espinas dendríticas de las células de Purkinje. En el mutante cerebeloso staggerer, en el cual se encuentran afectadas las células de Purkinje y no se produce la estabilización sináptica, se encontró que los niveles proteicos de PP1 no disminuyen a P20 como ocurre en el cerebelo normal, y que la actividad no se incrementaba. Por otro lado, la fosfatasa que mostró mayores variaciones durante el desarrollo fue la calcineurina. Específicamente, los niveles de proteínas de la isoforma CaN Aα se incrementan gradualmente con el tiempo, lo cual coincide con el período de formación de sinapsis. En este período además, se produce un incremento en la actividad de la calcineurina. En el mutante staggerer, los niveles de esta isoforma son similares hasta P11, pero después no se incrementan como sucede en el ratón normal. La actividad fosfatasa en el mutante decae también a partir de esta edad. Con el fin de estudiar con mayor detalle la función de la calcineurina, se estudió lo que ocurría en distintos cultivos del sistema nervioso (células PC12, células NT2 y cultivos primarios de células grano). Para esto se incubaron los distintos cultivos con inhibidores de la calcineurina y con oligonucleótidos antisentido contra las dos isoformas. En todos los casos se observó que, tanto la inhibición de la actividad como de la expresión, particularmente de la isoforma CaN Aβ, provocaba que las células murieran por apoptosis, independientemente del estadío de diferenciación en el que ellas se encontraran. Este proceso estaba relacionado con un aumento en los niveles de Bax y una disminución de Bad. Particularmente en el caso de las células NT2, se pudo observar que el aumento de la expresión de Bax coincidía con un incremento en la translocación de la proteína al núcleo, mientras que la disminución de Bad lo hacía con la aparición de “parches” en el citoplasma, lo que es indicativo de una translocación a mitocondria. Posteriormente se estudió lo que ocurría con estas proteínas pro-apoptóticas en el mutante staggerer, el cual presentaba una muy baja actividad de calcineurina. Bad no mostró variaciones pero los niveles de Bax a P20 aumentaron considerablemente. Todos estos resultados sugieren que la inhibición de la expresión o de la actividad de la calcineurina ocasiona que las células entren en apoptosis por un mecanismo que involucra, por lo menos, un aumento en los niveles de Bax.

Abstract:
The objective of this work was to characterize the behavior of serine/threonine phosphatases (STPases) during development in the nervous system. As first approach, mouse cerebellum postnatal development was employed as experimental model, because several processes during this period, such as axonal growth, synapses formation and apoptosis, might involved several STPases. A new method was developed, SSDD (Single-Strand Differential Display), to characterize mRNA expression of STPases, which allowed us to analyze the expression of these messengers at different ages. Using this method, not only a different pattern of mRNA expression was obtained but the identification of a new splicing form of PP1 gamma isoform was achieved. This technique was successfully applied to the study of the mRNA of STPases in tumors of the nervous system too, showing that the PP1 alpha, PP2A alpha and beta isoforms have a increased expression in malign tumors than in benign. In addition, for the first time, calcineurin gamma isoform (CaN Aγ) was detected in tumor of the nervous system. During cerebellum development, PP2A showed no significant changes in protein expression or in the phosphatase activity. On the other hand, PP1 shows differences, not only in protein expression, with an increase in expression at P13 and a posterior decrease at P20. The activity of PP1 was also modified, showing an increase that correlates with the period when synapses begin to form between granule cell axons and dendritic spines of Purkinje cells. When the cerebellar mutant mouse staggerer was analyzed, in which Purkinje cells are affected and synaptic stabilization are impaired, it was found that the protein PP1 levels do not decreased at P20, as in normal cerebellum, and that the activity no increased. On the other hand, the phosphatase that shows the most important changes was calcineurin. Specifically, protein levels of the CaN Aα isoform increased gradually with time, in correlation with the period of synapses formation. In addition, calcineurin showed a raise in its activity. In the staggerer mutant, similarily levels of this protein at P11 were observed, but after this time no increase in expression or activity were observed. With the objective to obtain a more detailed knowledge of calcineurin function, studies using several cultures of nervous system (PC12, NT2 and primary cultures of cerebellar granule cells) were conduced. Incubations with calcineurin inhibitors and oligonucleotide antisenses against both isoforms were performed. In all the cases, inhibition of either the activity or the expression, in particular of the CaN Aβ isoform, produced cell apoptosis, independently of the differentiated state in which the cells are found. In this process, increased Bax and decreased Bad levels were involved. In particular, in NT2 cells, the increased Bax expression was associated with an increased protein translocation to nucleus, while decreased Bad levels with a punctate staining pattern in the cytoplasm, indicating a translocation to mitochondria. Later, we study what happened with these pro-apoptotic proteins in the staggerer mutant mice, that presents a very low calcineurin phosphatase activity. In this case, Bad showed no modifications, but Bax levels increased condisederably. All these results sugget that expression or activity inhibition of calcineurin induce cells to enter in apoptosis, through a mechanism that involved, at least in part, increased in Bax levels.

Vicario, Ana Laura. "Estudio comparativo de la diversidad genética de germoplasma comercial de soja (Glycine max (L.) Merr.) y variedades tradicionales" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La soja (Glycine max (L) Merr.) es uno de los cultivos más importantes para los cuales la variabilidad genética es particularmente limitada debido a que es exótico en los principales países productores (USA, Brasil y Argentina). Los objetivos propuestos dentro del marco de esta tesis fueron la caracterización y cuantificación de la variabilidad genética del germoplasma de soja de uno de sus sitios de origen (China) para su comparación con el argentino y el boliviano mediante el uso de marcadores moleculares y, estudiar la posibilidad de utilizar a los SSR en el registro de variedades de soja en Argentina (y en general), específicamente mediante su adaptación al análisis DHE. Se utilizaron más de 120 genotipos que se analizaron con hasta 33 microsatélites. Como resultado se observó que la diversidad de las variedades comerciales de soja es menor que en el caso de variedades tradicionales. Las variedades chinas mostraron mayor número de alelos por locus, mayores valores de similitud e índices de diversidad genética. La mayoría de las variedades argentinas se agruparon separadas de las chinas, sin embargo algunas se relacionaron con estas últimas mostrando que hubo introgresiones de germoplasma chino en el argentino. Se analizaron 10 caracteres morfológicos para las variedades chinas a fin de compararlos con los datos de microsatélites, evidenciándose que cada tipo de marcador explica las relaciones entre las variedades de diferente manera. Ninguno de ellos mostró correlación con los requerimientos fotoperiódicos de las variedades chinas. Los análisis de homogeneidad y estabilidad muestran que es necesario establecer el número mínimo de marcadores a estudiar y cuáles serán éstos antes de aplicarlos en estudios de DHE, ya que las variaciones de los tipos alélicos de los SSR en el tiempo y el carácter selectivamente neutro de estos marcadores pueden modificar los umbrales de diferenciabilidad entre las variedades.

Abstract:
Soybean (Gycine max (L) Merr.) is one of the world most important crops for which the genetic variability is particularly limited, because it is exotic for the most important producing countries (USA, Brazil and Argentina). The principal aims of this work were to characterize and quantify the genetic variability of soybean germplasm form China (center of origin), Argentina and Bolivia using microsatellites markers and to test the possibility of using this kind of markers for DUS testing purposes. More than 120 genotypes were analyzed with up to 33 microsatellites. Commercial soybean varieties showed lower variability than traditional ones. Traditional soybean varieties showed larger allele number per locus, similarity index and diversity values. Most of Argentine varieties clustered separately form Chinese ones, but some mixes were found showing that there were Chinese introgressions into Argentine germplasm. Ten morphological traits were analyzed for Chinese germplasm to compare their genetic diversity description with that derived from micorsatellite profiles showing that different markers explain variety relationships in a different way. None of markers showed correlation with photoperiodic requirements among the Chinese varieties. The homogeneity and stability testing showed that it is needed to carefully establish a minimum number of very well characterized markers before their application to DUS testing, because variability in the allelic SSR profiles and its generally neutral selective nature could modify the distinguishing ability between varieties.

Vera, María Teresa. "Compatibilidad reproductiva entre poblaciones de Ceratitis Capitata (Díptera : Tephritidae)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La mosca de la fruta del Mediterráneo, Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae), es una de las principales plagas frutícolas y hortícolas del mundo. Sus larvas se desarrollan en la pulpa de la fruta, de aproximadamente 250 especies vegetales, produciendo daño directo sobre la producción y daño indirecto al restringir los mercados de exportación. Mundialmente, y en ciertas regiones de la Argentina, se la combate con la técnica del insecto estéril. El estudio de la compatibilidad entre poblaciones silvestres y entre poblaciones y líneas de laboratorio puede brindar información relevante para la mejora de dicha medida de control. En el presente trabajo se buscaron evidencias de incompatibilidad en distintas etapas del proceso reproductivo. Se puso especial énfasis en tres aspectos: compatibilidad para el apareamiento, comportamiento de recópula, y compatibilidad post-cigótica. El estudio de la compatibilidad para el aparcamiento se realizó en condiciones semi-naturales entre dos poblaciones silvestres y entre cuatro poblaciones silvestres y una línea de laboratorio. El estudio de distintos aspectos del comportamiento de recópula analizó principalmente el efecto del origen del macho con el que se aparea una hembra por primera vez en la propensión a recópula. El mismo se llevó a cabo con hembras de laboratorio bajo condiciones de laboratorio, y con hembras silvestres, en condiciones semi-naturales, con machos silvestres y de laboratorio. Estos últimos, en algunos casos, habian sido esterilizados con irradiación. El estudio de la compatibilidad post-cigótica analizó el desempeño de la progenie de cruzas híbridas en atributos relacionados con la viabilidad, la proporción de individuos de cada sexo, o la fertilidad. Se analizó la compatibilidad entre dos poblaciones silvestres, entre 19 poblaciones silvestres y una de dos líneas de laboratorio y entre 22 cruzas híbridas y las 8 líneas que las originaron. Asimismo, se comparó el desempeño de todas las cruzas con valores de referencia. Los resultados mostraron la presencia de compatibilidad entre la población silvestre de Sáenz Peña, Chaco, y la de Reconquista, Santa Fe, tanto para el aparcamiento como post-cigótica. En el estudio de la compatibilidad para el aparcamiento entre cuatro poblaciones silvestres y la linea Argl7y-80, se obtuvieron todas las combinaciones de pareja posibles, mostrando la ocurrencia de aparcamientos entre los individuos del campo y la línea de laboratorio en ambos sentidos. Sin embargo, se observaron también algunas diferencias en el comportamiento sexual entre la línea de laboratorio y los individuos silvestres. Las hembras de las poblaciones de Santa Rosa, Catamarca, y Concordia, Entre Ríos, mostraron una tendencia hacia una falta de aceptación de los machos de laboratorio, sugiriendo un grado incipiente de aislamiento. El estudio del comportamiento de recópula mostró diferencias entre líneas, tanto en machos como en hembras y confirmó que los machos de laboratorio tienen disminuida la capacidad de inducir refractariedad tanto en hembras silvestres como de laboratorio. Se concluyó que la duración de la primera cópula no es una buena medida del éxito post-copulatorio. Además, mostró que la irradiación tiene un efecto adverso sobre el comportamiento post-copulatorio. En cuanto a la compatibilidad post-cigótica, en ningún caso se detectó incompatibilidad en forma generalizada en todas las parejas obtenidas de la cruza entre dos origenes. Sin embargo, para todas las variables analizadas, viabilidad, relación macho:hembra y desarrollo de los ovarios, se observaron familias con anomalías, evidenciando cierto grado de incompatibilidad entre algunos origenes. En el caso puntual de atrofia gonadal, el fenómeno fue encontrado con mayor frecuencia en las líneas de laboratorio, y en las cruzas híbridas, que en las poblaciones silvestres o en cruzas entre poblaciones silvestres y líneas de laboratorio. Se postula que en C. capitata este fenómeno no está asociado al encuentro entre poblaciones silvestres, o líneas con pocas generaciones bajo cría artificial y líneas con muchas generaciones en el laboratorio como se observó en Drosophila melanogaster. Cuando la disponibilidad de material lo permitió y se realizaron las dos cruzas recíprocas, se observó que el comportamiento no fue similar entre ellas. Esto llevó a proponer la presencia de factores citoplasmáticos, y a recomendar que los estudios futuros involucren las cuatro cruzas posibles.

Abstract:
The Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae), is one of the main fruit pests of the world. Their larvae develop in the pulp of approximately 250 fruit or vegetable species, producing direct damage on the production and indirect damage by restricting the export markets. Worldwide, and in certain regions of Argentina, this pest is controlled with the Sterile Insect Technique (SIT). The study of the compatibility among wild populations, and between populations and laboratory strains, can provide useful information for the improvement of this control technique. The present work looked for evidences of incompatibility at different stages of the reproductive process. Special emphasis was placed in three aspects: mating compatibility, remating behaviour, and post-zygotic compatibility. The study of mating compatibility was carried out in field cages under semi-natural conditions between two wild populations and between each of four wild populations and a well-established laboratory strain. The study of different aspects of the remating behaviour focused mainly on the effects of the origin of the first male mated to a female, on the propensity of the female to remate. This study was carried out with laboratory females, under laboratory conditions, with males from different strains, and also with wild females in field cages under semi-natural conditions with wild and laboratory males. These last laboratory strain males, in some cases, had been sterilised with irradiation. Post-zygotic compatibility was analysed by hybrid crosses for traits related to viability and sex ratio of the progeny, as well as female fertility. This study was performed between two wild populations, between nineteen wild populations and one of two laboratory strains, and among eight laboratory strains. A global analysis was performed to compare all the crosses with reference values. The results showed the presence of both mating and post-zygotic compatibility between the populations of Sáenz Peña, Chaco, and Reconquista, Santa Fe. In the study of mating compatibility among four wild populations and the laboratory strain Argl7y-80, all the possible mating combinations were obtained, showing the presence of matings between wild individuals and the laboratory strain in both directions. However, some differences were also observed in the sexual behaviours of the laboratory compared to wild populations. Females from Santa Rosa, Catamarca, and Concordia, Entre Ríos, showed a tendency toward reduced acceptance of laboratory males, suggesting an incipient degree of behavioural isolation. The study of the remating behaviour showed differences among strains, as much in males as in females. It confirmed the fact that laboratory males have a diminished capacity to induce refractoriness to subsequent matings in wild and laboratory females compared to wild males. It is concluded that first mating duration is not a good indirect measure of post-copulatory success. This study also showed that irradiation has an adverse effect on post-copulatory female behaviour. As for post-zygotic compatibility, in no case was incompatibility detected in a generalised way. However, for all the analysed variables (viability, sex ratio and gonadal development), some abnormal families were observed, demostrating a certain degree of incompatibility among some strains. In the case of gonadal atrophy, the phenomenon was more frequent in laboratory strains, and in hybrid crosses among them, compared to wild populations or compared to crosses between wild populations and laboratory strains. It is suggested that in C. capitata this phenomenon is not associated to the encounter between wild populations, or strains with few generations under artificial rearing, and well-established strains with many generations in the laboratory like it was observed for Drosophila melanogaster. When the two reciprocal crosses were performed, they did not behave equally, suggesting the presence of cytoplasmatic incompatibility factors. It is recommend that future studies should involve the four possible crosses. The results obtained here provide bases for the improvement of certain aspects of the SIT, and allow the formulation of hypothesis related to the reproductive success and the compatibility among strains of various origins in this species.

Velardez, Miguel Omar. "Efecto del óxido nítrico sobre la fisiología de la adenohipófisis de la rata" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Antecedentes La regulación de los distintos procesos fisiológicos de la adenohipófisis, tales como desarrollo, diferenciación, secreción hormonal y muerte celular, implica la acción de una variedad de factores provenientes tanto de tejidos periféricos como del sistema nervioso central o de la propias células adenohipofisarias. El óxido nítrico (NO) puede regular la secreción de hormonas hipofisarias. Previamente demostramos que el NO inhibe la secreción basal de prolactina afectando diferentes mecanismos intracelulares. Sin embargo la acción del NO sobre las vías de segundos mensajeros de origen lipídico necesita ser estudiada. Por otro lado, existen diversos estados fisiológicos como la terminación de la lactancia o patofisiológicos como los procesos inflamatorios que pueden inducir muerte celular en la adenohipófisis. A pesar de que la muerte celular parece ser un evento frecuente en la adenohipófisis, son pocos los estudios realizados hasta el momento sobre posibles factores intrahipofisarios inductores de apoptosis. Objetivos Evaluar la acción del NO sobre el metabolismo de mensaieros intracelulares de origen lipídico que afectan la secreción de prolactina adenohipofisaria. Investigar el efecto del NO sobre la viabilidad celular adenohipofisaria. Métodos Se investigó el efecto del NO sobre la actividad de las lipooxigenasas (LOX) y de las ciclooxigenasas (COX) y su relación con la secreción de prolactina mediante la utilización de dadores de NO y sustratos e inhibidores de las NO sintasas (NOS) en adenohipófisis enteras. Se determinó la producción de metabolitos del ócido araquidónico (AA) por la técnica de radioconversión usando como precursor AA radioactivo. También se estudió el efecto del NO sobre el metabolismo de fosfoinosítidos en células adenohipofisarias de rata y su relación con la secreción de prolactina. Se utilizaron dadores de NO e inhibidores de las NOS en cultivos primarios de adenohipófisis premarcados con inositol radioactivo como precursor de los distintos inositoles fosfato (IPs). Se cuantificó la producción de IPs por cromatografía de intercambio iónico. En ambos casos se estudiaron los posibles mecanismos por los cuales el NO afectó la síntesis de dichos segundos mensajeros. Para estudiar la acción del NO sobre la viabilidad celular adenohipofisaria, se examinó la actividad celular (ensayo de MTT)y la morfología nuclear de las células adenohipofisarias en cultivo, utilizando DETA/NO como un dador de acción prolongada. Se estudiaron diferentes mecanismos por los cuales el NO podría afectar la viabilidad celular (capacidad nitrosilante, acción de los peroxinitritos, activación de las caspasas). Ademós, mediante técnicas inmunocitoquímicas, se determinaron los tipos celulares afectados por el NO. En todos los casos se cuantificó la liberación de prolactina por radioinmunoensayo. Resultados El NO inhibió la actividad de la LOX produciendo una disminución de la síntesis de 5-HETE y estimuló la actividad de la COX aumentando la síntesis de prostaglandinas y tromboxanos. Dado que el 5-HETE esta involucrado en la estimulación de la secreción basal de prolactina, y que ésta es la única hormona adenohipofisaria con una liberación basal espontánea, es probable que la disminución de la actividad de la LOX inducida por el NO esté mediando en parte el efecto inhibitorio tónico del NO sobre la liberación basal de prolactina. El NO inhibió la síntesis de IPs estimulada por Angll o TRH, sin afectar su síntesis basal. La inhibición de la actividad de la PLC por NO involucraría un mecanismo independiente de la vía guanilil ciclasa soluble / cGMP / PKG. El NO no tendría una acción directa sobre la PLC, sino que estaría modificando algún factor de la vía de transducción de señales localizado entre el receptor de membrana y la proteína G. Con respecto al efecto del NO sobre la viabilidad celular, demostramos que el NO produce muerte celular con características propias de un proceso apoptótico. En este proceso participarían la caspasa-3 y la caspasa-9 pero no estarían involucrados mecanismos de nitrosilación o la acción de peroxinitritos. Asimismo, la acción proapoptótica del NO parece afectar preferencialemente a los lactotropos. Conclusión El NO al afectar dos procesos fisiológicos fundamentales de la adenohipófisis como son la secreción hormonal y la muerte celular, puede ser considerado como un factor clave dentro los reguladores de la fisiología de la adenohipófisis.

Abstract:
Background The regulation of the physiological processes in anterior pituitary, such as development, differentiation, hormone secretion and cell death, involves a variety of factors coming from peripheral tissues, central nervous system and the pituitary itself. Nitric oxide (NO) is able to regulate anterior pituitary hormone release. Previously, we demonstrated that NO inhibits basal prolactin release by affecting several intracellular pathways. However, NO action on lipidic second messengers in anterior pituitary needs further investigation. On the other hand, there are some physiological -such as termination of lactation-, or pathophysiological states -such as inflammation-, which can induce cell death in the anterior pituitary gland. In spite of the fact that cell death is a frequent event in the anterior pituitary gland, there is little evidence about possible apoptosis inducing factors synthesized by anterior pituitary cells. Objectives To evaluate NO action on lipidic intracellular messengers that affect prolactin secretion. To investigate the effect of NO on anterior pituitary cell viability. Methods NO action on lipooxygenase (LOX)and cyclooxygenase (COX) activities and their relation with prolactin release were investigated by using NO donors and NOS substrate and inhibitors in whole anterior pituitaries. Production of arachidonic acid (AA) metabolites was carried out by a radioconversion technique, using radiolabeled AA as a precursor. Also the effect of NO on phosphoinositides metabolism in rat anterior pituitary cells was studied. We used NO donors and NOS substrate and inhibitors in primary cultures of anterior pituitary cells prelabeled with radioactive inositol as a precursor of inositol phosphates (IPs).Production of IPs was quantified by ionic exchange chromatography. In all cases we studied the mechanisms of action by which NO affected the synthesis of those second messengers. In order to study NO action on anterior pituitary cell viability, we investigated the changes in cellular activity (MTT assay) and nuclear morphology in primary cultures of anterior pituitary cells by using DETA/NO as a long term NO releaser. We studied different mechanisms by which NO could affect cell viability (nytrosylating activity, peroxynitrite action, caspases activation). Besides, we determined the cell types affected by NO by immunocytochemistry. In all cases prolactin release was quantified by radioimmunoassay. Results NO inhibited LOX activity producing a decrease in 5-HETE synthesis, and stimulated COX activity producing an increase of prostaglandins and thromboxanes. Since 5-HETE is involved in the stimulation of basal prolactin release and taking into account that prolactin is the only anterior pituitary hormone with an spontaneously high basal release, it is possible that the decrease in LOX activity induced by NO is mediating, at least in part, the tonic inhibitory effect of NO on prolactin release. NO inhibited Angll- or TRH-stimulated IPs synthesis, without affecting basal synthesis. The inhibition of PLC activity may involve a soluble guanylyl cyclase/cGMP/PKG-independent mechanism. NO seems not to act on PLC, but it could be modifying some factor localized between membrane receptor and G protein. Concerning NO effect on cell viability, we demonstrated that NO produces cell death with characteristics of apoptosis. In this effect, caspase-3 and caspase-9 but not nytrosylation events or peroxynitrites may be participating. Likewise, lactotrophs seem to be preferentially affected by the proapoptotic action of NO. Conclusion NO affected two relevant physiological processes in the anterior pituitary gland, hormonal secretion and cell death. Therefore, it could be considered as a key regulatory factor of the physiology of the rat anterior pituitary gland.

Trivi, Matilde Elena. "Paleoecología del Noroeste de la Provincia de Santa Cruz" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente trabajo de Tesis acerca de la Paleoecología del noroeste de la provincia de Santa Cruz ha sido concretado sobre la base del estudio de una transecta palinológica actual tendida entre Los Antiguos (46° 30’S, 71° 5O’W)y Puerto Deseado (47° 30’S, 66°W), y de un perfil tomado de una excavación arqueológica realizada en la Cueva Grande del Arroyo Feo o Cueva de Altamirano (46° 57'S, 70° 32' W), del área del Rio Pinturas. Los signos de desarrollo sociocultural de los pobladores que habitaron el área coadyuvaron al conocimiento de la historia ambiental. En la primera parte del trabajo se trató la problemática del ambiente actual. La calibración fue la aproximación utilizada para el posterior estudio del paleoambíente a partir del polen. Así, el estudio de las relaciones entre la presencia de polen actual y la información recogida por satélites posibilitó el armado de un modelo de vegetación actual. Por un lado, se utilizó la transecta de polen muestreada, entre la Cordillera y la costa, que atraviesa los distritos fitogeográficos Central Santacrucense, Golfo San Jorge y en algunos casos limita con el Distrito Occidental (Soriano 1956, Cabrera 1976). Por el otro, la información satelital fue tomada por un radiómetro avanzado de muy alta resolución (AVHRR) montado en un satélite Nimbus perteneciente a la Administración Nacional Oceánica Atmosférica (NOAA) de los Estados Unidos de América, en su paso por el área de estudio. La resolución espacial es de 1,1 km, escala compatible con los estudios palinológicos (D’Antoni y Schabitz 1995). Se analizó la información satelital en relación con las unidades fitogeográficas y se halló coincidencia entre los valores de albedo de los canales l y 2 y las unidades fitogeográficas características de cada sector. Luego, el modelo de vegetación actual fue desarrollado por medio de análisis de regresión múltiple: la variable dependiente resultó ser el índice de las diferencias normalizadas de la vegetación (NDVI) y las variables independientes los tipos polínicos Chenopodiaceae, Poaceae, Nassauvia y Ephedra spp. Dicho modelo fue validado y verificado. La segunda parte del trabajo consistió en el análisis de la problemática paleoambiental. En la primera sección se describió el área del Río Pinturas desde diversos aspectos y la segunda, se dedicó al estudio de la Cueva Grande del Arroyo Feo. La excavación realizada en la Cueva Grande en el año 1978 sirvió como base para el estudio de zonación de un perfil, con la datación más antigua de 9410 ╧ 70 años AP. Estudios sedimentológicos y faunísticos llevados a cabo en el sitio permitieron ahondar en la problemática. Se le agregaron a ellos análisis cualitativos del carbón hallado en las muestras de polen de forma de determinar el origen de los mismos y la posibilidad de incendios en el área. Se establecieron cuatro zonas y se hallaron algunas tendencias del clima en el área del Río Pinturas La tercera parte del estudio está relacionada con los aspectos socio-culturales y allí se trata fundamentalmente lo que tiene que ver con la presencia humana en el área: desde el poblamiento y las ocupaciones, los niveles culturales y las manifestaciones artísticas, hasta la relación del hombre con el ambiente La integración de las tres partes mencionadas, dio lugar al estudio integral del paleoambiente al aplicar el modelo de vegetación actual a los resultados encontrados en el estudio del polen fósil, sumado al bagaje cultural del hombre que hizo uso de aquel ambiente. La contribución más importante de esta Tesis es haber generado un modelo predictivo a partir de datos suficientes de la actualidad, e ilustrar el valor del modelo reconstruyendo los paleoambientes a pesar de lo exiguo de los datos. La significación de este estudio subraya la importancia del conocimiento del pasado y aporta nueva información al ampliar la ventana temporal, que abre nuevas posibilidades para predecir el futuro climático y ambiental con mayor precisión.

Abstract:
The present work of Thesis on the Palaeoecology of the Northwest of the province of Santa Cruz has been accomplished on the basis of a modern palinological transection laid between Los Antiguos (46° 30’S, 71° 50’W) and Puerto Deseado (47° 30’S, 66°W), and a profile taken from an archaeological excavation performed in the Cave Grande del Arroyo Feo or the otherwise called Cave of Altamirano (46° 57' S, 70° 32' W), from the area of Rio Pinturas. Signs of social and cultural development of the settlers that inhabited the area collaborated with the knowledge of the environmental history. In the first pan of the work the modern environmental problematic was treated. Calibration was the approximation used for the subsequent study of palaeoenvironments from pollen. Thus, the study of the relationships between the presence of modern pollen and the information gathered by satellites allowed the building of a modern vegetation model. On the one hand, the sampled pollen transection, from the Cordillera to coast, that crosses the Central Santacruzian, San Jorge Gulf and in some cases limiting with the Occidental phytogeographic districts (Soriano 1956, Cabrera 1976) was used. On the other hand, the satellite information was taken from an advanced very high resolution radiometer (AVHRR) mounted on a Nimbus satellite that belongs to the National Oceanic Atmospheric Administration (NOAA) from the United States of America, on its way over the area of study. The spatial resolution is 1.1 km, a scale compatible with palinological studies (D’Antoni and Schabitz 1995). Satellite information was analysed in relation to phytogeographical units and coincidences were found between the albedo values from channels l and 2 and the characteristic phytogeographical districts of each sector. Them a modern vegetation model was developed by means of multiple regression: the dependent variable resulted in the normalised difference vegetation index (NDVI), being the independent variables the Chenopodiaceae, Poaceae, Nassauvia y Ephedra spp. pollen types. Such a model was validated and verified. The second part of the work consisted of an analysis of the palaeoenvironmental problematic. In the first section, the Río Pinturas area was described from diverse aspects, and the second one, was dedicated to the study of Cueva Grande del Arroyo Feo. The excavation carried out in 1978 at Cueva Grande served as a base to the study of a profile zonation, with its earliest date at 9410 ╧ 70 years BP. Sedimentological and faunistic studies carried out at this site allowed to deepen the problematic. Qualitative analysis of charcoal found in the pollen samples were also done, so as to determine its origin and the possibility of fires in the area. Four pollen zones were established and some climate tendencies were found in the area of Río Pinturas. The third part of the study is related to the social and cultural aspects, and it mainly covers those connected with the presence of humans in the area: from peopling and occupations, cultural levels and artistic expressions, to the relationship of man with his surrounding. The integration of all three aforementioned parts, gave rise to an integral study of the palaeoenvironment by the application of the modern vegetation model to the results found in the studies of fossil pollen, added to the cultural baggage of the men who made use of that environment. The most important contribution to this Thesis is the generation of a predictive model from enough modern data, and to illustrate the value of the model by means of the reconstruction of palaeoenvironments in spite of the exiguity of data. The significance of this study underlines the importance of knowing the past and gives new information while enlarging the time window, that opens new possibilities for predicting the climatic and environmental future.

Tosto, Daniela S.. "Estudio de las relaciones genómicas y de similitud genética relativa entre especies del germoplasma del cultivo andino "oca" (Oxalis tuberosa) mediante análisis de AFLP y secuencias de ADN ribosomal" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Oxalis tuberosa, comúnmente conocida como oca, es una de las 8 especies andinas con raíces y tubérculos comestibles que juegan un rol importante en los sistemas agrícolas de las tierras altas de la región andina. Estos cultivos son de gran importancia económica y nutricional para la subsistencia de los agricultores de los Andes y un potencial alimento para el resto de la humanidad. La oca pertenece al género Oxalis, el cual está distribuido mundialmente e incluye alrededor de 800 especies. La mayor diversidad se encuentra en América del Sur y en Sud Africa; siendo las especies de América del Sur las que presentan el mayor rango de variación en cuanto a características morfológicas, ecológicas y citológicas. Los estudios citogenéticos revelaron una gran diversidad en el número básico de cromosomas variando desde X=5 a X=12, siendo X=7 el número más frecuente. Los niveles de poliplodía en el género también son variables (2n a 8n). De Azkue y Martínez (l990) encontraron que un grupo de once especies, que eran semejantes morfológicamente, compartían un número básico de cromosomas X=8. A este grupo pertenecen O. herrerae, O. medicaginea, O. mollissima, O. oblongiformis, O. peduncularis, O. subintegra, O. tabaconanensis. O.aff. víllosula (todas estas diploides), O. lotoides (2n=32), O. spiralis (2n=48) y la oca (O. tuberosa), un octoploide. A este grupo lo denominaron “la alianza de O. tuberosa”. Sin embargo este agrupamiento no coincide con la clasificación basada en criterios de taxonomía tradicional. El estudio de las especies silvestres relacionadas a los cultivos puede dar idea del proceso de domesticación y la evolución de los mismos, por otro lado pueden tener aplicaciones prácticas dado que las especies silvestres relacionadas a los cultivos son reservorios genéticos para el mejoramiento de los mismos. La caracterización de las distintas variedades y accesiones de O. tuberosa que existen es fundamental para saber con la diversidad que se cuenta y para el manejo de los bancos de germoplasma. Dentro de este marco los objetivos generales del presente estudio fueron por un lado poner a prueba, con herramientas de la taxonomía molecular, la hipótesis cromosómica que relaciona a O. tuberosa y con otras especies del género por compartir el mismo número básico de cromosomas X=8. Por otro lado evaluar distintas herramientas moleculares para cuantificar y comparar la diversidad genética de representantes del género y, más particularmente, de la especie cultivada, con el objeto de contribuir criterios objetivos para la conservación de estos recursos genéticos y su mejoramiento con fines agrícolas. Para lo cual se realizó el análisis de los genes ribosomales y se analizaron patrones de AFLP. El análisis de la región del espaciador interno de los genes ribosomales (ITS) corroboró la hipótesis cromosómica que relaciona a O. tuberosa y las especies que comparten el mismo número básico de cromosomas X=8. El análisis de AFLP también apoyó la hipótesis cromosómica ya que tanto en el análisis de agrupamientos como en el análisis mediante coordenadas principales las especies de la alianza se diferenciaron respecto de O. articulata generándose en el primer caso un dendrograma que sostenía este agrupamiento con un coeficiente de correlación cofenética de 0,99. El segundo análisis permitió identificar a las combinaciones de primers E41-M39 y E45- M43 como las que más aportaron a dicho agrupamiento. Los resultados no son del todo consistentes con los obtenidos a través de la taxonomía tradicional mediante descripciones puramente morfológicas, tanto en el caso de las clasificaciones que dividen a las distintas especies de la alianza en cuatro secciones (Knuth, 1939, 1936) como el caso en que las dividen en dos (Lourteig, 2000). De todos modos, la clasificación basada en datos moleculares de las especies de la alianza es más congruente con la propuesta taxonómica de Lourteig (2000) y puede ayudar a afinarla. El análisis de los genes ribosomales a nivel de la región codificante (la más conservada), muestra mayor similitud entre O. tuberosa y O. oblongiformis. Esta observación, sí sería congruente con la taxonomía tradicional, ya que ambas especies fueron las únicas de las especies estudiadas, agrupadas en la misma sección por Knuth (en Ortgiesae) y por Lourteig (en Lotoideae). Lo incongruente sería que, en su monografía, Lourteig (2000) sinonimizó a O. oblongiformis con O. tabaconasensis. El análisis del ADNr, pero a nivel de la región del IGS (la más variable) dio una idea de la compleja estructura de estas secuencias hipervariables en la alianza. Dado que es una región altamente variable no esclareció demasiado la relación de las especies diploides y poliploide cultivada, pero aportó información interesante de la relación entre las especies diploídes. Las tres especies diploides que comparten el mismo patrón de bandas fueron ubicadas por Knuth en tres secciones diferentes, mientras que por Lourteig en dos. Así mismo, esta parte del ADNr demostraría la inconsistencia de sinonimizar O. oblongiformis y O. tabaconasensis (Lourteig 2000). El análisis de los resultados obtenidos por los AFLP aparte de apoyar la hipótesis cromosómica de la alianza, permitieron visualizar el potencial de la técnica de AFLP para la caracterización de las distintas accesiones del cultivo y su utilización para el manejo de los bancos de germoplasma. Ya que se permitieron diferenciar accesiones que figuran con el mismo número, como así también identificar posibles duplicados, accesiones que figuran con distinto número, pero tienen perfiles de bandas idénticos. Siendo las combinaciones de primers E45-M43, E69-M69 y E41-M39 las que más incidieron para explicar la variación observada.

Abstract:
Oxalis tuberosa, commonly known as oca, is one of the 8 Andean species with edible underground roots and tubers that play a major role in the Andean highland farming systems. These crops are of great economic and nutritional importance to subsistence Andean farmers and a potential source of food for the whole mankind. Oca belongs to the genus Oxalis, that is worldwide distributed and represented by at least 800 species most of them in the southern hemisphere, mainly in America and South Africa, being South American species the most diverse in morphologigal, ecological and cytogenetic characteristics. Cytogenetic studies revealed a great deal of variability in the basic number of chromosomes (from X=5 to X=12), X=7 is the more frequent, as well as variation in the ploidy degree, that ranges from 2n to 8n (Marks, 1956; Cronquist, 1981; Naranjo et al., 1982; de Azkue, 1986; de Azkue & Martínez, 1983, 1984, 1989, 1990). Among them, a group of 12 species that share the same basic number of chromosomes (x=8) was defined by de Azkue & Martínez (1990). The group of species is named “the O. tuberosa alliance”. To this group belongs O. herrerae, O. medicaginea, O. mollissima, O. oblongiformis, O. peduncularis, O. subintegra, O. tabaconanensis, O. aff. villosula (all diploids species), O. Iotoides (2n=32), O. spiralis (2n=48) and the oca (O. tuberosa), an octoploid. However, this grouping is not consistent with the classification based on traditional taxonomy criteria. The study of the wild species related with the crop could help to clarify the processes of domestication and evolution of the oca. Furthermore, this study has practical applications since related wild species are natural genetic reservoirs for breeding. Characterization of different cultivars and accessions is very important in order to acknowledge the existing diversity and germplasm management. In this context, the general objectives of the present study were: first, to corroborate the chromosome hypothesis that relates O. tuberosa with the other species that share the same basic chromosome number, X=8. Second, to evaluate different molecular tools to quantitate and compare the genetic diversity of the different species of the genus, and particularly, within the crop species, so contributing objective criteria for genetic resources conservation and breeding. For these purposes, rDNA sequence analyses by RFLP complemented by nucleotide sequencing as well as AFLP were carried out. Comparative ribosomal intergenic transcribed sequences (ITS) analysis corroborated the hypothesis of relativeness of the species that share the same basic number of chromosome X=8. No differences were detected among the diploid species or within the O. tuberosa species. When diploid and polyploid species were compared, four differences were observed, two transitions in the ITS1 and two transversions in the ITS2. In contrast, when the species belonging to the alliance were compared to with an external reference species (O. articulata), several differences were found. The AFLP results also showed to be in good agreement with the cytogenetic hypothesis. Both cluster analysis and principal coordinates analysis discriminated the alliance species from O. articulata. In the first case, a dendrogram from UPGMA cluster analysis that show this grouping was obtained, and its very high cophenetic coefficient value (r = 0.99) indicates excellent fitness to the genetic similarity matrix. The co-ordinates analysis allowed to identify the primer combination E4l-M39 y E45-M43, as the most significant for this grouping. The results obtained from these analyses are not so consistent with those from the traditional taxonomy. Neither in the case of Knuth's classification (1930, 1936) by which the species of the alliance belong to four different sections, nor in the case of Lourteig (2000), which separates them in two different sections. In any case, the last classification is more congruent with the molecular data, which may help to refine it. O. tuberosa and O. oblongiformis showed identical restriction endonuclease patterns for the transcribed rDNA regions, which is consistent with conventional taxonomy, since both species were classified in the same section by Knuth (in Ortigiesae) and Lourteig (in Lotoideae). However, in the last case, the defined synonymy between O. oblongiformis and O. tabaconanensis is inconsistent with the molecular data shown here. Restriction endonuclease and sequence analyses of the IGS revealed a subrepeat organization which sequence and organization showed such degree of variation that did not allow relating polyploid to diploid species. However, the molecular organization of IGS rDNA contributed some important information on the relationship among diploids species. The three species that share the same pattern in this variable region, were classified by Knuth in three different sections, while they were classified in two by Lourteig. The IGS sequence also showed the inconsistency of the sinonimy between O. oblongiformis and O. tabaconanensis by Lourteig (2000). The AFLP analysis not only supported the chromosome hypothesis but also showed that AFLP is a powerful tool to characterize the different crop accessions and its usefulness for germplasm characterization and management (for example, for the identification of duplicate accessions), being the E45-M43, E69-M69 and E41-M39 primer combinations the most significant to explain the observed variability.

Tejera, Agueda Mercedes. "Efectos del tratamiento prolongado con AZT sobre células tumorales : acortamiento telomérico, inducción de senescencia y apoptosis, y reducción de tumorigenicidad" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Talí Jerónimo, Gabriela. "Descomposición equidimensional efectiva de variedades algebraicas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Presentamos algoritmos para el cálculo de la descomposición equidimensional de una variedad algebraica afín a partir (le un conjunto finito de polinomios que la define: En primer lugar, se prueba la existencia de un algoritmo dcterminístico no uniforme que calcula en tiempo polinomial una descripción de la componente equidimensional de dimensión máxima de una variedad algebraica. Aplicando este algoritmo se obtiene un procedimiento para decidir si una variedad es equidimensional o no. A continuación, se construye un algoritmo probabilistico que (la en tiempo polinomial, para cada componente equidimensional de una variedad dada, un conjunto Íinito de polinomios que la define. Para terminar, se desarrolla otro algoritmo probabilístico, que calcula la forma de Chow de cada una de las componentes equidimensionales de una variedad. La cota para la complejidad de este algoritmo también es —en el peor caso- polinomial en el tamaño del input. Sin embargo, bajo ciertas condiciones genéricas, puede darse una cota para su complejidad secuencial en términos del grado geométrico del sistema de polinomios que define la variedad y, por lo tanto, puede ser de orden muy inferior. Palabras clave: Sistemas de ecuaciones polinomiales, algoritmos, complejidad, variedades equidimensionales, descomposición equidimensional, forma de Chow.

Abstract:
We present algorithms for the computation of the equidimensional decomposition of an alline algebraic variety from a finite set of polynomials defining it: First, we prove the existence of a non-uniform deterministic algorithm which computes a description of the equidimensional component of maximal dimension of an algebraic variety in polynomial time. Applying this algorithm we obtain a procedure to determine whether a variety is equidimensional or not. Then, we construct a probabilistic algorithm which gives a finite set of polynomials defining each equidimensional component of a given variety in polynomial time. Finally, another probabilistic algorithn is developed. It computes the Chow form of each equidimensional component of a variety. The complexity bound for this algorithm —in the worst case- is also polynomial in the input size. IIowever, under certain genericity conditions, a complexity estimate in terms of the geometric degree of the polynomial system defining the variety can be given and, therefore, it may result in a much lower complexity order. Key words: Polynomial equation systems, algorithms, complexity, equidimensional varieties, equidimensional decomposition, Chow form.

Stripeikis, Jorge Daniel. "Optimización de la producción de átomos de selenio en espectroscopías atómicas : aplicaciones a su especiación y cuantificación en matices ambientales" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de este trabajo es el estudio y la optimización de mecanismos de producción de átomos de selenio en diferentes celdas de atomización: hornos de grafito y tubos de cuarzo. Los resultados obtenidos han sido aplicados en el desarrollo de sistemas de inyección en flujo acoplados a detectores atómicos que permitieran la determinación de selenio total en matrices biológicas y ambientales y la especiación de Se(IV) y Se(VI) en aguas de hemodiálisis y de consumo. En el capítulo l se presenta la optimización de la determinación optimizada de selenio total por espectrometría de absorción atómica con horno de grafito. Se evalúa la aptitud de diferentes modificadores de matriz (sales de níquel, cobre y paladio) para aumentar la estabilidad térmica de formas inorgánicas (Se(IV)) y orgánicas (selenometionina) de selenio. Tras la selección del modificador más apto, se presenta el estudio de las interacciones selenio/modificador con el fin de interpretar los mecanismos de estabilización térmica y optimizar los programas de calentamiento del horno. En el Capítulo de 2 se presenta un sistema automático de pre-concentración para la cuantificación de ultravestigios de Se(IV) y Se(VI) basado en el acoplamiento de un sistema en flujo al horno de grafito. Se utilizan resinas aniónicas fuertes para la retención de las dos formas inorgánicas, las que son eluidas selectivamente con soluciones de ácido clorhídrico de distinta concentración. Se utiliza un modificador “permanente” que consiste en depositar iridio en la superficie del horno previo a las secuencias de calentamiento, con el objetivo de favorecer la automatización del método y prevenir el efecto de interferencias que modifiquen la señal. En el capítulo 3 se presenta un método alternativo para la especiación de selenio basado en el acoplamiento de un sistema de flujo a un generador de hidruros. Dado que el Se(IV) es la única especie formadora de hidruros y que el Se(VI) necesita entonces ser prerreducido, se muestra un estudio de la cinética de reducción de Se(VI) a Se(IV) y de los factores que la afectan, con el objetivo de encontrar las condiciones de trabajo que permitan realizar la conversión Se(VI)/Se(IV) en tiempos compatibles con la operación “en línea”. Teniendo en cuenta que la sensibilidad de la técnica se afecta por un gran número de variables y que algunas de ellas son interdependientes, se ha optimizado el método a través del empleo de diseño factorial y construcción de las superficies de respuesta. Dado que las interferencias inorgánicas (particularmente el cobre y el hierro) reducen la eficiencia de generación de hidruros se desarrolló una estrategia para eliminarlas en linea utilizando resinas de intercambio aniónico para retener las especies cloruradas de los metales. En el capitulo 4 se aborda la discusión del concepto de trazabilidad en quimica analítica, presentándose las distintas estrategias para la validación de los métodos expuestos en los capítulos anteriores. El capitulo 5 presenta los métodos y materiales utilizados y el capítulo 6 señala las más relevantes conclusiones del trabajo.

Abstract:
This work is dedicated to the study and Optimization of the mechanisms of production of selenium atoms in graphite furnaces and quartz atomization cells. The optimized conditions have been applied to flow injection systems coupled to atomic detectors which allowed the determination of total selenium in biological and environmental samples and the speciation of Se(IV) and Se(VI) in hemodyalisis and tap waters. In chapter 1, the improved determination of total selenium via graphite furnace atomic spectrometry is presented. The aptitude of different matrix modifiers (nickel, copper and palladium salts) for increasing the thermal stability of inorganic and organic forms (selenomethionine) of selenium is assessed. After the selection of the modifier, an study involving the different interactions between the analyte and the modifier is presented. In this way it was possible to advance on the knowledge of the stabilization mechanisms of selenium inside the tube and to optimize the heating programs as well. In chapter 2, a fully automatic system for the preconcentration and quantitation of ultratraces of Se(IV) and Se(VI) is shown. The system involves a coupling between a flow injection system and the graphite furnace. Strong anionic resins are employed for the retention of both inorganic forms of selenium which are eluted in a selective way with hydrochloric acid solutions of different concentration. A "permanent" modifier obtained by depositing iridium on the graphite furnace surface is employed. In this way the method optimization is favored and the influence of interferences is prevented. Along chapter 3, an alternative methodology for selenium speciation is presented. The method is based on the coupling of a flow system to a hydride generator. Considering that only Se(IV) is reduced to H2Se by sodium borohydride and in order to perform this convertion "on-line", the kinetics of reduction Se(VI)/Se(IV) was fully studied. Results allowed to manage short reduction times which are compatible with "on-line" operation. Taking into account that the sensitivity of this technique is affected by a considerable number of variables and that some of them are inter-dependent, the best conditions were selected through factorial design and the subsequent building of response surfaces. Regarding chemical interferences (mainly copper and iron), ion-exchangers have been employed for the on-line elimination. Chapter 4 discusses the concept of traceability and shows different strategies for the validation of the new methodologies presented in the previous chapters. Chapter 5 shows the employed materials and methods and chapter 6 details the more relevant conclusions of the work.

Strier, Damián. "Procesos de auto-organización en sistemas biológicos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Sorianello, Eleonora Mariana. "Fisiopatología de un tumor ovárico experimental" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de esta tesis fue el estudio de distintos aspectos de la biología y fisiopatología de un tumor ovárico experimental altamente luteinizado (luteoma). Se analizaron parámetros relacionados a la proliferación celular, apoptosis, capacidad de síntesis esteroidogénica y de secreción del tumor. Se halló que el luteoma se desarrollaría preferentemente por hipertrofia y proliferación de células foliculares y una marcada ausencia de apoptosis. Además se detectó la síntesis de las distintas subunidades de inhibina a lo largo de 7 meses de desarrollo tumoral; se evidenciaron patrones fluctuantes a lo largo del tiempo para las subunidades β, que correlacionan estrechamente con los niveles séricos de FSH, demostrando así que tejido altamente luteinizado es capaz de producir inhibinas. Posteriormente, se estudió el camino de señalización de un análogo superactivo del GnRH, Buserelina, en células provenientes del luteoma, evidenciando que el camino clásico de transducción de señales acoplado al receptor de GnRH se encontraba alterado y hallándose los caminos altemativos activados por el decapéptido. Por otro lado, se puso de manifiesto la expresión del mRNA y del péptido de GnRH en células del luteoma, postulándose para el mismo un papel autocrino/paracrino en dicho tejido. Finalmente, evaluamos el efecto de drogas inmunosupresoras, Ciclosporina A y Dexametasona, sobre el desarrollo del tumor in vivo en comparación con animales con operación ficticia (Sham) a lo largo de 7 semanas. Los resultados indicaron que, a pesar de ser efectiva la inmunosupresión inducida por estas drogas sobre variables inmunológicas, las mismas no afectaron el desarrollo tumoral. A diferencia de los animales portadores del tumor, en animales Sham la Ciclosporina A indujo efectos sobre varios parámetros, sugiriendo la presencia de factor/es secretado/s por el tumor que impiden o compensan algunas de las acciones de la droga. Estos estudios aportaron nuevos conocimientos acerca de caracteristicas relacionadas al desarrollo y capacidad de síntesis y secreción del luteoma, como así también de caminos de señalización del receptor de GnRH y comportamiento del tumor bajo tratamiento con drogas inmunosupresoras.

Abstract:
The aim of this thesis was to study different aspects regarding the biology and physiopathology of a highly luteinized experimental ovarian tumor (luteoma). Parameters related to cellular proliferation, apoptosis, steroidogenic capacity and tumor secretion were analyzed. These demonstrated that tumors develop mainly due to proliferation of follicular cells, while a marked absence of apoptosis was also observed. In addition, synthesis of inhibin subunits was detected along 7 months of tumor growth, showing fluctuating expression of B subunits along development, tightly correlating with serum FSH levels. It was thus demonstrated that highly luteinized tissue is able to produce inhibins. The signaling pathways of a superactive analog of GnRH, Buserelin, were studied in luteoma cells, showing that the classical transduction system coupled to the GnRH receptor was markedly altered and describing the alternate pathways activated by the decapeptide in luteoma cells. Moreover, the expression of the GnRH mRNA and peptide was evidenced in luteoma cells, suggesting a possible role as an autocrine/paracrine modulator. Furthermore, the effects of immunosuppressive drugs such as Cyclosporine A and Dexamethasone were evaluated on in vivo tumor growth in comparison to Sham-operated animals along 7 weeks of treatment. Results showed that even though the drug-induced immunosuppression was evidenced on immunological variables, tumor growth was not altered. Marking a difference with tumor-bearing rats, in Sham animals Cyclosporin A affected various parameters, suggesting tumor secreted factor/s which would inhibit or compensate some of the drug’s actions. These studies have contributed new understanding concerning tumor characteristics related to tumor growth, synthesis and secretion capacity as well as different signaling pathways activated by GnRH and tumor behavior under immunosuppression.

Slamovits, Claudio H.. "Filogenia molecular y dinámica del ADN satélite : su relación con la evolución de los roedores tuco-tucos (Ctenomys, Octodontidae)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los tuco-tucos, roedores subterráneos del género Ctenomys, constituyen un excelente modelo para el estudio de los mecanismos implicados en la evolución cromosómica y la especiación. Estos roedores poseen en sus genomas el satélite SRPC, el cual mostró ser particularmente dinámico. Para explorar la relación entre la dinámica de cambio del SRPC y la variabilidad cromosómica, se abordó un enfoque que combina estudios filogenéticos y moleculares. Se llevó a cabo el análisis filogenético de unas 25 especies utilizando la secuencia del gen mitocondrial citocromo b, se determinó el número de copias y los patrones de restricción del satélite SRPC. Se empleó una aproximación filogenética para inferir la historia evolutiva de SRPC a lo largo de la filogenia de los tuco-tucos, y se encontró que su historia fue compleja. El satélite SRPC siguió un patrón conservativo en algunos grupos y altamente dinámico en otros. Por otro lado, se estudiaron aspectos relacionados con la estructura del satélite y la evolución de su secuencia nucleotidica. Se discuten las relaciones filogenéticas en el género y el rol del SRPC en la evolución cromosómica.

Abstract:
Subterranean rodents tuco-tucos of the genus Ctenomys constitute an excellent model to study the mechanisms involved in chromosome evolution and speciation. These rodents posses in their genomes the satellite RPCS, which showed to be highly dynamic. To explore the relationship between the dynamics of change of RPCS and chromosomal variability, an approach was used that combines phylogenetics and molecular studies. A phylogenetic analysis was carried out with 25 species, using the sequence of the mitochondrial gene cytochrome b, and the copy number and restriction pattern of RPCS were determined. A phylogenetic approximation was employed to infer the evolutionary history of RPCS along the tuco-tuco phylogeny, and a complex history was found. The SRPC satellite followed a conservative pattern in some groups, and a highly dinamic one in others. On the other hand, aspects related to the satellite structure and the evolution of its nucleotide sequence were studied. The phylogenetic relationships of the genus are discussed, as well as the role of the SRPC in the chromosomic evolution.

Simionato, Claudia G.. "Estudios de la sensibilidad de la circulación en el Atlántico Sur y la variabilidad de sus sistemas de corrientes de contorno a los forzantes atmosféricos de acuerdo al modelo Bryan-Cox/CIMA" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Simian, Marina. "La morfogénesis de la glándula mamaria del ratón: rol de las metaloproteasas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La glándula mamaria se desarrolla por un proceso de ramificación. Muchos factores han sido implicados en la regulación de este proceso morfogenético. Previamente, en nuestro laboratorio se desarrollaron ratones transgénicos que sobreexpresan la metaloproteasa estromelisina-1 (Str-1) y se demostró que la misma tiene un efecto morfogenético. Sin embargo resta dilucidar si este efecto es específico de las metaloproteasas de matriz (MMPs) y cuál es la relación entre la actividad proteolítica, los factores de crecimiento polipeptídicos y agentes morfogenéticos. El objetivo de la primera parte de esta Tesis fue contestar esta pregunta. Utilizamos para ello un sistema de cultivo tridimensional de organoides primarios de glándula mamaria de ratón y la línea celular epitelial de mama SCp2. Nuestros resultados indican que la morfogénesis de organoides primarios cultivados en geles de colágeno tipo I en presencia de factores de crecimiento polipeptídicos requiere de actividad MMP para que la misma se lleve a cabo. Por otra parte, la Str-1 recombinante fue capaz de estimular el proceso morfogenético en ausencia de factores de crecimiento. La plasmina también logró estimular el desanollo de ramificaciones por parte de los organoides; sin embargo este proceso también fue MMP dependiente. Para discernir entre señales morfogenéticas y de proliferación utilizamos una línea celular que carece de epimorfina y establecimos que las MMP, como la epimorfina, son necesarias para la morfogénesis pero no para la proliferación celular. Por otra parte la epimorfina, a diferencia de los factores de crecimiento polipeptídicos, estimuló la producción de MMPs sin afectar el número celular. Habiendo encontrado que la epimorfina es un regulador local de la actividad proteolítica, en la segunda etapa de esta Tesis quisimos investigar cuál era el papel de las hormonas sistémicas estrógenos y progesterona en la proteólisis. La observación de que ratones transgénicos para la isoforma A del receptor de progesterona (ratones PR-A) presentan un fenotipo hiperplásico muy similar al observado en los transgénicos para Str-l sugeria que podría haber una regulación a este nivel. Utilizamos para esta segunda parte del trabajo ratones PR-A, ratones knock-out para el receptor de progesterona (PR) y controles. Análisis de componentes de la membrana basal como la laminina-5 y el colágeno IV revelaron que la misma era discontinua en áreas de morfología anormal en las glándulas mamarias de los ratones transgénicos. También se detectaron pérdidas en la marcación para colágeno III. Esto se asoció con un aumento de células positivas para PCNA, un indicador de la proliferación celular. Por otra parte la ovariectomia demostró que el fenotipo es reversible y por lo tanto dependiente de la acción hormonal. Análisis de actividad proteolítica en tejidos de animales transgénicos y knock-out demostraron que habría una correlación entre los niveles de gelatinasa A y el PR sólo en el caso de los ratones knock-out. Tratamientos hormonales, por otra parte, permitieron establecer que las vías del PR y el ER estarían involucradan en la activación de la gelatinasa A. Por último encontramos en experimentos preliminares una correlación entre los niveles de MTl-MMP y los de PR, lo cual sugeriría que en la glándula mamaria del ratón, como se ha demostrado en otros sistemas, esta metaloproteasa de membrana estaría asociada a la activación de la gelatinasa A. Nuestros resultados demuestran un papel crítico para las metaloproteasas en la morfogénesis de la glándula mamaria y establecen que no sólo factores locales como la epimorfina son capaces de regular la actividad proteolítica de la glándula mamaria; las hormonas sistémicas estrógeno y progesterona juegan un rol protagónico también.

Abstract:
The mammary gland develops through a process called branching morphogenesis. Many factors have been implicated in the regulation of this morphogenetic process. Previously, we developed transgenic mice that overexpress the matrix metalloproteinase (MMP) stromelysin-1 (Str-1), and showed that it has a morphogenetic effect on the mammary gland. However, it still remains to be determined whether this effect is specific to MMPs, and what is the relationship between proteolytic activity, polypeptide growth factors and morphogenetic agents. The aim of the first part of this Thesis was to answer this question. To do so we used a three-dimensional culture system of primary mouse mammary organoids and the SCp2 mammary epithelial cell line. Our results indicate that branching morphogenesis of primary organoids in collagen I gels in the presence of polypeptide growth factors requires MMP activity. On the other hand recombinant stromelysin-1 was able to induce morphogenesis in the absence of growth factors. Plasmin also stimulated branching morphogenesis of primary organoids; this effect was also MMP dependent. To differentiate between signals for morphogenesis and proliferation, we used a mouse mammary epithelial cell line that lacks epimorphin and established that, like epimorphin, MMPs are required for morphogenesis but not proliferation. Moreover, epimorphin, in contrast to growth factors, increased the levels of MMPs without affecting cell number. Having found that epimorphin is a local regulator of proteolytic activity in the mammary gland, in the second part of this Thesis we looked into the role of the systemic horrnones estrogen and progesterone. The fact that transgenic mice for the A isoform of the progesterone receptor (PR-A mice) have a phenotype that is very similar to that found in Str-l transgenic mice suggested that this could be the case. Therefore, for this second set of experiments we used PR-A transgenic mice, knock-out mice for progesterone receptor (PR) and wild type mice. Analysis of components of the basement membrane such as laminin-5 and collagen IV revealed that it was discontinuous in areas where there was abnormal morphology in the mammary glands of transgenic mice. We also found alterations in the staining pattern of collagen III. This was associated with an increase in the number of cells positive for PCNA, an indicator of cell proliferation. On the other hand ovariectomy revealed that the phenotype was reversible and therefore dependent on signaling through PR. Analysis of proteolytic activity in tissues of transgenic and knock-our mice revealed that there was a correlation between the levels of PR and gelatinase A only in the mammary glands of knock-out mice. Hormonal treatments established that signaling through ER and PR is involved in the activation of gelatinase A. Finally we found in preliminary studies a correlation between the levels of PR and MT1-MMP, suggesting that in the mouse mammary gland, like in other systems, this membrane bound MMP would be involved in the activation of gelatinase A. Our results show a critical role for MMPs in mammary gland branching morphogenesis and establish that not only local factors such as epimorphin can regulate proteolytic activity in the mammary gland; estrogens and progesterone play a crucial role as well.

Schettini, Jorge L.. "IgA y plaquetas como moduladores del fenómeno apoptótico en granulocitos neutrófilos y eosinófilos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En la presente Tesis desarrollamos dos líneas de investigación, relacionadas ambas con la identificación y caracterización de factores propios al microambiente inflamatorio capaces de modular la apoptosis de granulocitos neutrófilos y eosinófilos. En relación a los neutrófilos hemos demostrado que Ia IgA inmovilizada, tanto plasmática como secretoria, promueve notoriamente el proceso apoptótico. En contraste, las formas solubles de la IgA plasmática y secretoria, como así también la IgA agregada soluble no mostró actividad modulatoria alguna. El mecanismo subyacente a la capacidad de la IgA inmovilizada de promover la apoptosis del neutrófilo mostró depender de la actividad de la molécula MAC-1 (CD11b/CD18) y de la activación del estallido respiratorio. Por el contrario, no involucró la actividad del sistema Fas/FasL. En relación a los eosinófilos hemos demostrado que las plaquetas ejercen un poderoso efecto preventivo sobre el proceso apoptótico, prolongando dramáticamente la sobrevida celular. Hemos demostrado que las plaquetas producen GM-CSF y que esta citoquina juega un papel central en la prevención de la apoptosis de eosinófilos mediada por plaquetas. La posible relevancia de las observaciones realizadas, en relación al curso y/o etiopatogenia de entidades patológicas tales como la nefropatía por IgA y el fenómeno alérgico es discutida en la presente Tesis.

Abstract:
In the current Thesis we develop two lines of investigation, both related with the identification and characterization of the own factors from inflammatory microenviroments able to modulate the apoptotic rate of neutrophilic and eosinophilic granulocytes. We found that culture of neutrophils on immobilized plasma IgA (ilgAp) or secretory IgA (iIgAs) induced a marked increase in apoptotic rates. By contrast, soluble IgAp, IgAs, or aggregated-plasma lgA (algAp) exerted no effect. Promotion of apoptosis by iIgA was almost completely prevented by blocking antibodies directed to either CD18 or CD11b, and showed to be dependent on the activation of the respiratory burst. We also report here that platelets delay apoptosis enhancing eosinophil survival. A marked inhibition of spontaneous apoptosis was observed using eosinophil:platelet ratios of 1:50, 1:25 and 1:10. Moreover, we found that promotion of apoptosis by either pronase or dexamethasone was also markedly inhibited when the cellular cultures were performed in the presence of platelets. The anti-apoptotic effect mediated by platelets was depended on the release of soluble products, and was markedly inhibited by neutralizing antibodies directed to GM-CSF. Studies performed by flow cytometry, directed to analyze the cellular source of this cytokine, demonstrated that intracellular GM-CSF is present in resting platelets. Moreover, GM-CSF was found in platelet supernatants, at concentrations able to prevent eosinophil apoptosis. The possible significance of our findings, in relation to the development of pathologic entities such as lgA nephropathy and the allergic phenomenon are discussed in the current Thesis.

Scherlis Perel, Damián Ariel. "Simulación de reactividad química en hemoproteínas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El trabajo de tesis puede subdividirse en dos incisos generales: el desarrollo de técnicas de simulación computacional orientadas al tratamiento de los efectos del entorno en sistemas moleculares de gran tamaño, y la aplicación de estas y otras metodologías de cálculo a diversos problemas atenientes a la reactividad de las hemoproteínas. En relación con el primer ítem, se halla la implementación de un método híbrido que combina el cálculo de estructura electrónica con un campo de fuerzas clásico, introduciendo de manera autoconsistente en el hamiltoniano mecanocuántico el potencial electrostático proveniente de una distribución de cargas parciales. Esta clase de técnicas, denotada habitualmente con las siglas QM-MM (Quantum Mechanics-Molecular Mechanics), resulta útil para el estudio de los efectos del entorno, por ejemplo un solvente o una proteína. La implementación del método híbrido fue realizada sobre el programa SIESTA, un algoritmo de cómputo basado en la teoría de los funcionales de la densidad (DFT) que utiliza funciones de base numéricas y pseudopotenciales. En lo que respecta al segundo inciso, se realiza en primer término un estudio metodológico tendiente a evaluar la aptitud de los diferentes tratamientos mecanocuánticos para describir la configuración electrónica de las metaloporfirinas. Seguidamente la investigación se focaliza sobre tres problemas específicos: (i) inhibición del citocromo P450 por el óxido nítrico; (ii) relación entre la afinidad por el oxígeno molecular y las uniones hidrógeno en la cavidad distal de la hemoglobina; (iii) modulación del efecto trans negativo del NO en el sitio activo de diferentes hemoenzimas, y sus implicancias en la activación de la guanilato ciclasa. A través de estos ejemplos se realiza una lectura microscópica de la actividad de las hemoproteínas, de sus propiedades reactivas, y de la modulación que sobre el sitio activo ejerce el entorno. Se estudian los efectos de los residuos proximales y distales, y se caracterizan distintos aspectos energéticos, estructurales y electrónicos que contribuyen a la interpretación de observaciones experimentales.

Abstract:
This thesis has two main goals: the development of computer simulation schemes to model environment effects in large systems and the application of these techniques to the investigation of chemical reactivity in heme proteins. Regarding the first goal, we have implemented a hybrid methodology combining an electronic structure calculation with a classical force field, including the electrostatic effects of the classical subsystem self-consistently in the Hamiltonian of the quantum subsystem. This kind of techniques, known usually as QM-MM (Quantum Mechanics- Molecular Mechanics), are specially useful to model environment effects in solution and in proteins. We have employed the SIESTA pseudopotential numerical basis set implementation of density functional theory (DFT) to describe the quantum subsystem, due to its computational performance. The implemented computational schemes have been used to investigate the following problems: (i) inhibition of cytochrome P450 by nitric oxide; (ii) role of hydrogen bonding in oxygen affinity of hemoglobins; (iii) modulation of nitric oxide negative trans effect in the active site in different heme proteins and its connection with the activation of guanylate cyclase. Through these examples, we have tried to provide a microscopic insight of the role of the environment on the chemical reactivity of heme proteins. We have investigated the effects of the distal and proximal residues, characterizing structural and energetical parameters which contribute to the interpretation of experimental results.

Scassa, María Elida. "Mecanismos de acción de la insulina en la represión de la transcripción : el gen de la 5-aminolevulinato sintetasa como modelo experimental" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La insulina desempeña un papel clave en la regulación de múltiples procesos celulares. La unión de la hormona a su receptor en la superficie celular activa la actividad intínseca de quinasa de tirosinas del mismo, ocasionando la autofosforilación del receptor y la fosforilación de sustratos intracelulares denominados IRSs. Los IRSs actúan como moléculas adaptadoras en la transducción de señales, reclutando a una gran variedad de proteínas que contienen dominios de homología Src (SH2), entre ellas: la subunidad regulatoria (p85) de la PI3K a la “growth factor receptor binding protein 2”(Grb2). Este evento conduce a la activación de las cascadas de la PI3K y de Ras/MAPK, respectivamente. En el presente trabajo hemos examinado la acción de la hormona peptídica sobre la expresión del gen de la 5-aminolevulinato sintetasa (ALAS) en hepatocitos de rata y en células de hepatoma humano HepG2. La ALAS es la primera enzima y regulatoria de la biosíntesis del hemo, su nivel es normalmente bajo en el hígado pero se incrementa marcadamente en respuesta a drogas porfirinogénicas como el fenobarbital. El tratamiento con insulina 5nM produjo una notable disminución en los niveles del mRNA de ALAS tanto en condiciones basales como de estimulación con fenobarbital. Este efecto fue dosis dependiente como pudo observarse mediante ensayos de Northern y slot blot. Por otra parte la vida media del mRNA de ALAS no fue modificada por la presencia de la hormona lo que sugiere que la acción ejercida por la insulina sería relevante a nivel transcripcional. Con la finalidad de determinar la actividad transcripcional del promotor, realizamos una construcción (pACAT) que contiene 876 pb de la región 5’ flanqueante del gen de ALAS dirigiendo la expresión de la cloramfenicol acetiltransferasa (CAT). En cotransfecciones transientes de células HepG2 observamos una significativa disminución de la actividad CAT cuando se incubaron las células con la hormona. Considerando estos resultados, utilizamos dos metodologías diferentes para caracterizar las vías de transducción de señales involucradas en la represión hormonal de ALAS. En un primer abordaje empleamos agentes químicos, permeables a la membrana plásmatica, que inhiben específicamente a proteínas intermediarias de la señalización de insulina, para evaluar la contribución de estos efectores a la respuesta final. Los inhibidores de la PI3K (wortmanina y LY294002), de la famesilación de Ras (lovastatina y PD152440) y de MEK (PD98059) abolieron la acción de la insulina, mientras que el inhibidor de mTOR/p70RSK (raparnicina) no tuvo efecto alguno sobre la represión hormonal. Por otra parte, analizamos el efecto de la sobrexpresión de formas dominantes negativas o constitutivamente activas de intermediarios de las vías de Ras/MAPK y de la PI3K para evaluar el papel de estas cascadas en la inhibición transcripcional de ALAS. La cotransfección de células HepG2 con versiones dominantes negativas de SOS, Ras, Raf, MEK y MAPK interfirió la acción de la insulina, mientras que la cotransfección con formas constitutivamente activas de Ras, MEK y p90RSK mimetizó la inhibición hormonal per se, independientemente del estímulo en el receptor. Un comportamiento similar se obtuvo cuando empleamos versiones dominantes negativas de PI3K y PKB o a la PKB miristoilada, respectivamente. Estos resultados nos permiten proponer que la señalización a través de ambas vías es requerida para obtener la totalidad del efecto final. Por último, la regulación hormonal fue mediada por un fragmento de ll7 pb (-469/354) del gen de ALAS, capaz de conferir sensibilidad a insulina cuando fue subclonado río arriba del promotor heterólogo de la quinasa de tímidina (pALIRE). Esta región presenta la secuencia GTTTTG, muy similar al IRE canónico reportado para genes reprimidos por la insulina, que resultó crucial para la inhibición. En EMSAs pudo observarse la formación de complejos por unión a secuencias con alta homología a las de HNF3 y NF1 presentes en esta región. Todos estos hallazgos sugieren que la insulina requiere la acción orquestada de efectores celulares (intermediarios de las cascadas Ras/MAPK/p90RSK y PI3K/PKB) y de factores de transcripción que reconocen secuencias específicas y abre la posibilidad de considerar que miembros de las familias HNF3 y NF1 podrían intervenir en la respuesta.

Abstract:
Insulin plays a key role in regulating a wide range of cellular processes. The binding of insulin to its cell surface receptors activates their intrinsic tyrosine kinase activity leading to receptor autophosphorylation and phosphorylation of citosolic proteins known as IRSs, which serve as adapters in intracellular signaling. IRS binds a variety of Src homology 2 (SH2) domain containing proteins, when specific tyrosines are phosphorylated, including the regulatory subunit of phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) and the growth factor receptor binding protein 2 (Grb2). This give rise to the activation of PI3K and Ras, and hence to the activation of serine/threonine protein kinases. We have explored the action of the peptidic hormone on 5-aminolevulinate synthase (ALAS) gene expression in rat hepatocytes and HepG2 cells. The ALAS is the first enzyme in the heme biosynthetic pathway and in liver at least is rate limiting, its level is normally very low in hepatocytes but is greatly increased in response to the addition of certain porphyrinogenic drugs such as phenobarbital. Treatment with 5 nM insulin led to a significant decrease of both basal and phenobarbital induced ALAS mRNA, in a dose dependent manner as measured by Northern and slot blot. Moreover ALAS mRNA half life was not modified by the presence of the hormone, suggesting that insulin plays an important role in regulating ALAS gene transcription. In a different approach, we fused a 876 bp fragment corresponding to the 5' flanking region of the hepatic rat ALAS gene to the bacterial reporter gene for CAT, to determine promotor activity. CAT activity was highly impaired in HepG2 cells transiently transfected with this fusion gene (pACAT plasmid) when treated with insulin as measured by CAT assay. In view of the preceding findings we undertook the present work to characterize the signal transduction pathways involved in insulin inhibition of ALAS gene expression. We used small cell permeant molecules that are specific inhibitors of particular proteins involved in insulin signaling to asses the contribution of these effectors to the hormonal regulation. Inhibitors of PI3K (wortmannin and LY 294002 ), Ras famesylation (lovastatin and PD 152440) and MEK (PD 98059) abolished insulin inhibition, however, inhibitor of mTOR/p70RSK (rapamycin) had no effect upon insulin action. To examine the role of the Ras/MAPK and PI3K pathways in insulin signaling relevant to ALAS inhibition we determined the effects of dominant negative and dominant active forms of regulatory enzymes involved in these cascades. Cotransfection of HepG2 cells with dominant negative forms of SOS, Ras, Raf, MEK and MAPK interfered inhibition by insulin, while cotransfection with dominant active forms of Ras, MEK and p90RSK mimicked the hormone action per se, independently of signaling input. A similar behaviour was observed with dominant negative versions of PI3K and PKB and myristoilated PKB, respectively. With the present results we propose that signaling through the PI3K and the Ras/MAPK cascades are required for insulin inhibition of ALAS gene expression. Finally, the regulation by insulin was mediated by a ll7 bp fragment (-469/—354), which confered hormonal sensitivity to the heterologous thymidine kinase promotor in transient transfection assays in HepG2 cells. EMSAs showed that multiple nuclear proteins bind to this region at conserved HNF3 and NF1 sequences. Taken together, these results suggest that the effect of insulin is due to a complex interplay of effectors (PI3K/PKB and Ras/MAPK/p90RSK cascade intermediaries) and of transcription factors, and underline the contribution of HNF3 and NF1 like proteins.

Santori, María Isabel. "Clonado y caracterización de proteínas relacionadas al control del ciclo celular del parásito Trypanosoma cruzi" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En nuestro laboratorio se clonaron dos CRKs (CDK1 Related Kinases) de T. cruzi, TzCRK1 y TzCRK3 (Gómez y col., 1998) y se identificaron, por doble híbrido, proteínas que se asocian a TzCRK1 con similitud a una familia de ciclinas (Gómez y col., 2001). En el presente trabajo de tesis se caracterizaron y clonaron proteínas candidatas a participar en el control del ciclo celular de T. cruzi. Se secuenciaron en su totalidad los fragmentos de los genes obtenidos por doble híbrido y se los denominó TzCYC4, TzCYC5 y TzCYC6. Además se clonaron los genes completos y se secuenciaron. La secuencia predicha para las tres proteinas mostró similtud con ciclinas denominadas PHO, presentes en S. cerevisiae. TzCYC5 posee una región rica en histidinas próxima al amino terminal. Se determinó que los tres genes son de copia única mediante Southern blot y por rastreo de una biblioteca genómica. La expresión de los tres genes mostró variaciones particulares en distintos estadios de T. cruzi. TzCYC6 complementó una cepa mutante de S. cerevisiae, deficiente en las ciclinas de G1, demostrando que es una ciclina funcional. Se determinó el patrón de expresión de TzCRK3 en estadíos de T. cruzi. El ARNm de TzCRK3 es más abundante en el estadío amastigotes que en epimastigotes o tripomastigotes. Se obtuvo un suero específico contra TzCRK3, inmunizando conejos con la proteína recombinante expresada en bacterias. Ensayos de Western blot mostraron, en epimastigotes la presencia de una proteína del peso molecular esperado, 35 kDa. En amastigotes y tripomastigotes, se observaron bandas específicas de menor movilidad. Se estableció que la proteina identificada en epimastigotes se asocia a p13ˢͧͨ¹-agarosa, proteína con alta afinidad por CDK1. TzCRK3 endógena mostró actividad quinasa de histona H1 y fue inhibida por inhibidores de CDKs: flavopiridol, roscovitina y olomoucina. Flavopiridol inhibió el crecimiento de epimastigotes en cultivo, aunque no en forma total. La actividad quinasa de la TzCRK3 de dichos epimastigotes se inhibió en forma dosis dependiente. La actividad de quinasa de histona H1 asociada a p13ˢͧͨ¹ mostró las mismas variaciones estadío especificas y similar sensibilidad a los CK1s que TzCRK3. En los cultivos con flavopiridol el IC50 no mostró diferencias significativas con el de TzCRK3. La actividad de TzCRK3 en epimastigotes sincronizados mostró un pico en G2/M mientras que la actividad asociada a p13ˢͧͨ¹ aumentó al mismo tiempo pero no disminuyó hasta M. La expresión de TzCRK3 fue constante. Los patrones de actividad y expresión de TzCRK3 son tipicos de una CDK. Esta evidencia indica que TzCRK3 está involucrada en el control del ciclo celular de T. cruzi, controlando el pasaje de G2/M, aunque no se puede excluir la presencia de otra CDK. Se identificó un EST con alta similitud de secuencia con Lmmp12ͨᴷˢ¹, el gen homólogo a p13ˢͧͨ¹ en Leishmania mexicana. Se clonó el gen completo y se determinó que es copia única. La secuencia esperada de la proteína muestra una alta identidad de secuencia con la familia de proteinas CKS. Su expresión mostró variaciones estadío especificas. La proteina recombinante se expresó en bacterias, en fusión a histidinas, se la purificó y se inmunizaron conejos para obtener un anti suero.

Abstract:
In our laboratry two CRK genes: TzCRK1 and TzCRK3 from T. cruzi were previously isolated (Gómez et al., 1998), and using the yeast two-hybrid system open reading frames coding for proteins able to associate with TzCRK1 were identified (Gómez et al, 2001). Positive clones obtained in the two hybrid screen were sequenced and compared in data banks. Clones sharing identity with S. cerevisiae PHO cyclins were named TzCYC4, TzCYC5 y TzCYC6. Full lenght genes were cloned and sequenced. Identity with proteins from the PHO family was still observed when the predicted aminoacidic sequences were compared. An histidine-rich domain was observed in the TzCYC5 amino terminal region. All three genes were shown to be single copy. Cyclins mRNA levels varied in a stage specific manner. TzCYC6 was able to functionally complement a S. cerevisiae deficient for G1 cyclins. To establish if TzCRK3 has a role in the regulation of the parasite cell cycle, its expression and activity were studied. Northern and Western blot analyses detected the enzyme in three forms of the parasite; mRNA levels, subcellular localization and apparent molecular weight of the protein varied throughout the stages. TzCRK3 from epimastigote soluble extracts interacted with p13ˢͧͨ¹-beads. Endogenous TzCRK3 phosphorylated histone H1 and this activity was inhibited by specific CDK inhibitors (CKIs): olomoucine, flavopiridol and roscovitine. In addition, p13ˢͧͨ¹ beads coprecipitated with a kinase activity that was inhibited by the CDK inhitors mentioned above. Flavopiridol partially inhibited the growth of T. cruzi epimastigotes at 50 nM, the lowest concentration used, but even with the highest (5 mM), cell growth was not completely arrested. TzCRK3 from flavopiridol inhibited epimastigotes extracts exhibited a dose dependent inhibition of histone H1 phosphorylation. T. cruziˢͧͨ¹- binding CRK displayed the same inhibition profile. TzCRK3 IC50 did not significatively differed from the shown by the kinase activity associated to p13ˢͧͨ¹. This indicates that TzCRK3 is the enzyme responsible for the majority of the kinase activity associated to p13ˢͧͨ¹. TzCRK3 activity of hydroxyurea (HU) synchronized epimastigotes peaked in G2/M boundary while the kinase activity associated to p13ˢͧͨ¹ beads increased at the same time point but remained high until late G2/M. In addition, TzCRK3 expression was constant along the cell cycle. This is a common pattern of CDK activity regulation. Taken together, these results contribute to support the idea that TzCRK3 is involved in control of the cell cycle in T. cruzi. A T. cruzi EST sharing high identity values with the Leishmania mexicana p13ˢͧͨ¹ homologous, Lmmp12ͨᴷˢ¹ was identified. The full lenght gene was cloned. The predicted aminoacidic sequence showed high identity scores with proteins belonging to the CKS family. This protein was named Tzp12ͨᴷˢ¹. mARN levels in different stages of the parasite varied. The recombinant protein, fused to a histidine tag, was expressed in bacteria. It was purified and used to immunize rabbits, in order to obtain a specif antibody.

Salio, Paola Verónica. "Caracterización de eventos de corriente en chorro en capas bajas de la atmósfera en base a reanálisis y la precipitación asociada en el Sudeste de Sudamérica" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El interés de esta Tesis se centra en la caracterización climática de los episodios de corriente en chorro en capas bajas al este de los Andes (SALLJ) y los campos de precipitación asociados a estos eventos, con énfasis en el impacto sobre la región Sudeste de Sudamérica (SESA). Este estudio utiliza los datos del reanálisis perteneciente al European Center Medium Weather Forecast (ERA), datos de radiación de onda larga saliente, datos de precipitación acumulada diaria y radiosondeos en Resistencia durante la estación cálida de 1979 - 1993. Estudios previos mostraron una relación entre el máximo de precipitación y la convergencia de vapor de agua sobre SESA. Nicolini and Saulo exploraron la hipótesis de una intensificación mutua en esta dependencia durante los eventos Chaco Jet (CJE). Estos eventos fueron definidos como casos SALLJ que penetran al sur de los 25ºS usando los productos del modelo operativo ETA durante la estación cálida de 1997 - 1998. Los CJEs representan un subensamble de eventos SALLJ poco frecuentes en los datos del ERA. Su duración oscila entre 1 a 10 días extendiéndose más frecuentemente entre 1 a 5 días. Las principales características de la circulación y de los campos termodinámicos que representan este ensamble son: un contraste máximo de masas de aire en 39ºS, la presencia de una vaguada con su eje sobre la cordillera de los Andes, un tren de ondas baroclínicas que penetra desde el Océano Pacífico y un máximo de calor y humedad sobre el norte de Argentina y Paraguay. Durante los CJEs existe un importante flujo de humedad y convergencia en los niveles bajos y medios que es 10 veces más intenso que la media del verano. La intensidad encontrada en las anomalías del flujo de humedad refuerza la importancia del estudio de estos episodios con el propósito de determinar el balance de vapor de agua sobre la SESA. El hecho que los CJEs representan una importante característica del clima de la SESA se basa en que los CJEs sólo representan el 17% (28%) del verano (primavera) y ellos son capaces de explicar una fracción significativa de la precipitación (un máximo de 55%) sobre el noreste de Argentina. Una comparación entre los CJEs y los eventos SALLJ - No Chaco muestra que estos últimos son más (menos) frecuentes durante el verano (primavera), llevando a la estación a comportarse como los SALLJ - No Chaco, mientras los CJEs presentan una fuerte componente baroclínica desarrollada en la escala sinóptica. Los campos medios de geopotencial en niveles bajos, dominados por una baja térmica y el Anticiclón del Atlántico Sur aumentan un patrón frontogenético que finalmente evoluciona en un pasaje frontal que marca el fin del CJE. Un estudio preliminar sobre el ciclo diurno de la convección es presentado en este trabajo utilizando observaciones de tiempo presente en Argentina. Una fase nocturna - matutina (03-09 hora local) en la convección prevalece durante primavera, mientras en verano se desarrolla por la tarde sobre el noreste de Argentina. Por otra parte, en el centro de Argentina la convección presenta una fase nocturna en verano. La misma fase que en primavera se manifiesta durante los CJEs, mientras un máximo a las 18UTC centrado en Formosa y Concordia se observa en los SALLJ - No Chaco durante toda la estación cálida. Otro máximo durante los SALLJ - No Chacho es identificado en verano en Mendoza, Salta y Neuquén en las horas de la mañana.

Abstract:
The interest of the present thesis centers on the climatic characterization of South American Low Level Jet (SALLJ) episodes and their associated precipitation fields, with emphasis on their impact on precipitation over Southeastern South America region (SESA). This study includes results using European Center Medium Weather Forecast reanalyses (ERA), outgoing longwave radiation data, raingauge network rainfall data and soundings at Resistencia during the 1979 - 1993 warm season. Previous studies showed a relationship between precipitation maximum and the convergence of vapor flux over SESA. Nicolini and Saulo explored the hypothesis of an intensification of this mutual dependency during Chaco Jet events (CJE). They defined these events as cases of SALLJ that penetrates southernmost 25ºS using ETA operative products during 1997 - 1998 austral warm season. The CJEs represent a subensemble of SALLJ infrequent in the ERA data set. Their duration varies from 1 to 10 days extending more frequently between 1 to 5 days. The outstanding features of the circulation and the thermodynamic field that represent this ensemble are: a maximum contrast of air masses in a latitude close to 39ºS, the presence of a trough with its axis over the Andes within a baroclinic wave train penetrating from the Pacific Ocean and a maximum of heat and moisture over northern Argentina and Paraguay. During the CJEs there is an important flux of moisture and convergence at low and mid levels that is about 10 times more intense than the summer mean. The intensity found in the water vapor flux anomaly reinforces the importance of studying these episodes for the purpose of determining the water balance over SESA. The statement that the CJEs represent an important characteristic of SESA climate is found on the fact that, although the CJEs only represent 17 per cent (28%) of the austral summer (spring) days, they account for a significant fraction of the precipitation (a maximum of 55%) over northeastern Argentina. A comparison between CJEs and SALLJ - No Chaco events shows that the latter are more (less) frequent during summer (spring), pushing the mean summer behavior toward the SALLJ No Chaco, while the former present a stronger baroclinic component in the synoptic scale. The mean geopotential field at low levels, dominated by a thermal low and a shifted toward the continent South Atlantic Anticyclone, enhance a frontogenetical pattern that finally evolves in a frontal passage that marks the demise of the CJE. A preliminary study about the diurnal cycle of the convection is addressed using present weather observations in Argentina. A nocturnal - morning phase (03 -09 local time) in convection prevails during spring, while it dominates in the afternoon during summer, over northeastern Argentina. In turn, Central Argentina presents a nocturnal phase in summer. The same phase as in spring is showed during the CJEs, while a maximum at 18UTC is centered on Formosa and Concordia during the SALLJ - No Chaco during the warm season. The SALLJ-No Chaco events present another maximum during summer at Mendoza, Salta and Neuqueén at the morning synoptic time.

Rusjan, Pablo. "Isomerización de carbocianinas simétricas en solventes polares" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo de tesis describe aspectos de equilibrio y dinámicos relativos a la reacción de retro-isomeración de un catión carbocianina (3,3’-Dietiloxacarbocianina, DOCI) en distintos entornos: acetonitrilo, alcoholes alifáticos de diferente longitud de cadena y mezclas metanol (MeOH) - acetonitrilo (ACN). El amplio espectro de longitudes características relevantes en el problema, que van desde uniones intramoleculares del orden de 1-2 Å hasta distancias del orden del tamaño molecular, aproximadamente de 20 Å; juntamente con una significativa redistribución de la densidad electrónica que genera estados intermedios de elevada polaridad, hacen de este proceso un problema particularmente interesante, cuya descripción microscópica es compleja. El método de estudio es la dinámica molecular. Las simulaciones presentan un modelo, propio de esta tesis, cuyas principales características son: (i) un alto grado de detalle en la descripción del soluto, incorporando explícitamente todos los grados de libertad, (ii) la capacidad de cambios en la distribución electrónica conformes al valor de la coordenada de reacción, (iii) un solvente modelado como una colección de cargas parciales mantenidas a distancia fijas; (iv) para los solventes de mayor tamaño un modelo simplificado que reproduce las propiedades más relevantes que influyen el proceso reactivo tales como polaridad, características de empaquetamiento, autodifusión. El estudio del proceso reactivo fue abordado, como es usual en estos casos, mediante el cálculo de la constante de velocidad k iso. Su estimación es la resultante de dos contribuciones: la primera proveniente de la aplicación de la teoría del estado de transición; la segunda está relacionada con los efectos dinámicos involucrados en el proceso. Complementariamente, el estudio del equilibrio nos permitió obtener información referente a las estructuras de solvatación propias de los distintos estadios de la reacción (de productos y de transición). Por otro lado se realizaron simulaciones de no equilibrio desde las que se obtuvo información de la relajación simultánea de los grados de libertad y observables del soluto y del solvente. Las conclusiones del trabajo son: (i) la presencia de solvente polar siempre disminuye la energía libre de activación respecto de la intrínseca en vacío, la magnitud de esta reducción resulta de una competencia entre las interacciones soluto-solvente y solvente-solvente, la energía libre de activación de los alcoholes obtenida de los experimentos de simulación, reproduce la tendencia, anómala según el modelo de Kramer, observada en trabajos experimentales para la constante de velocidad, en las experiencias con mezclas ACN/MeOH se observó solvatación preferencial del solvente aprótico. Finalmente resulta importante establecer, a partir de los resultados aquí obtenidos, la importancia de la ponderación de los procesos microscópicos que acompañan el desarrollo de la reacción para lograr una interpretación del fenómeno global; estos aspectos son generalmente soslayados o reinterpretados en términos de propiedades macroscópicas al encarar el estudio de reacciones de este tipo.

Abstract:
This work deals with equilibrium and dynamical aspects of the back-isomerization reaction of a carbocyanine cation (3,3’-Diethyloxacarbocyanine, DOCI) taking place in different solvents: acetonitrile, n-primary alcohols and mixtures of methanol (MeOH) and acetonitrile (ACN). The global description of the system is very complex due to the broad spectrum of relevant lengthscales in the problem, ranging from intramolecular bonds (with lengths in the order of 1 or 2 Å), to distances in the order of solute size (≈ 20 Å). In addition, an important redistribution of the electronic density that produces intermediate states of high polarity takes place as well. The methodolgy of study resorted on Molecular Dynamics techniques. The main characteristics of the model are: (i) a detailed model of the solute in which all degrees of freedom are explicitly included; (ii) the electronic distribution is allowed to change along the reaction coordinate; (iii) the solvents were considered as collection of partial charges kept at fix distances; (iv) for the largest solvent molecules, a simplified model was considered reproducing the most important properties that influence the reactive process, such as polarity, packing effects and self diffusion. Our approach to the study of the reaction included the computation of the rate constants. These rate constants are the result of two contributions: the first is the transition state theory estimate and, secondly corrections due to dynamical effects. Moreover, the equilibrium study provided information about solvation structures in the transition and product states. We have also performed non-equilibrium relaxations in which we monitored the simulataneous relaxation of the solute and the solvent degress of freedom. The mainly conclusions of this work are: (i) the presence of a solvent always produces a decrease of the free energy activation barrier with respect to the intrinsic barrier in vacuo. (ii) the value of this reduction is the result of a competition between the solute-solvent and solvent-solvent interactions, (iii) the computed activation free energies reproduces the observed trend of experimental rate constants, (iv) in the ACN/MeOH mixtures, we observed preferential solvation of the aprotic solvent.

Rubel, Carolina Julieta. "Modulación de la funcionalidad y sobrevida de neutrófilos humanos por fibrinógeno a traves de beta sub 2 integrinas : análisis de los caminos transduccionales involucrados" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La regulación de los procesos inflamatorios ocupa un lugar central en el mantenimiento de la homeostasis, ya sea durante el proceso de eliminación del agente agresor, durante las etapas posteriores de reparación de tejidos, o durante los procesos inflamatorios crónicos. El evento más importante en un proceso inflamatorio agudo lo constituye el acúmulo de neutrófilos (PMN) en el tejido injuriado. Durante estos procesos diversos factores como citoquinas, quemoquinas, agentes quimiotácticos (C5a, C3a), productos generados de la destrucción de las bacterias y factores del sistema de coagulación generan en los PMN una serie de cambios fenotípicos y morfológicos que llevan a la activación de los mismos y a su migración hacia los focos inflamatorios: en un primer momento los PMN interaccionan con el endotelio capilar a través de moléculas de adhesión denominadas L-selectinas, que les permiten unirse a sus paredes; luego dicha interacción se hace más firme a través de otras moléculas de adhesión como son las β2-integrinas. Aunque este es proceso fisiológico que tiende a mantener la homeostasis, bajo ciertas circunstancias, la interacción del endotelio con los PMN, células con un alto potencial citotóxico, puede llevar al daño endotelial y tisular. Por otra parte, las integrinas no sólo son responsables del reclutamiento leucocitario sino que desencadenan también diversas señales intracelulares. El fibrinógeno (Fbg), componente central del sistema de coagulación y proteína de fase aguda, es uno de los ligandos fisiológicos de la Bgintegrina Mac-l, CR3 o CD11b/CD18, presente en la superficie de los PMN. El objetivo del trabajo fue analizar si la interacción del Fbg soluble (sFbg) con los PMN activados durante un proceso inflamatorio, es capaz de modular su funcionalidad y sobrevida. Los resultados obtenidos permiten concluir que cuando los PMN han recibido señales inflamatorias se modifica la conformación del CDllb/CD18, de tal forma que aumenta su avidez por el sFbg, presente en el plasma o que ha trans-sudado a sitios inflamatorios. Dicha interacción resulta en la activación funcional de los PMN y en la inhibición de su mecanismo apoptótico. Así los PMN presentan una mayor actividad fagocítica y citotóxica y una mayor capacidad para volcar el contenido de sus gránulos con enzimas microbicidas y liticas. Estos resultados implican una conexión entre la cascada de coagulación y la respuesta inflamatoria. Sin embargo, los productos de degradación del sFbg pierden su actividad reguladora, resguardando procesos que descontrolados pueden tomarse sumamente dañinos para el huésped. Esta modulación de la actividad biológica no es más que la expresión de señales intracelulares específicas que resultan del balance de los distintos estímulos recibidos por las células. Aqui también se demuestra que la modulación de los PMN por el sFbg está mediada por una secuencia ordenada de fosforilaciones en residuos de tirosina de distintas proteinas, fundamentalmente la "Focal Adhesion Kinase" o Quinasa de Adhesión Focal (FAK) y la "extracellular regulated kinase" ERKl/2, proteína perteneciente a la familia de las "mitogen activated protein kinases" o proteinas quinasas activadas por mitógenos (MAPK). La activación de esta cascada juega un papel central en la inducción de degranulación, el aumento de la fagocitosis y el retardo de la apoptosis. Estos hallazgos aportan evidencias a favor de que la activación de la proteína ERKl/2 está asociada con un aumento en la actividad biológica y una disminución en los procesos de muerte celular en los PMN. El mecanismo apoptótico involucra además otras señales intracelulares, como la inducción de distintos factores nucleares y genes. Los factores de transcripción NF-kB son una familia de proteinas capaces de unirse a sitios reguladores del DNA modulando la expresión de diferentes genes entre ellos varios anti-apoptóticos. En esta tesis se demuestra que en los PMN el sFbg también activa el NF-kB, en forma secuencial a la activación de la ERKl/2 y que la translocación al núcleo del NF-kB, es responsable de la inhibición de la apoptosis. El conocimiento detallado de estos caminos intracelulares es de suma importancia para entender y, eventualmente, intervenir farrnacológicamente en enfermedades con un componente inflamatorio importante.

Rodriguez, Javier. "Transiciones en nanoagregados acuosos: isomerización y cambios de fase" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo consiste en la realización de experiencias de simulación computacional destinadas a analizar aspectos microscópicos relacionados con la estructura, respuesta de polarización y transiciones de fase sólido-líquido en nanoagregados acuosos pequeños: 6,8 y 9. Como primer paso de nuestro estudio, hemos analizado diversas estructuras correspondientes a mínimos locales empleando para ello metodos ab — initio y campos de fuerza medios. Nuestra aproximación al estudio cuántico se basó en la Teoría de los Funcionales de la Densidad, al nivel GGA. Para el caso particular del 6, fueron escogidos cinco confórmeros de energía similar, con diferente estructura y momento dipolar. Dentro de este grupo, sólo el confórmero cíclico resulta no polar. Para 8, las estructuras más estables correpondien a las formas cúbicas, no polares, D2d y S4. La polarizabilidad estática muestró ser proporcional al tamaño de los agrega(los, presentando una débil dependencia con el número de uniones hidrógeno. Con el objeto de examinar la influencia de las fluctuaciones térmicas en los agregados, fueron realizados una serie de experimentos dc dinámica molecular clásica, partiendo de bajas temperaturas hasta alcanzar la transición de fusión; empleando para ello dos pseudopotenciales distintos: TIP4P y MCY. Los procesos de isomerizacion en las cercanías de las transiciones de fase fueron caracterizados mediante el seguimiento del cambio en el momento dipolar, el número de uniones hidrógeno y el parámetro de Lindemann. Utilizando técnicas basadas en la técnica de Muestreo de Trayectorias Reactivas (MTR) hemos analizado la dinámica de la isomerización a bajas energias entre las estructuras cúbicas estables D2d y S4 del 8. El mecanismo de reacción involucra el pasaje sobre estados de transición caracterizados por la distorsión de una cara del cubo original debido a la presencia de un enlace de hidrógeno diagonal. El análisis dinámico de un conjunto de trayectorias muestra que la isomerizacion requiere de la rotación concertada de moléculas dobles donoras de protones y el intercambio entre los hidrogenos libres y enlazados, en moleculas donores simples de protones. A una energía total de E = —60.5 kcal/mol, el tiempo característico para la interconversión es del orden de los milisegundos. Hemos investigado también caminos reactivos para la transición de fusión, a temperaturas T ≈ 200 K en donde la barrera de energía libre entre interconversiones sólido-líquido no supera 2 kbT. Nuestro resultados predicen que las transiciones líquido-sólido no involucran el pasaje a través de barreras energéticas sino que la estabilización de la fase liquida es el resultado de cancelaciones entre las contribuciones energéticas y entrópicas. Por último, analizamos los canales reactivos que conducen la interconversión a bajas energías, entre dos estructuras estables de 9 derivadas de la estructura D2d antes mencionada. El análisis de modos normales instantáneos revela que el canal reactivo de la interconversión requiere de la la traslación concertada de tres moléculas. A una energia total de E: -76 kcal/mol, el tiempo característico para la interconversión, calculada a partir del MTR, es del orden de los 0.5 milisegundos. Esta estimación concuerda satisfactoriamente con predicciones obtenidas a partir de la teoría clásica microcanónica del estado de transición.

Abstract:
In this work, we have performed computer simulation experiments to unveil microscopic details related to the structural arrangement, polarization response and solid-liquid phase transitions in small aqueous nanoclusters :6,8 y 9. As first instance of our work, we analyzed different local minimum structures employing ab —initio methods and mean field force fields. Our approach to the quantum problem was based on Density Functional Theory, at the Generalized Gradient Approximation level. For the specific case of 6, we chose five conformers of similar energy differing in structure and dipolar moment. For this group, only the cyclic hexamer structure turned out to be non-polar. For 8, the most stable structures corresponded to the cubic D2d and S4, non polar conformers. The static polarizability was found to be proportional to the size of the aggregates and weakly dependent on the number of hydrogen bonds. In order to asses the effect of thermal fluctuations, we performed a series of classical Molecular Dynamics from low temperatures up to near the solid-liquid transitions, employing two well tested pseudopotentials: TIP4P and MCY. Isomerization processes in the vicinity of the liquid-solid phase transitions were followed by monitoring changes in the dipolar structure, number of hydrogen bonds and the Lindemann parameter. Using Transition Path Sampling (TPS) methods we also investigated dynamical aspects of the low energy isomerization between the D2d and S4 stable structures of 8. The reaction mechanism involved the passage over an ensemble of transition states characterized by distorted structures, in which an original face of the cube exhibits a diagonal hydrogen bond. The dynamical analysis of a set of reactive paths showed that the isomerization requires concerted flips of double proton donor molecules and the interchange between dangling and bonding hydrogens, in simple proton donor molecules. At a total energy of E = —60.5 kcal/mol, we calculated that the characteristic time for the interconversion is of the order of milliseconds. We have also investigated pathways for the melting transition at temperatures T≈200 K. We find that the barrier for solid-liquid interconversions never exceeds ZKbT. Such interconversions between liquid and solid do no involve the passage over an energetic barrier; instead, the stabilization of the liquid phase is the result of a concallation between energetic and entropic contributions. We finally analyzed dynamical pathways for the low energy interconversions between two stable 9 derived from the D2d octamer. Instantaneous normal mode analysis reveals that the dynamics over the ensemble of transition states is characterized by the concerted translation of three molecules. At a total energy E = —76 kcal/mol, the characteristic time for the interconversion, obtained from TPS tecnique, is of the order of 0.5 ns. This estimate compares well with predictions from classical microcanonical transition state theory.

Rodríguez Moreno, Paula Abigail. "Interferencia del cadmio sobre el proceso de muda del cangrejo de estuario Chasmagnathus granulata, DANA 1851 (Decapoda, Brachyura)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo comprendió el estudio experimental de la posible interferencia del cadmio sobre el proceso de muda del cangrejo Chasmagnathus granulata. Se realizó en primer término la descripción de los distintos estadios y subestadíos del ciclo normal de muda, principalmente a través del estudio setogénico. Esta información permitió desarrollar una herramienta esencial para el seguimiento del ciclo de muda de los animales que se utilizaron en los experimentos posteriores. Estos consistieron tanto en una exposición crónica ai cadmio, in vivo, así como en una exposición aguda al mismo metal, in vitro. Se determinaron numerosas variables en estos experimentos, tales como actividad ATPásica en branquias e hipodermis, contenido de calcio en el caparazón y niveles de ecdiesteroides. Durante la postmuda, la exposición in vitro a cadmio causó una inhibición irreversible sobre la actividad máxima de la Na,K-ATPasa, pero a concentraciones que in vivo resultaron ser letales. Concentraciones subletales ensayadas in vivo, en cambio, no produjeron una inhibición significativa ni sobre la actividad máxima de la Na,K-ATPasa, ni sobre la actividad fisiológica de la enzima (estimada mediante el consumo de oxígeno sensible a ouabaína). En correspondencia con estos resultados, se observó que el proceso de calcificación del exoesqueleto no se veía afectado, en términos del contenido de calcio que presentaban los caparazones en postmuda tardía. De igual modo, se verificó durante la premuda que el proceso de descalcificación del exoesqueleto no se veia significativamente inhibido por la exposición in vivo al metal. Si se encontró durante la premuda un arresto significativo de la muda, a una concentración de cadmio de 0,5 mg/I. Los animales arrestados fueron incapaces de avanzar en el desarrollo setal, quedando detenidos en premuda temprana, correspondiente al comienzo del aumento exponencial de la ecdisona en hemolinfa. Exposiciones que comenzaron en subestadíos posteriores de la premuda, cuando se verifica el pico de ecdisona, no inhibieron la muda, sugiriendo que el cadmio inhibiria la muda mediante la inhibición de la secreción pico de ecdisona esencial para que ésta ocurra.

Abstract:
This study was aimed at evaluating the possible interference of cadmium on the molting process of the estuarine crab Chasmagnathus granulata. Firstly. a description of the different stages and sub-stages of the normal molting cycle was made, by means of the setogenic study. This information allowed us to develop an essential tool for monitoring the molting cycle in the animals used later for all kind of bioassays. These assays comprised a chronic exposure to cadmium, in vivo, as well as an acute exposure to the same heavy metal, in vitro. Several variables were determined during those experiments, such as ATPase activity in gills and hypodermis, calcium content in carapace and ecdysteroids hemolymphatic levels. During postmolt, the in vitro exposure to cadmium caused an irreversible inhibition on the maximum activity of Na,K-ATPase, but at concentrations that were lethal in vivo. Instead, sublethal concentrations assayed in vivo did not produce a significant inhibition neither on maximum Na,K-ATPase activity nor on physiological activity of that enzyme (estimated by means of the oxygen consumption sensitive to oubain). In accordance with these results, no effect of cadmium on the calcification of carapace was noted, in terms of the calcium content of carapaces at the end of postmolt. Correspondingly, no effect of cadmium was observed in the decalcification process that carapace has during premolt. However. during premolt, an exposure to 0.5 mg/I of cadmium caused an arrest of molting. Arrested crabs were unable to progress in the molting cycle, stopped their cycle in early premolt, just before the ecdysteroid level peaked in hemolymph. When the exposure to cadmium begun after that peaking, no inhibition of molting was seen, suggesting that cadmium would inhibit molting by inhibiting the peak secretion of ecdysteroid needed for molting to ocurr.

Rivarola, Valeria. "Caracterización funcional y molecular de la regulación del transporte de agua y del pH intracelular en células del túbulo colector cortical" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los túbulos colectores corticales (CCD) del riñón de mamífero juegan un papel central en la regulación del transporte de agua-solutos y en el equilibrio ácido-base del organismo. Si bien muchos estudios han sido realizados para tratar de entender los mecanismos implicados en estos procesos, los mismos no han sido completamente aclarados. En la presente tesis hemos utilizado a la línea celular RCCD1 (modelo de CCD) para intentar clarificar los mecanismos por los cuales se produce el movimiento de agua y la regulación del pHi en este segmento del nefrón. En lo referente al movimiento de agua observamos que la línea celular desarrolla importantes flujos en ausencia de fuerzas impulsoras osmóticas e hidrostáticas. Demostramos, además, que los mismos ocurrirían por un mecanismo de cotransporte agua-soluto ya que la línea no expresa acuaporinas. Basalmente predominaría un flujo secretor asociado al movimiento de Cl-, HCO3- y K+. La hormona AVP estimularía, a “corto plazo”, una absorción de fluido acoplada a la de Na+ y, a “largo plazo”, un flujo secretor acoplado al Cl- probablemente mediado por el canal CFTR. En cuanto a la regulación del pHi demostramos funcional y molecularmente que la linea expresa, basolateralmente, las isoformas NHE-1 y NHE-2 del intercambiadores Na+/H+. La NHE-1 sería la encargada de la regulación del pHi ante una carga ácida y la NHE-2 mantendría el pHi basal. En lo que respecta a los intercambiadores Cl-/HCO3- demostramos que la línea celular RCCD1 expresa las isoforrnas AE2, AE3 y AE4. Las dos primeras se localizarían en la membrana basolateral y la AE4 estaría en la membrana apical. Funcionalmente AE3 y AE4 se encargarían de mantener el pHi basal mientras que la AE2 se activaría ante cargas alcalinas. Además proponemos que las células RCCD1 tendrían plasticidad en la expresión de sus intercambiadores Cl-/HCO3-. Finalmente mostramos que la AVP es capaz de modular tanto a los intercambiadores Na+/H+ como a los Cl-/HCO3-. Interesantemente hallamos que esta hormona, tradicionalmente asociada a las células principales, podría también regular a los transportadores Cl-/HCO3- presentes en las células intercalares.

Abstract:
The mammalian cortical collecting duct (CCD) plays an important role in the regulation of water-ion coupling and acid-base balance. Although several studies have been performed in order to study the bases of these processes, these have not been completely clarified. During this thesis we used the RCCD1 cell line (as a CCD model) to elucidate the mechanisms of water movement and pHi regulation in this part of the nefron. Conceming water movement this cell line developed important water fluxes in the absence of osmotic or hydrostatic driving forces. As this cell line does not express aquaporins, the mechanism involved in these movements is associated to a water-solute cotransport. In basal conditions RCCD1 cells developed a secretory flux associated to Cl-, HCO3- and K+ movements. A “short term” effect of AVP resulted in an absortive flux associated to Na+ and, a “long term” effect in a secretory flux associated to Cl- probably driven by CFTR channel. Conceming pHi regulation our functional and molecular studies showed that RCCD1 cells express, in the basolateral membrane, the NHE-l and NHE-2 isoforms of the Na+/H+ exchanger. NHE-1 would be responsible of pHi recovery after an acid load and NHE-2 would mainly be involved in steady-state pHi. On the other hand RCCD1 cells express AE2, AE3 and AE4 isoforms of the Cl-/HCO3- exchanger. AE2 and AE3 would be localized in the basolateral membrane and AE4 in the apical one. AE3 and AE4 would be involved in Steady-state pHi while AE2 would be activated after an alkaline load. Moreover we demonstrated that RCCD1 cells would have plasticity in Cl- /HCO3- exchanger expression. Finally our studies showed that AVP can activated both NHE and AE exchangers. Interestingly, we propose that the hormone action, traditionally associated to the principal cells, would be also able to regulate Cl-/HCO3- exchanger in the intercalated cells.

Puntel, Mariana. "Nuevas vacuna contra herpevirus bovino tipo 1 : Desarrollo de una cepa viral con patrón antigénico diferencial con respecto al de las cepas circulantes en el campo" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se obtuvo la cepa HVB-1ΔgEβlgal, a partir de la cepa HVB-1 LA en la cual el gen de la glicoproteina E (gE)fue reemplazado por el gen de la enzima ,βgalactosidasa, por técnicas de ingeniería genética. La cepafue caracterizada tanto a nivel genómico y antigénico,como en cuanto a sus propiedades de crecimiento en cultivo celulares. La inmunogenicidad de la cepa HVB-1ΔgE-βgal se mantuvo intacta, comparada con la cepa parental, cuando se la utilizó como un inmunógeno inactivado y permitió la diferenciación entre animales vacunados e infectados en base a su respuesta de anticuerpos. Utilizado como vacuna atenuada, HVB-1ΔgE-βgal indujo una buena respuesta inmune especifica que resultó protectora frente al desafio viral, independientemente de la via de inoculación. Además, se comprobó la seguridad de la cepa HVB-1ΔgE-βgal ya que, en las condiciones de la experiencia, no se transmitió por contacto, ni fue abortigénica. Asimismo, se verificó la respuesta inmune difierencial inducida frente a la vacunación con la cepa desarrollada, con respecto a la inducida por la infección viral. La respuesta inducida por la vacuna atenuada en bovinos adultos fue sostenida durante 330 días y se mantuvo negativa contra gE. La vacuna atenuada fue altamente inmunogénica tanto cuando fue administrada en animales adultos como en terneros jóvenes. En particular, en aquellos bovinos que al momento de la vacunación tenían 3 meses de vida, hijos de madres vacunadas y que por lo tanto contaban con niveles detectables de anticuerpos especificos. Si bien se evidenció un efecto de interferencia de los anticuerpos maternos frente al desarrollo de una respuesta inmune específica,fue posible detectar el aumento de los anticuerpos frente a una revacunación realizada cuando los bovinos contaban con 8 meses de vida (l60dpv).

Abstract:
A glycoprotein E gene-deleted and βgal expressing bovine type 1 recombinant (BHV-1ΔgEβgal) was developed by deleting the glicoprotein E (gE) gene and replacing it by the ,βgalactosidase coding region ,into the BHV-1 LA parental strain. The new BHV-1ΔgEβgal strain was characterized both by genetic, antigenic, as well as related to its properties about growing in tissue culture conditions. The immunogenicity of the strain BHV-1ΔgEβgal was maintained intact compared with the parental strain and allowed immunologic differentiation between infected and vaccinated animals in studies as an inactivated vaccine made in bovines. At the same time, bovines resulted protected against virus infection in a challenge experience. Pathogenicity of BHV-1ΔgEβgal virus in calves was mild and the immune induced response was protective against virus challenge with the parental strain, independently of the inoculation route used for the live vaccine. In addition, it was demonstrated the security of the live vaccine none abortigenic effect or change in the pregnancy period were observed; neither transmission between vaccinated and unvaccinated bovines. It was verified a differential immune response to the live BHV-1ΔgEβgal strain when compared to the virus infection, and the long lasting immunity during 330 days since vaccination. The live vaccine was highly immunogenic as well in adults bovine as in young calves. In particular, in those calves that were 3 months old at vaccination time born from vaccinated seropositive heifers, it was detected interference effect on the immune response of the calf but that effect disappeared when the same vaccinated calves were 8 months old. It was possible to detect a rice in the humoral response level when the calves were first vaccinated at 3 months of age and revaccinated at 8 months of age.

Portal, Daniel. "Control de la expresión génica en Trypanosoma Cruzi : proteínas que participan en la regulación del procesamiento de pre-RNA mensajeros" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El Trypanosoma cruzi. es el parásito protozoario flagelado responsable de la enfermedad de Chagas en Latinoamérica. Esta enfermedad produce miles de muertes y un costo elevado para los países de la región. El mecanismo de control de la expresion génica en el parásito es objeto de fuertes estudios, ya que éste procesa sus pre-RNA mensajeros de manera diferente a la forma en que lo hacen sus hospedadores, mediante un mecanismo conocido como trans-splicing. Por lo tanto, entender las bases moleculares de dicho control es importante para encontrar puntos potenciales para el desarrollo de drogas terapéuticas que puedan interrumpir el ciclo vital del parásito. Presentamos aquí el clonado y la caracterización de dos proteínas importantes para la catálisis y el control del procesamiento de los pre-RNAm jamás descriptas anteriormente en ningún protozoario poseedor del sistema de trans-splicing. Estas proteínas, llamadas TcSR, perteneciente a la familia de factores de splicing ricas en serina y arginina y su quinasa asociada, TcSRPK mostraron un altísimo grado de conservación a todo nivel con sus contrapartes de eucariotas superiores tanto en ensayos in vivo como in vitro. Si bien esto las descarta, en principio, como base para el desarrollo de drogas terapéuticas, ilustra sobre el grado de conservación que pueden tener dos vias aparentemente discímiles como el cis- y el trans-splicing. Además, los resultados sugieren que los mecanismos de control de la expresión génica a nivel del procesamiento del RNA están altamente conservados a pesar de la distancia evolutiva, demostrando la enorme presión de selección a la que está expuesto dicho mecanismo.

Abstract:
The Trypanosome cruzi, is a flagellate protozoan parasite responsible for the Chagas' disease in Latin America. The mechanisms of control of gene expression are not well understood, since the parasite processes nearly all of its pre-mRNAs by trans-splicing which is different from cis-splicing, in their insect and mammalian hosts. Understanding the molecular basis of such mechanism is important in order to develop drugs that could interrupt the parasite's vital cycle. Here we present for the first time in a trans-splicing performing organism, the cloning and characterization of two important proteins involved in the catalysis and control of pre-mRNA processing. These proteins, called TcSR, a member of the serine-arginine (SR) protein family of splicing factors and its associated kinase. TcSRPK, showed a highly conserved activity both in vitro and in vivo, in a variety of functional assays. Although this discards the proteins as potential targets for therapeutic drug development, it illustrates on the striking conservation that two apparent different pathways like cis- and trans-splicing can show. Moreover, the results suggest that the mechanisms of control of gene expression at the pre-mRNA processing level are highly conserved despite the evolutionary distance that separates the organisms. This demonstrates the huge selection pressure to which pre-mRNA processing is exposed.

Policastro, Lucía Laura. "Participación de las especies reactivas del oxígeno y del nitrógeno en la transformación celular y en la modulación de la radiosensibilidad" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las poblaciones celulares en un organismo están estrictamente controladas por el balance de señales complejas que estimulan o inhiben la proliferación, diferenciación y sobrevida de las células. Existen evidencias experimentales que sugieren que las especies reactivos del oxigeno estón involucradas en el desarrollo del cancer. El primer objetivo de este trabajo fue evaluar la participación de las especies reactivos del oxígeno en los mecanismos de proliferación y transformación celular y modular los niveles de estas especies a fin de inhibir la proliferación y de esta forma controlar el crecimiento tumoral. Los resultados demostraron que existe un aumento de la actividad de superóxido dismutasa y una disminución de los niveles de catalasa y glutatión peroxidasa, enzimas disipadoras de peróxido de hidrógeno, en función de la malignidad. Este desbalance enzimótico se correlacionó con aumento de la producción de peróxido de hidrógeno. La disipación de peróxido de hidrógeno de manera exógena mediante tratamientos con catalasa inhibió la proliferación en líneas celulares de diversos orígenes tisulares y de organismos diferentes, lo que sugiere que la participación del peróxido de hidrógeno en el control de la proliferación sería un fenómeno general. Por otro lado, tratamientos con catalasa inhibieron el desarrollo de tumores experimentales. En concordancia con estos resultados, se demostró que la transfección estable del cDNA de la catalasa en una línea celular tumoral humana, disminuyó la tasa de proliferación y revirtió características de fenotipo maligno. Con respecto a los mecanismos de la inhibiciónde proliferación por secuestro de peróxido de hidrógeno, se demostró aumento de los niveles de óxido nítrico en los tratamientos con catalasa, sugiriendoa esta especie como un posible mediador de esta vía. Por otro lado, dado que la radioterapia constituye junto a la quimioterapia una de las principales formas de tratamiento contra el crecimiento tumoral, el segundo objetivo de esta tesis fue la caracterización de la radiosensibilidad intrínseca de líneas celulares con diferente grado de malignidad, de la respuesta celular a diferentes tipos de radiaciones ionizantes y el estudio del efecto del óxido nítrico como posible radiosensibilizador selectivo de las células tumorales. Los estudios de radiosensibilidad intrínseca demostraron un aumento de la radiorresistencia en función de la malignidad en las células tumorales de ratón evaluadas, que no se manifestó en las células de origen humano. Con respecto a las irradiaciones con haces de protones y de litio en comparación con la radiación gamma, se demostró un aumento de la eficiencia biológica relativa (RBE) en función de la transferencia lineal de energía (LET) de la radiación, que resultó consistente con los datos bibliográficos. Por otro lado, los estudios de la acción del óxido nítrico mostraron un mayor efecto radiosensibilizador en las células con mayor capacidad tumorigénica. Este efecto podría ser explicado por el estado prooxidativo basal de las células mas malignas, que potenciaría la acción de la radiación. Se demostró también la acción del óxido nítrico como radiosensibílizadoren tumores experimentales. Estos resultados sugieren la posibilidad de explorar terapias antioxidantes específicas y radiosensibílizadores selectivos para el control del crecimiento tumoral.

Abstract:
Cell populations in a living organism are strictly controlled by the balance of complex signaling systems, which stimulate or inhibit cell proliferation, dífferentiation and survival. Substantial experimental evidence suggests a role of reactive oxygen species in the development of cancer. The first aim of the present study was to evaluate the involvement of reactive oxygen species in the mechanisms of cell proliferation and transformation and to modulate the levels of these species to inhibit proliferation and thus control tumor growth. The results showed an increase in superoxide dismutase activity and a fall in the activities of H2O2-detoxifying enzymes, catalase and glutathione peroxidase, as a function of malignancy. This imbalance in the antioxidant system was coupled to a rise in the levels of H2O2. The exogenous removal of H2O2 by treatment with catalase induced an inhibition of proliferation in all the tested cell lines of different tissues from several species, suggesting that the regulation of proliferation by H2O2 would be a general phenomenon. Moreover, in vivo treatments with catalase inhibited the growth of experimental tumors. Furthermore, the rate of proliferation was inhibited and some features of malignant phenotype were reversed by a stable transfection of the cDNA of catalase in a human tumor cell line. Regarding the mechanisms of the inhibition of cell proliferation by scavenging H2O2,an increase in the levels of nitric oxide by treatment with catalase was found, suggesting that nitricoxide could be a mediator of this signaling pathway. Taking into account that radiotherapy coupled to chemotherapy is one of the main forms of treatment for cancer, the second aim of this study was to characterize the intrinsic radiosensitivity of cell lines with different degrees of malignancy, the cellular response to different types of ionizing radiation and the effect of nitricoxide as a possible selective radiosensitizer of tumor cells. The studies of intrinsic radiosensitivity demonstrated an increase in radioresistance as a function of malignancy in the mouse tumor cells evaluated. However, this correlation was not found in the human cells tested. Regarding proton and Lithium beam irradiations as compared with gamma irradiations, an increase in relative biological effectiveness (RBE)as a function of the linear energy transfer (LET) was found, which was consistent with previous reports. Furthermore, the studies of the action of nitric oxide resulted in a greater radiosensitizing effect on the more tumorigenic cells. These differential effects could be due to the basal prooxidative state of the more malignant cells that could potentiate the effect of radiation. The radiosensitizing effect of nitric oxide on experimental tumors was also demonstrated. These results suggest the possibility of exploríng specific antioxidant therapies and selective radiosensitizers for the control of tumor growth.

Pieckenstain, Fernando Luis. "Control biológico de enfermedades causadas por Sclerotinia Sclerotiorum en el girasol y estudio del rol de las poliaminas en las distintas etapas del ciclo de vida de este patógeno" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Perez Castro, Carolina Inés. "Rol de la familia de citoquinas gp130 en la regulación de la función hipofisaria" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las cítoquinas mas conocidas en la regulación de la función de células de la pituitaria anterior son LIF e IL-6. Estas cítoquinas, junto con IL-11, oncostatina M, CNTF y cardiotrofma-1, son referidas como cítoquinas gp 130, debido a que comparten el mismo transductor de señales. En la presente tesis, se estudió el papel de las cítoquinas de la familia gp130 en células de la pitutaria anterior. Se encontró que, tanto células TtT (foliculoestrlladas-FS) como GH3 (lactosomatotrofas) expresan el mRNA para la cadena específica α del receptor de IL-11 (IL-11-R) y de CNTF-R. Ambas cítoquinas estimulan la proliferación de células FS y células GH3. También, CNTF estimula la producción hormonal (GH y PRL) en células GH3 e IL-11 la secreción de VEGF en células FS. Ambos tipos celulares expresan el mRNA para CNTF. Células normales de pituitaria anterior y adenomas humanos también expresan CNTF-R(α).IL-11 y CNTF estimulan en forma similar los niveles del mRNA GH en cultivos celulares acromegálicos en monocapa, sin modificar los niveles de secreción hormonal. CNTF estimula la secreción de PRL en monocapa de prolactinomas. En cultivos en monocapa de células normales, IL-11 y CNTF no modifican la secreción de GH y PRL, ni los niveles del mRNA GH. Sin embargo, cuando las células son cultivadas en forma de agregados celulares, ambas cítoquinas estimulan la secreción de dichas hormonas. Se estudió además la acción de esta familia de cítoquinas sobre los procesos tumorigénicos. En clones estables de células GH3 que sobreexpresan gp130 (gp130 sentido), y clones de expresión reducida (gp130 antisentido), se examinó la secreción hormonal, la proliferación celular y la capacidad tumorigénica de los clones en ratones nude. La sobreexpresión de gp130 no modificó el comportamiento celular. Sin embargo, los clones gp130 antisentido, que no responden al estímulo específico de la citoquina gp130, mostraron una marcada inhibición in vitro y en el desarrollo de tumores in vivo. Mediante la técnica de Differential Display se aisló e identificó un cDNA (X2CR1) el cual se expresa diferencialmente en células que sobreexpresan gp130. Este cDNA codifica para una proteina de 195-aa; no posee motivos funcionales conocidos y posee una localización citoplasmática/nuclear. Su perfil de expresión (mRNA) correlaciona con el de gp130. Presenta una secuencia altamente conservada (entre rata y humano), y dos isoformas (mRNA) en los distintos tejidos analizados. La sobreexpresión de X2CR1, regula negativamente tanto la expresión basal del promotor de GH, así como la estimulación con cAMP. De estos resultados se puede concluir: - las cítoquinas gp130 y sus receptores, se expresan y son funcionales en células normales como tumorales de la pituitaria anterior. IL-11 y CNTF son capaces de regular, a través del transductor común gp130, la secreción de hormonas y factores angiogénicos, así como la proliferación celular. La estructura de la glándula es de crítica importancia para la acción de estas cítoquinas; - la sobreexpresión de gp130 en células GH3 no modifica rotundamente el comportamiento celular. Sin embargo, la disminución en los niveles de expresión, refleja la importancia de la acción de las cítoquinas de esta familia no sólo en situaciones fisiológicas sino patofisiológicas como en la formación y/o el mantenimiento de adenomas hipofisarios; - células lactosomatotrofas sobreexpresoras de gp130, expresan diferencialmente X2CR1. Esta nueva proteína podría tener un papel como regulador negativo de las acciones de gp130 así como de otras rutas de señalización intracelular (como en la de CAMP).

Abstract:
Two of the most potent cytokines regulating anterior pituitary cell function are LIF and IL-6. These and others like IL-11, oncostatín M, CNTF and cardiotropin- 1 are referred to as the gp130 cytokines, because they share the gp130 protein as an initial signal transducer. In the present thesis of work, we studied the role of the gpl30 cytokine family in anterior pituitary cells. Receptors (mRNA α-chain specific) for IL-11 and CNTF are expressed on both lactosomatotropic (GH3 cells) and folliculostellate-FS cells (TtT cells). Both cytokines stimulate the proliferation of FS and GH3 cells. In addition, CNTF stimulates the hormonal production (GH and PRL) by GH3 cells and IL-11 stimulates the secretion of VEGF, by FS cells. Both GH3 and FS cells express the CNTF mRNA. The mRNA for the CNTF-R is expressed in all of the human adenoma types analyzed and normal pituitary cells. CNTF and IL-11 exerted a similar stimulatory effect on GH mRNA expression in acromegalic monolayers cell cultures, but these cytokines had no significant influence on GH secretion. CNTF stimulates prolactine secretion in prolactinoma monolayers cell cultures. In monolayers cell cultures from normal rat anterior pituitary, IL-11 and CNTF had no significant effect on the release of either GH or PRL, or on the level of GH mRNA. However, when these cells were cultured in aggregate cultures, both cytokines stimulated hormonal secretion. We generated GH3 gp130 stable clones (gp130 sense and gp130 antisense), in order to study the role of gp130 cytokine family in the tumorigenic process. We examined hormonal secretion, cell growth and tumorigenesis properties in athymic nude mice. The overexpressed gp130 clones did not shown any changes in the cellular behavior. The gp130 antisense clones did not respond to the specific gp130. Likewise, GH3 gp130 antisense cells had severely impaired the in vivo tumor development. By Differential Display technique, we isolated and identified a new cDNA (X2CR1), which differentially expressed in overexpressed gp130 cells. This cDNA encodes a protein of 195-aa, which contains no well-characterized functional motifs and shows a citoplasmic/nuclear localization. Its expression profile (mRNA) is linked with the gp130 expression. The rat X2CRl shares striking sequence homology with its human counterpart, and in the human tissues that we analyzed it presents two different isoforms. GH promoter baseline activity and also under CAMP stimulation were reduced by overexpression of X2CR1. From these results the following conclusions can be drawn: - the gp130 cytokines and their receptors are expressed and are functional in normal anterior pituitary cells and pituitary tumor cells. CNTF and IL-11 regulate, through gp130 transducer, the secretion of hormone, VEGF and the cell proliferation. The three-dimensional structure of the gland is critical for these actions; - the overexpressed gp130 protein did not produce any changes in the GH3 cellular behavior. In contrast, the reduction gp130 level, revealed the importance of the gp130 cytokines actions not only in physiological but also in patophysiological situations, like the beginning and/or the maintenance of pituitary adenoma development; - X2CR1, a novel protein isolated from overexpressed gp130 GH3 cells, may function as a negative regulator of the gp130 cytokines actions, and also may play a similar role in another intracellular pathways (like cAMP signaling).

Perazzo, Carlos Alberto. "Soluciones con tiempo de espera de la ecuación de difusión no lineal" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Investigamos en detalle las soluciones con tiempo de espera de ecuaciones de difusión no lineal de la forma ∂th = ∂x(h ͫdxh)(m > 0). Con este objetivo obtuvimos las soluciones numéricas para diferentes valores del parámetro de no linealidad m y para condiciones iniciales de la forma h(x,0) α xαq (q = 2/m). Si α ≥ l las soluciones tienen un tiempo de espera tw = tw(m,α), i.e. un intervalo finito de tiempo en el cual el frente se mantiene en reposo antes de comenzar a moverse. En trabajos previos hemos estudiado en detalle los casos m = 3, que corresponde a corrientes viscogravitatorias, y m = l, que describe el flujo isotérmico de un gas a través de un medio poroso y el flujo de acuíferos no confinados. Aquí investigamos numéricamente las soluciones con tiempo de espera para 1/2 ≤ m ≤ 9. Mostramos las soluciones en detalle, y estudiamos la influencia que m y α tienen sobre el tiempo de espera así como sobre otras propiedades de las soluciones obtenidas. El comportamiento de las soluciones es cualitativamente el mismo para todo m, pero difieren cuantitativamente como así también en varios detalles. Determinamos tw y la velocidad de arranque del frente e como funciones de m y α. Encontramos que los valores de T (m,α) = (tw¹´ͫ - t1¹´ͫ)/(t͚¹´ͫ - t1¹´ͫ) y C(m,α) = (^Cw¹´ͫ - ^C1¹´ͫ)/(^C͚¹´ͫ -^C1¹´ͫ) para el rango antes mencionado de m caen con buena aproximación sobre una única curva empírica universal (t1, t͚, ^c1 y ^c͚ se expresan por medio de fórmulas conocidas). Hacemos un estudio detallado del corner layer (un pequeño intervalo Δx en el cual hx varia fuertemente). Además investigamos las asintóticas intermedias cerca del frente que espera y próximo al momento de su arranque. Detectamos dos regímenes autosemejantes: el primero aparece en un dominio cercano al corner layer que está llegando al frente, y el otro aparece en un dominio detrás del corner layer pero un poco más lejos de él que el primero. El primer régimen tiende a una onda viajera con velocidad constante, mientras que el segundo pertenece a un tipo diferente de antosemejanza.

Abstract:
We investigate in detail the waiting-time solutions of nonlinear diffusion equations of the form ∂th = ∂x(h ͫ ∂xh)(m > 0). To this purpose we obtain the numerical solutions for different values of the nonlinearity parameter m and for initial conditions of the form h(x,0) α xαq (q = 2/m). If α ≥ l the solutions have a waiting-time tw = tw(m,α), i.e. a finite time interval in which the front is at rest before starting to move. In previous works we studied in detail the cases m = 3, corresponding to viscous gravity currents, and m = l, that describe isothermal gaseous percolation through a porous medium and flow in unconfined aquifers. Here we investigate the (numerical) waiting-time solutions for 1/2 ≤ m ≤ 9. The solutions are shown in detail and the m and α dependence of the waiting time as well as other properties are studied. The behaviour of the solutions is qualitatively the same for all m, but they differ quantitatively as well as in many details. We determine tw and the start-up velocity ^c as functions of m and α. We find that the values of T (m,α) = (tw¹´ͫ - t1¹´ͫ)/(t͚¹´ͫ - t1¹´ͫ) y C(m,α) = (^Cw¹´ͫ - ^C1¹´ͫ)/(^C͚¹´ͫ -^C1¹´ͫ) for the above mentioned range of m fall with good approximation on single universal empirical curves (here t1, t͚, ^c1, and ^C͚ are given by known formulae). We make a detailed study of the growth and evolution of the corner layer (the small interval Δx in which hx varies strongly). We also investigate the intermediate asymptotics close to the front and near start-up. We detect two self-similar regimes: the first one appears in a domain close to the corner layer that is arriving at the front and the other occurs in a domain behind the corner layer but a little further from it than the first one. The first regime approaches a constant velocity traveling wave, while the second one belongs to a different type of self-similarity.

Peralta, Juan E.. "Criterios teóricos y experimentales para identificar interacciones moleculares" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis se analizan criterios para poder comprender cómo se pueden emplear los parámetros de resonancia magnética nuclear de alta resolución para identificar interacciones moleculares. Desde el punto de vista metodológico, se implementó el cálculo de las cuatro contribuciones a la constante de acoplamiento isótropa empleando la teoría de la funcional de la densidad y se desarrolló un criterio para descomponer el término de contacto de Fermi en contribuciones por orbitales. Esta descomposición provee contribuciones de las capas internas, los pares no ligantes y los enlaces. Estos métodos son muy eficientes por lo que pueden utilizarse para analizar problemas de interés químico y biológico que contienen hasta aproximadamente 30 átomos (tanto de la primera fila de la Tabla Periódica como hidrógenos) empleando recursos computacionales modestos. Desde el punto de vista práctico, en esta Tesis se utilizan estos logros para analizar acoplamientos caracterizados por distintos mecanismos de transmisión. Se analizan también cómo influencian determinadas interacciones moleculares a las constantes de apantallamiento magnético. Se presta especial atención a las interacciones de origen electrostático y a las de transferencia de carga. Para describir a estas últimas se utiliza el análisis NBO, Natural Bond Orbitals.

Abstract:
In this Thesis several criteria to understand how the nuclear magnetic resonance high resolution parameters can be employed to identify molecular interactions are analyzed. From a methodological point of view, the calculation of the four contributions to NMR spin-spin coupling constants employing density functional theory was implemented and a criterion to dissect into orbital contributions the Fermi contact term was developed. This dissection provides core, lone pairs and bonds contributions. By applying this methods it is possible to analyze chemical and biological interesting problems in compounds containing about 30 atoms (first row and hydrogen atoms) using modest computational facilities. In this work such a method is applied to study molecular problems where coupling constants are characterized by different transmission mechanisms. The influence of several molecular interactions on magnetic shielding constants is also analyzed. Special attention is paid to electrostatic interaction sand charge transfer interactions. The latter are described by means of the NBO, Natural Bond Orbitals, analysis.

Parborell, M.Fernanda A.. "Regulación del crecimiento y diferenciación del folículo ovárico por un agonista de la hormona liberadora de gonadotrofinas (GnRH)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo de esta tesis fue evaluar el efecto de la administración de un agonista de Gn-RH (Acetato de Leuprolide, LA) sobre la apoptosis y la esteroidogénesis ovárica. Se administró dietilestilbestrol (DES) a ratas prepúberes para obtener una población de folículos antrales tempranos. Por otro lado, se utilizó un modelo de ratas inmaduras superovuladas con gonadotrofinas (PMSG: gonadotrofina de suero de yegua preñada) con el objetivo de estimular la foliculogénesis hasta el estadío de folículos preovulatorios; parte de estos animales fueron tratados in vivo con LA tanto en forma crónica como aguda. En folículos preovulatorios, LA produce un efecto directo inhibitorio sobre el desarrollo folicular, causando una disminución del número de folículos reclutados por las gonadotrofinas o bien llevando a la atresia a un mayor número de los mismos. Tanto el efecto in vivo como in vitro de LA produce un aumento de la apoptosis en los folículos preovulatorios provenientes de ratas tratadas con PMSG y este efecto es revertido parcialmente in vitro por EGF. El IGF-1 y el FGF fueron capaces de inhibir completamente el efecto estimulatorio de la apoptosis inducida por el agregado in vitro de LA. Con respecto a la familia de Bcl-2, LA disminuye la estabilidad de la isoforrna antiapoptótica (Bcl-xL), favoreciendo la apoptosis. LA aumenta los niveles de progesterona tisular y disminuye los niveles de estradiol sérico; no modifica los niveles de la enzima P450 scc pero aumenta el contenido de la StAR en folículos preovulatorios. En folículos antrales tempranos, FSH suprime parcialmente la apoptosis inducida por LA. En presencia del agonista, EGF, FGF e IGF-1 no son capaces de rescatar a los folículos de la apoptosis. Teniendo en cuenta las diferencias entre el efecto de FSH y los factores de crecimiento, se sugiere la existencia de un mecanismo complejo de transducción de señales para FSH en la prevención de la apoptosis que utilizaría un mecanismo de sobrevivencia que incluye señales diferentes a las usadas por los factores de crecimiento. En conclusión, GnRH-a sería un modulador atretogénico intraovárico que interfiere en el desarrollo folicular.

O’Rourke, Eyleen J.. "Identificación, caracterización e importancia biológica de las ADN glicosilasas del sistema de reparación del ADN por escisión de bases de Helicobacter pylori" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Ogando, Diego G.. "Rol del óxido nítrico (NO) en la reabsorción embrionaria inducida por LPS" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El óxido nítrico (NO) cumple importantes funciones durante la preñez (implantación, decidualización, vasodilatación y relajación miometrial). Sin embargo, en altas concentraciones como las encontradas en los casos de sepsis, el NO tiene efectos tóxicos dado su carácter de radical libre. El objetivo de este trabajo es caracterizar la producción del NO en útero y decidua en la reabsorción embrionaria inducida por lipopolisacárido (LPS) y determinar cuáles son las isoformas de la óxido nítrico sintasa (NOS) implicadas en dicho mecanismo. Se ha observado que el LPS produce un 100% de reabsorción embrionaria a las 24 horas, con una expulsión del feto a las 48 hs. El LPS incrementó la producción de NO en decidua y útero con un máximo en su producción a las 6 horas. Este incremento se debe a la inducción de la expresión de la isoforma inducible de la óxido nítrico sintasa en decidua y útero, y de la isoforma neuronal (nNOS) solamente en decidua que fue detectada por western blot e inmunohistoquímica. El LPS aumentó la expresión de iNOS en decidua y células miometriales y la expresión de nNOS en células de la decidua. El LPS produjo, además, la fibrinólisis y la infiltración de macrófagos iNOS y CD14(receptor de LPS) positivos. Por otro lado, el LPS indujo la expresión de CD14 en las glándulas endometriales que podrían amplificar la respuesta inflamatoria. La Aminoguanidina (AG), un inhibidor de la actividad de la isoforma iNOS, revirtió la reabsorción embrionaria inducida por LPS. Este hecho podría explicarse por una inhibiciónen la producción de NO, pero también podría deberse a una inhibición de la infiltración celular y de la fibrinólisis. El tratamiento con LPS produjo un aumento en el daño oxidativo de la decidua debido al anión peroxinitrito,evidenciado por la nitración de las tirosinas proteicas, hecho que también fue revertido por AG. A su vez, se cuantificó un aumento en la síntesis de prostaglandinas en decidua y útero debido al LPS, pero la AG sólo revirtió el efecto en útero. Estos resultados demuestran que el NO cumple un papel fundamental en la reabsorción embrionaria inducida por LPS.

Abstract:
Nitric oxide (NO) fulfills important functions during pregnancy: implantation, decidualization, vasodilatation and myometrial relaxation. However, in high concentrations such as the ones that are produced in sepsis, it has toxic effects since it is a free radical. The purpose of this work is to characterize the uterine and decidual NO production in the lipopolysaccharide (LPS) induced embryonic resorption and to determine which isoforms of the nitric oxide synthases (NOS) take part in it. It has been observed that LPS produced 100% embryonic resorption at 24h, with the complete fetus expulsions at 48 h. LPS increased NO decidual and uterine production - having its maximum production at 6 h. This increase is due to induction of expression of inducible nitric oxide synthase (iNOS) isoform in decidua and uterus, and neuronal nitric oxide synthase (nNOS) isoform only in decidua detected by western blot and immunohistochemistry. LPS increased the iNOS expression in decidual and myometrial cells and the nNOS expression in decidual cells. LPS also caused fibrinolysis and infiltration of mesometrial decidua by positive iNOS and CD14 (LPS receptor) macrophages. Also, LPS induced the CD14 expression in endometrial glands, that could amplify the inflammatory response. Aminoguanidine (AG), an inhibitor of iNOS activity, totally reversed the LPS-induced embryonic resorption. This could be explained by an inhibition of the increase in the NO production but also by an inhibition of the cellular infiltrationand fibrinolysis. LPS caused an increase in the oxidative damage of the decidua due to the peroxynitrite anion. This was evidenced by nitration of tyrosine proteins which was also reversed by AG. At the same time, an increase in the synthesis of prostaglandins was cuantified in uterus and decidua by LPS, but in this case, AG only reversed the effect in uterus. These results show that NO fulfills a fundamental role in LPS induced embryonic resorption.

Nudelman, María Alejandra. "Estudios de ultraestructura, filogenia molecular y ecofisiología en euglenoideos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los euglenoideos son un grupo muy antiguo y diverso de eucariotas flagelados relacionados con los kinetoplástidos que incluye taxones verdes e incoloros. Las relaciones fllogenéticas dentro del grupo, así como con otras protistas, son aún desconocidas. A pesar de su gran distribución y frecuencia en todos los ambientes, el conocimiento de este grupo es escaso. El esquema taxonómico actualmente en uso es mayormente intuitivo, basado sobre características morfológicas. Tal clasificación puede estar reflejando sólo eventos de convergencia más que relaciones filogenéticas y se requiere una revisión sustancial. Además, algunas de estas características, consideradas diagnósticas en taxonomía son en gran parte variables, influenciadas por las condiciones ambientales. El objetivo de esta tesis fue combinar datos morfológicos y moleculares y así proponer un esquema fllogenético y una clasificación taxonómica consistente de euglenoideos, basada en grupos naturales. Realizamos estudios de los organismos en cultivo a fin de evaluar el rango de plasticidad fenotípica de algunas características diagnósticas. Para investigar Ia validez de los caracteres usados en taxonomía, analizamos la secuencia gen ribosomal 185 de algunos euglenoideos representativos. El análisis filogenético se realizó usando metodologías de máxima parsimonia, máxima verosimilitud, distancia y bayesiano. Los resultados obtenidos fueron consistentes bajo todos los criterios. Los euglenoideos conforman un grupo monofilético. Entre los incoloros, el fagotrofo Peranema sp. diverge en la base de los árboles. Los taxones osmotrofos incluids en este trabajo (Astasia, Khawkinea,Hyalophacus) se habrían originado por una pérdida secundaria de cloroplastos. Los géneros fotosíntétícos Euglena, Phacus y Lepocinclis son poliflléticos. Los géneros Ioricados Trachelomonas y Strombomonas están asociados fuertemente. La clasificación tradicional de estos géneros como entidades genéricas diferentes, usualmente controversial, no es contradecida por los datos moleculares. Las especies de Eug/ena rígidas se agrupan con las especies de Lepocinclis y algunos Phacus, con los cuales comparten la estructura pelicular básica y el tipo de los cloroplastos. Después de la adquisición de los cloroplastos por una forma fagotrófica y metabólica, que sería el ancestro de los euglenoides verdes, la rigidez de la célula habría evolucionado como eventos independientes en los distintos linajes, como así también Ia pérdida de cloroplastos. Los resultados derivados del estudio ultrastructural, en particular, del complejo pelicular, cloroplastos y Ióricas es consistente con el esquema filogenético propuesto. El análisis de algunos caracteres morfológicos permitió confirmar su valor como criterio taxonómico.

Abstract:
The euglenoids are an ancient and diverse group of eukaryotic flagellates related to kinetoplastids that comprises green and colorless taxa. The relationships within the group as with other protists remain unclear. Despite their wide distribution and frequency in all environments the knowledge of this group remain scarce. The taxonomic scheme currently in use is mainly intuitive, based on morphological features. Such classification may reflect just convergence rather than phylogenetíc affiliations and a substantial revision is required. Moreover, some of these features considered diagnostic have been proved to be variable, influenced by environmental conditions. The objective of the present study was to combine morphological and molecular data to propose a phylogenetíc framework as well as a natural and consistent taxonomic system of euglenoids. We conducted studies of the organisms in culture to assess the range of plasticity of diagnostic features. To ínvestigate the valídity of the characters used in taxonomy we analyzed the SSUrDNAsequence of some representative euglenoids. Phylogenetíc analyses was performed using maximum parsimony, maximum Iikelihood and distance methodologies. Results were consistent using all the criteria. The euglenoids conform a monophyletic group, the phagotrophs (Peranema sp.) arising at the base of the trees and osmotrophs (taxa Astasra, Khawkihea, Hyalophacus) derived from secondary loss of chloroplasts. They are positioned in a clade intermixed among metabolic Euglena spp. The photosynthetic genera Euglena, Phacus and Lepocinclis are polyphyletic. The Ioricate genera Trachelomonas and Strombomonas are stroneg associated but their status as different generic entities, usually controversial, is not contradicted by the molecular data. Rigid Euglena spp. are associated with Lepocínclis and some Phacus, with which they share basic pellicle structure and chloroplasts. After the acquisition of chloroplasts by a metabolic phagotrophíc form, ancestor of the Euglenales, the cell rigidity seems to be acquired many times, as independent events during the evolution of green euglenoids, as well as seems to be the loss of plastids. Ultrastructure flndings, mainly particularities of the pellicular complex, chloroplasts and envelopes confirmed the phylogenetíc scheme derived from molecular evidence. Examination of such morphological details has shown they may be taxonomically diagnostic.

Molina, Sandra Mónica. "Transformada de Hankel de funciones generalizadas n-dimensionales" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Miranda, Enrique A.. "Mecanismos de conducción a través del aislante de puerta en estructuras MOS (Metal-Oxido-Semiconductor)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Hemos analizado los distintos modos de conducción que tienen lugar a través del aislante de puerta en estructuras Metal-Oxido-Semiconductor (MOS). En especial, por sus implicancias en las tecnologías microelectrónicas, se ha puesto énfasis en lo concerniente al dióxido de silicio (SiO2). Dependiendo del rango de voltajes y de espesores de aislante considerados, el SiO2 exhibe diferentes comportamientos que requieren un estudio particularizado. Cuando el óxido es muy delgado (<5-6nm), la corriente de túnel a altas tensiones presenta unas oscilaciones que pueden interpretarse, a partir de la mecánica cuántica, como consecuencia de la reflexión parcial de la función de onda electrónica en la interfaz anódica de la estructura. Nosotros hemos propuesto un modelo semi-empírico que logra captar la forma de las características de conducción en todo el rango de tensiones permitidos y para todos los espesores en los que el fenómeno es observable. Al aplicar un estrés eléctrico, la corriente de túnel a bajas tensiones exhibe un crecimiento anómalo que puede atribuirse a la generación de trampas en el seno del aislante. Este mecanismo de conducción se denomina SILC (stress-induced leakage current). Por otro lado, para óxidos más gruesos (>10nm), es posible detectar un cambio en el estado de carga del aislante a partir del desplazamiento de la curvas características capacidad-tensión y corriente-tensión. Hemos propuesto una sencilla modificación de la expresión que se utiliza habitualmente para la corriente de túnel Fowler-Nordheim, la cual permite dar cuenta de dicho comportamiento. Finalmente, se presenta una ampliación de un modelo de conducción que permite explicar de manera consistente los dos modos de ruptura (SOFT y HARD) que tienen lugar en óxidos ultra-delgados. El modelo se basa en la física de los sistemas conductores mesoscópicos y las propiedades de transmisión de los denominados contactos puntuales cuánticos. Hasta ahora, este es el único modelo analítico disponible que puede explicar numerosos hechos experimentales relacionados con el fenómeno bajo estudio.

Abstract:
We have analyzed the different conduction modes through the gate insulator that can be observed in Metal-0xide-Semiconductor (MOS) structures. Special emphasis is put on silicon dioxide (SiO2)due to its implications for microelectronic technologies. Depending on the voltage range and oxide thicknesses considered, SiO2 exhibits different behaviors that require a particular study. When the oxide is very thin (<5-6nm), the tunneling current at large bias shows oscillations that can be interpreted, in terms of quantum mechanics, as a consequence of the wave function’s reflection at the oxide interfaces. We have proposed a semi-empirical model that captures the shape of the conduction characteristics in the whole bias range and for all thicknesses in which the phenomenon is observable. When an electrical stress is applied, the tunneling current at low voltages exhibits an anomalous increase that can be attributed to the appearance of bulk traps at the insulator. This conduction mechanism is referred to as SILC (stress-induced leakage current). For a thicker oxide (>10nm), it is also possible to detect a change in the oxide state of charge by means of shifts of the capacity-voltage or current-voltage curves. We proposed a simple modification to the well-known Fowler-Nordheim tunneling expression, which allows to explain such behavior. Finally, we present an improved model for conduction to deal with the breakdown modes of ultra-thin oxides SOFT and HARD. The model is based on the physics of mesoscopic conducting systems and the transmission properties of the so-called quantum point contacts. Until now, this is the only analytical model available that can successfully explain a number of experimental facts related to the phenomenon under study.

Massoni, Viviana. "Parasitismo de cría del tordo renegrido sobre el varillero de ala amarilla" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió la interacción entre un parásito de cría generalista, el tordo renegrido Molothrus bonariensis, y uno de sus hospedadores, el varillero de ala amarilla Agelaius thilius. El 26.5 % de los nidos fue parasitado; el 80.6 % de estos nidos contenía un solo huevo parásito, mientras que el 19.4% contenía dos huevos puestos por distintas hembras de tordo. Los varilleros no rechazaron ninguno de los casos de parasitismo natural. Tampoco rechazaron huevos introducidos experimentalmente. El 70 % de los eventos de parasitismo ocurrieron durante el período de puesta del hospedador. Los períodos de incubación fueron de 12.4 y l1.6 días para el varillero y el parásito, respectivamente. Debido a la sincronización en la puesta y al menor tiempo de incubación, el 84.2 % de los pichones de tordo nacieron antes o junto con el primer pichón del hospedador. Pese a ello, la presencia de pichones parásitos no afectó el éxito de cria del hospedador y no se registró reducción de nidada. En cambio, los nidos con pichones parásitos sí tuvieron una mayor probabilidad de ser predados durante ese estadío. Los mayores costos de parasitismo se asociaron con la ruptura de huevos asociada a los parásitos. Las picaduras de huevos afectaron por igual a nidos parasitados y no parasitados, y causaron una alta proporción de abandono de huevos durante el estadío de huevos. Se cuantificó el costo de las picaduras de huevos en nidos parasitados y no parasitados, y éste se comparó entre los nidos de una colonia utilizada por el tordo renegrido y otra colonia no utilizada ni visitada por ellos. Los nidos sin picaduras ni parasitismo tuvieron un exito de nidificación del 21.7 %, los nidos sólo parasitados del 14.3 %, los nidos con picaduras pero no parasitados tuvieron un éxito de nidificación del 12.5 %, y los nidos con picaduras y parasitismo del 4 %. La nidificación colonial de los varilleros redujo significativamente las probabilidades de que sus nidos reciban picaduras y sean parasitados; también estuvo asociada con un aumento en su éxito de nidificación. Las picaduras de huevos les permitirían a los tordos renegridos evaluar el grado de incubación de los huevos del hospedador y decidir si conviene parasitar esos nidos. La picadura de huevos de varillero sólo fue seguida de parasitismo en aquellos nidos donde los huevos picados estaban en sus primeros días de incubación y, por lo tanto, podían proveer suficiente tiempo de incubación a los huevos de tordo renegrido.

Abstract:
I studied the interaction between the shiny cowbird Molothrus bonariensis, a generalist brood parasite, and one of its hosts, the yellow-winged blackbird, Agelaius thilius. The frequency of parasitism was 26.5 %; 80.6 % of these nests received single parasitism and 19.4% of them received two parasitic eggs laid by different females. The host did not reject parasitic eggs naturally laid or experimentally introduced at their nests. Seventy percent of the parasitic events occurred during the host's laying stage. The incubation periods of the host and the parasite were 12.4 and 11.6 days, respectively. As a result, 84.2 % of the cowbird chicks hatched in advance or the same day the first host chick hatched. In spite of this headstart, parasitized hosts did not suffer a reduced fledgling success or brood reduction. However, the presence of the cowbird chick did increase the probability of nest predation during the nestling stage. The main cost of parasitism was due to punctures inflicted by parasitic females to host eggs, which equally affected parasitized and non parasitized nests, and caused a high rate of nest desertion during the egg stage. The cost of egg punctures was quantified at parasitized and non parasitized nests, and compared among the nests belonging to a colony used by the parasites and another one, neither used nor visited by them: not punctured unparasitized nests had a nesting success of 21.7 %, not punctured- parasitized nests had a 14.3 %, punctured-unparasitized nests had a nesting success of 12.5 %, and punctured parasitized nests had a 4 %. Yellow-winged blackbird colonial nesting significantly reduced the daily probability of egg punctures and parasitism at the nests, and was associated with higher nesting success. Egg punctures would allow shiny cowbirds to assess host egg development and suitability for parasitism. Host egg punctures were followed by parasitism only when the host eggs were at an early stage of the incubation period and, therefore, the nest would provide enough incubation time for the parasitic egg to hatch.

Maisonnave, Roberto Carlos. "Consecuencias ambientales de la producción de carne bovina en sistemas intensivos confinados (Feedlots)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Se estudiaron variables fisicas y químicas de importancia ambiental en un Establecimiento dedicado al Engorde Bovino Intensivo en Confinamiento, comúnmente llamado feedlot, con el objetivo de determinar si esta actividad generó contaminación ambiental tras diez años de existencia. Se determinaron las concentraciones de distintas especies químicas utilizando métodos estandarizados de recolección y acondicionamiento de muestras, como así también métodos quimicos y fisicos normalizados de determinación. La especie química contaminante y la magnitud de su acumulación es función del recurso bajo análisis —suelo o agua subterránea- y de la ubicación relativa del sitio de muestreo según un gradiente de paisaje. Los contaminantes más importantes fueron nitratos, arsénico, cadmio y níquel en aguas subterráneas. En suelos, si bien no existe una variable química o fisica cuyo estado permita asegurar que la capacidad productiva del recurso ya ha sido afectada, la magnitud de los cambios operados sobre este recurso como consecuencia de la actividad productiva Ganaderia Intensiva alertan sobre el estado actual y los usos potenciales futuros para los suelos estudiados. Analizando el estado de los recursos Agua Subterránea y Suelos, y realizando comparaciones con aguas superficiales y sedimentos de obras de captación y almacenamiento de efluentes, quedó demostrado que la actividad Ganadería Intensiva a Corral genera contaminación ambiental. Todos los patrones de uso de la tierra mostraron una relación clara con la dinámica de las variables fisicas y químicas bajo estudio. Esto permitió establecer un análisis comparativo del estado de los recursos en fimción del patrón de uso de la tierra en cada caso. Se demostró que la ganaderia intensiva es una actividad que conlleva cierto riesgo ambiental, más localizado y concentrado que en el caso de agricultura, y este efecto de polución se potencia si no se aplican ciertas pautas de manejo. El diseño correcto y el mantenimiento de las obras de captación de efluentes resultan fundamentales para poder conducir y almacenar los contaminantes con un criterio de cuidado ambiental a favor de la prevención de episodios de contaminación. Son imprescindibles nuevas investigaciones en el área de diagnóstico del estado de los recursos bajo condiciones de producción en feedlots para distintas zonas geográficas. La profundización de los estudios realizados es indispensable para poder definir valores guía de calidad ambiental adaptados al modo de producción y condiciones de los recursos naturales en Argentina.

Mahler, Evelina Bárbara. "Rol de las proteínas ribosomales P de Trypanosoma cruzi en lasgeneración de anticuerpos con autorreactividad funcional en la cardiomiopatía crónica chagásica" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La cardiomiopatía crónica chagásica (CCCh) se caracteriza por su compleja sintomatología arritmogénica presentando diversos disturbios que incluyen arritmias ventriculares y disfunción de nódulo sinusal, cuya progresión puede llevar a la muerte súbita. Pese a que la CCCh es la resultante de un complejo número de factores, nuestro grupo ha demostrado que los anticuerpos que se generan contra las proteínas ribosomales P de T.cruzi en los pacientes podrían ejercer efectos patogénicos “no deseados” por reacción cruzada sobre el tejido cardíaco (estimulando los receptores β1-A y M2-Ch). En este trabajo demostramos la prevalencia de anticuerpos que reconocen receptores cardiovasculares en la CCCh y su correlación con la sintomatología arritmogénica de los pacientes. Investigamos el rol que desempeña la región C-terminal de la proteína ribosomal TcP2β,el péptido R13, en la generación de los anticuerpos que reaccionan en forma cruzada por un tanto con los receptores β1-A como con los receptores M2-Ch por un mecanismo de mimetismo molecular. Se demostró que los anticuerpos anti-R13 ejercen un efecto sobre la contractilidad de cardiomiocitos y sobre la cascada de señalización asociada a los receptores acoplados a proteína G. El estudio fino de los anticuerpos anti-R13 de diversos pacientes con CCCh y la caracterización de un anticuerpo monoclonal anti-R13 demostraron la heterogeneidad entre estos anticuerpos que fueron generados por un mismo antígeno pero con especificidad diferencial hacia los receptores cardíacos. El estudio de la especificidad de estos anticuerpos explicaría elementos de la compleja sintomatología en la CCCh. Finalmente, se construyó una biblioteca combinatorial de anticuerpos a partir de médula ósea de un paciente con CCCh y se identificaron anticuerpos recombinantes humanos anti-R13 que reproducen algunas de las características de los anticuerpos policlonales y el anticuerpo monoclonal. Esta biblioteca constituye una herramienta importante para comprender más profundamente los mecanismos moleculares implicados en la generación de anticuerpos con efectos cardíacos patogénicos y podrían permitir el diseño de estrategias terapéuticas para mejorar la calidad de vida del paciente con CCCh.

Abstract:
Chronic Chagas' Heart Disease (cChHD) is characterized by a complex arrhythmogenic symptomatology, displaying various dísturbances including ventricular arrhythmias and sinus node dysfunction, leading in many cases to sudden death. Even if the pathogenesis of cChHD is the result of a multiple símultneaous events, our group demonstrated that cross-reactive antibodies raised against T.cruzi ribosomal P proteins could exert pathogenic effects on heart membranes (stimulating β1-adrenergic and M2-cholínergic receptors). In this work, we investigated the prevalence of antibodies that stimulate G protein coupled receptors (GPCR) and their clinical correlation with electrical disorders amongst patients with cChHD. We further investigated the role of the C-terminal region of TcP2β, peptide R13, in raising antibodies that cross react with both β1-adrenergic and M2-cholinergic receptors by a mechanism of molecular mimicry. The ability of anti-R13 antibodies to exert various effects on the contractility and signal transduction associated with GPCR in cardiomyocytes was demonstrated. The detailed studies on anti-R13 antibodies purified from different cChHD patients and the characterization of an anti-R13 monoclonal antibody provided further insight on the heterogeneous features of these antibodies that are generated against a common antigen but display differential specificity on cardiac receptors. The study of the fine specificity of anti-R13 antibodies allowed us to understand part of the complex symptomatology of cChHD. Finally, a combinatorial antibody library, made from bone marrow of a cChHD donor, was constructed. Anti-R13 recombinant human Fab fragments were identified and their properties compared to the observed features in the policlonal response and the murine monoclonal antibody. This library represents an important tool to gain further insight into the molecular mechanisms underlying the generation of cross-reactive antibodies with pathogenic effects on the human heart in cChHD and could provide some elements to design new therapeutic strategies.

Lutzky, Viviana Paula. "PECAM-1/CD31 en células tumorales : Un nuevo blanco para la terapia antiotumoral?" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las moléculas de adhesión han sido implicadas en la metástasis y la progresión tumoral. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la expresión y el rol de las moléculas de adhesión, en particular PECAM-l/CD31 en las células tumorales humanas. PECAM-l/CD31 es una glicoproteína de 130kDa perteneciente a la superfamilia de Inmunoglobulinas. Se encuentra presente en células endoteliales, plaquetas y en la mayoría de los leucocitos. Sin embargo, en este trabajo se demostró, por inmunofluorescencia y Western blot, la presencia de la molécula en líneas de células de melanoma y de adenocarcinoma. La expresión cuantitativa y cualitativa de PECAM-l/CD31 sobre las células tumorales es diferente a la de los leucocitos y células endoteliales, ya que en las células tumorales la expresión es menor, y además, los anticuerpos monoclonales dirigidos contra los dominios-2 y —6 no reaccionan con la molécula. La expresión de PECAM-l/CD31 sobre la superficie de las células tumorales fue modulada por interacciones célula-célula, siendo mayor en las células provenientes de cultivos sub-confluentes y en las células desprendidas espontáneamente de monocapas de células tumorales confluentes. La fijación y la permeabilización de las células tumorales reveló la presencia de reservorios intracelulares de PECAM-l/CD31. Por otro lado, la expresión de PECAM-l/CD31 aumentó y disminuyó en presencia de citocalasina B y brefeldina A, respectivamente. Las células de melanoma se adhirieron a células endoteliales y a proteínas de matriz extracelular. En el primer caso, la adhesión fue parcialmente mediada por PECAM-l/CD31, ya que la transfección de las células de melanoma con un oligonucleótido antisentido para PECAM-l/CD31, disminuyó la expresión de esta molécula y su adhesión. Lo mismo sucedió al tratar las células tumorales con anticuerpos dirigidos contra los dominios-1, —3 y —4/—5. En cambio la adhesión a las distintas proteínas de matriz extracelular fue mediada por las integrinas α1 (para colágeno IV); α3 (para matrigel, laminina, colágeno IV y colágeno I); α4 y α5 (para fibronectina); α6 (para matrigel) y β1 (para matrigel, colágeno IV, colágeno I y fibronectina). Finalmente, la coligación de PECAM-l/CD31 con anticuerpos dirigidos contra el dominio 3 en las células de melanoma y adenocarcinoma, tiene un efecto inhibitorio sobre la proliferación celular. Los resultados obtenidos en el presente trabajo, indican que existe un reservorio intracelular de PECAM-l/CD31 en células tumorales que probablemente module la expresión de CD31 en la superficie celular. Además sugieren un rol de esta molécula en el crecimiento tumoral y en la metástasis.

Abstract:
Tumor progression and metastasis have been related to the adhesion molecules expression. The aim of the present study was to examine the expression and the role of adhesion molecules on tumor cells, in particular PECAM-l/CD31. PECAM-l/CD31 is a 130-kDa member of the Immunoglobulin gene superfamily that is highly expressed on endothelial cells, platelets and most leukocytes. However, herein it is demonstrated by Western Blot and immunofluorescence that some melanoma cells and adenocarcinoma cells express PECAM-l/CD31 on the cell surface. The expression of PECAM-l/CD31 on tumor cells seems to be different from normal cells, since the expression was low compared to endothelial cells and leukocytes, and based on the absence of reactivity of monoclonal antibodies directed to domains 2 and 6. Furthermore, the tumor cells surface expression of PECAM-l/CD31 can be regulated by cell-cell contact, being higher on sparse and spontaneously detached cells. Fixing and permeabilizing tumor cells revealed a cytoplasmic pool of the molecule. Indeed, cell surface CD31 was internalized following mAb binding and the expression was enhanced and decreased by cytochalasin B and brefeldin A, respectively. Melanoma cells were able to adhere to endothelial cells and to extracellular matrix proteins, using different adhesion molecules. The interaction of melanoma cells with endothelial cells was partially mediated by PECAM-l, since decreasing the expression of CD31 on tumor cells by CD31-specific antisense oligonucleotide or by treatment with mAbs to domains -1, -3, -4/—5 decreased the adhesion to endothelium. Melanoma cells adhesion to ECM proteins was mediated by α1 (for collagen type IV); α3 (for matrigel, laminin, collagen type IV and collagen type I); α4 and α5 (for fibronectin); α6 (for matrigel) and β1 (for matrigel, collagen type IV, collagen type I and fibronectin). Furthermore, ligation of CD31 via domain —3 but not β1 integrin inhibited proliferation of melanoma and adenocarcinoma cells. Overall, these results indicate that there is an intracellular pool of CD31 on tumor cells which might modulate CD31 surface expression and its role in cancer cell growth and metastasis.

López Fuentes, Marcelo. "Regiones activas solares : origen y evolución" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Estudiamos la evolución de regiones activas solares (RA) para inferir las propiedades de los tubos de flujo que las originan y analizar la relevancia que los movimientos del plasma, tanto en la zona convectiva como en la fotósfera, tienen sobre su evolución. Analizamos RA cuyas polaridades principales rotan una alrededor de la otra a lo largo de varias rotaciones solares, e interpretamos este comportamiento peculiar como la emergencia de tubos de flujo magnético deformados. A partir de las propiedades de las RA discutimos cuáles podrían ser los mecanismos causantes de la deformación y, luego de descartar a la inestabilidad de kink y la acción de la fuerza de Coriolis, concluímos que el más probable es la interacción de los tubos de flujo con el plasma en la zona convectiva. A continuación analizamos la inyección de helicidad magnética en configuraciones magnéticas sintéticas y en una RA observada. Comparamos esta inyección con la helicidad coronal calculada a partir de modelos del campo libre de fuerzas lineal y con la helicidad expulsada por las eyecciones coronales de masa (ECM) originadas en la RA. Nuestros resultados muestran que la helicidad inyectada por movimientos fotosféricos de pequeña escala y por rotación diferencial no alcanzan para explicar, ni el contenido de helicidad coronal de la RA, ni la cantidad eyectada por las ECM. Por lo tanto, la principal fuente de helicidad en la corona es la torsión inherente al tubo de flujo que forma la RA.

Abstract:
We study the evolution of solar active regions (ARs) to infer the properties of the flux tubes forming them and to analyze the role that convective and photosferic plasma motions may have in their evolution. We study a set of ARs in which the main polarities are observed to rotate one around the other along several solar rotations. We interpret this peculiar evolution as due to the emergence of distorted magnetic flux tubes. From the observed ARs properties we discuss the possible mechanisms at the origin of the deformation and, after discarding the kink instability and the Coriolis force, we conclude that the most likely mechanism is the interaction of the flux tubes with the convective zone plasma. Next, we analyze the magnetic helicity injection on synthetic magnetic configurations and in an observed AR. We compare this injection to the coronal helicity computed using a linear force free field approximation and to the helicity ejected by coronal mass ejections (CMEs) inferred from magnetic clouds observations. Our results show that the helicity injected by photospheric shearing motions and by the differential rotation are not enough to explain, neither the content of coronal helicity nor the amount of helicity ejected by CMES. Therefore, the main source of coronal magnetic helicity is the twist inherent to the flux tube forming the AR.

López, Claudia S.. "Caracterización físico-química de la membrana de Bacillus subtilis frente al estrés osmótico : relevancia de los fosfolípidos aniónicos en la osmorrespuesta" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La respuesta de las bacterias al estrés osmótico es actualmente de gran interés debido a los aspectos importantes de su aplicación. La mayoría de los estudios realizados en procariotas se han focalizado sobre la regulación genética y sobre aspectos fisiológicos de la adaptación a la alta osmolaridad. El comportamiento de las envolturas no ha sido prácticamente estudiado, sin embargo, existen diversas evidencias que sugieren que la composición de las envolturas celulares posee un rol importante durante el mecanismo de osmosensado. El objetivo de este trabajo fire el de estudiar el efecto del estrés osmótico sobre la estructura y composición bioquímica y biofisica de las membranas de Bacillus subtilis YB886 utilizando diferentes enfoques como la bioquímica, espectroscopía de fluorescencia y biología molecular. En esta tesis demostramos que se producen importantes variaciones en la composición de lípidos polares y de ácidos grasos (AG) durante la adaptación de B. subtilis. Entre los principales fosfolípidos presentes en la membrana de esta especie, se observó que cuando la bacteria es crecida en medios hipersalinos se produce una disminución en el contenido de fosfatidilglicerol de 40 a 31% y un aumento en el de cardiolipina de 24 a 46%. Además de las variaciones observadas a nivel del grupo polar de los lípidos, se determinó un cambio significativo en la composición de AG entre las diferentes condiciones de cultivo. Las células crecidas en el medio hipersalino presentan una marcada disminución en el contenido de AG saturados ramificados y un aumento en el de los saturados lineales. Asimismo, se observó un aumento en el contenido de los AG monoinsaturados, los cuales representan un 6% bajo condiciones normales de crecimiento y alcanzan un 18% en estrés osmótico. Con el objetivo de caracterizar la estructura y dinámica de la membrana, se utilizaron diferentes técnicas espectroscópicas. Se determinó que en respuesta al estrés osmótico se produce un aumento en el empaquetamiento de los lípidos de las membranas, hecho que fue evidenciado por medio de las tres sondas fluorescentes utilizadas. No obstante, esta variación no se observó en los liposomas preparados con los lípidos extraídos a partir de las células, indicando que el aumento en el empaquetamiento de los lípidos depende de la presencia de las proteínas de membrana. En este trabajo también se determinó que en las membranas de B. subtilis otras propiedades fisicas de la membrana, como la hidratación de la interfaz, cambia en fimción de la osmolaridad del medio exterior. Además, se construyeron diversas cepas mutantes para la biosíntesis de fosfolípidos. Los resultados obtenidos demostraron la importancia de los lípidos aniónicos (cardiolipina y fosfatidilglicerol específicamente) en la adaptación al estrés osmótico en esta especie. Nuestros resultados indican que la interrupción del gen cls2 provoca una deficiencia total en la síntesis de cardiolipina, sugieriendo que el producto del gen cls2 es la principal cardiolipina síntasa en esta especie. En esta tesis se demostró por primera vez los cambios biofisícos y bioquímicos que se producen en la membrana de B. subtilis en respuesta al estrés osmótico. Estos cambios serian indispensables para contrarrestar el desbalance osmótico presente entre las células y el medio externo.

Abstract:
Bacterial response to osmotic stress is of current and increasing interest due to the important aspects of its applications. Most of the studies on prokaryotes have centered on genetic regulation and physiological aspects of their adaptation to high osmolarity. The behavior of the envelopes has been practically unexplored; nevertheless, several evidences suggest that the cell envelope composition plays an important role during the osmosensing mechanism. The aim of the present work was to study the effect of osmotic stress on the biochemical and biophysical parameters of structure and composition of the Bacillus subtilis YB886 membrane using different approaches such as biochemistry, fluorescence spectroscopy and molecular biology. In this thesis we demonstrated that there are important variations in membrane polar lipid composition and fatty acids (FA) during osmoadaptation in B. subtilis. Among the major phospholipids present in the B. subtilis membrane, a decrease in phosphatidylglycerol content from 40 to 31%, and an increase in cardiolipin content from 24 to 46% were observed when the bacteria were grown in hypsaline medium. In addition to the variations observed at the polar group level, the FA composition, in particular, showed a significant change between different growth conditions. Bacterial growth in hypertonic medium resulted in a remarkable decrease in the branched-chain saturated FA content, and an increase in straight-chain saturated FA. There was also a significant increase of unsaturated FA, which represented 6% in normal conditions and reached 18% during osmotic stress. In order to characterize membrane structure and dynamics, different spectroscopic techniques were used. Bacteria growth in hyperosmotic media evoked an increase in the lipid packing in isolated whole membranes, fact that was evidenced by the three fluorescent probes used. However, this effect was not observed in liposomes prepared with the extracted bacterial lipids indicating that it was strongly dependent on the presence of membrane proteins. In this work we also indicate that in B. subtilis membranes, other physical properties as interface hydration change as a function of the external medium osmolarity. In addition, several mutants for phospholipids biosynthesis were constructed. We demonstrated the importance of anionic lipids (cardiolipin and phosphatidylglyerol specifically) for the adaptation of this specie to osmotic stress. Our results indicated that the interruption in gene cls2 resulted in a complete deficiency in cardiolipin synthesis, suggesting that B. subtilis cls2 gene product to be the major cardiolipin synthase. In our knowledge this is the first report about the biophysical and biochemical adaptation of the B. subtilis membranes to osmotic stress. These changes would be indispensable to counteract the osmotic imbalance between the cells and the external medium.

Loray, María Alicia. "Estudio y mejoramiento genético de levaduras osmotolerantes" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Entre las levaduras existen especies osmotolerantes como D. hansenii, T. delbrueckii, S. octosporus, y especies consideradas no osmotolerantes como, por ejemplo, S. cerevisiae. Algtmas levaduras osmotolerantes son utilizadas en la producción de determinados productos alimenticios mientras otras se encuentran como organismos contaminantes en varios alimentos. Sin embargo, Saccharomyces cerevisiae es la levadura empleada tradicionalmente en la industria para la producción de diversos productos. Algunos de estos bioprocesos se desarrollan en medios con alta presión osmótica y esto limita su rendimiento en los procesos mencionados. Se realizaron diversas fusiones de protoplastos entre levaduras osmotolerantes y diferentes cepas industriales de S. cerevisiae con el objeto de obtener híbridos que reúnan características de interés industrial de ambos parentales, para luego caracterizarlos principalmente en cuanto a su comportamiento en medios hiperosmóticos. Las fusiones de protoplastos realizadas entre las levaduras S. cerevisiae P-158 y Torulaspora delbrueckii CBS-813 y entre S. cerevisiae UCD-522 y Debaryomyces hansenii NRRL Y-7393, dieron como resultado productos de fusión estables que adquirieron el carácter osmotolerante. Estos productos de fusión y las cepas parentales fueron estudiados con respecto a su tolerancia osmótica y a otros aspectos fisiológicos como: morfología, asimilación y fermentación de azúcares, patrones electroforéticos de cromosomas y proteínas, cinética de crecimiento en medios de diferente osmolaridad, producción de polihidroxialcoholes y mecanismos de transporte de monosacáridos a través de la membrana plasmática. Al estudiar el efecto que tienen elevadas concentraciones de NaCl sobre el funcionamiento celular y el desarrollo del cultivo se observó: disminución de la μmax de crecimiento; disminución del rendimiento en la producción de biomasa; aumento de la síntesis y de la retención intracelular de polioles; alteración del potencial de membrana (Δψ)de las células; alteración del transporte de monosacáridos; disminución de la velocidad de consumo específico de oxígeno en presencia de glucosa; alteración de los patrones electroforéticos de proteínas totales y de membrana plasmática.

Abstract:
The most useful yeast for the industry is still being Saccharomyces cerevisiae, however this specie is not osmotolerant, and because some particular industrial processes are carried out on high osmotic environment, the yields of those processes are not as high as desired. There are some osmotolerant yeast species like Debaryomyces hansenii, Torulaspora delbrueckii, Schizosaccharomyces octosporus. Some of them are used on food manufacturing industry, but also are found as contaminant on other processes. The aim of this work was to develop yeast strains capable to being used as S. cerevisiae but also with the osmotolerant characteristic. We have carried out protoplast fusion between different industrial strains of S. cerevisiae and osmotolerant yeasts and we studied and characterized the obtained hybrids. The fusion between S. cerevisiae P-158 and T. delbruecki CBS-813, and between S. cerevisiae UCD-522 and D. hansenii NRRL Y-7393, yielded stabled hybrids which showed the desired characteristics of the parental strains. The fusion products as wells as their parental strains were studied in order to characterize their physiological behavior in high osmotic environments and also in general aspects as morphology, sugar assimilation and fermentation, proteins and chromosomal electrophoretical profiles, growth kinetics, polyhidroxyalcohols production and monosaccharides membrane transport mechanism. Studying the impact of high NaCl concentrations to the cell physiology, we observed that the maximum specific growth rate and the biomass yields decreased; the synthesis and accumulation of intracellular poliols increased; a membrane potential were modified; the monossaccharides transport were altered; the specific comsuption oxygen rate in media contained glucose decreased and that the electrophoretical profiles of total and plasmatic membranes proteins were modified.

Lomovasky, Betina Judith. "Dinámica poblacional y variaciones energéticas en la almeja rayada Eurhomalea exalbida de la Bahía Ushuaia, Canal Beagle" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Con el objeto de caracterizar aspectos fisiológicos y ecológicos de la almeja dura Eurhomalea exalbida de la Bahía Ushuaia (Canal Beagle), se estudiaron la edad individual, el crecimiento, la mortalidad, la producción y las características bioenergéticas y reproductivas de la población. El patrón de bandas internas de crecimiento, confirmado por un experimento anual de marca-recaptura y por los perfiles de isótopos de δ18O de las valvas indicaron la formación de una banda translúcida y una opaca cada año, correspondientes a periodos de crecimiento lento y rápido respectivamente. Se ha demostrado una fuerte estacionalidad en el crecimiento, con diferencias entre las tasas de crecimiento de juveniles y adultos a través de las estaciones del año y en la estación de crecimiento. Esto sugiere que este es influido no solamente por la temperatura, sino también por las diferencias en la partición de los recursos energéticos relacionada con la actividad gametogénica de los adultos. Los parámetros de la función de crecimiento de von Bertalanffy fueron estimados como Alto∞ = 73,98 mm, K = 0,180 año-1 , t0 = 0,147 año, alcanzando una edad máxima de 70 años. Los 56 años de incrementos anuales relativos medios analizados registraron la existencia de fuertes fluctuaciones a largo término en el crecimiento valvar. Estas variaciones han provocado que las almejas longevas, mayores a los 30 años de edad, tengan una morfología notoriamente distinta a la de las almejas más jóvenes, encontrándose animales de una misma talla que registraron edades muydistintas. Se analizó la utilización de un marcador fisiológico, como el pigmento lipofucsina, para la determinación de la edad en la almeja E. exalbida. Se encontró una relación exponencial positiva entre % de área fracción de lipofucsina en el tejido conectivo que rodea el intestino y la edad, siendo este estudio el primero en mostrar una relación entre la edad y la concentración de lipofucsina morfológica en un bivalvo. La producción individual máxima alcanzó los 2,742 g masa húmeda sin valvas (MHSV)a los 49,5 mm de alto valvar. Los individuos de 40 mm a 70 mm de alto valvar fueron los que contribuyeron en mayor medida a la producción somática (P) de toda la población que alcanzó los 133,89 g MHSV m -2 año-1. La biomasa media anual (B) alcanzó valores de 1122,69 g MHSV m-2 año-1. La relación PIB anual y la tasa de mortalidad Z fueron estimadas en 0,119 año-1 y 0,141 año-1, respectivamente. El análisis del ciclo reproductivo mostró un pico de desove en Noviembre, encontrándose gónadas maduras durante el resto del año. La primera madurez es alcanzada a los 4 años de edad. La variación detectada en el contenido energético y en el Índice relativo de condición para el conjunto Gónada-Digestivo-Pie durante el periodo experimental fue relacionada con el estado reproductivo de los individuos. En tanto la escasa variación en el contenido energético e indice relativo de condición del conjunto de músculos adductores y de Branquia-Manto-Sifón a través del año indicarla la falta de transferencia energética entre órganos y la ausencia de un reservorio energético. De este modo se desprende que la energia necesaria para los diferentes procesos metabólicos seria extraída directamente de los alimentos ingeridos. El crecimiento lento, la alta edad individual y la baja tasa de renovación hacen a esta población de E. exalbida poco adecuada para una explotación comercial sustentable.

Abstract:
In order to describe physiological and ecological aspects of the “hard clam" Eurhomalea exalbida in Ushuaia Bay (Beagle Channel), individual age, growth, mortality. production. bioenergetic and reproductive characteristics of the population were studied. The pattern of internal growth-bands, confirmed by a year-long “mark-recapture" experiment and by the δ18O isotope profiles of the shells, presents the formation of one translucent and one opaque band every year, corresponding to periods of low and high growth-rates respectively. A strong pattern of seasonal growth was observed, with differences between juvenile and adult growth-rates throughout the year and in the growth period. This suggests that the growth is influenced not only by temperature but also by differences in the distribution of energetics resources related to the gametogenic activities of adults. The parameters for the von Bertalanffy growth function were estimated as High∞ =73.98 mm, K = 0.180 year-1 , t0 = 0.147 year, reaching a maximum age of 70 years. The 56 years of mean relative annual growth increments analyzed showed the existence of strong fluctuations in long-term shell growth. As a result of these variations, clams older than 30 years of age have a notably different morphology from the younger clams. Thus animals of the same size but of very different ages were found. The use of a physiological marker such as the pigment “lipofuscin" was analyzed as a method for age-determination in E. exalbida. A positive exponential relationship was found between age and the % of “fraction-area of lipofuscin" in the connective tissue surrounding the intestine. This study is the first to show a relationship between age and the concentration of “morphological lipofuscin"in a bivalve. Maximum individual production reached 2.742 g shell-free wet mass (SFWM) at 49.5 mm of shell height. Individuals between 40 and 70 mm shell height contributed most to somatic production (P) in the population, reaching 133.89 g SFWM m-2 year-1. Mean annual biomass (B) reached values of 1122.69 g SFWM m-2 year-1. The annual ratio (PIB) and the mortality rate (Z) were estimated at 0.119 year-1 and 0.141 year-1 respectively. Analysis of the reproductive cycle showed a spawning peak in November, with mature gonads during the rest of the year. First maturity is reached at the age of 4. The variation detected in the energetics content and in the relative condition index for the Gonad-Digestive-Foot group during the experimental period was related to the reproductive stage of the individuals, while the low variation in the energetics content and relative condition index in the adductor muscle and the Gills-Mantle-Siphons groups throughout the year indicates the lack of energetics transfer between organs and the absence of an energetics reservoir. Hence, that the energy needed for different metabolic processes is extracted directly from the ingested nutrients. The slow growth rate, the longevity of individuals and the low rate of renovation make this population of E. exalbida poorly suited to sustainable commercial exploitation.

Libertum, Ariel R.. "Generación, caracterización y aplicaciones de pulsos láser ultracortos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se presenta el diseño y construcción de un láser de Titanio-Zafiro de pulsos ultracortos, sus sistemas de monitoreo y se explican los efectos principales que contribuyen a su funcionamiento pulsado. El láser construido emite pulsos de 50 a 100 fs de duración a una frecuencia de repetición de 90 MHz, con un ancho espectral de entre 20 y 50 nm centrado alrededor de los 800 nm y con una potencia media de 400 mW aproximadamente. Se describe una cavidad láser del Ti:Za modificada que emite pulsos cinco veces más energéticos que la cavidad convencional y a una frecuencia de repetición cinco veces más baja. También se presenta un diseño de un amplificador multipasaje tipo corbata de moño girada para la amplificación de los pulsos de láser de Ti:Za, y se analiza su desempeño a partir de un modelo teórico simple. Se expone el montaje experimental del mismo y se presentan las pruebas realizadas. Asimismo, se detalla la construcción y características de un láser construido para bombear la etapa amplificadora. El mismo consiste en un Nd:YAG, pulsado por la técnica de modulación de perdidas, doblado intracavidad que emite pulsos de 25 ns de duración a 4 kHz y con una potencia media de 160mW a 532 nm. Se explica un método para introducir variaciones rápidas de camino óptico y un sistema óptico para monitorearlo. Como resultado de la implementación experimental, se muestra la generación de retardos del orden de los 100 ps a una frecuencia de 10 Hz. Finalmente se presenta una nueva técnica para la caracterización de pulsos ultracortos en fase y amplitud. La técnica, denominada DGDOM, mide en forma directa el retardo de grupo de las componentes de frecuencia de un pulso ultracorto. DGDOM es demostrado a partir de un desarrollo teórico, es probado a partir de simulaciones numéricas y validado en forma experimental.

Abstract:
The design and construction details of an ultrashort pulse Titanium-Sapphire laser with its monitoring systems is presented and the main effects contributing to its pulsed behavior are described. The built laser emits pulses 50 to 100 fs in duration at a repetition rate of 90 MHz, with a bandwidth of 20 to 50 nm centered around 800 nm and an average output power of 400 mW approximately. A modified Ti:sapphire laser cavity that emits pulses five times as energetic as the standard cavity, at a repetition rate five times lower, is described. A design of the twisted bow tie multipass amplifier for amplifying Ti:sapphire pulses is presented and its performance is analyzed with a simple theoretical model. Its experimental set-up is showed and test results are presented. The construction and characteristics of the laser built for pumping the amplifying stage it is also detailed. The laser is a Q-Switched Nd:YAG intracavity-doubled that emits 25 ns long pulses at 4 kHz and with an average output power of 160mW at 532 nm. A method to produce rapid changes in optical path lengths and a system to monitor it are explained. As a result of experimental implementation, 100 ps of optical delays at a repetition rate of 10 Hz is shown. Finally, a new technique for ultrashort pulse characterization in phase and amplitude is presented. The technique, called DGDOM, directly measures the group delay of the frequency components of an ultrashort pulse. DGDOM is theoretically demonstrated, proved with numerical simulations and experimentally validated.

Lechner, Bernardo E.. "Estudio de la biodiversidad, fisiología y cultivo de las especies silvestres del género Pleurotus (Basidiomycetes, Agaricales) en la República Argentina" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo se estudió el género Pleurotus (Fr.) P. Kumm. en la República Argentina. Para conocer su biodiversidad, se analizaron los caracteres macro- y micromorfológicos de colecciones obtenidas a campo y de distintos herbarios nacionales (BAFC, LPS, LIL). Se utilizaron los cruzamientos intra- e interespecíficos entre cultivos monospóricos, obtenidos a partir de las fructificaciones de los aislamientos depositados en el cepario BAFC y de basidiocarpos coleccionados, como herramienta para la correcta delimitación de especies. Se concluyó que en la Argentina hay, hasta el momento, 6 especies, una de ellas representada por tres variedades: P. albidus, P. cystidiosus, P. djamor var. djamor, P. djamor var. cyathiformis, P. djamor var. roseus, P. ostreatus, P. pulmonarius y P. rickii. Se estudió la temperatura y el medio de cultivo óptimo de 28 cepas del género. Se caracterizaron los cultivos en medio sólido mediante la reacción enzimática con ácido gálico, ác. tánico, tirosina, p-cresol y guayacol, así como la degradación de Poly R-478 y Azure B. Se hizo el estudio de cultivo con base en la metodología propuesta por Nobles y en otros medios como agar papa glucosado, agar grano y medio sintético completo. Se utilizaron las técnicas de cultivo para la obtención de basidiocarpos con tres aplicaciones: 1) permitir que las fructificaciones pudieran ser estudiadas macro y micromorfológicamente en estado fresco; 2) obtener de ellas la esporada necesaria para lograr cultivos monospóricos y 3) analizar la capacidad productiva. Se ensayaron especies nativas en distintos sustratos artificiales con el fin de verificar su potencial productivo, encontrando diferencias entre las distintas cepas y sustratos ensayados.

Abstract:
To learn about the biodiversity of the genus Pleurotus (Fr.) P. Kumm. in Argentina, macro- and micromorfological characters of collections obtained in the field and from different national herbaria (BAFC, LPS, LIL)were analysed. Intra- and interspecific pairings between monosporic cultures, obtained from the fruit bodies of strains deposited in the BAFC culture collection and of collected fruit bodies were used as tool for the correct delimitation of species. We concluded that in Argentina there are, so far, 6 species. one of them represented by three varieties: P. albidus, P. cystidiosus, P. djamor var. djamor, P. djamor var. cyathifonnis, P. djamor var. roseus, P. ostreatus, P. pulmonarius and P. rickii. Optimum temperature and culture media of 28 strains of the genus were studied. Solid cultures were characterized by the enzymatic reaction with gallic and tannic acid. tyrosine, p-cresol and guaiacol, as well as the degradation of Poly R-478 and Azure B.Cultural study was based on Nobles’ protocol as well as on media such as potato glucose agar, grain agar and synthetic complete agar. Cultivation techniques used for obtaining basidiomata had three applications: 1) allowing macro- and micromorphological study of fresh developing fruitbodies, 2) to obtain spore prints and 3) to learn about their productive capacity. Native species were tested on different artificial substrates with the purpose of verifying their productive potential, and differences between the different strains and substrates were found.

Larotonda, Miguel Antonio. "Láser de ND:YAG con Mode-Locking por lente de Kerr bombeado por diodos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En los últimos años se han hecho progresos significativos en el estudio y desarrollo de láseres de estado sólido. La mayoría de los avances se basan en el desarrollo de nuevos materiales láser, fuentes de excitación óptica más eficientes y más potentes, y nuevos conceptos en geometría de cristales y diseños de láseres. El presente trabajo está dirigido al diseño, análisis y caracterización de sistemas láser de estado totalmente sólido con Mode-Locking pasivo por efecto Kerr (KLM). Se entiende por un sistema de estado totalmente sólido a un láser de estado sólido excitado por medio de un láser semiconductor o diodo láser. Tales sistemas combinan la robustez y practicidad de los materiales en estado sólido como medios activos con las ventajas de los láseres semiconductores con fuentes de bombeo frente a otros sistemas tradicionales (precio, potencia disponible, diseño compacto). En particular, en esta Tesis se estudia un láser de Nd:YAG como fuente de pulsos de picosegundos y se obtiene por primera vez KLM en láser de Nd:YAG bombeado por diodos. Se establecen las pautas para el diseño de la cavidad del láser pulsado, al maximizar los efectos no lineales que producen los pulsos. Asimismo, se plantea y discute un modelo simple que reproduce las características principales del sistema, teniendo en cuenta sólo la potencia y duración de los pulsos como variables. También se estudian regímenes de funcionamiento anómalo de varios pulsos por tránsito, y el fenómeno de auto-modulación de amplitud como generador de los mismos. Finalmente, se desarrolla una forma de cuantificar el efecto de modulación de amplitud no lineal, de manera de poder incluir este efecto en diseños o estudios de cavidades para láser KLM. De esta forma, se agregan herramientas para el estudio y diseño de láseres de ancho de banda angosto.

Abstract:
In recent years, significant progress has been achieved on the study and development of all-solid-state lasers. Most of this improvement is based on the development of new laser materials (new concepts in crystal geometry), optical pumping sources with improved efficiency and power, and new concepts on laser cavity design. This work is devoted to the design, study and characterization of Kerr-Lens mode locking (KLM) in all-solid-state laser systems. For all-solid-state system is intended a diode-pumped solid state (ion) laser. Such systems combine the robustness and practical features of solid state materials as active media with the advantages of semiconductor laser pumping, compared with traditional pumping systems (price, available power, compact design). In particular, in this Thesis, a Nd:YAG laser as a picosecond pulse source is studied and KLM is obtained for the first time in diode-pumped Nd:YAG laser. A specific outline for the pulsed laser cavity design is established, maximizing the non-linear effects that generate the pulses. Also, a simple model that reproduces the main features of the system is stated and discussed. Anomalous regimes of many pulses per round-trip, and the self-amplitude modulation phenomenon as its generator are studied as well. Finally, in order to be able to include this effect in designing or studying KLM laser cavities, a way of quantifying this non-linear amplitude modulation effect is developed. In this manner, we improve the ability of understanding narrow bandwidth pulsed laser systems.

Lanés, Silvia. "Paleoambientes y paleogeografía de la primera transgresión en cuenca Neuquina, sur de Mendoza" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo principal de este trabajo fue la determinación de los rasgos paleogeográficos de la transgresión del Triásico Tardío-Jurásico Temprano en el sector mendocino de la cuenca Neuquina (valle superior del Atuel y valle de Las Leñas). Para esto se realizó un análisis de litofacies y tafofacies, se determinaron los paleoambientes sedimentarios, su evolución y distribución areal, poniendo especial atención en la correlación bioestratigráfica de los perfiles sobre la base de amonites, bivalvos y braquiópodos. El rasgo notable del intervalo marino estudiado son las grandes variaciones litofaciales y de edad en trechos cortos, observándose que su base se vuelve más antigua hacia el oeste, variando desde Pliensbachiano inferior hasta Hettangiano medio. También hacia el oeste aumenta la participación de areniscas finas y pelitas marinas y disminuye la potencia de los conglomerados fluviales subyacentes. Para corroborar si tales cambios respondieron al control de un paleorrelieve de bloques, se levantaron perfiles segun dos transectas perpendiculares entre sí (una este-oeste y otra norte-sur) para luego correlacionarlos bioestratigráficamente. Posteriormente se correlacionaron las sucesiones pliensbachianas del valle superior del río Atuel y del valle de Las Leñas para verificar la influencia de un bloque de basamento (Alto Dedos-Silla, Legarreta y Kozlowsky 1984). La hipótesis a comprobar fue que la primera transgresión de la cuenca Neuquina se inició en el Triásico Tardío con la implantación de un ambiente mixto sobre un paleorrelieve de hemigrábenes y bloques elevados que controló la sedimentación hasta el Pliensbachiano. Justamente la distribución areal de los sistemas deposicionales y su antigüedad permitió establecer dos zonas en el valle del río Atuel: una al este y otra al oeste del arroyo El Freno. Las sucesiones de la zona occidental (Perfiles Arroyo Alumbre, Arroyo Malo y El Pedrero) registran la somerización de abanicos deltaicos de talud controlados tectónicamente por fallas normales ubicadas en los arroyos Alumbre y El Freno, y de abanicos deltaicos transicionales entre los de plataforma y los de tipo Gilbert, ambos transversales al hemigraben principal. Los perfiles de la zona oriental (Perfiles Puesto Araya, Las Chilcas, de los Caballos y Codo del Blanco) registran la profundización de una plataforma dominada por tormentas, desde estuarios dominados por oleaje hasta áreas de plataforma externa influída por corrientes de turbidez. La plataforma marina inclinaba hacia el oeste y norte desde una paleocosta de rumbo NO-SE hasta NE-SO aproximadamente. En este contexto, la condensación del Jurásico inferior marino en el valle de Las Leñas confirma la influencia del Alto Dedos-Silla. Los rasgos de los sistemas deposicionales y su antigüedad permitieron identificar dos etapas de diferente comportamiento tectónico. La primera, durante el Rhaetiano-Sinemuriano Temprano Tardío, se caracterizó por una acomodación mayor al aporte, que quedó registrada en los abanicos deltaicos de talud de la zona occidental. La segunda etapa, durante el Sinemuriano Temprano Tardío-Toarciano Temprano, se caracterizó por una acomodación menor al aporte, que controló parte de la sedimentación de los abanicos deltaicos intermedios entre los de plataforma y los de tipo Gilbert y la depositación de los estuarios y la plataforma marina. La relación de acomodación vs. aporte permite caracterizar estas dos etapas como una fase de sinrift y una fase de sag respectivamente. Sobre la base de rasgos de superficie y de las variaciones de los sistemas deposicionales se reconocieron secuencias deposicionales de dos escalas diferentes, estimándose la duración de las mismas cuando fue posible. A gran escala las sucesiones de abanicos deltaicos representan el cortejo de mar bajo (reconociéndose depósitos análogos a los abanicos de talud y a la cuña progradante de mar bajo); las acumulaciones costeras y de plataforma interna, al cortejo transgresivo y los niveles de plataforma externa influída por corrientes de turbidez constituyen el cortejo de mar alto de la Mesosecuencia Cuyo (Legarreta y Gulisano 1989). A una escala menos, se identificaron secuencias de 3° orden en los depósitos fandeltaicos, cuyo origen se relacionaría con la reactivación de fallas normales o la superposición de factores tectónicos y eustáticos. En las sucesiones marinas se reconocieron secuencias de 4° y 3° orden cuyo origen no estuvo controlado únicamente por la eustasia. Finalmente se propuso una redefinición de la Formación Puesto Araya a fin de considerar los cambios laterales de litofacies del Jurásico inferior mixto y marino.

Abstract:
Determination of sedimentary paleoenvironments and paleogeographical features from the Upper Triassic-Lower Jurassic transgression in Neuquén basin (upper Atuel valley and Las Leñas valley, southern Mendoza, Argentine) was the main thesis purpose. Vertical sections were chosen following two perpendicular transects (one east-west and the other north-south), where lithofacies and taphofacies were analized. These sections were biostratigraphycally correlated based on amonities, bivalves and brachiopods. The abrupt lateral lithofacies and age changes are the most notable features oh the studied marine sections. Particularly their base age varies towards the west from Early Pliensbachian at arroyo Blanco to Middle Hettangian at arroyo Malo. Simultaneously, the marine deposits increase their fine sandy and pelite content and the underlying fluvial conglomerates thin towards the west. The two transects of vertical sections were studied in order to determinate the probable controls of ancient basement horsts and halfgrabens on the observed changes above. Marine deposits of Pliensbachian age at Atuel and Las Leñas valleys were correlated to verify the influence of a basement high (Alto Dedos-Silla, Legarreta y Kozlowsky 1984). Depositional system age and areal distribution allowed to determine two regions in the Atuel valley; one to the east and the other to the west of arroyo El Freno. Vertical sections of western (Arroyo Alumbre, Arroyo Malo and Arroyo El Pedrero sections) recorded shallowing-upwards fluviodominated slope-type fan deltas and intermediate (shelf-type to Gilbert-type) fan deltas, both transversal to the main halfgraben and controlled by normal faults probably located at present Alumbre and El Freno creeks. Vertical sections of the eastern zone (Puesto Araya, Codo del Blanco, Las Chilchas and de los Caballos sections) record a transgressive siliciclastic storm-dominated shelf, evolving from wave-dominated estuaries to turbidite-influenced outer shelf settings. The storm-dominated shelf dipped towards west and north from an NW-SE to NE-SW paleoshoreline. In this paleogeographical framework the Pliensbachian condensed marine deposits and hiatal shell beds at Las Leñas valley confirm the influence of Alto Dedos-Silla. Depositional system features and age led to identify two stages of different tectonic behavior. During the first one (Rhaetian-Late Early Sinemurian) the accomodation space exceeded the sedimentary supply leading to the slope-type fandeltaic deposition in the western region. The second stage ocurred during the Late Early Sinemurian-Early Toarcian, when the accomodation space was outpaced by the sedimentary supply, allowing the estuarine, shelfal and intermediate-type fandeltaic deposits. The evolution of accomodation space vs. sedimentary supply allow to consider these two stages as synrift and sag phases respectively. Depositional sequences at two different scales were identified based on outcrop data, estimating their duration when it was possible. At the highest scale fan deltaic successions represent the lowstand system tract, the nearshore and inner shelfal deposits form the transgressive system tract and turbiditic outer shelfal beds represent the highstand system tract of the Cuyo Mesosequence (Legarreta y Gulisano 1989). At the lower scale third order depositional sequences were identified in the fandeltaic successions which are probably related to the normal faults reactivations or superimposed tectonic and eustatic controls. Third and fourth order depositional sequences were recognized in the marine shelfal successions which were not only controlled by eustasy. Finally a redefinition of the Puesto Araya Formation is proposed in order to consider the lateral lithofacies changes in the Lower Jurassic.

Labriola, Leticia. "Interacción entre las vías de transducción de señales activadas por el receptor de progesterona y las activadas por receptores con actividad de tirosina quinasa tipo I y II en cáncer de mama" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Existe numerosa evidencia que indica que los progestágenos están involucrados en el control de la tumorigénesis mamaria. A pesar de ello, los mecanismos por los cuales las hormonas esteroideas estimulan el crecimiento de células de cáncer de mama no han sido todavía descifrados completamente. Uno de los mecanismos propuestos ha sido la regulación de la expresión de factores de crecimiento que actuarían como mitógenos de las células tumorales. En particular, se ha demostrado previamente en el laboratorio que Heregulina (HRG), ligando de receptores con actividad de tirosina quinasa (RTK) tipo I, estimula el crecimiento de células epiteliales provenientes de cultivos primarios del tumor mamario progestágeno-dependiente C4HD y potencia los efectos mitogénicos del acetato de medroxiprogesterona (MPA) (Balañá et al., 1999; 2001). La primera parte del presente trabajo se centró en el estudio de interacciones entre los caminos de señalización activados por progestágenos y por RTKS tipo I y II en el modelo de carcinogénesis mamaria inducida por acetato de medroxiprogesterona en ratones Balb/c (Molinolo et al., 1987; Lanari et al., 1989). El tratamiento de las células C4HD con MPA indujo tanto el aumento de los niveles proteicos de ErbB-2 como el aumento de su fosforilación. Habíamos demostrado anteriormente que el receptor tipo I del factor de crecimiento similar a la insulina (IGF-IR) y el ErbB-2 están involucrados en la proliferación de estas células mediada por MPA. Al estudiar el bloqueo simultáneo de ErbB-2 y IGF-IR sobre la proliferación inducida por MPA, no se observaron efectos aditivos ni sinérgicos. Efectos aditivos hubieran sido esperados si IGF-IR y ErbB-2 activaran vías de señalización independientes. Una interacción sinérgica hubiera existido si el camino de transducción de señales activado por uno de los receptores potenciara el del otro receptor. Por lo tanto tan sólo un mecanismo que involucrara una interacción jerárquica entre IGF-IR y ErbB-2, en el cual uno de ellos es esencial para la activación de del otro, podía explicar nuestros resultados. En efecto, al suprimir la expresión del IGF-IR, la fosforilación del ErbB-2 inducida por MPA se vio totalmente inhibida. Sin embargo, el bloqueo de la síntesis de ErbB-2 no afectó la fosforilación del IGF-IR. Estos resultados muestran la existencia de una interacción jerárquica entre IGF-IR y ErbB-2; por medio de la cual IGF—IR dirige la activación de ErbB-2. Se demostró, por primera vez, que esta interacción involucra la asociación física de ambos receptores en un complejo heteromérico. Es más, experimentos de microscopía confocal laser mostraron que el MPA fue capaz de inducir la co-localización de ErbB-2 y IGF-IR. El propósito de la segunda parte del trabajo fue el de investigar la capacidad de HRG de activar al receptor de progesterona (RP) utilizando el mismo modelo experimental que en la primera parte. Es así que pudimos observar que HRG fue capaz de regular las características bioquímicas del RP en forma similar a la efectuada por la activación del receptor luego de la unión a un progestágeno. Se encontró que HRG fue capaz de inducir una disminución de los niveles proteicos de ambas isoformas, A y B, del RP y de disminuir la cantidad de sitios específicos de unión a progestágenos. Además, el tratamiento con HRG produjo un aumento de la proporción de RP con localización nuclear. Estudios posteriores nos permitieron saber que el tratamiento con HRG podía también inducir la unión del RP a su elemento respondedor en el ADN(PRE) y aumentar la transcripción de un gen reportero que contenía dos PRE en su promotor. Un antiprogestágeno como el RU486 provocó la inhibición de la activación transcripcional del RP mediada por HRG. Al profundizar en los mecanismos moleculares que estaban involucrados en los efectos de la HRG sobre el RP, pudimos observar que era necesaria la presencia de ErbB-2 funcional así como de proteínas quinasas activadas por mítógenos (MAPK) en su estado activo. Es más, MAPKs activadas por HRG tuvieron la capacidad de fosforilar al RP en ensayos de fosforilación in vitro. Los mismos estudios se realizaron en la línea de carcinoma mamario humano T47D obteniéndose resultados similares. Nuestros resultados mostraron que, en ausencia de progestágenos, HRG activa al RP tanto murino como humano mediante un mecanismo que requiere la presencia de ErbB-2 funcional así como la activación de MAPKs.

Abstract:
Accumulated evidence has indicated that progestins are involved in controlling mammary tumorigenesis. Although the mechanisms by which steroid hormones stimulate growth of breast cancer cells have not been completely deciphered, regulation of the expression of growth factors which in turn act as mitogens for tumor cells, has already been proposed. Particularly, we have previously demonstrated that Heregulin (HRG) stimulates gowth of primary cultures of the progestin-dependent C4HD mammary tumor epithelial cells and potentiates medroxyprogesterone acetate (MPA) mitogenic effects (Balañá et al., 1999; 2001). The first part of the present study focused on interactions between signaling pathways activated by progestins and by type I and II receptor tyrosine kinases (RTKs) in mammary tumors. An experimental model in which the synthetic progestin medroxyprogesterone acetate (MPA) induced mammary adenocarcinomas in Balb/c mice was used (Molinolo et a|., 1987; Lanari et al., 1989). MPA-stimulated proliferation of epithelial cells from primary cultures of progestin-dependent tumors induced up-regulation of ErbB-2 protein levels and tyrosine phosphorylation of this receptor. Recent findings in our laboratory indicate that type I insulin-like growth factor receptor (IGF-IR) and ErbB-2 are involved in proliferative signaling pathways in C4HD cells. Thus, we investigated the potential antiproliferative effect of the simultaneous downregulation of ErbB-2 and IGF-IR. The simultaneous blockage of ErbB-2 and IGF-IR showed neither synergistic nor additive effects on the inhibition of MPA induced proliferation of C4HD cells. Additive effects could have been expected if IGF-IR and ErbB-2 targeted different independent signaling pathways. Synergistic interaction could have been existed if one receptor pathway potentiated the other receptor biochemical pathway. Thus, only a mechamism involving a hierarchical interaction between IGF-IR and ErbB-2, wherein one of the receptors is essential for the activation of signal transduction pathways elicited by the other, could fit our results. In fact, suppression of IGF-IR by antisense oligodeoxinucleotides (ASODN) resulted in complete abrogation of MPA-induced phosphorylation of ErbB-2 in C4HD cells, whereas blockage of ErbB-2 did not affect IGF-IR phosphorylation. These results show the existence of hierarchical interactions between IGF-IR and ErbB-2, by means of which IGF-IR directs ErbB-2 phosphorylation. We demonstrated, for the first time, that this hierarchical interaction involves physical association of both receptors, resulting in the formation of a heteromeric complex. Furthermore, confocal laser microscopy experiments demonstrated that MPA was able to induce colocalization of ErbB-2 and IGF-IR. The aim of the second part of this study was to investigate the capacity of HRG to activate progesterone receptor (PR) by using the same model of hormonal mammary carcinogenesis. We first found that HRG was able to induce a decrease on PR A and B isoforms at protein level and to promote a significant increase in the nuclear localization of PR. Further studies allowed us to know that HRG was also able to induce PR binding to a progesterone response element (PRE) and significantly increased the transcription of a reporter gene with two PREs in its promoter. When we investigated molecular mechanisms involved in HRG action, we found that both the presence of functional ErbB-2 and activation of mitogen-activated protein kinases (MAPK)were needed. Additionally, HRG activated-MAPKs were able to phosphorylate PR in vitro. This PR activation by HRG was also seen in T47D human breast cancer cells. Our findings demonstrated that in the absence of progestins, HRG activates PR in both human and mouse breast cancer cells by a mechanism that requires both a functional ErbB-2 and MAPK activation. In addition, herein we provide the first evidence that MAPK activated by HRG are able to phosphorylate human and mouse PR in vitro.

Kreimann, Erica Lorena. "Estudios de terapia por captura neutrónica en boro (BNCT) en un modelo experimental de cáncer oral" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La Terapia por Captura Neutrónica en Boro (BNCT) es una modalidad terapéutica binaria que involucra la acumulación selectiva de portadores de ¹°Ben el tumor y la subsiguiente irradiación con un haz de neutrones. Las particulas de alta transferencia lineal de energia que se producen durante la reacción de captura de un neutrón térmico por el núcleo de boro tienen un rango de aproximadamente 5-9 μm y una alta eficacia biológica relativa. Así, el BNCT dañaría selectivamente las células tumorales. Esta terapia se encuentra en etapa de ensayo clínico en el mundo para tumores de cerebro y melanoma. Dentro del marco de la búsqueda de nuevas aplicaciones para BNCT, el estudio de la biologia y radiobiología del BNCT, la búsqueda de nuevos compuestos borados y la evaluación de la respuesta del tejido tumoral, precanceroso y normal hemos propuesto el modelo de cáncer oral en la bolsa de la mejilla del hamster para estudios de BNCT. Los estudios de biodistribución y farmacocinética en este modelo de un compuesto borado tradicional y uno de última generación demostraron la incorporación selectiva de boro al tumor en cantidades potencialmente terapéuticas. Un estudio de BNCT in vivo demostró por primera vez el éxito de esta terapia en el tratamiento del cáncer oral sin daño al tejido normal.

Abstract:
Boron Neutron Capture Therapy (BNCT) is a binary treatment modality that involves the selective accumulation of ¹°B carriers followed by irradiation with a neutron beam. The high linear energy transfer particles emitted during the capture of a thermal neutron by a ¹°B nucleus have a range of approximately 5-9 μm in tissue and are known to have a high relative biological effectiveness. Thus, BNCT would potentially target neoplastic tissue selectively. Clinical trials of BNCT for the treatment of brain tumors and melanoma are underway in the world. Within the context of the search for new applications of BNCT, the study of the biology and radiobiology of BNCT, the assessment of new boron compounds and the evaluation of the response of tumor, precancerous and dose-limiting normal tissues we have proposed the hamster cheek pouch oral cancer model for BNCT studies. The biodistribution and pharmacokinetic studies of a traditional and a new boron compound in this model evidenced potentially therapeutic, selective, incorporation of boron to tumor tissue. An in vivo study demonstrated, for the first time, the success of BNCT in the treatment of oral cancer with virtually no damage to normal tissue.

Kovalovsky, Damián. "Inducción y activación de Nurr77 y Nurr1 por CRH e IL-1 en corticotrofos : rol sobre la regulación del gen de POMC y vías de transducción de señales involucradas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo de tesis abordamos el estudio de la función corticotrofa normal y tumoral focalizándonos en tres temas fundamentales: a) los eventos moleculares involucrados en la regulación de los factores de transcripción Nur y sus consecuencias en la activación del gen de proopiomelanocortina (POMC) por la hormona liberadora de corticotrofina (CRH) y AMP cíclico (cAMP), b) la implicancia de los factores Nur en la regulación corticotrofa por interleuquina-1 (IL-1) y c) la de interacción entre IL-1,CRH y glucocorticoides. Demostramos en células corticotrofas AtT20 que la entrada por canales de calcio tipo L es esencial para la inducción de los mRNAs de Nur77 y Nurr1 y la estimulación de la actividad Nur por CRH a través de la actividad de CAMKII. La entrada de calcio es suficiente para producir la estimulación. El tratamiento con cAMP estimula Nur77 también independientemente del calcio entrante. Existe una vía de MAPK (Rap1/B-Raf/MEK1,2/ERK1,2) funcional en corticotrofos que estimula la fosforilación y actividad transcripcional de Nur77 y que es activada por CRH y cAMP en forma calcio-dependiente y calcio-independiente. La regulación por estas vías de señalización sobre la actividad Nur correlaciona con la regulación sobre el promotor de POMC. Demostramos también que Nur77 media la acción estimulatoria de IL-1 sobre el promotor de POMC: IL-1 estimula la actividad Nur sobre el sitio NurRE; produce la inducción del mRNA de Nur77 y no de Nurr1, un efecto transcripcional a nivel del promotor de Nur77; estos efectos dependen de la actividad de la protein quinasa p38; una línea que sobreexpresa una mutante dominante negativa de Nur77 es insensible a la estimulación por lL-1 de la secreción de ACTH, la actividad Nur y la inducción de POMC. La activación del factor de transcripción NFkB ejerce un efecto negativo en la estimulación de la actividad Nur y la inducción de POMC por IL-1. Demostramos que la potenciación entre IL-1 y CRH sobre la secreción de ACTH se observa también sobre la actividad Nur. El tratamiento con IL-1 aumenta la sensibilidad a la inhibición de la secreción de ACTH por glucocorticoides, tanto en la línea celular AtT20 como en cultivos primarios de adenomas corticotrofos humanos. Este efecto no es consecuencia de la inhibición del mRNA de POMC sino un efecto a nivel de la secreción y no es consecuencia de una diferencia en la afinidad de GR por los glucocorticoides ni una diferencia en el número de GR. En conclusión, en este trabajo de tesis caracterizamos por primera vez las vías de señalización involucradas en la regulación de la actividad Nur y la función corticotrofa por IL-1, CRH, glucocorticoides y sus interacciones, demostrando que la regulación de la expresión de POMC y ACTH en corticotrofos involucra: la existencia de una vía de MAPK funcional, la actividad fundamental de Nur tanto para CRH como para IL-1 y la interacción funcional de IL-1 con CRH (sinergismo) y con glucocorticoides (aumento de la sensibilidad a la inhibición).

Abstract:
In this thesis work we studied the normal and tumoral corticotrophic function focusing on three fundamental points: a) the molecular events involved in Nur regulation and its consequences on proopiomelanocortin (POMC) gene regulation by corticotrophic releasing hormone (CRH), cyclic AMP (cAMP), b) the implicance of Nur factors in corticotrophic regulation by interleukin-1 (IL-1) and c) the interaction among IL-1, CRH and glucocorticoids. We demonstrate that calcium entry through L type channels is crucial for Nur77 and Nurr1 mRNA induction and increased activity by CRH treatment involving CAMKII function. Calcium entry is sufficient to produce this stimulation. Treatment with cAMP stimulates Nur77 also independently of calcium. There is a functional MAPK (Rap1/B-Raf/MEK1,2/ERK1,2) pathway in corticotrophs that stimulates Nur77 phosphorylation and transcriptional activity and it is activated by CRH and cAMP treatments involving calcium-dependent and —independent signals. POMC regulation by this pathways correlates with Nur activity. We also demonstrate that Nur77 is involved in the stimulation of POMC by IL-1: IL-1 stimulates Nur activity on the NurRE site; induces Nur77 and not Nurr1 mRNAs, a transcriptional effect on the Nur77 promoter; these effects depend on p38 protein kinase activity; a cell line that overexpresses a dominant negative mutant of Nur77 is insensitive to IL-1 stimulation of ACTH secretion, Nur activity and POMC induction. NFkB activity exerts a negative effect on Nur activity and POMC mRNA induction by IL-1. We demonstrate that the synergism between CRH and IL-1 on ACTH secretion is also observed on Nur activity. IL-1 treatment increases the inhibitory effect of glucocorticoids on ACTH secretion, in the corticotrophic AtT20 cell line and in corticotroph human adenomas primary cultures. This effect is not a consequence of inhibition of POMC mRNA but an effect at the level of secretion and it is not due to different affinity of glucocorticoid receptor (GR) for glucocorticoids nor to different GR number. In conclusion, in this thesis work we characterized for the first time the signaling pathways involved in the regulation of Nur activity and the corticotrophic function by IL-1,CRH, glucocorticoids and its interactions, demostrating that the regulation of POMC mRNA expression and ACTH in corticotrophs involves: the existence of a functional MAPK pathway, the instrumental activity of Nur for CRH and IL-1 actions and the functional interaction of IL-1 with CRH (synergism) and with glucocorticoids (increased sensitivity to inhibition).

Kobayashi, Ken. "Análisis de la interacción planta-virus mediante la caracterización molecular de plantas transgénicas que expresan proteínas de movilización de PVX" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Durante la primera etapa del presente trabajo, se transformaron Nicotiana tabacum con el gen ORF3 que codifica la proteina p12 de PVX,con el fin de estudiar los efectos que provoca la expresión de esta proteina viral en la interacción planta-virus. A pesar de que las plantas transgénicas mostraron un aspecto normal, observaciones hechas con el microscopio revelaron la presencia de alteraciones en sus hojas. Al infectar estas plantas con PVX,se observó en sus hojas la aparición de sintomas atípicos y el desarrollo de resistencia al virus. Los sintomas consistlan en la formación de anillos amarillos concéntricos rodeados de tejido necrosado. Además, los mismos eran acompañados de cambios bioquímicos asociados a la respuesta hipersensible (HR), y no se formaban en plantas transgénicas sanas ni en plantas no transgénicas infectadas con PVX.No se observó una resistencia similar cuando las plantas p12 se inocularon con TMV o PVY. lo que sugirió la existencia de un mecanismo de resistencia específica contra PVX.A pesar de la aparición de sintomas de tipo HR, no se observó la inducción de una respuesta SAR en plantas p12 infectadas con PVX. Tampoco, se encontraron evidencias que indiquen la presencia de resistencia mediada por RNA. Durante la segunda etapa del trabajo, se analizaron plantas transgénicas previamente transformadas con el gen ORF2 que codifica la protelna p24 de PVX. con el fin de estudiar las alteraciones fisiológicas provocadas por la expresión de la misma. Estas plantas mostraron una apariencia clorótica y un marcado enanismo. A pesar de poseer hojas más pequeñas. distancias intemodales más cortas y reducción del tamaño en todos sus órganos, las plantas p24 poseían una relación de los tamaños tallo/raíz normal. Además, el tamaño de meristema radicular resultó más pequeño que el de las plantas control. Otros análisis revelaron que la tasa fotosíntética estaba disminuida en las plantas p24 y que los niveles de almidón, tanto en las hojas como en las raices, se encontraban reducidos. Además, las hojas mostraron un alto contenido de nitrato y una considerable acumulación de transcriptos de proteinas PR. Varias lineas de evidencia sugieren que el fenotipo enano de las plantas p24 serla una consecuencia directa de la actividad de la proteina p24, y no un efecto indirecto de la disminución de la fotosíntesis o de los cambios metabólicos.

Abstract:
In the first part of the present work, Nicotiana tabacum were transformed with the PVX ORF3 gene coding for the p12 protein, with the aim of studying the effects provoked by its overexpression. Although the transgenic plants exhibited a normal morphological aspect, microscopic examination revealed extensive alterations in leaf tissue structure. After challenging with PVX, the transgenic plants showed resistance to PVX infection and formation of leaf symptoms consisting of concentric rings encircled by necrotic borders. These novel symptoms were accompanied by biochemical changes normally associated with the Hypersensitive Response (HR) and were absent in non-infected transgenic plants or in PVX-infected non-transgenic plants. No equivalent virus resistance was observed after inoculation with TMV or PVY, suggesting the presence of a specific resistance mechanism in p12 plants. Despite the development of HR-like symptoms, SAR was not induced in PVX-infected p12 transgenic plants. No evidence of an RNA-mediated resistance mechanism was found. During the second part of this work, transgenic N. tabacum plants previously transformed with the PVX ORF2 gene coding the p24 movement protein were further analyzed with the aim of studying the physiological alterations provoked by viral MP. These plants exhibit a slightly chlorotic appearance and a pronounced stunted phenotype. Although p24 plants have smaller leaves, shorter internodes and reduced organs, their shoot to root ratio remained similar to that of control plants. Moreover, root meristems were smaller in p24 plants than in control plants. Further analyses of transgenic plants showed considerable reductions in photosynthetic rates and lower starch levels in both leaves and roots. In addition, p24 leaves showed higher nitrate levels and a significant accumulation of PRs transcripts. Different lines of evidence suggest that the stunted phenotype observed in p24 plants is a direct consequence of p24 activity and not an indirect effect derived from diminished photosynthesis or other metabolic changes.

Kadener, Sebastián. "Regulación transcripcional del Splicing alternativo" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En el presente trabajo de tesis investigamos aspectos relacionados con el acoplamiento entre la transcripción y el splicing alternativo. Utilizando como modelo al exón alternativo EDI de la fibronectina humana, encontramos que la elongación transcripcional es un importante modulador del splicing alternativo. El Ag T de SV40 activa la replicación del DNA 2 veces, la transcripción entre 12 y 20 veces, y es capaz de provocar un incremento de 25 veces en la inclusión del exón EDI. El efecto del Ag T es específico de exón, ocurre en cis y depende de la replicación del DNA y no de la transformación celular. VP16, un activador de la iniciación y elongación transcripcionales tiene un efecto similar en la transcripción pero opuesto sobre el splicing: inhibe la inclusión de EDI 35 veces. Es más, esta proteína viral es capaz de revertir el efecto del Ag T sobre el splicing de EDI. Consistentemente se determinó que la replicación es capaz de modificar la estructura cromatínica del molde y de ese modo alterar la capacidad elongadora de la RNA pol II. Por otro lado, el enhancer transcripcional del SV4O (una secuencia capaz de aumentar la capacidad elongadora de la RNA pol II) favorece la exclusión del exón EDI en forma independiente de los niveles de RNA. De este modo, la modulación de la capacidad elongadora de la RNA pol II aparece como una nueva forma de regular el splicing alternativo. Independientemente se determinaron dos hechos de importancia: ni el sitio intranuclear de transcripción, ni el reclutamiento de proteínas de splicing por la maquinaria transcripcional parecen tener una influencia importante sobre la decisión de inclusión del exón EDI en el transcripto maduro.

Abstract:
In this work we investigated aspects related to the coupling between transcription and alternative splicing. Using the fibronectin alternative EDI exon as a model, we found that th pol II elongation rate has an important influence on alternative splicing. SV40 large T-antigen (T-Ag) activates template replication by only 2-fold, transcription by 12-20 fold and provokes a 25-fold increase in the inclusion of the EDI exon into mature mRNA. VP16, an activator of transcriptional initiation and elongation, has a similar effect on trasncription but the opposite effect on splicing: EDI inclusion is inhibited by 35-fold. Moreover, this Viral protein can revert the T-Ag effect. T-Ag- mediated replication can modify the chromatin structure of the plasmid DNA and, as a consecuence of this, can inhibit the processivity of RNA pol II. The SV40 enhancer (a sequence capable of changing the elongation rate of RNA pol II) stimulates EDI exon exclusion. Then, modulation of the elongation rate apperars as a key mechanism to regulate alternative splicing. In addition, we found that the intranuclear transcription site and the recruitment of splicing proteins by the transcription machinery are not important for the fate of EDI inclusion in mature mRNA.

Judkowski, Valeria A.. "Diabetes Mellitus insulino-dependiente : identificación y utilización en el tratamiento de la enfermedad de ligandos peptídicos específicos de un clon diabetogénico proveniente de ratones no obesos y diabéticos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Jancic, Carolina Cristina. "Células dendríticas humanas : caracterización de su interacción con proteínas de matriz extracelular y de su capacidad inmunoreguladora" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Las células dendríticas (DC) son las más eficientes células presentadoras de antígenos y cumplen un rol central en la inducción de la respuesta inmune primaria. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la interacción de las DC con otros tipos celulares y con la matriz extracelular (MEC); los factores que modulan dicha interacción; y la capacidad de las DC para inducir la proliferación de células T. Para ello se utilizaron DC obtenidas a partir de monocitos de sangre periférica (moDC) empleando interleuquina (IL) 4 y el factor estimulante de colonias de granulocitos y macrófagos (GM-CSF), en presencia de suero humano (SH) o suero bovino fetal (SBF). Las moDC fueron capaces de adherirse a células endoteliales obtenidas a partir de vena de cordón umbilical humano (HUVEC) y a distintas proteínas de MEC. Esta adhesión fue modulada por citoquinas como el TNFα y la IL1β. Mientras que el tratamiento de las células endoteliales con TNFα indujo una mayor adhesión y migración de moDC, el tratamiento de las moDC con dicha citoquina provocó una disminución en la adhesión tanto a endotelio como a fibronectina (FN) y laminina (LM), pero no a colágeno tipo IV (Col tipo IV). Los efectos de esta citoquina fueron mediados por el receptor de tipo 11, cuya expresión disminuyó cuando las células se trataron con TNFα. La interacción de las moDC con HUVEC no activado fue parcialmente mediada por CD18, C029, CD49e y CD31. Por otro lado, la adhesión a proteínas de MEC fue mediada por las integrinas CD49e (para FN), CD49c y CD49f (para LM). La expresión de estas moléculas no se modificó con el tratamiento de las moDC con TNFα. Sin embargo, la activación de las integrinas con PMA revirtió el efecto inhibitoriodel TNFα sobre la adhesión a FN. Además de disminuir la adhesión a proteínas de MEC, el tratamiento de las moDC con TNFα e IL1β disminuyó el contenido intracelular de AMPc. Las células no adherentes a FN presentaron menores niveles de AMPc, mayor expresión de IL12 y mejor capacidad estimuladora de linfocitos T, comparadas con las células adherentes. En estas moDC el aumento del contenido de AMPc utilizando un inhibidor de la fosfodiesterasa o análogos de AMPc, revirtió el efecto del TNFα sobre la adhesión a FN y sobre su capacidad inmunoestimuladora. Por otro lado, estímulos “no clásicos” como el aumento de la osmolaridad extracelular modifican ciertas propiedades de las moDC, disminuyendo su capacidad endocítica. su adhesión a proteínas de MEC y su habilidad para inducir la proliferación de linfocitos T alogeneicos. El tratamiento hiperosmolar, además, provocó una disminución en el contenido de IL12, sin modificar la expresión de las moléculas HLA-I, HLA-DR, CD18, CD54 y CD86. Las moDC generadas bajo diferentes condiciones de cultivo presentaron características particulares. Las células cultivadas en presencia de SBF (moDC-SBF) expresaron CD80 en la superficie celular a diferencia de las células cultivadas en presencia de SH (moDC-SH). Estas últimas presentaron reservorios intracelulares de dicha molécula. Además, las moDC-SBF mostraron una mayor expresión de IL12 y una alta eficiencia para inducir la proliferación de células T durante una respuesta inmune antígeno específica, comparadas con las moDC-SH. Los resultados obtenidos en el presente trabajo sugieren que el TNFα actuaría sólo sobre la población de moDC que expresa el RTNF tipo II, posiblemente inactivando las integrinas que participan en la interacción con las proteínas de MEC, lo que resulta en una menor adhesión. Además, existiría una correlación entre el contenido de AMPc y los cambios inducidos por el TNFα en las moDC, tanto en la adhesión a FN como en su capacidad inmunoestimuladora. Por otro lado, el aumento en la osmolaridad extracelular podría generar moDC con baja habilidad para estimular la proliferaciónde células T, lo cual podría estar en parte debido a la menor producción de IL12 y la menor capacidad para incorporar antígenos bajo condiciones hiperosmolares. Finalmente, la expresión de CD80 podría depender de factores presentes en el suero utilizado durante el cultivo de las moDC. Resumen

Abstract:
Dendritic cells (DC) are professional antigens presenting cells that play a critical role in the induction of acquired immune responses. The aim of the present study was to analyze the cell-DC and extracellular matrix (ECM) proteins-DC interactions. The factors that modulate this interactions and the immunostimulatory capacity of DC were further examined. Monocytes derived DC (moDC) were used for these experiments. MoDC were able to adhere to endothelial cells obtained from human umbilical vein (HUVEC) and to ECM proteins. This adhesion was modulated by cytokines such as TNFα and IL1β. TNFa treated HUVEC increased moDC adhesion and migration. In contrast, TNFα treated moDC were less adherent to endothelium, fibronectin (FN) and laminin (LM), but not to collagen type IV (Col type IV). TNFα effect was mediated through TNF receptor II, which was downmodulated on TNFα-treated moDC. The moDC-HUVEC interaction was partially mediated by CD18, CD29, CD49e and CD31. The moDC adhesion to ECM proteins was mediated by CD49e for FN, and CD49c and CD49f for LM. The expression of these molecules did not change on TNFα treated moDC. However, PMA reversed the inhibitory effect of TNFα on FN adhesion, probably by integrin inactivation. TNFα also decreased the cAMP levels on moDC. Indeed, TNFα treated cells non-adhered to FN showed lower levels of cAMP, higher IL12 expression and better immunostimulatory capacity compared with FN adhered moDC. By increasing the cAMP content with a phosphodiesterase inhibitor (IBMX) or cAMP analogues (8Br-cAMP) was possible to reverse the TNFα effect on adhesion and T-cell stimulatory capacity. Alternatively, moDC incubated with high extracellular osmolarity detached from ECM proteins and showed lower immunostimulatory capacity, compared with cells in iso-osmolar conditions. The effect of hiperosmolarity could be mediated by IL12, since those treated moDC showed lower level of IL12 without changes in the expression of surface molecules. Some features of moDC were modified depending on the culture conditions. Cells cultured in the presence of fetal bovine serum (FBS) (moDC-FBS) expressed CD80 while CD80ˉ moDC were generated by using human serum (HS) (moDC-HS). However, the moDC-HS showed intracellular expression of this molecule. Other differences observed between these two moDC were the higher IL12 production and the capacity to stimulate antigen-specific T cells of moDC-FBS, compared with moDC-HS. Overall, these results suggest that TNFα and other non-classical stimuli act on some moDC decreasing the adhesion, probably by modulating the activation state of integrins. Furthermore, cAMP levels correlate with TNFα-induced changes of moDC adhesion and allostimulatory capacity. Finally, expression of CD80 on cellular membrane may depend on different factors present in serum, being FBS able to generate CD80+ moDC with better immunostimulatory capacity.

Herrmann, Carlos Jorge. "Estudio geológico del distrito wolframífero Ambul, Provincia de Córdoba" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El distrito wolframífero Ambul se emplaza en la unidad morfoestructural Sierras Pampeanas Orientales, en las estribaciones occidentales de la Sierra Grande de Córdoba. El basamento está integrado principalmente por gneises, anfibolitas, mármoles, rocas calcosilicáticas y metacuarcitas de edad proterozoica superior a cámbrica, e intrusiones de granitoides paleozoicos. Se trata de un antiguo distrito minero con dos tipologías de mineralización de wolframio, una de scheelita alojada en rocas calcosilicáticas (región Santa Rosa) y otra de scheelita y wolframita en mantos y vetas de cuarzo-turmalina (región de Jaime). Sus yacimientos fueeron explotados intensamente en tres períodos discontinuos entre los años 1914 y 1960, en etapas parcial o totalmente simultáneas con períodos bélicos (Primera y Segunda Guerra Mundial) y de rearme mundiales. La génesis de la mineralización scheelítica en rocas carbonáticas se asignaba antiguamente a un proceso de reemplazo metasomático, en tanto que la mineralización en “vetas” se vinculaba con hidrotermalismo relacionado con el granito de Achala. El estudio encarado, con el objeto de estudiar la mineralización de wolframio en el distrito Ambul bajo la óptica de nuevos modelos yacimientológicos, se fundamenta en la geología, estructura, mineralogía, petrología y geoquímica de los depósitos y la litología asociada; tiene como antecedentes la propuesta de Brodtkorb y Pezzutti (1991) y la amplia bibliografia de orden internacional —en mucho mayor medida que nacional- sobre mineralización de wolframio, sus ambientes, modelos de formación y litologias asociadas. El desarrollo de la investigación identificó como relevantes para la mineralización wolframifera del distrito el estudio de los siguientes elementos de la geología del área, sobre los cuales se trabajó con las mejores técnicas y elementos disponibles: a) la mineralización de wolframio alojada en rocas calcosilicáticas y en vetas de cuarzo, b) la presencia de anfibolitas de carácter ortoderivado, c) la presencia de exhalitas (turmalinitas), d) elementos comunes (B y W) en ambas tipologías de mineralización (diseminada y vetiforme), e) la importancia del metamorfismo regional, t) el posible vinculo con el plutonismo paleozoico y g) la relación con la faja de cizalla regional Ambul-Mussi. En el desarrollo de la investigación, sobre especímenes elegidos entre las 200 muestras recolectadas junto con datos y observaciones en cuatro campañas, se realizaron: estudio de cortes microscópicos petrográficos y calcográficos; examen de inclusiones fluidas en el mineral de ganga; análisis geoquímicos sobre elementos mayoritarios, minoritarios y trazas; reconocimiento de minerales mediante difracción de rayos X; estudio de minerales mediante microsonda electrónica y determinación de composición isotópica. En la región Santa Rosa (sur del distrito) la mineralización de los depósitos wolframíferos es de scheelita, incluida en bancos definidos y delimitados de rocas calcosilicáticas que yacen íntimamente relacionadas con mármoles y anfibolitas, presentando geometrías lentiformes y concordantes con la esquistosidad y foliación de los gneises regionales. Las dimensiones de estos bancos son casi exiguas para la observación a gran escala, al extremo que en la región casi nunca fueron mapeados y pocas veces mencionados. Presenta muy pequeña representatividad volumétrica pero gran continuidad y dispersión; su presencia se repite con semejantes características en áreas que distan cientos de kilómetros entre si, como los distritos Altautina (35 km al SO de Ambul), Agua de Ramón (70 km al NE de Ambul) y Sierra del Morro Oeste (180 km al SSO de Ambul), entre otros, siempre en ambiente de Sierras Pampeanas Orientales. Las anfibolitas, de acuerdo con su geoquimica, son exponentes de una filiación básica y su mineralogía indica que son producto de metamorfismo regional de presión y temperatura medias, que alcanzara una facies anfibolita baja. Su posición geotectónica se interpreta como perteneciente a un arco de islas y a estas rocas derivadas del volcanismo básico submarino de dicho ambiente. Son de características subalcalinas, tholeiíticas, con alto magnesio. Los gneises destacan su procedencia como sedimentaria, con un protolito de grauvacas-subgrauvacas. Las rocas calcosilicáticas derivaron de sedimentos carbonáticos cálcicos y magnesianos más o menos impuros debido a los aportes silicoclásticos, en algunos casos también muy aluminosos. La mineralización de wolframio está controlada estratigráficamente, encajada en sedimentos neoproterozoicos-cámbricos depositados en épocas de sedimentación carbonática creciente. No se halló ninguna evidencia que permita relacionar la mineralización scheelítica con intrusivos ácidos; tampoco la hay de metasomatismo con aporte wolframífero ni de “caminos” de fluidos mineralizantes considerados necesarios en una eventual hipótesis epigenética. Las turmalinitas relacionadas con la mineralización scheelítica de esta región, considerando los antecedentes que las relacionan con procesos exhalativos en ambiente volcano-sedimentario, fueron estudiadas en detalle mediante geoquimica, microsonda e isotopia de boro para reconocer sus características, deduciendo que la mineralización de scheelita y las turmalinitas en este sector de la Sierra Grande de Córdoba pueden estar vinculadas con fluidos hidrotermales exhalativos submarinos en circulación convectiva a través de metasedimentos. La scheelita alojada en las rocas calcosilicáticas se presenta generalmente como cristales xenomorfos o agregados, diseminados o bien alineados en una o varias capas de algunos milímetros de espesor; aunque en general son milimétricos, pueden alcanzar 2 cm de lado. También se aloja en charnelas de pliegues y en diaclasas, por removilización metamórfica. En forma saltuaria es acompañada por fluorita, pirita y titanita. Las estructuras de mayor importancia pertenecen al campo dúctil, donde más de una fase deformacional afectaron los gneises y la asociación de rocas calcosilicáticas mineralizadas mármol- anfibolitas. Sufrieron plegamiento según dos direcciones principales de esfuerzo (ciclos Pampeano y Famatiniano?), con efectos sobrepuestos de ambas fases de deformación, y un gran evento deformacional en forma de “faja” de orden regional (Faja Ambul-Mussi). La temporalidad de esta mineralización pudo acotarse en la finalización del Precámbrico o en el Cámbrico medio, con referencia a la edad probable de los eventos deformantes de las rocas que alojan la mineralización scheelítica de acuerdo con investigaciones de otros autores. Existe concordancia con algunas de las escasas dataciones de anfibolitas en la Sierra Grande, aunque con reservas ante la ausencia de datación en el área de estudio y la escasa certeza que se le asigna a algunas dataciones por el método Rb/Sr. En la región de Jaime (norte del distrito) hay ausencia de rocas calcosilicáticas y quienes portan mineralización de scheelita y wolframita son mantos y vetas de cuarzo y turmalina, de estructura masiva, con corridas de hasta l km y potencias máximas de 25 cm. Se emplazan concordante a subconcordantemente en gneises protomiloníticos y miloníticos, con rumbo general este-oeste e inclinaciones de 15 a 45° al N y NE en algunos yacimientos y desde 55° S hasta la vertical en otros. Se componen de abundante cuarzo y turmalina y, en forma muy subordinada, moscovita; los minerales primarios que integran la mena son escasos y corresponden a scheelita y wolframita, acompañados por pirita, calcopirita, molibdenita, bornita, enargita (?) y esfalerita. Las especies secundarias son óxidos de cobre y de hierro. Inclusiones fluidas en cuarzo indicaron condiciones termométricas de rangos medios (260 a 300° C) y salinidades relativamente bajas. Estudios de detalle (microsonda, composición isotópica, difracción de rayos X) caracterizaron la wolframita con leve tendencia a ferberita. En el estudio comparativo se evidencia un grado de semejanza entre la turmalina de vetas y mantos y las de turmalinitas asociadas con la mineralización scheelítica estratoligada de la región de Santa Rosa. Valores similares en la isotopía de boro pueden sugerir un origen común para el boro y soportan la idea que W y B sean productos removilizados debido a efectos del metamorfismo regional o tectónicos (cizallamiento regional). Se analizó también la participación de varios elementos de la historia geológica paleozoica inferior-media de la región (intrusiones graníticas del Cámbrico y Ordovícico; granito achaliano; faja de deformación Ambul-Mussi) en la génesis de los depósitos wolframíferos vetiformes y en eventos de removilización. En el estudio se correlacionaron datos con otros distritos wolframíferos de Sierras Pampeanas Orientales (Sierra del Morro en la provincia de San Luis, y Altautina y Agua de Ramón en la provincia de Córdoba) y con varios ejemplos mundiales de mineralización scheelítica estratoligada en rocas metamórficas y wolframífera en vetas y mantos. Para la mineralización scheelítica del distrito se encontró favorecido un modelo yacimientológico-genético de tipo estratoligado, volcanogénico-exhalativo de carácter básico derivado de un volcanismo de arco de probable edad proterozoica superior a cámbrica inferior, alojado singenéticamente en sedimentos carbonáticos impuros, transformados en rocas calcosilicáticas como producto del metamorfismo regional. Para la mineralización vetiforme se hallaron elementos geológicos que apoyan una posible removilización por efectos del metamorfismo regional y/o tectónicos (faja de deformación regional) que afectaron el área, con la intervención de fluidos derivados del plutonismo paleozoico o metamórficos, con enriquecimiento a partir de la mineralización estratoligada.

Abstract:
In the basement of Sierras Pampeanas Orientales, in the central part of Argentina, there are several scheelitic districts in a 300 km-length area that belong to various styles of tungsten mineralization. One of them is the Ambul wolfram district, located in the Córdoba province, which was mined until early 1960 decade. The lithology in the Ambul area consists mainly of gneisses (biotite and migmatitic gneisses in the south and mylonitic and protomylonitic gneisses in the north) with minor amphibolites, calcsilicate rocks and marbles. Gneisses are derived from rocks in the range of sub-graywackes and are mostly composed of quartz, plagioclase and biotite. The amphibolites are derived from tholeiitic basalts; they are composed of Mg-hornblende and plagioclase that ranges from andesine to labradorite. Marbles and calcsilicate rocks are in close association with the orthoamphibolite. Calcsilicate rocks (composed of tremolite-actinolite, epidote, carbonates, quartz, and ocassionally flogopite and gamet) and marbles, are derived from impure and pure carbonates; their protoliths were transformed by the action of regional metamorphism. These rocks occur in lenses concordant with gneisses of regional distribution. A particular type of rock -a tounnalinite- was identified in close relationship with scheelite deposits. The amphibolite facies of regional metamorphism has been reached in the area. The other rocks in the district are pegmatites, aplites, granitoids and lamprophyres (spessartites). Two major deformation events characterize the Sierras Pampeanas orogeny. They are known as the Pampean (Cambrian) and Famatinian (Ordovician) cycles. A regional shear zone probably related to the Famatinian cycle occurs in the Ambul district (called Ambul-Mussi deformation zone). The Ambul district is divided into two areas named Santa Rosa and Jaime, where two types of wolfram mineralization have been recognized. In the Santa Rosa area the tungsten deposits are stratabound scheelite mineralization in calcsilicate rocks associated with marbles and amphibolites, with a defined stratigraphic control. Scheelite is ocassionally accompanied by fluorite, pyrite and titanite. In the Jaime area the tungsten deposits are wolframite and scheelite bearing quartz-tourmaline mantos and veins. The wolfram minerals are accompanied by smaller quantities of pyrite, chalcopyrite, molibdenite, bomite, sphalerite, enargite(?) and copper and iron oxides. Conditions of mineralization are characterized by a temperature interval between 260 and 300° C and relatively low salinities (4,5 - 7,5 % NaCl eq.) Detailed petrographic and chalcographic studies, geochemical analyses including trace element geochemistry, and electro microprobe analyses have been made on main rocks and minerals to support this research. In adition, compositional characteristics of wolframite and fluid inclusions in quartz of wolframite-bearing quartz veins have been studied, and boron isotope compositions have been measured on tourmalinite-hosted and vein-hosted tourmalines. The tungsten deposits in the Ambul district are stratabound scheelite mineralization associated with calcsilicate rocks and orthoamphibolites. Wolfram may be derived from submarine hydrothermal fluids of volcanogenic origin circulating within the former sedimentary sequence. This process may be an integral part of the genesis of the tourmalinite-stratabound scheelite-orthoamphibolite association. Wolframite and scheelite veins are located at the northern boundary of the regional shear zone, while the calcsilicate rocks, marbles and amphibolites bearing scheelite crop out near its southern boundary. It is possible that fluids circulating through the shear zone formed the veins and were responsible for remobilization during a deformation episode of the Famatinian cycle. The fluids could be derived from Cambrian granites or small Ordovician intrusions, possibly in connection with metamorphic processes; however, in the absence of clear age constraints of the deformation episodes, it can not be ruled out the derivation from the granitic batholith of Devonian-Carboniferous age (Achala complex).

Helguero, Luisa Alejandra. "Expresión y funcionalidad del receptor de progesterona (RP) en la modulación del crecimiento hormono-dependiente y en la adquisición de resistencia al tratamiento hormonal de un modelo murino de carcinogénesis mamaria" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El cáncer de mama es la segunda causa de muerte en las mujeres, luego del cáncer de pulmón. En el desarrollo de esta enfermedad se postulan distintas etapas biológicas que van progresando desde un crecimiento hormono-dependiente a uno hormono-independiente, lo que está asociado a un aumento de la agresividad. En la clínica, si el tumor expresa receptores de estrógenos (RE) y progesterona (RP), una parte importante de los enfoques terapéuticos de elección, es la hormonoterapia con el antiestrógeno tamoxifeno. Sin bien en un principio la gran mayoría de los pacientes responden, con frecuencia el tumor evoluciona hacia la resistencia al tratamiento hormonal, lo que se asocia a diseminación generalizada. Esta resistencia, cuyos mecanismos aun se desconocen, no implica en general una pérdida de expresión de receptores hormonales y todo parece indicar que, o bien existe un cambio intrínseco en éstos, o en los mecanismos que regulan su expresión y activación. En nuestro laboratorio desarrollamos un modelo de adenocarcinomas mamarios murinos por la administración prolongada de MPA en ratones hembras vírgenes de la cepa BALB/c. Estos tumores son en su mayoría de origen ductal con capacidad invasora. En un principio poseen un comportamiento progestágeno-dependiente (PD), requiriendo de la hormona trófica para su crecimiento y expresan RE y RP, pero con el tiempo pueden adquirir un fenotipo progestágeno-independiente, en el cual se conserva aún la expresión de receptores. Previamente hemos demostrado que el RP estaria involucrado en la adquisición de hormonodependencia. El objetivo de este trabajo fue estudiar el papel del RP en la transición de hormono-dependencia a independencia y en la adquisición de resistencia hormonal. Para este estudio utilizamos seis tumores PD y nueve progestágeno-independientes. Caracterizamos la respuesta in vivo de los tumores independientes al tratamiento con los antiprogestágenos onapristona y mifepristona y al 17-β-estradiol. Seis tumores respondieron regresionando, y los llamarnos progestágeno-independientes respondedores (PI-NR) y tres no respondieron; a éstos los denominamos progestágeno-independientes no respondedores (PI-NR). En nuestro laboratorio ya se había evaluado la respuesta in vivo de los tumores PD, y respondieron a estrógenos y antiprogestágenos con regresión. Cuando, en cultivos primarios de un tumor PD, estudiamos la respuesta proliferativa a MPA in vitro observamos que la misma fue bifásica, con dos pendientes estimulatorias, una a concentraciones muy bajas (EC50 = 1.5 ± 0.7 fM) y la otra a concentraciones más altas (EC50 = 0.33 ± 0.3 nM). Con estos resultados, evaluamos por unión del ligando la expresión de receptores en todos los tumores y en tejidos normales. En útero normal, y en tumores PD y PI-R, descubrimos dos sitios receptores de progesterona, uno de alta afinidad no descrito previamente en el RP (Kd = 43 ± 9 pM, Q = 9 ± 2 fmoles/mg de proteína) y el otro sitio clásico que habíamos hallado previamente (Kd= 9.2 ± 4 nM). En los tumores PI-NR no se pudieron determinar estos parámetros. El estudio de la distribución subcelular de RP mostró que en los tumores PD y PI-R se localizan principalmente en el citosol, y son regulados por MPA, mientras que en los tumores PI-NR están principalmente en el núcleo y no son regulados. Sin embargo, durante el ciclo estral, los sitios receptores son regulados en todos los tipos de tumor estudiados. Para caracterizar la expresión de las isoformas del RP utilizamos Western blot. En los tumores PD y PI-R se encontraron ambas isoformas, RPa y RPb, con patrón de expresión similar al de los controles normales, útero y mama de ratón. Encontramos además, una proteína de 78 kDa que se expresa exclusivamente en los tumores, pero no en los tejidos normales. Desconocemos su naturaleza, pero se ha descrito una proteína similar en un 25 % de tumores humanos. Su ausencia de tejidos normales sugiere una posible aplicación como marcador tumoral. Con MPA, ambas isoformas RPA y RPB se regulan negativamente en forma similar. En los tumores PI-R se regula preferencialmente RPb, esto sugeriría un papel del RP en este tipo de crecimiento en particular por RPb. En los tumores PI-NR se detectaron menores niveles de RP, principalmente de RPb. Por estudios de Western Blot se podría predecir la capacidad de los tumores de responder al tratamiento hormonal. Por inmunohistoquímica, no se observaron diferencias en el patrón de marcación entre los tres tipos de tumores. Todos fueron positivos, con un porcentaje de células marcadas del 50 % o más. Los resultados de SSCP indican que la reactividad diferencial de los anticuerpos con Western blot e inmunohistoquímica no se debe a mutaciones en el gen de RP. Hemos teorizado la posibilidad de cambios de expresión de epitopes secundarios al distinto procesado de los tejidos en las técnicas. La caracterización de ARN por protección a RNasa indica que los niveles de RP en tumores PI-R y PI-NR son similares. Es probable que, en los tumores PI-NR, las diferencias de expresión observadas con Western blot se deban a cambios post-traduccionales. Con oligonucleótídos antisentido del RP (asRP) en cultivos primarios de tumores PI-NR demostramos que los RP están involucrados en la proliferación celular aún cuando han perdido la capacidad de unir al antiprogestágeno. Estos resultados, de ser extrapolables al humano indicarían que, en el tratamiento del cáncer de mama resistente a la terapia hormonal aún se podrían utilizar estrategias diseñadas a bloquear la funcionalidad de los receptores hormonales.

Abstract:
Breast cancer is, after lung cancer, the second cause of death in women. The development of this disease occurs through different stages from a hormone-dependent to a hormone-independent growth, which is associated to increased aggressiveness. One of the treatments of choice for ER and PR positive breast cancer is hormone therapy with the antiestrogen tamoxifen. Most of the patients respond, although eventually the tumor becomes refractory and the disease progresses. The mechanisms of resistance remain unknown, but most tumors still express hormone receptors, indicating that there is either an intrinsic modification on these molecules, or in the regulation of their expression and activation. In our laboratory, we have developed a murine mammary adenocarcinoma model by prolonged administration of MPA on female virgin BALB/c mice. Most of these tumors are invasive ductal carcinomas, disclosing a progestin-dependent pattern of growth (PD) and they express ER and PR. Either spontaneously or by successive transplantations in animals not treated with hormones, progestin-independent tumors may arise that maintain the expression of hormone receptors. Our goal was to study the role of PR in the transition from hormone-dependence to independence and in the acquisition of resistance to hormonal therapy. We characterized the in vivo response of progestin-independent tumors to the antiprogestins onapristone and mifepristone and to 17-β-estradiol. Six tumors regressed, and we named them responsive progestin-independent (R-PI); three did not respond and were named unresponsive progestin-independent tumors (UR-PI). We studied the proliferative response to MPA in vitro on primary cultures of a PD tumor, and observed that it was biphasic, with two stimulatory slopes, one at very low concentrations (EC50 = 1.5 ± 0.7 fM), and the other at higher concentrations (EC50 = 0.33 ± 0.3 nM). Based on these results we evaluated the receptor expression by radioligand binding in all the tumors and normal tissues. In uterus, PD and R-PI tumors, we discovered two sites for the progesterone receptor, one of high affinity not previously reported (Kd = 43 ± 9 pM, Q = 9 ± 2 fmoles/mg de protein) and the other site which corresponds to the classical PR described by others (Kd = 9.2 ± 4 nM, Q = 376 ± 74 fmoles/mg de protein). PR, in PD and R-PI tumors, are mainly localized in the cytosol, and are regulated by MPA, while in UR-PI tumors they are mainly in the nucleus and are not regulated by this hormone. Nevertheless, the receptor sites were regulated through the estral cycle in all the tumor types studied. To characterize PR isoform expression we used Western blot. We found both PRa and PRb isoforms in PD and R-PI tumors, with a similar expression pattern compared to the control tissue uterus and normal mammary gland. We also found a 78 kDa protein which is exclusively expressed in tumors but not in normal tissue. Its nature remains unknown but a similar protein has been described in 25 % of human cancers. Its absence in normal tissues suggests a possible use as a tumor marker. With MPA treatment, both PRa and PRb are down regulated. PRb is preferentially down regulated in R-PI tumors and this may be indicating its role in this type of growth. Lower levels of PR were detected in UR-PI tumors, particularly PRb. Based on the Western blot studies the ability of the tumors to respond to hormonal treatment could be predicted. PR expression was also studied by immunohistochemistry. No differences were observed between the staining patterns of the three tumor types. The signal was positive in 50% or more nuclei. We conclude based on the SSCP studies that the differential reactivity between the antibodies used in Western blot and immunohistochemistry is not due to mutations in the PR gene. We theorize the possibility that these changes are product of modifications in the epitope expression due to the processing of the sample for each technique, or to post-translational changes. The studies at RNA level by RNase protection assay indicate that PR expression levels in R-PI and UR-PI tumors are similar. Probably, in UR-PI tumors the lower expression levels observed with Western blot are due to post-translational modifications. In primary cultures of UR-PI tumors, using antisense oligonucleotides to PR (asPR) we demonstrated that PR are involved in cell proliferation even when they have lost their ability to bind to the antiprogestagens. The importance of these observations relies in that, if these results to humans are possible to extrapolate to human, in the treatment of hormone resistant breast cancer strategies designed to block the functionality of these receptors could still be used.

Guerin, Marcelo Eduardo. "Estudios moleculares sobre la UDP-GLC : Glicoproteína glucosiltransferasa : relación estructura-función" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El retículo endoplasmático (RE)es el compartimiento subcelular involucrado en la síntesis, modificación post-traduccional y plegamiento de proteínas y glicoproteínas que serán destinadas a secreción, membrana plasmática o distintas organelas de los sistemas endocítico y exocítico. Una de las modificaciones post-traduccionales más frecuentes, la N-glicosilación, está relacionada con el plegamiento de las proteínas. Numerosas proteínas son incapaces de alcanzar su conformación nativa sin la adición de N-oligosacáridos. Los intermediarios de plegamiento, las proteínas no totalmente ensambladas, las proteínas mal plegadas y los agregados proteicos son selectivamente retenidos en el RE. El transporte hacia los complejos de Golgi se lleva a cabo exclusivamente cuando las proteínas se han plegado correctamente y se han ensamblado los multímeros. Este importante fenómeno, que asegura la integridad funcional de las proteínas que salen del RE,ha sido denominado "control de calidad". En el caso de las glicoproteínas, la estructura y el grado de procesamiento de sus N-oligosacáridos resulta ser una señal para la retención en el RE o el transporte hacia los complejos de Golgi. La N-glicosilación de proteínas comienza en la mayoría de las células eucariotas, con la transferencia de un oligosacárido de estructura Glc3Man9GlcNAc2 desde un intermediario lipídico (dolicol-P-P-oligosacárido), a cadenas polipeptídicas nacientes en el lumen del RE.Sin embargo la Glc no es un componente normal de las N-glicoproteínas maduras. Inmediatamente luego de la transferencia, los residuos de Glc son removidos por las glucosidasas I (GI) y II (GII). Los N-oligosacáridos libres de Glc son reglucosilados transitoriamente por la UDPG-Glc:glicoproteína glucosiltransferasa (GT)y deglucosilados posteriormente por la GII. De acuerdo al modelo actualmente aceptado, la calnexina (CNX), la calreticulina (CRT), la GII y la GT intervienen en el control de calidad de plegamiento de glicoproteínas en el RE. A medida que las glicoproteínas van adquiriendo sus conformaciones nativas, alternan entre formas no glucosiladas y monoglucosiladas por efecto de las actividades catalíticas opuestas de la GII y de la GT. Las dos chaperonas moleculares no convencionales con propiedades de lectinas, CNX y CRT, que reconocen exclusivamente N-oligosacáridos monoglucosilados, unirían glicoproteínas en proceso de plegamiento o incorrectamente plegadas, reteniéndolas en el RE. Los ciclos de deglucosilación y reglucosilación continuarían hasta que el plegado correcto de las glicoproteínas se haya completado. Cuando las mismas adoptan su conformación nativa, se convertirían en sustrato de la GII, pero no de la GT, y se liberarían de las lectinas. Las glicoproteínas bien plegadas continuarían su camino por la vía secretoria hacia su destino mientras que las que se encuentran en proceso de plegamiento, serían retenidas en el RE y eventualmente translocadas al citoplasma para ser degradadas en el proteasoma. ' En este ciclo la GT funcionaría como un sensor del estado conformacional de las glicoproteínas, marcándolas o no con el residuo de Glc que determinará su unión a CNX o CRT. La GT fue purificada a homogeneidad a partir de Drosophila melanogaster,Rattus norvegicus y Schizosaccharomyces pombe,y demostró ser una proteína soluble del RE que depende de Ca2+ para su actividad y que utiliza UDP-Glc como dador de Glc. En cuanto a la glicoproteína aceptora, en un ensayo libre de células, ésta debe estar desnaturalizada para funcionar eficientemente como aceptor. La enzima reconoce el residuo más interno de GlcNAc de los N-oligosacáridos, y amino ácidos hidrofóbicos expuestos en las conformaciones no nativas de las glicoproteínas sustrato. Experimentos presentados en este trabajo de tesis demuestran que: (a) la GT de S. pombe es una enzima conformada por dos dominios: el dominio C-terminal (400 amino ácidos, altamente conservados entre GTS, 20% de la molécula), responsable de la interacción con UDP-Glc; y el dominio N-terminal (1100 amino ácidos, pobremente conservados entre GTs, 80% de la molécula) posiblemente responsable de la interacción de la GT con amino ácidos hidrofóbicos, confiriéndole a la enzima especificidad por glicoproteínas no totalmente plegadas. La unión entre ambos dominios se puede clivar proteolíticamente, pero ellos interaccionan a través de uniones no covalentes y no pueden separarse sin pérdida de la actividad enzimática. Esto explicaría el porqué la GT solo glucosila N-oligosacáridos muy cercanos al sitio mal plegado de la parte proteica (ver Discusión). Esta estructura de dos dominios está conservada desde levaduras a eucariotes superiores. (b) Los dominios N-terminal y C-terminal correspondientes a la GT de S. pombe, expresados separadamente en una misma célula S. pombe GT pueden formar una enzima activa y ser capaces de transferir Glc a glicoproteínas mal plegadas. (c) Los dominios N-terminal y C-terminal correspondientes a GTS de distintas especies, resultan ser intercambiables. (d) El dominio C-terminal correspondiente a la GT de S. pombe requiere la presencia del dominio N-terminal para plegarse correctamente y formar un complejo biológicamente activo, y/o para ser estable en el lumen del RE.

Abstract:
The endoplasmic reticulum (ER)is the intracellular location responsible for post-translational modifications and proper folding of proteins bound for secretion, the plasma membrane or organelles of the endocytic system. N-glycosylation is one of the most frequent post-translational modifications and is related to protein folding, as many species are unable of properly fold without N-glycan addition. Folding intermediates, incompletely assembled oligomers, misfolded proteins and aggregates are selectively retained in the ER. Transport to Golgi compartments takes place only if proteins are in their native conformations and properly assembled. The mecanism that ensures the functionality of proteins that exit the ER, is the so called "quality control" (QC) of glycoprotein folding. For glycoproteins, the structure and processing degree of the N-oligosaccharides appeared to be a signal for the retention or transport to the Golgi complex. In most eukariotic cells, N-glycosylation is initiated upon oligosaccharide (Glc3Man9GlcNAc2)transfer from a lipid-carrier (dolichol diphosphate) to nascent proteins in the ER lumen. However, the Glc unit is not usually found in folded glycoproteins. The three Glc residues of the transferred oligosaccharide are immediately trimmed by two ER resident enzymes, glucosidases I and II (GII). The Glc-free N-linked oligosaccharides are then transiently reglucosylated by the UDP-Glc:glycoprotein glucosyltransferase (GT)and further deglucosylated by GII. According to a currently accepted model, calnexin (CNX), calreticulin (CRT), GII and GT are involved in the ER glycoprotein-specific folding and QC. As glycoproteins acquiere their native conformations, they switch between nonglucosylated and monoglucosylated forms by the opposing activities of GII and GT. CNX and CRT are lectins that specifically bind monoglucosylated high mannose-type oligosaccharides in newly synthesized glycoproteins. The lectin-monoglucosylated glycoprotein interaction retains not properly folded or assembled species in the ER. The deglucosylation and reglucosylation cycle continues until proper folding is achieved. Once glycoproteins have adopted their mature, fully folded conformations, they are no longer recognized by GT. Subsequent GII-mediated deglucosylation liberates them from their lectin anchors, thus allowing properly folded species to continue their maturation along the secretory pathway. In addition, the lectin-glycoprotein interaction enhances folding efficiency by preventing aggregation, premature' oligomerization and incorrect disulfide bond formation. GT is the key element of the QC mechanism as it is the only element discriminating between glycoprotein conformations. GT was purified to homogeneity from Drosophila melanogaster, Rattus norvegicus and Schizosaccharomyces pombe. The enzyme is a soluble ER protein that has an absolute requirement of millimolar Ca2+ concentrations for activity and uses UDPGlc as sugar donor. In cell-free assays GT glucosylates glycoproteins only if the Noligosaccharides are linked to a polypeptide backbone displaying a non-native conformation. It has been proposed that GT senses the exposure of hydrophobic regions normally buried in native conformations. GT sequence analysis suggests that it is composed of two domains, the N-terminal that comprises 80% of the molecule, has no homology to other known proteins and is presumably involved in recognition of non-native conformers and the C-terminal or catalytic domain that binds UDP-Glc homologs and displays a similar size and significant homology to members of glycosyltransferase family 8. Here we show that N- and C-terminal domains from either R. norvegicusor S. pombe GTS remained tightly but not covalently bound upon mild proteolytic treatment and could not be separated by a variety of different procedures without loss of enzymatic activity. Further, the notion of a two domain protein was reinforced by the synthesis of an active enzyme on transfection of S.pombe GT null mutants with two expression vectors, each of them encoding one of both domains. The tight association between N- and C-terminal domains may explain why N-glycans in the close proximity to protein structural perturbations are preferentially glucosylated by the enzyme. In spite of displaying practically no homology with S. pombe N-terminal domain (15.5-16.3%),the same portions from R. norvegicus and D. melanogaster enzymes linked to the C-terminal domain of yeast GT were functionally active when expressed in S. pombe thus indicating that all N-terminal domains share a common role. No functional enzyme was obtained on expression of the C-terminal domain, thus reinforcing the idea that the N-terminal domain is responsible for recognition of non-native conformers.

Guberman, Alejandra Sonia. "Represión de la expresión génica mediante el secuestro de un coactivador : Transducción de la señal y elementos involucrados en la regulación ejercida por ésteres de forbol sobre el promotor del gen 5-aminolevulinato sintetasa" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los factores de transcripción AP-1 (Activation protein-1) son genes tempranos involucrados en gran diversidad de procesos regulatorios. El éster de forbol 12-O-tetradecanoilforbol- l3-acetato (TPA) es utilizado habitualmente para inducir la actividad de AP-1 y proteinquinasa C (PKC). El propósito de este trabajo es explorar los mecanismos moleculares involucrados en la regulación por TPA de la expresión del gen de 5-aminolevulinato sintetasa (ALAS), la primer enzima y determinante de velocidad de la biosíntesis de hemo. Análisis previos de la secuencia 5’ flanqueante revelaron la existencia de dos elementos de respuesta a cAMP (CRE) requeridos para la expresión basal y estimulada por CAMP. El fragmento —833a +42 en la región 5’flanqueante del gen de ALAS de rata, fue subclonado en un vector con el gen reporter cloranfenicol acetiltransferasa (CAT). El vector de expresión, pALAS/CAT, produjo una significativa actividad CAT en células de hepatoma humano HepG2 transfectadas transientemente, que fue reprimida por TPA. Mediante análisis de secuencias y deleciones dctectamos un elemento de respuesta a TPA (TRE), localizado entre —261 y -255 que según establecimos por mutagénesis, es crítico para la regulación por TPA. Demostramos que c-Fos, c-Jun y JunD están involucrados en el efecto inhibitorio por su habilidad de interactuar con TRE-ALAS, como evidenciamos por análisis de supershift y su capacidad para reprimir la actividad del promotor en ensayos de transfección. Demostramos la participación de componentes de diferentes vías de señalización. Se encuentran involucradas la isoforma α de la PKC, la fosfatidilinositol 3-quinasa (PI3K), la quinasa regulada por señales extracelulares (ERK 1/2) y la quinasa N-terminal de c-Jun (JNK). Asimismo, presentarnos a la quinasa p90RSK2 como un posible punto de convergencia de las vías de PI3K y ERK. Mediante sobreexpresión de CBP (CRE protein binding protein) o p300, se bloqueó significativamente la represión por TPA o sobreexpresión de Fos/Jun, de la actividad del promotor de ALAS. Por otra parte, cuando el sitio TRE se ubicó en diferente contexto con respecto a los sitios CRE, éste se comportó como un enhancer de la transcripción. Proponemos que la disminución en la actividad basal del promotor de ALAS en presencia del TPA puede reflejar una disminución en la capacidad del promotor de ensamblar un complejo de pre-iniciación eficiente, debido al secuestro de CBP, por parte de AP-1. Asimismo, sugerimos que las propiedades transcripcionales del sitio TRE serian dependientes de la disposición espacial, con respecto a los sitios CRE.

Abstract:
Activation protein -1 (AP-1) transcription factors are early response genes involved in a diverse set of transcriptional regulatory processes. The phorbol ester 12-O-tetradecanoylphorbol- l3-acetate (TPA) is often used to induce AP-1 and PKC activity. The purpose of this work is to explore the molecular mechanisms involved in the TPA regulation of 5-aminolevulinate synthase (ALAS) gene expression, the first and rate-controlling step of the heme biosynthesis. Previous analyses of the 5’-flanking sequence of ALAS revealed the existence of two camp response elements (CRE) required for basal and cAMP-stimulated expression. The fragment —833 to +42 in the 5’-flanking region of rat ALAS gene, was subcloned into a chloramphenicol acetyltransferase (CAT) reporter vector. The expression vector, pALAS/CAT, produced a significant CAT activity in transiently transfected HepG2 human hepatoma cells, which was repressed by TPA. Sequence and deletion analyses detected a TPA response element (TRE), located between —261 and —255 (TRE-ALAS), critical for TPA regulation, as we established by mutagenesis. We demonstrated that c-Fos, c-Jun, and JunD are involved in TPA inhibitory effect due to their ability to bind TRE-ALAS evidenced by supershift analyses and their capacity to repress promoter activity in transfection assays. We demonstrated the participation of components of different signaling pathways. The α isoform of proteinkinase C (α PKC), phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K), extracellular signal regulated kinase (ERK 1/2) and c-Jun N-terminal kinase (JNK) are involved. The p90RSK2 is presented as a putative convergence point of the P13K and ERK pathways. Repression of ALAS promoter activity by TPA-treatment or Fos/Jun overexpression was largely relieved when CRE protein binding protein (CBP) or p300 was ectopically expressed. When the TRE site was placed in a different context with respect to CRE sites, it appeared to act as a transcriptional enhancer. We propose that the decrease in ALAS basal activity observed in the presence of TPA may reflect a lower ability of this promoter to assemble the productive pre-initiation complex due to CBP sequestration. We also suggest that the transcriptional properties of this AP-1 site would depend of a spatial-disposition-dependent manner with respect to the CRE sites.

García, Graciela Viviana. "Estudio de los estados de agregación de reactivos organolíticos y de sus mecanismos de reacción : Desarrollo de secuencias "TANDEM" en síntesis orgánica" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Los compuestos organolíticos son seguramente los intermediarios organometálicos más utilizados en síntesis orgánica, y además presentan estructuras de agregación fascinantes tanto en estado sólido como en solución, que le otorgan un rol protagónico en las reacciones en las que intervienen. Se realizó un estudio detallado sobre la reacción de adición de reactivos organolíticos a compuestos carbonílicos α,β-insaturados. La misma resultó fuertemente dependiente de las condiciones de reacción, por un estudio cuidadoso de las distintas variables, descubrimos que pueden modificarse de manera tal de transformar a esta reacción en una original secuencia tandem de adición-β-litiación-sustitución electrofílica que constituye una excelente metodología one pot para la síntesis de dihidrochalconas β-sustituidas con muy altos rendimientos. Con el objetivo de esclarecer el/los mecanismos de esta nueva secuencia se realizaron estudios detallados de distintas condiciones de reacción, uso de diversos reactivos y compuestos organolíticos. Los pasos principales se verificaron por aislamiento y caracterización de los intermediarios de reacción, estudios de intercambio isotópico, uso de atrapadores radicalarios y espectroscopía de RMN de mezclas de reacción. Estas investigaciones fueron de gran significación para un mayor conocimiento de la naturaleza de intermediarios y mecanismos de reacción que involucran reactivos organolíticos y para su aplicación en síntesis orgánica. Por otro lado, se sintetizó un rápido radical clock para estudiar eI mecanismo para el intercambio litio-halógeno entre compuestos organolíticos y haluros orgánicos. Los resultados obtenidos permitieron plantear un mecanismo de reacción y explorar las utilidades sintéticas de la misma. La caracterización completa del intermediario permitió la propuesta de una útil ciclización aniónica. Así, se diseñó una estrategia que permite la síntesis de 2,3-dihidrobenzofuranos sustituidos basada en una secuencia tandem de ciclización-γ-alquilación a partir de 2-bromofenil (E)-3-fenil-2-propenil éter.

Abstract:
The organolithium compounds are the most used organometallic intermediates in Organic Synthesis. These reagents have fascinating aggregation structures in both, solid state and solution, that play a key role in their reactivity. A thorough study of the addition reaction of organolithium reagents to α,β-unsaturated carbonyl compounds was carried out. The reaction resulted strongly dependent on the reaction conditions, which can be modificated to transform it in one original tandem sequence of addition-β-lithiation-electrophilic substitution. This sequence constitutes an excellent “one-pot" methodology for the synthesis of β-substituted dihydrochalcones in very high yields. In order to elucidate the reaction mechanism, studies of the reaction under different conditions, use of diverse reactives and organolithium compounds were then carried out. Isolation and characterisation of reaction intermediates, isotopic exchange, use of radical traps and NMR spectroscopy confirmed the key steps. These investigations were of relevance to get more insight into the nature of the intermediates and the mechanisms of reactions where organolithium reagents are involved. In addition, fast radical clocks were synthesized to study the mechanism of the lithium-halogen exchange between organolithium compounds and organic halides. The results allowed to postulate a reaction mechanism and investigate the synthetic utility. The full characterization of the intermediate allowed the proposal of a useful anionic cyclization. Thus, a new strategy for the synthesis of substituted 2,3-dihydrobenzofurans was designed, which is based in a tandem sequence of cyclization-γ-alkilation from 2-bromophenyl (E)-3-phenyl-2-propenyl ether.

Gamberale, Romina. "Regulación de la sobrevida de los linfocitos B de Leucemia Linfática Crónica : papel de los receptores para el fragmento Fc de la IgG" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La leucemia linfática crónica de células B (LLC-B) se caracteriza por la progresiva acumulación de linfocitos B clonales, que presentan muy baja tasa proliferativa y resistencia a morir por apoptosis. El objetivo de este trabajo de Tesis fue investigar el papel que cumplen los leucocitos no-malignos como posibles reguladores de la apoptosis de las células leucémicas. Por otro lado, considerando que las células LLC-B expresan receptores para el fragmento Fc de la IgG (RFCγ)y que es frecuente la presencia de complejos inmunes (Cl) en el suero de los pacientes, se analizó el papel de los RFcγ en la modulación de la sobrevida de las células leucémicas. Los resultados obtenidos demuestran que los monocitos y las células NK son capaces de prolongar la sobrevida de las células leucémicas en cultivo a través de distintos factores, tanto solubles como de contacto celular. Para tratar de identificar la producción de alguno de ellos se realizaron cultivos en presencia de anticuerpos neutralizantes anti-IFNγ,anti-IL-4 y anti-IL-10, encontrándose una marcada heterogeneidad entre los distintos pacientes evaluados. La misma variabilidad de respuesta se obtuvo al bloquear la interacción de CD40 con su ligando mediante anticuerpos anti-CD40. En conjunto, estos resultados sugieren que la capacidad de los monocitos y las células NK de favorecer la sobrevida de las células leucémicas depende de una sumatoria de señales que parecen ser particulares de cada paciente. Cuando los cultivos de células LLC-B y leucocitos accesorios se llevaron a cabo en presencia de Cl fue posible no sólo inhibir la apoptosis espontánea sino también la inducida agentes quimioterápicos como la fludarabina, el clorambucilo y la dexametasona. Es decir, que la activación de monocitos y células NK por entrecruzamiento de sus RFCγ estaría favoreciendo la acumulación del clon leucémico. Teniendo en cuenta que las células LLC-B sobre expresan la proteína antiapoptótica Bcl-2 y que la expresión de la misma se inhibe a medida que progresa la apoptosis ¡n vitro, se examinaron los niveles de Bcl-2 en las células leucémicas cultivadas con o sin leucocitos accesorios. Los resultados indican que la presencia de monocitos y células NK retarda la down-regulación de Bol-2 en las células leucémicas. Por el contrario, cuando la inhibición de la apoptosis de las células LLC-B se da a consecuencia de la activación de los leucocitos accesorios por Cl , el bol-2 no parece estar involucrado. La última parte de esta Tesis comprende el estudio de la expresión y funcionalidad de los RFcγ expresados por las leucémicas. Los datos presentados demuestran que las células B-CLL expresan no sólo el RFcγIIb característico de las linfocitos B normales, sino también la isoforma RFcγIIa. Debido a que portan dominios ITAM en su porción citoplasmática. los RFCγIIa transducen señales de activación. Sin embargo, ni la utilización de distintos tipos de Cl, ni el entrecruzamiento selectivo de los RFCγIIa logró inducir la activación de las células LLC-B, medida como cambios en los flujos de calcio. Tampoco fue posible modular la apoptosis en las Leucémicas purificadas, Lo que sugiere que este receptor no seria funcional en LLC-B.

Abstract:
B cell chronic lymphocytic leukemia (B-CLL) is characterized by the progressive accumulation of clonal B lymphocytes caused by defects in programmed cell death rather than increased proliferation. The aim of the current Thesis was to investigate the role of non-malignant leucocytes in the regulation of B-CLLcells apoptosis. On the other hand, considering that leukemic cells express receptors for the Fc fragment of IgG (FCγR) and the presence of immune complexes (IC) is frequently found in B-CLL patients, we analized whether IC could modulate leukemic cells survival. Our results show that monocytes and NK cells were able to prolong the survival of cultured leukemic cells through different factors, not only soluble factors, but also cell-cell interactions. In an attempt to determine which are the factors involved in the protective effect mediated by accessory leukocytes, we performed cultures in the presence of neutralizing antibodies (Ab) directed to IL-4, IFNγ or IL-10, as well as blocking Ab to CD40. We found a marked heterogeneity among different patients, suggesting that the mechanisms involved in the regulation of apotosis might differ among B-CLL samples. In addition, it is conceivable that an array of factors rather than a single factor may account for the protective effect exerted by monocytes and NK cells. The anti-apoptotic effect was also observed when B-CLL cells and non-malignant Ieukocytes were cultured in the presence of immune complexes (IC). In this case, IC were able to inhibit,not only spontaneous apoptosis, but also the one induced by different chemotherapeutic agents, like fludarabine, chIorambuciI or dexamethasone. Thus, the activation of monocytes and NK cells by their FcγR crosslinking, may favor the accumulation of the leukemic clone. Taking into account that B-CLL cells over express the anti-apoptotic protein Bcl-2 and its expression was inhibited in vitro during the culture, we analized the expression of Bcl-2 in leukemic cells cultured with or without accessory leukocytes. Our results showed that the presence of monocytes and NK cells delays Bcl-2 down-regulation. However, when the cultures were done with IC, Bcl-2 seems not to be involved in the protective effect exerted by accessory cells. The last part of the current Thesis involves the study of the expression and functionality of FCyRexpressed by leukemic cells. We here present that B-CLL cells express no only FcγRIIb,found on normal B cells, but also FcγRIIa. which have ITAM domains related to activating signals. Surprisingly, neither the IC interaction with FeyRs on B-CLL cells, nor the FCγRIIa crosslinking with specific Ab, could modulate leukemic cells apoptosis or activation, measured by calcium mobilization. Our results suggest that FcγRIIa expressed on B-CLL cells may not be functional.

Gallo, Mariana. "Desarrollo de oligonucleótidos modificados químicamente con potencial aplicación en terapia génica" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Dentro del campo de la Terapia Génica, el concepto de oligonucleótidos como potenciales agentes terapéuticos ha ganado credibilidad y atención. El fundamento de la estrategia antisentido consiste en inhibir selectivamente la expresión de un determinado gen, impidiendo asi la producción de una dada proteína mediante la acción de un oligonucleótido de secuencia complementaria al ARN mensajero que codifica para esa proteina. Dentro de este enfoque, las ribozimas, moléculas de ARN con una secuencia de bases y una estructura tridimensional definidas y que presentan actividad enzimática, aparecen como una alternativa interesante, ya que permiten incorporar a la acción antisentido de los oligonucleótidos su actividad catalitica. Debido a que los oligonucleótidos son degradados rápidamente por nucleasas presentes tanto en suero como intracelularmente, surge la necesidad de modificados químicamente, lo cual permite obtener drogas con tiempos de vida medio adecuados. En el caso particular de las ribozimas y otros análogos de ARN, es importante que las modificaciones introducidas no afecten los requerimientos estructurales para la actividad o función particular de estas moléculas. Entre las diversas modificaciones desarrolladas, las modificaciones en la posición 2’ demostraron ser de utilidad. La presencia del hidroxilo-2’ probó ser de suma importancia en determinadas posiciones para el correcto plegamiento de las moléculas de ARN. Debido a que ninguna de las modificaciones desarrolladas en la posición 2' mantiene esta función, la utilización de una nueva generación de oligonucleótidos modificados en la posición 2' del azúcar que conserven esta función resulta atractiva y prometedora para el diseño de ribozimas estables en medios biológicos. Aquí se propone, por lo tanto, una nueva clase de nucleótidos modificados, los 2'—C-metilnucleótidos, potencialmente útiles para ser incorporados en determinadas posiciones de análogos de ARN resistentes a la degradación por nucleasas. Se espera que cuando un 2'—C-metilnucleótido sustituya un ribonucleótido particular proveerá un hidroxilo-2' disponible para reproducir las interacciones terciarias del ARN; mientras que la presencia del metilo, brindará resistencia a la degradación mediada por nucleasas. En este trabajo, se sintetizó la 2'—C-metiluridina siguiendo una ruta estereoselectiva, así como también, la fosforamidita adecuada para la sintesis automatizada de oligonucleótidos, incluyendo la protección regioselectiva del grupo hidroxilo-2'. Asimismo, se realizó un estudio confonnacional de la 2'-C-metiluridina en solución por RMN y se comparó con resultados obtenidos por cálculos computacionales. Los resultados mostrarón que la conformación preferida de este nucleósido es la misma que la de la uridina natural, con lo cual ambas moléculas posicionarían el hidroxilo-2' con la misma orientación. Con el fin de ensayar la hipótesis de la aplicabilidad de la nueva modificación, se eligió como modelo biológico la ribozima cabeza de martillo. Un estudio preliminar usando modelado molecular sugirió que la introducción de estos monómeros en las posiciones de esta ribozima para las cuales se había detectado que sus hidroxilos-2' tenían interacciones de orden terciario no parecía afectar la conformación global de la ribozima, excepto en una posición particular. La 2'-C—metiluridina fue, entonces, introducida en ribozimas cabeza de martillo dirigidas contra la región 5'-lider/gag del virus HIV-1 en las posiciones de la uridina del core catalítico cuyos hidroxilos-2' demostraron ser importantes. Las ribozimas resultaron ser activas y tener una incrementada estabilidad frente a nucleasas. Tambien se midió la afinidad por hebras complementarias de DNA y de RNA de oligodesoxinucleótidos conteniendo uridina, la nueva modificación o la (2’S)-2'-desoxi-2’-C-metiluridina.

Abstract:
Oligonucleotides have gained credibility and attention as potential therapeutic agents based on the gene therapy principle. The fundament of the antisense strategy consists in the selective inhibition of the gene expression by means of an oligonucleotide carrying a complementary sequence to that of the mRNA that codifies for the target protein. In particular, ribozymes, RNA molecules with a defined sequence and three-dimensional structure that show enzymatic activity; appear as an interesting alternative, due to the fact that they combine the antisense action with a catalytic activity. Since oligonucleotides are rapidly degraded by nucleases present both, in serum and intracellularly, it is mandatory to chemically modify them in order to obtain drugs with proper half life times. In the case of ribozymes and other RNA analogues, additional structural requirements must be taken into account in order to preserve activity or a particular function. Among the modifications developed so far, those involving the 2'-position proved to be useful, but they lack the 2'-hydroxyl group. The presence of this function showed to be of great importance for the correct folding of RNA molecules. Therefore, the development of a new generation of 2'-modified oligonucleotides carrying the 2'-hydroxyl is a promising alternative for the design of resistant ribozymes. Having in mind this goal, a new kind of analogues is proposed in this work, the 2'-C-methylnucleotides. They are expected to be potentially useful for generating RNA mimics resistant to the degradation by nucleases. This assumption is based on the hypothesis that when a 2'-C-methylnucleotide substitutes a particular ribonucleotide, it will provide a 2'-hydroxyl group available for reproducing RNA tertiary interactions; and additionally, the presence of the 2’methyl group will bring resistance to degradation mediated by nucleases. The 2'-C-methyluridine was syntehsized by a stereoselective strategy, the 2'-hydroxyl group was regioselectively protected and the corresponding phosphoramidite for solid phase synthesis of oligonucleotides was prepared. In addition, a conformational study of the 2'-C-methyluridine in solution was carried out by RMN techniques and these data were compared with those obtained by computational calculations. The results showed that the preferred sugar conformation of this nucleoside is the same than the one adopted by the natural uridine, and therefore, it is expected that both molecules will position the 2'-hydroyl group with the same orientation. With the aim of testing our hypothesis, the new monomer was introduced in the catalytic core of a hammerhead ribozyme in those positions where the 2'-hydroxyl group showed to be important for the activity. The ribozymes were targeted against the 5'-lider/gag region of the HIV-1. The modified ribozymes were active in vitro and displayed an increased resistance to nucleases. The affinity for RNA and DNA complementary sequences of oligonucleotides containing the new modification and the (2'S)-2'deoxy-2'-C-methyluridine is also reported.

Furlong, Laura Inés. "Caracterización bioquímica y molecular de los sitios de unión a zona pellucida presentes en proacrosina humana" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El presente trabajo tuvo como objetivo estudiar el rol de la proteina espermática humana proacrosina/acrosina como molécula de adhesión a las glicoproteínas de la zona pellucída (ZP). En una primera etapa, se llevó a cabo un análisis bioinformático sobre la secuencia aminoacídica de proacrosina con el propósito de identificar sitios potenciales de unión a glicoproteínas de la ZP. El resultado de este análisis reveló que los residuos Lys74. Lys169, Arg172, Arg199, Arg249, Lys251, Arg252 y la secuencia KRLQQKLIE, localizada entre los residuos 367-374, conformarían sitios potenciales de unión a la ZP. A continuación se realizaron experimentos para evaluar la interacción entre proacrosina/acrosina con glicoproteínas de la ZP. Para ello se desarrolló una estrategia de subclonado del ADNc de proacrosina humana en vectores de expresión procariotas (pET-22b, pGEX-3X) para la expresión de proacrosina recombinante. Utilizando el sistema de expresión en forma directa (pET-22b) se obtuvo un producto de expresión recombinante correspondiente a la proenzima (Rec-40), y productos truncados del extremo N-terminal de la proteína (Rec-30, Rec-20, Rec-10). Estas proteinas fueron caracterizadas mediante la utilización de anticuerpos especificos y análisis de secuenciación de aminoácidos, determinándose que Rec-30 correspondería a los residuos 1-300, Rec-20 a 1-190 y Rec-10 a 1-160 de proacrosina humana. Utilizando el mismo sistema de expresión se sintetizó un producto de expresión correspondiente a los residuos 1-59 de proacrosina (Rec-6). Los productos de expresión, obtenidos como cuerpos de inclusión, fueron solubilizados y aislados mediante electroforesis preparativa. El estudio de la interacción entre proacrosina/acrosina recombinante y las glicoproteínas de la ZP se llevó a cabo utilizando ensayos de unión en fase sólida ("Ligand blot", "Dot blot", ensayo en placa de poliestireno). Se utilizaron glicoproteínas obtenidas de ovocitos humanos de descarte de programas de fecundación in vitro, así como glicoproteínas obtenidas por expresión en células CHO a partir del ADNc (rec-hZPA, rec-hZPB, rec-hZPC). El resultado de estos estudios indicó que proacrosina recombinante (Rec-40) y fragmentos del extremo N-terminal de la proteína (Rec-30, 20 y 10) tienen capacidad de unión a glicoproteínas de la ZP y a azúcares. Las glicoproteínas de la ZP mostraron diferente capacidad de unión a proacrosina/acrosina, siendo hZPA el ligando principal. El mecanismo de unión involucraría interacciones electrostáticas entre aminoácidos cargados positivamente en proacrosina/acrosina, y oligosacáridos sulfatados en la ZP, así como el reconocimiento de residuos de fucosa y manosa presentes en los oligosacáridos de la ZP. El resultado del mapeo de los sitios de unión en la molécula de proacrosina permite proponer que éstos estarían localizados en dos regiones de la proteína. Una región estaría comprendida entre los residuos 59-160 (Dominio II), y otra entre los residuos 300-402 (Dominio III). Los sitios de unión localizados en el Dominio II de la proteina estarían estabilizados por uniones no covalentes y puentes disulfuro, mientras que los sitios localizados en el Domino II estarían estabilizados por interacciones no covalentes, y tendrían una contribución principal a la afinidad de la interacción. En dichas regiones, los residuos Lys74, Lys108, Lys114 y el motivo KRLQQKLIE (residuos 367-374), identificados mediante el análisis de secuencias, participarían en la interacción con glicoproteinas de la ZP y azúcares. En resumen, este trabajo muestra que proacrosina/acrosina humana presenta La capacidad de reconocer glicoproteinas de la ZP. de manera independiente de la actividad de proteasa. Esto permite proponer que proacrosina/acrosina participaría como molécula de adhesión en la unión secundaria del espermatozoide a la ZP en el humano.

Freire, Eleonora. "Estructura de compuestos de coordinación conteniendo oxoaniones de azufre y metales de transición" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo original de este trabajo fue la preparación, caracterización y determinación de las estructuras cristalinas de nuevos compuestos de coordinación de metales de transición con el ion tiosulfato y moléculas orgánicas nitrogenadas como ligandos. Entre estas últimas, el estudio se centró particularmente en aquellas que actúan como ligandos polidentados a través del nitrógeno como átomo donor (bipiridina, terpiridina, fenantrolina y otros). Los oxoaniones de azufre son buenos ligandos de metales de transición. El ion tiosulfato (S2O32-) en particular, había sido poco estudiado al momento de comenzar de este trabajo. La presencia en su estructura de átomos donores "duros" y "blandos", de acuerdo con la clasificación de Pearson, hace que pueda coordinarse a una amplia gama de iones metálicos mostrando una gran versatilidad en sus modos de coordinación. Prueba de ello es que entre los veintidós compuestos estudiados, se encontraron además de las coordinaciones más esperables (monodentado a través del azufre y bidentado por azufre y oxígeno) otras no reportadas anteriormente donde el anión se presenta como polidentado y puente, utilizando para tal fin el azufre y/o los oxígenos. En muchos casos la coordinación afecta muy significativamente los parámetros estructurales del anión (distancias y ángulos) corroborando lo encontrado en estudios anteriores. En algunos casos particulares (Ni(II) y Mn(II) como cationes, biquinolina y terpiridina ligandos orgánicos), además de obtenerse complejos con el ión tiosulfato se produjeron reacciones colaterales tipo redox que llevaron a la formación de especies del tipo 2'con n 2 ó 3. El estudio de este nuevo grupo de compuestos, que no es muy común en la literatura, permitió ampliar el objetivo inicial del trabajo. En todos los casos, se estudiaron las propiedades y caracteristicas de los ligandos poliatómicos intervinientes en lo que hace tanto al tipo de unión como a los eventuales efectos debidos a la coordinación, aportando abundante información sobre un terreno hasta el momento poco explorado. El estudio estructural incluyó el análisis de los poliedros de coordinación, así como el de las fuerzas secundarias determinantes del empaquetarniento cristalino, tales como las uniones puente hidrógeno y las interacciones tipo van der Waals.

Abstract:
The original aim of the project was the synthesis, characterization and structure determination of novel transition metal coordination compounds with thiosulfate and nitrogenated bases as ligands. Among the latter, we focussed specially in the polydentate ones containing donor nitrogens (bipyridine, terpyridine, etc). Sulfur oxoanions are good ligands for transition metals. The thiosulfate ion (S2O3 2-) in particular, had been scarcely studied at the beginning of this work. As it contains hard and soft donors atoms, according to Pearson classification, it is likely for the anion to coordinate to a wide range of metallic cations displaying a high versatility in its coordination modes. This property was largely confirmed throughout this work: among the twenty two compounds studied, not only the more common coordination modes were found (S-monodentate and S, O bidentate), but also a couple of new ones not already reported in the literature, where the anion acts as polydentate and bridge through sulfur and/or oxygen. In most cases the coordination largely affects the structural parameters of the anion (angles and distances), as already shown in previous works. In the presence of either Ni(II) or Mn(II) as cations, and some of the organic ligands (biquinoline, terpiridine), in addition to the expected thiosulfate complexes, collateral redox reactions led to the formation of 2'species with n = 2 or 3. The study of these new group of compounds, scarce in the literature, allowed us to broaden the initial scope of the work. In all cases, basic knowledge about the properties and characteristics of the polyatomic ligands about bond types and possible modificatíons eventually introduced by coordination was obtained, contributing to a field so far basically unexplored. Besides the structural analysis of coordination polyhedra, secondary coordination forces (van der Waals interactions and hydrogen bonds) which determine the crystal lattice were studied.

Franco, Paula Gabriela. "Rol del ácido retinoico durante la neurogénesis primaria de Xenopus Laevis" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El primer paso para la construcción del sistema nervioso de los vertebrados es la formación de la placa neural. Varios reportes sugieren que la señal retinoide es esencial para el establecimiento normal del patrón neural y la diferenciación neuronal. Aunque se ha progresado mucho en este sentido, quedan aún muchas preguntas sin respuestas para tratar de elucidar el rol que los retinoides juegan durante el desarrollo embrionario. En este trabajo, dentro del contexto de la cascada de la neurogénesis primaria de Xenopus laevis, exploramos la habilidad de los retinoides de regular diferentes pasos de la cascada que lleva a la diferenciación neuronal. Mostramos que el tratamiento con ácido retinoico (RA) produjo un sustancial aumento en el número de neuronas primarias que expresan N-tubulina debido a un incremento de la diferenciación neuronal sin involucrar cambios en la proliferación o muerte celular programada. Las evidencias indican que este efecto se origina en los pasos iniciales de la cascada neurogénica, ya que este tratamiento alteró el balance entre dos genes de prepattern de expresión temprana. Por un lado, se observó inducción de la expresión de Gli3, que promueve el destino neuronal y por otro, inhibición de Zic2, un represor de la neurogénesis. Además, se modificó la expresión de otros marcadores que participan en los pasos intermedios de la cascada como Neurogenina, MyT1 y X-Delta-1. Paralelamente, determinamos que los retinoides reprimen la expresión de sonic hedgehog (shh) en la línea media del embrión tanto en la placa del piso como en la notocorda y establecímos por primera vez un nexo entre shh, el RA y la neurogénesis primaria. En experimentos de rescate fenotípico demostramos que el RA no es capaz de revertir el efecto inhibitorio de shh, Zic2 o una versión costitutivamente activa de Notch (NotchICD) sobre la neurogénesis primaria. Estos resultados, junto con el hecho de que un pulso corto de RA alrededor del comienzo de la gastrulación es suficiente para desencadenar la inhibición de la expresión de shh, sugieren que el RA participa muy tempranamente en la regulación de esta vía. El tratamiento con agonistas y antagonistas selectivos de los receptores de ácido retinoico (RAR) nos permitió, por un lado, confirmar que la activación de los RAR es suficiente para inhibir la expresión de shh e inducir la neurogénesis y por otro, determinar que RARα es necesario in vivo tanto para regular la expresión de shh, como para establecer el patrón normal de neuronas primarias. Mediante una estrategia de dominancia negativa establecimos que el receptor RARα1 es requerido para la correcta regulación de shh, ya que cuando se interfiere con su función, la expresión de shh se desinhibe. Finalmente, el bloqueo específico de la síntesis de RARγ1 por microinyección de un oligo morfolino antisentido produjo un aumento muy marcado de la expresión de shh, sugiriendo que esta isoforma también es necesaria para mediar la regulación negativa que los retinoides ejercen sobre la expresión de shh. Contrariamente, mostramos mediante esta misma estrategia, que el receptor RARα2.2 no es necesario para ejercer in vivo esta regulación. Todos estos resultados en conjunto proveen nuevas evidencias que profundizan la comprensión del rol de los retinoides durante el desarrollo embrionario, en particular durante la neurogénesis primaria y aportan herramientas críticas para ayudar a descifrar los mecanismos moleculares que determinan la construcción en espacio y tiempo de la placa neural.

Abstract:
The first step in making the nervous system of a vertebrate is the segregation of the neural plate. Several reports suggest that retinoid signal is essential for normal neural patterning and neuronal differentiation. Although there was a lot of progress in this way, many questions remain without answers to elucidate the role that retinoids play during development. In this work, inside the context of Xenopus laevis primary neurogenesis cascade, we explored retinoid's ability to regulate different steps of the cascade that lead to neuronal differentiation. We show that retinoic acid (RA) treatment produced a substantial induction in the number of primary neurons that express N-tubulin due to a promotion of neuronal differentiation without involving changes in proliferation or programmed cell death. Evidences indicate that this effect originates in the initial steps of neurogenic cascade, as this treatment altered the balance between two prepattern genes with early expression. By one side, we observed an induction in Gli3 expression, a promotor of neuronal fate and by the other side, inhibition of Zic2, a repressor of neurogenesis. Furthermore, the expression of other markers that participate in the intermediate steps of the cascade, as neurogenin, MyT1 and Delta-1, was also modified. At the same time, we determined that retinoids repressed sonic hedgehog (shh) expression in the embryo midline, both in the floor plate as well as in the notochord and we established for the first time a link between shh, RA and primary neurogenesis. In phenotypic rescue experiments, we show that RA is not capable to reverse the inhibitory effect caused on primary neurogenesis by shh, Zic2 or a constitutively active form of Notch (Notch ICD). These results, together with the fact that a short RA pulse near the beginning of gastrulation is sufficient to inhibit shh expression, suggest that RA participate very early in the regulation of these processes. The treatment with selective agonists and antagonist of RA receptors (RAR) allowed us, first, to confirm that RAR activation is sufficient to inhibit shh expression and to induce neurogenesis, and second, to determine that RARα is required for proper shh regulation, as when we interfered with its function, shh inhibition was lost. Finally, the specific blockade of RARγ1 synthesis, by microinjection of a morpholino antisense oligo, produced a great induction of shh expression suggesting that this isoform is also necessary to mediate the negative regulation that retinoids exert over shh expression. On the contrary, we showed by the same strategy, that RARα2.2is not required for this regulation in vivo. All these results together, provide new evidences to understand the role that retinoids play during development, particularly during primary neurogenesis and contribute with critical tools to decipher the molecular mechanisms that lead to neural plate construction in space and time.

Fracchia, Sebastian. "Hongos saprotrofos del suelo como microorganismos auxiliares de micorrización" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La formación de micorrizas arbusculares se puede ver afectada por distintos factores bióticos y abióticos. Entre los primeros se encuentran los diferentes microorganismos del suelo que pueden tener efectos inhibitorios, neutros o positivos sobre el establecimiento y posterior desarrollo de la simbiosis. Los hongos saprótrofos del suelo que habitan en la rizósfera de plantas susceptibles, interaccionan con los hongos formadores de micorrizas arbusculares (hongos MA) en forma diversa. Existe un gran potencial en aquellas cepas de hongos saprótrofos que interactúan en forma sinérgica con la formación y desarrollo de esta simbiosis. Coínoculando cepas seleccionadas junto a los hongos MA en plantas hospedantes de interés agronómico favorecería una más rápida colonización de las raíces y una mejora en la bioprotección y nutrición del vegetal. Por otro lado la detección de cepas con efectos inhibitorios sobre la formación de la simbiosis permitiría tener un mayor control sobre la calidad del inóculo de los hongos MA. En el presente trabajo se aislaron 39 cepas de hongos saprótrofos del suelo y se enfrentaron a esporas de Gigaspora rosca. Se seleccionaron dos cepas de hongos saprótrofos, Aspergillus niger y la levadura Rhodotorula mucilaginosa, como los aislamientos más efectivos en la estimulación del desarrollo del micelio a partir de las esporas de Gi. rosea. Se obtuvieron los exudados de ambos hongos saprótrofos y se ensayó su efecto sobre distintas especies de hongos MA, distintas cepas de Gi. rosea y una mezcla de esporas de un suelo cultivado. Con el fin de estudiar la naturaleza del principio activo de ambos exudados, se ensayó la termoestabilidad de los mismos y la diálisis en membranas de distinto tamaño de poro. De acuerdo a los resultados observados, el principio activo no sería el mismo para cada hongo. Se realizó el estudio de la interacción a lo largo de todo el ciclo de vida de Gi. rosea en un sistema especial de crecimiento. El agregado de los exudados de A. niger y R. mucilaginosa produjeron una mayor cantidad de micelio desarrollado a partir de las esporas de Gi. rosea, más del doble número de ápices hifales, mayor número de apresorios sobre las raices de T. repens, mayor porcentaje de micorrización, mayor desarrollo del micelio extrarradical y finalmente una estimulación en la esporulación del hongo MA. La inoculación líquida de los hongos saprótrofos junto al inóculo de Gi. rosea, lO días previos al trasplante de las plantas de T. repens a macetas, resultó la forma más efectiva en la estimulación de la micorrización de las raíces por parte del hongo MA. Esta forma de inoculación resultó ser efectiva para distintas especies de hongos MAy distintos hospedantes de interés agronómico. La inoculación de los hongos saprótrofos en plantas previamente micorrizadas con Gi. rosca no tuvo efectos sobre los valores de micorrización observados al cabo de 9 semanas de crecimiento. El riego con los exudados de A. niger y R. mucilaginosa produjo un aumento en los niveles de micorrización de las raíces de T. repens. En la realización del ensayo del número más probable para hongos MA, se observó un aumento en el número de propágulos de Gi. rosca al inocular los hongos saprótrofos a un inóculo general de dicha cepa. Los dos hongos saprótrofos seleccionados A. niger y R. mucilaginosa pueden considerarse como microorganismos auxiliares de la formación de micorrizas arbusculares.

Abstract:
Arbuscular mycorrhizae formation can be affected by different biotic and abiotic factors. Among the bíotic factors are soil microorganisms, which can inhibit, enhance or have no effect on the stablishment and development of the symbiosis. There are many strains of saprotrophic soil fungi interacting sinergically with the symbiosis that have greate agronomical potential. Dual inoculation of this selected strains and AM fungi of economically important hosts, would favour a faster mycorrhizal formation and a better plant nutrition and bioprotection. On the other hand, the detection of strains with inhibitory effects on the formation of the AM symbiosis would allow a better control on the quality of AM inocula. In this work, 39 strains of saprotrophic soil fungi were isolated and tested against the AM fungi Gigaspora rosca. One strain of Aspergillus niger and one of the yeast Rhodotorula musilaginosa were the most effective stimulating the development of mycelium of Gi. rosea in an in vitro assay. The exhudates of these two fungi were tested in different species of AM fungi and different strains of Gi. rosca. The optimal concentration was 0,25% (VN) for both selected fungi. Dialysis of these exhudates showed that the active compound would be different for each fungus. The interaction study was performed along the whole life cycle of Gi. rosea in a specially design growth system. The addition of exhudates from A. niger and R. musilaginosa induced a higher presymbiotic mycelial growth, number of hyphal tips, entry points on T. repens roots, mycorrhizal colonization, extraradical mycelium development and a final higher sporulation of the MA fungus. Liquid inoculation of saprotrophic fungi with Gi. rosea, lO days before transplanting T. repens seedlings to pots, was the most effective inocultation way for stimulating root colonization in most of AM fungi and host combinations. Inoculation of already mycorrhized plants with saprotrophic fungi, had no effects on the mycorrhizal level observed after 9 weeks of growth. The direct application of exhudates from A. niger and R. mucilaginosa to T. repens inoculated with Gi.rosea, enhanced root colonization of this host. The most probable number assay for AM fungi, showed an increase of the number of Gi. rosea propagules when saprotrophic fungi were added to the general inoculum of the AM fiJngus. Both saprotrophic fungi can be considered as auxiliary microorganisms in the arbuscular mycorrhizal formation.

Fernández Bonder, Julián. "Un problema de frontera libre en teoría de combustión" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta Tesis consideramos el siguiente problema de perturbación singular que se presenta en teoría de combustión Δuᵋ - uᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, ΔYᵋ - Yᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, donde D C Rᴺ+¹, ƒε(s) = 1/ε² ƒ(s/ε) con ƒ una función Lipschitz soportada en (-∞, 1]. En este sistema Yᵋ es la fracción de masa de algún reactante, uᵋ la temperatura rescalada de la mezcla y ε es esencialmente el inverso de la energía de activación. Este modelo es derivado en el contexto de la teoría de llamas premezcladas equidifusionales para número de Lewis 1. Probamos que, bajo hipótesis adecuadas sobre las funciones uᵋ e Yᵋ, podemos pasar al límite (ε → 0) — llamado límite de alta energía de activación — y que la función límite u = lim uᵋ = lim Yᵋ es una solución del siguiente problema de frontera libre (P) Δu - ut = 0 en {u>0} │Vu│ = √2M(x,t) en ∂{u>0} en un sentido puntual en los puntos regulares de la frontera libre y en el sentido de la viscosidad. En (P), M(x,t) = ƒ¹̠w˳(x,t) (s+w˳(x,t))ƒ(s)ds y -1 < w˳= limε→0 Yᵋ-uᵋ/ε. Como Yᵋ—uᵋ es una solución de la ecuación del calor, queda completamente determinada por sus datos iniciales y de contorno. En particular, la condición de frontera libre depende fuertemente de las aproximaciones de esos datos. También probamos que, bajo condiciones más débiles sobre los datos, la función límite u (que llamaremos solución límite) es una supersolución clásica del problema de frontera libre. Más aún, si D ∩ ∂{u > 0} es una superficie Lipschitz, u resulta una solución clásica de (P). Finalmente probamos, bajo hipótesis geométricas adecuadas sobre los datos, la unicidad de solución límite para el problema (P).

Abstract:
In this work we consider the following problem arising in combustion theory Δuᵋ - uᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, ΔYᵋ - Yᵋt = Yᵋƒε(uᵋ) en D, where D C Rᴺ+¹, ƒε(s) = 1/ε² ƒ(s/ε) with ƒ a Lipschitz continuous function with support in (-∞, 1]. Here Yᵋ is the mass fraction of some reactant, uᵋ the rescaled temperature of the mixture and ε is essentially the inverse of the activation energy. This model is derived in the framework of the theory of equidiffusional premixed flames for Lewis number 1. We prove that, under suitable assumptions on the functions uᵋ and Yᵋ, we can pass to the limit (ε → 0) — the so called high activation energy limit — and that the limit function u = lim uᵋ = lim Yᵋ is a solution of the following free boundry problem (P) Δu - ut = 0 en {u>0} │Vu│ = √2M(x,t) en ∂{u>0} in a pointwise sense at regular free bounday points and in a viscosity sense. Here M(x,t) = ƒ¹̠w˳(x,t) (s+w˳(x,t))ƒ(s)ds y -1 < w˳= limε→0 Yᵋ-uᵋ/ε. Since Yᵋ — uᵋ is a solution of the heat equation it is fully determined by its initial-boundary datum. In particular, the free bounday condition only (but strongly) depends on the approximation of the initial-boundary datum. Also we prove that, under weaker assumptions on the data, the limit function u (that we call limit solution) is a classical supersolution of the free bounday problem. Moreover, if D ∩ ∂{u > 0} is a Lipschitz surface, u is a classical solution to (P). Finally we prove, under adequate geometric assumptions on the data, the uniqueness of limit solutions for problem (P).

Fernández Gimenez, Analia Verónica. "Requerimiento de vitaminas liposolubles A y E en la dieta del camarón Artemesia longinaris Bate, 1888 y el langostino Pleoticus muelleri (Bate, 1888)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Una condición importante para el cultivo exitoso de camarones y langostinos, es la calidad de la dieta, basada en su composición y en la proporción en que cada ingrediente es utilizado. Hasta el momento prácticamente no se han realizado estudios relacionados con requerimientos vitaminicos de los camarones penaeoideos del Mar Argentino. Este aspecto es esencial para elaborar una dieta apropiada para estas especies potencialmente cultivables en Argentina. En la presente Tesis se estudió la respuesta del camarón Artemesia longinaris y del langostino Pleoticus muelleri, alimentados con dietas con distintas dosis de vitaminas A y E. con la finalidad de determinar los valores óptimos para un buen crecimiento y estado de salud de los animales. Se realizaron experimentos de crecimiento en acuarios y al finalizar se analizó histológicamente el hepatopáncreas aplicando técnicas de rutina. En general se obtuvieron buenos valores de incremento en peso y supervivencia. En función del crecimiento y el análisis histológico del hepatopáncreas de Artemesia longinaris, se determinó un requerimiento de vitamina A de 500 mg/kg. Para Pleoticus muelleri se estableció un nivel óptimo de 180 mg/kg dieta. He & Lawrence (1994) demostraron que la incorporación de por lo menos 130 mg vitamina A/kg dieta asegura el normal crecimiento de Litopenaeus vannamei. Los camarones alimentados con una dieta suplementada con 1500 mg vitamina E/kg dieta, presentaron mayor incremento en peso y supervivencia y se conservó la estructura normal del hepatopáncreas. Para el langostino Pleoticus muelleri se estimó un requerimiento de 1750 mg vitamina E/kg. He & Lawrence (1993b), determinaron para Litopenaeus vannamei un requerimiento de 99 mg vitamina E/kg dieta, nivel significativamente menor a 300 mg/kg previamente recomendado por Akiyama et al. (1992) para la formulación de dietas comerciales. Los requerimientos vitamínicos difieren entre las distintas especies de camarones, probablemente debido a diferencias especie-especificas. Se observó en las dos especies estudiadas que la utilizaciónde BHT (antioxidante sintético), no permite un adecuado crecimiento de los individuos; además se evidenciaron severos trastornos histopatológicos en el hepatopáncreas. He y Lawrence (1993b) trabajando con Litopenaeus vannamei demostraron que los animales crecieron poco y sugirieron que el BHT no ejerce una buena protección de las membranas celulares. Se puede concluir que las vitaminas A y E son nutrientes esenciales para el camarón Artemesia longinaris y el langostino Pleoticus muelleri ya que en situaciones de estrés nutricional, el hepatopáncreas reacciona con cambios citológicos que pueden provocar la disminución de su actividad. Por lo tanto, para mantener el estado funcional normal de las especies estudiadas, es necesario suplementar las dietas con vitaminas A y E con las dosis recomendadas. Esta investigación aporta información para la reformulación y mejoramiento de las dietas utilizadas para el engorde de camarones y langostinos en cultivo, fundamentalmente en lo referente a las dosis para optimizar el crecimiento y la supervivencia. Asimismo representan un aporte al conocimiento de la respuesta funcional del hepatopáncreas, que hasta el momento no había sido estudiada para especies de crustáceos argentinos.

Abstract:
Diet quality, based on its composition and in the ingredients proportion, is an important condition for a successful culture of prawn and shrimp. Up to this moment, there are just a few studies related to the Vitamin requirement of penaeid shrimps from the Argentine Sea. This topic is essential to elaborate a suitable diet for these species that are potentially appropriate for culture in Argentina. The response of Artemesia longinaris and Pleoticus muelleri, fed with diets containing different quantities of vitamins A and E, was studied in the present Thesis. The main objective was to determine the optimum vitamin values to ensure a good health condition and a good growth of the animals. Growth experiments were carried out in aquaria and in the end the hepatopancreas were analyzed using routine histological techniques. In general, a good survival and good values of weight increment were obtained. According to the growth values and the histological analysis of the hepatopancreas. Artemesia longinaris has got a minimum requirement of 500 mg vitamin A/kg diet. For Pleoticus muelleri the optimum value was determined to be 180 mg vitamin A/Kg diet. He and Lawrence (1994) showed that the inclusion of at least 130 mg vitamin A/Kg diet ensure a normal growth of Litopenaeus vannamei. The shrimps, fed with a supplemented diet containing 1500 vitamin E/Kg, showed greater growth increment and survival and the hepatopancreas kept a normal structure. In Pleoticus muelleri, the requirement of vitamin E was estimated in 1750 mg of vitamin /kg diet. However, He and Lawrence (1993b) determined for Litopenaeus vannamei a requirement of 99 mg vitamin E/Kg diet, this level is significantly lower than the 300 mg/kg previously recommended by Akiyama et al. (1992) to formulate commercial diets. Vitamin requirements differ among distinct shrimp species, this is probably due to specie-specific differences. The studied species evidenced that the utilization of BHT (a synthetic antioxidant) does not permit an adequate growth of the individuals, at the same time severe histopathological changes were observed in the hepatopancreas. He and Lawrence (1993b) working with Litopenaeus vannamei showed that the shrimps had a poor growth and suggested BHT does not produce a good protection of cell membrane. The present work permits to conclude that the vitamins A and E are essential nutrients for Artemesia longinaris and Pleoticus muelleri, since under nutritional stress the hepatopancreas suffers histological changes that can produce a reduction of the organ activity. Then, it is necessary to supplement diets with vitamin A and E, using the recommended proportions, to maintain the normal functional state of the studied species. This investigation supplies information to reformulate and improve diets used to feed prawns and shrimps under culture conditions, in special it presents the minimum quantities of each vitamin to optimize growth and survival. At the same way, it represents a contribution to the knowledge of the functional response of the hepatopancreas; this aspect had not been studied yet for species of Argentine crustaceans.

Fernández, Gabriela C.. "Participación de la respuesta inflamatoria en el desarrollo del Síndrome Urémico hemolítico" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La forma típica del síndrome urémico hemolítico (D+SUH) es una microangiopatía trombótica caracterizada por anemia hemolítica con fragmentación de eritrocitos, trombocitopenia con agotamiento de la función plaquetaria y daño renal agudo. Esta enfermedad es la principal causa de daño renal en la población pediátrica y nuestro país presenta la mayor incidencia del mundo. Si bien la mortalidad es baja debido a las terapias de soporte empleadas en el tratamiento de los síntomas, existe una alta proporción de niños (hasta un 50%) que puede presentar secuelas renales y neurológicas. El D+SUH se desarrolla luego de la ingestión de alimentos o bebidas contaminadas con bacterias productoras de una exotoxina denominada toxina Shiga (Stx). La bacteria coloniza el intestino, y comienza a producir la toxina que pasa a la circulación y se une a un receptor (Gb3) en los tejidos blanco (principalmente el riñón), donde se internaliza e inhibe la síntesis de proteínas. Si bien la Stx es absolutamente necesaria para el desarrollo de la enfermedad, existen evidencias que demuestran que el sistema inflamatorio puede influenciar el curso del D+SUH. El objetivo de esta tesis fue determinar la importancia de distintos componentes centrales de la respuesta inflamatoria como los neutrófilos (PMNs), las plaquetas y el óxido nítrico (NO) en la fisiopatología del SUH en un modelo murino por inyección endovenosa de la variante tipo 2 de la Stx (Stx2) pura. Asimismo, se investigó el estado de activación y funcionalidad de los PMNs periféricos de pacientes cursando el período agudo del D+SUH y luego de la recuperación clínica. Los resultados mostraron una disminución en la muerte y daño renal de los animales inyectados con Stx2 en ausencia de PMNs. Sin embargo, la depleción de plaquetas no tuvo ninguna influencia en estos aspectos. En los animales inyectados con Stx2 se observó una marcada neutrofilia, la cual correlacionó con el daño renal. Estos PMNs periféricos poseían mayor capacidad citotóxica, adhesión a la vasculatura y expresión del marcador de activación CD1lb. Estos datos evidencian una activación de los PMNs luego de la inyección de la Stx2 y demuestran la importancia de este tipo celular en el desarrollo del SUH como un factor de exacerbación del daño. Por otra parte, también se demostró una activación plaquetaria termprana en respuesta a la Stx2, con una inhibición posterior por agotamiento, similar a la observada en los pacientes. La inhibición de la producción de NO provocó un aumento del daño renal y la mortalidad inducidos por la Stx2. Estos fenómenos fueron mediados, al menos en parte, por una mayor activación plaquetaria en ausencia de NO. Los estudios histológicos apoyaron estos hallazgos y evidenciaron, por primera vez, la formación de coágulos intraglomerulares en los animales tratados con Stx2. Estos resultados sugieren un papel protector del NO en la fisiopatologia del SUH, mediado por su acción antitrombótica e inhibitoria de la activación plaquetaria. El estudio de los PMNs de los pacientes con D+SUH reveló una disminución en los marcadores de activación FcyRIII (CD16) y CD1lb, y en el marcador de degranulación mieloperoxidasa (MPO) y una menor respuesta citotóxica dependiente de anticuerpos y de degranulación con respecto a una población de niños sanos. Los PMNs de los pacientes presentaron una disminución del FcyRIII, la MPO y las respuestas citotóxicas con respecto a una población de niños con neutrofilia no relacionada con el D+SUH, aunque la capacidad de respuesta de degranulación entre ambas poblaciones fue muy similar. El fenotipo y funcionalidad de los PMNs de los pacientes en el momento en que acuden al hospital indica que este tipo celular se encuentra parcialmente agotado, debido a un fenómeno de activación previo. Probablemente, los efectos de la toxina sobre los PMNs sean indirectos y mediados a través de la activación y daño endotelial, ya que en nuestras condiciones y por distintas metodologías, la Stx fue incapaz de unirse y/o de causar ningún efecto en PMNs provenientes de individuos adultos normales. En conclusión, en este trabajo pudimos demostrar el papel central y modulador de distintos componentes de la respuesta inflamatoria en la fisiopatología del SUH.

Falzone, Tomás Luis. "Estudio de la función del receptor dopaminérgico D4 en el sistema nervioso central a través del análisis de ratones modificados genéticamente" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Elola, María Dolores. "Estudio computacional de reacciones químicas en entornos acuosos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En este trabajo hemos estudiado aspectos dinámicos y de equilibrio relacionados con procesos reactivos que toman lugar en agregados acuosos, mediante técnicas de simulación de Dinámica Molecular. La metodología empleada consiste en un esquema mixto cuántico-clásico, que involucra un cálculo de estructura electrónica sobre una porción del sistema -aquella en la cual la densidad electrónica cambia sustancialmente durante la reacción- en conjunto con potenciales empíricos de campo medio para modelar el solvente. Investigamos en primer lugar la dinamica del desprendimiento electrónico en Ioduro producido por una excitación electrónica, en agregados acuosos, Iˉ(H2O)n, con N entre 6 y 100. Nuestro objetivo estuvo focalizada en el análisis de los efectos térmicos y de tamaño sobre los mecanismos microscópicos que gobiernan la reacción de desprendimiento. Nuestras simulaciones indican que la excitación electrónica genera estados electrónicos altamente difusos en los agregados más pequeños, favoreciendo la estabilización del solvente. Los tiempos característicos del proceso de relajación del solvente resultaron ser del orden de 0.05-0.1 p8. En segundo lugar estudiamos la reacción de disociación de ácido nítrico en agregados acuosos, HNO3(H20)n. Para ello utilizamos la metodología mixta, resolviendo el problema de estructura electrónica a través del formalismo de los Funcionales de la Densidad (DFT). Un aspecto importante de nuestra motivación fue saber el número mínimo de moléculas de agua necesarias para convertir la disociación del ácido en un proceso espontáneo. Al respecto, nuestras simulaciones muestran la existencia de un valor umbral por debajo del cual la disociación no ocurre, que se encuentra entre 3 ≤ N ≤ 10. Finalmente estudiamos la dinamica de la reacción de transferencia de protón entre ácido bromhídrico y el ion hidroxilo que toma lugar en agregados acuosos pequeños, con N = 2 y 6 moléculas de agua. En este último caso agregamos un ingrediente más en la modelización del solvente, incorporando explícitamente los efectos de polarización.

Abstract:
We have studied dynamical and equilibrium aspects of reactive processes taking place in aqueous clusters, using Molecular Dynamics techniques. The methodology employed consists in a mixed quantum-classical scheme that combines an electronic structure calculation for a portion of the system —where there is a substantial change in the electronic density- with empirical mean field potentials for the solvent. We have first investigated the solvation dynamics following electron photodetachment from Iodide in aqueous clusters, Iˉ(H2O)n, with N ranging between 6 and 100. Our main interest was focused on the analysis of thermal and size effects on the microscopic mechanisms that drive the electron photodetachment. Our simulations seem to indicate that the electronic excitation generates highly diffuse states in the smaller clusters, favoring solvent stabilization. The characteristic times of the solvent relaxation process were of the order of 0.05-0.1 ps. We have also studied the dissociation of nitric acid in aqueous clusters, HN03(H20)n, using a mixed quantum-classical methodology. The electronic structure was solved within the Density Functional formalism (DFT). A key question was how many water molecules are necessary to bring the acid dissociation of HN03 a spontaneous process? In this sense, our simulations show the existence of a threshold size of water molecules below which the reaction is not observed, in an intermediate value between 3 ≤ N ≤ 10. Finally we have studied the proton transfer reaction of bromidic acid with the hydroxile group taking place in small clusters, containing N = 2 and 6 water molecules. In this case we have included explicitly the solvent polarization degrees of freedom in the classical force field potentials.

Einsenberg, Patricia. "Síntesis, caracterización y entrecruzamiento de silsesquioxanos derivados de (3-metacriloxipropil) trimetoxisilano" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El objetivo principal de esta tesis fue la síntesis y caracterización de 3-metacriloxipropilsilsesquioxanos, y su utilización en la formulación de materiales híbridos orgánico-inorgánicos a través de la copolimerización con estireno y el sistema estireno-resina poliéster. La reacción de policondensación de (3-metacriloxipropil) trimetoxisilano fue llevada a cabo en masa (sin agregado de solvente), empleando ácido fórmico 98 % (p/p) (relación molar HCOOH/Si = 3 o 6), a 50°C o 70°C, durante periodos de tiempo de hasta un mes. Los silsesquioxanos (SSO) resultantes fueron caracterizados por RMN ¹H, IR-FT, SEC, UV-MALDI- TOF MS (modo lineal, reflector y PSD) y ESI-TOF MS. La concentración de grupos metolxilo Si-OCH3 residual y de los productos volátiles CH3OH y HCOOCH3, generados en el transcurso de la reacción fue evaluada cuantitativamente por RMN ¹H durante la etapa inicial de la síntesis. Al cabo de 2 días de reacción a 50°C, o de alrededor de 6 horas a 70°C, los SSO resultantes presentaban principalmente grupos silanol (Si-OH) residual y sólo trazas de grupos Si-OCH, , resultado confirmado por IR-FT y UV-MALDI-TOF MS en modo reflector. La reacción de policondensación continúa lentamente, durante el periodo de almacenamiento a temperatura ambiente, principalmente a través de la condensación de los grupos silanol residual (Si-OH + Si-OH). La fracción promedio de ciclos intramoleculares aumenta continuamente durante la policondensación. Para un producto de reacción típico, con especies involucrando de 6 a 24 átomos de silicio, se obtuvo un valor de Fprom = 0,81. El valor obtenido evidencia la presencia de estructuras relativamente cerradas. El espectro MS/MS mostró la fragmentación de uno o más grupos ésteres unidos al átomo de silicio, seguido de un reordenamiento de McLafferty . La adición de agua a la formulación inicial (relación molar 3:1 H2O/Si), dio lugar a una disminución en la velocidad de policondensación y a una disminución de la fracción promedio de ciclos intramoleculares, resultando en la formación de estructuras más abiertas. El empleo de ácido fórmico produce entonces SSO que presentan una fracción de ciclos intramoleculares superior respecto de los SSO sintetizados a partir de formulaciones convencionales. Los 3-metacriloxipropil-SSO fueron copolimerizados con estireno empleando peróxido de benzoílo como iniciador. Cuando la relación molar de estireno (S) a insaturaciones metacrílica (M), (S/M), fue > 1 la reacción de copolimerización alcanza conversión completa, resultado verificado a través del valor de reacción obtenido por calorimetría diferencial de barrido (DSC). Las propiedades térmicas y mecánicas de los materiales híbridos orgánico-inorgánicos fueron determinadas en función del contenido de SSO en la formulación. Al aumentar el contenido de SSO se observó un aumento en la temperatura de transición vítrea (hasta un punto donde no se observó devitrificación del material antes de la descomposición térmica del mismo), módulo elástico en estado goma, estabilidad térmica y dureza Barcol. Soluciones de 3-metacriloxipropil-SSO en estireno (S) fueron empleados como agentes de entrecruzamiento en formulaciones de resinas poliéster insaturadas (UP). La reacción de copolimerización se llevó a cabo empleando peróxido de benzoílo como iniciador, alcanzándose una alta conversión de insaturaciones como lo mostraron las mediciones de calor de reacción obtenidas por DSC. Las propiedades dinámico-mecánicas de los materiales híbridos obtenidos mostraron una fuerte dependencia con el contenido de SSO en la formulación inicial. Cuando el contenido de SSO era bajo o intermedio se observó un aumento en la temperatura de transición vítrea (Tg) y en el módulo elástico en estado goma. Cuando el contenido de SSO era mayor, el material mostró un comportamiento típico de un material compuesto formado por una matriz rica en SSO incluyendo un dominio "flexible" UP-S. El módulo elástico mantuvo un alto valor luego de la devitrificación del dominio “flexible” UP-S. En estos materiales también se observó un aumento en la resistencia a la degradación térmica.

Abstract:
The main objective of this thesis was the synthesis and characterization of 3-methacryloxypropyl- silsesquioxanes, and their utilization in the formulation of hybrid organic-inorganic polymer networks based on the copolymerization with styrene and styrene-polyester resins. The polycondensation of (3-methacryloxypropyl) trimethoxysilane was performed in bulk, using 98 wt% formic acid (molar ratio HCOOH/Si = 3 or 6), at 50°C or 70°C, for periods of time up to one month. The resulting silsesquioxanes (SSO's) were characterized by ¹H NMR, FTIR, SEC, UV-MALDI-TOF MS (linear, reflector and PSD modes), and ESI-TOF MS. The residual concentrations of Si-OCH3 groups, and generated CH3OH and HCOOCH3, were quantitatively monitored by ¹H NMR during the initial stage of the synthesis. After 2 days of reaction at 50 °C, or about 6 hours at 70 °C, the resulting SSO mainly contained residual SiOH groups with only traces of Si-OCH3 groups, as was also confirmed by FTIR and UV-MALDl- TOF MS in the reflector mode. After this time, the polycondensation continued sIowa during storage at room temperature, basically through Si-OH + Si-OH reactions. The average fraction of intramolecular cycles increased continuously during the polycondensation. An average value, Fav= 0.81, was found for species containing 6 to 24 Si atoms in a typical reaction product. This evidenced the presence of species with relatively closed structures. In MS/MS spectra, fragmentation of one or more ester groups attached to Si atoms was observed, following a McLafferty rearrangement. The addition of water to the initial formulation (about 3:1 H20/Si molar ratio), led to a slower polycondensation rate, and to a decrease of the average fraction of intramolecular cycles (formation of more open structures). Therefore, the use of 98 wt% formic acid was useful to synthesize SSO’s containing a higher fraction of intramolecular cycles than those resulting from conventional formulations. The 3-methacryloxypropyl-SSO were copolymerized with styrene using benzoyl peroxide as initiator. When the ratio of styrene (S) to methacrylic (M) unsaturations was S/M > 1, the reaction attained an almost complete conversion as shown by the total reaction heat determined by differential scanning calorimetry. Several properties of the resulting hybrid organic-inorganic polymer networks were determined as a function of the silsesquioxane amount used in the formulation. Increasing the silsesquioxane fraction led to an increase of the glass transition temperature up to a point where devitrification was not observed prior to decomposition, an increase of the elastic modulus in the rubbery state, a decrease of the intensity of tan δ, and an increase of both Barcol hardness and thermal stability. Solutions of 3-methacryloxypropyl-SSO in styrene (S) were used as hardeners of unsaturated polyesters (UP) based on phthalic and maleic anhydrides and propylene glycol. The cure with benzoyl peroxide was carried out to a high conversion of double bonds as revealed by the reaction heat measured by differential scanning calorimetry. Dynamic mechanical properties of the cured materials showed significant differences depending on the amount of SSO in the initial formulation. At low to medium SSO fractions, an increase in both the glass transition temperature (Tg) and the rubbery modulus was observed. But at large SSO fractions the material showed a typical behavior of a composite with a SSO-rich matrix including “soft” UP-S domains. The elastic modulus remained at high values after devitrification of the “soft” domains. Also, the addition of the SSO led to an improvement in the resistance to thermal degradation.

Eguia, Manuel Camilo. "Estadística y procesamiento de información en sistemas excitables con ruido" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo se centra en el estudio de los sistemas excitables bajo la acción del ruido. Aun los sistemas canónicos más simples presentan propiedades estadísticas no triviales que dan cuenta de la estructura topológica de su espacio de fases determinista. Algunos aspectos estructurales de estos sistemas se revelan en presencia de ruido y en proximidad de las bifurcaciones que los caracterizan. En particular las dos clases básicas de excitabilidad (tipo I y II) presentan huellas distintivas diferenciadas en los histogramas de tiempos entre pulsos cerca de sus respectivas bifurcaciones. En la primera parte de este trabajo se derivan expresiones analíticas y semianalíticas para los histogramas de tiempos entre pulsos excitables de dos sistemas clásicos: el péndulo con torque y el modelo de FitzHugh-Nagumo. Las aproximaciones abrevan de la teoría de escapes de un estado metaestable de Kramers y otros elementos de la teoría de procesos estocásticos. Se discute un posible impacto de los resultados en el estudio de la actividad espontánea estacionaria de neuronas. En la segunda parte de esta tesis abordamos algunos aspectos del acople de sistemas excitables. En particular mostramos cómo es posible realizar operaciones lógicas con sistemas excitables con ruido, sin sincronización externa. Para ello utilizamos las propiedades de saturación e integración temporal de un modelo simplificado de sinapsis qímicas rápidas. Finalmente aplicamos algunos elementos de teoría de la información a un modelo de neuronas que producen ráfagas con el propósito de poner en evidencia justamente algunas limitaciones de la aplicacion estándar de dicha teoría (concebida originalmente para elementos pasivos de trasducción) a los sistemas neuronales que son fuertemente no lineales y activos.

Abstract:
This thesis focuses on the behavior of excitable systems subjected to the action of external noise. Even the simplest systems display nontrivial statistical properties that account for the topological structure of its phase space. These features arise in the presence of noise and close to a characteristic bifurcation. For instance, the two basic types of excitability (class I and II) can be discriminated by means of the intespike histograms close to their respective bifurcations. In the first part of this work, we derive analytical and semianalytical expressions for the interspike histograms of two clasical models: the pendulum with friction and torque and the FitzHugh-Nagumo equations. The aproximations arise from Kramers’ escape theory and from the theory of stochastic processes. We discuss the potential impact of our results on the study of the spontaneous activity of neurons. In the second part of this thesis, we address the issue of coupling excitable systems. We show how to perform all the logical operations with excitable systems in a noisy environment and without external synchronization. In order to achieve this, we make use of the saturation and integration properties of a Simplified model of fast chemical synapse. Finally, we apply information theory to a bursting neuron model with the aim of revealing some limitations of a straightforward aplication of the information measures (originally concieved for pasive transducers) to a neural system, which is active and strongly nonlinear.

Di Paolo, Nelson César. "Estudio del efecto del factor de Necrosis tumoral -alfa sobre las neuronas dopaminérgicas de la substantia nigra en relación a la enfermedad de Parkinson" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La enfermedad de Parkinson (PD, “Parkinson Disease”) es una enfermedad neurodegenerativa crónica, de desarrollo muy lento. Su característica neuropatológica sobresaliente es la pérdida de las neuronas dopaminérgicas de la substantía nigra (s.n.) del cerebro. No se conoce la causa cierta, ni existe una cura para esta enfermedad. Las citoquinas inflamatorias han sido halladas en el cerebro de pacientes con diversas enfermedades neurodegenerativas, inclusive con PD. El Factor de Necrosis Tumoral-alfa (TNF) es una citoquina de particular interés, porque puede inducir tanto la sobrevida como la muerte de neuronas. El TNF y sus receptores han sido detectados en la s.n. de pacientes con PD, pero no de personas sanas. Sin embargo, no se tiene ninguna evidencia de cual podría ser la función del mismo en dicha patología. Utilizando ratones knock-in “hipomórficos” y un promotor específico de la s.n. (engrailed), se logró la expresión constitutiva de TNF en la s.n. de ratones. Combinando lo previo con dos elementos más (vectores adenovirales y el sistema Cre-LoxP), se desarrolló un modelo para lograr la expresión crónica de diferentes niveles de TNF en el cerebro de ratones in vivo. El mismo fue utilizado para analizar el papel de esa citoquina en la sobrevida o muerte de las neuronas dopaminérgicas. Realizando una única inyección estereotáxica de vectores adenovirales (Ad), se logró transducir las neuronas dopaminérgicas de la s.n. del ratón casi en un 100%. Así, cuando animales knock-in fueron inoculados en la s.n. con un adenovector codificante para la recombinasa Cre (AdCre), se observó la recombinación y escisión de un cassette que interfería con la expresión del transgén (cassette “PGK-neo”). El mismo estaba flanqueado por sitios llamados Lox-P (“floxeado”), los cuales son reconocidos por la recombinasa Cre. Seguidamente se demostró un aumento específico en la expresión del TNF respecto del basal en la s.n. de los animales knock-in inyectados con el AdCre, pero no cuando fueron inyectados con un Angal, o en animales silvestres (wt) inyectados con cualquiera de los dos adenovectores. Esos resultados demostraron que el mencionado cassette PGK-neo ejerce un efecto de “interferencia transcripcional” sobre el transgen de interés. Así, la combinación de las estrategias mencionadas ha permitido lograr la expresión constitutiva, e inducida, de una proteína de interés (TNF) en la s.n. del ratón. El análisis funcional de estos animales reveló que el TNF crónico inducido en algún momento de la vida adulta del animal provoca la lenta y progresiva desaparición de las neuronas dopaminérgicas de la s.n., representando un nuevo modelo de PD. Por otro lado, fue muy interesante observar que la expresión constitutiva de TNF logró aumentar 3 veces más el número de neuronas sobrevivientes que en los grupos controles ante el tratamiento de los animales con 6-hidroxidopamina (6-OHDa), una droga utilizada para modelar la PD. Estos resultados son un indicio para comenzar a comprender datos previos contradictorios de la literatura, referidos a la muerte o protección de neuronas mediado por TNF (el efecto final en cada caso podría depender de la concentración). La información aquí presentada será útil al considerar la posibilidad de una terapia que de alguna manera u otra afecte al TNF, o a cualquier otra citoquina (anti-inflamatorios, por ejemplo), como se ha realizado recientemente para esclerosis múltiple. Finalmente, la estrategia utilizada permitirá el estudio de las funciones de proteínas expresadas en la s.n. en forma controlada, y abre la posibilidad de establecer nuevos modelos animales de PD. Aún más, utilizando otros promotores endógenos, podrá permitir el estudio de otras patologías crónicas en el cerebro.

Abstract:
Parkinson Disease (PD) is a debilitating, long-term neurodegenerative disease, which most important neuropathological feature is the loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra (s.n.) of the brain. It is not known its cause, nor exists a cure for this disease. Immune cytokines have been found in the brain of patients with many neurodegenerative diseases, including PD. Tumor Necrosis Factor-alpha (TNF) is a cytokine of particular interest, because it can induce both the survival or death of neurons. Importantly, it has been found in the s.n. of PD patients, but not in control subjects. Nevertheless, it is not known which function could have TNF in this disease. Combining “hypomorphic” knock-in mice and a promoter specific for the s.n. (engrailed), we obtained constitutive expression of TNF in the s.n. of mice. Combining two more elements (adenoviral vectors and the Cre-LoxP system), we had developed a model to obtain chronic expression of different levels of TNF in vivo in the s.n. of mice. This system was used to study the role of this cytokine in the survival or death of dopaminergic neurons. We found that we could transduce dopaminergic neurons of the s.n. of adult mice with almost 100% efficiency with a single stereotaxic injection of adenoviral vectors. When knock-in mice were inoculated in this brain region with an adenoviral vector coding for Cre recombinase, a “floxed” PGK-neo cassette was recombined. In addition, s.n.-specific TNF expression was up-regulated in the AdCRE-injected knock-in mice but not in knock-in mice injected with Adbetagal or in AdCRE-injected control animals. These results showed that the PGK-neo cassette had a “transcriptional interference” effect on TNF expression. Moreover, the combination of the mentioned strategies allowed for the basal expression, and the temporal onset of an up-regulation, of a protein of interest in the s.n. of mice. When we analyzed the functional effects of TNF on neuronal viability, we found that longterm TNF up-regulation was deleterious, inducing the progressive death of dopaminergic neurons. This has provided us with a new animal model of PD. On the other hand, it was very interesting to observe that the constitutive expression of TNF could protect 3 times more neurons than wt mice in an accepted PD model injecting 6-OHDa, a neurotoxin used as an accepted PD model, into the striatum. These results should help to understand previous contradictory data in the literature related to the neuroprotective or neurodegenerative effects of TNF (the final effect could depend on subtle differences on the TNF concentration). Even more, the information presented here should be considered when designing a possible therapy for PD that could affect cytokines expression (and TNF in particular) in the s.n., as has recently been tested for multiple sclerosis. Finally, the strategy used in this work provides the means to analyze the function of proteins expressed in the s.n. in a temporal and regional controlled manner, and opens up the possibility to establish other new animal models of PD. Even more, using other endogenous promoters, it should facilitate the study of other chronic pathologies in the adult mouse brain.

Di Marco, Alejandro Carlos. "Metalogénesis de los depósitos de cobre-hierro y otros elementos metálicos asociados en anfibolitas de las fajas central y oriental del centro sur de las Sierras de Córdoba" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Di Chenna, Pablo Héctor. "Síntesis de análogos de esteroides neuroactivos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis se describe la síntesis de análogos de esteroides neuroactivos por dos vías: i) reordenamiento aniónico y radicalario de anillos ciclopropánicos,que llevó a la obtención de D-homo pregnanos conformacionalmente mhs flexibles. ii) introducción de un anillo aziridina en el esqueleto esteroidal, que permitió la preparación de un análogo conformacionalmente más rigido de minaxolona, un anestésico esteroidal. A partir de 11 α-hidroxiprogesterona se preparó la 11α-hidroxi-17β,18-ciclopregn-4-en-3,20-diona, ésta se transformó en los 3α-hidroxi-18-nor-D-homopregnanos con fusión de anillos A/B cis y trans por reducción del anillo A con Ni/Al/NaOH, seguido de oxidación, y tratamiento con NaOH/metanol. Se desarrolló la metodología de reordenamiento radicalario de ciclopropilcetonas vía hidruros de alquilmercurio aplicándola a distintos sustratos: ciclopropilcarvona, 3 β-acetoxi- 16α, 17α-metilenpregn-5-en-20-ona, 20β-hidroxi-4β,5βmetilenpregnan- 3-ona y 20-acetoxi-3α,5α-ciclopregnan-6-ona. Partiendo de 3β-acetoxi- 16α, 17α-metilenpregn-5-en-20-ona se obtuvo como producto principal el correspondiente D-homo pregnano (expansión del anillo) en un solo paso. Los resultados obtenidos demostraron la utilidad de los reordenamientos con hidruros de alquilmercurio como un método alternativo de reordenamiento radicalario de ciclopropilcetonas y especialmente útil en el caso de cetonas altamente impedidas donde los métodos tradicionales no dan buenos resultados. Se estudió también la posibilidad de realizar los reordenarnientos de ciclopropanos vía complejos de alquilcobalto a partir de ciclopropilalcoholes. Como estudio preliminar se sintetizó el primer complejo de alquilcobalto esteroidal, 3β- -pregn-5-en-20-ona,a partir de pregnenolona. Los intentos por tratar de introducir un buen grupo saliente en posición α al ciclopropano llevaron al reordenamiento catiónico. Finalmente se describe la aziridinación de pregn-11-eno-3,20-diona y 3α-acetoxipregn- 11-eno-20-ona mediante el uso de SesN=IPh y CuOTf que llevó a la formación de las N-Ses aziridinas esteroidales correspondientes; luego de desprotección y metilación se obtuvo la N-metil-11α, 12α-aziridino-5β-H-pregnano-3,20-diona y el análogo de minaxolona 3-α-hidroxi-N-metil-11α, 12α-aziridino-5β-H-pregnan-20-ona.

Abstract:
In this thesis the synthesis of analogues of neuroactive steroids is described i) by anionic and radical rearrangements of ciclopropane rings, that lead to cornformationally more flexible D-homopregnanes. ii) by introduction of an aziridine ring in the steroidal skeleton, that allowed the preparation of a rigid analogue of minaxolone, a steroidal anaesthetic. 11α- Hydroxy- 17β, 18-cyclopregn-4-ene-3,20-dione was prepared from 11α-hydroxy progesterone, and transformed into 3α-hydroxy-18-nor-D-homopregnanes with both cis and trans A/B ring fusion by reduction of ring A with Ni/Al/NaOH, followed by oxidation and treatment with NaOH/methanol. The radical rearrangement of cyclopropylketones via alkylrnercury hydrides was developed and used on a variety of substrates: cyclopropylcarvone, 3 β-acetoxy- 16α, 17α-methylenepregn-5-en-20-one, 20 β-hydroxy- 4β,5β-methylenepregnan-3-one and 20-acetoxy-3α,5α-cyclopregnan-6-one. 3β-Acetoxy- 16α, 17α-methylenepregn-5-en-20-one gave the D-homopregnane skeleton as the main product in one step (ring expansion). The results demostrated the usefullness of alkylmercury hydrides as an alternative method for the radical rearrangement of cyclopropylketones, especially with highly hindered ketones where the traditional methods fail. The possibility of radical rearrangement via alkylcobalt complexes from cyclopropyl alcohols was also explored. As a preliminary study 3β-pregn-5-en-20-one was prepared fiom pregnenolone. However, attempts to introduce a good leaving group next to the cyclopropane ring lead to a cationic rearrangement. Finally, the preparation of steroidal aziridines obtained by aziridination of 11-pregnene-3,20-dione and 3a-acetoxy- 11-pregnene-20-one with SesN=IPh and CuOTf is described; after deprotection and methylation N-methyl- 11α, 12α-aziridine-5β-H-pregnan-3,2O-dione and 3α-hydroxy-Nmethyl- 11α ,12α-aziridino-5β-H-pregnan-20-one(analogue of minaxolone) were obtained.

del Valle Alvarez, Martín Roberto. "Manejo sustentable del carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris, Linnaeus 1766) en Argentina : un aporte al conocimiento de la biología de la especie desde la cría en cautiverio" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El carpincho es un recurso natural que no esta sometido a planes de manejo sustentable en Argentina. Actualmente, este roedor es catalogado como “Especie Potencialmente Vulnerable” y, aunque se encuentra protegido en ocho Parques Nacionales y no figura en los Apéndices I o II de CITES, la intensa explotación de este caviomorfo en los últimos 20 años haría suponer que se debería encontrar bajo alguna forma de amenaza de extinción o en proceso de regresión numérica. El enfoque general de esta Tesis ha estado dirigido fundamentalmente a contribuir al desarrollo de una estrategia de manejo sustentable del carpinchoen Este trabajose desarrollóen el Criaderode Carpinchos,ubicado en la EEA. Delta del Paraná —INTA (Otamendi, Partido de Campana, Provinda de Buenos Aires, Argentina). La evaluación de los sistemas de manejo desarrollados en el Criadero puso de manifiesto que el Módulo 3 (corrales de 30 x 10 m, divididos en sectores de reproducción y parideras) fue el mejor para la fase reproductiva, incorporando la práctica de “Destete temporario”. Con este manejo disminuyeron los conflictos sociales entre las hembras, por tener más espacio para que los subordinados huyan y no se llegue a la agresión, y por mantenerse la identidad grupal; hubo una menor mortandad al destete dado que se realiza con crías mayores disminuyendo la duración del período entre partos. Se calculó una eficiencia reproductiva de 6,5 crías destetadas vivas / año X madre, de esta manera se alcanzan los parámetros reproductivos necesarios para utilizar el potencial productivo del carpincho en cautiverio. En cuanto a la alimentación, se pone de relieve el gran potencial zootécnico de esta especie para su crianza en cautiverio, siendo las respuestas observadas superiores a los valores encontrados en la literatura mundial para carpinchos en vida silvestre. Se evaluaron las implicancias biológicas de la selección del alimento por este herbívoro monogástrico, concluyéndose que habría una macro-selección del lugar de pastoreo, previo al refuerzo dado por el valor nutritivo del alimento finalmente consumido. La primer reacción ante un alimento es de macro-reacción ante la forma (arquitectura) vegetal. La segunda reacción es de calidad intrínseca del alimento, determinada por la relación Fibra:Proteina y la concentración de Vitamina C. Por eso los carpinchos distinguen entre parches de pastoreo, y dentro de ellos seleccionan las especies vegetales por la calidad nutritiva de cada una. Los mecanismos de reconocimiento posteriores a la ingestión del alimento se fundamentan en sus resultados metabólicos, que estan relacionados estrechamente con las características anatómicas y fisiológicas del animal; y a la vez, se vinculan con la maximización de la ingesta de energía digestible y la metabolización eficiente de los otros nutrientes. La experiencia previa influida sobre las preferencias y los patrones de alimentación diaria. En el caso del carpincho, la economía del nitrógeno parece ser la mayor restricción en la selección de la dieta. Asociado a ello, aparecen mecanismos comportamentales de economia de nitrógeno: la cecotrofia. Hemos concluido que la cecotrofia en el carpincho es facultativa, produciéndose en respuesta a un bajo aporte dictado de proteínas. Asimismo, se evaluó la distribución geográfica presente de poblaciones silvestres de este roedor, ofreciendo una interpretación biogeográfica y productiva, evaluando los factores que pudieran influir sobre su distribución actual, así como sobre la permanencia de las poblaciones actuales y futuras, y la potencialidad de distintas zonas de nuestro pais para implementar distintos sistemas de manejo productivos sustentables, de nuestros resultados no puede señalarse a la caza comercial controlada y a la cría en cautiverio como estrategias antagónicas e incompatibles. Así, proponemos un modelo integrado para el manejo sustentable del carpincho en la Argentina, donde convivan las alternativas actuales de producción y un sistema de fiscalización centrado en los intereses regionales, con la finalidad de dar un paso al frente en el mantenimiento de las poblaciones naturales de este roedor, aún no amenazado a escala global, pero cuya sobreexplotación podría conducir a un agotamiento del recurso, conllevando su tan tenida extinción.

Abstract:
As far as we are concerned, capybaras are not currently under any sustainable management plan in Argentina. This rodent is currently classified as a “Potentially Vulnerable Species”, however, it does not appear in the Appendix I or II of CITES. Although there are protected populations living in eight National Parks, the intense exploitation of this caviomorph rodent in the last 20 years would suggest that some of its populations could be under some form of threat or at least undergoing a decrease of the population number. The general focus of this Thesis has been to contribute to the development of a strategy of sustainable development of the capybara in Argentina. This work was developed in the Capybara Breeding Center, located in the EEA Delta del Paraná - INTA (Otamendi, Campana County, Buenos Aires Province, Argentina). The evaluation of the management systems developed in the Breeding Center showed that the Module 3 (30 x 10 m pens, including sectors for reproduction and breeding) was the best for the reproductive phase, with the implementation of a “temporary weaning". Under this management regime, social conflicts among females were reduced, because of the additional space for subordinates, which helped to avoid aggressions, while supporting group identity; mortality from birth to weaning was reduced, since weaning takes places at an older age, shortening the period between births. Reproductive efficiency was calculated in 6.5 weaned individuals per year per mother. Through this management strategy, the essential reproductive parameters are reached to take maximum advantage of the productive potential of capybaras in captivity. Regarding feeding, the great zootechnical potential of this species is emphasized, with higher parameters than those found in the available literature worldwide for capybaras in their natural habitats. The biological derivations of diet selection were evaluated, concluding that there would be a macro-selection of foraging places, previous to the reinforcanent given by the nutritious value of food itself. The first reaction against a potential food is a “macro-reaction” towards the vegetable form (architecture). The second reaction is towards the intrinsic quality of the food, determined by Fiber: Protein Rate and Vitamin C concentration. This is why capybaras are able to distinguish among foraging patches, and within each patch they can select which species to eat, according to the nutritional quality of each available food. The recognition mechanisms after food ingestion are based on the metabolic outcome, and are closer related to the anatomical and physiological features of the animal; at the same time, they are linked with the Optimization of digestible energy and the efficient metabolization of other nutrients. Previous experience would influence both preferences and daily feeding patterns. For capybaras, nitrogen economy seems to be the greatest constraint for diet selection. Behavioral mechanisms also appear, such as cecotrophy. We have concluded that cecotrophy in captive capybaras is Optional, occurring as a result of a low protein income. The geographical distribution of free ranging populations was also evaluated, offering a biogeographical and productive interpretation of the available data in Argentina, and assessing the factors that could influence on its current geographical range, as well as on the permanence of current and future populations, and the potential of different areas of our country to implement different sustainable management systems. We conclude from our results that controlled commercial hunting and captive breeding are not antagonistic and incompatible strategies. Therefore, we propose an integrated model for sustainable management of capybaras in Argentina, where the current alternatives of production and an inspection system centered in regional interests can coexist, with the goal of its natural populations,not yet threatened in a global scale,but susceptible to extinction due to overexploitation.

D’Adamo, Paola. "Claves utilizadas por la avispa social Vespula germanica durante el forrajeo" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La avispa social Vespula germanica es una especie invasora exitosa. En la mayoría de los países que ha invadido, se la considera perjudicial por causar daños económicos y ecológicos, además de ser una especie molesta y poseer una picadura dolorosa. Con el objeto de describir la situación de la especie en nuestro país y ahondar en las causas para su éxito de invasion, en primero lugar realizamos estudios de dieta y de su distribución, utilizando para esto último, un modelo ecoclimático. Los resultados indican que la avispa chaqueta amarilla se encuentra establecida en la Patagonia, donde es considerada plaga, a pesar de que desde el punto de vista ecoclimático ésta no seria un área muy favorable para la especie. Dadas las características de la especie y de los ambientes invadidos, es probable que su comportamiento de forrajeo constituya un factor relevante en su éxito colonizador. Para V.germanica se demostró la existencia de incremento local, un tipo de facilitación social por medio del cual, durante el forrajeo, las avispas son atraídas por conespecíficas a explotar una fuente de alimento. Estudios realizados previamente en la especie han propuesto a las claves visuales como principales responsables del proceso. Sin embargo, a través de varios experimentos nosotros demostramos que las claves olfativas serían las que prevalecen. Las avispas forrajeadoras son atraídas por el olor que emana de sus con-especificas. Los machacados de cabezas de estas avispas atraen conespecíficas desencadenando el aterrizaje y la remoción de fragmentos de cabezas. Los extractos de cabeza, aplicados sobre un papel de filtro desencadenan la atracción y aterrizaje de avispas, y la respuesta comportamental difiere de acuerdo a si el experimento es realizado cerca del nido o en condiciones de forrajeo. Postulamos que existe una feromona vinculada al forrajeo que se encuentra en las cabezas de las obreras de V. germanica. A nivel individual analizamos qué claves (visuales o de micro localización) prevalecen al re-localizar una fuente de alimento. Encontramos diferencias según el origen proteico o carbohidratado de la fuente explotada.

Abstract:
Vespula germanica is a social wasp that has successfully colonized many parts of the world. It affects economic activities and natural communities in invaded countries, and is responsible of painful sting. In order to describe the species situation in our country, we did studies on its diet and on its distribution using an ecoclimatic model. Our results show that yellow jackets are well established in Patagonia, where it is considered a pest, although according to ecoclimatic model this would not be a suitable place for the species establishment. Foraging behaviour probably constitutes a relevant characteristic for wasp invasion success. Local enhancement is a variant of social facilitation in which foragers are attracted by conspecifics exploiting a feeding source. Through a series of experiments we show that odour cues mediate this process. Forager wasps are attracted by the odour elicited by conspecifics. Wasps head squashes attract conspecifics eliciting landing and removal of head fragments. Head extract applied on filter paper attracts forager wasps eliciting landing, but behaviour differs according to the context of proximity to the nest or foraging conditions. We propose that a foraging related pheromone exists on Vespula germanica workers’ heads. We also analysed the cues used by an individual forager to relocate a feeding source. We found differences between the visual and micro-location cues utilised, depending on the type of food (protein or carbohydrates) offered during training sessions.

Comin, María Julieta. "Síntesis de nucleósidos carbocíclicos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La síntesis de nucleósidos carbocíclicos es un tema de gran interés que ha sido muy desarrollado durante los últimos años debido a la importancia de estos compuestos como agentes antivirales y antitumorales. La idea original en la que se basó el diseño de esta familia de compuestos es el aumento de la estabilidad de la unión glicosídica C-N produciendo los menores cambios estructurales posibles. Es sabido que la conformación juega un papel muy importante en la modulación de la actividad biológica de una droga. Debido a la ausencia del átomo de oxígeno del anillo furanósico, la conformación de los carbanucleósidos suele diferir de la que presentan los nucleósidos convencionales en solución y, por este motivo, en general son menos efectivos. lnspirados en la estructura cristalina del nucleósido carbocíclico natural neplanocina C (147), se sintetizaron carbanucleósidos conformacionalmente restringidos con un sistema bicíclicohexano como unidad de pseudoazúcar los cuales eran capaces de imitar a la conformación de los nucleósidos convencionales. En esta tesis se sintetizaron por primera vez nucleósidos carbocíclicos conformacionalmente restringidos construidos con un sistema 6-oxabicíclicohexano como unidad de pseudoazúcar. Se presenta la sintesis de 5'-nor-2',3'-didesoxiderivados de neplanocina C diseñados como inhibidores de la enzima S-adenosil-L-homocisteína hidrolasa. Se presenta también la primera síntesis enantioselectiva de neplanocina C (147) y del isómero no natural de neplanocina F (207), otro componente de la familia de nucleósidos carbocíclicos naturales conocida con el nombre de neplanocinas. Por otro lado, (N)-metano-carba-timidina (7) es un nucleósido carbocíclico muy potente como agente antiherpético, más efectivo en ensayos in vitro que las drogas utilizadas en la actualidad para el tratamiento de estas infecciones. Se realizó la sintesis enantioselectiva de 2'-desoxiderivados de neplanocina C con el objeto de evaluar su efectividad como agentes antivirales y como bloques de construcción de oligonucleótidos modificados. Por último. se presenta la primer síntesis enantioselectiva de (1R,2R,5S)-15-(Hidroximetil)biciclohex-2-il}-5-metil-5,3-dihidropirimidina-2,4-diona ((—)-156) diseñados como análogos de d4T (311) y 2'-desoxitimidina (145) y como herramientas para el estudio de la preferencia conformacional de las enzimas involucradas en la activación in vivo de 7. En todos los casos se utilizó una estrategia convergente a través de una reacción de tipo Mitsunobu como método de acoplamiento del anillo carbocíclico y la base purinica o pirimidínica.

Abstract:
The field of carbocyclic nucleosides Chemistry is a topic of great interest which experienced a phenomenal growth in the last years due to the increasing importance of these compounds as antiviral and antitumor agents. The original underlying concept for the synthesis of carbocyclic nucleosides was to seek a stable C-N bond, while causing minimal structural disturbances. It is well known that the conformation of the sugar moiety plays a critical role in modulating biological activity. Because of the loss of the furan oxygen atom, the conformation of the ciclopentane ring in carbocyclic nucleosides differs from that displayed by conventional nucleosides in solution. This conformational difference could explain why certain carbocyclic nucleosides are generally less effective than convetional nucleosides. The bicyclohexane system was used as the pseudosugar moiety to prepare a new family of rigid nucleosides with a conformation that mimics conformations of conventional nucleosides. These compoundos were envisioned by the cristal structure of neplanocina C (147), a naturally occurring carbocyclic nucleoside. In this Thesis, conformationally locked carbocyclic nuclesides built on an oxabicyclohexane unit as pseudosugar moiety were synthesized for the first time. The synthesis of 5'-nor-2’,3'-dideoxyderivatives of neplanocin C is presented. These compounds were designed as S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase inhibitors. The first enantioselective synthesis of neplanocin C (147) and the unnatural isomer of neplanocin F ((+)-207), another component of the neplanocin family of carbocyclic nucleosides were also presented. On the other hand, (N)-methano-carba-thymidine (7) is a carbocyclic nucleside that exhibits very potent action as antiherpetic agent. In in vitro assays, it is more effective than the drugs currently in use for the treatment of herpetic infections.The enantioselective syntheses of 2'-deoxyderivatives of neplanocin C was carried out aim at evaluating their antiviral potency and as building blocks of modified oligonucleotides. Finally, the enantioselective synthesis of (1R,2R,5S)-1--(Hydroxymethyl)bicyclohex-2- y|}-5-methyl-1.3-dihydropyrimidine-2,4-dione((—)-156)is presented. These compounds were designed as d4T (311) and 2'-deoxythymidine (145) analogs and as tools for studying the conformational preferences of enzymes involved in the in vivo activation of 7. In all cases, a convergent approach employing the Mitsunobu reaction was used for coupling the carbocyclic ring with the corresponding purinic and pyrimidinic bases.

Coll, Pablo E.. "Un enfoque poliedral del problema de secuenciamiento de tareas en procesadores heterogéneos bajo relaciones de precedencia" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Estudiamos un algoritmo exacto para el problema de secuenciamiento de tareas en procesadores heterogéneos bajo relaciones de precedencia. En este problema contamos con conjuntos de procesadores y tareas. Las tareas están descriptas por sus duraciones y por un digrafo acíclico de precedencias. El conjunto de procesadores heterogéneos es tal que no pueden establecerse relaciones entre procesadores, tareas y tiempos de procesamiento. No se permitiran las interrupciones de las tareas una vez comenzadas. El objetivo del problema es minimizar el tiempo necesario para completar todas las tareas. Una aplicación se presenta en el contexto de asignar tareas de programas paralelos en computadoras multiprocesador o sistemas distribuidos. Se propone una nueva formulación como problema de programación lineal entera. Esta formulación tiene menos restricciones y variables que las formulaciones previas. Se estudia un poliedro acotado consistente de un subconjunto de desigualdades de la nueva formulación. El poliedro de partición en ordenes lienales (PLO) por sus siglas en inglés, es una relajación y una proyección del poliedro original. Se estudia en detalle el poliedro PLO y se encuentra que muchos resultados son una generalización de aquellos hallados para el poliedro de partición en subgrafos completos . Las desigualdades obtenidas para este poliedro es muy probable que jueguen un importante papel en la formulación y resolución exacta a través de algoritmos de bifurcación y corte de una familia de problemas de secuenciamiento de múltiples máquinas. Finalmente, se desarrolla un algoritmo de bifurcación y corte basado en los cortes específicos desarrollados para el problema en cuestión e igualdades que definen facetas del poliedro PLO y se detallan los resultados computacionales.

Abstract:
We study an exact algorithm for the problem of scheduling unrelated processors under precedence constraints. In this problem we are given sets of tasks and processors. The tasks are described by their processing times and by a directed acyclic graph representing the precedence constraints. The set of unrelated processors is such that no proportional relations can be established between processors, tasks, and processing times. Preemption is not allowed. The goal of the Optimization problem is the minimization of the makespan, i.e., time needed to complete all tasks. An application arises in the context of scheduling tasks of parallel programs in multi-processor computers or distributed systems. A new integer programming formulation for the problem is proposed. This formulation has less contraints and variables than previous formulations. A polytope consisting of the subset of inequalities of the new formulation that defines a partition in linear orderings is studied. The partition in linear orderings (PLO) polytope is a relaxation and a projection of the original polytope. The PLO polytope is studied in detail and many results are found to be generalizations of those of the clique partition polytope . The inequalities obtained for this polyhedron are likely to play an important role in the formulation and exact solution via branch-and-cut algorithms of a family of multiple machines scheduling problems. Finally, a branch-and-cut algorithm is developed based on cuts specific to the scheduling problem under consideration and on facet defining inequalities for the PLO polytope. Computational results are reported.

Chernomoretz, Ariel. "Fragmentación de sistemas finitos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En la presente tesis estudiamos procesos de fragmentación de sistemas finitos, formados por constituyentes que interactúan de a pares a través de potenciales de corto rango. Utilizamos técnicas de dinámica molecular para simular experimentos de fragmentación de sistemas confinados en volúmen, de sistemas libres no-confinados y de procesos de producción de fragmentos como consecuencia de colisiones entre un blanco y un proyectil. En cada escenario analizamos el proceso de formación de fragmentos no sólo en el espacio configuracional, sino también en el espacio de fases, utilizando algoritmos avanzados de reconocimiento de fragmentos que buscan estructuras ligadas en el espacio q-p. En el estudio de sistemas confinados encontramos, para situaciones de alta dilución, claras señales de una transición de fase de primer orden, entre una fase tipo-líquida (presencia de una gota de gran masa) y una fase tipo-vapor (sólo fragmentos livianos), que tiene lugar en un sistema finito. Analizamos la existencia de fluctuaciones anormalmente grandes de la energía cinética, curvas calóricas con convexidades anómalas (loops) y calores específicos negativos. Determinamos el origen microscópico de dichas señales y pudimos explicar cómo “desaparecen” en la medida en que la densidad del sistema aumenta y la transición se torna contínua. A su vez, utilizando información de correlaciones microscópicas en el espacio de fases, pudimos obtener el diagrama de fases y caracterizar el comportamiento crítico del sistema. En el análisis de sistemas no-confinados encontramos que la dinámica del sistema sólo admite el establecimiento de un equilibrio local sobre un campo de velocidades asociado a un movimiento colectivo de expansión. En este nuevo escenario estudiamos el comportamiento de la curva calórica y la dependencia temporal de observables tales como las fluctuaciones relativas de la energía cinética, K y los espectros de masas de los fragmentos producidos. Pudimos reconocer el vínculo natural que se presenta entre fluctuaciones anormalmente grandes de K y la presencia de espectros de masa asintóticos libres de escala. Finalmente analizamos dos aspectos relacionados directamente con el mecanismo de excitación por colisiones. Por un lado estudiamos el proceso de deposición de energía en el blanco por parte del proyectil y pudimos encontrar la correspondiente curva calórica, encontrando que presentaba características similares al caso de explosiones no confinadas. Por otra parte, considerando un potencial semi-clásico para modelar la interacción nuclear, pudimos desarrollar un modelo de formación de fragmentos en colisiones de iones pesados que fija un marco dentro del cual se pueden interpretar recientes resultados experimentales.

Abstract:
In this thesis we studied the process of fragmentation of small systems composed by atomistic constituents that interact through short range potentials. We used molecular dynamics techniques in order to simulate fragmentation processes that take place in volume constrained systems, free to expand systems, and projectile-target collisions. We characterized the process of fragment formation not only in configurational space but also in phase space. We used, to that end, advance fragment recognition algorithms that search for well correlated structures in q-p space. In the case of constrained systems, for very diluted configurations, clear signals of a first order phase transitions taking place between a liquid-like phase (presence of a big cluster) and a gas-like phase (just light clusters) could be found. In particular, we analyzed the presence of abnormaly large kinetic energy fluctuations, abnormal convexities (loops) in caloric curves, and negative specific heats. We analyzed the microscopic origin of those signals, and explained why they dissapear as the system density is increased. Finally, using information about the microscopic correlations in phase space, we obtained the system phase diagram and characterized its critical behavior. For non-constrained systems we found that a local equilibrium picture, mounted over an expansive collective motion, is best suited to describe the fragmentation scenario. In this case, we studied the caloric curve behavior and the temporal evolution of observables like mass fragment distributions and relative kinetic energy fluctuations. In this way, we could recognize the relationship between large K fluctuations and scale-free asymptotic mass distributions. Finally, we analized two features directly related to collisions as a mechanism to excite finite system. On one hand, we studied the energy deposition process in the target, and calculated the respective caloric curve, finding that it presented the same features as the one corresponding to the non-constrained case. On the other hand, we introduced a quasi-classical model for the fragment formation process that take place in heavy ion collisions.

Chaia, Zulema Débora. "Síntesis y estudios fisicoquímicos de cristales líquidos moleculares derivados de rutenio y cobre" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El crecimiento exponencial de los avances tecnológicos actuales impulsa la sintesis de materiales moleculares con propiedades fisicoquimicas bien determinadas. Esto ha incentivado el desarrollo de nuevos compuestos con propiedades cristal líquido conteniendo metales de transición. Cuatro grupos de metalomesógenos se estudian en este trabajo, con el propósito de lograr mesofases estables a baja temperatura y caracterizar dichas fases desde el punto de vista estructural. La combinación de diferentes ligandos ecuatoriales y axiales se analizó en tres series de carboxilatos binucleares de rutenio de valencia mixta: Ru2(Cn),DOS, Ru2(B2OCn),DOS y Ru2(B3OCn), Cl. Además, se estudió la influencia de la introducción de ligandos voluminosos en una serie de complejos de cobre:Cu2(B3OCn). Se logró descender la temperatura de transición hacia la mesofase, respecto de los compuestos previamente estudiados por otros autores haciendo uso del principio del llenado eficaz del espacio intermolecular. De esta manera se logró obtener mesofases aún a temperatura ambiente en ciertos complejos de rutenio. La aparición de mesofases cúbicas en algunos de estos compuestos contribuye a la diversificación de la geometria molecular: a la vez que permite establecer nexos másfuertes entre compuestos termotrópicos y liotrópicos. Sobre la base de experimentos de difracción de rayos-X y con la ayuda de técnicas complementarias utilizadas como sondas locales, se propone en cada caso un modelo estructural adecuado.

Abstract:
The exponential growth of technological advances pushed up the synthesis of molecular materials exhibiting special physicochemical properties. This fact increased the development of new compounds showing liquid crystal behaviuor and containing transition metal atoms. In the present work four series of metallomesogens have been studied. with the aim of stabilizing low temperature mesophases in order to overcame a structural analysis. The combination of different equatorial and axial ligands was studied in the following series of ruthenium dinuclear mixed valence carboxylates: Ru2(Cn),DOS. Ru2(B2OCn),DOS and Ru2(B3OCn),Cl. Also, the influence of the introduction of bulky ligands in the copper complexes of the series Cu2(B3OCn),was analysed . A decrease in the transition temperature to the mesophase was achieved exploiting the principle of the intermolecular space filling. Thus even room temperature mesophases were obtained for some ruthenium complexes. Cubic mesophases appearance contribute to the diversification of the geometry and rise on a renewed link between thermotropic and lyotropic compounds. A structural model is proposed in each of the series on a basis of X-ray diffraction experiments and other complimentary techniques used as local probes.

Ceballos, Ana. "Evaluación de factores involucrados en la transmisión vertical del HIV-1" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
El 95% de los niños infectados con HIV-1 en el mundo contraen la infección por transmisión vertical. En la Argentina han sido informados hasta septiembre del 2001 1260 niños con SIDA, que corresponde al 7% del total de casos, el más alto de América Latina. Se han descripto muchos factores, virológicos e inmunológicos, que inciden sobre la tasa de transmisión. Actualmente existen protocolos eficaces de tratamiento antiviral y de procedimientos obstétricos para la prevención de la transmisión vertical. Sin embargo, el costo de los tratamientos resulta muy oneroso para los países en vías de desarrollo, por lo cual se está muy lejos de la resolución del problema. Por otro lado, el diagnóstico de la infección del niño nacido de madre infectada es más complejo que el del adulto, dada la persistencia de IgG maternas durante los primeros 12 meses de vida. Esta tesis aborda la transmisión vertical del HIV-1 desde distintos enfoques. Inicialmente se realizó un estudio de población en Buenos Aires y alrededores, para evaluar el éxito de las estrategias implementadas para prevenir la transmisión vertical desde 1993 hasta 2001, con el estudio de 874 familias. Se demostró un aumento gradual en el número de madres y niños que siguieron el protocolo ACTG 076 (AZT para la prevención de la transmisión vertical) que alcanzó un 80% en el período 1999-2000. Se registró un aumento en el número de niños nacidos por cesárea que alcanzó un 54.8% durante 1999-2000 contra un 19.4 en 1993-1995. La efectividad de estas medidas se vio reflejada en la disminución de la tasa de transmisión madre a hijo de 37,3% en el período 1993-1995 a 6.5% en el año 2001. Sin embargo, un porcentaje constante de mujeres (12%) continuaron amamantando en el período estudiado, desde 1993 hasta el 2000. El porcentaje de mujeres que se enteraron de su infección luego del nacimiento del niño también fue del 12%. Estos resultados muestran la necesidad de implementar estrategias adicionales que generalicen la educación, la consulta y el diagnóstico en las mujeres jóvenes y sus parejas. Se estudió la eficiencia de la detección de la IgA específica en l4l niños, 46 tratados bajo protocolo ACTG 076 y 95 no tratados, demostrando que no se encontraron diferencias significativas respecto a los niños no tratados, a pesar de que la sensibilidad es menor en los niños tratados. Al cuantificar los sueros de estos niños se observan títulos menores en los niños tratados. Sin embargo, esto no altera la detección e indica el valor de la prueba en niños tratados, que hoy en día son la mayoría. Se estudió la reactividad frente a péptidos del V3 loop del gen env de variantes locales recombinantes y de los subtipos B y F de 22 madres transmisoras y 22 no transmisoras de la infección. Se demostró una mayor reactividad en las muestras de plasma de las madres no transmisoras frente a las transmisoras con el péptido SF2 y B/F, y además una diferencia significativa en la reactividad general frente al péptido recombínante B/F local. Esto indicaría la importancia de la inmunidad humoral en la protección frente a la transmisión vertical del HIV-1. Estos resultados apoyarían el uso de inmunosueros para evitar la transmisión madre a hijo. No se encontraron diferencias significativas entre madres tratadas y no tratadas con antirretrovirales. La transmisión vertical del HIV-1 ocurre predominantemente en el parto, presumiblemente a través del contacto con líquidos y sangre materna. La oxitocina y las prostaglandinas (PGs) son hormonas que inducen el trabajo de parto fisiológicamente, y que son aplicadas en forma terapéutica para activar el proceso del nacimiento. Por otro lado, la oxitocina interviene en la lactancia materna. Se estudió la acción de dichas hormonas in vitro sobre la replicación del HIV-1. Se demostró que la PGF2α disminuye transitoriamente la producción del antígeno p24 en células persistentemente infectadas con HIV-1 y no en células con infección aguda, mientras que la oxitocina y la PGE2 no produjeron ninguna variación en la cantidad de virus. Esto demuestra que tanto la oxitocina como la prostaglandina se pueden utilizar terapéuticamente sin temor a que potencien la replicación viral en el momento del parto. Finalmente se analizó la variabilidad viral en casos de transmisión a niños utilizando métodos moleculares, filogenéticos y de evolución simulada. Se demostraron dos casos de transmisión horizontal de padre a hijo. Aunque estos casos deben ser considerados excepcionales en la clínica, sin embargo, el conocimiento de estas excepciones ayuda a limitar las oportunidades de la transmisión del HIV-1 en lugares poco comunes tales como en el seno familiar y, dado que, la extensión de la epidemia es considerable, podrían presentarse más casos de este tipo en el futuro. Por otro lado, por demanda legal, se demostró un evento de transmisión ocunido 7 años antes de la obtención de las muestras entre un donante, una madre receptora de la transfusión y su hijo. Estos métodos podrían utilizarse en casos semejantes en los cuales no se cuenta con datos epidemiológicos y clínicos suficientes y se debe corroborar un hecho de transmisión. Por otro lado, se analizó la variabilidad viral en cuatro casos de seroconversión materna durante el embarazo y/o la lactancia y se observó que las madres presentaban poblaciones virales con baja variabilidad. A pesar de la similitud entre las variantes maternas, no se observó un fenómeno de selección en la transmisión, las madres pudieron transmitir múltiples variantes virales a sus hijos. Esto puede deberse a la falta de madurez de la respuesta inmune materna, que parecería jugar un papel importante en el origen de la variabilidad viral del gen env y en los mecanismos de selección viral durante la trasnmisión vertical del HIV-1. Estos casos de seroconversión durante el embarazo y transmisión de la infección al niño muestran la necesidad de realizar diagnósticos durante y después del embarazo. Además, en poblaciones donde la incidencia de HIV entre las mujeres jóvenes es alta, se deberia repetir el diagnóstico en los últimos meses del embarazo o en el parto, las cuales permitirían implementar intervenciones para prevenir la transmisión vertical.

Abstract:
Vertical transmission is responsible for 95% of the children infected with HIV-1 in the wordl. In Argentina until September 2001, 1260 children with AIDS were reported, 7% of total AIDS cases in the country, the highest level of Latin America. Many different factors, whether virological or immunological, have been described to have an effect on the transmission rate. There are now efficacious treatment protocols as well as obstetric procedures to avoid vertical transmission. However, the cost of these treatments is too high for developing countries, therefore the problem is far from being solved. Further, the diagnosis of pediatric HIV infection is more complicated than that of the adult, due to the persistence of maternal IgG during the first 12 months of life. This tesis faces the problem of vertical transmission from different sides. Initially a study was performed to evaluate the success of a National Program for the prevention of mother to child transmission (MTCT) in 874 mother-infant pairs from Buenos Aires and its surroundings. This population was referred to the National Reference Center for AIDS for diagnosis of neonatal infection during 1993-2000. The data revealed a substantial increase in the percentage in the use of antiretroviral therapy during pregnancy from 3.2% in 1993-1994 to 73.1% in 1999-2000. An increase in the use of Caesarean section (reaching 54.8% in 1999-2000) was observed. However, the proportion of HIV-infected women who continued to breast feed their children remained steady (around 12%). The general improvement of the conditions to decrease MTCT resulted in a significant decrease of infected infants from 37.3% before 1995 to 10.7% in 1999-2000, and even 6.5% during 2001. Data on the time of diagnosis indicates that only 42.7% of the women knew about their HIV status before pregnancy, 44.8 during pregnancy and 12.3% after the birth of their child. The main risk factor for HIV infection of the mothers was heterosexual contact (73%) and for fathers was injection drug use (67 %). These results point out the urgent need to develop additional strategies to generalize education, counseling, and testing of young women. The efficiency of IgA detection was studied in children treated under protocol O76, showing no significant differences with the untreated children, in spite of a lower sensitivity in treated children. Samples of this groups of children were quantified and the titers for IgA were lower in treated childre. However, this fact doesnt alterate the detection possibilities. These results show the usefulness of this test in ACTG 076 treated children, which today are the majority. The reactivity to V3 loop peptides from env gen of local recombinant forms as well as B & F subtypes was analysed in plasma samples of 22 HIV-transmitting and 22 non transmitting mothers. A higher reactivity was shown in the samples of non transmitting mothers compared to the transmitting ones. Further, there was a general significant reactivity to the B/F recombinant local peptide. These results would point out the importance of humoral immunity in the protection for vertical transmission of HIV-1 and would support the use of hiperimmune sera to avoid mother to child transmission. No significant differences were found between treated and non treated mothers. Mother to child transmision of HIV occurs mainly during birth, probably through the contact with maternal blood and liquids. Oxytocin and prostaglandins (PGs) are hormones involved in labor and are used clinically for its induction. The effect of oxytocin, PGF2α, and PGE2 on HIV-l replication in vitro was analysed. No significant effect on p24 antigen production in acutely or persistently infected cells was found within the range of concentrations of oxytocin or PGs assayed, except for a transient decrease in persistently infected cells treated with 1μM PGF2α. These results showed that oxytocin and PGs could be used clinically for labor induction without any direct enhancement in viral production. Finally, viral variability in cases of transmission of HIV to children was analysed by means of mollecular, filogenetic and simulated evolution methods. Two cases of father to child horizontal transmission were proven with filogenetic methods. Even if these cases should be considered as exceptional in the clinical experience, nevertheless their knowledge helps to limitate the opportunities of HIV transmission in such uncommon places as the nuclear family. Further, since the epidemics is in expansion, new cases like those could appear in the future. By legal demand on our laboartory, an event of transmission which happenned 7 years before was shown with simulated evolution. This event included a male blood donor, a woman receptor of the transfussion during puerperium and her son. These methods could be used in similar situations in which the epidemiological and clinical data are insufficient and a transmission event has to be ascertained. Also, viral variability was analysed by means of mollecular cloning in four cases of maternal seroconversion during pregnancy and/or lactancy. Maternal viral populations presented low variability. In spite of the maternal variant likeness, no apparent selection was observed in mother to child transmission, and the children showed multiple variants shown in ther respective mothers. This could be due to the lack of maturity in the immune response of the mothers, which would apparently play an important rol in the origin of the variability of the env gen and in the mechanisms of viral selection during mother to child transmission of HIV. The mentioned cases of seroconversion show the need to strenghten the counseling ans testing of HIV during pregnancy. Further, in populations where HIV incidence is high, diagnosis should be repeated in the last trimester, to be able to take interventions to avoid mother to child transmission.

Castillo, Marcelo Daniel. "Prevención de la contaminación por hongos toxigénicos y sus micotoxinas en una leguminosa, Poroto (Phaseolus vulgaris L.): parámetros de almacenamiento, flora fúngica contaminante, probables micotoxinas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Carrillo, Carolina. "Metabolismo de las poliaminas y su regulación en parásitos tripanosomatidos : expresión del gen de la Ornitina decarboxilasa (ODC) de C. fasciculata en T. cruzi" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Trypanosoma cruzi es el agente causal del “Mal de Chagas”, enfermedad endémica en América Latina. Este parásito unicelular, al igual que otros parásitos tripanosomátidos, presenta un complejo ciclo de vida a través de diferentes hospedadores (insecto vector - hospedador vertebrado). A lo largo de su ciclo el parásito pasa por distintos estadios celulares, sufriendo profundos cambios morfológicos, fisiológicos y bioquímicos que le permiten adaptarse a los distintos ambientes. Uno de los estadios, el epimastigote, no es infectivo para el hospedador vertebrado y presenta una capacidad proliferativa que permite su cultivo en el laboratorio sin mayores dificultades. Trypanosoma cruzi presenta numerosas características metabólicas que lo diferencian de otros organismos incluso del mismo orden. Describir estas diferencias permitiría conocer más detalladamente al parásito aportando datos de utilidad taxonómica y evolutiva y contribuiría al posible desarrollo de tratamientos quimioterapéuticos más específicos y eficientes que los disponibles hasta el presente. Un punto clave en el metabolismo de los tripanosomátidos está asociado a las poliaminas. Estos policationes alifáticos (putrescina, esperrnidina y espermina) están presentes en la mayoría de los organismos, tanto procariotas como eucariotas, cumpliendo funciones celulares esenciales tales como asistir la síntesis de ácidos nucleicos y proteínas, estabilizar macromoléculas y estructuras celulares y participar en la proliferación y diferenciación celular. La biosíntesis de poliaminas comienza por la conversión de ornitina en putrescina por acción de la ornitina decarboxilasa (ODC). Esta enzima es fundamental en la regulación de la síntesis de poliaminas y su actividad esta rigurosamente controlada a distintos niveles. Además, se ha descripto un inhibidor específico e irreversible, difluorometilornitina (DFMO), que ha facilitado el estudio de dicha enzima. Una vía alternativa de síntesis de putrescina actúa a través de la arginina decarboxilasa (ADC) cuyo sustrato es el aminoácido arginina. Esta enzima fue inicialmente descripta en plantas y bacterias y recientemente ha sido encontrada en ciertos tejidos de mamíferos. En parásitos protozoarios existen controversias con respecto a la existencia de las enzimas que catalizan el primer paso de la síntesis de poliaminas, especialmente la ADC. La discutida carencia de dichas actividades es suplida por un transporte activo constitutivo de poliaminas desde el medio extracelular. A lo largo de este trabajo confirmamos que los epimastigotes de distintas cepas de T. cruzi son auxótrofas para poliaminas. Esta auxotrofia esta ocasionada por la falta de la actividad enzimática de ODC y de ADC que, a su vez, se da por la ausencia de los genes correspondientes. Además, se transfectaron epimastigotes de T. cruzi con un vector de expresión recombinado con el gen de ODC de Crithidia fasciculata (clonado en este laboratorio). De este modo, caracterizamos al cultivo transfectado con el gen heterólogo de ODC a nivel fisiológico (capacidad proliferativa), bioquímico (síntesis y concentración intracelular de poliaminas y caracterización de la actividad enzimática heteróloga) y molecular (ubicación del gen heterólogo, determinación del número de copias, etc.). El cultivo transfectado se volvió autótrofo para poliaminas y sensible al inhibidor de la ODC, el DFMO. Sin embargo, luego de un cierto tiempo de cultivo en presencia del inhibidor se seleccionó una subpoblación resistente a DFMO. Este cultivo también fue caracterizado comparándolo con los cultivos sensibles. Finalmente, el parásito transfectado con el gen heterólogo de ODC contribuyó con los estudios sobre el metabolismo de las poliaminas en T. cruzí y podría ser útil en futuras investigaciones acerca de la relación poliaminas - diferenciación a tripomastigote (metaciclogénesis) y poliaminas - infectividad en células de mamíferos.

Abstract:
Trypanosoma cruzi is the etiological agent of “Mal de Chagas”, an endemic illness in Latin America. This unicellular parasite, as other trypanosomatid protozoa, has a complex life cycle involving different hosts (insect vectors - vertebrate hosts). During its life cycle the parasite pass through several differentiation stages undergoing mayor morphological, physiological and biochemical changes in order to adapt to variable environments. Epimastigote is the noninfective form, which proliferates inside the insect and can be easily cultivated in axenic media. Trypanosoma cruzi differs from other trypanosomatid parasites in many physiological and metabolic characteristics. The study of these properties would increase the knowledge of the parasite, providing useful taxonomic and evolutive information. It would also contribute to the development of more specific and efficient chemoterapies against this protozoo. A key point of trypanosome metabolism is related to polyamines. These aliphatic cationes (putrescina, espermidina y espermina) are present in almost all living organisms (prokaryotes as well as eukaryotes). It is well known that polyamines participate in nucleic acids and protein syntheses and can stabilize macromolecules and cellular structures, therefore playing essential roles in cellular proliferation and differentiation. The biosynthesis of polyamines begins with the conversion of ornithine to putrescine by ornithine decarboxylase (ODC). This enzyme is essential in the regulation of the pathway and its activity is tightly controlled at different levels. Difluoromethil-ornitine (DFMO), an specific and irreversible inhibitor of ODC, has been described ago. Arginine decarboxylase (ADC), which catalyses an alternative route to synthesize putrescine from arginine has been first described in plants and bacteria, but recently has also been found in some mammal tissues. The presence of both polyamine biosynthetic pathways (from ornithine and arginine) in some protozoa has been a matter of controversy for many years. In this work, we confirmed that epimastigotes from different wild type strains of T. cruzi are auxotrophic for polyamines. This auxotrophy is due to the absence of ODC and ADC genes in the protozoa genome. These parasites which contain neither ODC nor ADC enzymatic activities are able to obtain polyamines from the environment through an active transport mechanism. We have been able to transform wild type T. cruzi epimastigotes with a recombinant plasmid bearing the ODC gene from Crithidia fasciculata (cloned in a previous work of our laboratory). The resulting transgenic parasites have been studied at the physiological, biochemical and molecular levels in order to determine the relationship among proliferation capacity, intracellular polyamine levels and exogenous gene location and expression. The transfected cultures became autotrophic for polyamine and sensitive to the presence of DFMO. However, after some time of exposure to high levels of the inhibitor, a DFMO resistant subpopulation was naturally selected. This resistant culture has been characterized together with the sensitive counterpart. The transfected parasites containing the heterologous ODC gene is a valuable tool to improve our knowledge about polyamine metabolism in T. cruzi; it could be very useful to study the relationship among differentiation to trypomastigote form (metacyclogenesis), infectivity towards mammalian cells and polyamine endogenous concentrations.

Carnevale, Silvana. "Diagnóstico de paludismo por Plasmodium Vivax utilizando secuencias repetitivas de ADN parasitario" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La malaria es un problema de salud pública mundial en más de 100 paises habitados por un total de 2.400 millones de personas, representando el 40% de la población mundial. Las cuatro especies más comunes que infectan al hombre son: Plasmodium vivax, P. falciparum, P. malariae y P. ovale, de las cuales, las dos primeras, representan el 95% de las infecciones. En Argentina se plantea la necesidad de trabajar sobre P. vivax, pues no se han registrado casos autóctonos de paludismo por P. falciparum. El propósito de este estudio fue disponer de herramientas moleculares para la detección de P. vivax, aplicables a muestras humanas y vectores, adaptables a las condiciones de recolección y procesamiento básico disponibles en las bases operativas del Programa Nacional de Paludismo. Para ello se obtuvieron y caracterizaron secuencias repetitivas de ADN de P. vivax. El fragmento clonado (instPv10) resultó en un tamaño de 6.899 pb y presentó varias repeticiones directas en tandem y un elemento repetitivo del tipo disperso. Este fragmento incluyó la secuencia específica de P. vivax, insPv10-ll, de 75 pb, que fue empleada como sonda en el desarrollo de la técnica de Dot blot, y la secuencia insPvE/C, dentro de la cual se diseñó el blanco de reacción de PCR. Desde el punto de vista del diagnóstico individual, las técnicas de PCR-sangre e insPv10-11-Dot blot demostraron ser valiosas para emplearse como métodos en el diagnóstico de pacientes sintomáticos y asintomáticos, incluyendo aquellos que retoman de una zona endémica de infecciones causadas por P. vivax, y para el seguimiento de pacientes. Desde la perspectiva epidemiológica la técnica de PCR-elutorios desarrollada en este trabajo permitió efectuar el diagnóstico específico de la especie P. vivax en pacientes sintomáticos y asintomáticos, lo que facilitaría su uso en acciones de detección por búsqueda pasiva y activa. Por otro lado, el método de PCR aplicado a vectores mostró ser una de las pocas alternativas disponibles de alta sensibilidad y especificidad para la detección de P. vivax en mosquitos experimental y naturalmente infectados, con condiciones prácticas de conservación de muestras. Las técnicas desarrolladas en este trabajo son de utilidad para el manejo de brotes y epidemias ya contribuyen a la detección del aumento de la tasa de infección en mosquitos, al estudio de las migraciones y la vigilancia de la quimiorresistencia. El trabajo realizado se enmarca como un desarrollo local de herramientas diagnósticas aplicables al control del paludismo en Argentina.

Abstract:
Malaria is a public health problem in more than one hundred countries, meaning that 40% (2,400 million) of the world’s total population is exposed to malaria risk. The four common species that infect humans are Plasmodium vivax, P. falciparum, P. malariae y P. ovale, and the two first ones represent 95% of infections. In Argentina it is necessary to work on P. vivax, because there are not local cases of malaria due to P. falciparum. The purpose of this study was to have disposal of molecular tools for the detection of P. vivax, that could be applied to human and mosquito samples, and adapted to the basic conditions of collection and processing available at the operating settings of the National Malaria Programme. In this way we obtained and characterized repetitive sequences of P. vivax DNA. The cloned fragment (insPv10) resulted in a molecular size of 6,899 bp, with several tandem direct repeats and a repetitive interspersed element. This fragment included the insPv10-ll P. vivax-specific sequence (75 bp), employed as probe for the development of the Dot blot technique, and the insPvE/C sequence, inside which the PCR target was designed. At the individual level, the PCR-blood and insPv10-11-Dot blot demonstrated to be valuable methods for the diagnosis of symptomatic and asymptomatic patients, including those returning from P. vivax endemic areas, and for management of cases. At the epidemiological level, the technique of PCR-blood impregnated filter paper disks developed in this work allowed the specific diagnosis of P. vivax in symptomatic and asymptomatic patients. This fact could facilitate its use in active and passive surveillance. The PCR methodology applied to malaria vectors showed to be one of the few available alternatives of high sensitivity and specificity for the detection of P. vivax in experimentally and naturally infected mosquitoes, with practical conditions for sample storage. The techniques developed in this work are useful for management of outbreaks and epidemics, as they contribute to the detection of increased infection ratios in mosquitoes, to the study of migrations, and to the surveillance of drug resistance. This work can be described as a local development of diagnostic tools that can be applied to malaria control in Argentina.

Capuzzi, Pablo. "Gases cuánticos confinados en trampas magnéticas múltiples" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
A partir del descubrimiento de la condensación de Bose-Einstein en gases diluidos confinados, a mediados de 1995, una nueva rama de la física comenzó a desarrollarse fuertemente. Dentro de esta área, esta tesis abarca el estudio de las propiedades en equilibrio y de las excitaciones de un gas de átomos confinados y enfriados a temperaturas donde la degeneración cuántica juega un papel fundamental. Motivados por los hallazgos experimentales, se estudiaron sistemas con múltiples componentes bosónicas y fermiónicas. El análisis se enfocó en tres sistemas particulares: bosones en pozos dobles, fermiones puros, y mezclas fermiones-bosones. Dentro de estos temas exploramos, entre otras cosas, la dependencia de las funciones termodinámicas con la geometría de pozo doble, la influencia de la interacción en la temperatura crítica y en las excitaciones, la respuesta lineal de mezclas fermiónicas puras y mezclas bosón-fermión ante perturbaciones multipolares. En todos los casos la formulación de campo medio escogida dio resultados confiables e interesantes a la vez.

Abstract:
Since the discovery of the Bose-Einstein condensation in dilute trapped gases in 1995, a new area in atomic physics began to develop strongly. Within this field, this PhD thesis embraces the study of the stationary properties and excitations of a confined gas which has been cooled down to a temperature where quantum degeneracy sets in. Encouraged by the latest experimental breakthroughs, we studied systems with multiple bosonic and fermionic components. The analysis was focused on three especific systems: bosons in double-well traps, pure confined fermions, and Bose-Fermi mixtures. We explored, within other topics, the dependence of the thermodynamical functions upon the trap geometry, the influence of interparticle interaction on both the critical temperature and the excitations, and the linear response of the gas mixtures against multipolar deformations of the trap. We found that the mean-field formulation yields both reliable and interesting results.

Capozzo, Alejandra Victoria. "Evaluación de la respuesta inmune humoral contra el virus de la fiebre aftosa inducida por inmunógenos tradicionales y recombinantes : Desarrollo de métodos de vacunación alternativa utilizando proteínas quiméricas y ADN como inmunógenos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La fiebre aftosa (FA) es una enfermedad viral altamente contagiosa que afecta a animales de pezuña hendida, como vacunos y porcinos; es causante de epidemias repentinas que acarrrean grandes pérdidas económicas. El control de esta enfermedad se realiza mediante la aplicación regular de vacunas a virus inactivado que son efectivas, pero que poseen el riesgo de re-introducción de la enfermedad debido al manipuleo de grandes cantidades de vian infeccioso o por la inactivación incompleta del antígeno. Este trabajo tiene por objetivos establecer parámetros serológicos que puedan ser útiles para la evaluación del nivel de protección de los animales, y el desarrollo de una estrategia de vacunación alternativa que conjugue seguridad y bajos costos. En primer lugar se evaluó la respuesta imnune humoral y su eventual correlación con el grado de protección contra la fiebre aftosa. Se estableció una correlación entre los niveles de isotipo IgG1 especificos contra VFA y protección. En una segunda parte, se construyeron genes quiméricos codificantes del gen para la proteína G del virus de la estomatitis vesicular (VSV-G),una glicoproteína altamente inmunogénica que posee epitopes T funcionales, como carrier del principal sitio antigénico presente en la proteína capsidal VP1 de VFA (ASA), blanco de la respuesta neutralizante. Estos genes quiméricos, uno con la secuencia entera de la G y otro con una deleción de la zona central y 3’, fueron expresados y caracterizados antigénicamente en sistemas libre de células y por transfección de células de mamíferos. Las proteínas quiméricas lograron exponer el epitope elegido en la conformación adecuada, similar sino idéntica a la presente en los viriones. Las construcciones expresadas en el sistema Baculovirus recombinante-céluias de insecto fueron inoculadas i.m. en bovinos en dos dosis de 30 ó 100 μg. La versión delecionada indujo una respuesta humoral con altos niveles de IgG1 y buena actividad neutralizante a los 90 días post vacunación (d.p.v). Se evaluaron las mismas construcciones como vacunas genéticas. Ratones vacunados con ADN codificante para estas quimeras respondieron con un perfil de respuesta Th1, presentando altos niveles de IgG2a. Bovinos vacunados con ADN codificante de la versión delecionada de la quimera, desarrollaron títulos de IgG1 anti VFA específicos tras una sola dosis (15 d.p.v) de 150 μg, pero los niveles de IgG2 prevalecieron a partir de los 45 d.p.v. En este trabajo se propone una estrategia de control de la FA mediante vacunación, combinando la utilización de proteinas recombinantes y ADN a fin de lograr una respuesta protectiva a largo plazo, sin los riesgos asociados a las vacunas a virus inactivado.

Abstract:
Foot and mouth disease (FMD) is a highly contagious viral disease of cloven-hoofed animals. It has the potential to cause explosive epidemics and huge economic losses to the agricultural industry worldwide. FMD control relies on regular vaccination with inactivated virus, which have been proven to be effective. However, current vaccines posses the risk of re-introduction of the disease due to handling of large amounts of infectious virus and by incomplete inactivation of the antigen. The main objectives of this work are, searching for serological parameters that could be useful in the evaluation of the potency of anti FMDV vaccines and subsequently, to develop efficient recombinant immunogens with potential as a safe and low cost non infectious candidates for massive vaccination of farm animals against FMDV. Qualitative aspects of bovine humoral response to commercial vaccines were first evaluated through the analysis of more than 200 samples. It was found that high levels of IgG1 isotype are directly correlated with protection and recovery from the disease. In a second part, hybrid genes coding for a carrier protein and a major antigenic site of FMDV VP1 were developed. Vesicular stomatitis virus (VSV) glycoprotein (G), which is highly immunogenic and has T-cell epitopes along its sequence, was chosen as a carrier for the 140-160 FMD virus major B- epitope of the capsidal protein VP1. One chimeric gene having the whole sequence of VSV-G and a second one, containing only the 3' third of the G gene, displayed FMD virus B-cell epitope activity, conformational dependent and somehow emulating the exposure encountered in the whole virus. Cattle vaccinated twice with 30 or 100 μg of the deleted baculovirus-expressed version of the chimera elicited a humoral immune response with high specific IgG1 levels and efficient neutralizing activity at 90 days post vaccination. DNA vaccines, that elicit both humoral and cellular immune response and are stable at room temperature, were also evaluated. Mice vaccinated with DNA encoding the G-VFA chimeras elicited a Th1 biased response, with high IgG2a levels. Cattle vaccinated with equivalent chimeric genes developed high IgG1 titers after 1 dose (150 μg) at 15 days post vaccination, but higher IgG2 levels were induced at longer periods. A strategy based in combining protein and DNA vaccination is proposed so as to immunize young animals and achieve a long lasting response, avoiding the risks associated with whole-virus inactivated vaccines.

Cameo, Paula. "La Leptina : una nueva hormona placentaria? Su función en la placenta humana" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Desde que se la descubriera en 1994, la leptina, una proteína de 16 kDa (167 aminoácidos) expresada por el gen de la obesidad (OB), ha atraído mucha atención debido a su papel importante en la regulación del balance energético. Durante los últimos años se ha sugerido que la leptina podría tener funciones diferentes durante la preñez, particularmente en la fisiología feto-placentaria. Utilizando cultivos primarios de células de CTB y STB y explantos de vellosidades coriónicas, evaluamos: 1) el papel de la leptina como moduladora de la secreción de hCG, progesterona y IL-6, 2) su efecto sobre la capacidad invasiva del trofoblasto, 3) la regulación de la secreción de leptina por distintos factores presentes en la interfase materno/fetal, 4) la expresión del receptor de leptina en el trofoblasto y 5) los niveles de leptina presentes en sueros de pacientes con problemas de aborto recurrente espontáneo (RSA). Se observó la expresión del ARNmde leptina en estos cultivos por medio de técnicas de RT-PCR. La leptina recombinante humana tuvo un efecto estimulatorio sobre la secreción de hCG y IL-6 y un efecto inhibitorio sobre la secreción de progesterona por el trofoblasto humano. Además, la leptina estimuló la actividad de la MMP-9 en estos cultivos. IL-6, IL-1, estradiol, hCG y pregnenolona estimularon la producción de leptina por la placenta; colesterol, TNF-α y M-CSF no tuvieron efecto. Observamos también la expresión de dos isoformas del receptor de la leptina; una de 187KDa y otra de 28KDa. La concentración de leptina en sueros de pacientes RSA fue significativamente menor, comparada con valores controles publicados por diferentes autores. Todos estos resultados apoyan la hipótesis que la leptina cumple un papel importante en fisiología feto-placentaria humana.

Abstract:
Leptin, the 16 KDa protein product of the obese (OB) gene, was originally seen as an adipocyte-derived signaling molecule. In recent years it has been suggested to be involved in some functions during pregnancy, particularly in the placenta. In this work we investigated the role of leptin in many of the fundamental functions of human placenta. Using cultures of CTB and STB cells and chorionic explant cultures we evaluated leptin role as a modulator of hCG, progesterone and IL-6 secretion, leptin effect on trophoblast gelatinolitic activity, cytokine and hormone modulatíon of leptin secretion by the trophoblast and leptin receptor expression. Additionally we measured leptin levels in sera form patients suffering recurrent spontaneous abortion (RSA). Leptin mRNA expression in these cultures was observed by reverse transcription - polymerase chain reaction. Recombinant human leptin showed a stimulatory effect on hCG and IL-6 secretion and an inhibítory effect on progesterone secretion by human trophoblast. It also stimulated MMP-9 activity in term tropholast cultures. IL-6, IL-1, estradíol, hCG, and pregnenolone stimulated leptin secretion in human trophoblast. Cholesterol, TNF-α and M-CSF had no effect on this activity. We observed the expression of two different isoforms of leptin receptor; one of 187 KDa and one of 28KDa. Leptin concentration in sera from RSA patients was significantly lower than in control groups, according to data published by different authors. All these results suggest a role for leptin in some of the basic functions of human placenta.

Burgin, María José. "Estudio del fotocontrol de la germinación de semillas de Datura Ferox : Aspectos fisiológicos y moleculares" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Dependiendo del nivel de dormición la germinación de semillas de Datura ferox puede ser estimulada por la luz mediante una LFR o una VLFR. En ambos casos, esta promoción involucra el aumento de la fuerza expansiva del eje embrionario y el ablandamiento del endospenna micropilar, este último, asociado al aumento de las actividades endo-β-mananasa y β-manosidasa en ese tejido. El análisis del nivel de transcriptos relacionados con la germinación, revela la existencia de puntos en común y diferencias importantes entre la LFR y la VLFR. La LFR produce en embriones un incremento en el nivel de transcriptos para GA 3β-hidroxilasa, DfGA3β-hy, y una reducción en aquellos que codifican para GA 20 oxidasa, DfGA20-ox, indicando un probable aumento en el contenido de giberelinas. En respuesta a la LFR, y posiblemente a la acción de las giberelinas, se observa en el endosperma micropilar un aumento en el nivel de mensajeros para endo-β-mananasa y expansinas, y en embriones un aumento de la acumulación de transcriptos para expansinas. En semillas sensibles a la VLFR, el requerimiento de luz solo se mantiene para el aumento del nivel de transcriptos de DfGA3β-hy, mientras que la acumulación de los otros mensajeros analizados se produce independientemente de la luz. La germinación de D.ferox inducida por una VLFR, o una LFR, puede ser inhibida por una HIR. En ninguno de estos casos la HIR afecta el potencial de crecimiento del eje embrionario, siendo el blanco de la inhibición el ablandamiento del endosprmna micropilar. El antagonismo LFR-HIR involucra una disminución de la actividad de endo-β-mananasa, mientras que en la inhibición de la VLFR por una HIR, la promoción de las actividades endo-β-mananasa y β-manosidasa se encuentra bloqueada. A nivel de los distintos transcriptos analizados, tanto en el antagonismo LPR-HIR como en el VLFR-HIR, se observa una fuerte relación entre nivel de mensajeros de DfGA3β-hy y los valores de germinación. En el caso de inhibición de la VLFR por la HIR, la inhibición de la actividad endo-β-mananasa se encuentra asociada a una disminución en el nivel de los mensajeros para esta enzima. Los resultados obtenidos indican que los efectos de la HIR sobre la actividad de endo-β-mananasa pueden deberse, tanto a una reducción en el nivel de mensajeros para esta enzima (VLFR), como a algún proceso posterior al establecimiento de dichos niveles, que determina una disminución de esta actividad enzimática (LFR).

Abstract:
Datura ferox seed germination can be promoted by a LFR or a VLFR, according to dormancy levels. In both cases, this promotion involves an increase in embryo growth potential and endosperm softening. Endosperm weakening is related to an increase in endo-β- mannanase y β-mannosidase activities. The analysis of transcript levels related to germination, reveal some common points but also differences between germination induced by a LFR, or by a VLFR. In response to the LFR, transcript accumulation for GA 3 β-hydroxylase, DfGA3β-hy, is promoted in embryos, while a reduction in those for GA 20 oxidase, DfGA20-ox, is observed, suggesting an increase in gibberellin content. An increase in transcript levels for endo-β-mannanase and expansins, in endosperm caps, and for expansins in embryos, is promoted by the LFR and gibberellins. In seeds sensible to the VLFR, the light requirement is only maintained for the rise in DfGA3β-hy transcripts level, while the other analyzed transcripts accumulated independently of the light. Germination of D.ferox induced by a LFR, or a VLFR, can be inhibited by a HIR. It could not be detected any affect of HIR on embryo growth potential. Endosperm softening is the target of the inhibition by the HIR. Endo-β-mannanase activity promoted by LFR is deeply diminished by HIR. In the VLFR, the promotion of endo-β-mannanase y β-mannosidase activities is cancelled by the HIR. HIR inhibition of germination, promoted by VLFR or LFR, is linked to the pattern of GA 3 β-hydroxylase transcript accumulation. In the VLFR-HIR antagonism, endo-β-mannanase activity inhibition is related to a decrease in the transcripts level for this enzyme. These results indicated that endo-β-mannanase activity could be affected by HIR by a lowering on its transcripts level (VLFR), or by some other process given after the establishment of this transcripts level, determining a drop in enzyme activity.

Binda, María Mercedes. "Factores reguladores de la angiogénesis en el fenómeno de resistencia antitumoral concomitante" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La resistencia antitumoral concomitante (RC) describe el fenómeno mediante el cual individuos portadores de un tumor son capaces de inhibir implantes tumorales secundarios o metástasis. En esta tesis se analizaron cinco modelos tumorales, tres derivados a partir de tumores mamarios murinos en ratones singenéicos y dos líneas de carcinoma de pulmon humano en ratones nude, el objeto de saber que factores angiogénicos/angiostáticos regulaban el fenómeno. Una de las líneas humanas generó una fuerte RC frente a un inóculo tumoral secundario subcutáneo (s.c.) en ratones nude, así como lo hicieron dos de los modelos tumorales murinos frente a inóculos s.c. y endovenosos (i.v.) de sus respectivas celulas. Se analizaron dos inhibidores (angiostatina y endostatina) y dos inductores (factor de crecimiento fibroblástico basico o bFGP y factor de crecimiento endotelial vascular o VEGF) de la angiogenesis, en sueros de animales portadores y en los medios condicionados (MCs) provenientes de los distintos tumores cultivados in vitro. Aunque no se pudo detectar angiostatina in vivo en los sueros de ratones portadores, si se detecto la conversion de plasminogeno a angiostatina in vitro por MCs en aquellos casos que mostraban capacidad de generan RC. El estudio con diferentes tipos de inhibidores de proteasas demostro que la enzima involucrada en esta conversión era una serinoproteasa. El uso de inhibidores del activador del plasminogeno de tipo uroquinasa (uPA) inhibio la generacion de angiostatina, a excepcion de una de las líneas murinas (M3MC) que posiblemente utilice una serinoproteasa distinta de uPA. Ademas, en general, se observo una baja concentración de VEGF y una alta concentración de endostatina en los sueros de animales portadores inductores de RC, respecto de sus controles y de los restantes grupos experimentales incapaces de desarrollar RC. Los resultados hallados permiten comprender mas profundamente el mecanismo de RC, a la vez aportan información que podría ser de utilidad para un eventual futuro tratamiento del cáncer basado en el uso de reguladores de la angiogenesis tumoral.

Abstract:
The term "concomitant antitumoral resistance” (CR) describes the phenomenon by which tumor-bearing hosts are capable of inhibiting secondary tumor implants or metastases. In order to elucidate whether the phenomenon under study is dependent on the capacity of tumor cells to generate different angiogenic and/or antiangiogenic factors, we used in this thesis three murine mammary adenocarcinomas and two human lung cancer cell lines. One of the human lung cancer cell lines revealed a strong CR against secondary subcutaneous (s.c.) tumor implants in nude mice, as well as two of the murine mammary tumors against secondary s.c. and intravenous (i.v.) tumor inoculations in syngeneic hosts did. Two angiogenesis inhibitors. (angiostatin and endostatin) and two angiogenic inducers (basic fibroblast growth factor or bFGF and vascular endothelial growth factor or VEGF)were analyzed in tumor-bearing mice sera and in conditioned media (CM)derived from the different tumor cells grown in vitro. Angiostatin could not be detected in either of the tumor-bearing mice sera analyzed. However, the CMs derived from those tumor cells that were capable to induce CR, showed in vitro conversion of plasminogen into angiostatin. The use of different types of protease inhibitors revealed that the conversion could be due to a serine protease. The use of urokinase type plasminogen activator (uPA) inhibitors could abrogate the generation of angiostatin, except for one of the murine mammary cancer cells lines, namer M3MC, that might utilize a serine protease other than uPA for the cleavage of plasminogen into angiostatin. Furthermore, a low VEGF concentration and a high endostatin concentration were usually found in sera from tumor-bearing mice, with respect to their controls and other experimental groups that did not induce CR. The results found herein lead to a more profound understanding of the CR mechanism, providing new information that could be useful for a future treatment of cancer based on the use of angiogenesis regulators.

Ben-Dov, Claudia Paola. "Regulación post-transcripcional en Trypanosoma cruzi : regiones intergénicas y elementos repetidos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Trypanosoma cruzí es un parásito protozoario causante de Ia enfermedad de Chagas, cuya regulación de la expresión génica se da casi exclusivamente a nivel post-transcripcional. Los objetivos de la presente tesis fueron estudiar las regiones intergénicas y la influencia del elemento repetido SIRE en las mismas. Se determinó la presencia del elemento SIRE en regiones no codificantes del genoma del parásito . Se estableció que SIRE se asocia a una amplia variedad de genes implicados en distintos procesos metabólicos. Másaún, se determinó la relevancia que esta asociación tiene en la regulación de la expresión génica del parásito, dado que SIRE pude disminuir la estabilidad y la traductibilidad del ARNm al estar en regiones 3’ UTR, o bien aumentar la traductibilidad del ARNm al incluirse los últimos nucleótidos de SIRE en regiones 5' UTR. A su vez se estudió en profundidad las secuencias requeridas en el transsplicing y se definió la existencia de elementos reguladores del mencionado proceso y al mismo tiempo de la traductibilidad del ARNm correspondiente. Por último los resultados determinan la falta de consensos estrictos para las señales reconocidas en los primeros pasos del trans-splicing.

Abstract:
Trypanosoma cruzi is a parasitic protozoan that causes Chagas disease. The regulation of gene expression occurs mainly at a post-transcriptional level. The aims of this thesis were to study the role of intergenic regions and the influence of the repetitive element SIRE. The results demonstrate that SIRE is present in non-coding regions of the genome. Moreover, the results reveal that SIRE is associated to a wide variety of genes involved in different metabolic processes. Also, the results determine the relevance of this association to the regulation of gene expression given that SIRE, when present in 3’ UTR regions, down regulates the stability of the mRNA as well as its translation. In addition, the last nucleotides of SIRE can stimulate translation when present in the 5' UTR region. Furthermore, we study which are the most important sequences for the trans-splicing reaction. We defined new elements that are able to up regulate not only trans-splicing but also the translation of the corresponding mRNA. Finally, the results determine that there is no need of consensus sequences to achieve the early steps of the trans-splicing process.

Bellani, Marina. "Replicación de plásmidos en Escherichia coli recBC sbcBC" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Este trabajo estudia la replicación de plásmidos en Escherichia coli recBC sbcB sbcCD, un contexto Rec+, en el cual se amplifican procesos de recombinación que involucran intermediarios conteniendo extremos doble cadena (en función de la deficiencia en RecBCD). En este contexto genético, plásmidos con diversos origenes de replicación acumulan multimeros lineales de muy alto peso molecular denominados HMW Se re-evaluó el proceso de generación de multimeros HMW en el contexto recBC sbcBC, a la luz de los nuevos conceptos vigentes acerca de la interrelación replicación / recombinación. Durante la primer etapa del trabajo, se utilizó el sistema de recombinación especifico-de-sitio del transposón γδ para poner a punto un sistema de complementación regulable, que permitiera generar células conteniendo un mínimo porcentaje de multimeros, para analizar luego la síntesis de HMW a lo largo de la curva de crecimiento. Utilizando este sistema, se demostró que las células recBC sbcBCD pueden sintetizar multimeros del plásmido descontroladamente, durante las primeras horas de la fase estacionaria. La capacidad de replicar descontroladamente el plásmido durante la fase estacionaria está determinada por las condiciones de cultivo y depende en parte de la respuesta de fase estacionaria, gobernada por el regulador de la respuesta general al estrés σˢ. Una vez establecida la cinética de acumulación de HMW, se realizó un análisis genético para individualizar las funciones celulares involucradas en la síntesis de estos multímeros. Se analizó la incidencia de anular funciones de recombinación (RecA, RecF, RecR, LexA) y funciones involucradas en el re-inicio de la replicación sobre una horquilla restaurada (PriA, PriC, Rep), sobre la capacidad de las células de sintetizar HMW. La comprobación de que PriA resulta indispensable para la generación de HMW en un contexto RecBC- SbcBC-, constituye una evidencia de que la generación de HMW involucra el colapso de intermediarios normales de replicación del plásmido y el reinicio de la replicación por un mecanismo alternativo. En base a los resultados reportados, se proponen dos modelos para explicar el mecanismo de generación de HMW, que involucran el colapso de un intermediario de replicación y el restablecimiento de la replicación por un mecanismo de invasión/replicación entre multimeros lineales (similar al que utiliza T4 en su etapa tardía de replicación) o por un mecanismo de tipo círculo rodante (equivalente al utilizado por el fago ʎ para generar concatémeros).

Abstract:
This work studies plasmid replication in Escherichia coli recBC sbcBC, a Rec+ background, in which recombination processes involving linear DNA (or DNA molecules containing a double strand end) are amplified, given the deficiency in RecBCD characteristic of this genetic context. In recBC sbcBC cells, plasmids with diverse replication origins, were reported to accumulate high molecular weight linear multimers (HMW). During the course of this work we have re-evaluated the phenomenon of HMW synthesis, in terms of the current understanding of the link between replication, recombination and repair. Acomplementation system was designed, based on the site-specific recombination system from transposon γδ, which permitted the reduction of the percentage of HMW in the culture to a minimum, in order to analyze the kinetics of HMW accumulation along the growth curve. This system allowed us to demonstrate that recBC sbcBC cells can synthesize plasmid multimers in an unregulated manner, during the first hours of stationary phase. The ability of non-growing cells to replicate the plasmid in an uncontrolled manner during stationary phase is determined by growth conditions and depends in part on the stationary phase response, which is regulated by σˢ (the regulator of the general stress response). A genetic analysis was performed in order to characterize the cellular functions involved in HMW synthesis. We analyzed the effect of inactivating recombination functions (RecA, RecF, RecR, LexA) or genes involved in re-initiating replication upon replication fork repair (PriA, PriC, Rep), on the ability of the cells to synthesize HMW. PriA proved to be essential for HMW synthesis in a RecBC- SbcBC- strain, providing strong evidence for a model for HMW synthesis involving replication fork collapse and re-initiation of plasmid replication through an alternative mechanism. We postulate two models to explain the alternative mechanisms to initiate the synthesis of HMW in a recBC sbcBC context.

Beigier Bompadre, Macarena. "Efecto de los péptidos formilados en la regulación del receptor para el fragmento Fc de inmunologlobulina G de tipo I (FcyRI) en monocitos humanos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En un fenómeno inflamatorio se produce la migración unidireccional (quimiotaxis) de los polimorfonucleares neutrófilos hacia el foco inflamatorio, seguidos luego por los monocitos sanguíneos. Esta migración es la respuesta al gradiente de concentración de un agente quimiotáctico determinado, como el leucotrieno B4 o las quimioquinas. También existen productos como los péptidos formilados, que son quimiotácticos para monocitos y neutrófilos. Estos péptidos formilados son productos de clivaje de proteínas bacterianas o mitocondriales. Los receptores para la porción Fc de lgG (FcγRs) son capaces de interconectar la especificidad de los anticuerpos con las funciones efectoras de los monocitos y neutrófilos. Tres clases de FCyRshan sido identificados en los leucocitos humanos: FcγRI, FcγRII y FcγRIII. El FcγRI es un receptor de alta afinidad capaz de mediar Ia fagocitosis y Ia citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC). Este receptor se expresa constitutivamente en la superficie de los fagocitos mononucleares y su expresión es aumentada por citoquinas como el interferón-γ (IFN-γ)y la interleukina-10 (IL-10). En este trabajo, se ha demostrado que la preincubación de los monocitos humanos con el péptido formilado prototipo N-formil-metionil-leucil-fenilalanina (FMLP) fue capaz de inhibir la expresión del FcγRI inducida por IFN-γ e IL-10. Esta inhibición se correlacionó con la inhibición de funciones dependientes del FcγRI como la ADCC y Ia fagocitosis, pero el FMLP no afectó otras funciones mediadas por el IFN-γ o la IL-10. El mecanismo de acción del FMLP cuando fue agregado antes que las citoquinas, involucraría la activación de las Mitogen Activated Kinases (MAPKs) p38 y Erk1/2, pero no de la proteín kinasa C (pKC). A su vez, el FMLP no modificó ni la expresión de los receptores para IFN-γ o IL-1O ni la fosforilación del factor de transcripción STAT-1. Por otra parte, el FMLP también inhibió la expresión del FcγRI en monocitos humanos previamente activados con IFN-γ. Sin embargo, en este caso, el FMLP no modificó la expresión del FcγRI en células pretratadas con IL-10. Sobrenadantes obtenidos de monocitos tratados primero con IFN-γ y luego con FMLP, indujeron la disminución de la expresión del FcγRI en monocitos naive. Este efecto estaria mediado por serin y metaloproteasas. A su vez, sobrenadantes provenientes de neutrófilos tratados con FMLP también fueron capaces de inducir la disminución del FcγRI en monocitos naive. En un modelo murino de inflamación crónica, el FMLP indujo la disminución de la expresión de FcγRs en macrófagos activados con IFN-γ. En pacientes con tuberculosis pulmonar activa, el IFN-γ y la IL-1O indujeron el aumento en la expresión del FCγRI en los monocitos. Sin embargo, el FMLP no fue capaz de disminuir la expresión del FCγRI inducida por estas citoquinas. Además, sobrenadantes de neutrófilos tratados con FMLP provenientes de estos pacientes no alteraron la expresión del FCγRI en monocitos naive. Este trabajo contribuye a la comprensión global de los mecanismos mediante los cuales agentes conocidos como pro-inflamatorios pueden tener funciones anti-inflamatorias en determinadas circunstancias. Este efecto antiinflamatorio del FMLP funcionaría como mecanismo de atenuación de una respuesta inflamatoria exacerbada por parte del huésped. El hecho de que los monocitos de los pacientes con tuberculosis pulmonar activa no presenten estos mecanismos concuerda con esta interpretación.

Abstract:
In the course of the inflammatory phenomenon, polymorphonuclear neutrophils migrate unidirectionally (chemotaxis) towards the inflammatory focus, followed by monocytes. This migration occurs in response to the concentration gradient of a chemotactic agent, such as leukotriene B4 or chemokines. Molecules such as formylpeptides are chemotactic for neutrophils and monocytes. These peptides are cleavage products of bacterial and mitochondrial proteins. The receptors for the Fc portion of IgG (FCγRs) act as a bridge between the specificity of antibodies and the effector functions of monocytes and neutrophils. Three classes of FcγRs have been identified on human leukocytes: FcγRI, FcγRII and FcγRIII. FcγRI is a high affinity receptor that mediates phagocytosis and antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC). This receptor is constitutively expressed on mononuclear phagocytes and its expression is enhanced by interferon-γ (IFN-γ) and interleukine-1O (IL-10). In this study, it has been demonstrated that pre-incubation of human monocytes with the prototypic formyl peptide N-formyI-methionyl-leucyl-phenylalanine (FMLP) inhibited the expression of FcγRI induced by IFN-γ or IL-10. This inhibition correlated with the inhibition of FcγRI-dependent functions such as ADCC and phagocytosis. However, FMLP did not affect other functions modulated by IFN-γ or IL-10. When FMLP was added to human monocytes before these cytokines, Mitogen Activated Kinases (MAPKs) p38 and Erk1/2, but not protein kinase C (pKC), were involved in the FMLP-mediated inhibition. FMLP altered neither the expression of IFN-γ/IL-10 receptors nor the phosphorylation of the transcription factor STAT1. On the other hand, FMLP also inhibited the expression of FcγRI in human monocytes that had been previously treated with IFN-γ. However, FMLP did not alter the expression of FcγRI in monocytes previously treated with IL-10. Supernatants obtained from monocytes treated first with IFN-γ and later with FMLP downregulated the expression of FcγRI on naive human monocytes. This effect was mediated by serine and metalloproteases. Moreover, this effect was also observed when using supernatants from FMLP-treated human neutrophils. In a murine model of chronic inflammation, FMLP downregulated the expression of FcγRd on IFN-γ-activated macrophages. In patients with active pulmonary tuberculosis, IFN-γ and IL-1O upregulated the expression of FcγRI. However, FMLP was not capable of downregulating the expression FcγRI induced by these cytokines. Besides, FMLP-treated neutrophils from these patients did not modify the expression of FcγRI on naive monocytes. This study contributes to the understanding of inflammatory phenomena. We have demonstrated that well-known pro-inflammatory molecules could behave, under certain circumstances, as anti-inflammatory agents. This antiinflammatory effect of FMLP would attenuate an exacerbated host immune response. The fact that monocytes from tuberculosis patients lack these antiinflammatory mechanisms is in agreement with this interpretation.

Balenzuela, Pablo. "Criticalidad y No-linealidad en fragmentación" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
En esta tesis estudiamos el comportamiento crítico y las propiedades no lineales en la evolución de sistemas de 147 partículas que interactúan mediante un potencial de Lennard-Jones. Analizamos dos tipos distintos de procesos: el de gotas que se expanden libremente y se fragmentan, y el de sistemas confinados a volumenes esféricos de distintos radios. Mediante la técnica de dinámica molecular resolvimos las ecuaciones de movimiento clásicas de manera de tener las posiciones y velocidades de las partículas a todo instante. El comportamiento crítico de los sistemas lo estudiamos a partir de analizar las distribuciones de fragmentos. En el caso de las gotas que se expanden libremente, encontramos que tanto las distribuciones calculadas a tiempo de fragmentación (definidas en el espacio de fases) como las obtenidas a tiempos asintóticos (accesibles experimentalmente) pueden ser descriptas en términos de la ley de escala que describe el comportamiento critico en el problema de percolación. Esta ley de escalas nos permitió obtener el punto crítico como aquel en el cual se maximizan ciertas fluctuaciones y aparecen distribuciones tipo ley de potencias, así como también los exponentes críticos que la caracterizan. Encontramos que tanto las señales de criticalidad como los exponentes obtenidos de las distribuciones asintóticas reflejan apropiadamente el comportamiento crítico a tiempo de fragmentación, lo que da un sustento a los esfuerzos experimentales en este sentido. En el caso de los sistemas confinados, encontramos evidencia de una transición de fase de primer orden a muy bajas densidades. Por otra parte, mediante el análisis de las distribuciones de fragmentos definidos en el espacio de fases encontramos exponentes críticos compatibles con una transición de segundo orden líquido-gas para un dado rango de densidades. Las propiedades no-lineales del sistema las estudiamos mediante el análisis del máximo exponente de Lyapunov (MLE). Para la gota libre, definimos los exponentes de Lyapunovs locales en el tiempo lo cual nos permitió seguir la evolución dinámica de la gota en su proceso de fragmentación. Encontramos que el sistema evoluciona de un estado muy caótico a otro mas ordenado y obtuvimos los tiempos característicos a partir de los cuales el sistema está ’ordenado’. Encontramos además que el MLE toma su valor máximo a aquellas energías para la cual la gota alcanza su máxima temperatura sin fragmentarse. Para el sistema confinado, estudiamos la dependencia del MLE con la energía y la densidad y su posible vinculación con la transición de fase definida mas arriba. Encontramos que el MLE es un indicador sensible de dicha transición y que su comportamiento esta altamente relacionado con las fluctuaciones de energia potencial/cinética del sistema.

Abstract:
In this thesis we study the critical behavior and non-linear properties of highly excited systems composed by 147 particles interacting via a Lennard-Jones potential. We analize two different processes: the evolution of free expanding drops that undergo fragmentation and the evolution of systems confined to espherical volumens of differents sizes. This calculations are performed by using Molecular Dynamics techniques. The critical behavior of the systems was studied by the analysis of the fragment mass distributions. In the case of free expanding drops, we found that the fragment distributions obtained at fragmentation time (in phase space) as well as those calculated at asymptotic time (in configurational space) follow the scaling hypothesis that describes critical behavior in the percolation problem. In this way, we could obtain the critical point by looking for the energy at which certain fluctuations have a maximum and power laws in the mass distributions appear. We also extracted the critical exponents that describe the transition. We found that critical exponents obtained from the asymptotic fragment mass spectra properly characterize the critical behavior of the system at fragmentation time. This results support current experimental efforts toward the analysis of asymptotic mass dsitributions. In the case of confined systems, we found strong evidency of a first order phase transition at very low densities. On the other hand, by analizing the cluster distributions obtained in phase space, we found critical exponents corresponding to a second order phase transitions in at large densities. The non-linear properties of the system were studied by the analysis of the maximum Lyapunov exponent (MLE). In the free expanding drop case, we defined the maximum local (in time) Lyapunov exponent which allowed us to follow the dynamical evolution of the fragmentation process in phase space. We found that the system evolves from a very chaotic state to a more ordered one and we calculated the characteristic of this process. We found that the MLE is maximum at the energies for which the drop have its maximum size and temperature. For the confined systems, we studied the dependence of the MLE with the energy and the density and the possible link with the phase transition described above. We found that the MLE is quite sensitive to this transition and its behavior is highly related to the with the potential/kinetic energy fluctuations of the system.

Asurmendi, Sebastián. "Desarrollo y aplicación de un sistema de expresión de poliproteínas autoclivables basado en la proteasa NIa del virus TEV para la obtención de plantas transgénicas con capacidad de procesar, secretar y dirigir subcelularmente las proteínas expresadas" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se desarrolló, perfeccionó y evaluó la factibilidad de aplicación práctica de un vector de transformación genética vegetal que permite la coexpresión de varias proteínas bajo el control de un promotor común. El sistema desarrollado basado en la proteasa NIa derivada del TEV fue capaz de procesar poliproteínas quiméricas y producir la acumulación de varias proteínas a partir de una única unidad transcripcional in vivo. Se expresaron diferentes combinaciones de proteínas (indicadoras, como GFP y GUS, cápsides de PVX, PVY y PLRV, así como proteínas de defensa antifúngica) in vivo e in vitro. El nivel de acumulación de cada proteína no dependió de la posición del ORF en la poliproteína. A pesar de lo expuesto el nivel de acumulación total de una proteína expresada a través de la poliproteína puede ser influenciada por propiedades intrínsecas de las mismas. Mediante microscopía electrónica se demostró que la cápside de PVY expresada a través de la poliproteína no sólo se procesa correctamente sino que el producto del procesamiento es capaz de formar partículas parecidas a virus (cápsides vacías). Cuando se agregó la señal de exportación al RE del gen de la patatina a poliproteínas conteniendo GUS y GFP, éstas fueron dirigidas al RE en protoplastos de tabaco de la línea BY-2. Las plantas transgénicas de papa expresando estas poliproteínas mostraron menor actividad GUS que las plantas control expresando la misma poliproteína pero sin señal de exportación. Este menor nivel de actividad podría ser atribuido a que la proteína GUS resulta glicosilada en el RE. Estos resultados sugieren que la poliproteína es dirigida al RE y luego en el lumen procesada para liberar las proteínas individuales. Se obtuvieron plantas de papa transgénica expresando poliproteínas conteniendo cuatro genes antifúngicos, codificantes para una quitinasa, una glucanasa, AP24 y RIP. Se obtuvieron plantas altamente resistentes a el ataque de R. solani, demostrando el correcto procesamiento de la poliproteína y el sinergismo de las proteínas antifúngicas expresadas para producir resistencia. Se encontró una asociación entre el espacio subcelular de acumulación de las proteínas glucanasa y AP24 (vacuolar versus apoplásmico) con el nivel de resistencia contra Rhizoctonia.

Abstract:
Development, characterization, as well as practical application of a plant transformation vector allowing the coexpression of different proteins under the control of a single promoter, is described. The system, based on NIa protease gene derived from tobacco etch potyvirus was shown to express and process chimerical polyproteins and to accumulate different proteins from a single transcription unit, including reporter genes (green fluorescent protein —GFP-and β-glucurunidase —GUS-), as well as coat proteins of potato virus Y (PVY), potato virus X (PVX) and antifungal proteins. Thus, different combinations of proteins were expressed in vitro or in vivo showing that protein accumulation does not depend upon relative position of the ORF within the cassette. However, the overall level of accumulation may be influenced by intrinsic properties of the expressed proteins. Electron microscopy showed that the PVY CP expressed in the polyprotein cassette assembled in vivo to form void virus-like-particles. Addition of the endoplasmic reticulum (ER) targeting sequence from patatin to the polyprotein containing GUS and GFP, targeted the protein to ER, in BY-2 tobacco protoplasts. Transgenic plants that encode the thus polyprotein exhibited lower enzymatic activity than transgenic plants expressing GUS from the cassette without the patatin leader sequence. Indirect evidence suggests that the low level of activity is the result of glycosylation of GUS in the ER. These results suggest that the polyprotein is first targeted to the ER where the polyprotein is processed to release the individual proteins. Transgenic potato plants expressing a polyprotein including four anti-fungal ORFs (chitinase, glucanase, AP24 and a RIP) were produced. High levels of protection against Rhizoctonia solani attack were shown, confirming the correct processing and synergism of these proteins to produce resistance. We found an association between the subcellular localization of the introduced glucanase and the level of resistance. Protein AP24 showed a similar but less apparent behavior. We conclude that the vector system pPRO10/20 is highly effective to express several proteins in planta. The expressed proteins can be, cytoplasmic or exported to the apoplasm or other subcellular compartments like vacuoles.

Ascunce, Marina Sofía. "Variabilidad nucletídica en el ADN mitocondrial de Alouatta Caraya del NE de Argentina" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Los primates como mamíferos de vida larga y socialmente complejos, constituyen modelos óptimos para observar los efectos del comportamiento y la demografía sobre la evolución de los grupos. Los Monos del Nuevo Mundo (Primates, Platyrrhini) presentan una gran diversidad taxonómica con l6 géneros, l10 especies y 205 especies y subespecies. Su gran radiación adaptativa permite observar una amplia variación en cuanto a parámetros de historias de vida, demografía y estructura social, entre otros. La diferenciación genética entre las poblaciones está determinada por la interacción de factores ecológicos y los procesos evolutivos tales como la selección natural, el flujo génico y la deriva génica. En este trabajo se han analizado los efectos de la organización social y los eventos históricos sobre la variabilidad nucleotídica mitocondrial en algunos platirrinos y particularmente en Alouatta caraya. Se analizaron los efectos de linaje sobre las tasas de evolución molecular mediante comparaciones entre dos familias de monos platirrinos: Atelidae (Ateles, Brachyteles Lagothrix y Alouatta) como representante de platirrinos de cuerpo grande y Cebidae (Cebus, Saimiri y Aotus) representativa de monos platirrinos de menor porte. Se empleó la secuencia nucleotídica del gen mitocondrial correspondiente a la subunidad II de la citocromo oxidasa c, de un total de 29 ejemplares de platirrinos, 11 de estas secuencias fueron obtenidas en el presente trabajo. Los resultados mostraron que el gen COII es un marcador útil para resolver relaciones filogenéticas intragenericas en este grupo. A su vez, en oposición a lo esperado en base a los efectos de linaje, Saimiri con un menor tamaño corporal mostró la menor tasa de sustitución nucleotídica a nivel del ADN mitocondrial, probablemente reflejando la retención de polimorfismos ancestrales, debido probablemente a tamaños poblacionales grandes asociados a características particulares de su organización social. En la segunda parte de la Tesis, se analizó la variabilidad en la secuencia nucleotídica del ADN mitocondrial observada en Alouatta caraya abarcando el área correspondiente a la porción marginal sur de su distribución, con el objetivo de establecer si ciertas características de su organización social afectan la estructura genética de sus poblaciones. Se obtuvo la secuencia de un fragmento de la región control mitocondrial (RC) para un total de 70 ejemplares de 7 localidades. La distribución de la variabilidad nucleotídica caracterizada por la presencia de dos linajes mitocondriales divergentes (clados A y B), se ajusta a un patrón filogeográfico de clase II. Para explicar este patrón se consideró a las selvas asociadas a los ríos Paraná y Paraguay como rutas de migración de la especie a través de las cuales A. caraya habría colonizado la región sur de la distribución. Los datos obtenidos indicarían que ambos linajes habrían sufrido un cuello de botella hace aproximadamente 10.000 años que coincide con un período de extrema aridez, que se conoce como Younger Dryas, considerado de transición entre el fin de las glaciaciones y el comienzo del calentamiento global. El estudio de la variación nucleotídica a nivel de la región control del mtADN en una población de ‘carayás' de un ambiente de selva de inundación (Isla Brasilera, Chaco) permitió observar una estructuración de la variabilidad mitocondrial coincidente con los grupos sociales (tropas) los cuales presentaron casi exclusivamente haplotipos asignables a uno de los dos linajes A ó B. Este patrón de variabilidad mitocondrial sugiere que en el albardón principal de Isla Brasilera (una zona rica en recursos). las tropas se habrían formado principalmente por eventos de fisión de matrilíneas, mientras que en la zona más periférica de la isla (más pobre en recursos), la formación de nuevos grupos se daría por dispersión de individuos desde el albardón o bien por nuevos eventos de colonización. Esto junto con el patrón de divergencia genética sexo específico sugeriría que las hembras presentan comportamiento filopátrico. En los platirrinos, si bien las características poblacionales y de estructuración social determinarían la probabilidad de fijación de los cambios genéticos, los eventos vicariantes parecen haber sido importantes en la especiación del grupo. A su vez, en este trabajo se observó que a nivel poblacional Alouatta caraya en su distribución marginal sur presentaría en la actualidad un patrón de variabilidad mitocondrial determinado no sólo por factores intrinsecos sino también signado por eventos demográficos históricos.

Abstract:
Primates as long-lived and socially complex mammals, offer the opportunity to assess the effects of behavior and demography on the evolution of the groups. New World Monkeys (Primates, Platyrrhini) show a great taxonomic diversity represented by l6 genera, ll0 species and 205 species and subspecies. Its great adaptive radiation is reflected by an extensive diversification of life histories, demography and social structure. Genetic differentiation among populations is determinated between ecological factors and evolutionary processes such as natural selection, gene flow and genetic drift. In this work, the effects of social organization and historic events on the nucleotide variability at the mtADN including some platyrrhine genera and particularly Alouatta caraya were analyzed. Lineage effects on the rates of molecular evolution were analyzed by means of comparisons between genera of two platyrrhine families Atelidae (Ateles, Bruchyteles Lagothrix and Alouatta) as representative of large-size genera and Cebidae (Cebus, Saimiri and Aotus) which are considered as medium size genera among platyrrhines. Nucleotide sequence variation at the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit II gene (COII) was analyzed in 29 New World monkey specimens, 11 obtained in this work. The results suggested that the main utility of COII in platyrrhine systematics lies at the intrageneric level. Contrary to the expectation considering the lineage effects, Saimiri, which is among the smallest size genera analyzed, showed low numbers of unique substitutions suggesting the maintenance of ancestral or plesiomorphic states of platyrrhine mt DNA nucleotide characters probably due to its large population sizes as compared to other platyrrhines, along with particularities in its social organization. In the second part of the Thesis, the nucleotide sequence variation at the mitochondrial DNA was analyzed considering the south marginal distribution area of Alouatta caraya, aiming to study the relationship between the pattern of genetic variation and features of its social organization. A fragment of the mitochondrial control region (CR) was sequenced in 70 specimens of 7 localities. The analysis of sequence variation revealed the presence of two divergent clades A and B which is concordant with a phylogeographic pattern type II. To explain this pattern, it was considered that the forest associated to the Paraná and Paraguay river margins have been used as migration routes by A. caraya. Sequence data suggested that both mitochondrial clades have passed through population bottlenecks about 10,000 years ago, in coincidence with a period of extreme dryness, known as Younger Dryas, during the transition between the end of the glaciations and the beginning of the global warming. The large sample size obtained for the ‘carayá' population of Isla Brasilera characterized as flooded forest, allowed a detailed study of microgeographic population structure. The analysis of genetic variability at the mitocondrial CR sequences showed that within the troops only haplotypes of clade A or B are mainly represented. This pattern of genetic variation suggested that at the main hillock (a zone rich in resources), the troops might be mainly form through the matrilineal fission, while in the peripheral area of the island (which is poorer in resources), the origin of new groups might be related to dispersion of individuals from the main hillock, or by means of new immigration events by new colonizers in the island. This observation together with a sex-specific pattern of genetic differentiation gives support to the hypothesis that females are phylopatric. In platyrrhines, although population and social organization traits may be important determinants of the probability of fixation of genetic changes, vicariant events seem to have played a central role in the diversification of the group. In addition, the present pattern of mitochondrial variability in A. caraya, in its south marginal distribution, appears to be the result of historical demographic events coupled with intrinsic factors such as social organization.

Alonso, Guillermo Daniel. "La arginina quinasa de Trypanosoma cruzi : Estudio de su regulación y utilización de modelos transgénicos" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
La arginina quinasa cataliza la transferencia reversible de un grupo fosfato entre el ATP y la L-arginina. En este trabajo se reporta modelos de sobre-expresión exitosos para una enzima endógena, como es el caso de la arginina quinasa. Se obtuvieron 60 veces de sobre-expresión, utilizando el vector de expresión de alta eficiencia pTREX-A. La población transfectada con la arginina quinasa presentó un aumento en la densidad celular y en la tasa de replicación, sugiriendo que los fosfágenos podrían estar involucrados en la división celular. Además, la actividad arginina quinasa aumento continuamente durante la fase exponencial de crecimiento. Se observó una correlación entre la tasa de crecimiento, la actividad arginina quinasa y los niveles de enzima. En el rango de tiempo de cultivo estudiado, los niveles de ARNm mostraron solo cambios menores. La sobreexpresión de la arginina quinasa presentó una cinética de degradación a lo largo de la curva de crecimiento coincidente con el aumento de la enzima endógena y de la actividad, indicando una posible regulación por proteólisis. La incorporación de arginina fue estudiada en epimastigotes de Trypanosoma cruzi durante las fases del cultivo in vitro. La incorporación de arginina disminuyó continuamente desde el 3ro al 14to día. Estas variaciones pueden ser reproducidas utilizando medio condicionado o medio fresco. El ayuno de arginina, la densidad celular y la disponibilidad de Fuentes de carbono, también afectaron la incorporación. En tripomastigotes, el estadio infectivo no replicativo, la actividad y expresión arginina quinasa fueron 2.2 veces superior a la correspondiente a epimastigotes del 7mo día, y la incorporación de arginina fue al menos 30 veces menor en tripomastigotes que en epimastigotes del 7mo dia. Además una disminución reversible del 40 % de la arginina incorporada fue observado cuando células del día 3 fueron tratadas con el agente antimitótico, hidroxi urea. Estos resultados sugieren una relación entre la incorporación de arginina, la tasa de duplicación celular, y el aumento en la actividad arginina quinasa.

Abstract:
Arginine kinase catalyzes the reversible transphosphorylation between ATP and L-arginine. This work reports one of the first successful over-expression models of an endogenous enzyme, such as arginine kinase. Thus, it was obtained a 60-fold over-expression using the high-efficiency expression vector pTREX-A. The cells transfected with arginine kinase showed an increase in cell density and replication rate, suggesting that phosphagens could be involved in cell division. Furthermore, the arginine kinase activity was increased continuously during the exponential phase of growth. A correlation between growth rate, enzyme-specific activity and enzyme protein was observed. In the whole range of the culture time mRNA levels showed minor changes. Overexpressed arginine kinase has a degradation kinetics along the parasite growth curve coincident with the increment of the endogenous enzyme protein and activity, indicating that arginine kinase activity might be regulated by proteolysis. Arginine uptake was measured in Trypanosoma cruzi epimastigote cells along the in vitro culture growth phases. Arginine uptake decreased continuously from the 3rd to the 14th day. These fluctuations could be resembled using conditioned or fresh medium. Arginine starvation, cell density and carbon source availability also affect the arginine uptake. In trypomastigote cells, the infective and nonreplicative stage, arginine kinase activity and expression were 2.2-fold higher than 7th-day epimastigote activity, and arginine uptake was at least 30-fold lower in trypomastigote than 7th-day epimastigote forms. Moreover, a reversible 40% decrease of the arginine uptake was observed when 3rd-day cells were treated with the antimitotic hidroxyurea. These results suggest a correlation between arginine uptake, the cell replication rate, and the increase in the arginine kinase specific activity.

Abel, María Cecilia. "Estudio de la variabilidad y la diferenciación genética por medio de técnica de Isoenzimas y RAPD en poblaciones naturales de especies de pejerreyes de la República Argentina, género Odontesthes (Atherinopsidae, Atherinopsinae, Sorgentinini)" (2002). Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires.

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Resumen:
Se estudió por medio de electroforesis de Isoenzimas y RAPD la variabilidad, diferenciación y estructura genética en poblaciones naturales de 0. argentinensis, 0. bonariensis y 0. hatcheri. Se analizó asimismo si la diferenciación genética entre poblaciones, detectada por Isoenzimas y RAPD, podria estar asociada con las distancias geográficas entre las mismas. La técnica de Isoenzimas permitió el análisis de 22 loci (19 para cada especie), de los cuales 8 fueron variables. Si bien las frecuencias alélicas de las poblaciones de cada especie para estos 8 loci mostraron algunas diferencias, la población de 0. bonariensis del Río de la Plata se destacó netamente entre las poblaciones de su especie por la presencia de un alelo fijado y diagnóstico (LDH-1*3). La comparación de frecuencias alélicas entre las distintas especies reveló importantes diferencias, siendo la especie más diferenciada 0. hatcheri. Esta especie se diferenció de 0. bonariensis y O. argentinensis por la presencia de 3 loci GOT exclusivos (diagnósticos) (GOT-2*, GOT-3*, GOT-5*). Además la expresión tisular diferencial permitió distinguir las 3 especies por los patrones de expresión de 3 loci (MEP-1*, MEP-2* y MEP3*). La técnica de RAPD permitió el análisis de 220 bandas. De éstas, sólo 4 resultaron monomórficas. La mayoría de las bandas amplificadas fueron compartidas por las especies y poblaciones variando sólo en sus frecuencias. Del análisis de estas frecuencias se deduce que existen 2 importantes grupos: uno conformado por las poblaciones de O. hatcheri y el otro compuesto por las poblaciones de 0. bonariensis y 0. argentinensis. Al igual que en el análisis isoenzimático la población de 0. bonariensis del Rio de la Plata fue las más diferenciada dentro de las de su especie. Los valores de variabilidad genética promedio por especie, calculados por Isoenzimas, fueron menores para 0. bonariensis (P= 6.31%, H=0.034) que para 0. argentinensis (P= 10.5%, H= 0.045) y 0. hatcheri (P= 10.5%, H=0.047). Esta disminución en los índices de variabilidad fueron asociados al tipo de distribución y a la alta presión pesquera que sufre 0. bonariensis. La población de 0. bonariensis de la laguna Salada Grande, fue la excepción a lo antedicho, registrando valores altos de variabilidad (P= 10.5%, H= 0.06). Siembras periódicas con alevinos obtenidos por inseminación artificial a partir de gametas parentales de dicha laguna mitigarían la disminucón de la variabilidad La estructura genética intrapoblacional estimada por el estadístico FIS de Wright (FIS promedio = 0.004 NS p>0.05) indicó que las frecuencias genotípicas en todas las poblaciones se ajustarían a lo esperado por la ley de Hardy-Weinberg; por ende el apareamiento sería aleatorio. El comportamiento promiscuo en el apareamiento, durante el cual muchos machos pueden fertilizar los huevos de una única hembra (descripto para otras especies de pejerreyes) ha sido sugerido para las especies en estudio, dado que este favorecería la panmixia. La diferenciación genética entre poblaciones de la misma y diferentes especies fue estimada por el índice de fijación FST para ambas metodologías, mientras que los índices de Distancia e Identidad de Nei solo fueron obtenidos para Isoenzimas. Los niveles de diferenciación genética entre poblaciones obtenidos a partir de los datos de Isoenzimas y RAPD fueron similares (FST promedio para todas las poblaciones igual a 0.807 y 0.78 respectivamente) e indicaron una diferenciación altamente significativa entre poblaciones de diferentes especies. Con ambas metodologías, el flujo génico estimado (Nm= 0.06 y 0.07) fue menor que 1 individuo por generación cuando se consideraron todas las poblaciones. La diferenciación entre poblaciones dentro de cada especie mostró valores de FST significativos a altamente significativos tanto para isoenzimas (FST= 0.022-0.130) como para RAPD (FST= 0.553-0.687) pero fue menor que la observada al incluir poblaciones de distintas especies (más evidente en Isoenzimas). Consecuentemente, la estimación indirecta del flujo génico a partir de la diferenciación isoenzimática fue mayor que un migrante por generación (Nm>1). Sin embargo, el Nm estimado a partir de los datos de RAPD (Nm= 0.114-0.202), si bien fue más alto que el obtenido considerando todas las poblaciones, no superó l migrante por generación. RAPD permitió una mayor diferenciación entre poblaciones de la misma especie que la observada mediante la técnica de lsozimas., como consecuencia del alto polmorfismo (bandas muy variables) encontrado por esta técnica. En Isoenzimas, la diferenciación también se estimó mediante los índices de Identidad y Distancia de Nei promedio entre especies. Los intervalos de distancias promedio para poblaciones coespecificas y de distintas especies se ajustaron a los valores encontrados por Shaklee y col. (1982) para peces. En cambio, el intervalo de distancia encontrado entre 0.bonariensis y 0. argentinensis (D=0.07 - 0.112) correspondería, según Thorpe (1979), al de poblaciones coespecificas. De acuerdo al intervalo de distancia genética de Nei (D) obtenido por Thorpe (1979) para especies congenéricas, tal vez sería necesario una revisión sistemática de estas poblaciones para dilucidar este problema. Sin embargo, si se tiene en cuenta el intervalo de distancias genéticas de Nei encontrado por Shaklee y col. (1982), para poblaciones de distintas especies, los valores de las asociaciones entre especies se ajustan a lo esperado por la taxonomía. La varianza genética total fue mayor para RAPD (49.58) que para isoenzimas (3.99). Esto se debió al mayor número de bandas analizadas para RAPD (220 ) que para isozimas (22 loci). A partir del análisis de la distribución de la variabilidad genética se determinó que la variación entre especies (variación especifica) fue la proporción mayor tanto para isoenzimas como para RAPD (73.9% y 44% respectivamente). De la comparación del porcentaje de variación especifica obtenido por ambos métodos se desprende que Isoenzimas detecta mejor este tipo de variación, pudiendo separar especies con mayor precisión. El porcentaje de variación entre poblaciones de la misma especie (variación poblacional) fue mayor para RAPD (34%) que para isoenzimas (6.8%), indicando que la variación poblacional fue mejor detectada por la primer técnica. El porcentaje de varianza dentro de las poblaciones (variación individual) fue similar para ambos métodos (19.3% y 22% para Isoenzimas y RAPD respectivamente). Asumiendo la hipótesis del reloj molecular, se estimó que 0. hatcheri divergió de su antecesor durante el Plioceno tardío; en cambio la divergencia obtenida entre 0.argentinesis y 0. bonariensis indicaría que ésta fue reciente, alrededor de 490.000 años (Pleistoceno medio). Dado el origen de la laguna Salada Grande donde se muestreo una de las poblaciones de O. bonariensis y la fuerte asociación entre esta población y 0. argentinensis obtenida mediante las técnicas de Isoenzimas como de RAPD, se postula un posible evento ancestral de hibridización introgresiva de 0. bonariensis proveniente de lagunas litorales con 0. argentinensis. La falta de correlación entre las distancias geográficas de las poblaciones de cada especie y la diferenciación genética obtenida tanto por RAPD como por Isoenzimas sugirió que la divergencia de las poblaciones de cada especie podría ser explicada por dos mecanismos evolutivos: la Selección o por Eventos fundadores recientes, no habiendose aún alcanzado el equilibrio entre deriva y migración. En cambio al incluir todas las poblaciones de las distintas especies la correlación positiva, tanto para Isozimas como RAPD, sugiere que pudo existir diferenciación de las mismas por Deriva Genética, aunque no se descarta a la Selección como probable fuerza operante. Al incluir todas las poblaciones de las diferentes especies se plantean distancias geográficas importantes, con ambientes muy disímiles donde las presiones selectivas podrían ser muy diferentes determinando una importante diferenciación génica que se correlacionaría con la distancia geográfica. El fenograma obtenido por Isoenzimas dejó visualizar 3 clusters correspondientes a las 3 especies estudiadas, permitiéndo este método una buena agrupación de las poblaciones de cada especie. El fenograma obtenido a partir de RAPD corroboró 2 de los cluster (O. hatcheri versus O. bonariensis y O. argentinensis) pero no tuvo buena resolución al momento de separar las poblaciones de 0. bonariensis y 0. argentinensis. La técnica de Isoenzimas permitió una mejor agrupación de las poblaciones de cada especie, indicando ser mejores marcadores que los RAPD al momento de comparar diferentes especies.

Abstract:
Isoenzyme electrophoresis and RAPD techniques were applied to analyze the genetic variability, differentiation and structure of natural populations of 0. argentinensis, 0. bonariensis y 0. hatcheri. The present study also evaluated if the genetic distances between populations are associated with geographic distances. Isozyme technique allowed analyzing 22 loci (19 for each specie), 8 of which were variables. Allelic frequencies of the populations of each species, for these 8 loci, showed some differences. Río de la Plata population was the most differentiated 0. bonariensis 'population, showing one fixed and diagnostic allele (LDH-1*3). The comparison of allelic frequencies among the different species revealed important differences, 0. hatcheri being the most differentiated one. This species differed from 0. bonariensis and 0. argentinensis by the presence of 3 GOT diagnostic loci (GOT-2 *, GOT-3 *, GOT-5 *). The analysis of tisular specificities also allowed to differentiate the 3 species by the relative expression of 3 loci (MEP-1*,MEP-2* and MEP-3*). RAPD technique allowed the analysis of 220 bands. Among them, 4 were monomorphic. Most of the amplified bands were shared by the species and populations, varyíng only in their frequencies. Two major groups emerged from RAPD analysis: one integrated by populations of O hatcheri and the other including populations of. 0. bonariensis and 0. argentinensis. Río de la Plata population was the most differentiated within O. bonariensis in both Isozyme and RAPD analyses. The average values of genetic variability for species, based on Isozyme data, were smaller in O. bonariensis (P = 6.31%, H = 0.034) than in 0. argentinensis (P = 10.5%, H = 0.045) and 0. hatcheri (P = 10.5%, H=0.047). The decrease of the genetic variability in 0.bonariensis could be associated with its distribution type and the fisheries pressure. The 0. bonariensis population belonging to the "Salada Grande" lagoon was the exception to the abovementioned, showing higher values of variability (P = 10.5%, H = 0.06). Periodic fingerlíngs sowing, obtained by artificial insemination from parental gametes of this lagoon, would mitigate the decrease of variability. The population 's genetic structure estimated by FIS Wright statistical (Average Fls = 0.004 NS p>0.05) indicated that all the populations would adjuste to Hardy-Weinberg, so there would be in random union of gametes. Panmixia could be reinforced through promiscuous behavior during the mating (many males fertilizing the eggs of one female) as was described for other silversides. The genetic differentiation among populations of the same and different species was estimated by the FST fixation index for both methods. Nei's Distance and Identity indexes were obtained only for Isozymes. The levels of genetic differentiation among populations obtained by means of Isozymes and RAPD data were similar (average FST for all populations was 0.807 and 0.78 respectively) and indicated a highly significant differentiation among populations of different species. With both methodologies, the genic flow (Nm = 0.06 and 0.07) was smaller than l individual for generation when all the populations were considered. The genetic differentiation among populations of each species showed significant to highly significant FST values, both for the Isozyme (FST=0.022-0.130) and RAPD (FST=0.553-0.687) analysis. However these values were smaller than the ones observed when including populations of different species (more evident in Isozymes). Consequently, for Isozymes, the estimation of gene flow among populations of the same species was bigger than a migrant for generation (Nm>l). For RAPD, although it was higher (Nm = 0.114-0.202) than the one obtained considering all the populations, it didn't reach l migrant for generation. RAPD allowed a higher differentiation among populations of the same species that the one observed by means of the Isozyme technique, as a consequence of the high polymorphism (very variable bands) found by this technique. In Isozymes, the differentiation also was estimated by means of the Nei average Identity and Distance indexes among species. The ranges of average distances for coespecific populations and for different species were similar to the values found by Shaklee el al. (1982) for fishes. On the other hand, according to Thorpe (1979) the range of average distance between 0.bonariensis and O. argentinensis (D=0.07 - 0.112) would correspond to that of coespecific populations. According to the range of average Nei distance obtained by Thorpe (1979) it would be necessary a systematic revision of these populations to elucidate this problem. However, applying the range of average Nei distance found by Shaklee et al. (1982) for populations of different species,the values adjust perfectly with the taxonomie. The total genetic variance was higher for RAPD (49.58) than for isozymes (3.99). This was due to the higher number of bands analyzed for RAPD (220) that for isozymes (22 loci). The analysis of the genetic variability's showed that the variation among species (specific variation) was the highest proportion, as much for isozymes as for RAPD (73.9% and 44% respectively). The variation percentage among species was higher for Isozyme (73,9%) than for RAPD (44%), indicating that the species variation is detected better by Isozyme analysis. The variation percentage within species (population variation) was higher for RAPD (34%) than for isozymes (6.8%), indicating that the population variation is detected better by RAPD. The percentage of variance within the populations (individual variation) was similar for both methods (19.3% and 22% for Isozymes and RAPD respectively). Assuming the hypothesis of the molecular clock, the divergence time was estimated. 0. hatcheri would have diverged from its predecessor during the late Plioceno; on the other hand, the divergence obtained between 0.argentinensis and 0. bonariensis would indicate that this was recent, around 490.000 years (Mid-Pleistoceno). A possible ancestral event of introgresive hibridazation is postuled for litoral lagoons. This could be the case of "Salada Grande" lagoon population (0. bonariensis) with 0. argentinensis., according to the origin of this lagoon and the strong association among the same ones, showed by means of Isozymes and RAPD techniques. The lack of correlation between geographical distances and genetic differentiation of the populations of each species obtained by RAPD and Isozyme, suggested that the divergence of the populations of each species could be explained by two evolutionary mechanisms: the Selection or by recent Founder Events, yet not having reached the balance between drift and migration. On the other hand, when all the populations of the different species were included, a positive correlation was showed, so much for Isozymes as for RAPD. Then it is suggested that the differentiation of these populations could have taken place by genetic drift, although the Selection could have been another operating force. Important geographical distances with very dissimilar environmental conditions should be consider when all the populations of different species were included. In these areas, the selective pressures could be very different determining an important genetic differentiation that would be correlated with the geographical distance The phenogram obtained by Isozymes showed 3 clusters corresponding to the 3 studied species. So this method allowed a good grouping of the populations of each species. The phenograms obtained by RAPD confirmed 2 of these clusters (O. hatcheri versus 0. bonariensis and 0. argentinensis) but didn't have good resolution to separate the populations of O. bonariensis and 0. argentinensis. Isozymes allowed a better grouping of the populations of each species, indicating to be better markers that the RAPD when comparing different species.

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