Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares

Giancola, Sandra M.

Registro:

Documento:	Tesis Doctoral
Disciplina:	biologia
Título:	Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares
Autor:	Giancola, Sandra M.
Editor:	Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Filiación:	Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) Castelar. Instituto de Investigaciones en Ciencias Veterinarias (CICV). Instituto de Biotecnología
Publicación en la Web:	2017-03-01
Fecha de defensa:	1998
Fecha en portada:	1998
Grado Obtenido:	Doctorado
Título Obtenido:	Doctor en Ciencias Biológicas
Director:	Hopp, Horacio Esteban
Idioma:	Español
Formato:	PDF
Handle:	http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3059_Giancola
PDF:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/download/tesis/tesis_n3059_Giancola.pdf
Registro:	https://bibliotecadigital.exactas.uba.ar/collection/tesis/document/tesis_n3059_Giancola
Ubicación:	Dep.BIO 003059
Derechos de Acceso:	Esta obra puede ser leída, grabada y utilizada con fines de estudio, investigación y docencia. Es necesario el reconocimiento de autoría mediante la cita correspondiente. Giancola, Sandra M.. (1998). Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de http://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3059_Giancola

Resumen:

La soja es una especie autopolinizante de escasa variabilidadgenética. Esta variabilidad se ve aún más reducida en variedadescultivadas de soja (Glycine max (L.) Merr.) debido a que en losprogramas de mejoramiento, usualmente se utilizan los mismosancestros. Debido a esta escasa variabilidad genética es que resultadifícil la identificación y diferenciación de nuevos cultivares. El objetivo de este trabajo fue testear la capacidad que tienen losdiferentes marcadores moleculares tales como, RAPD (amplificaciónazarosa de ADN polimórfico), AFLP (Polimorfismo de longitud defragmentos amplificados) y Microsatélites o SSR (secuenciasrepetitivas simples), para caracterizar y diferenciar un conjunto de 100variedades de soja registradas en el Registro Nacional de Cultivaresdel Instituto Nacional de Semillas (INASE), perteneciente a la Secretaría de Agricultura, Ganadería, Pesca y Alimentación. Fueronutilizadas 16 características morfológicas, fisiológicas y fenológicaspara comparar la relación genética obtenida con los marcadoresmoleculares. Se analizaron 424 loci genómicos polimórficos entre marcadoresmoleculares y morfológicos mostrando un porcentaje global depolimorfismo del 25.7% confirmando la baja variabilidad genéticarelativa de la soja comparada con otros cultivos y explicada por laestrecha base genética con que se maneja el mejoramiento de estaplanta La variabilidad evidenciada por cada uno de los sistemas demarcadores fue diferente. Las variedades fueron agrupadas por elsistema de “cluster analysis” y los resultados comparados con losdatos genealógicos de las variedades registradas, concluyéndose quelos microsatélites son los marcadores que mejor reflejan la evolucióngenómica de las variedades y mejor se correlacionan con ladiferenciación morfológica. Los AFLP mostraron un alto rango demultiplex, pero bajo polimorfismo, en cambio los RAPD mostraron unvalor intermedio de polimorfismo y bajo rango de multiplex. Se logró establecer una “huella digital genética” para cadavariedad y realizar un estudio de variabilidad genética, estimando ladistancia mínima a considerar para la obtención de la propiedad.

Abstract:

Soybean is a self pollinating species of limited geneticvariability. This variability is further reduced in soybean cultivars (Glycine max (L) Merr.) due to the fact that they are usually derivedfrom crosses among members of an elite group of genetically relatedparents. This limited variability is sometimes insufficient tounambiguously identify new cultivars. The aim of this work is to test the feasibility of using differentmolecular markers such as “Random Amplified Polymorphic DNA” (RAPD), “Amplified Fragments Length Polymorphism” (AFLP) and Microsatellite or Simple-Sequence-Repeat (SSR) to characterize anddifferentiate a set of 100 soybean varieties registered at the National Register of Cultivars of the National Seed Institute of Argentina (INASE, Secretariat of Agriculture, Livestock, Fisheries and Food). Sixteen known basic morphological, physiological and phenologicaltraits were also recorded for each variety in order to compare therelationships among varieties derived from molecular markers. The calculated variability indexes showed to be highly dependent onthe specific technique used for the analysis ranging from 0.262 for SSR analysis, 0.401 for RAPD and AFLP analysis and 0.574 formorphological traits analysis. In total 109 polymorphic genomic lociwere scored revealing a lower genetic variability when compared withpublished data of other species. The varieties were grouped by clusteranalysis and the relationships derived from these cluster analysis wascompared with known pedigree data of the registered varieties. The SSR data showed the best fit to pedigree data while mantaining anacceptable correlation to morphologically-based separation. AFLPshowed a high multiplexity but low percentage of polymorphic bandswhile RAPD was low in multiplexity but with a better level ofpolymorphism. A genetic fingerprint was established for each one of the 100 varietiesand a minimum genetic distance for distinctness definition within UPOV concept could be defined.

Citación:

---------- APA ----------

Giancola, Sandra M.. (1998). Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares. (Tesis Doctoral. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.). Recuperado de https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3059_Giancola

---------- CHICAGO ----------

Giancola, Sandra M.. "Caracterización y diferenciación de Germoplasma de Soja (Glycine max (L.) Merr.) mediante marcadores moleculares". Tesis Doctoral, Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, 1998.https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3059_Giancola

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