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Tesis > TÍTULO

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"Vacunación con células dendríticas y regulación de la respuesta inmune en melanoma experimental" (2014-07-16). Mac Keon, Soledad. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El objetivo del presente trabajo de Tesis fue explorar el mecanismo mediante el cual la vacuna CD-Apo/Nec, constituida por células dendríticas cocultivadas con células apoptóticas y necróticas del melanoma murino B16-F1, genera protección antitumoral, y establecer condiciones que potencien la capacidad inmunoestimuladora de la misma. En el trabajo de Tesis que se presenta se demuestra que la protección generada por la vacuna es sistémica, evitando el desarrollo s.c. de melanoma B16-F1 y controlando micrometástasis latentes. Se detectó en el sitio de vacunación la novedosa formación de una estructura linfoide terciaria, la cual no se evidenció con otras vacunas que no desarrollan protección antitumoral. En esta estructura se observaron vénulas con expresión de Adresina de Nódulo Linfático Periférico y el reclutamiento de linfocitos T CD4+ y CD8+ en estrecho contacto con células dendríticas. Para la formación de la estructura linfoide terciaria fue necesario el cocultivo ex vivo durante 24 horas de las células dendríticas con células Apo/Nec. En los ganglios linfáticos drenantes, la vacunación no indujo la acumulación de linfocitos T regulatorios, pero sí fue posible detectar allí el reclutamiento y proliferación de linfocitos T CD8+ vírgenes B16-F1-específicos. Se determinó al finalizar el esquema de vacunación la producción anticuerpos IgM/IgG anti-B16-F1, que podrían actuar opsonizando células B16-F1. Se ensayaron diferentes estrategias de maduración in vitro de las células CD-Apo/Nec. Sin embargo, no fue posible generar un aumento significativo en su capacidad inmunoestimuladora. Se dedujo que las células apoptóticas y necróticas de melanoma inducen una pérdida en la capacidad funcional de las células dendríticas. Se comprobó la acumulación de lípidos neutros en las células dendríticas, que podría estar afectando el procesamiento y presentación de antígenos tumorales. En este trabajo de Tesis se logró determinar diferentes aspectos de la respuesta inmune anti-tumoral gatillados en los animales vacunados con CD-Apo/Nec. Creemos que las células de melanoma irradiadas son una fuente completa de antígenos de melanoma, y que este trabajo contribuye a planear nuevas aproximaciones y estrategias de combinación que logren mejorar las terapias anti-melanoma existentes.

Abstract:
The aim of this Ph.D. Thesis was to explore the mechanisms of antitumor protection elicited by DC-Apo/Nec vaccine, constituted by dendritic cells charged with apoptotic and necrotic murine B16-F1 melanoma cells, and to establish new conditions to enhance it´s immunostimulatory capacity. In this PhD Thesis it is demonstrated that the DC-Apo/Nec vaccine generates systemic protection against s.c. B16-F1 melanoma and dormant micrometastasis. The neoformation of a tertiary lymphoid structure was described at the vaccination site, which was not evidenced with other vaccines lacking antitumor capacity. Within this structure the expression of Peripheral Lymph Node Addressin and the recruitment of CD4+ and CD8+ T lymphocytes, in close contact with dendritic cells, were observed. For the tertiary lymphoid structure to be formed, a 24 hour coculture of dendritic cells with apoptotic and necrotic melanoma cells was required. In draining lymph nodes, B16-F1 specific T CD8+ lymphocyte recruitment and proliferation was detected, and regulatory T lymphocytes were not induced. Anti- B16-F1 antibodies were detected, which could be assisting by opsonization in the immune detection of B16-F1 melanoma cells. New maturation approaches for DC-Apo/Nec cells were assayed, but it was not possible to enhance significantly their immunostimulatory capacity. It was deduced that during the coculture period the apoptotic and necrotic melanoma cells induce a loss in the functional properties of dendritic cells. Lipid accumulation was shown in these dendritic cells, which could be affecting the processing and presentation of tumoral antigens. Different aspects of the antitumor response elicited by DC-Apo/Nec vaccination were determined in this Ph.D. Thesis. We believe that apoptotic and necrotic melanoma cells are an complete melanoma antigen source, and that this work contributes on the search for new approximations and combination strategies to improve actual anti-melanoma therapies.

"Vacíos cuánticos no convencionales" (1986). Ferraro, Rafael. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La ambigüedad de la cuantificación de un campo en un espacio-tiempo curvo arbitrario, se resuelve introduciendo una noción de vacío cuántico dependiente de los observadores. Para ello se establece que el papel de un sistema de referencia en Relatividad General, consiste en determinar qué es el espacio y qué es el tiempo, nociones éstas que resultan dependientes de los observadores. Como los detectores de campo son sensibles a la diferencia entre espacio y tiempo, resulta natural que el vacío cuántico depende de los observadores. Para saber qué vacío corresponde a cada sistema de observadores, se define un Hamiltoniano invariante frente a cambio de coordenadas pero dependiente de los observadores. La base de soluciones de la ecuación de campo, que un dado sistema de observadores debe utilizar para cuantificar el campo, es aquella que diagonaliza el Hamiltoniano y minimiza la energía del vacío, criterios éstos que resultan ser equivalentes, los datos de Cauchy que la determinan son calculados cuando el tiempo se separa en la ecuación de campo. Esta prescripción para definir el vacío es de aplicación general, y contiene diferentes casos particulares en donde la noción de vacío estaba bien establecida. Por otra parte, se demuestra la invariancia conforme del Hamiltoniano definido. Se estudia también, mediante cálculo numérico, la evolución de un sistema de espejos solicitados por la fuerza ejercida por un campo cuantificado escalar sin masa, en un espacio-tiempo plano. El sistema presenta fuertes analogias con un modelo cosmológico semiclásico. La fuerza de un campo sobre una supeficie mávil es determinada mediante un principio variacional. Se encuentra que los espejos evolucionan hacia un estado final de velocidad constante, siempre que el sistema posea energía suficiente. Se calcula la energía de Casimir (dependiente de la velocidad de los espejos) percibida por observadores geodésicos en la etapa final de la evolución, y se estudian las razones por las cuales el espectro de particulas creadas por un espejo móvil podría ser no térmico.

"Valor medio de la distribución de espín a través de relaciones isoméricas" (1997). Capurro, Oscar A.. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Valoración de algunos elementos por espectrometría de absorción atómica" (1979). García Vior, Luis Oscar. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Valoración de lípidos en la heces" (1943). Petazze, María Luisa Ana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Valoración no cromatográfica de especies elementales basada en sistemas automáticos de extracción en fase sólida" (2009). Kim, Manuela Leticia. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En el presente trabajo se han estudiado sistemas en flujo contínuo para la valoración de especies elementales de cromo, vanadio y metales del grupo IB (Cobre, Plata y Oro) mediante su aislamiento de la matriz y preconcentración sobre sustratos ad-hoc sin utilizar la migración diferencial de especies como alternativa analítica. Se han estudiado sistemas en flujo utilizando extracción en fase sólida mediante la incorporación de microcolumnas empaquetadas con sólidos híbridos mesoporosos basados en sílica, los que han sido sintetizados en el laboratorio y caracterizados en ocasión del presente trabajo. El sistema en flujo así diseñado se ha acoplado en línea a distintos detectores espectroscópicos, dando lugar a diferentes aplicaciones en las que los sólidos híbridos mesoporosos son utilizados por primera vez con un objetivo analítico. Dentro de los alcances del presente trabajo se encuentran: · El diseño de los sistemas en flujo idóneos para los estudios de especiación y preconcentración de los analitos en estudio: Sistemas de extracción en fase sólida en línea (FI-SPE) acoplados con sistemas de detección contínua (espectrofotometría Uv-Vis) y discretas (espectrometría de absorción atómica con atomización electrotérmica, ETAAS). · La síntesis de los sólidos mesoporosos híbridos basados en sílica. Caracterización química y física de los mismos: Difracción de rayos X, microscopía electrónica de barrido, espectroscopía de infrarrojo y análisis elemental. · Estudios de adsorción y desorción de las diferentes especies elementales para la elucidación de los mecanismos de sorción y desorción involucrados: Evaluación de los diferentes sistemas de sorción, aplicando diferentes modelos de equilibrio y cinética involucrados en la interacción sorbente-sorbato. · Uso de esquemas de discriminación cinética de interferentes eventuales que puedan competir por los sitios activos de sorción: Utilización de las ventajas de los sitemas en flujo en sistemas de extracción en fase sólida con sólidos mesoporosos híbridos de sílica. · Aplicación analítica de los sistemas FI-SPE desarrollados: Valoración y especiación e Cromo, Vanadio, y elementos del grupo IB (Au, Ag, Cu). · Evaluación crítica de los diferentes sólidos mesoporosos híbridos funcionalizados en la adsorción de iones metálicos del grupo IB, con vías a futuras aplicaoines analíticas: Estudio comparado de las variables físicas y químicas inherentes al mejoramiento de la performance analítica de los sistemas FI-SPE-ETAAS desarrollados. Se presentarán resultados novedosos y aplicables a la determinación de iones metálicos en aguas naturales, mostrando la posibilidad de expandir nuevos horizontes en el desarrollo de nuevos materiales nunca antes utilizados en la química analítica.

Abstract:
In this work we present new analytical methodologies for the determination of inorganic species of chromium, vanadium and the metals of the group IB: copper, silver and gold. The quantification has been carried out by means of flow through systems holding different solid materials able to perform the selective or specific isolation and preconcentration of the analytes avoiding the chromatographic separation as alternative for the determination. Different flow injection systems holding microcolumns packed with lab-made hybrid mesoporous materials were designed in order to perform the solid phase extraction of the target analytes. The designed flow systems were on-line coupled to different spectroscopic detectors giving rise to different applications where the hybrid mesoporous solids were employed with analytical purposes for the first time. The main goals of the work can be summarized as follows: · Design of flow injection systems (FI) suitable for studies on “speciation” and preconcentration of different analytes based on solid phase extraction (SPE) manifolds, coupled on-line to continuous detectors (UV-vis spectrophotometry) and high performance discrete detectors (atomic absorption spectrometry with electrothermal atomization, ETAAS). · Synthesis and characterization of three different silica based hybrid mesoporous materials by means of X ray diffraction (XRD), scanning electronic microscopy (SEM), infrared spectroscopy (IR) and elemental analysis. · Studies on the mechanisms of adsorption and desorption of the elemental species onto the solids and critical evaluation via the employment of kinetic models for the interaction sorbent/analyte. · Employment of kinetic discrimination schemes for the specific retention and/or release of a given analyte by taking advantage of the reproducible times of operation imposed by the flow through systems. · Analytical applications of the FI-SPE systems for the speciation of chromium and vanadium in natural waters at ultratrace levels Summary · Critical evaluation of the sorption behavior of three different solids synthetized along this work with respect to the metallic ions Cu(II), Ag(I) and Au(III). Results obtained for the determination of inorganic elemental species in natural waters will be presented. The very good performances achieved encourage the development of new materials as efficient sorbents in analytical chemistry.

"Variabilidad de la precipitación en Argentina en diferentes escalas temporales, relacionada con actividad convectiva observada. Documentación de la metodología para el tratamiento de la información. Verificación del desempeño de un modelo regional de pronóstico de precipitación" (2007). Marino, Mónica Beatriz. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En base a observaciones meteorológicas de superficie y altura se ha encarado en esta Tesis el estudio de la variabilidad de la precipitación en Argentina en diferentes escalas temporales, relacionada con actividad convectiva observada. Uno de los objetivos de esta Tesis fue documentar la metodología de control de consistencia de los datos meteorológicos. Para ello, se hizo una discusión de los datos disponibles, de la problemática de los errores encontrados y la forma en que se trató de minimizar su incidencia. La metodología empleada permitió mejorar la consistencia de los datos, temporal y espacialmente, el correcto cálculo de los parámetros y la verificación de los valores extremos. Se ha ensayado una climatología mensual y anual de situaciones sinópticas en la Argentina para el período 1998-2005. La coincidencia de resultados de esta climatología sinóptica con otros autores, en trabajos anteriores, permite consistir la base de datos de situaciones, a pesar de que la designación de situaciones sinópticas y tiempos significativos no se hizo con un método objetivo. Se analizó la variabilidad interanual de las tormentas desde los datos observados, en puntos distribuidos en la parte continental de Argentina. En todas las estaciones analizadas puntualmente, la variabilidad interanual del número de tormentas mostró una tendencia positiva, en el período 1968-2006, sin embargo durante los años 2004 a 2006 se observó una disminución de tormentas en todas ellas. Se analizaron los periodogramas correspondientes al análisis armónico del número de tormentas anuales. La poca varianza explicada permite decir que no hay procesos fundamentales que definan la variabilidad interanual del número de tormentas, sino que esta es la resultante de un conjunto de procesos físicos que le dan un carácter de aleatoridad a este comportamiento. Se estudiaron los índices de inestabilidad asociados a eventos extremos de precipitación para aquellos puntos con mediciones de radiosondeos. Existen pocos casos con umbrales extremos de los índices en situación de tormentas severas en el horario del radiosondeo, 12 UTC. No obstante cuando se dan estos valores hay una alta probabilidad de que se produzcan tormentas, conformando un indicio importante en el momento del pronóstico. Se realizó un estudio de la variabilidad interanual de las precipitaciones, en los parámetros cantidad, intensidad y número de días con precipitación, en diferentes zonas de la Argentina. Se estudió, además, la tendencia interanual de 10 índices de precipitación en la región centro y noreste de la Argentina, con énfasis en los eventos extremos, en el período 1959-2002. Los estadísticos estudiados en el área al este de 65° W y norte de 37° S de nuestro país mostraron cambios que son consistentes con clima más húmedo. Se estudió la intensidad de precipitación en 60 minutos para Buenos Aires. Estos estudios llevan a pensar que la atmósfera, en la última década, fue capaz de producir eventos aislados de una intensidad no observada con anterioridad. También se hizo un estudio de las preferencias horarias de la precipitación, para diferentes umbrales de cantidad diaria, en la ciudad de Buenos Aires. A medida que se aumentó el umbral la diferencia de frecuencia horaria se hizo más marcada y las mayores frecuencias se produjeron hacia la madrugada. Se observó que en invierno existen dos máximos que se hacen más notorios cuanto mayor es el umbral de precipitación. Análisis similares se hicieron para otras estaciones. En base a las salidas de un modelo regional ETA, de pronóstico de malla fina y de las observaciones de precipitación medida, se examinó la verificación del desempeño del modelo para la representación de la precipitación. Se estudió la verificación de la precipitación en pronósticos a 24, 48 y 72 horas, en 9 puntos de observación distribuidos en el territorio argentino. Se estudiaron las diferencias entre el valor dado por el modelo y la observación, así como el porcentaje de aciertos de casos con y sin precipitación. El modelo pronosticó mejor los días sin precipitación que con precipitación. Los errores reiterados, es decir que se mantuvieron durante 3 días, oscilaron entre el 8% y 24% de los casos analizados. Cuando se produjeron errores reiterados de sorpresas el rango de la precipitación se encontró en su mayoría entre 4 y 12 mm. Los aciertos del modelo, para las estaciones estudiadas, estuvieron por encima del 76% para 24 horas de pronóstico, por encima de 71% para 48 horas y mayores a 65% a 72 horas.

Abstract:
This Thesis studies the precipitation variability in Argentina, in different time scales, related with convective observed activity, based on surface and height meteorological observations. Among the objectives of this Thesis it has figured to document the consistence control methodology of the meteorological data. For this purpose, it was made a discussion of available data, the problem of errors and the way to minimize their incidence. The methodology used allowed to improve the data consistence, spatial and temporary, the correct calculation of the parameters and the verification of the extreme values. A monthly and annual Argentinean climatology of synoptic situations has been rehearsed, for period 1998-2005. The coincidence of results between this synoptic climatology and other authors, in previous works, allows consist the meteorological situations database, although the appointment of synoptic situations and significant weather were not made with an objective method. The inter-annual storm variability from observed data, distributed in continental Argentina points, was analyzed. All the stations showed a positive tendency in inter-annual variability of the storms number, in period 1968-2006, however during the years 2004 at 2006 a decrease of storms is observed in all of them. The periodograms corresponding to harmonic analysis of annual number of precipitations days were analyzed. The little explained variance allows say that there are not fundamental processes that define the inter-annual variability of storms number, but rather this is the resultant of a group of physical processes that give a random character to this behavior. The instability indexes associated to extreme precipitation events were studied for those points with radiosondes measures. Few cases exist for extreme thresholds indexes, corresponding to severe storms situations, at 12UTC, in time of radiosonde, nevertheless when they are given there is a high probability that storms take place, conforming an important indication at forecast moment. It was carried out a study of inter-annual precipitation parameters variability, quantity, intensity and number of days with precipitation, for different Argentinean zones. It was also studied the inter-annual tendency of 10 precipitation indexes in center and northeast region of Argentina, with emphasis in extreme events, in 1959-2002 period. The statistical studied in the area at east of 65° W and north of 37° S, show changes in precipitation indexes that are consistent with more humid climate. The precipitation intensity for 60 minutes in Buenos Aires was studied. These studies carry to think that the atmosphere, in last decade, is able to produce isolated events of an intensity not observed previously. A study of preferences of precipitation horary, for Buenos Aires city, for different precipitation thresholds of daily quantity, it was made too. As is increased the threshold, the difference of horary frequency becomes more notable and the biggest frequencies take place toward the dawn. In winter, are observed two maximum, they become more notorious when the precipitation threshold is greater. Similar analysis was done for other stations. On the other hand, based on a fine mesh regional forecast ETA model outputs, and measured precipitation, the verification of model acting was examined for precipitation representation. The precipitation verification was studied for 24, 48 and 72 hours of forecast, in 9 observation points, distributed in Argentinean territory. It was studied the difference between the model and the observations, as well as the percentage of successes for cases with and without precipitation. The forecast model was better the days without precipitation than those with precipitation. The days with reiterated errors, that is the error stayed during 3 days, oscillated between 8% and 24% of analyzed cases. When reiterated errors of surprises took place, the precipitation range was majority between 4 and 12 mm. The model successes, for the studied stations, were above 76% for 24 hours of forecast, above 71% for 48 hours and bigger to 65% for 72 hours.

"Variabilidad de los eventos extremos de temperatura observados y modelados en el sudeste de Sudamérica, y sus proyecciones ante un escenario de cambio climático" (2010). Tencer, Bárbara. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En este trabajo se estudia la variabilidad de los eventos extremos de temperatura observados y modelados en el Sudeste de Sudamérica, y sus proyecciones ante un escenario de cambio climático. Los eventos extremos del tiempo y del clima afectan severamente los ecosistemas y la sociedad. La existencia de un cambio climático que produzca una pequeña variación en los valores medios de temperatura puede ocasionar grandes cambios en las temperaturas extremas. El objetivo general que se desea alcanzar en este trabajo es el de encontrar una aproximación que permita estimar los valores extremos de temperatura que ocurrirán en los próximos años en el Sudeste de Sudamérica ante la presencia de un cambio climático, reduciendo la incertidumbre propia de este tipo de proyecciones. Para ello, se exploran distintas metodologías que permiten estudiar la intensidad y la frecuencia de los eventos extremos de temperatura observados y simulados en el pasado, como así también proyectados para el clima futuro. En particular, se aplica la Teoría de Valores Extremos para estudiar la variabilidad observada en los eventos extremos de temperatura durante el siglo XX en estaciones que pertenecen a distintas regiones climáticas de Argentina. Además, se estudian distintas metodologías de downscaling (estadístico y dinámico) que permiten evaluar el impacto del cambio climático en las distribuciones de los extremos de temperatura a escala regional.

Abstract:
In this study variability of observed and simulated temperature extreme events are analysed in Southeastern South America, as well as their projections in a climate change scenario. Climate and weather extreme events severely affect the ecosystems and society. The existence of a climate change that induces small variations in mean temperature values can produce big changes in temperature extremes. The general objective of this study is to found an appropriate estimation of the temperature extreme values that will happen in the near future in Southeastern South America under the assumption of a climate change, reducing the typical uncertainty of this kind of projections. Therefore, different methodologies are explored in order to study the intensity and frequency of observed and simulated temperature extreme events in the past, as well as their projections for the future. In particular, the Extreme Value Theory is applied to study the observed variability of temperature extreme events during the XX century in meteorological stations belonging to different climate regimes in Argentina. Different downscaling techniques (statistical and dynamical) that allow to evaluate the impact of a climate change in extreme value distributions on a regional scale are also analysed.

"Variabilidad espacial y estructura de las comunidades de Trichoptera (Insecta) en arroyos del Parque Provincial Salto Encantado del Valle del Cuñá-Pirú (Misiones, Argentina)" (2011). Sganga, Julieta Valeria. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los tricópteros son un grupo de insectos acuáticos en sus estados inmaduros, que despliegan una gran variedad de adaptaciones tróficas y comportamentales. Debido a su riqueza taxonómica, diversidad ecológica, y abundancia constituyen un importante grupo indicador de la calidad del agua. Los ríos son sistemas jerárquicamente organizados, cuyas características bióticas y abióticas varían a diferentes escalas espaciales y temporales. Dentro de este sistema se reconocen varios niveles anidados, donde las comunidades de insectos responden a cambios espacio-temporales. Mientras que el clima, la geología, los procesos geomórficos, y los usos del suelo actúan a grandes escalas, a escala de meso- y microhábitat, la distribución y abundancia de los organismos bentónicos está determinada por el tipo de sustrato, el caudal, la velocidad de la corriente, y la temperatura del agua. Con el objeto de analizar variaciones estacionales y espaciales de las especies de Trichoptera en arroyos del Parque Provincial Salto Encantado, se realizaron campañas durante abril y noviembre de 2006 y enero y marzo de 2008, en 7 sitios ubicados en las cuencas de los arroyos Cuñá-Pirú y Garuhapé. Se tomaron muestras de Trichoptera con una red Surber obteniéndose un total de 195 réplicas (3 réplicas en rápidos/correderas en 2006 y 3 réplicas por hábitat en 2008). Además, en cada oportunidad se midieron distintas variables ambientales a escala de hábitat y tramo. La composición taxonómica difirió entre sitios en un mismo período hidrológico, pero no se detectaron diferencias marcadas entre períodos para un mismo sitio. La única excepcion se produjo en el sitio Ta. Se pudieron establecer distintos hábitats en los cuerpos de agua, que difirieron en cuanto a la composición taxonómica, abundancia, biomasa, riqueza y diversidad de taxa de Trichoptera. Estos hábitats presentan ensambles característicos, que responden a variables ambientales locales. Los rápidos con podostemáceas fueron los hábitats que sostuvieron los mayores valores de diversidad, riqueza, densidad media y biomasa. Los grupos funcionales alimenticios variaron entre hábitats en respuesta a sus requerimientos ambientales y disponibilidad de alimento. Todos los grupos alimenticios (con excepción de los succionadores) estuvieron representados, estableciéndose fuertes relaciones ambientales principalmente con las categorías de detrito autóctono y alóctono. Los cambios en los patrones de distribución (abundancia y biomasa) de los grupos funcionales alimenticios de tricópteros fueron evidentes a una escala de hábitat. El mantenimiento de la integridad ecológica de los ecosistemas estudiados es vital para la calidad del agua y la persistencia de la biota. Este trabajo presenta no sólo un inventario de tricópteros, sino que además establece relaciones especie ambiente a varias escalas espaciales y temporales en ríos de la selva misionera. Esta información es básica y necesaria para poder evaluar los cambios antrópicos que puedan producirse en un futuro.

Abstract:
The caddisflies are a group of aquatic insects in their immature stages, which display a variety of trophic and behavioral adaptations. Due to their taxonomic richness, ecological diversity, and abundance, they are important indicators of water quality. Rivers are hierarchically organized systems, with biotic and abiotic characteristics varying at different spatial and temporal scales. Within this system several nested levels are recognized, where the insect communities respond to changes in time and space. While climate, geology, geomorphic processes and land use act at large scales, at meso and microhabitat scales the distribution and abundance of benthic organisms are determined by the type of substrate, flow, current velocity and water temperature. In order to analyze temporal and spatial variations of species of Trichoptera in streams of the Parque Provincial Salto Encantado, campaigns were conducted during April and November 2006 and January and March 2008, at 7 sites located in the basins of Cuñá- Pirú and Garuhapé streams. Trichoptera were collected with a Surber sampler obtaining a total of 195 replicates (3 replicates per runs/riffles in 2006 and 3 replicates per habitat in 2008). In addition, at each time environmental variables at habitat and segment scales were measured. The taxonomic composition differed between sites in the same hydrological period, but there were no marked differences between periods for the same site. It was possible to establish different habitats in water bodies, which differed in terms of taxonomic composition, abundance, biomass, taxa richness and diversity of Trichoptera. These habitats have characteristic assemblages, which respond to local environmental variables. Run habitats with podostemaceae, supported the highest values of diversity, richness, mean density and biomass. Functional feeding groups varied between habitats in response to environmental requirements and food availability. Changes in distribution patterns (abundance and biomass) of functional feeding groups of caddisflies were evident at the scale of habitat. Maintaining the ecological integrity of the ecosystems studied is vital for water quality and the persistence of the biota. This work presents not only an inventory of caddisflies, but also establishes species environment relationships at various spatial and temporal scales in rivers of Misiones rainforest. This basic information is needed to assess the anthropogenic changes that may occur in the future.

"Variabilidad espacial y temporal de la concentración del hielo marino antártico y su relación con la circulación atmosférica" (2008). Barreira, Sandra C. B.. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Existen numerosos estudios en la literatura que sugieren algún tipo de conexión entre los campos de hielo marino de las regiones polares y el clima global pero, la naturaleza específica y los mecanismos a través de los cuales las variaciones en los campos de hielo marino están relacionadas con el clima global o de latitudes medias están todavía pobremente definidos. La presente tesis pretende completar los estudios realizados previamente por otros autores y mejorar los conocimientos existentes sobre conexiones entre el hielo marino en la Antártida y el clima global, a la vez que evaluar su significado enfocándose en la región antártica donde se producen las mayores variaciones del campo de hielo marino, tanto temporal como espacialmente, que es sobre los mares de Amundsen, Bellingshausen y Weddell. Específicamente, lo que se intentó realizar fue cuantificar la variabilidad tanto espacial como temporal del campo de hielo marino, identificar las relaciones que existen entre la variabilidad del hielo marino y el clima tanto polar, de latitudes medias como global, señalar la significancia de estas relaciones e identificar regiones geográficas que puedan mostrar las conexiones más fuertes, teniendo en cuenta que la identificación de las conexiones entre la región polar y el resto de las regiones terrestres es el primer paso para determinar los mecanismos responsables de las mismas. Para examinar las variaciones espaciales del hielo marino antártico, determinar cuando se da una cierta estructura de anomalía espacial e investigar su relación con el clima tanto polar como de Sudamérica, se analizaron los datos de concentración de hielo marino en modo-T y se confeccionaron mapas de composiciones de distintas variables atmosféricas. Para examinar las variaciones temporales, y encontrar las áreas donde las mismas resultan homogéneas así como ver la forma en que se relacionan con la variabilidad del clima global, se analizaron los datos de concentración de hielo marino en modo-S y se confeccionaron mapas de correlación entre distintas variables atmosféricas y las series patrón encontradas así como correlogramas cruzados entre dichas series y algunos índices atmosféricos.

Abstract:
There are numerous studies in the literature that suggest some kind of connection between sea ice fields of the polar regions and global climate but, the specific nature and the mechanisms through which the variations in sea ice fields are related to global or midlatitudes climate are still poorly defined. The present thesis tries to complete previous studies done by other authors and to improve the existing knowledge on connections between sea ice in the Antarctica and the global climate, simultaneously with the evaluation of its meaning focusing in the Antarctica region where the greater variations of sea ice field take place, temporary as well as spatially, that is on the Amundsen, Bellingshausen and Weddell Seas. Specifically, what was tried to be done was to quantify sea ice spatial and temporary variability, to identify the relations that exist between sea ice variability and polar, mid-latitudes and global climate, to indicate the significance of these relations and to identify the geographic regions which show the strongest connections, considering that the identification of the connections between the polar region and the rest of the terrestrial regions is the first step to determine the mechanisms that are responsible for them. In order to examine the space variations of Antarctic sea ice, to determine when a certain structure of space anomaly occurs and to investigate its relation with polar and South America climate, the sea ice concentration data were analyzed in T-mode and composite maps of different atmospheric variables were made. In order to examine the temporary variations, and to find the areas where the same ones turn out homogenous as well as to see the form they are related to the variability of the global climate, sea ice concentration data were analyzed in S-mode and correlation maps between different atmospheric variables and the found pattern series, as well as cross-correlograms between these series and some atmospheric indexes were made.

"Variabilidad genética espacial y ecología molecular en dos especies de roedores del Archipiélago de Tierra del Fuego: Ctenomys magellanicus, especie nativa y Castor canadensis, especie invasora" (2012). Fasanella, Mariana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En esta tesis, se analizan a nivel molecular dos especies que habitan el Archipiélago de Tierra del Fuego (ATDF): una especie endémica (Ctenomys magellanicus) y una invasora (Castor canadensis). Ctenomys magellanicus se encuentra en estado Vulnerable según la UICN y es la única especie del género Ctenomys que se encuentra en Tierra del Fuego, mientras que el castor es la exótica más importante del ATDF y que genera mayores problemas a nivel ecológico y económico. Utilizando trampas de captura muerta, se capturaron 255 ejemplares de C. canadensis muestreados en todo el ATDF incluyendo Chile y Argentina, mientras que se capturaron 60 ejemplares de C. magellanicus de la zona norte de la Isla Grande de TDF (Argentina) utilizando trampas de captura viva. Utilizando marcadores moleculares (ADNmt y microsatélites), se estudió la variabilidad genética y la estructura genético poblacional de ambas especies. Para esto se subdividió a la población de castor en 5 subpoblaciones y a la de tucos en dos regiones (REGION NORTE y REGION SUR) según la forma cromosómica y dentro de cada una en 2 y 4 subpoblaciones respectivamente. Para C. magellanicus se detectaron 9 haplotipos de ADNmt, 3 exclusivos de la REGION NORTE y 6 exclusivos de la REGION SUR mientras que para castor se encontraron 7 haplotipos distribuidos en casi todas las subpoblaciones. Se encontró una significativa estructuración genética en la población de tucos (tanto con el marcador mitocondrial Φst=0,181 p=0,001 como con el nuclear Fst=0,108 p=0,001) a diferencia de la población de castores, que no presentó estructuración significativa en ambos marcadores moleculares (Φst=0,058 p=0,002; Fst=0,052 p < 0,001). Los resultados del ADNmt y los microsatélites mostraron una alta variabilidad para tucos mientras que para castor la variabilidad fue menor. Por último, en castor, se identificó a la Isla Dawson (subpob E) como una Unidad de Erradicación (UE) mientras que dentro de la Isla Grande, al haber muy baja estructuración poblacional no se pudieron identificar UE. Debido a que en la Isla Grande no existen barreras a la dispersión para los castores, se deberá realizar un control simultáneo en toda la isla para evitar posibles recolonizaciones. Si bien los datos para Ctenomys magellanicus aportan información parcial, se podrían sugerir 5 Unidades de Manejo (UM) basadas en la estructuración genética: 4 UM para la REGION SUR y 1 UM para la REGION NORTE.

Abstract:
In this thesis, we analyze at the molecular level two species that inhabit the Tierra del Fuego Archipelago (TDFA): an endemic (Ctenomys magellanicus) and an invasive species (Castor canadensis). Ctenomys magellanicus is in a Vulnerable state by the UICN and is the only species of the genus Ctenomys found in Tierra del Fuego, while the beaver is the most important exotic in the TDFA and generates the biggest problems at the ecological and economic levels. Using killing traps we capture 255 individuals of C. canadensis sampled throughout the TDFA including Chile and Argentina, while we capture 60 individuals of C. magellanicus from the north of the Isla Grande of TDF (Argentina) live trapping. Using molecular markers (mtDNA and microsatellites), we studied the genetic variability and population genetic structure of both species. For this, beaver population was further divided into 5 sub-populations and C. magellanicus was divided into two regions (NORTH REGION and SOUTH REGION) according to the chromosome form and within each into 2 and 4 sub- populations respectively. For C. magellanicus we detected 9 mitochondrial haplotypes, 3 exclusive from the NORTH REGION and 6 exclusive from SOUTH REGION while for beaver we found 7 haplotypes in almost all sub-populations. There was a significant population genetic structure in tucos (both with mitochondrial marker Φst=0,181 p=0,001 as with nuclear Fst=0,108 p=0,001) as opposed to the beaver population which did not present significant structure in both molecular markers (Φst=0,058 p=0,002; Fst=0,052 p < 0,001). Microsatellite and mtADN results showed a high variability in tucos while in beavers the variability was less. Finally, in beavers, we identified Isla Dawson (Subpop E) as an Eradication Unit (EU) while inside the Isla Grande, we could not identified EUs because of the very low population structure. Since on the Isla Grande there are no barriers to dispersal for beavers, it should be performed a simultaneously control on the island to avoid recolonization. While data on Ctenomys magellanicus provide partial information, we could suggest 5 Management Units (MU) based on the genetic structure: 4 MU for the SOUTH REGION and 1 MU for the NORTH REGION.

"Variabilidad genética y antigénica del virus de la fiebre aftosa, serotipo O, entre aislamientos recuperados durante la replicación del virus en animales persistentemente infectados, y entre cepas de campo" (1996). Malirat, Viviana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La variación genética y antigénica en el virus de la fiebre aftosa, O1 Campos Brasil 1/58 (O1 C/58) se ha analizado en aislamientos consecutivos, recuperados durante un periodo de uno o dos años, a partir de cuatro bovinos con infección persistente, establecida en forma experimental. La comparación de los mapas bidimensionales de fragmentos resistentes a Rnasa T1, y de la secuencia de nucleótidos de la región que codifica para la proteína inmunogénica VP1, revelaron un aumento irregular de las fijaciones de mutaciones a medida que la infección avanzaba. El grado de variación con respecto a la cepa O1 C/58, usada originalmente para establecer la infección persistente, alcanzó valores máximos de 2,4 por ciento para el genoma total y de 1,4 por ciento para la secuencia de nucleótidos que codifica para la proteína VP1. La mayoría de los cambios no eran conservados entre aislamientos consecutivos. Estos resultados, junto con los valores substanciales de velocidad de variación genómica observados entre algunos pares de aislamientos recuperados con intervalos de tiempo muy cortos, indicaron la coexistencia de poblaciones heterogéneas, que predominaban unas sobre las otras en periodos irregulares, y que evolucionaban independientemente entre sí. No se observaron padrones de variación relacionados entre los cuatro animales. También fue evaluada la diversificación genética de cepas representativas de brotes de campo, serotipo O, ocurridos en regiones endémicas del sudeste de Brasil y del centro-este de Argentina entre los años 1958 y 1983. En base a los análisis de mapas bidimensionales de fragmentos resistentes a RNasa T1, los aislamientos mostraron diferencias respecto de la cepa O1 C/58, con valores que fluctuaban entre 0,7 por ciento y 4,0 por ciento de variación, y los valores registrados en base a la secuencia de nucleótidos que codifica para la proteína VP1 fluctuaron desde 1,0 por ciento hasta 17,2 por ciento. La variación genómica registrada era independiente del tiempo transcurrido entre los aislamientos, y los cambios no eran acumulativos. Estos resultados sugieren que las variantes no emergen sucesivamente en el campo, y que probablemente representan padrones independientes de evolución, donde podrían intervenir las infecciones persistentes.

Abstract:
Genetic and antigenic variation in foot-and-mouth disease virus O1 Campos Brasil 1/58 (O1 C/58) has been analyzed in consecutive isolates recovered over a one- or two-year period from four cattle with experimental persistent infections. Comparisons of RNase T1 two-dimensional maps and nucleotide sequences of the VP1-coding region revealed an oscillatory increase in the fixation of mutations as the infection progressed. The degree of variation with respect to the strain O1 C/58 used originally to establish the persistent infection, reached values of up to 2,4 per centum for the overall genome, and 1,4 per centum for the nucleotide sequence of the VP1-coding region. Most changes were not conserved in consecutive isolates. These results, together with the substantial rates of genomic variation observed between some pairs of strains recovered at close time periods, suggested the coexistence of heterogeneous populations in which variants predominate at irregular time intervals and evolve independently from each other. Furthermore, non-related patterns of variation were observed in the four animals. Genetic diversification of representative strains from major serotipe O outbreaks in endemic disease regions of southeastern Brazil and central-eastern Argentina between 1958 and 1983, was evaluated. On the basis of oligonucleotide fingerprinting, isolates showed variations, with respect to the early strain O1 C/58, ranging between 0.7 per centum and 4.0 per centum, and values between 1.0 per centum and 17.2 per centum on the basis of nucleotide sequencing of part of the VP1-coding region. The extent of differences among the genomes was independent of the time elapsed between viral isolations. Moreover, changes did not accumulate in subsequent samples. These results suggested that variants did not emerge successively in the field, and probably represent independent patterns of evolution, where persistent infections might be involved.

"Variabilidad interanual de la precipitación en la Pradera Pampeana y su relación con algunos índices de circulación atmosférica" (1999). Scian, Beatriz Viviana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En este trabajo de investigación se amplian los conocimientos de las relaciones entre los incrementos o deficiencias de las lluvias observadas en la pradera pampeana y las anomalías en la circulación de la atmósfera a través de algunos índices hemisféricos, en particular, el indice de Oscilación del Sur (SOI) y las anomalías de la temperatura superficial del mar en el Pacífico ecuatorial (SST3). Los datos utilizados son las lluvias mensuales de más de 40 localidades de la llanura pampeana con una longitud de registros desde comienzos de siglo hasta al menos la década del ‘80. Se hace una comparación de indices hídricos que acordes a la finalidades de sus concepciones: agronómica, climática, hidrológica, están mejor detallados en algunos rangos de valores extremos, que en otros. A fin de estudiar dichos extremos, sobre todo las sequías, se hace evidente los beneficios del Indice de Precipitación Estandarizada y normalizada, IPE, a escala mensual. Demuestra ser un buen indicador de sequías y episodios húmedos en la región, no sólo por su escala temporal variable sino por su mejor definición en rangos de bajos porcentajes de frecuencia. Empleando métodos estadísticos de clusters se circunscribe la zona de estudio a tres subregiones de la pampa central de Argentina: Sudoeste, Norte y Este, respectivamente. Los coeficientes de correlación del IPE para los meses estivales (Nov-Dic-Ene) con el SOI mensual muestran valores significativos al nivel del 5%, desde Junio a Agosto alcanzando un valor de -0.56 entre el SOI de Agosto y el IPE de Diciembre. El signo indica que una alteración en la posición del Anticiclón del Pacífico, que origina SOI negativos/positivos, produciría anomalías positivas/negativas en la precipitación de los meses de Noviembre y Diciembre cuando esta fase negativa/positiva del SOI se anticipa a partir del mes de Junio. Las correlaciones entre el IPE mensual y la serie de temperatura superficial del mar en la región Niño3 (SST3). a partir de 1949, son positivas y con valores máximos en las regiones Este y Norte; observándose valores de los coeficientes de hasta 0.58 entre la SST3 de Julio con el IPE de Diciembre y la SST3 de Octubre con el IPE de Noviembre, respectivamente. En la región Sudoeste sólo alcanza el 0.38 entre la SST3 de Octubre con el IPE de Noviembre. Este resultado sugeriría una mayor influencia del SOI que la SST3 sobre las lluvias en el sudoeste pampeano. Las anomalías de la precipitación para los episodios cálidos o fríos definidos por Ropelewski y Halpert (1996) tienen sus extremos al fin de la primavera y comienzos del verano. Los desfasajes en el comportamiento de las dos curvas se producen entre Noviembre y Diciembre, este último es el mes extremo húmedo. Existe un segundo pico, más débil entre 4 a 7 meses más tarde. Se analizan las anomalías del IPE mensual con las cinco fases del SOI establecidas por Stone y Auliciems (1992). En general, resulta en la región de estudio que la fase 2 y la fase 4 están asociadas a corrimientos negativos en la precipitación mediana, deficiencias de lluvia. Por otra parte, las fase 1 y 3 coinciden en relacionarse con desplazamientos positivos de las medianas de lluvia. Sin embargo, pueden darse situaciones con perturbaciones dentro de un ciclo positivo o negativo del SOI que verifican lo opuesto. De la inspección de los corrimientos medianos para la primera mitad del período de estudio, 1900-1940, y para la segunda, 1941-1988, se nota en toda la región la influencia positiva del mes de Marzo en fase 4 durante el último período pero no se encuentra notorio aumento (como era de esperar por las tendencias positivas de la lluvia en las últimas décadas) en los meses estivales, ni en fase 1 ni en fase 3. con respecto al primer período. Se obtuvieron buenos resultados al analizar los corrimientos significativos en las medianas de la precipitación de los meses de Noviembre y Diciembre ya que pueden anticiparse a partir de las condiciones del SOI (fases) desde el mes de Julio. Se considera a Agosto como el mejor mes predictor, con cuatro fases significativas, ya que las fases 1 y 3 del SOI provocarian anomalías positivas y fases 2 y 4 anomalías negativas para el mes de Diciembre, en la región Sudoeste.

Abstract:
In this study the relationship between anomalies in the pampean prairie precipitation and the anomalous behaviour of the atmospheric circulation, particularly focused on the Southern Oscilation Index (SOI) and the sea surface temperature anomalies in the equatorial Pacific (SST3) is examined. Data consist of secular month precipitation for more than 40 selected stations over the pampean plains. A comparison between different precipitation indexes based on agricultural, climatic and hydrological concepts is performed. In analyzing extreme events, such as drought, the Standarized Precipitation Index (SPI) or IPE in spanish, shows adequacy at a variable time scale. It has shown good properties when monitoring drought or wet episodes in the region, particularly, when classifying extreme conditions. Three coherent subregions in the central pampas of Argentina, Southwest, North and East, respectively were determined by clustering methods. The results indicate that precipitation over the whole region is significantly influenced by the SO phenomenon. A leading SOI correlated with the summer (Nov-Dec-Jan) anomalous rainfall shows significant coefficients, at 5% significance level, from June to August (peak values of -0.56, for August SOI-December IPE). A negative sign implies an anomalous position of the Pacific High that gives rise to negative SOI starting from June onwards, which in turn would produce positive anomalies in November and December precipitation. A positive SOI phase for the same two months, would be related to negative rainfall anomalies. Correlations were performed too, between monthly SPI values and the sea surface temperature of the Equatorial Pacific Niño3, SST3. From the latter, possitive and maximun coefficients result for the East and North regions, with values of 0.58 for each of July SST3 -December IPE and October SST3 November IPE, respectively. The Southwest portion reaches only a coefficient of 0.38 for October SST3 - November IPE, suggesting a Stronger SOI impact on the southwest prairies rainfall compare to that of the SST3. Anomalous precipitation for warm and cold events as defined by Ropelewski and Halpert (1996) have extreme values for spring and early summer. Maximum out of phase values between the two cases is reached in November and December, being the latter the extreme wet. A second and weaker peak occurs 4 to 7 months later. In order to clarify this behaviour SPI anomalies are analized through the SOI five phases established by Stone and Auliciems (1992). Results from the region evidence that: phases 2 and 4 are related to a negative shift in the median precipitation (rainfall deficit), while phases 1 and 3 are associated with a positive shift in median precipitation. Nevertheless, small perturbations during a positive or negative SOI cycle may produce opposite results. A significatively positive shift during March in phase 4 was observed in the period from 1941-1988, when an increase in summer rainfall during phase 1 and phase 3 had been expected as a consecuence of the high positive precipitation trends of the last decades in the region. Significative median rainfall shifts (a=0.05) for November and December are able to be forecasted from SOI conditions starting on July phases. August is the best predictor SOI month for December rainfall anomalies in the Southwest region. It shows four significative phases, 2 and 4 producing negative IPE shifts, and 1 and 3 positive ones.

"Variabilidad interanual en la frecuencia de ocurrencia de heladas en la Pampa húmeda y su relación con la circulación atmosférica asociada" (2005). Müller, Gabriela Viviana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Las irrupciones de aire frío más intensas en el sur de Sudamérica están acompañadas por importantes cambios en la circulación atmosférica en toda la tropósfera, tanto a escala sinóptica como hemisférica; dichos cambios se manifiestan en alta y baja frecuencia como consecuencia de la variabilidad interanual e interestacional. En este trabajo se analiza el rol que ellas tienen en la modulación de los aspectos de gran escala vinculados a las incursiones de aire frío que provocan heladas en la Pampa Húmeda, con un enfoque principalmente espacial. Las características de la circulación atmosférica regional y global asociadas a las heladas se abordan desde una perspectiva tanto sinóptica como climática. El estudio está basado en la temperatura mínima de las estaciones meteorológicas situadas en el centro-este de Argentina de los años 1961-1990, para lo cual se identifican y clasifican las heladas en tres categorías: aisladas, parciales y generalizadas. Asimismo, se definen los períodos de máxima y mínima frecuencia de ocurrencia de las heladas en sus distintas categorías, examinando las diferencias en la circulación entre ambos casos extremos a nivel estacional y mensual, utilizando los reanálisis de NCEP/NCAR. En particular se estudia la generación y evolución de los eventos de heladas generalizadas (HG) durante el invierno y a partir de los resultados surgidos del análisis observacional se proponen los mecanismos físicos responsables, los que son validados mediante simulaciones numéricas empleando un modelo baroclínico de circulación global. Por otra parte, escogiendo los episodios más representativos espacialmente - heladas parciales y generalizadas-, se realiza una caracterización de las situaciones en superficie de acuerdo a la frecuencia de ocurrencia de los tipos sinópticos principales que las representan. Esta clasificación se realiza para la totalidad de los inviernos y para los años El Niño, La Niña y Neutro del mismo período, empleando las observaciones de presión en superficie de las estaciones meteorológicas del cono sur del continente y los océanos adyacentes. Gran parte de la variabilidad interanual de la circulación del hemisferio sur está relacionada con los cambios en la convección tropical asociada al ENOS, como así también una importante componente de la variabilidad intraestacional está vinculada a la convección tropical. Se comprueba que la variabilidad interanual en la frecuencia de ocurrencia de heladas está condicionada al menos en parte, por la ocurrencia de las fases cálida y fría del ENOS, con un mayor (menor) número de heladas durante La Niña (El Niño). En particular el estado básico de máxima frecuencia de ocurrencia de HG, representado por el promedio de los inviernos respectivos, muestra características coincidentes con los años La Niña, junto con una mayor actividad convectiva en el Pacífico tropical occidental. Mediante simulaciones numéricas se examina el rol de la convección tropical cuya respuesta es la propagación de ondas de Rossby extratropicales que constituyen un mecanismo importante en la generación de HG. La mayor o menor frecuencia de ocurrencia de las HG está condicionada por el flujo básico en el cual se propagan dichas ondas. Los inviernos de máxima frecuencia de ocurrencia de tales eventos están caracterizados por un estado básico que acentúa el rol del jet subtropical y polar como eficientes guías de ondas. Ellas se generan en lugares remotos que están determinados por el flujo básico y se propagan en trayectorias zonales a lo largo de ambos jets, los que alcanzan una gran extensión longitudinal hasta las proximidades del continente. Al acercarse al mismo, las fases de ambos trenes de onda coinciden en el momento previo a los eventos más conspicuos de HG, provocando una sostenida y marcada advección de aire polar sobre todo el cono sur, reforzada por una anomalía ciclónica extendida meridionalmente en el Atlántico Sur frente a la costa. La mayor persistencia del evento está en relación directa con la intensidad de la anomalía anticiclónica sobre Sudamérica y el carácter cuasi-estacionario que la misma alcanza. En cambio los eventos de menor persistencia muestran un patrón de propagación con un único tren de ondas que alcanza América del Sur. La anomalía anticiclónica que afecta el continente junto a la ciclónica corriente abajo, siguen una trayectoria en forma de arco conforme el sistema evoluciona hacia el noreste a sotavento de los Andes. En el estado básico representado por los inviernos de mínima frecuencia de ocurrencia de HG no aparece un definido jet polar, a lo que se suma el hecho que la propagación de las ondas de Rossby está inhibida en particular en la región preferencial de ingreso de los sistemas sinópticos al continente Sudamericano. Estas diferencias entre ambos estados básicos se traducen en una mayor o menor ocurrencia de HG y a su vez explican la generación de los eventos más frecuentes y persistentes.

Abstract:
The most intense cold surges in South America are accompanied by important changes in the synoptic and hemispheric scale atmospheric circulation throughout the entire troposphere. These changes are evidenced as high and low frequency variations as a consequence of the seasonal and interannual variability, whose role in modulating the large scale features associated to the cold surges over the Pampa Húmeda is studied mainly from a spatial distribution point of view. A synoptic as well as a climatic perspective are applied to the study of the regional and global scale atmospheric circulation features. The study is based on the minimum temperature from the weather stations on central-east Argentina during the period 1961-1990, from which the frost events are identified and classified in three categories: isolated, partial and generalized frosts. Also, the periods of maximum and minimum frequency of frosts of the three categories are defined, and the differences in the atmospheric circulation between the two extremes are examined on a monthly and seasonal time scale by using the NCEP/NCAR reanalysis. In particular, the study focuses on the development and evolution of generalized frosts (GF) during wintertime, and based on the results of the observational study, their physical mechanism is proposed and tested by means of numerical simulations with a baroclinic general circulation model. By choosing the most representative cases in terms of spatial distribution, i.e. partial and generalized frosts, the surface weather situations are characterized according to the frequency of occurrence of the main synoptic patterns that represent the frosts. The classification is made for the winters of the entire period as well as those of El Niño, La Niña and Neutral years based on the sea level atmospheric pressure from the weather stations over the southern cone of the continent and the adjacent oceans. A large portion of the interannual variability in the southern hemisphere atmospheric circulation is associated to changes in ENSO-related tropical convection, just as a significant component of the intraseasonal variability is associated to tropical convection. It is found that the interannual variability of frost frequency is in part conditioned by the ENSO phases, since there is a larger (smaller) number of frosts during La Niña (El Niño) events. In particular the basic state of maximum GF frequency, represented by the respective averaged winter, shows similar characteristics to La Niña years, as well as enhanced convective activity over the western tropical Pacific Ocean. The role of tropical convection is examined by means of the numerical simulations, whose response is the propagation of extratropical Rossby waves that become an important mechanism for generating GF. The basic state flow, through which the Rossby waves propagate, is the one that determines a larger or smaller number of frosts. Winters with maximum frost frequency are characterized by a basic state flow that highlights the role of the subtropical and polar jets as efficient wave guides. Rossby waves are generated remotely at locations determined by the basic state and they propagate through zonal trajectories along both jets, which show large longitudinal extensions that reach the proximities of the continent. When approaching the continent, the phases of both wave trains coincide immediately before the most conspicuous GF events, giving rise to sustained polar air advection all over the southern cone, reinforced by a cyclonic anomaly located off the coast over the South Atlantic Ocean, with a large meridional extension. The persistence of frost events is in direct relationship to the intensity of the anticyclonic anomaly over South America and its cuasi-stationary degree. Instead, the less persistent events display a Rossby wave propagation pattern with only one wave train reaching South America. The anticyclonic anomaly that affects the continent, together with the cyclonic anomaly located downstream, both move to the northeast leeward to the Andes mountains. The basic state corresponding to winters with minimum frost frequency does not show a well-defined polar jet, in addition to which there are regions that inhibit the Rossby wave propagation, in particular one is located in the preferred region where the synoptic systems enter the continent. The differences between the two basic states translate into larger or smaller frost frequencies and at the same time they explain the development of the most frequent and most persistent frost events.

"Variabilidad intraestacional de alta y baja frecuencia de la temperatura máxima y mínima diaria en Sudamérica. Estudio de la predictabilidad mediante la entropía condicional" (2009). Naumann, Gustavo. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los pronósticos del tiempo y climáticos mejoran con el aumento de la habilidad de los modelos tanto dinámicos como probabilísticos en identificar situaciones de alto y bajo riesgo. Por esta razón el conocimiento de los procesos que intervienen en la identificación de situaciones con alto riesgo conlleva a una valoración en la información meteorológica por parte del usuario. Es por esto que la comprensión del funcionamiento del clima y su variabilidad requieren de diagnósticos específicos sobre la precipitación, las temperaturas y la circulación asociada a la misma. Esto adquiere más importancia a medida que la aplicación a diversos sistemas se hace necesaria. Por esto, este trabajo de Tesis tiene como objetivo general contribuir al conocimiento de la estructura de la temperatura máxima y mínima a escala diaria con las series de registros más largos en Sudamérica, que abarcan el período instrumental. Este conocimiento está dirigido a elaborar una climatología de valores diarios que permiten diagnosticar de forma objetiva y a través de síntesis matemática los procesos más importantes en las series de temperatura máxima y mínima diaria. Por lo tanto, el objetivo principal de este trabajo es obtener un análisis de la variabilidad climática especialmente dentro de la escala intraestacional en series de temperaturas extremas diarias en Sudamérica, para elaborar un diagnóstico y pronóstico objetivo con inferencia directa sobre el impacto.

Abstract:
Weather and climate forecasts improved with the increased ability of both dynamic and probabilistic models to identify situations of high and low risk. For this reason the knowledge of the processes involved in identifying high risk situations leads to a valuation of meteorological information by the user. For this reason the understanding of climate variability requires specific diagnostics on precipitation, temperatures and circulation associated with it. This becomes more important as the application to various systems is necessary. Therefore, this thesis work aims to contribute to general knowledge of the structure of the maximum and minimum daily temperature with the longest record series in South America, covering the instrumental period. This knowledge is intended to develop a climatology of daily values that can diagnose objectively and through mathematical synthesis of the most important processes in the series of daily maximum and minimum temperature. The main objective of this work is to obtain an analysis of climate variability, especially within the intraseasonal scale on series of daily extreme temperatures in South America, to develop an objective diagnosis and prognosis with direct inference on the impact.

"Variabilidad morfológica y biogeográfica de las especies argentinas del subgénero Dioicopoa (Poaceae)" (1997). Giussani, Liliana Mónica. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Las especies dioicas del género Poa L. son principalmente americanas. El dioicismo está representado por 41 especies en América del Sur, 11 en América del Norte, dos en Nueva Zelanda y una única especie en las Islas Periantárticas. En Sudamérica las especies fueron reunidas en el subgénero Dioicopoa(Desv.) Edm. y se distribuyen, en general, en Argentina y Chile. En el presente estudio de tesis doctoral, se analizó la variación fenética de las especies dioicas de Poa de Argentina mediante la utilización de métodos numéricos. Las 38 entidades analizadas fueron reunidas en 10 complejos taxonómicos conformados por taxones de alta similitud morfológica, y se pudieron distinguir claramente 8 de las especies ya descriptas. La discriminación entre los complejos y especies taxonómicas está relacionada con la variación fenotípica de los individuos pistilados y estaminados. Debido al dimorfismo sexual, se establecieron los rangos de variación pertinentes en caracteres diagnósticos para cada sexo y se confeccionó una clave para la identificación de los grupos. La distribución de los complejos y especies taxonómicas está relacionada con la variación del clima y la topografía, y se asoció con las diferentes áreas fitogeográficas. Cuando se analizó la variabilidad del complejo Poa rigidifolia,se observó que existen distintas escalas de correlación con el ambiente: a nivel regional, se pudieron establecer dos grupos asociados con las precipitaciones y la altitud; a nivel local, se observó que la morfología de las especies varía en función del efecto del pastoreo ovino y la cercanía con el coirón, y de la topografía. Estos resultados fueron utilizados para discutir la estabilidad de los caracteres diagnósticos y su consecuencia sobre la taxonomía del grupo.

Abstract:
Dioecious species of Poa L. are mainly American. There are 41 taxa in South America, 11 in North America, two in New Zealand and one species in the Periantartic Islands. South American species, considered within subgenus Dioicopoa(Desv.) Edm., usually grow in Argentina and Chile. The present treatment considers the phenetic variation of dioecious species of Poa from Argentina, using numerical techniques. Thirty eight taxa were examined, which were grouped in 10 taxonomic complexes, including closely related species, and eight species. Species and taxonomic groups were differentiated by phenetic characters of pistillate and staminate individuals. These characters were analyzed for staminate and pistillate specimens, and a key is provided for the identification of species and groups. Distribution of groups and species was correlated with variation of climate and topography, and associated with the different phytogeographic areas. Variability was studied within Poa rigidifolia complex, concluding that there are different levels of correlation between morphology and the environment. At the regional level, two groups were established, they are associated with altitude and rainfall; at a local scale, the morphological variation is related with grazing, the "coirón" closeness, and topographic variation. These results were used to discuss the stability of diagnostic characters and the taxonomy of the group.

"Variabilidad nucletídica en el ADN mitocondrial de Alouatta Caraya del NE de Argentina" (2002). Ascunce, Marina Sofía. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los primates como mamíferos de vida larga y socialmente complejos, constituyen modelos óptimos para observar los efectos del comportamiento y la demografía sobre la evolución de los grupos. Los Monos del Nuevo Mundo (Primates, Platyrrhini) presentan una gran diversidad taxonómica con l6 géneros, l10 especies y 205 especies y subespecies. Su gran radiación adaptativa permite observar una amplia variación en cuanto a parámetros de historias de vida, demografía y estructura social, entre otros. La diferenciación genética entre las poblaciones está determinada por la interacción de factores ecológicos y los procesos evolutivos tales como la selección natural, el flujo génico y la deriva génica. En este trabajo se han analizado los efectos de la organización social y los eventos históricos sobre la variabilidad nucleotídica mitocondrial en algunos platirrinos y particularmente en Alouatta caraya. Se analizaron los efectos de linaje sobre las tasas de evolución molecular mediante comparaciones entre dos familias de monos platirrinos: Atelidae (Ateles, Brachyteles Lagothrix y Alouatta) como representante de platirrinos de cuerpo grande y Cebidae (Cebus, Saimiri y Aotus) representativa de monos platirrinos de menor porte. Se empleó la secuencia nucleotídica del gen mitocondrial correspondiente a la subunidad II de la citocromo oxidasa c, de un total de 29 ejemplares de platirrinos, 11 de estas secuencias fueron obtenidas en el presente trabajo. Los resultados mostraron que el gen COII es un marcador útil para resolver relaciones filogenéticas intragenericas en este grupo. A su vez, en oposición a lo esperado en base a los efectos de linaje, Saimiri con un menor tamaño corporal mostró la menor tasa de sustitución nucleotídica a nivel del ADN mitocondrial, probablemente reflejando la retención de polimorfismos ancestrales, debido probablemente a tamaños poblacionales grandes asociados a características particulares de su organización social. En la segunda parte de la Tesis, se analizó la variabilidad en la secuencia nucleotídica del ADN mitocondrial observada en Alouatta caraya abarcando el área correspondiente a la porción marginal sur de su distribución, con el objetivo de establecer si ciertas características de su organización social afectan la estructura genética de sus poblaciones. Se obtuvo la secuencia de un fragmento de la región control mitocondrial (RC) para un total de 70 ejemplares de 7 localidades. La distribución de la variabilidad nucleotídica caracterizada por la presencia de dos linajes mitocondriales divergentes (clados A y B), se ajusta a un patrón filogeográfico de clase II. Para explicar este patrón se consideró a las selvas asociadas a los ríos Paraná y Paraguay como rutas de migración de la especie a través de las cuales A. caraya habría colonizado la región sur de la distribución. Los datos obtenidos indicarían que ambos linajes habrían sufrido un cuello de botella hace aproximadamente 10.000 años que coincide con un período de extrema aridez, que se conoce como Younger Dryas, considerado de transición entre el fin de las glaciaciones y el comienzo del calentamiento global. El estudio de la variación nucleotídica a nivel de la región control del mtADN en una población de ‘carayás' de un ambiente de selva de inundación (Isla Brasilera, Chaco) permitió observar una estructuración de la variabilidad mitocondrial coincidente con los grupos sociales (tropas) los cuales presentaron casi exclusivamente haplotipos asignables a uno de los dos linajes A ó B. Este patrón de variabilidad mitocondrial sugiere que en el albardón principal de Isla Brasilera (una zona rica en recursos). las tropas se habrían formado principalmente por eventos de fisión de matrilíneas, mientras que en la zona más periférica de la isla (más pobre en recursos), la formación de nuevos grupos se daría por dispersión de individuos desde el albardón o bien por nuevos eventos de colonización. Esto junto con el patrón de divergencia genética sexo específico sugeriría que las hembras presentan comportamiento filopátrico. En los platirrinos, si bien las características poblacionales y de estructuración social determinarían la probabilidad de fijación de los cambios genéticos, los eventos vicariantes parecen haber sido importantes en la especiación del grupo. A su vez, en este trabajo se observó que a nivel poblacional Alouatta caraya en su distribución marginal sur presentaría en la actualidad un patrón de variabilidad mitocondrial determinado no sólo por factores intrinsecos sino también signado por eventos demográficos históricos.

Abstract:
Primates as long-lived and socially complex mammals, offer the opportunity to assess the effects of behavior and demography on the evolution of the groups. New World Monkeys (Primates, Platyrrhini) show a great taxonomic diversity represented by l6 genera, ll0 species and 205 species and subspecies. Its great adaptive radiation is reflected by an extensive diversification of life histories, demography and social structure. Genetic differentiation among populations is determinated between ecological factors and evolutionary processes such as natural selection, gene flow and genetic drift. In this work, the effects of social organization and historic events on the nucleotide variability at the mtADN including some platyrrhine genera and particularly Alouatta caraya were analyzed. Lineage effects on the rates of molecular evolution were analyzed by means of comparisons between genera of two platyrrhine families Atelidae (Ateles, Bruchyteles Lagothrix and Alouatta) as representative of large-size genera and Cebidae (Cebus, Saimiri and Aotus) which are considered as medium size genera among platyrrhines. Nucleotide sequence variation at the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit II gene (COII) was analyzed in 29 New World monkey specimens, 11 obtained in this work. The results suggested that the main utility of COII in platyrrhine systematics lies at the intrageneric level. Contrary to the expectation considering the lineage effects, Saimiri, which is among the smallest size genera analyzed, showed low numbers of unique substitutions suggesting the maintenance of ancestral or plesiomorphic states of platyrrhine mt DNA nucleotide characters probably due to its large population sizes as compared to other platyrrhines, along with particularities in its social organization. In the second part of the Thesis, the nucleotide sequence variation at the mitochondrial DNA was analyzed considering the south marginal distribution area of Alouatta caraya, aiming to study the relationship between the pattern of genetic variation and features of its social organization. A fragment of the mitochondrial control region (CR) was sequenced in 70 specimens of 7 localities. The analysis of sequence variation revealed the presence of two divergent clades A and B which is concordant with a phylogeographic pattern type II. To explain this pattern, it was considered that the forest associated to the Paraná and Paraguay river margins have been used as migration routes by A. caraya. Sequence data suggested that both mitochondrial clades have passed through population bottlenecks about 10,000 years ago, in coincidence with a period of extreme dryness, known as Younger Dryas, during the transition between the end of the glaciations and the beginning of the global warming. The large sample size obtained for the ‘carayá' population of Isla Brasilera characterized as flooded forest, allowed a detailed study of microgeographic population structure. The analysis of genetic variability at the mitocondrial CR sequences showed that within the troops only haplotypes of clade A or B are mainly represented. This pattern of genetic variation suggested that at the main hillock (a zone rich in resources), the troops might be mainly form through the matrilineal fission, while in the peripheral area of the island (which is poorer in resources), the origin of new groups might be related to dispersion of individuals from the main hillock, or by means of new immigration events by new colonizers in the island. This observation together with a sex-specific pattern of genetic differentiation gives support to the hypothesis that females are phylopatric. In platyrrhines, although population and social organization traits may be important determinants of the probability of fixation of genetic changes, vicariant events seem to have played a central role in the diversification of the group. In addition, the present pattern of mitochondrial variability in A. caraya, in its south marginal distribution, appears to be the result of historical demographic events coupled with intrinsic factors such as social organization.

"Variabilidad regional de las temperaturas de superficie en intervalos diarios y cuatridiurnos" (1995). Rusticucci, Matilde. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Variaciones de la hormona hipofisaria somatolactina en la adaptación a los cambios de coloración del entorno en Cichlasoma dimerus" (2010). Cánepa, Maximiliano Martín. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En peces, el control de la coloración corporal está regulada por múltiples hormonas y por el sistema nervioso autónomo (SNA). En esta Tesis se propone también a Somatolactina (SL) como factor involucrado en este proceso. En primer lugar se clonó y secuenció a SL y su receptor putativo, el receptor de hormona de crecimiento tipo 1 (RGH1) en el pez cíclido, Cichlasoma dimerus. El análisis filogenético de ambos indica que se encuentran altamente conservados entre los peces del superorden Acanthopterygii tales como medaka, Oryzias latipes, y tilapia, Oreochromis mossambicus. Posteriormente, se evaluó la expresión de SL en hipófisis y el RGH1 en el tegumento mostrando que la expresión de ambos es mayor en animales mantenidos en un entorno negro. A continuación, se observó que las fibras inmunoreactivas (ir-) a MCH (hormona concentradora de melanina) y fibras ir-GnRH (hormona liberadora de gonadotrofinas) están relacionadas morfológicamente con las células de SL. Por último, estudios de liberación de SL a partir de hipófisis intactas en cultivo mostraron que tanto MCH como GnRH actúan como factores liberadores de SL. A partir de los resultados de esta Tesis se concluye que SL forma parte de un sistema multifactorial de regulación de la adaptación de la coloración del entorno actuando directamente sobre el tegumento.

Abstract:
In fish, background color adaptation is regulated by multiple hormones and the autonomic nervous system. In this Thesis somatolactin is proposed as a factor involved in such process. Firstly, Cichlasoma dimerus SL and its putative receptor, growth hormone receptor type 1 (GHR1) were cloned and sequenced. The phylogenetic analysis showed that both proteins were highly conserved among species from the superorder Acanthopterygii such as the medaka, Oryzias latipes, and the Tilapia, Oreochromis mossambicus. Secondly, the expression of both was assessed under black and white background showing a higher expression in animals maintained in the black one. Then, a close association between immunoreactive (ir-) MCH (melanin concentrating hormone) or ir-GnRH (gonadotropin-releasing hormone) fibers and SL cells was found. Finally, MCH and GnRH increased somatolactin release in pituitary cultures. The results obtained in this Thesis suggest that SL takes part of a multifactorial regulation system of background color adaptation having probably a direct effect on the integument color.

"Variaciones espacio-temporales en la comunidad de invertebrados bentónicos asociada al frente de talud. Equinodermos como caso de estudio" (2010). Escolar, Mariana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En esta Tesis se presentaron las variaciones espacio-temporales, durante el período 2002-2005, en la comunidad de invertebrados bentónicos dominada por Zygochlamys patagonica (Mollusca: Bivalvia: Pectinidae) asociada al frente de talud y sujeta a explotación pesquera. El phylum Echinodermata fue uno de los grupos más diversos y dominante dentro de la captura incidental de la pesquería en toda el área y periodo estudiado. Se estudió también la distribución espacial, biomasa y estructura de tallas de Ctenodiscus australis (Asteroidea), Sterechinus agassizi y Pseudechinus magellanicus (Echinoidea), y Ophiactis asperula, Ophiacantha vivipara y Ophiura lymani (Ophiuroidea), especies de equinodermos estrechamente relacionadas con la vieira patagónica y con una importante contribución en la comunidad. Las seis estudiadas presentaron un patrón de distribución latitudinal. Las especies de erizos y ofiuras presentaron además una evidente separación espacial con respecto a la profundidad. La biomasa de P. magellanicus y O. vivipara disminuyó durante el período 2002-2005 en toda el área estudiada. A su vez se comparó la biomasa y abundancia de las especies en áreas con y sin pesca comercial. Si bien las especies detritívoras y/u omnívoras se vieron beneficiadas por el aumento en la disponibilidad de alimento debido al descarte de la pesquería, las especies de mayor tamaño resultaron vulnerables al impacto. Esta tesis presentó los primeros estudios a nivel poblacional de invertebrados bentónicos colectados como parte conspicua de la fauna acompañante de una pesquería de arrastre, en este caso equinodermos, ampliando la información sobre la ecología de este grupo en áreas de la plataforma continental asociadas al frente de talud.

Abstract:
This thesis showed spatial and temporal variations, during the period 2002-2005, of the benthic invertebrates assemblage dominated by Zygochlamys patagonica (Mollusca: Bivalvia: Pectinidae) in shelf-break frontal areas subjected to commercial fishery. The phylum Echinodermata was one of the most diverse and dominant as part of the by-catch in the whole study area and period. The distribution, biomass and size structure of Ctenodiscus australis (Asteroidea), Sterechinus agassizi and Pseudechinus magellanicus (Echinoidea), and Ophiactis asperula, Ophiacantha vivipara and Ophiura lymani (Ophiuroidea) are studied, being these echinoderm species closely related with the Patagonian scallop assemblage. They showed a latitudinal distribution pattern. The sea urchins and ophiuroids also showed a spatial separation according to depth. The P. magellanicus and O. vivipara biomass decreased in the study area during the period 2002-2005. Biomass and abundance of echinoderms are also studied in relation with areas with and without commercial fishing. Although detritivores and/or omnivores were benefited by an increase in food availability due to fishery discards, the largest species resulted vulnerable to impact. This thesis showed the first populational studies of benthic invertebrates collected as conspicuous components of the by-catch in a trawling fishery, echinoderms in this case, and gives novel information about the ecology of the group in continental shelf areas associated to the shelf-break front.

"Variaciones fenotípicas y poblacionales entre híbridos convencionales y transgénicos de maíz (Zea mays L.) y sus posibles bases genéticas" (2012). Laserna, María Paula. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El uso de híbridos de maíz transgénicos (Bt, RR, Bt-RR) ha simplificado el manejo de los cultivos, debido a un control efectivo de plagas y malezas. Los efectos de la inserción de los transgenes sobre el comportamiento de los híbridos de maíz no están completamente documentados, especialmente sin la incidencia de adversidades bióticas. Los objetivos de esta tesis fueron (i) establecer las posibles diferencias en fenología, crecimiento y rendimiento entre un híbrido de maíz no transgénico y sus versiones transgénicas (híbridos Bt, híbridos RR e híbridos Bt-RR) y entre las versiones transgénicas de otro híbrido; (ii) analizar el impacto del aumento de la densidad poblacional sobre la variabilidad fenotípica de los diferentes rasgos en los distintos genotipos; (iii) establecer las diferencias genéticas existentes entre las distintas versiones dentro de cada grupo de híbridos; y (iv) relacionar la variabilidad genética entre las plantas de una misma versión con la variabilidad fenotípica observada en los distintos rasgos. Los experimentos se llevaron a cabo en el campo experimental de la FA-UBA, durante el período 2008-2009 (Exp 1), 2009-2010 (Exp 2) y 2010-2011 (Exp 3). Se cultivaron las distintas versiones de dos grupos de híbridos (DK747 y DK190) en dos densidades de siembra contrastantes (6 y 12 pl m-2 en Exp 1 y Exp 2) y con distinto espaciamiento entre las plantas de la hilera de siembra (Exp3). Todos los experimentos fueron regados y conducidos sin limitaciones de nutrientes, con controles químicos y mecánicos de malezas y de plagas. En las dos densidades de siembra, se registró variabilidad fenotípica de diferentes rasgos entre las versiones de un mismo grupo de híbridos (e.g. tasas de crecimiento, partición de biomasa a la espiga, TT a floración). También se describieron diferencias en la respuesta de la variabilidad fenotípica de algunos rasgos (e.g. rendimiento y tasa de crecimiento de la espiga) frente al aumento de presión de competencia, indicador de diferencias entre las versiones en la tolerancia a la alta densidad de siembra. Por último, se encontraron diferencias genéticas entre las versiones del híbrido DK747 y entre las plantas de una misma versión, siendo la versión convencional la más variable, y la versión Bt-RR la menos variable. La ubicación de los SNP variables en cada una de las versiones permitió inferir que la variabilidad podría deberse a heterocigosis residual en las líneas parentales. Algunos de los estimadores de la variabilidad fenotípica pudieron relacionarse con la variabilidad genética (e.g. el CV del NGP, la amplitud de la BT y el coeficiente de asimetría de la TCPPC), aunque resta establecer la bases ecofisiológicas determinantes de la variabilidad.

Abstract:
The use of transgenic maize hybrids (Bt, RR, Bt-RR) has simplified crop management because of an effective control of pests and weeds. The effects of the transgenes insertion on the performance of maize hybrids are not well documented, especially without the incidence of biotic adversities. The objectives of this thesis were (i) to establish the differences in phenology, growth and yield between non-transgenic maize hybrid versions and its transgenic versions (Bt hybrids, RR hybrids and Bt RR hybrid ) and among transgenic versions of another hybrid, (ii) to analyze the impact of increased population density on the phenotypic variability of several traits of the different genotypes, (iii) to establish the genetic differences among versions of each group of hybrids, and (iv) to relate the genetic variability among plants of a genotype with the phenotypic variability of several traits. The experiments were carried out in the experimental field of the FA-UBA, during 2008-2009 (Exp 1), 2009-2010 (Exp 2) and 2010-2011 (Exp 3). Different versions of two groups of hybrids (DK747 and DK190) were cultivated at two contrasting plant population densities (6 and 12 pl m-2 in Exp 1 and Exp 2) and with different spacing between plants along the rows (Exp3). All experiments were irrigated and conducted without nutrients limitations, with chemical and mechanical control of weeds and pests. At both plant densities, there were phenotypic variations of some traits among versions of the same group of hybrids (e.g. plant growth rate, biomass partitioning to the ear, time to flowering). Some versions also exhibited different phenotypic variability of some traits (e.g. grain yield and ear growth rate around female flowering) as competition was increased, i.e. an indicator of the tolerance to crowding degree of each genotype. Finally, genetic differences among versions of the DK747 and between plants of the same version were detected, resulting the non- transgenic DK747 the most variable, and the DK747MGRR, the less variable. The location of the variable SNP in each version let us infer that genetic variability is probably due to residual heterozygosity in the parental lines. Some of the estimators of the phenotypic variability could be related to genetic variability (e.g. the CV of the kernel number per plant, the amplitude of the total biomass and the skewness of plant growth rate around the critical period). Physiological bases of inter-plant variability were not determined.

"Variación del intercambio hidrosalino en el sapo Rhinella arenarum modulado por distintos mecanismos fisiológicos y su relación con el aprendizaje instrumental" (2013-08-28). Iurman, Mariana Gabriela. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En el desarrollo de esta tesis se estudió la manipulación de diferentes mecanismos fisiológicos implicados en la captación o pérdida de agua del sapo común Rhinella arenarum con el fin de encontrar diferentes reforzadores que pudieran ser aplicados en protocolos de aprendizaje instrumental. En primer lugar, se verificó que los sapos aprenden a encontrar agua deionizada (reforzador apetitivo) localizada en una posición fija con respecto a su cuerpo (a la derecha o a la izquierda) y que dependiendo de la osmolaridad externa de la solución ésta puede ser aversiva (pierden peso), neutra (no ganan ni pierden peso) o apetitiva (ganan peso) produciendo cambios en el comportamiento de animales parcialmente deshidratados (alejamiento, cuando están expuestos a una solución aversiva, y acercamiento, cuando está presente una solución apetitiva). Luego, se comenzó con el estudio de los mecanismos de transporte de membrana (canales de sodio sensibles a amilorida), hormonales (arginina- vasotocina -AVT-) y nerviosos (vías colinérgicas) que podrían estar involucrados en la variación de peso de los individuos. El bloqueo de los canales de sodio, mediante amilorida, produjo una disminución de la captación de agua y de la permeabilidad de la piel. En contraste, el bloqueo de los receptores colinérgicos muscarínicos, mediante atropina, aumentó la captación de agua y la permeabilidad de la piel. Este último efecto se contrapone con el efecto encontrado cuando se bloquean los receptores β adrénergicos, sobre la base de estudios previos obtenidos en nuestro laboratorio. De esta manera, se describe por primera vez, in vivo, en esta situación la participación de las vías colinérgicas y su antagonismo con las vías adrenérgicas en anfibios. No se encontró efecto de AVT sobre la variación de peso. Es más, ninguna de las drogas utilizadas produce cambios en la permeabilidad o en la pérdida de agua cuando los individuos están expuestos a una solución neutra de 300mM de cloruro de sodio. Esto último indicaría que los mecanismos involucrados en la captación de agua son diferentes a los de preservación de la misma. Globalmente, los resultados de esta tesis nos permiten ahora estar en condiciones de encarar a futuro experimentos de aprendizaje (considerando la situación estándar de los protocolos de entrenamiento en sapos) utilizando soluciones salinas y manipulando los mecanismos colinérgicos asociados de intercambio hidrosalino. De esta forma, la utilización de estos nuevos conocimientos ampliarán las posibilidades de entender la dinámica del balance hidrosalino en anfibios en situaciones de aprendizaje.

Abstract:
In this thesis we manipulated different physiological mechanisms involved in the uptake or loss of water in the common toad Rhinella arenarum to identify reinforcers that could be used in instrumental learning protocols. First, we verified that toads could learn to find deionized water (appetitive reinforcer) located at a fixed position with respect to their body (right or left). Depending on osmolarity, this solution was found to be behaviorally aversive (they lose weight), neutral (they neither gain nor lose weight) or appetitive (they gain weight) to the partially dehydrated animal. Specifically, animals moved away from the aversive solution and moved towards the appetitive solution. Second, we studied the membrane transport (amiloride-sensitive sodium channels), hormonal (aginine vasotocin -AVT-) and neural mechanism (cholinergic) that could be involved in the variation in weight of the individual. The blockade of sodium channels with amiloride resulted in decreased water uptake and permeability of the skin. In contrast, blockade of muscarinic cholinergic receptors increased water uptake and permeability of the skin. This latter effect contrasts with the results previously seen in our lab when blocking β adrenergic receptors. Thus, the work presented in this thesis is the first description, in amphibians, of the participation of the cholinergic pathways in this behavior and their antagonism with the adrenergic pathways. There was no effect of AVT on weight change. Moreover, none of the drugs used produced changes in the permeability or water loss when individuals were exposed to a solution of 300 mM sodium chloride. The latter suggest that the mechanisms involved in the uptake of water are different from those involved in its preservation. Overall, the results of this thesis allow us to now be able to address future learning experiments (considering the state standard training protocols in toads) using salt solutions and manipulating cholinergic mechanisms associated with water and ions exchange. Thus, the use of this new knowledge expands the possibilities of understanding the dynamics of the water balance in amphibians learning situations.

"Variación genética natural en las respuestas de escape al sombreado en Arabidopsis thaliana" (2014-03-31). Kasulin, Luciana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Las señales lumínicas percibidas por los fotorreceptores son importantes para una aclimatación adecuada de las plantas a su ambiente natural. Las plantas detectan la baja relación rojo:rojo-lejano (R/RL) reflejada por la proximidad de las plantas vecinas respondiendo morfológicamente antes de ser sombreadas. La disminución de luz R/RL promueve en las plantas el síndrome de escape al sombreado, SAS (del inglés, Shade Avoidance Syndrome) un conjunto de respuestas morfológicas que promueve el crecimiento de las estructuras vegetativas y mejora la competencia por luz evitando el sombreo por plantas vecinas. Es común encontrar una importante variación natural entre poblaciones de una misma especie en respuesta a la luz. El objetivo de esta tesis fue estudiar la variación natural en las respuestas asociadas al SAS en Arabidopsis thaliana, un modelo funcional muy atrayente para comprender cómo el genotipo determina la expresión de la plasticidad adaptativa de las plantas en ambientes lumínicos cambiantes. Mediante el mapeo de QTL en tres líneas recombinantes y endrocriadas, RILs (del inglés, Recombinant Inbred Lines) que comparten una misma línea parental, Landsberg erecta, se identificaron los QTL comunes y divergentes en la respuesta de crecimiento del hipocotilo entre las poblaciones. Además se determinó y caracterizó la contribución de ERECTA en distintas respuestas asociadas al SAS en las cuales los efectos pleiotrópicos de este gen fueron dependientes del fondo genético. Por otro parte, se realizaron mapeos de asociación de GWAS (del inglés, Genome Wide Association Study) para caracteres vegetativos, florales y reproductivos en plantas cultivadas en condiciones de radiación natural y sombreado en el invernáculo. Si bien la resolución de los mapeos GWAS fue baja, se identificaron dos QTNs (del inglés, Quantitative Trait Nucleotide) asociados al largo de la lámina y del vástago floral. Además, se estudió la fisiología y la diversidad genética de plantas de A.thaliana recolectadas en la Patagonia Argentina. El árbol de similitud genética sugiere que las poblaciones patagónicas son idénticas entre sí y similares a las accesiones originarias de Italia, siendo la más cercana Tívoli. Por otra parte, se determinó que la accesión Patagonia es hiposensible a la luz roja y a la SAS, y tiene requerimientos de vernalización que correlacionan con los patrones de expresión de FLC. Finalmente, esta tesis ha contribuido a la incorporación de un nuevo genotipo de A.thaliana al germoplasma de esta especie que puede ser de interés para estudios futuros.

Abstract:
Light signals perceived by photoreceptors are important for acclimation of plants to their natural environment. Plants detect low Red/Far-Red (R/FR) ratio reflected by the proximity of neighboring plants responding morphologically before being shaded. The decrease of R/FR ratio promotes the shade avoidance syndrome, SAS, a set of morphological responses that promotes the growth of vegetative structures to improve competition for photosynthesis light. It is common to find a large natural variation among populations of the same species in response to light. The aim of this thesis was to study the SAS natural variation in Arabidopsis thaliana, a small crucifera and an attractive model to understand how genotype determines the expression of plant adaptive plasticity in changing light environments. By mapping strategies, we explored the genetic bases of allelic variations associated to the phenotype. We found common and divergent QTL (Quantitative Trait Loci) for hypocotyl growth induced by simulated shade among three RIL (Recombinant Inbred Lines) populations sharing the same parental line, Landsberg erecta. Furthermore we characterized the contribution of ERECTA in the shade. We found ERECTA pleiotropic effects in the SAS being its effects dependent on the genetic background. Also we carried out genome wide mapping association study (GWAS) for vegetative, floral and reproductive traits for plants grown under natural radiation and shade light in a greenhouse. However GWAS resolution was low in our conditions, we mapped two QTNs (Quantitative Trait Nucleotide) associated with the length of leaf and flowering stem. Moreover, we studied the physiology and genetic diversity of A.thaliana plants collected in Patagonia, Argentina. The genetic similarity analysis suggests that Patagonia populations are identical between them, and similar to genotypes from Italy, being the closest Tivoli accession. In addition, we demonstrated that Patagonia accession is hyposensitive to red light and SAS, and it has vernalization requirements that correlate with the expression patterns of FLC. This thesis also contributes adding a new genotype in the A.thaliana germplasm that may be of interest for future studies.

"Variación interanual del mesozooplancton de la plataforma bonaerense en primavera : Introducción de las nuevas metodologías para su análisis." (2011). Di Mauro, Rosana P.. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Se analizó la distribución y abundancia del mesozooplancton (con énfasis en copépodos, cladóceros y apendicularias) de la plataforma bonaerense obtenido en primavera durante los años 2002, 2003 y 2004. Se utilizó un muestreador Minibongo provisto de mallas de 67 y 220 μm para lograr una completa representación del espectro de tamaños del mesozooplancton. El análisis incluyó el método óptico tradicional y un método automático basado en el análisis de imágenes denominado ZooImage. Los resultados se relacionaron con las condiciones oceanográficas, las cuales, en general, no mostraron desviaciones respecto de las condiciones medias para el área de estudio. La malla fina (67 μm) permitió una estimación más precisa de la abundancia y biomasa de pequeñas especies de copépodos (menores a 1 mm de largo total), dado que la malla gruesa (220 um) produjo una subestimación superior al 90 % en los adultos y/o estadios de desarrollo de especies dominantes en la comunidad como los copépodos Oithona nana, Paracalanus parvus, Euterpina acutifrons y Parvocalanus crassirostris. La subestimación de la abundancia y biomasa de apendicularias con la malla gruesa fue mayor al 86 % en los individuos con el largo del tronco menor que 600 μm. Las especies pequeñas dominaron el área y las variaciones interanuales de su abundancia, en líneas generales, no fueron significativas. Se definieron 3 áreas faunísticas caracterizadas por especies clave. Las pequeñas especies Acartia tonsa, P. crassirostris, P. parvus y Podon polyphemoides caracterizaron el área estuarial. O. nana, Microsetella norvegica, Evadne nordmanni y Oikopleura dioica, definieron el área costera, y los copépodos más grandes (> 1 mm de largo total) como Calanoides carinatus, Drepanopus forcipatus, Centropages brachiatus, Clausocalanus brevipes, Ctenocalanus vanus, y el ciclopoido O. helgolandica definieron el área de plataforma. Las elevadas abundancias de presas zooplanctónicas potenciales en los sectores donde se registraron mayores densidades de larvas de Engraulis anchoita, hacen suponer que el alimento no es una limitante para el crecimiento y supervivencia de éstas. El método ZooImage, empleado por primera vez en el Mar Argentino, presentó una exactitud equivalente al método tradicional de recuento en la determinación de la abundancia y biomasa de copépodos y apendicularias. Por la rapidez en la obtención de resultados, este tipo de análisis constituye una herramienta muy útil, adecuada a las demandas de los proyectos de evaluación pesquera.

Abstract:
The distribution and abundance of mesozooplankton (specially copepod, cladoceran and appendicularian species) of the Buenos Aires shelf obtained in spring, during the years 2002, 2003 and 2004, were analysed. A small bongo net provided with 67 and 220 μm meshes, was employed in order to obtain a complete representation of the size spectrum of the mesozooplankton. The analysis included both the traditional optical method and the a new automatic image analysis (ZooImage). The results were related with the oceanographic conditions, which were, in general similar to the mean conditions for the study area. The finer mesh (67 μm) allowed a more accurate estimation of the abundance and biomass of small copepod species (1mm total length), producing the tick mesh (220 μm) more than 90 % of underestimation for adults and/or development stages of dominant species like the copepods Oithona nana, Paracalanus parvus, Euterpina acutifrons and Parvocalanus crassirostris. The underestimation of appendicularians abundance and biomass with the tick mesh was higher than 86 % in individuals with trunk length smaller than 600 μm. Small species dominated the area with non significant interannual differences of their abundance, in most of cases. Three faunistic areas were defined, which were characterized by key species. Acartia tonsa, P. crassirostris, P. parvus y Podon polyphemoides caracterized the Estuarine Area. O. nana, Microsetella norvegica, Evadne nordmanni y Oikopleura dioica, defined the Coastal Area, and the large copepods (> 1 mm of total length) such as Calanoides carinatus, Drepanopus forcipatus, Centropages brachiatus, Clausocalanus brevipes, Ctenocalanus vanus, and the cyclopoid O. helgolandica defined the Shelf Area. High abundance of potential zooplanktonic prey in sectors where highest densities of Engraulis anchoita larvae were recorded, allow to suppose that food is not limitant for larval growth and survival. ZooImage method, employed for the first time in the Argentine Sea, presented an accuracy similar to the traditional optical method for the abundance and biomass estimation of copepods and appendicularians. Due to the quicky obtention of results, this kind of analysis represent a very useful tool, adequate to the fisheries programs requirements.

"Variedades combinatorias no homogéneas y dualidad de Alexander" (2014-12-05). Capitelli, Nicolás Ariel. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En esta Tesis introducimos la teoría de NH-variedades, una extensión de la teoría clásica de variedades combinatorias al contexto no homogéneo. Las NH-variedades poseen una estructura local que consiste en versiones simpliciales de espacios euclídeos de distintas dimensiones, lo que les confiere propiedades muy parecidas a las de las variedades usuales. Nuestro trabajo permite extender los resultados principales de la teoría clásica de variedades a una clase mucho más amplia de espacios; entre estos resultados, el teorema de expansiones regulares de Alexander y la existencia de entornos regulares. A lo largo de esta Tesis exhibimos muchos ejemplos de espacios que forman parte de esta teoría pero no están incluidos en la teoría clásica. Introducimos también la noción de shelling no homogéneo y caracterizamos todas las NH-variedades shellables en el sentido de Björner y Wachs. La teoría de NH-variedades puede aplicarse al estudio de variedades clásicas y lo exhibimos en el caso concreto de la factorización de operaciones simpliciales entre variedades combinatorias (starrings, shellings y bistellar moves). En particular, se muestra que dos variedades son PL-homeomorfas si y sólo si pueden relacionarse por medio de NH-factorizaciones involucrando una sucesión de NH-variedades. En la segunda parte del trabajo analizamos la relación entre la teoría clásica y la no homogénea en el contexto de la dualidad de Alexander combinatoria. Estudiamos el dual de Alexander de las bolas y esferas combinatorias y mostramos que los doble duales de estos complejos son NH-bolas y NH-esferas, las versiones no homogéneas de las bolas y esferas clásicas. Además, definimos la noción de NH-bola y NH-esfera minimal, bolas y esferas no puras que satisfacen una condición de minimalidad en la cantidad de símplices maximales. Las NH-bolas y NH-esferas minimales caracterizan completamente la clase del simplex y del borde del simplex en la relación de equivalencia generada por tomar dual de Alexander. Uno de los resultados principales de este trabajo es la generalización al contexto no homogéneo de los resultados de Dong y Santos-Sturmfels sobre el tipo homotópico del dual de Alexander de las bolas y esferas combinatorias: el dual de Alexander de una NH-bola es un espacio contráctil y el dual de Alexander de una NH-esfera es homotópicamente equivalente a una esfera. Nuestra generalización muestra que el tipo homotópico del dual de Alexander es preservado para una clase mucho más amplia de espacios que los contemplados en los resultados originales de Dong y Santos-Sturmfels. Por ejemplo, incluye todas las NH-bolas y NH-esferas exhibidas (explícita o implícitamente) en esta Tesis.

Abstract:
In this Thesis we introduce the theory of NH-manifolds, an extension of the classical theory of combinatorial manifolds to the non-homogeneous setting. NH-manifolds have a local structure consisting of simplicial versions of euclidean spaces of different dimensions, giving them features very similar to those of polyhedral manifolds. In our work we extend the main results from the classical theory of manifolds to a larger class of spaces; among these results, the Alexander's theorem on regular expansions and the existence of regular neighbourhoods. Throughout this Thesis we present many examples of spaces which are part of this theory but are not included in the classical theory. We also introduce the notion of non pure shelling and characterize all shellable NH-manifolds in the sense of Bjorner and Wachs. The theory of NH-manifolds can be applied to the study of classical manifolds. This is exhibited in the concrete case of factorization of simplicial moves between combinatorial manifolds (starrings, shellings and bistellar moves). In particular, it is shown that two manifolds are PL-homeomorphic if and only if they are related through NH-factorizations involving a sequence of NH-manifolds. In the second part of this work we analyze the relation between the classical and the non-pure theory within the context of combinatorial Alexander duality. We study the Alexander dual of combinatorial balls and spheres and show that the double duals of these classes of complexes are NH-balls and NH-spheres, the non-homogeneous versions of classical balls and spheres. We also define the notion of minimal NH-ball and NH- sphere, a subfamily of non-pure manifolds satisfying a minimality condition on the number of maximal simplices. Minimal NH-balls and NH-spheres completely characterize the class of the simplex and the boundary of the simplex in the equivalence relation generated by taking Alexander dual. One of the main results of this Dissertation is a generalization to the non-homogeneous setting of the results of Dong and Santos-Sturmfels on the homotopy type of the Alexander dual of combinatorial balls and spheres: the Alexander dual of an NH-ball is a contractible space and the Alexander dual of an NH-sphere is homotopically equivalent to a sphere. Our generalization shows that the homotopy type of the Alexander dual is preserved for a far larger class of spaces than the original results by Dong and Santos-Sturmfels. For example, all NH-balls and NH-spheres exhibited (explicitly or implicitly) in this Thesis are included.

"Variedades de BL-álgebras generadas por BLn-cadenas" (2003). Busaniche, Manuela. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Velocidad de disolución (influencia de la forma del cuerpo utilizado y la temperatura)" (1947). Baidembaum de Petroni, Ana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Velocidad de reacción de derivados halogenados aromáticos con la piperidina en benceno" (1950). Brieux, Jorge A. L.. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Verificación de autómatas temporizados en arquitecturas monoprocesador y multiprocesador" (2007). Schapachnik, Fernando. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Los sistemas de tiempo real están presentes en dispositivos embebidos, teléfonos celulares, controladores de vuelo, etc. Su complejidad es cada vez mayor, y cada vez cumplen funciones más críticas, donde las consecuencias de sus fallas son cada vez más graves. Por estos motivos tiene sentido realizar un análisis riguroso sobre ellos, que permita asegurar que sus diseños cumplen ciertas propiedades deseables. A este tipo de análisis se le suele llamar verificación automática o model checking. Un formalismo muy difundido para realizar esta tarea es el de los autómatas temporizados, una extensión de la teoría clásica de autómatas que permite trabajar con tiempo denso. Si bien las técnicas basadas en este tipo de autómatas se conocen desde hace un par de décadas, sufren aún de problemas de escalabilidad, lo que dificulta una utilización mayor en casos reales. Esta tesis analiza diversos mecanismos para acelerar la verificación de autómatas temporizados, tanto en el (clásico) ambiente monoprocesador, como así también en arquitecturas distribuidas. Durante el transcurso de la misma se construyó el model checker Zeus, que se utiliza para la experimentación. Luego de presentar la motivación e introducción al tema, se presentan los conceptos básicos del formalismo y las estructuras de datos más utilizadas en este tipo de herramientas. Se destacan los dos algoritmos tradicionales de verificación, forward y backwards. A continuación, se explora la paralelización del algoritmo backwards: se presenta una prueba de corrección de una versión distribuida y asincrónica del mismo, se la implementa, y se experimenta también con una versión sincrónica y con otra que reparte la carga de trabajo sobre los procesadores de manera dinámica. Se analizan los resultados obtenidos y se argumenta que son cercanos a óptimos utilizando la unidad de distribución de trabajo actual: la asignación de nodos del autómata a procesadores. Luego se aborda la paralización del algoritmo forward junto con una estrategia para la redistribución dinámica de trabajo entre los procesadores. Después de demostrar su corrección, se analizan varios casos de estudio sobre distintas configuraciones, obteniéndose resultados positivos pero no óptimos, y comprobándose que aún queda mucho por investigar con respecto a la distribución de este algoritmo, y planteándose varias posibles líneas de investigación. En el capítulo siguiente se compara el presente trabajo con otros del área, y se argumenta que ciertos resultados positivos obtenidos por otros investigadores tienen como causa no la paralización en sí sino ciertos efectos colaterales de la misma, que tal vez podrían reproducirse en un monoprocesador. A continuación se presenta trabajo realizado en pos de obtener una nueva estructura de datos. En ese marco, se introducen los rCDDs (restricted Clock Difference Diagrams) junto con casos de estudio en los que estos mejoran los tiempos de ejecución hasta en un treinta por ciento. El siguiente capitulo explora dos optimizaciones también validas para el caso monoprocesador. La primera consiste en computar rangos posibles para los valores de las estructuras de datos y de esa manera reacomodarlas para detectar antes ciertas condiciones de corte de operaciones utilizadas con mucha frecuencia. Los resultados muestran mejoras de hasta un diecisiete por ciento en los tiempos de ejecución. La segunda consiste en computar una aproximación al hipervolumen de los poliedros representados por las estructuras de datos, de manera tal de evitar O(n2) comparaciones al costo de O(1). Esta técnica logra una reducción de tiempo de hasta casi un veinte por ciento. El anteúltimo capítulo presenta VInTiMe, una herramienta gráfica que permite describir diseños de tiempo real, especificar sus propiedades de manera amigable, y verificarlas utilizando el model checker distribuido Zeus, de manera sencilla. Constituye un esfuerzo por acercar los métodos formales al usuario no tan experimentado. Finalmente, se exponen las conclusiones del trabajo, donde se argumenta la dificultad de decidir de antemano qué optimizaciones y/o parámetros serán más convenientes para un caso de estudio dado, y se proponen ideas alternativas para atacar el problema.

Abstract:
Real-time systems are present today in embedded devices, cellphones, flight controllers, etc. Their complexity is ever increasing, as well as the criticality of their functions. Consequences of failure are each day more dangerous. This is why performing a rigorous analysis over them makes sense, allowing to assert that their design complies with some desirable properties. This type of analysis is usually called automated verification or model checking. A well-known formalism for model checking is timed automata, an extension of the classical automata theory allowing to model dense time. Although timed automata-based techniques are known since a couple of decades ago, they still suffer from scalability issues, jeopardizing a broader adoption in real cases. This thesis analyzes diverse mechanisms to speedup timed automata verification, both in the (classical) monoprocessor environment, as well as in distributed architectures. While working on it, the model checker Zeus was built as a base for experimentation. After motivating and introducing the subject matter, foundational concepts of the formalism are presented, as well as the data structures more used by the tools. Special attention is payed to the two traditional verification algorithms, forward and backwards. Next, the parallelization of the backwards algorithm is explored: a correctness proof of a distributed and asynchronous version is presented. It is implemented, and experimentation is also done with a synchronous version and another one that dynamically balances workload among processors. Obtained results are analyzed and it is argued that they are close to optimal, as long as the same unit of distribution is used: assigning each automata node to only one processor. After that, a distributed version of the forward algorithm is analyzed, along with a dynamic workload migration strategy. Its correctness is proved, and various case studies over different configuration settings are tried. Positive results are achieved, yet not optimal, corroborating that there is still much research to perform regarding this algorithm. Also, various possible future continuation lines are presented. Next chapter compares against other work in the literature, and argues than certain positive results achieved by other researchers might be caused not by the distribution per se, but actually as a byproduct of it, and that the same effects might be reproducible in a monoprocessor setting. Work towards a new data structure is next, introducing rCDDs (short for restricted Clock Difference Diagrams). Along with their details and algorithms, case studies showing up to a thirty percent of improvement in running times are presented. After that, two optimizations also valid for the monoprocessor setting are introduced. The first one computes ranges of possible values for the data structures, trying to accommodate them in such a way that certain finishing conditions for the most used operation are met earlier. Results show improvements of up to a seventeen percent in running times. The second one is about computing an approximation to the hypervolume of the polyhedra represented by the data structures, thus avoiding O(n2) comparisons at the price of O(1). This technique allows to reduce running times by up to almost twenty percent. The penultimate chapter presents VInTiMe, a graphical tool that allows to describe real-time system designs, specify their properties in a friendly way, and verify them using the distributed model checker Zeus, in a simple manner. This is an efford to put formal methods closer to the practitioner. Lastly, conclusions are presented, arguing the difficulty of deciding beforehand which optimizations and parameters would be better for a particular case study, and proposing alternative ideas to palliate such an issue.

"Verificación de software usando Alloy" (2010). Galeotti, Juan Pablo. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La verificación acotada de software usando SAT consiste en la traducción del programa junto con las anotaciones provistas por el usuario a una fórmula proposicional. Luego de lo cual la fórmula es analizada en busca de violaciones a la especificación usando un SAT-solver. Si una violación es encontrada, una traza de ejecución exponiendo el error es exhibida al usuario. Alloy es un lenguaje formal relacional que nos permite automáticamente analizar especificiaciones buscando contraejemplos de aserciones con la ayuda de un SAT-solver off-the-shelf. Las contribuciones de la presente tesis son principalmente dos. Por un lado, se presenta una traducción desde software anotado en lenguaje JML al lenguaje Alloy. Para conseguir esto, se presenta: • DynAlloy, una extensión al lenguaje de especificación Alloy para describir propiedades dinámicas de los sistemas usando acciones. Extendemos la sintaxis de Alloy con una notación para escribir aserciones de correctitud parcial. La semántica de estas aserciones es una adaptación del precondición liberal más débil de Dijsktra. • DynJML, un lenguaje de especificación orientado a objetos que sirve de representación intermedia para facilitar la traducción de JML a DynAlloy. • TACO, un prototipo que implementa la traducción de JML a DynAlloy. En segundo lugar, introducimos una técnica novedosa, general y complementamente automatizable para analizar programas Java secuenciales anotados con JML usando SAT. Esta técnica es especialmente beneficiosa cuando el programa opera con estructuras de datos complejas. Para esto, se instrumenta el modelo Alloy con un predicado de ruptura de simetrías que nos permite el cómputo paralelo y automatizado de cotas ajustadas para los campos Java.

Abstract:
SAT-based bounded verification of annotated code consists of translating the code together with the annotations to a propositional formula, and an- alyzing the formula for specification violations using a SAT-solver. If a violation is found, an execution trace exposing the error is exhibited. Alloy is a formal specification language that allows us to automatically ana- lyze specifications by searching for counterexamples of assertions with the help of the off-the-shelf SAT solvers. The contributions of this dissertation are twofold. Firstly, we present a trans- lation from Java Modelling Language (a behavioural specification language for Java) to Alloy. In order to do so, we introduce: • DynAlloy, an extension to the Alloy specification language to describe dynamic properties of systems using actions. We extend Alloy’s syntax with a notation for partial correctness assertions, whose semantics relies on an adaptation of Dijkstra’s weakest liberal precondition. • DynJML, an intermediate object-oriented specification language to allevi- ate the burden of translating JML to DynAlloy. • TACO, a prototype tool which implements the entire tool-chain. Secondly, we introduce a novel, general and fully automated technique for the SAT-based analysis of JML-annotated Java sequential programs dealing with complex linked data structures. We instrument Alloy with a symmetry-breaking predicate that allows for the parallel, automated computation of tight bounds for Java fields. Experiments show that the translations to propositional formulas require significantly less propositional variables, leading to a speedup on the analysis of orders of magnitude compared to the non-instrumented SAT-based analysis.

"Viperina, un factor de restricción en la infección con el arenavirus Junín" (2016-03-23). Peña Cárcamo, José Rafael. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
Viperina (VIP) es una proteína cuya expresión es inducida por interferón (IFN) y se ha reportado como factor de restricción viral de diversos virus. En el presente trabajo se analizó por primera vez la acción antiviral de viperina en células A549 sobre la multiplicación del virus Junín (JUNV). Asimismo, se analizó la importancia de las estructuras lipídicas en el ciclo de mutiplicación de JUNV y la localización subcelular en la cual VIP ejerce su acción antiviral. Mediante distintos ensayos se pudo comprobar que la respuesta de IFN/VIP se encuentra activada en las células A549 infectadas con JUNV. Del análisis de sobreexpresión de VIP se confirmó que esta proteína tiene un efecto antiviral sobre la multiplicación de JUNV. Cabe destacar que los aumentos de los niveles relativos de mRNAs/proteínas VIP encontrados se correlacionan con la progresión de la infección con JUNV. Interesantemente, las estructuras lipídicas denominadas lipid droplets (LDs) se observaron aumentadas tanto en número como en tamaño en los cultivos infectados con JUNV. Por otro lado, la disminución de los LDs afectó negativamente la producción de viriones extracelulares, y las imágenes de microscopía revelaron que en las células infectadas las nucleoproteínas virales se encuentran cerca de los LDs, lo que sugiere que los complejos de replicación de JUNV podrían estar utilizando estas estructuras. Por último, los estudios de localización en membrana plasmática de las glicoproteínas virales sugieren que la acción de VIP no sería directamente en membrana pero sí podría ser a través de un paso previo relacionado con el transporte de glicoproteínas a microdominios rafts. En su conjunto, estos resultados no solamente incrementan el conocimiento sobre la biología del arenavirus Junín, sino que ofrece un nuevo blanco para la intervención del ciclo de replicación y la búsqueda de agentes quimioterapéuticos específicos.

Abstract:
Viperin (VIP) is a cellular protein induced by interferon (IFN) reported as restriction factor for several viruses. In the present work and for the first time it has been analyzed viperin antiviral action in A549 cells infected with Junín virus (JUNV). The importance of cellular lipidic structures in JUNV multiplication and putative subcellular localization where VIP action could take place, were also studied. Different assays showed that IFN/VIP response is activated in A549 cells upon JUNV infection. Overexpression of VIP showed to exert a strong antiviral effect on JUNV multiplication. In this line relative amounts of mRNA/protein levels correlate with the progression of JUNV infection. Interestingly, lipid droplets structures (LDs) in infected cells were augmented both in numbers and size. Accordingly diminished of LDs negatively affected extracellular virion production. Microscopy analysis revealed viral nucleoproteins close to LDs, suggesting that viral replication complexes may make use of these structures. Finally, immunofluorescense assays and localization studies showed that the viral glycoproteins is almost absent from plasma membrane suggesting that VIP action might be exerted in an indirect fashion through lipids rafts negative modulation. All together these results enlighten the knowledge about the biology of the arenaviruses and additionally reveal a very new and interesting target for the intervention design and screening of specific chemotherapeutic agents to combat JUNV.

"Virus Junin: mecanismo de entrada a la célula huésped: caracterización y función biológica de la glicoproteína principal de envoltura" (1995). Castilla, Viviana. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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"Virus de hepatitis B (HBV) y virus de hepatitis D (HDV) en Argentina: epidemiología molecular y variabilidad viral" (2013). Delfino, Cecilia María. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El objetivo principal de esta tesis fue estudiar la epidemiología molecular de la infección por HBV y HDV, determinar los genotipos y analizar la variabilidad genética de los aislamientos detectados en distintas poblaciones y regiones de Argentina. Se estudiaron donantes de sangre de Buenos Aires y Misiones, y Amerindios de cuatro comunidades originarias: Mbyá-guaraníes (Misiones), Kollas (Jujuy), Sagua-Huarpes (San Juan) y Wichis (Formosa). Las cifras de prevalencia para el HBsAg variaron de 0,2 a 0,73% para donantes y de 1,4 a 1,7% para originarios. El análisis filogenético de las secuencias de HBV determinó la circulación en ambas poblaciones de los subgenotipos A2, B2, C2, D3, D3/D6, F1b y F4. En las secuencias de HBV se detectaron mutaciones en regiones regulatorias asociadas a mayor severidad de la enfermedad hepática y en las proteínas del pre-Core (productoras de fenotipo e minus), del Core (dentro de los epítopes para linfocitos T), preS1-S2 (posiblemente asociadas a infección oculta por HBV), S (mutantes de escape a la respuesta inmune humoral), P (asociadas a resistencia antiviral) y X (implicadas en el desarrollo del hepatocarcinoma celular). Se describe por primera vez la circulación del genotipo 1 de HDV en donantes de sangre de Buenos Aires y en originarios de Misiones; con el interesante hallazgo de la detección de este virus en casos de infección oculta por HBV. Además, se identificaron mutaciones en el antígeno Delta que podrían justificar la no detección de anticuerpos anti-HDV (infección “oculta”) en estos casos.

Abstract:
The main objective of this thesis was to study the molecular epidemiology of HBV and HDV infection, to determine the genotypes and to analyze the genetic variability of the isolations detected in different populations and regions of Argentina. Blood donors from Buenos Aires and Misiones, and Amerindians from four original communities were studied: Mbyá-guaraníes (Misiones), Kollas (Jujuy), Sagua-Huarpes (San Juan) and Wichis (Formosa). The prevalence of HBsAg ranged from 0.2 to 0.73% in blood donors and from 1.4 to 1.7% for aborigines. The phylogenetic analysis of the HBV sequences revealed the circulation of A2, B2, C2, D3, D3/D6, F1b and F4 genotypes in both populations. In HBV sequences, mutations in the regulatory regions associated to more severe hepatic desease and in the pre-Core proteins (e minus producers), the Core (among the epitopes for T cells), preS1-S2 (possibly associated to occult HBV infection), S (escape mutants to the humoral immune response), P (associated to antiviral resistance) and X (implicated in the development of hepatocellular carcinoma). We describe for the first time the circulation of HDV genotype 1 among blood donors of Buenos Aires and aborigines of Misiones; only among those with occult HBV infection. Moreover, we identified mutations in the Delta antigen which could explain the non-detection anti-HDV antibodies (“occult” infection) in these cases.

"Virus de inmunodeficiencia de simios: estudio de la participación del dominio citoplasmático de la glicoproteína viral de envoltura (Env) en la infectividad viral y en la incorporación de Env a viriones" (2003). Celma, Cristina Cecilia del Pilar. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En las últimas etapas del ciclo de replicación de los virus de immunodeficiencia de simios (SIV), ocurre el ensamblado de las partículas virales en la membrana plasmática de las células infectadas. Durante la morfogénesis de los viriones se produce la incorporación de la glicoproteína viral de envoltura (Env), proceso que es esencial para la infectividad viral. La glicoproteína Env se sintetiza como un precursor proteico, el cual es clivado en las subunidades de superficie y transmembrana por proteasas celulares. A diferencia de otros retrovirus, SIV posee una proteína transmembrana con un dominio citoplasmático (CD) particularmente largo, de 164 residuos. Para investigar el rol que cumple el CD en la incorporación de Env a las partículas virales y en la infectividad, se generaron y caracterizaron glicoproteínas Env mutantes llevando pequeñas deleciones internas de 4 a 7 aminoácidos en el CD o bien acortamientos progresivos de 20 residuos desde su extremo carboxilo. Las mutaciones introducidas no tuvieron efecto alguno sobre la síntesis, procesamiento y expresión en la superficie celular de la glicoproteína Env. Sin embargo, las deleciones internas que afectaron el tercio carboxilo terminal del CD de Env inhibieron significativamente tanto la incorporación de Env a viriones como la infectividad viral. El mismo fenotipo defectivo fue observado al remover 20 a 100 aminoácidos del extremo carboxilo del CD. En cambio, glicoproteínas Env con CDs de 44 o 24 aminoácidos se incorporaron a viriones en forma más eficiente que la proteína Env salvaje, e incrementaron no menos de 10 veces la infectividad viral respecto de la de viriones llevando la Env salvaje. Por otro lado, se realizó un estudio de evolución forzada de un virus mutante llevando una deleción interna en el CD de Env que bloquea la capacidad replicativa del virus. La propagación durante períodos prolongados de tiempo de células linfoideas infectadas con este virus mutante condujo a la selección de poblaciones virales revertantes. En estos virus, el fenotipo defectivo causado por la deleción original fue revertido por mutaciones puntuales en el gen env que acortaron el CD a una longitud de 52 o 48 aminoácidos. En conjunto, los resultados presentados en este trabajo de Tesis demuestran cómo variaciones en la longitud del CD de la glicoproteína Env de SIV modulan las funciones virales mediadas por Env.

Abstract:
During the late stages of simian immunodeficiency virus (SIV) replication, particle assembly takes place at the plasma membrane of the infected cells. During virus morphogenesis, the envelope glycoprotein (Env) is incorporated into virions, a step that is essential for virus infectivity. The Env glycoprotein is synthesized as a heavily glycosylated precursor that is cleaved by cellular proteases into the surface and transmembrane subunits. The cytoplasmic domain of the SIV transmembrane protein is unusually long (164 amino acids) compared to those of other retroviruses. To investigate the role that the SIV Env cytoplasmic domain plays in Env incorporation into virions and virus infectivity, we generated and characterized two sets of SIV Env mutants: a series of mutants carrying small in-frame deletions throughout the entire Env cytoplasmic domain, and another series of Env mutants bearing progressively truncated cytoplasmic tails. None of these mutations had an effect on the synthesis, processing and cell surface expression of the SIV Env glycoproteins. Interestingly, in-frame deletions targeting domains in the C-terminal third of the Env cytoplasmic tail impaired both Env incorporation into particles and virus infectivity. Asimilar defective phenotype was observed for the SIV Env mutants lacking the C terminal 20 to 100 amino acids. Of note, SIV Env glycoproteins bearing a 44- or 24- amino acid cytoplasmic tail were incorporated into virions at levels significantly higher than those of wild-type Env and increased virus infectivity by more than 10-fold with respect to that conferred by the full-length Env protein. In addition, we performed a “forced evolution” study in which we propagated for a long period of time cells infected with a replication-defective mutant virus containing an in-frame deletion within the SIV Env cytoplasmic domain. These experiments led to the selection of second-site revertant viruses in which the defective phenotype imposed by the original deletion was reversed by mutations in the env gene that truncate the Env cytoplasmic tail to 52 or 48 amino acids. In conclusion, our results demostrate how variations in the length of the SIV Env cytoplasmic domain modulate Env-mediated viral functions.

"Virus emergentes : Especificidad de especie de los topotipos Catay y panasiático del virus de la fiebre aftosa. Rol de las proteínas no estructurales 3A y 3B." (2004). Pacheco Tobín, Juan Manuel. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El virus de la fiebre aftosa pertenece a la familia Picornaviridae y es el agente causal de una enfermedad altamente contagiosa y de gran importancia económica, que afecta a los animales de pezuña hendida. Algunos de los aislamientos pertenecientes al serotipo O originarios de Asia fueron clasidicados en tres topotípos, el topotipo Catay ( con una deleción en los aminoácidos 93-102 de la proteína 3A) y el topotipo Sudeste Asiático (con deleción en los aminoácidos 133-143 de la proteína 3A) y el topotipo Panasiático (sin deleción). Con algunos de estos aislamientos se contruyeron virus quimeras con las diferentes formas de 3A descriptas e inclusive virus con una deleción aún mayor, entre los aminoácidos 63-144. Se construyeron tambipen virus quimeras con una sola proteína 3B. Tanto los aislamientos naturales como los virus quimeras fueron evaluados in vitro, en células derivadas de bovino y porcino, e in vivo, en porcinos. Estudios de efectividad en células y en porcinos, así como estudios en virulencia, patogenia y transmisibilidad en porcino nos permiten concluir que los virus pertenecientes al topotico Catay, aunque atenuados para el bovino, son altamente virulentos para el procino y prodijeron una enfermedad aguda y sincrónica, de transmición rápida y efectiva. Mientras que los virus pertenecintes al topotipo Panasiático mostraron similar replicación en ambos tipos celulares, su comportamiento in vivo fue más heterogéneo, no fueron tan virulentos y produjeron una enfermedad más atenuada. Los virus con una sola proteína 3B mostraron una inefectividad reducida en células de porcino y nula en células de bovino, mientras que prodijeron una enfermedad suave en porcino.

Abstract:
Foot-and-mouth disease virus is a number of the Picornaviridae family, is the casual agent of a highly contagious and economically important disease of cloven-hoofed animals. Some of the isolates obtained from Asia that belong to a serotype 0 were classified in three topotypes: Cathay (with a deletion in protein 3A in aminoacids 93-102), Southeast Asia (with a deletion in protein 3A in aminoacids 133-143) and PanAsia (non-deleted). With some of this isolates, genetically engineered viruses were constructed with the different forms of 3A and with an even larger deletion, in between aminoacids 93-144 of 3A. Viruses with only one single 3B protein were also recovered. All the isolates as well as genetically engineered viruses were evaluated in vitro, in bovine and porcine derived cells, and in vivo, in swine. Studies of inefectivity in cells and in swine, together with studies of virulence, pathogenicity and transmissibility in swine, let us conclude, that although when the were attenuated for bovine, viruses of the Cathay topotype are highly virulent and produce an acute and synchronic disease, of fast and effective transmission in porcine. Whereas viruses of the PanAsia topotype showed similar replication in both cell types, bovine or porcine, showed to be more heterogeneous in vivo, not so virulent, and they produced a milder disease. Viruses harboring one single 3B showed a decreased infectivity in porcine cells, and null infectivity in bovine cells, and they produced a mild disease in swine.

"Virus linfotrópico T-humano tipo 1 y 2 (HTLV-1/2): optimización del diagnóstico y epidemiología molecular en distintas poblaciones de Argentina" (2010). Berini, Carolina Andrea. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
El objetivo principal de esta tesis es ampliar los conocimientos sobre el diagnóstico, la prevalencia y la epidemiología molecular del HTLV-1/2 y brindar datos que permitan un diagnóstico más eficiente en Argentina. Con tal fin, se analizaron equipos de tamizaje frecuentemente utilizados en nuestro país, y se demostró la importancia de confirmar los resultados seroindeterminados por WB mediante una técnica molecular para obtener un diagnóstico final. En cuanto a la prevalencia de HTLV-1/2 en las distintas poblaciones estudiadas, hemos demostrado que ambos virus se encuentran circulando con prevalencias altas en poblaciones de riesgo y bajas en las de no riesgo en la mayor parte del país, manteniendo la característica epidemiológica de su restricción étnico/geográfica ya demostrada. Es por ello, que debemos considerar también el riesgo de infección en aquellos casos que presenten antecedentes de riesgo como, por ejemplo, haber nacido, ser descendientes o haber sido pareja sexual de individuos provenientes de áreas endémicas. Mediante estudios filogenéticos se demostró que todas las cepas estudiadas del HTLV-1, resultaron subtipo a subgrupo A, mientras que para el HTLV-2 el subtipo b fue el mayoritario ambos en poblaciones no originarias sugiriendo que estos subtipos han sido introducidos en nuestra población caucásica a partir de la interacción con comunidades originarias.

Abstract:
The main objectives of this thesis work were to widen the knowledge about the molecular epidemiology of HTLV-1/2 infection in Argentina and to collaborate with the implementation of an optimal algorithm for its diagnosis. Therefore, different commercial kits frequently used in blood banks along South America were analyzed, showing their efficiency and demonstrating that the further molecular confirmation of seroindeterminate results by WB is an important tool for obtaining a final diagnosis and the real serostatus of this infection. Regarding the prevalence of HTLV-1/2 in the different study populations, we demonstrated that both circulating viruses have high prevalence in at-risk populations and low prevalence in non at-risk populations in most of the country, maintaining the epidemiologic characteristics according to the ethnic/geographic restriction areas already demonstrated. In relation to HTLV- 1/2 infection risk, this data should be considered especially in the cases that have risk antecedents such as being born, being descendent or being a sexual partner of an individual coming from endemic areas. As for HTLV-1 phylogeny, all the circulating strains belong to subtype a subgroup A while for HTLV-2 the major subtype in non-aboriginal populations was b suggesting that these subtypes (HTLV-1aA and HTLV-2b) have been introduced to the general population due to closer interactions with aboriginal communities.

"Visualización de datos geoespaciales aplicada a la meteorología" (2016-05-02). Diehl, Alexandra. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
La visualización de datos geoespaciales cubre un gran espectro de técnicas visuales e interactivas para la representación, interacción y análisis de datos geoespaciales. Este tipo de datos se caracteriza por tener una referencia geográfica, también puede contener una componente temporal, y usualmente proviene de fuentes masivas y heterogéneas. El diseño de herramientas efectivas para asistir a los usuarios en el proceso de razonamiento analítico de datos complejos y dinámicos constituye un gran desafío. Un diseño efectivo comprende una combinación correcta de representaciones visuales, mecanismos interactivos, y procesamiento semiautomático. Una selección equilibrada de estos elementos depende del dominio específico de aplicación. Esto puede ser sólo alcanzado por un enfoque integral donde el usuario cumple un rol central, colaborando en cada paso de su diseño y evaluación. Diferentes factores influencian este proceso, por ejemplo, el flujo de trabajo de tareas específico del dominio de aplicación, los requerimientos del usuario, y la complejidad de los datos. La presente tesis conduce al lector a través de diferentes enfoques que abordan el desafío de diseñar soluciones de visualización geoespacial eficientes, con aplicaciones específicas para la meteorología. Estos enfoques combinan distintas estrategias de visualización analítica para asistir a los pronosticadores en el análisis del pronóstico operativo del estado del tiempo. Los pronosticadores necesitan realizar un análisis rápido de la información, en el día a día. Proponemos un diseño novedoso que balancea la experiencia del usuario y el análisis semiautomático. Este diseño permite al usuario identificar tendencias y anomalías, analizar incertidumbre, y detectar errores del modelo numérico en forma ágil. También analizamos la integración de tecnologías de juegos serios y visualización científica. Nuestro diseño incorpora técnicas de visualización y tecnologías de juegos serios, en particular de simuladores de vuelo. El mismo demuestra los beneficios que esta integración puede brindar a la interacción con datos geoespaciales por medio de una aplicación de visualización 3D que explora ambientes topográficos y datos atmosféricos. Hemos evaluado la factibilidad y eficiencia de ambos enfoques por medio de diferentes casos de estudio diseñados en estrecha colaboración con meteorólogos, expertos del dominio. Esta evaluación fue realizada usando una metodología de diseño participativa e iterativa. Las conclusiones discutidas en este trabajo abrirán nuevas oportunidades de investigación para el diseño de soluciones de visualización de datos geoespaciales eficientes en el área de meteorología, en el análisis del estado del tiempo y soporte para la toma de decisiones.

Abstract:
Geospatial data visualization covers a huge scope of visual techniques and interactive mechanisms for the representation, interaction and analysis of geospatial data. This kind of data is characterized for having a geographic reference, it can have a temporal component and often comes from massive and heterogeneous sources. The design of effective tools to assist users on analytical reasoning on these complex and dynamic data constitutes a big challenge. Effective design entails a right combination of visual representations, interactive mechanisms and semi-automatic processing. A carefully chosen selection of these elements depends on the specific domain of application. This can be achieved by an integral approach where the user plays a central role, collaborating in each step of the design and evaluation. Different factors influence this process, for example, the specific domain task workflow, user’s needs and data complexity. This thesis guides readers through different approaches that address the challenge of designing efficient geospatial visualization solutions with specific applications in meteorology. Our approaches face different visual analytical strategies to assist forecasters in the analysis of operational weather forecasts. Forecasters need to perform quick analysis of the data on a daily basis. We propose novel designs that balance user experience and semiautomated analysis. They allow the user to identify trends and anomalies, to analyze uncertainty, and to detect numerical model errors in an agile process. We also analyze the integration of serious games technologies and scientific visualization. Our design combines visualization techniques and serious games technologies, in particular flight simulators. It puts forward the benefits that this integration can bring to the interaction with geospatial data by means of a specific data model design and a 3D visualizer of topographic environments and weather information. We evaluated the feasibility and efficiency of our approaches by means of several case studies designed in close collaboration with meteorologists, who are the domain experts. This evaluation was performed using an iterative and participatory methodology. Conclusions discussed in this work will open new research opportunities to enhance the design of efficient geospatial visualization tools for meteorology, weather analysis and decision-making support.

"Vías de señalización en la respuesta mitogénica a PGF 2 alfa, lif y citoquinas relacionadas, en células Swiss 3T3 que involucran la expresión de ciclinas D y CDKs" (2000). Sauane, Moira. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Abstract:
Mammalian cell division, is a highly complex process, regulated and coordinated by mechanisms that are conserved through most species. The physiological control of eucariotic cell proliferation initiation is external, and it is excerted by humoral factors, made by the same or other cells, under certain requirements of the organism. Progression through the different phases of the cell cycle, is governed by a regulatory machinery conserved through most species, that not only coordinates the various events that made up the cell cycle, but also connects the cell cycle with extracellular signals, that regulates cell proliferation. Beginning with a given mitogenic stimulus acting through a specific receptor in a target cell, signalling mechanisms cascades are generated in the membrane and in the citosol of that cell. These early events, act on the cell cycle machinery, finally leading to cell division. The expression of proteins that regulate the cell cycle is in part induced by mitogen-stimulated signalling mechanisms. The passage from G0 to S phase, depends on the activity of cyclin-dependent kinases (CDKs). These kinases are CDK4 and CDK6, and they are activated when they form complexes with cyclins D (D1, D2 and D3), induced in the G1 phase. Cyclins D are considered as "sensors" of the extracellular medium, since their induction is triggered by mitogenic stimuli. The activated complexes cyclin D-CDK4 and cyclin D-CDKG catalyse the phosphorilation of the Rb protein. In Swiss 3T3 cells, PGF2α is capable of inducing DNA synthesis, by means of multiple signalling mechanisms, in the absence of other factors. However its mitogenic effect is potentiated by TGFβ1 addition. We have shown that PGF2α triggers cyclin D1 mRNA/protein expression prior to cellular entry into the S phase, but fails to raise CDK4 or cyclin D3 levels, while 1-oleoyl-2acetyllglycerol (OAG), a protein kinase C (PKC) and tyrosine kinase (TK) activator, induces only cyclin D1 expression with no mitogenic response. In contrast, in PKC-depleted or -inhibited cells, PGF2α, but not OAG, increases cyclin D1 expression with no mitogenic response. Finally, OAG, in the presence of orthovanadate (Na3VO4)or TGFβ1, induces DNA synthesis. Thus, it appears that PGF2α triggers cyclin D1 expression via two independent signalling events that complement with TGFβ1-triggered events to induce DNA synthesis. TGFβ1 cannot trigger cyclin D1 expression, but, stabilise cyclin D1 mRNA, after PGF2α-triggered its expression. Leukaemia inhibitory factor (LIF) was originally described on the basis of its ability to stimulate the differentiation of murine M1 leukemic cells into granulocytes and macrophages. In Swiss 3T3 cells, both LIF and prostaglandin F2α (PGF2α) trigger initiation of DNA synthesis and cell proliferation. LIF appears to exert its action through signals and processes markedly different from those elicited by PGF2α. While pre-treatment the cell culture with either GF 109203 (bysoindolmalemide), a specific PKC inhibitor, or 12-tetradecanoyl-13-phorbolacetate, which causes PKC down modulation, or lovastatin, known to block mevalonic acid synthesis and protein isoprenylation, totally impairs PGF2α mitogenic action. None of these treatments inhibited LIF-induced DNA replication. Agents capable of rising intracellular cAMP, enhanced both LIF and PGF2α ability to cause cellular entry into the S phase. However, H89 and PKI, both PKA inhibitors, prevented cAMP-mediated potentiation, but did not affect LIF induction of cellular entry into S phase. PD98059, a MEK (MAPKK)inhibitor, prevents PGF2α-mitogenic response but does not block LIF-induced initiation of DNA synthesis. Immunofluorescence studies revealed that LIF and PGF2α responses exhibit marked differences in STAT cytoplasmic-nuclear translocation. After 15 to 30 min, LIF causes STAT1 but not STAT3 or STAT5 translocation. In contrast, PGF2α failed to induce translocation of any of those transcriptional factors. Thus, it appears that LIF triggers mitogenic action through independent signalling events such as those involving PKC, PKA, MEK, p38MAPK and protein isoprenilation. In addition, its mitogenic effect is markedly potentiated by PKC, PKA, and probably PTK mediated signalling mechanisms. Western blot analyses of cyclin D1, D2 and D3 expression (implicated in most mitogen actions), revealed that PGF2α, after 7-9 h, caused an increase in cyclin D1 protein levels, and a later increase in cyclin D2 levels. In contrast, LIF failed to increase either cyclin D1, D2, D3, CDK4 or CDK6 protein levels. Finally, oncostatin M(OSM), a cytokine closely related to LIF, exerts its action through signals and processes markedly similar to those elicited by LIF. This conclusion is based in the following facts: both cytokines causes STAT1 tranlocation; the effect of Prostaglandin E1 and insulin, when added separately or in combination, enhances the effect of either LIF or OSM; PGF2α enhances the effect of LIF or OSM on DNA synthesis, both at subsaturant or saturant concentration. Moreover, LIF and OSM added together at subsaturating concentrations had an additive effect on DNA synthesis. LIF and OSM added together at saturating concentration had an similar effect to that of these same cytokines when added separately. Interleukin -6 and CNTF, fail to cause either cyclin D expression or mitogenic response. The results obtained suggest that the PGF2α-stimulated mitogenesis would occur through cyclin D1 expression, mediated by DAG/PKC and TK dependent mechanisms, while calcium dependent mechanisms would be involved in other processes. Finally, the LlF stimulated mitogenesis is not depend on signalling mechanisms such as those that act through PKC, PKA, MEK, p38MAPK and isoprenilated proteins, and also independently of the expression of cyclins D, CDK4 and CDK6.

Título :	Vías de señalización en la respuesta mitogénica a PGF 2 alfa, lif y citoquinas relacionadas, en células Swiss 3T3 que involucran la expresión de ciclinas D y CDKs = Signal transduction pathways in the mitogenic response to PGF 2 alfa LIF and related cytokines in Swiss 3T3 cells, including cyclins Ds and CDKs expression by diverse signalling pathways
Autor :	Sauane, Moira
Director :	Jiménez de Asúa, Luis
Año :	2000
Editor :	Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Filiación :	Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Fundación Campomar. Instituto de Investigaciones Bioquímicas
Grado obtenido :	Doctor en Ciencias Biológicas
Ubicación :	Preservación - http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3289_Sauane
Idioma :	Español
Area Temática :
Palabras claves :	CELULAS DE RATON SWISS 3T3; FACTORES DE CRECIMIENTO; MECANISMOS DE TRANSDUCCION DE SEÑAES; MOLECULAS REGULATORIAS DEL CICLO CELULAR; FACTOR INHIBIDOR DE LA LEUCEMIA (LIF); ONCOSTATINA M (OSM); CITOQUINAS DE TIPO IL-6; TGFBETA1; PGF2ALFA; FASE G1; PROTEINAS QUINASAS DE TIROSINAS (PKT); PROTEINA QUINASA C (PKC); CALCIO; AMPC; PROTEINAS QUINASAS DEPENDIENTES DE AMPC (PTK); CICLINAS D; QUINASAS DEPENDIENTES DE CICLINAS (CDK); TRANSDUCTORES DE SEÑALES Y FACTORES DE TRANSCRIPCION (STATS); SWISS 3T3 CELLS; GROWTH FACTORS; SIGNALLING MECHANISMS; CELL CYCLE; LEUKAEMIA INHIBITORY FACTOR (LIF); ONCOSTATIN M (OSM); CILIARY NEUROTROPHIC FACTOR (CNTF); INTERLEUKIN-6 (IL-6); TRANSFORMING GROWTH FACTOR BETA1 (TGFBETA1); PROSTAGLANDIN 2ALPHA (PGF 2ALPHA); G1 PHASE; PROTEIN TYROSINE KINASE (PKT); CALCIUM; MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE (MAPK); AMPC; PROTEIN KINASE A (PKA); CYCLIN-D; CYCLIN-DEPENDANT KINASE (CDK); SIGNAL TRANSDUCERS AND ACTIVATORS OF TRANSCRIPTION (STATS)
URL al Documento :	http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/Tesis/Tesis_3289_Sauane.pdf
URL al Registro :	http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3289_Sauane

"Vórtices en monocristales de NbSe2: dinámica alterna en el régimen plástico" (2012). Pérez Daroca, Diego Raúl. Tesis doctoral. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires

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Resumen:
En esta tesis se investigó la dinámica alterna de vórtices superconductores en monocristales de NbSe2 , en condiciones compatibles con el régimen plástico.Mediante mediciones de susceptibilidad ac en el régimen lineal se exploraron configuraciones de vórtices en las inmediaciones de la transición orden - desorden, siguiendo diferentes historias térmicas, magnéticas y dinámicas. También, se estudió la respuesta del sistema después de agitar los vortices con campos magnéticos oscilatorios. Con estas mediciones, identificamos tres regiones. En la región T < T1 (H), agitar la red de vórtices lleva a configuraciones estables con máximo orden. Identificamos esta región con la fase de vidrio de Bragg. Para T > T2 (H) las configuraciones son desordenadas. En la región T1 < T < T2, al agitar la red de vórtices se producen deformaciones plásticas (irreversibles) que identificamos con la creación y aniquilación de disclinaciones alcanzándose configuraciones con propiedades peculiares. Profundizando el estudio en esta región, se hicieron experimentos cambiando la frecuencia y la forma de onda del agitado. Se observó que las frecuencias de agitados más altas llevan a configuraciones más ordenadas. Estas configuraciones no depende de la condición inicial, pero mantiene memoria de la frecuencia de agitado. Usando un modelo simple de la dinámica de vórtices y mediante simulaciones de dinámica molecular se analizó el desanclaje de la red de vótices bajo la acción de una fuerza externa ac. Se discutió la diferencia con el caso de una fuerza externa dc y se determinaron los observables más representativos para identificar el desanclaje ac. Para un conjunto compatible de parámetros de interacción que modelan cualitativamente las características principales de los protocolos experimentales de agitado, se realizaron simulaciones que revelan una posible naturaleza de las configuraciones de vórtices obtenidas mediante agitados en la región T1
Abstract:
In this thesis we studied the ac dynamics of superconducting vortices in NbSe2 single crystals in the plastic regime. By performing ac susceptibility measurements in the Campbell regime, we explored vortex configurations in the vicinity of the order - disorder transition following different thermal, magnetic and dynamical histories. Also, we studied the response of the system after shaking with oscillatory magnetic fields. With these measurements, we identified three regions. In the region T < T1 (H), shaking the vortex lattice leads to stable configurations with maximum order. We identify this region with the Bragg glass phase. For T > T2 (H) configurations are disordered. In the region T1 < T < T2 , shaking the vortex lattice produces plastic (irreversible) deformations that we associate with the creation and annihilation of disclinations leading to configurations with peculiar properties. Additional studies of this region were performed by changing the frequency and waveform of the shaking field. The highest shaking frequencies lead to the most ordered configurations. The system does not keep memory of the initial condition, but the final configuration depends on the shaking frequency. Using a simple model for the vortex dynamics and performing molecular dyna- mics simulations we analyzed the vortex lattice depinning by an ac external force. We discussed the difference with the case of a dc external force and considered the most representative observables to characterize the ac depinning. Additional simulation were performed that reveal a possible nature of vortex configurations obtained by shaking protocols in the region T1 < T < T2 ithin this picture the vortex configurations could be associated to stationary states in which both, lattice vortex disclinations and the average velocity fluctuate around a stable value. These states could be similar to the fluctuating states proposed in colloidal systems. In summary, a dynamic reorganization in the plastic regime that maintains memory of the shaking frequency, but it is independent of the initial configuration has been observed experimentally and numerically.

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